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lowQualScore                  :     . . .  . .... . ..  . .... . ...........  ..... ..... . . .. ............ ........... ... ... . .  .. .. .... .. ..  . .. ....... . ... . .... .  ... . . .... . ....... ... ..... .  ... . .. . ... .... ..  .. ..  .... . .... .. . .          
lowQualScore                  :     0 5 4  0 9999 9 00  5 8888 4 99999999999  22222 44444 8 4 88 555555555555 44444444444 111 333 8 4  66 66 6666 22 00  4 22 9999999 8 777 8 3333 8  222 8 4 9999 8 7777777 777 00000 4  777 4 88 8 111 2222 00  66 00  7777 4 5555 55 4 3          
consensus                     : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
Reference ( gi|3247 )         : ATTA-C-A-TC-A--G-T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-G--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3249                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-A--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A--TA----T-T----T--T-G-ACATTTTCCC
gi|3248                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--T--A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3251                       : ATTT-T-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-T-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTTCC
gi|3250                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-A-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---G-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T---A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3252                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---C-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A----------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3253                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----G-C-----------TA-----A-----A-T-T--TT-----------A-----------T---C---C-G-CT--G--T-A--A--T--TT-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-G--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATCTCCCC
gi|3254                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---T-G-CA--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-CCTGAT-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-GCATTTTCC
gi|3255                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T-----G-CT--G--G----A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA-----A-A----A-A-------T---T-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCC
gi|3256                       : ATTA-C-G-TC-A--A-A-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-T---T-C----T-AA---T-G-A----A-A-------C---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A--CA----C-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3257                       : ATTA-T-A-TC-A--A-G-G--TG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--A-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-CT---T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-------------GCATTTTCCC
gi|3258                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-T-CA--A--G-A--A--T--TT-A--C-------C-C---A-C----T-AA---T-A-A----A-A-------------------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
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gi|3267                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----G-C-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TG-G--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-
gi|3270                       : ATTA-C-ACTC-A--A---G--AG-T------------------TA-----A-----GGT-T--T------------A---------------C---C-A-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----TTAA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-AT---T-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCCaat
gi|3269                       : ATTA-C-A-TC-G--A-T-G--AG-TT---G-G-----------CA-----A-----G-T-T--T------------A-----------G---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-AT-T-------C-T---T-C----T-AATT-T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T---A-T-------AA--A--TA----T-TA---A--T-A-ACATTTTCCC
gi|3271                       : ATTA-C-ACTC-A--A-T-G--A--T----G-A-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-C--A-------C-C---T-C----T-AA---T---A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A--TA----T-T----A--T-A---ATTTTCC
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gi|3273                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-C-----------TA-----A-----A-T-C--T------------A-----------T---C---C-G-CT--A--G-A--A--T--TG-A--T-------T-C---T-C----T-AA---T-A--------------------T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AC--A--TA------T----A--T-G-
gi|3274                       : ATAA-C-G-TC-A--A-T-A--AA-T----G-A-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--C-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-T----T-A------A-G----A-A-------T---T-----T-GTATAA-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----G--T-G-ACAT
gi|3275                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-T-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---CCG-CT--T--A-A--A--T--TG-A--------------------------A---T-A-A----A-A-------T---C-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
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gi|3277                       : ATTA-C-A-TC-T--A-T-G--G--T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T---------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-G--A--A--TC-A--T-------C-C---T-C-------------------------------------------T---A-A--T-C-A-T----G---A--A--TG----T-T----A--T-G-ACATTTTTCC
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gi|3281                       : ATTA-C-AATC-G--T-T-T--GC-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--TTA----------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--C--T--TC-A--T-------C-C---T-C----TAAA---T-A-A----A-AT------T---T-----T-GT---A-A--T-T-A-T----GGAAA--A--TA----T-TGA--A--C-G-A-GTTCTCC
gi|3278                       : ATTA-C-A-TC-A------------T----G-A-----------TG-----G-----G-T-T--T------------A-----------C---C---C-G-CT--G--G-A--AA-T--TC------------T-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-------------ACATT
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gi|3286                       : ATTA-C-G-TC-A--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--T-----T-------C------------------------------A-------T---T-----A-G--------------------G--AA--A--AA----T-T----A--G-G-ACATTTTCCC
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gi|3293                       :  TTA-C-A-TT-A--AAT-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--A-A--AA-T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3296                       :  TTA-C-A-TCTA--T-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--A-------C-C---T-C----T-TA---C-A-A----AGA-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
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gi|3295                       :  TTA-C-A-TC-T--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--A-------C-C---T-C----T-TA---C-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3297                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------A-T---T-C----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--T-----T-T----A--T-T-ACATTTTCCC
gi|3298                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----T-T-A--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--A-------C-C---T-C----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3299                       :  TTA-C-A-TC-A--G-T---------------------------A-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----A-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TAG---T-T----A--T-G-ACATT
gi|3301                       :  TTA-C-AGTC-A--T-T-G--AG-T----G-TAAT--------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--A----A--T--GC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCC
gi|3300                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--A--T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C-G-CT--G--GAA--A--T--TC-A--A-------C-C---T-T----C-TA---T-A-A----G-AT------T---T-----T-GT---A-A--TCC-A-T----G--AA--A--TA----T-T-------T-G-ACATTTTCCC
gi|3302                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----A-G-----------AC-----A-----A-T-T--TGAGATGACTTTTA-----------T---C---C-G-TT--G--A-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-G-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TG----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3303                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----ATT---A-T-A--T------------A-----------T---C-----G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--A-------C-C---T-T----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-TA---A-A--T-C-A-T----G--AA--A----------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3304                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----A-GACAATTTGACATA-----ACCTTTA-TAT--T------------A-----------C---C---C-G-TT--G--G-A--A--G--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-G----A-A-------T---T-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3305                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----A-GACAATTTTTAATATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-G-CT--G--G-A--G--T--TC-A--T-------C-C---G-C----T-CA---T-A-A----G-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A--TA----T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3306                       :  TTA-C-A-CC-A--A-T-A--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------TG--T---C-G-TT--G--G-A--A--T--T--A--T-------C-C---T-C----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T--T---A-A--T-C-A-T----T--AA--A--TAT---T-T----A--TGG-ACATTTCCC
gi|3307                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----A-GACAATTTTGA-TATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-T-CT--G--G-A--G--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-C--------A--AA--A--TAT---T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3309                       :  TTA-C-A-TC-A----T-G--GA------G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---TT--C-G-AT--GCCG-A--AATT--TC-A--A-------C-C---T-C----T-CA---T-A-A----G-A-------G---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----GC-AA--A--TA----T-T----A--T-GAACATTTTCCC
gi|3310                       :  TTA-C-A-GC-A--A-T-G--GA-T----G-G------------A-----A-----A-T-T--C------------A-----------TATTT---C-G-CT--G--G-A--A--TG-TC-A--A-------C-CAGTT-CA---T-AGC--T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AACCA--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3308                       :  TTA-C-A-TC-A--GAT-G--GG-T----G-G------------A-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C-G-CA--G--G-A--A--T--TA-A----------C-C---T-C----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-G----A-A--T-C-A-T----G--AA--A--AA----T-A----A--T-
gi|3311                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-TT---G-G------------------A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-CT---T-TG---T-A-A----A-A-----------------T-GT---G-A--T-C-
gi|3312                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-C--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3314                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-GA-A--T--TC-A--T-------T-C---T-C----T-AA---T--------A-A-------T---G-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3318                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C-G-CT--T--G-A--A--T--TC-A--A-------T-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-AA------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A--TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3317                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---G-G-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C-G-CT--T--G-A--A--T--TC-A--A-------T-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-AA------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A--TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3319                       :   TA-T-G-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----C-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A--
gi|3315                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----G-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--
gi|3316                       :   TA-T-A-TC-A--A------GG------G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--T--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-G-------T---T-----T-GC---A-A--T-A-A-T----A--CA--A--TA----T-T----T--T-G-ATATTTTCCC
gi|3320                       :   TA-T-A-TC-AATG-T-G--GG-T----C-A-----------TG-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A------------------C----T-GA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--
gi|3321                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T-------------------A-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---TG--C-G-CT--G--G-T-----T--TC-A--T-------C-C---T-C----A-AA---T-A-A----A-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A--TA----T-TTTTGA--T-G-A---TTTCCC
gi|3323                       :   TA-A-A-TC-A--G-T-G--GG-T----G-G-----------TATATATAT----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-T-CTCTG--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AG---T-A-A----A-A-------T---T-----T-AT---A-A--T-C-
gi|3313                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----G-G-----------TCC----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-GGCA--T--TC-AA-T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----CGGT---A-A--C-A-G----------A--A--TA----T-TAA--A--T-GAACATa
gi|3325                       :   TA-C-AATC-AC-A-T-G--GG-T----G-C-----------TA-----A-----A-A-T--T------------A-----------C---C---C----T--G-------A--T--TG-G--T-------C-C---T-C----T-A----T-A-A----A---------T---T-----T-GT---G-A--T-C-A-T----G--AG--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3324                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-GC-AG-T----G-G-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-----------T-A--T-------CTC---T-C----T-AA---T-A-A----A-------------T-----T-GTAA-A-A--T-C-A-TA---A--AA--A--TA----A-T----A--T-GAACATTTCCTC
gi|3322                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----G-A-----------AA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-
gi|3326                       :   TA-T-A-TC-A--A-C-T--GG-T----A-G-----------TA-----A-------T-T--T------------A-----------T---CG--C-G-CC--G--A-A--A--T--TC----T-------A-C---TGC----T-A----T-A-A----A-C-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A--TAATATT-T----A--T-ATACATTTCCCC
gi|3328                       :    A-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----T-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--C-G--A--T--TC-A--T-------C-T---T-C----T-AA---T-A-A----T-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3329                       :    A-C-A-TCCA--A-T-G--GA-T----G-G-----------TA-----A-----A-C-T--TTAT---------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--AA-T--TC-A--A-------C-C---T-C----C-TA---T-A-T----G-A-------A---T-----T-GT---A-A--G-C-A-T----G--AA--ATATA----T-T----AT-T-G-ACATTTTCCC
gi|3330                       :     -C-A-TT-A--A-T-A--AG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---C-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A--TA----A-T----A--T-G-ACATTTT
gi|3331                       :     -C-A-TC-A----T-GA-GG-T----G-G-----------TA-----A-----G-T-----------------A-----------T---T---C-G-CT--A--G-A--A--T--TC-A--T-------T-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-AATG----T---T-----T-GT---A-G--T-C-A------G--AA--G--TA----T-A----G--T-G-ACA
gi|3332                       :       -A-TC-A--T-T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TG-A--T-------C-C---T-CTAATT-AA---T-G-A----A-A-------T---T-----T-GTA--A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-----ATTTCCCC
gi|3334                       :         -TC-A--GAT-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--A------------A-----------T---T---C-G-CA--G--G-A--A--T--TA-A----------C-C---T-C----T-TC---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--
gi|3337                       :            -A--A-T-G--GT-T----A-G-----------TA-----A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C-T-CT--G--G-G--A--A--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATATCCCC
gi|3338                       :                 -T-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--C-A--A--T--TC-A--T-------A-T---T-C----T-AA---T-A-G----C-A-------T---T-----T-GT---A-T--T-C-G-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3339                       :                  a-G--GG-T----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-A-CT--G--G-A--A--T--TA-A--T-------C-T---A-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A----------T----A--T-G-ACGTTTCCCC
gi|3335                       :                   -G--GG-T----G-T-----------T--------------T-T--T------------A-----------T---C---CTG-CT--G--G-A--A--T--CG-G--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A---------------------GT---G-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----C-T----A--T-G-ACATT
gi|3340                       :                     caaa-T----G-G-----------CC-----A-----A-T-T---------------A-----------T---T---T-G-CT--G--G-A--G--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T-------AA--A--TA----T-TG---A--G-G-ACATT
gi|3336                       :                         -T----G-G-----------TA-----G-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---A-C----G-AA---T-A-A----A-A-------T---G-----T-GT---A-A--T-
gi|3342                       :                    caacgat----G-G-----------TA-----A-----A-T-T--T------------AA----------T---C---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------T-A---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ATATaatg
gi|3343                       :                                -G-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-G-CT--G--G-A--G--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----AGG-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----C--AA--A---A-----------A--G-G-ACATTTTCCC
gi|3344                       :                                  -----------TA-----A-----A-T-T--GG-----------A-----------T---T---C-G-CT--G--G-A--A--C--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A--TA----T-T----
gi|3345                       :                                              A-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---A---C-G-CT--G--G-A--A--T--TC-A--A-------C-C---T-C----T-TA---T-A-A----G-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3346                       :                                               -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T-G-CT--G--A-A--A--T--TC-A--T-------C-----T-C----T-TA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3347                       :                                               -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C-G-CT--G--A-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-TA---T-A-AAATTA-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----T-T----AACT-G-ACAT
gi|3348                       :                                               -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-G-CT--G--T-A--G--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----G-G-------T---TTGTCCT-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A--TA----TCT----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3349                       :                                               -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T-G-CT--T--G-A--G--T--TC-A--T-------CTC---T-C----T-AC---T-A-A----G-G-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A--TA----T-T----A--G-G-ACATTTT
gi|3351                       :                                                     -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-AT--G--G-A--A--T--AC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-ACA----C-A-------T---T-----A-TT---A-A--T-C-A-T----T--AA--A--TA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3352                       :                                                     -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C-G-AT--G--G-A--A--T--AC-AATT-------C-C---T-C----T-AA---T-A-C----A-C-------T---T-----A-TT---A-A--T-C-A-T----G--AA--AT-TA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3353                       :                                                           -T-T--T------------A-----------G---C---T-A-GT--G--G-A--A--T--TC-A--T-------C-C---T-C----T-AA---T-A-A----A-A-------T---T-----T-GT---A-A--T-C-G-TGATCG--AA--A--TA----T-T----A--T-G-GCATT

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lowQualScore                  :     . . .  . .. . . ..  . ....  ...........  ..... ..... . . .. ............ ........... ... ... ..   .. .. . .. .. .. ..... . .. .. . ... . .... .  ... . . ....... . ...  ..... .  ... . .. . . . .... ..  .. .  .... . .... .. . .          
lowQualScore                  :     0 5 4  5 55 9 4 66  4 2222  88888888888  22222 44444 8 4 88 999999999999 88888888888 111 333 33   88 66 4 66 22 00 00000 4 88 33 8 777 8 3333 8  222 8 4 2222222 8 333  77777 4  777 4 88 8 4 8 1111 00  22 4  7777 4 5555 55 3 3          
consensus                     : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
Reference ( family-225 )      : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3247                       : ATTA-C-A-TC-A--G-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-G--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3248                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-------A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3249                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-A--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----T--T-G-ACATTTTCCC
gi|3250                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GA-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---G--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
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gi|3252                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---C-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3253                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-T--TT-----------A-----------T---C---C--GCT--G--T-A--A--T--T-----T-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-G--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATCTCCCC
gi|3254                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCA--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CCTGAT-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATTTTCC
gi|3255                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T------GCT--G--G-A-----T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA-----A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCC
gi|3256                       : ATTA-C-G-TC-A--A-A-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-T---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---CT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A-CA----C-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3257                       : ATTA-T-A-TC-A--A-G-G--TG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-------------GCATTTTCCC
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gi|3261                       : ATTA-C-A-TC-A--G-T-G--AG-T----GG-----------TG-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--TCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C------------------------------------T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCC
gi|3262                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-A----TG-----------TA-----A-----A-T-T---------------A-----------C---C---A--AGT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-AA---T-A-A-------A-A----T-----T-GT---G-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATTTTCCC
gi|3263                       : ATTA-T-A-AC-A--T-T-T--GG------GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-A---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ATAT
gi|3264                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-GAAGT-T----GG-----------TC-----A-------T-T--T------------AC----------T---C---C--GCT--G--G-A-----T--T-----C-A--T--C-----T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TG-------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-GCACATTTTCCC
gi|3265                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------T------A-----G-T-T--G------------AG----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--TGGT-----C-A--TCCC-C---T-C----T-AA---TAA-A-------A-A---TT-----T-GT---ACAGCTGC-A-TG---G--AA--A-TA----T-GA---A--T-G-ACATTTTCC
gi|3266                       : ATTA---A-TC-A--A-T-G--GG-T----AG-----------AC-----A-----A-T-T--T------------GAGATGACTTTTT---C---C--GTT--G--A-A--AA-T--T-----CGA--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TG----T-T----AC-T-G-ACAT
gi|3267                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----G-G--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----
gi|3269                       : ATTA-C-A-TC-G--A-T-G--AG-TT---GG-----------CA-----A-----G-T-T--T------------A-----------G---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-AT-T--C-T---T-C----T-AATT-T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T---A-T-------AA--A-TA----T-TA---A--T-A-ACATTTTCCC
gi|3270                       : ATTA-C-ACTC-A--A---G--AG-T-----------------TA-----A-----GGT-T--T------------A---------------C---C--ACT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----TTAA---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---T-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3271                       : ATTA-C-ACTC-A--A-T-G--A--T----GA-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-C--A--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A-TA----T-T----A--T-A---ATTTTCC
gi|3272                       : ATT--C-A-TC-A--A-T-G--AG-TACGTGG-----------TA-----T-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--ACT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-G----T-AA---T-A-A-------A-C---TT-----T-GC---C-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-A----T--T-G-ACATTTTCCC
gi|3273                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-C--T------------A-----------T---C---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----G-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A----------------T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AC--A-TA------T----A--T-G-
gi|3274                       : ATAA-C-G-TC-A--A-T-A--AA-T----GA-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--C-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-T----T-A------A-G-------A-A---TT-----T-GTATAA-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----G--T-G-ACAT
gi|3275                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GT-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---CC-GCT--T--A-A--A--T--T-----G-A---------------------A---T-A-A-------A-A---TC-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3276                       : ATTA-C-A-TA-A--A-T-A--GG-T----GG-----------TA-----A-------T-G--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---C-A--T-CAA-T----G--AA--A-
gi|3277                       : ATTA-C-A-TC-T--A-T-G--G--T----GG-----------TA-----A-----G-T-T---------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-G--A--A--T-----C-A--T--C-C---T-C---------------------------------------T---A-A--T-C-A-T----G---A--A-TG----T-T----A--T-G-ACATTTTTCC
gi|3278                       : ATTA-C-A-TC-ATGA-T-G--GG-T----------------------------------T--T------------A-----------C---C---C--GCT--G--G-A--AA-T--T-----C-------T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-------------ACATT
gi|3279                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---------------------------------------C-C---T-C----T-AA---C-A-AAACTTCTA-A---TT-----T-CT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-AC
gi|3280                       : ACTA-T-A-TC-A--A-T-A--GA-T----TG-----------TA-----T-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C--------------A-----------------------T-----T-GT---A-G--T-C-G-C----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3281                       : ATTA-C-AATC-G--T-T-T--GC-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--TTA----------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--C--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----TAAA---T-A-A-------A-AT--TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----GGAAA--A-TA----T-TGA--A--C-G-A-GTTCTCC
gi|3282                       : ATTAAT-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--TA-----------A-----------T---T---C--GCTA-G--G-A--A--T--TACTAAC-C--TG-C-C---T-A----T-AC---C-A-G-------A-T---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AAG-A-TA----T-T----A--T-G-AAATTTT
gi|3283                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T----------------------------------------T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-C-------A-C---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-A----G--AA--A-TAT---T-T----A--T-G-ACTTTTTCCC
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gi|3287                       : ATTAAC-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C------------------C--T-----C-A--T--T-A---A-C----A-AAATTT-A-A-------A-A---TT-----T-GA---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-A-AC
gi|3291                       :  TTA-T-A-TC-A--G-T-G--TG-T----GG-----------TA-----A-----AAT-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----T-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3292                       :  TTA-C-A-TT-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCTC
gi|3293                       :  TTA-C-A-TT-A--AAT-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--A-A--AA-T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3294                       :  TTA-C-A-TT-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T-----------ACATTTTCCC
gi|3295                       :  TTA-C-A-TC-T--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---C-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3296                       :  TTA-C-A-TC-T--A-TTG--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---C-A-A-------AGA---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3297                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--A-T---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-T-----T-T----A--T-T-ACATTTTCCC
gi|3298                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----T-T-A--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3299                       :  TTA-C-A-TC-A------------------G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----A-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TAG---T-T----A--T-G-ACATT
gi|3300                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--A--T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--GAA--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-T----C-TA---T-A-A-------G-AT--TT-----T-GT---A-A--TCC-A-T----G--AA--A-TA----T-T-------T-G-ACATTTTCCC
gi|3301                       :  TTA-C-AGTC-A--T-T-G--AG-T----GTAAT--------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G----A--A--T--G-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCC
gi|3302                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AG-----------AC-----A-----A-T-T--TGAGATGACTTTTA-----------T---C---C--GTT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TG----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3303                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----ATT---A-T-A--T------------A-----------T---C------GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-T----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-TA---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3304                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTGACATA-----ACCTTTA-TAT--T------------A-----------C---C---C--GTT--G--G-A--A--G--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-G-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3305                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTTTAATATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---G-C----T-CA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3306                       :  TTA-C-A-CC-A--A-T-A--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------TG--T---C--GTT--G--G-A--A--T--T-------A--T--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T--T---A-A--T-C-A-T----T--AA--A-TAT---T-T----A--TGG-ACATTTCCC
gi|3307                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTTGA-TATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--TCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A---------AA--A-TAT---T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3308                       :  TTA-C-A-TC-AG-A-T-G--GG-T----GG------------A-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCA--G--G-A--A--T--T-----A-A-----C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-G----A-A--T-C-A-T----G--AA--A-AA----T-A----A--T-
gi|3309                       :  TTA-C-A-TC-A----T-G--GA------GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---TT--C--GAT--GCCG-A--AATT--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-CA---T-A-A-------G-A---GT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----GC-AA--A-TA----T-T----A--T-GAACATTTTCCC
gi|3310                       :  TTA-C-A-GC-A--A-T-G--GA-T----GG------------A-----A-----A-T-T--C------------A-----------TATTT---C--GCT--G--G-A--A--TG-T-----C-A--A--C-CAGTT-CA---T-AGC--T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AACCA-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3311                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-TT---GG------------------A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-TG---T-A-A-------A-A----------T-GT---G-A--T-C-
gi|3312                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-C--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3313                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TCC----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-GGCA--T--T-----C-AA-T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----CGGT---A-A----C-A---------GA--A-TA----T-TAA--A--T-GAACAT
gi|3314                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCTG-G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-----------A-A---TG-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3315                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----G-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-
gi|3316                       :   TA-T-A-TC-A--A------GG------GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--T--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-G---TT-----T-GC---A-A--T-A-A-T----A--CA--A-TA----T-T----T--T-G-ATATTTTCCC
gi|3317                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C--GCT--T--G-A--A--T--T-----C-A--A--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AA--TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3318                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C--GCT--T--G-A--A--T--T-----C-A--A--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AA--TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3319                       :   TA-T-G-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----C-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-
gi|3320                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-GTGGG-T----CA-----------TG-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A-------------C----T-GA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-
gi|3321                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T------------------A-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---TG--C--GCT--G--G----T--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----A-AA---T-A-A-------A-G---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A-TA----T-TTTTGA--T-G-A---TTTCCC
gi|3322                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GA-----------AA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-
gi|3323                       :   TA-A-A-TC-A--G-T-G--GG-T----GG-----------TATATATAT----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--TCTCTG--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AG---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-
gi|3324                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-GC-AG-T----GG-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G----------------T-A--T--CTC---T-C----T-AA---T-A-A-------A------T-----T-GTAA-A-A--T-C-A-TA---A--AA--A-TA----A-T----A--T-GAACATTTCCTC
gi|3325                       :   TA-C-AATC-AC-A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-A-T--T------------A-----------C---C---C----T--G-------A--T--T-----G-G--T--C-C---T-C----T-A----T-A-A-------A-----TT-----T-GT---G-A--T-C-A-T----G--AG--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3326                       :   TA-T-A-TC-A--A-C-T--GG-T----AG-----------TA-----A-------T-T--T------------A-----------T---CG--C--GCC--G--A-A--A--T--T-----C----T--A-C---TGC----T-A----T-A-A-------A-C---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TAATATT-T----A--T-ATACATTTCCCC
gi|3328                       :    A-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----T-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--C-G--A--T--T-----C-A--T--C-T---T-C----T-AA---T-A-A-------T-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3329                       :    A-C-A-TCCA--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-C-T--TTAT---------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--AA-T--T-----C-A--A--C-C---T-C----C-TA---T-A-T-------G-A---AT-----T-GT---A-A--G-C-A-T----G--AAATA-TA----T-T----AT-T-G-ACATTTTCCC
gi|3330                       :     -C-A-TT-A--A-T-A--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---C-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A-TA----A-T----A--T-G-ACATTTT
gi|3331                       :     -C-A-TC-A----T-GA-GG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-----------------A-----------T---T---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AATGTT-----T-GT---A-G--T-C-A------G--AA--G-TA----T-A----G--T-G-ACA
gi|3332                       :       -A-TC-A--T-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----G-A--T--C-C---T-CTAATT-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GTA--A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-----ATTTCCCC
gi|3333                       :       -A-TC-AC-A-T-G--AG-TT---GG-----------TA-----T-----G-T-T--TT-----------A-----------T---C------ACT--G--A-A--A--T--T-----C-AA-T--C-C---TGT----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GC---C-A--T-C-C-T----T--GA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3334                       :         -TC-AG-A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--A------------A-----------T---T---C--GCA--G--G-A--A--T--T-----A-A-----C-C---T-C----T-TC---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--
gi|3335                       :           C-A--A-A-G--GG-T----GT-----------T--------------T-T--T------------A-----------T---C---CT-GCT--G--G-A--A--T--C-----G-G--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A--------------GT---G-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----C-T----A--T-G-ACATT
gi|3336                       :           C-A--A-C-G--AT-T----GG-----------TA-----G-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---A-C----G-AA---T-A-A-------A-A---TG-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--
gi|3337                       :            -A--A-T-G--GT-T----AG-----------TA-----A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C--TCT--G--G-G--A--A--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATATCCCC
gi|3338                       :              --A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--C-A--A--T--T-----C-A--T--A-T---T-C----T-AA---T-A-G-------C-A---TT-----T-GT---A-T--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3339                       :                   -G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--ACT--G--G-A--A--T--T-----A-A--T--C-T---A-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACGTTTCCCC
gi|3340                       :                         -T----GG-----------CC-----A-----A-T-T---------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T-------AA--A-TA----T-TG---A--G-G-ACATT
gi|3342                       :                           ----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------AA----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-A---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ATAT
gi|3343                       :                                G-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------AGG---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----C--AA--A--A-----------A--G-G-ACATTTTCCC
gi|3344                       :                                 -----------TA-----A-----A-T-T--GG-----------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--C--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A-TA----T-T----
gi|3345                       :                                             A-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---A---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3346                       :                                              -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-----T-C----T-TA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3347                       :                                              -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-TA---T-A-AAATT---A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----AACT-G-ACAT
gi|3348                       :                                              -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--T-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TTTGTCCT-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----TCT----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3349                       :                                              -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--T--G-A--G--T--T-----C-A--T--CTC---T-C----T-AC---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--G-G-ACATTTT
gi|3351                       :                                                    -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-ACA-------C-A---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-T----T--AA--A-TA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3352                       :                                                    -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-AATT--C-C---T-C----T-AA---T-A-C-------A-C---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-T----G--AA--ATTA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3353                       :                                                          -T-T--T------------A-----------G---C---T--AGT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-TGATCG--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATT

lowQualScore                  :     1 0 2  0 22 0 1 22  0 3333  66666666666  33333 22222 0 0 33 444444444444 33333333333 111 222 11   11 00 0 00 22 11 11111 0 11 11 0 000 0 3333 0  222 0 0 2222222 0 222  11111 0  111 0 11 0 0 0 2222 11  22 0  2222 0 3333 11 1 2          
lowQualScore                  :     . . .  . .. . . ..  . ....  ...........  ..... ..... . . .. ............ ........... ... ... ..   .. .. . .. .. .. ..... . .. .. . ... . .... .  ... . . ....... . ...  ..... .  ... . .. . . . .... ..  .. .  .... . .... .. . .          
lowQualScore                  :     0 5 4  5 55 9 4 66  4 2222  88888888888  22222 44444 8 4 88 999999999999 88888888888 111 333 33   88 66 4 66 22 00 00000 4 88 33 8 777 8 3333 8  222 8 4 2222222 8 333  77777 4  777 4 88 8 4 8 1111 00  22 4  7777 4 5555 55 3 3          
consensus                     : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
Reference ( family-225 )      : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3247                       : ATTA-C-A-TC-A--G-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-G--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3248                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-------A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3249                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-A--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----T--T-G-ACATTTTCCC
gi|3250                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GA-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---G--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3251                       : ATTT-T-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-T---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTTCC
gi|3252                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---C-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3253                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-T--TT-----------A-----------T---C---C--GCT--G--T-A--A--T--T-----T-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-G--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATCTCCCC
gi|3254                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCA--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CCTGAT-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATTTTCC
gi|3255                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T------GCT--G--G-A-----T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA-----A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCC
gi|3256                       : ATTA-C-G-TC-A--A-A-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-T---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---CT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--GA--A-CA----C-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3257                       : ATTA-T-A-TC-A--A-G-G--TG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-------------GCATTTTCCC
gi|3258                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--TCA--A--G-A--A--T--T-----T-A--C--C-C---A-C----T-AA---T-A-A-------A-A------------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3259                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-C--T------------AGTA--------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----G-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AAATA-TA----T-T----T--T-G-ACATT
gi|3260                       : ATTA-C-A-TC-A--AAT-G--GA-A----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---CGGAC--AGT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---TTA-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--C-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATTTCCC
gi|3261                       : ATTA-C-A-TC-A--G-T-G--AG-T----GG-----------TG-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--TCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C------------------------------------T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCC
gi|3262                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-A----TG-----------TA-----A-----A-T-T---------------A-----------C---C---A--AGT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-AA---T-A-A-------A-A----T-----T-GT---G-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATTTTCCC
gi|3263                       : ATTA-T-A-AC-A--T-T-T--GG------GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-A---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ATAT
gi|3264                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-GAAGT-T----GG-----------TC-----A-------T-T--T------------AC----------T---C---C--GCT--G--G-A-----T--T-----C-A--T--C-----T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TG-------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-GCACATTTTCCC
gi|3265                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------T------A-----G-T-T--G------------AG----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--TGGT-----C-A--TCCC-C---T-C----T-AA---TAA-A-------A-A---TT-----T-GT---ACAGCTGC-A-TG---G--AA--A-TA----T-GA---A--T-G-ACATTTTCC
gi|3266                       : ATTA---A-TC-A--A-T-G--GG-T----AG-----------AC-----A-----A-T-T--T------------GAGATGACTTTTT---C---C--GTT--G--A-A--AA-T--T-----CGA--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TG----T-T----AC-T-G-ACAT
gi|3267                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----G-G--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----
gi|3269                       : ATTA-C-A-TC-G--A-T-G--AG-TT---GG-----------CA-----A-----G-T-T--T------------A-----------G---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-AT-T--C-T---T-C----T-AATT-T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T---A-T-------AA--A-TA----T-TA---A--T-A-ACATTTTCCC
gi|3270                       : ATTA-C-ACTC-A--A---G--AG-T-----------------TA-----A-----GGT-T--T------------A---------------C---C--ACT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----TTAA---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---T-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3271                       : ATTA-C-ACTC-A--A-T-G--A--T----GA-----------TA-----A-----G-C-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-C--A--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A-TA----T-T----A--T-A---ATTTTCC
gi|3272                       : ATT--C-A-TC-A--A-T-G--AG-TACGTGG-----------TA-----T-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--ACT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-G----T-AA---T-A-A-------A-C---TT-----T-GC---C-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-A----T--T-G-ACATTTTCCC
gi|3273                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GC-----------TA-----A-----A-T-C--T------------A-----------T---C---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----G-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A----------------T-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AC--A-TA------T----A--T-G-
gi|3274                       : ATAA-C-G-TC-A--A-T-A--AA-T----GA-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--C-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-T----T-A------A-G-------A-A---TT-----T-GTATAA-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----G--T-G-ACAT
gi|3275                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GT-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---CC-GCT--T--A-A--A--T--T-----G-A---------------------A---T-A-A-------A-A---TC-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3276                       : ATTA-C-A-TA-A--A-T-A--GG-T----GG-----------TA-----A-------T-G--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---C-A--T-CAA-T----G--AA--A-
gi|3277                       : ATTA-C-A-TC-T--A-T-G--G--T----GG-----------TA-----A-----G-T-T---------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-G--A--A--T-----C-A--T--C-C---T-C---------------------------------------T---A-A--T-C-A-T----G---A--A-TG----T-T----A--T-G-ACATTTTTCC
gi|3278                       : ATTA-C-A-TC-ATGA-T-G--GG-T----------------------------------T--T------------A-----------C---C---C--GCT--G--G-A--AA-T--T-----C-------T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-------------ACATT
gi|3279                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---------------------------------------C-C---T-C----T-AA---C-A-AAACTTCTA-A---TT-----T-CT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-AC
gi|3280                       : ACTA-T-A-TC-A--A-T-A--GA-T----TG-----------TA-----T-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C--------------A-----------------------T-----T-GT---A-G--T-C-G-C----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3281                       : ATTA-C-AATC-G--T-T-T--GC-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--TTA----------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--C--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----TAAA---T-A-A-------A-AT--TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----GGAAA--A-TA----T-TGA--A--C-G-A-GTTCTCC
gi|3282                       : ATTAAT-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--TA-----------A-----------T---T---C--GCTA-G--G-A--A--T--TACTAAC-C--TG-C-C---T-A----T-AC---C-A-G-------A-T---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AAG-A-TA----T-T----A--T-G-AAATTTT
gi|3283                       : ATTA-C-A-TC-A--A-T----------------------------------------T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-C-------A-C---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-A----G--AA--A-TAT---T-T----A--T-G-ACTTTTTCCC
gi|3284                       : ATTA-C-A-TC-A----T-G--GA------GG-----------TA-----AT----A-T-TAAT------------A-----------T---TT--C--GCT--G----A--A--T--T-----C-A--A--C-T---T-T-------A---C-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-AA-T-C-A-TT---G--AA--A-TA----T-T----A--T-T-ACATTTTCCC
gi|3285                       : ATTA-TGA-TC-A--A-T-GC-GGCT----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---TTTGTTT-G--G-A--A--T--T-----C-A--TT-C-C---G-C----T-AAGT-T-A-G-------A-A---TTCGT--T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AC--A-CA----T------A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3286                       : ATTA-C-G-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T----------T--C-----------------------------------------------------A--T-T-A-G----G--AA--A-AA----T-T----A--G-G-ACATTTTCCC
gi|3287                       : ATTAAC-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C------------------C--T-----C-A--T--T-A---A-C----A-AAATTT-A-A-------A-A---TT-----T-GA---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-A-AC
gi|3291                       :  TTA-T-A-TC-A--G-T-G--TG-T----GG-----------TA-----A-----AAT-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----T-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3292                       :  TTA-C-A-TT-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T---A-------A-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCTC
gi|3293                       :  TTA-C-A-TT-A--AAT-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--A-A--AA-T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCCC
gi|3294                       :  TTA-C-A-TT-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T-----------ACATTTTCCC
gi|3295                       :  TTA-C-A-TC-T--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---C-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3296                       :  TTA-C-A-TC-T--A-TTG--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---C-A-A-------AGA---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3297                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--A-T---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-T-----T-T----A--T-T-ACATTTTCCC
gi|3298                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----T-T-A--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-ATT----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3299                       :  TTA-C-A-TC-A------------------G-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----A-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TAG---T-T----A--T-G-ACATT
gi|3300                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--A--T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---C--GCT--G--GAA--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-T----C-TA---T-A-A-------G-AT--TT-----T-GT---A-A--TCC-A-T----G--AA--A-TA----T-T-------T-G-ACATTTTCCC
gi|3301                       :  TTA-C-AGTC-A--T-T-G--AG-T----GTAAT--------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G----A--A--T--G-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-------GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCC
gi|3302                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AG-----------AC-----A-----A-T-T--TGAGATGACTTTTA-----------T---C---C--GTT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TG----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3303                       :  TTA-C-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----ATT---A-T-A--T------------A-----------T---C------GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-T----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-TA---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3304                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTGACATA-----ACCTTTA-TAT--T------------A-----------C---C---C--GTT--G--G-A--A--G--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-G-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3305                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTTTAATATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---G-C----T-CA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3306                       :  TTA-C-A-CC-A--A-T-A--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------TG--T---C--GTT--G--G-A--A--T--T-------A--T--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T--T---A-A--T-C-A-T----T--AA--A-TAT---T-T----A--TGG-ACATTTCCC
gi|3307                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T----AGACAATTTTGA-TATGCC-A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--TCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A---------AA--A-TAT---T-T----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3308                       :  TTA-C-A-TC-AG-A-T-G--GG-T----GG------------A-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---T---C--GCA--G--G-A--A--T--T-----A-A-----C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-G----A-A--T-C-A-T----G--AA--A-AA----T-A----A--T-
gi|3309                       :  TTA-C-A-TC-A----T-G--GA------GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---TT--C--GAT--GCCG-A--AATT--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-CA---T-A-A-------G-A---GT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----GC-AA--A-TA----T-T----A--T-GAACATTTTCCC
gi|3310                       :  TTA-C-A-GC-A--A-T-G--GA-T----GG------------A-----A-----A-T-T--C------------A-----------TATTT---C--GCT--G--G-A--A--TG-T-----C-A--A--C-CAGTT-CA---T-AGC--T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-AA-T-C-A-T----G--AACCA-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3311                       :  TTA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-TT---GG------------------A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-CT---T-TG---T-A-A-------A-A----------T-GT---G-A--T-C-
gi|3312                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-C--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----C-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3313                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TCC----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-GGCA--T--T-----C-AA-T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----CGGT---A-A----C-A---------GA--A-TA----T-TAA--A--T-GAACAT
gi|3314                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCTG-G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-----------A-A---TG-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3315                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----G-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-
gi|3316                       :   TA-T-A-TC-A--A------GG------GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--T--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-G---TT-----T-GC---A-A--T-A-A-T----A--CA--A-TA----T-T----T--T-G-ATATTTTCCC
gi|3317                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C--GCT--T--G-A--A--T--T-----C-A--A--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AA--TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3318                       :   TA-T-A-TC-A--C-TTG--GG-TT---GG-----------TA-----A-----A-T-TA-T------------A-----------T---C---C--GCT--T--G-A--A--T--T-----C-A--A--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AA--TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--TGG-ATATTTTCCC
gi|3319                       :   TA-T-G-TC-A--A-T-G--AG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----C-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-T----G--AA--A-
gi|3320                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-GTGGG-T----CA-----------TG-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A-------------C----T-GA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-
gi|3321                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GG-T------------------A-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---TG--C--GCT--G--G----T--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----A-AA---T-A-A-------A-G---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A-TA----T-TTTTGA--T-G-A---TTTCCC
gi|3322                       :   TA-T-A-TC-A--A-T-G--GA-T----GA-----------AA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-
gi|3323                       :   TA-A-A-TC-A--G-T-G--GG-T----GG-----------TATATATAT----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--TCTCTG--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AG---T-A-A-------A-A---TT-----T-AT---A-A--T-C-A-
gi|3324                       :   TA-C-A-TC-A--A-T-GC-AG-T----GG-----------TC-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G----------------T-A--T--CTC---T-C----T-AA---T-A-A-------A------T-----T-GTAA-A-A--T-C-A-TA---A--AA--A-TA----A-T----A--T-GAACATTTCCTC
gi|3325                       :   TA-C-AATC-AC-A-T-G--GG-T----GC-----------TA-----A-----A-A-T--T------------A-----------C---C---C----T--G-------A--T--T-----G-G--T--C-C---T-C----T-A----T-A-A-------A-----TT-----T-GT---G-A--T-C-A-T----G--AG--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3326                       :   TA-T-A-TC-A--A-C-T--GG-T----AG-----------TA-----A-------T-T--T------------A-----------T---CG--C--GCC--G--A-A--A--T--T-----C----T--A-C---TGC----T-A----T-A-A-------A-C---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TAATATT-T----A--T-ATACATTTCCCC
gi|3328                       :    A-C-A-TC-A--A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----T-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--C-G--A--T--T-----C-A--T--C-T---T-C----T-AA---T-A-A-------T-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA------T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3329                       :    A-C-A-TCCA--A-T-G--GA-T----GG-----------TA-----A-----A-C-T--TTAT---------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--AA-T--T-----C-A--A--C-C---T-C----C-TA---T-A-T-------G-A---AT-----T-GT---A-A--G-C-A-T----G--AAATA-TA----T-T----AT-T-G-ACATTTTCCC
gi|3330                       :     -C-A-TT-A--A-T-A--AG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---C-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-T-A-T----G--AA--A-TA----A-T----A--T-G-ACATTTT
gi|3331                       :     -C-A-TC-A----T-GA-GG-T----GG-----------TA-----A-----G-T-----------------A-----------T---T---C--GCT--A--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-AATGTT-----T-GT---A-G--T-C-A------G--AA--G-TA----T-A----G--T-G-ACA
gi|3332                       :       -A-TC-A--T-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----G-A--T--C-C---T-CTAATT-AA---T-G-A-------A-A---TT-----T-GTA--A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-----ATTTCCCC
gi|3333                       :       -A-TC-AC-A-T-G--AG-TT---GG-----------TA-----T-----G-T-T--TT-----------A-----------T---C------ACT--G--A-A--A--T--T-----C-AA-T--C-C---TGT----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GC---C-A--T-C-C-T----T--GA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTCCC
gi|3334                       :         -TC-AG-A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--A------------A-----------T---T---C--GCA--G--G-A--A--T--T-----A-A-----C-C---T-C----T-TC---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--
gi|3335                       :           C-A--A-A-G--GG-T----GT-----------T--------------T-T--T------------A-----------T---C---CT-GCT--G--G-A--A--T--C-----G-G--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A--------------GT---G-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----C-T----A--T-G-ACATT
gi|3336                       :           C-A--A-C-G--AT-T----GG-----------TA-----G-----A-T-T--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---A-C----G-AA---T-A-A-------A-A---TG-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--
gi|3337                       :            -A--A-T-G--GT-T----AG-----------TA-----A-----A-T-T--C------------A-----------T---C---C--TCT--G--G-G--A--A--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATATCCCC
gi|3338                       :              --A-T-G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--C-A--A--T--T-----C-A--T--A-T---T-C----T-AA---T-A-G-------C-A---TT-----T-GT---A-T--T-C-G-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3339                       :                   -G--GG-T----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--ACT--G--G-A--A--T--T-----A-A--T--C-T---A-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A---------T----A--T-G-ACGTTTCCCC
gi|3340                       :                         -T----GG-----------CC-----A-----A-T-T---------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T-------AA--A-TA----T-TG---A--G-G-ACATT
gi|3342                       :                           ----GG-----------TA-----A-----A-T-T--T------------AA----------T---C---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--T-A---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ATAT
gi|3343                       :                                G-----------TC-----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--G-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------AGG---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----C--AA--A--A-----------A--G-G-ACATTTTCCC
gi|3344                       :                                 -----------TA-----A-----A-T-T--GG-----------A-----------T---T---C--GCT--G--G-A--A--C--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-A-A-T----A--AA--A-TA----T-T----
gi|3345                       :                                             A-----A-----A-T-A--T------------A-----------T---A---C--GCT--G--G-A--A--T--T-----C-A--A--C-C---T-C----T-TA---T-A-A-------G-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACATTTTCCC
gi|3346                       :                                              -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---T--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-----T-C----T-TA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----A--T-G-ACAT
gi|3347                       :                                              -----A-----A-T-A--T------------A-----------T---C---C--GCT--G--A-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-TA---T-A-AAATT---A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----T-T----AACT-G-ACAT
gi|3348                       :                                              -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--G--T-A--G--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------G-G---TTTGTCCT-GT---A-A--T-C-A-T----G--AA--A-TA----TCT----A--G-G-ACATTTTTCC
gi|3349                       :                                              -----A-----A-T-T--T------------A-----------T---T---T--GCT--T--G-A--G--T--T-----C-A--T--CTC---T-C----T-AC---T-A-A-------G-G---TT-----T-GT---A-A--T-C-A-T----A--AA--A-TA----T-T----A--G-G-ACATTTT
gi|3351                       :                                                    -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-ACA-------C-A---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-T----T--AA--A-TA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3352                       :                                                    -----A-T-T--T------------A-----------T---C---C--GAT--G--G-A--A--T--A-----C-AATT--C-C---T-C----T-AA---T-A-C-------A-C---TT-----A-TT---A-A--T-C-A-T----G--AA--ATTA----T-T----A--T-G-AC-TTTTCCC
gi|3353                       :                                                          -T-T--T------------A-----------G---C---T--AGT--G--G-A--A--T--T-----C-A--T--C-C---T-C----T-AA---T-A-A-------A-A---TT-----T-GT---A-A--T-C-G-TGATCG--AA--A-TA----T-T----A--T-G-GCATT


blockSeqs                     :     A   C    TG   T AA    ACGT  ACAATTTGACA  TATAT CCTTT     AA GAGATGACTTTT AGATGACTTTT ATT GGA TT   CT         AT    ACTAA   AT CC         CTGA    ATT     AACTTCT   ATG  TGTCC    ATA   GC       GATC     AT    ATAT   TTTG AC G C
blockSeqs                     :     A   C    G    T TG    T     ACAATTTTTAA  TGCC  TT        A  TAT          GTA         G   T   C    A          A     .       T  G          TAAT    TT      AATT      T    CGT      AA    A        G        CC    T      GA   C  G A
blockSeqs                     :     .   A    C    T C     T     ACAATTTTGA   TGCC  T         A  TA           C           .   T   T    T          A     .       A  T          T       GT      .         T    .        A     A        T        AT    G      AA   T  G A
blockSeqs                     :     .   G    C    . C     T     AAT          C     T         A  T            G           .   G   .    G          A     .       A  .          T       C       .         A    .        .     A        A        G     T      A    .  . A
blockSeqs                     :     .   A    G    . A     T     .            .     .         A  A            A           .   G   .    .          A     .       .  .          A       .       .         A    .        .     .        .        .     T      A    .  . T
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     T     .            .     .         A  T            .           .   .   .    .          .     .       .  .          T       .       .         .    .        .     .        .        .     .      G    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         A  G            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         A  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         A  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :     .   .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :         .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :         .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :         .    .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :              .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :              .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :              .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :              .    . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :                   . .     .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  . .
blockSeqs                     :                           .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .  .  
blockSeqs                     :                           .     .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .    .     
blockSeqs                     :                                 .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .     .      .          
blockSeqs                     :                                 .            .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .                       
blockSeqs                     :                                              .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .                       
blockSeqs                     :                                              .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .                       
blockSeqs                     :                                              .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .        .                       
blockSeqs                     :                                              .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .                                
blockSeqs                     :                                              .     .         .  .            .           .   .   .    .          .     .       .  .          .       .       .         .    .        .     .        .                                
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