lowQualScore                  :                                             2222    0   0   33 1 0 11  11  0 11 0 0 0 11 0  11 4444  0 0  111 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                                             ....    .   .   .. . . ..  ..  . .. . . . .. .  .. ....  . .  ... . .  .   .      
lowQualScore                  :                                             7777    3   3   66 0 3 77  99  3 11 7 3 7 44 3  11 3333  3 3  999 6 3  6   8      
consensus                     :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--N-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( gi|21549 )        :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21551                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-GTTT-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21562                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA---TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21560                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-CTT--A-GG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21555                      :                                      AGCGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21554                      :                                      AGCGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21548                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21564                      :                                      AACGAAC--G-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-C-T-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21565                      :                                      AGCGAAC--G-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GACCCT-G--T-T-C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21559                      :                                      AGCGAAC--T-TAGA-GCA-G-C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21563                      :                                      AGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21550                      :                                      AGCGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CGTagag
gi|21577                      :                                      AGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21553                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGCGAAC--G-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21590                      :                                      AGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21586                      :                 agcagtcgtggacctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21585                      :               agagcagtcgtggagctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21584                      :               agagcagtcgtggagctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21583                      :               agagcagtcgtggagctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21582                      :               agagcagtcgtggagctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21578                      :               agagcagtcgtggagctgttctaAGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21574                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21572                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21571                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21598                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21576                      :                 agcagtcgtggagctgttctaAGCGAAC--G-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21573                      :               agagcagtcgtggacctgttctaAGCGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21602                      :               agagcagtcctggacctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-
gi|21588                      :                 agcagtcgtagagctgttctaAGTGAAC--T-TAGA-GCA-GTC--G-T-G--Gg
gi|21558                      :                  aagtcgttggacctgttctaAGCGAAC--G-TGGA-GCA-GTC--G------GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21490                      :                                      AGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21570                      :                                    agAGC-AAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-g
gi|21599                      :            acgtagagcagtcgtgacctgttctaAGTGAAC--T-TGCA-GCA-GTC--G-T-G--GA-
gi|21601                      :                 agcagtcgtagagctgttctaAGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-g
gi|21595                      :                 agcagtcgtagagctgttctgAGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-g
gi|21487                      :                 agcagtcatagagctgttctaAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21492                      :                                    agAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21506                      :                                    agAGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--A-T-A--GA-a
gi|21520                      :   agagcagtcgtggagcagtcagcagaactgttctaAGCGGTC--A-TAAA-GCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21589                      :                                    aaAGTGAAC--T-TGGAAGCA-GTC--G-T-A--GA-taga
gi|21488                      :                aagcagtcgtagagcagttctaAGC-AGC--TCTAGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21535                      :                                    agAGC-AGC--TCTAGA-GCA-GTC--AAC-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21561                      :                                    agAGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--
gi|21501                      :      agcagtcgtgagcagtcagcagaactgttctaAGTGAACC-T-TGGA-GCA-GTC--A-T-G--GA-aatagag
gi|21495                      :  agagcagcctagcaagcagtcagcagagctgttctaAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TAAA-AG--T--GAAA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21532                      :                                    agAGCGGTC--A-TAAA-GCA-ATC--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21491                      :                                    agAGC-AGC--TCTAGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAaaa
gi|21525                      :                                    agAGCGGTC--A-TAAA-GCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AA--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGg
gi|21526                      :                         agagcagacgtaaAGCAGACATT-TAAA-GCA-GTC--T-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21528                      :                                    agAGCGGTC--C-TAAA-GCA-GTA--A-T-A--AA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATacataaag
gi|21530                      :                         aaagcagacgtaaAGCGGTC--A-TAAA-GCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21515                      :                         agagcagacgcaaAGCGATC--A-TA-A-GCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-Caaag
gi|21502                      :                         agagcagacgcgaAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-GC-GA-CCT-G--T-T-C-T--ACAG--T--G-AA-C-TT---G-G-GCAAGT-CATGGAaaaga
gi|21498                      :                                    agAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CC--G--T-T-C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGA
gi|21524                      :                                    agAGCAGAC--A-TAAA-GCG-GTC--A-T-A--AA-ATT-A--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGg
gi|21566                      :                                    agAGTGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--acat
gi|21505                      : agcagacgcaaatgacctgtacaatgaccagtatctaAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-ATAGA-CCT-G--TCT-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TTCA-G-A-GC-AGT-Caatagag
gi|21503                      :                                    agAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--GAT-G--GA-CGTAG--T-T-C-T--A-AG--T--GAAA-C-TT-GCG-A-GC-AGT-CATagagag
gi|21543                      :                                    agAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-CG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-a
gi|21507                      :                                     gAGCAGAC--G-CAAA-GCT-GTC--T-T-A--GA-CCT-G--T-T-CTT--A-AGA-T--T-AA-C--T-A-G-A-GC-AGT-Ccggacttagag
gi|21593                      :                                       agGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-agagag
gi|21603                      :               agcagtcgtggacctgttctaagtttGAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-
gi|21596                      :                  agcaatcgtagagctgttctaaatAAC--T-TGGA-GCA-GTC--A-T-G--GA-g
gi|21581                      :                 agcagtcgtggagctgttctaagttAAC--T-TGGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-g
gi|21509                      :               agagcagtcgtagagctgttctaagttAAC--T-TGGA-GCA-GTC--A-T-G--GA-g
gi|21570                      :  agagcagcttctaagagcagtcagcagagctgttctaagttAC--G-TAGA-GCA-GTC--G-T-G---A-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C----AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21496                      :                                           AC--TCTAGA-GCA--TC--A-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21514                      :                                      agagcAC--G-TAAA-GCG-GTC--A-T-A--AA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAagag
gi|21521                      :                                         agatcag-TGGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGA
gi|21506                      :                                      agagcagtcg-TGGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21546                      :                                      agagcagtcg-TAGA-GCA-GTCA-G-C-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGg
gi|21517                      :                                       gagcagtcg-TGGA-GCA-GTC--A-G-C--GA-GCT-GC-T-T-C-T--A-AG--TT-G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGActctagag
gi|21544                      :                                       agagcagtg-TAGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21567                      :                                       gagcagtcg-TAGA-GCA-GTCAGG-C-A--GAGCCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-T-T----G-G-GC-AGT-CATAGAaaag
gi|21577                      :                                           agcagtcgGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21585                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21582                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21578                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21574                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21571                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                                  aGA-GCA-GTC--C-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                                  aGA-GCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21509                      :                                                  aGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21561                      :                                     agagcagcttctaaGA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                                          agcagtcgtGA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--TG-G-AA-C-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAaatagag
gi|21590                      :                                     agagcaggacgcacaA-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21598                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21593                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AGTTT--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21602                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21599                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21596                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21601                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--G-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21595                      :                                                    A-GCA-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                                    A-GCA-ATC--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AA--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21597                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21592                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-Ag
gi|21589                      :                                                    A-GCA-GTC--G-T-A--GA-GCA-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGAtcacagag
gi|21494                      :                                                   aA-GCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-TG--T--A-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21501                      :                                      agcgcagacgcaacA-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AACC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :                                      agagcagcctagcaA-GCA-GTC--A-T-G--GA-CTT-G--T-T-C-T--A-AG--A--T-AC-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21531                      :                             agagcagacgcaaagctgtcataA-GCA-GTC--A-T-G--GA-ACT-G--T-T-C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGg
gi|21522                      :                                         agagcagccaaA-GCA-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-CT-A-G-A-GC-AG
gi|21516                      :                              agagcagacgtaaggggtcataA-GCAAGTC--A-T-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AGC-T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAacataaag
gi|21513                      :                              agagcagacgccaggctgtcatA-GCT-GTC--AAT-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-CGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAg
gi|21512                      :                                     agagcaagaccgcaaA-GCA-GTC--A-T-GA-GA-ACT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21499                      :                            agagcagacgcaaagcggtcacaaA-GCA-GTC--A-T-GA-GA-ACT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGcaaag
gi|21511                      :                             agagcagacgcaaagcggtcgcaA-GCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAcaaag
gi|21527                      :                             agagcagacacaaagcggtcataA-GCA-ATT--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--C-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGA
gi|21504                      :                                       agatcagtcataaA-GCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATg
gi|21493                      :                            agagcagacgcgaagcggtcattaA-GCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATaaa
gi|21534                      :                             agagcagacgcgaagcggtcataA-ACA-GTC--A-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21497                      :                              agagcagacgtaaatcggtcata-GCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGA
gi|21529                      :                                        agagcagctctag-GCG-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AT-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTg
gi|21588                      :                                          aaagcagacacaatA-GTC--G-TTG--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGaaag
gi|21604                      :                                                        a-GTC--G-T-G--GA-C-T-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-C
gi|21500                      :                                                       ct-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TTC-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21547                      :                                            agagagacgcaaactTC--A-T-GT-GA-GCT-G--T-C-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGAg
gi|21606                      :                                        gaccagccggcaaaggctgtC--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-CT-G-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21497                      :                                                            C--A-T-G--GA-C-T-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGaca
gi|21519                      :                                      agagcagctctaggcagtcagcagag-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAgag
gi|21608                      :                                       agcgcagtacgcatacaggctgatcat-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21569                      :                                                                  -G--GA-CCT-GT-T-T-C-T--A-AG--TTGA-AA-C-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAa
gi|21566                      :                                              gcagacgcaaagctgtaacata--GA-CCA-G--TAT-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21564                      :                                                 agcagacgcaaatgacctgtacaatCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-CA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-Caatagag
gi|21596                      :                                                     aacgaacgtggagcagtcgtgCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcgtgga
gi|21581                      :                                                             agcagtcgtggagCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcatggag
gi|21521                      :                                                           agagcagtcgtagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcgtagag
gi|21604                      :                                               agagcagtcgtggagcagtcagcagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-CA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-Ctcgcggag
gi|21520                      :                                                                  ctgtcgtgCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-tc
gi|21488                      :                                                 aaagcggtcataaagcagtcatagaCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcattaga
gi|21535                      :                                               agagcagctctagagcagtcagcagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcatggag
gi|21509                      :                                               agagcagctctagagcagtcaacagagCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcgtaga
gi|21532                      :                                             agagcagcttctaagagcagtcagcagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-tcatggag
gi|21491                      :                                                 agagcggtcataaagcaatcatagaCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGacgtaaa
gi|21531                      :                                               agagcagctctagagcagtcagcagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-AC-AGT-tcaaggag
gi|21525                      :                                                   agagcagccaaagcagtcatggaCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-T-TT-A-G-A-AC-AGT-
gi|21522                      :                                      agagcagacgtaaagcggtcataaagcagtcatagaCT-G--C-T-C-T--A-GG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGacataaag
gi|21496                      :                                       agagcagacgtaaggggtcataagcagtcatagagCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGacataaag
gi|21544                      :                                                  agagcactctagagcatcacagagCT-G--A-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGtcatgagag
gi|21512                      :                                                gagcagtcgtagagcagtcagcagagCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-tcataaag
gi|21499                      :                                     agagcagacgcaaagcggtcacaaagcagtcatgagaCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-acgcaaag
gi|21608                      :                                      agagcagacgcaaagcggtcgcaagcagtcatgagaCT-G--C-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGacgcaaag
gi|21526                      :                                                                      ggacCT-G--C-T-C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-tca
gi|21527                      :                                               agagcagacatttaaagcagtcttagaCT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-GA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-acataaag
gi|21528                      :                                                 agatcagtcataaagcaattatagaCT-G--A-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-acatagag
gi|21529                      :                                      aaagcagacgtaaagcggtcctaaagcagtaataaaCT-G--C-T-C-T--A-AG--A--T-AA-C-TT-A-G-A-AC-AGT-tcataaag
gi|21563                      :                                                                 aaagcagacacaatgcggtcataga-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAacgtaaag





Alignments
lowQualScore                  :                                   9999 0     0   44 1 0 22  22  0 11 0  0 11 0  11 3333   0  0 1 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                                   .... .     .   .. . . ..  ..  . .. .  . .. .  .. ....   .  . . . .  .   .      
lowQualScore                  :                                   3333 6     4   77 2 4 22  00  4 88 8  8 88 4  33 2222   8  4 2 8 4  8   9      
consensus                     :                            AGCGGAC--N-TAGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( family-209 )      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--N-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21487                      :                            AGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21488                      :                          agAGC-AGC--TCTAGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21490                      :                          agAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21491                      :                          agAGC-AGC--TCTAGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAg
gi|21492                      :                          agAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21493                      :                                        agAGCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21494                      :                   agagcagacgcgaagcggtcataAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-TG--T--A-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAaaa
gi|21495                      :              agcgcagacgcaacAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-TAAA-AG--TG-A-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21496                      :                               agAC--TCTAGAGCA--TC--A-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21497                      :                                      agagcGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGAagag
gi|21498                      :               agagcagctctagAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-G--GA-CC--G--T-TC-T--A-A---T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGAg
gi|21499                      :                                        agAGCA-GTC--A-T-GA-GA-ACT-G--C-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21500                      :                       agagcagacgcaaagcggtcgca-GTC--A-T-G--GA-CCT-GT-T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT---G-A-GC-AGT-CATAGAcaaag
gi|21501                      :                           agagagacgcaaactAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AACCTT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21502                      :              agagcagcctagcaAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-GC-GA-CCT-G--T-TC-T--ACAG--T--G-AAC-TT-G-G---GCAAGT-CATGGAg
gi|21503                      :                          agAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--GAT-G--GA-CGTAG--T-TC-T--A-AG--TG-A-AAC-TT-GCG-A-GC-AGT-CAT
gi|21504                      :                                        agAGCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21505                      :    agagcagacgcgaagcggtcattaAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-ATAGA-CCT-G--TCTC-T--A-AG--T--T-AAC-TTCA-G-A-GC-AGT-Caaa
gi|21506                      :                                    ag-TGGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAagagag
gi|21507                      :                  agagcagtcgAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--T-T-A--GA-CCT-G--T-TCTT--A-AGA-T--T-AAC--T-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                                       agGAGCT-GTC--A-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--TG-G-AAC-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAagagag
gi|21509                      :                          agagcaggacgcacaGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :                            agagcagcttctaaAGCA-GTC--A-T-G--GA-CTT-G--T-TC-T--A-AG--A--T-ACC-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21511                      :                   agagcagacgcaaagctgtcataAGCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21512                      :                   agagcagacacaaagcggtcataAGCA-GTC--A-T-GA-GA-ACT-G--C-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGA-CG
gi|21513                      :                  agagcagacgcaaagcggtcacaaAGCT-GTC--AAT-G--GA-CCT-G--T-TC-TA-A-AG--T--G-AACGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAcaaag
gi|21514                      :                  agagcaagaccgcaaAC--G-TAAAGCG-GTC--A-T-A--AA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21515                      :                     agatcagAGCGATC--A-TA-AGCA-GTC--A-C-A--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-GT-C-G-A-GC-GGT-C
gi|21516                      :                             agagcagacgcgaAGCAAGTC--A-T-A--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AGC-T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAaaaga
gi|21517                      :                agagcagacgccaggctgtcat-TGGAGCA-GTC--A-G-C--GA-GCT-GC-T-TC-T--A-AG--T--TGAAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21519                      :                                            agagcagtg-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAg
gi|21520                      : agcgcagtacgcatacaggctgatcatAGCGGTC--A-TAAAGCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21521                      :                                    aa-TGGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGAtaga
gi|21522                      :                                agagcagtcgAGCA-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-CT-A-G-A-GC-AGg
gi|21524                      :      agagcagacgtaaggggtcataAGCAGAC--A-TAAAGCG-GTC--A-T-A--AA-ATT-A--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21525                      :                          agAGCGGTC--A-TAAAGCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AA--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGacat
gi|21526                      :               agagcagacgtaaAGCAGACATT-TAAAGCA-GTC--T-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21527                      :                                        agAGCA-ATT--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--C-AAC-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGAacataaag
gi|21528                      :               agatcagtcataaAGCGGTC--C-TAAAGCA-GTA--A-T-A--AA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21529                      :                              aaagcagacgtaaGCG-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-ATC-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTaaag
gi|21530                      :              aaagcagacacaatAGCGGTC--A-TAAAGCA-GTC--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-C--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21531                      :                             agagcagacgcaaAGCA-GTC--A-T-G--GA-ACT-G--T-TC-T--C-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGaaag
gi|21532                      :                 agagcagccaaAGCGGTC--A-TAAAGCA-ATC--A-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21534                      :                                        agAACA-GTC--A-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21535                      :     agagcagacgtaaatcggtcataAGC-AGC--TCTAGAGCA-GTC--AAC-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21543                      :                          agAGCAGAC--G-CAAAGCT-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-CG--T--T-AAC-TT-A-G-A-GC-
gi|21544                      :                                     g-TAGAGCA-GTCA-G-C-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-A-G-A-TC-AGT-CATcggacttagag
gi|21546                      :                             gagcagtcg-TAGAGCA-GTCA-G-C-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGaaag
gi|21547                      :                                       gagcagtcgTC--A-T-GT-GA-GCT-G--T-CC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGActctagag
gi|21548                      :        gaccagccggcaaaggctgtAGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21549                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21550                      :                            AGCGAAC--T-TAGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT---G-A-GC-AGT-CGT
gi|21551                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-GTTT-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21553                      :                            AGCGAAC--G-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-TA-A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21554                      :                            AGCGAAC--T-TAGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21555                      :                            AGCGAAC--T-TAGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AA--TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21558                      :                            AGCGAAC--G-TGGAGCA-GTC--G------GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21559                      :                            AGCGAAC--T-TAGAGCA-G-C--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21560                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TCTT--A-GG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21561                      :                                         GAGCA-GTCA-G-C-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21562                      :                   agcagtcgtAGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAaatagag
gi|21563                      :                            AGCGAAC--T-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-TA-A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21564                      :                            AACGAAC--G-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GA-C-T-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAagag
gi|21565                      :                            AGCGAAC--G-TGGAGCA-GTC--G-T-G--GACCCT-G--T-TC-T--A-A---T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21566                      :                                                         --GA-CCA-G--TATC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21567                      :             agcagacgcaaatgacctgtacaat-TAGAGCA-GTCAGG-C-A--GAGCCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AA--TT-G-G---GC-AGT-CATAGAaatagag
gi|21569                      :                                               agcagtcg-G--GA-CCT-GT-T-TC-T--A-AG--TTGA-AAC-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAg
gi|21570                      :           gcagacgcaaagctgtaacataAC--G-TAGAGCA-GTC--G-T-G---A-CCT-G--T-TC-T--A-AG-----C-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21571                      :                                         GAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                        aGAGCA-GTC--C-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21574                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21577                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21578                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--C--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21582                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21585                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                        aGAGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21588                      :                                            aA-GTC--G-TTG--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGg
gi|21589                      :                                         aAGCA-GTC--G-T-A--GA-GCA-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGA
gi|21590                      :                                         aAGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21592                      :                                          AGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT---G-A-GC-A
gi|21593                      :                                          AGCA-GTC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AGTTT--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAtcacagag
gi|21595                      :                                          AGCA-GTC--A-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21596                      :                                          AGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21597                      :                                          AGCA-GTC--G-T-A--GA-ACT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21598                      :                                          AGCA-GTC--G-T-G--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21599                      :                                          AGCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21601                      :                                          AGCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--G-AG--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21602                      :                                          AGCA-GTC--G-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                          AGCA-ATC--G-T-A--GA-GCT-G--T-TC-T--A-AA--T--G-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21604                      :                                              -GTC--G-T-G--GA-C-T-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-TT-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21606                      :                                               ctC--G-T-G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--G-AAC-CT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21608                      :                                                       -G--GA-CCT-G--T-TC-T--A-AG--T--T-AAC-TT-G-G-A-GC-AGT-Caca





Alignments
lowQualScore                  :                               0  2 1 00 11111    0  00 44 1 0 22  22  0 11 0 0 0 11 0  11 1111  0 0  0 1 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                               .  . . .. .....    .  .. .. . . ..  ..  . .. . . . .. .  .. ....  . .  . . . .  .   .      
lowQualScore                  :                               7  5 0 77 11111    4  66 77 2 8 22  00  4 33 8 4 8 88 4  33 7777  4 4  4 2 8 4  8   9      
consensus                     :                            AGC-GGACGT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( family-209 )      :                            AGC-GGACNT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21487                      :                            AGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21488                      :                          agAGC-AGCTCT--A--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21490                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21491                      :                          agAGC-AGCTCT--A--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAg
gi|21492                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21493                      :                          agAGC-GGTCAT--A-----AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21494                      :                agagcagacgcgaGC-AGACGC--A--AC-AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-TG--T--A-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAaaa
gi|21495                      :                         agcAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TAAA-AG--T--GAAA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21496                      :                                   agT--A--G--AGCA--T--C--A-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21497                      :                   agagcactcAGC-AGCTCT--A--G---GCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGAagag
gi|21498                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CC--G--T-T-C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGAg
gi|21499                      :                          agAGC-GGTCGC--A-----AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21500                      :                    agagcagacgcaaGACGC--A--A--A-CT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-TTC-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CATAGAcaaag
gi|21501                      :                       agagaAGC-AG-CCT--A--GCAAGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AACC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21502                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-GC-GA-CCT-G--T-T-C-T--ACAG--T--G-AA-C-TT-G-G---GCAAGT-CATGGAg
gi|21503                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--GAT-G--GA-CGTAG--T-T-C-T--A-AG--T--GAAA-C-TT-GCG-A-GC-AGT-CAT
gi|21504                      :                          agAGC-GGTCAT--T--A--AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21505                      :               agagcagacgcgaAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-ATAGA-CCT-G--TCT-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TTCA-G-A-GC-AGT-Caaa
gi|21506                      :                          agAGC-AGTCGT--G--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAagagag
gi|21507                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--T-T-A--GA-CCT-G--T-T-CTT--A-AGA-T--T-AA-C--T-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                          agAGCAGGACGC--ACAG--AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--TG-G-AA-C-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAagagag
gi|21509                      :                                    ag--A--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :               agagcagcttctaAGC-TGTCAT--A-----AGCA-GT--C--A-T-G--GA-CTT-G--T-T-C-T--A-AG--A--T-AC-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21511                      :               agagcagacgcaaAGC-GGTCAT--A-----AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21512                      :               agagcagacacaaAGC-GGTCAC--A--A--AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G--C-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CG
gi|21513                      :                      agagcagacgcaaCGC--A--A--AGCT-GT--C--AAT-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-CGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAcaaag
gi|21514                      :                    agagcaagacC-AGACGT--A--A--AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21515                      :                        agatAGC-GATCAT--A-----AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-C
gi|21516                      :                               agagcagacgcga--AGCAAGT--C--A-T-A--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AGC-T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAaaaga
gi|21517                      :      agagcagacgccaggctgtcatAGC-AG-TGT--G--G--AGCA-GT--C--A-G-C--GA-GCT-GC-T-T-C-T--A-AG--TT-G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21519                      :                                                         ag-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAg
gi|21520                      : agcgcagtacgcatacaggctgatcatAGC-GGTCAT--A--A--AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21521                      :                          aaAGC-AGTCGT--G--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGAtaga
gi|21522                      :                          agAGG-GGTCAT--A-----AGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-CT-A-G-A-GC-AGg
gi|21524                      :                agagcagacgtaAGC-AGACAT--A--A--AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ATT-A--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21525                      :                          agAGC-GGTCAT--A--A--AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AA--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacat
gi|21526                      :               agagcagacgtaaAGC-AGACATTTA--A--AGCA-GT--C--T-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21527                      :                                 agCAT--A--A--AGCA-AT--T--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--C-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGAacataaag
gi|21528                      :                    agatcagtAGC-GGTCCT--A--A--AGCA-GT--A--A-T-A--AA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21529                      :               aaagcagacgtaaAGC-AGACAC--A--A--TGCG-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AT-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTaaag
gi|21530                      :                          aaAGC-GGTCAT--A--A--AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21531                      :                         agagcagacgcaa--A--A--AGCA-GT--C--A-T-G--GA-ACT-G--T-T-C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGaaag
gi|21532                      :                   agagcagccAGC-GGTCAT--A--A--AGCA-AT--C--A-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21534                      :                            agC-GGTCAT--A--A--A-CA-GT--C--A-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21535                      :             agagcagacgtaaatAGC-AGCTCT--A--G--AGCA-GT--C--AAC-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21543                      :                          agAGC-AGACGC--A--A--AGCT-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-CG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-
gi|21544                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATcggacttagag
gi|21546                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G--AGCA-GT--CA-G-C-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGaaag
gi|21547                      :                                                   gT--C--A-T-GT-GA-GCT-G--T-C-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGActctagag
gi|21548                      :        gaccagccggcaaaggctgtAGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21549                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21550                      :                            AGC-GAACTT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CGT
gi|21551                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-GTTT-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21553                      :                            AGC-GAACGT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21554                      :                            AGC-GAACTT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21555                      :                            AGC-GAACTT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA---TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21558                      :                            AGC-GAACGT--G--G--AGCA-GT--C--G------GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21559                      :                            AGC-GAACTT--A--G--AGCA-G---C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21560                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-CTT--A-GG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21561                      :                            AGC-AGTCGT-----G--AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21562                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAaatagag
gi|21563                      :                            AGC-GAACTT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21564                      :                            AAC-GAACGT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-C-T-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAagag
gi|21565                      :                            AGC-GAACGT--G--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GACCCT-G--T-T-C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21566                      :                                                               --GA-CCA-G--TAT-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21567                      :   agcagacgcaaatgacctgtacaatAGC-AGTCGT--A--G--AGCA-GT--CAGG-C-A--GAGCCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA---TT-G-G---GC-AGT-CATAGAaatagag
gi|21569                      :                             GC-AGACGC--A--A--AGCT-GTAAC--A-TAG--GA-CCT-GT-T-T-C-T--A-AG--TTGA-AA-C-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAg
gi|21570                      :                                  ACGT--A--G--AGCA-GT--C--G-T-G---A-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C----AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21571                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--C-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21574                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21577                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21578                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21582                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21585                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                      --A--G--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21588                      :                                                 A-GT--C--G-TTG--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGg
gi|21589                      :                                           a--AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCA-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGA
gi|21590                      :                                           a--AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21592                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-A
gi|21593                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AGTTT--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAtcacagag
gi|21595                      :                                            --AGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21596                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21597                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-A--GA-ACT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21598                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21599                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21601                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--G-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21602                      :                                            --AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                            --AGCA-AT--C--G-T-A--GA-GCT-G--T-T-C-T--A-AA--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21604                      :                                                  -GT--C--G-T-G--GA-C-T-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21606                      :                                                   ct--C--G-T-G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--G-AA-C-CT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21608                      :                                                             -G--GA-CCT-G--T-T-C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Caca





Alignments
lowQualScore                  :                               0  0 0 00 00 222222222    0  00 44 1 0 22  22  0 0 0 11 0 11 0  11 1111  0 0  0 1 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                               .  . . .. .. .........    .  .. .. . . ..  ..  . . . .. . .. .  .. ....  . .  . . . .  .   .      
lowQualScore                  :                               7  8 7 77 77 777777777    4  66 77 2 8 22  00  4 8 8 00 8 88 4  33 7777  4 4  4 2 8 4  8   9      
consensus                     :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( family-209 )      :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21487                      :                            AGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21488                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21490                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21491                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAg
gi|21492                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21493                      :                          agAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21494                      :                agagcagacgcgaGC-AGACGC--A--AC--------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-TG--T--A-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAaaa
gi|21495                      :                         agcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TAAA-AG--T--GAAA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21496                      :                                   agT--A--G---------AGCA--T--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21497                      :                            agagcactcT--A--G----------GCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGAagag
gi|21498                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CC--G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGAg
gi|21499                      :                          agAGC-GGTCGC--A------------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21500                      :                    agagcagacgcaaGACGC--A--A---------A-CT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-TT-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CATAGAcaaag
gi|21501                      :                       agagaAGC-AGCC-T--A--GCA-------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AACC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21502                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-GC-GA-CCT-G-T-T--C-T--ACAG--T--G-AA-C-TT-G-G---GCAAGT-CATGGAg
gi|21503                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--GAT-G--GA-CGTAG-T-T--C-T--A-AG--T--GAAA-C-TT-GCG-A-GC-AGT-CAT
gi|21504                      :                          agAGC-GGTCAT--T--A---------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21505                      :               agagcagacgcgaAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-ATAGA-CCT-G-TCT--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TTCA-G-A-GC-AGT-Caaa
gi|21506                      :                          agAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAagagag
gi|21507                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--T-T-A--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-AGA-T--T-AA-C--T-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                          agAGCAGGACGC--ACAG---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--TG-G-AA-C-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAagagag
gi|21509                      :                                    ag--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :               agagcagcttctaAGC-TGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-CTT-G-T-T--C-T--A-AG--A--T-AC-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21511                      :               agagcagacgcaaAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21512                      :               agagcagacacaaAGC-GGTCAC--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CG
gi|21513                      :                      agagcagacgcaaCGC--A--A---------AGCT-GT--C--AAT-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-CGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAcaaag
gi|21514                      :                    agagcaagacC-AGACGT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21515                      :                        agatAGC-GATCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-C
gi|21516                      :                               agagcagacgcga---------AGCAAGT--C--A-T-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGC-T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAaaaga
gi|21517                      :      agagcagacgccaggctgtcatAGC-AG-TGT--G--G---------AGCA-GT--C--A-G-C--GA-GCT-GCT-T--C-T--A-AG--TT-G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21519                      :                                                                ag-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAg
gi|21520                      : agcgcagtacgcatacaggctgatcatAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21521                      :                          aaAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGAtaga
gi|21522                      :                          agAGC-AGACGT--A--AGGGGTCATAAGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-CT-A-G-A-GC-AGg
gi|21524                      :                          agAGC-AGACAT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ATT-A-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21525                      :                          agAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AA--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacat
gi|21526                      :               agagcagacgtaaAGC-AGACATTTA--A---------AGCA-GT--C--T-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21527                      :                                 agCAT--A--A---------AGCA-AT--T--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--C-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGAacataaag
gi|21528                      :                    agatcagtAGC-GGTCCT--A--A---------AGCA-GT--A--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21529                      :               aaagcagacgtaaAGC-AGACAC--A--A---------TGCG-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AT-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTaaag
gi|21530                      :                          aaAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21531                      :                         agagcagacgcaa--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-ACT-G-T-T--C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGaaag
gi|21532                      :                   agagcagccAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-AT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21534                      :                            agC-GGTCAT--A--A---------A-CA-GT--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21535                      :                      agagcagacgtaaatT--A--G---------AGCA-GT--C--AAC-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21543                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-CG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-
gi|21544                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATcggacttagag
gi|21546                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGaaag
gi|21547                      :                                                          gT--C--A-T-GT-GA-GCT-G-T-C--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGActctagag
gi|21548                      :        gaccagccggcaaaggctgtAGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21549                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21550                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CGT
gi|21551                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-TTTC-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21553                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21554                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21555                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21558                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G------GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21559                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-G---C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21560                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-GG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21561                      :                            AGC-AGTCGT-----G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21562                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAaatagag
gi|21563                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21564                      :                            AAC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAagag
gi|21565                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GACCCT-G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21566                      :                                                                      --GA-CCA-G-TAT--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21567                      :   agcagacgcaaatgacctgtacaatAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CAGG-C-A--GAGCCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-G-G---GC-AGT-CATAGAaatagag
gi|21569                      :                             GC-AGACGC--A--A---------AGCT-GTAAC--A-TAG--GA-CCT-GTT-T--C-T--A-AG--TTGA-AA-C-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAg
gi|21570                      :                                  ACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G---A-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C----AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21571                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--C-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21574                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21577                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21578                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21582                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21585                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21588                      :                                                        A-GT--C--G-TTG--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGg
gi|21589                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCA-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGA
gi|21590                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21592                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-A
gi|21593                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGTTT--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAtcacagag
gi|21595                      :                                            ---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21596                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21597                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21598                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21599                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21601                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--G-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21602                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                            ---------AGCA-AT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AA--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21604                      :                                                         -GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21606                      :                                                          ct--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-CT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21608                      :                                                                    -G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Caca





Alignments
lowQualScore                  :                               0  0 0 00 00 222222222    0  00 44 1 0 22  22  0 0 0 11 0 11 0  11 1111  0 0  0 1 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                               .  . . .. .. .........    .  .. .. . . ..  ..  . . . .. . .. .  .. ....  . .  . . . .  .   .      
lowQualScore                  :                               7  8 7 77 77 777777777    4  66 77 2 8 22  00  4 8 8 00 8 88 4  33 7777  4 4  4 2 8 4  8   9      
consensus                     :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( family-209 )      :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21487                      :                            AGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21488                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21490                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21491                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAg
gi|21492                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21493                      :                          agAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21494                      :                agagcagacgcgaGC-AGACGC--A--AC--------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-TG--T--A-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAaaa
gi|21495                      :                         agcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TAAA-AG--T--GAAA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21496                      :                                   agT--A--G---------AGCA--T--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21497                      :                            agagcactcT--A--G----------GCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGAagag
gi|21498                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CC--G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGAg
gi|21499                      :                          agAGC-GGTCGC--A------------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21500                      :                    agagcagacgcaaGACGC--A--A---------A-CT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-TT-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CATAGAcaaag
gi|21501                      :                       agagaAGC-AGCC-T--A--GCA-------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AACC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21502                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-GC-GA-CCT-G-T-T--C-T--ACAG--T--G-AA-C-TT-G-G---GCAAGT-CATGGAg
gi|21503                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--GAT-G--GA-CGTAG-T-T--C-T--A-AG--T--GAAA-C-TT-GCG-A-GC-AGT-CAT
gi|21504                      :                          agAGC-GGTCAT--T--A---------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21505                      :               agagcagacgcgaAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-ATAGA-CCT-G-TCT--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TTCA-G-A-GC-AGT-Caaa
gi|21506                      :                          agAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAagagag
gi|21507                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--T-T-A--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-AGA-T--T-AA-C--T-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                          agAGCAGGACGC--ACAG---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--TG-G-AA-C-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAagagag
gi|21509                      :                                    ag--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :               agagcagcttctaAGC-TGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-CTT-G-T-T--C-T--A-AG--A--T-AC-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21511                      :               agagcagacgcaaAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21512                      :               agagcagacacaaAGC-GGTCAC--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CG
gi|21513                      :                      agagcagacgcaaCGC--A--A---------AGCT-GT--C--AAT-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-CGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAcaaag
gi|21514                      :                    agagcaagacC-AGACGT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21515                      :                        agatAGC-GATCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-C
gi|21516                      :                               agagcagacgcga---------AGCAAGT--C--A-T-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGC-T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAaaaga
gi|21517                      :      agagcagacgccaggctgtcatAGC-AG-TGT--G--G---------AGCA-GT--C--A-G-C--GA-GCT-GCT-T--C-T--A-AG--TT-G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21519                      :                                                                ag-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAg
gi|21520                      : agcgcagtacgcatacaggctgatcatAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21521                      :                          aaAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGAtaga
gi|21522                      :                          agAGC-AGACGT--A--AGGGGTCATAAGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-CT-A-G-A-GC-AGg
gi|21524                      :                          agAGC-AGACAT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ATT-A-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21525                      :                          agAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AA--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacat
gi|21526                      :               agagcagacgtaaAGC-AGACATTTA--A---------AGCA-GT--C--T-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21527                      :                                 agCAT--A--A---------AGCA-AT--T--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--C-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGAacataaag
gi|21528                      :                    agatcagtAGC-GGTCCT--A--A---------AGCA-GT--A--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21529                      :               aaagcagacgtaaAGC-AGACAC--A--A---------TGCG-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AT-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTaaag
gi|21530                      :                          aaAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21531                      :                         agagcagacgcaa--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-ACT-G-T-T--C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGaaag
gi|21532                      :                   agagcagccAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-AT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21534                      :                            agC-GGTCAT--A--A---------A-CA-GT--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21535                      :                      agagcagacgtaaatT--A--G---------AGCA-GT--C--AAC-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21543                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-CG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-
gi|21544                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATcggacttagag
gi|21546                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGaaag
gi|21547                      :                                                          gT--C--A-T-GT-GA-GCT-G-T-C--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGActctagag
gi|21548                      :        gaccagccggcaaaggctgtAGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21549                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21550                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CGT
gi|21551                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-TTTC-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21553                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21554                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21555                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21558                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G------GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21559                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-G---C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21560                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-GG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21561                      :                            AGC-AGTCGT-----G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21562                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAaatagag
gi|21563                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21564                      :                            AAC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAagag
gi|21565                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GACCCT-G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21566                      :                                                                      --GA-CCA-G-TAT--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21567                      :   agcagacgcaaatgacctgtacaatAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CAGG-C-A--GAGCCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-G-G---GC-AGT-CATAGAaatagag
gi|21569                      :                             GC-AGACGC--A--A---------AGCT-GTAAC--A-TAG--GA-CCT-GTT-T--C-T--A-AG--TTGA-AA-C-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAg
gi|21570                      :                                  ACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G---A-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C----AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21571                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--C-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21574                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21577                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21578                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21582                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21585                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21588                      :                                                        A-GT--C--G-TTG--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGg
gi|21589                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCA-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGA
gi|21590                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21592                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-A
gi|21593                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGTTT--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAtcacagag
gi|21595                      :                                            ---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21596                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21597                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21598                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21599                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21601                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--G-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21602                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                            ---------AGCA-AT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AA--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21604                      :                                                         -GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21606                      :                                                          ct--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-CT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21608                      :                                                                    -G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Caca


blockSeqs                     :                                            GGGGTCATA          AG A   TA  CC             AA    TT TGA          C
blockSeqs                     :                                            CA                 A  A   A   GC             A     A  GA           T
blockSeqs                     :                                            C                  A  A   C   G              A     C  GA           C
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   A   C              A     .  GG           .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   T   G              .     .  TG           .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  A  .   .   G              .     .  A            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  C            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   A              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                            .                  .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                               .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                               .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                               .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                               .  .   .   G              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                                  .   .   C              .     .  G            .
blockSeqs                     :                                                                      .   C              .     .  T            .
blockSeqs                     :                                                                      .   C              .     .  .            .


blockSeqCons                  :                            
originalCons                  :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
finalCons                     :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA





Alignments
lowQualScore                  :                               0  0 0 00 00 222222222    0  00 44 1 0 22  22  0 0 0 11 0 11 0  11 1111  0 0  0 1 0 0  0   0      
lowQualScore                  :                               .  . . .. .. .........    .  .. .. . . ..  ..  . . . .. . .. .  .. ....  . .  . . . .  .   .      
lowQualScore                  :                               7  8 7 77 77 777777777    4  66 77 2 8 22  00  4 8 8 00 8 88 4  33 7777  4 4  4 2 8 4  8   9      
consensus                     :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
Reference ( family-209 )      :                            AGC-GGACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21487                      :                            AGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGA
gi|21488                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21490                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21491                      :                                   agT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CAAGGAg
gi|21492                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21493                      :                          agAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21494                      :                agagcagacgcgaGC-AGACGC--A--AC--------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-TG--T--A-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAaaa
gi|21495                      :                         agcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TAAA-AG--T--GAAA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGg
gi|21496                      :                                   agT--A--G---------AGCA--T--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATG
gi|21497                      :                            agagcactcT--A--G----------GCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGTCCATGGAagag
gi|21498                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CC--G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-A-T-CATAGAg
gi|21499                      :                          agAGC-GGTCGC--A------------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGg
gi|21500                      :                    agagcagacgcaaGACGC--A--A---------A-CT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-TT-C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CATAGAcaaag
gi|21501                      :                       agagaAGC-AGCC-T--A--GCA-------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AACC-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21502                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-GC-GA-CCT-G-T-T--C-T--ACAG--T--G-AA-C-TT-G-G---GCAAGT-CATGGAg
gi|21503                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--GAT-G--GA-CGTAG-T-T--C-T--A-AG--T--GAAA-C-TT-GCG-A-GC-AGT-CAT
gi|21504                      :                          agAGC-GGTCAT--T--A---------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATa
gi|21505                      :               agagcagacgcgaAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-ATAGA-CCT-G-TCT--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TTCA-G-A-GC-AGT-Caaa
gi|21506                      :                          agAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAagagag
gi|21507                      :                          agAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--T-T-A--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-AGA-T--T-AA-C--T-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21508                      :                          agAGCAGGACGC--ACAG---------AGCT-GT--C--A-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--TG-G-AA-C-TT-GTGCA-GC-AGT-CATGGAagagag
gi|21509                      :                                    ag--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21510                      :               agagcagcttctaAGC-TGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-CTT-G-T-T--C-T--A-AG--A--T-AC-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21511                      :               agagcagacgcaaAGC-GGTCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21512                      :               agagcagacacaaAGC-GGTCAC--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-GA-GA-ACT-G-C-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CG
gi|21513                      :                      agagcagacgcaaCGC--A--A---------AGCT-GT--C--AAT-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-CGTT-G-G-A-GC-AGT-C-TGGAcaaag
gi|21514                      :                    agagcaagacC-AGACGT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAg
gi|21515                      :                        agatAGC-GATCAT--A------------AGCA-GT--C--A-C-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-C
gi|21516                      :                               agagcagacgcga---------AGCAAGT--C--A-T-A--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGC-T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGTACATAGAaaaga
gi|21517                      :      agagcagacgccaggctgtcatAGC-AG-TGT--G--G---------AGCA-GT--C--A-G-C--GA-GCT-GCT-T--C-T--A-AG--TT-G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATAGAg
gi|21519                      :                                                                ag-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-ACG-A-GCTAGT-CATAGAg
gi|21520                      : agcgcagtacgcatacaggctgatcatAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CATg
gi|21521                      :                          aaAGC-AGTCGT--G--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGCGGAtaga
gi|21522                      :                          agAGC-AGACGT--A--AGGGGTCATAAGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-CT-A-G-A-GC-AGg
gi|21524                      :                          agAGC-AGACAT--A--A---------AGCG-GT--C--A-T-A--AA-ATT-A-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21525                      :                          agAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AA--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGacat
gi|21526                      :               agagcagacgtaaAGC-AGACATTTA--A---------AGCA-GT--C--T-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TG-A-G-A-GC-AGacataaag
gi|21527                      :                                 agCAT--A--A---------AGCA-AT--T--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--C-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CATAGAacataaag
gi|21528                      :                    agatcagtAGC-GGTCCT--A--A---------AGCA-GT--A--A-T-A--AA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATg
gi|21529                      :               aaagcagacgtaaAGC-AGACAC--A--A---------TGCG-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AT-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGTaaag
gi|21530                      :                          aaAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-C--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AAA-CGTaaag
gi|21531                      :                         agagcagacgcaa--A--A---------AGCA-GT--C--A-T-G--GA-ACT-G-T-T--C-T--C-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGaaag
gi|21532                      :                   agagcagccAGC-GGTCAT--A--A---------AGCA-AT--C--A-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGA-CGT
gi|21534                      :                            agC-GGTCAT--A--A---------A-CA-GT--C--A-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-GT-C-G-A-GC-GGT-CATAGAaaa
gi|21535                      :                      agagcagacgtaaatT--A--G---------AGCA-GT--C--AAC-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21543                      :                  agagcagctcAGC-AGACGC--A--A---------AGCT-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-CG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-GC-
gi|21544                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-A-G-A-TC-AGT-CATcggacttagag
gi|21546                      :                           gAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CA-G-C-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGaaag
gi|21547                      :                                                          gT--C--A-T-GT-GA-GCT-G-T-C--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-AGGC-ATT-CATAGActctagag
gi|21548                      :        gaccagccggcaaaggctgtAGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21549                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21550                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT---G-A-GC-AGT-CGT
gi|21551                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-TTTC-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21552                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGA
gi|21553                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CACAGAg
gi|21554                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21555                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21556                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21557                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21558                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G------GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC--GT-CACAGA
gi|21559                      :                            AGC-GAACTT--A--G---------AGCA-G---C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21560                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--CTT--A-GG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21561                      :                            AGC-AGTCGT-----G---------AGCA-GT--CA-G-C-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21562                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAaatagag
gi|21563                      :                            AGC-GAACTT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-TA-A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21564                      :                            AAC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAagag
gi|21565                      :                            AGC-GAACGT--G--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GACCCT-G-T-T--C-T--A-A---T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21566                      :                                                                      --GA-CCA-G-TAT--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21567                      :   agcagacgcaaatgacctgtacaatAGC-AGTCGT--A--G---------AGCA-GT--CAGG-C-A--GAGCCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA---TT-G-G---GC-AGT-CATAGAaatagag
gi|21569                      :                             GC-AGACGC--A--A---------AGCT-GTAAC--A-TAG--GA-CCT-GTT-T--C-T--A-AG--TTGA-AA-C-TT---G-A-GC-AGT--ATGGAg
gi|21570                      :                                  ACGT--A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G---A-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C----AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21571                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21572                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21573                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--C-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21574                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21576                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-GT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21577                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21578                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--C--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGA
gi|21581                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21582                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21583                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21584                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21585                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21586                      :                                      --A--G---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21588                      :                                                        A-GT--C--G-TTG--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGg
gi|21589                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCA-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-GAA-GC-AGT-CGTAGA
gi|21590                      :                                           a---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21592                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT---G-A-GC-A
gi|21593                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AGTTT--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTGGAtcacagag
gi|21595                      :                                            ---------AGCA-GT--C--A-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGA
gi|21596                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CATGGAg
gi|21597                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-ACT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A--C-AGT-CGTAGAg
gi|21598                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-G--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21599                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-G-C-A-GC-AGT-CGTGGAg
gi|21601                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--G-AG--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21602                      :                                            ---------AGCA-GT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21603                      :                                            ---------AGCA-AT--C--G-T-A--GA-GCT-G-T-T--C-T--A-AA--T--G-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-CGTAGAg
gi|21604                      :                                                         -GT--C--G-T-G--GA-C-T-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-TT-A-G-A-GC-AGT-Cg
gi|21606                      :                                                          ct--C--G-T-G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--G-AA-C-CT-G-G-A-GC-AGT-C
gi|21608                      :                                                                    -G--GA-CCT-G-T-T--C-T--A-AG--T--T-AA-C-TT-G-G-A-GC-AGT-Caca