lowQualScore                  :                                                                                               11111111                                 1111111111111111111111111111                                                                
lowQualScore                  :     0  11  111 0 1111 111 2222 22222 111 11 1  44444 0 111 3333333333333333333333 11 0000 1 0 77777777 22222 111 1111 44444444 6666666 9999999999999999999999999999 1111111 1 111 111 555 000 0 0 0 0 444444444 000 0 0  0 0    5  
lowQualScore                  :     .  ..  ... . .... ... .... ..... ... .. .  ..... . ... ...................... .. .... . . ........ ..... ... .... ........ ....... ............................ ....... . ... ... ... ... . . . . ......... ... . .  . .    .  
lowQualScore                  :     9  00  111 4 8888 333 1111 99999 111 00 2  99999 4 333 6666666666666666666666 55 7777 4 7 66666666 66666 777 2222 77777777 7777777 7777777777777777777777777777 6666666 0 333 333 888 999 3 3 7 3 777777777 666 3 3  7 4    9  
consensus                     : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAANAA
Reference ( gi|44695 )        : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44713                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAT-C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---TTC-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATA
gi|44693                      : GATA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--TATACA-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44696                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AC-------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-
gi|44691                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------CCCT--C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44706                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------CCTGTTC---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-T----G----G---G-G-GA-T-ATAAt
gi|44717                      : GACA-GA--CT---G-A----CCC-A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AG-------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---GCG-GG-T-ATAAAAAtga
gi|44692                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----CCT-C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44707                      : GACG-GA--CA---GCA----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------AA-T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44702                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-TCCG-G----G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44714                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CCTAT----------------------A--C----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------ACC---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-GTGG-T-ATAAt
gi|44708                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA----C---T----------------------A--T----A-T-AC-------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GA-T-At
gi|44699                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCCCCTCCCCA--------ACC------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAACAAat
gi|44748                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GAGAA--C-C---T----------------------A--T----T-C-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-CTT---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44718                      : GACA-GA--CA---G-A----C---AA---G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----ATT-A--------C-----C---C----C--------C-------C----------------------------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAAGAA
gi|44704                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----CT-------C-------C-------------------A--------A-------A-C---G---T-C-G---T-T-T-G-C---------T---G-G-GG-T-ATAACAA
gi|44694                      : GACA-GA--CAA--G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACC------C-----C---C----C--------C-------C-------------------ACCC-----A-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44716                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---GC-T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CAACCCC-------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GT-T-ATAA
gi|44726                      : GACG-GA--CA---G-A----C---G----G-----A---G--TTGA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AACC-----C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T--TAAAAAt
gi|44709                      : GACA-GA--CAATAG-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----CC-------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-T----A----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44719                      : GACA-GA--CG---G-A----C---AAACTG-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------TT----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----A----G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44728                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GA-T-ATAATAAtga
gi|44742                      : GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAA-C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-T-T----G----C---G-G-GG-T-AT
gi|44710                      : GACA-GA--CA---G-A----C---T----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AC-------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------ATC---T---T-C-G---T-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAATAAttaataa
gi|44733                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--TTGA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44722                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---T----------------------A--A----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-A---T---T-C-G---T-T-T-G-CG---G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44765                      : GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------T-------------------A--------A-------A-----T---T-T-G---T-T-T-G-C---------A---G-G-GG-T-ATAAAAAt
gi|44727                      : GACA-GA--CG---G-A----C---GACGGG-----A---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-TTA--------C-----C---C----C--------CGC-----C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44737                      : GACA-GA--CA-----A----C---A----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-C-ATC------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GA-T-ATAA
gi|44761                      : GACG-GAG-CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----ACT-A--------C-----C---C----C--------C-------A-------------------G--------A-------C-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C-------------G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44773                      : GACA-GA--CA---A-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---A-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44736                      : GACA-GA--CA---G-AG---C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AG-------C-----CCCAC----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-CT--T---T-C-G---T-T-TGG-C----A----G---G-G-GG-T-ATA
gi|44756                      : GACG-GA--TG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-T----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44775                      : GACA-GA--CT---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---A----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C----------------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAAAAtga
gi|44735                      : GACA-GAAACA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACC------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---TAT-T-GAC----G----G---G-G-G
gi|44715                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44753                      : GACAAGA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-TTA--------C-----T---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44771                      : GACA-GA--C----G-A----C---A----G-----GT--GATT-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---CTT--C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-G-G-T---------G---G-G-GG-T-ATAAAAAt
gi|44729                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T-------------------------T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCCCCCCCCCAC-------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATA
gi|44711                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-AC-------C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------C-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----G----G---G-G-A----ATAAActaa
gi|44777                      : GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--CGC---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44755                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--TGGA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------------C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---TTCGT-C-G---T-T-T-G-C----T----G---G-G-G
gi|44745                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-C--------A-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-CG---G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44766                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C--------------------------A--T----A-T-A--------------------------------C-------C-------------------A--------G-------ACC---T---T-C-G---T-T-T-G-C----A----G---G-T-GG-T-ATAAAAAt
gi|44697                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-G-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44720                      : GACA-GA--C----G-A----C---A----AACT--G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------TT----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----A----G---G-G-TG-T-ATAA
gi|44698                      : GACA-GA--CA---G-A----CGGCA----G-----A---G--T-GA-T---C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAATAAta
gi|44763                      : GACA-GA--CA---G-A----C---G----GAACATG---C--T-GA-TT--C-C---A----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GA-T-ATAATAA
gi|44747                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----GACAG--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----CCC------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-G-T---T-T-T-G-C----GA---G---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44757                      : GACA-G---CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---T----------------------ATAT----A-T-A--------T-----C---C----C--------C-------A-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-T----G----G---A-G-GG-T-ATAA
gi|44738                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCCCC-C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GA-T-ATAA
gi|44721                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCCCCCC-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAACAA
gi|44767                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAAAC-C---T----------------------AA-T----A-T-A--------C-----C---C----A--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---G---T-C-G---T-T-TGG-C----G----G---G-G-GG-
gi|44740                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----ATT-C--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---A-G-GGTT-ATAA
gi|44731                      : GACA-AA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-C-ATAACAAca
gi|44723                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCC-----C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAACAA
gi|44703                      : GACA-GA--CA---G-A----T---G----G-----G---G--T-GA-AA--C-A---T----------------------A--C----A-T-A--------------C---C----C--------C-------T-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-T----G----G---G-G-TA-T-ATAATAA
gi|44758                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CTA-T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCCAAAAAAAA--------A--------A-------A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----G----A---A-G-CG-C-AT
gi|44705                      : GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C--------------------------A--T----A-T-ACGCCAC--C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44746                      : GACA-GA--CA---G------C---T----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCCCCCA------------A--------A-------A-CT--T---T-C-G---T-T-T-G-G----T----G---G-G-GT-T-ATAA
gi|44750                      : GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----AGT-AA-------C-----C---C----C--------C-------C----------------------------------------------C-C-A---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAAAAta
gi|44772                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----C---G--T-GA-AA--T-C---T----------------------T--T----A-T-A--------------C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-T-G-----T-T-G-C----G----G---T-A-GG-T-ATAATAA
gi|44741                      : GACACGA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-G--AA--C-C---T----------------------A--T----T-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCA-----------------A--------A-------A-C-------T-C-G---T-T-T-G-C---------------G-GG-T-ATAACAA
gi|44751                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----T--------C-------CCCCCCCAAAAAAAA-----A--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C----G----G---G-A-GG-T-ATAA
gi|44769                      : GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCCC--C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-----T-T-T-G-CGGGAG----G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44725                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----GCA---G---A--C-AA-GATTC-C---T----------------------A--T----A-T-ACC------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T-------G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44776                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A-----------------------------------------------------------------------------A-C-----------G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GA-T-ATAAAAA
gi|44730                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-T---------G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44739                      : GACA-GA--AA---G-A----C---A----G------------T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----CACC-----C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----A----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44734                      : GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------------C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C---------------G-GG-T-ATAATAAta
gi|44774                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---A----------------------A--T----A-C-C--------C-----C---C----CCCCCCCCTC-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44700                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------t
gi|44770                      : GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-----T-T-T-G-C----GGAGAG---G-G-GG-T-GTATAcc
gi|44764                      : GACA-GA--CA---G-AGA--C---G----GAC---G---G--T--A-AA--C-C---T----------------------AC-T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------CCCCCCCCCA-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-TAATAA
gi|44744                      : GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---A--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-AACCC----C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---C---T-T-G---T-T-T-G-C---------A---G-G-GG-T-ATAACAA
gi|44752                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T------T-A--------C-----C---C----T--------C-------CCCCCAAAAAAAAA------A--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C----G----G---G-A-GG-T-ATAA
gi|44759                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-----T-T---C----------------------A--A----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------CC-------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44762                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---T--C-GA-TT--C-C---A----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G-C----G----G---A-G-GG-T-ATAATAA
gi|44712                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---T----------------------A--T----A-T-C--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------CCCCCCCCA-C---TA--T-C-A---T-T-T-G-C----G----G---G-G-A----ATAAA
gi|44778                      : GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---A----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCCCCCTCAGAAAAAAAAAG--------A-------A-A---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GT-T-ATAA
gi|44760                      : GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TATATACCCCTAAAGCTGGTTTAA--T----A-T-A--------C-----C---C----CGCCCCCCCC-------C-------------------C--------A-------A-C---T-----C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAAta
gi|44800                      :  ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACC------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-A----G----T---G-G-GG-T-ATAAAAA
gi|44801                      :  ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T------T-A--------T-----A---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44802                      :  ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CCCA----------------A--------A-------A-C---T---T---G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATA
gi|44803                      :  ACA-GA--CA---G-AATGAC---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-T---T----------------------A--T----A-T-A--------A-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---A---T---G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44808                      :   CA-GA--CA---G-A----T---A----G-----G---A--T-GA-AT--T-C---T----------------------A--T----A-T-T--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-T-G---T-T-T-G-C----A----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44807                      :   CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ATCCCCC--C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------G-------A-C---A---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-A-AAA
gi|44810                      :   CG-GA--GA---G-A----C---A----G-----G---A--T-AC-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CTTCCC--C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C---------G---G-G-GG-T-ATAACAAtaa
gi|44809                      :   CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--A----A-T-A--------C-----C---CGCTAC--------C-------C----------------------------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-A----G----G---G-G------ATAA
gi|44811                      :   CA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------G--T----A-T-A--------C-----CTGTC----C--------C-------CCCCCCCGCCA---------G--------A-------A-C---TC--T-C-A---T-TCT-G-CA---A----A---G-A-GG-T-ATAATAAtga
gi|44813                      :    A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C----------------------------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G----G---G-G-GG-T-ATAA
gi|44816                      :    A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AC--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---T----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-A-----T-T-G-T----G----G---G-G-GGTT-ATAA
gi|44814                      :    A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-G-G-G----G----G---A-G-GG-t
gi|44815                      :    A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C--------C-------C-------------------C--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-G-G-G----G----G---A-G-GG-ggggttacaataa
gi|44818                      :     -GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CTCCCCCAC-------------------A--------C-------A-C---T---T-C-G---T-C-T-G-C----G----G---G-G-GT-C-ATAAggggggttacaataa
gi|44820                      :       A--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T----------------------T--T----A-T-A--------------C---C----C--------C-------C-------------------A--------A-------A-C---A---T-T-G---T-T-T-G-C---------A---G-G-GG-T-ATAAAAAt
gi|44822                      :       A--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----T--------A-------C-------------------A--------A-------A-C---T---T-C-----T-T-T-G-C----A----G---G-G-GG-T-ATAATAA
gi|44824                      :        --CA---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-CAT-C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------CAC---C---C----C--------C-------C----------------------------A-------A-C---T---T-A-G---T-T-T-G-C----T----G---G-G-GG-T-CTAA
gi|44825                      :        --CA---G-A----C---T----T-----G---G--C-GA-AT--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------C-------------------CCCCCC---ACC-----A-C---T---T-C-A---T-T-T-G-C----A----G---G-G-GG-T-ATAAt
gi|44827                      :                                          --T-GA-AA--C-C---T----------------------A--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CC------------------A--------A-------A-A---T---T-C-G---T-T-T-T-C----G----G---G-G-GG-T-ATAACAAt
gi|44763                      :                                                        ---T----------------------A--T----A-T-C--------C-----C---C----C--------G-------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G-----------G---G-G-GG-T-ATA
gi|44800                      :                                                      gacagacagacggaacatgctgattccaa--T----A-T-A--------C-----C---C----CAC------T-------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G-G----G----G---G-G-GG-T-ATAataa
gi|44708                      :                                                            acagacagacagggtgaaaccta--T----A-T-C--------C-----C---C----C--------G-------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAaaaa
gi|44704                      :                                                            gacagacagacagggtgaaacta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------AG------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-C-G---T-T-T-G------G----A---G-G-GG-T-ATAat
gi|44709                      :                                                           gacagacagacagggtgaaaccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CTA-----C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAacaa
gi|44710                      :                                                        gacagacaatagacatggtgaaaccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CC------------------A--------A-------A-C---G---A-A-GA--T-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAat
gi|44808                      :                                                           gacagacagactgtgtgaaaccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CTG-----C-------------------A--------A-------A-C---A---A-A-G---T-T-T-G-G----G----G---G-G-AA-T-ATAGAataa
gi|44802                      :                                                                  cagacagataggatgaa--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CGC-----------------A--------A-------A-CAAGT---T---------T-T-G-G----G----G---G-G-GG-T-ATAataa
gi|44729                      :                                                            acagacagacagagtgattccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G-T----G----G---G-G-GG-
gi|44777                      :                                              gacggacagacagggtgaaaccttatacccccccccc--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C---A---A-A-G---T-T-T-G-----------G---G-G-GG-T-ATActaa
gi|44820                      :                                                           gacgacagacagagtgattcgcta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------TG------C-------------------A--------A-------A-C---A---A-T-G---T-T-T-G---------------G-G-GG-T-ATAAAa
gi|44698                      :                                                                  acagacagggtgaaacc--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C-------A-A-G---T-T-T--------G----G---G-G-GG-T-ATAaaaa
gi|44747                      :                                                         gacagacagacggcagagtgatccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CTCG----C-------------------A--------A-------A-A---C---A-A-G---T-T-T-G-G----G----G---G-G-GG-T-ATAataa
gi|44810                      :                                                        gacggacagacaggacagtgattccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C---G---A-A-G---T-T-T-G-G----G----GAAGG-G-GG-T-ATAaaaa
gi|44827                      :                                                             cggagagacaggatacaaccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CGA-----------------A--------A-------A-----------C-GAATT-T-T-G------G----G---G-G-GG-T-ATAacaa
gi|44725                      :                                                                          tgaaaccta--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------C-------CGC-----------------A--------A-------A-C---------A-G---T-T-T-G-G----G----G---G-G-GG-T-ATAacaa
gi|44762                      :                                                       gacagacggacagcagacaagattccta--T----A-T-A--------C-----C---C----T--------C-------CGC-----------------A--------A-------A-C---T---T-C-G---T-T-T-G-C----G--------G-G-GG-T-ATAataa
gi|44803                      :                                                           gacagacggacaggtcgattccaa--T----A-T-A--------C-----C---C----C--------CG------C-------------------A--------A-------A-C---A---T---G---T-T-T-G-G----G----G---G-T-TA-T-ATAAGAAataa





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                            22222222                            2222222222222222222222222222                                                              
lowQualScore                  :                                                                        0  11  111 0 1111 111 2222 22222 111 11 1  44444 0 111  11 1111 1 0 00000000 33333 111 1111 222 3333333 3333333333333333333333333333 1111111 1 0 111 444  0 0 0 0 666666666  0 0  11111 0 00   1  
lowQualScore                  :                                                                        .  ..  ... . .... ... .... ..... ... .. .  ..... . ...  .. .... . . ........ ..... ... .... ... ....... ............................ ....... . . ... ...  . . . . .........  . .  ..... . ..   .  
lowQualScore                  :                                                                        8  00  111 4 8888 333 1111 88888 111 00 2  77777 4 333  88 3333 6 8 66666666 11111 999 4444 111 3333333 2222222222222222222222222222 9999999 2 8 555 333  4 4 8 4 555555555  4 4  99999 4 66   0  
consensus                     :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
Reference ( family-192 )      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAANAA
gi|44691                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCCT--C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44692                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----CCT-C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAt
gi|44693                      :                                                                    GATA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TATACA-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAAt
gi|44694                      :                                                                    GACA-GA--CAA--G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---C----C---C-------C-------------------ACCC-----A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44695                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44696                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-
gi|44697                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-G-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44698                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----CGGCA----G-----A---G--T-GA-T---C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44699                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCCCCTCCCCA--------ACC------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44700                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------
gi|44702                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-TCCG-G----GG-G-GG-----T-A--TAAcc
gi|44703                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----T---G----G-----G---G--T-GA-AA--C-A---TA--C----A-T-A--------------C---C----C---C-------T-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-T----G----GG-G-TA-----T-A--TAATAAt
gi|44704                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----CT--C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-T-G-C---------TG-G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44705                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C----A--T----A-T-ACGCCAC--C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44706                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCTGTTC---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----G----GG-G-GA-----T-A--TAATGA
gi|44707                      :                                                                    GACG-GA--CA---GCA----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44708                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA----C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-----T-A--t
gi|44709                      :                                                                    GACA-GA--CAATAG-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----CC--C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----A----GG-G-GG-----T-A--TAAat
gi|44710                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---T----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------ATC-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-----T-A--TAATAAt
gi|44711                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------C-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-A--------A--TAAA
gi|44712                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--T----A-T-C--------C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------CCCCCCCCA-C-TA--T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-A--------A--TAAAt
gi|44713                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAT-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---TTC-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TA
gi|44714                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CCTATA--C----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-GTGG-----T-A--TAA
gi|44715                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAAt
gi|44716                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---GC-T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CAACCCC-------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GT-----T-A--TAA
gi|44717                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----CCC-A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GGCG-GG-----T-A--TAAAAAt
gi|44718                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---AA---G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ATT-A--------C-----C---C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAAGAA
gi|44719                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---AAACTG-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-----T-A--TAATGA
gi|44720                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----AACT--G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-TG-----T-A--TAAT
gi|44721                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCCCC-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44722                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44723                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCC-----C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAACAAt
gi|44725                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----GCA---G---A--C-AA-GATTC-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T-------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44726                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---G----G-----A---G--TTGA-AA--C-C---TA--T----A-T-AACC-----C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T----TAAAAA
gi|44727                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---GACGGG-----A---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----C---C----C---CGC-----C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44728                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-----T-A--TAATAA
gi|44729                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T---T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCCCCCCCCCAC-------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TACTAA
gi|44730                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T---------GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44731                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----C-A--TAACAA
gi|44733                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--TTGA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44734                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C------------G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44735                      :                                                                    GACA-GAAACA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GTAT-T-GAC----G----GG-G-G
gi|44736                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AG---C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----CCCAC----C---C-------C-------------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-TGG-C----A----GG-G-GG-----T-A--TA
gi|44737                      :                                                                    GACA-GA--CA-----A----C---A----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-C-ATC------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GA-----T-A--TAA
gi|44738                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCC-C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-----T-A--TAA
gi|44739                      :                                                                    GACA-GA--AA---G-A----C---A----G------------T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----CACCC-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-----T-A--TAAT
gi|44740                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----ATT-C--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GA-G-GGT----T-A--TAAC
gi|44741                      :                                                                    GACACGA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-G--AA--C-C---TA--T----T-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCA-----------------A--------A-------A-C-----T-C-GT-T-T-G-C------------G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44742                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAA-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-T-T----G----CG-G-GG-----T-ATTTAATAA
gi|44744                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---A--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-AACCC----C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-C---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44745                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-C--------A-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44746                      :                                                                    GACA-GA--CA---G------C---T----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCCCCCA------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-T-G-G----T----GG-G-GT-----T-A--TAATt
gi|44747                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----GACAG--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----CCC-C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-G-TT-T-T-G-C----GA---GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44748                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GAGAA--C-C---TA--T----T-C-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-CTTT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44750                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----AGT-AA-------C-----C---C----C---C-------C--------------------------------------------C-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44751                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----T---C-------CCCCCCCAAAAAAAA-----A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-----T-A--TAA
gi|44752                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T------T-A--------C-----C---C----T---C-------CCCCCAAAAAAAAA------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-----T-A--TAAt
gi|44753                      :                                                                    GACAAGA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----T---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAt
gi|44755                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--TGGA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-TTCGT-C-GT-T-T-G-C----T----GG-G-Gt
gi|44756                      :                                                                    GACG-GA--TG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GG-G-GG-----T-A--TAATGA
gi|44757                      :                                                                    GACA-G---CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TATAT----A-T-A--------T-----C---C----C---C-------A-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GA-G-GG-----T-A--TAA
gi|44758                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CTA-TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCCAAAAAAAA--------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----AA-G-CG-----C-A--T
gi|44759                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-----T-T---CA--A----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------CC-------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44760                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---T-------A-------------------A--------A-------G-C-T---
gi|44760                      :                                                                                                                                                                                                                         ---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAggtttaatataccccgccccccccccaactcgtttgcggggggtataa
gi|44761                      : gacagacagacaggtgaaacctatatacccctaaagctggtttaatataccccgccccccccccaacGACG-GAG-CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ACT-A--------C-----C---C----C---C-------A-------------------G--------A-------C-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----------G-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44762                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---T--C-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---CG------C-------------------A--------A-------A-C-G---A-A-GT-T-T-G-C----G----GA-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44763                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---G----GAACATG---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-----T-A--TAATAA
gi|44764                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AGA--C---G----GAC---G---G--T--A-AA--C-C---TAC-T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------CCCCCCCCCA-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----TAA--TAA
gi|44765                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------T-------------------A--------A-------A---T---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44766                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C----A--T----A-T-A---------------------------C-------C-------------------A--------G-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----A----GG-T-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44767                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAAAC-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---C----A---C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-TGG-C----G----GG-G-GG-----
gi|44769                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCC--C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-CGGGAG----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44770                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----GGAGAGG-G-GG-----T-G--TA
gi|44771                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----G-----GT--GATT-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---CTT--C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-T---------GG-G-GG-----T-A--TAAAAAtaa
gi|44772                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----C---G--T-GA-AA--T-C---TT--T----A-T-A--------------C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-G--T-T-G-C----G----GT-A-GG-----T-A--TAATAA
gi|44773                      :                                                                    GACA-GA--CA---A-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GA-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44774                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-C-C--------C-----C---C----C---C-------CCCCCCTCC-----------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44775                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---C----C-----------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAAAAAt
gi|44776                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A------------------------------------------------------------------------A-C---------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-----T-A--TAAAAA
gi|44777                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--CGC---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44778                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCCCCCTCAGAAAAAAAAAG--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GT-----T-A--TAAT
gi|44800                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----TG-G-GG-----T-A--TAAAAA
gi|44801                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TT---A-T-A--------C-----C---C----C-------------------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44802                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CCCA----------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TA
gi|44803                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-AATGAC---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-T---TA--T----A-T-A--------A-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44807                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TA--T----A-T-ATCCCCC--C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------G-------A-C-A---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--AAATAA
gi|44808                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----T---A----G-----G---A--T-GA-AT--T-C---TA--T----A-T-T--------C-----C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44809                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---CGCTAC---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----GG-G----------A--TAATGA
gi|44810                      :                                                                      CG-GA--GA---G-A----C---A----G-----G---A--T-AC-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---CTTCCC--C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-----T-A--TAACAA
gi|44811                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TG--T----A-T-A--------C-----CTGTC----C---C-------CCCCCCCGCCA---------G--------A-------A-C-TC--T-C-AT-TCT-G-CA---A----AG-A-GG-----T-A--TAATAA
gi|44813                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAA
gi|44814                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGTT-A--CAATAA
gi|44815                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GG-----
gi|44816                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AC--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---T----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-A--T-T-G-T----G----GG-G-GGT----T-A--TAAggggggttacaataa
gi|44818                      :                                                                        -GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---CTCCCCCAC-------------------A--------C-------A-C-T---T-C-GT-C-T-G-C----G----GG-G-GT-----C-A--TAAt
gi|44820                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TT--T----A-T-A--------------C---C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-----T-A--TAAAAAt
gi|44822                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----T---A-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----A----GG-G-GG-----T-A--TAATAA
gi|44824                      :                                                                           --CA---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-CAT-C-C---TA--T----A-T-A--------CAC---C---C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-A-GT-T-T-G-C----T----GG-G-GG-----T-C--TAA
gi|44825                      :                                                                           --CA---G-A----C---T----T-----G---G--C-GA-AT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------C-------------------CCCCCC---ACC-----A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-----T-A--TAAt
gi|44827                      :                                                                                                             --T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---C----C---C-------CC------------------A--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-T-C----G----GG-G-GG-----T-A--TAACAAt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                            22222222                                  2222222222222222222222222222                                                               
lowQualScore                  :                                                                        0  11  111 0 1111 111 2222 22222 111 11 1  44444 0 111  11 1111 1 0 00000000 33333 222222222 1111 222 3333333 2222222222222222222222222222 1111111 1 0 111 444  0 0 0 0 666666666  0 0  3333333  00      
lowQualScore                  :                                                                        .  ..  ... . .... ... .... ..... ... .. .  ..... . ...  .. .... . . ........ ..... ......... .... ... ....... ............................ ....... . . ... ...  . . . . .........  . .  .......  ..      
lowQualScore                  :                                                                        8  00  111 4 8888 333 1111 88888 111 00 2  77777 4 333  88 3333 6 8 66666666 11111 999999999 4444 111 3333333 3333333333333333333333333333 9999999 2 8 555 333  4 4 8 4 111111111  4 8  2222222  66      
consensus                     :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
Reference ( family-192 )      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44691                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCCT--C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44692                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----CCT-------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44693                      :                                                                    GATA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TATACA-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44694                      :                                                                    GACA-GA--CAA--G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------ACCC-----A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44695                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44696                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------
gi|44697                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-G-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44698                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----CGGCA----G-----A---G--T-GA-T---C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44699                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCCCCA--------ACC------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44700                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------
gi|44702                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-TCCG-G----GG-G-GG-------TA--TAATcc
gi|44703                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----T---G----G-----G---G--T-GA-AA--C-A---TA--C----A-T-A--------------C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-T----G----GG-G-TA-------TA--TAATAA
gi|44704                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CT--C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-T-G-C---------TG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44705                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C----A--T----A-T-ACGCCAC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44706                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCTGTTC---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----G----GG-G-GA-------TA--TAATGA
gi|44707                      :                                                                    GACG-GA--CA---GCA----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44708                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA----C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-G---------A--TAAT
gi|44709                      :                                                                    GACA-GA--CAATAG-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CC--C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44710                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---T----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ATC-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44711                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------C-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAAT
gi|44712                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--T----A-T-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------CCCCCCCCA-C-TA--T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAA
gi|44713                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAT-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---TTC-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44714                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CCTATA--C----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-GTGG-------TA--TAAT
gi|44715                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44716                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---GC-T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CAACCCC-------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GT-------TA--TAAT
gi|44717                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----CCC-A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GGCG-GG-------TA--TAAAAA
gi|44718                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---AA---G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ATT-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAGAA
gi|44719                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---AAACTG-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44720                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----AACT--G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-TG-------TA--TAATA
gi|44721                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCCCC-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44722                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44723                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44725                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----GCA---G---A--C-AA-GATTC-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T-------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44726                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---G----G-----A---G--TTGA-AA--C-C---TA--T----A-T-AACC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------T---TAAAAA
gi|44727                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---GACGGG-----A---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----C---------C----C---CGC-----C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44728                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44729                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T---T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCCCCCAC-------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TACTAA
gi|44730                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44731                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------CA--TAACAA
gi|44733                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--TTGA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44734                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAATAA
gi|44735                      :                                                                    GACA-GAAACA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GTAT-T-GAC----G----GG-G-G
gi|44736                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AG---C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----CCCA------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-TGG-C----A----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44737                      :                                                                    GACA-GA--CA-----A----C---A----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-C-ATC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44738                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCC-C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44739                      :                                                                    GACA-GA--AA---G-A----C---A----G------------T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CACCC-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATA
gi|44740                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----ATT-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GA-G-GGT------TA--TAACA
gi|44741                      :                                                                    GACACGA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-G--AA--C-C---TA--T----T-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCA-----------------A--------A-------A-C-----T-C-GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAACAA
gi|44742                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAA-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-T-T----G----CG-G-GG-------TATTTAATAA
gi|44744                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---A--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-AACCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-C---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44745                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-C--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44746                      :                                                                    GACA-GA--CA---G------C---T----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCA------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-T-G-G----T----GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44747                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----GACAG--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CCC-C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-G-TT-T-T-G-C----GA---GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44748                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GAGAA--C-C---TA--T----T-C-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-CTTT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44750                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----AGT-AA-------C-----C---------C----C---C-------C--------------------------------------------C-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44751                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCCCAAAAAAAA-----A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44752                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T------T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCAAAAAAAAA------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44753                      :                                                                    GACAAGA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----T---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44755                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--TGGA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-TTCGT-C-GT-T-T-G-C----T----GG-G-G
gi|44756                      :                                                                    GACG-GA--TG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44757                      :                                                                    GACA-G---CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TATAT----A-T-A--------T-----C---------C----C---C-------A-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GA-G-GG-------TA--TAA
gi|44758                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CTA-TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCAAAAAAAA--------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----AA-G-CG-------CA--T
gi|44759                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-----T-T---CA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CC-------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44760                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---T-------A-------------------A--------A-------G-C-T---
gi|44760                      :                                                                                                                                                                                                                               ---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAggtttaatataccccgccccccccccaactcgtttgcggggggtataa
gi|44761                      : gacagacagacaggtgaaacctatatacccctaaagctggtttaatataccccgccccccccccaacGACG-GAG-CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ACT-A--------C-----C---------C----C---C-------A-------------------G--------A-------C-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----------G-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44762                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---T--C-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CG------C-------------------A--------A-------A-C-G---A-A-GT-T-T-G-C----G----GA-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44763                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---G----GAACATG---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44764                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AGA--C---G----GAC---G---G--T--A-AA--C-C---TAC-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCCCCCA-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----------TAATAA
gi|44765                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A---T---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44766                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C----A--T----A-T-A---------------------------------C-------C-------------------A--------G-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----A----GG-T-GG-------TA--TAAAAA
gi|44767                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAAAC-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----A---C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-TGG-C----G----GG-G-GG-------
gi|44769                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-CGGGAG----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44770                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----GGAGAGG-G-GG-------TG--T-ATAA
gi|44771                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----G-----GT--GATT-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------CTT--C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44772                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----C---G--T-GA-AA--T-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-G--T-T-G-C----G----GT-A-GG-------TA--TAATAA
gi|44773                      :                                                                    GACA-GA--CA---A-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GA-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44774                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-C-C--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCC-----------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44775                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C-----------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44776                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A------------------------------------------------------------------------------A-C---------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAAAAA
gi|44777                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--CGC---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44778                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCTCAGAAAAAAAAAG--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44800                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----TG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44801                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TT---A-T-A--------C-----C---------C----C-------------------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44802                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCA----------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44803                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-AATGAC---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-T---TA--T----A-T-A--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44807                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TA--T----A-T-ATCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------G-------A-C-A---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--AAATAA
gi|44808                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----T---A----G-----G---A--T-GA-AT--T-C---TA--T----A-T-T--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44809                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------CGCTAC---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----GG-G-----------A--TAATGA
gi|44810                      :                                                                      CG-GA--GA---G-A----C---A----G-----G---A--T-AC-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTTCCC--C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44811                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TG--T----A-T-A--------C-----CTGTCCCCCCC----C---C-------C-------------------GCCAG----A-------A-C-TC--T-C-AT-TCT-G-C----A----AA-GAGG-------TA--TAATAA
gi|44813                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44814                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGT--TA--CAATAA
gi|44815                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGGGTTA--CAATAA
gi|44816                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AC--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------T----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-A--T-T-G-T----G----GG-G-GGT------TA--TAAT
gi|44818                      :                                                                        -GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTCCCCCAC-------------------A--------C-------A-C-T---T-C-GT-C-T-G-C----G----GG-G-GT-------CA--TAAT
gi|44820                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44822                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---A-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44824                      :                                                                           --CA---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-CAT-C-C---TA--T----A-T-A--------CAC---C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-A-GT-T-T-G-C----T----GG-G-GG-------TC--TAAT
gi|44825                      :                                                                           --CA---G-A----C---T----T-----G---G--C-GA-AT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCC---ACC-----A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44827                      :                                                                                                             --T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CC------------------A--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-T-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                            22222222                                  2222222222222222222222222222                                                               
lowQualScore                  :                                                                        0  11  111 0 1111 111 2222 22222 111 11 1  44444 0 111  11 1111 1 0 00000000 33333 222222222 1111 222 3333333 2222222222222222222222222222 1111111 1 0 111 444  0 0 0 0 666666666  0 0  3333333  00      
lowQualScore                  :                                                                        .  ..  ... . .... ... .... ..... ... .. .  ..... . ...  .. .... . . ........ ..... ......... .... ... ....... ............................ ....... . . ... ...  . . . . .........  . .  .......  ..      
lowQualScore                  :                                                                        8  00  111 4 8888 333 1111 88888 111 00 2  77777 4 333  88 3333 6 8 66666666 11111 999999999 4444 111 3333333 3333333333333333333333333333 9999999 2 8 555 333  4 4 8 4 111111111  4 8  2222222  66      
consensus                     :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
Reference ( family-192 )      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44691                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCCT--C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44692                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----CCT-------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44693                      :                                                                    GATA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TATACA-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44694                      :                                                                    GACA-GA--CAA--G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------ACCC-----A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44695                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44696                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------
gi|44697                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-G-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44698                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----CGGCA----G-----A---G--T-GA-T---C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44699                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCCCCA--------ACC------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44700                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------
gi|44702                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-TCCG-G----GG-G-GG-------TA--TAATcc
gi|44703                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----T---G----G-----G---G--T-GA-AA--C-A---TA--C----A-T-A--------------C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-T----G----GG-G-TA-------TA--TAATAA
gi|44704                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CT--C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-T-G-C---------TG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44705                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C----A--T----A-T-ACGCCAC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44706                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCTGTTC---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----G----GG-G-GA-------TA--TAATGA
gi|44707                      :                                                                    GACG-GA--CA---GCA----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44708                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA----C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-G---------A--TAAT
gi|44709                      :                                                                    GACA-GA--CAATAG-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CC--C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44710                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---T----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ATC-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44711                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------C-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAAT
gi|44712                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--T----A-T-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------CCCCCCCCA-C-TA--T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAA
gi|44713                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAT-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---TTC-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44714                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CCTATA--C----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-GTGG-------TA--TAAT
gi|44715                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44716                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---GC-T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CAACCCC-------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GT-------TA--TAAT
gi|44717                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----CCC-A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GGCG-GG-------TA--TAAAAA
gi|44718                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---AA---G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ATT-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAGAA
gi|44719                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---AAACTG-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44720                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----AACT--G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-TG-------TA--TAATA
gi|44721                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCCCC-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44722                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44723                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44725                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----GCA---G---A--C-AA-GATTC-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T-------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44726                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---G----G-----A---G--TTGA-AA--C-C---TA--T----A-T-AACC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------T---TAAAAA
gi|44727                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---GACGGG-----A---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----C---------C----C---CGC-----C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44728                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44729                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T---T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCCCCCAC-------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TACTAA
gi|44730                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44731                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------CA--TAACAA
gi|44733                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--TTGA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44734                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAATAA
gi|44735                      :                                                                    GACA-GAAACA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GTAT-T-GAC----G----GG-G-G
gi|44736                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AG---C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----CCCA------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-TGG-C----A----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44737                      :                                                                    GACA-GA--CA-----A----C---A----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-C-ATC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44738                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCC-C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44739                      :                                                                    GACA-GA--AA---G-A----C---A----G------------T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CACCC-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATA
gi|44740                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----ATT-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GA-G-GGT------TA--TAACA
gi|44741                      :                                                                    GACACGA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-G--AA--C-C---TA--T----T-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCA-----------------A--------A-------A-C-----T-C-GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAACAA
gi|44742                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAA-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-T-T----G----CG-G-GG-------TATTTAATAA
gi|44744                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---A--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-AACCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-C---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44745                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-C--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44746                      :                                                                    GACA-GA--CA---G------C---T----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCA------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-T-G-G----T----GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44747                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----GACAG--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CCC-C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-G-TT-T-T-G-C----GA---GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44748                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GAGAA--C-C---TA--T----T-C-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-CTTT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44750                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----AGT-AA-------C-----C---------C----C---C-------C--------------------------------------------C-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44751                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCCCAAAAAAAA-----A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44752                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T------T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCAAAAAAAAA------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44753                      :                                                                    GACAAGA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----T---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44755                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--TGGA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-TTCGT-C-GT-T-T-G-C----T----GG-G-G
gi|44756                      :                                                                    GACG-GA--TG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44757                      :                                                                    GACA-G---CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TATAT----A-T-A--------T-----C---------C----C---C-------A-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GA-G-GG-------TA--TAA
gi|44758                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CTA-TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCAAAAAAAA--------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----AA-G-CG-------CA--T
gi|44759                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-----T-T---CA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CC-------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44760                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---T-------A-------------------A--------A-------G-C-T---
gi|44760                      :                                                                                                                                                                                                                               ---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAggtttaatataccccgccccccccccaactcgtttgcggggggtataa
gi|44761                      : gacagacagacaggtgaaacctatatacccctaaagctggtttaatataccccgccccccccccaacGACG-GAG-CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ACT-A--------C-----C---------C----C---C-------A-------------------G--------A-------C-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----------G-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44762                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---T--C-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CG------C-------------------A--------A-------A-C-G---A-A-GT-T-T-G-C----G----GA-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44763                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---G----GAACATG---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44764                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AGA--C---G----GAC---G---G--T--A-AA--C-C---TAC-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCCCCCA-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----------TAATAA
gi|44765                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A---T---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44766                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C----A--T----A-T-A---------------------------------C-------C-------------------A--------G-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----A----GG-T-GG-------TA--TAAAAA
gi|44767                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAAAC-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----A---C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-TGG-C----G----GG-G-GG-------
gi|44769                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-CGGGAG----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44770                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----GGAGAGG-G-GG-------TG--T-ATAA
gi|44771                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----G-----GT--GATT-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------CTT--C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44772                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----C---G--T-GA-AA--T-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-G--T-T-G-C----G----GT-A-GG-------TA--TAATAA
gi|44773                      :                                                                    GACA-GA--CA---A-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GA-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44774                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-C-C--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCC-----------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44775                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C-----------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44776                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A------------------------------------------------------------------------------A-C---------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAAAAA
gi|44777                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--CGC---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44778                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCTCAGAAAAAAAAAG--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44800                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----TG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44801                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TT---A-T-A--------C-----C---------C----C-------------------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44802                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCA----------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44803                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-AATGAC---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-T---TA--T----A-T-A--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44807                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TA--T----A-T-ATCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------G-------A-C-A---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--AAATAA
gi|44808                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----T---A----G-----G---A--T-GA-AT--T-C---TA--T----A-T-T--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44809                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------CGCTAC---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----GG-G-----------A--TAATGA
gi|44810                      :                                                                      CG-GA--GA---G-A----C---A----G-----G---A--T-AC-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTTCCC--C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44811                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TG--T----A-T-A--------C-----CTGTCCCCCCC----C---C-------C-------------------GCCAG----A-------A-C-TC--T-C-AT-TCT-G-C----A----AA-GAGG-------TA--TAATAA
gi|44813                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44814                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGT--TA--CAATAA
gi|44815                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGGGTTA--CAATAA
gi|44816                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AC--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------T----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-A--T-T-G-T----G----GG-G-GGT------TA--TAAT
gi|44818                      :                                                                        -GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTCCCCCAC-------------------A--------C-------A-C-T---T-C-GT-C-T-G-C----G----GG-G-GT-------CA--TAAT
gi|44820                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44822                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---A-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44824                      :                                                                           --CA---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-CAT-C-C---TA--T----A-T-A--------CAC---C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-A-GT-T-T-G-C----T----GG-G-GG-------TC--TAAT
gi|44825                      :                                                                           --CA---G-A----C---T----T-----G---G--C-GA-AT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCC---ACC-----A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44827                      :                                                                                                             --T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CC------------------A--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-T-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA


blockSeqs                     :                                                                               ATA   ATGA GGC AACT AACAT ACA    T  GATT    CTA  TA ATAC T   CCCCCCCC CTGTT TGTCCCCCC GCTA ACC TCCCCCA CCCCCCTCAGAAAAAAAAAG         CCCCCCC T   TCG TC           GGGAG           GGGGGGT
blockSeqs                     :                                                                               A     GA   CC  ACGG ACT   T      T  AAAA    TA   A  T    T   CCCCCCC  AC    CCA       TT   CC  TTCCC   CCCCCCAAAAAAAAA              CC      C   A   CT           GGAGA           GGGGT  
blockSeqs                     :                                                                               .     G    .   A    CA    .      G  AAT     .    C  .    G   CGCCAC   T     CT        .    T   GC      CCCCCTCCCCAACC               .       C   C   T            CCGG            T      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    AC    .      .  AAA     .    A  .    C   CCCCCC   T     .         .    C   G       CCCCAAAAAAAAAA               .       .   .   C            GG              T      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  GAA     .    .  .    .   TCCCCC   .     .         .    .   .       CCCCCCCCCCACA                .       .   .   C            GG              .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  CAT     .    .  .    .   CCCCC    .     .         .    .   .       CCCAAAAAAAAA                 .       .   .   C            GA              .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCCC    .     .         .    .   .       CCCCCCCCC                    .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCCC    .     .         .    .   .       CCCCCTCCA                    .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCCC    .     .         .    .   .       CCCCCCAA                     .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCC     .     .         .    .   .       AACCCCA                      .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCC     .     .         .    .   .       CCCCCC                       .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   ACCC     .     .         .    .   .       GCCAG                        .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCCC     .     .         .    .   .       ACCC                         .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CCC      .     .         .    .   .       CCAA                         .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   ACC      .     .         .    .   .       CAA                          .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CC       .     .         .    .   .       CC                           .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CC       .     .         .    .   .       CA                           .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   CC       .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   TC       .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   CC       .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   C        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   C        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   C        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   C        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   G        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   G        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   A        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   G            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            T               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   A            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            T               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       G                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   T            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   A            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   C            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            T               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            A               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            G               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       C                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AC      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       A                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  TT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AT      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  AA      .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  T       .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .               .      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  A       .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .                      
blockSeqs                     :                                                                               .     .    .   .    .     .      .  A       .    .  .    .   .        .     .         .    .   .       .                            .       .   .   .            .                      
blockSeqs                     :                                                                                                                .  .       .    .  .    .   .        .     .         .    .   .                                                .                                       


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                     *****
originalCons                  :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
finalCons                     :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                            22222222                                  2222222222222222222222222222                                                               
lowQualScore                  :                                                                        0  11  111 0 1111 111 2222 22222 111 11 1  44444 0 111  11 1111 1 0 00000000 33333 222222222 1111 222 3333333 2222222222222222222222222222 1111111 1 0 111 444  0 0 0 0 666666666  0 0  3333333  00      
lowQualScore                  :                                                                        .  ..  ... . .... ... .... ..... ... .. .  ..... . ...  .. .... . . ........ ..... ......... .... ... ....... ............................ ....... . . ... ...  . . . . .........  . .  .......  ..      
lowQualScore                  :                                                                        8  00  111 4 8888 333 1111 88888 111 00 2  77777 4 333  88 3333 6 8 66666666 11111 999999999 4444 111 3333333 3333333333333333333333333333 9999999 2 8 555 333  4 4 8 4 111111111  4 8  2222222  66      
consensus                     :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
Reference ( family-192 )      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44691                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCCT--C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44692                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----CCT-------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44693                      :                                                                    GATA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TATACA-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44694                      :                                                                    GACA-GA--CAA--G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------ACCC-----A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44695                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44696                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------
gi|44697                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-G-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44698                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----CGGCA----G-----A---G--T-GA-T---C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44699                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCCCCA--------ACC------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44700                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------
gi|44702                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-TCCG-G----GG-G-GG-------TA--TAATcc
gi|44703                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----T---G----G-----G---G--T-GA-AA--C-A---TA--C----A-T-A--------------C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-T----G----GG-G-TA-------TA--TAATAA
gi|44704                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CT--C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-T-G-C---------TG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44705                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C----A--T----A-T-ACGCCAC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44706                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------CCTGTTC---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----G----GG-G-GA-------TA--TAATGA
gi|44707                      :                                                                    GACG-GA--CA---GCA----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44708                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA----C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-G---------A--TAAT
gi|44709                      :                                                                    GACA-GA--CAATAG-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CC--C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-T----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44710                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---T----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ATC-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44711                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AC-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------C-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAAT
gi|44712                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--T----A-T-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------CCCCCCCCA-C-TA--T-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-AA-------TA--AAA
gi|44713                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAT-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---TTC-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44714                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CCTATA--C----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-GTGG-------TA--TAAT
gi|44715                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44716                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---GC-T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CAACCCC-------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GT-------TA--TAAT
gi|44717                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----CCC-A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GGCG-GG-------TA--TAAAAA
gi|44718                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---AA---G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ATT-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAGAA
gi|44719                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---AAACTG-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44720                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----AACT--G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------TT----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-TG-------TA--TAATA
gi|44721                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCCCC-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44722                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-A---C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44723                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44725                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----GCA---G---A--C-AA-GATTC-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T-------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44726                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---G----G-----A---G--TTGA-AA--C-C---TA--T----A-T-AACC-----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------T---TAAAAA
gi|44727                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---GACGGG-----A---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----C---------C----C---CGC-----C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G------G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44728                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44729                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---T---T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCCCCCAC-------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TACTAA
gi|44730                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44731                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------CA--TAACAA
gi|44733                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--TTGA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44734                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAATAA
gi|44735                      :                                                                    GACA-GAAACA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GTAT-T-GAC----G----GG-G-G
gi|44736                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AG---C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-AG-------C-----CCCA------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-TGG-C----A----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44737                      :                                                                    GACA-GA--CA-----A----C---A----G-----T---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-C-ATC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44738                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----A-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCCC-C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAA
gi|44739                      :                                                                    GACA-GA--AA---G-A----C---A----G------------T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CACCC-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATA
gi|44740                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----ATT-C--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GA-G-GGT------TA--TAACA
gi|44741                      :                                                                    GACACGA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-G--AA--C-C---TA--T----T-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCA-----------------A--------A-------A-C-----T-C-GT-T-T-G-C------------G-GG-------TA--TAACAA
gi|44742                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAA-C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-T-T----G----CG-G-GG-------TATTTAATAA
gi|44744                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---A--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-AACCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-C---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44745                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-C--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-CG---G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44746                      :                                                                    GACA-GA--CA---G------C---T----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCA------------A--------A-------A-CTT---T-C-GT-T-T-G-G----T----GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44747                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----GACAG--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----CCC-C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-G-TT-T-T-G-C----GA---GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44748                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GAGAA--C-C---TA--T----T-C-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-CTTT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44750                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----AGT-AA-------C-----C---------C----C---C-------C--------------------------------------------C-C-AT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44751                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCCCAAAAAAAA-----A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44752                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T------T-A--------C-----C---------C----T---C-------CCCCCAAAAAAAAA------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----G----GG-A-GG-------TA--TAAT
gi|44753                      :                                                                    GACAAGA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-TTA--------C-----T---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44755                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--TGGA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-TTCGT-C-GT-T-T-G-C----T----GG-G-G
gi|44756                      :                                                                    GACG-GA--TG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GG-G-GG-------TA--TAATGA
gi|44757                      :                                                                    GACA-G---CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TATAT----A-T-A--------T-----C---------C----C---C-------A-------------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-T----G----GA-G-GG-------TA--TAA
gi|44758                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-CTA-TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCAAAAAAAA--------A--------A-------A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----G----AA-G-CG-------CA--T
gi|44759                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-----T-T---CA--A----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CC-------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44760                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G------T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---T-------A-------------------A--------A-------G-C-T---
gi|44760                      :                                                                                                                                                                                                                               ---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAggtttaatataccccgccccccccccaactcgtttgcggggggtataa
gi|44761                      : gacagacagacaggtgaaacctatatacccctaaagctggtttaatataccccgccccccccccaacGACG-GAG-CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----ACT-A--------C-----C---------C----C---C-------A-------------------G--------A-------C-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----------G-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44762                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----G-----G---T--C-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CG------C-------------------A--------A-------A-C-G---A-A-GT-T-T-G-C----G----GA-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44763                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---G----GAACATG---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAATAA
gi|44764                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-AGA--C---G----GAC---G---G--T--A-AA--C-C---TAC-T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCCCCCA-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-----------TAATAA
gi|44765                      :                                                                    GACA-AA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------T-------------------A--------A-------A---T---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44766                      :                                                                    GACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C----A--T----A-T-A---------------------------------C-------C-------------------A--------G-------ACC-T---T-C-GT-T-T-G-C----A----GG-T-GG-------TA--TAAAAA
gi|44767                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AAAAC-C---TAA-T----A-T-A--------C-----C---------C----A---C-------C-------------------A--------A-------A-C-G---T-C-GT-T-TGG-C----G----GG-G-GG-------
gi|44769                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-CGGGAG----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44770                      :                                                                    GACG-GA--CG---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----GGAGAGG-G-GG-------TG--T-ATAA
gi|44771                      :                                                                    GACA-GA--C----G-A----C---A----G-----GT--GATT-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------CTT--C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-T---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44772                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----C---G--T-GA-AA--T-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-G--T-T-G-C----G----GT-A-GG-------TA--TAATAA
gi|44773                      :                                                                    GACA-GA--CA---A-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T---GA-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44774                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-C-C--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCTCC-----------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44775                      :                                                                    GACA-GA--CT---G-A----C---A----T-----G---C--T-GA-TT--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C-----------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44776                      :                                                                    GACG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A------------------------------------------------------------------------------A-C---------GT-T-T-G-C----G----GG-G-GA-------TA--TAAAAA
gi|44777                      :                                                                    GAC--GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--CGC---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44778                      :                                                                    GACA-GA--CG---G-A----C---A----T-----G---G--T-GA-AA--C-C---AA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCCCCCTCAGAAAAAAAAAG--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GT-------TA--TAATA
gi|44800                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACC------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----TG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44801                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--TT---A-T-A--------C-----C---------C----C-------------------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44802                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CCCA----------------A--------A-------A-C-T---T---GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TA
gi|44803                      :                                                                     ACA-GA--CA---G-AATGAC---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-T---TA--T----A-T-A--------A-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T---GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44807                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-AA-AA--C-C---TA--T----A-T-ATCCCCC--C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------G-------A-C-A---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--AAATAA
gi|44808                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----T---A----G-----G---A--T-GA-AT--T-C---TA--T----A-T-T--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-T-GT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44809                      :                                                                      CG-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--A----A-T-A--------C-----C---------CGCTAC---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-A----G----GG-G-----------A--TAATGA
gi|44810                      :                                                                      CG-GA--GA---G-A----C---A----G-----G---A--T-AC-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTTCCC--C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C---------GG-G-GG-------TA--TAACAA
gi|44811                      :                                                                      CA-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TG--T----A-T-A--------C-----CTGTCCCCCCC----C---C-------C-------------------GCCAG----A-------A-C-TC--T-C-AT-TCT-G-C----A----AA-GAGG-------TA--TAATAA
gi|44813                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-C-GT-T-T-G-C----G----GG-G-GG-------TA--TAA
gi|44814                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCC----C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGT--TA--CAATAA
gi|44815                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-ACCCCC---C-----C---------C----C---C-------C-------------------C--------A-------A-C-T---T-C-GT-T-G-G-G----G----GA-G-GGGGGGGGTTA--CAATAA
gi|44816                      :                                                                       A-GA--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AC--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------T----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C-A--T-T-G-T----G----GG-G-GGT------TA--TAAT
gi|44818                      :                                                                        -GA--CA---G-A----C---A----A-----G---G--T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---CTCCCCCAC-------------------A--------C-------A-C-T---T-C-GT-C-T-G-C----G----GG-G-GT-------CA--TAAT
gi|44820                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----G---G--T-GA-AA--C-C---TT--T----A-T-A--------------C---------C----C---C-------C-------------------A--------A-------A-C-A---T-T-GT-T-T-G-C---------AG-G-GG-------TA--TAAAAA
gi|44822                      :                                                                          A--CA---G-A----C---A----G-----A---G--T-GA-TT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----T---A-------C-------------------A--------A-------A-C-T---T-C--T-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAATAA
gi|44824                      :                                                                           --CA---G-A----C---A----G-----G---A--T-GA-CAT-C-C---TA--T----A-T-A--------CAC---C---------C----C---C-------C----------------------------A-------A-C-T---T-A-GT-T-T-G-C----T----GG-G-GG-------TC--TAAT
gi|44825                      :                                                                           --CA---G-A----C---T----T-----G---G--C-GA-AT--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------C-------------------CCCCCC---ACC-----A-C-T---T-C-AT-T-T-G-C----A----GG-G-GG-------TA--TAAT
gi|44827                      :                                                                                                             --T-GA-AA--C-C---TA--T----A-T-A--------C-----C---------C----C---C-------CC------------------A--------A-------A-A-T---T-C-GT-T-T-T-C----G----GG-G-GG-------TA--TAACAA