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gi|17559 : TATCTAA--TT-CACAA--A-A--T-T---TT-T---A---G---G---A---------T---C-AAT--AG---TGACTTTGAT--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17560 : TATCATG--GT-CGCAA--G-A--T-T---TT-TTTTA---G---G---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--T--CACTGA
gi|17561 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-TT--A---GGTAC---ATG-TA--G-TACTC-AAT--AG---TAACCTTGAC--T-T--TTGA--C--CCT
gi|17562 : TATCATG--CT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AT--G---C---A-A-TA--G-T-----AA---AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17563 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-G---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---T-AGT--AG---TGACCTTGAC--T-T--TTAA--C--CCTTGA
gi|17564 : TATCTTG--TT-CACGG--G-A--A-T---TG-T---AT--G---C---A-A-TA--G-T---C-GAT--AG---TAACCTTGAC--C-T--TTGA--C--
gi|17565 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA----T---C-AAC--AG---TGACCTTGAC--T-T--TGGA--C--CCTTGA
gi|17566 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACATTGA
gi|17567 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---G---GG--C---A-G-TA--C-T---A-TAT--AG---TGACCTAGAC--C-T--TTGA-----TCTTGA
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gi|17569 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AG--G---C---A-G-TA--C-T---C-AAT--AG---TGA-CTTAAC--C-T--
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gi|17574 : TATCTTG--TT-CACAA--G-G--T-T---TT-TCA-A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACTTTGAT--C-T--TTGA--C--CCCTGA
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gi|17588 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TC-C---A---GG--C---A-A-TA--G-C---C-AAC--AG---TGGCCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCCCGA
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gi|17590 : TATCTTG--TT-CATAA--G-A--T-T---TT-A---A---GT--C---A-A-TG--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTCA--C--CATTGA
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gi|17597 : TATCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCATGAA--C-T--TTGG--A--CCTTGA
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gi|17653 : TTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TT--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--T
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gi|17658 : TG--TT-CACAA--T-C--T-T---TG-T---A---GG--C---A-A-C-----T---C-AGT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTT
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Alignments
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Reference ( family-190 ) : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
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gi|17558 : TATCATG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCCTGA
gi|17559 : TATCTAA--TT-CACAA--A-A--T-T---TT-T---A---G---G---A---------T---C-AAT--AG---TGACTTTGAT--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17560 : TATCATG--GT-CGCAA--G-A--T-T---TT-TTTTA---G---G---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--T--CACTGA
gi|17561 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-TT--A---GGTAC---ATG-TA--G-TACTC-AAT--AG---TAACCTTGAC--T-T--TTGA--C--CCT
gi|17562 : TATCATG--CT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AT--G---C---A-A-TA--G-T-----AA---AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17563 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-G---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---T-AGT--AG---TGACCTTGAC--T-T--TTAA--C--CCTTGA
gi|17564 : TATCTTG--TT-CACGG--G-A--A-T---TG-T---AT--G---C---A-A-TA--G-T---C-GAT--AG---TAACCTTGAC--C-T--TTGA--C--
gi|17565 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA----T---C-AAC--AG---TGACCTTGAC--T-T--TGGA--C--CCTTGA
gi|17566 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACATTGA
gi|17567 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---G---GG--C---A-G-TA--C-T---A-TAT--AG---TGACCTAGAC--C-T--TTGA-----TCTTGA
gi|17568 : TATCTAA--TT-CACAA--A-A--TAT---TT-T---A---GG--C---A-A-TATAA-T---C-AAT--AT---TGACTCTGAT--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17569 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AG--G---C---A-G-TA--C-T---C-AAT--AG---TGA-CTTAAC--C-T--
gi|17570 : TATCTTG--TT-CAAAA--G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--C-C---C-AAT--AG---CAACCTTGAC--C-T--TTGA-----TCTTGA
gi|17571 : TACCTTG--TTTCACAA--G-A--T-T---TTAG---G---G---C---A-G-TA----T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-TCATTGA--C--CGTTGA
gi|17572 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TTGT---G---G---C---A-G-TA----T---C-AAT--AG---TGACGCTGAC--CATCATTGA--C--CTTTGA
gi|17573 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--G-T---TT-T---AA--G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--GA---TGACCTTGAC--C-T--CTGA--T--CCTTGA
gi|17574 : TATCTTG--TT-CACAA--G-G--T-T---TT-TCA-A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACTTTGAT--C-T--TTGA--C--CCCTGA
gi|17575 : TACCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--T--
gi|17576 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-CAT--AA---TGACCTTGAC--C-T--TCGA--C--CCTTGA
gi|17577 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---G-----------------T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17578 : TATCTTG--TC-CACAAT-G-A--T-T---TTTT---A---G---C---A-A-TA--G-T---C-TAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA-----CCTTGA
gi|17579 : TATCTTA--TT-CACAA--G-AATT-T---TT-C---G---G---C---A-G-TA--G-T---C-AAA--AG---TGACCTTGAC--C-T--TCGA--C--CCT
gi|17580 : TATCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-----G-T---C-AAT--AG---TGACATTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17581 : TATCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-----G-T---C-AAT--AG---TGACATTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17582 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-CA--G-T---C-CAT--AG---TGACCTTGAG--T-G--TTGA-----CCTTGA
gi|17585 : TATCTTG--TT-CACAT--A-A--T-T---TT-T---A---G---TTCGA-G-TA--G-T---C-CAT--AG---TGACCTTGACCTC-T--TTGA--C--CCT
gi|17586 : TATCTTG--TT-CACAAT-A-A--T-TC--TT-T---A---GTT-C---G-G-TA--G-T---C-CAT--AG---TGACCTTGAC--CTT--TTGA--C--CCT
gi|17588 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TC-C---A---GG--C---A-A-TA--G-C---C-AAC--AG---TGGCCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCCCGA
gi|17589 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TA-T---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-CAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17590 : TATCTTG--TT-CATAA--G-A--T-T---TT-A---A---GT--C---A-A-TG--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTCA--C--CATTGA
gi|17591 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-CA--G-T---C-CAT--AG---TGACTTTGAC--C-T--TTGA--C--CTT
gi|17593 : TATCTTG--TT-CACGA--G-A--T-T---TG-A---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--
gi|17594 : TATCTTG--TT-CCCAA--G-A--A-T---TT-A---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA-----CCTTGA
gi|17595 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---AG--G---C---C-A-TA--G-T---C-A----AG---TGACCTTAAC--C-T--TTGA--C--CTT
gi|17596 : TATCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AATA-AG---TGACCTTGAC--C-T--TTAA-----CCTTGA
gi|17597 : TATCTTG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCATGAA--C-T--TTGG--A--CCTTGA
gi|17599 : TATCTAG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AC--G---T---T-A-TA--G-T---C-ATT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17600 : TATCTAG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AC--G---T---T-A-TA--G-T---C-ATT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17601 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--GG---TGACCTTGA
gi|17602 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--GG---TGACCTTGA
gi|17603 : TATCGTG--TT-CACAA--G-G--T-T---T------G---G---G---G-A-TA--G-T---T-ACT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17606 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---C-A-TA--G-T---T-AAT--AG---TGACCTTGAC--A-T--TTAA--
gi|17607 : TATCTTG--TT-CACAA--G-G--A-T---TT-C---A---GG--C---A-A-TA--G-C---C-AAT--AA---TGACCATGAC--C-T--TTGA-----TCTTGA
gi|17608 : TATCGTG--TT-CAAAA--G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGATCTTGAC--C-T--T
gi|17609 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-A---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTAGAC--C-T--TTCA-----CCTTGA
gi|17610 : ATGTTG--TT-CACAA--G-A--G-G---TT-T---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AC---TGACTTTGAC--C-T--ATGA--C--CTTTAA
gi|17611 : taccTCTTA--TT-CACAA--G-A--T-A---TT-G---A---G---------G-CA--G-T---C-GAT--AG---TGACCTTGAC--C----TTGA--C--CGTTGA
gi|17612 : tacTATCTTG--TT-TACAA--A-A--T-G---TT-G---A---G---------A-CA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAT--C-T--TTGA-----CCTTGA
gi|17613 : TATCTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C---C--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA-----TCTTGA
gi|17614 : TACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-G---A---G---C---A-A-----G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--T
gi|17627 : ACCTTG--TT-CACGT--G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-G-TA--C-T---C-AAT--AG---TGATCTTGAC--T-T--TTGA-----ACTTGA
gi|17628 : ATCTTG--TT-CACAA--G-AA-T-T---TT-T---G---G---G---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--A-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17629 : ACCTTGGGTT-CACGT--G-A--T-T---TT-T---A---G---C---A-GCTA--C-T---C-AAT--AG---TGATCTTGAC--T-T--TTGA-----ACTTGA
gi|17630 : ACCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---A---AGA-C---A-A-CA--G-T---C-AAT--AG---TGATCTTGAT--C-T--TTGA-----CCTTGA
gi|17631 : ATCTTG--TT-CA-AATTA-A--T-T---TT-A---G---G---C---C-A-TA--G-T---A-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TGGA--C--CCTTGA
gi|17632 : ACCCTG--TT-TACAA--G-A--T-T---TT-G---A---GT--C---A-C-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--ATGACCC--CCTTGA
gi|17633 : ACCCTG--TT-TACAA--G-A--T-T---TT-G---A---GG--C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TT
gi|17634 : ATCTTA--TT-CACAAT-G-A--T-T---TT-A---A---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--GG---TGACATTGAC--C-T--TTGA--C--CCT
gi|17635 : ACCTTG--TT-CGCAA--G-A--T-T---TT-A---G---G---C---A-A-----G-T---C-CAC--AG---TGACCTTCAC--C-C--TTGA--T--CCTTGA
gi|17637 : CTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-A-GA--G-T---C-AAT--GG---TGACCTTGAT--T-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17638 : cCTTG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---AG--G---C---A-A-GA--G-T---CAAAT--GG---TGACCTTGA---T-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17640 : cCTTG--TT-CTCAT--G-A--T-T---TT-T---A---GA--C---A-G-TA--C-T---T-AAT--AG---TGATCTTGAC--T-T--TTGA--CCACCTTGA
gi|17641 : CTTG--TT-CACACT-G-A--T-T---TT-A---G---G---C---A-G-GA--C-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--A-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17642 : CTTG--TT-CACGTT-G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-G-TA--C-T---C-AAT---G---TGATCTTTAC--T-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17643 : CTTG--TG-TGCAT--G-A--T-T---TT-T---A---GGGTC---A-G-TA--CCT---T-AAT--AG---TGACCTTGACTTT-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17644 : CTTG--TT-CACGT--G-A--T-T---TT-A---G---G---C-----A-TA--C-T---C-AAT--AGTTTTGATCTTGACT-T-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17645 : CTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-CAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--
gi|17647 : CTTA--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAA--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA-----CCTTGA
gi|17648 : CTTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-TA--G-T---C-CAT--AA---TGACCTTGAT--C-T--TTGG--C--CCTT
gi|17651 : TTT--TT-CACGT--G-A--T-T---TT-T---A---GG--C---A-G-TA--C-T---C-AAT--AG---TGATCTTGAC--T-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17652 : TTG--TT-AACAT--G-A--T-T---TG-T---A---GG--C---A-A-TA--C-T---C-AATTTAG---TGATCTTGAC--A-T--TTGA--C--CCTTG
gi|17653 : TTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GG--C---A-A-TT--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--T
gi|17654 : TTG--TT-CACAA--G-A--A-T---TT-T---A---GT--C---A-A-AA--G-T---C-AAT--AG---GGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17657 : TG--TT-CACAAAGG-A--T-T---TT-T---G---G---C---A-A-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--
gi|17658 : TG--TT-CACAA--T-C--T-T---TG-T---A---GG--C---A-A-C-----T---C-AGT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCTT
gi|17659 : TG--TT-CACAA--GGA--T-T---TT-T---G---G---G---A-A-----G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CTT
gi|17660 : TG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-T---A---G---C---A-A-TG--G-T---C-AAT--AA---AGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CCCT
gi|17661 : TG--TT-CTCAA--G-A--T-T---TT-T---G---G---------------G-----C-AGT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGT--C--CCTTGA
gi|17662 : TG--TT-CACAA--G-A--T-T---TT-TTT-A---G---T---A-A-CA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--C--CACTGA
gi|17665 : G--TT-CGCAA--G-A--T-TATTTT-T---A---G---G---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--T--CACTGA
gi|17666 : --TT-CACAA--A-A--T-A---TT-T---A---GG--C---A-T-TA--A-T---C-AAT--AT---TGACTCTGAT--C-T--TTGA--C--CCTTGA
gi|17670 : -CACAA--G-A--T-A---TT-T---A---GG--T---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACTTTGAC--C-T--ATGA-----CCTTGA
gi|17672 : -CATAA--G-A--T-T---TA-T---ATAAG---C---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--A-T--TTGG--C--CCTTAA
gi|17674 : a-A--T-T---TT-T---A---G---G---A-G-TA--G-T---C-AAT--AG---TGACCTTGAC--C-T--TTGA--T--CACTGA