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Reference ( gi|4090 ) : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC---------------------A-----CG-----------C-----------A--C-G-G-----------T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GA-ACG
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gi|4073 : tTACA-CTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C------T-T-A-C--C-ACA--------------------A-----CG-----------C-----------A--T-GTG-----------T---GA-C-----------C-----A-CACGCC--AGG-A-C-
gi|4074 : tTACA---C-CCTGAA--T-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--A-AC---------------------A-----CA-----------C-----------A--C-G-G-----------T---GA-C-----------C-----A-C-CG-C--AGA-
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gi|4156 : tTACA-GTC-CCTG----------------T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC---------------------A-----AG-----------C-----------A--C-G-G-----------T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--TGA-A-C-G
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gi|4158 : tTACA-GTC-CTGAAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T----------AC---------------------AA----CG-----------C-----------T--C-G-G-----------T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--GAA-A-C-GATACG
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gi|4075 : tTACA-GTCTCCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----TAT-A-C--CAAC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-TGGGGA-C-----------CCGGGGG-CACG-CCTAGACA-C-GC-ACG
gi|4076 : tTACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-G----T-G-A------AC-----------AGTGAG----------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-ATGAATTGTGAAC-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-ACG
gi|4077 : tTACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------ACTTTGTTCTAGC-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------AC---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-------------------AACG-C--AGA-C-C-G
gi|4078 : tTACA-GTC-ACTGGA--A-CG-T-T--C-T-------T-----------C-T----T-T-G-C--C-ACTTGAACGTTGAA---------------------CG---C-----A--C-G-----------A-T---GG-G-----------T-----G-AACG-C--AGG-G-C-GA-ACG
gi|4079 : tTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------AGCAACGAGTGCCGACGCTGAACG---C-----A--C-G-------------T---GA-C-----------C-----A-CACG-C--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4080 : ttaccaatTGCA-GTC-CTTGAA--AACG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-TTA-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-A---GA-
gi|4081 : tTGCA-GTC-CTTGAA--AACG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-TTA-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-A---GA-
gi|4089 : tTACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--AGA-A-C-GA-AC
gi|4090 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GA-ACG
gi|4091 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------GG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GA-ACG
gi|4093 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-TATG-C--AGA-A-C-GA-ACG
gi|4096 : TACA-GTC-CCTGAA--A-TG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-CCG
gi|4097 : TACA-GTC-CCTAAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4098 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AA-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-AC
gi|4099 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CATG-C--AGA-C-C-GA-ACG
gi|4100 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--T-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CATG-C--AGA-A-T-GA-ATG
gi|4102 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--TGA-A-T-GC-ACG
gi|4104 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-A-A-C--C-AC-----------A---------------------CA---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GG-ACG
gi|4105 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CA---C-----A--C-G-----------G-T---GA-G-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GC-AC
gi|4106 : TACA-GTC-CCTAAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--T-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-G-GA-AC
gi|4107 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CA-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-CCAC-AC-----------A---------------------CA---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GA-CCG
gi|4108 : TACA-GTC-C-TGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AG--A-C-GC-ACG
gi|4109 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CA-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--T-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-T-GA-ATG
gi|4110 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-C--A-T-------A-----------C-T----T-T-A-C----AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4111 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-
gi|4112 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-A-----------A-----G-CACG-C--TGA-A-T-GC-ACG
gi|4114 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--A-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-
gi|4115 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-TATC-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-GC----------G-T---GACC-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4117 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CA-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------G---------------------TG---C-----A--C-A-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--TGA-A-C-GC-ACG
gi|4119 : TACA-GTG-TCTGAA--A-CA-T-T--CCT-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------C---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----A-CACA-C--TGA-A-C-GC-AC
gi|4120 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------T-T---GA-C-----------C-----G-CATG-C--TGA-A-C-G
gi|4121 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-T--C-AC-----------A---------------------CG---C-----T--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----A-CACG-C--TGA-A-C-G
gi|4122 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CGGA-CAACGAA--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--TGA-A-C-GC-ACG
gi|4123 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-A-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CATG-C--
gi|4124 : TACA-GTC-CCTGAA--A-GA-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CA---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-TATG-C--AGA-G-G-GA-ACG
gi|4125 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-TCT--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-T-----------G-TTGGGA-C-----------C-----G-CAC
gi|4127 : TACA-GTC-TCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CA
gi|4128 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--T-A-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-A-----------G-T---GA-C-----------C-----A-CACG-C--TGA-A-C-G
gi|4130 : TACA-CTG-TCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AA-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CATA-C--AGA-G-C-GA-ACG
gi|4132 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-ACACGTACGCTGAA---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CATG-G--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4133 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------ACGCACGGAGAA----------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--TGA-A-C-AA-
gi|4134 : TACA-GTC-CCTGAA----CT-T-T--C---------A-----------C-C----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-G
gi|4136 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A----C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-TACG-
gi|4137 : TACAAGTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------AA----------C-T----T-T-A-CA-C-A------------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-TACG-
gi|4138 : TACA-GTC-CCCGAA--A-CG-T-T--T-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---A-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-TATG-C--TGA-A-C-G
gi|4139 : TACA--TT-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------C---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---CA-C-----------C-----G-CACG-C--AG--G-C-GA-ACG
gi|4140 : TACA-GTC-C-TGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-A----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------A-----G-CACA-C--TGA-A-C-AA-
gi|4141 : TGCA-ATC-CCTGTA--A-CG-T-T--A-T-------A-----------T-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-T-----------C-----G-CACG-C--AGG-G-C-GA-ACG
gi|4142 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T--------------------------------C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------GGT---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4143 : TACA-GTC-CCAGAA----CG-A-T--C-T-------A-----------C-T----T-TTA-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--CTA-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-ACG
gi|4144 : TACA-GTC-CCAGAA--C-CG-A-T--C-T-------A-----------CTT----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----AGCT-A-----------G-T---GA-C-----------C-----GATACG-C--AGA-G-C-GA-ACG
gi|4145 : TACA-GTC-CCTGAA--A-TG-C-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-T--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----A-CACA-A--TGA-A-C-GC-ACG
gi|4146 : TACA-GTC-C-TGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-ATC--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A----G-----------G-T---GA-------------------G-CACGCC--AGA-A-C-GC-ACG
gi|4147 : TACA-ATC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-TGA-C--C-AT-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CA
gi|4148 : TACA-GTC-CCTGAACAG-CG-T-T----T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-
gi|4149 : TGCA-GTC-CCTGAC--A-TG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---T-----A--T-G-----------G-C---GA-C-----------C-----G-CACA-G--AGA-A-C-G
gi|4150 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CGTT-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CGACAT-----A--T-G-----------T-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGATG-CGGA-ACG
gi|4151 : TACA-GTC-CCTGAA--A-AG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AT-----------A---------------------CG---C-----A--C-GGAGAACGCACAG-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--TGA-A-C-AA-
gi|4152 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-TC------AT----------C-T----TAT-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--CGG-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-TG-ACA-A-T-GA-ATG
gi|4154 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-TTTTAT-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----AT-C-AT----------G-T---GA-C-----------C-----G-C-CA-C--AGA-G-C-AA-AC
gi|4155 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-TACTCCTAA-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------AC--------------------CG---C-----A--C-GC----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-
gi|4156 : TACA-GTC-CCTG----------------T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------AG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--TGA-A-C-G
gi|4157 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CGAG-T--C-T-------C-----------C-T----T-T-A-CA-C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CAC
gi|4158 : TACA-GTC-CTGAAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T----------AC-----------AA--------------------CG---C-----T--C-G-----------G-T---GA-C-----------T-----G-CACG-C--GAA-A-C-GATACG
gi|4159 : TACA-GTC-GCTGAA--A-CT-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------G-T---
gi|4160 : TACA-GTC-CCTGAA--AACGAT-C--C-T-------A-----------C-G----T-C-A-C----AC-----------T---------------------TG---A-----A--C-G-----------G-T---GA-G-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-ACG
gi|4161 : TACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T----------------------------T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---------A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----GCCACG-
gi|4169 : ACA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AG-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-AC
gi|4171 : CA-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C----ACTG---------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGG-A-C-GC-ACG
gi|4172 : CA-GTC-CCTGAA--A-CG---T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--CAAC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----A-CACG-C--A
gi|4174 : A-GTC-CCTGAA--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-A-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGA-G-C-GA-ATG
gi|4175 : A-GTC-CCAGAA--A-CA-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--C-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CACG-G--AAA-A-
gi|4176 : A-GTC-CCTGAA----TG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T---C--C-AC-----------A---------------------CG---C-----A--T-G-----------G-T---GA-C-----------C-----G-CAAG-C--TGA-A-C-
gi|4177 : GAA--A-CG-T-TT-C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------CA---C-----A--C-G-----------G-----GA-C-----------C-----G-CACG-C--AGC-A-C-GC-ACG
gi|4178 : A--A-CG-T-T--C-T-------A-----------C-T----T-T-A-C--C-AC-----------A---------------------TG---C-----A--C-G-----------A-T---GA-C-----------C-----T-CACG-C--AGA-C-C-GC-ACG