lowQualScore                  :                 0  00  7 0000 33 0 22  0000 2222 44444444444 0 111 0 00 0 0 0 0 2222 0 0 1  1 0 0 0 00 0 2 22222 33333  0 0     
lowQualScore                  :                 .  ..  . .... .. . ..  .... .... ........... . ... . .. . . . . .... . . .  . . . . .. . . ..... .....  . .     
lowQualScore                  :                 4  66  2 6666 00 6 55  6666 2222 99999999999 3 000 5 66 3 3 8 3 8888 3 5 1  9 3 3 3 77 3 2 11111 88888  7 7     
consensus                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
Reference ( gi|112665 )       :            AATCC-AT--GTCA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112661                     :            AATCT-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112655                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-CCATA
gi|112666                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT----A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112660                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-AA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-G-----A-----AG-G-TCATA
gi|112663                     :            AATAC-AC--GTTA-G--A-AA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112690                     :            AATCC-AT--GTAA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--AAC-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--GGA-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112681                     :            AATCC-AT--GT-A-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112656                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT----A-T--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-CCATA
gi|112700                     :            AATCC-AT--GTGA-G--A-GA-AGACT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112687                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-TTGAT-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-ATA-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCA
gi|112675                     :            AATCC-AT--GTTA-T--G-AA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-ATA--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112676                     :            AATCC-AT---TTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-T-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-CCATA
gi|112692                     :            AATCC-AA--GTTA-A--A-GA-A---T--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112678                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------T-T-T---T-G--C-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----A--A-TCATA
gi|112697                     :            AATCT-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--TTA-T--A-C---------T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112706                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-TA-A--CT--T-A-A--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-C-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TC
gi|112671                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-AA-A---T--T-A-T--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-T-----A-----AG-G-TC
gi|112707                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-----------T-T---T-GT-A-T-C-T-C--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112693                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-AA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-A-G-TC-A-G-A-G--G-T-C-----A-----AA-A-TC
gi|112717                     :            AATCC-AT--GTTG-G--AAGA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-T-C-----A-----A--G-CCATA
gi|112725                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--ATC-------C-T-T---T-GGAA-C-CAT-T--G-A-GAG-TT-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112721                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-CG------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-GATCAA-A-A-A--G-T-C-----------AG-G-TCACA
gi|112730                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--GT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--G-A---G-TC-A-A-A-A--A-T-C-----A-----TG-G-TCA
gi|112735                     :            AATCC-A---GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-TT-A-C-------C-T-T-----G--A-C-C-TCT--G-A-GTG-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112691                     :            AACTC-AT--GTTA-A--A-AA-AA-CT--T-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112696                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CA--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCAT
gi|112720                     :            AATCC-AC--GTTA-G--A-AATA--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A---G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-A-T-ATA
gi|112744                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-GA-----T--T-AAT--A-C-------C-T-T-----G--A-C-C-T-T--G-T-A-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112742                     :            AATCC-AT----TA-G--A-GACA--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-T-C-----AG----AG-G-TC
gi|112724                     :            AATTC-AA--GTTA-G--A-AA-A---T--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-C-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-G-----A-----AG-G-TCATA
gi|112701                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--AAT-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112686                     :            AATCCTAT--GT-A-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---TTG--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----
gi|112703                     :            AATTC-AT--ATTA-A--A-AA-A--CT--G-A-A--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112702                     :            AATCC-AC--GTTA-A--A----A--CT--T-A-T--A-C-------A-T-T---T-G--C-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--T-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112711                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--A-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-A-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112727                     :            AATCC-AT--GTTAAG--A-AA-A--CTCTT-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-GC-A-A-A-A--G-T-C-----AAT---AG-GTTCAT
gi|112712                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-G--CT--T-A-T--A-A-------T-G-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-C-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112713                     :            AATTC-ATCAGTTA-A--A-AA-A--CT--T-AAT--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112714                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-T-------T-T-T---T-G--A-TTC-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112679                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A--A-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112752                     :            AAACC-AA--GTTA-A--A-GA-A---T--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-T-----A-----AG-G-TCTTA
gi|112719                     :            AATGC-AT--GTTG-A--A-AA-A--CG--T-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-C-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112746                     :            AATCC-AC--ATTA-G--A-TA----CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-A-C-----A-----AA-GTTCATA
gi|112761                     :            AATCC-AT--GTCA-A--A--A-A--CT--T-T-G--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-CC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----
gi|112748                     :            AATCC-AT--GTT--G--T-GA-T--GT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-CTT-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-
gi|112688                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT----A-C--A-T-------A-T-T---T-G--A-C-A-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112683                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-AA-CT--A-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-A-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112682                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-AA-CT--A-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-A-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112695                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A--A-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-TTGG-A-A-G-TC-A-G-A-G--G-T-C-----A-----
gi|112715                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-AA-CT--G-A-T--A-T-------T-T-T---TTG--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112726                     :            AATCC-AT--GTTA-G--A-AA-A--CC--T-A----A-T---------T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-T-A-T--G-T-C-----A-----AG-G-TCA
gi|112708                     :            AATTC-AA--ATTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112763                     :            AATCA-AA--GTTA-G--A-GA-A---T--T-A-T--A-C-------A-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-T--T-T-C-----A-----AG-G-TAATA
gi|112664                     :            AATGC-AT--GTTA-A--A-AA-A--TT--G-A-T--A-T-------T-T-T---T-T--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCAT
gi|112698                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-C-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-T-TC-A-A-A-G--C-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112667                     :            AATTT-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-C-----AG----GG-G-TCATA
gi|112728                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C---T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TC
gi|112694                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--AT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-T-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-T--G-T-C-----A-----AG-A-TCATA
gi|112745                     :            AATCC-AT--GTTA-A--A--A-A--CC--T-A-T--A-A-------G-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TTATA
gi|112716                     :            AATCC-AT--GTTA-A--A--A-A--CC--T-A-T--A-A-------G-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TTATA
gi|112732                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-CACTGTAAT-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--A-T-A-----A-----AG-G-TCATA
gi|112734                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-T---------T-T---T-G--A-C-C-T-T--GGA-G-GCTG-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112680                     :            AATGC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CC--T-A-T--A-A-------G-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TTATA
gi|112684                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-----------T-TA--T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-A-----A-----AG-G-TCATA
gi|112759                     :            AATCC-AT--GTTA-GGAA-AA-A--CT--T---T--GTC-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-GGTC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AC-G-T
gi|112657                     :            AATTC-AT--ATTA-A--A----A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCCTA
gi|112718                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-C--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-ATA-T--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112738                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A--A-A--CT--G-A-T--A-T-------T-T-T---T-G--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TCCA-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TC
gi|112685                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-A---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--A-T-A-----A-----AG-G-TCATA
gi|112760                     :            AATCC-AT--GT-A-G--A-AA-A--CT--T-A----A-A-------C-T-T---T-A--A-C-C-T-T--G-A-G---TC-A-A-A----G-T-C-----A-----AG-T-TCATA
gi|112741                     :            AATTC-TT--GTTA-A--A--A-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-T-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--A-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112739                     :            AATCC-AT--GTTA-A--A-AA-AA-CC--T-A-T--A-A-------G-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC-------A--G-T-C-----A-----AG-G-TTATA
gi|112733                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CC--TGA-T--A-A-------T-T-A---T-G--A-C-C-T-T--G-G-G-C-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112743                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AC-A--CT--T-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-T-C-----ACACAGAG-G-TCAT
gi|112673                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-T-CATACAA-----AG-G-TCAT
gi|112699                     :            AATCC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CC--T-A-T--A-A-------G-C-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC-----A-A--GTT-C-----A-----AG-G-TTATA
gi|112750                     :            AATTC-AT--GTTT-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-T---------T-T---T-G--A-T-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----------AG-G-TCATA
gi|112662                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A---------T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-T-C-----ATACAGAG-G-TCAT
gi|112722                     :            AATCC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CC--T-A-TG-A-G-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-T-A-----A-----AG-G-TTATA
gi|112704                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-C--CT--G-A-T--A-T-------T-T-T---T----A-T-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G---C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112755                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--AT----A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-A-T--T-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TGATA
gi|112753                     :            AATTC-AT--ATTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-TCT---T-G--A-C-C-T-TG-A-G-G-G-TC-A-A-A-AG-G-T-CT----A-----AG-G-TCATA
gi|112668                     :            AATTT-AT--GTTA-A--A-AA-A---T--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-T-C-----ATG---GG-G-TCATA
gi|112689                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A--A-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-TC--T-G--A-C-C-T-T--G-ATG-G----A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112762                     :            AATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CC--T-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-G-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-T-C-----A-----
gi|112729                     :            AATTC-AT--ATTG-A--A-AA-AATCT--G-A-T--A-A-------TGT-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-GATC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112709                     :            AATTC-AT---TTA-A--A--A-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-T--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-CA----A-----AG-G-TCATA
gi|112781                     :             ATCC-AA--GTTA-C--A-A------T--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----TG-G-TCATA
gi|112783                     :             ATCC-AT--GTTA-A--A-AA-A--AT--T-C-T--A-A---------T-T---T-G--A-T-G-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112740                     :             ACCC-AT-----A-G--A-AA-A--CT--T-A-T--A-C---------T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-T-G-TC---A-A-A--G-T-CGA---A-----AG-G-TCATA
gi|112779                     :        aatccATTC-AT--ATTA-A--A-AA-A--CT--G-A-T--T-A-------A-T-T---T-T--A-C-A-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112780                     :             ATTC-AT--GTTA-A--A-AA-A--CA--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-TG-A-G-G-G-TCAA-A-A-A--G-T-C-----------AG-G-TCAT
gi|112786                     :              TCC-AT--GTTA-G--A-GA-A--CT--T-A-T--A-C-------C-T-T---T-A--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112787                     :              TCC-AA--GTTA-G--A-GA-A---T--T-A-T--A-C-------C-T-T---C-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-C--C-T-C-----A-----TG-G-TCATA
gi|112788                     :               CC-AT--GTTA-G--A-TA-A--CT--T---T--A-CTA-----C-T-T---T-G--A-C-CCT-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-AAAG-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112752                     :                            --A-GA-C--CT--T-A----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-
gi|112657                     :        aaaccaagttaaagaattat--A-GG-A--CC--T-T-G--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--ta
gi|112747                     :       aattcatattaaaactgataa--A-AA-A--CT--G-A-T--AAT-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATa
gi|112756                     :                 aattctattga--A-AA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112661                     :                     aattcaatta-GA-C--CT--T-G----A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TAT-----A-----AG-T-TC
gi|112666                     :                  aatctatgttaga-GA-C--CT--T-G----A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ata
gi|112660                     :           aatccatgttagagaactat-GA-C--CT--T---C--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ata
gi|112663                     :          aatccatgttagaaaacttat-GA-C--CT--T-G----A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ata
gi|112692                     :          aatacacgttagaaaacttat-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ata
gi|112706                     :           aatccaagttaaagaattat-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-G-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-T-----T-----AA-G-TTATata
gi|112671                     :                   aatccatgttag-GA-C--CT--T-A----A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-
gi|112691                     :           aatccatgttagaaaattat-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--
gi|112696                     :       aactcatgttaaaaaaacttataa-GA-C--CT--T-G----A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112724                     :        aattcatgttaaaaaacagataa-GA-C--CT--T---C--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-G-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-at
gi|112703                     :           aattcaagttagaaaattat-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-T--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112711                     :        aattcatattaaaaaactgaaaa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-T-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112727                     :        aattcatgttaaaaaactaataa-GA-A--CC--T-A-TTGA-C-------T-T-T---T-G--C-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ata
gi|112713                     :       aatccatgttaagaaaactcttat-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--at
gi|112719                     :     aattcatcagttaaaaaacttaataa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-G-G-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112688                     :        aatgcatgttgaaaaacgtataa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-T-G-TC-A-A-A-ata
gi|112683                     :        aattcatgttaaaaaactacata-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-T-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112682                     :       aattcatgttaaaaaaactaataa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-T-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112715                     :       aattcatgttaaaaaaactaataa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-A-TC-A-A-A-A--ata
gi|112732                     :      aattcatgttaaaaaaactgatatt-GA-C--CT--T---T--A-T-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--ata
gi|112747                     : aattcatgttaaaaaactgatacactgtaa-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-T-T-----A-----ata
gi|112729                     :            aattctattgaaaaactga-GA-C--CT--T-G----A-C-------C-T-T---T-G--ATC-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-at
gi|112722                     :      aattcatattgaaaaaatctgataatgA-A--CC--T-T-T--A-C-------C-T-T-----G--A-T-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--C-T-C-----AT----AG-G-Tata
gi|112791                     :                  aatccatgttaaaaaA-A--CC--T-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-A-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AA-G-TCATAata
gi|112794                     :                     atattaaaaattA-A--CT--G-A-T--A-A-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-T--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--A-T-C-----A-----AG-G-TCATA
gi|112791                     :                                 a-A--CT--T-T-G--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-T-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--T-T-A-----T-----AG-G-TTA
gi|112673                     :                             atattaaaaat--T-A-T--G-A-------C-C-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--cata
gi|112662                     :                 aattcatgttaaaaaactgataa--T-A-T--G-A-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-caaaggtcat
gi|112655                     :                        aattcatgttaaaaaactgataa--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TAT-----A-----AG-T-TCcagaggtcat
gi|112656                     :                                  aatccatgttaga--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-T-caaggccata
gi|112676                     :                           aatccatgttagagaactat--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-TAT-----A-----AG-T-TCcaaggccata
gi|112678                     :                                   aatccatttaga--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-GC-A-A-A-A--G-TAT-----A-----AG-T-TCcaaggccata
gi|112693                     :                                  aatccatgttaga--A-C-------C-T-C---T-G--A-C-T-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-caaatcata
gi|112686                     :                          aatccatgttagaaaacttat--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-A-TC-A-A-A-A--G-caaaatc
gi|112761                     :                        aatcctatgtagagaacttatac--A-C-------T-T-T---T-G--G-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-C-----A-----AA-G-Tcaa
gi|112781                     :                                 aatccatgtcaaaa--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-caa
gi|112748                     :                              atccaagttacaattat--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-T-CA-A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-catggtcata
gi|112759                     :                           aatccatgttgtgatgttat--A-C-------T-T-T---T-G--A-C-C-C-TC-A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-A-C-----A-----AA-G-Tcaagg
gi|112750                     :                              aatccatgttaggaaaa--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-A-TC-A-A-A-A--caacgt
gi|112709                     :                         aattcatgtttaaaaactgata--A-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TA-A-A-A-A--caggtcata
gi|112712                     :                             aattcatttaaaaactgataa-C-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-caaaggtcata
gi|112700                     :                           aattcatgttaaaaagcttataatg-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-ccaaggtcata
gi|112708                     :                             aatccatgtgagagaagacttat-------C-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--tcaaggtcata
gi|112743                     :                             aattcaaattaaaaaactgataa-------C-C-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--tcaaggtcata
gi|112675                     :                                     aattcatgttaaaacacttataa-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TAT-----A-----AGTT-TCATAtcacacagaggtcat
gi|112717                     :                                                   aatccatgt-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TAT-----A-----AG-T-TCtagtcaaggtcata
gi|112742                     :                                              aatccatgttggaa-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TAT-----A-----AGTG-TCaagtcaagccata
gi|112746                     :                                                 aatccattaga-T-T---T-G--A-C-C-T-C--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-T-aagtcagaggtc





Alignments
lowQualScore                  :                                          11111111111                                                                
lowQualScore                  :      0  00  0  0000 66 111 33 0 3333 1 0 22222222222 0 111 0 11  0 1 666 0 1 0 1  2 0 0 0 11 0  22222 33333   0     
lowQualScore                  :      .  ..  .  .... .. ... .. . .... . . ........... . ... . ..  . . ... . . . .  . . . . .. .  ..... .....   .     
lowQualScore                  :      4  66  4  7777 44 555 11 4 3333 2 4 22222222222 4 555 8 00  4 2 888 8 6 8 2  8 4 4 4 00 4  44444 99999   8     
consensus                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--T-A-T-A-N-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
Reference ( family-183 )      : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TC--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112655                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112656                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T----A-T-A-C-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112657                     : AATTC-AT--AT-TA-A--A------A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCCTA
gi|112660                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-AA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112661                     : AATCT-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112662                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A---------T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-TC-----ATACAGAGG-TCAT
gi|112663                     : AATAC-AC--GT-TA-G--A-AA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112664                     : AATGC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--T-T--G-A-T-A-T-------T-T-T---T-T--AT-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112665                     : AATCC-AT--GT-CA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--A-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112666                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T----A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112667                     : AATTT-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TC-----AG----GGG-TCATA
gi|112668                     : AATTT-AT--GT-TA-A--A-AA---A----T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TC-----ATG---GGG-TCATA
gi|112671                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-AA---A----T--T-A-T-A-C-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TT-----A-----AGG-TC
gi|112673                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-TCATACAA-----AGG-TCAT
gi|112675                     : AATCC-AT--GT-TA-T--G-AA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-ATA--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112676                     : AATCC-AT---T-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-T-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112678                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------T-T-T---T-G--CC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----A-A-TCATA
gi|112679                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112680                     : AATGC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-C--T-A-T-A-A-------G-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112681                     : AATCC-AT--GT--A-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AT-C-TT--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112682                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---AA-C-T--A-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-A-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112683                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---AA-C-T--A-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-A-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112684                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-----------T-TA--T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112685                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-A---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112686                     : AATCCTAT--GT--A-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---TTG--AT-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112687                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-TTGAT-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-ATA-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112688                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-TA-C-A-T-A-----------T-T---T-G--AC-A-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112689                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-TC--T-G--AC-C-TT--G-ATG-G----A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112690                     : AATCC-AT--GT-AA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-AAC-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--GGA-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112691                     : AACTC-AT--GT-TA-A--A-AA---AA-C-T--T-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112692                     : AATCC-AA--GT-TA-A--A-GA---A----T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112693                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-AA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-A-G-TC-A-G-A-G--G-TC-----A-----AAA-TC
gi|112694                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--A-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-T-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-T--G-TC-----A-----AGA-TCATA
gi|112695                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A--A---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TTTGG-A-A-G-TC-A-G-A-G--G-TC-----A-----
gi|112696                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-A--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112697                     : AATCT-AT--GT-TA-G--A-GA---A--CTT--T-A-T-A---------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112698                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-C-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-T-TC-A-A-A-G--C-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112699                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-C--T-A-T-A-A-------G-C-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC-----A-A--GTTC-----A-----AGG-TTATA
gi|112700                     : AATCC-AT--GT-GA-G--A-GA---AGAC-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112701                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-AAT-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112702                     : AATCC-AC--GT-TA-A--A------A--C-T--T-A-T-A-C-------A-T-T---T-G--CC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--T-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112703                     : AATTC-AT--AT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-A-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--A-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112704                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---C--C-T--G-A-T-A-T-------T-T-T---T----AT-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G--C-----A-----AGG-TCATA
gi|112706                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-TA---A--C-T--T-A-A-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-CT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112707                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-----------T-T---T-GT-AT-C-TC--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112708                     : AATTC-AA--AT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112709                     : AATTC-AT---T-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-T--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TCA----A-----AGG-TCATA
gi|112711                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--A-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-A-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112712                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---G--C-T--T-A-T-A-A-------T-G-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-CC-----A-----AGG-TCATA
gi|112713                     : AATTC-ATCAGT-TA-A--A-AA---A--C-T--T-AAT-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112714                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-T-------T-T-T---T-G--ATTC-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112715                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---AA-C-T--G-A-T-A-T-------T-T-T---TTG--AT-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112716                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A--A---A--C-C--T-A-T-A-A-------G-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112717                     : AATCC-AT--GT-TG-G--AAGA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-TC-----A-----A-G-CCATA
gi|112718                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-C-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-ATA-T--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112719                     : AATGC-AT--GT-TG-A--A-AA---A--C-G--T-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-CT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112720                     : AATCC-AC--GT-TA-G--A-AAT--A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A---G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGA-T-ATA
gi|112721                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-CG------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-GATCAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCACA
gi|112722                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-C--T-A-TGA-G-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-TA-----A-----AGG-TTATA
gi|112724                     : AATTC-AA--GT-TA-G--A-AA---A----T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-CT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112725                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-ATC-------C-T-T---T-GGAAC-CATT--G-A-GAG-TT-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112726                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-AA---A--C-C--T-A---A-T---------T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-T-A-T--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112727                     : AATCC-AT--GT-TAAG--A-AA---A--C-TCTT-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-GC-A-A-A-A--G-TC-----AAT---AGGTTCAT
gi|112728                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-T---G-A-G-G-TG-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112729                     : AATTC-AT--AT-TG-A--A-AA---AATC-T--G-A-T-A-A-------TGT-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-GATC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112730                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--G-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TC--G-A---G-TC-A-A-A-A--A-TC-----A-----TGG-TCA
gi|112732                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-CACTGTAAT-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112733                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-C--TGA-T-A-A-------T-T-A---T-G--AC-C-TT--G-G-G-C-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112734                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-T---------T-T---T-G--AC-C-TT--GGA-G-GCTG-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112735                     : AATCC-A---GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-ATT-A-C-------C---T---T-G--AC-C-TCT-G-A-GTG-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112738                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-T-------T-T-T---T-G--AT-C-TT--G-A-G-G-TCCA-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112739                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A-AA---AA-C-C--T-A-T-A-A-------G-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC-------A--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112740                     : AATCC-AC--CCATA-G--A-AA---A--C-T--T-A-T-A-C---------T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-T-G-TC---A-A-A--G-TCGA---A-----AGG-TCATA
gi|112741                     : AATTC-TT--GT-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-T-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112742                     : AATCC-AT-----TA-G--A-GAC--A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TCAA-A-A-A--G-TC-----AG----AGG-TC
gi|112743                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AC---A--C-T--T-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-TC-----ACACAGAGG-TCAT
gi|112744                     : AATCC-AT--GT-TA-G--A-GA--------T--T-AAT-A-C-------C-T-T-----G--AC-C-TT--G-T-A-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112745                     : AATCC-AT--GT-TA-A--A--A---A--C-C--T-A-T-A-A-------G-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-A-TC---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112746                     : AATCC-AC--AT-TA-G--A-TA------C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-AC-----A-----AAGTTCATA
gi|112747                     : AATTC--T--AT-TG-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-AAT-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112748                     : AATCC-AT--GT-T--G--T-GA---T--G-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-CTTT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-
gi|112750                     : AATTC-AT--GT-TT-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-T---------T-T---T-G--AT-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----------AGG-TCATA
gi|112752                     : AAACC-AA--GT-TA-A--A-GA---A----T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TT-----A-----AGG-TCTTA
gi|112753                     : AATTC-AT--AT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-TCT---T-G--AC-C-TT--G-AGG-G-TC-A-A-A-AG-G-TCT----A-----AGG-TCATA
gi|112755                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--A-T----A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-AT--T-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TGATA
gi|112756                     : AATTC-A---AT-TA-A--A--A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112759                     : AATCC-AT--GT-TA-GGAA-AA---A--C-T--TTG-T---C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-AGG-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----ACG-T
gi|112760                     : AATCC-AT--GT--A-G--A-AA---A--C-T--T-A---A-A-------C-T-T---T-A--AC-C-TT--G-A-G---TC-A-A-A----G-TC-----A-----AGT-TCATA
gi|112761                     : AATCC-AT--GT-CA-A--A--A---A--C-T--T-T-G-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-CC-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112762                     : AATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-C--T-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AG-C-TT--G-A-G-G-TC---A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112763                     : AATCA-AA--GT-TA-G--A-GA---A----T--T-A-T-A-C-------A-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-T--T-TC-----A-----AGG-TAATA
gi|112779                     :  ATTC-AT--AT-TA-A--A-AA---A--C-T--G-A-T-T-A-------A-T-T---T-T--AC-A-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112780                     :  ATTC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--C-A--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-AGG-G-TCAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCAT
gi|112781                     :  ATCC-AA--GT-TA-C--A-A---------T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112783                     :  ATCC-AT--GT-TA-A--A-AA---A--A-T--T-C-T-A-A---------T-T---T-G--AT-G-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112786                     :   TCC-AT--GT-TA-G--A-GA---A--C-T--T-A-T-A-C-------C-T-T---T-A--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112787                     :   TCC-AA--GT-TA-G--A-GA---A----T--T-A-T-A-C-------C-T-T---C-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TC-A-A-A-C--C-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112788                     :    CC-AT--GT-TA-G--A-TA---A--C-T--T---T-A-CTA-----C-T-T---T-G--AC-CCTT--G-A-G-G-TC-A-A-A-AAAG-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112791                     :      -AT--AT-TA-A--A-AATTAA--C-C--T-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-A-G-TC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AAG-TCATA
gi|112794                     :                       A---A--C-T--G-A-T-A-A-------T-T-T---T-G--AC-C-TT--G-A-G-G-TG-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA





Alignments
lowQualScore                  :      0  00  0  00   0 111 333  444444444 0 0 777777 0 111 1 11  0 0 0 11 0 1 0 1 0 2 0 0 0 11 0  22222 33333   0     
lowQualScore                  :      .  ..  .  ..   . ... ...  ......... . . ...... . ... . ..  . . . .. . . . . . . . . . .. .  ..... .....   .     
lowQualScore                  :      4  66  4  66   8 555 444  222222222 8 4 222222 4 111 6 00  4 8 4 33 4 6 8 2 4 4 4 4 4 00 4  33333 99999   8     
consensus                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
Reference ( family-183 )      : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112655                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112656                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112657                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA---------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCCTA
gi|112660                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112661                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112662                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A----T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----ATACAGAGG-TCAT
gi|112663                     : AATAC-AC--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112664                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---TT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-T--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112665                     : AATCC-AT--GT-CA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112666                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112667                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----AG----GGG-TCATA
gi|112668                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A----T-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----ATG---GGG-TCATA
gi|112671                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TT-----A-----AGG-TC
gi|112673                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TCATACAA-----AGG-TCAT
gi|112675                     : AATCC-AT--GT-TA--TGA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-ATA--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112676                     : AATCC-AT---T-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112678                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----A-A-TCATA
gi|112679                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112680                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112681                     : AATCC-AT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112682                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112683                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112684                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112685                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112686                     : AATCCTAT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112687                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-TTGAT-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-ATA-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112688                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT---------A-C-A-T--A-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112689                     : AATTC-AT--GT-T---AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-TC--T-G--AC-C-T-T--G-ATG-G-----A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112690                     : AATCC-AT--GT-AA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-A--CCT-T---T-G--AC-C-T-T--GGA-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112691                     : AACTC-AT--GT-TA--AAAAA---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112692                     : AATCC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112693                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----AAA-TC
gi|112694                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--G-TC-----A-----AGA-TCATA
gi|112695                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TTGG-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----
gi|112696                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112697                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------TTA-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112698                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-T-T-C-A-A-A-G--C-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112699                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-----A-A--GTTC-----A-----AGG-TTATA
gi|112700                     : AATCC-AT--GT-GA--GAG-A---AGA-CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112701                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112702                     : AATCC-AC--GT-TA--AAA---------CT-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--T-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112703                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-A-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112704                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---C---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T----AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G--C-----A-----AGG-TCATA
gi|112706                     : AATCC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T-A-A-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112707                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A------T-T---T-GT-AT-C-T-C--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112708                     : AATTC-AA--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112709                     : AATTC-AT---T-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-T--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TCA----A-----AGG-TCATA
gi|112711                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112712                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---G---CT-------T-A-T-A-A--T-G-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-CC-----A-----AGG-TCATA
gi|112713                     : AATTC-ATCAGT-TA--AAA-A---A---CT-------T-AAT-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112714                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--ATTC-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112715                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112716                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112717                     : AATCC-AT--GT-TG--GAAGA---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----A-G-CCATA
gi|112718                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-C-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-ATA-T--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112719                     : AATGC-AT--GT-TG--AAA-A---A---CG-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112720                     : AATCC-AC--GT-TA--GAA-AT--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A---G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGA-T-ATA
gi|112721                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ACG--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCACA
gi|112722                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-TGA-G--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TA-----A-----AGG-TTATA
gi|112724                     : AATTC-AA--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112725                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ATC--C-T-T---T-GGAAC-CAT-T--G-A-GAG-T-T-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112726                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CC-------T-A-----A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-T-A-T--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112727                     : AATCC-AT--GT-TA--AGA-A---AACTCT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-G-C-A-A-A-A--G-TC-----AAT---AGGTTCAT
gi|112728                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C---T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112729                     : AATTC-AT--AT-TG--AAA-A---AAT-CT-------G-A-T-A-A--TGT-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112730                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---GT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-C--G-A---G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----TGG-TCA
gi|112732                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CTGATACACT-G-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112733                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------TGA-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-G-G-C-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112734                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AC-C-T-TG-G-A-G-GCT-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112735                     : AATCC-A---GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-T-A--C-C-T---T-G--AC-C-TCT--G-A-GTG-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112738                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-TCC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112739                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-------A--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112740                     : AATCC-AC--CCATA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-T-G-T-C---A-A-A--G-TCGA---A-----AGG-TCATA
gi|112741                     : AATTC-TT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112742                     : AATCC-AT-----TA--GAG-AC--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----AG----AGG-TC
gi|112743                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-C---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----ACACAGAGG-TCAT
gi|112744                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A--------T-------T-AAT-A-C--C-T-T-----G--AC-C-T-T--G-T-A-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112745                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112746                     : AATCC-AC--AT-TA--GAT-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-AC-----A-----AAGTTCATA
gi|112747                     : AATTC--T--AT-TG--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112748                     : AATCC-AT--GT-TG--TGA-T---G----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TT-G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-
gi|112750                     : AATTC-AT--GT-TT--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----------AGG-TCATA
gi|112752                     : AAACC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TT-----A-----AGG-TCTTA
gi|112753                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-TCT---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-AG-G-TCT----A-----AGG-TCATA
gi|112755                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT---------A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-A-T--T-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TGATA
gi|112756                     : AATTC-A---AT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112759                     : AATCC-AT--GT-TAGGAAA-A---A---CT-------TTG-T---C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----ACG-T
gi|112760                     : AATCC-AT--GT--A--GAA-A---A---CT-------T-A---A-A--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G---T-C-A-A-A----G-TC-----A-----AGT-TCATA
gi|112761                     : AATCC-AT--GT-CA--AAA-A-------CT-------T-T-G-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-C-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112762                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AG-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112763                     : AATCA-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--T-TC-----A-----AGG-TAATA
gi|112779                     :  ATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-T-A--A-T-T---T-T--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112780                     :  ATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCAT
gi|112781                     :  ATCC-AA--GT-TA--CAA----------T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112783                     :  ATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------T-C-T-A-A----T-T---T-G--AT-G-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112786                     :   TCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112787                     :   TCC-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---C-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-C--C-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112788                     :    CC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T---T-A-CTAC-T-T---T-G--AC-CCT-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-AAAG-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112791                     :      -AT--AT-TA--AAA-ATTAA---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AAG-TCATA
gi|112794                     :                    A-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA





Alignments
lowQualScore                  :      0  00  0  00   0 111 333  444444444 0 0 777777 0 111 1 11  0 0 0 11 0 1 0 1 0 2 0 0 0 11 0  22222 33333   0     
lowQualScore                  :      .  ..  .  ..   . ... ...  ......... . . ...... . ... . ..  . . . .. . . . . . . . . . .. .  ..... .....   .     
lowQualScore                  :      4  66  4  66   8 555 444  222222222 8 4 222222 4 111 6 00  4 8 4 33 4 6 8 2 4 4 4 4 4 00 4  33333 99999   8     
consensus                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
Reference ( family-183 )      : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112655                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112656                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112657                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA---------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCCTA
gi|112660                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112661                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112662                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A----T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----ATACAGAGG-TCAT
gi|112663                     : AATAC-AC--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112664                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---TT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-T--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112665                     : AATCC-AT--GT-CA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112666                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112667                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----AG----GGG-TCATA
gi|112668                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A----T-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----ATG---GGG-TCATA
gi|112671                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TT-----A-----AGG-TC
gi|112673                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TCATACAA-----AGG-TCAT
gi|112675                     : AATCC-AT--GT-TA--TGA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-ATA--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112676                     : AATCC-AT---T-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112678                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----A-A-TCATA
gi|112679                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112680                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112681                     : AATCC-AT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112682                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112683                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112684                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112685                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112686                     : AATCCTAT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112687                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-TTGAT-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-ATA-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112688                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT---------A-C-A-T--A-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112689                     : AATTC-AT--GT-T---AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-TC--T-G--AC-C-T-T--G-ATG-G-----A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112690                     : AATCC-AT--GT-AA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-A--CCT-T---T-G--AC-C-T-T--GGA-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112691                     : AACTC-AT--GT-TA--AAAAA---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112692                     : AATCC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112693                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----AAA-TC
gi|112694                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--G-TC-----A-----AGA-TCATA
gi|112695                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TTGG-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----
gi|112696                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112697                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------TTA-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112698                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-T-T-C-A-A-A-G--C-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112699                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-----A-A--GTTC-----A-----AGG-TTATA
gi|112700                     : AATCC-AT--GT-GA--GAG-A---AGA-CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112701                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112702                     : AATCC-AC--GT-TA--AAA---------CT-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--T-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112703                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-A-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112704                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---C---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T----AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G--C-----A-----AGG-TCATA
gi|112706                     : AATCC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T-A-A-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112707                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A------T-T---T-GT-AT-C-T-C--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112708                     : AATTC-AA--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112709                     : AATTC-AT---T-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-T--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TCA----A-----AGG-TCATA
gi|112711                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112712                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---G---CT-------T-A-T-A-A--T-G-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-CC-----A-----AGG-TCATA
gi|112713                     : AATTC-ATCAGT-TA--AAA-A---A---CT-------T-AAT-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112714                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--ATTC-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112715                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112716                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112717                     : AATCC-AT--GT-TG--GAAGA---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----A-G-CCATA
gi|112718                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-C-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-ATA-T--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112719                     : AATGC-AT--GT-TG--AAA-A---A---CG-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112720                     : AATCC-AC--GT-TA--GAA-AT--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A---G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGA-T-ATA
gi|112721                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ACG--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCACA
gi|112722                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-TGA-G--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TA-----A-----AGG-TTATA
gi|112724                     : AATTC-AA--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112725                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ATC--C-T-T---T-GGAAC-CAT-T--G-A-GAG-T-T-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112726                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CC-------T-A-----A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-T-A-T--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112727                     : AATCC-AT--GT-TA--AGA-A---AACTCT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-G-C-A-A-A-A--G-TC-----AAT---AGGTTCAT
gi|112728                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C---T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112729                     : AATTC-AT--AT-TG--AAA-A---AAT-CT-------G-A-T-A-A--TGT-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112730                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---GT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-C--G-A---G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----TGG-TCA
gi|112732                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CTGATACACT-G-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112733                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------TGA-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-G-G-C-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112734                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AC-C-T-TG-G-A-G-GCT-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112735                     : AATCC-A---GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-T-A--C-C-T---T-G--AC-C-TCT--G-A-GTG-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112738                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-TCC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112739                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-------A--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112740                     : AATCC-AC--CCATA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-T-G-T-C---A-A-A--G-TCGA---A-----AGG-TCATA
gi|112741                     : AATTC-TT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112742                     : AATCC-AT-----TA--GAG-AC--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----AG----AGG-TC
gi|112743                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-C---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----ACACAGAGG-TCAT
gi|112744                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A--------T-------T-AAT-A-C--C-T-T-----G--AC-C-T-T--G-T-A-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112745                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112746                     : AATCC-AC--AT-TA--GAT-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-AC-----A-----AAGTTCATA
gi|112747                     : AATTC--T--AT-TG--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112748                     : AATCC-AT--GT-TG--TGA-T---G----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TT-G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-
gi|112750                     : AATTC-AT--GT-TT--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----------AGG-TCATA
gi|112752                     : AAACC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TT-----A-----AGG-TCTTA
gi|112753                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-TCT---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-AG-G-TCT----A-----AGG-TCATA
gi|112755                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT---------A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-A-T--T-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TGATA
gi|112756                     : AATTC-A---AT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112759                     : AATCC-AT--GT-TAGGAAA-A---A---CT-------TTG-T---C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----ACG-T
gi|112760                     : AATCC-AT--GT--A--GAA-A---A---CT-------T-A---A-A--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G---T-C-A-A-A----G-TC-----A-----AGT-TCATA
gi|112761                     : AATCC-AT--GT-CA--AAA-A-------CT-------T-T-G-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-C-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112762                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AG-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112763                     : AATCA-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--T-TC-----A-----AGG-TAATA
gi|112779                     :  ATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-T-A--A-T-T---T-T--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112780                     :  ATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCAT
gi|112781                     :  ATCC-AA--GT-TA--CAA----------T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112783                     :  ATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------T-C-T-A-A----T-T---T-G--AT-G-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112786                     :   TCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112787                     :   TCC-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---C-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-C--C-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112788                     :    CC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T---T-A-CTAC-T-T---T-G--AC-CCT-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-AAAG-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112791                     :      -AT--AT-TA--AAA-ATTAA---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AAG-TCATA
gi|112794                     :                    A-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA


blockSeqs                     :                       TTA ACT  GATACACT      CTAC     TGA T           TG   T   A   A             ATACA TACAG
blockSeqs                     :                       T   GA   TT            ACC      C   T           G    G   A   A             GA    CACAG
blockSeqs                     :                       C   AT   TG            CGC      .   T           T    G   C   A             A     TG   
blockSeqs                     :                       .   A    TT            TCC      .   T           .    G   .   A             T     AT   
blockSeqs                     :                       .   A    G             ATG      .   .           .    .   .   A             .     G    
blockSeqs                     :                       .   A    T             CT       .   .           .    .   .   A             .     G    
blockSeqs                     :                       .   A    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    A             AG       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    A             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             TA       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AG       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CA       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    A             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AG       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             GT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             TT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AG       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AG       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             AC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CA       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AA       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             CC       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             AT       .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             A        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             T        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    T             C        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    G             T        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    .             C        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    .             T        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    .             A        .   .           .    .   .   .             .     .    
blockSeqs                     :                       .   .    .             .        .   .           .    .   .   .             .     .    


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
finalCons                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA





Alignments
lowQualScore                  :      0  00  0  00   0 111 333  444444444 0 0 777777 0 111 1 11  0 0 0 11 0 1 0 1 0 2 0 0 0 11 0  22222 33333   0     
lowQualScore                  :      .  ..  .  ..   . ... ...  ......... . . ...... . ... . ..  . . . .. . . . . . . . . . .. .  ..... .....   .     
lowQualScore                  :      4  66  4  66   8 555 444  222222222 8 4 222222 4 111 6 00  4 8 4 33 4 6 8 2 4 4 4 4 4 00 4  33333 99999   8     
consensus                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
Reference ( family-183 )      : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------T-A-T-A-N--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112655                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112656                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112657                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA---------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCCTA
gi|112660                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112661                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112662                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A----T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----ATACAGAGG-TCAT
gi|112663                     : AATAC-AC--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112664                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---TT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-T--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112665                     : AATCC-AT--GT-CA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112666                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT---------A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112667                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----AG----GGG-TCATA
gi|112668                     : AATTT-AT--GT-TA--AAA-A---A----T-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----ATG---GGG-TCATA
gi|112671                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TT-----A-----AGG-TC
gi|112673                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TCATACAA-----AGG-TCAT
gi|112675                     : AATCC-AT--GT-TA--TGA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-ATA--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112676                     : AATCC-AT---T-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-CCATA
gi|112678                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--T-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----A-A-TCATA
gi|112679                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112680                     : AATGC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112681                     : AATCC-AT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112682                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112683                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112684                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112685                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112686                     : AATCCTAT--GT--A--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112687                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-TTGAT-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-ATA-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112688                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT---------A-C-A-T--A-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112689                     : AATTC-AT--GT-T---AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-TC--T-G--AC-C-T-T--G-ATG-G-----A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112690                     : AATCC-AT--GT-AA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-A--CCT-T---T-G--AC-C-T-T--GGA-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112691                     : AACTC-AT--GT-TA--AAAAA---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112692                     : AATCC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112693                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----AAA-TC
gi|112694                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--G-TC-----A-----AGA-TCATA
gi|112695                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TTGG-A-A-G-T-C-A-G-A-G--G-TC-----A-----
gi|112696                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112697                     : AATCT-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------TTA-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112698                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-T-T-C-A-A-A-G--C-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112699                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--G-C-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-----A-A--GTTC-----A-----AGG-TTATA
gi|112700                     : AATCC-AT--GT-GA--GAG-A---AGA-CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112701                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112702                     : AATCC-AC--GT-TA--AAA---------CT-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--CC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--T-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112703                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-A-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--A-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112704                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---C---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T----AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G--C-----A-----AGG-TCATA
gi|112706                     : AATCC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T-A-A-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112707                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A------T-T---T-GT-AT-C-T-C--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112708                     : AATTC-AA--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112709                     : AATTC-AT---T-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-T--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TCA----A-----AGG-TCATA
gi|112711                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------A-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112712                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---G---CT-------T-A-T-A-A--T-G-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-CC-----A-----AGG-TCATA
gi|112713                     : AATTC-ATCAGT-TA--AAA-A---A---CT-------T-AAT-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112714                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--ATTC-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112715                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---TTG--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112716                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112717                     : AATCC-AT--GT-TG--GAAGA---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----A-----A-G-CCATA
gi|112718                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-C-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-ATA-T--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112719                     : AATGC-AT--GT-TG--AAA-A---A---CG-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112720                     : AATCC-AC--GT-TA--GAA-AT--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A---G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGA-T-ATA
gi|112721                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ACG--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCACA
gi|112722                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-TGA-G--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TA-----A-----AGG-TTATA
gi|112724                     : AATTC-AA--GT-TA--GAA-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-C-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TG-----A-----AGG-TCATA
gi|112725                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-ATC--C-T-T---T-GGAAC-CAT-T--G-A-GAG-T-T-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112726                     : AATCC-AT--GT-TA--GAA-A---A---CC-------T-A-----A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-T-A-T--G-TC-----A-----AGG-TCA
gi|112727                     : AATCC-AT--GT-TA--AGA-A---AACTCT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-G-C-A-A-A-A--G-TC-----AAT---AGGTTCAT
gi|112728                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C---T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112729                     : AATTC-AT--AT-TG--AAA-A---AAT-CT-------G-A-T-A-A--TGT-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-GAT-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112730                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---GT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-C--G-A---G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----TGG-TCA
gi|112732                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CTGATACACT-G-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TA-----A-----AGG-TCATA
gi|112733                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------TGA-T-A-A--T-T-A---T-G--AC-C-T-T--G-G-G-C-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112734                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AC-C-T-TG-G-A-G-GCT-G-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112735                     : AATCC-A---GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-T-A--C-C-T---T-G--AC-C-TCT--G-A-GTG-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112738                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-T--T-T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-TCC-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TC
gi|112739                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A---AA--CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C-------A--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112740                     : AATCC-AC--CCATA--GAA-A---A---CT-------T-A-T-A----C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-T-G-T-C---A-A-A--G-TCGA---A-----AGG-TCATA
gi|112741                     : AATTC-TT--GT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-T-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112742                     : AATCC-AT-----TA--GAG-AC--A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----AG----AGG-TC
gi|112743                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-C---A---CT-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----ACACAGAGG-TCAT
gi|112744                     : AATCC-AT--GT-TA--GAG-A--------T-------T-AAT-A-C--C-T-T-----G--AC-C-T-T--G-T-A-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112745                     : AATCC-AT--GT-TA--AAA-A-------CC-------T-A-T-A-A--G-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-A-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TTATA
gi|112746                     : AATCC-AC--AT-TA--GAT-A-------CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-AC-----A-----AAGTTCATA
gi|112747                     : AATTC--T--AT-TG--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---TTG--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCAT
gi|112748                     : AATCC-AT--GT-TG--TGA-T---G----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-TT-G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-
gi|112750                     : AATTC-AT--GT-TT--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-T----T-T---T-G--AT-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----------AGG-TCATA
gi|112752                     : AAACC-AA--GT-TA--AAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TT-----A-----AGG-TCTTA
gi|112753                     : AATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-TCT---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-AG-G-TCT----A-----AGG-TCATA
gi|112755                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT---------A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-A-T--T-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TGATA
gi|112756                     : AATTC-A---AT-TA--AAA-A-------CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-G--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112759                     : AATCC-AT--GT-TAGGAAA-A---A---CT-------TTG-T---C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----ACG-T
gi|112760                     : AATCC-AT--GT--A--GAA-A---A---CT-------T-A---A-A--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G---T-C-A-A-A----G-TC-----A-----AGT-TCATA
gi|112761                     : AATCC-AT--GT-CA--AAA-A-------CT-------T-T-G-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-C-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112762                     : AATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AG-C-T-T--G-A-G-G-T-C---A-A-A--G-TC-----A-----
gi|112763                     : AATCA-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--A-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-T--T-TC-----A-----AGG-TAATA
gi|112779                     :  ATTC-AT--AT-TA--AAA-A---A---CT-------G-A-T-T-A--A-T-T---T-T--AC-A-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112780                     :  ATTC-AT--GT-TA--AAA-A---A---CA-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-AGG-G-T-CAA-A-A-A--G-TC-----------AGG-TCAT
gi|112781                     :  ATCC-AA--GT-TA--CAA----------T-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112783                     :  ATCC-AT--GT-TA--AAA-A---A---AT-------T-C-T-A-A----T-T---T-G--AT-G-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--G-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112786                     :   TCC-AT--GT-TA--GAG-A---A---CT-------T-A-T-A-C--C-T-T---T-A--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112787                     :   TCC-AA--GT-TA--GAG-A---A----T-------T-A-T-A-C--C-T-T---C-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-C--C-TC-----A-----TGG-TCATA
gi|112788                     :    CC-AT--GT-TA--GAT-A---A---CT-------T---T-A-CTAC-T-T---T-G--AC-CCT-T--G-A-G-G-T-C-A-A-A-AAAG-TC-----A-----AGG-TCATA
gi|112791                     :      -AT--AT-TA--AAA-ATTAA---CC-------T-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-A-G-T-C-A-A-A-G--G-TC-----A-----AAG-TCATA
gi|112794                     :                    A-A---A---CT-------G-A-T-A-A--T-T-T---T-G--AC-C-T-T--G-A-G-G-T-G-A-A-A-A--A-TC-----A-----AGG-TCATA