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Reference ( gi|7640 )         : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--G--A--G-AAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----TGA-T--------AT--AC-C--GGA----C------T--G--A----C------G---G---AC----A-------G----ACA-G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--GG-A--G-AAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----TGA-T--------TT--AC-C--GGA----C------T--G--A----C------G---G---AC----A-------G----ACA-G-A-CA-GAC
gi|7641                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--G--A--A-GAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----TGA-T--------TT--AC-C--GGA----C------T--G--A----C----------G---AC----A-------G----ACA-G-A-CA-GACA
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gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-ATATC-T-G-C-AA-GC-G-GT--A--A--G-AAAAAC--A----G-TAT--G-G-A--A--A---A-----C--------C--------AG--AG-C--GGA----G------A--G--AAT--G------G---G---AC----A-------G----ACA-G-A-CAGGACAgaca
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gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GA-A-GT--G--T--G-AAAAAA--A----G-TTC--G-G-A--A--A---A-----C----CAA-T--------
gi|7631                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--A--A--G-AAAAA---A----G-TTCT-G-G-AAGA--A---A-----C----CAA-T-------------C-G--GGA----C------A--G--AATG-G------G---G---AC----AG------G----ACA-G-A-CA-ggg
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-AT--C-T---C-AA-GC-A-GT--A--A--G-AAAAAA--A----G-TGT--G-G-A--A--A---AT----C----CAA-T--------G------G--GGA----C------A--G--A----CCCAACAA---G---ACATGAA-------G----ACA-G-A-CA-GACA
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gi|7639                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-T-AA-GC-A-GT--A--A--G---CAAA--A----G-TCT--G-G-A--A--A---A-----C----CAA-T--------G------G--GGA----CAGAA--T--G--G----G------G---G---AC----AG------G----ACA-A-A-CA-GACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-AT--A-T-G-C-GA-GC-A-GT--G--A--G-CAAAAA--G----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----CAA-T--------
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-AT--CCT-G-C-AA-GC---GT--A--A--G-AAAAA--------G-T-T--G-G-A--A--A---A-----C----CA------------------C--GGA----CG-----T--G--G----C------G---G---AC----A-------G----ACA-G-A-AA-GACAggggacaga
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-G---G--A--GAAAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----CCA----------AT--G-----GGA----C------G--G--AAATTG------G---G---AC----A-------G----ACA---A-CA-
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gi|7634                       : TATC-AA-A--G-AA-T-AT--C-T-G-C-A--GC-A-GT--A--A--G-AAAAAA--A----G-TCT--G-G-A--AACA---A-----C----CAA--------------AC-G--GGA----C------A--GGAA----T------G---GGA-AC----A-------G----ACAGG-A-CA-
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gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC---GT--A--A--T-AAAAAA--G----T-CTT--G-G-A--A--A---A-----C------A--------------AC-G--GGA----CGGTTAAT--G--G----G------G---G---AC----A-------G----ACA-A-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-AT--C-T-G-A-TA-G--A-GT--A--A--G-AAAAAA---------T-T--G-G-A--A--ACCAA-----CGGGACGG-T--------AT-----T--GGG----A------A--G--A----C------A---G---AC----AT------G----A-A-G-A-CA-GACA
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--G--A--G-AAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----TGA-T--------
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC-A-GT--G--A--G-AAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----TGA-T--------
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--A-T-G-C-AAAGC-A-GT--G--AAAG-AAAAAA--A----G-TGC--G-G-A--A--A---A-----C----CAA-T--------G------G--GGA----C------A--G--A----C------A---G---AC----A-------G----ATA-G-A-CA-GA
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GC---GT--A--C--G--CAAAA--G----G-TCT--G-G-A--A--A---A-----C----CAA-T--------GG--GA-C--AGA----A------T--G--G-----------G---G---AC----A-------G----AC--G-A-CA-GACAaagacagaca
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---AT--C-T-T-C----GC-A-GT--------G-AAAAAA--A----G-T-CTTG-G-A--G--A---A-----C----CAA-C--------GA--GA-C--GAA----T------T--G--G-----------G---G---A-----A-------G----ACA-A-A-C--GACA
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7735 ): TCAAATGATTCCTCACCAAGATAAAGAAAAAAGTCTGGGGAAACCAATGGGACGGAATTGGGACAGACAGACA
Unaligned ( gi|7741 ): AATGAATCTCACAAGCATAAAGAAAAAAAAAAGTCTGGAAAACCAATGGGACAGAGTGGG
Unaligned ( gi|7726 ): ATCAATGAATATCTGCAAGTGTCGACGAACGATAATAAAAGGAGTCTGGAAACCCACCAGGAGGCGGGAATGGGGACACGACAGACAG
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Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--GA---T---G---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
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gi|7622                       : TATC-AA-AATG-AA-TTA-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--AT--G-G----A--A---A-----C--C--AA---TCG-G---------G-A-C-GG--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7626                       : TATC-AA-A-AG-AA-T-A-T--T-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--A--A--A-TAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---C---G---------G-GAC-GG--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----A-A-CA-GACA
gi|7627                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7628                       : TACC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--AG-G-AAAAA--AA----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C--AA---TG--G---------G-A-C-GG--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7629                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-AGGT--G--A--GAAAAAA--AA----A---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---T---------A-C-C-GG--G----C-------G-A----C------G---G---AC-----G-------G----ACA----G-A-CAGGACA
gi|7631                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AG----T---T--CT--G-G-AAGA--A---A-----C--C--AA---T---------------C-G-GG--A----C----A--G-AATG-G------G---G---AC-----AG------G----ACA----G-A-CA-gac
gi|7632                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--GAAA--G-AAAAA--AA----GTCCT--GG--G-A-A--A--A---A-----C--C--AA---CGG-G---------A-C-A-GA--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7633                       : TATC-AA-A-TG-A--T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--A-GAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A------------------------------A-C-C-AG--A----C----G--G-A---------------G---AC-----AGAATGGGG----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7634                       : TATC-AA-A--G-AA-T-A-T--C-T-G-C-A--G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--AACA---A-----C--C--AAACGG---G---------A-C-A-GG--A----A----T--G-G-----------G---A---AC-----A-------G----ACAG---G-A-CA-
gi|7635                       : TATC-AA-A-TG-AA-A-T-T--C-T-G-C-AAAG----------C-ACGT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--C---A-----C--C--AA-----------------A-C-G-GG--A----C----A--G-AAT--G------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7636                       : TATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AATTC-A---T--G---G-G-A--A--A---AAAAACC--T--AA---C---GGGGGAAAAAA-C-CAGA--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7639                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-T-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---CAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----CAGAAT--G-G----G------G---G---AC-----AG------G----ACA----A-A-CA-GACA
gi|7640                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---AT--------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7641                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-GAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C----------G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7642                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7643                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7644                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7646                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---AAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG---------------G-A----C------A---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7647                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--AA---T---
gi|7648                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7649                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AG----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--TA---T---G---------------GG---------------G-A----C------A---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------T---G---AC-----G-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7656                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-C--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----C------A---G---ACATGA-A-------G----ACA----G-A-CA-GAgac
gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--CA----G---T--AT--G-G-A--A--A---A-----C--C--A--------G---------A-G-C-GG--A----G----A--G-AAT--G------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CAGGACA
gi|7661                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---TGG-G---------G-A-C-AG--A----C----A--G-A----C------G---G---ACATGA-A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---AC----C--C--AA---T---G---------------GG--A----C----G--G-AAATTG------G---G---AC-----A-------G----ACA------A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C--AA---TGGGG---------A-C-A-GG--A----C----A--T-A----C------A---G---ACATTGAA-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--------G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----C------AACAG---AC-----ATGAA---G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---GGA-------G-A-C-AG--A----C----T--G-A----C------A---G---GT-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-A-T--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---AT----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----CCCAACAA---G---ACATGA-A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---T---------T-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACG----G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7670                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--AA----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------
gi|7673                       : TATC-AA-A-GG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----C------A---G---AC-----A-------GGAAAACA----G-A-CG-GACAgg
gi|7674                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---gaca
gi|7675                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----A--G-A----C------A---G---AC-----G-------G----ACA----
gi|7676                       : TATC-AA-A-TA-A------T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG---------------G-A----C------A---G---AC-----A-------G----AAA----G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--ACTGGC----T--G-A----C------G---G---AC-----G-------G----AAA----G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--AG----T---C--TT--G-G-A--A--A---A-----CAAC--GG-------G---------A---C-GGTTA----A----T--G-G----G------G---G---AC-----A-------G----ACA----A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-A-T--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA--------G---T---T--G-G-A--A--A---A-----C--C--A----------------------C-GG--A----CG---T--G-G----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------T---G---AC-----G-------G----ACG----G-A-
gi|7683                       : TATC-AA-A-T--AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--C---A-----A--G--GT---T---T---------A-C-C-GG--A----C----TG-G-A----C------G---GCGCAC-----A-------G----ACA----GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7685                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--TAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------A---G---AC-----G-------G----ACG----G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A-------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C--AA---C---GGG-------A-C-G-GT--A----T----T--G-G-----------GAA-G---AC-----A-------G----ACATGAAG-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A----------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG---------------G-A----C------A---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
gi|7689                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---ACG----A-------G----ACG----G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--AA----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7693                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--AAAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A--GAT--T---T---------A-C-T-GG--A----C----T--G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACG----G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--AG----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----
gi|7695                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----GC--T--GC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---c
gi|7697                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7698                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACAA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--GAA----C------G---G---AC-----G-------G----ACG----G-A-
gi|7699                       : TATT-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T--GATT-T---T---------A-C-C-GG--AAC--C----T--G-A----C------G---G---AC-----G-------G----ACG----G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T--GAT--T---T---------A-C-C-GG--A----C----T--G-G----C------A---G---AC-----G-------G----ACG----G-
gi|7701                       : TATC-AA-AATG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--GA---T---
gi|7702                       : TATC-AA-A-TA-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--AA----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG---------------G-A----C------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--AG----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG--A----C----A--G-AATG-G------G---G---AC-----A-------G----AC-----G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA---T---
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--AA----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-----GG--A----C----A--G-A----C------A---G---AC-----A-------G----ATA----G-A-CA-GA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--AA----G---T---CTTG-G-A--G--A---A-----C--C--AA---C---G---------AGA-C-GA--A----T----T--G-G-----------G---G---A------A-------G----ACA----A-A-C--GACAaagacagaca
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gi|7730                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-GAC-GG--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--AA----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG--A----C----A--G-A----ATGG---G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---A---G---------------GG--A----C----A--G-A----ATGG---G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CT-GGCA
gi|7735                       :   TC-AA-A-TG-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--AA----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C--AA---T---GGG-------A-C-G-GA--A----T----T--G-------------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
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gi|7737                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--AA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------G-TAC-AG--A----C----T--A-A----T------G---G---AC-----A-------G----ACA----A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-TG-AT-T-C-C--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AG----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG--A----C----A--G-A----ATGG---G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA---T---G---------------GG--A----C----G--A-A----T------G---G----------G-------G----ACA----G-A-CA-GACA
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gi|7743                       :                                                            a-AAAAA--AA----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC---G---G---------G-A-C-GG--A----A----T--G-G-----------G---G---AC-----A-------G----ACA----G-A-CA-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7741 ): AATGAATCTCACAAGCATAAAGAAAAAAAAAAGTCTGGAAAACCAATGGGACAGAGTGGG






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Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--GA--T-----G-----G---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
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gi|7646                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---AAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------A---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-
gi|7647                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--AA--T-----
gi|7648                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7649                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--TA--T-----G-----G----------------------------------------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--TTTACCG-----G---------A-C-TG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GAC
gi|7656                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-C--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------A---G---ACATGA-A----G----ACA----G-A-CA-GA
gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-ATATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--C---A----G---TAT--G-G-A--A--A---A-----C--CA-GAG-C-----G-----G---------A-G-AG--A----A----T--G---------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CAGGACA
gi|7661                       : TATC-AA---TG-AA-T-AT--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--TGG---G-----G---------A-C-AG--A----C----A--G-AC------G---G---ACATGA-A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---AC----C--C--AA--TG----G-----G---------A-C-GGAAA----T----T--G---------G---G---AC-----A----G----ACA------A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-ATTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--A-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----GGGA------C-A-GG--A----C----A--T-AC------A---G---ACATTGAA----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-ATT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA-----------G---TGC--A-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------AACAG---AC-----ATGAAG----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-TG-AA-T-AT--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----GGA---G---------A-C-AG--A----C----T--G-AC------A---G---GT-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-AT--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---AT----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-ACCCAACAA---G---ACATGA-A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----T-----T---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACG----G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7670                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---TTC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------
gi|7673                       : TATC-AA-A-GG-AA-T-AT--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TAC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------A---G---AC-----A----GGAAAACA----G-A-CG-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----gaca
gi|7675                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T----------------------------------T----T--A-CC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CG-GACA
gi|7676                       : TATC-AA-A-TA-A-----T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------A---G---AA-----A----G----ATA----G-A-CA-
gi|7679                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--ACTGGC----T--G-AC------G---G---AC-----G----G----AAA----G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--A---G----T---CTT--G-G-A--A--A---A-----CAAC--G---------G-----G---------A-C-GGTTA----A----T--G-GG------G---G---AC-----A----G----ACA----A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-AT--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA-----------G---T-T--G-G-A--A--A---A-----C--C--A---------------------------C-GG--A----CG---T--G-GC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------T---G---AC-----G----G----ACG----G-A-
gi|7683                       : TATC-AA-A-T--AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--C---A-----A--G--GT--T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----TG-G-AC------G---GCGCAC-----A----G----ACA----GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A---------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--TAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------A---G---AC-----G----G----ACG----G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-AT--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A--------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C--AA--C-----G-----G---------GAC-GGT-A----T----T--G-G-------GAA-G---AC-----A----G----ACATGAAG-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-----------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G----------------------------------------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7689                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-AC------G---G---ACG----A----G----ACG----G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---TTC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--A--GAT-T-----T-----A---------C-T-GG--A----C----T--G-AC------G---G---AC-----A----G----ACG----G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-AT--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---G----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-A
gi|7695                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--TGC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----c
gi|7697                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7698                       : TATC-AA---TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACA---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--GAAC------G---G---AC-----G----G----ACG----G-A-
gi|7699                       : TATT-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--GCG-A--A--A---A-----C--T--GATTT-----T-----A---------C-C-GG--AAC--C----T--G-AC------G---G---AC-----G----G----ACG----G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---TGC--G-A-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T-----A---------C-C-GG--A----C----T--G-GC------A---G---AC-----G----G----ACG----G-
gi|7701                       : TATC-AA-AATG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-TA-AA-G-TT--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A--------G---TGC--G-G-A--A--A---------C--C--AA--T-----G-----G--------------G---------------G-AC------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--TG----G-----G---------A-C-AG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----AC-----G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-AT--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--A---A----G---TGC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G-------------GG--A----C----A--G-AC------A---G---AC-----A----G----ATA----G-A-CA-GA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---AT--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--A---A----G---T-CTTG-G-A--G--A---A-----C--C--AA--C-----GA----G---------A-C-GA--A----T----T--G-G-------G---G---A------A----G----ACA----A-A-C--GACAaagacagaca
gi|7726                       :  ATC-AA---TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-GTGTCGACGAAC-G-AT--A--A--T-AAAAG--G---A----G---TCT--G-G-A--A--ACCCA-----C--CAGGA--------G-----G---------C-G-GG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----AC---G----ACA----G-A-CA-
gi|7730                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCAT--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------GAC-GG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-AT--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---TGT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCAT--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------GAC-AG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-CC--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AAA-G-----G-----G---------A-C-AG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CT-GGCA
gi|7736                       :   TC-AA-A-TT-GA-T-TC--C-TCA-C-AA-G----------C-A-TT--A--AA-G-AAAAA--A---A----G---T-CTTG-G-A--A--A---A-----C--C--AA--C-----G-----G---------A-C-GG--A------------A-AG------G---G---AC-----AT---G----ACA----G-A-CC-GAC
gi|7737                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-CC--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--A---A----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------TAC-AG--A----C----T--A-AT------G---G---AC-----A----G----ACA----A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-TG-AT-T-CC--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---G----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------GAC-AG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-TG-AA-TCAT--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-------------------GG--A----C----G--A-AT------G---G----------G----G----ACA----G-A-CA-GACA
gi|7741                       :       A-A-TG-AA-T-CT--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---TCT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G-----G---------
gi|7742                       :                                                      --A--G-GAACA--A---A----G---TCA--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----GCATGGG---------A-T-GG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-GACAgacagagtggg
gi|7743                       :                                                           a-AAAAA--A---A----G---T-C--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC--G-----G-----G---------A-C-GG--A----A----T--G-G-------G---G---AC-----A----G----ACA----G-A-CA-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7735 ): TCAAATGATTCCTCACCAAGATAAAGAAAAAAGTCTGGGGAAACCAATGGGACGGAATTGGGACAGACAGACA






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gi|7671                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G-
gi|7673                       : TATC-AA-A-G-G-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC--T-----G--G------GG-----A--C------AG-A-----C------A--G---AC-----A----GGAAAAC----A-G-A-CG-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----gaca
gi|7675                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-------------------------T------TA-C-----C------G--G---AC-----A----G----AC----A-G-A-CG-GACA
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gi|7678                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G------GG-----A------------------C------A--G---AC-----A----G----AA----A-G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--TTTACCG--G-A--C-TG-----G--C------TG-A-----C------G--G---AC-----G----G----AA----A-G-A-TA-GACA
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gi|7683                       : TATC-AA-A-T---AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--C---A-----A--G--GT--T-----T--A-C--C-GG-----A--C------TG-GA----C------G--GCGCAC-----A----G----AC----A-GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--TAT-T-----T--A-C--C-GG-----A--C------TG-A-----C------A--G---AC-----G----G----AC----G-G-A-
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gi|7688                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-------------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G---------------------------------------G--G---AC-----A----G----AC----A-G-A-CA-GACA
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gi|7690                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A--GA--T-----T--T-A--CTGG-----A--C------TG-A-----C------G--G---AC-----A----G----AC----G-G-A-CA-AACA
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gi|7695                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--T--GC--G-A-A--A--A---aga
gi|7696                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----c
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gi|7699                       : TATT-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T--GATTT-----T--A-C--C-GG-----AACC------TG-A-----C------G--G---AC-----G----G----AC----G-G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T--GAT-T-----T--A-C--C-GG-----A--C------TG-G-----C------A--G---AC-----G----G----AC----G-G-
gi|7701                       : TATC-AA-AAT-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C--GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-T-A-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G------GG-----A------------------C------G--G---AC-----A----G----AC----A-G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--TG----G--G-A--C-AG-----A--A------TG-G------------G--G---AC-----A----G----AC------G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T--GA--T-----
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gi|7735                       :   TC-AA-A-T-G-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G-GA-C-GG-----AA-T------TG-G-------------------------------G----AC----A-G-A-CA-GACA
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gi|7740                       :       A-A-T-G-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--T-----G--G-G--A-CG-----A--A------TG-G------------G--G---AC-----A----G----AC----A-G-A-CA-
gi|7741                       :       A-A-T-G-AA-T-C-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C--AA--TG----G--G-A--C-AG-----A--G------TG-G-----
gi|7743                       :                                                              -AAAAA--A---A----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C--AC--G-----G--G-A--C-GG-----A--A------TG-G------------G--G---AC-----A----G----AC----A-G-A-CA-g
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7742 ): AAGGAACAAAGTCAGGAAAACCAATGCATGGGATGGAATGGGGACAGACAGACAGACA






Alignments
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Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----G--G--------A-C--GG--A--NTG-G-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7592                       : TATC-AA-G-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--C--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
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gi|7598                       : TATC-AA-G-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-T--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GA
gi|7600                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-
gi|7601                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A--T-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-GAA--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7603                       : TATC-AA-AAT-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A--ATG-G------------A--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7604                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-C-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7608                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTAAG--A--A-AAAAA--A---A----G---T---C--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7609                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--AG-G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7610                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7611                       : TATC-AA-A-A-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7613                       : TATC-AA-A-T-G-AA-A-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-C--GACA
gi|7614                       : TATC-AA-A-T-A-AA---A-T--C-T-GTC-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-C
gi|7615                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7616                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----
gi|7621                       : TATC-AA-AAT-G-AA-TTA-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AT--G-G----A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACAtgaat
gi|7622                       : TATC-AA-AAT-G-AA-TTA-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AT--G-G----A--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7626                       : TATC-AA-A-A-G-AA-T-A-T--T-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--A--A--A-TAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-A-A-CA-GACA
gi|7627                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7628                       : TACC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--AG-G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7629                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-AGGT--G--A--GAAAAAA--A---A----A---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTACC-G--G--------G-C---G--A--CGG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----AGG-A-CA-GAC
gi|7631                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----T---T--CT--G-G-AAGA--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----AGGAC----A-G-A-CA-
gi|7632                       : TATC-AA-A-T-G-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--GAAA--G-AAAAA--A---A----GTCCT--GG--G-A-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-CA-GA--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7633                       : TATC-AA-A-T-G-A--T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-GAA--A--A---A-----C--CA-----GA--C-----GGAG--------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7634                       : TATC-AA-A---G-AA-T-A-T--C-T-G-C-A--G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--AACA---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-CA-GG--A--ATG-G------------G--AAC-----A-GAC----AGG-A-CA-
gi|7635                       : TATC-AA-A-T-G-AA-A-T-T--C-T-G-C-AAAG----------C-ACGT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--C---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-C--AG--A--ATG--------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7636                       : TATC-AA-A-T-G-AA---A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---ATTC-A---T--G---G-G-A--A--A---AAAAACC--T------AA--C-----G--GGGGAAAAAA-CCAGA--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7639                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-T-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---CAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A--ATG-G-----G------G--GAC-----AGGAC----A-A-A-CA-GACA
gi|7640                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----A--T--------ACC--GG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7641                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTG-A-----C---------GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7642                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7643                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7644                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7646                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---AAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A------------C------A--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7647                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------AA--T-----
gi|7648                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7649                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------TA--T-----G--G-------------------------------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GAC
gi|7656                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-C--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A--CAG-A-----C------A--GACATGA-A-GAC----A-G-A-CA-GA
gi|7658                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-TATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--C---A----G---T--AT--G-G-A--A--A---A-----C--CA-----GAG-C-----G--G--------A-G--AG--A--ATG--------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CAGGACA
gi|7661                       : TATC-AA---T-G-AA-T-A-T--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A--CAG-A-----C------G--GACATGA-A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---AC----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GGAAA--TTG--------------G--GAC-----A-GAC----A---A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-TTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A--CAG-GACATAC------A--GACATTGAA-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-TT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA-----------G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A--C-A-A-----C------A--GACATGA-A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-T-G-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----GGAG--------A-C--AG--A--CTG-A-----C------A--GGT-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-T-GAAA-T-A-T--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---AT----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A--CAG-A-----CCCAACAA--GACATGA-A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------C-C--GG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----G-G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7670                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7671                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G--------
gi|7673                       : TATC-AA-A-G-G-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--CACTGGGGA--C-----A--G--------A-C--AG--A--CAG-G-----A------A--AAC-----A-GAC----G-G-A-CA-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7675                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------A-C-------------------C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CG-GACA
gi|7676                       : TATC-AA-A-T-A-A------T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--A--------C-C--GG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A------------C------A--GAC-----A-GAA----A-G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--G--CTG-A-----C------G--GAC-----G-GAA----A-G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-T-GGAA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--A---G----T---C--TT--G-G-A--A--A---A-----CAAC------G---------G--G--------A-C--GGTTA--ATG-G-----G------G--GAC-----A-GAC----A-A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-T-G-AA-T-A-T--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA-----------G---T---T--G-G-A--A--A---A-----C--C-------A--C-----G--G--------A-C--G-------TG-G-----C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----G-GA
gi|7683                       : TATC-AA-A-T---AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--AC-A---A---------------GG--TTTACCG--G--------A-C--TG--G--ACG-G-----C------G--CAC-----A-GAC----A-GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------TA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTG-A-----C------A--GAC-----G-GAC----G-G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGG-AA-T-A-T--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A----------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--GGT-A--TTG-G------------GAAGAC-----A-GACATGAA-G-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-------------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------------------------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7689                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTG-A-----C------G--GACG----A-GAC----G-G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A------GA--T-----T--T--------A-CT-GG--A--CTG-A-----C------G--GAC-----A-GAC----G-G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-T-G-AA-T-A-T--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A--
gi|7695                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--T--GC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----c
gi|7697                       : TATC-AA-A-T-G-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7698                       : TATC-AA---T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACA---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTGAA-----C------G--GAC-----G-GAC----G-G-A-
gi|7699                       : TATT-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T------GATTT-----T--A--------C-C--GG--AACCTG-A-----C------G--GAC-----G-GAC----G-G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A--CTG-G-----C------A--GAC-----G-GAC----G-G-
gi|7701                       : TATC-AA-AAT-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-T-A-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A------------C------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC------G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7722                       :  ATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7723                       :  ATC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A--CAG-A-----C------A--GAC-----A-GAT----A-G-A-CA-GA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-T-G-AA---A-T--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--G--A---A-----C--C------AA--C-----GA-G--------A-C--GA--A--TTG-G------------G--GA------A-GAC----A-A-A-C--GACAaagacagaca
gi|7726                       :  ATC-AA---T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-GTGTCGACGAAC-G-AT--A--A--T-AAAAG--G---A----G---T--CT--G-G-A--A--ACCCA-----C--C------AG--G-----A--G--------G-CG-GG--A--ATG-G------------G--GAC-----ACGAC----A-G-A-CA-G
gi|7730                       :   TC-AA-A-T-G-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-T-G-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-T-G-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-T-G-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AAA-G-----G--G--------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CT-GGCA
gi|7735                       :   TC-AA-A-T-G-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A--AT--------T------G--G---------GAC----A-G-A-CA-GACA
gi|7736                       :   TC-AA-A-T-T-GA-T-T-C--C-TCA-C-AA-G----------C-A-TT--A--AA-G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--G--------A-C--GG--A--AAG--------------G--GAC-----ATGAC----A-G-A-CC-GAC
gi|7737                       :   TC-AA-A-T-G-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GT-------A-C--AG--A--CTA-A-----T------G--GAC-----A-GAC----A-A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-T-G-AT-T-C-C--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-T-G-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C---G--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-
gi|7741                       :       A-A-T-G-AA-T-C-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A--GTG-G-----
gi|7742                       :                                                        --A--G-GAACA--A---A----G---T--CA--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--C--------A-T--GG--G--ATG-GAA---T------G--GG--------GAC----A-G-A-CA-GACAg
gi|7743                       :                                                             a-AAAAA--A---A----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C------AC--G-----G--G--------A-C--GG--A--ATG-G------------G--GAC-----A-GAC----A-G-A-CA-gaca





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                            11111                                    111                                   
lowQualScore                  :     0  0 1  1  0 2 0 11 0 0 0 0  0 1111111111 0 1  11 00 11 1     00 000 1111 111 111 11 0 0 00 00 000 11111 00 222222  22 77777 22 6666666666 33  00 555555555 00  666 0   44444 2   1111 2222 0 0  0    
lowQualScore                  :     .  . .  .  . . . .. . . . .  . .......... . .  .. .. .. .     .. ... .... ... ... .. . . .. .. ... ..... .. ......  .. ..... .. .......... ..  .. ......... ..  ... .   ..... .   .... .... . .  .    
lowQualScore                  :     4  4 6  2  8 0 4 55 4 8 4 4  8 8888888888 4 2  00 66 88 2     66 777 6666 111 666 11 4 8 55 99 777 99999 66 111111  66 55555 11 8888888888 66  88 999999999 88  888 6   66666 4   3333 5555 6 6  7    
consensus                     : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7592                       : TATC-AA-G-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--C--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7593                       : TATC-AA-G-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--C--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GGGACA-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
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gi|7604                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-C-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7608                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTAAG--A--A-AAAAA--A---A----G---T---C--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
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gi|7622                       : TATC-AA-AATG-AA-TTA-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AT--G-G----A--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7626                       : TATC-AA-A-AG-AA-T-A-T--T-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--A--A--A-TAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----A-A-CA-GACA
gi|7627                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7628                       : TACC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--AG-G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7629                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-AGGT--G--A--GAAAAAA--A---A----A---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTACC-G--G--------G-C--G----------A--C--GGA-CG-GAC-----A-GAC----AG---G-A-CA-GAC
gi|7631                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----T---T--CT--G-G-AAGA--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----AGGAC----A----G-A-CA-
gi|7632                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--GAAA--G-AAAAA--A---A----GTCCT--GG--G-A-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-CA-GA--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7633                       : TATC-AA-A-TG-A--T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-GAA--A--A---A-----C--CA-----GA--C-----GGAG--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7634                       : TATC-AA-A--G-AA-T-A-T--C-T-G-C-A--G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--AACA---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-CA-GG--A------A--T--GG---G-AAC-----A-GAC----AG---G-A-CA-
gi|7635                       : TATC-AA-A-TG-AA-A-T-T--C-T-G-C-AAAG----------C-ACGT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--C---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7636                       : TATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---ATTC-A---T--G---G-G-A--A--A---AAAAACC--T------AA--C-----G--GGGGAAAAAA-CCAGA--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7639                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-T-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---CAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG--GG-GAC-----AGGAC----A----A-A-CA-GACA
gi|7640                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----A--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7641                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--C--GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7642                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7643                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7644                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7646                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---AAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7647                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------AA--T-----
gi|7648                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7649                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------TA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7656                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-C--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GACATGAA----G-A-CA-GACA
gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--C---A----G---T--AT--G-G-A--A--A---A-----C--CA-----GAG-C-----G--G--------A-G--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CAGGACAga
gi|7661                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------C--A--GA--CG-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---AC----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------AATT--G----G-GAC-----A-GAC----A------A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-CA-GG--AC-----A--T---A--CA-GACATTGAA-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA-----------G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG---------A--C--AA--CA-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----GGAG--------A-C--AG--A------C--T--GA--CA-GGT-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-A-T--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---AT----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--ACCCAACA--A--GA--CATGA------A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7670                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G--------
gi|7673                       : TATC-AA-A-GG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--CACTGGGGA--C-----A--G--------A-C--AG--A------C--A--GG--AA-AAC-----A-GAC----G----G-A-CA-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7675                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------A-C-----------------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CG-GACA
gi|7676                       : TATC-AA-A-TA-A------T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--A--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------C--T--GA--CG-GAC-----G-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--A---G----T---C--TT--G-G-A--A--A---A-----CAAC------G---------G--G--------A-C--GGTTA------A--T--GG--GG-GAC-----A-GAC----A----A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-A-T--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA-----------G---T---T--G-G-A--A--A---A-----C--C-------A--C-----G--G--------A-C--G-------------T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----G-GA
gi|7683                       : TATC-AA-A-T--AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--AC-A---A---------------GG--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------A--C--GG--CG-CAC-----A-GAC----A----GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------TA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CA-GAC-----G-GAC----G----G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A----------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--T------A--TTGGG--AA-GAC-----A-GAC----ATGAAG-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-------------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7689                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GACG----A-GAC----G----G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A------GA--T-----T--T--------A-CT-GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------
gi|7695                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--T--GC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----c
gi|7697                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7698                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACA---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------A--C--GGA-CG-GAC-----G-GA
gi|7699                       : TATT-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T------GATTT-----T--A--------C-C--GG--A------ACCT--GA--CG-GAC-----G-GAC----G----G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GG--CA-GAC-----G-GAC----G----G-
gi|7701                       : TATC-AA-AATG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-TA-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC---------G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAC----A----G-A-TA-GACA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--G--A---A-----C--C------AA--C-----GA-G--------A-C--GA--A------T--T--GG---G-GA------A-GAC----A----A-A-C--GACAgaaagacagaca
gi|7726                       :  ATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-GTGTCGACGAAC-G-AT--A--A--T-AAAAG--G---A----G---T--CT--G-G-A--A--ACCCA-----C--C------AG--G-----A--G--------G-CG-GG--A------A--T--GG---G-GAC-----ACGAC----A----G-A-CA-G
gi|7730                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AAA-G-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GGCA
gi|7735                       :   TC-AA-A-TG-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--TG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7736                       :   TC-AA-A-TT-GA-T-T-C--C-TCA-C-AA-G----------C-A-TT--A--AA-G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--G--------A-C--GG--A------A--A--G----G-GAC-----ATGAC----A----G-A-CC-GAC
gi|7737                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GT-------A-C--AG--A------C--T--AA--TG-GAC-----A-GAC----A----A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-TG-AT-T-C-C--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C---G--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7741                       :       A-A-TG-AA-T-C-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------G--T--GG--
gi|7742                       :                                                       --A--G-GAACA--A---A----G---T--CA--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--C--------A-T--GG--G------A--T--GGAATG-GG--------GAC----A----G-A-CA-GACAg
gi|7743                       :                                                            a-AAAAA--A---A----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C------AC--G-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-gaca





Alignments
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lowQualScore                  :     0  0 1  1  0 2 0 11 0 0 0 0  0 1111111111 0 1  11 00 11 1     00 000 1111 111 111 11 0 0 00 00 000 11111 00 222222  22 77777 22 6666666666 33  00 555555555 00  666 0   44444 2   1111 2222 0 0  0    
lowQualScore                  :     .  . .  .  . . . .. . . . .  . .......... . .  .. .. .. .     .. ... .... ... ... .. . . .. .. ... ..... .. ......  .. ..... .. .......... ..  .. ......... ..  ... .   ..... .   .... .... . .  .    
lowQualScore                  :     4  4 6  2  8 0 4 55 4 8 4 4  8 8888888888 4 2  00 66 88 2     66 777 6666 111 666 11 4 8 55 99 777 99999 66 111111  66 55555 11 8888888888 66  88 999999999 88  888 6   66666 4   3333 5555 6 6  7    
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Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7592                       : TATC-AA-G-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--C--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
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gi|7604                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-C-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
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gi|7635                       : TATC-AA-A-TG-AA-A-T-T--C-T-G-C-AAAG----------C-ACGT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--C---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
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gi|7649                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------TA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7656                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-C--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GACATGAA----G-A-CA-GACA
gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--C---A----G---T--AT--G-G-A--A--A---A-----C--CA-----GAG-C-----G--G--------A-G--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CAGGACAga
gi|7661                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------C--A--GA--CG-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---AC----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------AATT--G----G-GAC-----A-GAC----A------A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-CA-GG--AC-----A--T---A--CA-GACATTGAA-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA-----------G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG---------A--C--AA--CA-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----GGAG--------A-C--AG--A------C--T--GA--CA-GGT-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-A-T--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---AT----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--ACCCAACA--A--GA--CATGA------A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7670                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G--------
gi|7673                       : TATC-AA-A-GG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--CACTGGGGA--C-----A--G--------A-C--AG--A------C--A--GG--AA-AAC-----A-GAC----G----G-A-CA-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7675                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------A-C-----------------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CG-GACA
gi|7676                       : TATC-AA-A-TA-A------T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--A--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------C--T--GA--CG-GAC-----G-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--A---G----T---C--TT--G-G-A--A--A---A-----CAAC------G---------G--G--------A-C--GGTTA------A--T--GG--GG-GAC-----A-GAC----A----A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-A-T--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA-----------G---T---T--G-G-A--A--A---A-----C--C-------A--C-----G--G--------A-C--G-------------T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----G-GA
gi|7683                       : TATC-AA-A-T--AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--AC-A---A---------------GG--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------A--C--GG--CG-CAC-----A-GAC----A----GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------TA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CA-GAC-----G-GAC----G----G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A----------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--T------A--TTGGG--AA-GAC-----A-GAC----ATGAAG-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-------------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7689                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GACG----A-GAC----G----G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A------GA--T-----T--T--------A-CT-GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------
gi|7695                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--T--GC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----c
gi|7697                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7698                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACA---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------A--C--GGA-CG-GAC-----G-GA
gi|7699                       : TATT-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T------GATTT-----T--A--------C-C--GG--A------ACCT--GA--CG-GAC-----G-GAC----G----G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GG--CA-GAC-----G-GAC----G----G-
gi|7701                       : TATC-AA-AATG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-TA-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC---------G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAC----A----G-A-TA-GACA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--G--A---A-----C--C------AA--C-----GA-G--------A-C--GA--A------T--T--GG---G-GA------A-GAC----A----A-A-C--GACAgaaagacagaca
gi|7726                       :  ATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-GTGTCGACGAAC-G-AT--A--A--T-AAAAG--G---A----G---T--CT--G-G-A--A--ACCCA-----C--C------AG--G-----A--G--------G-CG-GG--A------A--T--GG---G-GAC-----ACGAC----A----G-A-CA-G
gi|7730                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AAA-G-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GGCA
gi|7735                       :   TC-AA-A-TG-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--TG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7736                       :   TC-AA-A-TT-GA-T-T-C--C-TCA-C-AA-G----------C-A-TT--A--AA-G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--G--------A-C--GG--A------A--A--G----G-GAC-----ATGAC----A----G-A-CC-GAC
gi|7737                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GT-------A-C--AG--A------C--T--AA--TG-GAC-----A-GAC----A----A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-TG-AT-T-C-C--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C---G--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7741                       :       A-A-TG-AA-T-C-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------G--T--GG--
gi|7742                       :                                                       --A--G-GAACA--A---A----G---T--CA--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--C--------A-T--GG--G------A--T--GGAATG-GG--------GAC----A----G-A-CA-GACAg
gi|7743                       :                                                            a-AAAAA--A---A----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C------AC--G-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-gaca


blockSeqs                     :          A  A    T   AT            TGTCGACGAA   G        AA A            AAGG TCC CTG TT               AAAAC    ACTGGG  AC TTACC GA GGGAAAAAA  CA     CCCAACA       GAC     ATTGA G   ATGA TGAA
blockSeqs                     :          A  G    T   TT            .            C        G  A            TTC  C   C   TT               C        A       AC TTACC GA GA         A      AAT           AAT     ATGA  G   .    G   
blockSeqs                     :          A  G    C   T             .            T        G  A            .    .   G   .                T        A       TT TTACC A  AC         A      ACC           AC      ATGA  C   .    G   
blockSeqs                     :          A  .    C   .             .            .        A  .            .    .   G   .                .        .       G  TTACC .  AC         A      CA            AC      G     T   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    C   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       A  TTACC .  AC         T      A             G       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  TACC  .  AC         G      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  CG    .  GA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  CG    .  AC         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  GG    .  AC         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   T   .                .        .       .  GG    .  GA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  GG    .  GA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   T   .                .        .       .  GG    .  GA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   A   .                .        .       .  GG    .  TA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  GG    .  GA         .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   A   .                .        .       .  G     .  A          .      A             A       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   A   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      A             G       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  G     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  G          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  G     .  A          .      C             A       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  .     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             C       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             T       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  C          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   A   .                .        .       .  .     .  C          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      T             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  C          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   T   .                .        .       .  .     .  A          .      C             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   A   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  G          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      G             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      A             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   T   .                .        .       .  .     .  A          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  A          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .      .             .       .     .   .    .   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .      .             .       .     .            
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .      .             .       .     .            
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   T   .                .        .       .  .     .  .          .      .                                        
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .  .          .                                               
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .     .                                                             
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   C   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
blockSeqs                     :          .  .    .   .             .            .        .  .            .    .   G   .                .        .       .  .                                                                   
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Reference ( family-178 )      : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
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gi|7622                       : TATC-AA-AATG-AA-TTA-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AT--G-G----A--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7626                       : TATC-AA-A-AG-AA-T-A-T--T-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--A--A--A-TAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----A-A-CA-GACA
gi|7627                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7628                       : TACC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--AG-G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7629                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-AGGT--G--A--GAAAAAA--A---A----A---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTACC-G--G--------G-C--G----------A--C--GGA-CG-GAC-----A-GAC----AG---G-A-CA-GAC
gi|7631                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----T---T--CT--G-G-AAGA--A---A-----C--C------AA--TCG---G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----AGGAC----A----G-A-CA-
gi|7632                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--GAAA--G-AAAAA--A---A----GTCCT--GG--G-A-A--A--A---A-----C--C------AA--CG----G--G--------A-CA-GA--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7633                       : TATC-AA-A-TG-A--T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-GAA--A--A---A-----C--CA-----GA--C-----GGAG--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7634                       : TATC-AA-A--G-AA-T-A-T--C-T-G-C-A--G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--AACA---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-CA-GG--A------A--T--GG---G-AAC-----A-GAC----AG---G-A-CA-
gi|7635                       : TATC-AA-A-TG-AA-A-T-T--C-T-G-C-AAAG----------C-ACGT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--C---A-----C--C------AAACG-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7636                       : TATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---ATTC-A---T--G---G-G-A--A--A---AAAAACC--T------AA--C-----G--GGGGAAAAAA-CCAGA--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7639                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-T-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---CAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG--GG-GAC-----AGGAC----A----A-A-CA-GACA
gi|7640                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----A--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7641                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--C--GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7642                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7643                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7644                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT-----A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7646                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G---AAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7647                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------AA--T-----
gi|7648                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7649                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---
gi|7650                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-C-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------TA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7651                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GTG-G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7655                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-A-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7656                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AC-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-C--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GACATGAA----G-A-CA-GACA
gi|7658                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TATC-T-G-C-AA-G----------C-G-GT--A--A--G-AAAAA--C---A----G---T--AT--G-G-A--A--A---A-----C--CA-----GAG-C-----G--G--------A-G--AG--A------A--T--G----G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CAGGACAga
gi|7661                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C---G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------C--A--GA--CG-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7662                       : TATT-CA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-G---G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---AC----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--GG--A------AATT--G----G-GAC-----A-GAC----A------A-CA-
gi|7663                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TTTC-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-CA-GG--AC-----A--T---A--CA-GACATTGAA-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7664                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-TT-C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA-----------G---T--GC--A-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG---------A--C--AA--CA-GACATGA-A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7666                       : TACC-AATA-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----GGAG--------A-C--AG--A------C--T--GA--CA-GGT-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7667                       : TATC-AA-A-TGAAA-T-A-T--C-T---C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---AT----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--ACCCAACA--A--GA--CATGA------A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7668                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CG-GAaca
gi|7669                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7670                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7671                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------A-A-GT--G--T--G-AAAAA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G--------
gi|7673                       : TATC-AA-A-GG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AA-G----------A-A-AT--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--AC--G-G-A--A--A---A-----C--CACTGGGGA--C-----A--G--------A-C--AG--A------C--A--GG--AA-AAC-----A-GAC----G----G-A-CA-GACAg
gi|7674                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--A-ATAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7675                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-AT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------A-C-----------------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CG-GACA
gi|7676                       : TATC-AA-A-TA-A------T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAA---A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--A--------C-C--GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GAC
gi|7678                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-T-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7679                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------C--T--GA--CG-GAC-----G-GAA----A----G-A-TA-GACA
gi|7680                       : TATCGAA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--T-AAAAA--A---G----T---C--TT--G-G-A--A--A---A-----CAAC------G---------G--G--------A-C--GGTTA------A--T--GG--GG-GAC-----A-GAC----A----A-A-
gi|7681                       : TAT--AA-A-TG-AA-T-A-T--CCT-G-C-AA-G----------C---GT--A--A--G-AAAAA-----------G---T---T--G-G-A--A--A---A-----C--C-------A--C-----G--G--------A-C--G-------------T--GG--CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-AA-GACA
gi|7682                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------C--T--GA--CG-GAC-----G-GA
gi|7683                       : TATC-AA-A-T--AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--AC-A---A---------------GG--TTTACCG--G--------A-C--TG--G------A--C--GG--CG-CAC-----A-GAC----A----GAA-CA-GAC
gi|7684                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A--------T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7685                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A-----------GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------TA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CA-GAC-----G-GAC----G----G-A-
gi|7687                       : TATC-AA-A-TGGAA-T-A-T--C-T-G-A-TA-G------------A-GT--A--A--G-AAAAA--A----------------T--T-G-G--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--GG-------A-C--GG--T------A--TTGGG--AA-GAC-----A-GAC----ATGAAG-A-CA-GACA
gi|7688                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A-------------------------------G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-----------------------------------G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7689                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-CAAA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GA--CG-GACG----A-GAC----G----G-A-C--GACA
gi|7690                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--
gi|7691                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-A----------C-A-GT--G--A--G-AAAGA--A---A----G---T--TC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7693                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G-AGAAA--A---AAAGGG---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--A------GA--T-----T--T--------A-CT-GG--A------C--T--GA--CG-GAC-----A-GAC----G----G-A-CA-AACA
gi|7694                       : TATC-AG-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-GA-G----------C-A-GT--G--A--G-CAAAA--A---G----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TGG---G--G--------A-C--AG--A------
gi|7695                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----GC--T--GC--G-A-A--A--A---
gi|7696                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-TCG-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----c
gi|7697                       : TATC-AA-A-TG-AAAT-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--GAAAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7698                       : TATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAAACA---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--TTTACCG--G--------A-C--TG--A------A--C--GGA-CG-GAC-----G-GA
gi|7699                       : TATT-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--GCG-A--A--A---A-----C--T------GATTT-----T--A--------C-C--GG--A------ACCT--GA--CG-GAC-----G-GAC----G----G-ACCA-GA
gi|7700                       : TATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------T-A-GT--G--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-A-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----T--T--------ACC--GG--A------C--T--GG--CA-GAC-----G-GAC----G----G-
gi|7701                       : TATC-AA-AATG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------CTA-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------GA--T-----
gi|7702                       : TATC-AA-A-TA-AA-G-T-T--A-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--A--A--G--AAAA--A---A----G---T--GC--G-G----A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CG-GAC-----A-GAC----A----G-A-
gi|7720                       :  ATG-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C---GT--A--C--G--CAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC---------G-A-CA-GACA
gi|7721                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7722                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--T------GA--T-----
gi|7723                       :  ATC-AA-A-TG-AA-T-A-T--A-T-G-C-AAAG----------C-A-GT--G--AAAG-AAAAA--A---A----G---T--GC--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--G-------------GG--A----------------CA-GAC-----A-GAC----A----G-A-TA-GACA
gi|7724                       :  ATC-AA-A-TG-AA---A-T--C-T-T-C----G----------C-A-GT--------G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--G--A---A-----C--C------AA--C-----GA-G--------A-C--GA--A------T--T--GG---G-GA------A-GAC----A----A-A-C--GACAgaaagacagaca
gi|7726                       :  ATC-AA---TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-GTGTCGACGAAC-G-AT--A--A--T-AAAAG--G---A----G---T--CT--G-G-A--A--ACCCA-----C--C------AG--G-----A--G--------G-CG-GG--A------A--T--GG---G-GAC-----ACGAC----A----G-A-CA-G
gi|7730                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7731                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-A-T--C-T-G-C-AA-G----------C-A-GT--G--A--G-GAAAA--A---A----G---T--GT--G-G-A--A--A---A-----
gi|7732                       :   TC-AA-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--A-GAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-GACA
gi|7733                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AAA-G-----G--G--------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GGCA
gi|7735                       :   TC-AA-A-TG-AT-T-CCT--C-A-C-C-AA-G--------------AT--A--A--A-GAAAA--A---A----G---TCTG---G-G-G--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--GG--A------A--T--TG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7736                       :   TC-AA-A-TT-GA-T-T-C--C-TCA-C-AA-G----------C-A-TT--A--AA-G-AAAAA--A---A----G---T---CTTG-G-A--A--A---A-----C--C------AA--C-----G--G--------A-C--GG--A------A--A--G----G-GAC-----ATGAC----A----G-A-CC-GAC
gi|7737                       :   TC-AA-A-TG-AA-T-C-C--T-C-A-C-AA-G----------C-ATAT--C--A----CAAAA--A---A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GT-------A-C--AG--A------C--T--AA--TG-GAC-----A-GAC----A----A-A-CG-GA
gi|7739                       :    C-AA-A-TG-AT-T-C-C--T-C-A-C-AA-C----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--A---G----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--GG-------A-C--AG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CT-GACA
gi|7740                       :       A-A-TG-AA-TCA-T--C---A-C-AA-G----------C-A--T--A--A--G-AAAAA------A----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C---G--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-
gi|7741                       :       A-A-TG-AA-T-C-T--C---A-C-AA-G----------C-A-TA--A--A--G-AAAAA--AAAAA----G---T--CT--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--TG----G--G--------A-C--AG--A------G--T--GG--
gi|7742                       :                                                       --A--G-GAACA--A---A----G---T--CA--G-G-A--A--A---A-----C--C------AA--T-----G--C--------A-T--GG--G------A--T--GGAATG-GG--------GAC----A----G-A-CA-GACAg
gi|7743                       :                                                            a-AAAAA--A---A----G---T---C--G-G-A--A--A---A-----C--C------AC--G-----G--G--------A-C--GG--A------A--T--GG---G-GAC-----A-GAC----A----G-A-CA-gaca