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Reference ( gi|55187 )        : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--G-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------G--A--G-TT-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCT-AAT
gi|55191                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TT--T-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-C-T--A--T--C-C--T-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------G--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-AAT
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gi|55239                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--T-----T-CG-C--T--------G-A-------G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-T--C-AA-A-C-TT-T-----CA-A---T--GG-A-A-TC-A----G-A--T--G-------A--A---T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATgttt
gi|55267                      : TTTTT--CC---GGAAA-A--TC--A-A--CAG-------G-A---T-TTCTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-CTTT-AA-A-G-TT-TTCACCCA-G---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--AAATT---A--TAC-T-TT-TT------G--A--C-TT-T-T-C-G-T-CC-G-G--A--ACCT-CATttt
gi|55222                      : TTTGT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--GT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----T-CA-A-T--A--T--C-A--A-AA-T-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---TTTGA--AAC----T-TT------GA-A--G-TT-A-T-C-G-T-CT-T-G-AA--Aatttt
gi|55244                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TCT-A-A--CAG-------GCG---T-T-TTC-A--C-----T-CA-C--TC-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-GTTT-T-----CA-A---T--TG-T-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AA--T-TT-TG------G--A--G-TT---T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCT-CAT
gi|55248                      : TTTTT--CC---G-AGA-A--TT--A-A--TAG-------G-A---G-T-CTC-A--T-----T-CA-C--TT-------T-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--A--A--C-C--C-GA-A-G-TT-T-----CA-T---T--TG-A-A-TC-A----A-A--A--G---T---A--AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCT-CATgttt
gi|55261                      : TTTTC--CC---G-AAA-ACTTC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-TT-C-----T-CA-C--TT-------G-A-TTA-T-G--T---AC----A-CA-A-TGCA--T--C-C--T-AA-A-G-TG-T-----TA-ACACT--TG-A-A-TC-A----G-A--T--A---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-T-C-A-T-TT-G-G-AT--ACCT-gttt
gi|55223                      : TTTGT--TC---G-AAA-A--TC--A-AAAGAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-T--GT-------G-A-T-AAT-GG-C---A-----A-CA-A----A--T--C-C----AA-A-G-TT-T-----CA-AA--T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--GGG-T---A--AAC-T-TT-TTT-----G--A--A-TT-A-T-C-A-T-CC-G-G-AAATACCT-CATcacatattttt
gi|55227                      : TTTTT--CC---G-AA-----TC--A-A--TAG-------G-G---T---CTC-T--C-------CA-C--TTA------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA---T--A--T--C-T--T-AA-A-G-TT-T-----AA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--A---A---T--AAC---TT-TT------G--A--A-GT-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATtgtt
gi|55246                      : TTTTT--CCCCCA-AAA-T--TC--A-A--T-----------------T-CTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-T--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--GG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-T-T-G-T-TC-G-G-AA--ACCT-TATattt
gi|55253                      : TTTTT--CC---G-GAA-AATTC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-AGT--A--TTGC-C----AA-A-G--T-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--TTGG---T---A--AAC-T-TT-TTG-----G--A--GCTT-A-T-T-G-C-TC-G-GAAA--ACCT-CATttt
gi|55206                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--T-----C-TA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--T-AT-T-G-TT-------CA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCT-CATtttt
gi|55197                      : TTGTT--CC---G-AAACA--TC--A-AA-TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--AT-------G-A---A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--T--C-A-TC-A----G-A--TTCT---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TTAA-C-C-G-T-CC-GCC-AA--ACCT-AATatttt
gi|55249                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-AA-TAG-------G-------T-TTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G---G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A---TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TT-A----G-A--T--G---T------AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-C-TA-G-GAAA--ACCT-CATatttt
gi|55224                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-C--C-----C-C-------------------------------------A-CA-A-T--A--T--G-C--G-AA-G-T-TT-T-----CA-C---T--TG-ATA-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------A--A--G-TT-A-T-C-----CC-G-G-AA--Attt
gi|55229                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAA-------G-GT--T-T-TTC-T--C-----T-CA-T--AT-------G-A-T-T-T-G--C---------A-CA-A-T--A--T--C-C--T-AT-A-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC---TT-TT------GAAA--G-TT-A-A-C-G-T--C-G-G-AA--ACC
gi|55240                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-C---T-T-CTT-A--C-----T-CA-C--CT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--A--T--C-C--C-TA-A-G-TT-T-----TA-T---T--TG-A-A-TC-A----G-A--A--G---T---A--AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A---C-A-T-atattt
gi|55201                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CC-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--A--TC-C-C--A-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--A---A---A--AAC-C-TT-TCAATTTGG--A--G-TA-A-T-T-A-T-CA-G-GAAA--ACCT-CATgtattgctcggaaatc
gi|55256                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--TA--A-----A-CA-A-T--A--TC-C-C--G-AA-A-G-TT-T-----GA-A---A--TT-A-A-TC-A----G-A--T--ATTTT---A--GAT-T-TT-TT------G--ttt
gi|55228                      : TTTGT--CA---G-AAA-AA-TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T--C-----T-CA-A--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA---G-TG-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--T---T---A--AAA-C-TT-TG------A--A--G-TT-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CAT
gi|55208                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T--TC-TTGC-----T-CA-C--TT-------G-A---A-T-GAGT---A-----A-CA-ACT--A--T--CTC--T-GA-A-G-TT-T-----CA-T---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---TA--A--AAC-T-TT-TG------G--A--G-CT-A-T-T-GTT-CC-A-G-AA--ACCTCAATatttt
gi|55255                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-TTG--C---A-----A-CA-A-T--A--T--G-C--T-AT-A-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TCCA----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------GA-A--G-TT-A-A-C-G-TGCC-G-GAAA--ACCT-CATttt
gi|55270                      : TTTGT--CG---A-AAA-A--TC--A----TAG-------G-----T-T-CTC-T--T-----T-TG-----T-------G-ACT-A-T-G--TG--A-----A-CA-A-TTGA--T--T-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TC------G--AG-G-TT-A-T-C-G-T-CCGG-G-AA--ACCT-CATattt
gi|55230                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------T-A---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T-----C--C-T--T-TA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TA-ATA-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC----T-TT------GA-A--G-TT-A-A-C-G-T-TCAG-G-AA--ACCT-CATgattttt
gi|55254                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AG-TAG-------G-G---T-T-CTC-T--A-----T-CA-CA-TT-------A-A-T-C-T-C--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--CCAA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-C----G-ATTT--T---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-A-CGG-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55251                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-GGGTT-T-CT--T--C-----T-CA-C--AT-------GAA-T-A-T-G------A-----A-CA-A-T--A--T--CGC--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-AT---G-AT-T--G---T---AACAAC-T-TT-TG------A--A--G-TTAA-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55231                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------T-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A----A--C--G-C--T-AT-G-G-TT-T-----CA-A---T--T--C-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC----T-TT------GA-A--G-TT-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55260                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TCCTC-A--C-----T-CA-CT-TT-------G-A-T-G-A-G--TCAAA-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-T-G-TT-TCC---CA-A---TCGTG-A-A-TC-A----GAA--TTGG---T---AC-AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-CTG-C-TC-G-G-AAG-ACCT-CATattt
gi|55277                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A----TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-A-TGG--C---A-----A-C--A-T--A--T--C-C-------A-G-TT-TCTA--CA-T---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--T---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TTAA-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAATttt
gi|55216                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A--C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--A--T--T-C--C-CA-A-G-TT-T-----CA-T---T--AA-A-A-TC-A----G-A-----A---A---A--AGCGT-TT-TG------G--A--G-TA-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCT-atttt
gi|55212                      : TTTTT--CC---A-AAA-T--TC--T-A--TAG-------G-G---T-C-CTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CG-A-T--A--T--T-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--T-----------------------------------C-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATcaagttttt
gi|55263                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A----TAG-------G-G---T-T-T---------------A-A--TG-------G-C-T-A----------A-----A-CA-G-T--A--T--T-C--C-AA-G-T-TT-T-----CA-A---T--TG-AGA-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------G--A--GCTC-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-AATttt
gi|55209                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TG--ACG--TAG-------G-G---T-T-CCT-A--C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-C-G--A--T--C-A--C-TA-A-G-TT-T-----CA-T---T--TT-A-A-TC-A----G-A--A--G---T---A--AAC-T-TT-TG------G--AT-G-AT-A-T-T-G-T-CCTG-G-AA--ACCT-tttt
gi|55276                      : TTTTT--CC-----AAA-A--TC--G-A--TAG-------A-T---T-T-CTC-A--C-----T-AA-G--TT-------A-A---A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-TA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-CC-A----G-A--C--A---T---A--AA----TT-TT------GA-A--A-AT-A-T-T-G-T-CC-G-T-AA--ACCT-
gi|55282                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TTT-G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CAAC--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-CA-A-G-TT-T-----TA-A---T--TG-A-A-TA-A----G-A--T--G---T---A--cgttt
gi|55271                      : TTTTT--TT---G-AAA-A--TCG-A-A--TTA-------G-G---T-G-CTC-T--C-----T-CA-A--AT-------T-A-T-A-T-G--C---A-----AACA-ACT--A--T--C-CC-A-AA-A-G-TTGT-----CA-A---T--TGGA-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAA-C-TT-TT------GGAA--G-TT-A-T-C-GTT-TT-G-G-AA--ACCT-CAT
gi|55245                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--CAG-------G-G---T-T--TC-A--C-----T-CA-C--TC-------G-A-T-G-A-G--TA--A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-GTTT-T-----CA-A---T--TG-T-A-TC-G----A-A--T--G---T---AT-AAT-A-TT-CTATATA-G--AATG-TT-T-T-T-G-C-CC-G-GTAA--ACCT-attt
gi|55275                      : TTTTG--TC---A-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A--T-----T-GA-C--TT-------G-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--A--T--C-C--C-CA-A-G-TT-T-----C--A---T--TA-C-A-TC-A----G-A--A--G-------A--CGC-T-TG-TG------A--A--G-TT-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCT-CAT
gi|55281                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-A---T-T-CTG-------------A-C--T---------------------------------CA-A-T--A--T--C-C--C-AA---G-TT-T-----CA-T---T--TG-A-A-TT-A----G-A--A--A---T---G--AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--gttt
gi|55292                      :  TTTT--CCA--G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--T-----T-CT-T--GT-------G-A-T-A-A-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--T-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TA------A--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACTT-
gi|55302                      :  TTTT--CC---T-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTCCT--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--G-T--G-AA-ATG-TT-T-----CA-T---T--GG-A-A-TC-A----G-A--T--A---T---A--AAG-TATT-TA------A--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCT-CATcacatttt
gi|55295                      :  TTTC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTA-C--T-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-------CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-------CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-T-T-G-C-TC---G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55293                      :  TTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CC-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--A---A---A--AAC-C-TT-TCAATTTGG--A--G-TA-A-T-T-A-T-CA-G-G-AA--ACCT-CATttt
gi|55299                      :  TTTTGACC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------C-A---T-T-CTT-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-C-T--A--T--C-C------------------------------TA-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAT-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATttt
gi|55303                      :  TTTG--TC---A-AAA-A--CC--A-A--TTG-------G-G---T-TTCTC-A--C-----T-CA-C--TG-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-TG-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-C-AT-T-----CA-A---G--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AG--T-TT-TG------G--G--G-TT-A-T-T-T-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55296                      :  TTTG--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----CACA-C-------------A-TAA-T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C----AA-A-G-AT-C-----AA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A---------T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-A-C-G-T-CC---G-AA--ACCT-CATtttt
gi|55294                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-C--C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-T--C---A-----A-CA-A-G--ATTT--C-C-----A-A-G-TT-T-----CA-T---T--TG-A-A----A------------G---T---A--AAG-T-TT-TA------G--A--G-TT-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCT-CATatttt
gi|55306                      :  TTGT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--T-----T-CA-T--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-
gi|55300                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--ATG-------G-G---T-T-TTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-----------------T--TG-A-A-TC-A----G-A--T------------------------------------G-TT-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CAT
gi|55297                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---GAT-CTC-A--C-----TCCA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CACG-T--A--T--C-C-----C-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G----T--G---A---A--AAC-TATT-GG------G--A--G-TT-A-A-T-G-T-AC-G-GAAA--ACCT-CATttt
gi|55313                      :   TTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----TGCA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--T-AA-A-G-TT-G-----GA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--A---G---A--AAC----T-TT------G--A--A-GT-A-C-C-G-T-CC-G-T-AA--ACCT-ttt
gi|55316                      :   TTT--CT---G-AAA-T--TC--G-A--TAG-------T-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--G--A-A-G-TT-T-----CA-A---A--TG-A-ACTA-A----G-A--T--G---T---A--A------T-TT------G--A--G----A-T-T-G-T-CT---G-AA--ACCT-AATctatttt
gi|55318                      :    TC--CC---G-AAA-A--TT--A-A--TAGCCTAAAGG-G---T-T-CTT-A--G-----C-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---C---A--AAC-T-TT-TT------G--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ATCT-AATt
gi|55319                      :    TT--TC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G------------------------------TT-----------T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--A--T--C------AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------G--A--G-CC-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-AATtgtt
gi|55320                      :    TT--CC---GTAAA-A--TTTAA-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CA-C--TTTT-----G-A-T-A-G-G--T---AGTTAAA-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TG-A-T-AC-A----C-A--T--G---T---A--AAC-C-TT-TG------G--A--G-TT-ATT-T-G-C-TC-G-G--A--ACCT-Gtttt
gi|55322                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-AC-C--AT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--T---T---A--AAC-T-GT-TG------A--A--G-TT-A---C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-CATcaatttt
gi|55323                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T--C-------CA-C--AT-------G-A-T---T-G--C---A-----A-CA-A-T--A--T--C-C--T-AG-T-G-TT-T-----CA-A---T--TC-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TG------A--A--G-TT-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAAT
gi|55325                      :          ---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T--TC-T--C-----TTCA-C--GT---------A-T-A-T-G--C---A-----ATCA-A-T--A--T--C-A--C-AA-G-T-TT-T-----CA-AA--T--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AA----TT-TT------GA-A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCAATttt
gi|55328                      :                  -A--TT--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--CT-------A-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-A-C--A--T--C-C--T-AA-A-G-TT-T-----CA-A---G--TA-A-A-CC-A----G-A--T--G---T---A--AAC-T-TT-TT------C--A--G-TT-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCT-AATgttt
gi|55330                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--A--T--A-C--T-AA-A-G-TT-T-----CA-A---G--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAT-G-TT-TT------G--A--G-TT-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTT-AAT
gi|55331                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--A--T--TAC--T-AA-A-G-TT-T-----CA-A---G--TG-A-A-TC-A----G-A--T--G---T---A--AAT-G-TT-TT------G--A--G--T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTT-AATtgtt
gi|55332                      :                                 G-------G-A---T-T-TTC-C--CAAAAAT-CA-C--TT-------G-A-T-G-T-G--T---G-----A-CA-A-T--A--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----TA-A---T--TG-A-A-CC-A----G-A--T--G---T---A--ACC-T-TT-TG------G--A--G-TT-A-A-T-G-T-CA-G-G-AA--ACCT-CATtgtt
gi|55333                      :                                  -------G-G---T-T-CTC-A--C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--G--T--C-C--C-AA-A-G-TT-T-----TA-T---T--TG-A-A-TC-A----G-A--A--G---T---A--AAC-G-TT-TG------G--A--G-TT-A-C-T-A-C-CC-A-G-AA--ACCT-CATttct
gi|55208                      :                                                                                        -T-G--G---A-----A-CA-A-T--AGCT--C-C--A-AA-A-G-TT-T-----TACA---TC-TG-A-T-TC-A----A-A--T--G-------A--AAC-T-Tgttt
gi|55248                      :                                                ttttccccaaaatcaatagggtttcttgctcacttgaatgagtaacaactatctctg-CA-A-T--AACT--C-C--A-AA-A-G-TT-TA----CT-T---T--TG-A-T-TC-A----A-A--T--G-------A--AAC----T-TC------G--G--G-TT-A-T-T-A-T-gaaacctcaatttt





Alignments
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lowQualScore                  :      ..  ... .   . ..  .. . ..   ....... . ... . .   ... ..... .  . ... ....... . . . . . .. ... ..... .  . . ..   . .. .  . . .  . ..... .  ... ..  . . . .  .... . .. .. ... ... .........   . ......  ..... .. . .. . ...... . . . . . .  . . .  ..       
lowQualScore                  :      66  222 8   4 55  66 4 22   3333333 8 111 4 8   999 00000 2  4 333 3333333 4 2 2 4 8 66 999 44444 8  8 2 11   2 55 6  4 2 8  4 22222 4  111 55  4 6 4 4  3333 8 00 66 888 555 000000000   2 222222  44444 66 8 44 8 222222 2 4 4 8 8 4  7 4 8  00       
consensus                     : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAT
Reference ( family-170 )      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-NG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAT
gi|55187                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--G-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55188                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-A-AA--ACATCAT
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gi|55193                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-A-CTC-T-C-----T-CA-C--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-AG-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55194                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-AA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55195                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-T--TAT-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--C--T---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55196                      : TTTGT--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TGG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-AG-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-CG-A--G-A------T-A-T-T-A-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55197                      : TTGTT--CC---G-AAACA--TC--A-AA-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-A---A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--TTCT---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------TAA-C-C-G-T-CC-GCC-AA--ACCTAATatttt
gi|55199                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--CT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----T-TA-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55200                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--CT-------A-A-T-A-T----T---A-------CA-A-C--ATC-C--C-AA-AAG-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----T-TA-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTgttt
gi|55201                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CC-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CAAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----T-GG-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-GAAA--ACCTCAT
gi|55202                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----GAA--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55203                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T--A-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--A-CTCATttt
gi|55204                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AC-TAG-------A-G-----T-CTC-T-C-----T-CG-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----T-CG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTAATatttt
gi|55205                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-CA-AT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtgtt
gi|55206                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----C-TA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-T-G-TT-------C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55207                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--CC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----C-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----G-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-ACA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--A-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55208                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTT-G-C-----T-CA-C--TT-------G-A---A-T-GAGT---A-----A-CA-ACT--ATC-T--CTGA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-C------T-A-T-T-GTT-CC-A-G-AA--ACCTCAtgtt
gi|55209                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TG--ACG--TAG-------G-G---T-T-CCT-A-C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-C-G--ATC-A--C-TA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TT-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-AT-G-A------T-A-T-T-G-T-CCTG-G-AA--ACCTatttt
gi|55210                      : TTTTT--CT---G-ACA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-G--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---C--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAT-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55211                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------A-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-GA-A-A-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC--------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CT-G-G-AA--ACCTTATtgtt
gi|55212                      : TTTTT--CC---A-AAA-T--TC--T-A--TAG-------G-G---T-C-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CG-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T------------------------------------------C-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55213                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CG-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAA-T------TT-----T-CG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-A-AA--ACCTAATttt
gi|55214                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--AAA-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AG---T--AG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----A-GA-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55215                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--GC--C---AACTTTTGCCAAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-atttt
gi|55216                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--AA-A-A-T-CA----G-A-----A---A---A---------AGCGT------TT-----T-GG-A--G-T------A-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCA
gi|55217                      : TTTCC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-CT-T--GT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATagttttt
gi|55218                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---C-T-CTC-T-C-----T-CT-C----------------------------A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-CG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCgttt
gi|55219                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--AC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----G-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TT-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATaaattgtt
gi|55220                      : TTTTT--CC---G--AA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-C-A-G--T---A-----A-CATT-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55221                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TGTTC-T-C-----C-CA-CGGTT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AACA-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CCTG-G-AA--ACCTCATttct
gi|55222                      : TTTGT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--GT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----T-CA-A-T--ATC-A--A-AA-T-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TTTGA---------AAC--------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-T-G-AA--atttt
gi|55223                      : TTTGT--TC---G-AAA-A--TC--A-AAAGAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-T--GT-------G-A-TAA-TGG--C---A-----A-CA-A----AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TGGG---T---A---------AACTT------TT-----T-TG-A--A-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AAATACCTCAT
gi|55224                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-C-C-----C-C-------------------------------------A-CA-A-T--ATG-C--G-AA-G-T-TT-T-----C-AC---T--TG-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TA-A--G-T------T-A-T-C-----CC-G-G-AA--tgtt
gi|55226                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CG-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C--A---T--TC-A-A-T-CA------A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55227                      : TTTTT--CC---G-AA-----TC--A-A--TAG-------G-G---T---CTC-T-C-------CA-C--TTA------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA---T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---T---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55228                      : TTTGT--CA---G-AAA-AA-TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T-C-----T-CA-A--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TG-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAA-C------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55229                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAA-------G-GT--T-T-TTC-T-C-----T-CA-T--AT-------G-A-T-T-T-G--C---------A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TGAA-A--G-T------T-A-A-C-G-T--C-G-G-AA--ACCatttt
gi|55230                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------T-A---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T---CC-T--T-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-TCAG-G-AA--ACCTCATatattt
gi|55231                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A----ACG-C--T-AT-G-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55232                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------------T-T-TTC-T-C-----T-CA-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AG-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-C------TT-----T-TA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTGATattt
gi|55233                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A----G----G-----------------------------T------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-A-G-T-CT-G-G-AA--ACCgttt
gi|55236                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-A-----T-CA-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-CG-A--G-T------T-T-C-T-G-T-CT-G-G-AA--ACaaattgtt
gi|55237                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--T-A--TAC-------G-G---T-T-CTC-G-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C--A-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-C
gi|55238                      : TTTTC--CC---G-CAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C----------------------------A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55239                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-T-----T-CG-C--T--------G-A-------G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-C-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G-------A---------A---T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55240                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-C---T-T-CTT-A-C-----T-CA-C--CT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-TTACATGT-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ATCttt
gi|55241                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------GTG---T-T--TC-T-C-----T-CA-T--GT-------A-A-C-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-C-G-TT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--GTCTAAT
gi|55243                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-CA-C--TTAATACTTG-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ACC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---G---------AAC-G------TT-----T-TA-G--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55244                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TCT-A-A--CAG-------GCG---T-T-TTC-A-C-----T-CA-C--TC-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----T-GG-A--G-T------T---T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55245                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--CAG-------G-G---T-T--TC-A-C-----T-CA-C--TC-------G-A-T-G-A-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CG----A-A--T--G---T---AT--------AAT-A------TTCTATAT-AG-AATG-T------T-T-T-T-G-C-CC-G-GTAA--ACCTgttt
gi|55246                      : TTTTT--CCCCCA-AAA-T--TC--A-A--T-----------------T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-T-G-T-TC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55247                      : TTTCT--CC---G-AAA-A--TC--T-A--TAG-------G-A---T-A-TTC-T-C-----T-CA-C--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--A-AA-A-G-AT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------TTT-T------TT-----T-TT-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATttt
gi|55248                      : TTTTT--CC---G-AGA-A--TT--A-A--TAG-------G-A---G-T-CTC-A-T-----T-CA-C--TT-------T-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--AAC-C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----A-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55249                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-AA-TAG-------G-------T-TTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G---G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A---TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--G---T-------------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TA-G-GAAA--ACCTCATgttt
gi|55250                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T----TC-T-C-----T-TG-T--GT-------G-A-T-AGT-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CATAATT-A--T--G---T---A---------AAC-T------TTG----T-CG-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACTTAATttt
gi|55251                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-GGGTT-T-CT--T-C-----T-CA-C--AT-------GAA-T-A-T-G------A-----A-CA-A-T--ATCGC--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CAT---G-AT-T--G---T---AAC-------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55253                      : TTTTT--CC---G-GAA-AATTC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-AGT--ATTGC--C-AA-A-G--T-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TTGG---T---A---------AACTT------TT-----T-GG-A--GCT------T-A-T-T-G-C-TC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55254                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AG-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----T-CA-CA-TT-------A-A-T-C-T-C--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CCAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CC----G-ATTT--T---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-CGG-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtttt
gi|55255                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A-A--TA--------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-ATT-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATG-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-TCCA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TGAA--G-T------T-A-A-C-G-TGCC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55256                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--CGAA-A-G-TT-T-----G-AA---A--TT-A-A-T-CA----G-A--T--ATTTT---A---------GAT-T------TT-----T-TG-attt
gi|55259                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CG-T--GT-------G-ATT-A-T-G--T---------A-CA-A-G--AT--T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--TG-G---T---A---------AAC-T------TT-----T-CG-A--G-T------T-A-TCC-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAAT
gi|55260                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TCCTC-A-C-----T-CA-CT-TT-------G-A-T-G-A-G--TCAAA-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-T-G-TT-TCC---C-AA---TCGTG-A-A-T-CA----GAA--TTGG---T---AC--------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-CTG-C-TC-G-G-AAG-ACCTCATt
gi|55261                      : TTTTC--CC---G-AAA-ACTTC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-TTC-----T-CA-C--TT-------G-A-TTA-T-G--T---AC----A-CA-A-TGCATC-C--T-AA-A-G-TG-T-----T-AACACT--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TT-G-G-AT--ACCTCAttt
gi|55263                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A----TAG-------G-G---T-T-T--------------A-A--TG-------G-C-T-A----------A-----A-CA-G-T--ATT-C--C-AA-G-T-TT-T-----C-AA---T--TG-AGA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--GCT------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATcatattttt
gi|55267                      : TTTTT--CC---GGAAA-A--TC--A-A--CAG-------G-A---T-TTCTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-CTTT-AA-A-G-TT-TTCACCC-AG---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--AAATT---A---------TAC-T------TT-----T-TG-A--C-T------T-T-T-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtttt
gi|55270                      : TTTGT--CG---A-AAA-A--TC--A----TAG-------G-----T-T-CTC-T-T-----T-TG-----T-------G-ACT-A-T-G--TG--A-----A-CA-A-TTGATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-CG-AG-G-T------T-A-T-C-G-T-CCGG-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55271                      : TTTTT--TT---G-AAA-A--TCG-A-A--TTA-------G-G---T-G-CTC-T-C-----T-CA-A--AT-------T-A-T-A-T-G--C---A-----AACA-ACT--ATC-C--C-AA-AAG-TTGT-----C-AA---T--TGGA-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----T-GGAA--G-T------T-A-T-C-GTT-TT-G-G-AA--ACCTCATgattttt
gi|55275                      : TTTTG--TC---A-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-T-----T-GA-C--TT-------G-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----C--A---T--TA-C-A-T-CA----G-A--A--G-------A---------CGC-T------TG-----T-GA-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55276                      : TTTTT--CC-----AAA-A--TC--G-A--TAG-------A-T---T-T-CTC-A-C-----T-AA-G--TT-------A-A---A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--C--A---T---A---------AA--T------TT-----T-GA-A--A-A------T-A-T-T-G-T-CC-G-T-AA--ACCTCGTgttt
gi|55277                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A----TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--AT-------G-A-T-A-TGG--C---A-----A-C--A-T--ATC-C-------A-G-TT-TCTA--C-AT---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAtt
gi|55281                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-A---T-T-CTG------------A-C--T---------------------------------CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-TA----G-A--A--A---T---G---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--atatttt
gi|55282                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TTT-G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CAAC--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-T-AA----G-A--T--G---T---A---------
gi|55292                      :  TTTT--CCA--G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-CT-T--GT-------G-A-T-A-A-G--C---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-AA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACTTCA
gi|55293                      :  TTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CC-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----T-GG-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-G-AA--ACCTCATcatttt
gi|55294                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-C-C-----T-CA-T--TT-------G-A-T-A-T-T--C---A-----A-CA-A-G--ATT-T--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A----A------------G---T---A---------AAG-T------TT-----T-AG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55295                      :  TTTC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTA-C-T-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-------CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-------C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC---G-AA--ACCTCAT
gi|55296                      :  TTTG--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----CACA-C-------------A-TAA-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-AT-C-----A-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A---------T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC---G-AA--ACCTCATttt
gi|55297                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---GAT-CTC-A-C-----TCCA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CACG-T--ATC-C--C----A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G----T--G---A---A---------AAC-TA-----TT-----G-GG-A--G-T------T-A-A-T-G-T-AC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55299                      :  TTTTGACC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------C-A---T-T-CTT-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-C-T--ATC-C------------------------------TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55300                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--ATG-------G-G---T-T-TTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-----------------T--TG-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55302                      :  TTTT--CC---T-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTCCT-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATG-T--G-AA-ATG-TT-T-----C-AT---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAG-TA-----TT-----T-AA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCATttt
gi|55303                      :  TTTG--TC---A-AAA-A--CC--A-A--TTG-------G-G---T-TTCTC-A-C-----T-CA-C--TG-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-TG-A-T--ATC-C--C-AA-A-C-AT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AG--T------TT-----T-GG-G--G-T------T-A-T-T-T-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55306                      :  TTGT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-CA-T--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-tttt
gi|55313                      :   TTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----TGCA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-G-----G-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---G---A---------AAC-T------TT--------G-A--A-G------T-A-C-C-G-T-CC-G-T-AA--ACCTC
gi|55316                      :   TTT--CT---G-AAA-T--TC--G-A--TAG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AA---A--TG-A-ACT-AA----G-A--T--G---T---A---------A-----------T-----T-TG-A--G----------A-T-T-G-T-CT---G-AA--ACCTAATtatttt
gi|55318                      :    TC--CC---G-AAA-A--TT--A-A--TAGCCTAAAGG-G---T-T-CTT-A-G-----C-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ATCTAATt
gi|55319                      :    TT--TC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-----------------------------TT-----------T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC------AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TG-A--G-C------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55320                      :    TT--CC---GTAAA-A--TTTAA-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TTTT-----G-A-T-A-G-G--T---AGTTAAA-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-T-A-CA----C-A--T--G---T---A---------AAC-C------TT-----T-GG-A--G-T------T-ATT-T-G-C-TC-G-G--A--ACCTtttt
gi|55322                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-AC-C--AT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------GT-----T-GA-A--G-T------T-A---C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgacaatttt
gi|55323                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-------CA-C--AT-------G-A-T---T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AG-T-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCA
gi|55325                      :          ---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-T-------T-CA-C--GT---------A-T-A-T-G--C---A-----ATCA-A-T--ATC-A--C-AA-G-T-TT-T-----C-AAA--T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----T-GA-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCAatttt
gi|55328                      :                  -A--TT--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--CT-------A-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TA-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T-TC-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatgttt
gi|55330                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATA-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----T-TG-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAAT
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gi|55332                      :                                 G-------G-A---T-T-TTC-C-CAAAAAT-CA-C--TT-------G-A-T-G-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------ACC-T------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-A-T-G-T-CA-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55333                      :                                  -------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-CA-C--TT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--GTC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-G------TT-----T-GG-A--G-T------T-A-C-T-A-C-CC-A-G-AA--ACCTCATttct





Alignments
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Reference ( family-170 )      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAT
gi|55187                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--G-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55188                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-A-AA--ACATCAT
gi|55189                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-C-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------CAC-G------TT-----CT-A-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55190                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-T-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------GCG-T------TT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55191                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TT--T-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-C-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55192                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-C---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55193                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-A-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55194                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55195                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-T--TAT-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--C--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55196                      : TTTGT--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TGG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-A-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-A------T-A-T-T-A-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55197                      : TTGTT--CC---G-AAACA--TC--A-AA-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A---A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--TTCT---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-C-C-G-T-CC-GCC-AA--ACCTAATatttt
gi|55199                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----TT-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55200                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T----T---A-------CA-A-C--ATC-C--C-AA-AAG-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----TT-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTgttt
gi|55201                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-C-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CAAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-GAAA--ACCTCAT
gi|55202                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----GAA--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55203                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T--A-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--A-CTCATttt
gi|55204                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AC-TAG-------A-G-----T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTAATatttt
gi|55205                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-CA-AT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtgtt
gi|55206                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----C-T-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-T-G-TT-------C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55207                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--CC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----C-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----G-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-ACA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--A-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55208                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTT-G-C-----T-C-A-C--TT-------G-A---A-T-GAGT---A-----A-CA-ACT--ATC-T--CTGA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-C------T-A-T-T-GTT-CC-A-G-AA--ACCTCAtgtt
gi|55209                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TG--ACG--TAG-------G-G---T-T-CCT-A-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-C-G--ATC-A--C-TA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TT-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-AT-G-A------T-A-T-T-G-T-CCTG-G-AA--ACCTatttt
gi|55210                      : TTTTT--CT---G-ACA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-G--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---C--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAT-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55211                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-GA-A-A-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CT-G-G-AA--ACCTTATtgtt
gi|55212                      : TTTTT--CC---A-AAA-T--TC--T-A--TAG-------G-G---T-C-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CG-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T------------------------------------------C-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55213                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAA-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-A-AA--ACCTAATttt
gi|55214                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--AAA-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AG---T--AG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----AG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55215                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--GC--C---AACTTTTGCCAAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-atttt
gi|55216                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--AA-A-A-T-CA----G-A-----A---A---A---------AGCGT------TT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCA
gi|55217                      : TTTCC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATagttttt
gi|55218                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---C-T-CTC-T-C-----T-C-T-C----------------------------A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCgttt
gi|55219                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--AC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----G-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TT-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATaaattgtt
gi|55220                      : TTTTT--CC---G--AA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-C-A-G--T---A-----A-CATT-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55221                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TGTTC-T-C-----C-C-A-CGGTT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AACA-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CCTG-G-AA--ACCTCATttct
gi|55222                      : TTTGT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----T-CA-A-T--ATC-A--A-AA-T-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TTTGA---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-T-G-AA--atttt
gi|55223                      : TTTGT--TC---G-AAA-A--TC--A-AAAGAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-T--GT-------G-A-TAA-TGG--C---A-----A-CA-A----AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TGGG---T---A---------AACTT------TT-----TT-G-A--A-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AAATACCTCAT
gi|55224                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-C-C-----C-C--------------------------------------A-CA-A-T--ATG-C--G-AA-G-T-TT-T-----C-AC---T--TG-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-----CC-G-G-AA--tgtt
gi|55226                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C--A---T--TC-A-A-T-CA------A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55227                      : TTTTT--CC---G-AA-----TC--A-A--TAG-------G-G---T---CTC-T-C-------C-A-C--TTA------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA---T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---T---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55228                      : TTTGT--CA---G-AAA-AA-TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T-C-----T-C-A-A--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TG-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAA-C------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55229                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAA-------G-GT--T-T-TTC-T-C-----T-C-A-T--AT-------G-A-T-T-T-G--C---------A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TGAA-A--G-T------T-A-A-C-G-T--C-G-G-AA--ACCatttt
gi|55230                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------T-A---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T---CC-T--T-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-TCAG-G-AA--ACCTCATatattt
gi|55231                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A----ACG-C--T-AT-G-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55232                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------------T-T-TTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AG-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-C------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTGATattt
gi|55233                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A------A----G-G--T------------------------T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-A-G-T-CT-G-G-AA--ACCgttt
gi|55236                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-A-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-T-C-T-G-T-CT-G-G-AA--ACaaattgtt
gi|55237                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--T-A--TAC-------G-G---T-T-CTC-G-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA---G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-C
gi|55238                      : TTTTC--CC---G-CAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----------------------------A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55239                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-T-----T-C-G-C--T--------G-A-------G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-C-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G-------A---------A---T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55240                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-C---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--CT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-TTACATGT-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ATCttt
gi|55241                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------GTG---T-T--TC-T-C-----T-C-A-T--GT-------A-A-C-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-C-G-TT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--GTCTAAT
gi|55243                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--TTAATACTTG-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ACC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---G---------AACGT------TT-----TA-G----G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55244                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TCT-A-A--CAG-------GCG---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-G-A--G-T------T---T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55245                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--CAG-------G-G---T-T--TC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CG----A-A--T--G---T---AT--------AAT-A------TTCTATATA-G-AATG-T------T-T-T-T-G-C-CC-G-GTAA--ACCTgttt
gi|55246                      : TTTTT--CCCCCA-AAA-T--TC--A-A--T-----------------T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-TC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55247                      : TTTCT--CC---G-AAA-A--TC--T-A--TAG-------G-A---T-A-TTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--A-AA-A-G-AT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------TTT-T------TT-----TT-T-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATttt
gi|55248                      : TTTTT--CC---G-AGA-A--TT--A-A--TAG-------G-A---G-T-CTC-A-T-----T-C-A-C--TT-------T-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--AAC-C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----A-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55249                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-AA-TAG-------G-------T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G---G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A---TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--G---T-------------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TA-G-GAAA--ACCTCATgttt
gi|55250                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T----TC-T-C-----T-T-G-T--GT-------G-A-T-AGT-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CATAATT-A--T--G---T---A---------AAC-T------TTG----TC-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACTTAATttt
gi|55251                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-GGGTT-T-CT--T-C-----T-C-A-C--AT-------GAA-T-A-T-G------A-----A-CA-A-T--ATCGC--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CAT---G-AT-T--G---T---AAC-------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55253                      : TTTTT--CC---G-GAA-AATTC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-AGT--ATTGC--C-AA-A-G--T-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TTGG---T---A---------AACTT------TT-----TG-G-A--GCT------T-A-T-T-G-C-TC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55254                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AG-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----T-C-A-CA-TT-------A-A-T-C-T-C--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CCAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CC----G-ATTT--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-CGG-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtttt
gi|55255                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A-A--TA--------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-ATT-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATG-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-TCCA----G-A--T--G---T---A---------AACTT------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-TGCC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55256                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--CGAA-A-G-TT-T-----G-AA---A--TT-A-A-T-CA----G-A--T--ATTTT---A---------GAT-T------TT-----Tattt
gi|55259                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-TTA-T-G--T---A-------CA-A-G--ATT-C----AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--TG-G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-TCC-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtg
gi|55260                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TCCTC-A-C-----T-C-A-CT-TT-------G-A-T-G-A-G--TCAAA-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-T-G-TT-TCC---C-AA---TCGTG-A-A-T-CA----GAA--TTGG---T---AC--------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-CTG-C-TC-G-G-AAG-ACCTCATt
gi|55261                      : TTTTC--CC---G-AAA-ACTTC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-TTC-----T-C-A-C--TT-------G-A-TTA-T-G--T---AC----A-CA-A-TGCATC-C--T-AA-A-G-TG-T-----T-AACACT--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TT-G-G-AT--ACCTCAttt
gi|55263                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A----TAG-------G-G---T-T-T---------------A-A--TG-------G-C-T-A----------A-----A-CA-G-T--ATT-C--C-AA-G-T-TT-T-----C-AA---T--TG-AGA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--GCT------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATcatattttt
gi|55267                      : TTTTT--CC---GGAAA-A--TC--A-A--CAG-------G-A---T-TTCTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-CTTT-AA-A-G-TT-TTCACCC-AG---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--AAATT---A---------TAC-T------TT-----TT-G-A--C-T------T-T-T-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtttt
gi|55270                      : TTTGT--CG---A-AAA-A--TC--A----TAG-------G-----T-T-CTC-T-T-----T-T-G-----T-------G-ACT-A-T-G--TG--A-----A-CA-A-TTGATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-AG-G-T------T-A-T-C-G-T-CCGG-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55271                      : TTTTT--TT---G-AAA-A--TCG-A-A--TTA-------G-G---T-G-CTC-T-C-----T-C-A-A--AT-------T-A-T-A-T-G--C---A-----AACA-ACT--ATC-C--C-AA-AAG-TTGT-----C-AA---T--TGGA-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----TG-GAA--G-T------T-A-T-C-GTT-TT-G-G-AA--ACCTCATgattttt
gi|55275                      : TTTTG--TC---A-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-T-----T-G-A-C--TT-------G-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----C--A---T--TA-C-A-T-CA----G-A--A--G-------A---------CGC-T------TG-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55276                      : TTTTT--CC-----AAA-A--TC--G-A--TAG-------A-T---T-T-CTC-A-C-----T-A-A-G--TT-------A-A---A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--C--A---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--A-A------T-A-T-T-G-T-CC-G-T-AA--ACCTCGTgttt
gi|55277                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A----TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-A-TGG--C---A-----A-C--A-T--ATC-C-------A-G-TT-TCTA--C-AT---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAtt
gi|55281                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-A---T-T-CTG-------------A-C--T---------------------------------CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-TA----G-A--A--A---T---G---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--atatttt
gi|55282                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TTT-G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-AAC--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-T-AA----G-A--T--G---T---A---------
gi|55292                      :  TTTT--CCA--G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-A-G--C---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACTTCA
gi|55293                      :  TTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-C-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-G-AA--ACCTCATcatttt
gi|55294                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-C-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-T--C---A-----A-CA-A-G--ATT-T--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A----A------------G---T---A---------AAG-T------TT-----TA-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55295                      :  TTTC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTA-C-T-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-------CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-------C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC---G-AA--ACCTCAT
gi|55296                      :  TTTG--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----CAC-A-C-------------A-TAA-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-AT-C-----A-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A---------T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC---G-AA--ACCTCATttt
gi|55297                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---GAT-CTC-A-C-----T-CCA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CACG-T--ATC-C--C-A----G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G----T--G---A---A---------AAC-TA-----TT-----GG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-AC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55299                      :  TTTTGACC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------C-A---T-T-CTT-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-C-T--ATC-C------------------------------TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55300                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--ATG-------G-G---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-----------------T--TG-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55302                      :  TTTT--CC---T-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTCCT-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATG-T--G-AA-ATG-TT-T-----C-AT---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAG-TA-----TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCATttt
gi|55303                      :  TTTG--TC---A-AAA-A--CC--A-A--TTG-------G-G---T-TTCTC-A-C-----T-C-A-C--TG-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-TG-A-T--ATC-C--C-AA-A-C-AT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AG--T------TT-----TG-G-G--G-T------T-A-T-T-T-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55306                      :  TTGT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-A-T--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-tttt
gi|55313                      :   TTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----TGC-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-G-----G-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---G---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-T-AA--ACCTC
gi|55316                      :   TTT--CT---G-AAA-T--TC--G-A--TAG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AA---A--TG-A-ACT-AA----G-A--T--G---T---A---------A---T------TT--------G-A--G----------A-T-T-G-T-CT---G-AA--ACCTAATtatttt
gi|55318                      :    TC--CC---G-AAA-A--TT--A-A--TAGCCTAAAGG-G---T-T-CTT-A-G-----C-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ATCTAATt
gi|55319                      :    TT--TC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G------------------------------TT-----------T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC------AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-C------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55320                      :    TT--CC---GTAAA-A--TTTAA-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TTTT-----G-A-T-A-G-G--T---AGTTAAA-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-T-A-CA----C-A--T--G---T---A---------AAC-C------TT-----TG-G-A--G-T------T-ATT-T-G-C-TC-G-G--A--ACCTtttt
gi|55322                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-A-C-C--AT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------GT-----TG-A-A--G-T------T-A---C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgacaatttt
gi|55323                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-------C-A-C--AT-------G-A-T---T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AG-T-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCA
gi|55325                      :          ---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T--TC-T-CT----T-C-A-C--GT---------A-T-A-T-G--C---A-----ATCA-A-T--ATC-A--C-AA-G-T-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCAatttt
gi|55328                      :                  -A--TT--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TA-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-C-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatgttt
gi|55330                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATA-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAAT
gi|55331                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATTAC--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G--------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAATtgtt
gi|55332                      :                                 G-------G-A---T-T-TTC-C-CAAAAAT-C-A-C--TT-------G-A-T-G-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------ACC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-CA-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55333                      :                                  -------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--GTC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-G------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-C-T-A-C-CC-A-G-AA--ACCTCATttct





Alignments
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lowQualScore                  :      ..  ... .   . ..  .. . ..   ....... . ... . .   ... ..... . . . ... ....... . . . . . .. ... ..... .  . . ..   . .. .  . . .  . ..... .  ... ..  . . . .  .... . .. .. ... ... .........   . ......  ..... .. . .. . ...... . . . . . .  . . .  ..       
lowQualScore                  :      66  222 8   4 55  66 4 22   3333333 8 111 4 4   999 44444 8 4 4 333 3333333 4 8 6 4 8 66 999 44444 8  8 2 11   2 55 6  4 2 8  4 22222 8  777 55  4 6 4 4  3333 8 00 66 888 555 000000000   0 222222  44444 66 4 44 8 222222 2 4 4 8 8 4  7 4 8  00       
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Reference ( family-170 )      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAT
gi|55187                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--G-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
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gi|55212                      : TTTTT--CC---A-AAA-T--TC--T-A--TAG-------G-G---T-C-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CG-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T------------------------------------------C-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55213                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAA-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-A-AA--ACCTAATttt
gi|55214                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--AAA-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AG---T--AG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----AG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55215                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--GC--C---AACTTTTGCCAAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-atttt
gi|55216                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--AA-A-A-T-CA----G-A-----A---A---A---------AGCGT------TT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCA
gi|55217                      : TTTCC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATagttttt
gi|55218                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---C-T-CTC-T-C-----T-C-T-C----------------------------A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCgttt
gi|55219                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--AC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----G-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TT-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATaaattgtt
gi|55220                      : TTTTT--CC---G--AA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-C-A-G--T---A-----A-CATT-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55221                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TGTTC-T-C-----C-C-A-CGGTT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AACA-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CCTG-G-AA--ACCTCATttct
gi|55222                      : TTTGT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----T-CA-A-T--ATC-A--A-AA-T-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TTTGA---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-T-G-AA--atttt
gi|55223                      : TTTGT--TC---G-AAA-A--TC--A-AAAGAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-T--GT-------G-A-TAA-TGG--C---A-----A-CA-A----AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TGGG---T---A---------AACTT------TT-----TT-G-A--A-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AAATACCTCAT
gi|55224                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-C-C-----C-C--------------------------------------A-CA-A-T--ATG-C--G-AA-G-T-TT-T-----C-AC---T--TG-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-----CC-G-G-AA--tgtt
gi|55226                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C--A---T--TC-A-A-T-CA------A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55227                      : TTTTT--CC---G-AA-----TC--A-A--TAG-------G-G---T---CTC-T-C-------C-A-C--TTA------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA---T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---T---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55228                      : TTTGT--CA---G-AAA-AA-TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T-C-----T-C-A-A--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TG-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAA-C------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55229                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAA-------G-GT--T-T-TTC-T-C-----T-C-A-T--AT-------G-A-T-T-T-G--C---------A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TGAA-A--G-T------T-A-A-C-G-T--C-G-G-AA--ACCatttt
gi|55230                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------T-A---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T---CC-T--T-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-TCAG-G-AA--ACCTCATatattt
gi|55231                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A----ACG-C--T-AT-G-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55232                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------------T-T-TTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AG-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-C------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTGATattt
gi|55233                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A------A----G-G--T------------------------T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-A-G-T-CT-G-G-AA--ACCgttt
gi|55236                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-A-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-T-C-T-G-T-CT-G-G-AA--ACaaattgtt
gi|55237                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--T-A--TAC-------G-G---T-T-CTC-G-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA---G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-C
gi|55238                      : TTTTC--CC---G-CAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----------------------------A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55239                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-T-----T-C-G-C--T--------G-A-------G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-C-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G-------A---------A---T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55240                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-C---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--CT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-TTACATGT-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ATCttt
gi|55241                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------GTG---T-T--TC-T-C-----T-C-A-T--GT-------A-A-C-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-C-G-TT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--GTCTAAT
gi|55243                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--TTAATACTTG-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ACC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---G---------AACGT------TT-----TA-G----G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55244                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TCT-A-A--CAG-------GCG---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-G-A--G-T------T---T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55245                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--CAG-------G-G---T-T--TC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CG----A-A--T--G---T---AT--------AAT-A------TTCTATATA-G-AATG-T------T-T-T-T-G-C-CC-G-GTAA--ACCTgttt
gi|55246                      : TTTTT--CCCCCA-AAA-T--TC--A-A--T-----------------T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-TC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55247                      : TTTCT--CC---G-AAA-A--TC--T-A--TAG-------G-A---T-A-TTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--A-AA-A-G-AT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------TTT-T------TT-----TT-T-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATttt
gi|55248                      : TTTTT--CC---G-AGA-A--TT--A-A--TAG-------G-A---G-T-CTC-A-T-----T-C-A-C--TT-------T-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--AAC-C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----A-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55249                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-AA-TAG-------G-------T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G---G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A---TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--G---T-------------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TA-G-GAAA--ACCTCATgttt
gi|55250                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T----TC-T-C-----T-T-G-T--GT-------G-A-T-AGT-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CATAATT-A--T--G---T---A---------AAC-T------TTG----TC-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACTTAATttt
gi|55251                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-GGGTT-T-CT--T-C-----T-C-A-C--AT-------GAA-T-A-T-G------A-----A-CA-A-T--ATCGC--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CAT---G-AT-T--G---T---AAC-------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55253                      : TTTTT--CC---G-GAA-AATTC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-AGT--ATTGC--C-AA-A-G--T-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TTGG---T---A---------AACTT------TT-----TG-G-A--GCT------T-A-T-T-G-C-TC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55254                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AG-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----T-C-A-CA-TT-------A-A-T-C-T-C--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CCAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CC----G-ATTT--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-CGG-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtttt
gi|55255                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A-A--TA--------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-ATT-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATG-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-TCCA----G-A--T--G---T---A---------AACTT------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-TGCC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55256                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--CGAA-A-G-TT-T-----G-AA---A--TT-A-A-T-CA----G-A--T--ATTTT---A---------GAT-T------TT-----Tattt
gi|55259                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-TTA-T-G--T---A-------CA-A-G--ATT-C----AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--TG-G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-TCC-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtg
gi|55260                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TCCTC-A-C-----T-C-A-CT-TT-------G-A-T-G-A-G--TCAAA-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-T-G-TT-TCC---C-AA---TCGTG-A-A-T-CA----GAA--TTGG---T---AC--------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-CTG-C-TC-G-G-AAG-ACCTCATt
gi|55261                      : TTTTC--CC---G-AAA-ACTTC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-TTC-----T-C-A-C--TT-------G-A-TTA-T-G--T---AC----A-CA-A-TGCATC-C--T-AA-A-G-TG-T-----T-AACACT--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TT-G-G-AT--ACCTCAttt
gi|55263                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A----TAG-------G-G---T-T-T---------------A-A--TG-------G-C-T-A----------A-----A-CA-G-T--ATT-C--C-AA-G-T-TT-T-----C-AA---T--TG-AGA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--GCT------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATcatattttt
gi|55267                      : TTTTT--CC---GGAAA-A--TC--A-A--CAG-------G-A---T-TTCTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-CTTT-AA-A-G-TT-TTCACCC-AG---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--AAATT---A---------TAC-T------TT-----TT-G-A--C-T------T-T-T-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtttt
gi|55270                      : TTTGT--CG---A-AAA-A--TC--A----TAG-------G-----T-T-CTC-T-T-----T-T-G-----T-------G-ACT-A-T-G--TG--A-----A-CA-A-TTGATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-AG-G-T------T-A-T-C-G-T-CCGG-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55271                      : TTTTT--TT---G-AAA-A--TCG-A-A--TTA-------G-G---T-G-CTC-T-C-----T-C-A-A--AT-------T-A-T-A-T-G--C---A-----AACA-ACT--ATC-C--C-AA-AAG-TTGT-----C-AA---T--TGGA-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----TG-GAA--G-T------T-A-T-C-GTT-TT-G-G-AA--ACCTCATgattttt
gi|55275                      : TTTTG--TC---A-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-T-----T-G-A-C--TT-------G-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----C--A---T--TA-C-A-T-CA----G-A--A--G-------A---------CGC-T------TG-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55276                      : TTTTT--CC-----AAA-A--TC--G-A--TAG-------A-T---T-T-CTC-A-C-----T-A-A-G--TT-------A-A---A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--C--A---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--A-A------T-A-T-T-G-T-CC-G-T-AA--ACCTCGTgttt
gi|55277                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A----TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-A-TGG--C---A-----A-C--A-T--ATC-C-------A-G-TT-TCTA--C-AT---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAtt
gi|55281                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-A---T-T-CTG-------------A-C--T---------------------------------CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-TA----G-A--A--A---T---G---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--atatttt
gi|55282                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TTT-G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-AAC--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-T-AA----G-A--T--G---T---A---------
gi|55292                      :  TTTT--CCA--G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-A-G--C---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACTTCA
gi|55293                      :  TTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-C-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-G-AA--ACCTCATcatttt
gi|55294                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-C-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-T--C---A-----A-CA-A-G--ATT-T--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A----A------------G---T---A---------AAG-T------TT-----TA-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55295                      :  TTTC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTA-C-T-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-------CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-------C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC---G-AA--ACCTCAT
gi|55296                      :  TTTG--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----CAC-A-C-------------A-TAA-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-AT-C-----A-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A---------T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC---G-AA--ACCTCATttt
gi|55297                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---GAT-CTC-A-C-----T-CCA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CACG-T--ATC-C--C-A----G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G----T--G---A---A---------AAC-TA-----TT-----GG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-AC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55299                      :  TTTTGACC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------C-A---T-T-CTT-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-C-T--ATC-C------------------------------TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55300                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--ATG-------G-G---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-----------------T--TG-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55302                      :  TTTT--CC---T-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTCCT-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATG-T--G-AA-ATG-TT-T-----C-AT---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAG-TA-----TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCATttt
gi|55303                      :  TTTG--TC---A-AAA-A--CC--A-A--TTG-------G-G---T-TTCTC-A-C-----T-C-A-C--TG-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-TG-A-T--ATC-C--C-AA-A-C-AT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AG--T------TT-----TG-G-G--G-T------T-A-T-T-T-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55306                      :  TTGT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-A-T--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-tttt
gi|55313                      :   TTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----TGC-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-G-----G-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---G---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-T-AA--ACCTC
gi|55316                      :   TTT--CT---G-AAA-T--TC--G-A--TAG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AA---A--TG-A-ACT-AA----G-A--T--G---T---A---------A---T------TT--------G-A--G----------A-T-T-G-T-CT---G-AA--ACCTAATtatttt
gi|55318                      :    TC--CC---G-AAA-A--TT--A-A--TAGCCTAAAGG-G---T-T-CTT-A-G-----C-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ATCTAATt
gi|55319                      :    TT--TC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G------------------------------TT-----------T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC------AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-C------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55320                      :    TT--CC---GTAAA-A--TTTAA-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TTTT-----G-A-T-A-G-G--T---AGTTAAA-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-T-A-CA----C-A--T--G---T---A---------AAC-C------TT-----TG-G-A--G-T------T-ATT-T-G-C-TC-G-G--A--ACCTtttt
gi|55322                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-A-C-C--AT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------GT-----TG-A-A--G-T------T-A---C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgacaatttt
gi|55323                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-------C-A-C--AT-------G-A-T---T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AG-T-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCA
gi|55325                      :          ---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T--TC-T-CT----T-C-A-C--GT---------A-T-A-T-G--C---A-----ATCA-A-T--ATC-A--C-AA-G-T-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCAatttt
gi|55328                      :                  -A--TT--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TA-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-C-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatgttt
gi|55330                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATA-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAAT
gi|55331                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATTAC--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G--------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAATtgtt
gi|55332                      :                                 G-------G-A---T-T-TTC-C-CAAAAAT-C-A-C--TT-------G-A-T-G-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------ACC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-CA-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55333                      :                                  -------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--GTC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-G------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-C-T-A-C-CC-A-G-AA--ACCTCATttct


blockSeqs                     :          CCC       AT  TA   AA   CCTAAAG   GGT   T   TT  AAAAA       GGT AATACTT     A        CAA GTTAA      C GC   G    A    A      TCACC              C      TAAT      TC TTT TTG ACTTTTGCC   G TTTCAA  CTATA      AT   TACATG A            T   A  AT
blockSeqs                     :          A         CT  T    A    .         T     G   CT  T           AA  TT          T        A   C          G TG   G    T    A      CTA                T      T         GG AAT A   AC          T TTTCAA  G          T    .      A            T   A  G 
blockSeqs                     :          .         A   C    C    .         .     C   A   .           AT  A           T        A   .          C .    A    C    T      CC                 T      .         TG C   A   T           G A       .          G    .      A            A   T  . 
blockSeqs                     :          .         .   G    A    .         .     T   T   .           TT  .           A        G   .          . .    .    G    .      .                  G      .         TG .   .   C           T A       .          .    .      .            G   A  . 
blockSeqs                     :          .         .   C    G    .         .     T   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         G  .   .   .           T .       .          .    .      .            .   A  . 
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blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           C   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           C   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   G   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   C   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           C   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   G   .           C   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   C   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   C   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           G   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   A   .           A   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
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blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :          .         .   .    .    .         .     .   T   .           T   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .            .   .  . 
blockSeqs                     :                    .   .    .    .         .     .   C   .           .   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .                     
blockSeqs                     :                    .   .    .    .         .     .   A   .           .   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .          .    .      .                     
blockSeqs                     :                    .   .    .    .         .     .   .   .           .   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .           . .       .                                            
blockSeqs                     :                                  .         .     .   .   .           .   .           .        .   .          . .    .    .    .      .                  .      .         .  .   .   .                                                                  
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Alignments
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lowQualScore                  :      66  222 8   4 55  66 4 22   3333333 8 111 4 4   999 44444 8 4 4 333 3333333 4 8 6 4 8 66 999 44444 8  8 2 11   2 55 6  4 2 8  4 22222 8  777 55  4 6 4 4  3333 8 00 66 888 555 000000000   0 222222  44444 66 4 44 8 222222 2 4 4 8 8 4  7 4 8  00       
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Reference ( family-170 )      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAT
gi|55187                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--G-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55188                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-A-AA--ACATCAT
gi|55189                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-C-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------CAC-G------TT-----CT-A-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55190                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-T-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------GCG-T------TT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55191                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TT--T-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-C-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55192                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-C---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55193                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-A-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55194                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55195                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-T--TAT-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--C--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55196                      : TTTGT--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TGG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-A-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-A------T-A-T-T-A-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55197                      : TTGTT--CC---G-AAACA--TC--A-AA-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A---A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--TTCT---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-C-C-G-T-CC-GCC-AA--ACCTAATatttt
gi|55199                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----TT-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55200                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T----T---A-------CA-A-C--ATC-C--C-AA-AAG-TT-T-----C-AA---T--TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TG-----TT-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTgttt
gi|55201                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-C-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CAAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-GAAA--ACCTCAT
gi|55202                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----GAA--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55203                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T--A-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--A-CTCATttt
gi|55204                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AC-TAG-------A-G-----T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTAATatttt
gi|55205                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-CA-AT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtgtt
gi|55206                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----C-T-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-T-G-TT-------C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55207                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--CC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----C-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----G-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-ACA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--A-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatttt
gi|55208                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTT-G-C-----T-C-A-C--TT-------G-A---A-T-GAGT---A-----A-CA-ACT--ATC-T--CTGA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-C------T-A-T-T-GTT-CC-A-G-AA--ACCTCAtgtt
gi|55209                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TG--ACG--TAG-------G-G---T-T-CCT-A-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-C-G--ATC-A--C-TA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TT-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-AT-G-A------T-A-T-T-G-T-CCTG-G-AA--ACCTatttt
gi|55210                      : TTTTT--CT---G-ACA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-G--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---C--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAT-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55211                      : TTTTT--TA---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-GA-A-A-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CT-G-G-AA--ACCTTATtgtt
gi|55212                      : TTTTT--CC---A-AAA-T--TC--T-A--TAG-------G-G---T-C-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CG-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--T------------------------------------------C-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgttt
gi|55213                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAA-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-A-AA--ACCTAATttt
gi|55214                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--AAA-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AG---T--AG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----AG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55215                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--GC--C---AACTTTTGCCAAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-atttt
gi|55216                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-A-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-A--C---A-----A-CA-A-G--ATT-C--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--AA-A-A-T-CA----G-A-----A---A---A---------AGCGT------TT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCA
gi|55217                      : TTTCC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATagttttt
gi|55218                      : TTTGT--CC-----AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---C-T-CTC-T-C-----T-C-T-C----------------------------A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCgttt
gi|55219                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--AC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----G-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TT-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATaaattgtt
gi|55220                      : TTTTT--CC---G--AA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-C-A-G--T---A-----A-CATT-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55221                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TGTTC-T-C-----C-C-A-CGGTT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AACA-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CCTG-G-AA--ACCTCATttct
gi|55222                      : TTTGT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----T-CA-A-T--ATC-A--A-AA-T-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---TTTGA---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-T-G-AA--atttt
gi|55223                      : TTTGT--TC---G-AAA-A--TC--A-AAAGAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-T--GT-------G-A-TAA-TGG--C---A-----A-CA-A----AT--C--C-AA-A-G-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TGGG---T---A---------AACTT------TT-----TT-G-A--A-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AAATACCTCAT
gi|55224                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-C-C-----C-C--------------------------------------A-CA-A-T--ATG-C--G-AA-G-T-TT-T-----C-AC---T--TG-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-----CC-G-G-AA--tgtt
gi|55226                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C--A---T--TC-A-A-T-CA------A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAAT
gi|55227                      : TTTTT--CC---G-AA-----TC--A-A--TAG-------G-G---T---CTC-T-C-------C-A-C--TTA------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA---T--ATC-T--T-AA-A-G-TT-T-----A-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---T---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55228                      : TTTGT--CA---G-AAA-AA-TC--A-A--TAG-------G-----T-T-CTC-T-C-----T-C-A-A--CT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TG-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAA-C------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55229                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAA-------G-GT--T-T-TTC-T-C-----T-C-A-T--AT-------G-A-T-T-T-G--C---------A-CA-A-T--ATC-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TGAA-A--G-T------T-A-A-C-G-T--C-G-G-AA--ACCatttt
gi|55230                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------T-A---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T---CC-T--T-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TA-ATA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-TCAG-G-AA--ACCTCATatattt
gi|55231                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-T-T-G--C---A-----A-CA-A----ACG-C--T-AT-G-G-TT-T-----C-AA---T--T--C-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55232                      : TTTTT--TC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------------T-T-TTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-A--ATC-C--T-AG-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-C------TT-----TT-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTGATattt
gi|55233                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A------A----G-G--T------------------------T------TT-----T--G-A--G-T------T-A-T-A-G-T-CT-G-G-AA--ACCgttt
gi|55236                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-A-----T-C-A-C--TT-------A-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-T-C-T-G-T-CT-G-G-AA--ACaaattgtt
gi|55237                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--T-A--TAC-------G-G---T-T-CTC-G-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA---G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-C
gi|55238                      : TTTTC--CC---G-CAA-A--TC--A-A--TAG-------G-T---T-T-CTC-T-C-----------------------------A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55239                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-T-----T-C-G-C--T--------G-A-------G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-C-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G-------A---------A---T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55240                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-C---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--CT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-TTACATGT-A-T-T-G-C-TC-G-G-AA--ATCttt
gi|55241                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------GTG---T-T--TC-T-C-----T-C-A-T--GT-------A-A-C-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-C-G-TT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--GTCTAAT
gi|55243                      : TTTTC--CC---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTT-A-C-----T-C-A-C--TTAATACTTG-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ACC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---G---------AACGT------TT-----TA-G----G-T------T-A-T-C-A-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55244                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TCT-A-A--CAG-------GCG---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-G-A--G-T------T---T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55245                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--CAG-------G-G---T-T--TC-A-C-----T-C-A-C--TC-------G-A-T-G-A-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-GTTT-T-----C-AA---T--TG-T-A-T-CG----A-A--T--G---T---AT--------AAT-A------TTCTATATA-G-AATG-T------T-T-T-T-G-C-CC-G-GTAA--ACCTgttt
gi|55246                      : TTTTT--CCCCCA-AAA-T--TC--A-A--T-----------------T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-T-TC-G-G-AA--ACCTTAT
gi|55247                      : TTTCT--CC---G-AAA-A--TC--T-A--TAG-------G-A---T-A-TTC-T-C-----T-C-A-C--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATT-C--A-AA-A-G-AT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---A---A---------TTT-T------TT-----TT-T-A--A-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATttt
gi|55248                      : TTTTT--CC---G-AGA-A--TT--A-A--TAG-------G-A---G-T-CTC-A-T-----T-C-A-C--TT-------T-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--AAC-C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-CA----A-A--A--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55249                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-AA-TAG-------G-------T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G---G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A---TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-TA----G-A--T--G---T-------------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TA-G-GAAA--ACCTCATgttt
gi|55250                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T----TC-T-C-----T-T-G-T--GT-------G-A-T-AGT-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--T--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CATAATT-A--T--G---T---A---------AAC-T------TTG----TC-G-A--G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACTTAATttt
gi|55251                      : TTTTT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-GGGTT-T-CT--T-C-----T-C-A-C--AT-------GAA-T-A-T-G------A-----A-CA-A-T--ATCGC--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CAT---G-AT-T--G---T---AAC-------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-A-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55253                      : TTTTT--CC---G-GAA-AATTC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-AGT--ATTGC--C-AA-A-G--T-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--TTGG---T---A---------AACTT------TT-----TG-G-A--GCT------T-A-T-T-G-C-TC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55254                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A-AG-TAG-------G-G---T-T-CTC-T-A-----T-C-A-CA-TT-------A-A-T-C-T-C--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--CCAA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CC----G-ATTT--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-CGG-T-CC-G-G-AA--ACCTCATtttt
gi|55255                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A-A--TA--------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-ATT-T-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATG-C--T-AT-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-TCCA----G-A--T--G---T---A---------AACTT------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-TGCC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55256                      : TTTTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--TA--A-----A-CA-A-T--ATC-C--CGAA-A-G-TT-T-----G-AA---A--TT-A-A-T-CA----G-A--T--ATTTT---A---------GAT-T------TT-----Tattt
gi|55259                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-G-T--GT-------G-A-TTA-T-G--T---A-------CA-A-G--ATT-C----AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--TG-G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-A--G-T------T-A-TCC-G-T-CC-A-G-AA--ACCTAATtg
gi|55260                      : TTTTT--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-TCCTC-A-C-----T-C-A-CT-TT-------G-A-T-G-A-G--TCAAA-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-T-G-TT-TCC---C-AA---TCGTG-A-A-T-CA----GAA--TTGG---T---AC--------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-CTG-C-TC-G-G-AAG-ACCTCATt
gi|55261                      : TTTTC--CC---G-AAA-ACTTC--A-A--TAG-------G-G---T-TTCTC-TTC-----T-C-A-C--TT-------G-A-TTA-T-G--T---AC----A-CA-A-TGCATC-C--T-AA-A-G-TG-T-----T-AACACT--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TT-G-G-AT--ACCTCAttt
gi|55263                      : TTTGT--CC---G-AAA-A--TC--A----TAG-------G-G---T-T-T---------------A-A--TG-------G-C-T-A----------A-----A-CA-G-T--ATT-C--C-AA-G-T-TT-T-----C-AA---T--TG-AGA-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--GCT------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATcatattttt
gi|55267                      : TTTTT--CC---GGAAA-A--TC--A-A--CAG-------G-A---T-TTCTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-CTTT-AA-A-G-TT-TTCACCC-AG---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--AAATT---A---------TAC-T------TT-----TT-G-A--C-T------T-T-T-C-G-T-CC-G-G--A--ACCTCATtttt
gi|55270                      : TTTGT--CG---A-AAA-A--TC--A----TAG-------G-----T-T-CTC-T-T-----T-T-G-----T-------G-ACT-A-T-G--TG--A-----A-CA-A-TTGATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TC-G-AG-G-T------T-A-T-C-G-T-CCGG-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55271                      : TTTTT--TT---G-AAA-A--TCG-A-A--TTA-------G-G---T-G-CTC-T-C-----T-C-A-A--AT-------T-A-T-A-T-G--C---A-----AACA-ACT--ATC-C--C-AA-AAG-TTGT-----C-AA---T--TGGA-A-T-CA----G-A--T--G---TA--A---------AAC-T------TT-----TG-GAA--G-T------T-A-T-C-GTT-TT-G-G-AA--ACCTCATgattttt
gi|55275                      : TTTTG--TC---A-AAA-A--TCC-A-A--TAG-------G-G---T-T-TTC-A-T-----T-G-A-C--TT-------G-A-T-A-T-C--T---A-----A-TA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----C--A---T--TA-C-A-T-CA----G-A--A--G-------A---------CGC-T------TG-----TG-A-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--ACCTCATattt
gi|55276                      : TTTTT--CC-----AAA-A--TC--G-A--TAG-------A-T---T-T-CTC-A-C-----T-A-A-G--TT-------A-A---A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-TA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--C--A---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--A-A------T-A-T-T-G-T-CC-G-T-AA--ACCTCGTgttt
gi|55277                      : TTTGT--CC---G-AAA----TC--A----TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--AT-------G-A-T-A-TGG--C---A-----A-C--A-T--ATC-C-------A-G-TT-TCTA--C-AT---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------TAA-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCAtt
gi|55281                      : TTTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-A---T-T-CTG-------------A-C--T---------------------------------CA-A-T--ATC-C--C-AA---G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A-T-TA----G-A--A--A---T---G---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-CC-G-G-AA--atatttt
gi|55282                      : TTTTC--CC---C-AAA-A--TTT-G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-AAC--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-CA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-T-AA----G-A--T--G---T---A---------
gi|55292                      :  TTTT--CCA--G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-T-T--GT-------G-A-T-A-A-G--C---A-----A-CA-A-T--ATT-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACTTCA
gi|55293                      :  TTTT--TA---A-AAA-A--TC--G-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-C-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---A---A---------AAC-CTTTCAATT-----TG-G-A--G-T------A-A-T-T-A-T-CA-G-G-AA--ACCTCATcatttt
gi|55294                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TT--G-A--TAG-------G-G---T-T-CCA-C-C-----T-C-A-T--TT-------G-A-T-A-T-T--C---A-----A-CA-A-G--ATT-T--C-CA-A-G-TT-T-----C-AT---T--TG-A-A----A------------G---T---A---------AAG-T------TT-----TA-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CT-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55295                      :  TTTC--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTA-C-T-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-------CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-------C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-T-T-G-C-TC---G-AA--ACCTCAT
gi|55296                      :  TTTG--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----CAC-A-C-------------A-TAA-T-G--C---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-AA-A-G-AT-C-----A-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A---------T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC---G-AA--ACCTCATttt
gi|55297                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---GAT-CTC-A-C-----T-CCA-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CACG-T--ATC-C--C-A----G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G----T--G---A---A---------AAC-TA-----TT-----GG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-AC-G-GAAA--ACCTCATatttt
gi|55299                      :  TTTTGACC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------C-A---T-T-CTT-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---G-----A-CA-C-T--ATC-C------------------------------TA-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATttt
gi|55300                      :  TTTT--CT---G-AAA-A--TC--A-A--ATG-------G-G---T-T-TTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-G-A-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-----------------T--TG-A-A-T-CA----G-A--T----------------------------------------------G-T------T-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55302                      :  TTTT--CC---T-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTCCT-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATG-T--G-AA-ATG-TT-T-----C-AT---T--GG-A-A-T-CA----G-A--T--A---T---A---------AAG-TA-----TT-----TA-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCATttt
gi|55303                      :  TTTG--TC---A-AAA-A--CC--A-A--TTG-------G-G---T-TTCTC-A-C-----T-C-A-C--TG-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-TG-A-T--ATC-C--C-AA-A-C-AT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AG--T------TT-----TG-G-G--G-T------T-A-T-T-T-T-CC-G-G-AA--ACCTCATatttt
gi|55306                      :  TTGT--CC---A-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-T-----T-C-A-T--GT-------A-A-T-A-T-G--T---A-----A-CG-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-tttt
gi|55313                      :   TTT--CC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----TGC-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AA-A-G-TT-G-----G-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--A---G---A---------AAC--------TT-----TG-A-A--G--------T-A-C-C-G-T-CC-G-T-AA--ACCTC
gi|55316                      :   TTT--CT---G-AAA-T--TC--G-A--TAG-------T-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--AT--C--C-GA-A-G-TT-T-----C-AA---A--TG-A-ACT-AA----G-A--T--G---T---A---------A---T------TT--------G-A--G----------A-T-T-G-T-CT---G-AA--ACCTAATtatttt
gi|55318                      :    TC--CC---G-AAA-A--TT--A-A--TAGCCTAAAGG-G---T-T-CTT-A-G-----C-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---C---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-A-G-AA--ATCTAATt
gi|55319                      :    TT--TC---G-AAA----TC--A-A--TAG-------G------------------------------TT-----------T-A-T-G--T---A-----A-CA-A-T--ATC------AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-G-A--G-C------C-A-T-T-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATtgtt
gi|55320                      :    TT--CC---GTAAA-A--TTTAA-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TTTT-----G-A-T-A-G-G--T---AGTTAAA-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TG-A-T-A-CA----C-A--T--G---T---A---------AAC-C------TT-----TG-G-A--G-T------T-ATT-T-G-C-TC-G-G--A--ACCTtttt
gi|55322                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-A-C-C--AT-------A-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--T---T---A---------AAC-T------GT-----TG-A-A--G-T------T-A---C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCATgacaatttt
gi|55323                      :     T--CC---G-AAA-A--TC--A-A--TCG-------G-G---T-T-CTC-T-C-------C-A-C--AT-------G-A-T---T-G--C---A-----A-CA-A-T--ATC-C--T-AG-T-G-TT-T-----C-AA---T--TC-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-A-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTCA
gi|55325                      :          ---G-AAA-A--TC--A-A--TAG-------G-G---T-T--TC-T-CT----T-C-A-C--GT---------A-T-A-T-G--C---A-----ATCA-A-T--ATC-A--C-AA-G-T-TT-T-----CAAA---T--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AA--T------TT-----TG-A-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-GAAA--ACCTCAatttt
gi|55328                      :                  -A--TT--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--CT-------A-A-T-A-T-A--T---A-----A-CA-A-C--ATC-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TA-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------AAC-T------TT-----TT-C-A--G-T------T-A-T-C-G-T-CC-G-G-AA--ACCTAATatgttt
gi|55330                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATA-C--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G-T------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAAT
gi|55331                      :                    --TC--A-A--TAG-------G-G---T-T-CTC-T-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-G--C---A-----A-CA-A-C--ATTAC--T-AA-A-G-TT-T-----C-AA---G--TG-A-A-T-CA----G-A--T--G---T---A---------AAT-G------TT-----TT-G-A--G--------T-A-T-C-A-T-TC-A-G-AA--ACTTAATtgtt
gi|55332                      :                                 G-------G-A---T-T-TTC-C-CAAAAAT-C-A-C--TT-------G-A-T-G-T-G--T---G-----A-CA-A-T--ATC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AA---T--TG-A-A-C-CA----G-A--T--G---T---A---------ACC-T------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-A-T-G-T-CA-G-G-AA--ACCTCATtgtt
gi|55333                      :                                  -------G-G---T-T-CTC-A-C-----T-C-A-C--TT-------G-A-T-A-T-T--T---A-----A-TA-A-T--GTC-C--C-AA-A-G-TT-T-----T-AT---T--TG-A-A-T-CA----G-A--A--G---T---A---------AAC-G------TT-----TG-G-A--G-T------T-A-C-T-A-C-CC-A-G-AA--ACCTCATttct