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gi|58157 : CATC-TT----C---GCAA-G-C-CA----A--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-T-C
gi|58161 : CATC-T-----C---GCGA-G-C-CA----AT-GTG--TC-CGG---A--TT--C-GC-T--TCAC-T-----C--T-A--A---T-C-TAA---C-G-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58158 : CATC-TT----C---GCGA---C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--CCGC-T--G-AC-T-----C--T-G--A---T-C-T-----T-TACC----C-ATG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58162 : CATC-TT----C---GCAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----
gi|58163 : CATC-TT----C---GCGA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-C
gi|58165 : CATC-TT----C---GCGA-G-C-CA----AA-GTGGTTG-CG----A--TT--C-GT-T--T-AC-T-----C--T-A--AA--T-C-T-----AAC-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58201 : ATC-TT----C---GCAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58204 : ATC-TT----C---ACAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CGGCCGA--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TCCCCCC-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58202 : ATC-TT----C---G-AA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-A--------C--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---A-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58211 : TC-TT----C---GCAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-T--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58212 : TC-TT----C---GCAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CA----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58214 : TC-TT----C---GCGA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GCTT--T-CC-T-----C--T-A--A---T-C-TTA---C-C-CC----A-ATG---G-C--AGG-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58218 : C-TT----C---GCAA-G-C-CA----C--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--C-CA-A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-A-------G-A-TT--A--G-TCCGCG
gi|58219 : C-TT----C---GCGA-G-C-CA----A--GTG--TC-C-----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-A-----C-C-CT----C-TT----G-C--T-G-------A-T-TT--A--GTT-CGCG
gi|58221 : -TT----C---GCGA-G-C-CA----A--GGG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-TA----C-C-CA----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGC
gi|58225 : ---GCAA-G-C-CA----A--GTG--TC-CG----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---C-C-T-----C-C-CC----C-TTT---G-C--A-G-------A-A-TT--
gi|58227 : CAA-G-A-CAGATCA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-CAAA-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58229 : ----A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
Alignments
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lowQualScore : . .... . ... . . . .. .. . .... .. .. . . .. . . ..... .. .... ... . . ....... . .... . ... . .. . ....... . . .. .. . .
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Reference ( family-169 ) : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58072 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58073 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58074 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58075 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----CATTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58076 : CATC-AT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58077 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-A-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--
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gi|58081 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--G---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
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gi|58083 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58084 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58085 : CATC-T-----C-GC-A-A-G-C--AA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----A--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TTC-A--G-T-CG
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gi|58088 : CATC-TT----C-AC-A-A-G-C-CA---GTG--TC-CA----A--T---C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-GT------T-T-TT--A--G-T-CG
gi|58089 : CAT--TT----C-AC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CA----A--TC--T-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TCG---G-C--A-G---------T-TT--A--G-T-CG
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gi|58099 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--A-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-
gi|58100 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-TG----A--TT--C-GC-T--T-AA-C-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGTG
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gi|58102 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-GATTTACTA-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58103 : CATC-TT----C-GC-A-T-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--CT----GC-T--T-AC-C-----T--T-C--A---TTC-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58104 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58105 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-T-------A-T-TT--A--A-T-CGCG
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gi|58107 : CATC-TC----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------T-CC----C-TTG---G-C----G-------A-T-TT--A--G-T-CG
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gi|58109 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--TTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
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gi|58116 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTGG-TG-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C-------A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58117 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-C--AA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------A-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A---TT--A--G-T-CGCG
gi|58118 : CATC-TT----C-GC-G-----C-CA---GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------A-CC----C-TTA---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58119 : CATT-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-CAT-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-C-GGCG
gi|58120 : CATC-TTAAGTC-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-A-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58121 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--AT--T-C-T-----C-C-CC----C-TT----G-C--A-T-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
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gi|58124 : CATCCTT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTGG-TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC-------TGT--G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
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gi|58127 : CATC-TT----C-GC-A-T-G-C-AAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--TTAC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--A-T-TGC
gi|58128 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTGGCTG-C--ATG-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58129 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-TTAGTAC--T-CTAA---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
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gi|58132 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-ACA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T---------AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58133 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-ACA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T---------AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58134 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--ATG--TC-CG----A--T---C-GC-T--T-AC-T-----C--A-T--A---A-T-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58135 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-CC-G-----A--T-C--A---T-C-T-----C-C-AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58136 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C--AA--TGG--TCGCG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58137 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-ATGT-----T--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------ATT-TT--A--G-T-CGCG
gi|58138 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-GG----AA-TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--TAC--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58139 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-G-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T----A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58140 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--A-AC-T-----C--T----A---T-T-A-----T-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58141 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C----C--T-AA-A-----C--TGC--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGC
gi|58142 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C--AA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-TG----T--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-C-TT--
gi|58143 : CATC-TT----C-ACTGCA-G-C-CAA--GTG--TC-AG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----A-TT----G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58144 : CATC-TTT---C-GC-A-A-GGCACAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GCGT--T-AC-T-----C--T-C--ATTTT-C-T-----C-C-CC----C-TT----G-C--A-G-------A-T-TT--AT-G-T-CG
gi|58145 : CATC-TT----TTGC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--AGTG-T-CGCG
gi|58146 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----ATTTT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--AAT-T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---GCC--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58147 : CATC-TT----C-GC-A-T-A-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-TA----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--A-C-CG
gi|58148 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-CGCAA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----T-C-CC----C--TG---G-C--A-G-------A-TCTT--A--G-T-CG
gi|58149 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CGA---A--TT--C-GC----T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-------T-CC----C-TTG---G-C--A-G-------ATT-TT--A--G-T-CG
gi|58150 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-C-----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-A--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58151 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--CAGC-T--T-AC-T-----CTAT-A--A---T-C-TA----C-G-CC----C-TT----G-C--A-G-------A-T-TT--A--GCT-CG
gi|58152 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-C-CAAA-GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-T--AAT-T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---GCC--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58153 : CATC-TT----C--C-A-A-G-C-CAA--GTG--TC--G----A--TT--C-AC-T----AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TTTAG--G-T-CGCG
gi|58154 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-T-CAA--GTA--TC-CT----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-
gi|58155 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-
gi|58157 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-T-C
gi|58158 : CATC-TT----C-GC-G-A---C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--CCGC-T--G-AC-T-----C--T-G--A---T-C-T-----T-TACC----C-ATG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58161 : CATC-T-----C-GC-G-A-G-C-CAAT-GTG--TC-CGG---A--TT--C-GC-T--TCAC-T-----C--T-A--A---T-C-TAA---C-G-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58162 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----
gi|58163 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-C
gi|58165 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAAA-GTGGTTG-CG----A--TT--C-GT-T--T-AC-T-----C--T-A--AA--T-C-T-----AAC-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58201 : ATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58202 : ATC-TT----C-G--A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-A--------C--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---A-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58204 : ATC-TT----C-AC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CGGCCGA--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TCCCCCC-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58211 : TC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-T--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58212 : TC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CA----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58214 : TC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GCTT--T-CC-T-----C--T-A--A---T-C-TTA---C-C-CC----A-ATG---G-C--AGG-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58218 : C-TT----C-GC-A-A-G-C-CAC--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--C-CA-A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-A-------G-A-TT--A--G-TCCGCG
gi|58219 : C-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-C-----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-A-----C-C-CT----C-TT----G-C--T-G-------A-T-TT--A--GTT-CGCG
gi|58221 : -TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GGG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-TA----C-C-CA----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGC
gi|58225 : -GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---C-C-T-----C-C-CC----C-TTT---G-C--A-G-------A-A-TT--
gi|58227 : A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-CAAA-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58229 : caagacagatcA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
Alignments
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lowQualScore : . .... . ... . . . .. .. . .... .. .. . . .. . . ..... .. .... ... . . ....... . .... . ... . .. . ....... . . .. .. . .
lowQualScore : 4 9999 4 888 4 4 8 88 33 4 7777 00 66 8 2 66 8 8 66666 55 9999 666 4 4 5555555 4 9999 4 111 2 44 8 8888888 2 4 00 00 9 5
consensus : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
Reference ( family-169 ) : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58072 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58073 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58074 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58075 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----CATTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58076 : CATC-AT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58077 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-A-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--
gi|58078 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAG--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58079 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-AC-T--T-AT-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58080 : CATT-TT----T-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58081 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--G---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58082 : CGTC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-TT----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58083 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58084 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58085 : CATC-T-----C-GC-A-A-G-C--AA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----A--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TTC-A--G-T-CG
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gi|58088 : CATC-TT----C-AC-A-A-G-C-CA---GTG--TC-CA----A--T---C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-GT------T-T-TT--A--G-T-CG
gi|58089 : CAT--TT----C-AC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CA----A--TC--T-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TCG---G-C--A-G---------T-TT--A--G-T-CG
gi|58091 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--C-C--A---T-C-T-----T-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58092 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--G-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
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gi|58099 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--A-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-
gi|58100 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-TG----A--TT--C-GC-T--T-AA-C-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGTG
gi|58101 : CATC-TT----T-GC-A-A-G-C-CAAATGTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58102 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-GATTTACTA-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58103 : CATC-TT----C-GC-A-T-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--CT----GC-T--T-AC-C-----T--T-C--A---TTC-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
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gi|58109 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--TTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58110 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----A--T-C--A---T-T-T-----C-C-CCCTGGC-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58111 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-TG----A--TT--C-AC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTT---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58112 : CATC-TT----T-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-ACTT-----T--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---GCC--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58113 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTA---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58114 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-CA-A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58115 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-TA----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--T--G-T-CG
gi|58116 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTGG-TG-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C-------A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58117 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-C--AA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------A-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A---TT--A--G-T-CGCG
gi|58118 : CATC-TT----C-GC-G-----C-CA---GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------A-CC----C-TTA---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58119 : CATT-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC--G----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-CAT-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-C-GGCG
gi|58120 : CATC-TTAAGTC-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-A-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58121 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--AT--T-C-T-----C-C-CC----C-TT----G-C--A-T-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58122 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-------A-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58123 : CATC-TT----C-GC-G-A-T-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-TC----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58124 : CATCCTT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTGG-TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC-------TGT--G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58125 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-TG----A--TT--C-GCTT--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TTG---G-CA-A-A-------A-T-TT--
gi|58126 : CATT-TT----C-GC-A-AAG-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-T-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58127 : CATC-TT----C-GC-A-T-G-C-AAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--TTAC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----T-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--A-T-TGC
gi|58128 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTGGCTG-C--ATG-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58129 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-TTAGTAC--T-CTAA---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58130 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-TA----C-C-CT----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TA--A--G-T-CG
gi|58131 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-A--------C--T-T--A---T-C-TA----T-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58132 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-ACA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T---------AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58133 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-ACA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T---------AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58134 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--ATG--TC-CG----A--T---C-GC-T--T-AC-T-----C--A-T--A---A-T-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58135 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-CC-G-----A--T-C--A---T-C-T-----C-C-AC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58136 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C--AA--TGG--TCGCG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58137 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-ATGT-----T--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------ATT-TT--A--G-T-CGCG
gi|58138 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-GG----AA-TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--TAC--A---T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
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gi|58202 : ATC-TT----C-G--A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-A--------C--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---A-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58204 : ATC-TT----C-AC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CGGCCGA--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TCCCCCC-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
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gi|58214 : TC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GCTT--T-CC-T-----C--T-A--A---T-C-TTA---C-C-CC----A-ATG---G-C--AGG-------A-T-TT--A--G-T-CG
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gi|58219 : C-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-C-----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-A-----C-C-CT----C-TT----G-C--T-G-------A-T-TT--A--GTT-CGCG
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gi|58225 : -GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---C-C-T-----C-C-CC----C-TTT---G-C--A-G-------A-A-TT--
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Reference ( family-169 ) : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
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gi|58151 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--CAGC-T--T-AC-T-----CTAT-A--A---T-C-TA----C-G-CC----C-TT----G-C--A-G-------A-T-TT--A--GCT-CG
gi|58152 : CATC-TTT---C-GC-G-A-G-C-CAAA-GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-T--AAT-T-C-T-----A-C-CC----C-TTG---GCC--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58153 : CATC-TT----C--C-A-A-G-C-CAA--GTG--TC--G----A--TT--C-AC-T----AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TTTAG--G-T-CGCG
gi|58154 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-T-CAA--GTA--TC-CT----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-
gi|58155 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-
gi|58157 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTA--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----C-T-C
gi|58158 : CATC-TT----C-GC-G-A---C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--CCGC-T--G-AC-T-----C--T-G--A---T-C-T-----T-TACC----C-ATG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58161 : CATC-T-----C-GC-G-A-G-C-CAAT-GTG--TC-CGG---A--TT--C-GC-T--TCAC-T-----C--T-A--A---T-C-TAA---C-G-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58162 : CATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-T-----
gi|58163 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-C
gi|58165 : CATC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAAA-GTGGTTG-CG----A--TT--C-GT-T--T-AC-T-----C--T-A--AA--T-C-T-----AAC-CC----C-TTG---G-C--T-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58201 : ATC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----G--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58202 : ATC-TT----C-G--A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-A--------C--T-A--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---A-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58204 : ATC-TT----C-AC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CGGCCGA--TT--C-AC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TCCCCCC-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-G-CG
gi|58211 : TC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-T--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58212 : TC-TT----C-GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CA----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-
gi|58214 : TC-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GCTT--T-CC-T-----C--T-A--A---T-C-TTA---C-C-CC----A-ATG---G-C--AGG-------A-T-TT--A--G-T-CG
gi|58218 : C-TT----C-GC-A-A-G-C-CAC--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--C-CA-A---T-C-TC----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-A-------G-A-TT--A--G-TCCGCG
gi|58219 : C-TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GTG--TC-C-----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-A-----C-C-CT----C-TT----G-C--T-G-------A-T-TT--A--GTT-CGCG
gi|58221 : -TT----C-GC-G-A-G-C-CAA--GGG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-T-----C--T-A--A---T-C-TA----C-C-CA----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGC
gi|58225 : -GC-A-A-G-C-CAA--GTG--TC-CG----A--TT--T-GC-T--T-AC-T-----C--T-C--A---C-C-T-----C-C-CC----C-TTT---G-C--A-G-------A-A-TT--
gi|58227 : A--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-------C-CC----C-TTG---G-CAAA-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG
gi|58229 : caagacagatcA--GTG--TC-CG----A--TT--C-GC-T--T-AC-G-----C--T-C--A---T-C-T-----C-C-CC----C-TTG---G-C--A-G-------A-T-TT--A--G-T-CGCG