lowQualScore : 4 2 2 33 2
lowQualScore : 11 11 99 0 1111 1 0 2 0 0 0 0 00 11111 0 1 1 0 0 33333333333 1 0 0 0 0 0 0 11 11 0 111 11 11 0 0 0 00 00 0 22 2222 1 0 999 33 8888 66 0 3 3 7 66 0 3
lowQualScore : .. .. .. . .... . . . . . . . .. ..... . . . . . ........... . . . . . . . .. .. . ... .. .. . . . .. .. . .. .... . . ... .. .... .. . . . . .. . .
lowQualScore : 00 55 99 4 3333 2 4 0 4 4 4 4 66 00000 8 2 2 8 8 11111111111 2 4 4 4 8 8 8 44 00 4 777 00 00 4 8 4 66 99 6 88 5555 3 6 666 11 9999 55 0 7 7 3 77 7 7
consensus : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAG---T--TA--T-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTGA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
Reference ( gi|12050 ) : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAA---T--TA--T-CACTGATACTTATGGTACTGAAACTTTACACAAGATCTGAATCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12049 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A----C-T-CCT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAA---T--TA--T-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTGAATCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAATTTT-TTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12048 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAAA--T--TA--T-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTGA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12047 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAAA--T--TA--T-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTGA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12051 : TATTTACTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-CTT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12056 : TATTCATTATA--GG--A--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TT-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGG-CA--T--TT-T---A--TT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----
gi|12054 : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---------ATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AAAC-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12057 : TATTTATTATA--GT--A--T------AAA-CATT-C-TTGT----AA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CTCACA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-ATAAA---
gi|12055 : TATTTACTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AAA-CA-----TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--T--G----A----TA-A-AA
gi|12070 : ATTTACTATA--AG--A--T-T----ATA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-G--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12077 : ATTTACTATA--AGGAA--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA--AATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-TAGAA--CT--CA-C-AAA-C--T--A-A--A----TA-A-AAG---T--T
gi|12076 : ATTTAT-ATA--GG--A--T-TT---AAA-CAT--C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T--GA-CG--T--TC-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12067 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12065 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12066 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12069 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-T-T-C-T-GGT-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12078 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-TGAATAAAATATA-AA-T-G-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12104 : aTTATTA----GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-
gi|12052 : TACTATA--GG--A--T-T----AT--CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12068 : taTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-TA--A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12071 : aTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--T-A--A----CATA-AAA---T--T
gi|12072 : aTGTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-TAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--CT--TG-C-AAA-C--T--A-A--A----TA-A-AAA---T--
gi|12053 : aTATTAAA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12058 : taTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAC-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TT-T-----------A-AT-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12059 : taTATTATACCGG--A--T-T----AAA-CATT-T-TTTTTT-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAC-T--TT-T---AACCC--CA-C-AAA-C--T--GAA--A----TA-A-AAG---T--
gi|12120 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAG---T--
gi|12103 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--C--G-A--A----TA-A-AAgcgaagcaattctgctgactactaaagataaaatttagtgacaaaaagac
gi|12111 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-A
gi|12116 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12108 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12122 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-A-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-
gi|12101 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A-A--A----TA-A-AAG---T--
gi|12132 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A-AC-A----TA-A-AAG---T--
gi|12117 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--T--G-A--A----TA-A-gcttcgcacttttattcattttgtgagtaaaaa
gi|12123 : TTATA--AGC-A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--T-AACA----TA-A-AAA---
gi|12128 : TTATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTA-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAG-C--T--G-A--A----TT-A-AAA---at
gi|12112 : TTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A--G-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12144 : TTATG--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------T-AA-C-T-C-A-GGA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-T-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12135 : TTATA--AG--AA-TAT----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA------T-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12130 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12109 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TTAT---A--CT---A-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAA---
gi|12125 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TGATG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TTCTT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--gt
gi|12136 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-C-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12119 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12118 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12133 : TTATAT-GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAT-T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-A--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12149 : TTATA--AG--AA-T-T----AAG-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-TGA-CA--T--AT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--T-A--A----CA-T-AAA---T--T
gi|12106 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12105 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12114 : TTATG--AG-----T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-C-TG-TG-T-------------AA-C-T---T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12102 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A---T--CA-C-AAA-C--
gi|12143 : TTATA--AG--AA-C-G----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12138 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--TT--AA-C-AAA-C--
gi|12141 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GTA-GAATT----AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12139 : TTATA--AG--A--A-T----TAA-CGTT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12110 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-G-A-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12126 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAAAGAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--T--C-AC-A----TA-A-AAA---
gi|12134 : TTATA--GG--A--T-T----AAAACATT-CCTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CACC-AAA-C--
gi|12154 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---C--TT--CA-A-AAA-C--T--T-A--A----CATA-AAA---G--TACTT-CAC
gi|12146 : TTATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-CA-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12142 : TTATA--AG--AA-T-T----ATA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12147 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CATTT--TT-T---T--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12127 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CTTA-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-G-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12153 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAA-T-T--AT-----C-G-A-TGTTG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TC-TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12152 : TTATA--AGGAA--T-T----ATA-CATTTC-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12074 : TTA-A--GA--A--T-TTTAAAAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12140 : attTTATA--AT--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATTGC--AT-----CTG-A-TG-TG-T-----------AGAA-C-TCC-T-GGAGCA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A-----A-A-AA
gi|12155 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AG--T--TT-
gi|12157 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA--A--T--TT-T---C--TC--CA-C-AAG-C--
gi|12131 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAAGCA--T--CT-T---A--TT--CA-C-AAG-C--
gi|12150 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CC--NA-g
gi|12113 : TTATA--AG--AAGT-T----AAA-CAGT-T-CTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT--------CT--CA-C-AAA-C--
gi|12115 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA--ATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----CAG-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--G--TT-T---AT-CT--CA-C-AAA-C--
gi|12178 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12182 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TC-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12179 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-TTTAT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12185 : TATA--CG--A--T-T----AAA-CAAT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AC-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12184 : TATA--G---A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-CCAT--G-A--A----TA-A-AA
gi|12183 : TATA--AG--AA-T-T----AAA-TATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12091 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C---A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--T--A-A--G----TA-A-AAG---T--
gi|12181 : tcTATG--AG--T--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ACTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12186 : TATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12191 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT---TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C---A-T-GGA--A--T--TT-TTA-A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12193 : TATA--AG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ATAA-CGT-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--TC--CT-C-AAA-C--
gi|12188 : TATA--GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT---GAA-GAATT----AT-----C-GGA-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C-----G-A--A----TA-A-AA
gi|12092 : ATA--GG--A--T------AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12201 : ttaATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CGTTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A-A--A----TA-A-AAG---T--
gi|12203 : ATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTT-T-GAA-GATTT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12204 : ATG--GG--A--C-T----AGG-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ACAA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-
gi|12093 : ATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--ATATTATC-G-A-TG-TG-T-----------A-A--C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-G--TGCG-A--AGCACTT-A-AAA---T--TA--T-
gi|12209 : ttaTA--GG--A--A-T----AAA-CATT-C-TCTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GCA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-A
gi|12207 : TA--AA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--GT-T---A--CTC-CA-C-AAA-C--T--T-A--ACAC-TA-A-AAG---TGCTT--TGCACTTTTATTCATGGT
gi|12211 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AAttg
gi|12210 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
gi|12214 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C-AAATT--T--G-AC-A----TA-A-AAGTGCT--TA--G-CACTTTTATTTA
gi|12215 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-TCGAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C--AA-T--T--G-A--C----TA-A-AAGTGCT--TA--G-CACTTTTATTTA
gi|12217 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TATT-T-GAA-GAGTT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-T-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12224 : --A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T----A--A----TA-A-AA
gi|12225 : --A--T-T----AAA-CATT-CATTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12229 : ----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--G-A--A----TA-A-AA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1 11 2
lowQualScore : 11 11 99 0 1111 1 0 2 0 0 0 0 00 11111 0 1 1 0 0 33333333333 1 0 0 0 0 0 0 11 00 0 111 11 11 0 0 0 00 0 33 111 1 0 111 33 5 22 6 111 0 77 0
lowQualScore : .. .. .. . .... . . . . . . . .. ..... . . . . . ........... . . . . . . . .. .. . ... .. .. . . . .. . .. ... . . ... .. . .. . ... . .. .
lowQualScore : 00 55 88 4 3333 2 4 0 4 4 4 4 55 00000 8 2 2 8 8 11111111111 2 4 4 4 8 8 8 33 99 4 777 00 00 4 8 4 66 6 77 777 3 6 777 11 0 00 7 000 0 55 0
consensus : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
Reference ( family-151 ) : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12047 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12048 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12049 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A----C-T-CCT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-AATCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12050 : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTACTGAAACTTTACACAAGATCTGAA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12051 : TATTTACTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-CTT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12052 : TACTATA--GG--A--T-T----AT--CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12053 : taTATTAAA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12054 : taTATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---------ATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AAAC-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12055 : TATTTACTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AAA-CA-----TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TG----A---T-A-AAA
gi|12056 : TATTCATTATA--GG--A--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TT-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGG-CA--T--TT-T---A--TT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---
gi|12057 : TATTTATTATA--GT--A--T------AAA-CATT-C-TTGT----AA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CTCACA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12058 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAC-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TT-T-----------A-AT-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--taaa
gi|12059 : taTATTATACCGG--A--T-T----AAA-CATT-T-TTTTTT-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAC-T--TT-T---AACCC--CA-C-AAA-C--TGAA--A---T-A-AAAG---T--
gi|12065 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12066 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12067 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12068 : aTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-TA--A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12069 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-T-T-C-T-GGT-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12070 : aATTTACTATA--AG--A--T-T----ATA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-G--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12071 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-ATAAAA---T--T
gi|12072 : aTGTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-TAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--CT--TG-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAA---T--
gi|12074 : aTTA-A--GA--A--T-TTTAAAAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12076 : attATTTAT-ATA--GG--A--T-TT---AAA-CAT--C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T--GA-CG--T--TC-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12077 : ATTTACTATA--AGGAA--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA--AATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-TAGAA--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--T
gi|12078 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-TGAATAAAATATA-AA-T-G-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12091 : aTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C---A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TA-A--G---T-A-AAAG---T--
gi|12092 : tcATA--GG--A--T------AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12093 : ttaATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--ATATTATC-G-A-TG-TG-T-----------A-A--C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-G--TG-
gi|12101 : ttaTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--cgaagcacttaaaattat
gi|12102 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A---T--CA-C-AAA-C--
gi|12103 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--CG-A--A---T-A-AAA
gi|12104 : TTATTA----GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-
gi|12105 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12106 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12108 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12109 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TTAT---A--CT---A-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12110 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-G-A-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--agt
gi|12111 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12112 : TTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A--G-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12113 : TTATA--AG--AAGT-T----AAA-CAGT-T-CTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT--------CT--CA-C-AAA-C--
gi|12114 : TTATG--AG-----T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-C-TG-TG-T-------------AA-C-T---T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12115 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA--ATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----CAG-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--G--TT-T---AT-CT--CA-C-AAA-C--
gi|12116 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12117 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12118 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12119 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12120 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12122 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-A-AAA-C--TG-A--A---T-A-Agcgaagcaattctgctgactactaaagataaaatttagtgacaaaaagac
gi|12123 : TTATA--AGC-A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAA
gi|12125 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TGATG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TTCTT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--aat
gi|12126 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAAAGAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TC-AC-A---T-A-AAA
gi|12127 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CTTA-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-G-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--a
gi|12128 : TTATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTA-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAG-C--TG-A--AT--T-A-AAA
gi|12130 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12131 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAAGCA--T--CT-T---A--TT--CA-C-AAG-C--
gi|12132 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TCG-CACTTTTATTCATTTTG-TGAg
gi|12133 : TTATAT-GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAT-T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-A--TG-A--A---T-A-AAAgtaaaaa
gi|12134 : TTATA--GG--A--T-T----AAAACATT-CCTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CACC-AAA-C--
gi|12135 : TTATA--AG--AA-TAT----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA------T-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12136 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-C-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12138 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--TT--AA-C-AAA-C--
gi|12139 : TTATA--AG--A--A-T----TAA-CGTT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12140 : TTATA--AT--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATTGC--AT-----CTG-A-TG-TG-T-----------AGAA-C-TCC-T-GGAGCA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A-----A-AAA
gi|12141 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GTA-GAATT----AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12142 : TTATA--AG--AA-T-T----ATA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12143 : TTATA--AG--AA-C-G----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12144 : TTATG--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------T-AA-C-T-C-A-GGA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-T-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12146 : TTATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-CA-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12147 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CATTT--TT-T---T--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12149 : TTATA--AG--AA-T-T----AAG-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-TGA-CA--T--AT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-A-TAAA---T--T
gi|12150 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CC--NA-
gi|12152 : TTATA--AGGAA--T-T----ATA-CATTTC-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12153 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAA-T-T--AT-----C-G-A-TGTTG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TC-TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12154 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---C--TT--CA-A-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAAG---T--
gi|12155 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AG--T--TT-acttcac
gi|12157 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA--A--T--TT-T---C--TC--CA-C-AAG-C--
gi|12178 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12179 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-TTTAT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12181 : TATG--AG--T--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ACTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12182 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TC-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12183 : TATA--AG--AA-T-T----AAA-TATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12184 : TATA--G---A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-CCATG-A--A---T-A-AAA
gi|12185 : TATA--CG--A--T-T----AAA-CAAT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AC-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12186 : TATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12188 : TATA--GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT---GAA-GAATT----AT-----C-GGA-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C---G-A--A---T-A-AAA
gi|12191 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT---TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C---A-T-GGA--A--T--TT-TTA-A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12193 : TATA--AG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ATAA-CGT-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--TC--CT-C-AAA-C--
gi|12201 : ATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CGTTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12203 : ATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTT-T-GAA-GATTT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12204 : ATG--GG--A--C-T----AGG-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ACAA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12207 : TA--AA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--GT-T---A--CTC-CA-C-AAA-C--TT-A--ACACT-A-AAAG---TGCTTTGCACTTTTATTCATGGTT-TG
gi|12209 : TA--GG--A--A-T----AAA-CATT-C-TCTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GCA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12210 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12211 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12214 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C-AAATT--TG-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12215 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-TCGAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C--AA-T--TG-A--C---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12217 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TATT-T-GAA-GAGTT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-T-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12224 : --A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A--A---T-A-AAA
gi|12225 : --A--T-T----AAA-CATT-CATTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12229 : ----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1 11 1
lowQualScore : 11 11 99 0 1111 1 0 2 0 0 0 0 00 11111 0 1 1 0 0 33333333333 1 0 0 0 0 0 0 11 00 0 111 11 11 0 0 0 00 0 33 111 1 0 111 33 5 22 6 111 0 77 5
lowQualScore : .. .. .. . .... . . . . . . . .. ..... . . . . . ........... . . . . . . . .. .. . ... .. .. . . . .. . .. ... . . ... .. . .. . ... . .. .
lowQualScore : 00 55 88 4 3333 2 4 0 4 4 4 4 55 00000 8 2 2 8 8 11111111111 2 4 4 4 8 8 8 33 99 4 777 00 00 4 8 4 66 6 77 777 3 6 777 11 0 00 7 000 0 55 5
consensus : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
Reference ( family-151 ) : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12047 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12048 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12049 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A----C-T-CCT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-AATCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12050 : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTACTGAAACTTTACACAAGATCTGAA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12051 : TATTTACTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-CTT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12052 : TACTATA--GG--A--T-T----AT--CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12053 : taTATTAAA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12054 : taTATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---------ATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AAAC-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12055 : TATTTACTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AAA-CA-----TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TG----A---T-A-AAA
gi|12056 : TATTCATTATA--GG--A--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TT-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGG-CA--T--TT-T---A--TT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---
gi|12057 : TATTTATTATA--GT--A--T------AAA-CATT-C-TTGT----AA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CTCACA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12058 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAC-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TT-T-----------A-AT-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--taaa
gi|12059 : taTATTATACCGG--A--T-T----AAA-CATT-T-TTTTTT-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAC-T--TT-T---AACCC--CA-C-AAA-C--TGAA--A---T-A-AAAG---T--
gi|12065 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12066 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12067 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12068 : aTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-TA--A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12069 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-T-T-C-T-GGT-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12070 : aATTTACTATA--AG--A--T-T----ATA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-G--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12071 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-ATAAAA---T--T
gi|12072 : aTGTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-TAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--CT--TG-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAA---T--
gi|12074 : aTTA-A--GA--A--T-TTTAAAAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12076 : attATTTAT-ATA--GG--A--T-TT---AAA-CAT--C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T--GA-CG--T--TC-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12077 : ATTTACTATA--AGGAA--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA--AATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-TAGAA--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--T
gi|12078 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-TGAATAAAATATA-AA-T-G-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12091 : aTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C---A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TA-A--G---T-A-AAAG---T--
gi|12092 : tcATA--GG--A--T------AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12093 : ttaATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--ATATTATC-G-A-TG-TG-T-----------A-A--C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-G--TG-
gi|12101 : ttaTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--cgaagcacttaaaattat
gi|12102 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A---T--CA-C-AAA-C--
gi|12103 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--CG-A--A---T-A-AAA
gi|12104 : TTATTA----GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-
gi|12105 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12106 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12108 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12109 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TTAT---A--CT---A-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12110 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-G-A-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--agt
gi|12111 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12112 : TTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A--G-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12113 : TTATA--AG--AAGT-T----AAA-CAGT-T-CTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT--------CT--CA-C-AAA-C--
gi|12114 : TTATG--AG-----T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-C-TG-TG-T-------------AA-C-T---T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12115 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA--ATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----CAG-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--G--TT-T---AT-CT--CA-C-AAA-C--
gi|12116 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12117 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12118 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12119 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12120 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12122 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-A-AAA-C--TG-A--A---T-A-Agcgaagcaattctgctgactactaaagataaaatttagtgacaaaaagac
gi|12123 : TTATA--AGC-A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAA
gi|12125 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TGATG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TTCTT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--aat
gi|12126 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAAAGAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TC-AC-A---T-A-AAA
gi|12127 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CTTA-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-G-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--a
gi|12128 : TTATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTA-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAG-C--TG-A--AT--T-A-AAA
gi|12130 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12131 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAAGCA--T--CT-T---A--TT--CA-C-AAG-C--
gi|12132 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TCG-CACTTTTATTCATTTTG-TGAg
gi|12133 : TTATAT-GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAT-T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-A--TG-A--A---T-A-AAAgtaaaaa
gi|12134 : TTATA--GG--A--T-T----AAAACATT-CCTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CACC-AAA-C--
gi|12135 : TTATA--AG--AA-TAT----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA------T-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12136 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-C-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12138 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--TT--AA-C-AAA-C--
gi|12139 : TTATA--AG--A--A-T----TAA-CGTT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12140 : TTATA--AT--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATTGC--AT-----CTG-A-TG-TG-T-----------AGAA-C-TCC-T-GGAGCA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A-----A-AAA
gi|12141 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GTA-GAATT----AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12142 : TTATA--AG--AA-T-T----ATA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12143 : TTATA--AG--AA-C-G----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12144 : TTATG--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------T-AA-C-T-C-A-GGA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-T-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12146 : TTATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-CA-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12147 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CATTT--TT-T---T--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12149 : TTATA--AG--AA-T-T----AAG-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-TGA-CA--T--AT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-A-TAAA---T--T
gi|12150 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CC--NA-
gi|12152 : TTATA--AGGAA--T-T----ATA-CATTTC-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12153 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAA-T-T--AT-----C-G-A-TGTTG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TC-TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12154 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---C--TT--CA-A-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAAG---T--
gi|12155 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AG--T--TT-acttcac
gi|12157 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA--A--T--TT-T---C--TC--CA-C-AAG-C--
gi|12178 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12179 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-TTTAT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12181 : TATG--AG--T--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ACTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12182 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TC-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12183 : TATA--AG--AA-T-T----AAA-TATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12184 : TATA--G---A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-CCATG-A--A---T-A-AAA
gi|12185 : TATA--CG--A--T-T----AAA-CAAT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AC-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12186 : TATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12188 : TATA--GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT---GAA-GAATT----AT-----C-GGA-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C---G-A--A---T-A-AAA
gi|12191 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT---TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C---A-T-GGA--A--T--TT-TTA-A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12193 : TATA--AG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ATAA-CGT-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--TC--CT-C-AAA-C--
gi|12201 : ATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CGTTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12203 : ATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTT-T-GAA-GATTT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12204 : ATG--GG--A--C-T----AGG-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ACAA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12207 : TA--AA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--GT-T---A--CTC-CA-C-AAA-C--TT-A--ACACT-A-AAAG---TGCTTTGCACTTTTATTCATGGTT-TG
gi|12209 : TA--GG--A--A-T----AAA-CATT-C-TCTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GCA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12210 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12211 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12214 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C-AAATT--TG-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12215 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-TCGAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C--AA-T--TG-A--C---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12217 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TATT-T-GAA-GAGTT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-T-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12224 : --A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A--A---T-A-AAA
gi|12225 : --A--T-T----AAA-CATT-CATTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12229 : ----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
blockSeqs : GA AG TTAA A T G T GAATAAAATAT G TT AGA AC CAC A TGC GC G GA C AA T GC T
blockSeqs : GA A T A T G T A T C TA AC T . TGC . . GA . AA . . T
blockSeqs : C A . A C G C A C T A C . . TGC . . GA . A . . .
blockSeqs : . A . . G . . A . . . C . . . . . TT .
blockSeqs : . A . . A . . . . . . C . . . . . TT .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . TT
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . TT
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
finalCons : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1 11 1
lowQualScore : 11 11 99 0 1111 1 0 2 0 0 0 0 00 11111 0 1 1 0 0 33333333333 1 0 0 0 0 0 0 11 00 0 111 11 11 0 0 0 00 0 33 111 1 0 111 33 5 22 6 111 0 77 5
lowQualScore : .. .. .. . .... . . . . . . . .. ..... . . . . . ........... . . . . . . . .. .. . ... .. .. . . . .. . .. ... . . ... .. . .. . ... . .. .
lowQualScore : 00 55 88 4 3333 2 4 0 4 4 4 4 55 00000 8 2 2 8 8 11111111111 2 4 4 4 8 8 8 33 99 4 777 00 00 4 8 4 66 6 77 777 3 6 777 11 0 00 7 000 0 55 5
consensus : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
Reference ( family-151 ) : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--TAT-CACTNNTACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12047 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12048 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C--TTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---TAA-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-A-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGAGCCTTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACA-CTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12049 : TATTT--TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A----C-T-CCT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTA-TGAAACTTTACACAAGATCTG-AATCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAA-TTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12050 : TATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAA---T--TAT-CACTGATACTTATGGTACTGAAACTTTACACAAGATCTGAA-TCCCCAAAAGGAAAAGGGAACACATTGTGTGTCAATCAGTAAAAAATTAAAAATAGAATGTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGATGGTGGAGCTAATGCCAAAAACGTCAGTTTATATTTACCCGAAAGA--CCTTAAAGTCGTGAGCAAAAAGACATCTGGATGTGCAAAGGCCCGGTA
gi|12051 : TATTTACTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-CTT-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12052 : TACTATA--GG--A--T-T----AT--CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12053 : taTATTAAA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12054 : taTATTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---------ATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AAAC-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12055 : TATTTACTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AAA-CA-----TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TG----A---T-A-AAA
gi|12056 : TATTCATTATA--GG--A--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TT-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGG-CA--T--TT-T---A--TT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---
gi|12057 : TATTTATTATA--GT--A--T------AAA-CATT-C-TTGT----AA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CTCACA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12058 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAC-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TT-T-----------A-AT-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--taaa
gi|12059 : taTATTATACCGG--A--T-T----AAA-CATT-T-TTTTTT-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAC-T--TT-T---AACCC--CA-C-AAA-C--TGAA--A---T-A-AAAG---T--
gi|12065 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12066 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12067 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12068 : aTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-TA--A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12069 : aTTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-T-T-C-T-GGT-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12070 : aATTTACTATA--AG--A--T-T----ATA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-G--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12071 : TATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-ATAAAA---T--T
gi|12072 : aTGTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-TAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--CT--TG-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAA---T--
gi|12074 : aTTA-A--GA--A--T-TTTAAAAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12076 : attATTTAT-ATA--GG--A--T-TT---AAA-CAT--C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T--GA-CG--T--TC-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12077 : ATTTACTATA--AGGAA--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA--AATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-TAGAA--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--T
gi|12078 : TTATTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-TGAATAAAATATA-AA-T-G-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12091 : aTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C---A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-CAAAA-C--TA-A--G---T-A-AAAG---T--
gi|12092 : tcATA--GG--A--T------AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12093 : ttaATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--ATATTATC-G-A-TG-TG-T-----------A-A--C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-G--TG-
gi|12101 : ttaTTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--cgaagcacttaaaattat
gi|12102 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GGA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A---T--CA-C-AAA-C--
gi|12103 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--CG-A--A---T-A-AAA
gi|12104 : TTATTA----GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-
gi|12105 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12106 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ATTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-ACA-C--
gi|12108 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12109 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-T-CTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TTAT---A--CT---A-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12110 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-G-A-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TGTT-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--agt
gi|12111 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12112 : TTATA--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A--G-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12113 : TTATA--AG--AAGT-T----AAA-CAGT-T-CTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT--------CT--CA-C-AAA-C--
gi|12114 : TTATG--AG-----T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-C-TG-TG-T-------------AA-C-T---T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12115 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA--ATT-C-TTTT---GAA-GAATT-T--AT-----CAG-A-TG-TG-TA----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--G--TT-T---AT-CT--CA-C-AAA-C--
gi|12116 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12117 : TTGTA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----A-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12118 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12119 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-CG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--AA-C-AAA-C--
gi|12120 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12122 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-A-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-A-AAA-C--TG-A--A---T-A-Agcgaagcaattctgctgactactaaagataaaatttagtgacaaaaagac
gi|12123 : TTATA--AGC-A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAA
gi|12125 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CTTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TGATG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TTCTT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--aat
gi|12126 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAAAGAATT-T--AT-----C-GGA-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C--AA-C--TC-AC-A---T-A-AAA
gi|12127 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CTTA-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-G-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--a
gi|12128 : TTATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTA-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-TGGGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAG-C--TG-A--AT--T-A-AAA
gi|12130 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-T-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12131 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAAGCA--T--CT-T---A--TT--CA-C-AAG-C--
gi|12132 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TCG-CACTTTTATTCATTTTG-TGAg
gi|12133 : TTATAT-GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CAT-T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-A--TG-A--A---T-A-AAAgtaaaaa
gi|12134 : TTATA--GG--A--T-T----AAAACATT-CCTTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CACC-AAA-C--
gi|12135 : TTATA--AG--AA-TAT----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CA------T-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12136 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-C-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12138 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--TT--AA-C-AAA-C--
gi|12139 : TTATA--AG--A--A-T----TAA-CGTT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12140 : TTATA--AT--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATTGC--AT-----CTG-A-TG-TG-T-----------AGAA-C-TCC-T-GGAGCA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A-----A-AAA
gi|12141 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GTA-GAATT----AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12142 : TTATA--AG--AA-T-T----ATA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12143 : TTATA--AG--AA-C-G----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12144 : TTATG--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------T-AA-C-T-C-A-GGA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-T-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12146 : TTATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-CA-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12147 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-AGA-CATTT--TT-T---T--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12149 : TTATA--AG--AA-T-T----AAG-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-TGA-CA--T--AT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TT-A--A---C-A-TAAA---T--T
gi|12150 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CC--NA-
gi|12152 : TTATA--AGGAA--T-T----ATA-CATTTC-TTTT-T-GAA-AAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12153 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAA-T-T--AT-----C-G-A-TGTTG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--TC-TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12154 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-A-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---C--TT--CA-A-AAA-C--TT-AACA---T-A-AAAG---T--
gi|12155 : TTATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-AG--T--TT-acttcac
gi|12157 : TTATA--AG--AA-T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA--A--T--TT-T---C--TC--CA-C-AAG-C--
gi|12178 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12179 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT---GAA-GAATT-TTTAT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12181 : TATG--AG--T--T-C----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-ACTG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA-----TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12182 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TC-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12183 : TATA--AG--AA-T-T----AAA-TATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12184 : TATA--G---A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-TAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-CCATG-A--A---T-A-AAA
gi|12185 : TATA--CG--A--T-T----AAA-CAAT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AC-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12186 : TATA--AG--A--A-T----AAAACATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TA-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12188 : TATA--GG--A--T------AAA-C--T-C-TTTT---GAA-GAATT----AT-----C-GGA-TG-TG-------------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C---G-A--A---T-A-AAA
gi|12191 : TATA--GG--A--T-T----AAA-CATT---TTTT-T-GAA-GAATT-T---T-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C---A-T-GGA--A--T--TT-TTA-A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12193 : TATA--AG--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ATAA-CGT-C-T-GGA-AA--T--TT-T---A--TC--CT-C-AAA-C--
gi|12201 : ATA--GG--A--T-T----AAA-CATT-CGTTTT-T-GAA-GAATG-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TA-A--A---T-A-AAAG---T--
gi|12203 : ATA--GG--A--T-T----AAC-CATT-C-TTTT-T-GAA-GATTT-T--AT-----C-G-A-TG-AG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12204 : ATG--GG--A--C-T----AGG-CATT-C-TTTT-T-AAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------ACAA-C-T-C-T-AGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-A
gi|12207 : TA--AA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-T-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--GT-T---A--CTC-CA-C-AAA-C--TT-A--ACACT-A-AAAG---TGCTTTGCACTTTTATTCATGGTT-TG
gi|12209 : TA--GG--A--A-T----AAA-CATT-C-TCTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GCA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AA
gi|12210 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12211 : A--GA--A--T-T----CAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----T-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA
gi|12214 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-C-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C-AAATT--TG-AC-A---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12215 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-TCGAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--TA-C--AA-T--TG-A--C---T-A-AAAGTGCT--TAG-CACTTTTATTTA
gi|12217 : A--GA--A--T-T----AAA-CATT-C-TATT-T-GAA-GAGTT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-T-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AA
gi|12224 : --A--T-T----AAA-CATT-C-TTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GGA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--T--A--A---T-A-AAA
gi|12225 : --A--T-T----AAA-CATT-CATTTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-T-A-TG-TG-T-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--T--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--
gi|12229 : ----AAA-CATT-C-ATTT-T-GAA-GAATT-T--AT-----C-G-A-CG-TG-C-----------A-AA-C-T-C-T-GAA-CA--A--TT-T---A--CT--CA-C-AAA-C--TG-A--A---T-A-AAA