lowQualScore : 222222 1111111111111
lowQualScore : 0 0 00 0 0 00 11 0 1 0 0 5555555555555555555 0 0 0 1 0 0 0 111 0 0 111111 0 0 0 1111111111111 00 0 1 1 0 66666 0 00 0 0 1111 1 0 22222 22 1111 222222 11 0 666 0 111 0 1 0
lowQualScore : . . .. . . .. .. . . . . ................... . . . . . . . ... . . ...... . . . ............. .. . . . . ..... . .. . . .... . . ..... .. .... ...... .. . ... . ... . . .
lowQualScore : 4 4 66 4 8 66 11 4 2 8 4 5555555555555555555 4 4 4 6 8 4 8 999 4 4 222222 8 4 4 4444444444444 55 4 2 6 4 00000 4 66 5 5 0000 8 5 11111 99 0000 333333 11 5 666 5 666 5 1 9
consensus : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Reference ( gi|53578 ) : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-T-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53308 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTG-A---T-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-T-C-AC---T-A-TTCAAA-GGAAT
gi|53543 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TA-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---C-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-CT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTA
gi|53309 : acAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53314 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-CCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-T-C-GT---C-A-TTCGAA-GGTAT
gi|53315 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GA--C-C-A-T-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-T-C-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53310 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----A--T-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-AATAT
gi|53311 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAG--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--A-AG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53544 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TT-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TTTGC-TTC-A---T-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TCCAAA-GATA
gi|53312 : acAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAG--G-A-GT-A-A---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----A------TG-GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53318 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-AC-A-GAATA-AG-TT--T-GG-G----A-TT-A-----AC-A----A------T--GT-A-T-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53313 : aacAAGA-T-G--CC-C-ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---T-A--G----AGAA----A-GC-A-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53316 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--T-C-A-C-T-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TC-GC-TTT-A---T-G--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------C--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53320 : aactAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-CA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-C----A------T--GT-G-G-C-AT---T-A-TTCAAA-TGTAT
gi|53323 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--CT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-T-A-C-AC---T-T-TTCAAA-GG
gi|53317 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--T--TT-GC-TTC-A---T-C--G----AGAA--G-A-GC-G-G---A-AA-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAGA-TGTA
gi|53319 : aacAAGA-G-G--TT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------GC-AC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--TT-G-C-C-AC---T-A-TTCA
gi|53321 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AA------------------TC-GC-TC-AAC-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---A-A--G----AGAA--G---GC-G-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-A-C-C-GC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53322 : aacAAGC-A-G--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GT-TTC-A---T-T--G----AGAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53327 : aacAAGA-G-A--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----AGAA--G-A-GT-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----TC-A----A------T--GT-G-C-T-AC---T-A-TTCA
gi|53324 : aaaAACA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-A-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-AC-A-G---A-AA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-C-TTCAAA-GATA
gi|53326 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-CTT-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-G---T-T--G----AGAA----A-GC-T-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GC-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53329 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-T---T-GCA-C--T--TT-GC-TTT----------------GAA--G-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53328 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GT--T-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--A-A-GC-C-G---A-AG-TT--A-AG-G----A-TT-T-----CC-A----ATGTCATT--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53330 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GT--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-G--T--TT-GC-TTC-A---TAA--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-A-----AT-A----A------T--AT-G-C-C-GC---T-A-TTCCAA-
gi|53580 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--AGAGC-C-A-C-A-------------------TCCGC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GT-TTT-A---T-A--G----AGAG--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AA-T----ATTT-T-----AC-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53332 : AAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TT-TT---C-C-A-G---A-GCA-C--T--TT-GT-TTC-A---T-A--G----AAAA--G-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AT-A----A------T--GA-G-C-C-AC---TAA-TTCAAA-GGTAT
gi|53339 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53336 : aatAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-G-
gi|53546 : aacAAGA-G-G--TT-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-A-A-G---A-GCA-C--T--TT-GA-TTC-A---T-A--ATCTTAGAA--A-A-G--A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GAT
gi|53338 : acAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--------TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-G-
gi|53340 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53342 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-G---A-TCA-C--C--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAT--G-A-AC-A-A---C-AG-TT--T-GG-G----A--A-T-----AA-A----A------T--GT-A-T-T-CC---C-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53348 : aacAACA-A-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---G-AGTG----AGAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----
gi|53344 : agcAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53547 : aaaAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53341 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53570 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T---------------------------GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-AT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAGA-TGT
gi|53347 : cAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC----A-C-C-T-G---A-GCA-T--T--TT-GC-GTC-A---T-A--G----AGAA------------------G-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-ACTTAT-A-TTC
gi|53345 : aaaAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CG-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-TG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53343 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C----------TAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53346 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--TG-TT-GC-TTC-A---T-T--A----ACAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TTTGT-GG-G----A-AT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53355 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T------------------T-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TA-T-----AC-A----G------T--
gi|53350 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--CTC-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------A-GT-TTC-A---T-T--A----AGAA--G-A-GC-A-C---T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-G-
gi|53581 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-T-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-A-G---G-ATA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-G--G----AAAA--G-A-AC-A-T---A-AC-TT--TGGG-G----A-TA-T-----GC-A----A------T--GT-A-C-T-AC---A-A-TTCAAT-GGTAT
gi|53551 : AAGA-G-G--AC-C-A-G--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AAC-T-A-------AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-C-C-AC---
gi|53550 : acAAGATG-GAACC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-ATG---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53359 : acAAGA-G-G--CC-C-ATG--AG--C-C-A-TGA-------------------TC-AA-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-C---A----TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----
gi|53351 : aaaAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C---A-C-A----------------------GA-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-G--TTC-A---C-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T----G----A-TT-T-----AT-A----G------T--GT-G-C-C-AC-------TTCAA
gi|53354 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------A--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53353 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--AG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CG-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TTATTAAG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53352 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C----------TAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53356 : aacAAGA-G-G--CC-CCAAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TTG---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----AG-----T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53357 : aacAAGA-T-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GG--A-GCA-C--CAGCT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---ATAG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53361 : aacAAGA-G-G--AC-C-ATG--CG--C-CCA-C-A-------------------TA-GCGTC-A-T-T-T-G---A-GCA-C--T--TC-GC-TTC-A--------------AAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--C-GA-G----A-TT-T-----AC-AATACA------T--GT-G-T-C-AC---T-GTTTTAAA-GGTAT
gi|53358 : aacAAGA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCATC--G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT---C-C-AC---T-G-
gi|53331 : aacAAG--G-G--CC-C-ATG--GGAAC-A-A-C-AAA-----------------TC-CC-TC-A-C---T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-AA--A-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----A--A----A------T--GC-G-C-C-AC---T-A-TT-AGA-TGTAT
gi|53548 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------AC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-G-T---A-GT-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53364 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CAGC--TT-GC-TTC-AC--T-G--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-CG--T--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--
gi|53582 : aacAAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-AAATTAAAGAACCATGGCCATC-TC-TCTA-CAC-T-G---A-ACA-C--T--TT--C-TTC-AA--T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G---C-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53365 : AAGA-G-G--CC-T-TTG--TG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GG-TTC-A---T-T--A----AGGA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--G
gi|53369 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AAT-----------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G-----GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AAAA--G-A-GC-A-GTT-A-GT-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53360 : aagAAGA-G-A--CC-C-AAG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AG-A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53363 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---AGGG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53362 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---AGGG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53368 : aacAAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--T----AGAT--G-A-GC-A-G---A-AA-TT--T-
gi|53552 : aacAAGA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-T--A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTA-AAACT-A--A----AAAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GG-A----A------T--GT-G-A-C-A
gi|53366 : acAAGA-G-G--CC-C-ATGCCGG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-GCA-C--CA-CT-GC-TTC-AC--T-A--A----AAAG--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T---T-GAC-C-AC---T-G-
gi|53367 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A--------------------C-GC-TC-A-C-C-T-----A-GCA-CA-G--CT-GC-TTA-C---T-A--G----A--A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53373 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-AC--T-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---
gi|53372 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-C--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53370 : aacAAGA-T-A--CCTC-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AA-T--A-C-C-T-G---AGGCA-C--T--GT-AC-TTC-A---T----T----AGAA--A-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----ACGA----A------T--GC-A-C-C-AA---T-A-TTCAACTGGTATacaatgtagcaact
gi|53385 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53382 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53381 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53379 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53377 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53375 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53388 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---
gi|53386 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTCAA---T-A-------AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53394 : aacAAGA-G-T--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---T-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53396 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---
gi|53384 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----AGAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53383 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----AGAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---T-G-
gi|53378 : aacAAGA-G----CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GCTTTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC---G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TTAT-----AG-A----AC-----T--GT-A-C-C-AC---T-
gi|53390 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-------A--G----A------------------------------------------T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTCAGA-TGTAT
gi|53391 : aacAAGA-GAG--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--A--GT-GC-TTC-A---C----T----AGAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AG-A----A------T--GT-A-C-C-AC---
gi|53395 : aacAAGA-G-G--CC-C-CTG--GG--T-T-G-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TGG---A-GCA-C--TAGTTAGC-TTT-A---T-A--G----AGAA--G-A----A-G---A-GA-TT--T--G-G----A-TT-T-----GC-
gi|53549 : aacAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--A-A-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-A---A--CA-C--T--TT-GC-TTT-A---T-A--GA---AGAA--G-A-AT-T-G---A-AG-TT--A-GG-G----A--T-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTAAGG-GGCATttcagtaagaaagcagaagatttggatttacatgtgccttattcaaaggt
gi|53584 : accAGA-G-G--CT-C-AAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-TCC-AC---T-
gi|53374 : AGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-G-A-C-A-------------------TC-GC-TT-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---G-AGGG----AGAACGA-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AC-T----A------T--TT-T-G-C-GC---T-AGTTGAAA-GGTAT
gi|53371 : aacAAA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CC-GC-TTC-A---C-T--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-
gi|53349 : aacA-G-G--CC-CCATG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-T-T-GGAGA-ACA-C--T--TT-GC-TTA-AA--T-G--G----AGAA--GCA-GC-A-G---G-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------TCGATGG-C-C-AC---T-A-TTCAAA-GGTATac
gi|53393 : aacgaA-G-A--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----AGAA--G-A-GC-A-G---T-AG--T--T-GG-G----A-TT-T------T-G----A------T--G--G-T-C-AC---T-G-
gi|53389 : aaca-G-A--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-T-T-G---A-GCA-C-------------------------------AA--G---GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--CT-G-C-C-AC---T-A-TTC-AA-GGTAT
gi|53588 : aaccatg-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TA-GT-TTC-G---T-A--G----AGAA--A-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-GG-GATAAA-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-C-C-ACTG-T-A-TTCAAA-GATA
gi|53589 : -ATG--GG--C-C-A-G-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----AGAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----T-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-C-C-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53590 : -ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-G-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--T----AGAA-------C-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--G--G-TCC-AC---A-A-TTCAAA-GGTA
gi|53325 : --GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-T-G---A-GAA-C--T--TT-AC-GTC-A---T-A--GA---AGAA--G-A-GC-A-G---G-AC-GT--T-GG-G----A-TA-T-----ACAA----A------T--AT-G-C-C-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53594 : aacaagatatccttG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-CTC-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----AGAA--G-ACGC-A-G---A-AG-TT--T-GGAA----A-TT-T-----AC-A----A---------GT-G-T-CGAC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53395 : --T--TT-GC-TTC-AG--T-A-------AGAA----A-GC-A-G---A-AG-AT--T-TG-G----A-TT-T-----AC------A------T--GT-G-C-C--T---T-A-TTCAAA-GGT
Alignments
lowQualScore : 222222 1111111111111
lowQualScore : 0 0 00 0 0 00 11 0 1 0 0 5555555555555555555 0 0 0 1 0 0 0 111 0 0 000000 0 0 0 0000000000000 0 00 0 1 1 0 44444 0 00 0 0 1111 1 0 22222 22 1111 222222 11 1 1 0 111 0 1 0
lowQualScore : . . .. . . .. .. . . . . ................... . . . . . . . ... . . ...... . . . ............. . .. . . . . ..... . .. . . .... . . ..... .. .... ...... .. . . . ... . . .
lowQualScore : 4 4 66 4 8 66 11 4 2 8 4 4444444444444444444 4 4 4 6 8 4 8 999 4 4 666666 8 4 4 6666666666666 4 55 4 2 6 4 44444 8 66 9 4 0000 8 4 00000 66 0000 333333 11 0 0 5 555 5 1 9
consensus : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Reference ( family-117 ) : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53308 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTG-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGAAT
gi|53309 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53310 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----A--T-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AATAT
gi|53311 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--A-AG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53312 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GT-A-A---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----A------TG-GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53313 : aacAAGA-T-G--CC-C-ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---T-A--G----A-GAA----A-GC-A-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53314 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-CCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-GT---C-A-TTCGAA-GGTAT
gi|53315 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GA--C-C-A-T-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53316 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--T-C-A-C-T-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TC-GC-TTT-A---T-G--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------C--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53317 : aactAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--T--TT-GC-TTC-A---T-C--G----A-GAA--G-A-GC-G-G---A-AA-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTA
gi|53318 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-GAATA-AG-TT--T-GG-G----A-TT-A-----AC-A----A------T--GT-A-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53319 : aacAAGA-G-G--TT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------GC-AC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--TT-G-CC-AC---T-A-TTCA
gi|53320 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-CA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-C----A------T--GT-G-GC-AT---T-A-TTCAAA-TGTAT
gi|53321 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AA------------------TC-GC-TC-AAC-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---A-A--G----A-GAA--G---GC-G-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-GC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53322 : aacAAGC-A-G--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GT-TTC-A---T-T--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53323 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--CT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-T-AC-AC---T-T-TTCAAA-GG
gi|53324 : aatAACA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-A-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-G---A-AA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-C-TTCAAA-GATA
gi|53325 : aac--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-T-G---A-GAA-C--T--TT-AC-GTC-A---T-A--GA---A-GAA--G-A-GC-A-G---G-AC-GT--T-GG-G----A-TA-T-----ACAA----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53326 : aacaagatatccttAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-CTT-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-G---T-T--G----A-GAA----A-GC-T-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53327 : aacAAGA-G-A--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GT-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----TC-A----A------T--GT-G-CT-AC---T-A-TTCA
gi|53328 : aaaAAGA-A-G--CC-C-ATG--GT--T-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-C-G---A-AG-TT--A-AG-G----A-TT-T-----CC-A----ATGTCATT--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53329 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-T---T-GCA-C--T--TT-GC-TTT-----------------GAA--G-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53330 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GT--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-G--T--TT-GC-TTC-A---TAA--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-A-----AT-A----A------T--AT-G-CC-GC---T-A-TTCCAA-
gi|53331 : aacAAG--G-G--CC-C-ATG--GGAAC-A-A-C-AAA-----------------TC-CC-TC-A-C---T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A--AA--A-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----A--A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TT-AGA-TGTAT
gi|53332 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TT-TT---C-C-A-G---A-GCA-C--T--TT-GT-TTC-A---T-A--G----A-AAA--G-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AT-A----A------T--GA-G-CC-AC---TAA-TTCAAA-GGTAT
gi|53336 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T-----GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53338 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--------TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53339 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53340 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53341 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53342 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-G---A-TCA-C--C--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAT--G-A-AC-A-A---C-AG-TT--T-GG-G----A--A-T-----AA-A----A------T--GT-A-TT-CC---C-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53343 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53344 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53345 : aaaAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--GG-CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-TG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53346 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--TG-TT-GC-TTC-A---T-T--A----A-CAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TTTGT-GG-G----A-AT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53347 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC----A-C-C-T-G---A-GCA-T--T--TT-GC-GTC-A---T-A--G----A-GAA--G-----------------TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-ACTTAT-A-TTC
gi|53348 : aaaAACA-A-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---G-AGTG----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----
gi|53349 : agcA-G-G--CC-CCATG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-T-T-GGAGA-ACA-C--T--TT-GC-TTA-AA--T-G--G----A-GAA--GCA-GC-A-G---G-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------TCGATGG-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53350 : aacgaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--CTC-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--A-----GT-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--TTGG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53351 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C---A-C-A----------------------GA-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-G--TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T----G----A-TT-T-----AT-A----G------T--GT-G-CC-AC-------TTCAA
gi|53352 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53353 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--AG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CG-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TTATTAAG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53354 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------A--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53355 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T------------------T-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TA-T-----AC-A----G------T--
gi|53356 : aacAAGA-G-G--CC-CCAAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TTG---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----AG-----T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53357 : aacAAGA-T-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GG--A-GCA-C--CAGCT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---ATAG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53358 : aacAAGA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCATC--G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT---CC-AC---T-G-
gi|53359 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--AG--C-C-A-TGA-------------------TC-AA-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-----C-A--TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----
gi|53360 : aaaAAGA-G-A--CC-C-AAG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-G-A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53361 : aacAAGA-G-G--AC-C-ATG--CG--C-CCA-C-A-------------------TA-GCGTC-A-T-T-T-G---A-GCA-C--T--TC-GC-TTC-A---------------AAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--C-GA-G----A-TT-T-----AC-AATACA------T--GT-G-TC-AC---T-GTTTTAAA-GGTAT
gi|53362 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53363 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53364 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CAGC--TT-GC-TTC-AC--T-G--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-CG--T--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--
gi|53365 : aacAAGA-G-G--CC-T-TTG--TG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GG-TTC-A---T-T--A----A-GGA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--G
gi|53366 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATGCCGG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-GCA-C--CA-CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-AAG--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T---T-GACC-AC---T-G-
gi|53367 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A--------------------C-GC-TC-A-C-C-T-----A-GCA-CA-G--CT-GC-TTA-C---T-A--G----A---A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53368 : aacAAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--T----A-GAT--G-A-GC-A-G---A-AA-TT--T-
gi|53369 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AAT-----------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G-----GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-AAA--G-A-GC-A-GT--T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53370 : aagAAGA-T-A--CCTC-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AA-T--A-C-C-T-G---AGGCA-C--T--GT-AC-TTC-A---T----T----A-GAA--A-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----ACGA----A------T--GC-A-CC-AA---T-A-TTCAACTGGTAT
gi|53371 : aacAAA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CC-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C
gi|53372 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-C--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--------------------T-----AC-A----A------T--GTAG-CA-AC---T-
gi|53373 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53374 : aacAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-G-A-C-A-------------------TC-GC-TT-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---G-AGGG----A-GAACGA-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AC-T----A------T--TT-T-GC-GC---T-AGTTGAAA-GGTAT
gi|53375 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53377 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53378 : aacAAGA-G----CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GCTTTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TTAT-----AG-A----AC-----T--GT-A-CC-AC---T-
gi|53379 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53381 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53382 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53383 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53384 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53385 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53386 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTCAA---T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53388 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53389 : aac-G-A--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-T-T-G---A-GCA-C--------------------------------AA--G---GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--CT-G-CC-AC---T-A-TTC-AA-GGTAT
gi|53390 : aaccatgAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-------A--G----A-------------------------------------------T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTAT
gi|53391 : aacAAGA-GAG--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--A--GT-GC-TTC-A---C----T----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53393 : aacA-G-A--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--T--T-GG-G----A-TT-T------T-G----A------T--G--G-TC-AC---T-G-
gi|53394 : aacaAAGA-G-T--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53395 : aacAAGA-G-G--CC-C-CTG--GG--T-T-G-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TGG---A-GCA-C--TAGTTAGC-TTT-A---T-A--G----A-GAA--G-A----A-G---A-GA-TT--T--G-G----A-TT-T-----GC-
gi|53395 : aac--T--TT-GC-TTC-AG--T-A-------A-GAA----A-GC-A-G---A-AG-AT--T-TG-G----A-TT-T-----AC------A------T--GT-G-CC--T---T-A-TTCAAA-GGTttcagtaagaaagcagaagatttggatttacatgtgccttattcaaaggt
gi|53396 : aacaagaggcccctgggttgcatcgctcacctggagcactagttagctttatagagaagaagagatttggaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53543 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TA-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-CT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTA
gi|53544 : acAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TT-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TTTGC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TCCAAA-GATA
gi|53546 : acAAGA-G-G--TT-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-A-A-G---A-GCA-C--T--TT-GA-TTC-A---T-A--ATCTTA-GAA--A-A-G--A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GAT
gi|53547 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53548 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------AC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53549 : acAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--A-A-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-A---A--CA-C--T--TT-GC-TTT-A---T-A--G----AAGAA--G-A-AT-T-G---A-AG-TT--A-GG-G----A-TT-------AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTAAGG-GGCAT
gi|53550 : accAAGATG-GAACC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-ATG---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53551 : acAAGA-G-G--AC-C-A-G--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AAC-T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53552 : acAAGA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-T--A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTA-AAACT-A--A----A-AAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GG-A----A------T--GT-G-AC-A
gi|53570 : acAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T----------------------------GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-AT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGT
gi|53578 : cAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53580 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--AGAGC-C-A-C-A-------------------TCCGC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GT-TTT-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AA-T----ATTT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53581 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-T-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-A-G---G-ATA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-G--G----A-AAA--G-A-AC-A-T---A-AC-TT--TGGG-G----A-TA-T-----GC-A----A------T--GT-A-CT-AC---A-A-TTCAAT-GGTAT
gi|53582 : AAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-AAATTAAAGAACCATGGCCATC-TC-TCTA-CAC-T-G---A-ACA-C--T--TT--C-TTC-AA--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G--C-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53584 : AGA-G-G--CT-C-AAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-ATCC-AC---T-
gi|53588 : -C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TA-GT-TTC-G---T-A--G----A-GAA--A-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-GG-GATAAA-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-ACTG-T-A-TTCAAA-GATA
gi|53589 : -ATG--GG--C-C-A-G-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----T-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53590 : -ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-G-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--T----A-GAA-------C-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GG-T-CC-AC---A-A-TTCAAA-GGTA
gi|53594 : G--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-CTC-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-ACGC-A-G---A-AG-TT--T-GGAA----A-TT-T-----AC-A----A---------GT-G-TCGAC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Alignments
lowQualScore : 222222 1111111111111
lowQualScore : 0 0 00 0 0 00 11 0 1 0 0 5555555555555555555 0 0 0 1 0 0 0 111 0 0 000000 0 0 0 0000000000000 0 00 0 1 1 0 44444 0 00 0 0 1111 1 0 22222 22 1111 222222 11 1 1 0 111 0 1 0
lowQualScore : . . .. . . .. .. . . . . ................... . . . . . . . ... . . ...... . . . ............. . .. . . . . ..... . .. . . .... . . ..... .. .... ...... .. . . . ... . . .
lowQualScore : 4 4 66 4 8 66 11 4 2 8 4 4444444444444444444 4 4 4 6 8 4 8 999 4 4 666666 8 4 4 6666666666666 4 55 4 2 6 4 44444 8 66 9 4 0000 8 4 00000 66 0000 333333 11 0 0 5 555 5 1 9
consensus : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Reference ( family-117 ) : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53308 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTG-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGAAT
gi|53309 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53310 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----A--T-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AATAT
gi|53311 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--A-AG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53312 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GT-A-A---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----A------TG-GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53313 : aacAAGA-T-G--CC-C-ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---T-A--G----A-GAA----A-GC-A-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53314 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-CCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-GT---C-A-TTCGAA-GGTAT
gi|53315 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GA--C-C-A-T-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53316 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--T-C-A-C-T-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TC-GC-TTT-A---T-G--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------C--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53317 : aactAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--T--TT-GC-TTC-A---T-C--G----A-GAA--G-A-GC-G-G---A-AA-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTA
gi|53318 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-GAATA-AG-TT--T-GG-G----A-TT-A-----AC-A----A------T--GT-A-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53319 : aacAAGA-G-G--TT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------GC-AC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--TT-G-CC-AC---T-A-TTCA
gi|53320 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-CA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-C----A------T--GT-G-GC-AT---T-A-TTCAAA-TGTAT
gi|53321 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AA------------------TC-GC-TC-AAC-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---A-A--G----A-GAA--G---GC-G-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-GC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53322 : aacAAGC-A-G--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GT-TTC-A---T-T--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53323 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--CT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-T-AC-AC---T-T-TTCAAA-GG
gi|53324 : aatAACA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-A-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-G---A-AA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-C-TTCAAA-GATA
gi|53325 : aac--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-T-G---A-GAA-C--T--TT-AC-GTC-A---T-A--GA---A-GAA--G-A-GC-A-G---G-AC-GT--T-GG-G----A-TA-T-----ACAA----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53326 : aacaagatatccttAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-CTT-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-G---T-T--G----A-GAA----A-GC-T-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53327 : aacAAGA-G-A--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GT-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----TC-A----A------T--GT-G-CT-AC---T-A-TTCA
gi|53328 : aaaAAGA-A-G--CC-C-ATG--GT--T-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-C-G---A-AG-TT--A-AG-G----A-TT-T-----CC-A----ATGTCATT--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53329 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-T---T-GCA-C--T--TT-GC-TTT-----------------GAA--G-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53330 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GT--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-G--T--TT-GC-TTC-A---TAA--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-A-----AT-A----A------T--AT-G-CC-GC---T-A-TTCCAA-
gi|53331 : aacAAG--G-G--CC-C-ATG--GGAAC-A-A-C-AAA-----------------TC-CC-TC-A-C---T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A--AA--A-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----A--A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TT-AGA-TGTAT
gi|53332 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TT-TT---C-C-A-G---A-GCA-C--T--TT-GT-TTC-A---T-A--G----A-AAA--G-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AT-A----A------T--GA-G-CC-AC---TAA-TTCAAA-GGTAT
gi|53336 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T-----GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53338 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--------TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53339 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53340 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53341 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53342 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-G---A-TCA-C--C--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAT--G-A-AC-A-A---C-AG-TT--T-GG-G----A--A-T-----AA-A----A------T--GT-A-TT-CC---C-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53343 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53344 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53345 : aaaAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--GG-CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-TG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53346 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--TG-TT-GC-TTC-A---T-T--A----A-CAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TTTGT-GG-G----A-AT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53347 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC----A-C-C-T-G---A-GCA-T--T--TT-GC-GTC-A---T-A--G----A-GAA--G-----------------TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-ACTTAT-A-TTC
gi|53348 : aaaAACA-A-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---G-AGTG----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----
gi|53349 : agcA-G-G--CC-CCATG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-T-T-GGAGA-ACA-C--T--TT-GC-TTA-AA--T-G--G----A-GAA--GCA-GC-A-G---G-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------TCGATGG-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53350 : aacgaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--CTC-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--A-----GT-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--TTGG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53351 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C---A-C-A----------------------GA-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-G--TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T----G----A-TT-T-----AT-A----G------T--GT-G-CC-AC-------TTCAA
gi|53352 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53353 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--AG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CG-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TTATTAAG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53354 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------A--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53355 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T------------------T-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TA-T-----AC-A----G------T--
gi|53356 : aacAAGA-G-G--CC-CCAAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TTG---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----AG-----T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53357 : aacAAGA-T-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GG--A-GCA-C--CAGCT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---ATAG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53358 : aacAAGA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCATC--G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT---CC-AC---T-G-
gi|53359 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--AG--C-C-A-TGA-------------------TC-AA-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-----C-A--TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----
gi|53360 : aaaAAGA-G-A--CC-C-AAG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-G-A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53361 : aacAAGA-G-G--AC-C-ATG--CG--C-CCA-C-A-------------------TA-GCGTC-A-T-T-T-G---A-GCA-C--T--TC-GC-TTC-A---------------AAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--C-GA-G----A-TT-T-----AC-AATACA------T--GT-G-TC-AC---T-GTTTTAAA-GGTAT
gi|53362 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53363 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53364 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CAGC--TT-GC-TTC-AC--T-G--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-CG--T--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--
gi|53365 : aacAAGA-G-G--CC-T-TTG--TG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GG-TTC-A---T-T--A----A-GGA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--G
gi|53366 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATGCCGG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-GCA-C--CA-CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-AAG--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T---T-GACC-AC---T-G-
gi|53367 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A--------------------C-GC-TC-A-C-C-T-----A-GCA-CA-G--CT-GC-TTA-C---T-A--G----A---A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53368 : aacAAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--T----A-GAT--G-A-GC-A-G---A-AA-TT--T-
gi|53369 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AAT-----------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G-----GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-AAA--G-A-GC-A-GT--T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53370 : aagAAGA-T-A--CCTC-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AA-T--A-C-C-T-G---AGGCA-C--T--GT-AC-TTC-A---T----T----A-GAA--A-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----ACGA----A------T--GC-A-CC-AA---T-A-TTCAACTGGTAT
gi|53371 : aacAAA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CC-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C
gi|53372 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-C--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--------------------T-----AC-A----A------T--GTAG-CA-AC---T-
gi|53373 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53374 : aacAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-G-A-C-A-------------------TC-GC-TT-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---G-AGGG----A-GAACGA-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AC-T----A------T--TT-T-GC-GC---T-AGTTGAAA-GGTAT
gi|53375 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53377 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53378 : aacAAGA-G----CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GCTTTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TTAT-----AG-A----AC-----T--GT-A-CC-AC---T-
gi|53379 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53381 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53382 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53383 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53384 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53385 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53386 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTCAA---T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53388 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53389 : aac-G-A--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-T-T-G---A-GCA-C--------------------------------AA--G---GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--CT-G-CC-AC---T-A-TTC-AA-GGTAT
gi|53390 : aaccatgAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-------A--G----A-------------------------------------------T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTAT
gi|53391 : aacAAGA-GAG--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--A--GT-GC-TTC-A---C----T----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53393 : aacA-G-A--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--T--T-GG-G----A-TT-T------T-G----A------T--G--G-TC-AC---T-G-
gi|53394 : aacaAAGA-G-T--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53395 : aacAAGA-G-G--CC-C-CTG--GG--T-T-G-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TGG---A-GCA-C--TAGTTAGC-TTT-A---T-A--G----A-GAA--G-A----A-G---A-GA-TT--T--G-G----A-TT-T-----GC-
gi|53395 : aac--T--TT-GC-TTC-AG--T-A-------A-GAA----A-GC-A-G---A-AG-AT--T-TG-G----A-TT-T-----AC------A------T--GT-G-CC--T---T-A-TTCAAA-GGTttcagtaagaaagcagaagatttggatttacatgtgccttattcaaaggt
gi|53396 : aacaagaggcccctgggttgcatcgctcacctggagcactagttagctttatagagaagaagagatttggaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53543 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TA-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-CT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTA
gi|53544 : acAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TT-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TTTGC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TCCAAA-GATA
gi|53546 : acAAGA-G-G--TT-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-A-A-G---A-GCA-C--T--TT-GA-TTC-A---T-A--ATCTTA-GAA--A-A-G--A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GAT
gi|53547 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53548 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------AC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53549 : acAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--A-A-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-A---A--CA-C--T--TT-GC-TTT-A---T-A--G----AAGAA--G-A-AT-T-G---A-AG-TT--A-GG-G----A-TT-------AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTAAGG-GGCAT
gi|53550 : accAAGATG-GAACC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-ATG---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53551 : acAAGA-G-G--AC-C-A-G--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AAC-T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53552 : acAAGA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-T--A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTA-AAACT-A--A----A-AAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GG-A----A------T--GT-G-AC-A
gi|53570 : acAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T----------------------------GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-AT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGT
gi|53578 : cAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53580 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--AGAGC-C-A-C-A-------------------TCCGC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GT-TTT-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AA-T----ATTT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53581 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-T-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-A-G---G-ATA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-G--G----A-AAA--G-A-AC-A-T---A-AC-TT--TGGG-G----A-TA-T-----GC-A----A------T--GT-A-CT-AC---A-A-TTCAAT-GGTAT
gi|53582 : AAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-AAATTAAAGAACCATGGCCATC-TC-TCTA-CAC-T-G---A-ACA-C--T--TT--C-TTC-AA--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G--C-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53584 : AGA-G-G--CT-C-AAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-ATCC-AC---T-
gi|53588 : -C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TA-GT-TTC-G---T-A--G----A-GAA--A-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-GG-GATAAA-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-ACTG-T-A-TTCAAA-GATA
gi|53589 : -ATG--GG--C-C-A-G-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----T-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53590 : -ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-G-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--T----A-GAA-------C-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GG-T-CC-AC---A-A-TTCAAA-GGTA
gi|53594 : G--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-CTC-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-ACGC-A-G---A-AG-TT--T-GGAA----A-TT-T-----AC-A----A---------GT-G-TCGAC---T-A-TTCAAA-GGTAT
blockSeqs : AA G AATTAAAGAACCATGGCCA A GAG CAGC TAATCTT T A AATA T TATTA CA TGTCAT CG TTA T
blockSeqs : AG C AA C G AGCT AACTAA T A AT T A CG G G TG G
blockSeqs : . G AT C A TAGT GAGTG C T AG T A C C . . .
blockSeqs : . . A C A AGC GAGGG . T AG T . C . . . .
blockSeqs : . . T . . AGC TAGA . . TT . . C . . . .
blockSeqs : . . T . . AGC TAAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC CTAA . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC ATGG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . GGC CTAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TGT CTGA . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC CTAA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . GGC CTAA . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC CTAA . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC ACTA . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC ATAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TGG . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TCG . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC AAG . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TTG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TAG . . T . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TG TTG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TG TAA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . G . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TG TTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TC TAG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TTA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CAG . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TG CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . C . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . CT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAT . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . GC CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CCA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TG CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . AG CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT AAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT AAG . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CAA . . T . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TTA . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAG . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TT GTA . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . A . . .
blockSeqs : . . . . . TT CAG . . A . . G . . .
blockSeqs : . . . . . TT TAA . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TT CTA . . A . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T TAG . . T . . C . .
blockSeqs : . . . . . T CTA . . T . . C . .
blockSeqs : . . . . . A TAG . . T . . G . .
blockSeqs : . . . . . T TAG . . A . . C . .
blockSeqs : . . . . . . TGG . . A . . C . .
blockSeqs : . . . . . . CTA . . A . . C
blockSeqs : . . . . . . TAG . . A . . C
blockSeqs : . . . . . . TAG . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . TAT . . T
blockSeqs : . . . . . . TAA . . A
blockSeqs : . . . . . . TT . . A
blockSeqs : . . . . . . TA . . A
blockSeqs : . . . . . . AG . . A
blockSeqs : . . . . . . CT . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
finalCons : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Alignments
lowQualScore : 222222 1111111111111
lowQualScore : 0 0 00 0 0 00 11 0 1 0 0 5555555555555555555 0 0 0 1 0 0 0 111 0 0 000000 0 0 0 0000000000000 0 00 0 1 1 0 44444 0 00 0 0 1111 1 0 22222 22 1111 222222 11 1 1 0 111 0 1 0
lowQualScore : . . .. . . .. .. . . . . ................... . . . . . . . ... . . ...... . . . ............. . .. . . . . ..... . .. . . .... . . ..... .. .... ...... .. . . . ... . . .
lowQualScore : 4 4 66 4 8 66 11 4 2 8 4 4444444444444444444 4 4 4 6 8 4 8 999 4 4 666666 8 4 4 6666666666666 4 55 4 2 6 4 44444 8 66 9 4 0000 8 4 00000 66 0000 333333 11 0 0 5 555 5 1 9
consensus : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
Reference ( family-117 ) : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---N-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53308 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTG-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGAAT
gi|53309 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53310 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----A--T-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AATAT
gi|53311 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--A-AG-A----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53312 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GT-A-A---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----A------TG-GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53313 : aacAAGA-T-G--CC-C-ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---T-A--G----A-GAA----A-GC-A-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53314 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-CCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-GT---C-A-TTCGAA-GGTAT
gi|53315 : aacAAGA-G-G--TC-C-ATG--GA--C-C-A-T-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53316 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATT--GG--T-C-A-C-T-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TC-GC-TTT-A---T-G--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------C--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53317 : aactAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--T--TT-GC-TTC-A---T-C--G----A-GAA--G-A-GC-G-G---A-AA-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTA
gi|53318 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-GAATA-AG-TT--T-GG-G----A-TT-A-----AC-A----A------T--GT-A-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53319 : aacAAGA-G-G--TT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------GC-AC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--TT-G-CC-AC---T-A-TTCA
gi|53320 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-CA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-C----A------T--GT-G-GC-AT---T-A-TTCAAA-TGTAT
gi|53321 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AA------------------TC-GC-TC-AAC-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---A-A--G----A-GAA--G---GC-G-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-GC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53322 : aacAAGC-A-G--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--GT-GT-TTC-A---T-T--G----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-AGTAT
gi|53323 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--CT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-T-AC-AC---T-T-TTCAAA-GG
gi|53324 : aatAACA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-A-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-AC-A-G---A-AA-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-C-TTCAAA-GATA
gi|53325 : aac--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-T-G---A-GAA-C--T--TT-AC-GTC-A---T-A--GA---A-GAA--G-A-GC-A-G---G-AC-GT--T-GG-G----A-TA-T-----ACAA----A------T--AT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53326 : aacaagatatccttAAGA-G-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-CTT-G---A-GCA-C--T--GT-GC-TTC-G---T-T--G----A-GAA----A-GC-T-G---A-AC-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GATAT
gi|53327 : aacAAGA-G-A--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GT-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----TC-A----A------T--GT-G-CT-AC---T-A-TTCA
gi|53328 : aaaAAGA-A-G--CC-C-ATG--GT--T-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--A-A-GC-C-G---A-AG-TT--A-AG-G----A-TT-T-----CC-A----ATGTCATT--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53329 : aacAAAA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-T---T-GCA-C--T--TT-GC-TTT-----------------GAA--G-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53330 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GT--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-G--T--TT-GC-TTC-A---TAA--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-A-----AT-A----A------T--AT-G-CC-GC---T-A-TTCCAA-
gi|53331 : aacAAG--G-G--CC-C-ATG--GGAAC-A-A-C-AAA-----------------TC-CC-TC-A-C---T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A--AA--A-A-GA-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----A--A----A------T--GC-G-CC-AC---T-A-TT-AGA-TGTAT
gi|53332 : aacAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TT-TT---C-C-A-G---A-GCA-C--T--TT-GT-TTC-A---T-A--G----A-AAA--G-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AT-A----A------T--GA-G-CC-AC---TAA-TTCAAA-GGTAT
gi|53336 : aacAAGA-A-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T-----GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53338 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--------TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53339 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53340 : aatAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-AG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53341 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53342 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-AC-TT-A-C-C-T-G---A-TCA-C--C--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAT--G-A-AC-A-A---C-AG-TT--T-GG-G----A--A-T-----AA-A----A------T--GT-A-TT-CC---C-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53343 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53344 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53345 : aaaAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--GG-CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-TG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53346 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-A--TG-TT-GC-TTC-A---T-T--A----A-CAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TTTGT-GG-G----A-AT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53347 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC----A-C-C-T-G---A-GCA-T--T--TT-GC-GTC-A---T-A--G----A-GAA--G-----------------TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-ACTTAT-A-TTC
gi|53348 : aaaAACA-A-G--TC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---G-AGTG----A-GAA--A-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----
gi|53349 : agcA-G-G--CC-CCATG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-T-T-GGAGA-ACA-C--T--TT-GC-TTA-AA--T-G--G----A-GAA--GCA-GC-A-G---G-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------TCGATGG-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53350 : aacgaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--CTC-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--A-----GT-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--TTGG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-G-
gi|53351 : aacAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C---A-C-A----------------------GA-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-C--T--TT-G--TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T----G----A-TT-T-----AT-A----G------T--GT-G-CC-AC-------TTCAA
gi|53352 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-A---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-----------TAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53353 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--AG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CG-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TTATTAAG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53354 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------A--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53355 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T------------------T-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AG-G----A-TA-T-----AC-A----G------T--
gi|53356 : aacAAGA-G-G--CC-CCAAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TTG---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----AG-----T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53357 : aacAAGA-T-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GG--A-GCA-C--CAGCT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---ATAG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53358 : aacAAGA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCATC--G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT---CC-AC---T-G-
gi|53359 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--AG--C-C-A-TGA-------------------TC-AA-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-----C-A--TT--T-GG-G----A-TT-T-----GC-A----
gi|53360 : aaaAAGA-G-A--CC-C-AAG--G-----C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-G-A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53361 : aacAAGA-G-G--AC-C-ATG--CG--C-CCA-C-A-------------------TA-GCGTC-A-T-T-T-G---A-GCA-C--T--TC-GC-TTC-A---------------AAA--G-A-GC-A-A---A-AG-TT--C-GA-G----A-TT-T-----AC-AATACA------T--GT-G-TC-AC---T-GTTTTAAA-GGTAT
gi|53362 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53363 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-AGA-CA-G--CT-GC-TGC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-GA--G-GG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53364 : aacAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CAGC--TT-GC-TTC-AC--T-G--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-CG--T--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--
gi|53365 : aacAAGA-G-G--CC-T-TTG--TG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GG-TTC-A---T-T--A----A-GGA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--G
gi|53366 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATGCCGG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-ACC-C-T-G---A-GCA-C--CA-CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-AAG--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AG-A----A------T---T-GACC-AC---T-G-
gi|53367 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A--------------------C-GC-TC-A-C-C-T-----A-GCA-CA-G--CT-GC-TTA-C---T-A--G----A---A--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53368 : aacAAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--T----A-GAT--G-A-GC-A-G---A-AA-TT--T-
gi|53369 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-AAT-----------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G-----GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-AAA--G-A-GC-A-GT--T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53370 : aagAAGA-T-A--CCTC-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-AA-T--A-C-C-T-G---AGGCA-C--T--GT-AC-TTC-A---T----T----A-GAA--A-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----ACGA----A------T--GC-A-CC-AA---T-A-TTCAACTGGTAT
gi|53371 : aacAAA-G-G--CC-C-A-A--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CC-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-A----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-C
gi|53372 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-C--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--------------------T-----AC-A----A------T--GTAG-CA-AC---T-
gi|53373 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53374 : aacAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--C-G-A-C-A-------------------TC-GC-TT-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--T--TT-CC-TTC-A---G-AGGG----A-GAACGA-A-GC-A-G-----AG-TT--T-GG-G----ATTT-T-----AC-T----A------T--TT-T-GC-GC---T-AGTTGAAA-GGTAT
gi|53375 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53377 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53378 : aacAAGA-G----CC-C-ATT--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GCTTTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TTAT-----AG-A----AC-----T--GT-A-CC-AC---T-
gi|53379 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53381 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53382 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53383 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53384 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-AGC-AT------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-CAC-T---A-A--G----A-GAA--G-ATGCAA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A--T-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53385 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53386 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTCAA---T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53388 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-T-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53389 : aac-G-A--CC-A-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-T-T-G---A-GCA-C--------------------------------AA--G---GC-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--CT-G-CC-AC---T-A-TTC-AA-GGTAT
gi|53390 : aaccatgAAGA-G-A--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-TC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-------A--G----A-------------------------------------------T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGTAT
gi|53391 : aacAAGA-GAG--CC-C-AAG--GG--C---A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-GA--A-GCA-C--A--GT-GC-TTC-A---C----T----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53393 : aacA-G-A--CC-C-ATG--G---C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AC--T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG--T--T-GG-G----A-TT-T------T-G----A------T--G--G-TC-AC---T-G-
gi|53394 : aacaAAGA-G-T--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---T-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-T
gi|53395 : aacAAGA-G-G--CC-C-CTG--GG--T-T-G-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-TGG---A-GCA-C--TAGTTAGC-TTT-A---T-A--G----A-GAA--G-A----A-G---A-GA-TT--T--G-G----A-TT-T-----GC-
gi|53395 : aac--T--TT-GC-TTC-AG--T-A-------A-GAA----A-GC-A-G---A-AG-AT--T-TG-G----A-TT-T-----AC------A------T--GT-G-CC--T---T-A-TTCAAA-GGTttcagtaagaaagcagaagatttggatttacatgtgccttattcaaaggt
gi|53396 : aacaagaggcccctgggttgcatcgctcacctggagcactagttagctttatagagaagaagagatttggaAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---
gi|53543 : aacAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TA-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---C-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-CT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GGTA
gi|53544 : acAAGA-G-G--CC-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TT-GC-TT-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TTTGC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TCCAAA-GATA
gi|53546 : acAAGA-G-G--TT-C-ATG--GA--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-A-A-G---A-GCA-C--T--TT-GA-TTC-A---T-A--ATCTTA-GAA--A-A-G--A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-TA----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAAA-GAT
gi|53547 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53548 : acAAGA-G-G--CC-C-AAG--GG--C-C-A-C-A-------------------AC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC---G---T-AGTTT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53549 : acAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--A-A-A-C-A-------------------TT-GC-TC-A-C-C-T-A---A--CA-C--T--TT-GC-TTT-A---T-A--G----AAGAA--G-A-AT-T-G---A-AG-TT--A-GG-G----A-TT-------AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTAAGG-GGCAT
gi|53550 : accAAGATG-GAACC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GC-ATG---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-G-
gi|53551 : acAAGA-G-G--AC-C-A-G--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-AAC-T-A-------A-GAA--G-A-GC-A-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AA-A----A------T--GT-A-CC-AC---
gi|53552 : acAAGA-G-G--AC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-T--A-C-C-T-G---A-GCA-C------T-GC-TTA-AAACT-A--A----A-AAA--G-A-GC-A-C---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----GG-A----A------T--GT-G-AC-A
gi|53570 : acAAGA-G-G--CT-C-ATG--GG--T-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-ACA-C--T----------------------------GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-AT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTCAGA-TGT
gi|53578 : cAAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-TC-AC---T-A-TTCAAA-GGTAT
gi|53580 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--AGAGC-C-A-C-A-------------------TCCGC-TC-A-C-C-T-G---C-GCA-C--T--TT-GT-TTT-A---T-A--G----A-GAG--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-AA-T----ATTT-T-----AC-A----A------T--GT-A-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53581 : AAGA-G-G--CC-C-ATG--GG--C-C-A-T-A-------------------TC-AC-TC-A-C-C-A-G---G-ATA-T--T--TT-GC-TTC-A---T-G--G----A-AAA--G-A-AC-A-T---A-AC-TT--TGGG-G----A-TA-T-----GC-A----A------T--GT-A-CT-AC---A-A-TTCAAT-GGTAT
gi|53582 : AAGA-G-A--CC-T-ATG--GG--C-C-A-C-AAATTAAAGAACCATGGCCATC-TC-TCTA-CAC-T-G---A-ACA-C--T--TT--C-TTC-AA--T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T--G-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G--C-AC---T-A-TTCAGA-
gi|53584 : AGA-G-G--CT-C-AAG--GG--C-CGA-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-CA-G--CT-GC-TTC-A---C-T--A----A-GAA--G-A-GCTA-G---T-AG-TT--T-GG-G----A-TT-T-----AG-A----A------T--GT-ATCC-AC---T-
gi|53588 : -C-ATG--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-C-C-T-G---A-GCA-C--T--TA-GT-TTC-G---T-A--G----A-GAA--A-A-TC-A-G---A-AG-TT--T-GG-GATAAA-TT-T-----AC-A----A------T--AT-G-CC-ACTG-T-A-TTCAAA-GATA
gi|53589 : -ATG--GG--C-C-A-G-A-------------------TC-GC-TC-A-T-C-T-G---A-GTA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--G----A-GAA--G-A-GC-A-G---A-AG-TT--T-GG-A----T-TT-T-----AC-A----A------T--GT-G-CC-AC---T-A-TTGAAA-GGTAT
gi|53590 : -ATA--GG--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-A-C-G-G---A-ACA-C--T--TT-AC-TTC-A---T-A--T----A-GAA-------C-A-G---A-AG-TT--T-GA-G----A-TT-T-----AC-A----A------T--GG-T-CC-AC---A-A-TTCAAA-GGTA
gi|53594 : G--C-C-A-C-A-------------------TC-GC-TC-A-CTC-T-G---A-ACA-C--T--TT-GC-TTC-A---T-A--A----A-GAA--G-ACGC-A-G---A-AG-TT--T-GGAA----A-TT-T-----AC-A----A---------GT-G-TCGAC---T-A-TTCAAA-GGTAT