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gi|7024                       :   TTT-TCA-T-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----A---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTT-C---T--C--C-G-T-C--G--T-C----CG---TCTGT
gi|7041                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--A-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----ACTCAA--G-TG--A--G--C-TA--TT-CT-G-ATT-G--CT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7023                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--------A----A--G-TG--AGCG--C-TT--TT-CT-G-ATC-A-CCT-GTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCCGT
gi|7026                       :   TTT-TTA-G-CT--CT-C--C-T-GAC----T-C----G----A-------A-----G---A-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTGTCCAT--T--G-T-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|6992                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-T---A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TGTTATCTGT
gi|7000                       :   TTA-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-T----A----A-------A-----G---G-C--A--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-A-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7002                       :   TTT-TTAAG-CT--CA-CGAC-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--TCC----TG---TC
gi|7011                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C------G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--AA-G--C-TT--TTTCT-G-ATC-G-CCT-TTTTG---T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7017                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-T----G----A-------A-----A---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTTG-------T--CGG-T-C--G--T-C----TG---T
gi|7045                       :   TTT-TTA-C-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GATAT---C--CGGC-G-T-C-----T-C----TG---TCTGT
gi|7016                       :   TTT-TTA-G--T--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--CTTT--TT-CT-G-ATC-G-CCA-TTTG----T--C--C-G-T-CG-G--T-C----TG---TCTGT
gi|7052                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--GTTG--A--G--CTTT--TT-CT-G-ATC-A-CCTGGTTGT---C--T----G-T-C--G--T-CA---TG---TCTGT
gi|7018                       :   TTT-TTA---CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----
gi|7037                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----GGCTG-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-T---TT-CT-G-A-C-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---CC
gi|7034                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-T----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATT-A-CCA-TTTGT---C--T----G-A-C--G--T-C----TG---TCTAT
gi|7025                       :   TTA-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--GATG--A--G--C-TT--TT-C--G-ATC-GCCCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCT
gi|7028                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-T----G----A-------A-----A---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-A-CCG-GTTG----T--C--C-G-C-C--G--T-C----CG---TCTGT
gi|7031                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-A-AAA-TTTG----T--C--C-G-T-T--G--T-C----TG---TC
gi|7035                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-CCGT--C-----A----A--G--G--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATT-G-CCT-TTTG----T--C--C-A-TCC--G--T-C----CG---TCTGT
gi|7048                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--CAT-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-A--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CTCG-ATC-GCCCT-TTTG----T--A--A-G-T-C--G--T-C----TG---TCCGT
gi|7043                       :   TTT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GGG----C-T----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TA--A--A--C-TT--TT-CT-G-ATC-A-CAT-TTTG----T--C--C-G-T-C--A--T-C----GG---TCTGT
gi|7180                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-A-T-C--G--T-T----TG---TCTGT
gi|7187                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TA--TT-CT-GAATC-GCCCT-TTTG----T--C--C-G-TCC--G--T-C----TG---TCTGT
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gi|7182                       :    TT-TTA-G-AT--CA-C--C-T-GAA----T-A----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CTT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7186                       :    TT-TTA-G-CT--CA-G--C-T-AAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-A-CCT-TTTG----T--C--C-T-T-T--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7191                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----A----A-------A-----G---G-C--T--T-----A----A--G-TG--A--G--C-TA--TTATT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--GTTT-C----TG---TCTGT
gi|7190                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----A----A-------A-----G---G-C--T--T-----A----A--G-TG--A--G--C-TA--TTATT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--GTTT-C----TG---TCTGT
gi|7193                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----G----A-------G-----G---G-C--T--C-----A----A--G-AG--A--G--C-TA--TT-CT-G-ATC-G-CTT-TTTG----T--C--C-G-T-C--C--T-C----TG---TTTGT
gi|7188                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----T-T----G----A-------A-----G---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATT-G-CC--TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TT---TCTGT
gi|7183                       :    TT-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-C--A--C-----A----A--G-AG--A--G--C-TT--TT-CT-A-ATC-G-CCG-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7194                       :    TT-TTA-G-CT--TA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--T-----A----A--G-TG--A--G--T-TT--TT-CT-G-GTC-G-ACT-GTTGT---CCGC--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
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gi|7223                       :     T-TTA-G-CT--CA-C--C-T-GTA----C------G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TA--TT-CC-G-ATT-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-CT-G--T-C----TG---TCTGT
gi|7221                       :     T-TTA-G-CT--CA-C--C-A-GAG----C-C----A----A-------A-----C---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCCGT
gi|7231                       :      -TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTTG----T--C--C-G-T-C--G--T-C----TG---TCTGT
gi|7235                       :      -TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAA----C-C----G----A-------A-----G---G-T--TTTC-----A----A--G-TG--A--G--C-TA--TT-CT-G-ATC-G-CCT-TTTG----T--C--C-G-T-CG-G--T-C----TG---TCCGT
gi|7234                       :      -TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAG----C-C----G----A-------A-----G---G-T--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CC-A-ATT-G-CCT-TTTGT---CG-T--C-G-T-T--G--T-C----TG---TCCGT
gi|7236                       :      -TTA-G-CT--CA-C--C-T-GAT----C-T----G----A-------A-----A---G-C--T--C-----A----A--G-TG--A--G--C-TT--TT-CT-G-ATC-G-CCT-GTTG----T--C--C-G-T-CT-G--T-C----TG---TCCGT
gi|6960                       :        TA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--
gi|7006                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C---------T-------ATC---G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtctgtcgtctgtctgt
gi|6979                       :    ttttTA-G-GT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgttcgtcgtctgcc
gi|6980                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--A-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtccgt
gi|6957                       :   tttatTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----T----T-------C-----G---G-C--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtctgt
gi|7010                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--T--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtccgt
gi|6984                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttccgatcgccttttgttcgtcgtctctctgt
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gi|6965                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----T----T-------C-----G---G-C--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtctgt
gi|6962                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----T----T-------C-----G---G-C--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-Tttctgatcgccttttgtccgtcgtcttgtctgt
gi|6983                       :  tttttaTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------T-----C---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtctgt
gi|6978                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------------G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcgccttttgtccgtcgtctgtccgt
gi|6985                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcaccttttgtccgtcgtctgtc
gi|6972                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----T----T-------C-----G---G-C--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcaccttttgcccgtcgtccgtccgt
gi|6990                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttttgatcgccttttgtccgttgtctgtctgt
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gi|7022                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctaatcgccttttgtccgtctgtccgtccgt
gi|6989                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAG----C-C----T----T-------C-----G---G-C--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-ttcttatagccttttgtccgtcgtctccctgt
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gi|7046                       :    ttttTA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-CTTCGG----TTC-----ACCTTCG---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--ttctgatcaaccttttgtccgtctgtccgtc
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gi|6966                       :     ttttA-G-CT--CA-C--T-T-GAA----C-C----T----T-------C-----G---G-T--T--C-----A----G--G-TG--A--G--C-TA--tttttgatcgcctgttgtccgtcgtctgtccgt
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Alignments
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lowQualScore                  :    .   . .  ..   .. .       ... ........... .. .. ... .. ..... .  . ..... . .. ...  .  . .   . . . . .   . . ... ..  .... ..... .. .. . ....    .  
lowQualScore                  :    2   6 4  66   00 4       777 33333333333 00 66 333 33 99999 2  4 00000 4 33 888  6  4 8   4 2 4 8 8   4 8 777 55  6666 22222 55 66 4 4444    2  
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Reference ( family-103 )      : TTT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAACCGNN-G-----------G--T--T---C--A----GG-TG-A-----G-C--TA--TT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|6955                       : TTT-TTA-G-CT--TAC--A-TGAACCGAA-G-----------G--T--T---T--A----AG-TG-A-----G-C--TT--TT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
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gi|7048                       : TTT-TTA-G-CT--CAC--CATGAG-----------CCGA-AG---G-A--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CTCG-ATC-GCC-C-T-TTT-G-T---A--AG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|7049                       : TTT-TGA-GACT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----GGC--T-ATTACT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCAGT
gi|7050                       : TTT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---GTT--T--C--A----AGTTG-A-----G-C--T-ATT-CT-G-ATC-G-C-C-TGTTT-G-T---C--CGT---T-----C--G--T-CT---TGTCTGT
gi|7051                       : TTT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CTGA-AG---G-T--T--G--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CT-A-ATC-A-C-C-T-TTT-G-C---C--CG----TC----C--G--T-C----CGTCTGT
gi|7052                       : TTT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AGTTG-A-----G-CT-T-TTT-CT-G-ATC-A-C-C-TGGTT-G-T---C--TG----T-----C--G--T-CA---TGTCTGT
gi|7179                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCGA-AG---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGT
gi|7180                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CA----T-----C--G--T-T----TGTCTGTatgt
gi|7181                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AGT--G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-A-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|7182                       :  TT-TTA-G-AT--CAC--C-TGAA-----------TAGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-T-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7183                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCGA-AG---G-C--A--C--A----AG-AG-A-----G-C--T-TTT-CT-A-ATC-G-C-C-G-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7186                       :  TT-TTA-G-CT--CAG--C-TAAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-A-C-C-T-TTT-G-T---C--CT----T-----T--G--T-C----TGTCTGT
gi|7187                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CT-GAATC-GCC-C-T-TTT-G-T---C--CG----TC----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7188                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------TTGA-AG---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATT-G-C-C---TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TTTCTGT
gi|7190                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCAA-AG---G-C--T--T--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATTATT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--GTTT-C----TGTCTGT
gi|7191                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCAA-AG---G-C--T--T--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATTATT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--GTTT-C----TGTCTGT
gi|7192                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--C----A-------------GA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|7193                       :  TT-TTA-G-CT--CAC--T-TGAG-----------CCGA-GG---G-C--T--C--A----AG-AG-A-----G-C--T-ATT-CT-G-ATC-G-C-T-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--C--T-C----TGTTTGT
gi|7194                       :  TT-TTA-G-CT--TAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--T--A----AG-TG-A-----G-T--T-TTT-CT-G-GTC-G-A-C-T-GTT-G-TCCGC--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7220                       :   T-TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCGA-AG---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7221                       :   T-TTA-G-CT--CAC--C-AGAG-----------CCAA-AC---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|7223                       :   T-TTA-G-CT--CAC--C-TGTA-----------C-GA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CC-G-ATT-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----CT-G--T-C----TGTCTGT
gi|7231                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7234                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CC-A-ATT-G-C-C-T-TTT-G-T---CGTCG----T-----T--G--T-C----TGTCCGT
gi|7235                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--TTTC--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----CG-G--T-C----TGTCCGT
gi|7236                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAT-----------CTGA-AA---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----CT-G--T-C----TGTCCGT


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blockSeqs                     :    A   C                 .                 T                    T    GT      TA T   A          C                     C    C     G  TT   T       C
blockSeqs                     :    A   A                 .                 .                    T    A       T  A   A          C                     T    C     T  TT   T       T
blockSeqs                     :    .   A                 .                 .                    T    .       T  T   A          C                     .    C     T  .    T       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     G  .    A       T
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blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  G   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       A
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
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blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       A
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  A   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       C
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
blockSeqs                     :    .   .                 .                 .                    .    .       .  T   .          .                     .    .     .  .    .       T
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gi|7221                       :   T-TTA-G-CT--CAC--C-AGAG-----------CCAA-AC---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCCGT
gi|7223                       :   T-TTA-G-CT--CAC--C-TGTA-----------C-GA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CC-G-ATT-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----CT-G--T-C----TGTCTGT
gi|7231                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----C--G--T-C----TGTCTGT
gi|7234                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAG-----------CCGA-AG---G-T--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CC-A-ATT-G-C-C-T-TTT-G-T---CGTCG----T-----T--G--T-C----TGTCCGT
gi|7235                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAA-----------CCGA-AG---G-T--TTTC--A----AG-TG-A-----G-C--T-ATT-CT-G-ATC-G-C-C-T-TTT-G-T---C--CG----T-----CG-G--T-C----TGTCCGT
gi|7236                       :    -TTA-G-CT--CAC--C-TGAT-----------CTGA-AA---G-C--T--C--A----AG-TG-A-----G-C--T-TTT-CT-G-ATC-G-C-C-T-GTT-G-T---C--CG----T-----CT-G--T-C----TGTCCGT