[1] # (a,c,g,t)= (0.333, 0.167, 0.167, 0.333) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.344 C 0.156 G 0.156 T 0.344 # l= 1 # Values AA 0.147 AC 0.0532 AG 0.0444 AT 0.0987 CA 0.0578 CC 0.0264 CG 0.0277 CT 0.0444 GA 0.0479 GC 0.0288 GG 0.0264 GT 0.0532 TA 0.0908 TC 0.0479 TG 0.0577 TT 0.147 # l= 2 # Values AAA 0.0668 AAC 0.0204 AAG 0.0165 AAT 0.0438 ACA 0.0207 ACC 0.0085 ACG 0.00859 ACT 0.0155 AGA 0.0139 AGC 0.00793 AGG 0.00717 AGT 0.0155 ATA 0.0277 ATC 0.0128 ATG 0.0145 ATT 0.0438 CAA 0.0236 CAC 0.0107 CAG 0.0089 CAT 0.0145 CCA 0.00969 CCC 0.00476 CCG 0.00478 CCT 0.00717 CGA 0.00887 CGC 0.00542 CGG 0.00478 CGT 0.00859 CTA 0.0116 CTC 0.00747 CTG 0.00889 CTT 0.0165 GAA 0.0194 GAC 0.00817 GAG 0.00746 GAT 0.0128 GCA 0.0102 GCC 0.00525 GCG 0.00542 GCT 0.00793 GGA 0.0079 GGC 0.00525 GGG 0.00475 GGT 0.00849 GTA 0.014 GTC 0.00817 GTG 0.0107 GTT 0.0204 TAA 0.0376 TAC 0.014 TAG 0.0116 TAT 0.0277 TCA 0.0172 TCC 0.00791 TCG 0.00887 TCT 0.0139 TGA 0.0172 TGC 0.0102 TGG 0.00968 TGT 0.0207 TTA 0.0376 TTC 0.0194 TTG 0.0236 TTT 0.0667 # l= 3 # Values AAAA 0.0304 AAAC 0.00914 AAAG 0.00692 AAAT 0.0203 AACA 0.00807 AACC 0.00302 AACG 0.00321 AACT 0.00605 AAGA 0.00495 AAGC 0.00288 AAGG 0.00254 AAGT 0.00614 AATA 0.0135 AATC 0.00532 AATG 0.0065 AATT 0.0184 ACAA 0.00861 ACAC 0.00368 ACAG 0.00319 ACAT 0.00518 ACCA 0.00311 ACCC 0.00141 ACCG 0.00153 ACCT 0.00244 ACGA 0.00273 ACGC 0.00155 ACGG 0.0013 ACGT 0.003 ACTA 0.00393 ACTC 0.0023 ACTG 0.00312 ACTT 0.00613 AGAA 0.00584 AGAC 0.00216 AGAG 0.0022 AGAT 0.00367 AGCA 0.00278 AGCC 0.00133 AGCG 0.00154 AGCT 0.00228 AGGA 0.00219 AGGC 0.00126 AGGG 0.00129 AGGT 0.00244 AGTA 0.00388 AGTC 0.0023 AGTG 0.00324 AGTT 0.00606 ATAA 0.0132 ATAC 0.00381 ATAG 0.00319 ATAT 0.00747 ATCA 0.00485 ATCC 0.00186 ATCG 0.00242 ATCT 0.00367 ATGA 0.00454 ATGC 0.00245 ATGG 0.00233 ATGT 0.00517 ATTA 0.012 ATTC 0.00509 ATTG 0.00635 ATTT 0.0203 CAAA 0.0106 CAAC 0.00365 CAAG 0.00304 CAAT 0.00635 CACA 0.00394 CACC 0.00192 CACG 0.00161 CACT 0.00324 CAGA 0.00273 CAGC 0.00165 CAGG 0.00139 CAGT 0.00312 CATA 0.0037 CATC 0.00216 CATG 0.00214 CATT 0.0065 CCAA 0.00398 CCAC 0.00194 CCAG 0.00143 CCAT 0.00233 CCCA 0.00164 CCCC 0.00102 CCCG 0.000805 CCCT 0.00129 CCGA 0.00155 CCGC 0.000948 CCGG 0.000982 CCGT 0.0013 CCTA 0.00193 CCTC 0.00132 CCTG 0.00139 CCTT 0.00254 CGAA 0.0034 CGAC 0.00159 CGAG 0.00146 CGAT 0.00242 CGCA 0.00178 CGCC 0.00118 CGCG 0.000914 CGCT 0.00154 CGGA 0.00142 CGGC 0.00104 CGGG 0.000805 CGGT 0.00153 CGTA 0.00223 CGTC 0.00154 CGTG 0.00161 CGTT 0.00321 CTAA 0.00457 CTAC 0.00212 CTAG 0.0017 CTAT 0.00319 CTCA 0.0025 CTCC 0.0013 CTCG 0.00146 CTCT 0.0022 CTGA 0.00271 CTGC 0.00156 CTGG 0.00143 CTGT 0.00319 CTTA 0.00399 CTTC 0.00256 CTTG 0.00304 CTTT 0.00692 GAAA 0.00921 GAAC 0.00258 GAAG 0.00256 GAAT 0.0051 GACA 0.00301 GACC 0.00133 GACG 0.00154 GACT 0.0023 GAGA 0.00244 GAGC 0.00142 GAGG 0.00132 GAGT 0.0023 GATA 0.00372 GATC 0.00161 GATG 0.00216 GATT 0.00532 GCAA 0.00426 GCAC 0.00189 GCAG 0.00156 GCAT 0.00245 GCCA 0.00203 GCCC 0.000935 GCCG 0.00104 GCCT 0.00125 GCGA 0.00173 GCGC 0.00119 GCGG 0.000948 GCGT 0.00155 GCTA 0.00198 GCTC 0.00142 GCTG 0.00165 GCTT 0.00288 GGAA 0.00344 GGAC 0.00131 GGAG 0.0013 GGAT 0.00185 GGCA 0.00173 GGCC 0.00101 GGCG 0.00118 GGCT 0.00133 GGGA 0.00139 GGGC 0.000936 GGGG 0.00102 GGGT 0.00141 GGTA 0.00222 GGTC 0.00133 GGTG 0.00192 GGTT 0.00302 GTAA 0.0058 GTAC 0.00225 GTAG 0.00212 GTAT 0.00381 GTCA 0.00312 GTCC 0.00131 GTCG 0.00159 GTCT 0.00216 GTGA 0.0032 GTGC 0.00189 GTGG 0.00194 GTGT 0.00368 GTTA 0.00499 GTTC 0.00258 GTTG 0.00365 GTTT 0.00914 TAAA 0.0166 TAAC 0.00499 TAAG 0.00398 TAAT 0.012 TACA 0.00564 TACC 0.00222 TACG 0.00223 TACT 0.00388 TAGA 0.00374 TAGC 0.00198 TAGG 0.00193 TAGT 0.00393 TATA 0.0067 TATC 0.00372 TATG 0.00369 TATT 0.0136 TCAA 0.0068 TCAC 0.0032 TCAG 0.00271 TCAT 0.00454 TCCA 0.00291 TCCC 0.00139 TCCG 0.00142 TCCT 0.00219 TCGA 0.00285 TCGC 0.00173 TCGG 0.00155 TCGT 0.00273 TCTA 0.00374 TCTC 0.00244 TCTG 0.00273 TCTT 0.00495 TGAA 0.00677 TGAC 0.00312 TGAG 0.0025 TGAT 0.00485 TGCA 0.00386 TGCC 0.00173 TGCG 0.00178 TGCT 0.00278 TGGA 0.00291 TGGC 0.00202 TGGG 0.00164 TGGT 0.00311 TGTA 0.00564 TGTC 0.00301 TGTG 0.00394 TGTT 0.00807 TTAA 0.014 TTAC 0.0058 TTAG 0.00457 TTAT 0.0132 TTCA 0.00677 TTCC 0.00344 TTCG 0.0034 TTCT 0.00584 TTGA 0.0068 TTGC 0.00425 TTGG 0.00398 TTGT 0.0086 TTTA 0.0166 TTTC 0.00921 TTTG 0.0106 TTTT 0.0304 # l= 4 # Values AAAAA 0.0136 AAAAC 0.0042 AAAAG 0.00294 AAAAT 0.00963 AAACA 0.00358 AAACC 0.00137 AAACG 0.00149 AAACT 0.0027 AAAGA 0.00199 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000961 AAAGT 0.00274 AAATA 0.00661 AAATC 0.00257 AAATG 0.00318 AAATT 0.00794 AACAA 0.00345 AACAC 0.00149 AACAG 0.00119 AACAT 0.00195 AACCA 0.0011 AACCC 0.000512 AACCG 0.000625 AACCT 0.000781 AACGA 0.00102 AACGC 0.000631 AACGG 0.000512 AACGT 0.00105 AACTA 0.00169 AACTC 0.000886 AACTG 0.00125 AACTT 0.00222 AAGAA 0.00211 AAGAC 0.000828 AAGAG 0.000779 AAGAT 0.00123 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000487 AAGCG 0.000576 AAGCT 0.00081 AAGGA 0.000781 AAGGC 0.000495 AAGGG 0.000451 AAGGT 0.000809 AAGTA 0.00164 AAGTC 0.000923 AAGTG 0.00135 AAGTT 0.00222 AATAA 0.00683 AATAC 0.00178 AATAG 0.00145 AATAT 0.00348 AATCA 0.00205 AATCC 0.00078 AATCG 0.00109 AATCT 0.0014 AATGA 0.00206 AATGC 0.00112 AATGG 0.00103 AATGT 0.00229 AATTA 0.00549 AATTC 0.00224 AATTG 0.00271 AATTT 0.00794 ACAAA 0.00382 ACAAC 0.00129 ACAAG 0.00102 ACAAT 0.00248 ACACA 0.00138 ACACC 0.000642 ACACG 0.000591 ACACT 0.00107 ACAGA 0.00102 ACAGC 0.000567 ACAGG 0.000511 ACAGT 0.0011 ACATA 0.0014 ACATC 0.000724 ACATG 0.000763 ACATT 0.00229 ACCAA 0.00133 ACCAC 0.000612 ACCAG 0.000444 ACCAT 0.000729 ACCCA 0.000491 ACCCC 0.000294 ACCCG 0.000227 ACCCT 0.0004 ACCGA 0.000498 ACCGC 0.000293 ACCGG 0.000306 ACCGT 0.000429 ACCTA 0.00074 ACCTC 0.00043 ACCTG 0.000462 ACCTT 0.000809 ACGAA 0.00107 ACGAC 0.00048 ACGAG 0.000471 ACGAT 0.000714 ACGCA 0.000556 ACGCC 0.000308 ACGCG 0.000252 ACGCT 0.000438 ACGGA 0.000391 ACGGC 0.000274 ACGGG 0.000208 ACGGT 0.000429 ACGTA 0.000801 ACGTC 0.000532 ACGTG 0.000616 ACGTT 0.00105 ACTAA 0.00155 ACTAC 0.000672 ACTAG 0.000574 ACTAT 0.00114 ACTCA 0.000835 ACTCC 0.000354 ACTCG 0.000487 ACTCT 0.000621 ACTGA 0.00101 ACTGC 0.000521 ACTGG 0.000498 ACTGT 0.0011 ACTTA 0.00149 ACTTC 0.000811 ACTTG 0.0011 ACTTT 0.00274 AGAAA 0.00287 AGAAC 0.000751 AGAAG 0.000744 AGAAT 0.00148 AGACA 0.000839 AGACC 0.00031 AGACG 0.000423 AGACT 0.000584 AGAGA 0.00078 AGAGC 0.000416 AGAGG 0.00038 AGAGT 0.000621 AGATA 0.00122 AGATC 0.000437 AGATG 0.00062 AGATT 0.0014 AGCAA 0.00119 AGCAC 0.000519 AGCAG 0.000461 AGCAT 0.000607 AGCCA 0.000495 AGCCC 0.000236 AGCCG 0.00028 AGCCT 0.000317 AGCGA 0.00052 AGCGC 0.000319 AGCGG 0.000266 AGCGT 0.000438 AGCTA 0.000596 AGCTC 0.000395 AGCTG 0.000481 AGCTT 0.00081 AGGAA 0.000968 AGGAC 0.00034 AGGAG 0.00035 AGGAT 0.000526 AGGCA 0.000444 AGGCC 0.000234 AGGCG 0.000261 AGGCT 0.000317 AGGGA 0.000378 AGGGC 0.000256 AGGGG 0.000254 AGGGT 0.0004 AGGTA 0.000756 AGGTC 0.000376 AGGTG 0.000529 AGGTT 0.000781 AGTAA 0.00162 AGTAC 0.000642 AGTAG 0.000609 AGTAT 0.00101 AGTCA 0.000842 AGTCC 0.000362 AGTCG 0.00051 AGTCT 0.000584 AGTGA 0.001 AGTGC 0.000586 AGTGG 0.000584 AGTGT 0.00107 AGTTA 0.00153 AGTTC 0.000762 AGTTG 0.00107 AGTTT 0.0027 ATAAA 0.00604 ATAAC 0.00172 ATAAG 0.00132 ATAAT 0.00412 ATACA 0.00162 ATACC 0.000573 ATACG 0.000605 ATACT 0.00101 ATAGA 0.00101 ATAGC 0.000543 ATAGG 0.000502 ATAGT 0.00114 ATATA 0.00196 ATATC 0.00103 ATATG 0.000989 ATATT 0.00348 ATCAA 0.00185 ATCAC 0.000976 ATCAG 0.000799 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.000667 ATCCC 0.000318 ATCCG 0.000342 ATCCT 0.000526 ATCGA 0.000804 ATCGC 0.000495 ATCGG 0.000412 ATCGT 0.000714 ATCTA 0.00103 ATCTC 0.000668 ATCTG 0.000738 ATCTT 0.00123 ATGAA 0.00182 ATGAC 0.00083 ATGAG 0.000673 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000377 ATGCG 0.000452 ATGCT 0.000607 ATGGA 0.000717 ATGGC 0.000504 ATGGG 0.000377 ATGGT 0.000729 ATGTA 0.0015 ATGTC 0.000753 ATGTG 0.000981 ATGTT 0.00195 ATTAA 0.00462 ATTAC 0.00183 ATTAG 0.00145 ATTAT 0.00412 ATTCA 0.00183 ATTCC 0.000903 ATTCG 0.000889 ATTCT 0.00148 ATTGA 0.00175 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.000996 ATTGT 0.00248 ATTTA 0.00509 ATTTC 0.00267 ATTTG 0.00291 ATTTT 0.00963 CAAAA 0.00503 CAAAC 0.0015 CAAAG 0.00115 CAAAT 0.00291 CAACA 0.00149 CAACC 0.000552 CAACG 0.000545 CAACT 0.00107 CAAGA 0.000907 CAAGC 0.000502 CAAGG 0.000533 CAAGT 0.0011 CAATA 0.00192 CAATC 0.000783 CAATG 0.000942 CAATT 0.00271 CACAA 0.00168 CACAC 0.0007 CACAG 0.000577 CACAT 0.000981 CACCA 0.000713 CACCC 0.000368 CACCG 0.000313 CACCT 0.000529 CACGA 0.0005 CACGC 0.000279 CACGG 0.000214 CACGT 0.000616 CACTA 0.000723 CACTC 0.000523 CACTG 0.000648 CACTT 0.00135 CAGAA 0.00117 CAGAC 0.000429 CAGAG 0.000397 CAGAT 0.000738 CAGCA 0.000535 CAGCC 0.0003 CAGCG 0.000333 CAGCT 0.000481 CAGGA 0.00045 CAGGC 0.000219 CAGGG 0.000259 CAGGT 0.000462 CAGTA 0.000719 CAGTC 0.0005 CAGTG 0.000648 CAGTT 0.00125 CATAA 0.00172 CATAC 0.000524 CATAG 0.000461 CATAT 0.000989 CATCA 0.000811 CATCC 0.000351 CATCG 0.000381 CATCT 0.00062 CATGA 0.000654 CATGC 0.000379 CATGG 0.00034 CATGT 0.000763 CATTA 0.00157 CATTC 0.00081 CATTG 0.000942 CATTT 0.00318 CCAAA 0.00177 CCAAC 0.000702 CCAAG 0.000509 CCAAT 0.000996 CCACA 0.000686 CCACC 0.000402 CCACG 0.000269 CCACT 0.000584 CCAGA 0.000445 CCAGC 0.000266 CCAGG 0.000223 CCAGT 0.000498 CCATA 0.000585 CCATC 0.000373 CCATG 0.00034 CCATT 0.00103 CCCAA 0.00068 CCCAC 0.000347 CCCAG 0.000235 CCCAT 0.000377 CCCCA 0.000366 CCCCC 0.000227 CCCCG 0.000174 CCCCT 0.000254 CCCGA 0.00028 CCCGC 0.00015 CCCGG 0.000167 CCCGT 0.000208 CCCTA 0.000329 CCCTC 0.000248 CCCTG 0.000259 CCCTT 0.000451 CCGAA 0.000602 CCGAC 0.0003 CCGAG 0.000239 CCGAT 0.000412 CCGCA 0.000295 CCGCC 0.000239 CCGCG 0.000148 CCGCT 0.000266 CCGGA 0.000312 CCGGC 0.000197 CCGGG 0.000167 CCGGT 0.000306 CCGTA 0.000333 CCGTC 0.000242 CCGTG 0.000214 CCGTT 0.000512 CCTAA 0.000779 CCTAC 0.000401 CCTAG 0.000246 CCTAT 0.000502 CCTCA 0.000418 CCTCC 0.000262 CCTCG 0.000255 CCTCT 0.00038 CCTGA 0.000408 CCTGC 0.000248 CCTGG 0.000223 CCTGT 0.000511 CCTTA 0.000598 CCTTC 0.000443 CCTTG 0.000533 CCTTT 0.000961 CGAAA 0.0016 CGAAC 0.00047 CGAAG 0.000439 CGAAT 0.000889 CGACA 0.000498 CGACC 0.000296 CGACG 0.000285 CGACT 0.00051 CGAGA 0.000453 CGAGC 0.00027 CGAGG 0.000255 CGAGT 0.000487 CGATA 0.000647 CGATC 0.000307 CGATG 0.000381 CGATT 0.00109 CGCAA 0.00071 CGCAC 0.000344 CGCAG 0.000277 CGCAT 0.000452 CGCCA 0.000466 CGCCC 0.000215 CGCCG 0.000239 CGCCT 0.000261 CGCGA 0.000304 CGCGC 0.00021 CGCGG 0.000148 CGCGT 0.000252 CGCTA 0.000348 CGCTC 0.000286 CGCTG 0.000333 CGCTT 0.000576 CGGAA 0.000603 CGGAC 0.000247 CGGAG 0.000226 CGGAT 0.000342 CGGCA 0.000303 CGGCC 0.000213 CGGCG 0.000239 CGGCT 0.00028 CGGGA 0.000258 CGGGC 0.000146 CGGGG 0.000174 CGGGT 0.000227 CGGTA 0.000346 CGGTC 0.000242 CGGTG 0.000313 CGGTT 0.000625 CGTAA 0.000978 CGTAC 0.000319 CGTAG 0.000326 CGTAT 0.000605 CGTCA 0.000559 CGTCC 0.000273 CGTCG 0.000285 CGTCT 0.000423 CGTGA 0.000469 CGTGC 0.000279 CGTGG 0.000269 CGTGT 0.000591 CGTTA 0.000723 CGTTC 0.000453 CGTTG 0.000545 CGTTT 0.00149 CTAAA 0.00197 CTAAC 0.000664 CTAAG 0.00049 CTAAT 0.00145 CTACA 0.000836 CTACC 0.000351 CTACG 0.000326 CTACT 0.000609 CTAGA 0.000604 CTAGC 0.000273 CTAGG 0.000246 CTAGT 0.000574 CTATA 0.000821 CTATC 0.000454 CTATG 0.000461 CTATT 0.00145 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.00043 CTCAG 0.000369 CTCAT 0.000673 CTCCA 0.000488 CTCCC 0.000235 CTCCG 0.000226 CTCCT 0.00035 CTCGA 0.000486 CTCGC 0.000267 CTCGG 0.000239 CTCGT 0.000471 CTCTA 0.000605 CTCTC 0.000415 CTCTG 0.000397 CTCTT 0.000779 CTGAA 0.00106 CTGAC 0.000475 CTGAG 0.000369 CTGAT 0.000799 CTGCA 0.00057 CTGCC 0.000256 CTGCG 0.000277 CTGCT 0.000461 CTGGA 0.000482 CTGGC 0.000271 CTGGG 0.000235 CTGGT 0.000444 CTGTA 0.000928 CTGTC 0.000503 CTGTG 0.000577 CTGTT 0.00119 CTTAA 0.00154 CTTAC 0.000633 CTTAG 0.00049 CTTAT 0.00132 CTTCA 0.000907 CTTCC 0.000474 CTTCG 0.000439 CTTCT 0.000744 CTTGA 0.000967 CTTGC 0.000545 CTTGG 0.000509 CTTGT 0.00102 CTTTA 0.00179 CTTTC 0.00104 CTTTG 0.00115 CTTTT 0.00294 GAAAA 0.00419 GAAAC 0.00131 GAAAG 0.00104 GAAAT 0.00267 GAACA 0.000986 GAACC 0.000375 GAACG 0.000453 GAACT 0.000762 GAAGA 0.000821 GAAGC 0.000488 GAAGG 0.000443 GAAGT 0.000811 GAATA 0.00139 GAATC 0.000649 GAATG 0.00081 GAATT 0.00224 GACAA 0.00117 GACAC 0.000577 GACAG 0.000503 GACAT 0.000753 GACCA 0.000495 GACCC 0.000215 GACCG 0.000242 GACCT 0.000376 GACGA 0.000463 GACGC 0.000303 GACGG 0.000242 GACGT 0.000532 GACTA 0.000548 GACTC 0.000327 GACTG 0.0005 GACTT 0.000923 GAGAA 0.000983 GAGAC 0.000372 GAGAG 0.000415 GAGAT 0.000668 GAGCA 0.000505 GAGCC 0.000232 GAGCG 0.000286 GAGCT 0.000395 GAGGA 0.000406 GAGGC 0.000232 GAGGG 0.000248 GAGGT 0.00043 GAGTA 0.000559 GAGTC 0.000327 GAGTG 0.000523 GAGTT 0.000886 GATAA 0.00176 GATAC 0.000471 GATAG 0.000454 GATAT 0.00103 GATCA 0.000614 GATCC 0.000249 GATCG 0.000307 GATCT 0.000437 GATGA 0.000701 GATGC 0.000366 GATGG 0.000373 GATGT 0.000724 GATTA 0.00132 GATTC 0.000649 GATTG 0.000783 GATTT 0.00257 GCAAA 0.00188 GCAAC 0.000702 GCAAG 0.000545 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000679 GCACC 0.000344 GCACG 0.000279 GCACT 0.000586 GCAGA 0.000473 GCAGC 0.000321 GCAGG 0.000248 GCAGT 0.000521 GCATA 0.000588 GCATC 0.000366 GCATG 0.000379 GCATT 0.00112 GCCAA 0.000826 GCCAC 0.000421 GCCAG 0.000271 GCCAT 0.000504 GCCCA 0.000295 GCCCC 0.000238 GCCCG 0.000146 GCCCT 0.000256 GCCGA 0.000322 GCCGC 0.000242 GCCGG 0.000197 GCCGT 0.000274 GCCTA 0.000309 GCCTC 0.000232 GCCTG 0.000219 GCCTT 0.000495 GCGAA 0.000627 GCGAC 0.000345 GCGAG 0.000267 GCGAT 0.000495 GCGCA 0.000363 GCGCC 0.000294 GCGCG 0.00021 GCGCT 0.000319 GCGGA 0.000263 GCGGC 0.000242 GCGGG 0.00015 GCGGT 0.000293 GCGTA 0.000341 GCGTC 0.000303 GCGTG 0.000279 GCGTT 0.000631 GCTAA 0.000793 GCTAC 0.000376 GCTAG 0.000273 GCTAT 0.000543 GCTCA 0.000463 GCTCC 0.000268 GCTCG 0.00027 GCTCT 0.000416 GCTGA 0.000494 GCTGC 0.000321 GCTGG 0.000266 GCTGT 0.000567 GCTTA 0.000661 GCTTC 0.000488 GCTTG 0.000502 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00156 GGAAC 0.000499 GGAAG 0.000474 GGAAT 0.000903 GGACA 0.000468 GGACC 0.000209 GGACG 0.000273 GGACT 0.000362 GGAGA 0.000417 GGAGC 0.000268 GGAGG 0.000262 GGAGT 0.000354 GGATA 0.000477 GGATC 0.000249 GGATG 0.000351 GGATT 0.00078 GGCAA 0.000744 GGCAC 0.000357 GGCAG 0.000256 GGCAT 0.000377 GGCCA 0.000361 GGCCC 0.000199 GGCCG 0.000213 GGCCT 0.000234 GGCGA 0.00034 GGCGC 0.000294 GGCGG 0.000239 GGCGT 0.000308 GGCTA 0.000309 GGCTC 0.000232 GGCTG 0.0003 GGCTT 0.000487 GGGAA 0.000588 GGGAC 0.000249 GGGAG 0.000235 GGGAT 0.000318 GGGCA 0.000284 GGGCC 0.000199 GGGCG 0.000215 GGGCT 0.000236 GGGGA 0.000264 GGGGC 0.000238 GGGGG 0.000227 GGGGT 0.000294 GGGTA 0.000319 GGGTC 0.000215 GGGTG 0.000368 GGGTT 0.000512 GGTAA 0.000913 GGTAC 0.000386 GGTAG 0.000351 GGTAT 0.000573 GGTCA 0.000514 GGTCC 0.000209 GGTCG 0.000296 GGTCT 0.00031 GGTGA 0.000534 GGTGC 0.000344 GGTGG 0.000402 GGTGT 0.000642 GGTTA 0.000731 GGTTC 0.000375 GGTTG 0.000552 GGTTT 0.00137 GTAAA 0.0025 GTAAC 0.000833 GTAAG 0.000633 GTAAT 0.00183 GTACA 0.000901 GTACC 0.000386 GTACG 0.000319 GTACT 0.000642 GTAGA 0.000675 GTAGC 0.000376 GTAGG 0.000401 GTAGT 0.000672 GTATA 0.00103 GTATC 0.000471 GTATG 0.000524 GTATT 0.00178 GTCAA 0.00117 GTCAC 0.000638 GTCAG 0.000475 GTCAT 0.00083 GTCCA 0.000476 GTCCC 0.000249 GTCCG 0.000247 GTCCT 0.00034 GTCGA 0.000463 GTCGC 0.000345 GTCGG 0.0003 GTCGT 0.00048 GTCTA 0.000528 GTCTC 0.000372 GTCTG 0.000429 GTCTT 0.000828 GTGAA 0.00115 GTGAC 0.000638 GTGAG 0.00043 GTGAT 0.000976 GTGCA 0.000668 GTGCC 0.000357 GTGCG 0.000344 GTGCT 0.000519 GTGGA 0.000563 GTGGC 0.000421 GTGGG 0.000347 GTGGT 0.000612 GTGTA 0.000912 GTGTC 0.000577 GTGTG 0.0007 GTGTT 0.00149 GTTAA 0.00177 GTTAC 0.000833 GTTAG 0.000664 GTTAT 0.00172 GTTCA 0.000857 GTTCC 0.000499 GTTCG 0.00047 GTTCT 0.000751 GTTGA 0.000959 GTTGC 0.000702 GTTGG 0.000702 GTTGT 0.00129 GTTTA 0.00213 GTTTC 0.00131 GTTTG 0.0015 GTTTT 0.0042 TAAAA 0.00756 TAAAC 0.00213 TAAAG 0.00179 TAAAT 0.00509 TAACA 0.00201 TAACC 0.000731 TAACG 0.000723 TAACT 0.00153 TAAGA 0.00124 TAAGC 0.000661 TAAGG 0.000598 TAAGT 0.00149 TAATA 0.00364 TAATC 0.00132 TAATG 0.00157 TAATT 0.00549 TACAA 0.00231 TACAC 0.000912 TACAG 0.000928 TACAT 0.0015 TACCA 0.000801 TACCC 0.000319 TACCG 0.000346 TACCT 0.000756 TACGA 0.000753 TACGC 0.000341 TACGG 0.000333 TACGT 0.000801 TACTA 0.000963 TACTC 0.000559 TACTG 0.000719 TACTT 0.00164 TAGAA 0.00158 TAGAC 0.000528 TAGAG 0.000605 TAGAT 0.00103 TAGCA 0.000733 TAGCC 0.000309 TAGCG 0.000348 TAGCT 0.000596 TAGGA 0.000548 TAGGC 0.000309 TAGGG 0.000329 TAGGT 0.00074 TAGTA 0.000963 TAGTC 0.000548 TAGTG 0.000723 TAGTT 0.00169 TATAA 0.00288 TATAC 0.00103 TATAG 0.000821 TATAT 0.00196 TATCA 0.00138 TATCC 0.000477 TATCG 0.000647 TATCT 0.00122 TATGA 0.00112 TATGC 0.000588 TATGG 0.000585 TATGT 0.0014 TATTA 0.00364 TATTC 0.00139 TATTG 0.00192 TATTT 0.00661 TCAAA 0.00312 TCAAC 0.000959 TCAAG 0.000967 TCAAT 0.00175 TCACA 0.00119 TCACC 0.000534 TCACG 0.000469 TCACT 0.001 TCAGA 0.000797 TCAGC 0.000494 TCAGG 0.000408 TCAGT 0.00101 TCATA 0.00112 TCATC 0.000701 TCATG 0.000654 TCATT 0.00206 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000563 TCCAG 0.000482 TCCAT 0.000717 TCCCA 0.000489 TCCCC 0.000264 TCCCG 0.000258 TCCCT 0.000378 TCCGA 0.000452 TCCGC 0.000263 TCCGG 0.000312 TCCGT 0.000391 TCCTA 0.000548 TCCTC 0.000406 TCCTG 0.00045 TCCTT 0.000781 TCGAA 0.0011 TCGAC 0.000463 TCGAG 0.000486 TCGAT 0.000804 TCGCA 0.000571 TCGCC 0.00034 TCGCG 0.000304 TCGCT 0.00052 TCGGA 0.000452 TCGGC 0.000322 TCGGG 0.00028 TCGGT 0.000498 TCGTA 0.000753 TCGTC 0.000463 TCGTG 0.0005 TCGTT 0.00102 TCTAA 0.00145 TCTAC 0.000675 TCTAG 0.000604 TCTAT 0.00101 TCTCA 0.000788 TCTCC 0.000417 TCTCG 0.000453 TCTCT 0.00078 TCTGA 0.000797 TCTGC 0.000473 TCTGG 0.000445 TCTGT 0.00102 TCTTA 0.00124 TCTTC 0.000821 TCTTG 0.000907 TCTTT 0.00199 TGAAA 0.00318 TGAAC 0.000857 TGAAG 0.000907 TGAAT 0.00183 TGACA 0.0012 TGACC 0.000514 TGACG 0.000559 TGACT 0.000842 TGAGA 0.000788 TGAGC 0.000463 TGAGG 0.000418 TGAGT 0.000835 TGATA 0.00138 TGATC 0.000614 TGATG 0.000811 TGATT 0.00205 TGCAA 0.00161 TGCAC 0.000668 TGCAG 0.00057 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.000704 TGCCC 0.000284 TGCCG 0.000303 TGCCT 0.000444 TGCGA 0.000571 TGCGC 0.000363 TGCGG 0.000295 TGCGT 0.000556 TGCTA 0.000733 TGCTC 0.000505 TGCTG 0.000535 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000476 TGGAG 0.000488 TGGAT 0.000667 TGGCA 0.000704 TGGCC 0.000361 TGGCG 0.000466 TGGCT 0.000495 TGGGA 0.000489 TGGGC 0.000295 TGGGG 0.000366 TGGGT 0.000491 TGGTA 0.000801 TGGTC 0.000495 TGGTG 0.000713 TGGTT 0.0011 TGTAA 0.00228 TGTAC 0.000901 TGTAG 0.000836 TGTAT 0.00162 TGTCA 0.0012 TGTCC 0.000468 TGTCG 0.000498 TGTCT 0.000839 TGTGA 0.00119 TGTGC 0.000679 TGTGG 0.000686 TGTGT 0.00138 TGTTA 0.00201 TGTTC 0.000986 TGTTG 0.00149 TGTTT 0.00358 TTAAA 0.00606 TTAAC 0.00177 TTAAG 0.00154 TTAAT 0.00462 TTACA 0.00228 TTACC 0.000913 TTACG 0.000978 TTACT 0.00162 TTAGA 0.00145 TTAGC 0.000793 TTAGG 0.000779 TTAGT 0.00155 TTATA 0.00288 TTATC 0.00176 TTATG 0.00172 TTATT 0.00683 TTCAA 0.00274 TTCAC 0.00115 TTCAG 0.00106 TTCAT 0.00182 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.000588 TTCCG 0.000603 TTCCT 0.000968 TTCGA 0.0011 TTCGC 0.000627 TTCGG 0.000602 TTCGT 0.00107 TTCTA 0.00158 TTCTC 0.000983 TTCTG 0.00117 TTCTT 0.00211 TTGAA 0.00274 TTGAC 0.00117 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.00185 TTGCA 0.00161 TTGCC 0.000744 TTGCG 0.00071 TTGCT 0.00119 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.000826 TTGGG 0.00068 TTGGT 0.00133 TTGTA 0.00231 TTGTC 0.00117 TTGTG 0.00168 TTGTT 0.00345 TTTAA 0.00606 TTTAC 0.0025 TTTAG 0.00197 TTTAT 0.00604 TTTCA 0.00318 TTTCC 0.00156 TTTCG 0.0016 TTTCT 0.00287 TTTGA 0.00312 TTTGC 0.00188 TTTGG 0.00177 TTTGT 0.00382 TTTTA 0.00756 TTTTC 0.00419 TTTTG 0.00503 TTTTT 0.0136 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.448 AAAAC 0.1383 AAAAG 0.09681 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3922 AAACC 0.1494 AAACG 0.1631 AAACT 0.2953 AAAGA 0.2872 AAAGC 0.1779 AAAGG 0.139 AAAGT 0.3959 AAATA 0.3255 AAATC 0.1266 AAATG 0.1565 AAATT 0.3914 AACAA 0.4271 AACAC 0.1847 AACAG 0.1469 AACAT 0.2413 AACCA 0.3652 AACCC 0.1694 AACCG 0.207 AACCT 0.2584 AACGA 0.3166 AACGC 0.1966 AACGG 0.1593 AACGT 0.3275 AACTA 0.2797 AACTC 0.1463 AACTG 0.2071 AACTT 0.3669 AAGAA 0.4262 AAGAC 0.1672 AAGAG 0.1574 AAGAT 0.2492 AAGCA 0.3497 AAGCC 0.1692 AAGCG 0.1999 AAGCT 0.2811 AAGGA 0.3079 AAGGC 0.1953 AAGGG 0.1779 AAGGT 0.3188 AAGTA 0.2676 AAGTC 0.1504 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3623 AATAA 0.504 AATAC 0.1317 AATAG 0.1072 AATAT 0.2571 AATCA 0.3857 AATCC 0.1466 AATCG 0.2047 AATCT 0.2629 AATGA 0.3175 AATGC 0.1718 AATGG 0.1581 AATGT 0.3525 AATTA 0.2987 AATTC 0.122 AATTG 0.1474 AATTT 0.432 ACAAA 0.4435 ACAAC 0.15 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2881 ACACA 0.3746 ACACC 0.1743 ACACG 0.1605 ACACT 0.2905 ACAGA 0.3186 ACAGC 0.1776 ACAGG 0.1599 ACAGT 0.3439 ACATA 0.2699 ACATC 0.1399 ACATG 0.1474 ACATT 0.4428 ACCAA 0.4266 ACCAC 0.1965 ACCAG 0.1426 ACCAT 0.2343 ACCCA 0.3477 ACCCC 0.2084 ACCCG 0.1609 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3264 ACCGC 0.192 ACCGG 0.2005 ACCGT 0.281 ACCTA 0.3033 ACCTC 0.1763 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.3312 ACGAA 0.3907 ACGAC 0.1756 ACGAG 0.1725 ACGAT 0.2612 ACGCA 0.3579 ACGCC 0.1985 ACGCG 0.1621 ACGCT 0.2815 ACGGA 0.3002 ACGGC 0.2107 ACGGG 0.1596 ACGGT 0.3296 ACGTA 0.267 ACGTC 0.1773 ACGTG 0.2052 ACGTT 0.3505 ACTAA 0.3937 ACTAC 0.171 ACTAG 0.146 ACTAT 0.2893 ACTCA 0.3636 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.212 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3222 ACTGC 0.1668 ACTGG 0.1595 ACTGT 0.3515 ACTTA 0.2427 ACTTC 0.1322 ACTTG 0.179 ACTTT 0.4461 AGAAA 0.4912 AGAAC 0.1285 AGAAG 0.1274 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3891 AGACC 0.1439 AGACG 0.1962 AGACT 0.2708 AGAGA 0.3552 AGAGC 0.1893 AGAGG 0.173 AGAGT 0.2825 AGATA 0.3311 AGATC 0.1191 AGATG 0.169 AGATT 0.3808 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.166 AGCAT 0.2184 AGCCA 0.3729 AGCCC 0.1776 AGCCG 0.2109 AGCCT 0.2386 AGCGA 0.3372 AGCGC 0.2069 AGCGG 0.1723 AGCGT 0.2836 AGCTA 0.2611 AGCTC 0.1731 AGCTG 0.2108 AGCTT 0.355 AGGAA 0.4431 AGGAC 0.1558 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2407 AGGCA 0.3535 AGGCC 0.1862 AGGCG 0.2079 AGGCT 0.2524 AGGGA 0.2937 AGGGC 0.199 AGGGG 0.1969 AGGGT 0.3104 AGGTA 0.3098 AGGTC 0.1539 AGGTG 0.2166 AGGTT 0.3198 AGTAA 0.4179 AGTAC 0.1654 AGTAG 0.1569 AGTAT 0.2598 AGTCA 0.3666 AGTCC 0.1577 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.254 AGTGA 0.309 AGTGC 0.1808 AGTGG 0.1802 AGTGT 0.33 AGTTA 0.2522 AGTTC 0.1259 AGTTG 0.1764 AGTTT 0.4455 ATAAA 0.4574 ATAAC 0.1305 ATAAG 0.09998 ATAAT 0.3121 ATACA 0.4258 ATACC 0.1504 ATACG 0.159 ATACT 0.2649 ATAGA 0.3161 ATAGC 0.1701 ATAGG 0.1573 ATAGT 0.3564 ATATA 0.2628 ATATC 0.1381 ATATG 0.1324 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3822 ATCAC 0.2012 ATCAG 0.1646 ATCAT 0.252 ATCCA 0.3599 ATCCC 0.1718 ATCCG 0.1846 ATCCT 0.2837 ATCGA 0.3314 ATCGC 0.2041 ATCGG 0.1701 ATCGT 0.2944 ATCTA 0.2807 ATCTC 0.1821 ATCTG 0.2011 ATCTT 0.3361 ATGAA 0.4001 ATGAC 0.1827 ATGAG 0.1481 ATGAT 0.2691 ATGCA 0.4139 ATGCC 0.1537 ATGCG 0.1847 ATGCT 0.2478 ATGGA 0.3082 ATGGC 0.2163 ATGGG 0.1622 ATGGT 0.3133 ATGTA 0.2889 ATGTC 0.1454 ATGTG 0.1896 ATGTT 0.3761 ATTAA 0.3845 ATTAC 0.1521 ATTAG 0.1205 ATTAT 0.3429 ATTCA 0.3586 ATTCC 0.1773 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2897 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1569 ATTGT 0.3903 ATTTA 0.2507 ATTTC 0.1314 ATTTG 0.1436 ATTTT 0.4744 CAAAA 0.475 CAAAC 0.1415 CAAAG 0.1084 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4074 CAACC 0.1512 CAACG 0.1491 CAACT 0.2923 CAAGA 0.2982 CAAGC 0.165 CAAGG 0.1754 CAAGT 0.3614 CAATA 0.3016 CAATC 0.1233 CAATG 0.1483 CAATT 0.4268 CACAA 0.4266 CACAC 0.1777 CACAG 0.1465 CACAT 0.2492 CACCA 0.3709 CACCC 0.1915 CACCG 0.1626 CACCT 0.275 CACGA 0.3106 CACGC 0.1734 CACGG 0.1332 CACGT 0.3828 CACTA 0.223 CACTC 0.1614 CACTG 0.1999 CACTT 0.4157 CAGAA 0.4276 CAGAC 0.157 CAGAG 0.1453 CAGAT 0.2701 CAGCA 0.3246 CAGCC 0.182 CAGCG 0.2019 CAGCT 0.2916 CAGGA 0.3238 CAGGC 0.1574 CAGGG 0.1864 CAGGT 0.3324 CAGTA 0.2303 CAGTC 0.1601 CAGTG 0.2076 CAGTT 0.402 CATAA 0.4659 CATAC 0.1417 CATAG 0.1248 CATAT 0.2676 CATCA 0.375 CATCC 0.1623 CATCG 0.176 CATCT 0.2868 CATGA 0.3062 CATGC 0.1774 CATGG 0.1594 CATGT 0.357 CATTA 0.2415 CATTC 0.1246 CATTG 0.145 CATTT 0.4889 CCAAA 0.4456 CCAAC 0.1763 CCAAG 0.1278 CCAAT 0.2503 CCACA 0.3533 CCACC 0.2073 CCACG 0.1384 CCACT 0.3011 CCAGA 0.3106 CCAGC 0.1859 CCAGG 0.1557 CCAGT 0.3478 CCATA 0.2516 CCATC 0.1605 CCATG 0.1463 CCATT 0.4416 CCCAA 0.415 CCCAC 0.2116 CCCAG 0.1432 CCCAT 0.2303 CCCCA 0.359 CCCCC 0.222 CCCCG 0.1706 CCCCT 0.2485 CCCGA 0.3482 CCCGC 0.1863 CCCGG 0.2075 CCCGT 0.258 CCCTA 0.2556 CCCTC 0.1926 CCCTG 0.2013 CCCTT 0.3505 CCGAA 0.3877 CCGAC 0.193 CCGAG 0.1537 CCGAT 0.2656 CCGCA 0.3113 CCGCC 0.2517 CCGCG 0.1566 CCGCT 0.2804 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.2008 CCGGG 0.1701 CCGGT 0.3118 CCGTA 0.256 CCGTC 0.1861 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3932 CCTAA 0.4044 CCTAC 0.2078 CCTAG 0.1276 CCTAT 0.2603 CCTCA 0.318 CCTCC 0.1992 CCTCG 0.1938 CCTCT 0.289 CCTGA 0.2937 CCTGC 0.1786 CCTGG 0.1604 CCTGT 0.3673 CCTTA 0.236 CCTTC 0.1746 CCTTG 0.2102 CCTTT 0.3792 CGAAA 0.4706 CGAAC 0.1383 CGAAG 0.1293 CGAAT 0.2618 CGACA 0.3132 CGACC 0.1865 CGACG 0.1795 CGACT 0.3208 CGAGA 0.3093 CGAGC 0.1843 CGAGG 0.1741 CGAGT 0.3323 CGATA 0.2669 CGATC 0.1269 CGATG 0.1571 CGATT 0.4491 CGCAA 0.3979 CGCAC 0.193 CGCAG 0.1555 CGCAT 0.2537 CGCCA 0.3942 CGCCC 0.1822 CGCCG 0.2027 CGCCT 0.2209 CGCGA 0.3326 CGCGC 0.2293 CGCGG 0.1625 CGCGT 0.2756 CGCTA 0.2253 CGCTC 0.1855 CGCTG 0.2159 CGCTT 0.3733 CGGAA 0.425 CGGAC 0.1744 CGGAG 0.1592 CGGAT 0.2414 CGGCA 0.2927 CGGCC 0.2055 CGGCG 0.2313 CGGCT 0.2706 CGGGA 0.3203 CGGGC 0.1812 CGGGG 0.2162 CGGGT 0.2823 CGGTA 0.2268 CGGTC 0.1585 CGGTG 0.2049 CGGTT 0.4098 CGTAA 0.439 CGTAC 0.143 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2718 CGTCA 0.363 CGTCC 0.1773 CGTCG 0.1852 CGTCT 0.2745 CGTGA 0.2917 CGTGC 0.1737 CGTGG 0.167 CGTGT 0.3676 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.141 CGTTG 0.1697 CGTTT 0.464 CTAAA 0.4307 CTAAC 0.1454 CTAAG 0.1073 CTAAT 0.3167 CTACA 0.3941 CTACC 0.1653 CTACG 0.1534 CTACT 0.2871 CTAGA 0.3561 CTAGC 0.1607 CTAGG 0.145 CTAGT 0.3382 CTATA 0.2575 CTATC 0.1425 CTATG 0.1446 CTATT 0.4554 CTCAA 0.4122 CTCAC 0.1718 CTCAG 0.1473 CTCAT 0.2688 CTCCA 0.3757 CTCCC 0.1811 CTCCG 0.1736 CTCCT 0.2696 CTCGA 0.3322 CTCGC 0.1827 CTCGG 0.163 CTCGT 0.3221 CTCTA 0.2755 CTCTC 0.189 CTCTG 0.1808 CTCTT 0.3547 CTGAA 0.3931 CTGAC 0.1757 CTGAG 0.1363 CTGAT 0.295 CTGCA 0.3641 CTGCC 0.1638 CTGCG 0.1772 CTGCT 0.2949 CTGGA 0.3369 CTGGC 0.1891 CTGGG 0.164 CTGGT 0.31 CTGTA 0.2905 CTGTC 0.1576 CTGTG 0.1807 CTGTT 0.3712 CTTAA 0.3868 CTTAC 0.1589 CTTAG 0.1231 CTTAT 0.3313 CTTCA 0.3536 CTTCC 0.185 CTTCG 0.1712 CTTCT 0.2902 CTTGA 0.318 CTTGC 0.1793 CTTGG 0.1674 CTTGT 0.3353 CTTTA 0.2589 CTTTC 0.1499 CTTTG 0.166 CTTTT 0.4252 GAAAA 0.4557 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1126 GAAAT 0.2897 GAACA 0.3828 GAACC 0.1457 GAACG 0.1757 GAACT 0.2957 GAAGA 0.3203 GAAGC 0.1904 GAAGG 0.1727 GAAGT 0.3166 GAATA 0.2733 GAATC 0.1274 GAATG 0.159 GAATT 0.4403 GACAA 0.3906 GACAC 0.1919 GACAG 0.1673 GACAT 0.2502 GACCA 0.3728 GACCC 0.1622 GACCG 0.1821 GACCT 0.2829 GACGA 0.3005 GACGC 0.1967 GACGG 0.1573 GACGT 0.3455 GACTA 0.2386 GACTC 0.1422 GACTG 0.2176 GACTT 0.4017 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1524 GAGAG 0.1703 GAGAT 0.2741 GAGCA 0.3559 GAGCC 0.1637 GAGCG 0.2019 GAGCT 0.2785 GAGGA 0.3086 GAGGC 0.1763 GAGGG 0.1882 GAGGT 0.3268 GAGTA 0.2438 GAGTC 0.1423 GAGTG 0.2279 GAGTT 0.386 GATAA 0.4737 GATAC 0.1266 GATAG 0.1222 GATAT 0.2774 GATCA 0.3819 GATCC 0.1547 GATCG 0.1913 GATCT 0.2721 GATGA 0.3238 GATGC 0.1691 GATGG 0.1726 GATGT 0.3345 GATTA 0.2476 GATTC 0.122 GATTG 0.1473 GATTT 0.483 GCAAA 0.4417 GCAAC 0.165 GCAAG 0.1281 GCAAT 0.2652 GCACA 0.3597 GCACC 0.182 GCACG 0.1479 GCACT 0.3104 GCAGA 0.3026 GCAGC 0.2054 GCAGG 0.1588 GCAGT 0.3332 GCATA 0.2402 GCATC 0.1494 GCATG 0.1547 GCATT 0.4557 GCCAA 0.4085 GCCAC 0.2084 GCCAG 0.1339 GCCAT 0.2492 GCCCA 0.3158 GCCCC 0.2542 GCCCG 0.156 GCCCT 0.274 GCCGA 0.3108 GCCGC 0.2341 GCCGG 0.1903 GCCGT 0.2648 GCCTA 0.2461 GCCTC 0.185 GCCTG 0.1744 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3615 GCGAC 0.199 GCGAG 0.1542 GCGAT 0.2853 GCGCA 0.3058 GCGCC 0.2483 GCGCG 0.1767 GCGCT 0.2691 GCGGA 0.2772 GCGGC 0.2556 GCGGG 0.1581 GCGGT 0.3091 GCGTA 0.2193 GCGTC 0.195 GCGTG 0.1795 GCGTT 0.4063 GCTAA 0.3996 GCTAC 0.1896 GCTAG 0.1374 GCTAT 0.2735 GCTCA 0.327 GCTCC 0.1891 GCTCG 0.1905 GCTCT 0.2934 GCTGA 0.2997 GCTGC 0.1949 GCTGG 0.1615 GCTGT 0.3439 GCTTA 0.2295 GCTTC 0.1694 GCTTG 0.1741 GCTTT 0.4269 GGAAA 0.4542 GGAAC 0.1451 GGAAG 0.138 GGAAT 0.2628 GGACA 0.3568 GGACC 0.1592 GGACG 0.208 GGACT 0.276 GGAGA 0.3205 GGAGC 0.2061 GGAGG 0.2014 GGAGT 0.272 GGATA 0.2568 GGATC 0.134 GGATG 0.1892 GGATT 0.42 GGCAA 0.429 GGCAC 0.206 GGCAG 0.1478 GGCAT 0.2171 GGCCA 0.3586 GGCCC 0.198 GGCCG 0.2113 GGCCT 0.2321 GGCGA 0.2876 GGCGC 0.2493 GGCGG 0.202 GGCGT 0.2612 GGCTA 0.2324 GGCTC 0.1747 GGCTG 0.2259 GGCTT 0.367 GGGAA 0.423 GGGAC 0.1787 GGGAG 0.1693 GGGAT 0.229 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2132 GGGCG 0.2302 GGGCT 0.2523 GGGGA 0.2578 GGGGC 0.2326 GGGGG 0.2216 GGGGT 0.288 GGGTA 0.2253 GGGTC 0.1523 GGGTG 0.2605 GGGTT 0.3619 GGTAA 0.4107 GGTAC 0.1737 GGTAG 0.1579 GGTAT 0.2577 GGTCA 0.3865 GGTCC 0.1572 GGTCG 0.223 GGTCT 0.2333 GGTGA 0.278 GGTGC 0.1788 GGTGG 0.2093 GGTGT 0.3339 GGTTA 0.2417 GGTTC 0.1242 GGTTG 0.1827 GGTTT 0.4515 GTAAA 0.4318 GTAAC 0.1438 GTAAG 0.1092 GTAAT 0.3152 GTACA 0.4007 GTACC 0.1717 GTACG 0.1418 GTACT 0.2858 GTAGA 0.3179 GTAGC 0.1771 GTAGG 0.1886 GTAGT 0.3164 GTATA 0.2704 GTATC 0.1236 GTATG 0.1375 GTATT 0.4685 GTCAA 0.3764 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1526 GTCAT 0.2664 GTCCA 0.3626 GTCCC 0.1895 GTCCG 0.1884 GTCCT 0.2595 GTCGA 0.2916 GTCGC 0.2174 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.3023 GTCTA 0.2449 GTCTC 0.1724 GTCTG 0.1989 GTCTT 0.3838 GTGAA 0.3606 GTGAC 0.1995 GTGAG 0.1346 GTGAT 0.3053 GTGCA 0.3535 GTGCC 0.1892 GTGCG 0.1823 GTGCT 0.2751 GTGGA 0.2896 GTGGC 0.2168 GTGGG 0.1786 GTGGT 0.315 GTGTA 0.2478 GTGTC 0.1569 GTGTG 0.1902 GTGTT 0.4051 GTTAA 0.355 GTTAC 0.1669 GTTAG 0.133 GTTAT 0.345 GTTCA 0.3327 GTTCC 0.1936 GTTCG 0.1823 GTTCT 0.2913 GTTGA 0.2625 GTTGC 0.1922 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2331 GTTTC 0.1431 GTTTG 0.164 GTTTT 0.4598 TAAAA 0.4563 TAAAC 0.1286 TAAAG 0.1081 TAAAT 0.3071 TAACA 0.4026 TAACC 0.1464 TAACG 0.145 TAACT 0.306 TAAGA 0.3102 TAAGC 0.166 TAAGG 0.1501 TAAGT 0.3737 TAATA 0.3027 TAATC 0.1096 TAATG 0.1306 TAATT 0.4571 TACAA 0.409 TACAC 0.1616 TACAG 0.1644 TACAT 0.265 TACCA 0.3606 TACCC 0.1434 TACCG 0.1557 TACCT 0.3404 TACGA 0.3379 TACGC 0.153 TACGG 0.1495 TACGT 0.3597 TACTA 0.248 TACTC 0.1441 TACTG 0.1852 TACTT 0.4227 TAGAA 0.4219 TAGAC 0.1411 TAGAG 0.1618 TAGAT 0.2753 TAGCA 0.3692 TAGCC 0.1556 TAGCG 0.1751 TAGCT 0.3001 TAGGA 0.2845 TAGGC 0.1603 TAGGG 0.1708 TAGGT 0.3843 TAGTA 0.2451 TAGTC 0.1395 TAGTG 0.1841 TAGTT 0.4313 TATAA 0.4306 TATAC 0.1538 TATAG 0.1226 TATAT 0.293 TATCA 0.371 TATCC 0.1282 TATCG 0.174 TATCT 0.3269 TATGA 0.3045 TATGC 0.1592 TATGG 0.1584 TATGT 0.3779 TATTA 0.2683 TATTC 0.1027 TATTG 0.1414 TATTT 0.4876 TCAAA 0.4596 TCAAC 0.1411 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2571 TCACA 0.3728 TCACC 0.1672 TCACG 0.1467 TCACT 0.3133 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.1826 TCAGG 0.1509 TCAGT 0.3719 TCATA 0.2477 TCATC 0.1542 TCATG 0.144 TCATT 0.4541 TCCAA 0.3944 TCCAC 0.1933 TCCAG 0.1657 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.352 TCCCC 0.1899 TCCCG 0.1858 TCCCT 0.2724 TCCGA 0.3189 TCCGC 0.1855 TCCGG 0.2198 TCCGT 0.2757 TCCTA 0.2508 TCCTC 0.186 TCCTG 0.206 TCCTT 0.3573 TCGAA 0.3853 TCGAC 0.1624 TCGAG 0.1705 TCGAT 0.2818 TCGCA 0.3291 TCGCC 0.1958 TCGCG 0.1752 TCGCT 0.2998 TCGGA 0.2911 TCGGC 0.2074 TCGGG 0.1806 TCGGT 0.321 TCGTA 0.2755 TCGTC 0.1694 TCGTG 0.1829 TCGTT 0.3722 TCTAA 0.3888 TCTAC 0.1804 TCTAG 0.1614 TCTAT 0.2694 TCTCA 0.3232 TCTCC 0.171 TCTCG 0.1858 TCTCT 0.32 TCTGA 0.2917 TCTGC 0.1732 TCTGG 0.1628 TCTGT 0.3723 TCTTA 0.2497 TCTTC 0.1659 TCTTG 0.1831 TCTTT 0.4013 TGAAA 0.4696 TGAAC 0.1266 TGAAG 0.134 TGAAT 0.2699 TGACA 0.3858 TGACC 0.1647 TGACG 0.1793 TGACT 0.2702 TGAGA 0.3146 TGAGC 0.185 TGAGG 0.167 TGAGT 0.3333 TGATA 0.2841 TGATC 0.1264 TGATG 0.1671 TGATT 0.4224 TGCAA 0.4172 TGCAC 0.1728 TGCAG 0.1475 TGCAT 0.2625 TGCCA 0.4057 TGCCC 0.164 TGCCG 0.1746 TGCCT 0.2557 TGCGA 0.3199 TGCGC 0.2032 TGCGG 0.1653 TGCGT 0.3116 TGCTA 0.2636 TGCTC 0.1815 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3624 TGGAA 0.4394 TGGAC 0.1634 TGGAG 0.1678 TGGAT 0.2293 TGGCA 0.3475 TGGCC 0.1782 TGGCG 0.2299 TGGCT 0.2444 TGGGA 0.2977 TGGGC 0.1799 TGGGG 0.2232 TGGGT 0.2992 TGGTA 0.2574 TGGTC 0.159 TGGTG 0.2291 TGGTT 0.3544 TGTAA 0.4046 TGTAC 0.1596 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2875 TGTCA 0.3999 TGTCC 0.1557 TGTCG 0.1655 TGTCT 0.2789 TGTGA 0.3028 TGTGC 0.1726 TGTGG 0.1742 TGTGT 0.3504 TGTTA 0.249 TGTTC 0.1223 TGTTG 0.1845 TGTTT 0.4442 TTAAA 0.4332 TTAAC 0.1267 TTAAG 0.1101 TTAAT 0.3301 TTACA 0.3937 TTACC 0.1574 TTACG 0.1687 TTACT 0.2801 TTAGA 0.318 TTAGC 0.1733 TTAGG 0.1704 TTAGT 0.3382 TTATA 0.2185 TTATC 0.1334 TTATG 0.1304 TTATT 0.5176 TTCAA 0.4044 TTCAC 0.1702 TTCAG 0.1571 TTCAT 0.2684 TTCCA 0.3719 TTCCC 0.1712 TTCCG 0.1753 TTCCT 0.2816 TTCGA 0.3236 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.1773 TTCGT 0.3144 TTCTA 0.2703 TTCTC 0.1684 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.3612 TTGAA 0.4028 TTGAC 0.1725 TTGAG 0.1519 TTGAT 0.2728 TTGCA 0.3787 TTGCC 0.1748 TTGCG 0.1667 TTGCT 0.2798 TTGGA 0.2883 TTGGC 0.2073 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3335 TTGTA 0.2681 TTGTC 0.1365 TTGTG 0.1951 TTGTT 0.4003 TTTAA 0.3659 TTTAC 0.1511 TTTAG 0.1188 TTTAT 0.3643 TTTCA 0.3453 TTTCC 0.1696 TTTCG 0.1736 TTTCT 0.3116 TTTGA 0.2949 TTTGC 0.1774 TTTGG 0.1675 TTTGT 0.3602 TTTTA 0.2487 TTTTC 0.138 TTTTG 0.1655 TTTTT 0.4477 [2] # (a,c,g,t)= (0.315, 0.185, 0.185, 0.315) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.342 C 0.158 G 0.158 T 0.342 # l= 1 # Values AA 0.146 AC 0.0536 AG 0.0445 AT 0.0978 CA 0.0581 CC 0.0271 CG 0.0286 CT 0.0445 GA 0.0482 GC 0.0295 GG 0.0271 GT 0.0536 TA 0.0896 TC 0.0482 TG 0.0581 TT 0.146 # l= 2 # Values AAA 0.0657 AAC 0.0204 AAG 0.0165 AAT 0.0433 ACA 0.0207 ACC 0.00863 ACG 0.00882 ACT 0.0154 AGA 0.0137 AGC 0.00804 AGG 0.00728 AGT 0.0154 ATA 0.0272 ATC 0.0129 ATG 0.0145 ATT 0.0433 CAA 0.0237 CAC 0.0109 CAG 0.00898 CAT 0.0145 CCA 0.00986 CCC 0.00498 CCG 0.00501 CCT 0.00728 CGA 0.00911 CGC 0.00567 CGG 0.00501 CGT 0.00882 CTA 0.0115 CTC 0.00759 CTG 0.00897 CTT 0.0165 GAA 0.0194 GAC 0.00833 GAG 0.00759 GAT 0.0128 GCA 0.0103 GCC 0.00547 GCG 0.00567 GCT 0.00804 GGA 0.00805 GGC 0.00547 GGG 0.00497 GGT 0.00863 GTA 0.0139 GTC 0.00833 GTG 0.0109 GTT 0.0204 TAA 0.037 TAC 0.0139 TAG 0.0115 TAT 0.0272 TCA 0.0173 TCC 0.00805 TCG 0.00911 TCT 0.0137 TGA 0.0173 TGC 0.0103 TGG 0.00985 TGT 0.0207 TTA 0.037 TTC 0.0194 TTG 0.0237 TTT 0.0656 # l= 3 # Values AAAA 0.0297 AAAC 0.00911 AAAG 0.00686 AAAT 0.02 AACA 0.00803 AACC 0.00306 AACG 0.00327 AACT 0.00599 AAGA 0.00488 AAGC 0.0029 AAGG 0.00257 AAGT 0.0061 AATA 0.0133 AATC 0.00533 AATG 0.00648 AATT 0.0182 ACAA 0.00859 ACAC 0.00374 ACAG 0.0032 ACAT 0.00514 ACCA 0.00314 ACCC 0.00145 ACCG 0.00158 ACCT 0.00245 ACGA 0.00279 ACGC 0.00161 ACGG 0.00135 ACGT 0.00306 ACTA 0.00388 ACTC 0.00232 ACTG 0.00315 ACTT 0.00609 AGAA 0.00575 AGAC 0.00217 AGAG 0.0022 AGAT 0.00362 AGCA 0.00279 AGCC 0.00137 AGCG 0.00159 AGCT 0.00229 AGGA 0.00221 AGGC 0.00129 AGGG 0.00132 AGGT 0.00245 AGTA 0.00383 AGTC 0.00233 AGTG 0.00329 AGTT 0.006 ATAA 0.013 ATAC 0.00377 ATAG 0.00315 ATAT 0.00732 ATCA 0.00487 ATCC 0.00188 ATCG 0.00248 ATCT 0.00362 ATGA 0.00454 ATGC 0.00247 ATGG 0.00235 ATGT 0.00514 ATTA 0.0118 ATTC 0.00508 ATTG 0.00638 ATTT 0.02 CAAA 0.0106 CAAC 0.0037 CAAG 0.00308 CAAT 0.00639 CACA 0.00399 CACC 0.00198 CACG 0.00168 CACT 0.00329 CAGA 0.00272 CAGC 0.00169 CAGG 0.00142 CAGT 0.00315 CATA 0.00366 CATC 0.00219 CATG 0.00217 CATT 0.00648 CCAA 0.00403 CCAC 0.002 CCAG 0.00147 CCAT 0.00235 CCCA 0.0017 CCCC 0.00109 CCCG 0.000857 CCCT 0.00133 CCGA 0.00161 CCGC 0.00101 CCGG 0.00103 CCGT 0.00135 CCTA 0.00192 CCTC 0.00136 CCTG 0.00142 CCTT 0.00257 CGAA 0.00346 CGAC 0.00165 CGAG 0.00152 CGAT 0.00248 CGCA 0.00185 CGCC 0.00125 CGCG 0.000978 CGCT 0.00159 CGGA 0.00147 CGGC 0.0011 CGGG 0.000857 CGGT 0.00158 CGTA 0.00226 CGTC 0.00161 CGTG 0.00168 CGTT 0.00327 CTAA 0.00451 CTAC 0.00212 CTAG 0.0017 CTAT 0.00315 CTCA 0.00253 CTCC 0.00134 CTCG 0.00152 CTCT 0.0022 CTGA 0.00272 CTGC 0.00159 CTGG 0.00147 CTGT 0.0032 CTTA 0.00395 CTTC 0.00257 CTTG 0.00308 CTTT 0.00686 GAAA 0.00916 GAAC 0.00259 GAAG 0.00257 GAAT 0.00509 GACA 0.00304 GACC 0.00136 GACG 0.00161 GACT 0.00233 GAGA 0.00246 GAGC 0.00145 GAGG 0.00136 GAGT 0.00232 GATA 0.00371 GATC 0.00162 GATG 0.00219 GATT 0.00533 GCAA 0.00431 GCAC 0.00194 GCAG 0.00159 GCAT 0.00247 GCCA 0.00209 GCCC 0.000997 GCCG 0.0011 GCCT 0.00129 GCGA 0.0018 GCGC 0.00125 GCGG 0.00101 GCGT 0.00161 GCTA 0.00199 GCTC 0.00145 GCTG 0.00169 GCTT 0.0029 GGAA 0.00349 GGAC 0.00135 GGAG 0.00134 GGAT 0.00188 GGCA 0.00178 GGCC 0.00106 GGCG 0.00125 GGCT 0.00137 GGGA 0.00144 GGGC 0.000998 GGGG 0.00109 GGGT 0.00145 GGTA 0.00222 GGTC 0.00136 GGTG 0.00198 GGTT 0.00306 GTAA 0.00578 GTAC 0.00226 GTAG 0.00211 GTAT 0.00377 GTCA 0.00317 GTCC 0.00135 GTCG 0.00165 GTCT 0.00217 GTGA 0.00325 GTGC 0.00194 GTGG 0.002 GTGT 0.00374 GTTA 0.00496 GTTC 0.00259 GTTG 0.0037 GTTT 0.00911 TAAA 0.0163 TAAC 0.00497 TAAG 0.00395 TAAT 0.0118 TACA 0.00561 TACC 0.00222 TACG 0.00226 TACT 0.00383 TAGA 0.00368 TAGC 0.00199 TAGG 0.00192 TAGT 0.00388 TATA 0.00653 TATC 0.00371 TATG 0.00365 TATT 0.0133 TCAA 0.00678 TCAC 0.00325 TCAG 0.00272 TCAT 0.00454 TCCA 0.00293 TCCC 0.00144 TCCG 0.00147 TCCT 0.00221 TCGA 0.0029 TCGC 0.0018 TCGG 0.00161 TCGT 0.0028 TCTA 0.00368 TCTC 0.00246 TCTG 0.00271 TCTT 0.00488 TGAA 0.00672 TGAC 0.00317 TGAG 0.00253 TGAT 0.00487 TGCA 0.00389 TGCC 0.00178 TGCG 0.00185 TGCT 0.00279 TGGA 0.00293 TGGC 0.00209 TGGG 0.0017 TGGT 0.00314 TGTA 0.00561 TGTC 0.00304 TGTG 0.00399 TGTT 0.00803 TTAA 0.0137 TTAC 0.00578 TTAG 0.00451 TTAT 0.013 TTCA 0.00672 TTCC 0.00349 TTCG 0.00346 TTCT 0.00575 TTGA 0.00678 TTGC 0.00431 TTGG 0.00403 TTGT 0.00859 TTTA 0.0163 TTTC 0.00916 TTTG 0.0105 TTTT 0.0297 # l= 4 # Values AAAAA 0.0132 AAAAC 0.00416 AAAAG 0.0029 AAAAT 0.0094 AAACA 0.00356 AAACC 0.00137 AAACG 0.00151 AAACT 0.00266 AAAGA 0.00195 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000974 AAAGT 0.0027 AAATA 0.00647 AAATC 0.00257 AAATG 0.00315 AAATT 0.0078 AACAA 0.00343 AACAC 0.0015 AACAG 0.00118 AACAT 0.00192 AACCA 0.00111 AACCC 0.000528 AACCG 0.000643 AACCT 0.000782 AACGA 0.00103 AACGC 0.000647 AACGG 0.000528 AACGT 0.00106 AACTA 0.00166 AACTC 0.000887 AACTG 0.00126 AACTT 0.00219 AAGAA 0.00207 AAGAC 0.000829 AAGAG 0.000778 AAGAT 0.00121 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.0005 AAGCG 0.000592 AAGCT 0.000806 AAGGA 0.000788 AAGGC 0.000506 AAGGG 0.000469 AAGGT 0.00081 AAGTA 0.00162 AAGTC 0.000927 AAGTG 0.00137 AAGTT 0.00219 AATAA 0.0067 AATAC 0.00177 AATAG 0.00144 AATAT 0.0034 AATCA 0.00206 AATCC 0.000789 AATCG 0.00111 AATCT 0.00138 AATGA 0.00206 AATGC 0.00112 AATGG 0.00103 AATGT 0.00227 AATTA 0.00541 AATTC 0.00223 AATTG 0.00272 AATTT 0.0078 ACAAA 0.00379 ACAAC 0.0013 ACAAG 0.00103 ACAAT 0.00247 ACACA 0.0014 ACACC 0.000657 ACACG 0.000611 ACACT 0.00108 ACAGA 0.00101 ACAGC 0.000576 ACAGG 0.000513 ACAGT 0.0011 ACATA 0.00138 ACATC 0.000723 ACATG 0.000771 ACATT 0.00227 ACCAA 0.00133 ACCAC 0.000625 ACCAG 0.000452 ACCAT 0.000724 ACCCA 0.000502 ACCCC 0.000309 ACCCG 0.000239 ACCCT 0.000401 ACCGA 0.000512 ACCGC 0.000309 ACCGG 0.000319 ACCGT 0.000444 ACCTA 0.000732 ACCTC 0.00044 ACCTG 0.000472 ACCTT 0.00081 ACGAA 0.00109 ACGAC 0.000495 ACGAG 0.000487 ACGAT 0.000726 ACGCA 0.000573 ACGCC 0.000323 ACGCG 0.000268 ACGCT 0.000448 ACGGA 0.000402 ACGGC 0.000289 ACGGG 0.000218 ACGGT 0.000444 ACGTA 0.000809 ACGTC 0.000548 ACGTG 0.000639 ACGTT 0.00106 ACTAA 0.00152 ACTAC 0.000668 ACTAG 0.000573 ACTAT 0.00112 ACTCA 0.00084 ACTCC 0.000363 ACTCG 0.000505 ACTCT 0.000616 ACTGA 0.00101 ACTGC 0.000528 ACTGG 0.000512 ACTGT 0.0011 ACTTA 0.00148 ACTTC 0.000806 ACTTG 0.00111 ACTTT 0.0027 AGAAA 0.00282 AGAAC 0.000744 AGAAG 0.000737 AGAAT 0.00145 AGACA 0.000837 AGACC 0.000312 AGACG 0.000436 AGACT 0.000583 AGAGA 0.000774 AGAGC 0.00042 AGAGG 0.000389 AGAGT 0.000616 AGATA 0.00119 AGATC 0.000435 AGATG 0.000619 AGATT 0.00138 AGCAA 0.00119 AGCAC 0.000526 AGCAG 0.000464 AGCAT 0.000603 AGCCA 0.000508 AGCCC 0.00025 AGCCG 0.000293 AGCCT 0.00032 AGCGA 0.000531 AGCGC 0.000335 AGCGG 0.000277 AGCGT 0.000448 AGCTA 0.000589 AGCTC 0.0004 AGCTG 0.000491 AGCTT 0.000806 AGGAA 0.000979 AGGAC 0.000346 AGGAG 0.000358 AGGAT 0.000529 AGGCA 0.000449 AGGCC 0.000244 AGGCG 0.000273 AGGCT 0.00032 AGGGA 0.000386 AGGGC 0.000269 AGGGG 0.000269 AGGGT 0.000401 AGGTA 0.00075 AGGTC 0.000384 AGGTG 0.000539 AGGTT 0.000782 AGTAA 0.0016 AGTAC 0.000642 AGTAG 0.000601 AGTAT 0.00099 AGTCA 0.000849 AGTCC 0.000371 AGTCG 0.000524 AGTCT 0.000583 AGTGA 0.00101 AGTGC 0.000598 AGTGG 0.0006 AGTGT 0.00108 AGTTA 0.0015 AGTTC 0.000761 AGTTG 0.00107 AGTTT 0.00266 ATAAA 0.00595 ATAAC 0.00171 ATAAG 0.0013 ATAAT 0.00402 ATACA 0.0016 ATACC 0.000564 ATACG 0.000608 ATACT 0.00099 ATAGA 0.000988 ATAGC 0.000541 ATAGG 0.000499 ATAGT 0.00112 ATATA 0.00192 ATATC 0.00102 ATATG 0.000975 ATATT 0.0034 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.000992 ATCAG 0.000802 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.00067 ATCCC 0.000328 ATCCG 0.00035 ATCCT 0.000529 ATCGA 0.000817 ATCGC 0.000511 ATCGG 0.000426 ATCGT 0.000726 ATCTA 0.001 ATCTC 0.000674 ATCTG 0.000734 ATCTT 0.00121 ATGAA 0.0018 ATGAC 0.000835 ATGAG 0.00068 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000385 ATGCG 0.000466 ATGCT 0.000603 ATGGA 0.000721 ATGGC 0.000516 ATGGG 0.000386 ATGGT 0.000724 ATGTA 0.00148 ATGTC 0.000752 ATGTG 0.000988 ATGTT 0.00192 ATTAA 0.00454 ATTAC 0.00183 ATTAG 0.00143 ATTAT 0.00402 ATTCA 0.00181 ATTCC 0.000915 ATTCG 0.00091 ATTCT 0.00145 ATTGA 0.00175 ATTGC 0.00115 ATTGG 0.00101 ATTGT 0.00247 ATTTA 0.00501 ATTTC 0.00267 ATTTG 0.00291 ATTTT 0.0094 CAAAA 0.00496 CAAAC 0.00152 CAAAG 0.00116 CAAAT 0.00291 CAACA 0.0015 CAACC 0.000568 CAACG 0.000558 CAACT 0.00107 CAAGA 0.000905 CAAGC 0.000514 CAAGG 0.000547 CAAGT 0.00111 CAATA 0.00191 CAATC 0.000799 CAATG 0.000954 CAATT 0.00272 CACAA 0.00169 CACAC 0.000722 CACAG 0.000585 CACAT 0.000988 CACCA 0.000729 CACCC 0.000379 CACCG 0.000332 CACCT 0.000539 CACGA 0.00052 CACGC 0.000295 CACGG 0.000228 CACGT 0.000639 CACTA 0.000723 CACTC 0.000539 CACTG 0.000659 CACTT 0.00137 CAGAA 0.00115 CAGAC 0.000433 CAGAG 0.000399 CAGAT 0.000734 CAGCA 0.000544 CAGCC 0.000313 CAGCG 0.000343 CAGCT 0.000491 CAGGA 0.000463 CAGGC 0.000225 CAGGG 0.000262 CAGGT 0.000472 CAGTA 0.000715 CAGTC 0.000513 CAGTG 0.000659 CAGTT 0.00126 CATAA 0.00171 CATAC 0.00052 CATAG 0.000454 CATAT 0.000975 CATCA 0.00082 CATCC 0.000357 CATCG 0.000391 CATCT 0.000619 CATGA 0.000661 CATGC 0.000387 CATGG 0.000349 CATGT 0.000771 CATTA 0.00156 CATTC 0.000815 CATTG 0.000954 CATTT 0.00315 CCAAA 0.00178 CCAAC 0.000718 CCAAG 0.00052 CCAAT 0.00101 CCACA 0.000696 CCACC 0.000418 CCACG 0.000286 CCACT 0.0006 CCAGA 0.000451 CCAGC 0.000276 CCAGG 0.000232 CCAGT 0.000512 CCATA 0.000583 CCATC 0.000381 CCATG 0.000349 CCATT 0.00103 CCCAA 0.000702 CCCAC 0.000362 CCCAG 0.000247 CCCAT 0.000386 CCCCA 0.000388 CCCCC 0.000244 CCCCG 0.000189 CCCCT 0.000269 CCCGA 0.000298 CCCGC 0.000163 CCCGG 0.000178 CCCGT 0.000218 CCCTA 0.000334 CCCTC 0.000259 CCCTG 0.000262 CCCTT 0.000469 CCGAA 0.000621 CCGAC 0.000316 CCGAG 0.000252 CCGAT 0.000426 CCGCA 0.000311 CCGCC 0.000258 CCGCG 0.000161 CCGCT 0.000277 CCGGA 0.000321 CCGGC 0.000212 CCGGG 0.000178 CCGGT 0.000319 CCGTA 0.000341 CCGTC 0.000255 CCGTG 0.000228 CCGTT 0.000528 CCTAA 0.000779 CCTAC 0.0004 CCTAG 0.000246 CCTAT 0.000499 CCTCA 0.000428 CCTCC 0.000274 CCTCG 0.000268 CCTCT 0.000389 CCTGA 0.00042 CCTGC 0.000258 CCTGG 0.000232 CCTGT 0.000513 CCTTA 0.000603 CCTTC 0.000449 CCTTG 0.000547 CCTTT 0.000974 CGAAA 0.00162 CGAAC 0.000484 CGAAG 0.000446 CGAAT 0.00091 CGACA 0.000512 CGACC 0.000311 CGACG 0.000303 CGACT 0.000524 CGAGA 0.000468 CGAGC 0.000281 CGAGG 0.000268 CGAGT 0.000505 CGATA 0.000659 CGATC 0.00032 CGATG 0.000391 CGATT 0.00111 CGCAA 0.000732 CGCAC 0.000362 CGCAG 0.000288 CGCAT 0.000466 CGCCA 0.000487 CGCCC 0.000231 CGCCG 0.000261 CGCCT 0.000273 CGCGA 0.000323 CGCGC 0.000226 CGCGG 0.000161 CGCGT 0.000268 CGCTA 0.000356 CGCTC 0.0003 CGCTG 0.000343 CGCTT 0.000592 CGGAA 0.000622 CGGAC 0.000257 CGGAG 0.000237 CGGAT 0.00035 CGGCA 0.000318 CGGCC 0.000227 CGGCG 0.000261 CGGCT 0.000293 CGGGA 0.000271 CGGGC 0.000158 CGGGG 0.000189 CGGGT 0.000239 CGGTA 0.000354 CGGTC 0.000254 CGGTG 0.000332 CGGTT 0.000643 CGTAA 0.000998 CGTAC 0.000324 CGTAG 0.000332 CGTAT 0.000608 CGTCA 0.000578 CGTCC 0.000288 CGTCG 0.000303 CGTCT 0.000436 CGTGA 0.000488 CGTGC 0.000296 CGTGG 0.000286 CGTGT 0.000611 CGTTA 0.000734 CGTTC 0.000465 CGTTG 0.000558 CGTTT 0.00151 CTAAA 0.00192 CTAAC 0.000667 CTAAG 0.000485 CTAAT 0.00143 CTACA 0.000829 CTACC 0.000352 CTACG 0.000332 CTACT 0.000601 CTAGA 0.000603 CTAGC 0.000277 CTAGG 0.000246 CTAGT 0.000573 CTATA 0.000802 CTATC 0.000454 CTATG 0.000454 CTATT 0.00144 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.000444 CTCAG 0.000369 CTCAT 0.00068 CTCCA 0.000499 CTCCC 0.000246 CTCCG 0.000237 CTCCT 0.000358 CTCGA 0.000501 CTCGC 0.000281 CTCGG 0.000252 CTCGT 0.000487 CTCTA 0.000603 CTCTC 0.000418 CTCTG 0.000399 CTCTT 0.000778 CTGAA 0.00106 CTGAC 0.000487 CTGAG 0.000369 CTGAT 0.000802 CTGCA 0.000578 CTGCC 0.000265 CTGCG 0.000288 CTGCT 0.000464 CTGGA 0.00049 CTGGC 0.000282 CTGGG 0.000247 CTGGT 0.000452 CTGTA 0.000913 CTGTC 0.000516 CTGTG 0.000585 CTGTT 0.00118 CTTAA 0.00153 CTTAC 0.000635 CTTAG 0.000485 CTTAT 0.0013 CTTCA 0.000905 CTTCC 0.000481 CTTCG 0.000446 CTTCT 0.000737 CTTGA 0.000973 CTTGC 0.000557 CTTGG 0.00052 CTTGT 0.00103 CTTTA 0.00176 CTTTC 0.00104 CTTTG 0.00116 CTTTT 0.0029 GAAAA 0.00414 GAAAC 0.00132 GAAAG 0.00104 GAAAT 0.00267 GAACA 0.000984 GAACC 0.000382 GAACG 0.000465 GAACT 0.000761 GAAGA 0.000816 GAAGC 0.000497 GAAGG 0.000449 GAAGT 0.000806 GAATA 0.00138 GAATC 0.000654 GAATG 0.000815 GAATT 0.00223 GACAA 0.00118 GACAC 0.000588 GACAG 0.000516 GACAT 0.000752 GACCA 0.000502 GACCC 0.000223 GACCG 0.000254 GACCT 0.000384 GACGA 0.00048 GACGC 0.000322 GACGG 0.000255 GACGT 0.000548 GACTA 0.000549 GACTC 0.000337 GACTG 0.000513 GACTT 0.000927 GAGAA 0.000983 GAGAC 0.000381 GAGAG 0.000418 GAGAT 0.000674 GAGCA 0.000512 GAGCC 0.000243 GAGCG 0.0003 GAGCT 0.0004 GAGGA 0.000417 GAGGC 0.000243 GAGGG 0.000259 GAGGT 0.00044 GAGTA 0.000559 GAGTC 0.000337 GAGTG 0.000539 GAGTT 0.000887 GATAA 0.00177 GATAC 0.000467 GATAG 0.000454 GATAT 0.00102 GATCA 0.000614 GATCC 0.000254 GATCG 0.00032 GATCT 0.000435 GATGA 0.00071 GATGC 0.000372 GATGG 0.000381 GATGT 0.000723 GATTA 0.00131 GATTC 0.000654 GATTG 0.000799 GATTT 0.00257 GCAAA 0.00189 GCAAC 0.000711 GCAAG 0.000557 GCAAT 0.00115 GCACA 0.000689 GCACC 0.000357 GCACG 0.000296 GCACT 0.000598 GCAGA 0.000473 GCAGC 0.000335 GCAGG 0.000258 GCAGT 0.000528 GCATA 0.000586 GCATC 0.000372 GCATG 0.000387 GCATT 0.00112 GCCAA 0.000846 GCCAC 0.000443 GCCAG 0.000282 GCCAT 0.000516 GCCCA 0.000311 GCCCC 0.00026 GCCCG 0.000158 GCCCT 0.000269 GCCGA 0.000338 GCCGC 0.000261 GCCGG 0.000212 GCCGT 0.000289 GCCTA 0.000312 GCCTC 0.000243 GCCTG 0.000225 GCCTT 0.000506 GCGAA 0.000645 GCGAC 0.00036 GCGAG 0.000281 GCGAT 0.000511 GCGCA 0.000379 GCGCC 0.000314 GCGCG 0.000226 GCGCT 0.000335 GCGGA 0.000276 GCGGC 0.000261 GCGGG 0.000163 GCGGT 0.000309 GCGTA 0.000349 GCGTC 0.000322 GCGTG 0.000295 GCGTT 0.000647 GCTAA 0.000791 GCTAC 0.000381 GCTAG 0.000277 GCTAT 0.000541 GCTCA 0.000474 GCTCC 0.00028 GCTCG 0.000281 GCTCT 0.00042 GCTGA 0.000504 GCTGC 0.000335 GCTGG 0.000276 GCTGT 0.000576 GCTTA 0.000664 GCTTC 0.000497 GCTTG 0.000514 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00158 GGAAC 0.000509 GGAAG 0.000481 GGAAT 0.000915 GGACA 0.000473 GGACC 0.000215 GGACG 0.000288 GGACT 0.000371 GGAGA 0.000425 GGAGC 0.00028 GGAGG 0.000274 GGAGT 0.000363 GGATA 0.000479 GGATC 0.000254 GGATG 0.000357 GGATT 0.000789 GGCAA 0.000762 GGCAC 0.000371 GGCAG 0.000265 GGCAT 0.000385 GGCCA 0.000378 GGCCC 0.000216 GGCCG 0.000227 GGCCT 0.000244 GGCGA 0.000357 GGCGC 0.000314 GGCGG 0.000258 GGCGT 0.000323 GGCTA 0.000317 GGCTC 0.000243 GGCTG 0.000313 GGCTT 0.0005 GGGAA 0.000605 GGGAC 0.000259 GGGAG 0.000246 GGGAT 0.000328 GGGCA 0.000299 GGGCC 0.000216 GGGCG 0.000231 GGGCT 0.00025 GGGGA 0.00028 GGGGC 0.00026 GGGGG 0.000244 GGGGT 0.000309 GGGTA 0.000321 GGGTC 0.000223 GGGTG 0.000379 GGGTT 0.000528 GGTAA 0.000915 GGTAC 0.000392 GGTAG 0.000352 GGTAT 0.000564 GGTCA 0.000526 GGTCC 0.000215 GGTCG 0.000311 GGTCT 0.000312 GGTGA 0.000546 GGTGC 0.000357 GGTGG 0.000418 GGTGT 0.000657 GGTTA 0.00074 GGTTC 0.000382 GGTTG 0.000568 GGTTT 0.00137 GTAAA 0.00248 GTAAC 0.000838 GTAAG 0.000635 GTAAT 0.00183 GTACA 0.000907 GTACC 0.000392 GTACG 0.000324 GTACT 0.000642 GTAGA 0.000667 GTAGC 0.000381 GTAGG 0.0004 GTAGT 0.000668 GTATA 0.00101 GTATC 0.000467 GTATG 0.00052 GTATT 0.00177 GTCAA 0.00119 GTCAC 0.000657 GTCAG 0.000487 GTCAT 0.000835 GTCCA 0.000484 GTCCC 0.000259 GTCCG 0.000257 GTCCT 0.000346 GTCGA 0.000478 GTCGC 0.00036 GTCGG 0.000316 GTCGT 0.000495 GTCTA 0.000526 GTCTC 0.000381 GTCTG 0.000433 GTCTT 0.000829 GTGAA 0.00116 GTGAC 0.000657 GTGAG 0.000444 GTGAT 0.000992 GTGCA 0.000681 GTGCC 0.000371 GTGCG 0.000362 GTGCT 0.000526 GTGGA 0.000572 GTGGC 0.000443 GTGGG 0.000362 GTGGT 0.000625 GTGTA 0.000924 GTGTC 0.000588 GTGTG 0.000722 GTGTT 0.0015 GTTAA 0.00176 GTTAC 0.000838 GTTAG 0.000667 GTTAT 0.00171 GTTCA 0.000855 GTTCC 0.000509 GTTCG 0.000484 GTTCT 0.000744 GTTGA 0.000965 GTTGC 0.000711 GTTGG 0.000718 GTTGT 0.0013 GTTTA 0.00211 GTTTC 0.00132 GTTTG 0.00152 GTTTT 0.00416 TAAAA 0.00738 TAAAC 0.00211 TAAAG 0.00176 TAAAT 0.00501 TAACA 0.00199 TAACC 0.00074 TAACG 0.000734 TAACT 0.0015 TAAGA 0.00121 TAAGC 0.000664 TAAGG 0.000603 TAAGT 0.00148 TAATA 0.00353 TAATC 0.00131 TAATG 0.00156 TAATT 0.00541 TACAA 0.00229 TACAC 0.000924 TACAG 0.000913 TACAT 0.00148 TACCA 0.000798 TACCC 0.000321 TACCG 0.000354 TACCT 0.00075 TACGA 0.000762 TACGC 0.000349 TACGG 0.000341 TACGT 0.000809 TACTA 0.000942 TACTC 0.000559 TACTG 0.000715 TACTT 0.00162 TAGAA 0.00155 TAGAC 0.000526 TAGAG 0.000603 TAGAT 0.001 TAGCA 0.000727 TAGCC 0.000317 TAGCG 0.000356 TAGCT 0.000589 TAGGA 0.000545 TAGGC 0.000312 TAGGG 0.000334 TAGGT 0.000732 TAGTA 0.000942 TAGTC 0.000549 TAGTG 0.000723 TAGTT 0.00166 TATAA 0.0028 TATAC 0.00101 TATAG 0.000802 TATAT 0.00192 TATCA 0.00138 TATCC 0.000479 TATCG 0.000659 TATCT 0.00119 TATGA 0.00111 TATGC 0.000586 TATGG 0.000583 TATGT 0.00138 TATTA 0.00353 TATTC 0.00138 TATTG 0.00191 TATTT 0.00647 TCAAA 0.00309 TCAAC 0.000965 TCAAG 0.000973 TCAAT 0.00175 TCACA 0.00121 TCACC 0.000546 TCACG 0.000488 TCACT 0.00101 TCAGA 0.000785 TCAGC 0.000504 TCAGG 0.00042 TCAGT 0.00101 TCATA 0.00111 TCATC 0.00071 TCATG 0.000661 TCATT 0.00206 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000572 TCCAG 0.00049 TCCAT 0.000721 TCCCA 0.000499 TCCCC 0.00028 TCCCG 0.000271 TCCCT 0.000386 TCCGA 0.000466 TCCGC 0.000276 TCCGG 0.000321 TCCGT 0.000402 TCCTA 0.000545 TCCTC 0.000417 TCCTG 0.000463 TCCTT 0.000788 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.000478 TCGAG 0.000501 TCGAT 0.000817 TCGCA 0.000586 TCGCC 0.000357 TCGCG 0.000323 TCGCT 0.000531 TCGGA 0.000466 TCGGC 0.000338 TCGGG 0.000298 TCGGT 0.000512 TCGTA 0.000762 TCGTC 0.00048 TCGTG 0.00052 TCGTT 0.00103 TCTAA 0.00142 TCTAC 0.000667 TCTAG 0.000603 TCTAT 0.000988 TCTCA 0.000789 TCTCC 0.000425 TCTCG 0.000468 TCTCT 0.000774 TCTGA 0.000785 TCTGC 0.000473 TCTGG 0.000451 TCTGT 0.00101 TCTTA 0.00121 TCTTC 0.000816 TCTTG 0.000905 TCTTT 0.00195 TGAAA 0.00314 TGAAC 0.000855 TGAAG 0.000905 TGAAT 0.00181 TGACA 0.00122 TGACC 0.000526 TGACG 0.000578 TGACT 0.000849 TGAGA 0.000789 TGAGC 0.000474 TGAGG 0.000428 TGAGT 0.00084 TGATA 0.00138 TGATC 0.000614 TGATG 0.00082 TGATT 0.00206 TGCAA 0.00162 TGCAC 0.000681 TGCAG 0.000578 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.000717 TGCCC 0.000299 TGCCG 0.000318 TGCCT 0.000449 TGCGA 0.000586 TGCGC 0.000379 TGCGG 0.000311 TGCGT 0.000573 TGCTA 0.000727 TGCTC 0.000512 TGCTG 0.000544 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000484 TGGAG 0.000499 TGGAT 0.00067 TGGCA 0.000717 TGGCC 0.000378 TGGCG 0.000487 TGGCT 0.000508 TGGGA 0.000499 TGGGC 0.000311 TGGGG 0.000388 TGGGT 0.000502 TGGTA 0.000798 TGGTC 0.000502 TGGTG 0.000729 TGGTT 0.00111 TGTAA 0.00227 TGTAC 0.000907 TGTAG 0.000829 TGTAT 0.0016 TGTCA 0.00122 TGTCC 0.000473 TGTCG 0.000512 TGTCT 0.000837 TGTGA 0.00121 TGTGC 0.000689 TGTGG 0.000696 TGTGT 0.0014 TGTTA 0.00199 TGTTC 0.000984 TGTTG 0.0015 TGTTT 0.00356 TTAAA 0.00591 TTAAC 0.00176 TTAAG 0.00153 TTAAT 0.00454 TTACA 0.00227 TTACC 0.000915 TTACG 0.000998 TTACT 0.0016 TTAGA 0.00142 TTAGC 0.000791 TTAGG 0.000779 TTAGT 0.00152 TTATA 0.0028 TTATC 0.00177 TTATG 0.00171 TTATT 0.0067 TTCAA 0.0027 TTCAC 0.00116 TTCAG 0.00106 TTCAT 0.0018 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.000605 TTCCG 0.000622 TTCCT 0.000979 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000645 TTCGG 0.000621 TTCGT 0.00109 TTCTA 0.00155 TTCTC 0.000983 TTCTG 0.00115 TTCTT 0.00207 TTGAA 0.0027 TTGAC 0.00119 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00162 TTGCC 0.000762 TTGCG 0.000732 TTGCT 0.00119 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.000846 TTGGG 0.000702 TTGGT 0.00133 TTGTA 0.00229 TTGTC 0.00118 TTGTG 0.00169 TTGTT 0.00343 TTTAA 0.00591 TTTAC 0.00248 TTTAG 0.00192 TTTAT 0.00595 TTTCA 0.00314 TTTCC 0.00158 TTTCG 0.00162 TTTCT 0.00282 TTTGA 0.00309 TTTGC 0.00189 TTTGG 0.00178 TTTGT 0.00379 TTTTA 0.00738 TTTTC 0.00414 TTTTG 0.00496 TTTTT 0.0132 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.448 AAAAC 0.1383 AAAAG 0.09681 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3922 AAACC 0.1494 AAACG 0.1631 AAACT 0.2953 AAAGA 0.2872 AAAGC 0.1779 AAAGG 0.139 AAAGT 0.3959 AAATA 0.3255 AAATC 0.1266 AAATG 0.1565 AAATT 0.3914 AACAA 0.4271 AACAC 0.1847 AACAG 0.1469 AACAT 0.2413 AACCA 0.3652 AACCC 0.1694 AACCG 0.207 AACCT 0.2584 AACGA 0.3166 AACGC 0.1966 AACGG 0.1593 AACGT 0.3275 AACTA 0.2797 AACTC 0.1463 AACTG 0.2071 AACTT 0.3669 AAGAA 0.4262 AAGAC 0.1672 AAGAG 0.1574 AAGAT 0.2492 AAGCA 0.3497 AAGCC 0.1692 AAGCG 0.1999 AAGCT 0.2811 AAGGA 0.3079 AAGGC 0.1953 AAGGG 0.1779 AAGGT 0.3188 AAGTA 0.2676 AAGTC 0.1504 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3623 AATAA 0.504 AATAC 0.1317 AATAG 0.1072 AATAT 0.2571 AATCA 0.3857 AATCC 0.1466 AATCG 0.2047 AATCT 0.2629 AATGA 0.3175 AATGC 0.1718 AATGG 0.1581 AATGT 0.3525 AATTA 0.2987 AATTC 0.122 AATTG 0.1474 AATTT 0.432 ACAAA 0.4435 ACAAC 0.15 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2881 ACACA 0.3746 ACACC 0.1743 ACACG 0.1605 ACACT 0.2905 ACAGA 0.3186 ACAGC 0.1776 ACAGG 0.1599 ACAGT 0.3439 ACATA 0.2699 ACATC 0.1399 ACATG 0.1474 ACATT 0.4428 ACCAA 0.4266 ACCAC 0.1965 ACCAG 0.1426 ACCAT 0.2343 ACCCA 0.3477 ACCCC 0.2084 ACCCG 0.1609 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3264 ACCGC 0.192 ACCGG 0.2005 ACCGT 0.281 ACCTA 0.3033 ACCTC 0.1763 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.3312 ACGAA 0.3907 ACGAC 0.1756 ACGAG 0.1725 ACGAT 0.2612 ACGCA 0.3579 ACGCC 0.1985 ACGCG 0.1621 ACGCT 0.2815 ACGGA 0.3002 ACGGC 0.2107 ACGGG 0.1596 ACGGT 0.3296 ACGTA 0.267 ACGTC 0.1773 ACGTG 0.2052 ACGTT 0.3505 ACTAA 0.3937 ACTAC 0.171 ACTAG 0.146 ACTAT 0.2893 ACTCA 0.3636 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.212 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3222 ACTGC 0.1668 ACTGG 0.1595 ACTGT 0.3515 ACTTA 0.2427 ACTTC 0.1322 ACTTG 0.179 ACTTT 0.4461 AGAAA 0.4912 AGAAC 0.1285 AGAAG 0.1274 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3891 AGACC 0.1439 AGACG 0.1962 AGACT 0.2708 AGAGA 0.3552 AGAGC 0.1893 AGAGG 0.173 AGAGT 0.2825 AGATA 0.3311 AGATC 0.1191 AGATG 0.169 AGATT 0.3808 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.166 AGCAT 0.2184 AGCCA 0.3729 AGCCC 0.1776 AGCCG 0.2109 AGCCT 0.2386 AGCGA 0.3372 AGCGC 0.2069 AGCGG 0.1723 AGCGT 0.2836 AGCTA 0.2611 AGCTC 0.1731 AGCTG 0.2108 AGCTT 0.355 AGGAA 0.4431 AGGAC 0.1558 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2407 AGGCA 0.3535 AGGCC 0.1862 AGGCG 0.2079 AGGCT 0.2524 AGGGA 0.2937 AGGGC 0.199 AGGGG 0.1969 AGGGT 0.3104 AGGTA 0.3098 AGGTC 0.1539 AGGTG 0.2166 AGGTT 0.3198 AGTAA 0.4179 AGTAC 0.1654 AGTAG 0.1569 AGTAT 0.2598 AGTCA 0.3666 AGTCC 0.1577 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.254 AGTGA 0.309 AGTGC 0.1808 AGTGG 0.1802 AGTGT 0.33 AGTTA 0.2522 AGTTC 0.1259 AGTTG 0.1764 AGTTT 0.4455 ATAAA 0.4574 ATAAC 0.1305 ATAAG 0.09998 ATAAT 0.3121 ATACA 0.4258 ATACC 0.1504 ATACG 0.159 ATACT 0.2649 ATAGA 0.3161 ATAGC 0.1701 ATAGG 0.1573 ATAGT 0.3564 ATATA 0.2628 ATATC 0.1381 ATATG 0.1324 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3822 ATCAC 0.2012 ATCAG 0.1646 ATCAT 0.252 ATCCA 0.3599 ATCCC 0.1718 ATCCG 0.1846 ATCCT 0.2837 ATCGA 0.3314 ATCGC 0.2041 ATCGG 0.1701 ATCGT 0.2944 ATCTA 0.2807 ATCTC 0.1821 ATCTG 0.2011 ATCTT 0.3361 ATGAA 0.4001 ATGAC 0.1827 ATGAG 0.1481 ATGAT 0.2691 ATGCA 0.4139 ATGCC 0.1537 ATGCG 0.1847 ATGCT 0.2478 ATGGA 0.3082 ATGGC 0.2163 ATGGG 0.1622 ATGGT 0.3133 ATGTA 0.2889 ATGTC 0.1454 ATGTG 0.1896 ATGTT 0.3761 ATTAA 0.3845 ATTAC 0.1521 ATTAG 0.1205 ATTAT 0.3429 ATTCA 0.3586 ATTCC 0.1773 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2897 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1569 ATTGT 0.3903 ATTTA 0.2507 ATTTC 0.1314 ATTTG 0.1436 ATTTT 0.4744 CAAAA 0.475 CAAAC 0.1415 CAAAG 0.1084 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4074 CAACC 0.1512 CAACG 0.1491 CAACT 0.2923 CAAGA 0.2982 CAAGC 0.165 CAAGG 0.1754 CAAGT 0.3614 CAATA 0.3016 CAATC 0.1233 CAATG 0.1483 CAATT 0.4268 CACAA 0.4266 CACAC 0.1777 CACAG 0.1465 CACAT 0.2492 CACCA 0.3709 CACCC 0.1915 CACCG 0.1626 CACCT 0.275 CACGA 0.3106 CACGC 0.1734 CACGG 0.1332 CACGT 0.3828 CACTA 0.223 CACTC 0.1614 CACTG 0.1999 CACTT 0.4157 CAGAA 0.4276 CAGAC 0.157 CAGAG 0.1453 CAGAT 0.2701 CAGCA 0.3246 CAGCC 0.182 CAGCG 0.2019 CAGCT 0.2916 CAGGA 0.3238 CAGGC 0.1574 CAGGG 0.1864 CAGGT 0.3324 CAGTA 0.2303 CAGTC 0.1601 CAGTG 0.2076 CAGTT 0.402 CATAA 0.4659 CATAC 0.1417 CATAG 0.1248 CATAT 0.2676 CATCA 0.375 CATCC 0.1623 CATCG 0.176 CATCT 0.2868 CATGA 0.3062 CATGC 0.1774 CATGG 0.1594 CATGT 0.357 CATTA 0.2415 CATTC 0.1246 CATTG 0.145 CATTT 0.4889 CCAAA 0.4456 CCAAC 0.1763 CCAAG 0.1278 CCAAT 0.2503 CCACA 0.3533 CCACC 0.2073 CCACG 0.1384 CCACT 0.3011 CCAGA 0.3106 CCAGC 0.1859 CCAGG 0.1557 CCAGT 0.3478 CCATA 0.2516 CCATC 0.1605 CCATG 0.1463 CCATT 0.4416 CCCAA 0.415 CCCAC 0.2116 CCCAG 0.1432 CCCAT 0.2303 CCCCA 0.359 CCCCC 0.222 CCCCG 0.1706 CCCCT 0.2485 CCCGA 0.3482 CCCGC 0.1863 CCCGG 0.2075 CCCGT 0.258 CCCTA 0.2556 CCCTC 0.1926 CCCTG 0.2013 CCCTT 0.3505 CCGAA 0.3877 CCGAC 0.193 CCGAG 0.1537 CCGAT 0.2656 CCGCA 0.3113 CCGCC 0.2517 CCGCG 0.1566 CCGCT 0.2804 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.2008 CCGGG 0.1701 CCGGT 0.3118 CCGTA 0.256 CCGTC 0.1861 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3932 CCTAA 0.4044 CCTAC 0.2078 CCTAG 0.1276 CCTAT 0.2603 CCTCA 0.318 CCTCC 0.1992 CCTCG 0.1938 CCTCT 0.289 CCTGA 0.2937 CCTGC 0.1786 CCTGG 0.1604 CCTGT 0.3673 CCTTA 0.236 CCTTC 0.1746 CCTTG 0.2102 CCTTT 0.3792 CGAAA 0.4706 CGAAC 0.1383 CGAAG 0.1293 CGAAT 0.2618 CGACA 0.3132 CGACC 0.1865 CGACG 0.1795 CGACT 0.3208 CGAGA 0.3093 CGAGC 0.1843 CGAGG 0.1741 CGAGT 0.3323 CGATA 0.2669 CGATC 0.1269 CGATG 0.1571 CGATT 0.4491 CGCAA 0.3979 CGCAC 0.193 CGCAG 0.1555 CGCAT 0.2537 CGCCA 0.3942 CGCCC 0.1822 CGCCG 0.2027 CGCCT 0.2209 CGCGA 0.3326 CGCGC 0.2293 CGCGG 0.1625 CGCGT 0.2756 CGCTA 0.2253 CGCTC 0.1855 CGCTG 0.2159 CGCTT 0.3733 CGGAA 0.425 CGGAC 0.1744 CGGAG 0.1592 CGGAT 0.2414 CGGCA 0.2927 CGGCC 0.2055 CGGCG 0.2313 CGGCT 0.2706 CGGGA 0.3203 CGGGC 0.1812 CGGGG 0.2162 CGGGT 0.2823 CGGTA 0.2268 CGGTC 0.1585 CGGTG 0.2049 CGGTT 0.4098 CGTAA 0.439 CGTAC 0.143 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2718 CGTCA 0.363 CGTCC 0.1773 CGTCG 0.1852 CGTCT 0.2745 CGTGA 0.2917 CGTGC 0.1737 CGTGG 0.167 CGTGT 0.3676 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.141 CGTTG 0.1697 CGTTT 0.464 CTAAA 0.4307 CTAAC 0.1454 CTAAG 0.1073 CTAAT 0.3167 CTACA 0.3941 CTACC 0.1653 CTACG 0.1534 CTACT 0.2871 CTAGA 0.3561 CTAGC 0.1607 CTAGG 0.145 CTAGT 0.3382 CTATA 0.2575 CTATC 0.1425 CTATG 0.1446 CTATT 0.4554 CTCAA 0.4122 CTCAC 0.1718 CTCAG 0.1473 CTCAT 0.2688 CTCCA 0.3757 CTCCC 0.1811 CTCCG 0.1736 CTCCT 0.2696 CTCGA 0.3322 CTCGC 0.1827 CTCGG 0.163 CTCGT 0.3221 CTCTA 0.2755 CTCTC 0.189 CTCTG 0.1808 CTCTT 0.3547 CTGAA 0.3931 CTGAC 0.1757 CTGAG 0.1363 CTGAT 0.295 CTGCA 0.3641 CTGCC 0.1638 CTGCG 0.1772 CTGCT 0.2949 CTGGA 0.3369 CTGGC 0.1891 CTGGG 0.164 CTGGT 0.31 CTGTA 0.2905 CTGTC 0.1576 CTGTG 0.1807 CTGTT 0.3712 CTTAA 0.3868 CTTAC 0.1589 CTTAG 0.1231 CTTAT 0.3313 CTTCA 0.3536 CTTCC 0.185 CTTCG 0.1712 CTTCT 0.2902 CTTGA 0.318 CTTGC 0.1793 CTTGG 0.1674 CTTGT 0.3353 CTTTA 0.2589 CTTTC 0.1499 CTTTG 0.166 CTTTT 0.4252 GAAAA 0.4557 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1126 GAAAT 0.2897 GAACA 0.3828 GAACC 0.1457 GAACG 0.1757 GAACT 0.2957 GAAGA 0.3203 GAAGC 0.1904 GAAGG 0.1727 GAAGT 0.3166 GAATA 0.2733 GAATC 0.1274 GAATG 0.159 GAATT 0.4403 GACAA 0.3906 GACAC 0.1919 GACAG 0.1673 GACAT 0.2502 GACCA 0.3728 GACCC 0.1622 GACCG 0.1821 GACCT 0.2829 GACGA 0.3005 GACGC 0.1967 GACGG 0.1573 GACGT 0.3455 GACTA 0.2386 GACTC 0.1422 GACTG 0.2176 GACTT 0.4017 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1524 GAGAG 0.1703 GAGAT 0.2741 GAGCA 0.3559 GAGCC 0.1637 GAGCG 0.2019 GAGCT 0.2785 GAGGA 0.3086 GAGGC 0.1763 GAGGG 0.1882 GAGGT 0.3268 GAGTA 0.2438 GAGTC 0.1423 GAGTG 0.2279 GAGTT 0.386 GATAA 0.4737 GATAC 0.1266 GATAG 0.1222 GATAT 0.2774 GATCA 0.3819 GATCC 0.1547 GATCG 0.1913 GATCT 0.2721 GATGA 0.3238 GATGC 0.1691 GATGG 0.1726 GATGT 0.3345 GATTA 0.2476 GATTC 0.122 GATTG 0.1473 GATTT 0.483 GCAAA 0.4417 GCAAC 0.165 GCAAG 0.1281 GCAAT 0.2652 GCACA 0.3597 GCACC 0.182 GCACG 0.1479 GCACT 0.3104 GCAGA 0.3026 GCAGC 0.2054 GCAGG 0.1588 GCAGT 0.3332 GCATA 0.2402 GCATC 0.1494 GCATG 0.1547 GCATT 0.4557 GCCAA 0.4085 GCCAC 0.2084 GCCAG 0.1339 GCCAT 0.2492 GCCCA 0.3158 GCCCC 0.2542 GCCCG 0.156 GCCCT 0.274 GCCGA 0.3108 GCCGC 0.2341 GCCGG 0.1903 GCCGT 0.2648 GCCTA 0.2461 GCCTC 0.185 GCCTG 0.1744 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3615 GCGAC 0.199 GCGAG 0.1542 GCGAT 0.2853 GCGCA 0.3058 GCGCC 0.2483 GCGCG 0.1767 GCGCT 0.2691 GCGGA 0.2772 GCGGC 0.2556 GCGGG 0.1581 GCGGT 0.3091 GCGTA 0.2193 GCGTC 0.195 GCGTG 0.1795 GCGTT 0.4063 GCTAA 0.3996 GCTAC 0.1896 GCTAG 0.1374 GCTAT 0.2735 GCTCA 0.327 GCTCC 0.1891 GCTCG 0.1905 GCTCT 0.2934 GCTGA 0.2997 GCTGC 0.1949 GCTGG 0.1615 GCTGT 0.3439 GCTTA 0.2295 GCTTC 0.1694 GCTTG 0.1741 GCTTT 0.4269 GGAAA 0.4542 GGAAC 0.1451 GGAAG 0.138 GGAAT 0.2628 GGACA 0.3568 GGACC 0.1592 GGACG 0.208 GGACT 0.276 GGAGA 0.3205 GGAGC 0.2061 GGAGG 0.2014 GGAGT 0.272 GGATA 0.2568 GGATC 0.134 GGATG 0.1892 GGATT 0.42 GGCAA 0.429 GGCAC 0.206 GGCAG 0.1478 GGCAT 0.2171 GGCCA 0.3586 GGCCC 0.198 GGCCG 0.2113 GGCCT 0.2321 GGCGA 0.2876 GGCGC 0.2493 GGCGG 0.202 GGCGT 0.2612 GGCTA 0.2324 GGCTC 0.1747 GGCTG 0.2259 GGCTT 0.367 GGGAA 0.423 GGGAC 0.1787 GGGAG 0.1693 GGGAT 0.229 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2132 GGGCG 0.2302 GGGCT 0.2523 GGGGA 0.2578 GGGGC 0.2326 GGGGG 0.2216 GGGGT 0.288 GGGTA 0.2253 GGGTC 0.1523 GGGTG 0.2605 GGGTT 0.3619 GGTAA 0.4107 GGTAC 0.1737 GGTAG 0.1579 GGTAT 0.2577 GGTCA 0.3865 GGTCC 0.1572 GGTCG 0.223 GGTCT 0.2333 GGTGA 0.278 GGTGC 0.1788 GGTGG 0.2093 GGTGT 0.3339 GGTTA 0.2417 GGTTC 0.1242 GGTTG 0.1827 GGTTT 0.4515 GTAAA 0.4318 GTAAC 0.1438 GTAAG 0.1092 GTAAT 0.3152 GTACA 0.4007 GTACC 0.1717 GTACG 0.1418 GTACT 0.2858 GTAGA 0.3179 GTAGC 0.1771 GTAGG 0.1886 GTAGT 0.3164 GTATA 0.2704 GTATC 0.1236 GTATG 0.1375 GTATT 0.4685 GTCAA 0.3764 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1526 GTCAT 0.2664 GTCCA 0.3626 GTCCC 0.1895 GTCCG 0.1884 GTCCT 0.2595 GTCGA 0.2916 GTCGC 0.2174 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.3023 GTCTA 0.2449 GTCTC 0.1724 GTCTG 0.1989 GTCTT 0.3838 GTGAA 0.3606 GTGAC 0.1995 GTGAG 0.1346 GTGAT 0.3053 GTGCA 0.3535 GTGCC 0.1892 GTGCG 0.1823 GTGCT 0.2751 GTGGA 0.2896 GTGGC 0.2168 GTGGG 0.1786 GTGGT 0.315 GTGTA 0.2478 GTGTC 0.1569 GTGTG 0.1902 GTGTT 0.4051 GTTAA 0.355 GTTAC 0.1669 GTTAG 0.133 GTTAT 0.345 GTTCA 0.3327 GTTCC 0.1936 GTTCG 0.1823 GTTCT 0.2913 GTTGA 0.2625 GTTGC 0.1922 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2331 GTTTC 0.1431 GTTTG 0.164 GTTTT 0.4598 TAAAA 0.4563 TAAAC 0.1286 TAAAG 0.1081 TAAAT 0.3071 TAACA 0.4026 TAACC 0.1464 TAACG 0.145 TAACT 0.306 TAAGA 0.3102 TAAGC 0.166 TAAGG 0.1501 TAAGT 0.3737 TAATA 0.3027 TAATC 0.1096 TAATG 0.1306 TAATT 0.4571 TACAA 0.409 TACAC 0.1616 TACAG 0.1644 TACAT 0.265 TACCA 0.3606 TACCC 0.1434 TACCG 0.1557 TACCT 0.3404 TACGA 0.3379 TACGC 0.153 TACGG 0.1495 TACGT 0.3597 TACTA 0.248 TACTC 0.1441 TACTG 0.1852 TACTT 0.4227 TAGAA 0.4219 TAGAC 0.1411 TAGAG 0.1618 TAGAT 0.2753 TAGCA 0.3692 TAGCC 0.1556 TAGCG 0.1751 TAGCT 0.3001 TAGGA 0.2845 TAGGC 0.1603 TAGGG 0.1708 TAGGT 0.3843 TAGTA 0.2451 TAGTC 0.1395 TAGTG 0.1841 TAGTT 0.4313 TATAA 0.4306 TATAC 0.1538 TATAG 0.1226 TATAT 0.293 TATCA 0.371 TATCC 0.1282 TATCG 0.174 TATCT 0.3269 TATGA 0.3045 TATGC 0.1592 TATGG 0.1584 TATGT 0.3779 TATTA 0.2683 TATTC 0.1027 TATTG 0.1414 TATTT 0.4876 TCAAA 0.4596 TCAAC 0.1411 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2571 TCACA 0.3728 TCACC 0.1672 TCACG 0.1467 TCACT 0.3133 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.1826 TCAGG 0.1509 TCAGT 0.3719 TCATA 0.2477 TCATC 0.1542 TCATG 0.144 TCATT 0.4541 TCCAA 0.3944 TCCAC 0.1933 TCCAG 0.1657 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.352 TCCCC 0.1899 TCCCG 0.1858 TCCCT 0.2724 TCCGA 0.3189 TCCGC 0.1855 TCCGG 0.2198 TCCGT 0.2757 TCCTA 0.2508 TCCTC 0.186 TCCTG 0.206 TCCTT 0.3573 TCGAA 0.3853 TCGAC 0.1624 TCGAG 0.1705 TCGAT 0.2818 TCGCA 0.3291 TCGCC 0.1958 TCGCG 0.1752 TCGCT 0.2998 TCGGA 0.2911 TCGGC 0.2074 TCGGG 0.1806 TCGGT 0.321 TCGTA 0.2755 TCGTC 0.1694 TCGTG 0.1829 TCGTT 0.3722 TCTAA 0.3888 TCTAC 0.1804 TCTAG 0.1614 TCTAT 0.2694 TCTCA 0.3232 TCTCC 0.171 TCTCG 0.1858 TCTCT 0.32 TCTGA 0.2917 TCTGC 0.1732 TCTGG 0.1628 TCTGT 0.3723 TCTTA 0.2497 TCTTC 0.1659 TCTTG 0.1831 TCTTT 0.4013 TGAAA 0.4696 TGAAC 0.1266 TGAAG 0.134 TGAAT 0.2699 TGACA 0.3858 TGACC 0.1647 TGACG 0.1793 TGACT 0.2702 TGAGA 0.3146 TGAGC 0.185 TGAGG 0.167 TGAGT 0.3333 TGATA 0.2841 TGATC 0.1264 TGATG 0.1671 TGATT 0.4224 TGCAA 0.4172 TGCAC 0.1728 TGCAG 0.1475 TGCAT 0.2625 TGCCA 0.4057 TGCCC 0.164 TGCCG 0.1746 TGCCT 0.2557 TGCGA 0.3199 TGCGC 0.2032 TGCGG 0.1653 TGCGT 0.3116 TGCTA 0.2636 TGCTC 0.1815 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3624 TGGAA 0.4394 TGGAC 0.1634 TGGAG 0.1678 TGGAT 0.2293 TGGCA 0.3475 TGGCC 0.1782 TGGCG 0.2299 TGGCT 0.2444 TGGGA 0.2977 TGGGC 0.1799 TGGGG 0.2232 TGGGT 0.2992 TGGTA 0.2574 TGGTC 0.159 TGGTG 0.2291 TGGTT 0.3544 TGTAA 0.4046 TGTAC 0.1596 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2875 TGTCA 0.3999 TGTCC 0.1557 TGTCG 0.1655 TGTCT 0.2789 TGTGA 0.3028 TGTGC 0.1726 TGTGG 0.1742 TGTGT 0.3504 TGTTA 0.249 TGTTC 0.1223 TGTTG 0.1845 TGTTT 0.4442 TTAAA 0.4332 TTAAC 0.1267 TTAAG 0.1101 TTAAT 0.3301 TTACA 0.3937 TTACC 0.1574 TTACG 0.1687 TTACT 0.2801 TTAGA 0.318 TTAGC 0.1733 TTAGG 0.1704 TTAGT 0.3382 TTATA 0.2185 TTATC 0.1334 TTATG 0.1304 TTATT 0.5176 TTCAA 0.4044 TTCAC 0.1702 TTCAG 0.1571 TTCAT 0.2684 TTCCA 0.3719 TTCCC 0.1712 TTCCG 0.1753 TTCCT 0.2816 TTCGA 0.3236 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.1773 TTCGT 0.3144 TTCTA 0.2703 TTCTC 0.1684 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.3612 TTGAA 0.4028 TTGAC 0.1725 TTGAG 0.1519 TTGAT 0.2728 TTGCA 0.3787 TTGCC 0.1748 TTGCG 0.1667 TTGCT 0.2798 TTGGA 0.2883 TTGGC 0.2073 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3335 TTGTA 0.2681 TTGTC 0.1365 TTGTG 0.1951 TTGTT 0.4003 TTTAA 0.3659 TTTAC 0.1511 TTTAG 0.1188 TTTAT 0.3643 TTTCA 0.3453 TTTCC 0.1696 TTTCG 0.1736 TTTCT 0.3116 TTTGA 0.2949 TTTGC 0.1774 TTTGG 0.1675 TTTGT 0.3602 TTTTA 0.2487 TTTTC 0.138 TTTTG 0.1655 TTTTT 0.4477 [3] # (a,c,g,t)= (0.297, 0.203, 0.203, 0.297) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.339 C 0.161 G 0.161 T 0.339 # l= 1 # Values AA 0.144 AC 0.0539 AG 0.0446 AT 0.0968 CA 0.0585 CC 0.0279 CG 0.0296 CT 0.0446 GA 0.0485 GC 0.0303 GG 0.0279 GT 0.0539 TA 0.0884 TC 0.0485 TG 0.0585 TT 0.144 # l= 2 # Values AAA 0.0646 AAC 0.0204 AAG 0.0164 AAT 0.0427 ACA 0.0207 ACC 0.00878 ACG 0.00905 ACT 0.0154 AGA 0.0136 AGC 0.00815 AGG 0.0074 AGT 0.0154 ATA 0.0267 ATC 0.0129 ATG 0.0145 ATT 0.0427 CAA 0.0238 CAC 0.0112 CAG 0.00906 CAT 0.0145 CCA 0.01 CCC 0.00524 CCG 0.00524 CCT 0.0074 CGA 0.00936 CGC 0.00595 CGG 0.00524 CGT 0.00906 CTA 0.0114 CTC 0.00773 CTG 0.00906 CTT 0.0164 GAA 0.0194 GAC 0.0085 GAG 0.00773 GAT 0.0129 GCA 0.0105 GCC 0.00571 GCG 0.00595 GCT 0.00815 GGA 0.00821 GGC 0.00571 GGG 0.00523 GGT 0.00877 GTA 0.0139 GTC 0.0085 GTG 0.0112 GTT 0.0204 TAA 0.0364 TAC 0.0139 TAG 0.0114 TAT 0.0267 TCA 0.0173 TCC 0.00821 TCG 0.00936 TCT 0.0136 TGA 0.0173 TGC 0.0104 TGG 0.01 TGT 0.0207 TTA 0.0364 TTC 0.0194 TTG 0.0238 TTT 0.0645 # l= 3 # Values AAAA 0.029 AAAC 0.00908 AAAG 0.0068 AAAT 0.0196 AACA 0.008 AACC 0.00311 AACG 0.00333 AACT 0.00593 AAGA 0.00481 AAGC 0.00293 AAGG 0.00261 AAGT 0.00606 AATA 0.013 AATC 0.00535 AATG 0.00644 AATT 0.0179 ACAA 0.00858 ACAC 0.0038 ACAG 0.00321 ACAT 0.0051 ACCA 0.00316 ACCC 0.0015 ACCG 0.00164 ACCT 0.00247 ACGA 0.00286 ACGC 0.00167 ACGG 0.00141 ACGT 0.00312 ACTA 0.00382 ACTC 0.00235 ACTG 0.00317 ACTT 0.00606 AGAA 0.00564 AGAC 0.00218 AGAG 0.0022 AGAT 0.00357 AGCA 0.00279 AGCC 0.00142 AGCG 0.00164 AGCT 0.00229 AGGA 0.00224 AGGC 0.00132 AGGG 0.00137 AGGT 0.00247 AGTA 0.00378 AGTC 0.00236 AGTG 0.00334 AGTT 0.00593 ATAA 0.0127 ATAC 0.00372 ATAG 0.0031 ATAT 0.00716 ATCA 0.00489 ATCC 0.00191 ATCG 0.00253 ATCT 0.00357 ATGA 0.00452 ATGC 0.00248 ATGG 0.00237 ATGT 0.0051 ATTA 0.0116 ATTC 0.00507 ATTG 0.00642 ATTT 0.0196 CAAA 0.0105 CAAC 0.00374 CAAG 0.00312 CAAT 0.00642 CACA 0.00405 CACC 0.00204 CACG 0.00176 CACT 0.00334 CAGA 0.0027 CAGC 0.00174 CAGG 0.00146 CAGT 0.00318 CATA 0.00361 CATC 0.00221 CATG 0.0022 CATT 0.00644 CCAA 0.00409 CCAC 0.00207 CCAG 0.00151 CCAT 0.00237 CCCA 0.00177 CCCC 0.00118 CCCG 0.000918 CCCT 0.00137 CCGA 0.00168 CCGC 0.00107 CCGG 0.00108 CCGT 0.00141 CCTA 0.00192 CCTC 0.00141 CCTG 0.00146 CCTT 0.00261 CGAA 0.00353 CGAC 0.00171 CGAG 0.00158 CGAT 0.00253 CGCA 0.00192 CGCC 0.00133 CGCG 0.00106 CGCT 0.00164 CGGA 0.00152 CGGC 0.00117 CGGG 0.000917 CGGT 0.00165 CGTA 0.00229 CGTC 0.00167 CGTG 0.00176 CGTT 0.00333 CTAA 0.00445 CTAC 0.00211 CTAG 0.0017 CTAT 0.0031 CTCA 0.00256 CTCC 0.00139 CTCG 0.00158 CTCT 0.0022 CTGA 0.00272 CTGC 0.00162 CTGG 0.00151 CTGT 0.00321 CTTA 0.00393 CTTC 0.00256 CTTG 0.00312 CTTT 0.0068 GAAA 0.00911 GAAC 0.00261 GAAG 0.00256 GAAT 0.00507 GACA 0.00307 GACC 0.00141 GACG 0.00167 GACT 0.00236 GAGA 0.00247 GAGC 0.00149 GAGG 0.00141 GAGT 0.00235 GATA 0.00371 GATC 0.00164 GATG 0.00221 GATT 0.00535 GCAA 0.00436 GCAC 0.002 GCAG 0.00162 GCAT 0.00248 GCCA 0.00216 GCCC 0.00107 GCCG 0.00117 GCCT 0.00132 GCGA 0.00187 GCGC 0.00134 GCGG 0.00107 GCGT 0.00167 GCTA 0.00199 GCTC 0.00149 GCTG 0.00174 GCTT 0.00293 GGAA 0.00353 GGAC 0.00138 GGAG 0.00139 GGAT 0.0019 GGCA 0.00184 GGCC 0.00113 GGCG 0.00133 GGCT 0.00142 GGGA 0.00149 GGGC 0.00107 GGGG 0.00118 GGGT 0.0015 GGTA 0.00222 GGTC 0.0014 GGTG 0.00204 GGTT 0.00311 GTAA 0.00575 GTAC 0.00228 GTAG 0.0021 GTAT 0.00372 GTCA 0.00322 GTCC 0.00138 GTCG 0.00171 GTCT 0.00218 GTGA 0.00332 GTGC 0.00199 GTGG 0.00207 GTGT 0.00381 GTTA 0.00494 GTTC 0.00261 GTTG 0.00374 GTTT 0.00908 TAAA 0.0159 TAAC 0.00494 TAAG 0.00393 TAAT 0.0116 TACA 0.00557 TACC 0.00222 TACG 0.00229 TACT 0.00378 TAGA 0.00362 TAGC 0.00199 TAGG 0.00192 TAGT 0.00382 TATA 0.00636 TATC 0.00371 TATG 0.00361 TATT 0.013 TCAA 0.00676 TCAC 0.00332 TCAG 0.00272 TCAT 0.00452 TCCA 0.00296 TCCC 0.00149 TCCG 0.00152 TCCT 0.00224 TCGA 0.00296 TCGC 0.00187 TCGG 0.00168 TCGT 0.00286 TCTA 0.00362 TCTC 0.00247 TCTG 0.00269 TCTT 0.00481 TGAA 0.00666 TGAC 0.00322 TGAG 0.00256 TGAT 0.00489 TGCA 0.00391 TGCC 0.00183 TGCG 0.00192 TGCT 0.00279 TGGA 0.00296 TGGC 0.00216 TGGG 0.00176 TGGT 0.00316 TGTA 0.00557 TGTC 0.00307 TGTG 0.00405 TGTT 0.008 TTAA 0.0135 TTAC 0.00575 TTAG 0.00445 TTAT 0.0128 TTCA 0.00666 TTCC 0.00353 TTCG 0.00353 TTCT 0.00564 TTGA 0.00676 TTGC 0.00436 TTGG 0.00409 TTGT 0.00857 TTTA 0.0159 TTTC 0.00911 TTTG 0.0105 TTTT 0.029 # l= 4 # Values AAAAA 0.0128 AAAAC 0.00413 AAAAG 0.00286 AAAAT 0.00916 AAACA 0.00354 AAACC 0.00138 AAACG 0.00153 AAACT 0.00262 AAAGA 0.00191 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000987 AAAGT 0.00267 AAATA 0.00634 AAATC 0.00256 AAATG 0.00311 AAATT 0.00764 AACAA 0.00341 AACAC 0.00152 AACAG 0.00118 AACAT 0.00189 AACCA 0.00111 AACCC 0.000548 AACCG 0.000662 AACCT 0.000786 AACGA 0.00105 AACGC 0.000663 AACGG 0.000545 AACGT 0.00108 AACTA 0.00163 AACTC 0.000889 AACTG 0.00126 AACTT 0.00215 AAGAA 0.00202 AAGAC 0.00083 AAGAG 0.000777 AAGAT 0.00118 AAGCA 0.001 AAGCC 0.000514 AAGCG 0.000609 AAGCT 0.000801 AAGGA 0.000794 AAGGC 0.000519 AAGGG 0.000488 AAGGT 0.000811 AAGTA 0.00159 AAGTC 0.00093 AAGTG 0.00139 AAGTT 0.00215 AATAA 0.00657 AATAC 0.00175 AATAG 0.00142 AATAT 0.00331 AATCA 0.00206 AATCC 0.0008 AATCG 0.00113 AATCT 0.00136 AATGA 0.00205 AATGC 0.00112 AATGG 0.00104 AATGT 0.00223 AATTA 0.00531 AATTC 0.00222 AATTG 0.00273 AATTT 0.00764 ACAAA 0.00376 ACAAC 0.00131 ACAAG 0.00104 ACAAT 0.00246 ACACA 0.00142 ACACC 0.000673 ACACG 0.000633 ACACT 0.00109 ACAGA 0.000994 ACAGC 0.000587 ACAGG 0.000515 ACAGT 0.00111 ACATA 0.00136 ACATC 0.000723 ACATG 0.000778 ACATT 0.00223 ACCAA 0.00134 ACCAC 0.00064 ACCAG 0.00046 ACCAT 0.000718 ACCCA 0.000516 ACCCC 0.000328 ACCCG 0.000252 ACCCT 0.000404 ACCGA 0.000527 ACCGC 0.000327 ACCGG 0.000332 ACCGT 0.000459 ACCTA 0.000725 ACCTC 0.000454 ACCTG 0.000481 ACCTT 0.000811 ACGAA 0.00111 ACGAC 0.00051 ACGAG 0.000502 ACGAT 0.000739 ACGCA 0.000589 ACGCC 0.000338 ACGCG 0.000287 ACGCT 0.000459 ACGGA 0.000416 ACGGC 0.000305 ACGGG 0.00023 ACGGT 0.000459 ACGTA 0.000815 ACGTC 0.000563 ACGTG 0.000664 ACGTT 0.00108 ACTAA 0.00149 ACTAC 0.000663 ACTAG 0.000573 ACTAT 0.00109 ACTCA 0.000845 ACTCC 0.000373 ACTCG 0.000524 ACTCT 0.000612 ACTGA 0.00101 ACTGC 0.000533 ACTGG 0.000524 ACTGT 0.00111 ACTTA 0.00147 ACTTC 0.000796 ACTTG 0.00112 ACTTT 0.00267 AGAAA 0.00276 AGAAC 0.000738 AGAAG 0.000726 AGAAT 0.00142 AGACA 0.000836 AGACC 0.000316 AGACG 0.000447 AGACT 0.000583 AGAGA 0.000769 AGAGC 0.00042 AGAGG 0.0004 AGAGT 0.000612 AGATA 0.00117 AGATC 0.000432 AGATG 0.000618 AGATT 0.00136 AGCAA 0.00119 AGCAC 0.000535 AGCAG 0.000464 AGCAT 0.000598 AGCCA 0.000524 AGCCC 0.000266 AGCCG 0.000306 AGCCT 0.000325 AGCGA 0.000542 AGCGC 0.000353 AGCGG 0.000291 AGCGT 0.000459 AGCTA 0.000584 AGCTC 0.000406 AGCTG 0.000501 AGCTT 0.000801 AGGAA 0.000988 AGGAC 0.000352 AGGAG 0.000369 AGGAT 0.000533 AGGCA 0.000456 AGGCC 0.000255 AGGCG 0.000285 AGGCT 0.000325 AGGGA 0.000395 AGGGC 0.000281 AGGGG 0.000288 AGGGT 0.000404 AGGTA 0.000739 AGGTC 0.000394 AGGTG 0.000551 AGGTT 0.000786 AGTAA 0.00157 AGTAC 0.00064 AGTAG 0.000594 AGTAT 0.000972 AGTCA 0.000855 AGTCC 0.000381 AGTCG 0.000539 AGTCT 0.000583 AGTGA 0.00102 AGTGC 0.000609 AGTGG 0.000618 AGTGT 0.00109 AGTTA 0.00147 AGTTC 0.000759 AGTTG 0.00107 AGTTT 0.00262 ATAAA 0.00585 ATAAC 0.00169 ATAAG 0.00129 ATAAT 0.00391 ATACA 0.00159 ATACC 0.000554 ATACG 0.00061 ATACT 0.000972 ATAGA 0.00097 ATAGC 0.000537 ATAGG 0.000498 ATAGT 0.00109 ATATA 0.00187 ATATC 0.00101 ATATG 0.00096 ATATT 0.00331 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.00101 ATCAG 0.000805 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.000673 ATCCC 0.00034 ATCCG 0.000359 ATCCT 0.000533 ATCGA 0.000828 ATCGC 0.000529 ATCGG 0.000439 ATCGT 0.000739 ATCTA 0.00098 ATCTC 0.00068 ATCTG 0.000729 ATCTT 0.00118 ATGAA 0.00178 ATGAC 0.00084 ATGAG 0.000685 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000392 ATGCG 0.00048 ATGCT 0.000598 ATGGA 0.000727 ATGGC 0.000528 ATGGG 0.000397 ATGGT 0.000718 ATGTA 0.00146 ATGTC 0.000751 ATGTG 0.000995 ATGTT 0.00189 ATTAA 0.00445 ATTAC 0.00182 ATTAG 0.00142 ATTAT 0.00391 ATTCA 0.0018 ATTCC 0.000923 ATTCG 0.00093 ATTCT 0.00142 ATTGA 0.00176 ATTGC 0.00117 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.00246 ATTTA 0.00493 ATTTC 0.00266 ATTTG 0.0029 ATTTT 0.00916 CAAAA 0.00489 CAAAC 0.00154 CAAAG 0.00117 CAAAT 0.0029 CAACA 0.00151 CAACC 0.000585 CAACG 0.000572 CAACT 0.00107 CAAGA 0.000904 CAAGC 0.000526 CAAGG 0.000562 CAAGT 0.00112 CAATA 0.0019 CAATC 0.000815 CAATG 0.000966 CAATT 0.00273 CACAA 0.00171 CACAC 0.00075 CACAG 0.000595 CACAT 0.000995 CACCA 0.000743 CACCC 0.000393 CACCG 0.000353 CACCT 0.000551 CACGA 0.000542 CACGC 0.000312 CACGG 0.000244 CACGT 0.000664 CACTA 0.000724 CACTC 0.000558 CACTG 0.000669 CACTT 0.00139 CAGAA 0.00113 CAGAC 0.000438 CAGAG 0.000401 CAGAT 0.000729 CAGCA 0.000554 CAGCC 0.000328 CAGCG 0.000353 CAGCT 0.000501 CAGGA 0.000475 CAGGC 0.000233 CAGGG 0.000266 CAGGT 0.000481 CAGTA 0.00071 CAGTC 0.000528 CAGTG 0.000669 CAGTT 0.00126 CATAA 0.00168 CATAC 0.000518 CATAG 0.000447 CATAT 0.00096 CATCA 0.000828 CATCC 0.000366 CATCG 0.000401 CATCT 0.000618 CATGA 0.000664 CATGC 0.000396 CATGG 0.000358 CATGT 0.000778 CATTA 0.00155 CATTC 0.00082 CATTG 0.000966 CATTT 0.00311 CCAAA 0.00179 CCAAC 0.000736 CCAAG 0.000533 CCAAT 0.00103 CCACA 0.000708 CCACC 0.000434 CCACG 0.000306 CCACT 0.000618 CCAGA 0.000458 CCAGC 0.000287 CCAGG 0.000242 CCAGT 0.000524 CCATA 0.000582 CCATC 0.000392 CCATG 0.000358 CCATT 0.00104 CCCAA 0.000727 CCCAC 0.000379 CCCAG 0.00026 CCCAT 0.000397 CCCCA 0.000415 CCCCC 0.000267 CCCCG 0.000208 CCCCT 0.000288 CCCGA 0.000318 CCCGC 0.000178 CCCGG 0.000191 CCCGT 0.00023 CCCTA 0.000339 CCCTC 0.000273 CCCTG 0.000266 CCCTT 0.000488 CCGAA 0.000641 CCGAC 0.000332 CCGAG 0.000267 CCGAT 0.000439 CCGCA 0.000328 CCGCC 0.00028 CCGCG 0.000176 CCGCT 0.000291 CCGGA 0.00033 CCGGC 0.000229 CCGGG 0.000191 CCGGT 0.000332 CCGTA 0.00035 CCGTC 0.000269 CCGTG 0.000244 CCGTT 0.000545 CCTAA 0.000779 CCTAC 0.000398 CCTAG 0.000248 CCTAT 0.000498 CCTCA 0.000438 CCTCC 0.000288 CCTCG 0.000283 CCTCT 0.0004 CCTGA 0.00043 CCTGC 0.000268 CCTGG 0.000242 CCTGT 0.000515 CCTTA 0.000608 CCTTC 0.000454 CCTTG 0.000562 CCTTT 0.000987 CGAAA 0.00165 CGAAC 0.000498 CGAAG 0.000452 CGAAT 0.00093 CGACA 0.000525 CGACC 0.000327 CGACG 0.000322 CGACT 0.000539 CGAGA 0.000482 CGAGC 0.000294 CGAGG 0.000283 CGAGT 0.000524 CGATA 0.000668 CGATC 0.000335 CGATG 0.000401 CGATT 0.00113 CGCAA 0.000756 CGCAC 0.000381 CGCAG 0.000299 CGCAT 0.00048 CGCCA 0.000512 CGCCC 0.000249 CGCCG 0.000285 CGCCT 0.000285 CGCGA 0.000344 CGCGC 0.000248 CGCGG 0.000176 CGCGT 0.000287 CGCTA 0.000367 CGCTC 0.000316 CGCTG 0.000353 CGCTT 0.000609 CGGAA 0.000641 CGGAC 0.000267 CGGAG 0.00025 CGGAT 0.000359 CGGCA 0.000334 CGGCC 0.000241 CGGCG 0.000285 CGGCT 0.000306 CGGGA 0.000287 CGGGC 0.000172 CGGGG 0.000208 CGGGT 0.000252 CGGTA 0.000363 CGGTC 0.000267 CGGTG 0.000353 CGGTT 0.000662 CGTAA 0.00102 CGTAC 0.00033 CGTAG 0.000336 CGTAT 0.00061 CGTCA 0.000597 CGTCC 0.000303 CGTCG 0.000322 CGTCT 0.000447 CGTGA 0.000509 CGTGC 0.000314 CGTGG 0.000306 CGTGT 0.000633 CGTTA 0.000745 CGTTC 0.00048 CGTTG 0.000572 CGTTT 0.00153 CTAAA 0.00188 CTAAC 0.00067 CTAAG 0.000481 CTAAT 0.00142 CTACA 0.000821 CTACC 0.000353 CTACG 0.000336 CTACT 0.000594 CTAGA 0.000601 CTAGC 0.000281 CTAGG 0.000248 CTAGT 0.000573 CTATA 0.000783 CTATC 0.000452 CTATG 0.000447 CTATT 0.00142 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.000459 CTCAG 0.000372 CTCAT 0.000685 CTCCA 0.00051 CTCCC 0.000257 CTCCG 0.00025 CTCCT 0.000369 CTCGA 0.000518 CTCGC 0.000297 CTCGG 0.000267 CTCGT 0.000502 CTCTA 0.000598 CTCTC 0.000423 CTCTG 0.000401 CTCTT 0.000777 CTGAA 0.00105 CTGAC 0.000498 CTGAG 0.000372 CTGAT 0.000805 CTGCA 0.000585 CTGCC 0.000274 CTGCG 0.000299 CTGCT 0.000464 CTGGA 0.000498 CTGGC 0.000293 CTGGG 0.00026 CTGGT 0.00046 CTGTA 0.000902 CTGTC 0.000529 CTGTG 0.000595 CTGTT 0.00118 CTTAA 0.00152 CTTAC 0.000637 CTTAG 0.000481 CTTAT 0.00129 CTTCA 0.000899 CTTCC 0.000486 CTTCG 0.000452 CTTCT 0.000726 CTTGA 0.00098 CTTGC 0.000567 CTTGG 0.000533 CTTGT 0.00104 CTTTA 0.00173 CTTTC 0.00104 CTTTG 0.00117 CTTTT 0.00286 GAAAA 0.00408 GAAAC 0.00132 GAAAG 0.00104 GAAAT 0.00266 GAACA 0.000983 GAACC 0.000392 GAACG 0.00048 GAACT 0.000759 GAAGA 0.000808 GAAGC 0.000503 GAAGG 0.000454 GAAGT 0.000796 GAATA 0.00137 GAATC 0.000661 GAATG 0.00082 GAATT 0.00222 GACAA 0.00119 GACAC 0.000599 GACAG 0.000529 GACAT 0.000751 GACCA 0.00051 GACCC 0.000233 GACCG 0.000267 GACCT 0.000394 GACGA 0.000498 GACGC 0.00034 GACGG 0.000269 GACGT 0.000563 GACTA 0.000551 GACTC 0.000348 GACTG 0.000528 GACTT 0.00093 GAGAA 0.00098 GAGAC 0.000391 GAGAG 0.000423 GAGAT 0.00068 GAGCA 0.000516 GAGCC 0.000254 GAGCG 0.000316 GAGCT 0.000406 GAGGA 0.00043 GAGGC 0.000254 GAGGG 0.000273 GAGGT 0.000454 GAGTA 0.000558 GAGTC 0.000348 GAGTG 0.000558 GAGTT 0.000889 GATAA 0.00178 GATAC 0.000463 GATAG 0.000452 GATAT 0.00101 GATCA 0.000611 GATCC 0.00026 GATCG 0.000335 GATCT 0.000432 GATGA 0.000719 GATGC 0.000378 GATGG 0.000392 GATGT 0.000723 GATTA 0.00131 GATTC 0.000661 GATTG 0.000815 GATTT 0.00256 GCAAA 0.0019 GCAAC 0.000719 GCAAG 0.000567 GCAAT 0.00117 GCACA 0.000699 GCACC 0.000372 GCACG 0.000314 GCACT 0.000609 GCAGA 0.000472 GCAGC 0.000349 GCAGG 0.000268 GCAGT 0.000533 GCATA 0.00058 GCATC 0.000378 GCATG 0.000396 GCATT 0.00112 GCCAA 0.00087 GCCAC 0.000465 GCCAG 0.000293 GCCAT 0.000528 GCCCA 0.000327 GCCCC 0.000286 GCCCG 0.000172 GCCCT 0.000281 GCCGA 0.000354 GCCGC 0.00028 GCCGG 0.000229 GCCGT 0.000305 GCCTA 0.000315 GCCTC 0.000254 GCCTG 0.000233 GCCTT 0.000519 GCGAA 0.000664 GCGAC 0.000376 GCGAG 0.000297 GCGAT 0.000529 GCGCA 0.000397 GCGCC 0.000337 GCGCG 0.000248 GCGCT 0.000353 GCGGA 0.00029 GCGGC 0.00028 GCGGG 0.000178 GCGGT 0.000327 GCGTA 0.000358 GCGTC 0.00034 GCGTG 0.000312 GCGTT 0.000663 GCTAA 0.00079 GCTAC 0.000386 GCTAG 0.000281 GCTAT 0.000537 GCTCA 0.000485 GCTCC 0.000293 GCTCG 0.000294 GCTCT 0.00042 GCTGA 0.000514 GCTGC 0.000349 GCTGG 0.000287 GCTGT 0.000587 GCTTA 0.000669 GCTTC 0.000503 GCTTG 0.000526 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.0016 GGAAC 0.000521 GGAAG 0.000486 GGAAT 0.000923 GGACA 0.000477 GGACC 0.000223 GGACG 0.000303 GGACT 0.000381 GGAGA 0.000434 GGAGC 0.000293 GGAGG 0.000288 GGAGT 0.000373 GGATA 0.000481 GGATC 0.00026 GGATG 0.000366 GGATT 0.0008 GGCAA 0.00078 GGCAC 0.000387 GGCAG 0.000274 GGCAT 0.000392 GGCCA 0.000396 GGCCC 0.000235 GGCCG 0.000241 GGCCT 0.000255 GGCGA 0.000377 GGCGC 0.000337 GGCGG 0.00028 GGCGT 0.000338 GGCTA 0.000326 GGCTC 0.000254 GGCTG 0.000328 GGCTT 0.000514 GGGAA 0.000623 GGGAC 0.000271 GGGAG 0.000257 GGGAT 0.00034 GGGCA 0.000316 GGGCC 0.000235 GGGCG 0.000249 GGGCT 0.000266 GGGGA 0.000299 GGGGC 0.000286 GGGGG 0.000267 GGGGT 0.000328 GGGTA 0.000325 GGGTC 0.000233 GGGTG 0.000393 GGGTT 0.000548 GGTAA 0.000914 GGTAC 0.000398 GGTAG 0.000353 GGTAT 0.000554 GGTCA 0.00054 GGTCC 0.000223 GGTCG 0.000327 GGTCT 0.000316 GGTGA 0.000559 GGTGC 0.000372 GGTGG 0.000434 GGTGT 0.000673 GGTTA 0.000754 GGTTC 0.000392 GGTTG 0.000585 GGTTT 0.00138 GTAAA 0.00245 GTAAC 0.000841 GTAAG 0.000637 GTAAT 0.00182 GTACA 0.000912 GTACC 0.000398 GTACG 0.00033 GTACT 0.00064 GTAGA 0.000659 GTAGC 0.000386 GTAGG 0.000398 GTAGT 0.000663 GTATA 0.000989 GTATC 0.000463 GTATG 0.000518 GTATT 0.00175 GTCAA 0.0012 GTCAC 0.000678 GTCAG 0.000498 GTCAT 0.00084 GTCCA 0.000493 GTCCC 0.000271 GTCCG 0.000267 GTCCT 0.000352 GTCGA 0.000495 GTCGC 0.000376 GTCGG 0.000332 GTCGT 0.00051 GTCTA 0.000525 GTCTC 0.000391 GTCTG 0.000438 GTCTT 0.00083 GTGAA 0.00117 GTGAC 0.000678 GTGAG 0.000459 GTGAT 0.00101 GTGCA 0.000692 GTGCC 0.000387 GTGCG 0.000381 GTGCT 0.000535 GTGGA 0.000582 GTGGC 0.000465 GTGGG 0.000379 GTGGT 0.00064 GTGTA 0.000937 GTGTC 0.000599 GTGTG 0.00075 GTGTT 0.00152 GTTAA 0.00174 GTTAC 0.000841 GTTAG 0.00067 GTTAT 0.00169 GTTCA 0.000857 GTTCC 0.000521 GTTCG 0.000498 GTTCT 0.000738 GTTGA 0.000972 GTTGC 0.000719 GTTGG 0.000736 GTTGT 0.00131 GTTTA 0.00208 GTTTC 0.00132 GTTTG 0.00154 GTTTT 0.00413 TAAAA 0.00719 TAAAC 0.00208 TAAAG 0.00173 TAAAT 0.00493 TAACA 0.00197 TAACC 0.000754 TAACG 0.000745 TAACT 0.00147 TAAGA 0.00119 TAAGC 0.000669 TAAGG 0.000608 TAAGT 0.00147 TAATA 0.00343 TAATC 0.00131 TAATG 0.00155 TAATT 0.00531 TACAA 0.00227 TACAC 0.000937 TACAG 0.000902 TACAT 0.00146 TACCA 0.000792 TACCC 0.000325 TACCG 0.000363 TACCT 0.000739 TACGA 0.000768 TACGC 0.000358 TACGG 0.00035 TACGT 0.000815 TACTA 0.000918 TACTC 0.000558 TACTG 0.00071 TACTT 0.00159 TAGAA 0.00151 TAGAC 0.000525 TAGAG 0.000598 TAGAT 0.00098 TAGCA 0.000718 TAGCC 0.000326 TAGCG 0.000367 TAGCT 0.000584 TAGGA 0.000543 TAGGC 0.000315 TAGGG 0.000339 TAGGT 0.000725 TAGTA 0.000918 TAGTC 0.000551 TAGTG 0.000724 TAGTT 0.00163 TATAA 0.00272 TATAC 0.000989 TATAG 0.000783 TATAT 0.00187 TATCA 0.00139 TATCC 0.000481 TATCG 0.000668 TATCT 0.00117 TATGA 0.00109 TATGC 0.00058 TATGG 0.000582 TATGT 0.00136 TATTA 0.00343 TATTC 0.00137 TATTG 0.0019 TATTT 0.00634 TCAAA 0.00306 TCAAC 0.000972 TCAAG 0.00098 TCAAT 0.00176 TCACA 0.00122 TCACC 0.000559 TCACG 0.000509 TCACT 0.00102 TCAGA 0.000771 TCAGC 0.000514 TCAGG 0.00043 TCAGT 0.00101 TCATA 0.00109 TCATC 0.000719 TCATG 0.000664 TCATT 0.00205 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000582 TCCAG 0.000498 TCCAT 0.000727 TCCCA 0.00051 TCCCC 0.000299 TCCCG 0.000287 TCCCT 0.000395 TCCGA 0.000479 TCCGC 0.00029 TCCGG 0.00033 TCCGT 0.000416 TCCTA 0.000543 TCCTC 0.00043 TCCTG 0.000475 TCCTT 0.000794 TCGAA 0.00112 TCGAC 0.000495 TCGAG 0.000518 TCGAT 0.000828 TCGCA 0.000604 TCGCC 0.000377 TCGCG 0.000344 TCGCT 0.000542 TCGGA 0.000479 TCGGC 0.000354 TCGGG 0.000318 TCGGT 0.000527 TCGTA 0.000768 TCGTC 0.000498 TCGTG 0.000542 TCGTT 0.00105 TCTAA 0.00139 TCTAC 0.000659 TCTAG 0.000601 TCTAT 0.00097 TCTCA 0.000789 TCTCC 0.000434 TCTCG 0.000482 TCTCT 0.000769 TCTGA 0.000771 TCTGC 0.000472 TCTGG 0.000458 TCTGT 0.000994 TCTTA 0.00119 TCTTC 0.000808 TCTTG 0.000904 TCTTT 0.00191 TGAAA 0.0031 TGAAC 0.000857 TGAAG 0.000899 TGAAT 0.0018 TGACA 0.00123 TGACC 0.00054 TGACG 0.000597 TGACT 0.000855 TGAGA 0.000789 TGAGC 0.000485 TGAGG 0.000438 TGAGT 0.000845 TGATA 0.00139 TGATC 0.000611 TGATG 0.000828 TGATT 0.00206 TGCAA 0.00163 TGCAC 0.000692 TGCAG 0.000585 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.00073 TGCCC 0.000316 TGCCG 0.000334 TGCCT 0.000456 TGCGA 0.000604 TGCGC 0.000397 TGCGG 0.000328 TGCGT 0.000589 TGCTA 0.000718 TGCTC 0.000516 TGCTG 0.000554 TGCTT 0.001 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000493 TGGAG 0.00051 TGGAT 0.000673 TGGCA 0.00073 TGGCC 0.000396 TGGCG 0.000512 TGGCT 0.000524 TGGGA 0.00051 TGGGC 0.000327 TGGGG 0.000415 TGGGT 0.000516 TGGTA 0.000792 TGGTC 0.00051 TGGTG 0.000743 TGGTT 0.00111 TGTAA 0.00225 TGTAC 0.000912 TGTAG 0.000821 TGTAT 0.00159 TGTCA 0.00123 TGTCC 0.000477 TGTCG 0.000525 TGTCT 0.000836 TGTGA 0.00122 TGTGC 0.000699 TGTGG 0.000708 TGTGT 0.00142 TGTTA 0.00197 TGTTC 0.000983 TGTTG 0.00151 TGTTT 0.00354 TTAAA 0.00575 TTAAC 0.00174 TTAAG 0.00152 TTAAT 0.00445 TTACA 0.00225 TTACC 0.000914 TTACG 0.00102 TTACT 0.00157 TTAGA 0.00139 TTAGC 0.00079 TTAGG 0.000779 TTAGT 0.00149 TTATA 0.00272 TTATC 0.00178 TTATG 0.00168 TTATT 0.00657 TTCAA 0.00266 TTCAC 0.00117 TTCAG 0.00105 TTCAT 0.00178 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.000623 TTCCG 0.000641 TTCCT 0.000988 TTCGA 0.00112 TTCGC 0.000664 TTCGG 0.000641 TTCGT 0.00111 TTCTA 0.00151 TTCTC 0.00098 TTCTG 0.00113 TTCTT 0.00202 TTGAA 0.00266 TTGAC 0.0012 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00163 TTGCC 0.00078 TTGCG 0.000756 TTGCT 0.00119 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.00087 TTGGG 0.000727 TTGGT 0.00134 TTGTA 0.00227 TTGTC 0.00119 TTGTG 0.00171 TTGTT 0.00341 TTTAA 0.00575 TTTAC 0.00245 TTTAG 0.00188 TTTAT 0.00585 TTTCA 0.0031 TTTCC 0.0016 TTTCG 0.00165 TTTCT 0.00276 TTTGA 0.00306 TTTGC 0.0019 TTTGG 0.00179 TTTGT 0.00376 TTTTA 0.00719 TTTTC 0.00408 TTTTG 0.00489 TTTTT 0.0128 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.448 AAAAC 0.1383 AAAAG 0.09681 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3922 AAACC 0.1494 AAACG 0.1631 AAACT 0.2953 AAAGA 0.2872 AAAGC 0.1779 AAAGG 0.139 AAAGT 0.3959 AAATA 0.3255 AAATC 0.1266 AAATG 0.1565 AAATT 0.3914 AACAA 0.4271 AACAC 0.1847 AACAG 0.1469 AACAT 0.2413 AACCA 0.3652 AACCC 0.1694 AACCG 0.207 AACCT 0.2584 AACGA 0.3166 AACGC 0.1966 AACGG 0.1593 AACGT 0.3275 AACTA 0.2797 AACTC 0.1463 AACTG 0.2071 AACTT 0.3669 AAGAA 0.4262 AAGAC 0.1672 AAGAG 0.1574 AAGAT 0.2492 AAGCA 0.3497 AAGCC 0.1692 AAGCG 0.1999 AAGCT 0.2811 AAGGA 0.3079 AAGGC 0.1953 AAGGG 0.1779 AAGGT 0.3188 AAGTA 0.2676 AAGTC 0.1504 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3623 AATAA 0.504 AATAC 0.1317 AATAG 0.1072 AATAT 0.2571 AATCA 0.3857 AATCC 0.1466 AATCG 0.2047 AATCT 0.2629 AATGA 0.3175 AATGC 0.1718 AATGG 0.1581 AATGT 0.3525 AATTA 0.2987 AATTC 0.122 AATTG 0.1474 AATTT 0.432 ACAAA 0.4435 ACAAC 0.15 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2881 ACACA 0.3746 ACACC 0.1743 ACACG 0.1605 ACACT 0.2905 ACAGA 0.3186 ACAGC 0.1776 ACAGG 0.1599 ACAGT 0.3439 ACATA 0.2699 ACATC 0.1399 ACATG 0.1474 ACATT 0.4428 ACCAA 0.4266 ACCAC 0.1965 ACCAG 0.1426 ACCAT 0.2343 ACCCA 0.3477 ACCCC 0.2084 ACCCG 0.1609 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3264 ACCGC 0.192 ACCGG 0.2005 ACCGT 0.281 ACCTA 0.3033 ACCTC 0.1763 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.3312 ACGAA 0.3907 ACGAC 0.1756 ACGAG 0.1725 ACGAT 0.2612 ACGCA 0.3579 ACGCC 0.1985 ACGCG 0.1621 ACGCT 0.2815 ACGGA 0.3002 ACGGC 0.2107 ACGGG 0.1596 ACGGT 0.3296 ACGTA 0.267 ACGTC 0.1773 ACGTG 0.2052 ACGTT 0.3505 ACTAA 0.3937 ACTAC 0.171 ACTAG 0.146 ACTAT 0.2893 ACTCA 0.3636 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.212 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3222 ACTGC 0.1668 ACTGG 0.1595 ACTGT 0.3515 ACTTA 0.2427 ACTTC 0.1322 ACTTG 0.179 ACTTT 0.4461 AGAAA 0.4912 AGAAC 0.1285 AGAAG 0.1274 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3891 AGACC 0.1439 AGACG 0.1962 AGACT 0.2708 AGAGA 0.3552 AGAGC 0.1893 AGAGG 0.173 AGAGT 0.2825 AGATA 0.3311 AGATC 0.1191 AGATG 0.169 AGATT 0.3808 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.166 AGCAT 0.2184 AGCCA 0.3729 AGCCC 0.1776 AGCCG 0.2109 AGCCT 0.2386 AGCGA 0.3372 AGCGC 0.2069 AGCGG 0.1723 AGCGT 0.2836 AGCTA 0.2611 AGCTC 0.1731 AGCTG 0.2108 AGCTT 0.355 AGGAA 0.4431 AGGAC 0.1558 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2407 AGGCA 0.3535 AGGCC 0.1862 AGGCG 0.2079 AGGCT 0.2524 AGGGA 0.2937 AGGGC 0.199 AGGGG 0.1969 AGGGT 0.3104 AGGTA 0.3098 AGGTC 0.1539 AGGTG 0.2166 AGGTT 0.3198 AGTAA 0.4179 AGTAC 0.1654 AGTAG 0.1569 AGTAT 0.2598 AGTCA 0.3666 AGTCC 0.1577 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.254 AGTGA 0.309 AGTGC 0.1808 AGTGG 0.1802 AGTGT 0.33 AGTTA 0.2522 AGTTC 0.1259 AGTTG 0.1764 AGTTT 0.4455 ATAAA 0.4574 ATAAC 0.1305 ATAAG 0.09998 ATAAT 0.3121 ATACA 0.4258 ATACC 0.1504 ATACG 0.159 ATACT 0.2649 ATAGA 0.3161 ATAGC 0.1701 ATAGG 0.1573 ATAGT 0.3564 ATATA 0.2628 ATATC 0.1381 ATATG 0.1324 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3822 ATCAC 0.2012 ATCAG 0.1646 ATCAT 0.252 ATCCA 0.3599 ATCCC 0.1718 ATCCG 0.1846 ATCCT 0.2837 ATCGA 0.3314 ATCGC 0.2041 ATCGG 0.1701 ATCGT 0.2944 ATCTA 0.2807 ATCTC 0.1821 ATCTG 0.2011 ATCTT 0.3361 ATGAA 0.4001 ATGAC 0.1827 ATGAG 0.1481 ATGAT 0.2691 ATGCA 0.4139 ATGCC 0.1537 ATGCG 0.1847 ATGCT 0.2478 ATGGA 0.3082 ATGGC 0.2163 ATGGG 0.1622 ATGGT 0.3133 ATGTA 0.2889 ATGTC 0.1454 ATGTG 0.1896 ATGTT 0.3761 ATTAA 0.3845 ATTAC 0.1521 ATTAG 0.1205 ATTAT 0.3429 ATTCA 0.3586 ATTCC 0.1773 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2897 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1569 ATTGT 0.3903 ATTTA 0.2507 ATTTC 0.1314 ATTTG 0.1436 ATTTT 0.4744 CAAAA 0.475 CAAAC 0.1415 CAAAG 0.1084 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4074 CAACC 0.1512 CAACG 0.1491 CAACT 0.2923 CAAGA 0.2982 CAAGC 0.165 CAAGG 0.1754 CAAGT 0.3614 CAATA 0.3016 CAATC 0.1233 CAATG 0.1483 CAATT 0.4268 CACAA 0.4266 CACAC 0.1777 CACAG 0.1465 CACAT 0.2492 CACCA 0.3709 CACCC 0.1915 CACCG 0.1626 CACCT 0.275 CACGA 0.3106 CACGC 0.1734 CACGG 0.1332 CACGT 0.3828 CACTA 0.223 CACTC 0.1614 CACTG 0.1999 CACTT 0.4157 CAGAA 0.4276 CAGAC 0.157 CAGAG 0.1453 CAGAT 0.2701 CAGCA 0.3246 CAGCC 0.182 CAGCG 0.2019 CAGCT 0.2916 CAGGA 0.3238 CAGGC 0.1574 CAGGG 0.1864 CAGGT 0.3324 CAGTA 0.2303 CAGTC 0.1601 CAGTG 0.2076 CAGTT 0.402 CATAA 0.4659 CATAC 0.1417 CATAG 0.1248 CATAT 0.2676 CATCA 0.375 CATCC 0.1623 CATCG 0.176 CATCT 0.2868 CATGA 0.3062 CATGC 0.1774 CATGG 0.1594 CATGT 0.357 CATTA 0.2415 CATTC 0.1246 CATTG 0.145 CATTT 0.4889 CCAAA 0.4456 CCAAC 0.1763 CCAAG 0.1278 CCAAT 0.2503 CCACA 0.3533 CCACC 0.2073 CCACG 0.1384 CCACT 0.3011 CCAGA 0.3106 CCAGC 0.1859 CCAGG 0.1557 CCAGT 0.3478 CCATA 0.2516 CCATC 0.1605 CCATG 0.1463 CCATT 0.4416 CCCAA 0.415 CCCAC 0.2116 CCCAG 0.1432 CCCAT 0.2303 CCCCA 0.359 CCCCC 0.222 CCCCG 0.1706 CCCCT 0.2485 CCCGA 0.3482 CCCGC 0.1863 CCCGG 0.2075 CCCGT 0.258 CCCTA 0.2556 CCCTC 0.1926 CCCTG 0.2013 CCCTT 0.3505 CCGAA 0.3877 CCGAC 0.193 CCGAG 0.1537 CCGAT 0.2656 CCGCA 0.3113 CCGCC 0.2517 CCGCG 0.1566 CCGCT 0.2804 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.2008 CCGGG 0.1701 CCGGT 0.3118 CCGTA 0.256 CCGTC 0.1861 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3932 CCTAA 0.4044 CCTAC 0.2078 CCTAG 0.1276 CCTAT 0.2603 CCTCA 0.318 CCTCC 0.1992 CCTCG 0.1938 CCTCT 0.289 CCTGA 0.2937 CCTGC 0.1786 CCTGG 0.1604 CCTGT 0.3673 CCTTA 0.236 CCTTC 0.1746 CCTTG 0.2102 CCTTT 0.3792 CGAAA 0.4706 CGAAC 0.1383 CGAAG 0.1293 CGAAT 0.2618 CGACA 0.3132 CGACC 0.1865 CGACG 0.1795 CGACT 0.3208 CGAGA 0.3093 CGAGC 0.1843 CGAGG 0.1741 CGAGT 0.3323 CGATA 0.2669 CGATC 0.1269 CGATG 0.1571 CGATT 0.4491 CGCAA 0.3979 CGCAC 0.193 CGCAG 0.1555 CGCAT 0.2537 CGCCA 0.3942 CGCCC 0.1822 CGCCG 0.2027 CGCCT 0.2209 CGCGA 0.3326 CGCGC 0.2293 CGCGG 0.1625 CGCGT 0.2756 CGCTA 0.2253 CGCTC 0.1855 CGCTG 0.2159 CGCTT 0.3733 CGGAA 0.425 CGGAC 0.1744 CGGAG 0.1592 CGGAT 0.2414 CGGCA 0.2927 CGGCC 0.2055 CGGCG 0.2313 CGGCT 0.2706 CGGGA 0.3203 CGGGC 0.1812 CGGGG 0.2162 CGGGT 0.2823 CGGTA 0.2268 CGGTC 0.1585 CGGTG 0.2049 CGGTT 0.4098 CGTAA 0.439 CGTAC 0.143 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2718 CGTCA 0.363 CGTCC 0.1773 CGTCG 0.1852 CGTCT 0.2745 CGTGA 0.2917 CGTGC 0.1737 CGTGG 0.167 CGTGT 0.3676 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.141 CGTTG 0.1697 CGTTT 0.464 CTAAA 0.4307 CTAAC 0.1454 CTAAG 0.1073 CTAAT 0.3167 CTACA 0.3941 CTACC 0.1653 CTACG 0.1534 CTACT 0.2871 CTAGA 0.3561 CTAGC 0.1607 CTAGG 0.145 CTAGT 0.3382 CTATA 0.2575 CTATC 0.1425 CTATG 0.1446 CTATT 0.4554 CTCAA 0.4122 CTCAC 0.1718 CTCAG 0.1473 CTCAT 0.2688 CTCCA 0.3757 CTCCC 0.1811 CTCCG 0.1736 CTCCT 0.2696 CTCGA 0.3322 CTCGC 0.1827 CTCGG 0.163 CTCGT 0.3221 CTCTA 0.2755 CTCTC 0.189 CTCTG 0.1808 CTCTT 0.3547 CTGAA 0.3931 CTGAC 0.1757 CTGAG 0.1363 CTGAT 0.295 CTGCA 0.3641 CTGCC 0.1638 CTGCG 0.1772 CTGCT 0.2949 CTGGA 0.3369 CTGGC 0.1891 CTGGG 0.164 CTGGT 0.31 CTGTA 0.2905 CTGTC 0.1576 CTGTG 0.1807 CTGTT 0.3712 CTTAA 0.3868 CTTAC 0.1589 CTTAG 0.1231 CTTAT 0.3313 CTTCA 0.3536 CTTCC 0.185 CTTCG 0.1712 CTTCT 0.2902 CTTGA 0.318 CTTGC 0.1793 CTTGG 0.1674 CTTGT 0.3353 CTTTA 0.2589 CTTTC 0.1499 CTTTG 0.166 CTTTT 0.4252 GAAAA 0.4557 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1126 GAAAT 0.2897 GAACA 0.3828 GAACC 0.1457 GAACG 0.1757 GAACT 0.2957 GAAGA 0.3203 GAAGC 0.1904 GAAGG 0.1727 GAAGT 0.3166 GAATA 0.2733 GAATC 0.1274 GAATG 0.159 GAATT 0.4403 GACAA 0.3906 GACAC 0.1919 GACAG 0.1673 GACAT 0.2502 GACCA 0.3728 GACCC 0.1622 GACCG 0.1821 GACCT 0.2829 GACGA 0.3005 GACGC 0.1967 GACGG 0.1573 GACGT 0.3455 GACTA 0.2386 GACTC 0.1422 GACTG 0.2176 GACTT 0.4017 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1524 GAGAG 0.1703 GAGAT 0.2741 GAGCA 0.3559 GAGCC 0.1637 GAGCG 0.2019 GAGCT 0.2785 GAGGA 0.3086 GAGGC 0.1763 GAGGG 0.1882 GAGGT 0.3268 GAGTA 0.2438 GAGTC 0.1423 GAGTG 0.2279 GAGTT 0.386 GATAA 0.4737 GATAC 0.1266 GATAG 0.1222 GATAT 0.2774 GATCA 0.3819 GATCC 0.1547 GATCG 0.1913 GATCT 0.2721 GATGA 0.3238 GATGC 0.1691 GATGG 0.1726 GATGT 0.3345 GATTA 0.2476 GATTC 0.122 GATTG 0.1473 GATTT 0.483 GCAAA 0.4417 GCAAC 0.165 GCAAG 0.1281 GCAAT 0.2652 GCACA 0.3597 GCACC 0.182 GCACG 0.1479 GCACT 0.3104 GCAGA 0.3026 GCAGC 0.2054 GCAGG 0.1588 GCAGT 0.3332 GCATA 0.2402 GCATC 0.1494 GCATG 0.1547 GCATT 0.4557 GCCAA 0.4085 GCCAC 0.2084 GCCAG 0.1339 GCCAT 0.2492 GCCCA 0.3158 GCCCC 0.2542 GCCCG 0.156 GCCCT 0.274 GCCGA 0.3108 GCCGC 0.2341 GCCGG 0.1903 GCCGT 0.2648 GCCTA 0.2461 GCCTC 0.185 GCCTG 0.1744 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3615 GCGAC 0.199 GCGAG 0.1542 GCGAT 0.2853 GCGCA 0.3058 GCGCC 0.2483 GCGCG 0.1767 GCGCT 0.2691 GCGGA 0.2772 GCGGC 0.2556 GCGGG 0.1581 GCGGT 0.3091 GCGTA 0.2193 GCGTC 0.195 GCGTG 0.1795 GCGTT 0.4063 GCTAA 0.3996 GCTAC 0.1896 GCTAG 0.1374 GCTAT 0.2735 GCTCA 0.327 GCTCC 0.1891 GCTCG 0.1905 GCTCT 0.2934 GCTGA 0.2997 GCTGC 0.1949 GCTGG 0.1615 GCTGT 0.3439 GCTTA 0.2295 GCTTC 0.1694 GCTTG 0.1741 GCTTT 0.4269 GGAAA 0.4542 GGAAC 0.1451 GGAAG 0.138 GGAAT 0.2628 GGACA 0.3568 GGACC 0.1592 GGACG 0.208 GGACT 0.276 GGAGA 0.3205 GGAGC 0.2061 GGAGG 0.2014 GGAGT 0.272 GGATA 0.2568 GGATC 0.134 GGATG 0.1892 GGATT 0.42 GGCAA 0.429 GGCAC 0.206 GGCAG 0.1478 GGCAT 0.2171 GGCCA 0.3586 GGCCC 0.198 GGCCG 0.2113 GGCCT 0.2321 GGCGA 0.2876 GGCGC 0.2493 GGCGG 0.202 GGCGT 0.2612 GGCTA 0.2324 GGCTC 0.1747 GGCTG 0.2259 GGCTT 0.367 GGGAA 0.423 GGGAC 0.1787 GGGAG 0.1693 GGGAT 0.229 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2132 GGGCG 0.2302 GGGCT 0.2523 GGGGA 0.2578 GGGGC 0.2326 GGGGG 0.2216 GGGGT 0.288 GGGTA 0.2253 GGGTC 0.1523 GGGTG 0.2605 GGGTT 0.3619 GGTAA 0.4107 GGTAC 0.1737 GGTAG 0.1579 GGTAT 0.2577 GGTCA 0.3865 GGTCC 0.1572 GGTCG 0.223 GGTCT 0.2333 GGTGA 0.278 GGTGC 0.1788 GGTGG 0.2093 GGTGT 0.3339 GGTTA 0.2417 GGTTC 0.1242 GGTTG 0.1827 GGTTT 0.4515 GTAAA 0.4318 GTAAC 0.1438 GTAAG 0.1092 GTAAT 0.3152 GTACA 0.4007 GTACC 0.1717 GTACG 0.1418 GTACT 0.2858 GTAGA 0.3179 GTAGC 0.1771 GTAGG 0.1886 GTAGT 0.3164 GTATA 0.2704 GTATC 0.1236 GTATG 0.1375 GTATT 0.4685 GTCAA 0.3764 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1526 GTCAT 0.2664 GTCCA 0.3626 GTCCC 0.1895 GTCCG 0.1884 GTCCT 0.2595 GTCGA 0.2916 GTCGC 0.2174 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.3023 GTCTA 0.2449 GTCTC 0.1724 GTCTG 0.1989 GTCTT 0.3838 GTGAA 0.3606 GTGAC 0.1995 GTGAG 0.1346 GTGAT 0.3053 GTGCA 0.3535 GTGCC 0.1892 GTGCG 0.1823 GTGCT 0.2751 GTGGA 0.2896 GTGGC 0.2168 GTGGG 0.1786 GTGGT 0.315 GTGTA 0.2478 GTGTC 0.1569 GTGTG 0.1902 GTGTT 0.4051 GTTAA 0.355 GTTAC 0.1669 GTTAG 0.133 GTTAT 0.345 GTTCA 0.3327 GTTCC 0.1936 GTTCG 0.1823 GTTCT 0.2913 GTTGA 0.2625 GTTGC 0.1922 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2331 GTTTC 0.1431 GTTTG 0.164 GTTTT 0.4598 TAAAA 0.4563 TAAAC 0.1286 TAAAG 0.1081 TAAAT 0.3071 TAACA 0.4026 TAACC 0.1464 TAACG 0.145 TAACT 0.306 TAAGA 0.3102 TAAGC 0.166 TAAGG 0.1501 TAAGT 0.3737 TAATA 0.3027 TAATC 0.1096 TAATG 0.1306 TAATT 0.4571 TACAA 0.409 TACAC 0.1616 TACAG 0.1644 TACAT 0.265 TACCA 0.3606 TACCC 0.1434 TACCG 0.1557 TACCT 0.3404 TACGA 0.3379 TACGC 0.153 TACGG 0.1495 TACGT 0.3597 TACTA 0.248 TACTC 0.1441 TACTG 0.1852 TACTT 0.4227 TAGAA 0.4219 TAGAC 0.1411 TAGAG 0.1618 TAGAT 0.2753 TAGCA 0.3692 TAGCC 0.1556 TAGCG 0.1751 TAGCT 0.3001 TAGGA 0.2845 TAGGC 0.1603 TAGGG 0.1708 TAGGT 0.3843 TAGTA 0.2451 TAGTC 0.1395 TAGTG 0.1841 TAGTT 0.4313 TATAA 0.4306 TATAC 0.1538 TATAG 0.1226 TATAT 0.293 TATCA 0.371 TATCC 0.1282 TATCG 0.174 TATCT 0.3269 TATGA 0.3045 TATGC 0.1592 TATGG 0.1584 TATGT 0.3779 TATTA 0.2683 TATTC 0.1027 TATTG 0.1414 TATTT 0.4876 TCAAA 0.4596 TCAAC 0.1411 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2571 TCACA 0.3728 TCACC 0.1672 TCACG 0.1467 TCACT 0.3133 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.1826 TCAGG 0.1509 TCAGT 0.3719 TCATA 0.2477 TCATC 0.1542 TCATG 0.144 TCATT 0.4541 TCCAA 0.3944 TCCAC 0.1933 TCCAG 0.1657 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.352 TCCCC 0.1899 TCCCG 0.1858 TCCCT 0.2724 TCCGA 0.3189 TCCGC 0.1855 TCCGG 0.2198 TCCGT 0.2757 TCCTA 0.2508 TCCTC 0.186 TCCTG 0.206 TCCTT 0.3573 TCGAA 0.3853 TCGAC 0.1624 TCGAG 0.1705 TCGAT 0.2818 TCGCA 0.3291 TCGCC 0.1958 TCGCG 0.1752 TCGCT 0.2998 TCGGA 0.2911 TCGGC 0.2074 TCGGG 0.1806 TCGGT 0.321 TCGTA 0.2755 TCGTC 0.1694 TCGTG 0.1829 TCGTT 0.3722 TCTAA 0.3888 TCTAC 0.1804 TCTAG 0.1614 TCTAT 0.2694 TCTCA 0.3232 TCTCC 0.171 TCTCG 0.1858 TCTCT 0.32 TCTGA 0.2917 TCTGC 0.1732 TCTGG 0.1628 TCTGT 0.3723 TCTTA 0.2497 TCTTC 0.1659 TCTTG 0.1831 TCTTT 0.4013 TGAAA 0.4696 TGAAC 0.1266 TGAAG 0.134 TGAAT 0.2699 TGACA 0.3858 TGACC 0.1647 TGACG 0.1793 TGACT 0.2702 TGAGA 0.3146 TGAGC 0.185 TGAGG 0.167 TGAGT 0.3333 TGATA 0.2841 TGATC 0.1264 TGATG 0.1671 TGATT 0.4224 TGCAA 0.4172 TGCAC 0.1728 TGCAG 0.1475 TGCAT 0.2625 TGCCA 0.4057 TGCCC 0.164 TGCCG 0.1746 TGCCT 0.2557 TGCGA 0.3199 TGCGC 0.2032 TGCGG 0.1653 TGCGT 0.3116 TGCTA 0.2636 TGCTC 0.1815 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3624 TGGAA 0.4394 TGGAC 0.1634 TGGAG 0.1678 TGGAT 0.2293 TGGCA 0.3475 TGGCC 0.1782 TGGCG 0.2299 TGGCT 0.2444 TGGGA 0.2977 TGGGC 0.1799 TGGGG 0.2232 TGGGT 0.2992 TGGTA 0.2574 TGGTC 0.159 TGGTG 0.2291 TGGTT 0.3544 TGTAA 0.4046 TGTAC 0.1596 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2875 TGTCA 0.3999 TGTCC 0.1557 TGTCG 0.1655 TGTCT 0.2789 TGTGA 0.3028 TGTGC 0.1726 TGTGG 0.1742 TGTGT 0.3504 TGTTA 0.249 TGTTC 0.1223 TGTTG 0.1845 TGTTT 0.4442 TTAAA 0.4332 TTAAC 0.1267 TTAAG 0.1101 TTAAT 0.3301 TTACA 0.3937 TTACC 0.1574 TTACG 0.1687 TTACT 0.2801 TTAGA 0.318 TTAGC 0.1733 TTAGG 0.1704 TTAGT 0.3382 TTATA 0.2185 TTATC 0.1334 TTATG 0.1304 TTATT 0.5176 TTCAA 0.4044 TTCAC 0.1702 TTCAG 0.1571 TTCAT 0.2684 TTCCA 0.3719 TTCCC 0.1712 TTCCG 0.1753 TTCCT 0.2816 TTCGA 0.3236 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.1773 TTCGT 0.3144 TTCTA 0.2703 TTCTC 0.1684 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.3612 TTGAA 0.4028 TTGAC 0.1725 TTGAG 0.1519 TTGAT 0.2728 TTGCA 0.3787 TTGCC 0.1748 TTGCG 0.1667 TTGCT 0.2798 TTGGA 0.2883 TTGGC 0.2073 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3335 TTGTA 0.2681 TTGTC 0.1365 TTGTG 0.1951 TTGTT 0.4003 TTTAA 0.3659 TTTAC 0.1511 TTTAG 0.1188 TTTAT 0.3643 TTTCA 0.3453 TTTCC 0.1696 TTTCG 0.1736 TTTCT 0.3116 TTTGA 0.2949 TTTGC 0.1774 TTTGG 0.1675 TTTGT 0.3602 TTTTA 0.2487 TTTTC 0.138 TTTTG 0.1655 TTTTT 0.4477