[1] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.348 C 0.152 G 0.152 T 0.348 # l= 1 # Values AA 0.128 AC 0.0517 AG 0.0462 AT 0.122 CA 0.0554 CC 0.0214 CG 0.0292 CT 0.0462 GA 0.053 GC 0.0262 GG 0.0214 GT 0.0517 TA 0.112 TC 0.053 TG 0.0554 TT 0.128 # l= 2 # Values AAA 0.05 AAC 0.0174 AAG 0.0175 AAT 0.043 ACA 0.0209 ACC 0.00675 ACG 0.00981 ACT 0.0142 AGA 0.0176 AGC 0.00744 AGG 0.00694 AGT 0.0142 ATA 0.0437 ATC 0.0166 ATG 0.0188 ATT 0.043 CAA 0.0193 CAC 0.00888 CAG 0.00846 CAT 0.0188 CCA 0.00784 CCC 0.00293 CCG 0.00371 CCT 0.00694 CGA 0.0104 CGC 0.00523 CGG 0.00371 CGT 0.00981 CTA 0.0125 CTC 0.00781 CTG 0.00846 CTT 0.0175 GAA 0.0215 GAC 0.00708 GAG 0.00781 GAT 0.0166 GCA 0.00988 GCC 0.00361 GCG 0.00523 GCT 0.00744 GGA 0.00812 GGC 0.00361 GGG 0.00293 GGT 0.00675 GTA 0.0183 GTC 0.00708 GTG 0.00888 GTT 0.0174 TAA 0.037 TAC 0.0183 TAG 0.0125 TAT 0.0437 TCA 0.0168 TCC 0.00812 TCG 0.0104 TCT 0.0176 TGA 0.0168 TGC 0.00988 TGG 0.00784 TGT 0.0209 TTA 0.037 TTC 0.0215 TTG 0.0193 TTT 0.05 # l= 3 # Values AAAA 0.019 AAAC 0.00659 AAAG 0.00708 AAAT 0.0174 AACA 0.00712 AACC 0.00208 AACG 0.0034 AACT 0.0048 AAGA 0.00688 AAGC 0.0026 AAGG 0.00255 AAGT 0.00542 AATA 0.0158 AATC 0.00528 AATG 0.00685 AATT 0.0151 ACAA 0.00741 ACAC 0.00311 ACAG 0.00309 ACAT 0.00728 ACCA 0.00258 ACCC 0.000788 ACCG 0.00124 ACCT 0.00214 ACGA 0.00366 ACGC 0.00165 ACGG 0.00117 ACGT 0.00332 ACTA 0.00413 ACTC 0.00199 ACTG 0.00268 ACTT 0.00542 AGAA 0.00762 AGAC 0.00202 AGAG 0.0028 AGAT 0.00518 AGCA 0.00295 AGCC 0.000959 AGCG 0.00138 AGCT 0.00216 AGGA 0.00283 AGGC 0.001 AGGG 0.000969 AGGT 0.00214 AGTA 0.00521 AGTC 0.00183 AGTG 0.00237 AGTT 0.0048 ATAA 0.0146 ATAC 0.00652 ATAG 0.00463 ATAT 0.018 ATCA 0.00562 ATCC 0.00226 ATCG 0.0035 ATCT 0.00518 ATGA 0.00594 ATGC 0.00304 ATGG 0.00254 ATGT 0.00728 ATTA 0.0132 ATTC 0.00608 ATTG 0.00634 ATTT 0.0174 CAAA 0.00726 CAAC 0.00291 CAAG 0.00275 CAAT 0.00634 CACA 0.00323 CACC 0.00137 CACG 0.0019 CACT 0.00237 CAGA 0.00292 CAGC 0.00157 CAGG 0.00128 CAGT 0.00268 CATA 0.00621 CATC 0.00289 CATG 0.00284 CATT 0.00686 CCAA 0.00258 CCAC 0.00146 CCAG 0.00125 CCAT 0.00254 CCCA 0.000925 CCCC 0.000525 CCCG 0.000511 CCCT 0.000968 CCGA 0.00121 CCGC 0.000751 CCGG 0.000567 CCGT 0.00118 CCTA 0.00174 CCTC 0.00136 CCTG 0.00128 CCTT 0.00255 CGAA 0.00362 CGAC 0.0016 CGAG 0.00172 CGAT 0.0035 CGCA 0.00158 CGCC 0.000749 CGCG 0.00152 CGCT 0.00138 CGGA 0.00124 CGGC 0.000713 CGGG 0.000511 CGGT 0.00124 CGTA 0.00296 CGTC 0.00155 CGTG 0.0019 CGTT 0.0034 CTAA 0.00391 CTAC 0.0024 CTAG 0.00156 CTAT 0.00463 CTCA 0.00196 CTCC 0.00133 CTCG 0.00172 CTCT 0.0028 CTGA 0.00241 CTGC 0.00171 CTGG 0.00125 CTGT 0.00309 CTTA 0.00414 CTTC 0.00349 CTTG 0.00275 CTTT 0.00708 GAAA 0.009 GAAC 0.00296 GAAG 0.00349 GAAT 0.00608 GACA 0.00274 GACC 0.000961 GACG 0.00155 GACT 0.00183 GAGA 0.00321 GAGC 0.00124 GAGG 0.00136 GAGT 0.00199 GATA 0.00573 GATC 0.00266 GATG 0.00289 GATT 0.00528 GCAA 0.00353 GCAC 0.0016 GCAG 0.00171 GCAT 0.00304 GCCA 0.00142 GCCC 0.000474 GCCG 0.000713 GCCT 0.001 GCGA 0.0018 GCGC 0.00104 GCGG 0.000751 GCGT 0.00165 GCTA 0.00202 GCTC 0.00124 GCTG 0.00157 GCTT 0.00261 GGAA 0.00345 GGAC 0.00109 GGAG 0.00133 GGAT 0.00226 GGCA 0.00137 GGCC 0.000529 GGCG 0.000749 GGCT 0.000959 GGGA 0.00114 GGGC 0.000474 GGGG 0.000525 GGGT 0.000788 GGTA 0.00234 GGTC 0.000961 GGTG 0.00137 GGTT 0.00208 GTAA 0.00621 GTAC 0.00319 GTAG 0.0024 GTAT 0.00652 GTCA 0.00236 GTCC 0.00109 GTCG 0.0016 GTCT 0.00202 GTGA 0.00271 GTGC 0.0016 GTGG 0.00146 GTGT 0.00311 GTTA 0.00494 GTTC 0.00296 GTTG 0.00291 GTTT 0.00659 TAAA 0.0148 TAAC 0.00494 TAAG 0.00414 TAAT 0.0132 TACA 0.0078 TACC 0.00234 TACG 0.00296 TACT 0.00521 TAGA 0.0046 TAGC 0.00202 TAGG 0.00174 TAGT 0.00413 TATA 0.016 TATC 0.00573 TATG 0.00621 TATT 0.0158 TCAA 0.00573 TCAC 0.00271 TCAG 0.00241 TCAT 0.00594 TCCA 0.00291 TCCC 0.00114 TCCG 0.00124 TCCT 0.00283 TCGA 0.00377 TCGC 0.0018 TCGG 0.00121 TCGT 0.00366 TCTA 0.0046 TCTC 0.00321 TCTG 0.00292 TCTT 0.00689 TGAA 0.00683 TGAC 0.00236 TGAG 0.00196 TGAT 0.00562 TGCA 0.00398 TGCC 0.00137 TGCG 0.00158 TGCT 0.00295 TGGA 0.00291 TGGC 0.00142 TGGG 0.000925 TGGT 0.00258 TGTA 0.0078 TGTC 0.00273 TGTG 0.00324 TGTT 0.00712 TTAA 0.0123 TTAC 0.00621 TTAG 0.00391 TTAT 0.0146 TTCA 0.00683 TTCC 0.00345 TTCG 0.00362 TTCT 0.00762 TTGA 0.00573 TTGC 0.00353 TTGG 0.00258 TTGT 0.00741 TTTA 0.0148 TTTC 0.009 TTTG 0.00726 TTTT 0.019 # l= 4 # Values AAAAA 0.00715 AAAAC 0.00231 AAAAG 0.00279 AAAAT 0.00678 AAACA 0.00274 AAACC 0.000733 AAACG 0.00128 AAACT 0.00183 AAAGA 0.00288 AAAGC 0.000991 AAAGG 0.00103 AAAGT 0.00217 AAATA 0.00665 AAATC 0.00197 AAATG 0.0028 AAATT 0.00593 AACAA 0.00269 AACAC 0.000965 AACAG 0.00108 AACAT 0.00238 AACCA 0.000793 AACCC 0.000235 AACCG 0.000368 AACCT 0.00068 AACGA 0.00134 AACGC 0.000534 AACGG 0.000407 AACGT 0.00112 AACTA 0.00143 AACTC 0.000636 AACTG 0.000946 AACTT 0.00179 AAGAA 0.0031 AAGAC 0.000734 AAGAG 0.00101 AAGAT 0.00204 AAGCA 0.00106 AAGCC 0.0003 AAGCG 0.000478 AAGCT 0.000764 AAGGA 0.0011 AAGGC 0.000349 AAGGG 0.000354 AAGGT 0.000744 AAGTA 0.00213 AAGTC 0.000628 AAGTG 0.000877 AAGTT 0.00179 AATAA 0.00572 AATAC 0.00215 AATAG 0.00167 AATAT 0.00623 AATCA 0.00186 AATCC 0.000692 AATCG 0.00109 AATCT 0.00164 AATGA 0.00226 AATGC 0.00108 AATGG 0.000934 AATGT 0.00259 AATTA 0.00483 AATTC 0.00207 AATTG 0.00225 AATTT 0.00593 ACAAA 0.00293 ACAAC 0.000993 ACAAG 0.00102 ACAAT 0.00247 ACACA 0.00129 ACACC 0.00039 ACACG 0.000678 ACACT 0.000758 ACAGA 0.00112 ACAGC 0.000525 ACAGG 0.000476 ACAGT 0.00097 ACATA 0.0027 ACATC 0.000916 ACATG 0.00107 ACATT 0.00259 ACCAA 0.000881 ACCAC 0.000472 ACCAG 0.000431 ACCAT 0.000799 ACCCA 0.000266 ACCCC 0.000128 ACCCG 0.00014 ACCCT 0.000254 ACCGA 0.000433 ACCGC 0.000228 ACCGG 0.00019 ACCGT 0.000392 ACCTA 0.000608 ACCTC 0.000375 ACCTG 0.000411 ACCTT 0.000744 ACGAA 0.00136 ACGAC 0.000508 ACGAG 0.000591 ACGAT 0.00121 ACGCA 0.00054 ACGCC 0.000205 ACGCG 0.000481 ACGCT 0.000423 ACGGA 0.000417 ACGGC 0.000197 ACGGG 0.00017 ACGGT 0.000392 ACGTA 0.00111 ACGTC 0.000449 ACGTG 0.000641 ACGTT 0.00112 ACTAA 0.0013 ACTAC 0.000797 ACTAG 0.000508 ACTAT 0.00152 ACTCA 0.000562 ACTCC 0.0003 ACTCG 0.000472 ACTCT 0.000655 ACTGA 0.000813 ACTGC 0.000522 ACTGG 0.000376 ACTGT 0.00097 ACTTA 0.00141 ACTTC 0.000952 ACTTG 0.000879 ACTTT 0.00217 AGAAA 0.00332 AGAAC 0.000948 AGAAG 0.00126 AGAAT 0.00209 AGACA 0.000828 AGACC 0.000253 AGACG 0.000409 AGACT 0.000531 AGAGA 0.00127 AGAGC 0.000388 AGAGG 0.000486 AGAGT 0.000655 AGATA 0.00188 AGATC 0.000754 AGATG 0.000905 AGATT 0.00164 AGCAA 0.00109 AGCAC 0.00045 AGCAG 0.000545 AGCAT 0.00086 AGCCA 0.000382 AGCCC 0.000122 AGCCG 0.000177 AGCCT 0.000278 AGCGA 0.000512 AGCGC 0.000235 AGCGG 0.00021 AGCGT 0.000423 AGCTA 0.000585 AGCTC 0.000326 AGCTG 0.00048 AGCTT 0.000764 AGGAA 0.00126 AGGAC 0.000345 AGGAG 0.000458 AGGAT 0.000769 AGGCA 0.0004 AGGCC 0.000132 AGGCG 0.000192 AGGCT 0.000278 AGGGA 0.000393 AGGGC 0.000149 AGGGG 0.000172 AGGGT 0.000254 AGGTA 0.000789 AGGTC 0.00027 AGGTG 0.000399 AGGTT 0.00068 AGTAA 0.00183 AGTAC 0.000836 AGTAG 0.000786 AGTAT 0.00176 AGTCA 0.000646 AGTCC 0.000252 AGTCG 0.000402 AGTCT 0.000531 AGTGA 0.000794 AGTGC 0.000411 AGTGG 0.000411 AGTGT 0.000758 AGTTA 0.0014 AGTTC 0.000764 AGTTG 0.000802 AGTTT 0.00183 ATAAA 0.00602 ATAAC 0.00178 ATAAG 0.00153 ATAAT 0.00525 ATACA 0.00297 ATACC 0.000776 ATACG 0.00101 ATACT 0.00176 ATAGA 0.00175 ATAGC 0.00072 ATAGG 0.000635 ATAGT 0.00152 ATATA 0.00715 ATATC 0.00212 ATATG 0.00247 ATATT 0.00623 ATCAA 0.00193 ATCAC 0.000869 ATCAG 0.000813 ATCAT 0.002 ATCCA 0.000848 ATCCC 0.000293 ATCCG 0.000348 ATCCT 0.000769 ATCGA 0.00132 ATCGC 0.000566 ATCGG 0.000409 ATCGT 0.00121 ATCTA 0.00144 ATCTC 0.000836 ATCTG 0.000868 ATCTT 0.00204 ATGAA 0.0025 ATGAC 0.000785 ATGAG 0.000653 ATGAT 0.002 ATGCA 0.00131 ATGCC 0.000382 ATGCG 0.00049 ATGCT 0.00086 ATGGA 0.000977 ATGGC 0.00046 ATGGG 0.000303 ATGGT 0.000799 ATGTA 0.003 ATGTC 0.000834 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.00238 ATTAA 0.00448 ATTAC 0.00213 ATTAG 0.00135 ATTAT 0.00525 ATTCA 0.00202 ATTCC 0.000916 ATTCG 0.00105 ATTCT 0.00209 ATTGA 0.0019 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.000833 ATTGT 0.00247 ATTTA 0.00523 ATTTC 0.00286 ATTTG 0.00249 ATTTT 0.00678 CAAAA 0.00264 CAAAC 0.00105 CAAAG 0.00108 CAAAT 0.00249 CAACA 0.00114 CAACC 0.000393 CAACG 0.000573 CAACT 0.000802 CAAGA 0.000996 CAAGC 0.000465 CAAGG 0.000406 CAAGT 0.000879 CAATA 0.00213 CAATC 0.000862 CAATG 0.00109 CAATT 0.00225 CACAA 0.00106 CACAC 0.000621 CACAG 0.000496 CACAT 0.00106 CACCA 0.000511 CACCC 0.000184 CACCG 0.000276 CACCT 0.000399 CACGA 0.000643 CACGC 0.000368 CACGG 0.000247 CACGT 0.000641 CACTA 0.000624 CACTC 0.000379 CACTG 0.000494 CACTT 0.000877 CAGAA 0.0012 CAGAC 0.000372 CAGAG 0.000479 CAGAT 0.000868 CAGCA 0.000585 CAGCC 0.000226 CAGCG 0.000281 CAGCT 0.00048 CAGGA 0.000487 CAGGC 0.000206 CAGGG 0.000181 CAGGT 0.000411 CAGTA 0.00085 CAGTC 0.000391 CAGTG 0.000494 CAGTT 0.000946 CATAA 0.00195 CATAC 0.00106 CATAG 0.000725 CATAT 0.00247 CATCA 0.000925 CATCC 0.00045 CATCG 0.000612 CATCT 0.000905 CATGA 0.000854 CATGC 0.000508 CATGG 0.000404 CATGT 0.00107 CATTA 0.00191 CATTC 0.00105 CATTG 0.00109 CATTT 0.0028 CCAAA 0.000916 CCAAC 0.00044 CCAAG 0.000395 CCAAT 0.000833 CCACA 0.000419 CCACC 0.000321 CCACG 0.000307 CCACT 0.000411 CCAGA 0.000409 CCAGC 0.000265 CCAGG 0.000203 CCAGT 0.000376 CCATA 0.000713 CCATC 0.000489 CCATG 0.000404 CCATT 0.000934 CCCAA 0.000293 CCCAC 0.000185 CCCAG 0.000143 CCCAT 0.000303 CCCCA 0.000154 CCCCC 0.000109 CCCCG 9e-05 CCCCT 0.000172 CCCGA 0.000157 CCCGC 0.000107 CCCGG 7.73e-05 CCCGT 0.00017 CCCTA 0.000223 CCCTC 0.00021 CCCTG 0.000181 CCCTT 0.000354 CCGAA 0.000391 CCGAC 0.000206 CCGAG 0.000208 CCGAT 0.000409 CCGCA 0.000199 CCGCC 0.000133 CCGCG 0.000208 CCGCT 0.00021 CCGGA 0.000181 CCGGC 0.000118 CCGGG 7.73e-05 CCGGT 0.00019 CCGTA 0.00032 CCGTC 0.0002 CCGTG 0.000247 CCGTT 0.000407 CCTAA 0.000568 CCTAC 0.000322 CCTAG 0.000216 CCTAT 0.000635 CCTCA 0.000304 CCTCC 0.000277 CCTCG 0.000299 CCTCT 0.000486 CCTGA 0.000354 CCTGC 0.000251 CCTGG 0.000203 CCTGT 0.000476 CCTTA 0.000562 CCTTC 0.000552 CCTTG 0.000406 CCTTT 0.00103 CGAAA 0.00135 CGAAC 0.000582 CGAAG 0.000634 CGAAT 0.00105 CGACA 0.000519 CGACC 0.000245 CGACG 0.000435 CGACT 0.000402 CGAGA 0.000629 CGAGC 0.000322 CGAGG 0.000299 CGAGT 0.000472 CGATA 0.00112 CGATC 0.000681 CGATG 0.000612 CGATT 0.00109 CGCAA 0.000547 CGCAC 0.000283 CGCAG 0.000258 CGCAT 0.00049 CGCCA 0.000291 CGCCC 0.0001 CGCCG 0.000166 CGCCT 0.000192 CGCGA 0.0005 CGCGC 0.000336 CGCGG 0.000208 CGCGT 0.000481 CGCTA 0.000361 CGCTC 0.00026 CGCTG 0.000281 CGCTT 0.000478 CGGAA 0.000488 CGGAC 0.000188 CGGAG 0.000217 CGGAT 0.000348 CGGCA 0.000249 CGGCC 0.000121 CGGCG 0.000166 CGGCT 0.000177 CGGGA 0.00019 CGGGC 9.08e-05 CGGGG 9e-05 CGGGT 0.00014 CGGTA 0.000395 CGGTC 0.000201 CGGTG 0.000276 CGGTT 0.000368 CGTAA 0.000966 CGTAC 0.000565 CGTAG 0.000412 CGTAT 0.00101 CGTCA 0.000449 CGTCC 0.000255 CGTCG 0.000435 CGTCT 0.000409 CGTGA 0.000557 CGTGC 0.000356 CGTGG 0.000307 CGTGT 0.000678 CGTTA 0.00088 CGTTC 0.000674 CGTTG 0.000573 CGTTT 0.00128 CTAAA 0.00151 CTAAC 0.000593 CTAAG 0.000456 CTAAT 0.00135 CTACA 0.000855 CTACC 0.000343 CTACG 0.000412 CTACT 0.000786 CTAGA 0.000553 CTAGC 0.000282 CTAGG 0.000216 CTAGT 0.000508 CTATA 0.00153 CTATC 0.00071 CTATG 0.000725 CTATT 0.00167 CTCAA 0.000669 CTCAC 0.000357 CTCAG 0.000284 CTCAT 0.000653 CTCCA 0.000444 CTCCC 0.000206 CTCCG 0.000217 CTCCT 0.000458 CTCGA 0.000608 CTCGC 0.000314 CTCGG 0.000208 CTCGT 0.000591 CTCTA 0.000638 CTCTC 0.00067 CTCTG 0.000479 CTCTT 0.00101 CTGAA 0.000948 CTGAC 0.000361 CTGAG 0.000284 CTGAT 0.000813 CTGCA 0.000632 CTGCC 0.000276 CTGCG 0.000258 CTGCT 0.000545 CTGGA 0.000447 CTGGC 0.000234 CTGGG 0.000143 CTGGT 0.000431 CTGTA 0.00106 CTGTC 0.000455 CTGTG 0.000496 CTGTT 0.00108 CTTAA 0.00138 CTTAC 0.000775 CTTAG 0.000456 CTTAT 0.00153 CTTCA 0.000966 CTTCC 0.000631 CTTCG 0.000634 CTTCT 0.00126 CTTGA 0.000802 CTTGC 0.000534 CTTGG 0.000395 CTTGT 0.00102 CTTTA 0.0018 CTTTC 0.0014 CTTTG 0.00108 CTTTT 0.00279 GAAAA 0.00332 GAAAC 0.00141 GAAAG 0.0014 GAAAT 0.00286 GAACA 0.00116 GAACC 0.000365 GAACG 0.000674 GAACT 0.000764 GAAGA 0.00143 GAAGC 0.000554 GAAGG 0.000552 GAAGT 0.000952 GAATA 0.00205 GAATC 0.000902 GAATG 0.00105 GAATT 0.00207 GACAA 0.000986 GACAC 0.00046 GACAG 0.000455 GACAT 0.000834 GACCA 0.000371 GACCC 0.000119 GACCG 0.000201 GACCT 0.00027 GACGA 0.000634 GACGC 0.000266 GACGG 0.0002 GACGT 0.000449 GACTA 0.000505 GACTC 0.000306 GACTG 0.000391 GACTT 0.000628 GAGAA 0.00133 GAGAC 0.000379 GAGAG 0.00067 GAGAT 0.000836 GAGCA 0.000485 GAGCC 0.000171 GAGCG 0.00026 GAGCT 0.000326 GAGGA 0.00057 GAGGC 0.00021 GAGGG 0.00021 GAGGT 0.000375 GAGTA 0.000669 GAGTC 0.000306 GAGTG 0.000379 GAGTT 0.000636 GATAA 0.00191 GATAC 0.000986 GATAG 0.00071 GATAT 0.00212 GATCA 0.000828 GATCC 0.000396 GATCG 0.000681 GATCT 0.000754 GATGA 0.000979 GATGC 0.000508 GATGG 0.000489 GATGT 0.000916 GATTA 0.00154 GATTC 0.000902 GATTG 0.000862 GATTT 0.00197 GCAAA 0.00126 GCAAC 0.000602 GCAAG 0.000534 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000581 GCACC 0.000253 GCACG 0.000356 GCACT 0.000411 GCAGA 0.000572 GCAGC 0.000365 GCAGG 0.000251 GCAGT 0.000522 GCATA 0.000947 GCATC 0.000508 GCATG 0.000508 GCATT 0.00108 GCCAA 0.000435 GCCAC 0.000292 GCCAG 0.000234 GCCAT 0.00046 GCCCA 0.000147 GCCCC 8.76e-05 GCCCG 9.08e-05 GCCCT 0.000149 GCCGA 0.00023 GCCGC 0.000168 GCCGG 0.000118 GCCGT 0.000197 GCCTA 0.000238 GCCTC 0.00021 GCCTG 0.000206 GCCTT 0.000349 GCGAA 0.000603 GCGAC 0.000313 GCGAG 0.000314 GCGAT 0.000566 GCGCA 0.000313 GCGCC 0.000153 GCGCG 0.000336 GCGCT 0.000235 GCGGA 0.000248 GCGGC 0.000168 GCGGG 0.000107 GCGGT 0.000228 GCGTA 0.000482 GCGTC 0.000266 GCGTG 0.000368 GCGTT 0.000534 GCTAA 0.000593 GCTAC 0.000429 GCTAG 0.000282 GCTAT 0.00072 GCTCA 0.000313 GCTCC 0.000219 GCTCG 0.000322 GCTCT 0.000388 GCTGA 0.000416 GCTGC 0.000365 GCTGG 0.000265 GCTGT 0.000525 GCTTA 0.000595 GCTTC 0.000554 GCTTG 0.000465 GCTTT 0.000991 GGAAA 0.00137 GGAAC 0.000528 GGAAG 0.000631 GGAAT 0.000916 GGACA 0.000422 GGACC 0.000162 GGACG 0.000255 GGACT 0.000252 GGAGA 0.00053 GGAGC 0.000219 GGAGG 0.000277 GGAGT 0.0003 GGATA 0.000719 GGATC 0.000396 GGATG 0.00045 GGATT 0.000692 GGCAA 0.000478 GGCAC 0.000238 GGCAG 0.000276 GGCAT 0.000382 GGCCA 0.000203 GGCCC 7.26e-05 GGCCG 0.000121 GGCCT 0.000132 GGCGA 0.000257 GGCGC 0.000153 GGCGG 0.000133 GGCGT 0.000205 GGCTA 0.000262 GGCTC 0.000171 GGCTG 0.000226 GGCTT 0.0003 GGGAA 0.000473 GGGAC 0.000168 GGGAG 0.000206 GGGAT 0.000293 GGGCA 0.000179 GGGCC 7.26e-05 GGGCG 0.0001 GGGCT 0.000122 GGGGA 0.0002 GGGGC 8.76e-05 GGGGG 0.000109 GGGGT 0.000128 GGGTA 0.00025 GGGTC 0.000119 GGGTG 0.000184 GGGTT 0.000235 GGTAA 0.000804 GGTAC 0.000419 GGTAG 0.000343 GGTAT 0.000776 GGTCA 0.000301 GGTCC 0.000162 GGTCG 0.000245 GGTCT 0.000253 GGTGA 0.000407 GGTGC 0.000253 GGTGG 0.000321 GGTGT 0.00039 GGTTA 0.000584 GGTTC 0.000365 GGTTG 0.000393 GGTTT 0.000733 GTAAA 0.00233 GTAAC 0.000973 GTAAG 0.000775 GTAAT 0.00213 GTACA 0.00137 GTACC 0.000419 GTACG 0.000565 GTACT 0.000836 GTAGA 0.000848 GTAGC 0.000429 GTAGG 0.000322 GTAGT 0.000797 GTATA 0.00232 GTATC 0.000986 GTATG 0.00106 GTATT 0.00215 GTCAA 0.00078 GTCAC 0.000438 GTCAG 0.000361 GTCAT 0.000785 GTCCA 0.00039 GTCCC 0.000168 GTCCG 0.000188 GTCCT 0.000345 GTCGA 0.000573 GTCGC 0.000313 GTCGG 0.000206 GTCGT 0.000508 GTCTA 0.000536 GTCTC 0.000379 GTCTG 0.000372 GTCTT 0.000734 GTGAA 0.00104 GTGAC 0.000438 GTGAG 0.000357 GTGAT 0.000869 GTGCA 0.000629 GTGCC 0.000238 GTGCG 0.000283 GTGCT 0.00045 GTGGA 0.000511 GTGGC 0.000292 GTGGG 0.000185 GTGGT 0.000472 GTGTA 0.00107 GTGTC 0.00046 GTGTG 0.000621 GTGTT 0.000965 GTTAA 0.00159 GTTAC 0.000973 GTTAG 0.000593 GTTAT 0.00178 GTTCA 0.0009 GTTCC 0.000528 GTTCG 0.000582 GTTCT 0.000948 GTTGA 0.000874 GTTGC 0.000602 GTTGG 0.00044 GTTGT 0.000993 GTTTA 0.00182 GTTTC 0.00141 GTTTG 0.00105 GTTTT 0.00231 TAAAA 0.00592 TAAAC 0.00182 TAAAG 0.0018 TAAAT 0.00523 TAACA 0.00208 TAACC 0.000584 TAACG 0.00088 TAACT 0.0014 TAAGA 0.00157 TAAGC 0.000595 TAAGG 0.000562 TAAGT 0.00141 TAATA 0.00493 TAATC 0.00154 TAATG 0.00191 TAATT 0.00483 TACAA 0.00268 TACAC 0.00107 TACAG 0.00106 TACAT 0.003 TACCA 0.000907 TACCC 0.00025 TACCG 0.000395 TACCT 0.000789 TACGA 0.00105 TACGC 0.000482 TACGG 0.00032 TACGT 0.00111 TACTA 0.00157 TACTC 0.000669 TACTG 0.00085 TACTT 0.00213 TAGAA 0.00199 TAGAC 0.000536 TAGAG 0.000638 TAGAT 0.00144 TAGCA 0.000814 TAGCC 0.000262 TAGCG 0.000361 TAGCT 0.000585 TAGGA 0.000672 TAGGC 0.000238 TAGGG 0.000223 TAGGT 0.000608 TAGTA 0.00157 TAGTC 0.000505 TAGTG 0.000624 TAGTT 0.00143 TATAA 0.005 TATAC 0.00232 TATAG 0.00153 TATAT 0.00715 TATCA 0.00201 TATCC 0.000719 TATCG 0.00112 TATCT 0.00188 TATGA 0.00185 TATGC 0.000947 TATGG 0.000713 TATGT 0.0027 TATTA 0.00493 TATTC 0.00205 TATTG 0.00213 TATTT 0.00665 TCAAA 0.00215 TCAAC 0.000874 TCAAG 0.000802 TCAAT 0.0019 TCACA 0.000947 TCACC 0.000407 TCACG 0.000557 TCACT 0.000794 TCAGA 0.000822 TCAGC 0.000416 TCAGG 0.000354 TCAGT 0.000813 TCATA 0.00185 TCATC 0.000979 TCATG 0.000854 TCATT 0.00226 TCCAA 0.000975 TCCAC 0.000511 TCCAG 0.000447 TCCAT 0.000977 TCCCA 0.000358 TCCCC 0.0002 TCCCG 0.00019 TCCCT 0.000393 TCCGA 0.000394 TCCGC 0.000248 TCCGG 0.000181 TCCGT 0.000417 TCCTA 0.000672 TCCTC 0.00057 TCCTG 0.000487 TCCTT 0.0011 TCGAA 0.00127 TCGAC 0.000573 TCGAG 0.000608 TCGAT 0.00132 TCGCA 0.000527 TCGCC 0.000257 TCGCG 0.0005 TCGCT 0.000512 TCGGA 0.000394 TCGGC 0.00023 TCGGG 0.000157 TCGGT 0.000433 TCGTA 0.00105 TCGTC 0.000634 TCGTG 0.000643 TCGTT 0.00134 TCTAA 0.00145 TCTAC 0.000848 TCTAG 0.000553 TCTAT 0.00175 TCTCA 0.000785 TCTCC 0.00053 TCTCG 0.000629 TCTCT 0.00127 TCTGA 0.000822 TCTGC 0.000572 TCTGG 0.000409 TCTGT 0.00112 TCTTA 0.00157 TCTTC 0.00143 TCTTG 0.000996 TCTTT 0.00288 TGAAA 0.00295 TGAAC 0.0009 TGAAG 0.000966 TGAAT 0.00202 TGACA 0.000967 TGACC 0.000301 TGACG 0.000449 TGACT 0.000646 TGAGA 0.000785 TGAGC 0.000313 TGAGG 0.000304 TGAGT 0.000562 TGATA 0.00201 TGATC 0.000828 TGATG 0.000925 TGATT 0.00186 TGCAA 0.00141 TGCAC 0.000629 TGCAG 0.000632 TGCAT 0.00131 TGCCA 0.000545 TGCCC 0.000179 TGCCG 0.000249 TGCCT 0.0004 TGCGA 0.000527 TGCGC 0.000313 TGCGG 0.000199 TGCGT 0.00054 TGCTA 0.000814 TGCTC 0.000485 TGCTG 0.000585 TGCTT 0.00106 TGGAA 0.00123 TGGAC 0.00039 TGGAG 0.000444 TGGAT 0.000848 TGGCA 0.000545 TGGCC 0.000203 TGGCG 0.000291 TGGCT 0.000382 TGGGA 0.000358 TGGGC 0.000147 TGGGG 0.000154 TGGGT 0.000266 TGGTA 0.000907 TGGTC 0.000371 TGGTG 0.000511 TGGTT 0.000793 TGTAA 0.00261 TGTAC 0.00137 TGTAG 0.000855 TGTAT 0.00297 TGTCA 0.000967 TGTCC 0.000422 TGTCG 0.000519 TGTCT 0.000828 TGTGA 0.000947 TGTGC 0.000581 TGTGG 0.000419 TGTGT 0.00129 TGTTA 0.00208 TGTTC 0.00116 TGTTG 0.00114 TGTTT 0.00274 TTAAA 0.00489 TTAAC 0.00159 TTAAG 0.00138 TTAAT 0.00448 TTACA 0.00261 TTACC 0.000804 TTACG 0.000966 TTACT 0.00183 TTAGA 0.00145 TTAGC 0.000593 TTAGG 0.000568 TTAGT 0.0013 TTATA 0.005 TTATC 0.00191 TTATG 0.00195 TTATT 0.00572 TTCAA 0.00235 TTCAC 0.00104 TTCAG 0.000948 TTCAT 0.0025 TTCCA 0.00123 TTCCC 0.000473 TTCCG 0.000488 TTCCT 0.00126 TTCGA 0.00127 TTCGC 0.000603 TTCGG 0.000391 TTCGT 0.00136 TTCTA 0.00199 TTCTC 0.00133 TTCTG 0.0012 TTCTT 0.0031 TTGAA 0.00235 TTGAC 0.00078 TTGAG 0.000669 TTGAT 0.00193 TTGCA 0.00141 TTGCC 0.000478 TTGCG 0.000547 TTGCT 0.00109 TTGGA 0.000975 TTGGC 0.000435 TTGGG 0.000293 TTGGT 0.000881 TTGTA 0.00268 TTGTC 0.000986 TTGTG 0.00106 TTGTT 0.00269 TTTAA 0.00489 TTTAC 0.00233 TTTAG 0.00151 TTTAT 0.00602 TTTCA 0.00295 TTTCC 0.00137 TTTCG 0.00135 TTTCT 0.00332 TTTGA 0.00215 TTTGC 0.00126 TTTGG 0.000916 TTTGT 0.00293 TTTTA 0.00592 TTTTC 0.00332 TTTTG 0.00264 TTTTT 0.00715 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3757 AAAAC 0.1212 AAAAG 0.1468 AAAAT 0.3563 AAACA 0.4165 AAACC 0.1112 AAACG 0.1939 AAACT 0.2783 AAAGA 0.4075 AAAGC 0.1401 AAAGG 0.1453 AAAGT 0.307 AAATA 0.3831 AAATC 0.1137 AAATG 0.1616 AAATT 0.3416 AACAA 0.3784 AACAC 0.1355 AACAG 0.1514 AACAT 0.3347 AACCA 0.3821 AACCC 0.1133 AACCG 0.1771 AACCT 0.3276 AACGA 0.3936 AACGC 0.1568 AACGG 0.1196 AACGT 0.33 AACTA 0.2983 AACTC 0.1324 AACTG 0.1971 AACTT 0.3722 AAGAA 0.4503 AAGAC 0.1066 AAGAG 0.147 AAGAT 0.296 AAGCA 0.4081 AAGCC 0.1151 AAGCG 0.1836 AAGCT 0.2933 AAGGA 0.4325 AAGGC 0.1368 AAGGG 0.139 AAGGT 0.2918 AAGTA 0.3924 AAGTC 0.1159 AAGTG 0.1618 AAGTT 0.3299 AATAA 0.3627 AATAC 0.1366 AATAG 0.1058 AATAT 0.3948 AATCA 0.3514 AATCC 0.1311 AATCG 0.2062 AATCT 0.3112 AATGA 0.329 AATGC 0.1569 AATGG 0.1362 AATGT 0.3778 AATTA 0.3203 AATTC 0.1375 AATTG 0.1492 AATTT 0.3931 ACAAA 0.3958 ACAAC 0.134 ACAAG 0.1371 ACAAT 0.333 ACACA 0.4132 ACACC 0.1255 ACACG 0.2179 ACACT 0.2434 ACAGA 0.3618 ACAGC 0.1699 ACAGG 0.154 ACAGT 0.3142 ACATA 0.3709 ACATC 0.1258 ACATG 0.1476 ACATT 0.3558 ACCAA 0.341 ACCAC 0.1827 ACCAG 0.1668 ACCAT 0.3095 ACCCA 0.3377 ACCCC 0.1626 ACCCG 0.1777 ACCCT 0.322 ACCGA 0.3484 ACCGC 0.1835 ACCGG 0.1527 ACCGT 0.3154 ACCTA 0.2844 ACCTC 0.1755 ACCTG 0.1924 ACCTT 0.3478 ACGAA 0.3706 ACGAC 0.1387 ACGAG 0.1614 ACGAT 0.3293 ACGCA 0.3276 ACGCC 0.1244 ACGCG 0.2915 ACGCT 0.2565 ACGGA 0.3546 ACGGC 0.1675 ACGGG 0.1447 ACGGT 0.3333 ACGTA 0.3338 ACGTC 0.1351 ACGTG 0.1929 ACGTT 0.3383 ACTAA 0.3154 ACTAC 0.1928 ACTAG 0.1229 ACTAT 0.369 ACTCA 0.2825 ACTCC 0.1509 ACTCG 0.2372 ACTCT 0.3293 ACTGA 0.3033 ACTGC 0.1945 ACTGG 0.1403 ACTGT 0.3619 ACTTA 0.2607 ACTTC 0.1757 ACTTG 0.1624 ACTTT 0.4012 AGAAA 0.4358 AGAAC 0.1244 AGAAG 0.1653 AGAAT 0.2744 AGACA 0.4096 AGACC 0.1254 AGACG 0.2025 AGACT 0.2625 AGAGA 0.4538 AGAGC 0.1387 AGAGG 0.1734 AGAGT 0.2341 AGATA 0.3627 AGATC 0.1456 AGATG 0.1746 AGATT 0.3171 AGCAA 0.3706 AGCAC 0.1526 AGCAG 0.185 AGCAT 0.2918 AGCCA 0.3983 AGCCC 0.1276 AGCCG 0.1846 AGCCT 0.2895 AGCGA 0.3709 AGCGC 0.1701 AGCGG 0.1524 AGCGT 0.3066 AGCTA 0.2715 AGCTC 0.1514 AGCTG 0.2226 AGCTT 0.3545 AGGAA 0.4447 AGGAC 0.1219 AGGAG 0.1617 AGGAT 0.2717 AGGCA 0.3994 AGGCC 0.132 AGGCG 0.1917 AGGCT 0.277 AGGGA 0.4063 AGGGC 0.1537 AGGGG 0.1779 AGGGT 0.2621 AGGTA 0.3689 AGGTC 0.1263 AGGTG 0.1868 AGGTT 0.318 AGTAA 0.3513 AGTAC 0.1603 AGTAG 0.1508 AGTAT 0.3375 AGTCA 0.353 AGTCC 0.1374 AGTCG 0.2196 AGTCT 0.29 AGTGA 0.3347 AGTGC 0.173 AGTGG 0.1732 AGTGT 0.3191 AGTTA 0.2917 AGTTC 0.1591 AGTTG 0.1671 AGTTT 0.3821 ATAAA 0.4129 ATAAC 0.1223 ATAAG 0.105 ATAAT 0.3598 ATACA 0.4558 ATACC 0.119 ATACG 0.1555 ATACT 0.2697 ATAGA 0.3785 ATAGC 0.1553 ATAGG 0.1371 ATAGT 0.3291 ATATA 0.398 ATATC 0.1181 ATATG 0.1375 ATATT 0.3464 ATCAA 0.3439 ATCAC 0.1547 ATCAG 0.1447 ATCAT 0.3567 ATCCA 0.3756 ATCCC 0.1298 ATCCG 0.1539 ATCCT 0.3407 ATCGA 0.3768 ATCGC 0.1618 ATCGG 0.1168 ATCGT 0.3446 ATCTA 0.2777 ATCTC 0.1613 ATCTG 0.1676 ATCTT 0.3934 ATGAA 0.4204 ATGAC 0.1322 ATGAG 0.11 ATGAT 0.3374 ATGCA 0.4301 ATGCC 0.1256 ATGCG 0.1613 ATGCT 0.283 ATGGA 0.3846 ATGGC 0.1812 ATGGG 0.1195 ATGGT 0.3148 ATGTA 0.4121 ATGTC 0.1145 ATGTG 0.146 ATGTT 0.3274 ATTAA 0.3394 ATTAC 0.1611 ATTAG 0.1024 ATTAT 0.3972 ATTCA 0.3317 ATTCC 0.1507 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.3443 ATTGA 0.3001 ATTGC 0.1787 ATTGG 0.1316 ATTGT 0.3897 ATTTA 0.3012 ATTTC 0.1649 ATTTG 0.1433 ATTTT 0.3906 CAAAA 0.3642 CAAAC 0.1445 CAAAG 0.1489 CAAAT 0.3424 CAACA 0.3926 CAACC 0.1351 CAACG 0.1968 CAACT 0.2755 CAAGA 0.3627 CAAGC 0.1692 CAAGG 0.148 CAAGT 0.3201 CAATA 0.3369 CAATC 0.1361 CAATG 0.172 CAATT 0.355 CACAA 0.3262 CACAC 0.192 CACAG 0.1533 CACAT 0.3286 CACCA 0.3729 CACCC 0.1342 CACCG 0.2015 CACCT 0.2914 CACGA 0.3387 CACGC 0.1937 CACGG 0.1303 CACGT 0.3374 CACTA 0.2629 CACTC 0.1597 CACTG 0.2081 CACTT 0.3693 CAGAA 0.4117 CAGAC 0.1273 CAGAG 0.164 CAGAT 0.2971 CAGCA 0.3721 CAGCC 0.1435 CAGCG 0.1791 CAGCT 0.3053 CAGGA 0.3792 CAGGC 0.16 CAGGG 0.1407 CAGGT 0.3201 CAGTA 0.3171 CAGTC 0.1458 CAGTG 0.1843 CAGTT 0.3529 CATAA 0.3147 CATAC 0.1705 CATAG 0.1168 CATAT 0.398 CATCA 0.32 CATCC 0.1556 CATCG 0.2116 CATCT 0.3128 CATGA 0.3007 CATGC 0.1788 CATGG 0.1424 CATGT 0.3781 CATTA 0.2782 CATTC 0.1537 CATTG 0.159 CATTT 0.4091 CCAAA 0.3545 CCAAC 0.1701 CCAAG 0.1528 CCAAT 0.3226 CCACA 0.2873 CCACC 0.2201 CCACG 0.2106 CCACT 0.282 CCAGA 0.3266 CCAGC 0.211 CCAGG 0.1622 CCAGT 0.3002 CCATA 0.2806 CCATC 0.1925 CCATG 0.1592 CCATT 0.3676 CCCAA 0.3168 CCCAC 0.2003 CCCAG 0.1548 CCCAT 0.3281 CCCCA 0.2924 CCCCC 0.2082 CCCCG 0.1714 CCCCT 0.328 CCCGA 0.3073 CCCGC 0.2091 CCCGG 0.1513 CCCGT 0.3324 CCCTA 0.2307 CCCTC 0.2171 CCCTG 0.1865 CCCTT 0.3657 CCGAA 0.3219 CCGAC 0.1701 CCGAG 0.1713 CCGAT 0.3367 CCGCA 0.2648 CCGCC 0.1777 CCGCG 0.2773 CCGCT 0.2801 CCGGA 0.32 CCGGC 0.2088 CCGGG 0.1365 CCGGT 0.3347 CCGTA 0.2726 CCGTC 0.1704 CCGTG 0.2105 CCGTT 0.3465 CCTAA 0.3262 CCTAC 0.185 CCTAG 0.1239 CCTAT 0.3648 CCTCA 0.2225 CCTCC 0.203 CCTCG 0.2187 CCTCT 0.3558 CCTGA 0.2756 CCTGC 0.1957 CCTGG 0.1583 CCTGT 0.3704 CCTTA 0.2203 CCTTC 0.2168 CCTTG 0.1594 CCTTT 0.4035 CGAAA 0.3738 CGAAC 0.1607 CGAAG 0.1749 CGAAT 0.2907 CGACA 0.3243 CGACC 0.153 CGACG 0.2717 CGACT 0.2511 CGAGA 0.3655 CGAGC 0.1868 CGAGG 0.1734 CGAGT 0.2742 CGATA 0.3193 CGATC 0.1947 CGATG 0.1749 CGATT 0.3112 CGCAA 0.3465 CGCAC 0.1794 CGCAG 0.1636 CGCAT 0.3105 CGCCA 0.3879 CGCCC 0.1336 CGCCG 0.2221 CGCCT 0.2564 CGCGA 0.3278 CGCGC 0.2203 CGCGG 0.1365 CGCGT 0.3154 CGCTA 0.2614 CGCTC 0.1884 CGCTG 0.2038 CGCTT 0.3464 CGGAA 0.3934 CGGAC 0.1512 CGGAG 0.1753 CGGAT 0.2802 CGGCA 0.3495 CGGCC 0.1691 CGGCG 0.2333 CGGCT 0.2481 CGGGA 0.3722 CGGGC 0.1777 CGGGG 0.1761 CGGGT 0.274 CGGTA 0.3185 CGGTC 0.1623 CGGTG 0.2227 CGGTT 0.2964 CGTAA 0.3267 CGTAC 0.1912 CGTAG 0.1392 CGTAT 0.3428 CGTCA 0.2901 CGTCC 0.1648 CGTCG 0.2807 CGTCT 0.2644 CGTGA 0.2934 CGTGC 0.1875 CGTGG 0.1618 CGTGT 0.3573 CGTTA 0.2584 CGTTC 0.1979 CGTTG 0.1683 CGTTT 0.3754 CTAAA 0.3862 CTAAC 0.1516 CTAAG 0.1166 CTAAT 0.3456 CTACA 0.357 CTACC 0.143 CTACG 0.1719 CTACT 0.3281 CTAGA 0.3551 CTAGC 0.1809 CTAGG 0.1384 CTAGT 0.3257 CTATA 0.3298 CTATC 0.1532 CTATG 0.1566 CTATT 0.3603 CTCAA 0.3406 CTCAC 0.182 CTCAG 0.1446 CTCAT 0.3327 CTCCA 0.3351 CTCCC 0.1556 CTCCG 0.164 CTCCT 0.3453 CTCGA 0.3532 CTCGC 0.1826 CTCGG 0.1208 CTCGT 0.3435 CTCTA 0.228 CTCTC 0.2392 CTCTG 0.1711 CTCTT 0.3617 CTGAA 0.3939 CTGAC 0.1501 CTGAG 0.1181 CTGAT 0.3379 CTGCA 0.3692 CTGCC 0.1612 CTGCG 0.151 CTGCT 0.3186 CTGGA 0.3561 CTGGC 0.1862 CTGGG 0.1141 CTGGT 0.3436 CTGTA 0.3431 CTGTC 0.1472 CTGTG 0.1606 CTGTT 0.3491 CTTAA 0.3325 CTTAC 0.1873 CTTAG 0.1102 CTTAT 0.37 CTTCA 0.2767 CTTCC 0.1807 CTTCG 0.1816 CTTCT 0.3611 CTTGA 0.2918 CTTGC 0.1943 CTTGG 0.1437 CTTGT 0.3701 CTTTA 0.254 CTTTC 0.1985 CTTTG 0.1528 CTTTT 0.3946 GAAAA 0.3688 GAAAC 0.1572 GAAAG 0.1561 GAAAT 0.318 GAACA 0.3908 GAACC 0.1235 GAACG 0.2277 GAACT 0.258 GAAGA 0.4107 GAAGC 0.1586 GAAGG 0.1582 GAAGT 0.2725 GAATA 0.3372 GAATC 0.1484 GAATG 0.1734 GAATT 0.3411 GACAA 0.3606 GACAC 0.1683 GACAG 0.1663 GACAT 0.3048 GACCA 0.3858 GACCC 0.1238 GACCG 0.2095 GACCT 0.281 GACGA 0.4093 GACGC 0.172 GACGG 0.1292 GACGT 0.2895 GACTA 0.2759 GACTC 0.1674 GACTG 0.2136 GACTT 0.3431 GAGAA 0.4138 GAGAC 0.1178 GAGAG 0.2083 GAGAT 0.26 GAGCA 0.3903 GAGCC 0.1376 GAGCG 0.2094 GAGCT 0.2627 GAGGA 0.4175 GAGGC 0.1536 GAGGG 0.154 GAGGT 0.2749 GAGTA 0.336 GAGTC 0.154 GAGTG 0.1905 GAGTT 0.3195 GATAA 0.3331 GATAC 0.1722 GATAG 0.1239 GATAT 0.3707 GATCA 0.3112 GATCC 0.149 GATCG 0.2562 GATCT 0.2836 GATGA 0.3385 GATGC 0.1757 GATGG 0.1692 GATGT 0.3166 GATTA 0.2921 GATTC 0.1708 GATTG 0.1634 GATTT 0.3737 GCAAA 0.3575 GCAAC 0.1704 GCAAG 0.1512 GCAAT 0.3208 GCACA 0.3633 GCACC 0.1578 GCACG 0.2224 GCACT 0.2566 GCAGA 0.3345 GCAGC 0.2135 GCAGG 0.147 GCAGT 0.305 GCATA 0.3116 GCATC 0.1672 GCATG 0.1672 GCATT 0.354 GCCAA 0.3063 GCCAC 0.2053 GCCAG 0.1644 GCCAT 0.324 GCCCA 0.3103 GCCCC 0.1846 GCCCG 0.1914 GCCCT 0.3137 GCCGA 0.3228 GCCGC 0.2352 GCCGG 0.1659 GCCGT 0.276 GCCTA 0.2375 GCCTC 0.2093 GCCTG 0.2052 GCCTT 0.348 GCGAA 0.3356 GCGAC 0.1743 GCGAG 0.1749 GCGAT 0.3152 GCGCA 0.3021 GCGCC 0.1477 GCGCG 0.3238 GCGCT 0.2264 GCGGA 0.3306 GCGGC 0.2234 GCGGG 0.1425 GCGGT 0.3035 GCGTA 0.2923 GCGTC 0.1615 GCGTG 0.2228 GCGTT 0.3234 GCTAA 0.2929 GCTAC 0.2121 GCTAG 0.1393 GCTAT 0.3557 GCTCA 0.252 GCTCC 0.1764 GCTCG 0.259 GCTCT 0.3126 GCTGA 0.2649 GCTGC 0.2325 GCTGG 0.1684 GCTGT 0.3342 GCTTA 0.2285 GCTTC 0.2126 GCTTG 0.1784 GCTTT 0.3805 GGAAA 0.3984 GGAAC 0.1531 GGAAG 0.1829 GGAAT 0.2656 GGACA 0.3866 GGACC 0.1486 GGACG 0.2341 GGACT 0.2307 GGAGA 0.3994 GGAGC 0.1652 GGAGG 0.2089 GGAGT 0.2265 GGATA 0.3185 GGATC 0.1755 GGATG 0.1994 GGATT 0.3067 GGCAA 0.3483 GGCAC 0.173 GGCAG 0.2008 GGCAT 0.278 GGCCA 0.3846 GGCCC 0.1373 GGCCG 0.228 GGCCT 0.2501 GGCGA 0.3435 GGCGC 0.2045 GGCGG 0.1781 GGCGT 0.2739 GGCTA 0.2736 GGCTC 0.1783 GGCTG 0.2353 GGCTT 0.3128 GGGAA 0.4144 GGGAC 0.1476 GGGAG 0.1809 GGGAT 0.257 GGGCA 0.3779 GGGCC 0.1531 GGGCG 0.211 GGGCT 0.258 GGGGA 0.3807 GGGGC 0.1668 GGGGG 0.2083 GGGGT 0.2442 GGGTA 0.3176 GGGTC 0.1509 GGGTG 0.2333 GGGTT 0.2982 GGTAA 0.3433 GGTAC 0.179 GGTAG 0.1463 GGTAT 0.3315 GGTCA 0.3129 GGTCC 0.1686 GGTCG 0.2548 GGTCT 0.2637 GGTGA 0.2967 GGTGC 0.1843 GGTGG 0.2342 GGTGT 0.2849 GGTTA 0.2815 GGTTC 0.1761 GGTTG 0.1894 GGTTT 0.3531 GTAAA 0.3754 GTAAC 0.1568 GTAAG 0.1249 GTAAT 0.3429 GTACA 0.429 GTACC 0.1315 GTACG 0.1774 GTACT 0.2621 GTAGA 0.3538 GTAGC 0.1792 GTAGG 0.1345 GTAGT 0.3325 GTATA 0.3562 GTATC 0.1511 GTATG 0.1623 GTATT 0.3304 GTCAA 0.33 GTCAC 0.1851 GTCAG 0.1528 GTCAT 0.3321 GTCCA 0.3575 GTCCC 0.1543 GTCCG 0.1719 GTCCT 0.3164 GTCGA 0.358 GTCGC 0.1956 GTCGG 0.1289 GTCGT 0.3174 GTCTA 0.2653 GTCTC 0.1874 GTCTG 0.184 GTCTT 0.3633 GTGAA 0.3847 GTGAC 0.1618 GTGAG 0.1321 GTGAT 0.3214 GTGCA 0.393 GTGCC 0.1485 GTGCG 0.1772 GTGCT 0.2813 GTGGA 0.3501 GTGGC 0.1997 GTGGG 0.1269 GTGGT 0.3233 GTGTA 0.3426 GTGTC 0.1479 GTGTG 0.1995 GTGTT 0.31 GTTAA 0.322 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1201 GTTAT 0.361 GTTCA 0.3042 GTTCC 0.1784 GTTCG 0.1968 GTTCT 0.3206 GTTGA 0.3005 GTTGC 0.2068 GTTGG 0.1511 GTTGT 0.3415 GTTTA 0.2761 GTTTC 0.2146 GTTTG 0.1592 GTTTT 0.35 TAAAA 0.4008 TAAAC 0.1233 TAAAG 0.1218 TAAAT 0.3542 TAACA 0.4204 TAACC 0.1182 TAACG 0.1781 TAACT 0.2833 TAAGA 0.3793 TAAGC 0.1438 TAAGG 0.1357 TAAGT 0.3412 TAATA 0.3734 TAATC 0.1167 TAATG 0.1443 TAATT 0.3655 TACAA 0.3429 TACAC 0.1367 TACAG 0.1358 TACAT 0.3845 TACCA 0.3874 TACCC 0.1069 TACCG 0.1687 TACCT 0.3369 TACGA 0.3537 TACGC 0.1632 TACGG 0.1083 TACGT 0.3748 TACTA 0.3012 TACTC 0.1282 TACTG 0.163 TACTT 0.4076 TAGAA 0.4323 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1387 TAGAT 0.3125 TAGCA 0.4026 TAGCC 0.1297 TAGCG 0.1785 TAGCT 0.2893 TAGGA 0.3859 TAGGC 0.1366 TAGGG 0.1283 TAGGT 0.3492 TAGTA 0.3801 TAGTC 0.1222 TAGTG 0.151 TAGTT 0.3467 TATAA 0.3126 TATAC 0.1451 TATAG 0.09542 TATAT 0.4469 TATCA 0.3511 TATCC 0.1256 TATCG 0.1951 TATCT 0.3281 TATGA 0.2978 TATGC 0.1525 TATGG 0.1148 TATGT 0.4348 TATTA 0.313 TATTC 0.13 TATTG 0.1354 TATTT 0.4216 TCAAA 0.3755 TCAAC 0.1526 TCAAG 0.14 TCAAT 0.3319 TCACA 0.3502 TCACC 0.1503 TCACG 0.2059 TCACT 0.2937 TCAGA 0.3418 TCAGC 0.173 TCAGG 0.1471 TCAGT 0.3381 TCATA 0.3114 TCATC 0.1648 TCATG 0.1439 TCATT 0.3799 TCCAA 0.3351 TCCAC 0.1757 TCCAG 0.1535 TCCAT 0.3357 TCCCA 0.3135 TCCCC 0.1751 TCCCG 0.1667 TCCCT 0.3447 TCCGA 0.3177 TCCGC 0.2001 TCCGG 0.1462 TCCGT 0.336 TCCTA 0.2373 TCCTC 0.2013 TCCTG 0.1721 TCCTT 0.3893 TCGAA 0.3372 TCGAC 0.152 TCGAG 0.1612 TCGAT 0.3496 TCGCA 0.2935 TCGCC 0.1433 TCGCG 0.2783 TCGCT 0.285 TCGGA 0.3245 TCGGC 0.1896 TCGGG 0.1295 TCGGT 0.3564 TCGTA 0.2855 TCGTC 0.1731 TCGTG 0.1756 TCGTT 0.3658 TCTAA 0.3148 TCTAC 0.1841 TCTAG 0.1202 TCTAT 0.3809 TCTCA 0.2442 TCTCC 0.1648 TCTCG 0.1958 TCTCT 0.3953 TCTGA 0.2815 TCTGC 0.1958 TCTGG 0.1402 TCTGT 0.3826 TCTTA 0.228 TCTTC 0.2083 TCTTG 0.1447 TCTTT 0.4189 TGAAA 0.4318 TGAAC 0.1318 TGAAG 0.1414 TGAAT 0.295 TGACA 0.4092 TGACC 0.1273 TGACG 0.1901 TGACT 0.2734 TGAGA 0.3997 TGAGC 0.1594 TGAGG 0.1547 TGAGT 0.2863 TGATA 0.3578 TGATC 0.1473 TGATG 0.1647 TGATT 0.3302 TGCAA 0.3548 TGCAC 0.1579 TGCAG 0.1587 TGCAT 0.3286 TGCCA 0.3965 TGCCC 0.1305 TGCCG 0.1815 TGCCT 0.2914 TGCGA 0.3337 TGCGC 0.1983 TGCGG 0.1258 TGCGT 0.3421 TGCTA 0.2763 TGCTC 0.1646 TGCTG 0.1984 TGCTT 0.3608 TGGAA 0.4218 TGGAC 0.134 TGGAG 0.1527 TGGAT 0.2915 TGGCA 0.3834 TGGCC 0.1432 TGGCG 0.2046 TGGCT 0.2688 TGGGA 0.3869 TGGGC 0.1592 TGGGG 0.1661 TGGGT 0.2878 TGGTA 0.3513 TGGTC 0.1436 TGGTG 0.1979 TGGTT 0.3072 TGTAA 0.334 TGTAC 0.1753 TGTAG 0.1096 TGTAT 0.3811 TGTCA 0.3535 TGTCC 0.1541 TGTCG 0.1897 TGTCT 0.3027 TGTGA 0.293 TGTGC 0.1798 TGTGG 0.1295 TGTGT 0.3977 TGTTA 0.2917 TGTTC 0.1624 TGTTG 0.1604 TGTTT 0.3854 TTAAA 0.3964 TTAAC 0.1288 TTAAG 0.1115 TTAAT 0.3633 TTACA 0.4198 TTACC 0.1296 TTACG 0.1557 TTACT 0.295 TTAGA 0.3704 TTAGC 0.1514 TTAGG 0.1451 TTAGT 0.333 TTATA 0.343 TTATC 0.1308 TTATG 0.134 TTATT 0.3922 TTCAA 0.3435 TTCAC 0.1524 TTCAG 0.1387 TTCAT 0.3654 TTCCA 0.3561 TTCCC 0.1371 TTCCG 0.1416 TTCCT 0.3652 TTCGA 0.3511 TTCGC 0.1664 TTCGG 0.1078 TTCGT 0.3747 TTCTA 0.261 TTCTC 0.1745 TTCTG 0.1578 TTCTT 0.4068 TTGAA 0.4097 TTGAC 0.1362 TTGAG 0.1168 TTGAT 0.3373 TTGCA 0.4 TTGCC 0.1355 TTGCG 0.1551 TTGCT 0.3095 TTGGA 0.3773 TTGGC 0.1684 TTGGG 0.1134 TTGGT 0.3409 TTGTA 0.361 TTGTC 0.133 TTGTG 0.1424 TTGTT 0.3635 TTTAA 0.3316 TTTAC 0.1579 TTTAG 0.1024 TTTAT 0.4081 TTTCA 0.3277 TTTCC 0.1526 TTTCG 0.1505 TTTCT 0.3692 TTTGA 0.2962 TTTGC 0.1738 TTTGG 0.1261 TTTGT 0.404 TTTTA 0.3109 TTTTC 0.1744 TTTTG 0.139 TTTTT 0.3756