################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 887315 Total trinity transcripts: 1849486 Percent GC: 36.26 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 7967 Contig N20: 5284 Contig N30: 3814 Contig N40: 2801 Contig N50: 2062 Median contig length: 562 Average contig: 1117.46 Total assembled bases: 2066718534 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 6904 Contig N20: 4398 Contig N30: 3003 Contig N40: 2120 Contig N50: 1501 Median contig length: 434 Average contig: 860.79 Total assembled bases: 763788564