################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 127738 Total trinity transcripts: 344944 Percent GC: 46.21 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 4597 Contig N20: 3479 Contig N30: 2835 Contig N40: 2375 Contig N50: 1985 Median contig length: 650 Average contig: 1132.95 Total assembled bases: 390805991 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 4680 Contig N20: 3487 Contig N30: 2791 Contig N40: 2266 Contig N50: 1791 Median contig length: 381 Average contig: 845.46 Total assembled bases: 107996989