lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( gi|9 ) : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|8 : ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|6 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCA
gi|2 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|15 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|3 : ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|7 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|14 : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|10 : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|5 : ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|4 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCTaa
gi|12 : ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|11 : ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|1 : ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTaaa
gi|13 : aTGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|18 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|17 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|16 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|20 : ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTCaa
gi|19 : CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|22 : CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|21 : CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( family-551 ) : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|1 : ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCT
gi|10 : aATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|11 : ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|12 : ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaaa
gi|13 : TGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|14 : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|15 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|16 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|17 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|18 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|19 : CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|2 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|20 : ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTC
gi|21 : CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|22 : CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|3 : ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|4 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCT
gi|5 : ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|6 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCAaa
gi|7 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|8 : ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|9 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
blockSeqCons :
originalCons : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
finalCons : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( family-551 ) : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|1 : ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCT
gi|10 : aATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|11 : ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|12 : ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaaa
gi|13 : TGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|14 : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|15 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|16 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|17 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|18 : ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|19 : CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|2 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|20 : ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTC
gi|21 : CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|22 : CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|3 : ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|4 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCT
gi|5 : ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|6 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCAaa
gi|7 : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|8 : ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|9 : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA