lowQualScore : 111111111 44444444 11111 1 1 33333333333333 111 111111111 11111111 1 333333333 11111111111
lowQualScore : 6 2 777 333333333 4 66666666 11111 1 4 555 555 2 88 2 5 2 0 22 00000000000000 44 44 555 1 555 2 333333333 0 8 4 3 666666 222 2222 2222 88888 444 1 1 2 2 7777777 33333333 66 666666 55555 0 5 0 000000000 44 77 6666 44 44 4 33333333333 3 4 5
lowQualScore : . . ... ......... . ........ ..... . . ... ... . .. . . . . .. .............. .. .. ... . ... . ......... . . . . ...... ... .... .... ..... ... . . . . ....... ........ .. ...... ..... . . . ......... .. .. .... .. .. . ........... . . .
lowQualScore : 7 0 888 222222222 6 00000000 11111 1 4 000 000 4 11 7 3 7 4 99 88888888888888 66 66 888 4 555 4 666666666 9 0 4 5 111111 444 9999 9999 33333 333 9 9 4 4 6666666 22222222 44 888888 99999 3 1 3 444444444 22 33 5555 22 22 6 88888888888 6 0 8
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---T-----ATATTCATAT---A----TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCC-A-A-CCCAACAGTTC-GTGATTNC--A--A---TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTAATTATTGG--GT-CTACCCC---------CTGCACTACTAANTNATTTTGAAC------T---G----TTGG----GTCTAGACCCAACAA--TC--GAC-TTTCG-GACCCAACAATC-G-AC-------T-------TT-NG------A-----CCCAACAGTACGGTCTCACA-TTTA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAA-GTTTA-AAACTATATATAT
Reference ( gi|2 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---T-----ATATTCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCC-A-A-CCAAACAGTTC-GTGGTTTC--A--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGG--TT-CTACCCC---------CTGCACTGCTAAATAATTTTGAAC------T---G----TTGG----GTCTAGACCCAACAA--TC--GAC-TTTTG-GACCCAACAATC-G-AC-------T-------CT-GG------A-----CCCAACAGTACTGTCTCACA-TTGA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAA-GTTTA-AAATTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A---T-----AT--TCATAT--------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCC-A-A-CCCAACAGTTC-GTGATTAC--A--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGG--GT-CTACCCC---------CTGCACTACTAAATAATTTTGAAC------T---G----TTGG----ATATAGACCCAACAA--TT--GAC-TTTCG-GACCCAACAATC-G-AC-------T-------CT-GG------A-----CCCAACAGTACGGTCTCATA-TTTA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTG----------------A-ATATATATATTATATAT
gi|3 : aaatatataaaTATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATAT--AT---A---T-----ATATTCATAT--------TTTT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCC-A-A-ACCAACAGTAC-GTGATCAC--A--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGG--GT-CTACCCC---------CTGCACTACTAAATAATTTTGAAC------T---G----TTGG----GTCTAAACCCAACAA--TC--GAC-TTTTG-GACCCAACAATC-G-AC-------T-------CT-GG------A-----CCCAA-AGTACGGTCTCACA-TTTA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--Attagatatgtaca
gi|9 : atataTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---A---C-----ATGTTTATATCTCATGTGTATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCC-G-A-CCAAACGTTTA-GTG--TTCAAA--A---TG--TTA--TGGTCCTCATATTACAT----TTATTGG--GT-CCATCC-------------CACTACTAATTGATTTTGACG------T---G----TTGG----GTTTGAATGCAAC
gi|5 : atataaaCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A---T-----ATATTCATAT--------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCC-A-G-TCCAACAGTT-----------------------------------CATTTTACACCTAATTATTGG--GT-CGACCCC---------CTGCACTACTAAATAATTTTGAAG------T---G----TTGG----GTCTAGACCCAACAA--TC--TAC-TTTCG-ACCCCAACAATC-G-AC-------T-------CT-GG------A-----CCCAACAGTTCGGCCTCACA-TTTA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAA-GTTTA-AAA-TATA
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA---T-----ACATTCATTT--------TAc
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGTT-----ACATTCATATACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGA-A-CCAA
gi|8 : TATGCAT---A---C-----ATA---ATATGCAA----TATA-----TCACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCT-G-ATCCAAG--GTTCAGTG--TTC--AGGA---TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCCCTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGACC------T---G----TTGG----GTCTAGACCCAACTG--TC--GCC-CTTCG-GACCCAATAATC-C-AC-------T-------TT-TG------A-----cgt
gi|4 : aatTATATAT---A---TTCATAATA-TCATGTGTAA----TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAATG-GTT-AGTC------CTAAAGA-TTG-GTG--TTC--A--AAACTG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCG--GT-CTA--CC---------CTGTACAAATAATTCATTTTAAAC------T---G----TTGG----GTTTAGACCCAAC----T----AC-------GAACCAACAATC-G-AA-------T-------AA-CG------A-----CCAAACAATTTGGTC---------A--AA--AA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAA-ATTTA-AAA
gi|14 : catatatatgtactcatatagatctcattAT---A---T-----ATATTCATAT--------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCC-A-A-CCCAACAGTTC-GTGATCAC--A--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGG--AT-CTACCCC---------CTGCACTACTTAATAA
gi|7 : --------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCC-A-A-CCCAACAGTTC-GTGATCAC--A--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGT--GT-CTACCCC---------CTGCACTACTAAATAATTTTGAAC------T---G----TTGG----G-GTAGACCCAACAA--TC--GAC-TTTCG-GACCCAACAATC-G-GC-------T-------CT-AG------A-----CCCAACAGTACGGTCTCACATTTTT--TA--AA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAA-GTTTA-AAAT
gi|16 : AAGGTCCAA---A---CTTGGAT---CTGGACCC-A-A-CC-AACAGTTC-
gi|1 : tggttttGGGTCCGA---A---AGTCAATT-GTTGGGTCT-ATA-TCCAACAGTTC-cgacccaacaatcggctttcgatccaacaactatcgcatctttaaaagattcaact
gi|3 : aaatatataaatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatacatattcatattatttcgcctcagtattgggtcaaaaattaaattactgggtccaacccaacagttcgtgattacaatgatatgttcattttacacctaattattgggtctaccccctgcactactaaataattttGGGTCCAA---A---AGTCGATT-GTTGGGTTT-AGA-CCCAACAGTTC-aacaatcgactctggacccaacagtacggtctcatatttataaaagacccaactgaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|7 : atatatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatatatattcatattttttcgccccagtattgggaaaaaaattaaataacttggtccaaaccaacagtacgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaattattgggtctaccccctgcactactaaataattttGGGTCCGA---A---AGTCGATT-GTTGGGTCT-A-C-CCCAACAGTTC-aacaatcgactctggacccaaagtacggtctcacatttataaaagacccaactgtcca
gi|6 : tatttcgccccagtactgggtcaaaaattaaataactgggtccaacccaacagttcgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaattattgtgtctaccccctgcactactaaataattttGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCC-G-A-CCTAGCATTTG-GTG--TTC--A--AAA-TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGG--GT-CTACCCC---------CTGTACTACTAACTGATTTTTAAC------T---T----ATGG----GTCCAAACCCAACTT--TA--GAC-TTTCG-GATCCAACAATC-G-AC-------T-------CT-CC------A-----TCCAACAATACGGCATCGCA-TCTA--TA--AA--A----GAC--CCA--ACT-T------------------TTTA-CAATTATATaacaatcggctctagacccaacagtacggtctcacattttttaaaagacccaactgtccaccaagtttaaaat
gi|10 : tgtatgtccacaagttcgaaataaatTCC-G-A-TCCAAC-GTTT-GGTGTTCC--AG-A---TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTG--GT-CTATCCCTGCC-----CTGCACTTCTA-----TTTTGAAC------G---G----TTGG----ATTTAGAACCA-----------AC-TT-------CCTACCTTC-GAAC-------T-------TT-CG------A-----TCCAAAAATACGGTCTCAAA--AGACGCA--AA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAA-TTTtcatgtat
gi|11 : ---TA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGG--GT-CTACCCA-----------ACACTA-TAACTTATTTC--AT------TTTTA----TTGG----ATCTTGACCCAAC-A--TG--TAC----TGAAATACATTAATC-G-AC-------T-------TT-AG------A-----CTCAACGATACGA--TCAAA-TTCC--TA--AAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAA-CTTTA-
gi|13 : aaatcacgggcG--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGG--GT-CTACACC---------CTGTACTAATAATTAATTTTTAAC-------------------------CT-------------TT--GAC-TTTTG-GACCCAACAATC-G-AC-------T-------TT-CG------A-----ACCAAAAGTAT------------------------A----GAC--ACA------TCC--AT-------AAATGTTTA-AAACTATATATATt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGG--GT-CTGCCCA---------CCCCACTACTAATTGTTTGTGAAC------T---A----TTGG----GTCTGGATCTAA
gi|1 : tacAATTGTTGG--GT-CTATATC---------CAACAGTTCAAAATTATTTAGTAG------T---G----CAGG----GGGTAGACCCAATAA--Tttttctatcaagtttaaca
gi|7 : aaatatataaatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatacatattcatattatttcgcctcagtattgggtcaaaaattaaattactgggtccaacccaacagttcgtgattacaatgatatgttcattttacacctaATTGTTGG--GT-CTACCCC---------A-ACAGTTCAAAATTATTTAGTAG------T---G----CAGG----GGGTAGACACAATAA--Tgactttcggacccaacaatcgactctggacccaacagtacggtctcatatttataaaagacccaactgaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|5 : tatttcgccccagtactgggtcaaaaattaaataactgggtccaacccaacagttcgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaATTGTTGG--GT-CTAGACC---------CAACACTTCAAAATTATTTAGTAG------T---G----CAGG----GGGTCGACCCAATAA--Tcgactttcggacccaacaatcggctctagacccaacagtacggtctcacattttttaaaagacccaactgtccaccaagtttaaaat
gi|19 : ctcaaacttggtcagttaatgggaccaatatatattcatattatttcgccccggtattgagtaaaaaattaaattactgggtccagtccaacagttcattttacacctaTTAATGG--TT-GTACCCG---------ATGCACTACTAATTGGTTTTGAAC------T---G----CTGG----GTCTAAACCTAAC-T--TT--GCC-TTTTctactttcgaccccaacaatcgactctggacccaacagttcggcctcacatttataaaagacccaactgtccaccaagtttaaaatatac
gi|12 : CCCC---------TCCCACTACTAATTCATTTAGAAC------T---A----TTGG----GTC--AACCCCCCAT--TTTAGGC-TTGCG-GACCGAACAATC-G-AC-------T-------TT-TG------G-----CCCAACAATATGGTTCCA-------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAA-GTTTA-AAACTAT
gi|8 : ATAATCCTGAACAC----T---GAACCTTGG----ATC-AGACCCAGTAA--AC--GTCATTTTT-TACCAAATAAT
gi|1 : aattatgcatacataatatgcaatatatcacaccTAATCACGAAC------T---G----TTGG----GT-TGGACCCAGTAA--TT--TAA-TTTTT-GACCCAATAacattcattttaaacctacccattgggcttacttcccctcagcccacctccaccacttattgattttgacctgttgggtctagacccaactgtcgcccttcggacccaataatccacttttga
gi|9 : aaatatataaatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatacatattcatattatttcgcctcagATTTTGAACACTAAAC---G----TTTG----GTC-GGACCCAATAAAATC---AG-TTTTG--ACCCAATAAcaatgatatgttcattttacacctaattattgggtctaccccctgcactactaaataattttgaactgttggatatagacccaacaattgactttcggacccaacaatcgactctggacccaacagtacggtctcatatttataaaagacccaactgaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|16 : atataaatatactaaaaccaggtcaaatataggtttccatgtatatacatgtttatatctcatgtgtattatatattgctccgTTTTGAAC------T---G----TTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTT--TG--GAC-CTTCG--ACCCAACAATC-G-GC-------T-------TT-CG------A-----TCCAACA--ACTATCGCATC-TT----TA--AA--A----GAT--TCA--ACTgttatggtcctcatattacatttattgggtccatcccactactaattgattttgacgtgttgggtttgaatgcaac
gi|5 : tggGAAC------T---G----TTGG----GTCCAG-------AG--TC--GAT-TGTTG-GGGTCGAAAGTA-G-ATTGTTGGGT-------CT-AG------A-----CCCAACA
gi|14 : ctcaaacttggtcagttaatgggaccaatatatattcatattatttcgccccggtattgagtaaaaaattaaattactgggtccagtccaacagttcattttacacctaattattgggtcgaccccctgcactactaaataattttgaagGAAC------T---G----TTGG----GT-TGGGCACAGTTA--TT--TAA-TTTTT-GACCCAATAggcctcacatttataaaagacccaactgtccaccaagtttaaaatatac
gi|1 : atatatattcatattatttcgacccagAC------T---G----TTGG----GTCCAG-------AG--TC--GAT-TGTTG-GGTCCGAAAGTC-A-AT-------TG------TT-GGGTCTATA-----TCCAACAGTgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaattattggatctaccccctgcactacttaataa
gi|3 : aaatatataaatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatacatattcatattatttcgcctcagtattgggtcaaaaattaaattactgggtccaacccaacagttcgtgattacaatgatatgttcattttacacctaattattgggtctaccccctgcactactaaataattttgaAC------T--------TTGG----GTCCAGA-------G--TC--GAT-TGTTG-GGTCCAAAAGTC-G-AT-------TGTTGGGTTT-AG------A-----CCCAACAGTacggtctcatatttataaaagacccaactgaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|7 : atatatatactcaaacttggtcaattattgggacccatatatatatattcatattttttcgccccagtattgggaaaaaaattaaataacttggtccaaaccaacagtacgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaattattgggtctaccccctgcactactaaataattttgaAC------T---G----TTGG----GTCTAGAGC---------C--GAT-TGTTG-GGTCCGAAAGTC-G-AT-------TG------TT-GG------GTCTACCCCAACAGTacggtctcacatttataaaagacccaactgtcca
gi|5 : tatttcgccccagtactgggtcaaaaattaaataactgggtccaacccaacagttcgtgatcacaatgatatgttcattttacacctaattattgtgtctaccccctgcactactaaataattttgaAT------T---G----TTGG----GTCTAGACCCAACAacggtctcacattttttaaaagacccaactgtccaccaagtttaaaat
gi|8 : ctcaaacttggtcagttaatgggaccaatatatattcatattatttcgccccggtattgagtaaaaaattaaattactgggtccagtccaacagttcattttacacctaattattgggtcgaccccctgcactactaaataattttgaagAC------A---G----TTGG----GTCTAGACCCAACActactttcgaccccaacaatcgactctggacccaacagttcggcctcacatttataaaagacccaactgtccaccaagtttaaaatatac
gi|4 : aattatgcatacataatatgcaatatatcacaccattatttggtaaaaaatgacgtttactgggtctgatccaaggttcagtgttcaggattatacattcattttaaacctacccattgggcttacttcccctcagcccacctccaccacttattgattttgacc---G----TTGG----GTCTAAACCCAACAG--Tcgcccttcggacccaataatccacttttga
gi|18 : catatatatgtactcatatagatctcatttatatatattcataatatcatgtgtaatatttcaccccattattggatcacactcatttcaatggttagtcctaaagattggtgttcaaaactgttatgttcattttacacctattgattcggtctaccctgtacaaataattcattttaa-GAACCAACGTTCCG-AC-------T-------TTTGG------A-------------TACGGTCTCA-A-TAGA--CACAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAA-GTTTA-A---TATATAtacgaaccaacaatcgaataacgaccaaacaatttggtcaaaaaagacgcaagactttctatcaaatttaaaa
gi|20 : aatgattttattggctcc-TTAA--TA--AAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAA-GTTTA-AAACTATATATAT
Alignments
lowQualScore : 111111 11111111 33333333333 11111 11 1 11 111111111 11111111111
lowQualScore : 5 1 777 888888 44444444 88888888888 00000 666 666 00 3 2 2 88 555 44 8888888 2 33 66666 33 99999999 1 1 444 5555 22 555 2 2 1 1 0 55 000000000 7777777 33 33 5 22222222222 5
lowQualScore : . . ... ...... ........ ........... ..... ... ... .. . . . .. ... .. ....... . .. ..... .. ........ . . ... .... .. ... . . . . . .. ......... ....... .. .. . ........... .
lowQualScore : 7 1 000 555555 66666666 11111111111 00000 444 444 66 6 6 3 66 888 22 2222222 9 44 22222 44 11111111 9 8 444 3333 22 666 9 9 0 2 8 22 999999999 4444444 99 99 4 44444444444 3
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A------TAT-----AT-TCATAT-----------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGATCACA--A---TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Reference ( family-4728 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A------TAT-----AT-TCATAT---A-------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTNCA--A---TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTNATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTTTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A------TAT--------TCATAT-----------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTACA--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----ATATAGACCCAACAATT--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACGGTCTCA-TA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTG
gi|10 : aaatatataaaTCCGATCCAACGTTTG-GTG-TTCCAG-A---TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTGGTCTAT--CCCTGCCCT--GC--------ACTTCTA-----TTTTGAA---CGGTTGG----ATTTAGAACCAACTTCC--TACCTTCG-AAC-------------TTTCGATCCAAAAATACGGTCTCA-AA----AGACGCAAA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAATTTaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|11 : ---TA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGGGTCTAC--CCA--------AC--------ACTA-TAACTTATTTC--ATTTTTATTGG----ATCTTGACCCAAC-ATG--TACT---GAAATACATTAATC-GACTTTAGACTCAACGATACGA--TCA-AA-TTCC----TAAAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAACTTTA
gi|12 : aaatcacgggcC--CCC----TC--CC--------ACTACTAATTCATTTAGAA---CTATTGG----GTC--AACCCCCCATTTTAGGCTTGCG-GACCGAACAATC-GACTTTTGGCCCAACAATATGGTTCCA--------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAAGTTTAAAACTATt
gi|13 : G--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGGGTCTAC--ACC----CT--GT--------ACTAATAATTAATTTTTAA---C------------CT-----------TT--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTTTCGAACCAAAAGTATAG--ACA-CA-TCCA----TAAA-------------------T------------------GTTTAAAACTATATATAT
gi|14 : AT---A------TAT-----AT-TCATAT-----------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGATCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTTAATAA
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGT---TAC-----AT-TCATAT---ACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGAACCAAC
gi|16 : TGGTTTTGAA---CTGTTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTTTG--GACCTTCG--ACCCAACAATC-GGCTTTCGATCCAACA--AC--TATCG-CA-TCTT----TAAA--A----GAT--TCA--ACTgt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGGGTCTGC--CCA----CC--CC--------ACTACTAATTGTTTGTGAA---CTATTGG----GTCTGGATCTAA
gi|18 : tacTCC-GAACCAACGTTCCGACTTTTGG-------ATACGGTCTCAATA-GACA----CAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAAGTTTAA---TATATAttttctatcaagtttaaca
gi|19 : aatgattttattggcTTAATGGTTGTAC--CCG----AT--GC--------ACTACTAATTGGTTTTGAA---CTGCTGG----GTCTAAACCTAAC
gi|2 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A------TAT-----AT-TCATAT-----------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCAAACAGTTC-GTGGTTTCA--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGTTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTGCTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACTGTCTCA-CA-TTGA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAATTATATATATtttgcctttt
gi|20 : -TTAA----TAAAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA------TAC-----AT-TCATatattcg
gi|3 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A------TAT--------TCATAT---T-------T-TT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCCAAACCAACAGTAC-GTGATCACA--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAAACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAA-AGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--Attta
gi|4 : atataCTCATTTATAT---A------TATTCATAATATCATGTGTAA-------TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAAT------GGTTAGTCCTAAAGATTG-GTG--TTCA--AAACTG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCGGTCTAC--CC------T--GT--------ACAAATAATTCATTTTAAA---CTGTTGG----GTTTAGACCCAAC----------TACG-AA-CCAACAATC-GAATAACGACCAAACAATTTGGTC----------A----AAAA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAAATTTAAAA
gi|5 : catatatatgtactcatatagatCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A------TAT-----AT-TCATAT-----------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAGTCCAACAGTTC---------------------------------ATTTTACACCTAATTATTGGGTCGAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---GTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--TACTTTCG-ACCCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTTCGGCCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAA-TATA
gi|6 : TGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCCGACCTAGCATTTG-GTGTTCAAA--A---TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGGGTCTAC--CCC----CT--GT--------ACTACTAACTGATTTTTAA---CTTATGG----GTCCAAACCCAACTTTA--GACTTTCG-GATCCAACAATC-GACTCTCCATCCAACAATACGGCATCG-CA-TCTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACT-T-----------------TTTACAATTATATc
gi|7 : tgtatgtccacaagttcgaaataaa-------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA--A---TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGTGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----G-GTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GGCTCTAGACCCAACAGTACGGTCTCA-CATTTTT----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAAtcatgtat
gi|8 : ATACAT---A-------AT-----AT-GCA-AT---A-------TAT-------CACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCTGATCCAA-GGTTCAGTG--TTCAGGA---TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCC----CTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGAC---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACTGTC--GCCCTTCG-GACCCAATAATC-CACTTTTGAt
gi|9 : aattatgcTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---ACATGTTTAT-----ATCTCATGT---G-------TATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCCGACCAAACGTTTA-GTGTTCAAA--A---TG--TTA--TGGTCCTCATATTACAT----TTATTGGGTCCAT--CC----------C--------ACTACTAATTGATTTTGAC---GTGTTGG----GTTTGAATGCAAC
Alignments
lowQualScore : 11111 44444444 11111 11 11 111111111 11111111111
lowQualScore : 5 1 0 777 777 00000 4 11111111 00000 666 666 00 3 5 0 3 77 44 8888888 1 33 66666 33 99999999 1 2 444 5555 22 555 33 2 1 1 0 55 000000000 7777777 33 33 5 22222222222 5
lowQualScore : . . . ... ... ..... . ........ ..... ... ... .. . . . . .. .. ....... . .. ..... .. ........ . . ... .... .. ... .. . . . . .. ......... ....... .. .. . ........... .
lowQualScore : 7 1 8 000 000 00000 0 88888888 00000 444 444 66 6 1 4 3 99 22 2222222 0 44 22222 44 11111111 9 5 444 3333 99 666 44 9 0 2 8 22 999999999 4444444 99 99 4 44444444444 3
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A--TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Reference ( family-4728 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGATCACA-A--TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A---TAT--------TCATAT--------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTACA-A--TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----ATATAGACCCAACAATT--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACGGTCTCA-TA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTG
gi|10 : aaatatataaaTCCGATCCAACGTTTG-GTGTTC-CAGA--TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTGGTCTAT--CCCTGCCCT--GC--------ACTTCTA-----TTTTGAA---CGGTTGG----ATTTAGAACCAACTTCC--TACCTTCG--------------AACTTTCGATCCAAAAATACGGTCTCA-AA----AGACGCAAA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAATTTaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|11 : ATCACG-GGCTA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGGGTCTAC--CCA--------AC--------ACTA-TAACTTATTTC--ATTTTTATTGG----ATCTTGACCCAACA-TG--TACT---GAAATACATTAATC-GACTTTAGACTCAACGATACGA--TCA-AA-TTCC----TAAAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAACTTTA
gi|12 : aaC--CCC----TC--CC--------ACTACTAATTCATTTAGAA---CTATTGG----GTC--AACCCCCCATTTTAGGCTTGCG-GACCGAACAATC-GACTTTTGGCCCAACAATATGGTTCCA--------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAAGTTTAAAACTATt
gi|13 : G--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGGGTCTAC--ACC----CT--GT--------ACTAATAATTAATTTTTAA---C------------CT-----------TT--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTTTCGAACCAAAAGTATAG--ACA-CA-TCCA----TAAA-------------------T------------------GTTTAAAACTATATATAT
gi|14 : AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A--TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGATCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTTAATAA
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGTTAC-----AT-TCATATACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGAACCAACG
gi|16 : TGGTTTTGAA---CTGTTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTTTG--GACCTTCG--ACCCAACAATC-GGCTTTCGATCCAACA--AC--TATCG-CA-TCTT----TAAA--A----GAT--TCA--ACTt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGGGTCTGC--CCA----CC--CC--------ACTACTAATTGTTTGTGAA---CTATTGG----GTCTGGATCTAA
gi|18 : tacTCC-GAACCAACGTTCCGACTTTTGG-------ATACGGTCTCAATA-GACA----CAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAAGTTTAA---TATATAttttctatcaagtttaaca
gi|19 : aatgattttattggcTTAATGGTTGTAC--CCG----AT--GC--------ACTACTAATTGGTTTTGAA---CTGCTGG----GTCTAAACCTAAC-TTT--GCCTTT
gi|2 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCAAACAGTTC-GTGGTTTCA-A--TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGTTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTGCTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACTGTCTCA-CA-TTGA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAATTATATATATt
gi|20 : -TTAA----TAAAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA---TAC-----AT-TCATTT--------TAatattcg
gi|3 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATAT--AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TTTT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCCAAACCAACAGTAC-GTGATCACA-A--TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAAACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAA-AGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--A
gi|4 : atataCTCATTTATAT---A---TATTCATAATATCATGTGTAA----TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAAT------GGTTAGTCCTAAAGATTG-GTGTTCAAA-AC-TG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCGGTCTAC--CC------T--GT--------ACAAATAATTCATTTTAAA---CTGTTGG----GTTTAGACCCAAC----------TACG-AA-CCAACAATC-GAATAACGACCAAACAATTTGGTC----------A----AAAA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAAATTTAAAA
gi|5 : catatatatgtactcatatagatCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAGTCCAACAGTTC-------------------------------ATTTTACACCTAATTATTGGGTCGAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---GTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--TACTTTCG-ACCCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTTCGGCCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAA-TATA
gi|6 : TGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCCGACCTAGCATTTG-GTGTTCAAA-A--TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGGGTCTAC--CCC----CT--GT--------ACTACTAACTGATTTTTAA---CTTATGG----GTCCAAACCCAACTTTA--GACTTTCG-GATCCAACAATC-GACTCTCCATCCAACAATACGGCATCG-CA-TCTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACT-T-----------------TTTACAATTATATc
gi|7 : tgtatgtccacaagttcgaaataaa--------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A--TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGTGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----G-GTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GGCTCTAGACCCAACAGTACGGTCTCA-CATTTTT----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAAtcatgtat
gi|8 : TATGCAT---A---CAT-----A----ATATGCAA----TATA-----TCACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCTGATCCAA-GGTTCAGTGTTCAGG-A--TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCC----CTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGAC---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACTGTC--GCCCTTCG-GACCCAATAATC-CACTTTTGAt
gi|9 : aatTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---A---CAT-----GT-TTATATCTCATGTGTATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCCGACCAAACGTTTA-GTGTTCAAA-A--TG--TTA--TGGTCCTCATATTAC----ATTTATTGGGTCCAT--CC----------C--------ACTACTAATTGATTTTGAC---GTGTTGG----GTTTGAATGCAAC
Alignments
lowQualScore : 11111 44444444 11111 11 11 111111111 11111111111
lowQualScore : 5 1 0 777 777 00000 4 11111111 00000 666 666 00 3 2 1 3 3 44 8888888 1 33 66666 33 99999999 1 2 444 5555 22 555 33 2 1 1 0 55 000000000 7777777 33 33 5 22222222222 5
lowQualScore : . . . ... ... ..... . ........ ..... ... ... .. . . . . . .. ....... . .. ..... .. ........ . . ... .... .. ... .. . . . . .. ......... ....... .. .. . ........... .
lowQualScore : 7 1 8 000 000 00000 0 88888888 00000 444 444 66 6 3 4 6 3 22 2222222 0 44 22222 44 11111111 9 5 444 3333 99 666 44 9 0 2 8 22 999999999 4444444 99 99 4 44444444444 3
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Reference ( family-4728 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A---TAT--------TCATAT--------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----ATATAGACCCAACAATT--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACGGTCTCA-TA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTG
gi|10 : aaatatataaaTCCGATCCAACGTTTG-GTGTTC-CAGA-TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTGGTCTAT--CCCTGCCCT--GC--------ACTTCTA-----TTTTGAA---CGGTTGG----ATTTAGAACCAACTTCC--TACCTTCG--------------AACTTTCGATCCAAAAATACGGTCTCA-AA----AGACGCAAA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAATTTaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|11 : -TA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGGGTCTAC--CCA--------AC--------ACTA-TAACTTATTTC--ATTTTTATTGG----ATCTTGACCCAACA-TG--TACT---GAAATACATTAATC-GACTTTAGACTCAACGATACGA--TCA-AA-TTCC----TAAAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAACTTTA
gi|12 : aaatcacgggcC--CCC----TC--CC--------ACTACTAATTCATTTAGAA---CTATTGG----GTC--AACCCCCCATTTTAGGCTTGCG-GACCGAACAATC-GACTTTTGGCCCAACAATATGGTTCCA--------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAAGTTTAAAACTATt
gi|13 : G--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGGGTCTAC--ACC----CT--GT--------ACTAATAATTAATTTTTAA---C------------CT-----------TT--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTTTCGAACCAAAAGTATAG--ACA-CA-TCCA----TAAA-------------------T------------------GTTTAAAACTATATATAT
gi|14 : AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGATCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTTAATAA
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGTTAC-----AT-TCATATACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGAACCAACG
gi|16 : TGGTTTTGAA---CTGTTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTTTG--GACCTTCG--ACCCAACAATC-GGCTTTCGATCCAACA--AC--TATCG-CA-TCTT----TAAA--A----GAT--TCA--ACTt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGGGTCTGC--CCA----CC--CC--------ACTACTAATTGTTTGTGAA---CTATTGG----GTCTGGATCTAA
gi|18 : tacTCC-GAACCAACGTTCCGACTTTTGG-------ATACGGTCTCAATA-GACA----CAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAAGTTTAA---TATATAttttctatcaagtttaaca
gi|19 : aatgattttattggcTTAATGGTTGTAC--CCG----AT--GC--------ACTACTAATTGGTTTTGAA---CTGCTGG----GTCTAAACCTAAC-TTT--GCCTTT
gi|2 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCAAACAGTTC-GTGGTTTCA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGTTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTGCTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACTGTCTCA-CA-TTGA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAATTATATATATt
gi|20 : -TTAA----TAAAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA---TAC-----AT-TCATTT--------TAatattcg
gi|3 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATAT--AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TTTT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCCAAACCAACAGTAC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAAACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAA-AGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--A
gi|4 : atataCTCATTTATAT---A---TATTCATAATATCATGTGTAA----TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAAT------GGTTAGTCCTAAAGATTG-GTGTTCAAA-ACTG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCGGTCTAC--CC------T--GT--------ACAAATAATTCATTTTAAA---CTGTTGG----GTTTAGACCCAAC----------TACG-AA-CCAACAATC-GAATAACGACCAAACAATTTGGTC----------A----AAAA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAAATTTAAAA
gi|5 : catatatatgtactcatatagatCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAGTCCAACAGTTC------------------------------ATTTTACACCTAATTATTGGGTCGAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---GTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--TACTTTCG-ACCCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTTCGGCCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAA-TATA
gi|6 : TGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCCGACCTAGCATTTG-GTGTTCAAA-A-TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGGGTCTAC--CCC----CT--GT--------ACTACTAACTGATTTTTAA---CTTATGG----GTCCAAACCCAACTTTA--GACTTTCG-GATCCAACAATC-GACTCTCCATCCAACAATACGGCATCG-CA-TCTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACT-T-----------------TTTACAATTATATc
gi|7 : tgtatgtccacaagttcgaaataaa--------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGTGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----G-GTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GGCTCTAGACCCAACAGTACGGTCTCA-CATTTTT----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAAtcatgtat
gi|8 : TATGCAT---A---CAT-----A----ATATGCAA----TATA-----TCACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCTGATCCAA-GGTTCAGTGTTCAGG-A-TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCC----CTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGAC---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACTGTC--GCCCTTCG-GACCCAATAATC-CACTTTTGAt
gi|9 : aatTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---A---CAT-----GT-TTATATCTCATGTGTATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCCGACCAAACGTTTA-GTGTTCAAA-A-TG--TTA--TGGTCCTCATATTAC----ATTTATTGGGTCCAT--CC----------C--------ACTACTAATTGATTTTGAC---GTGTTGG----GTTTGAATGCAAC
Alignments
lowQualScore : 11111 44444444 11111 11 11 111111111 11111111111
lowQualScore : 5 1 0 777 777 00000 4 11111111 00000 666 666 00 3 2 1 3 3 44 8888888 1 33 66666 33 99999999 1 2 444 5555 22 555 33 2 1 1 0 55 000000000 7777777 33 33 5 22222222222 5
lowQualScore : . . . ... ... ..... . ........ ..... ... ... .. . . . . . .. ....... . .. ..... .. ........ . . ... .... .. ... .. . . . . .. ......... ....... .. .. . ........... .
lowQualScore : 7 1 8 000 000 00000 0 88888888 00000 444 444 66 6 3 4 6 3 22 2222222 0 44 22222 44 11111111 9 5 444 3333 99 666 44 9 0 2 8 22 999999999 4444444 99 99 4 44444444444 3
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Reference ( family-4728 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A---TAT--------TCATAT--------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----ATATAGACCCAACAATT--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACGGTCTCA-TA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTG
gi|10 : aaatatataaaTCCGATCCAACGTTTG-GTGTTC-CAGA-TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTGGTCTAT--CCCTGCCCT--GC--------ACTTCTA-----TTTTGAA---CGGTTGG----ATTTAGAACCAACTTCC--TACCTTCG--------------AACTTTCGATCCAAAAATACGGTCTCA-AA----AGACGCAAA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAATTTaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|11 : -TA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGGGTCTAC--CCA--------AC--------ACTA-TAACTTATTTC--ATTTTTATTGG----ATCTTGACCCAACA-TG--TACT---GAAATACATTAATC-GACTTTAGACTCAACGATACGA--TCA-AA-TTCC----TAAAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAACTTTA
gi|12 : aaatcacgggcC--CCC----TC--CC--------ACTACTAATTCATTTAGAA---CTATTGG----GTC--AACCCCCCATTTTAGGCTTGCG-GACCGAACAATC-GACTTTTGGCCCAACAATATGGTTCCA--------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAAGTTTAAAACTATt
gi|13 : G--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGGGTCTAC--ACC----CT--GT--------ACTAATAATTAATTTTTAA---C------------CT-----------TT--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTTTCGAACCAAAAGTATAG--ACA-CA-TCCA----TAAA-------------------T------------------GTTTAAAACTATATATAT
gi|14 : AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGATCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTTAATAA
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGTTAC-----AT-TCATATACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGAACCAACG
gi|16 : TGGTTTTGAA---CTGTTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTTTG--GACCTTCG--ACCCAACAATC-GGCTTTCGATCCAACA--AC--TATCG-CA-TCTT----TAAA--A----GAT--TCA--ACTt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGGGTCTGC--CCA----CC--CC--------ACTACTAATTGTTTGTGAA---CTATTGG----GTCTGGATCTAA
gi|18 : tacTCC-GAACCAACGTTCCGACTTTTGG-------ATACGGTCTCAATA-GACA----CAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAAGTTTAA---TATATAttttctatcaagtttaaca
gi|19 : aatgattttattggcTTAATGGTTGTAC--CCG----AT--GC--------ACTACTAATTGGTTTTGAA---CTGCTGG----GTCTAAACCTAAC-TTT--GCCTTT
gi|2 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCAAACAGTTC-GTGGTTTCA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGTTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTGCTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACTGTCTCA-CA-TTGA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAATTATATATATt
gi|20 : -TTAA----TAAAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA---TAC-----AT-TCATTT--------TAatattcg
gi|3 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATAT--AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TTTT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCCAAACCAACAGTAC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAAACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAA-AGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--A
gi|4 : atataCTCATTTATAT---A---TATTCATAATATCATGTGTAA----TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAAT------GGTTAGTCCTAAAGATTG-GTGTTCAAA-ACTG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCGGTCTAC--CC------T--GT--------ACAAATAATTCATTTTAAA---CTGTTGG----GTTTAGACCCAAC----------TACG-AA-CCAACAATC-GAATAACGACCAAACAATTTGGTC----------A----AAAA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAAATTTAAAA
gi|5 : catatatatgtactcatatagatCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAGTCCAACAGTTC------------------------------ATTTTACACCTAATTATTGGGTCGAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---GTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--TACTTTCG-ACCCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTTCGGCCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAA-TATA
gi|6 : TGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCCGACCTAGCATTTG-GTGTTCAAA-A-TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGGGTCTAC--CCC----CT--GT--------ACTACTAACTGATTTTTAA---CTTATGG----GTCCAAACCCAACTTTA--GACTTTCG-GATCCAACAATC-GACTCTCCATCCAACAATACGGCATCG-CA-TCTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACT-T-----------------TTTACAATTATATc
gi|7 : tgtatgtccacaagttcgaaataaa--------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGTGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----G-GTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GGCTCTAGACCCAACAGTACGGTCTCA-CATTTTT----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAAtcatgtat
gi|8 : TATGCAT---A---CAT-----A----ATATGCAA----TATA-----TCACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCTGATCCAA-GGTTCAGTGTTCAGG-A-TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCC----CTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGAC---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACTGTC--GCCCTTCG-GACCCAATAATC-CACTTTTGAt
gi|9 : aatTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---A---CAT-----GT-TTATATCTCATGTGTATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCCGACCAAACGTTTA-GTGTTCAAA-A-TG--TTA--TGGTCCTCATATTAC----ATTTATTGGGTCCAT--CC----------C--------ACTACTAATTGATTTTGAC---GTGTTGG----GTTTGAATGCAAC
blockSeqs : A T AAG AGT TCATA A ACAAAATG ATATA CTC CTG TT A T C G C TT TGGTC T TT CTGCC CA CCACCTCC C T TTT TTGG TT TTA AA C C A AT AGACG AGCTC TA AG T CAGCTTCCTTT C
blockSeqs : . A . . . . CTCATGTG . . . A . A C . . . ATTA T . A . . T C . . AT C G . A A A TTTTT ACA . . G AC T
blockSeqs : . A . . . . GTAA . . . T . G C . . . CG A . C . . T A . . TT G G . T A A TTCC GA . . G AC C
blockSeqs : . A . . . . GCAA . . . T . A C . . . CA A . C . . A A . . AA T G . C G C TCCA A . . T AC T
blockSeqs : . T . . . . . . . . A . T A . . . TG T . C . . T G . . AA G G . C A C TCTT A . . G AA .
blockSeqs : . A . . . . . . . . T . T A . . . TG A . A . . T G . . AA T G . T G C GACA A . . T AT .
blockSeqs : G . . . . . . . . A . A C . . . TG A . G . . A G . . TT C A . G G C TTGA A . . G AC
blockSeqs : . . . . . . . . . T . T G . . . TG T . C . . A A . . AA C A . G A C TTAA A . . T AC
blockSeqs : . . . . . . . . . . T A . . . CA A . C . . T A . . TG C G . C G C TTTA A . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG G . C . . A C . . A A G . G A C TTTA A . . G .
blockSeqs : . . CA A . C . . C A . . T C G . C G . TCTA A . . .
blockSeqs : . . C . C . . A G . . . C . . A . . A A . . .
blockSeqs : T . C . . T A . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . T G . .
blockSeqs : . . . . . G . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
finalCons : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Alignments
lowQualScore : 11111 44444444 11111 11 11 111111111 11111111111
lowQualScore : 5 1 0 777 777 00000 4 11111111 00000 666 666 00 3 2 1 3 3 44 8888888 1 33 66666 33 99999999 1 2 444 5555 22 555 33 2 1 1 0 55 000000000 7777777 33 33 5 22222222222 5
lowQualScore : . . . ... ... ..... . ........ ..... ... ... .. . . . . . .. ....... . .. ..... .. ........ . . ... .... .. ... .. . . . . .. ......... ....... .. .. . ........... .
lowQualScore : 7 1 8 000 000 00000 0 88888888 00000 444 444 66 6 3 4 6 3 22 2222222 0 44 22222 44 11111111 9 5 444 3333 99 666 44 9 0 2 8 22 999999999 4444444 99 99 4 44444444444 3
consensus : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
Reference ( family-4728 ) : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCGACCCAACGGTTC-GTGNTCACA-A-TG--ATA--CG---TTCATTTTACACCTANTTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAANTGATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACANTC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTNGACCCAACAGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|1 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAC---A---TAT--------TCATAT--------TATT-----TCGCCTCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATTACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----ATATAGACCCAACAATT--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACGGTCTCA-TA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTG
gi|10 : aaatatataaaTCCGATCCAACGTTTG-GTGTTC-CAGA-TGTTATAATTA---TTCATTGTGCAACTATTCATTTGGTCTAT--CCCTGCCCT--GC--------ACTTCTA-----TTTTGAA---CGGTTGG----ATTTAGAACCAACTTCC--TACCTTCG--------------AACTTTCGATCCAAAAATACGGTCTCA-AA----AGACGCAAA--AGCTCGAC--CTA--CCTTTCC--AT-------CAATTTaatatatatattatatatttagatatgtaca
gi|11 : -TA--ATA--CG---T-CATCTTACACATGTGTAATGGGTCTAC--CCA--------AC--------ACTA-TAACTTATTTC--ATTTTTATTGG----ATCTTGACCCAACA-TG--TACT---GAAATACATTAATC-GACTTTAGACTCAACGATACGA--TCA-AA-TTCC----TAAAACA----GACTACCA--A--G-CT--AC-------CAACTTTA
gi|12 : aaatcacgggcC--CCC----TC--CC--------ACTACTAATTCATTTAGAA---CTATTGG----GTC--AACCCCCCATTTTAGGCTTGCG-GACCGAACAATC-GACTTTTGGCCCAACAATATGGTTCCA--------------AA--A----GAC--ACA--GATGTCCCAGCTTCCTTTCAAGTTTAAAACTATt
gi|13 : G--ATA--CA---TTCATTTTACATTTTATTTTTGGGTCTAC--ACC----CT--GT--------ACTAATAATTAATTTTTAA---C------------CT-----------TT--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTTTCGAACCAAAAGTATAG--ACA-CA-TCCA----TAAA-------------------T------------------GTTTAAAACTATATATAT
gi|14 : AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGACCCAGTATTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGTGCCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGATCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTTAATAA
gi|15 : GGCCAAT-TAAAAGGACCCATTTATAT---AAGTTAC-----AT-TCATATACAAAATGTATA-----T-GACCCATTAATGGACCAAA---A---ATGATTTT-ATTGGCTCCGAACCAACG
gi|16 : TGGTTTTGAA---CTGTTGGTTGGGTCCAGATCCAAGTTTG--GACCTTCG--ACCCAACAATC-GGCTTTCGATCCAACA--AC--TATCG-CA-TCTT----TAAA--A----GAT--TCA--ACTt
gi|17 : TCATTTTGAACCTTTTTATTGGGTCTGC--CCA----CC--CC--------ACTACTAATTGTTTGTGAA---CTATTGG----GTCTGGATCTAA
gi|18 : tacTCC-GAACCAACGTTCCGACTTTTGG-------ATACGGTCTCAATA-GACA----CAAA--A----GAT--CCA--ACTTTCC--AC-------CAAGTTTAA---TATATAttttctatcaagtttaaca
gi|19 : aatgattttattggcTTAATGGTTGTAC--CCG----AT--GC--------ACTACTAATTGGTTTTGAA---CTGCTGG----GTCTAAACCTAAC-TTT--GCCTTT
gi|2 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATATATAT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCAGTATAGGGTCAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAACCAAACAGTTC-GTGGTTTCA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGTTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTGCTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTACTGTCTCA-CA-TTGA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAATTATATATATt
gi|20 : -TTAA----TAAAG-A----GAT--CCA--ACTTTCT--AA-------CAAGTTTAAAACTATATATAT
gi|21 : TCAAACTTGGT-AATATATTGGGTCCCATATATATAAGA---TAC-----AT-TCATTT--------TAatattcg
gi|3 : TATACTCAAACTTGGTCAAT-TATTGGGACCCATAT--AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TTTT-----TCGCCCCAGTATTGGGAAAAA---A---ATTAAATA-ACTTGGTCCAAACCAACAGTAC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGGGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----GTCTAAACCCAACAATC--GACTTTTG-GACCCAACAATC-GACTCTGGACCCAA-AGTACGGTCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--A
gi|4 : atataCTCATTTATAT---A---TATTCATAATATCATGTGTAA----TATT-----TCACCCCATTATTGGATCACACTCA---TTTCAAT------GGTTAGTCCTAAAGATTG-GTGTTCAAA-ACTG--TTA--TG---TTCATTTTACACCTATTGATTCGGTCTAC--CC------T--GT--------ACAAATAATTCATTTTAAA---CTGTTGG----GTTTAGACCCAAC----------TACG-AA-CCAACAATC-GAATAACGACCAAACAATTTGGTC----------A----AAAA--A----GAC--GCAAGACTTTCT--AT-------CAAATTTAAAA
gi|5 : catatatatgtactcatatagatCTCAAACTTGGTCAGT-TAATGGGACC-----A-AT---A---TAT-----AT-TCATAT--------TATT-----TCGCCCCGGTATTGAGTAAAA---A---ATTAAATT-ACTGGGTCCAGTCCAACAGTTC------------------------------ATTTTACACCTAATTATTGGGTCGAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---GTGTTGG----GTCTAGACCCAACAATC--TACTTTCG-ACCCCAACAATC-GACTCTGGACCCAACAGTTCGGCCTCA-CA-TTTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAA-TATA
gi|6 : TGGGTCACA---A-----TAAAT------GGTCCGACCTAGCATTTG-GTGTTCAAA-A-TG--ATA--CA---TTCATTTTACACCTCGTTGTTGGGTCTAC--CCC----CT--GT--------ACTACTAACTGATTTTTAA---CTTATGG----GTCCAAACCCAACTTTA--GACTTTCG-GATCCAACAATC-GACTCTCCATCCAACAATACGGCATCG-CA-TCTA----TAAA--A----GAC--CCA--ACT-T-----------------TTTACAATTATATc
gi|7 : tgtatgtccacaagttcgaaataaa--------TATT-----TCGCCCCAGTACTGGGTCAAA---A---ATTAAATA-ACTGGGTCCAACCCAACAGTTC-GTGATCACA-A-TG--ATA--TG---TTCATTTTACACCTAATTATTGTGTCTAC--CCC----CT--GC--------ACTACTAAATAATTTTGAA---CTGTTGG----G-GTAGACCCAACAATC--GACTTTCG-GACCCAACAATC-GGCTCTAGACCCAACAGTACGGTCTCA-CATTTTT----TAAA--A----GAC--CCA--ACTGTCC--AC-------CAAGTTTAAAAtcatgtat
gi|8 : TATGCAT---A---CAT-----A----ATATGCAA----TATA-----TCACACCATTATTTGGTAAAA---A---ATGACGTTTACTGGGTCTGATCCAA-GGTTCAGTGTTCAGG-A-TT--ATA--CA---TTCATTTTAAACCTACCCATTGGGCTTACTTCCC----CTCAGCCCACCTCCACCACTTATTGATTTTGAC---CTGTTGG----GTCTAGACCCAACTGTC--GCCCTTCG-GACCCAATAATC-CACTTTTGAt
gi|9 : aatTATACTAAAACCAGGTCAAA-TATAGGTTTCCATGTATAT---A---CAT-----GT-TTATATCTCATGTGTATTATATATTGCTCCGTTATTGGGTCAAA---ACTGATT---TT-ATTGGGTCCGACCAAACGTTTA-GTGTTCAAA-A-TG--TTA--TGGTCCTCATATTAC----ATTTATTGGGTCCAT--CC----------C--------ACTACTAATTGATTTTGAC---GTGTTGG----GTTTGAATGCAAC