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gi|8                          : TATAATGTTCTTCGTCTGAACATTTGAATTA-AAGACAA-CTATTTTCTCTTGTATAACAGGGTCTCCGATAGAGGG----AGTGTT------TGTTCATGGGCTTGTGACCATACACATTT---GGTGGTAATCTGTCATTCAGTGCTGAGGGTG-GATCAGAATGAGTGGCTTT---GA---AA---G-CATGAATATTGAAGATGTAGGAATTATAAAATACTTATGTAT--------CAC------AAAataggtcattgtcaagttgtggctgaatgcaagactgcgtgcaattatacaaacattta
gi|13                         : TATCATTTTCTTCGTTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCCTTGTATAAC--AGTCTCCGATAGAGGGAGTAGGTGTA------TGTGCACGGG--TAT-Acacagaca
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gi|11                         : TATACTGTTTTATGTTTGGAAATTTTAATTTGAAGAACA-TTATATCACCTTTTATAACATAGTAGCTGATAGATAGAGTTAGTGTA----------CA-------------GCGCACATTT---GGCGGT
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gi|4                          :       TTTCTTTCTTTGAAAATTTGAATTAAAAGAAAAACTATTTTCCCTTGTATAATAGAGTCTGCGGTAGAGGGAGCTGGTGTA--------------GG--C----CCATGCACATTT---GGCGGTAATCGGTCATTCATCGCTAACAGCGCGACCAGTACAGGTGGATTT--AAAATTAA---GATATGAAT-T--AAGATATGAACATTATAAGATGCATCAATTT--------CATAAACAAAGAAATAG-TA--TATTATTTTCAGTAAA-ATA-ATTTCT---GAAAGTCGATATTGACATTGTATTGATATTTGCATTATCATATTGAATGATAAACATAAACATGTGAA----TATGATATAA-------------TCGAGCGCAAGTAACA
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gi|6                          :                                                    TGTATAACAGAGTCTCCAATAGAGGGAGTTAGTTTA------TGTGCACGGG--TAT-ACCGCGCACACTT---GGCGGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCGACTAGCACAGCTGGATTT--AAA---AA---G-CATGAATATTGAAAATGTAGGAATTATAACATGCTTCTATTTTATAAA--CAT------GGAATTAT-GA--TATGATTATTAGAAAA-ATATTTTT-T---AAAGGACGATATTGATATTGTAGAGATATTTGCATCATCATACTGAATGATAA--ATATATGTATGTACATGTATAATAACATCTGGTTGCACTCTCGAGCGCTAGTAACAA
gi|9                          :                                                                                                                                                   GTTGAGAGCATGACCATTACA------TTT--AAA---AT---G-CATGAATATTGAAGATGTAGGAATTATAAAACACTTCTGTTTCATAAA--CAT------AGAAGTAT-TA--TAAGAGTATCAGTAGA-ATG-ATTTCT---AAAGGACGATATTGATATTGTATGGGTATATCTATTAGCATATTGAATGATGA--ATA
gi|15                         :                                                                                                                         ccgcgacaaaccagtataccagtacagccctaAGCACGACCAGTACAGGTGGATTA--AAA---AA---G-CATGAATAta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gATATTGACATTGTATGAATATTTGCATTAACATATAGAATGATAA--ATATATGCATGTAAA--TATGATACAAGCTGGTTGTACTCTCGAGCGCTAGTAACAat
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Reference ( family-967 )      : TATAATTTTCTTCGTTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCCTTGTATAACAGAGTCTCCGATAGAGGGAGTTAGTGTA------TGTGCACGG----G-T-A-ACCGCGCACATTT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCGACCAGTACAGGTGGATTT--AAAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAGAC-GC-TTCTGT-T-T-AT-AAA--CATAGAANTATGATATGATTATTAGTAAAATAATTTCT--AAAGGACGATATTGACATTGTATGGATATTTGCATTATCATATTGAATGATAAATATATGCATGTACATGTATAATATAAGCTGGTTGCACTCTCGAGCGCTAGTAACAAT
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gi|14                         :                                            TTTCCCCTTTTATAACAGAGTATCTGATAGATGGAGTTA-T---------TGTTCA----------------GCGCACATTTGGCGGC---GGTAATCAGTCATTCAta
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Reference ( family-967 )      : TATAATTTTCTTCGTTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCCTTGTATAACAGAGTCTCCGATAGAGGGAGTTAGTGTA------TGTGCACGG----G-T-A-ACCGCGCACATTT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCGACCAGTACAGGTGGATTT--AAAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAGAC-GC-TTCTATTTCATAAA--CATAGAATTATGATATGATTATTAGTAAAATAATTTCT--AAAGGACGATATTGATATTGTANGGATATTTGCATTATCATATTGAATGATAAATATATGCATGCACATGTATAATATAAGCTGGTTGCACTCTCGAGCGCTAGTAACAAT
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lowQualScore                  :                                        4                    0                   1      333333333333333333333333333           666   666                                                55    666  000       4    66         888     1    55  4        1     66  0    1        0                   1 77                      1            0 0                            4 2                                          
lowQualScore                  :                                        .                    .                   .      ...........................           ...   ...                                                ..    ...  ...       .    ..         ...     .    ..  .        .     ..  .    .        .                   . ..                      .            . .                            . .                                          
lowQualScore                  :                                        0                    2                   7      333333333333333333333333333           444   444                                                00    444  000       0    11         000     0    11  4        9     11  1    9        7                   7 99                      0            8 5                            3 0                                          
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Reference ( family-967 )      : TATAATTTTCTTCGTTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCCTTGTATAACAGAGTCTCCGATAGAGGGAGTTAGTGTA------TGTGCACGG----G-T-A-ACCGCGCACATTT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCGACCAGTACAGGTGGATTT--AAAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAGAC-GC-TTCTATTTCATAAA--CATAGAATTATGATATGATTATTAGTAAAATAATTTCT--AAAGGACGATATTGATATTGTANGGATATTTGCATTATCATATTGAATGATAAATATATGCATGCACATGTATAATATAAGCTGGTTGCACTCTCGAGCGCTAGTAACAAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATAATATAAGCTGGTTACACTCTCCAGCACTAGAAACAAat
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gi|5                          : TATAATTTTCTTCGTTTGAAAATTAACATAAGAAGAAAA-TGATTTTCCCTTG--TAACAGGGTCTCCGATAGAGCGAGTT--TG-----------GC---G----G-T-A-A--------------------------TCGGTCATT---CGTT----GCGCGGCCAGTACAGGTCGA-AT--AAAA---AG---CATGAAC-ATTA--AAGATGTAG--AAATTATAAGAT-GC-TTCTGTTTGATAAA--CACAGAATTATGATATGATTATTAGTAAAATAATTTCT--AAAGGACGATATTGTTATTGTAGGGATGTTTGCATCATCATATTAAATGATAAATATATGCATGCACATGTATAATATAAGCTGGTTGCACTCTCGAGTGCTAGGGACAAct
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gi|7                          : TATAATTTTCTTCATTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCTTTGTATAACAAAGTCTCCGATAGAGGGAGTAGGTGTA------TGTGCACGG----G-TAA-ACCGCGCACATAT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCCACCAGTACAGGTGGATTT--AAAT---AG----ATAGGTCATTGTCAAGTTGTGGCTGAA-TGCAAGACTGCGTGCAATTATACAAA--CAT
gi|8                          : TATAATGTTCTTCGTCTGAACATTTGAATTA-AAGACAA-CTATTTTCTCTTGTATAACAGGGTCTCCGATAGAGGG----AGTGTT------TGTTCATGGGCTTG-T-G-ACCATACACATTT---GGT---GGTAATCTGTCATTCAGTGCTGAGGGTG-GATCAGAATGAGTGGCTTT---GAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAAAT-AC-TTATGTATCACAAA--CACAGAtta
gi|9                          :                                                                                                                                                         GTTGAGAGCATGACCATTACA------TTT--AAAA---TG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAAAC-AC-TTCTGTTTCATAAA--CATAGAAGTATTATAAGAGTATCAGTAGAATGATTTCT--AAAGGACGATATTGATATTGTATGGGTATATCTATTAGCATATTGAATGATGAATATAca


blockSeqs                     :                                        A                                        A      AATGTATGTGCACGGACCGAC                 GGC   GGT                                                TA    TTA  ACA       C    TC         CTG     A    CT  G        C     GG       T                            T TT                      T                                           A T
blockSeqs                     :                                        .                                        T      TGTTCATGGGCTTGTGAC                    .     .                                                  .     .    A         .    .          G       T    C   .        C     .        A                            C .                       G                                           C T
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blockSeqs                     :                                        .                                        A      TGTGCACGGGTAAAC                       .     .                                                  .     .    .         .    .          G       C    T   .        T     .        T                            T .                       G                                           C .
blockSeqs                     :                                        .                                        T      GCGGTAA                               .     .                                                  .     .    .         .    .          G       T    T   .        T     .        G                            C .                       G                                           . .
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blockSeqs                     :                                        .                                        T      GGCC                                  .     .                                                  .     .    .         .    .          .       .    C   .        C     .                                                                                                              
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Reference ( family-967 )      : TATAATTTTCTTCGTTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCCTTGTATAACAGAGTCTCCGATAGAGGGAGTTAGTGTA------TGTGCACGG----G-T-A-ACCGCGCACATTT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCGACCAGTACAGGTGGATTT--AAAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAGAC-GC-TTCTATTTCATAAA--CATAGAATTATGATATGATTATTAGTAAAATAATTTCT--AAAGGACGATATTGATATTGTANGGATATTTGCATTATCATATTGAATGATAAATATATGCATGCACATGTATAATATAAGCTGGTTGCACTCTCGAGCGCTAGTAACAAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATAATATAAGCTGGTTACACTCTCCAGCACTAGAAACAAat
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gi|7                          : TATAATTTTCTTCATTTGAAAATTTGAATTAGAAGAAAA-TTATTTTCCTTTGTATAACAAAGTCTCCGATAGAGGGAGTAGGTGTA------TGTGCACGG----G-TAA-ACCGCGCACATAT---GGC---GGTAATCGGTCATTCAGCGTTGAGAGCGCCACCAGTACAGGTGGATTT--AAAT---AG----ATAGGTCATTGTCAAGTTGTGGCTGAA-TGCAAGACTGCGTGCAATTATACAAA--CAT
gi|8                          : TATAATGTTCTTCGTCTGAACATTTGAATTA-AAGACAA-CTATTTTCTCTTGTATAACAGGGTCTCCGATAGAGGG----AGTGTT------TGTTCATGGGCTTG-T-G-ACCATACACATTT---GGT---GGTAATCTGTCATTCAGTGCTGAGGGTG-GATCAGAATGAGTGGCTTT---GAA---AG---CATGAAT-ATTG--AAGATGTAG--GAATTATAAAAT-AC-TTATGTATCACAAA--CACAGAtta
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