lowQualScore : 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222 11111 11111 66666666666666666666666666666666666666666666666 11111 3333333333333333333333 3333333 1
lowQualScore : 66 55 777 3 3 555 3 5555 3 33 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 999999 222222222222 33333 7 44 77777 777 88888888888888888888888888888888888888888888888 99999 5 33333 66 2222222222222222222222 66 6666666 2 6 3
lowQualScore : .. .. ... . . ... . .... . .. ............................................................ . ...... ............ ..... . .. ..... ... ............................................... ..... . ..... .. ...................... .. ....... . . .
lowQualScore : 00 99 111 5 3 888 3 6666 3 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9 666666 777777777777 22222 5 11 55555 000 66666666666666666666666666666666666666666666666 44444 0 11111 11 2222222222222222222222 99 6666666 7 6 5
consensus : GCTANNATGATATCACG-CNATTCT-CAG---A-AGGCGGTAAAT-CAACGTATTTG-NTT-AGA-A--NA-A--T-TA-A-A-A----AAC---A-------T---------T---GGTATGCAA------GAA-NAAA--AN---TCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAATGAGA----TT---CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A--------CN----TCGGTCC--CA-AT--A--A--ACANCGTAAAACCT-GGGTNT-GNAATATCCTTATCT--CAACC-TTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
Reference ( gi|3 ) : GCTATGATGATATCATG-TAATTCT-CAG---A-AGGCGGTAAAT-CAACATATTTG-ATC-AGA-A--CA-A--T-TA-A-A-A----AAC---A-------C---------T---GGTATGCAA------GAA-TAAA--AT---TCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAATGAGA----AT---CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A--------CG----TCAGTCC--CA-AT--A--A--ACATTGTAAGACCT-GGGTAT-ATAATATCCTTATCT--CAACC-TTAAACACCCATGATAGATACCTATAATT
gi|4 : GCTATGATGATATCATG-TAATTCT-CAG---A-AGGCGGTAAAT-CAACATATTTG-ATC-AGA-A--CA-A--T-TA-A-A-A----AAC---A-------C---------T---GGTATGCAA------GAA-TAAA--AT---TCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAATGAGA----AT---CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A--------CG----TCAGTCC--CA-AT--A--A--ACATTGTAAGACCT-GGGTAT-ATAATATCCTTATCT--CAACC-TTAAACACCCATGATAGATACCTATAAT
gi|16 : GCTAGTATGATGTCACACTAAT-CT-CAG---A-AGGTGGTAAAA-CAATGTATTTA-AAT-AGG-A--CA-AATC-TA-A-A-A----AAA---AAAAAGTCT---------T---GATACGGAA------GAA-AAAA--AA---TCAAT-AA
gi|9 : GCTAATATGAC-TTGCG-TTACTCT-AAA---A-AGACGGCAAAT-CAACGCAGTTT-ATT--GA-ATTCG-A----TA-A-A-A----ATC---G-------TTG-------T---GGTATACAA------GAA--AAAGGAA---TCAAT-CATGAATATTTTATTTGGATAGTG
gi|10 : gagctaatgttatcttacccatatgatcaaaatacgattcgagcgcttataagatacacgcATGCTCATACAATG-CAACACT-CAGTTAA-AGACAGTTAAT-AAAGGTACTTG-TTT-CGA-A--AA-A--A-TA-T-ATA----AACTTTA-------A---------T---GGTATGCAA------GAA-AAAG--AA---CCAAT----GCATATATGACTGAGATAAAGTGA----TT---CCAAC----------------C--G--TTAGTA-TACA--------CT----GCAATCTCGCA-GTCGA--A--ACAACGTGAAAC
gi|6 : gtgcATGA---CACG-CTATTCT-CAG---A-TGA-AATAATTTCAACATTTTT---TT-AAA-A--AA-A--A-CA-A-C-AC---AAC---A-------TAG-------T---GATATGCAAATAAAGGAA-TGAA-------TCAAG-TATGAGTTTATGGTTGAGACAATGATG----TT---CCAAC------CTTC--------------------A-A--------CC----CTGGTCC--CG-AT--A--A--AAACAGTGAAGTCT-CGGTTT-GAAATATCCTTATCTCCCAACTATT----ACCCATGAAAGATTCCGATA
gi|5 : ATGATATCATG-CGATTTT-CAA---A-AG-------AT-T----TATT-G-AGG-AAA-A--GATA--T-TA-A-A-A------------------C---------T---A--ATGCAA------GAAATATA--AT----CAAT-GATGAGTACACAATCAAGATACTGAGGTGGGAT---C-----------------------A--TCAGTA-GA-G--------TA----TCAGTTC--CA-AT--ATAA--ACACC---ACACCT-TGACTT-AACATATCCTTATCT--CAAC
gi|14 : gtgcttgtATGACATCATG-TCAT-CT-CCA---A-CGACAAGAAAT-CAAATTATTTG-TTC--------------T-CA-A-A-A----AGT-----------C---------TTGTGGTATGCAA------GAataatacaagaaatacaatcaatgatgagtacataatca
gi|13 : gagatgtttcttattaatattaccattagaatgagataagattcatgcgctcataacatgtattcacaaacATACT-CAC---C-AGGTGGTATAT-CAATTTCTTTG-TTA-AGACA--CA-G--T-TG-T-G-A----TAC---A-----------------T---GTAACACAA------GAAAGAGA--ATGAATCAAG-AGCACACA----ATTGAGATAATGAGA----CC---CCGAC------CCTC----T-CGGG--TTGCTA-
gi|1 : gtgtgctagcattatgctacattTTCT-CAG---A-AAATGTTAAAT-CGACATATCTGTATAGAGA-A--AA-T--T-TA-GTA-ATGTTAAC---A----------------------ATATACAA------GAA-AAAG--AA---TCAAC-AGTGAGTACACAATTGAGATGATAAGA----TT---CCAATGCTCTGTTTC----TAT--GTTTTGATAGGA-A--------TA----TTGG-----CATATA-A--A--ACAGTGAAAG-CTT-CGTTGT-G-AATGTCCT--TCT--CAACC-TTAA--ACCCATGAta
gi|2 : attttgtctcatagtagagttgggataaaagttgcacactcaagaatgtgttatgtgctagtcTTCTGCAG---ACAGACTATAAAT-----GTATTTG-TTT-AGA-A--TA-A--G-TATG-A-A----AAT---A-------T---------TTGTGGTATGCAA------GAA-AAAG--AA---TCTATCGGTGAGAATACGAATGAAGTATTAGAA----ATTGCCCAAC------CTTCGATAT-C--T--TTGACAGGA-A--------CC----TTAG-CG--CA-AT-----------T--CAAG--TT-GG-------AATATCTTTATAA--CAACC---AAATACCCATGAAAGACTCCTaaagttccaaaaatcac
gi|8 : aaaatggttaaactgttagtgctggtaaagcatcctatattTCT-CAG---A-AGGCACTAAAT-CAGCATATTTG-CGT-A-A-A--GA-A--TATA-A-ATATC--AAC---A-------TGATTCATAGT---GATATGCAA------GA---AAA--ATTA-TCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAATGATA----TT---CCAAC------a
gi|7 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcTCT-CAG---A-AGGCACTAAAT-CAGCATATTTG-CGT-A-A-A--GA-A--TATA-A-ATATC--AAC---A-------TGATTCATAGT---GATATGCAA------GA---AAA--ATTA-TCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAATGATA----TT---CCAAC------acttgatgttacttgttttg
gi|15 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcATAATGAGA----TT---CCAAC------CCTCAGTCT-A--A--CTGATA-GA-AACCTAGGCCGAGCCTTGGCTC--CG-AT--A--A--ATACAGTGAAACCTTGGGTAGGAT--TACCCTTATCT--CAACC-TT--ACACATGTGAAGGATACacttgatgttacttgttttgaaactcagagggag
gi|18 : aA-A--------CC----TCAGTTC--CA-AC--A--AGAACAATG-AAATTTT-GTGT-T-GAAATATTTATATCT--CGACC-ATA--TACCCATGAAAGATTCAAATAATt
gi|19 : --A--A--ACA--GTAAAACCT-GACTG--AGAATATTCTTATCT--CAAAT----GATACCTATGAAAGAT
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): GACAGAATCAGTGTATTGGTTTAGAAAGAATACAAAAATCTTAGTGATGTTTTAGAAAAAGAATCAATTGAAGATACAATTGGCATTGTGTCTTTCCAACCCTTTTGTATCAACCCTTAGAAACAGGGAACCATCGGGTTGGAATATCCTTTTTGGAACTAAATACACTTGAAAG
Unaligned ( gi|12 ): AAATATAACACTTTTGCTAGTACAACGTCTTGCTTTTCTCAAGACGACATAAAAGGATCGTATTTGTTTAGACAAAGTATGAATATCGTGGAGGTATGAAAGTAAATTAATCAACCATGAGTATTTAAATGAGAGAGTAAATTTCCAATTTTTGAT
Unaligned ( gi|17 ): TGCTTACAAGTATACAAGAAAAAATTATTTTTAACAGAAGTACACAATTTATACAATAAGATTCCAACCCGTGATATTTCTATTTTGAAAGGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TGATATTGCAACCCTCAGTATTAGTACAATAAAGTCAACCAAACCTCAGATTGAAATATCCTTATCTACCA
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1 111111
lowQualScore : 22 33 1 2 555 2 1 555 2 666 1 5 555 1111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 33 33 1 1111 1 99 1 2 0 44 222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 3 55 99 88 55 88888 0 55 4 2 88 55 888888 1
lowQualScore : .. .. . . ... . . ... . ... . . ... ................................................. . . .. .. . .... . .. . . . .. ............................................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . .. .. ...... .
lowQualScore : 00 22 0 9 000 9 6 666 7 222 0 3 666 2222222222222222222222222222222222222222222222222 7 7 77 77 0 6666 0 44 9 9 2 22 555555555555555555555555555555555555555555555 0 2 8 55 55 66 00 00000 5 55 0 7 99 55 333333 0
consensus : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTATTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG--AAAAA-G--AATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTGG-AATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
Reference ( family-941 ) : GCTANNATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTATTTGNTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG--AANAA-A--ANTCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTGN-AATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
gi|1 : TTCT-CAG---A-AAATGT--TAAAT-CGA-CATATCTGTATAGAGA--AAA----T-TT-AG-T--AATG-------T---------T-----A--ACAAT-A-TACA--AG--AAAAA-G--AATCAAC-AGTGAGTACACAATTGAGATGAT-AAGATT--CCAATGCTCTGTTTC----TAT--GTTTTGATAGGA-A------------TATTGG-----CAT-ATA-AA--ACAGTG-AAAGCT--T-CGTTGTG--AATGTCCT--TCT--CAACCTTAA--ACCCATGAAAAGTTCCAAAAAT
gi|10 : attttgtctcatagtagagttgggataaaagttgcacactcaagaatgtgttatgtgctagtcATACAATGCAACACT-CAGTTAA-AGACAG--TTAAT-AAA-GGTACTTGTTTCGA-A--AAA----A-TA-TATA--AACT-------T---------TAAT--G--G---T-A-TGCA--AG--AAAAA-G--AACCAAT----GCATATATGACTGAGATAAA-GTGATT--CCAAC----------------C--G--TTAGTA-TACA------------CTGCAATCTCGCA--GTCGAA--ACAACGTGAAACcac
gi|11 : gtgcatgctcAAT-CAG-TGTATTGGTTTAGA-A--AGA----A-TACAA-A--AATC-------T---------T-----A--G---TGA-TGTTTTAG--AAAAA-G--AATCAAT---TGAAGATACAATTGGCATTGT-GTCTTT--CCAAC------CCTT----T-T--G--T-----------------------ATCAACCC--TT--AG--AA--ACAGGG---AACCATC-GGGT-TGG-AATATCCTTTTTG--GAAC--TAAATACACTTGAAAG
gi|12 : gacagGCTAGTACAACGTCTTGCTTTTCT-CA------AGACGACATAAAA-GGATCGTATTTGTTTAGA-C--AAA----G-T--AT-G--AATA-------T---------CGTGGAG--G---T-A-TGAA--AG--TAAAT-T--AATCAAC-CATGAGTATTTAAATGAGAGAGT-AAATTT--CCAAT------TTT
gi|13 : aaatataacacttttGCTAGCATTATGCTACATTATACT-CAC---C-AGGTGG--TATAT-CAA-TTTCTTTGTTAAGACA--CAG----T-TG-TG-A--TACA-------T------------------G---T-AACACA--AG--AAAGA-G--AATGAAT-CAAGAGCACACAATTGAGATAAT-GAGACC--CCGAC------CCTC----T-CGGG--TTGCTA-tgat
gi|14 : gtgtAACATGACATCATGTCAT-CT-CCA---A-CGACAA--GAAAT-CAA-ATTATTTGTTC--------------T-CA-AA-A--AGTC-------T---------T-----GTGG---T-A-TGCA--AG--Ata
gi|15 : gagatgtttcttattaatattaccattagaatgagataagattcatgcgctcataacatgtattcacaATAAT-GAGATT--CCAAC------CCTCAG--T-CTAA--CTGATA-GA-AACCTAGGCCGAGCCTTGGCTC--CG--AT--AA--ATACAGTGAAACC--TTGGGTA-GG-ATTACCCTTATCT--CAACCTT--ACACATGTGAAGGAT
gi|16 : aGCTAGTATGATGTCACACTAATCT-CAG---A-AGGTGG--TAAAA-CAA-TGTATTTAAATAGG-A--CAAAT--C-TA-AA-A--AAAAAAAAGTCT---------T-----G--A---T-A-CGGA--AG--AAAAA-A--AATCAAT-AAact
gi|18 : A-A------------CCTCAGTTC--CA--AC--AAGAACAATG-AAATTT--T-GTGT-TGA-AATATTTATATCT--CGACCATA--TACCCATGAAAGATTCAAATAAT
gi|19 : --AA--ACA--GTAAAACC--T-GA--CTGAGAATATTCTTATCT--CAAAT---GATACCTATGAAAGATTCTGATA
gi|2 : ggttttgattgTTCTGCAG---ACAGACTA--TAAAT------GTATTTGTTTAGA-A--TAA----G-TATGA-A--AATA-------T---------TTGT--G--G---T-A-TGCA--AG--AAAAA-G--AATCTATCGGTGAGAATACGAATGAAGTATTAGAAATTGCCCAAC------CTTCGATAT-C--T--TTGACAGGA-A------------CCTTAG-CG--CA--AT------------TCAA---------GT-TGG-AATATCTTTATAA--CAACC--AAATACCCATGAAAGACTCCTttaatct
gi|3 : aaaatggttaaactgttagtgctggtaaagcatcctatattGCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATATTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG--AATAA-A--ATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATAT-AATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATa
gi|4 : GCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATATTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG--AATAA-A--ATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATAT-AATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATt
gi|5 : GCTTGTATGATATCATGCGATTTT-CAA---A-AG-------------------ATTTATTGAGG-A--AAAGATAT-TA-AA-A-------------C---------T-----A--------A-TGCA--AG--AAATA-T--AATCAAT-GATGAGTACACAATCAAGATACT-GAGGTG--GGA----------------T-C--A--TCAGTA-GA-G------------TATCAGTTC--CAATAT--AA--ACACC---ACACC--T-TGACTTAA-CATATCCTTATCT--CAACAT--AATAC
gi|6 : gtATGA---CACGCTATTCT-CAG---A-TGA-AA--TAATTTCAA-C--ATTTTTTTAAA-A--AAA----A-CA-AC-AC-AACA-------TAG-------T-----G--A---T-A-TGCA--AATAAAGGA-ATGAATCAAG-TATGAGTTTATGGTTGAGACAAT-GATGTT--CCAAC------CTTC--------------------A-A------------CCCTGGTCC--CG--AT--AA--AAACAGTGAAGTC--T-CGGTTTGA-AATATCCTTATCTCCCAACT---ATTACCCATGAAAGATTCCGATAaagaaatacaatcaatgatgagtacataatca
gi|7 : TCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATATTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG--AAAAA-T--TATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTT
gi|8 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcTCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATATTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG--AAAAA-T--TATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTTgatgttacttgttttgaaactcagagggag
gi|9 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcGCTAATATGAC-TTGCGTTACTCT-AAA---A-AGACGG--CAAAT-CAA-CGCAGTTTATT-GA-ATTCGA------TA-AA-A--ATCG-------TTG-------T-----G--G---T-A-TACA--AG--AAAAAGG--AATCAAT-CATGAATATTTTATTTGGATAGT-Ggatgttacttgttttg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGCTTACAAGTATACAAGAAAAAATTATTTTTAACAGAAGTACACAATTTATACAATAAGATTCCAACCCGTGATATTTCTATTTTGAAAGGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TGATATTGCAACCCTCAGTATTAGTACAATAAAGTCAACCAAACCTCAGATTGAAATATCCTTATCTACCA
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1 111111
lowQualScore : 33 1 2 555 2 1 555 2 666 2 0 5 555 1111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 33 2 33 66 77 1 2 0 44 222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 3 55 99 88 55 88888 0 55 4 2 4 55 888888 1
lowQualScore : .. . . ... . . ... . ... . . . ... ................................................. . . .. . .. .. .. . . . .. ............................................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. ...... .
lowQualScore : 22 0 9 000 9 6 666 7 222 7 6 3 666 2222222222222222222222222222222222222222222222222 7 7 77 7 99 33 66 9 9 2 22 555555555555555555555555555555555555555555555 0 2 8 55 55 66 00 00000 5 55 0 7 0 55 333333 0
consensus : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
Reference ( family-941 ) : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
gi|1 : TTCT-CAG---A-AAATGT--TAAAT-CGA-CATA-TCTGTATAGAGA--AAA----T-TT-AG-T--AATG-------T---------T-----A--ACAAT-A-TACA--AG-AAA--AA-GAATCAAC-AGTGAGTACACAATTGAGATGAT-AAGATT--CCAATGCTCTGTTTC----TAT--GTTTTGATAGGA-A------------TATTGG-----CAT-ATA-AA--ACAGTG-AAAGCT--T-CGTTGT--GAATGTCCT--TCT--CAACCTTAA--ACCCATGAAAAGTTCCAAAAAT
gi|10 : attttgtctcatagtagagttgggataaaagttgcacactcaagaatgtgttatgtgctagtcATACAATGCAACACT-CAGTTAA-AGACAG--TTAAT-AAA-GGTA-CTTGTTTCGA-A--AAA----A-TA-TATA--AACT-------T---------TAAT--G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAACCA----ATGCATATATGACTGAGATAAA-GTGATT--CCAAC----------------C--G--TTAGTA-TACA------------CTGCAATCTCGCA--GTCGAA--ACAACGTGAAACcac
gi|11 : gtgcatgctcAAT-CAG-TGTA-TTGGTTTAGA-A--AGA----A-TACAA-A--AATC-------T---------T-----A--G---TGA-TGTTTTAG-AAA--AA-GAATCAAT---TGAAGATACAATTGGCATTGT-GTCTTT--CCAAC------CCTT----T-T--G--T-----------------------ATCAACCC--TT--AG--AA--ACAGGG---AACCATC-GGGT-TG-GAATATCCTTTTTG--GAAC--TAAATACACTTGAAAG
gi|12 : gacagGCTAGTACAACGTCTTGCTTTTCT-CA------AGACGACATAAAA-GGATCGTA-TTTGTTTAGA-C--AAA----G-T--AT-G--AATA-------T---------CGTGGAG--G---T-A-TGAA--AG-TAA--AT-TAATCAAC-CATGAGTATTTAAATGAGAGAGT-AAATTT--CCAAT------TTT
gi|13 : aaatataacacttttGCTAGCATTATGCTACATTATACT-CAC---C-AGGTGG--TATAT-CAA-TTTC-TTTGTTAAGACA--CAG----T-TG-TG-A--TACA-------T------------------G---T-AACACA--AG-AAA--GA-GAATGAAT-CAAGAGCACACAATTGAGATAAT-GAGACC--CCGAC------CCTC----T-CGGG--TTGCTA-tgat
gi|14 : gtgtATGACATCATGTCAT-CT-CCA---A-CGACAA--GAAAT-CAA-ATTA-TTTGTTC--------------T-CA-AA-A--AGTC-------T---------T-----GTGG---T-A-TGCA--AG-Ata
gi|15 : gagatgtttcttattaatattaccattagaatgagataagattcatgcgctcataacatgtattcacaaacATAAT-GAGATT--CCAAC------CCTCAG--T-CTAA--CTGATA-GA-AACCTAGGCCGAGCCTTGGCTC--CG--AT--AA--ATACAGTGAAACC--TTGGGTA-G-GATTACCCTTATCT--CAACCTT--ACACATGTGAAGGAT
gi|16 : aGCTAGTATGATGTCACACTAATCT-CAG---A-AGGTGG--TAAAA-CAA-TGTA-TTTAAATAGG-A--CAAAT--C-TA-AA-A--AAAAAAAAGTCT---------T-----G--A---T-A-CGGA--AG-AAA--AA-AAATCAAT-AAact
gi|18 : A-A------------CCTCAGTTC--CA--AC--AAGAACAATG-AAATTT--T-GTGT-TG-AAATATTTATATCT--CGACCATA--TACCCATGAAAGATTCAAATAAT
gi|19 : --AA--ACA--GTAAAACC--T-GA--CTGAGAATATTCTTATCT--CAAAT---GATACCTATGAAAGATTCTGATA
gi|2 : ggttttgattgTTCTGCAG---ACAGACTA--TAAAT------GTA-TTTGTTTAGA-A--TAA----G-TATGA-A--AATA-------T---------TTGT--G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCTATCGGTGAGAATACGAATGAAGTATTAGAAATTGCCCAAC------CTTCGATAT-C--T--TTGACAGGA-A------------CCTTAG-CG--CA--AT------------TCAA---------GT-TG-GAATATCTTTATAA--CAACC--AAATACCCATGAAAGACTCCTttaatct
gi|3 : aaaatggttaaactgttagtgctggtaaagcatcctatattGCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAT--AA-AATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATa
gi|4 : GCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAT--AA-AATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATt
gi|5 : GCTTGTATGATATCATGCGATTTT-CAA---A-AG-------------------A-TTTATTGAGG-A--AAAGATAT-TA-AA-A-------------C---------T-----A--------A-TGCA--AG-AAA--TA-TAATCAAT-GATGAGTACACAATCAAGATACT-GAGGTG--GGA----------------T-C--A--TCAGTA-GA-G------------TATCAGTTC--CAATAT--AA--ACACC---ACACC--T-TGACTTA-ACATATCCTTATCT--CAACAT--AATAC
gi|6 : gtATGA---CACGCTATTCT-CAG---A-TGA-AA--TAATTTCAA-C--A-TTTTTTTAAA-A--AAA----A-CA-AC-AC-AACA-------TAG-------T-----G--A---T-A-TGCA--AATAAAGGAATGAATCAAG-TATGAGTTTATGGTTGAGACAAT-GATGTT--CCAAC------CTTC--------------------A-A------------CCCTGGTCC--CG--AT--AA--AAACAGTGAAGTC--T-CGGTTTG-AAATATCCTTATCTCCCAACT---ATTACCCATGAAAGATTCCGATAaagaaatacaatcaatgatgagtacataatca
gi|7 : TCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-TTATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTT
gi|8 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcTCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-TTATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTTgatgttacttgttttgaaactcagagggag
gi|9 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcGCTAATATGAC-TTGCGTTACTCT-AAA---A-AGACGG--CAAAT-CAA-CGCAGTTTATT--GA-ATTCGA------TA-AA-A--ATCG-------TTG-------T-----G--G---T-A-TACA--AG-AAA--AAGGAATCAAT-CATGAATATTTTATTTGGATAGT-Ggatgttacttgttttg
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGCTTACAAGTATACAAGAAAAAATTATTTTTAACAGAAGTACACAATTTATACAATAAGATTCCAACCCGTGATATTTCTATTTTGAAAGGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TGATATTGCAACCCTCAGTATTAGTACAATAAAGTCAACCAAACCTCAGATTGAAATATCCTTATCTACCA
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1 111111
lowQualScore : 33 1 2 555 2 1 555 2 666 2 0 5 555 1111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 33 2 33 66 77 1 2 0 44 222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 3 55 99 88 55 88888 0 55 4 2 4 55 888888 1
lowQualScore : .. . . ... . . ... . ... . . . ... ................................................. . . .. . .. .. .. . . . .. ............................................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. ...... .
lowQualScore : 22 0 9 000 9 6 666 7 222 7 6 3 666 2222222222222222222222222222222222222222222222222 7 7 77 7 99 33 66 9 9 2 22 555555555555555555555555555555555555555555555 0 2 8 55 55 66 00 00000 5 55 0 7 0 55 333333 0
consensus : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
Reference ( family-941 ) : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
gi|1 : TTCT-CAG---A-AAATGT--TAAAT-CGA-CATA-TCTGTATAGAGA--AAA----T-TT-AG-T--AATG-------T---------T-----A--ACAAT-A-TACA--AG-AAA--AA-GAATCAAC-AGTGAGTACACAATTGAGATGAT-AAGATT--CCAATGCTCTGTTTC----TAT--GTTTTGATAGGA-A------------TATTGG-----CAT-ATA-AA--ACAGTG-AAAGCT--T-CGTTGT--GAATGTCCT--TCT--CAACCTTAA--ACCCATGAAAAGTTCCAAAAAT
gi|10 : attttgtctcatagtagagttgggataaaagttgcacactcaagaatgtgttatgtgctagtcATACAATGCAACACT-CAGTTAA-AGACAG--TTAAT-AAA-GGTA-CTTGTTTCGA-A--AAA----A-TA-TATA--AACT-------T---------TAAT--G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAACCA----ATGCATATATGACTGAGATAAA-GTGATT--CCAAC----------------C--G--TTAGTA-TACA------------CTGCAATCTCGCA--GTCGAA--ACAACGTGAAACcac
gi|11 : gtgcatgctcAAT-CAG-TGTA-TTGGTTTAGA-A--AGA----A-TACAA-A--AATC-------T---------T-----A--G---TGA-TGTTTTAG-AAA--AA-GAATCAAT---TGAAGATACAATTGGCATTGT-GTCTTT--CCAAC------CCTT----T-T--G--T-----------------------ATCAACCC--TT--AG--AA--ACAGGG---AACCATC-GGGT-TG-GAATATCCTTTTTG--GAAC--TAAATACACTTGAAAG
gi|12 : gacagGCTAGTACAACGTCTTGCTTTTCT-CA------AGACGACATAAAA-GGATCGTA-TTTGTTTAGA-C--AAA----G-T--AT-G--AATA-------T---------CGTGGAG--G---T-A-TGAA--AG-TAA--AT-TAATCAAC-CATGAGTATTTAAATGAGAGAGT-AAATTT--CCAAT------TTT
gi|13 : aaatataacacttttGCTAGCATTATGCTACATTATACT-CAC---C-AGGTGG--TATAT-CAA-TTTC-TTTGTTAAGACA--CAG----T-TG-TG-A--TACA-------T------------------G---T-AACACA--AG-AAA--GA-GAATGAAT-CAAGAGCACACAATTGAGATAAT-GAGACC--CCGAC------CCTC----T-CGGG--TTGCTA-tgat
gi|14 : gtgtATGACATCATGTCAT-CT-CCA---A-CGACAA--GAAAT-CAA-ATTA-TTTGTTC--------------T-CA-AA-A--AGTC-------T---------T-----GTGG---T-A-TGCA--AG-Ata
gi|15 : gagatgtttcttattaatattaccattagaatgagataagattcatgcgctcataacatgtattcacaaacATAAT-GAGATT--CCAAC------CCTCAG--T-CTAA--CTGATA-GA-AACCTAGGCCGAGCCTTGGCTC--CG--AT--AA--ATACAGTGAAACC--TTGGGTA-G-GATTACCCTTATCT--CAACCTT--ACACATGTGAAGGAT
gi|16 : aGCTAGTATGATGTCACACTAATCT-CAG---A-AGGTGG--TAAAA-CAA-TGTA-TTTAAATAGG-A--CAAAT--C-TA-AA-A--AAAAAAAAGTCT---------T-----G--A---T-A-CGGA--AG-AAA--AA-AAATCAAT-AAact
gi|18 : A-A------------CCTCAGTTC--CA--AC--AAGAACAATG-AAATTT--T-GTGT-TG-AAATATTTATATCT--CGACCATA--TACCCATGAAAGATTCAAATAAT
gi|19 : --AA--ACA--GTAAAACC--T-GA--CTGAGAATATTCTTATCT--CAAAT---GATACCTATGAAAGATTCTGATA
gi|2 : ggttttgattgTTCTGCAG---ACAGACTA--TAAAT------GTA-TTTGTTTAGA-A--TAA----G-TATGA-A--AATA-------T---------TTGT--G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCTATCGGTGAGAATACGAATGAAGTATTAGAAATTGCCCAAC------CTTCGATAT-C--T--TTGACAGGA-A------------CCTTAG-CG--CA--AT------------TCAA---------GT-TG-GAATATCTTTATAA--CAACC--AAATACCCATGAAAGACTCCTttaatct
gi|3 : aaaatggttaaactgttagtgctggtaaagcatcctatattGCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAT--AA-AATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATa
gi|4 : GCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-A--CAA----T-TA-AA-A--AACA-------C---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAT--AA-AATTCAAT-AACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAAC------TTTC----T-T--G--TTGGTA-GA-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AA--ACATTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCT--CAACCTTAAACACCCATGATAGATACCTATAATt
gi|5 : GCTTGTATGATATCATGCGATTTT-CAA---A-AG-------------------A-TTTATTGAGG-A--AAAGATAT-TA-AA-A-------------C---------T-----A--------A-TGCA--AG-AAA--TA-TAATCAAT-GATGAGTACACAATCAAGATACT-GAGGTG--GGA----------------T-C--A--TCAGTA-GA-G------------TATCAGTTC--CAATAT--AA--ACACC---ACACC--T-TGACTTA-ACATATCCTTATCT--CAACAT--AATAC
gi|6 : gtATGA---CACGCTATTCT-CAG---A-TGA-AA--TAATTTCAA-C--A-TTTTTTTAAA-A--AAA----A-CA-AC-AC-AACA-------TAG-------T-----G--A---T-A-TGCA--AATAAAGGAATGAATCAAG-TATGAGTTTATGGTTGAGACAAT-GATGTT--CCAAC------CTTC--------------------A-A------------CCCTGGTCC--CG--AT--AA--AAACAGTGAAGTC--T-CGGTTTG-AAATATCCTTATCTCCCAACT---ATTACCCATGAAAGATTCCGATAaagaaatacaatcaatgatgagtacataatca
gi|7 : TCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-TTATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTT
gi|8 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcTCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-A--GAA----TATA-AATATCAACA-------TGATTCATAGT-----G--A---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-TTATCAAG-TATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACA-----CTTgatgttacttgttttgaaactcagagggag
gi|9 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcGCTAATATGAC-TTGCGTTACTCT-AAA---A-AGACGG--CAAAT-CAA-CGCAGTTTATT--GA-ATTCGA------TA-AA-A--ATCG-------TTG-------T-----G--G---T-A-TACA--AG-AAA--AAGGAATCAAT-CATGAATATTTTATTTGGATAGT-Ggatgttacttgttttg
blockSeqs : CG T G TTA C A ACA T TCG G C TTC TATAAATATCAACATGATTCATAGTGA G A TT T GG TG CG G A GC CCTCAGTCTAACTGATAGAAACCTAGGCCGAG T A T CG AT CG GA ACGTG AT T A A CC CTTAAA A
blockSeqs : TG T . . . A G . GG . . A TATAAATATCAACATGATTCATAGTGA . . . . . GG C A . . CTTCGATATCTTTGACAGGAA A A C . . . . CAGTG . . C . . CTTAAA G
blockSeqs : CA C . . . G G . TG . . A ATCTAAAAAAAAAAAAGTCTTGA . . . . . G C A . . TTTCTTGTTGGTAGAA C G C . . . . TTGTA . . A . . TAAA T
blockSeqs : TG T . . . A A . TT . . A ATATATAAACTTTAATGG . . . . . G A A . . TTTCTTGTTGGTAGAA C A T . . . . TTGTA . . A . . CTTA T
blockSeqs : TA A . . . G G . AT . . C GTATGAATATCGTGGAGG . . . . . T A G . . CGTTAGTATACA C A T . . . . CAGTG . . T . . CATA T
blockSeqs : TA A . . . A A . TG . . C GTATGAAAATATTTGTGG . . . . . G A G . . TCATCAGTAGAG G A T . . . . ATGA . . T . . CAAA G
blockSeqs : TA G . . . G G . CA . . T ACAACACAACATAGTGA . . . . . A G G . . CCTTTTGT G A T . . . . GGG . . . . . ATAA
blockSeqs : C T . . . G G . CA . . C TCAAAAAGTCTTGTGG . . . . . G T A . . CTTCAA A A T . . . . GTA . . . . . TGA
blockSeqs : . T . . . A A . CA . . C ATACAAAAATCTTAG . . . . . A T G . . C G . . . . . TC . . . . . TAT
blockSeqs : . . . G C . CA . . A TAAAAATCGTTGTGG . . . . . A T C . . . . CC
blockSeqs : . . . G C . CG . . A TTAAAAAACACTGG . . . . . T C C . .
blockSeqs : . . . A G . G . . G TTAAAAAACACTGG . . . . . T . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . . G GATATTAAAACTA . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . TTGTGATACATG . . . .
blockSeqCons : NTATAAAAACATTTGTGG******************************* CCTCTGTTGGTAGAA****************************** ** ** CCGTG CAAA**
originalCons : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAA----T-TA-AA-A--AACA-------T---------T-----G--G---T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAAC------CTTC----T-C--G--TTGGTA-GA-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACANCGTAAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCTTAAATACCCATGAAAGATTCCNATAAT
finalCons : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-A--NAANTATAAAAACATTTGTGG-------------------------------T-A-TGCA--AG-AAA--AA-GAATCAAT-NATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAACCCTCTGTTGGTAGAA------------------------------CNTCGGTCC--CA--AT--AA--ACACCGTGAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCT--CAACCAAA--TACCCATGAAAGATTCCNATAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGCTTACAAGTATACAAGAAAAAATTATTTTTAACAGAAGTACACAATTTATACAATAAGATTCCAACCCGTGATATTTCTATTTTGAAAGGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TGATATTGCAACCCTCAGTATTAGTACAATAAAGTCAACCAAACCTCAGATTGAAATATCCTTATCTACCA
Alignments
lowQualScore : 444444444444444444444444 1111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 111111 111111
lowQualScore : 33 1 2 555 2 1 555 2 666 2 0 1 2 1 88 4444 333333333333333333333333 444 0 2 33 88 3333333 2 2 0 33 000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 77777 88 44 666 7777 0 55 000000 44 333333 4 1
lowQualScore : .. . . ... . . ... . ... . . . . . .. .... ........................ ... . . .. .. ....... . . . .. ................................................... . ..... .. .. ... .... . .. ...... .. ...... . .
lowQualScore : 22 0 9 000 9 6 666 7 222 7 6 1 7 0 99 1111 555555555555555555555555 777 1 5 77 55 9999999 2 5 5 77 000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 00000 66 66 333 5555 2 00 222222 00 888888 0 0
consensus : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-ANAAN-T--ATAAA----AACA------T--TT----GT---GGTATGCAAG-AAA--AA-GAATCAAT-N-----ATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAACCCTC--T---G---T-----T----------GGTA-G-A-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AAA--CA-CNGTGAAACC--T-NGGTTTG-GAATATCCTTATCTCAACC--AA--A-TACCCATGAAAGATTCCNATAAT
Reference ( family-941 ) : GCTAGTATGATATCACGCNATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CGTA-TTTGTTTAGA-ANAAN-T--ATAAA----AACA------T--TT----GT---GGTATGCAAG-AAA--AA-GAATCAAT-N-----ATGAGTATACGATTGAGATAAT-GAGATT--CCAACCCTC--T---G---T-----T----------GGTA-G-A-A------------CNTCGGTCC--CA--AT--AAA--CA-CCGTGAAACC--T-GGGTNTG-GAATATCCTTATCTCAACC--AA--A-TACCCATGAAAGATTCCNATAAT
gi|1 : TTCT-CAG---A-AAATGT--TAAAT-CGA-CATA-TCTGTATAGA-GAAAA-T--TTAGT----AATG------T--TA----AC---AATATACAAG-AAA--AA-GAATCAAC-A-----GTGAGTACACAATTGAGATGAT-AAGATT--CCAATGCTC--T---G---T-----TTCTATGTTTTGATA-GGA-A------------TATTGG-----CAT-AT--AAA---A-CAGTGAAAGC--T-TCGTTGT-GAATGTCCTT--CTCAACC--TT--A-AACCCATGAAAAGTTCCAAAAAT
gi|10 : attttgtctcatagtagagttgggataaaagttgcacactcaagaatgtgttatgtgctagtcATACAATGCAACACT-CAGTTAA-AGACAG--TTAAT-AAA-GGTA-CTTGTTTCGA-AAAAA-T--ATATA----AACT------T--TA----AT---GGTATGCAAG-AAA--AA-GAACCA---------ATGCATATATGACTGAGATAAA-GTGATT--CCAACC---------G---T-----T----------AGTA-T-ACA------------CTGCAATCTCGCA--GTCGAAA--CA-ACGTGAAACcac
gi|11 : gtgcatgctcAAT-CAG-TGTA-TTGGTTTAGA-AAGAA-T--ACAAA----AATC------T--TA----GT---GATGTTTTAG-AAA--AA-GAATCAAT--------TGAAGATACAATTGGCATTGT-GTCTTT--CCAACCCT-----------T-----T----------TGTA--------------------TCAACCC--TT--AG--AAA--CA---G-GGAACCATC-GGGT-TG-GAATATCCTTTTTGGAACT--AA--A-TACACTTGAAAG
gi|12 : gacagGCTAGTACAACGTCTTGCTTTTCT-CA------AGACGACATAAAA-GGATCGTA-TTTGTTTAGA-CAAAG-T--ATGAA----TA-----------TC----GTGGAGGTATGAAAG-TAA--AT-TAATCAAC-C-----ATGAGTATTTAAATGAGAGAGT-AAATTT--CCAA
gi|13 : aaatataacacttttGCTAGCATTATGCTACATTATACT-CAC---C-AGGTGG--TATAT-CAA-TTTC-TTTGTTAAGACACAGT-T--GTGAT----A-CA------T--------GT---AACA--CAAG-AAA--GA-GAATGAAT-C-----AAGAGCACACAATTGAGATAAT-GAGACC--CCGACCCTC--TCGGG---T-----T----------GCTA-tttttgat
gi|14 : gtgtATGACATCATGTCAT-CT-CCA---A-CGACAA--GAAAT-CAA-ATTA-TTTGTTCTCA-AAAAG-T---------------------C--TT----GT---GGTATGCAAG-Ata
gi|15 : gagatgtttcttattaatattaccattagaatgagataagattcatgcgctcataacatgtattcacaaacATAAT-GAGATT--CCAACCCTC--A---G---TCTAACT----------GATA-G-A-AACCTAGGCCGAGCCTTGGCTC--CG--AT--AAA--TA-CAGTGAAACC--TTGGGTA-G-GATTACCCTTATCTCAACC--TT--A-CACATGTGAAGGAT
gi|16 : aGCTAGTATGATGTCACACTAATCT-CAG---A-AGGTGG--TAAAA-CAA-TGTA-TTTAAATAGG-ACAAA-T--CTAAA----AAAAAAAAAGT--CT-----T---GATACGGAAG-AAA--AA-AAATCAAT-A-----Aact
gi|17 : GTATACAAG-AAA--AA---ATTATT-TTTAACAGAAGTACACAATTTATACAAT-AAGATT--CCAACCC
gi|18 : tgcttacaa-A-A------------CCTCAGTTC--CA--AC--AAG--AA-CAATGAAATT--T-TGTGTTG-AAATATTTATATCTCGACC--AT--A-TACCCATGAAAGATTCAAATAATgtgatatttctattttgaaaggaat
gi|19 : --AAA--CA---GTAAAACC--T-GA--CTGAGAATATTCTTATCTCAAAT--GA----TACCTATGAAAGATTCTGATA
gi|2 : ggttttgattgTTCTGCAG---ACAGACTA--TAAAT------GTA-TTTGTTTAGA-ATAAG-T--ATGAA----AATA------T--TT----GT---GGTATGCAAG-AAA--AA-GAATCTATCG-----GTGAGAATACGAATGAAGTATTAGAAATTGCCCAACCTTCGAT---ATCTT-----T----------GACAGG-A-A------------CCTTAG-CG--CA--AT-------------TCAA---------GT-TG-GAATATCTTTATAACAACC--AA--A-TACCCATGAAAGACTCCTttaatct
gi|20 : aaaatggttaaactgttagtgctggtaaagcatcctatattT-GATATT--GCAACCCTCAGT---A---T-----T----------AGTA-----------------------------CA--AT--AAAGTCAACC---AAACC--T-CAGATTG-AAATATCCTTATCT--ACC--Aa
gi|3 : GCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-ACAAT-T--A-AAA----AACA------C---------T---GGTATGCAAG-AAT--AA-AATTCAAT-A-----ACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAACTTTCT-T---G---T-----T----------GGTA-G-A-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AAA--CA-TTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCTCAACCTTAA--A-CACCCATGATAGATACCTATAAT
gi|4 : GCTATGATGATATCATGTAATTCT-CAG---A-AGGCGG--TAAAT-CAA-CATA-TTTGATCAGA-ACAAT-T--A-AAA----AACA------C---------T---GGTATGCAAG-AAT--AA-AATTCAAT-A-----ACGCATATATGATTGAGATAAT-GAGAAT--CCAACTTTCT-T---G---T-----T----------GGTA-G-A-A------------CGTCAGTCC--CA--AT--AAA--CA-TTGTAAGACC--T-GGGTATA-TAATATCCTTATCTCAACCTTAA--A-CACCCATGATAGATACCTATAATt
gi|5 : GCTTGTATGATATCATGCGATTTT-CAA---A-AG-------------------A-TTTATTGAGG-AAAAGAT--ATTAA----AAC-----------------T---A--ATGCAAG-AAA--TA-TAATCAAT-G-----ATGAGTACACAATCAAGATACT-GAGG-T--GGGATCATC---------------------------AGTA-G-A-G------------TATCAGTTC--CAATAT--AAA--CA-CC---ACACC--T-TGACTTA-ACATATCCTTATCTCAACA--TA--A-TAC
gi|6 : gtATGA---CACGCTATTCT-CAG---A-TGA-AA--TAATTTCAA-C--A-TTTTTTTAAA-AAAAA-C--AACAC----AACA------T--A-----GT---GATATGCAAATAAAGGAATGAATCAAG-T-----ATGAGTTTATGGTTGAGACAAT-GATGTT--CCAACCTTC----------------------------------A-A------------CCCTGGTCC--CG--AT--AAA--AA-CAGTGAAGTC--T-CGGTTTG-AAATATCCTTATCTC--CC--AACTATTACCCATGAAAGATTCCGATAaagaaatacaatcaatgatgagtacataatca
gi|7 : TCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-AGAA--T--ATAAATATCAACA------TGATTCATAGT---GATATGCAAG-AAA--AA-TTATCAAG-T-----ATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACACTTGAT---G---T-----T----------
gi|8 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcTCT-CAG---A-AGGCAC--TAAAT-CAG-CATA-TTTGCGTA-A-AGAA--T--ATAAATATCAACA------TGATTCATAGT---GATATGCAAG-AAA--AA-TTATCAAG-T-----ATGAGTGTACCATGGAGACAAT-GATATT--CCAACACTTGAT---G---T-----T----------acttgttttgaaactcagagggag
gi|9 : actttgtctcaagctggggtcacaatcaaattcacaggctcagcGCTAATATGAC-TTGCGTTACTCT-AAA---A-AGACGG--CAAAT-CAA-CGCAGTTTATT------GAAT-TCGATAAA----AATC------G--TT----GT---GGTATACAAG-AAA--AAGGAATCAAT-C-----ATGAATATTTTATTTGGATAGT-Gacttgttttg