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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttgtcgagttccatttcttccaataa-GCACGT---TTCAT-ATAGTT--CAAGCAAAGG--TCAGATTATTACACAG-TAAATT-ATTTCCGATGCAAaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
16 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TTAATTTGTCAATAGTGGTCCGTTTTACTAATAACTCATTTTGATAAAATAAGAAACAGAAGTATATACAACGCGGTGATTTATGTTAACTGCTATGACAAGTTTAGATGAATTCCTTTTTGTAAGTCGTATTTTGATTGGATAATCAATAATAATGAGCGGACGTAATTTTATATGTCAATGTTATAAACTGAAACAACATCGCATGATTAATATTATTCGAGGGCAAAGG
Unaligned ( gi|6 ): AAATCGCACAACAATACATTACAAGACATTTCTTTCATTTTTATTGGTCGTCATGCCACATGTATTTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAACATGTAATGTAATTTAAGTTTTGTCGATTGTTAGTCACTTGTTGATTGGTTAATCGAAAATAAGGTGTGCAGACTGGTATTATTTTCTATTTTTCAAAATAAGAAATAACATCTTTCATAAAATTGGAGGAGATGT
Unaligned ( gi|7 ): AGTAAAACAATGTGCGGCTTAAGATTTCTATGATCCCTGGTCAACGGATATTTTCCCACTTCTTCTACATCGAGACATCTGCTGATGTACTGAGTGCCATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTACTGATACACGAAACGCATGTTTCATTAATTGACAGCAATCACATGATATTACACATATAACTTCTAAAATAATAAACAGAAATGTACTGTTA
Unaligned ( gi|8 ): TTCTTCTATTTTTAATCTCCTATTTGATTATGGTCGTGTTCTTTTTAAATTGCATAACGATACGTGACACAATTTTGTATTGGTCGATAACGGTCTCATTTCATTTAAATAAAAAACAGGACTTTTTATTACATTTTTATTTACATCACCTGTTAATTATTATGTTTTAAAAGCCGTATTTTGATTGGCTAATTGGTAGCAAGATGGGTGGACTAAAGT
Unaligned ( gi|9 ): TATTTTTTCTCTAACATTCTCTTCTCAGAGACTAGTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCTGTTAATCATCCCACGATATATAAAACTATGTTTTATTTGTTGATAGCGGTCATACGTTCATATTGTAGAAATTGTATTGCTTTAATATTGGTATGACTGACTTCTTGTAAACTGTATTTTGATTGGCTAATCAATAGTA
Unaligned ( gi|10 ): ACAGATACAAATATATCGTATATTTTGTAAGCCCCAATTTGATTTGCTGGTAAATAGCAAGGTGCACGTTCTGCAGTAACAGTTTTTTTTTTTAAATTCTCATTTAATTTTTGATAGCATGCATTTCGTAATATTTAAACAGAGGTCAGACTATTACATGATAATGCATTACCATTTCAAATGACAGTATAGTTGAT
Unaligned ( gi|12 ): GTTACTAAAACTCAGATGTTTACTTTTATAAGATAAATTTTGATTGACTATATTTAATAGCAAGTTGTGCAGACTAACATTATTTTTATTTTTTCATACTCAAAAACGAAAAATGCACATATTTCATACTACTCAGATGGAGATCAGAGGTCAGATTTACTGCACAGTAAGTTATGACCA
Unaligned ( gi|14 ): AATTATCACATTTTGAGATATTGTAATTGGCTCATTAATAGCTATGCGTATGGACTGACGATTTTCTCATTTCCCGCTTTAACGAAAACTGCAGATGATTGTACCATTCGAGCAAAAGTCAGCTTATTAATTAATTTGTGAAAGGTGCAAATGAGAG
Unaligned ( gi|15 ): GATCAATTGGATGTTTTCTTTTTAAATCACTTGAAGATACATAACAACATTTTTTCATTGGTCGATAGAGATTCTTATTTTAATCATCTGAGAGACAGAAATGTATTATTACATCGTTTACA
Unaligned ( gi|16 ): CTTGTAAATCTGATGATAATTTTTATTATGGAGCCACGGGCCTATTTGAGAACCATGAATGTCAACCACATGTTTGGTACTATTCATGCAGAGGTCAGAATATCATCAT
Unaligned ( gi|17 ): AATATATATGTTTTTCCCGCTAAAATTAGAAACGGCACATGATTGAGCAGAGGTTAGAATAGTGTATAGGTCTGTATTTATTGACGATGCAA
Unaligned ( gi|18 ): TTAAAGACATAAATAGCACGTGTTTTATTATATCCGACCAGAGGTCAGAACATAGCACGGGAATTTGTGACTAGGGCAAA
Unaligned ( gi|19 ): ATGGACATACGTAATTTTTACTTTCCCACAAGAAGAGGTCCGGAGTATTATACAGTAATTGATGATCAATGCAATGGAG
Unaligned ( gi|20 ): CGAGCAGAATTCAGAGTCTTACATAGTAATTCATGATCCATACAAAGGAGAAATAATAACACTAACTTACTTGGTG
Unaligned ( gi|22 ): ATCAGATAATTTGTGATAAATTTCTGCATGCTCCATGGTCTGAGGACAA
Unaligned ( gi|23 ): GATTAATTTCTGTCGCTCTCTTGTCGCATGTTTT






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gi|2                          : TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCAACTCAGTGTA--ATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTG-AC-ATTACA-TGACA--T-CATTTAC-------CTAATTGGTCATTA-GTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACCCTA---ATGT-GTGT---G--TCA--T-TT---TGTTGGATGTT-------ATG--ACAGGTTCA--G------G-TACTTTTG--------A----------TGTATGGACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-ATTCT-----------CCTATT-----AAAATC--A-GA-ATT---AGCATGTGTC----ATTATA-------C------GAG--CGGA--TCAGAAT-AT--T--AC--A---G-T---TAGT-T-ACCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 c----C------GAG--CAGAATTCAGAGT-CT--T--ACATA---G-T---AATT-C-ATGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCACGTTTC----AT-ATAGTT----C------AAG--CAAAGGTCAGATT-AT--TACAC--A---G-T---AAAT-T-ATTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTTATTAAGTGCA---TATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTA-AC-ACTACA-CAATG--C-CATTT---------TTTATTGGTCAATG-GCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A---A----ATGT---A--TTA--C-TTCAATGTT---TGTTGATTAAAACG--ACATATTCA--GACAATTA-TATTCTTGTAAGTCATA----------TTT-T-GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC-ACTGA-----------CATATTTTCTAAAAATC--A-GA-ACC---AGCACATGTT-----TTGTA--CCATTC------AAG--CAGAGGTCAGAAT-AC--A--ACATA---G-T---AATT-T-ATGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTA-CGTTAA-ATC-----------------ACTC-GTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACA-TC-AATATG-TGACA--C-AATTT---------TCAATCGTTTAT-A-GCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAGACGT-TCATCCCA--TCA--TATT---TACT---TGTC-------ATG--GTAGGTTCA-----------TA-----G--------A----------T-------CT-GGC-----GTA-------GTTTT--ATTTT-----------CTAGCT-----AAGATT--A-GGCATG---A-CGCATGTT-----TTGTA--CTATTC------GAG--CAGAGGTCAGAAT-AT--T--AC--A---GAG---TAAT-TGATGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatttgctatAAATCGCACA-AC-AATACA-TTACAAGA-CATTT-CTTTCATTTTTATTGGTCGTCATGC---CACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAAC------ATGTAATGT---AATTTAAGT-TT---TGTCGATTGTT-------A-GTCACTTGTTGATTG------GTTAATC--G--------AAAATAAGGTGTGC-A-GACT-GGT-----ATT-------ATTTTCTATTTT---------------TC-----AAAATA--A-GA-AAT---AACATCTTTC----ATgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAACGGATATTT-TCCCACTTCTTCTA-CATCGAGACA-TCT-GCTGA----TGTACTGAGTGCC--ATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTA-CT-GATACA-CGAAA--CGCATGT---------TTCATTAATTGACA-GCAATCACATGATAT-TAaaaattggaggagatgt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATT-----C-TCTT-CTCAGAGACTAGTTGAGTGCC--ATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCC-AC-GATATA-TAAAA--C-TATGT---------TTTATTTGTTGATA-GCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACANTTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGAA--ACTN-ACTNAGTGCNATATCTTGCTACGACCTTGTTAAATCGCCTAACG-NTACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCGNTA-GCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANCCTA-ATGT-GTGT---A--TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACTCT----TG------ATG-TAT---GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TTT-----------CCTATT--AAAATC--A-GA-ATN---AGCACGTGTC----ATTATA--C----C------GAG--CAGAGGT-CAGA-ATAT--T--AC--A---GT---NANTTATNACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gttactaaaactcagatgtttacttttataagataaattttgattgactatatttaatagcaagttgtgcaAAATGGGCTA-----TACAC-----TACA------C-AG-TTT--TTCATTGGTCAATA-GTAGTCACATG-TTC-TATTTGTTAC------TAAATGTa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttgtcgagttccatttcttccaataaCTTTTTAAATCACTTGAAG-ATACAT-----AACA------A-CATTTT--TTCATTGGTCGATA-Gtactaaaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatcaattggatgttttCT-GATG----ATA-------ATTTTT-AT-------TATGGAGCCACGGGCCTATTTGAGAACC--ATGA-ATGTCAACCACATGTTTGGTACTAT---T----C------ATG--CAGAGGT-CAGA-ATAT--C--Aagattcttattttaatcatctgagagacagaaatgtattattacatcgtttaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttgtaaatT-------TTT-----------CCCGCT--AAAATT--A-GA-AAC---GGCACATG------ATT-----------------GAG--CAGAGGT-TAGA-ATAG--T--GT--ATAGGTCTGTATTTATTGACGATGCAAtcat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatatatatgtTT--AAAGAC--A-TA-AAT---AGCACGTGTTTT--ATTATAT-C----C------GAC--CAGAGGT-CAGA-ACATAGC--AC--G---GG---AATTTGTGACTAGGGCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----C------AAG--AAGAGGTCCGGA-GTATTAT--AC--A---GT---AATTGATGATCAATGCAA
gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACA-TTACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCATTA-GTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACCCTA-ATGT-GTGT---G--TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACTTT----TG------ATG-TATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TCT-----------CCTATT--AAAATC--A-GA-ATT---AGCATGTGTC----ATTATA-------C------GAG--CGGA--T-CAGA-ATAT--T--AC--A---GT---TAGTTACCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c----C------GAG--CAGAATT-CAGA-GTCT--T--ACATA---GT---AATTCATGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCACGTTTC----AT-ATAGTT----C------AAG--CAAAGGT-CAGA-TTAT--TACAC--A---GT---AAATTATTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTT-ATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACA-CTACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCAATG-GCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAAA-A-ATGT-AT-T---ACTTCAA--TGTTTGTTGATTAAAA-CGACATATTCA--GACAATTA-TATTCT----TGTAAGTCATATTTT---GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC-ACTGACATATTT-----------TCTA----AAAATC--A-GA-ACC---AGCACATGTT-----TTGTA--CCATTC------AAG--CAGAGGT-CAGA-ATAC--A--ACATA---GT---AATTTATGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT------------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCA-ATATGT-----GACA------C-AA--TT--TTCAATCGTTTATA-GCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATCAGAGACGT-TCATCCCA--TC-A--TATTTACT---TGTCA-TGGTAGGTTCA-----------TA---------G------AT----------CT-GGC-----GTA-------GTTTT--AT-------TTT-----------CTAGCT--AAGATT--A-GGCATG---A-CGCATGTT-----TTGTA--CTATTC------GAG--CAGAGGT-CAGA-ATAT--T--ACAGA---GT---AATTGATGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatttgctatAAATCGCACAACA-ATACATTACAAGACATTTCTTT-CA-TTT--TT-ATTGGTCGTCATGC---CACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAAC----ATGTAATGT---AATTT-AAGT-TTTGTCGATTGTTAGTCACTTGTTGATTG------GTTAATCGAAAATA------AGG-TGTGCAGACT-GGT-----ATT-------ATTTTCTAT-------TTT-----------TC------AAAATA--A-GA-AAT---AACATCTTTC----ATgg
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCA--GAG--ACTA-GTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACG-ATATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTGATA-GCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGA---ACTN-ACTGAGTGCCATATCTTGCTACGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-A--T-TTTGTTGGNTGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--CT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC--AT-------TTT-----------CCTACT--AAAATC--A-GA-ATN---AGCACGTGTC----ATTATA--C----C------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
gi|1                          :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CACTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAC------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC--AT-------TCT-----------CCTATT--AAAATC--A-GA-ATT---AGCATGTGTC----ATTATA-------C------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACACACACAACTGCAGATTAAGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA--CAGAGGTC-AGACT-A-T--T--A--C--ATGA---TA-ATGCA-TTACCATTTCAAATGACAGTATAGTTGATg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                     acagatacaaatatatcgtatattttgtaagccccaatttgatttgctggtaaatagcaaggtgcacgttctgcagtaacagtttttttttttaaattctcatttaatttttgatagcatgcatttcgtaatatttaCATTGGACATTTGTCTTATTTCCTCTA-CGTTAA-ATC-TCTCACTG----ATTT-ATTAAGCGTCACATCTCACTATTACCCTGTTAAATCGCGTAACGACTGCAT-------TG------T-CA-ATT--TTCATTGG-CA--ATTAGCGGTCAGGTG--A---ATTTGTTAC------T
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttactaaaactcagatgtttacttttataagataaattttgattgactatatttaatagcaagtGAGTTCCATTTCTTCCAATAA-------AAATGGGCTA-----TACAC-----TACA------C-AG-TTT--TTCATTGGTCA--A-TAGTAGTCACATG-TTC-TATTTGTTAC------TAAATGTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttgtcC-A--T-TTTG--AGATATTG-TAATTGGCTCA--T--------TAATAGCTA---TG-------CGTATG--GACT-GAC-----G---------ATTTTCTCAT-------TTC-----------CC-GCT--TTAACG--A-AA-ACT----GCAGATG------ATTGTA--C----CATTC--GAG--CAAAAGTC-AGCTT-A-T--T--A-----A--T---TA-ATTTG-TGAAAGGTGCAAA-TG-AG---AGtactaaaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aattatcaCTTTTTAAATCACTTGAAGA-TACAT-----AACA------A-CATTTT--TTCATTGGTCG--A-TAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gatcaattggatgttttCT-GATG----ATA-------ATTTTT--AT-------TATGGAGCCACGGGCCTATTTGAGAACC--ATGA-ATGTCAACCACATGTTTGGTACTAT---T----C------ATG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--C--A--agattcttattttaatcatctgagagacagaaatgtattattacatcgtttaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cttgtaaatT-------TTT-----------CCCGCT--AAAATT--A-GA-AAC---GGCACATG------ATT-----------------GAG--CAGAGGTT-AGAAT-AGTG-T--A--T--A--GGTCTGTATTTATTGA-CGATGCAAtcat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatatatatgtT--AAAGAC--A-TA-AAT---AGCACGTGTTTT--ATTATAT-C----C------GAC--CAGAGGTC-AGAAC-A-TAGC--A--C--G--G---GA-ATTTG-TGACTAGGGCAAA
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gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC--AT-------TCT-----------CCTATT--AAAATC--A-GA-ATT---AGCATGTGTC----ATTATA-------C------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     c----C------GAG--CAGAATTC-AGAGT-C-T--T--A--CATA--G---TA-ATTCA-TGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCACGTTTC----AT-ATAGTT----C------AAG--CAAAGGTC-AGATT-A-T--TACA--C--A--G---TA-AATTA-TTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTT-ATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACAC-TACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCA--A-TGGCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A-AATGTAT-TACT----TCAA--TGTTTGTTGATTAAAA-CGACATATTCA--GACAATTA-TATT--CT----TGTAAGTCATATTTT--GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC--ACTGACATATTT-----------TCTA----AAAATC--A-GA-ACC---AGCACATGTT-----TTGTA--CCATTC------AAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-C--A--A--CATA--G---TA-ATTTA-TGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT------------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCAA-TATGT-----GACA------C-AA-TTT--T-CAATCGTTT--A-TAGCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAG-ACGTTCA-TCCCATC-A--TATTTACT---TGTCA-TGGTAGGTTCA-----------TA-----------G------AT---------CT-GGC-----GTA-------GTTTT---AT-------TTT-----------CTAGCT--AAGATT--A-GGCATG---A-CGCATGTT-----TTGTA--CTATTC------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--CAGA--G---TA-ATTGA-TGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatttgctatAAATCGCACAACAA-TACATTACAAGACATTTCTTT-CA-TTT--TT-ATTGGTCGTCA-T----GCCACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAACATGTAATGTA---A-T----TT-AAGT-TTTGTCGATTGTTAGTCACTTGTTGATTG------GTTAAT--CGAAAATA------AGGTGTGCAGACT-GGT-----ATT-------ATTTTCT-AT-------TTT-----------TC------AAAATA--A-GA-AAT---AACATCTTTC----ATgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAACGGATA-TTTTCCCACTTCTTCTA-CATCGAGACA-TCT-GCTGA-----TGTACTGAGTGCCATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTACTGA-TACAC-----GAAA------CGCA-TGT--TTCATTAATTG--A-CAGCAATCACATGATAT-TAaaaattggaggagatgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtaaaacaatgtgcggcttaagatttctatgatccctggCTTTTTAAATTGCATAACGA-TACGT-----GACA------C-AA-TTT--TGTATTGGTCG--A-TAACGGTCTCATcacatataacttctaaaataataaacagaaatgtactgtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCA--GAG--ACTA-GTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACGA-TATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTG--A-TAGCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TTAATTTGTCAATAGTGGTCCGTTTTACTAATAACTCATTTTGATAAAATAAGAAACAGAAGTATATACAACGCGGTGATTTATGTTAACTGCTATGACAAGTTTAGATGAATTCCTTTTTGTAAGTCGTATTTTGATTGGATAATCAATAATAATGAGCGGACGTAATTTTATATGTCAATGTTATAAACTGAAACAACATCGCATGATTAATATTATTCGAGGGCAAAGG
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Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGA---ACTN-ACTGAGTGCCATATCTTGCTATGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TANT--CT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TTT--CCTACT--AAAATCAGAANTAGCACG--TGTC--ATTATA--C----C---------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttactaaaactcagatgtttacttttataagataaattttgattgactatatttaatagcaagtGAGTTCCATTTCTTCCAATAA-------AAATGGGCTA-----TACAC-----TACA------C-AG-TTT--TTCATTGGTCA--A-TAGTAGTCACATG-TTC-TATTTGTTAC------TAAATGTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttgtcC-A--T-TTTG--AGATATTG-TAATTGGCTCA--T--------TAATAGCTA---TG-------CGTATG--GACT-G-------ACG-------ATTTTC--TCA-----TTT--CCCGCT--TTAACGAAAACT-GCAGA--TG----ATTGTA--CCATTC---------GAG--CAAAAGTC-AGCTT-A-T--T--A-----A--T---TA-ATTTG-TGAAAGGTGCAAA-TG-AG---AGtactaaaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aattatcaCTTTTTAAATCACTTGAAGA-TACAT-----AACA------A-CATTTT--TTCATTGGTCG--A-TAG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatcaattggatgttttT-------TTT--CCCGCT--AAAATTAGAAACGGCACA--TG----ATT--------------------GAG--CAGAGGTT-AGAAT-AGTG-T--A--T--A--GGTCTGTATTTATTGA-CGATGCAAagattcttattttaatcatctgagagacagaaatgtattattacatcgtttaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatatatatgtT--AAAGACATAAATAGCACG--TGTTTTATTATAT-C----C---------GAC--CAGAGGTC-AGAAC-A-TAGC--A--C--G--G---GA-ATTTG-TGACTAGGGCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t----C---------AAG--AAGAGGTCCGGAGT-A-T--T--ATAC--A--G---TA-ATTGA-TGATCAATGCAA
gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TCT--CCTATT--AAAATCAGAATTAGCATG--TGTC--ATTATA-------C---------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    c----C---------GAG--CAGAATTC-AGAGT-C-T--T--A--CATA--G---TA-ATTCA-TGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCACG--TTTC--AT-ATAGTT----C---------AAG--CAAAGGTC-AGATT-A-T--TACA--C--A--G---TA-AATTA-TTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTT-ATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACAC-TACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCA--A-TGGCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A-AATGTAT-TACT----TCAA--TGTTTGTTGATTAAAA-CGACATATTCA--GACAATTA-TATT--CT----TGTAAGTCATATTTT--GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC-ACTGACATATTT--TCTA----AAAATCAGAACCAGCACA--TGTT---TTGTA--CCATTC---------AAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-C--A--A--CATA--G---TA-ATTTA-TGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT------------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCAA-TATGT-----GACA------C-AA-TTT--T-CAATCGTTT--A-TAGCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAG-ACGTTCA-TCCCATC-A--TATTTACT---TGTCA-TGGTAGGTTCA-----------TA-----------G------AT---------CT-GGC-----GTA-------GTTTT--AT-------TTT--CTAGCT--AAGATTAGGCATGACGCA--TGTT---TTGTA--CTATTC---------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--CAGA--G---TA-ATTGA-TGACCGATACAAAt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCA--GAG--ACTA-GTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACGA-TATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTG--A-TAGCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
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consensus                     :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGA---ACTN-ACTGAGTGCCATATCTTGCTATGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TANT--CT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TTT--CCTGCT--AAAATCAGAANTAGCACG--TG--TCATTATA--C----C---------GAG--CAGAGGTC-AGANT-A-T--T--A--C--A--G---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGA---ACTN-ACTGAGTGCCATATCTTGCTATGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TANT--CT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TTT--CCTGCT--AAAATCAGAANTAGCACG--TG--TCATTATA--C----C---------GAG--CAGAGGTC-AGANT-A-T--T--A--C--A--G---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
gi|1                          :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CACTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAC------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TCT--CCTATT--AAAATCAGAATTAGCATG--TG--TCATTATA-------C---------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACACACACAACTGCAGATTAAGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCATGCATT--TCGTAATA--T----TT--------AAA--CAGAGGTC-AGACT-A-T--T--A--C--ATGA---TA-ATGCA-TTACCATTTCAAATGACAGTATAGTTGATg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                            acagatacaaatatatcgtatattttgtaagccccaatttgatttgctggtaaatagcaaggtgcacgttctgcagtaacagtttttttttttaaattctcatttaatttttgaCATTGGACATTTGTCTTATTTCCTCTA-CGTTAA-ATC-TCTCACTG----ATTT-ATTAAGCGTCACATCTCACTATTACCCTGTTAAATCGCGTAACGACTGCAT-------TG------T-CA-ATT--TTCATTGG-CA--ATTAGCGGTCAGGTG--A---ATTTGTTAC------T
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cTGTGCA--GACT-AAC-----ATT-------ATTTTT-AT-------TTTTTCATACTCAAAAACGAAAAAT-GCACA--TA--TT-TCATA--C----TACTCAGATGGAGATCAGAGGTC-AGATTTA-C--TGCA--C--A--G---TA-AGTTA-TGACCttagttggaactagaaattttttgcttgatttgtttatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttactaaaactcagatgtttacttttataagataaattttgattgactatatttaatagcaagtGAGTTCCATTTCTTCCAATAA-------AAATGGGCTA-----TACAC-----TACA------C-AG-TTT--TTCATTGGTCA--A-TAGTAGTCACATG-TTC-TATTTGTTAC------TAAATGTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttgtcC-A--T-TTTG--AGATATTG-TAATTGGCTCA--T--------TAATAGCTA---TG-------CGTATG--GACT-G-------ACG-------ATTTTC--TCA-----TTT--CCCGCT--TTAACGAAAACT-GCAGA--TG----ATTGTA--CCATTC---------GAG--CAAAAGTC-AGCTT-A-T--T--A-----A--T---TA-ATTTG-TGAAAGGTGCAAA-TG-AG---AGtactaaaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aattatcaCTTTTTAAATCACTTGAAGA-TACAT-----AACA------A-CATTTT--TTCATTGGTCG--A-TAG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatcaattggatgttttT-------TTT--CCCGCT--AAAATTAGAAACGGCACA--TG----ATT--------------------GAG--CAGAGGTT-AGAAT-AGTG-T--A--T--A--GGTCTGTATTTATTGA-CGATGCAAagattcttattttaatcatctgagagacagaaatgtattattacatcgtttaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatatatatgtT--AAAGACATAAATAGCACG--TGTTTTATTATAT-C----C---------GAC--CAGAGGTC-AGAAC-A-TAGC--A--C--G--G---GA-ATTTG-TGACTAGGGCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t----C---------AAG--AAGAGGTCCGGAGT-A-T--T--ATAC--A--G---TA-ATTGA-TGATCAATGCAA
gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TCT--CCTATT--AAAATCAGAATTAGCATG--TG--TCATTATA-------C---------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    c----C---------GAG--CAGAATTC-AGAGT-C-T--T--A--CATA--G---TA-ATTCA-TGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCACG--TT--TCAT-ATAGTT----C---------AAG--CAAAGGTC-AGATT-A-T--TACA--C--A--G---TA-AATTA-TTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTT-ATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACAC-TACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCA--A-TGGCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A-AATGTAT-TACT----TCAA--TGTTTGTTGATTAAAA-CGACATATTCA--GACAATTA-TATT--CT----TGTAAGTCATATTTT--GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC-ACTGACATATTT--TCTA----AAAATCAGAACCAGCACA--TG--TT-TTGTA--CCATTC---------AAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-C--A--A--CATA--G---TA-ATTTA-TGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT------------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCAA-TATGT-----GACA------C-AA-TTT--T-CAATCGTTT--A-TAGCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAG-ACGTTCA-TCCCATC-A--TATTTACT---TGTCA-TGGTAGGTTCA-----------TA-----------G------AT---------CT-GGC-----GTA-------GTTTT--AT-------TTT--CTAGCT--AAGATTAGGCATGACGCA--TG--TT-TTGTA--CTATTC---------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--CAGA--G---TA-ATTGA-TGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatttgctatAAATCGCACAACAA-TACATTACAAGACATTTCTTT-CA-TTT--TT-ATTGGTCGTCA-T----GCCACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAACATGTAATGTA---A-T----TT-AAGT-TTTGTCGATTGTTAGTCACTTGTTGATTG------GTTAAT--CGAAAATA------AGGTGTGCAGACT-GGT-----ATT-------ATTTTCTAT-------TTT--TC------AAAATAAGAAATAACATC--TT--TCATgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAACGGATA-TTTTCCCACTTCTTCTA-CATCGAGACA-TCT-GCTGA-----TGTACTGAGTGCCATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTACTGA-TACAC-----GAAA------CGCA-TGT--TTCATTAATTG--A-CAGCAATCACATGATAT-TAaaaattggaggagatgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtaaaacaatgtgcggcttaagatttctatgatccctggCTTTTTAAATTGCATAACGA-TACGT-----GACA------C-AA-TTT--TGTATTGGTCG--A-TAACGGTCTCATcacatataacttctaaaataataaacagaaatgtactgtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCA--GAG--ACTA-GTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACGA-TATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTG--A-TAGCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTGA---ACTN-ACTGAGTGCCATATCTTGCTATGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TANT--CT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TTT--CCTGCT--AAAATCAGAANTAGCACG--TG--TCATTATA--C----C---------GAG--CAGAGGTC-AGANT-A-T--T--A--C--A--G---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttactaaaactcagatgtttacttttataagataaattttgattgactatatttaatagcaagtGAGTTCCATTTCTTCCAATAA-------AAATGGGCTA-----TACAC-----TACA------C-AG-TTT--TTCATTGGTCA--A-TAGTAGTCACATG-TTC-TATTTGTTAC------TAAATGTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttgtcC-A--T-TTTG--AGATATTG-TAATTGGCTCA--T--------TAATAGCTA---TG-------CGTATG--GACT-G-------ACG-------ATTTTC--TCA-----TTT--CCCGCT--TTAACGAAAACT-GCAGA--TG----ATTGTA--CCATTC---------GAG--CAAAAGTC-AGCTT-A-T--T--A-----A--T---TA-ATTTG-TGAAAGGTGCAAA-TG-AG---AGtactaaaatataagacagactcagctgatcatatatttgtaacctgtattttgattggctaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aattatcaCTTTTTAAATCACTTGAAGA-TACAT-----AACA------A-CATTTT--TTCATTGGTCG--A-TAG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatcaattggatgttttT-------TTT--CCCGCT--AAAATTAGAAACGGCACA--TG----ATT--------------------GAG--CAGAGGTT-AGAAT-AGTG-T--A--T--A--GGTCTGTATTTATTGA-CGATGCAAagattcttattttaatcatctgagagacagaaatgtattattacatcgtttaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatatatatgtT--AAAGACATAAATAGCACG--TGTTTTATTATAT-C----C---------GAC--CAGAGGTC-AGAAC-A-TAGC--A--C--G--G---GA-ATTTG-TGACTAGGGCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t----C---------AAG--AAGAGGTCCGGAGT-A-T--T--ATAC--A--G---TA-ATTGA-TGATCAATGCAA
gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCA-ACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-A--T-TTTGTTGGATGTTA-TGACAGGTTCA--G------G-TACT--TT----TG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC-AT-------TCT--CCTATT--AAAATCAGAATTAGCATG--TG--TCATTATA-------C---------GAG--CGGA--TC-AGAAT-A-T--T--A--C--A--G---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    c----C---------GAG--CAGAATTC-AGAGT-C-T--T--A--CATA--G---TA-ATTCA-TGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCACG--TT--TCAT-ATAGTT----C---------AAG--CAAAGGTC-AGATT-A-T--TACA--C--A--G---TA-AATTA-TTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TGA----TTT-ATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACAC-TACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCA--A-TGGCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A-AATGTAT-TACT----TCAA--TGTTTGTTGATTAAAA-CGACATATTCA--GACAATTA-TATT--CT----TGTAAGTCATATTTT--GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC-ACTGACATATTT--TCTA----AAAATCAGAACCAGCACA--TG--TT-TTGTA--CCATTC---------AAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-C--A--A--CATA--G---TA-ATTTA-TGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT------------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCAA-TATGT-----GACA------C-AA-TTT--T-CAATCGTTT--A-TAGCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAG-ACGTTCA-TCCCATC-A--TATTTACT---TGTCA-TGGTAGGTTCA-----------TA-----------G------AT---------CT-GGC-----GTA-------GTTTT--AT-------TTT--CTAGCT--AAGATTAGGCATGACGCA--TG--TT-TTGTA--CTATTC---------GAG--CAGAGGTC-AGAAT-A-T--T--A--CAGA--G---TA-ATTGA-TGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatttgctatAAATCGCACAACAA-TACATTACAAGACATTTCTTT-CA-TTT--TT-ATTGGTCGTCA-T----GCCACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAACATGTAATGTA---A-T----TT-AAGT-TTTGTCGATTGTTAGTCACTTGTTGATTG------GTTAAT--CGAAAATA------AGGTGTGCAGACT-GGT-----ATT-------ATTTTCTAT-------TTT--TC------AAAATAAGAAATAACATC--TT--TCATgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAACGGATA-TTTTCCCACTTCTTCTA-CATCGAGACA-TCT-GCTGA-----TGTACTGAGTGCCATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTACTGA-TACAC-----GAAA------CGCA-TGT--TTCATTAATTG--A-CAGCAATCACATGATAT-TAaaaattggaggagatgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtaaaacaatgtgcggcttaagatttctatgatccctggCTTTTTAAATTGCATAACGA-TACGT-----GACA------C-AA-TTT--TGTATTGGTCG--A-TAACGGTCTCATcacatataacttctaaaataataaacagaaatgtactgtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCA--GAG--ACTA-GTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACGA-TATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTG--A-TAGCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T      T     CTCTAACA    G  ACATTGAAACACCA              C       A    T    T          G     AC     TACAAG   TTTCTTT   T   AC  C        TC T        A    A   ATAT       TTTATT     G C   C ATGT      TTCATCCCA   A AGT     T AGA     G           GACAATTATATTCTTGTAAGTC             G  CA    G ATAATCAATAGCAAGGC      T  TGACATA   TT  TACTCA     G    A A     CA  TTTTA     CTACTCAGATG         AT    G   C   C T G TGCAC       TG GTC  T     T             TGAC  TAT  T                                                                                                                                       T      C                 T
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-926 )      :                             TTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCGAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGCTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTNGTTTCCTCTA-CGTTAA-ATA-TCTCACTG----ACTTACTGAGTGCCATATCTTGCTATGACCTTGTTAAATCGCCTAACGA-TACAT-----GACA------C-CA-TTT--TTCATTGGTCG--A-TAGCGGTCGCATG-TAC-TATTTGTTAC------TAGATNTNGAANC--NTAATGTGTGTA-T----TC-ATG-TTTGTTG-GATGTTA-TGACAGGTTC-----ATTGA-TANTC----NTG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC--AT-------TTT--CCTGCT--AAAATCAGAANTAGCACG--TGTCATTAT-A-C-ATTC-----GAG--CAGAGGTC-AGANT-ATTACACAG---TA-ATTTA-TGACCGATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCGGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACNCACACANCTGCAGATTAAGAGGGGNGGGGGGGGGGGGGG
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatatatatgtT--AAAGACATAAATAGCACG--TGTT-TTATTA-T-ATCC-----GAC--CAGAGGTC-AGAAC-ATAGCACGG---GA-ATTTG-TGACTAGGGCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tC-----AAG--AAGAGGTCCGGAGT-ATTATACAG---TA-ATTGA-TGATCAATGCAA
gi|2                          : atggacatacgtaatttttactttcccaTTGGGCCCCACTCATGTGTATGACAGTCAAGTTCTCTACAAGACAAGTAAATGTAAAAGTACCTACCACAGTATGTGTAGATGATGTTCCTCTCTTCAAATCGCACCTTTAAATTATACAGCACTGAAAATACACAAAATGTGATAAGTGAGTAAGGTAAGTTTACTTTCTCAGGTGGAATAACATCATTTTTAGATCAGTTTGAGAAAGAATCAAGATGACTGCTTTAACCTTCTTTAATTCATTTATATATCAATATTGTGTTATACTATATCATAATGGAATATACATATGTTTATCTTTGAAATTTAAACATAGGCTCAGTGGACAATTTTCTGGTTTC---------TAA-ATA----CATTGAAACACCAACTCAGTGTAATATCATGCTATGACTTAGTTAAATGGCCTGACAT-TACAT-----GACA------T-CA-TTTACCTAATTGGTCA--T-TAGTGGTTGCATG-TAC-AAGCTGTTAT------TAGATCTCTAACC--CTAATGTGTGTG------TC-AT--TTTGTTG-GATGTTA-TGACAGGTTC-----A--GG-TACTT----TTG------ATGTATG--GACT-GAT-----ATA-------ATTTTC--AT-------TCT--CCTATT--AAAATCAGAATTAGCATG--TGTCATTAT-A------C-----GAG--CGGA--TC-AGAAT-ATT--ACAG---TT-AGTTA-CCACCAATGCAAATTA-AG---AGTTAATCAAATAATAATTGCCTATTTATTTTCATGTGCTGATTATATTCCGACTTCATTCTATATTACCAGGCATGAAAGAGATTCAAATAAAATATATACCAGTAGTGAATATCATAAAGGCCCCCAACCCACCACTCACACACCTGCAGATTAAGAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGtggag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cC-----GAG--CAGAATTC-AGAGT-CTTACATAG---TA-ATTCA-TGATCCATACAA---A-GG---AG------AAATAATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCACG--TTTCAT-AT-A---GTTC-----AAG--CAAAGGTC-AGATT-ATTACACAG---TA-AATTA-TTTCCGATGCAAcactaacttacttggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTTTCTTCTA-TTTTAA-AAAATCTC--TG----ATTTATTAAGTGC-ATATCTTGCCATGACCTTGTTAAATTGCTTAACAC-TACAC-----AATG------C-CA-TTT--TTTATTGGTCA--A-TGGCAGTCACATG-TAC-TCATTGTTAC------TAAATCTAGAAAA--A-AATGTAT-TACT----TCAATG-TTTGTTG-ATTAAAA-CGACATATTCAGACAATT-A-TATTC----TTGTAAGTCATATTTT--GATTGGATAATCAATAGCAAGGCATTCTC--ACTGACATATTT--TCTA----AAAATCAGAACCAGCACA--TGTT-TTGT-ACC-ATTC-----AAG--CAGAGGTC-AGAAT-ACAACATAG---TA-ATTTA-TGACTGGTACAggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTA-CGTTAA-AT-----CACT-----------CGTGTGCTATATCTTTCTATCACTATGTTAAATCGCACATCAA-TATGT-----GACA------C-AA-TTT--T-CAATCGTTT--A-TAGCGATCGCGAG-TAC-T-TCTTCTAC------TAGAAACAGAATC--AGAG-ACGTTCA-TCCCATC-ATA-TTTACT----TGTCA-TGGTAGGTTC-----ATAGA-T----------------------------CT-GGC-----GTA-------GTTTT---AT-------TTT--CTAGCT--AAGATTAGGCATGACGCA--TGTT-TTGT-A-CTATTC-----GAG--CAGAGGTC-AGAAT-ATTACAGAG---TA-ATTGA-TGACCGATACAAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatttgctatAAATCGCACAACAA-TACATTACAAGACATTTCTTT-CA-TTT--TT-ATTGGTCGTCA-T----GCCACATG-TAT---TTTGTTACTTTATTTAGATAGGGAAACATGTAATGTA---A-T----TT-AAGTTTTGTCG-ATTGTTAGTCACTTGTTG-----ATTGGTTAATCGAAAATA------AGGTGTGCAGACT-GGT-----ATT-------ATTTTCT-AT-------TTT--TC------AAAATAAGAAATAACATC--TTTCA-TA--A-A-ATTG-----GAG--GAGATGTgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAACGGATA-TTTTCCCACTTCTTCTA-CATCGAGACA-TCT-GCTG----ATGTACTGAGTGCCATTTCTTCTTACCACCTAGATAAATCATCTACTGA-TACAC-----GAAA------CGCA-TGT--TTCATTAATTG--A-CAGCAATCACATGATAT-TA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtaaaacaatgtgcggcttaagatttctatgatccctggCTTTTTAAATTGCATAACGA-TACGT-----GACA------C-AA-TTT--TGTATTGGTCG--A-TAACGGTCTCATcacatataacttctaaaataataaacagaaatgtactgtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcttctatttttaatctcctatttgattatggtcgtgttTTTTCTCTAACATTCT-CT--TCTCAGAG----ACTAGTTGAGTGCCATAGCTTGCTACGGGCT-GTTAA-TCATCCCACGA-TATAT-----AAAA------C-TA-TGT--TTTATTTGTTG--A-TAGCGGTCATACG-TTCATATTttcatttaaataaaaaacaggactttttattacatttttatttacatcacctgttaattattatgttttaaaagccgtattttgattggctaattggtagcaagatgggtggactaaagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TTAATTTGTCAATAGTGGTCCGTTTTACTAATAACTCATTTTGATAAAATAAGAAACAGAAGTATATACAACGCGGTGATTTATGTTAACTGCTATGACAAGTTTAGATGAATTCCTTTTTGTAAGTCGTATTTTGATTGGATAATCAATAATAATGAGCGGACGTAATTTTATATGTCAATGTTATAAACTGAAACAACATCGCATGATTAATATTATTCGAGGGCAAAGG
Unaligned ( gi|16 ): CTTGTAAATCTGATGATAATTTTTATTATGGAGCCACGGGCCTATTTGAGAACCATGAATGTCAACCACATGTTTGGTACTATTCATGCAGAGGTCAGAATATCATCAT
Unaligned ( gi|22 ): ATCAGATAATTTGTGATAAATTTCTGCATGCTCCATGGTCTGAGGACAA
Unaligned ( gi|23 ): GATTAATTTCTGTCGCTCTCTTGTCGCATGTTTT