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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTTGATAACATTTTACACT-----AATATAAA-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCATAAAATA--AA-CAAACAAAACAAGCTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTG-CGGCGC-CATTGATGCCTTGCATTAATCATTT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTGGTACATATTCATAAAATA--AATCATACAAAGCAATCTCATTGTTGTTTCTTGAAAACAAACTTG-TGGCGC-CATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
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gi|20                         :                                                                                                                                                      caagtgaaagttcgcatgcaaaaatgcatatgatgaccacttgaactattttcgatgttggtttagtctgtaatgtactcacatccaatgatctaaatttcatcaataacacaagtgcccaaaactatgtacatgattataaaaatagtatacagaagaaaccaagcagcttttgtcattcatgtaaccggttcttatatccagatcagtttaaagttctccgttcgaccaatatttctgtaataaatttggctttggaaatgccttgtaatgtgtgatcaacttgttattcgtgtttgaaaaaaggtgtcattacacaatctttgaagtgatgactattttcttttgtttactctgatcattcgacagaacagtttatatttcgattttatatttttggttatcaaactagccttacatgttcaaaattattgttttatctcttaataacattttacactaaacggtcattatctttcttTTTAAAACAAATCTG-CGGCGT-CATTGATGCCTTGCCTCAATC-TTTGtc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTCTTTAACAATTATGGAACCTTTGATCAATATCTATTGCCATTATCACTTCTTTTTATTGATCAGAAACATACAAGTTCCGTTACCTTACTTTTCATAGTCAGTATCCTGTATAGCATCCTCCACATTGATGCACGGAACTTGTATGTTTCTAATCAATAAAAAGAAGTGATAATGGCAATAGATTTTGATGAAAGTTTCCAGGAAATGTAGAAAGATGTTATATTATCAAATAAAATAATTTTCAAAATATCGATA






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCTCCGTTCGATAAATATTTCTGT--AATAAAGTTAGCTTTGGAAATGCCTTTTAATATTTGTTTA---TCTTGTTATTTGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAACAATCACACAATCCTTGAAGTGGTTAC-T-TTT--TCCAT--TTGTTTACT----CTGTTAAATCGACAGAACTCGTTTACCTGTCGCTTTTATATGTTTATAGC---CTTACAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-C--------TCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CG----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCCTTAAAACAAACTTGCGGTGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGgttcaaaatgattgttttgtctcttaataacattttacactaaactctgttggtacatattcataaaataaacgtacaaagcaaactcattgttgtttccttaaaacaaacttgcggtgccattgatgccttgcatcaatctttgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctccgttcgataaatatttctgtaataaagttagctttggaaatgccttttaatatttgtttatcttgttatttgtgtttgagaaaaggtatcaacaatcacacaatccttgaagtggttactttttccatttgtttactctgttaaatcgacagaactcgtttacctgtcgcttttatatgtttaAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGATCAATGAAACCATGTTCAATGTTGGTTTAGTCTG-TGA-TTTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATGTCATCAATTGCACAAGTGACAAAAAAAATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCGTTTGTCATTCATGCAACCGTTTCTTTTATATCTAGATCAGGTTAAAATTCGCTGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAAATGGGCTTCGGAAGTGCCTTGTTATGTGTGTTCA---ACTTGTTCTTCGTGTTTGAG-AA-AA---TGTGTCAAA----ACACAGTCCTTGAAGTGGTGAC-tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTCGATGTTGGTTTCGTCTG---A-TGTACTCACATCCAAT---T---AT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTATTATTATATATTCAT-AAAA-AAA-CA----TGCAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAACCAAGCTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgcaaagcaaactcattgttgtttctttaaaccaagcttgcggcgccattgatgccttgcatcaatctttgtcttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttcgatgttggtttcgtctgatgtactcacatccaattattaAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGCCATTCTCTGTTGGTATATAGTCAT-AAAATAAA-CA----TAGAA--CAAACGCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGTTGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtcttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTTGATAACATTTTACACT-----AATATAAA-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----AACAAAACAAGCTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATTAATCATTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAGTGAAAGTTCACATGCAATGAAGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTCGTCTG---A-TGTACTCACATCCAAT---T---ATt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAATCA----TACAAAGCAATCTCATTGTTGTTTCTTGAAAACAAACTTGTGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AACATTAA-CA----TACAAAGCAAAAGC-TTGTTGTATCTTTAAAACAAGCTTACGGTGCCATTGAT-CCCTGCATt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACACGTGAAAGTTCACATGAAACAATGAATAGGATGACTAATGAAACCATTTCCGTTGTTGGTTTCGTCTG-TGA-TGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAAAC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCAGT--TTTTATACCAAGGTCAG-------TTCTCTGTTCAACAAATATTTATGT--AATAAATTTGGCTTTAAAAATGCCTTATAATGTGTGTTCA---ACTTGCTATTTGTGTTTGAG-AA-TA---GGTATCAAATATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAT-G-TTT--TCAAT--GTATTTACT----ATGGTAAACCGACAGAACTCCTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TG--------ACATCTCATCTAGTTTACCCAGATCAAGGTAGTCTTAC---------ATGTTCT-AAATGATAGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCA-TCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAACCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttgttttgttatagatttaaaatgCAAGTGAAAGTCCACATGCAGCAATGAATATGATAACTAATGAAACC-TTTTCAATGTTAGTTTAGCCTGTT-A-TGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAATTTTCATCAATTACACAAGTGACTAAAACCATGTACATGATTTTGAAAATAGTATACAGAAGAAACC-CT-------GCAGTTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATTCAGATCAGGTAAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTTATATGTGTT-A---ACTTGTTATCTGTGTTTAAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAACTCAAAAGAACTTATTTATCTTTGGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCTTACATCTCATTTATTTTACCCAGATCAAGCTAACCTTAC---------ATTTTCA-AAATGATTGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A---------------TGGTTCATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAAATTGTGGCA-CATTGATGTCTTGCATCAATC-TTTGtctttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGTAAGTTCA-------------A-ATGATGACTAATGAAACTATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTG-TGA-TGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAACTACACAAGTGATCAAAACCATGTACATGATTATG-------------GAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACTGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATACTTCTGT--TATAAATTTGTTTTTGGAAATGCTTTGTATTGTGTGTTCA---GCTTGTTATTGGTGTTTGAGAAA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCGTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TTTTA--TATTTTACCCTTACTAGTAAATTGAAAGAACACGTTTATCTTTCGATTTCATAT-ATT-TGGC-TTCCTGCATCTCATTTATTTTACCAAGATCAAGCTAGCCTTGCAATAATAAAATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATTACATTTTACACTAAAAAAA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCT-----------TTGCAGCGCCATTGATGCATTGCATCAATC-TTtct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaAAAAAGTGAAAGTTCACATCCAACAATGAATATGACGACTAATAAAAGCA-TATCGATGTTGGTTTAGTCTT-TGA-TGTGCTCACATCCAAA---G---ATTTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-AA-------GCAGCGTTTGTCA-------------T--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTTTCCGTTCGAAAAATATTGCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTCGTTATTCGTATTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACA-CACACAACCCTTGA--TGGTGAC-T-TTT--TCTAA--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTTTCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTCTACCTATATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTAC-CT-----AA-----AGCGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGAAAACTC--TCTT-TTTTTTTAAAACAAACTTGCGGCGGCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGAAGCGCCATTGATGCCTTGCATCGATC-TTTGttcttttattgttgtttctttaaaacaaacttgaagcgccattgatgccttgcatcgatctttgtc
gi|8                          : caagtgaaagttcgcatgcaaaaatgcatatgatgaccacttgaactattttcgatgttggtttagtctgtaatgtactcacatccaatgatctaaatttcatcaataacacaagtgcccaaaactatgtacatgattataaaaatagtatacagaagaaaccaagcagcttttgtcattcatgtaaccggttcttatatccagatcagtttaaagttctccgttcgaccaatatttctgtaataaatttggctttggaaatgccttgtaatgtgtgatcaacttgttattcgtgtttgaaaaaaggtgtcattacacaatctttgaagtgatgactattttcttttgtttactctgatcattcgacagaacagtttatatttcgattttatatttttggttatcaaactagccttacatgttcaaaattattgttttatctcttaataacattttacactaaacggtcattatctttcttAGTGAAAGTTCACATGTTACAATGAATATGATGATTAATGAAACCATTTCCGATGTTGGTTTAGTCTG-TGA-TGTACTCATATCAAACTTAGTCTATCTAAATTTCGTCAATTACACAAGTTACCAAAACTATGTACATGATTATGGAAATAGTATACGGACC---CC-CACCCCCCTGCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGTTTAAAGTTCTCTGTTCGACAAATAC------------------GCTTT----ATG-------ATGTGTATTCAAATAATTGTTATTCGTGTATGAG-AA-AA---TGTATCAAACATCAAACAATCCCTGAAGTGGTAACTT-TTT--TCTACCGTATTTTAAT----CTGGTAAATCGACATAACTCGTTTATCGTTCCATATTATAT-TTT-TGGGTTTCCTTCATCTCATCTATTTTACCTATATCAAGGTAGCCTTAC---------ATGTTTATCTAT--TTATTTATTCTCTT--TAAC-TCCTCCGGT------T-----A-CAGAGATTTTA---TGGTACATGAACAC-AATGCAAA-CATATGTACAAAGtc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGTTCGATAAATATTTCTGT--GATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCCTGTAACGTGT--TTA---ACTTATTATTCGTGTTTGAG-AT-AA---GGTGTCA----TTACAAAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTTTTTCTAT--TTTTGTACT----CTGGTCAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGGTTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTACAGCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAGTGATTGTTTTGTCTCTTGATAACGTTTTACACT-----AA-----A-AGGCCATTCTCTTTTGGTACATATTCAGAAAAATTAA-CA----TACAAAGGAAACTCAGTGTTATTTCGTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-CTTGtga
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTCTTTAACAATTATGGAACCTTTGATCAATATCTATTGCCATTATCACTTCTTTTTATTGATCAGAAACATACAAGTTCCGTTACCTTACTTTTCATAGTCAGTATCCTGTATAGCATCCTCCACATTGATGCACGGAACTTGTATGTTTCTAATCAATAAAAAGAAGTGATAATGGCAATAGATTTTGATGAAAGTTTCCAGGAAATGTAGAAAGATGTTATATTATCAAATAAAATAATTTTCAAAATATCGATA






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Reference ( family-9105 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTAGATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACCAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCACTTTCAATGTTGGTTTAGTCTG--ATGTACTCACACCCAAA---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAGTAGTATATGGAAAAAAAAACA-------GCAGCTTTTGTCATTCATCCAAGCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCAACAAATATTTCTGT--AATAAATAGGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGATAATTCGACAGAACTAGTTTATCTTTCGATTATATAT-TTT-TGGTTTACCTACATCTCATTTATTTCACCCAGATCAAGCTTGTCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACGTTTTAAACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCGGTTGGTAGATACTCAT-AAAACAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATCATTGTTTCTTTAAAACAAAATTGGGTCGCCATTGATGCCGTGCATCAATC-TTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTCCGTTCGATAAATATTTCTGT--AATAAAGTTAGCTTTGGAAATGCCTTTTAATATTTGTTTA---TCTTGTTATTTGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAACAATCACACAATCCTTGAAGTGGTTAC-T-TTT--TCCAT--TTGTTTACT----CTGTTAAATCGACAGAACTCGTTTACCTGTCGCTTTTATATGTTTATAGC---CTTACAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-C--------TCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CG----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCCTTAAAACAAACTTGCGGTGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGgttcaaaatgattgttttgtctcttaataacattttacactaaactctgttggtacatattcataaaataaacgtacaaagcaaactcattgttgtttccttaaaacaaacttgcggtgccattgatgccttgcatcaatctttgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctccgttcgataaatatttctgtaataaagttagctttggaaatgccttttaatatttgtttatcttgttatttgtgtttgagaaaaggtatcaacaatcacacaatccttgaagtggttactttttccatttgtttactctgttaaatcgacagaactcgtttacctgtcgcttttatatgtttaAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGATCAATGAAACCATGTTCAATGTTGGTTTAGTCTGTGATTTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATGTCATCAATTGCACAAGTGACAAAAAAAATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCGTTTGTCATTCATGCAACCGTTTCTTTTATATCTAGATCAGGTTAAAATTCGCTGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAAATGGGCTTCGGAAGTGCCTTGTTATGTGTGTTCA---ACTTGTTCTTCGTGTTTGAG-AA-AA---TGTGTCAAA----ACACAGTCCTTGAAGTGGTGAC-tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---AT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATTATTATATATTCAT-AAAA-AAA-CA----TGCAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAACCAAGCTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgcaaagcaaactcattgttgtttctttaaaccaagcttgcggcgccattgatgccttgcatcaatctttgtcttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attttcgatgttggtttcgtctgatgtactcacatccaattattaAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGCCATTCTCTGTTGGTATATAGTCAT-AAAATAAA-CA----TAGAA--CAAACGCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGTTGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtcttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGATAACATTTTACACT-----AATATAAA-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----AACAAAACAAGCTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATTAATCATTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAGTGAAAGTTCACATGCAATGAAGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---ATt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAATCA----TACAAAGCAATCTCATTGTTGTTTCTTGAAAACAAACTTGTGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AACATTAA-CA----TACAAAGCAAAAGC-TTGTTGTATCTTTAAAACAAGCTTACGGTGCCATTGAT-CCCTGCATt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACACGTGAAAGTTCACATGAAACAATGAATAGGATGACTAATGAAACCATTTCCGTTGTTGGTTTCGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAAAC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCAGT--TTTTATACCAAGGTC-------AGTTCTCTGTTCAACAAATATTTATGT--AATAAATTTGGCTTTAAAAATGCCTTATAATGTGTGTTCA---ACTTGCTATTTGTGTTTGAG-AA-TA---GGTATCAAATATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAT-G-TTT--TCAAT--GTATTTACT----ATGGTAAACCGACAGAACTCCTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TG--------ACATCTCATCTAGTTTACCCAGATCAAGGTAGTCTTAC---------ATGTTCT-AAATGATAGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCA-TCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAACCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAAAACAAATCTGCGGCGTCATTGATGCCTTGCCTCAATC-TTTGatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttgttttgttatagatttaaaatgCAAGTGAAAGTCCACATGCAGCAATGAATATGATAACTAATGAAACC-TTTTCAATGTTAGTTTAGCCTGTTATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAATTTTCATCAATTACACAAGTGACTAAAACCATGTACATGATTTTGAAAATAGTATACAGAAGAAACC-CT-------GCAGTTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATTCAGATCAGGTAAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTTATATGTGTT-A---ACTTGTTATCTGTGTTTAAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAACTCAAAAGAACTTATTTATCTTTGGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCTTACATCTCATTTATTTTACCCAGATCAAGCTAACCTTAC---------ATTTTCA-AAATGATTGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A---------------TGGTTCATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAAATTGTGGCA-CATTGATGTCTTGCATCAATC-TTTGtctttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGTAAGTTCA-------------A-ATGATGACTAATGAAACTATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAACTACACAAGTGATCAAAACCATGTACATGATTATG-------------GAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACTGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATACTTCTGT--TATAAATTTGTTTTTGGAAATGCTTTGTATTGTGTGTTCA---GCTTGTTATTGGTGTTTGAGAAA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCGTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TTTTA--TATTTTACCCTTACTAGTAAATTGAAAGAACACGTTTATCTTTCGATTTCATAT-ATT-TGGC-TTCCTGCATCTCATTTATTTTACCAAGATCAAGCTAGCCTTGCAATAATAAAATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATTACATTTTACACTAAAAAAA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCT-----------TTGCAGCGCCATTGATGCATTGCATCAATC-TTtct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaAAAAAGTGAAAGTTCACATCCAACAATGAATATGACGACTAATAAAAGCATAT-CGATGTTGGTTTAGTCTTTGATGTGCTCACATCCAAA---G---ATTTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-AA-------GCAGCGTTTGTCA-------------T--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTTTCCGTTCGAAAAATATTGCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTCGTTATTCGTATTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACA-CACACAACCCTTGA--TGGTGAC-T-TTT--TCTAA--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTTTCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTCTACCTATATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTAC-CT-----AA-----AGCGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGAAAACTC--TCTT-TTTTTTTAAAACAAACTTGCGGCGGCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGAAGCGCCATTGATGCCTTGCATCGATC-TTTGttcttttattgttgtttctttaaaacaaacttgaagcgccattgatgccttgcatcgatctttgtc
gi|8                          : caagtgaaagttcgcatgcaaaaatgcatatgatgaccacttgaactattttcgatgttggtttagtctgtaatgtactcacatccaatgatctaaatttcatcaataacacaagtgcccaaaactatgtacatgattataaaaatagtatacagaagaaaccaagcagcttttgtcattcatgtaaccggttcttatatccagatcagtttaaagttctccgttcgaccaatatttctgtaataaatttggctttggaaatgccttgtaatgtgtgatcaacttgttattcgtgtttgaaaaaaggtgtcattacacaatctttgaagtgatgactattttcttttgtttactctgatcattcgacagaacagtttatatttcgattttatatttttggttatcaaactagccttacatgttcaaaattattgttttatctcttaataacattttacactaaacggtcattatctttcttAGTGAAAGTTCACATGTTACAATGAATATGATGATTAATGAAACCATTTCCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCATATCAAACTTAGTCTATCTAAATTTCGTCAATTACACAAGTTACCAAAACTATGTACATGATTATGGAAATAGTATACGGACC---CC-CACCCCCCTGCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGTTTAAAGTTCTCTGTTCGACAAATAC------------------GCTTT----ATG-------ATGTGTATTCAAATAATTGTTATTCGTGTATGAG-AA-AA---TGTATCAAACATCAAACAATCCCTGAAGTGGTAACTT-TTT--TCTACCGTATTTTAAT----CTGGTAAATCGACATAACTCGTTTATCGTTCCATATTATAT-TTT-TGGGTTTCCTTCATCTCATCTATTTTACCTATATCAAGGTAGCCTTAC---------ATGTTTATCTAT--TTATTTATTCTCTT--TAAC-TCCTCCGGT------T-----A-CAGAGATTTTA---TGGTACATGAACAC-AATGCAAA-CATATGTACAAAGtc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGTTCGATAAATATTTCTGT--GATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCCTGTAACGTGT--TTA---ACTTATTATTCGTGTTTGAG-AT-AA---GGTGTCA----TTACAAAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTTTTTCTAT--TTTTGTACT----CTGGTCAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGGTTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTACAGCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAGTGATTGTTTTGTCTCTTGATAACGTTTTACACT-----AA-----A-AGGCCATTCTCTTTTGGTACATATTCAGAAAAATTAA-CA----TACAAAGGAAACTCAGTGTTATTTCGTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-CTTGtga
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTCTTTAACAATTATGGAACCTTTGATCAATATCTATTGCCATTATCACTTCTTTTTATTGATCAGAAACATACAAGTTCCGTTACCTTACTTTTCATAGTCAGTATCCTGTATAGCATCCTCCACATTGATGCACGGAACTTGTATGTTTCTAATCAATAAAAAGAAGTGATAATGGCAATAGATTTTGATGAAAGTTTCCAGGAAATGTAGAAAGATGTTATATTATCAAATAAAATAATTTTCAAAATATCGATA






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Reference ( family-9105 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTAGATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACCAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCACTTTCAATGTTGGTTTAGTCTG--ATGTACTCACACCCAAA---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAGTAGTATATGGAAAAAAAAACA-------GCAGCTTTTGTCATTCATCCAAGCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCAACAAATATTTCTGT--AATAAATAGGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGATAATTCGACAGAACTAGTTTATCTTTCGATTATATAT-TTT-TGGTTTACCTACATCTCATTTATTTCACCCAGATCAAGCTTGTCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACGTTTTAAACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCGGTTGGTAGATACTCAT-AAAACAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATCATTGTTTCTTTAAAACAAAATTGGGTCGCCATTGATGCCGTGCATCAATC-TTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTCCGTTCGATAAATATTTCTGT--AATAAAGTTAGCTTTGGAAATGCCTTTTAATATTTGTTTA---TCTTGTTATTTGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAACAATCACACAATCCTTGAAGTGGTTAC-T-TTT--TCCAT--TTGTTTACT----CTGTTAAATCGACAGAACTCGTTTACCTGTCGCTTTTATATGTTTATAGC---CTTACAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-C--------TCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CG----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCCTTAAAACAAACTTGCGGTGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGgttcaaaatgattgttttgtctcttaataacattttacactaaactctgttggtacatattcataaaataaacgtacaaagcaaactcattgttgtttccttaaaacaaacttgcggtgccattgatgccttgcatcaatctttgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctccgttcgataaatatttctgtaataaagttagctttggaaatgccttttaatatttgtttatcttgttatttgtgtttgagaaaaggtatcaacaatcacacaatccttgaagtggttactttttccatttgtttactctgttaaatcgacagaactcgtttacctgtcgcttttatatgtttaAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGATCAATGAAACCATGTTCAATGTTGGTTTAGTCTGTGATTTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATGTCATCAATTGCACAAGTGACAAAAAAAATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCGTTTGTCATTCATGCAACCGTTTCTTTTATATCTAGATCAGGTTAAAATTCGCTGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAAATGGGCTTCGGAAGTGCCTTGTTATGTGTGTTCA---ACTTGTTCTTCGTGTTTGAG-AA-AA---TGTGTCAAA----ACACAGTCCTTGAAGTGGTGAC-tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---AT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATTATTATATATTCAT-AAAA-AAA-CA----TGCAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAACCAAGCTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgcaaagcaaactcattgttgtttctttaaaccaagcttgcggcgccattgatgccttgcatcaatctttgtcttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attttcgatgttggtttcgtctgatgtactcacatccaattattaAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGCCATTCTCTGTTGGTATATAGTCAT-AAAATAAA-CA----TAGAA--CAAACGCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGTTGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtcttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGATAACATTTTACACT-----AATATAAA-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----AACAAAACAAGCTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATTAATCATTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAGTGAAAGTTCACATGCAATGAAGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---ATt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAATCA----TACAAAGCAATCTCATTGTTGTTTCTTGAAAACAAACTTGTGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AACATTAA-CA----TACAAAGCAAAAGC-TTGTTGTATCTTTAAAACAAGCTTACGGTGCCATTGAT-CCCTGCATt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACACGTGAAAGTTCACATGAAACAATGAATAGGATGACTAATGAAACCATTTCCGTTGTTGGTTTCGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAAAC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCAGT--TTTTATACCAAGGTC-------AGTTCTCTGTTCAACAAATATTTATGT--AATAAATTTGGCTTTAAAAATGCCTTATAATGTGTGTTCA---ACTTGCTATTTGTGTTTGAG-AA-TA---GGTATCAAATATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAT-G-TTT--TCAAT--GTATTTACT----ATGGTAAACCGACAGAACTCCTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TG--------ACATCTCATCTAGTTTACCCAGATCAAGGTAGTCTTAC---------ATGTTCT-AAATGATAGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCA-TCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAACCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAAAACAAATCTGCGGCGTCATTGATGCCTTGCCTCAATC-TTTGatctt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttgttttgttatagatttaaaatgCAAGTGAAAGTCCACATGCAGCAATGAATATGATAACTAATGAAACC-TTTTCAATGTTAGTTTAGCCTGTTATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAATTTTCATCAATTACACAAGTGACTAAAACCATGTACATGATTTTGAAAATAGTATACAGAAGAAACC-CT-------GCAGTTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATTCAGATCAGGTAAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTTATATGTGTT-A---ACTTGTTATCTGTGTTTAAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAACTCAAAAGAACTTATTTATCTTTGGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCTTACATCTCATTTATTTTACCCAGATCAAGCTAACCTTAC---------ATTTTCA-AAATGATTGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A---------------TGGTTCATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAAATTGTGGCA-CATTGATGTCTTGCATCAATC-TTTGtctttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGTAAGTTCA-------------A-ATGATGACTAATGAAACTATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAACTACACAAGTGATCAAAACCATGTACATGATTATG-------------GAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACTGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATACTTCTGT--TATAAATTTGTTTTTGGAAATGCTTTGTATTGTGTGTTCA---GCTTGTTATTGGTGTTTGAGAAA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCGTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TTTTA--TATTTTACCCTTACTAGTAAATTGAAAGAACACGTTTATCTTTCGATTTCATAT-ATT-TGGC-TTCCTGCATCTCATTTATTTTACCAAGATCAAGCTAGCCTTGCAATAATAAAATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATTACATTTTACACTAAAAAAA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCT-----------TTGCAGCGCCATTGATGCATTGCATCAATC-TTtct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaAAAAAGTGAAAGTTCACATCCAACAATGAATATGACGACTAATAAAAGCATAT-CGATGTTGGTTTAGTCTTTGATGTGCTCACATCCAAA---G---ATTTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-AA-------GCAGCGTTTGTCA-------------T--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTTTCCGTTCGAAAAATATTGCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTCGTTATTCGTATTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACA-CACACAACCCTTGA--TGGTGAC-T-TTT--TCTAA--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTTTCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTCTACCTATATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTAC-CT-----AA-----AGCGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGAAAACTC--TCTT-TTTTTTTAAAACAAACTTGCGGCGGCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
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gi|8                          : caagtgaaagttcgcatgcaaaaatgcatatgatgaccacttgaactattttcgatgttggtttagtctgtaatgtactcacatccaatgatctaaatttcatcaataacacaagtgcccaaaactatgtacatgattataaaaatagtatacagaagaaaccaagcagcttttgtcattcatgtaaccggttcttatatccagatcagtttaaagttctccgttcgaccaatatttctgtaataaatttggctttggaaatgccttgtaatgtgtgatcaacttgttattcgtgtttgaaaaaaggtgtcattacacaatctttgaagtgatgactattttcttttgtttactctgatcattcgacagaacagtttatatttcgattttatatttttggttatcaaactagccttacatgttcaaaattattgttttatctcttaataacattttacactaaacggtcattatctttcttAGTGAAAGTTCACATGTTACAATGAATATGATGATTAATGAAACCATTTCCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCATATCAAACTTAGTCTATCTAAATTTCGTCAATTACACAAGTTACCAAAACTATGTACATGATTATGGAAATAGTATACGGACC---CC-CACCCCCCTGCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGTTTAAAGTTCTCTGTTCGACAAATAC------------------GCTTT----ATG-------ATGTGTATTCAAATAATTGTTATTCGTGTATGAG-AA-AA---TGTATCAAACATCAAACAATCCCTGAAGTGGTAACTT-TTT--TCTACCGTATTTTAAT----CTGGTAAATCGACATAACTCGTTTATCGTTCCATATTATAT-TTT-TGGGTTTCCTTCATCTCATCTATTTTACCTATATCAAGGTAGCCTTAC---------ATGTTTATCTAT--TTATTTATTCTCTT--TAAC-TCCTCCGGT------T-----A-CAGAGATTTTA---TGGTACATGAACAC-AATGCAAA-CATATGTACAAAGtc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGTTCGATAAATATTTCTGT--GATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCCTGTAACGTGT--TTA---ACTTATTATTCGTGTTTGAG-AT-AA---GGTGTCA----TTACAAAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTTTTTCTAT--TTTTGTACT----CTGGTCAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGGTTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTACAGCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAGTGATTGTTTTGTCTCTTGATAACGTTTTACACT-----AA-----A-AGGCCATTCTCTTTTGGTACATATTCAGAAAAATTAA-CA----TACAAAGGAAACTCAGTGTTATTTCGTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-CTTGtga


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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTCTTTAACAATTATGGAACCTTTGATCAATATCTATTGCCATTATCACTTCTTTTTATTGATCAGAAACATACAAGTTCCGTTACCTTACTTTTCATAGTCAGTATCCTGTATAGCATCCTCCACATTGATGCACGGAACTTGTATGTTTCTAATCAATAAAAAGAAGTGATAATGGCAATAGATTTTGATGAAAGTTTCCAGGAAATGTAGAAAGATGTTATATTATCAAATAAAATAATTTTCAAAATATCGATA






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Reference ( family-9105 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTAGATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACCAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGACTAATGAAACCACTTTCAATGTTGGTTTAGTCTG--ATGTACTCACACCCAAA---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACAAGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAGTAGTATATGGAAAAAAAAACA-------GCAGCTTTTGTCATTCATCCAAGCGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCAACAAATATTTCTGT--AATAAATAGGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTTGTTATTCGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGATAATTCGACAGAACTAGTTTATCTTTCGATTATATAT-TTT-TGGTTTACCTACATCTCATTTATTTCACCCAGATCAAGCTTGTCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACGTTTTAAACT-----AA-----A-CGGTCATTCTCGGTTGGTAGATACTCAT-AAAACAAA-CA----TACAAAGCAAACTCATCATTGTTTCTTTAAAACAAAATTGGGTCGCCATTGATGCCGTGCATCAATC-TTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTCCGTTCGATAAATATTTCTGT--AATAAAGTTAGCTTTGGAAATGCCTTTTAATATTTGTTTA---TCTTGTTATTTGTGTTTGAG-AA-AA---GGTATCAACAATCACACAATCCTTGAAGTGGTTAC-T-TTT--TCCAT--TTGTTTACT----CTGTTAAATCGACAGAACTCGTTTACCTGTCGCTTTTATATGTTTATAGC---CTTACAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-C--------TCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CG----TACAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCCTTAAAACAAACTTGCGGTGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGgttcaaaatgattgttttgtctcttaataacattttacactaaactctgttggtacatattcataaaataaacgtacaaagcaaactcattgttgtttccttaaaacaaacttgcggtgccattgatgccttgcatcaatctttgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctccgttcgataaatatttctgtaataaagttagctttggaaatgccttttaatatttgtttatcttgttatttgtgtttgagaaaaggtatcaacaatcacacaatccttgaagtggttactttttccatttgtttactctgttaaatcgacagaactcgtttacctgtcgcttttatatgtttaAGTGAAAGTTCACATGCAACAATGAATATGATGATCAATGAAACCATGTTCAATGTTGGTTTAGTCTGTGATTTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATGTCATCAATTGCACAAGTGACAAAAAAAATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-CA-------GCAGCGTTTGTCATTCATGCAACCGTTTCTTTTATATCTAGATCAGGTTAAAATTCGCTGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAAATGGGCTTCGGAAGTGCCTTGTTATGTGTGTTCA---ACTTGTTCTTCGTGTTTGAG-AA-AA---TGTGTCAAA----ACACAGTCCTTGAAGTGGTGAC-tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---AT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATTATTATATATTCAT-AAAA-AAA-CA----TGCAAAGCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAACCAAGCTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgcaaagcaaactcattgttgtttctttaaaccaagcttgcggcgccattgatgccttgcatcaatctttgtcttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attttcgatgttggtttcgtctgatgtactcacatccaattattaAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGCCATTCTCTGTTGGTATATAGTCAT-AAAATAAA-CA----TAGAA--CAAACGCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGTTGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtcttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGATAACATTTTACACT-----AATATAAA-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----AACAAAACAAGCTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATTAATCATTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAGTGAAAGTTCACATGCAATGAAGAATATGATGACTAATGAAACCATTTTCGATGTTGGTTTCGTC--TGATGTACTCACATCCAAT---T---ATt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAATCA----TACAAAGCAATCTCATTGTTGTTTCTTGAAAACAAACTTGTGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTGtactattattatatattcataaaaaaacatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AACATTAA-CA----TACAAAGCAAAAGC-TTGTTGTATCTTTAAAACAAGCTTACGGTGCCATTGAT-CCCTGCATt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACACGTGAAAGTTCACATGAAACAATGAATAGGATGACTAATGAAACCATTTCCGTTGTTGGTTTCGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAAAC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCAGT--TTTTATACCAAGGTC-------AGTTCTCTGTTCAACAAATATTTATGT--AATAAATTTGGCTTTAAAAATGCCTTATAATGTGTGTTCA---ACTTGCTATTTGTGTTTGAG-AA-TA---GGTATCAAATATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAT-G-TTT--TCAAT--GTATTTACT----ATGGTAAACCGACAGAACTCCTTTATCTTTCGATTTTATAT-TTT-TG--------ACATCTCATCTAGTTTACCCAGATCAAGGTAGTCTTAC---------ATGTTCT-AAATGATAGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A-CGGTCA-TCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAACCAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttgttttgttatagatttaaaatgCAAGTGAAAGTCCACATGCAGCAATGAATATGATAACTAATGAAACC-TTTTCAATGTTAGTTTAGCCTGTTATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAATTTTCATCAATTACACAAGTGACTAAAACCATGTACATGATTTTGAAAATAGTATACAGAAGAAACC-CT-------GCAGTTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATTCAGATCAGGTAAAAGTTCTCCGTTCGACAAATATTTCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTTATATGTGTT-A---ACTTGTTATCTGTGTTTAAG-AA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TCTAT--TTTTTTACT----CTGGTAACTCAAAAGAACTTATTTATCTTTGGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCTTACATCTCATTTATTTTACCCAGATCAAGCTAACCTTAC---------ATTTTCA-AAATGATTGTTTTATCTCTTGATAACATTTTACACT-----AA-----A---------------TGGTTCATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCTTTAAAACAAAATTGTGGCA-CATTGATGTCTTGCATCAATC-TTTGtctttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACAAGTGTAAGTTCA-------------A-ATGATGACTAATGAAACTATTTTCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCACATCCAAT---G---ATCTAAATTTCATCAACTACACAAGTGATCAAAACCATGTACATGATTATG-------------GAAGAAACC-CA-------GCAGCTTTTGTCATTCATGCAACTGGT--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTCTCCGTTCGACAAATACTTCTGT--TATAAATTTGTTTTTGGAAATGCTTTGTATTGTGTGTTCA---GCTTGTTATTGGTGTTTGAGAAA-AA---GGTATCAAACATCACACAATCGTTGAAGTGGTGAC-T-TTT--TTTTA--TATTTTACCCTTACTAGTAAATTGAAAGAACACGTTTATCTTTCGATTTCATAT-ATT-TGGC-TTCCTGCATCTCATTTATTTTACCAAGATCAAGCTAGCCTTGCAATAATAAAATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTGATTACATTTTACACTAAAAAAA-----A-CGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGTAAACTCATTGTTGTTTCT-----------TTGCAGCGCCATTGATGCATTGCATCAATC-TTtct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaAAAAAGTGAAAGTTCACATCCAACAATGAATATGACGACTAATAAAAGCATAT-CGATGTTGGTTTAGTCTTTGATGTGCTCACATCCAAA---G---ATTTAAATTTCATCAATTACACACGTGACCAAAACCATGTACATGATTATGAAAATAGTATACGGAAGAAACC-AA-------GCAGCGTTTGTCA-------------T--TTTTATATCCAGATCAGGTTAAAGTTTTCCGTTCGAAAAATATTGCTGT--AATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCTTGTAATGTGTGTTCA---ACTCGTTATTCGTATTTGAG-AA-AA---GGTATCAAACA-CACACAACCCTTGA--TGGTGAC-T-TTT--TCTAA--TTTTTTACT----CTGGTAAATCGACAGAACTCGTTTTTCTTTCGATTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTCTACCTATATCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAATGATTGTTTTGTCTCTTAATAACATTTTAC-CT-----AA-----AGCGGTCATTCTCTGTTGGTACATATTCAT-AAAATAAA-CA----TACAAAGAAAACTC--TCTT-TTTTTTTAAAACAAACTTGCGGCGGCATTGATGCCTTGCATCAATC-TTTG
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gi|8                          : caagtgaaagttcgcatgcaaaaatgcatatgatgaccacttgaactattttcgatgttggtttagtctgtaatgtactcacatccaatgatctaaatttcatcaataacacaagtgcccaaaactatgtacatgattataaaaatagtatacagaagaaaccaagcagcttttgtcattcatgtaaccggttcttatatccagatcagtttaaagttctccgttcgaccaatatttctgtaataaatttggctttggaaatgccttgtaatgtgtgatcaacttgttattcgtgtttgaaaaaaggtgtcattacacaatctttgaagtgatgactattttcttttgtttactctgatcattcgacagaacagtttatatttcgattttatatttttggttatcaaactagccttacatgttcaaaattattgttttatctcttaataacattttacactaaacggtcattatctttcttAGTGAAAGTTCACATGTTACAATGAATATGATGATTAATGAAACCATTTCCGATGTTGGTTTAGTCTGTGATGTACTCATATCAAACTTAGTCTATCTAAATTTCGTCAATTACACAAGTTACCAAAACTATGTACATGATTATGGAAATAGTATACGGACC---CC-CACCCCCCTGCAGCTTTTGTCATTCATGCAACCGGT--TTTTATATCCAGATCAGTTTAAAGTTCTCTGTTCGACAAATAC------------------GCTTT----ATG-------ATGTGTATTCAAATAATTGTTATTCGTGTATGAG-AA-AA---TGTATCAAACATCAAACAATCCCTGAAGTGGTAACTT-TTT--TCTACCGTATTTTAAT----CTGGTAAATCGACATAACTCGTTTATCGTTCCATATTATAT-TTT-TGGGTTTCCTTCATCTCATCTATTTTACCTATATCAAGGTAGCCTTAC---------ATGTTTATCTAT--TTATTTATTCTCTT--TAAC-TCCTCCGGT------T-----A-CAGAGATTTTA---TGGTACATGAACAC-AATGCAAA-CATATGTACAAAGtc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGTTCGATAAATATTTCTGT--GATAAATTTGGCTTTGGAAATGCCCTGTAACGTGT--TTA---ACTTATTATTCGTGTTTGAG-AT-AA---GGTGTCA----TTACAAAATCCTTGAAGTGGTGAC-T-TTTTTTCTAT--TTTTGTACT----CTGGTCAATCGACAGAACTCGTTTATCTTTCGGTTTTATAT-TTT-TGGCTTTCCTACATCTCATTTATTTTACCTACAGCAAGCTAGCCTTAC---------ATGTTCA-AAGTGATTGTTTTGTCTCTTGATAACGTTTTACACT-----AA-----A-AGGCCATTCTCTTTTGGTACATATTCAGAAAAATTAA-CA----TACAAAGGAAACTCAGTGTTATTTCGTTAAAACAAACTTGCGGCGCCATTGATGCCTTGCATCAATC-CTTGtga
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTCTTTAACAATTATGGAACCTTTGATCAATATCTATTGCCATTATCACTTCTTTTTATTGATCAGAAACATACAAGTTCCGTTACCTTACTTTTCATAGTCAGTATCCTGTATAGCATCCTCCACATTGATGCACGGAACTTGTATGTTTCTAATCAATAAAAAGAAGTGATAATGGCAATAGATTTTGATGAAAGTTTCCAGGAAATGTAGAAAGATGTTATATTATCAAATAAAATAATTTTCAAAATATCGATA