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lowQualScore : . .. .. ....... . . . . ........ . ..... .... . . . .. . ... . . ................................................... . . . . ..... . . .... . . .. .................................... ....... . ... . ... . .... . . . . .... . .......... . ............... . .. ..... . ........ .... .... ...... . ... . . . . .. . .. . . . . . ......................... .............................. . .. . . . . .. ........ .. . . . . . . ....... . . . .. .. ........ . . ... .. . . . ............. . . . . . .. . ......... .... . ........................................ . . .... . .... . .
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consensus : CCCAGAGATAG-GG--GGT--GTTTATTT----ACTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGC----TGAGTCCGAAAATCCATTTCTTACTA-ACCG-CT-G-TT-GGGGCGTTTGGTCAC-AAATNCAAGNTGGCNNCCAAAATNGCCGCCAAANATTGAAATTCNNGTT-ATAATATATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACAT----GT-TTNAGG--G-----NA------AA------T------N-------AAT------ATGGTTG---ATTCATGT---A-AAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG----AA-AAAA-TTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC-----------ATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTATTTAT-----AAATGCT-T--------GTTTCTAG----AGGT----AAAA------TGT---ATGCTGAGTC-CGAAA-ATCC-ATTTCTTACTA--A-CGGCTGTT-GGGGCGTTTGGTCACAAAT------------C------------CAAGATG------------G---C------------CGC--CAAA-TA-TTGAAATT-CATGTT-ATAATTATT-ATAAA-TCT-GATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-------TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGG-TAAAA-NAGAGTA-A-AACG-T--G-GTTGATTCATGT--A-A-AA--A--GTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG--AA-AAAA-TGACACT-TTTTTCTGCAAATA---TACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATT----T---T--TA--TA--------TAAA-NGT--T--CCGTTTTTAGAGGTANAATTTAAAATGTTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
Reference ( gi|2 ) : CCCAGAGATAGCGG--GGT--GTTTATTT----AGTTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGC----TTAGTCCGAAAATCTATTTCTTACTA-ATCG-CT-G-TT-GGGGCGTTTGGTCAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATAATATATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTGTGACAT----GT-TTAAGG--G-----GA------AA------T------T-------AAT------ATGATTG---ATTCAAGT---A-AAAACAA-TCTAAATAAGGCACAAAATGGCTGCCGAAATATG----AA-AACA-TTACACTTTTTTCTGCAAATATACTTAAAATATA---ATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTCATCTTTATTTAT-----AAATGCT-T--------GTTTCTAG----AGGT----AAAA------TGT---ATACTGAGTC-CGAAA-ATCT-ATTTCTTACTA--A-CGGCTGAT-GGAGCATTTGGTCTCAAAT------------C------------CAAGATA------------G---C------------CAC--CAAA-TA-TTGAAATT-CATGTT-ATAATTATT-ATAAAGTCT-GATAG-AAAACACTGTAAAGTGTGAAAAATTAG-ATT-------TATTGCGTTGTTATAAGTTGTATGACATAATTTAGGA-TAAAG-CAGAATA-A-AATG-T--G-GTTAATTCAAGT--A-A-AA--G--GTCTAAATAAGGGTCAAAATGGCCACCAAATTATG--AA-AAAA-TGACACT-TTTTTCTGCAAATT---TACTCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATT----T---T--TA--TA--------TGAA-AGT--T--CCATTTTTA-AGGTATAATTTAAAA----TAATAC-AACT-GAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|3 : CCCAGAGATAGCGG--GGT--GTTTATTT----ACGTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGC----TTAGTCCGAAAATCCATTTCTTACTA-ATCG-CT-G-TT-GGGGCGTTTGGTCAC-
gi|1 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaaattataccttaaaaatggaactttcatataaaataaggccagaacattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaaattgtcatttttttcataatttggtggccattttgcccttatttagaccttttacttgaattaaccacattttattctgctttatcctaaattatgtcatacaacttataacaacgcaataaatctaatttttcacactttacagtgttttctatcagactttataataattataacatgaatttcaatatttggtggctatcttggatttatgaccaaatgctccatcagtcgttagtaagaaatagattttcggactcagtatacattttacctctagaaacaagcctttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgttttcatatttcggcagccattttgtgccttatttagattgttttagatttCCCAGAGATAG-GG--GTT--GTTTATTT----ACTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------ATATATTTT----TTACGC----TGAGTTCGAAAATCCATTT-TTACTT-ACCG-CT-G-TT-GGGCCGGTTAGTCACAAAACAAAGATGGCCACCAAAAATGGCGACCAAATATTGAAATTCATGTT-ATAATATATAAACTGATAG-AAAATACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTATTGTTGTAAGTTGTAAGACCT----GT-TTTAGG--G-----TAAAAACGAA------TAA----A-------AAT------ATGGTTG---ATTCAAGT---A-AAAAGAAGTATAAATAAGGGACAAAATGGCTTCCAAAATATac
gi|6 : CCTAAGGATAGGGG--GGT--GTTTATTT----A-CTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGAAAATG----TTATAC----TGAGTCCGAAAATCCATTTCTTACTA-A-CGTCT-A-TT-GGGGCGTTTGGTCAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCTG--------------CAAAGTGTTATCATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGAAATGTGTATGACAT----GT-TTAACA--GCAAAAAA------AA------G------TACA----AAT------ATGGTTG---ATTCGTGT---A-CAAAAAG-TCTAAATAAGGGACACAATGGCCGCTATAATAAG----AATAAAA-T--GACTTTTTTCTTTAAAT-------AAATGCA---G-TTTGTTGAATGCTTTAACCTCATCTTAATTTAT-----AAATGGT-T--------atatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
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gi|14 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaa-ATAGTATATAATCTGACTG-AAAACAGTGCAAAGTTTTTAAATTTAGAATTCCATGTATATTATTTTTGTAAGTTGT---ACAT----AT-TTCAGG--G-----ttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgttttcatatttcggcagccattttgtgccttatttagattgttttagatttgtgaccaaacgccccaacagcgattagtaagaaatggattttcggactaagcataaaatttacttctagaaacaagtctcaaacattttgaacataaaacgtaaataaacaccccgctatctctgggac
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gi|7 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggttacaagtccaTATGTTGTTGCAAG--------CAT----GT-TTTAGA--G-----CA------AAAACAA-G------T-------AAA------AAGATTGTTGATTCA--T---ATAAAACAAGTCTAAACAGATGATAATATGGACGCCAAAATAAG----AA-AAAAATGATAGTTTTT-CTGCA----T-TTTG---TATACGGATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTCTTATTTAT-----AGATGTT-T--------ATgggctgccaaaatatgacaaaaat
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gi|1 : tatactcaaataatactagaataaaggggatttcaatgttcgagcgccatATATTTATTTAT-----AAATGCA-T--------GTTTCTGG----TTGT----AAAA------TGT---ATGATGAGTC-TAAAA-ATAT-ATTTCTTACTA--A-CGGCTGTT-GGGGCG--------CAAAT------------T------------CAAGATGACTGCTAAATG-G---C------------CAC--CAAA--A-TTGATATT-CATGTC---------T-ATAAAATCT-AATAG-AAAACACTACAAAGTATTACAATTTAG-ATT-------TTTTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGCCATGTGTTATGG-TAAAA-TA-AGTA-ATAATA-T--G-GTTGATTCATGTACA-A-AA--A--ATCTACATTTGGGACAAAATTGCCACCAAA--ATA--AG-AAAG-T---ATTGTTTTTCTGCAAATA---TACGCATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATT----T---A--TATTTA--------TAAATGGT--T--C-----TGA-AAAT---ACTGAAAATGTTTAATACAAACTGGAATATtttggttc
gi|7 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatTTTTTATGTCT-----AAACGGT-TTGGAGTATGTTTCTAAGAGTAGGT----TATA------TTT---ATGCTGAATT-CGAAA-ATCC-ATTTCTTACTA--G-CGGCTACT-GGGGTGTTAAGTCACAAAT------------C------------CAAGATT------------G---C------------CAC--CAAA-ctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
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gi|15 : tatGCT-T--------GTTTCTAG----GGTT----AACA------TTG---ATGCTGAGTC-CGAAA-ATTC-ATTTCTTACTA--A-CAGCTGTC-GGGGCATTTTGTCGCAAAT------------T------------CAAGATG------------G---C------------CGC--CAAA-acatttcggacataaaacgtaaataaacaccccctatctctgga
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gi|11 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagAAGTCCAGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTA--ATT-------T-TT---TTGT-----GTTGTATGACATGTTTTAGGG-TAAA--------A-A-AATG-T--G-ATT
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Alignments
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consensus : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAAT-----CCAAGAT------GGCCGCC-AAAATGGCCGC-C-AAA-TATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACAT----GTTTNAGGGTA------AAAA------T--NAATA------TGGTTGATTCANGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAANAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGTAC-A-AA--AGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-AAAAAA-T-GACANTTTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTA--T--ATAAANGTT-------------CCATTTTTA-AGG--TATA-ATTTGAAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
Reference ( family-7040 ) : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACCGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAAT-----NCAAGNT------GGCNNCC-AAAATNGCCGC-C-AAA-NATTGAAATT-CNNGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACAT----GTTTNAGGGNA------AA--------T--NAATA------TGGTTGATTCATGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCCATTTCTTACTAACGGCTGTTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATGGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAGATTTATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAANAGAGTAA-AA-CG-TGGTTGATTCATGTA--A-AA--AGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG--AAAAAA-T-GACACTTTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTA--T--ATAAANGTT-------------CCGTTTTTAGAGG--TANA-ATTTAAAA----TGTTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
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gi|17 : ctCCCAGAGATAGCGG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-GTTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGCTTAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--ATCGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCA
gi|18 : CCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCGAAATGTTTTATACT-TGTTTCTAGAGGTAAAGGTAAATT----TTACGCTTAGTTCAAAGATCC-ATTTCTTACTA--ACCGCC--TT-GGGGCGTTactat
gi|19 : tatAA-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTT--ATGTTCAAAGGGTTTGAGTCT-TGTTTCTAA------AGGTAAAAT----GTATGCTGAGTGCGAAAATCC-ATTTCTTTCTA--ACAGACG-TTGGGGGCGTTTa
gi|2 : CCCAGAGATAGCGG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-GTTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGCTTAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--ATCGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACNNNN-----NNNNNNN------NNNNNNN-NNNNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNNNNN-NNNNNN---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTGTGACAT----GTTTAAGGGGA------AA--------T--TAATA------TGATTGATTCAAGT---AAAAACAA-TCTAAATAAGGCACAAAATGGCTGCCGAAATATGA-A-AACATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTTAAAATATAA--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTCATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATACTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCTGATGGAGCATTTGGTCTC-AAATCCAAGATAGCCACCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AAGTCT-GATAGAAAACACTGTAAAGTGTGAAAAATTAGATTTATTGCGTTGTTATAAGTTGTATGACATAATTTAGGATAAAGCAGAATAA-AA-TG-TGGTTAATTCAAGTA--A-AA--GGTCTAAATAAGGGTCAAAATGGCCACCAAATTATG--AAAAAA-T-GACACTTTTTTCTGCAA---ATTTACTCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTA--T--ATGAAAGTT-------------CCATTTTTA-AGG--TATA-ATTTAAAA--------TAATAC-AACT-GAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATAta
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gi|4 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaaattataccttaaaaatggaactttcatataaaataaggccagaacattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaaattgtcatttttttcataatttggtggccattttgcccttatttagaccttttacttgaattaaccacattttattctgctttatcctaaattatgtcatacaacttataacaacgcaataaatctaatttttcacactttacagtgttttctatcagactttataataattataacatgaatttcaatatttggtggctatcttggatttatgaccaaatgctccatcagtcgttagtaagaaatagattttcggactcagtatacattttacctctagaaacaagcctttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgtAGAGATAG-GGAG-----G-T-GTTAA-TCT----A-TTTTTA-ATGTCCCAAAGGTTTGTGACT-TGGTTCTAG------AGGAAAATT----T-ATGCCGAGTTCGAAAATCT-ATTTCCTACTG--GCGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAAT-----ACAAGAT------GGCCGCC-AAAATGGCCGC-C-AAA-TATTGAAATTATATTTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAA-TTTAG-ATT-----TATTGTGCTGTTGTTAGTTGTATGACAT----GTTTTAGAGTA------AAAGAGAG--T--AAACA------TGGTTGATTCATGT-------------CTAAATAATGGACCAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-ATAATGGCACTTTTT-CTGAAAATATACGC--------A--------TTTTGTTAAATGCTTTGGTCTTATTGAAATTTATATATAATTGTTTCCAGATAAAAAATGTATGGTGAATA-TGAAAGTCTATTTCTTACTAACGGTCATTGGGGTGTTTGGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNN-NATATTCAT-----AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAAGTCAGATTTATTGTGTTGCTGTTAGTTGCACGACATac
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gi|7 : agagctaggggtgggtatgtttatttgctttttatgtctaaacggtttggagtatgtttctaagagtaggttatatttatgctgaattcgaaaatccatttcttactagcggctactggggtgttaagtcacaaatccaagattgccacTATGTTGTTGCAAG--------CATGTTTTAGAGCAAAAACAAGTAA-AA-AGATTGTTGATTCATATA--A-AACAAGTCTAAACAGATGATAATATGGACGCCAAAATAAG--AAAAAAAT-GATAGTTTTT-CTGCATTTTGTATACGGATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTCTTATTT--ATAGATGTT-------------ttgttgcaagcatgttttagagcaaaaacaagtaaaaagattgttgattcatataaaacaagtctaaacagatgataatatggacgccaaaataagaaaaaaatgatagtttttctgcattttgtatacggattttgttgaatgctttgaccttattcttatttatagatgtttatataacgatgaagtaagagtaaggat
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Alignments
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Reference ( family-7040 ) : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTNAGGGTAAAA------A----T------NAAT------ATGGTTGATTCANGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAANAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGTAC-A-A-AAGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG-AAAAAAATGACANTTTTTTCTGCA---AATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTA--TATAAANGTT-------------CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|1 : CCCAGAGATAG-GG-G-----T-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------ATATATTTT----TTACGCTGAGTTCGAAAATCC-ATTT-TTACTT--ACCGCTG-TT-GGGCCGGTTAGTCACAAAACAAAGATGGCC--------AC-CAAAAATGGCGAC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAAACTGATAG-AAAATACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTATTGTTGTAAGTTGTAAGACCTGTTTTAGGGTAAAA------A----CGAATAAAAAT------ATGGTTGATTCAAGT---AAAAAGAAGTATAAATAAGGGACAAAATGGCTTCCAAAATAT
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gi|1 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaataTATATAA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAA-------------------------AAAGAGTAA-AAACA-CGGTTGATTCGTGTAC-ATA-AAGTCTAAATAACGGACGAAATAGCCGCCAAAATATGAAAAAAAACGATAC-TTTTTCTGCA---AATAAACACAT------------TTTGGCTTTATTTTTA--TA-AATGGTTCTGAGAATACTGACCATGTTTAAGGATTATTCTTTG-TTACTTCTACTTAATACAAACTGGAATA-GTTctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|10 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacAGAGATAG-GG-G-------T-GATTA-TTT----A-CCGTTT-ATGTCCAAAAGGTTTAAGACT-TGTTTCTGG------AGGTAAATT----TTATGCTAAGTCCAAAAATCT-ATTTCTTACTA--ACGGCTGTTT-GGGGCGTTTTTTCACAAATCTATGATTGCC--------GC-C-AAAATGGTCGT-C-AAA-TAATGGAAATA-CGTGAT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAATTGTTAAAATTTAA-ATT-----AATTGTGTTCTAATAAGTTATATGACA---TTCAAGGTAAAA------A----
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gi|11 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggGGCTGCCAAAATATGACA-AAAATgggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|12 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggttacaagtccagatagaaaacactgcaaagtgttaaaatttaatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggTTTAGTTT----ATCTTTTT-ATGTCAAAAACGTTTCAGACG-TGTTTCTAG------AGGTAAGAG----ATATGCCATATT-----ATCCCATCCCTTATTATAACGGTGG-TT-GGGACATTTTATCACAAATTCAAGATGGCC--------AC-C-AAAATGG-CGCTC-GAA-C-ATTGAAATC-CCCTTT---ATTCTAGTATTATTTGA
gi|13 : tatacAGGGTAAAA------AG---T------TAGT------AT---TGATTCAAGT---AAAAACAA-TATAAATGATGCACATAATGGCTGCCAAAATATGA-A-AAAAATACACTTTT-TCTGCAAATATATTC--------A--------TTTTGTTGTATGTTTTGGACTTATTTGCATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCacttctttggttc
gi|14 : tTGGTC--------GC-C-AAAATGGATGC---AAG-T-AT----ATT-CATGTT---ATAGTA-TATAATCTGACTG-AAAACAGTGCAAAGTTTTTAAATTTAGAATTCCATGTATATTATTTTTGTAAGTTGT---ACATATTTCAGGGT
gi|14 : TGTTTCTAGAAATAAAATGT---CTG-GTCGCCAAAATgacattttatttctagaaacagcctt
gi|15 : accctgaaatatgtacaacttacaaaaataatatacatggaattctaaatttaaaaactttgcactgttttcagtcagattatatactataacatgaatatacttgcatccAGAGATAGCGA-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGGCT-TGTTTCTAG------GGTTAACAT----TGATGCTGAGTCCGAAAATTC-ATTTCTTACTA--ACAGCTG-TC-GGGGCATTTTGTCGCAAATTCAAGATGGCC--------GC-C-AAAGTGgcctt
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Alignments
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Reference ( family-7040 ) : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTNAGGGTAAAA------A----T------NAAT------ATGGTTGATTCANGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAANAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGTAC-A-A-AAGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG-AAAAAAATGACANTTTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTAT------TTAT--AAANGTT--CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|1 : CCCAGAGATAG-GG-G-----T-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------ATATATTTT----TTACGCTGAGTTCGAAAATCC-ATTT-TTACTT--ACCGCTG-TT-GGGCCGGTTAGTCACAAAACAAAGATGGCC--------AC-CAAAAATGGCGAC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAAACTGATAG-AAAATACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTATTGTTGTAAGTTGTAAGACCTGTTTTAGGGTAAAA------A----CGAATAAAAAT------ATGGTTGATTCAAGT---AAAAAGAAGTATAAATAAGGGACAAAATGGCTTCCAAAATAT
gi|1 : TATATTTATTTATAAATGCATGTTTCTGGTTGTAAAATGTATGATGAGTC-TAAAAATATATTTCTTACTAACGGCTGTTGGGGCG--------C-AAATTCAAGATGACTGCTAAATGGCCACCAAAATTGATATTCATGTCTATAA---------AA-TCT-AATAGAAAACACTACAAAGTATTACAATTTAGATTTTTTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGCCATGTGTTATGGTAAAATA-AGTAATAA-TA-TGGTTGATTCATGTACAA-A-AAATCTACATTTGGGACAAAATTGCCACCAAAATAAG-AAAGTATTG-----TTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTTATAT------TTAT--AAATG------GTTCTGAAAA--TA----CTGAAAA----TGTTTAATACAAACTGGAATATatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|1 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaataTATATAA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAA-------------------------AAAGAGTAA-AAACA-CGGTTGATTCGTGTAC-ATA-AAGTCTAAATAACGGACGAAATAGCCGCCAAAATATGAAAAAAAACGATAC-TTTTTCTGCAA---ATAAACACAT------------TTTGGCTTTATTTTTATAAATGGTTCTGAGAATACTGACCATGTTTAAGGATTATTCTTTG-TTACTTCTACTTAATACAAACTGGAATA-GTTctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|10 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacAGAGATAG-GG-G-------T-GATTA-TTT----A-CCGTTT-ATGTCCAAAAGGTTTAAGACT-TGTTTCTGG------AGGTAAATT----TTATGCTAAGTCCAAAAATCT-ATTTCTTACTA--ACGGCTGTTT-GGGGCGTTTTTTCACAAATCTATGATTGCC--------GC-C-AAAATGGTCGT-C-AAA-TAATGGAAATA-CGTGAT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAATTGTTAAAATTTAA-ATT-----AATTGTGTTCTAATAAGTTATATGACA---TTCAAGGTAAAA------A----
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gi|11 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggGGCTGCCAAAATATGACA-AAAATgggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|12 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggttacaagtccagatagaaaacactgcaaagtgttaaaatttaatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggTTTAGTTT----ATCTTTTT-ATGTCAAAAACGTTTCAGACG-TGTTTCTAG------AGGTAAGAG----ATATGCCATATT-----ATCCCATCCCTTATTATAACGGTGG-TT-GGGACATTTTATCACAAATTCAAGATGGCC--------AC-C-AAAATGG-CGCTC-GAA-C-ATTGAAATC-CCCTTT---ATTCTAGTATTATTTGA
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gi|14 : tTGGTC--------GC-C-AAAATGGATGC---AAG-T-AT----ATT-CATGTT---ATAGTA-TATAATCTGACTG-AAAACAGTGCAAAGTTTTTAAATTTAGAATTCCATGTATATTATTTTTGTAAGTTGT---ACATATTTCAGGGT
gi|14 : TGTTTCTAGAAATAAAATGT---CTG-GTCGCCAAAATgacattttatttctagaaacagcctt
gi|15 : accctgaaatatgtacaacttacaaaaataatatacatggaattctaaatttaaaaactttgcactgttttcagtcagattatatactataacatgaatatacttgcatccAGAGATAGCGA-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGGCT-TGTTTCTAG------GGTTAACAT----TGATGCTGAGTCCGAAAATTC-ATTTCTTACTA--ACAGCTG-TC-GGGGCATTTTGTCGCAAATTCAAGATGGCC--------GC-C-AAAGTGgcctt
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gi|4 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaaattataccttaaaaatggaactttcatataaaataaggccagaacattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaaattgtcatttttttcataatttggtggccattttgcccttatttagaccttttacttgaattaaccacattttattctgctttatcctaaattatgtcatacaacttataacaacgcaataaatctaatttttcacactttacagtgttttctatcagactttataataattataacatgaatttcaatatttggtggctatcttggatttatgaccaaatgctccatcagtcgttagtaagaaatagattttcggactcagtatacattttacctctagaaacaagcctttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgtAGAGATAG-GGAG-----G-T-GTTAA-TCT----A-TTTTTA-ATGTCCCAAAGGTTTGTGACT-TGGTTCTAG------AGGAAAATT----T-ATGCCGAGTTCGAAAATCT-ATTTCCTACTG--GCGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATACAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATTATATTTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAA-TTTAG-ATT-----TATTGTGCTGTTGTTAGTTGTATGACATGTTTTAGAGTAAAA------GAGAGT------AAAC------ATGGTTGATTCATGT-------------CTAAATAATGGACCAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-ATAATGGCACTTTTT-CTGAAAATATACGC--------A--------TTTTGTTAAATGCTTTGGTCTTATTGAAATTTATATATAATTGTTTCCAGATAAAAAATGTATGGTGAATA-TGAAAGTCTATTTCTTACTAACGGTCATTGGGGTGTTTGGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNN-NATATTCAT-----AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAAGTCAGATTTATTGTGTTGCTGTTAGTTGCACGACATac
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gi|7 : ttaaacatgttcagtatttagAGAGCTAG-GG-GTGGGTA-T-GTTTA-TTT----G-CTTTTT-ATGTCTAAACGGTTTG-GAGTATGTTTCTAA------GAGTAGGTTATATTTATGCTGAATTCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--GCGGCTA-CT-GGGGTGTTAAGTCACAAATCCAAGATTGCC--------AC-C-AAAATGGTCGC-C-AAAGT-AT
gi|7 : GTTGTTGCAAG--------CATGTTTTAGAGCAAAAACAAGTAA-AA-AGATTGTTGATTCATATAA-A-ACAAGTCTAAACAGATGATAATATGGACGCCAAAATAAG-AAAAAAATGATAGTTTTT-CTGCATTTTGTATACGGATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTCTTAT------TTAT--AGATGTT--gttgttgcaagcatgttttagagcaaaaacaagtaaaaagattgttgattcatataaaacaagtctaaacagatgataatatggacgccaaaataagaaaaaaatgatagtttttctgcattttgtatacggattttgttgaatgctttgaccttattcttatttatagatgtttatataacgatgaagtaagagtaaggat
gi|8 : agagctaggggtgggtatgtttatttgctttttatgtctaaacggtttggagtatgtttctaagagtaggttatatttatgctgaattcgaaaatccatttcttactagcggctactggggtgttaagtcacaaatccaagattgccaccaaaatggtcgccaaagtatCCTAGA-ATAG-GG-A-----G-T-GTTTA-TAT----A-CTTTTTTACATCCAAAATGTTTGAGATT-TGTTTCTAG------AGATAAATT----TTATGCCGAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--AC----------GGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCT--------TG-C-AAAGTTGTCGC-C-TAA-T-ATCGAAATT-CACATT---TTAATA-TATAATCTGATAGAAAAACACTAC--------AAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTTAGTCGTATAATATtatataacgatgaagtaagagtaaggat
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Alignments
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lowQualScore : . . ..... . . . .... . . . ...... .... . .. . . . . . ........ . . . . ... . . . . ... . . . ..... . ............................ . ... . ... . . . . . ................. . . . . . . . . . . . .......... . .. ..... . . . . . . . .... . . . . .. . . . . . .. .. .. . ... . . . ........ .. . . .. .. ... . ........ . . .
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Reference ( family-7040 ) : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTNAGGGTAAAA------A----T------NAAT------ATGGTTGATTCANGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAANAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGTAC-A-A-AAGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG-AAAAAAATGACANTTTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTAT------TTAT--GAATGTT--CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|1 : CCCAGAGATAG-GG-G-----T-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------ATATATTTT----TTACGCTGAGTTCGAAAATCC-ATTT-TTACTT--ACCGCTG-TT-GGGCCGGTTAGTCACAAAACAAAGATGGCC--------AC-CAAAAATGGCGAC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAAACTGATAG-AAAATACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTATTGTTGTAAGTTGTAAGACCTGTTTTAGGGTAAAA------A----CGAATAAAAAT------ATGGTTGATTCAAGT---AAAAAGAAGTATAAATAAGGGACAAAATGGCTTCCAAAATAT
gi|1 : TATATTTATTTATAAATGCATGTTTCTGGTTGTAAAATGTATGATGAGTC-TAAAAATATATTTCTTACTAACGGCTGTTGGGGCG--------C-AAATTCAAGATGACTGCTAAATGGCCACCAAAATTGATATTCATGTCTATAA---------AA-TCT-AATAGAAAACACTACAAAGTATTACAATTTAGATTTTTTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGCCATGTGTTATGGTAAAATA-AGTAATAA-TA-TGGTTGATTCATGTACAA-A-AAATCTACATTTGGGACAAAATTGCCACCAAAATAAG-AAAGTATTG-----TTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTTATAT------TTAT--AAATG------GTTCTGAAAA--TA----CTGAAAA----TGTTTAATACAAACTGGAATATatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|1 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaataTATATAA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAA-------------------------AAAGAGTAA-AAACA-CGGTTGATTCGTGTAC-ATA-AAGTCTAAATAACGGACGAAATAGCCGCCAAAATATGAAAAAAAACGATAC-TTTTTCTGCAA---ATAAACACAT------------TTTGGCTTTATTTTTATAAATGGTTCTGAGAATACTGACCATGTTTAAGGATTATTCTTTG-TTACTTCTACTTAATACAAACTGGAATA-GTTctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|10 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacAGAGATAG-GG-G-------T-GATTA-TTT----A-CCGTTT-ATGTCCAAAAGGTTTAAGACT-TGTTTCTGG------AGGTAAATT----TTATGCTAAGTCCAAAAATCT-ATTTCTTACTA--ACGGCTGTTT-GGGGCGTTTTTTCACAAATCTATGATTGCC--------GC-C-AAAATGGTCGT-C-AAA-TAATGGAAATA-CGTGAT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAATTGTTAAAATTTAA-ATT-----AATTGTGTTCTAATAAGTTATATGACA---TTCAAGGTAAAA------A----
gi|11 : CAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----T-CTTTTT-ATATCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----GTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--AC--C---------GCGTTTGGTTACAAGTCC-AGATAG---------------AAAAC-ACTGC-A-AAG-T-GTTAAAATT-TAagaaaaa
gi|11 : TTACA-AG-TCCAGATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTA-ATTT-TT---TTGT-----GTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAA-------AA-AA-TG-TGATTGatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|11 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggGGCTGCCAAAATATGACA-AAAATgggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|12 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggttacaagtccagatagaaaacactgcaaagtgttaaaatttaatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggTTTAGTTT----ATCTTTTT-ATGTCAAAAACGTTTCAGACG-TGTTTCTAG------AGGTAAGAG----ATATGCCATATT-----ATCCCATCCCTTATTATAACGGTGG-TT-GGGACATTTTATCACAAATTCAAGATGGCC--------AC-C-AAAATGG-CGCTC-GAA-C-ATTGAAATC-CCCTTT---ATTCTAGTATTATTTGA
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gi|14 : tTGGTC--------GC-C-AAAATGGATGC---AAG-T-AT----ATT-CATGTT---ATAGTA-TATAATCTGACTG-AAAACAGTGCAAAGTTTTTAAATTTAGAATTCCATGTATATTATTTTTGTAAGTTGT---ACATATTTCAGGGT
gi|14 : TGTTTCTAGAAATAAAATGT---CTG-GTCGCCAAAATgacattttatttctagaaacagcctt
gi|15 : accctgaaatatgtacaacttacaaaaataatatacatggaattctaaatttaaaaactttgcactgttttcagtcagattatatactataacatgaatatacttgcatccAGAGATAGCGA-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGGCT-TGTTTCTAG------GGTTAACAT----TGATGCTGAGTCCGAAAATTC-ATTTCTTACTA--ACAGCTG-TC-GGGGCATTTTGTCGCAAATTCAAGATGGCC--------GC-C-AAAGTGgcctt
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gi|4 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaaattataccttaaaaatggaactttcatataaaataaggccagaacattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaaattgtcatttttttcataatttggtggccattttgcccttatttagaccttttacttgaattaaccacattttattctgctttatcctaaattatgtcatacaacttataacaacgcaataaatctaatttttcacactttacagtgttttctatcagactttataataattataacatgaatttcaatatttggtggctatcttggatttatgaccaaatgctccatcagtcgttagtaagaaatagattttcggactcagtatacattttacctctagaaacaagcctttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgtAGAGATAG-GGAG-----G-T-GTTAA-TCT----A-TTTTTA-ATGTCCCAAAGGTTTGTGACT-TGGTTCTAG------AGGAAAATT----T-ATGCCGAGTTCGAAAATCT-ATTTCCTACTG--GCGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATACAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATTATATTTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAA-TTTAG-ATT-----TATTGTGCTGTTGTTAGTTGTATGACATGTTTTAGAGTAAAA------GAGAGT------AAAC------ATGGTTGATTCATGT-------------CTAAATAATGGACCAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-ATAATGGCACTTTTT-CTGAAAATATACGC--------A--------TTTTGTTAAATGCTTTGGTCTTATTGAAATTTATATATAATTGTTTCCAGATAAAAAATGTATGGTGAATA-TGAAAGTCTATTTCTTACTAACGGTCATTGGGGTGTTTGGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNN-NATATTCAT-----AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAAGTCAGATTTATTGTGTTGCTGTTAGTTGCACGACATac
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gi|6 : CCTAAGGATAG-GG-G-----GGT-GTTTA-TTT----A-CTTTT--ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGAAAATG----TTATACTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGTCTA-TT-GGGGCGTTTGGTCACNNNNNNNNNNNNNNN--------NN-N-NNNNNNNNNNN-N-NNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNN---NNNNNN-NNNNNNCTG--------------CAAAGTGTTATCATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGAAATGTGTATGACATGTTTAACAGCAAAAAAAAGTA----C------AAAT------ATGGTTGATTCGTGT---ACAAAAAG-TCTAAATAAGGGACACAATGGCCGCTATAATAAGA-ATAAAAT--GACTTTTTTCTTTAAATAAATGC--------A--------GTTTGTTGAATGCTTTAACCTCATCTTAATTTATAAATGGTTc
gi|7 : ttaaacatgttcagtatttagAGAGCTAG-GG-GTGGGTA-T-GTTTA-TTT----G-CTTTTT-ATGTCTAAACGGTTTG-GAGTATGTTTCTAA------GAGTAGGTTATATTTATGCTGAATTCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--GCGGCTA-CT-GGGGTGTTAAGTCACAAATCCAAGATTGCC--------AC-C-AAAATGGTCGC-C-AAAGT-AT
gi|7 : GTTGTTGCAAG--------CATGTTTTAGAGCAAAAACAAGTAA-AA-AGATTGTTGATTCATATAA-A-ACAAGTCTAAACAGATGATAATATGGACGCCAAAATAAG-AAAAAAATGATAGTTTTT-CTGCATTTTGTATACGGATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTCTTAT------TTAT--AGATGTT--gttgttgcaagcatgttttagagcaaaaacaagtaaaaagattgttgattcatataaaacaagtctaaacagatgataatatggacgccaaaataagaaaaaaatgatagtttttctgcattttgtatacggattttgttgaatgctttgaccttattcttatttatagatgtttatataacgatgaagtaagagtaaggat
gi|8 : agagctaggggtgggtatgtttatttgctttttatgtctaaacggtttggagtatgtttctaagagtaggttatatttatgctgaattcgaaaatccatttcttactagcggctactggggtgttaagtcacaaatccaagattgccaccaaaatggtcgccaaagtatCCTAGA-ATAG-GG-A-----G-T-GTTTA-TAT----A-CTTTTTTACATCCAAAATGTTTGAGATT-TGTTTCTAG------AGATAAATT----TTATGCCGAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--AC----------GGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCT--------TG-C-AAAGTTGTCGC-C-TAA-T-ATCGAAATT-CACATT---TTAATA-TATAATCTGATAGAAAAACACTAC--------AAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTTAGTCGTATAATATtatataacgatgaagtaagagtaaggat
gi|9 : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-ATTTA-TTTT---C-CTTTTT-ATGTCCAAAAGAGTCGAGACC---------------------------------GTTAAGTCCGAAAATTC-ATTTCTGTCTA--ACGGCTG-TT-GAGGCGTTTTGCTACAAATTCAAGATGACC--------GC-C-AATATTGCCGC-C-AAA-T-AATGAATTT-CATGTT---ATACTA-TTTAAACTTATTC-AAAACACTACAAAGTGTTAAAATTTAG-ATG-----TATTGTGTTCTTG-A------ATGACATGTTTTAGTGTTAA-----------------------------ATGGTTGATTCATGTACAAAAAAAAA----AAATAAGGGActacgtttacgcgaaatacgaaaacattttttttaaacagtagtatattttacaacagttgtatgtttataaca
blockSeqs : C A TGGGT G T G TTTT T T A AGGTAA ATAT C TA G T G TAAATAAG A . T TC G A A TAT G A A CCATG C ATGAGTAAAACG A ACA C TA T T . T T AAAATATAA G T A T T T N . . TT TATAT G A T A T A T AAAG . A A T C T C A A T AA AT CT TTT A TAAATGGT GA T C GA AT TTC . CTTCTACT A G T
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blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A C . . . . . . . . A GAGAGTAAAC T . C TC A T . . G A . C T T A A . . . TC TATA . . A A T A A GCAG . . . A . . . A T T A AC GT . T . . A T . . TAA . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . N A . . . . . . . . T AGTTAGT T . A TG A T . . T A . TATA . . A A T A T AACA . . . T . . . . A A . AT C . G . . T T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C N . . . . . . . . A ATTAAT T . A TC C C . . . A . . . . G . . . . . . . .
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finalCons : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTNAGGGTAAAA------A----T------NAAT------ATGGTTGATTCANGT---AAAAANAATC-TAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAGNAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGTA--A-A-AAGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG-AAAAAAATGACANTTTTTTCTGCAA---ATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTAT-------TAT--GAATGTT--CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
Alignments
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lowQualScore : . . ..... . . . .... . . . ...... .... . .. . . . . . ........ . . . . ... . . . . ... . . . ..... . ............................ . ... . ... . . . . . ................. . . . . . . . . . . . .......... . .. ..... . . . . . . . .... . . . . .. . . .. . . . .. .. .. ... . . . ........... . . .. .. ... . ........ . . .
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Reference ( family-7040 ) : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----TTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTNAGGGTAAAA------A----T------NAAT------ATGGTTGATTCANGT---AAAAANAA-TCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-AAAATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTC--------A--------TTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGGCCGNTGGGGCGTTTGGTCAC-AAATCCAAGATAGCCGCCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAANTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAAGNAGAGTAA-AA-TG-TGGTTGATTCATGT--A-A-AA--AGTCTAAATAAGGGACAAAATGGCCGCCAAAATATG-AAAAAAATGACANTTTTTTCTGCA---AATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATTTTTA-T---------TATGAATGTT--CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA----TGCTTAATACAAACTGGAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|1 : CCCAGAGATAG-GG-G-----T-T-GTTTA-TTT----A-CTTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------ATATATTTT----TTACGCTGAGTTCGAAAATCC-ATTT-TTACTT--ACCGCTG-TT-GGGCCGGTTAGTCACAAAACAAAGATGGCC--------AC-CAAAAATGGCGAC-C-AAA-T-ATTGAAATT-CATGTT---ATAATA-TATAAACTGATAG-AAAATACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----TATTGTATTGTTGTAAGTTGTAAGACCTGTTTTAGGGTAAAA------A----CGAATAAAAAT------ATGGTTGATTCAAGT---AAAAAGAAGTATAAATAAGGGACAAAATGGCTTCCAAAATAT
gi|1 : TATATTTATTTATAAATGCATGTTTCTGGTTGTAAAATGTATGATGAGTC-TAAAAATATATTTCTTACTAACGGCTGTTGGGGCG--------C-AAATTCAAGATGACTGCTAAATGGCCACCAAAATTGATATTCATGTCTATAA---------AA-TCT-AATAGAAAACACTACAAAGTATTACAATTTAGATTTTTTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGCCATGTGTTATGGTAAAATA-AGTAATAA-TA-TGGTTGATTCATGTACA-A-AA--AATCTACATTTGGGACAAAATTGCCACCAAAATAAG-AAAGTATTG-----TTTTTCTGCA---AATATACGCATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTTATATT---------TATAAATG------GTTCTGAAAA--TA----CTGAAAA----TGTTTAATACAAACTGGAATATatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|1 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaataTATATAA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAGATTTATTGCGTTGTTGTAA-----------------------AA--AGAGTAA-AAACA-CGGTTGATTCGTGT--ACATAA--AGTCTAAATAACGGACGAAATAGCCGCCAAAATATGAAAAAAAACGATAC-TTTTTCTGCA---AATAAACACAT------------TTTGGCTTTATTTTTA-TAAATGGTTCTGAGAATACTGACCATGTTTAAGGATTATTCTTTG-TTACTTCTACTTAATACAAACTGGAATA-GTTctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacaactattccagtttgtattaagtagaagtaacaaagaataatccttaaacatggtcagtattctcagaaccatttataaaaataaagccaaaatgtgtttatttgcagaaaaagtatcgttttttttcatattttggcggctatttcgtccgttatttagactttatgtacacgaatcaaccgtgtttttactctttttacaacaacgcaataaatctaaattttaacactttgcagtgttttctatcagattatata
gi|10 : cccagagataggggttgtttatttactttttatgtccaaaaggtttgagacttgtttctagatatattttttacgctgagttcgaaaatccatttttacttaccgctgttgggccggttagtcacaaaacaaagatggccaccaaaaatggcgaccaaatattgaaattcatgttataatatataaactgatagaaaatactgcaaagtgttaaaatttagatttattgtattgttgtaagttgtaagacctgttttagggtaaaaacgaataaaaatatggttgattcaagtaaaaagaagtataaataagggacaaaatggcttccaaaatatatatttatttataaatgcatgtttctggttgtaaaatgtatgatgagtctaaaaatatatttcttactaacggctgttggggcgcaaattcaagatgactgctaaatggccaccaaaattgatattcatgtctataaaatctaatagaaaacactacaaagtattacaatttagattttttgtgttgttgtaagttgtatgccatgtgttatggtaaaataagtaataatatggttgattcatgtacaaaaaatctacatttgggacaaaattgccaccaaaataagaaagtattgtttttctgcaaatatacgcattttgttgaatgctttgaccttatttatatttataaatggttctgaaaatactgaaaatgtttaatacaaactggaatatctgtatcttcttcacgttatgtttctttcactataatataaacttgtttattgcattgcattgttagagagaaagaaacataacatgaagaatatacAGAGATAG-GG-G-------T-GATTA-TTT----A-CCGTTT-ATGTCCAAAAGGTTTAAGACT-TGTTTCTGG------AGGTAAATT----TTATGCTAAGTCCAAAAATCT-ATTTCTTACTA--ACGGCTGTTT-GGGGCGTTTTTTCACAAATCTATGATTGCC--------GC-C-AAAATGGTCGT-C-AAA-TAATGGAAATA-CGTGAT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGCAAATTGTTAAAATTTAA-ATT-----AATTGTGTTCTAATAAGTTATATGACA---TTCAAGGTAAAA------A----
gi|11 : CAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----T-CTTTTT-ATATCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGTAAATT----GTATGCTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--AC--C---------GCGTTTGGTTACAAGTCC-AGATAG---------------AAAAC-ACTGC-A-AAG-T-GTTAAAATT-TAagaaaaa
gi|11 : TTACA-AG-TCCAGATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTA-ATTT-TT---TTGT-----GTTGTATGACATGTTTTAGGGTAAA-------AA-AA-TG-TGATTGatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|11 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggGGCTGCCAAAATATGACA-AAAATgggctgccaaaatatgacaaaaat
gi|12 : cagagatagggggtgtttattttctttttatatccaaaaggtttgagacttgtttctagaggtaaattgtatgctgagtccgaaaatccatttcttactaaccgcgtttggttacaagtccagatagaaaacactgcaaagtgttaaaatttaatttttttgtgttgtatgacatgttttagggtaaaaaaatgtgattggTTTAGTTT----ATCTTTTT-ATGTCAAAAACGTTTCAGACG-TGTTTCTAG------AGGTAAGAG----ATATGCCATATT-----ATCCCATCCCTTATTATAACGGTGG-TT-GGGACATTTTATCACAAATTCAAGATGGCC--------AC-C-AAAATGG-CGCTC-GAA-C-ATTGAAATC-CCCTTT---ATTCTAGTATTATTTGA
gi|13 : tatacAGGGTAAAA------AG---T------TAGT------AT---TGATTCAAGT---AAAAACAA-TATAAATGATGCACATAATGGCTGCCAAAATATGA-A-AAAAATACACTTTT-TCTGCAAATATATTC--------A--------TTTTGTTGTATGTTTTGGACTTATTTGCATTTATAAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGCacttctttggttc
gi|14 : tTGGTC--------GC-C-AAAATGGATGC---AAG-T-AT----ATT-CATGTT---ATAGTA-TATAATCTGACTG-AAAACAGTGCAAAGTTTTTAAATTTAGAATTCCATGTATATTATTTTTGTAAGTTGT---ACATATTTCAGGGT
gi|14 : TGTTTCTAGAAATAAAATGT---CTG-GTCGCCAAAATgacattttatttctagaaacagcctt
gi|15 : accctgaaatatgtacaacttacaaaaataatatacatggaattctaaatttaaaaactttgcactgttttcagtcagattatatactataacatgaatatacttgcatccAGAGATAGCGA-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCAAAAGGTTTGAGGCT-TGTTTCTAG------GGTTAACAT----TGATGCTGAGTCCGAAAATTC-ATTTCTTACTA--ACAGCTG-TC-GGGGCATTTTGTCGCAAATTCAAGATGGCC--------GC-C-AAAGTGgcctt
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gi|17 : ctCCCAGAGATAGCGG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-GTTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGCTTAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--ATCGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCA
gi|18 : CCAGAGATAG-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTCCGAAATGTTTTATACT-TGTTTCTAGAGGTAAAGGTAAATT----TTACGCTTAGTTCAAAGATCC-ATTTCTTACTA--ACCGCC--TT-GGGGCGTTactat
gi|19 : tatAA-GG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CTTTT--ATGTTCAAAGGGTTTGAGTCT-TGTTTCTAA------AGGTAAAAT----GTATGCTGAGTGCGAAAATCC-ATTTCTTTCTA--ACAGACG-TTGGGGGCGTTTa
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gi|20 : -GG-G-----G-T-ATTTT-TTTTTTTA-CTTTTT-ATGTCCAAACGGTTAGAGAGT-TGTTTCTAG------AGATAAAAC----GTAGTCTAAGTCCGGAA
gi|21 : taAGAAGTAG-GT-G-----G-TTGTTTA-TAT----A-TGTTTT-GTGTCCAAAAGCTTTGAGATT-TGTTCCTAG------AG
gi|3 : tcttAAAACAA-TCTAAATAAGGCACAAAATGGCTGCCGAAATATGA-A-AACATTACACTTTTTTCTGCAAATATACTT--------AAAATATAATTTTGTTGAATGCTTTGGCCTTATCTTTATTTATAAAGGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATACTGAGTC-CGAAAATCTATTTCTTACTAACGACTGATGGAGCATTTGGTCAT-AAATCCAAGATAGCCACCAAAT----------ATTGAAATTCATGT-TATAATTATTATA-AAGTCT-GATAGAAAACACTGTAAAGTGTGAAAAATTAGATTTATTGCGTTGTTATAAGTTGTATGACATAATTTAGGATAAAGCAGAATAA-AA-TG-TGGTTAATTCAAGT--A-A-AA--GGTCTAAATAAGGG-CAAAATGGCCACCAAATTATG-AAAAAAATGACAATTTTTTCTGCA---AATATACTCATTTTGTTGAATGTTCTGGCCTTA-TTTTA-----------TATGAAAGTT--CCATTTTTAAGG--TATAATTTG-AAA--------TAATAC-AACT-GAATATGTTAAACTTAAGCTCTAGTAAACTATA
gi|3 : aCCCAGAGATAGCGG-G-----G-T-GTTTA-TTT----A-CGTTTT-ATGTTCAAAATGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AAGTAAATT----TTATGCTTAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ATCGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATCTAAAACAATCTAAATAAGGCAC-AAAATGGCTGC-CGAAA-T-A-TGAAAagatttgtgaccaaacgccccaacagcgattagtaagaaatggattttcggactaagcataaaatttacttctagaaacaagtctcaaacattttgaacataaaacgtaaataaacaccccgctatctctgggac
gi|4 : atatagtttactagagcttaagtttaacatattcagttgtattatttcaaattataccttaaaaatggaactttcatataaaataaggccagaacattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaaattgtcatttttttcataatttggtggccattttgcccttatttagaccttttacttgaattaaccacattttattctgctttatcctaaattatgtcatacaacttataacaacgcaataaatctaatttttcacactttacagtgttttctatcagactttataataattataacatgaatttcaatatttggtggctatcttggatttatgaccaaatgctccatcagtcgttagtaagaaatagattttcggactcagtatacattttacctctagaaacaagcctttataaataaagataaggccaaagcattcaacaaaattatattttaagtatatttgcagaaaaaagtgtaatgtAGAGATAG-GGAG-----G-T-GTTAA-TCT----A-TTTTTA-ATGTCCCAAAGGTTTGTGACT-TGGTTCTAG------AGGAAAATT----T-ATGCCGAGTTCGAAAATCT-ATTTCCTACTG--GCGGCTG-TT-GGGGCGTTTGGTCACAAATACAAGATGGCC--------GC-C-AAAATGGCCGC-C-AAA-T-ATTGAAATTATATTTT---ATAATA-TATAATCTGATAG-AAAACACTGTAAAATGTTAAA-TTTAG-ATT-----TATTGTGCTGTTGTTAGTTGTATGACATGTTTTAGAGTAAAA------GAGAGT------AAAC------ATGGTTGATTCATGT-------------CTAAATAATGGACCAAATGGCCGCCAAAATATGA-A-ATAATGGCACTTTTT-CTGAAAATATACGC--------A--------TTTTGTTAAATGCTTTGGTCTTATTGAAATTTATATATAATTGTTTCCAGATAAAAAATGTATGGTGAATA-TGAAAGTCTATTTCTTACTAACGGTCATTGGGGTGTTTGGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNN-NATATTCAT-----AA-TCT-GATAGAAAACACTGCAAAGTGTTAAAAGTCAGATTTATTGTGTTGCTGTTAGTTGCACGACATac
gi|5 : G-AG-G-----A-T-GTTAA-TT-----A-CCATTT-ATGCCCAAAAGGTTTGAGACA-TGTTTCCAG------AGGCAAATT----TTATGCTGTGTCCGATAATCC-ATTTCTTACTA--ACCGCTT-TT-GGGGTGTTTGGTCACAAATCCAAGAT-------------------------------AAA-T-ATTAAAGTT-CATATTTATACAATA-TATAATGTGATAA-AAAACACTGCAAAGTGTTAAAATTTAG-ATT-----CATTGTGTTGTTGTAAGTTGTATGACATGTTTAAGGATAAAA------A----T------GAGTAAAACGATGGTTGAGTCATGT---AAAAA-AG-TGTAAATAAGGGA------------CAAAATATGA-A-GAAATTAC-CGTTTTTCTACAAATATACTC--------A--------TTTTGTCGAATGCTTTGGCTTTATTATTATTTATTAATGCTTGTTTCTAGAGGTAAAATGTATGATTAGTC-CGGAAATCCATTTCTTAATAAC
gi|6 : CCTAAGGATAG-GG-G-----GGT-GTTTA-TTT----A-CTTTT--ATGTCCAAAAGGTTTGAGACT-TGTTTCTAG------AGGAAAATG----TTATACTGAGTCCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--ACGTCTA-TT-GGGGCGTTTGGTCACNNNNNNNNNNNNNNN--------NN-N-NNNNNNNNNNN-N-NNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNN---NNNNNN-NNNNNNCTG--------------CAAAGTGTTATCATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGAAATGTGTATGACATGTTTAACAGCAAAAAAAAGTA----C------AAAT------ATGGTTGATTCGTGT---ACAAAAAG-TCTAAATAAGGGACACAATGGCCGCTATAATAAGA-ATAAAAT--GACTTTTTTCTTTAAATAAATGC--------A--------GTTTGTTGAATGCTTTAACCTCATCTTAATTTATAAATGGTTc
gi|7 : ttaaacatgttcagtatttagAGAGCTAG-GG-GTGGGTA-T-GTTTA-TTT----G-CTTTTT-ATGTCTAAACGGTTTG-GAGTATGTTTCTAA------GAGTAGGTTATATTTATGCTGAATTCGAAAATCC-ATTTCTTACTA--GCGGCTA-CT-GGGGTGTTAAGTCACAAATCCAAGATTGCC--------AC-C-AAAATGGTCGC-C-AAAGT-AT
gi|7 : GTTGTTGCAAG--------CATGTTTTAGAGCAAAAACAAGTAA-AA-AGATTGTTGATTCATAT--A-A-AACAAGTCTAAACAGATGATAATATGGACGCCAAAATAAG-AAAAAAATGATAG-TTTTTCTGCATTTTGTATACGGATTTTGTTGAATGCTTTGACCTTATTCTTATT---------TATAGATGTT--gttgttgcaagcatgttttagagcaaaaacaagtaaaaagattgttgattcatataaaacaagtctaaacagatgataatatggacgccaaaataagaaaaaaatgatagtttttctgcattttgtatacggattttgttgaatgctttgaccttattcttatttatagatgtttatataacgatgaagtaagagtaaggat
gi|8 : agagctaggggtgggtatgtttatttgctttttatgtctaaacggtttggagtatgtttctaagagtaggttatatttatgctgaattcgaaaatccatttcttactagcggctactggggtgttaagtcacaaatccaagattgccaccaaaatggtcgccaaagtatCCTAGA-ATAG-GG-A-----G-T-GTTTA-TAT----A-CTTTTTTACATCCAAAATGTTTGAGATT-TGTTTCTAG------AGATAAATT----TTATGCCGAGTCCGAAAATCT-ATTTCTTACTA--AC----------GGGCGTTTGGTCACAAATCCAAGATGGCT--------TG-C-AAAGTTGTCGC-C-TAA-T-ATCGAAATT-CACATT---TTAATA-TATAATCTGATAGAAAAACACTAC--------AAAATTTAG-ATT-----TATTGTGTTGTTGTTAGTCGTATAATATtatataacgatgaagtaagagtaaggat
gi|9 : CCCAGAGATAG-GG-G-----G-T-ATTTA-TTTT---C-CTTTTT-ATGTCCAAAAGAGTCGAGACC---------------------------------GTTAAGTCCGAAAATTC-ATTTCTGTCTA--ACGGCTG-TT-GAGGCGTTTTGCTACAAATTCAAGATGACC--------GC-C-AATATTGCCGC-C-AAA-T-AATGAATTT-CATGTT---ATACTA-TTTAAACTTATTC-AAAACACTACAAAGTGTTAAAATTTAG-ATG-----TATTGTGTTCTTG-A------ATGACATGTTTTAGTGTTAA-----------------------------ATGGTTGATTCATGTACAAAAAAAAA----AAATAAGGGActacgtttacgcgaaatacgaaaacattttttttaaacagtagtatattttacaacagttgtatgtttataaca