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lowQualScore : .. . ........ . ................... .. ............... .. . .... .............. . ... . .... .... ................................................................. . .. ... .. ..... . ............... . . ..... . .... . .. ....... ......... .... .. .. ... . . . . ..... ............................... . ..... . .. . . .. ... . . ...... . .
lowQualScore : 22 6 66666666 0 8888888888888888888 99 555555555555555 99 4 6666 22222222222222 0 444 5 1111 7777 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 11 888 00 00000 2 444444444444444 1 3 77777 7 6666 7 11 7777777 888888888 9999 22 77 444 9 9 2 7 00000 9999999999999999999999999999999 3 77777 8 11 5 9 66 444 2 2 111111 1 5
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Reference ( gi|1 ) : AAGATACAA-TATACACAAT---GT---ATTTATAGTC-GTCATAATG--AGATATAGAACAA--TAAACA--------AT----ATAGCTA--TTGACCGATATTT----ATAGACGTCATGT-TGATATATAACACAATGAACACTTGCTATGTATAGCTATT----GAC----ATTTATAGTCGTCATT--GTGAG-------ATA-TAACG--C-------A-------CTA-------G-------CTATGTATAACTATTGAC--CG---ACATTT--AT-----AGTC-GTCA-TGA-TG--AGATAT-AACACAA-----TAAACACTAGCT-AT-GTATAG-------TCGGCATGGA---AT--ATAACACA----ATAAA--CACTAGCTAT---GTAT-A-GCTATAGACT--GGCATTT--GT-----AGTC-GT--CA-TG-A-TG--AGATAT-AACACAA-----TAAACACTAGCT-AT-GTATAG---TCGGCAAGAGATAT-----AACACAATAAACACTAGCTATGTATA
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gi|8 : ttT-AT-TTACAG-------TCGACATGCT---AT--ATACCACA----ATAGA--CATGAGCTAT---GTAT-A-GTTATTGACC--GACATTcgcaataaagtcggttgatatcgatatatcggttatcatttgtgcataacatatattagatataatatataaaataatgttccactgctataataa
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gi|11 : aaaatgtgttAG-------TCAATATGG-----T--ACAGCAGAGAT-ATAAA--CTCTAGTTTT---AAAT-A-GCTATTGACC--GACAT
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gi|14 : caggatacaatgttttTTT--AT-----AGTC-GA--CA-TA-A------------GACACAA-----TAAACATTAGCT-TT-GTATAG---tattgaccgacattactgtcaatcaattaagctgtattcagccaaatct
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gi|7 : TAT-AA---GA-----TACAAACT--TT-AT-TTATAG---TCGGCATGAGCTGT-----AATACAATAGATACCAGCTATGTTTA
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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