lowQualScore                  :                                   11111   22222222222222222222                                                           
lowQualScore                  :             4        3       333  88888   11111111111111111111 4444            1      9  333   777777777 0    1          
lowQualScore                  :             .        .       ...  .....   .................... ....            .      .  ...   ......... .    .          
lowQualScore                  :             5        4       555  55555   55555555555555555555 0000            9      5  333   666666666 3    9          
consensus                     :           TAATATTACTACCTTTGAC---TC-----CCTN-C-GTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATG-AAATGGGAA---TGT---------GCGTTT-CTGTATTGAA
Reference ( gi|10 )           :           TAGTATTACTATCTTTGAC---TC-----CCTT-C-GTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATG-AAATGGAAA---TGT---------GTGTTT-CTGTATTGAA
gi|9                          :           TAATATTACTACCTTTAAC---TC-----CCTT-T-ATCCAT----TAC-A-G----AAAATTGAAATG-AAATGGGAA---TGT---------GTGTTT-CTGTATTGA
gi|8                          :         aaTAATATAACTACCTTGAAC---TC-----CCTA-C-GCCCGT----CAA-G-T----AAAATGGGAACG-AATTGGGAA---TGT---------GAGTTT-CTGTATTGAA
gi|4                          :         aaTAATATTACTAACTTTGAC---TCGATA-CCCT-C---TCAT----CAC-GGT----TAAATGGGAATG-AAATGGGAA---TGT---------GGGTCT-C-ATATTGAA
gi|12                         :        aatTAATATTACTACCTTTGAC---TC-----GATA-C---CC-T----CTC-G-T----TAAATGGGAATG-CAATGGGAA---TGT---------GCGTTT-CTGCATTTAA
gi|6                          :          aTAATATAACTACCTTTGAC---TC-----CCTG-T-GTACGC----CAC-A-T----TAAATGGAAATG-AAAGGGGAATGTTGT---------GCGTTT-TAGTATTG
gi|15                         :         aaTAATATTACTCCCTTTGAC---TCGATAGCCTC-C----------------------CAAATGGGAATG-AAATGGGAA---TAT---------GCGTTT-CTGTATTGA
gi|5                          :        aaaTAATATTACTACCTTTGAT---TTGATA-CCCT-C-TT--GT----CAT-G-T----TAA-TGGGAATGAAAATGG-AA---CAA---------GTGTTT-CTGTATTGAA
gi|19                         :         agTAATATTGACACCTTTGAC---AC-----CCTT-T-GCCC------------T----TAAAT-----------TGG-AA---TGT---------GTGTTT-CTGTATTGAA
gi|1                          :      agaaaTAATATTACAACCTTTAAT---TC-----ACTAAC-ATCTGT----CACTG-TAGCATAATTGGGAATG-AAATTGTAT---TAA---------GTGTTTACT---TTGAA
gi|16                         :       gaaaTAATATGACTAT----GAC---TC-----TCTT-T-GTCT----------G-T----TCAATGAGAATG---------------T---------GCATTT-CTGTATTTAAaca
gi|7                          : aaatttaaaaaAGTA--AGTATCATTCAC---TC-----CCTA-G-GTATGT----CAT-G-T----TAAATCGGAATG-AAGTGAAAG---TGT---------GTGTTT-CTGTAact
gi|11                         :    aataatattaTATTACTACCTTTGAC---TCGATAGCCTC-CCGTC-AT-----AC---------AATTGGGAATG-AAATGGGAA---TGT---------GTGTTT-CTGTATTGAAa
gi|14                         :             aTATTACTACCATTGAC---TC-----CCTA-C-GTCCATGAAACAT-G-T----TAAAGAAGAAAG-AAACGGGAA---TGT---------GTGTCT-CT
gi|20                         :          atgaTATTACTATCTTTGAT---TG-----TTTG-C-GTACGT----CTT-G-T-----------GAATG-AAATGGGAA---TGT---------GTGTTT-
gi|2                          :        gaaatgaATCATTACCTTTGAC---TT-----CCTA-C-ATCCAT----CAA-G-T----AAAAGGGGAATA-AATTTAGAA---TATACTTGCTCCATGTTT-CTGTATTGA
gi|13                         :         aaataaaTTACTTCCTTCGAC---TA-----CTTG-C-GTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATG-AAATGAGAA---TGT---------GAGTTT-CTATATTGAA
gi|18                         :              ttTTATTATTTTCGACAAACC-----CCTG-T-G-------------A-T----TAAATAAGAATG-AAATTGGAA---TGT---------GCGTTT-CTGTATTGAA
gi|17                         :                   CTGCCTTTGAC---CC-----CCTT-T-GTCAGT----CAC-A-T----TAAATGGGAATT-AAATGAGAA---TGT---------GCGTTT-CTATATTGAA
gi|3                          :                    TACCTTTGAC---TC-----CCTT-C-GCCCGT----CAC-A-G----TAAATGGGAATG-AAATGGGAA---TGT---------GCCTTT-TTGTGTTGA
gi|21                         :         aatgatattactgtaacaGAC---CA-----CCTT-T-G---AC----TAC-T-T----TAAATGTGAATG-AAAGGGGAA---CGT---------GCATTT-TTGTATTG
gi|22                         :                                                                ----TAAATGGGAA-G-AAATGGGAA---TGT---------GTGTTT-CTGTATTGAAca
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): AATGATATTACTACCTTTGACTCCCAACGACCG






Alignments
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lowQualScore                  :               ..... .......         ... ..... .....   ......  . ....   .........                    ...    ..........    .          
lowQualScore                  :               55555 9999999         222 55555 44444   111111  5 0000   333333333                    222    0000000000    8          
consensus                     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
Reference ( family-6861 )     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|1                          :      TAATATTAC-----A-------ACCTTTAAT---T-----C-----ACTAA-CATCTGT----CACTG-TAGCATAATTGGGAATGAAATTGTAT---TAAGT---------GTTTACT---TTGAA
gi|10                         :  gaaaTAGTATTAC-----T-------ATCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGAAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAaca
gi|11                         :        ATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----CGATAGCCT-C-C---CGT----CAT-A-C-----AATTGGGAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|12                         :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----GAT-A-C--CC-T----CTC-G-T----TAAATGGGAATGCAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGCATTTAA
gi|13                         :          aTTAC-----T-------TCCTTCGAC---T-----A-----CTT-G-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGAGAA---TGTGA---------GTTT-CTATATTGAA
gi|14                         :    ttTGATATTAC-----T-------ACCATTGAC---T-----C-----CCT-A-CGTCCATGAAACAT-G-T----TAAAGAAGAAAGAAACGGGAA---TGTGT---------GTCT-CT
gi|15                         :     aTAATATTAC-----T-------CCCTTTGAC---T-----C-----GAT-AGCCTCC-----------------CAAATGGGAATGAAATGGGAA---TATGC---------GTTT-CTGTATTGA
gi|16                         :   aaaTAATATGAC-----T-------A----TGAC---T-----C-----TCT-T-TGTCTGT----T-C---------------------AATGAGAA---TGTGC---------ATTT-CTGTATTTAA
gi|17                         :   aaatttaaaaaC-----T-------GCCTTTGAC---C-----C-----CCT-T-TGTCAGT----CAC-A-T----TAAATGGGAATTAAATGAGAA---TGTGC---------GTTT-CTATATTGAAact
gi|18                         :           TTAT-----T-------ATTTTCGACAAAC-----C-----CCT-G-TG-------------A-T----TAAATAAGAATGAAATTGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|19                         :      TAATATTGA-----C-------ACCTTTGAC---A-----C-----CCT-T-TGCCC------------T----TAAAT-----T------GGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|2                          : agaaaTAAAATCAT-----T-------ACCTTTGAC---T-----T-----CCT-A-CATCCAT----CAA-G-T----AAAAGGGGAATAAATTTAGAA---TATACTTGCTCCATGTTT-CTGTATTGA
gi|20                         :   aaaTGATATTAC-----T-------ATCTTTGAT---T-----G-----TTT-G-CGTACGT----CTT-G-T-----------GAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-
gi|21                         :         gaaaAC-----C-------ACCTTTGAC---T-----------------------------AC-T-T----TAAATGTGAATGAAAGGGGAA---CGTGC---------ATTT-TTGTATTG
gi|22                         :                                                                           g----TAAATGGGAA-GAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAca
gi|23                         :    agTGATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCA-A-CGACCGat
gi|3                          :    aaTGATATTAC-----TGTAACATACCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGCCCGT----CAC-A-G----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------CTTT-TTGTGTTGA
gi|4                          :    aaTAATATTAC-----T-------AACTTTGAC---T-----CGATA-CCC-T-C--TCAT----CAC-GGT----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGG---------GTCT-C-ATATTGAA
gi|5                          :   aatTAATATTAC-----T-------ACCTTTGAT---TTGATAC-----CCT-C-T---TGT----CAT-G-T----TAA-TGGGAATGAAAATGGAA---CAAGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|6                          :    agTAATATAAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-G-TGTACGC----CAC-A-T----TAAATGGAAATGAAAGGGGAATGTTGTGC---------GTTT-TAGTATTG
gi|7                          :    aaTAATATTAAGTAAGT-------ATCATTCAC---T-----C-----CCT-A-GGTATGT----CAT-G-T----TAAATCGGAATGAAGTGAAAG---TGTGT---------GTTT-CTGTA
gi|8                          :    aaTAATATAAC-----T-------ACCTTGAAC---T-----C-----CCT-A-CGCCCGT----CAA-G-T----AAAATGGGAACGAATTGGGAA---TGTGA---------GTTT-CTGTATTGAAa
gi|9                          :    aaTAATATTAC-----T-------ACCTTTAAC---T-----C-----CCT-T-TATCCAT----TAC-A-G----AAAATTGAAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGA





Alignments
lowQualScore                  :               44444 5555555         333 44444 88888   888888  3 4444   555555555                    333    8888888888    1          
lowQualScore                  :               ..... .......         ... ..... .....   ......  . ....   .........                    ...    ..........    .          
lowQualScore                  :               55555 9999999         222 55555 44444   111111  5 0000   333333333                    222    0000000000    8          
consensus                     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
Reference ( family-6861 )     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|1                          :      TAATATTAC-----A-------ACCTTTAAT---T-----C-----ACTAA-CATCTGT----CACTG-TAGCATAATTGGGAATGAAATTGTAT---TAAGT---------GTTTACT---TTGAA
gi|10                         :  gaaaTAGTATTAC-----T-------ATCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGAAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAaca
gi|11                         :        ATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----CGATAGCCT-C-C---CGT----CAT-A-C-----AATTGGGAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|12                         :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----GAT-A-C--CC-T----CTC-G-T----TAAATGGGAATGCAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGCATTTAA
gi|13                         :          aTTAC-----T-------TCCTTCGAC---T-----A-----CTT-G-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGAGAA---TGTGA---------GTTT-CTATATTGAA
gi|14                         :    ttTGATATTAC-----T-------ACCATTGAC---T-----C-----CCT-A-CGTCCATGAAACAT-G-T----TAAAGAAGAAAGAAACGGGAA---TGTGT---------GTCT-CT
gi|15                         :     aTAATATTAC-----T-------CCCTTTGAC---T-----C-----GAT-AGCCTCC-----------------CAAATGGGAATGAAATGGGAA---TATGC---------GTTT-CTGTATTGA
gi|16                         :   aaaTAATATGAC-----T-------A----TGAC---T-----C-----TCT-T-TGTCTGT----T-C---------------------AATGAGAA---TGTGC---------ATTT-CTGTATTTAA
gi|17                         :   aaatttaaaaaC-----T-------GCCTTTGAC---C-----C-----CCT-T-TGTCAGT----CAC-A-T----TAAATGGGAATTAAATGAGAA---TGTGC---------GTTT-CTATATTGAAact
gi|18                         :           TTAT-----T-------ATTTTCGACAAAC-----C-----CCT-G-TG-------------A-T----TAAATAAGAATGAAATTGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|19                         :      TAATATTGA-----C-------ACCTTTGAC---A-----C-----CCT-T-TGCCC------------T----TAAAT-----T------GGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|2                          : agaaaTAAAATCAT-----T-------ACCTTTGAC---T-----T-----CCT-A-CATCCAT----CAA-G-T----AAAAGGGGAATAAATTTAGAA---TATACTTGCTCCATGTTT-CTGTATTGA
gi|20                         :   aaaTGATATTAC-----T-------ATCTTTGAT---T-----G-----TTT-G-CGTACGT----CTT-G-T-----------GAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-
gi|21                         :         gaaaAC-----C-------ACCTTTGAC---T-----------------------------AC-T-T----TAAATGTGAATGAAAGGGGAA---CGTGC---------ATTT-TTGTATTG
gi|22                         :                                                                           g----TAAATGGGAA-GAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAca
gi|23                         :    agTGATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCA-A-CGACCGat
gi|3                          :    aaTGATATTAC-----TGTAACATACCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGCCCGT----CAC-A-G----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------CTTT-TTGTGTTGA
gi|4                          :    aaTAATATTAC-----T-------AACTTTGAC---T-----CGATA-CCC-T-C--TCAT----CAC-GGT----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGG---------GTCT-C-ATATTGAA
gi|5                          :   aatTAATATTAC-----T-------ACCTTTGAT---TTGATAC-----CCT-C-T---TGT----CAT-G-T----TAA-TGGGAATGAAAATGGAA---CAAGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|6                          :    agTAATATAAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-G-TGTACGC----CAC-A-T----TAAATGGAAATGAAAGGGGAATGTTGTGC---------GTTT-TAGTATTG
gi|7                          :    aaTAATATTAAGTAAGT-------ATCATTCAC---T-----C-----CCT-A-GGTATGT----CAT-G-T----TAAATCGGAATGAAGTGAAAG---TGTGT---------GTTT-CTGTA
gi|8                          :    aaTAATATAAC-----T-------ACCTTGAAC---T-----C-----CCT-A-CGCCCGT----CAA-G-T----AAAATGGGAACGAATTGGGAA---TGTGA---------GTTT-CTGTATTGAAa
gi|9                          :    aaTAATATTAC-----T-------ACCTTTAAC---T-----C-----CCT-T-TATCCAT----TAC-A-G----AAAATTGAAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGA


blockSeqs                     :               GTAAG GTAACAT         AAA TGATA GATAG   AGCCT   A GAAA   GGTT                         TGT    CTTGCTCCAT    .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     GATA    TCGT    G .      GTT                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       GCGT    A .      GTT                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       ACGT    A .      GTT                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TTGT    G .      GTT                          .      A             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TTGT    G .      ATT                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TTGC    A .      ATT                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       ACAT    G .      GTA                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       GCGT    G .      TTT                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       ACGA    G .      AGT                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TCGC    A .      GTT                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       GTGT    G .      ATT                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       AGGT    G .      GTT                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       ACGC    G .      GTA                          .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TTAT    G .      AGA                          .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       GTG     A .      AC                           .      G             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       CC      . .      TT                           .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       AC      . .      GT                           .      C             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       TC      . .      C                            .      T             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       CT      . .      .                            .      A             .
blockSeqs                     :               .     .               .   .     .       .       .                                     .      T             .


blockSeqCons                  :                                                       NCGT**           GTT******
originalCons                  :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
finalCons                     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCTNCGT--CCGT----CACGTT------AAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA





Alignments
lowQualScore                  :               44444 5555555         333 44444 88888   888888  3 4444   555555555                    333    8888888888    1          
lowQualScore                  :               ..... .......         ... ..... .....   ......  . ....   .........                    ...    ..........    .          
lowQualScore                  :               55555 9999999         222 55555 44444   111111  5 0000   333333333                    222    0000000000    8          
consensus                     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
Reference ( family-6861 )     :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-N-CGTCCGT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|1                          :      TAATATTAC-----A-------ACCTTTAAT---T-----C-----ACTAA-CATCTGT----CACTG-TAGCATAATTGGGAATGAAATTGTAT---TAAGT---------GTTTACT---TTGAA
gi|10                         :  gaaaTAGTATTAC-----T-------ATCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGGAAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAaca
gi|11                         :        ATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----CGATAGCCT-C-C---CGT----CAT-A-C-----AATTGGGAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|12                         :      TAATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----GAT-A-C--CC-T----CTC-G-T----TAAATGGGAATGCAATGGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGCATTTAA
gi|13                         :          aTTAC-----T-------TCCTTCGAC---T-----A-----CTT-G-CGTCCAT----CAC-G-T----TAAATGGGAATGAAATGAGAA---TGTGA---------GTTT-CTATATTGAA
gi|14                         :    ttTGATATTAC-----T-------ACCATTGAC---T-----C-----CCT-A-CGTCCATGAAACAT-G-T----TAAAGAAGAAAGAAACGGGAA---TGTGT---------GTCT-CT
gi|15                         :     aTAATATTAC-----T-------CCCTTTGAC---T-----C-----GAT-AGCCTCC-----------------CAAATGGGAATGAAATGGGAA---TATGC---------GTTT-CTGTATTGA
gi|16                         :   aaaTAATATGAC-----T-------A----TGAC---T-----C-----TCT-T-TGTCTGT----T-C---------------------AATGAGAA---TGTGC---------ATTT-CTGTATTTAA
gi|17                         :   aaatttaaaaaC-----T-------GCCTTTGAC---C-----C-----CCT-T-TGTCAGT----CAC-A-T----TAAATGGGAATTAAATGAGAA---TGTGC---------GTTT-CTATATTGAAact
gi|18                         :           TTAT-----T-------ATTTTCGACAAAC-----C-----CCT-G-TG-------------A-T----TAAATAAGAATGAAATTGGAA---TGTGC---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|19                         :      TAATATTGA-----C-------ACCTTTGAC---A-----C-----CCT-T-TGCCC------------T----TAAAT-----T------GGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|2                          : agaaaTAAAATCAT-----T-------ACCTTTGAC---T-----T-----CCT-A-CATCCAT----CAA-G-T----AAAAGGGGAATAAATTTAGAA---TATACTTGCTCCATGTTT-CTGTATTGA
gi|20                         :   aaaTGATATTAC-----T-------ATCTTTGAT---T-----G-----TTT-G-CGTACGT----CTT-G-T-----------GAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-
gi|21                         :         gaaaAC-----C-------ACCTTTGAC---T-----------------------------AC-T-T----TAAATGTGAATGAAAGGGGAA---CGTGC---------ATTT-TTGTATTG
gi|22                         :                                                                           g----TAAATGGGAA-GAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGAAca
gi|23                         :    agTGATATTAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCA-A-CGACCGat
gi|3                          :    aaTGATATTAC-----TGTAACATACCTTTGAC---T-----C-----CCT-T-CGCCCGT----CAC-A-G----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGC---------CTTT-TTGTGTTGA
gi|4                          :    aaTAATATTAC-----T-------AACTTTGAC---T-----CGATA-CCC-T-C--TCAT----CAC-GGT----TAAATGGGAATGAAATGGGAA---TGTGG---------GTCT-C-ATATTGAA
gi|5                          :   aatTAATATTAC-----T-------ACCTTTGAT---TTGATAC-----CCT-C-T---TGT----CAT-G-T----TAA-TGGGAATGAAAATGGAA---CAAGT---------GTTT-CTGTATTGAA
gi|6                          :    agTAATATAAC-----T-------ACCTTTGAC---T-----C-----CCT-G-TGTACGC----CAC-A-T----TAAATGGAAATGAAAGGGGAATGTTGTGC---------GTTT-TAGTATTG
gi|7                          :    aaTAATATTAAGTAAGT-------ATCATTCAC---T-----C-----CCT-A-GGTATGT----CAT-G-T----TAAATCGGAATGAAGTGAAAG---TGTGT---------GTTT-CTGTA
gi|8                          :    aaTAATATAAC-----T-------ACCTTGAAC---T-----C-----CCT-A-CGCCCGT----CAA-G-T----AAAATGGGAACGAATTGGGAA---TGTGA---------GTTT-CTGTATTGAAa
gi|9                          :    aaTAATATTAC-----T-------ACCTTTAAC---T-----C-----CCT-T-TATCCAT----TAC-A-G----AAAATTGAAATGAAATGGGAA---TGTGT---------GTTT-CTGTATTGA