lowQualScore                  :                22            2          4 4 
lowQualScore                  :                ..            .          . . 
lowQualScore                  :                99            5          0 1 
consensus                     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
Reference ( gi|9 )            :    ATGGAGAGTATCATAATGGATTACCCATGGGTATTCGGCAA
gi|6                          :    ATGGTGAGTATGAAAATGGATTACCCATGGGTATTCAACA
gi|3                          :  gaATGGAGGGTATCGTAATGGATTATCCATGGATAATCGACGtg
gi|8                          :  gaATGGAGAGTATCATGATGGATTAGCCGAGGGTATTCGtgata
gi|5                          :   aATGGAGAGTACTGTAATGGAATACCCGTGGGTAATCGGCGatgat
gi|4                          :  caATGGAGAGTATCCGAATGGATTACCAGTGGGTATTCAACGtgc
gi|10                         : taaATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCC-TTGGTATCCtg
gi|7                          :   aATGGAAAATATCAGAATGGATTGCTCAAGGGTATTCGACGaaaga
gi|1                          :   aATGGAGAATATCCGAATGGATTACTCGTGGGTATTtgg
gi|14                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCGttatgatgcatgtttg
gi|15                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCt
gi|11                         :       GAGAGTATCGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGACG
gi|12                         :         GAGTATCGTAATGGATTAACCGTCGGTATTCGACGtg
gi|16                         :          AGTATTGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGtgc
gi|2                          :          AGTCTCGGAATGGATTACCCGTCGGTATCCGACGatg
gi|13                         :             ATCGGAATGGATTACCCGTGGGTATTCGtgatgtgtcccatgt
gi|5                          :                      GATTACCCACGGGTATTCctatgacca

lowQualScore                  :                 0                           
lowQualScore                  :                 .                           
lowQualScore                  :                 1                           
consensus                     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
Reference ( family-6505 )     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
gi|1                          :    ATGGAGAATATCCGAATGGATTACTCGTGGGTATTTTATGA
gi|10                         :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCC-TTGGTATCCAAAGAtgcatgtttg
gi|11                         :      aGAGAGTATCGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGACGA
gi|12                         :         GAGTATCGTAATGGATTAACCGTCGGTATTCGACGAtg
gi|13                         :             ATCGGAATGGATTACCCGTGGGTATTCGtgc
gi|14                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCGctatgacca
gi|15                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCt
gi|16                         :          AGTATTGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGATG
gi|2                          :          AGTCTCGGAATGGATTACCCGTCGGTATCCGACGA
gi|3                          :    ATGGAGGGTATCGTAATGGATTATCCATGGATAATCGACGAtgatgtgtcccatgt
gi|4                          :  gaATGGAGAGTATCCGAATGGATTACCAGTGGGTATTCAACGAtgata
gi|5                          : taaATGGAGAGTACTGTAATGGAATACCCGTGGGTAATCGGCGAtg
gi|6                          :  caATGGTGAGTATGAAAATGGATTACCCATGGGTATTCAACAAtgc
gi|7                          :  gaATGGAAAATATCAGAATGGATTGCTCAAGGGTATTCGACGAtg
gi|8                          :   aATGGAGAGTATCATGATGGATTAGCCGAGGGTATTCGATGAtgg
gi|9                          :   aATGGAGAGTATCATAATGGATTACCCATGGGTATTCGGCAAt




blockSeqCons                  :    
originalCons                  :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
finalCons                     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA

lowQualScore                  :                 0                           
lowQualScore                  :                 .                           
lowQualScore                  :                 1                           
consensus                     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
Reference ( family-6505 )     :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCCGTGGGTATTCGACGA
gi|1                          :    ATGGAGAATATCCGAATGGATTACTCGTGGGTATTTTATGA
gi|10                         :    ATGGAGAGTATCGTAATGGATTACCC-TTGGTATCCAAAGAtgcatgtttg
gi|11                         :      aGAGAGTATCGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGACGA
gi|12                         :         GAGTATCGTAATGGATTAACCGTCGGTATTCGACGAtg
gi|13                         :             ATCGGAATGGATTACCCGTGGGTATTCGtgc
gi|14                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCGctatgacca
gi|15                         :     TGGAGAGCATCATAATGAATTACCCATGGGTATTCt
gi|16                         :          AGTATTGTAATGGATTACCTGTGGGTATTCGATG
gi|2                          :          AGTCTCGGAATGGATTACCCGTCGGTATCCGACGA
gi|3                          :    ATGGAGGGTATCGTAATGGATTATCCATGGATAATCGACGAtgatgtgtcccatgt
gi|4                          :  gaATGGAGAGTATCCGAATGGATTACCAGTGGGTATTCAACGAtgata
gi|5                          : taaATGGAGAGTACTGTAATGGAATACCCGTGGGTAATCGGCGAtg
gi|6                          :  caATGGTGAGTATGAAAATGGATTACCCATGGGTATTCAACAAtgc
gi|7                          :  gaATGGAAAATATCAGAATGGATTGCTCAAGGGTATTCGACGAtg
gi|8                          :   aATGGAGAGTATCATGATGGATTAGCCGAGGGTATTCGATGAtgg
gi|9                          :   aATGGAGAGTATCATAATGGATTACCCATGGGTATTCGGCAAt