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Reference ( gi|3 )            :    TGTGTACACAGT-T--CCAT-CAGTTAATACCAATTG---AAATAA---TAGAGA-AAAAT--TATTTCTT-AAAAAATCAGTAATATCA---AT---TCCATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--AA----AAA----A---GAAGACTGGAAA------------AGGAATAGGAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGAT---CTA---------CATTGTTGTCATTAAGGTAAC--TGTTTACATATTCTAGATAT----AT---------ATCAC-TAT-TGATTATGAATGTTTGTCAATCGTT-AT------------T-T-------TTT-A-------TTT-TC--TTTTTTCTTAT-----TGGATATAACAATA-CTTTTT-ATGA-CGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAATCTTA
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gi|9                          :    TGTGTACACAAT-TATCCAT-CAGTTGATAACAATTG---AAATAA---TAGGGA-GAAA------------AAAAAATTAGTAATACCA---AT---TCAATTTAGTTCTCAT-AAGGTTAG--AA----AAA----AT--AAAGACTAGAAA------------AGGA-------TTTAATAA--GCATTTAGACAC--TATGCATACTCGTAAC-AC---AACAATA---ACAGAATGTT-AACCCGGTATGAT---CAG---------CATTGTTGTCATTA----AAC--TGTTTACATATTCTAG--------AT---------ATCAA-TAT-TGATTATGAATGCTTGTC
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gi|2                          : acggGTGTACACATTAT--CCAT-CAGTTAATACCAATTG---AAATAA---TAGAGA-AAAAG--TTTTTCTT-AAAAAATCAGTAATATCA---AT---TTCATTTAGTT-TCATTAAGGTTAACAAA----AAAT---A---GAAGACTGGAAA------------AGGAATAGGAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACCATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGAT---CTA---------CATTGTTGTCATTAAAGTAAC--TGTTTACATATTCTAGATAC----AT---------ATCAA-TAA-TGATTATGAATGTTTGTCAATCGTT-ATAGAAAGCTTCTGT-T-------TTT-C-------TTTATT--TTTTATCGTAT-----TGGATATAACAATG-CTTTTT-ATGA-CGAATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCTAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAAAATTAACCTTAaacgttgtacgtttta
gi|7                          :     GTGCACACAAT-TATCCAT-CAGTGAATAACAATTG---AAATAA---CAGAAG-AAAA----------------AATCAGTAATA-CATGTATGTATTCAACTAGTTCTTAT-AAGGTGAG--AA----AAA----ATA-GAAGACTGGAAA------------AGGAATAGGGATG-------------TAGATAC--TATGCAGACTTGTTAC-AC---AACAACA---AAAA--TGTT-AACCCGGTATGAT---CAG---------CAATGTTGTCATTAAAATAAC--TTTAAACATATTCTAGA-A----------------ATCAA-TAT-TGATAAGGAATACTTGTCAATAGTT-AT------------A-TAAAAAACTTT-G-------CTT-T---TTTTATCGTAT-----TGAATATAACAATA--TTTTT-ATGT-AGGATTTATAAAATAGCAa
gi|18                         :    ggTGTACACAAT-TATCCAT-CAATTAGTTACAAATG---AAACAA------------AAT--AAT----------AA-CAGCAATATCT---AT---TCAGTTTAATTCTTTT-AAAGTTAG--GAC---AAG----A---GAAGACAAGAAA------------CGAAAatgg
gi|12                         :          CACAAT-TATCCAT-CAGTTAATAACAATTG---AAATAA---TAGATA-GAAA---------------AAATCAGTAATACCA---AT---TCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTCAA--AA----AAAT---A---GAAGACTAGAAA------------AGTAATAGGGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAAG-TT-AACCTGGTATGAT---CGG---------CATTGTTGTCATTAAAGTAatgg
gi|4                          :          tACAAT-TATCCGT-CATTTAATAACAATTG---AAATGA---T----------T--T-TTTTTT-AAAA--TCAATAATACCA---AT---TCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--AA----AAA----AAATGAAGACTGGAAA------------AGGAATAGGGGTGCAATGGATGCATTTAGACAC--TAGGTAGACTTGTTAC-AC---GACAAC-----AAATATGTT-AATCCGGTATGAT---CAG---------CAATGTTGTCATTAA-ATAAC--TGTTTACATATTCTAG--------AT---------GTCAA-TAT-TGATT----ATGCTTTTCAATAATC-ATAAAAAA------C-T-------T-----------TTT-TC---TCTATCTTAA-----TGGATTTAACAATG-CTTTTT-ATGA-TGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTAAAGATTTAATAAACTGTTGCACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATTCAAGATTGGAGTTGGCATATAATATTAACCATA
gi|17                         :             ttt-T--CCAT-CAGTTAATACCAATTG---AAATAA---TAGAGA-AAAAC--TTTTTCTTAAAAAAATCAATAATATCA---AT---TCCATTTAGTTCTGAC-AAGGTTAA--AA----GAAAATGA---GAAAACTGGGAA------------AGGAATAAGATTGCAATAGATGAATTTAGACAC--
gi|5                          :             tta-T--TCAC-CAGTTAATAACAATTG---AAACAAAAATAATAA-AAAA------------AAAGAAT-AGTAATGGCA---AT---TCTGTTTAGTTCTTAC-AAAGTTAG--GATCAGAAA----A---GACGA--GCACA------------TATAGTGGGA---CAATAGTTACATTTAAACAT--TCTGCATAC--GTAA--AG---AACAAAAGC-AAAAAATATTTAACCCAGTATGAT---CCACTGAGTCACCATTGTTGTCATTAAAG------TGTGTATCTATTCGAGAAATTGACATGGGTAACCAATAACATATATAATTATGAA---TTGTTAA
gi|10                         :              ta-T--CCAT-CAGTTAATA---ACTGTGTAAACAA----------AAAAC-----------AGAATATC--TAATACTA---AT---CCAATTGAGTTCCTAT-GAGGATAG--GA----AAA----A---AAGGAATAGAAA------------AGAAATAGGGATGAAATAGATATATAGAGAGAC--C-TGTATACGTGTTAC-AC---AAAAACA---AAAACTG-TT-AA-CCAGCATAATTAATTAGTCAC----CATTGTTGTCATAAA---AACATTTTTTACCTACTCGAGATAT----attgaatgatcgttttgaagattttataaaattttgtatagctttaaatattttagtattgcaatcatttacttcatcatggttgccatgtagtaacaacctta
gi|6                          :                                                                     acaaaattgAATATCAGTAATATCA---AT---TCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--AA----AAAT---A---GAAGACTGGAAA------------AGGAATAGGGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TAAGCAGGCTTGTTAC-AC---AACAATA---AAAAAAG-TT-AACCCGGTATGAT---CAA---------AATTGTTGTCATTAAAGTAAC--TGTTTACATATTCTAGATAT-----------------CAA-TAT-TGATTTTGAATGTTTGTAAATAGTT---------------------------T-AAGAAAGCTTT-TCGGTTTTATCATAT-----TGGATATAACAATG-CTTTTT-ATGA-AGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTGAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTCTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTTGTCATTATAATAAC--TGTTTACATATTCTAGATATC---AA---------AT------T-TGATAATAA----TTATTAAA-----A---------------------------A-------CCT-TT--TTTTTTCTTTT-----CGGATATAACAATA-ATTTGT-ATGAAC--ATTTCTTAATCAGTACTCGGATTTTAATCGTTTTGAAGATTTAATAAGCTATTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTTTAACCTTCGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
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gi|15                         :                                                                                  cagtgtgtacactgtgtacagttaataacatttgaaataatagagacaaaactaaaaattcagtaataccaattcaatttagttcttataaggtttgataaatagaagacggaaaaaggaatagggatgcagtaggtgcatttagacactatacagacttgtaacacaataataataaaaaaaagtttacccggtatgatcagccagagacatagaaacatcgtctatgtgtctggatcggct---------ATTAC-TAT-TGATTATAAATGATTATCAATAATTGAT------------TGT-------TTTGA-------TTA-TC--TTTTTTTATATAACTATGGA-ATAGTAATG-CTTTTTTATGA-AGAATTTCTCAATACATACTATGTTTCAAATCGTCTTGAAGATTTAACAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                             CACAATTATCCATCAGTTAATAACAATTGAAAT---AAT----AGATA-GAAA---------------------------AAATCAGTAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTCAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTAGAAA------------AGTAATA--GGGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAA-G-TTAACCTGGTATGA--------TC-----GG----CATTGTTGTCATTAAAGTAa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tCAAT---AT---TGATTATGAATGTTTGTCAATCGTT-AT---AGAAA-C-CTT---TATTT-------T--------------TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCAGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATAGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTGCACAATTATCTATCAGTTAATAACAATTGAAAC---AA---------A-AATA--------T--------A-------ACATATC--TAAAAC---CG---GTTCAATTTA-------T-AAGGTTAG--G--GAAA-G-A--GAACACTGGAAA------------AGAAATA--GTGCTGAAATATATGCATTTAG---------------TTGTCACGAT---AATGATATTTAAAAAATA-TTGAa
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actgttgtcataaaaatttcaaaaT---TATTGGATATAACAATG-TTTTTTTATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATACAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTGAATATTTTAGTAGTATCAACGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tTTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAAT---AAT----AGAGA-AAAA-------CTTTTTCTTAA-------AAAAATCAATAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTGAC-AAGGTTAA--AAGAAAA-TGA--GAAAACTGGGAA------------AGGAATA--AGATTGCAATAGATGAATTTAGACAC--a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGTACACAATTATCCATCAATTAGTTACAAATGAAAC---AA-------------AA--------T--------A-------ATAA--CAGCAATAT---CT---ATTCAGTTTAATTCTTTT-AAAGTTAG--G--ACAA-G-A--GAAGACAAGAAA------------CGAAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                              ACAATTATCCGTCATTTAATAACAATTGAAAT---GATTTTT-----------------TT--------T-------TAAAATCAATAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--A--AAAA-A-AATGAAGACTGGAAA------------AGGAATA--GGGGTGCAATGGATGCATTTAGACAC--TAGGTAGACTTGTTAC-AC---GACAACA---AATA--TG-TTAATCCGGTATGA--------TC-----AG----CAATGTTGTCATTAAA-TAACTGTTTACATATTCTAGATGT-------------CAAT---AT---TGATTATG----CTTTTCAATAATC-AT---AAAAAAC-TTT---T---T-------TC--TCT-ATCT---TAATGGATTTAACAATG-CTTTT-TATGATGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTAAAGATTTAATAAACTGTTGCACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATTCAAGATTGGAGTTGGCATATAATATTAACCATA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGTTTTGAAGATTTTATAAAATTTTGTATAGCTTTAAATATTTTAGTATTGCAATCATTTACTTCATCATGGTTGCCATGTAGTAACAACCTTAattgaatgatcgttttgaagattttataaaattttgtatagctttaaatattttagtattgcaatcatttacttcatcatggttgccatgtagtaacaacctta
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTTGTCATTATAATAACTGTTTACATATTCTAGATAT-------------CAAA---TT---TGAT----------------AATAATT-ATT--AAAAA-CCTTT---TTTTT-------TC--TTTT----------CGGATATAACAATA-ATTTG-TATGAAC-ATTTCTTAATCAGTACTCGGATTTTAATCGTTTTGAAGATTTAATAAGCTATTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTTTAACCTTCGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                             CACAATTATCCATCAGTTAATAACAATTGAAATAA---T-----AGATA-GAAA---------------------AAATCAGTAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTCAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTAG------------AAAAGTAATAG--GGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAA-GTT-AACCTGGTATGA--------TC-----GG----CATTGTTGTCATTAAAGTAa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tCAAT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---AGAAA-C-CTT---TATTT-------T--------------TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCAGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATAGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTGCACAATTATCTATCAGTTAATAACAATTGAAACAA-------------A-AATA--------T---------AACATATC--TAAAAC---CG---GTTCAATTTA-------T-AAGGTTAG--G--GAAA-G-A--GAACACTGG------------AAAAGAAATAG--TGCTGAAATATATGCATTTAG---------------TTGTCACGAT---AATGATATTTAAAAAATATT-GAa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acgg-----ATTACT---AT---TGATTATAAATGATTATC--AATAATTGAT---TG----T-TTTGATTATCT-------TT--TTTTATATAACTAT-GGA-ATAGTAATG-CTTTTTTATGAAGAATTTCTCAATACATACTATGTTTCAAATCGTCTTGAAGATTTAACAAAaacgttgtacgtttta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actgttgtcataaaaatttcaaaaT---TATTGGATATAACAATG-TTTTTTTATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATACAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTGAATATTTTAGTAGTATCAACGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tTTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------CTTTTTCTTAAAAAAATCAATAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTGAC-AAGGTTAA--AAGAAAA-TGA--GAAAACTGG------------GAAAGGAATAA--GATTGCAATAGATGAATTTAGACAC--a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGTACACAATTATCCATCAATTAGTTACAAATGAAACAA-----------------AA--------T---------AATAA--CAGCAATAT---CT---ATTCAGTTTAATTCTTTT-AAAGTTAG--G--ACAA-G-A--GAAGACAAG------------AAACGAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGTACACA-TTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAAGTTTTTCTT---------AAAAAATCAGTAATAT---CA---ATTTCATTTAGTT-TCATTAAGGTTAACAA--AAAA-T-A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACCATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGA--------TC-----TA----CATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATATTCTAGATAC----AT-----ATCAAT---AA---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---AGAAAGC-TTC---TGTTTTTCTTTATT--TTTTATCG---TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGACGAATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCTAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAAAATTAACCTTAatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTACACAGTT--CCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------TTATTTCTT-AAAAAATCAGTAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA---A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGA--------TC-----TA----CATTGTTGTCATTAAGGTAACTGTTTACATATTCTAGATAT----AT-----ATCACT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---------T-TTT---TATTT-------TC--TTTTTTCT---TATTGGATATAACAATA-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAATCTTAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                              ACAATTATCCGTCATTTAATAACAATTGAAATGA---TTTTTT------------------T---------TTAAAATCAATAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--A--AAAA-A-AATGAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGGTGCAATGGATGCATTTAGACAC--TAGGTAGACTTGTTAC-AC---GACAACA---AATA--TGTT-AATCCGGTATGA--------TC-----AG----CAATGTTGTCATTAAA-TAACTGTTTACATATTCTAGATGT-------------CAAT---AT---TGATTATG----CTTTTC--AATAATC-AT---AAAAA-A-CTT---TTTTC-------TC--T---ATCT---TAATGGATTTAACAATG-CTTTT-TATGATGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTAAAGATTTAATAAACTGTTGCACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATTCAAGATTGGAGTTGGCATATAATATTAACCATA
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gi|10                         : cagtgtgtacactgtgtacagttaataacatttgaaataatagagacaaaactaaaaattcagtaataccaattcaatttagttcttataaggtttgataaatagaagacggaaaaaggaatagggatgcagtaggtgcatttagacactatacagacttgtaacacaataataataaaaaaaagtttacccggtatgatcagccagagacatagaaacatcgtctatgtgtctgACAAAATTGTCCATCAGTTAATAACTGTGTAAACAA---------------AAAA--------C---------AGAATATC--TAATAC---TA---ATCCAATTGAGTTCCTAT-GAGGATAG--G--AAAA---A--AAGGAATAG------------AAAAGAAATAG--GGATGAAATAGATATATAGAGAGAC--C-TGTATACGTGTTAC-AC---AAAAAC----AAAAACTGTT-AA-CCAGCATAATTAATTAGTC-----AC----CATTGTTGTCATAAAAAC-ATTTTTTACCTACTCGAGATAT----
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTTGTCATTATAATAACTGTTTACATATTCTAGATAT-------------CAAA---TT---TGAT----------------AATAATT-ATT--AAAAA-CCTTT---TTTTT-------TC--TTTT----------CGGATATAACAATA-ATTTG-TATGAAC-ATTTCTTAATCAGTACTCGGATTTTAATCGTTTTGAAGATTTAATAAGCTATTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTTTAACCTTCGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                             CACAATTATCCATCAGTTAATAACAATTGAAATAA---T-----AGATA-GAAA---------------------AAATCAGTAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTCAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTAG------------AAAAGTAATAG--GGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAA-GTT-AACCTGGTATGA--------TC-----GG----CATTGTTGTCATTAAAGTAa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tCAAT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---AGAAA-C-CTT---TATTT-------T--------------TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCAGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATAGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTGCACAATTATCTATCAGTTAATAACAATTGAAACAA-------------A-AATA--------T---------AACATATC--TAAAAC---CG---GTTCAATTTA-------T-AAGGTTAG--G--GAAA-G-A--GAACACTGG------------AAAAGAAATAG--TGCTGAAATATATGCATTTAG---------------TTGTCACGAT---AATGATATTTAAAAAATATT-GAa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acgg-----ATTACT---AT---TGATTATAAATGATTATC--AATAATTGAT---TG----T-TTTGATTATCT-------TT--TTTTATATAACTAT-GGA-ATAGTAATG-CTTTTTTATGAAGAATTTCTCAATACATACTATGTTTCAAATCGTCTTGAAGATTTAACAAAaacgttgtacgtttta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actgttgtcataaaaatttcaaaaT---TATTGGATATAACAATG-TTTTTTTATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATACAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTGAATATTTTAGTAGTATCAACGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tTTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------CTTTTTCTTAAAAAAATCAATAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTGAC-AAGGTTAA--AAGAAAA-TGA--GAAAACTGG------------GAAAGGAATAA--GATTGCAATAGATGAATTTAGACAC--a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGTACACAATTATCCATCAATTAGTTACAAATGAAACAA-----------------AA--------T---------AATAA--CAGCAATAT---CT---ATTCAGTTTAATTCTTTT-AAAGTTAG--G--ACAA-G-A--GAAGACAAG------------AAACGAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGTACACA-TTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAAGTTTTTCTT---------AAAAAATCAGTAATAT---CA---ATTTCATTTAGTT-TCATTAAGGTTAACAA--AAAA-T-A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACCATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGA--------TC-----TA----CATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATATTCTAGATAC----AT-----ATCAAT---AA---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---AGAAAGC-TTC---TGTTTTTCTTTATT--TTTTATCG---TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGACGAATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCTAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAAAATTAACCTTAatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTACACAGTT--CCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------TTATTTCTT-AAAAAATCAGTAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA---A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGA--------TC-----TA----CATTGTTGTCATTAAGGTAACTGTTTACATATTCTAGATAT----AT-----ATCACT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-AT---------T-TTT---TATTT-------TC--TTTTTTCT---TATTGGATATAACAATA-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAATCTTAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                              ACAATTATCCGTCATTTAATAACAATTGAAATGA---TTTTTT------------------T---------TTAAAATCAATAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--A--AAAA-A-AATGAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGGTGCAATGGATGCATTTAGACAC--TAGGTAGACTTGTTAC-AC---GACAACA---AATA--TGTT-AATCCGGTATGA--------TC-----AG----CAATGTTGTCATTAAA-TAACTGTTTACATATTCTAGATGT-------------CAAT---AT---TGATTATG----CTTTTC--AATAATC-AT---AAAAA-A-CTT---TTTTC-------TC--T---ATCT---TAATGGATTTAACAATG-CTTTT-TATGATGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTAAAGATTTAATAAACTGTTGCACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATTCAAGATTGGAGTTGGCATATAATATTAACCATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                tttTATTCACCAGTTAATAACAATTGAAACAAAAAT-----A-ATA-AAAA--------A---------AAAGAAT-AGTAATGG---CA---ATTCTGTTTAGTTCTTAC-AAAGTTAG--G--ATCA-G-A--AAAGAC--G------------AGCACATATAGTGGGA--CAATAGTTACATTTAAACAT--TCTGCATAC--GTAA--AG---AACAAAAGC-AAAAAATATTTAACCCAGTATGA--------TCCACTGAGTCACCATTGTTGTCATTAAAG----TGTGTATCTATTCGAGAAATTGACATGGGTAACCAATAACATATATAATTATGAA---TTGTT--AA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATCGTTTTGAAGATTTTATAAAATTTTGTATAGCTTTAAATATTTTAGTATTGCAATCATTTACTTCATCATGGTTGCCATGTAGTAACAACCTTAattgaatgatcgttttgaagattttataaaattttgtatagctttaaatattttagtattgcaatcatttacttcatcatggttgccatgtagtaacaacctta
gi|6                          :                             tattcaccagttaataacaattgaaacaaaaataataaaaaaaaagaatagtaatggcaattctgtttagttcttacaaagttaggatcagaaaagacgagcacatatagtgggacaatagttacatttaaacattctgcatacgtaaagaacaaaagcaaaaaatatttaacccagtatgatccactgagtcaccattgttgtcattaaagtgtgtatctattcgagaaattgacatgggtaaccaataacatatataattatgaattgttaaattgaatgAATATCAGTAATAT---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TAAGCAGGCTTGTTAC-AC---AACAATA---AAAAAA-GTT-AACCCGGTATGA--------TC-----AA----AATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATATTCTAG--------AT-----ATCAAT---AT---TGATTTTGAATGTTTGTA--AATAGTT-TA---AGAAA---------GCTTT-------TCGGTTTTATCA---TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTGAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTCTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                     ggTGTGTACACAATTATCCATCAGTTTATAACAATTGAAATAA---T-----AGAAA-AAAA--------T---------AATAATTCAGTAAAAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTGGAAATGGAATAAAAAAAGGAATAG--GGATGCAATAGGTCCATTTAGAGACTATATGCAGACTTGCAAC-AC---AACAATA---AAAAA--GTT-TACCCATTATGA--------TC-----AG----CATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATAT-----ATAT----AT-----AT--AT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC-------------------A-C-TTT---TCTCT-------TT--TTTT--------------TATAACAATGTTTTTT-TATG-AGGATTatgg
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Reference ( family-6396 )     :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTACACAATTATCCATCAGTTAATAACAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------T---------AAAAAATCAGTAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--A--AAAA-T-A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAATGTT-AACCCGGTATGA--------TC-----AG----CATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATA----TTCTAGA---TA-ATAT-------CAAT---AT---TGATTATGAATGCTTGTC--AATAGTT-A-T---AGAAA-CTTT---TNTTTTC-------TTTTATCT---TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acggACTGTTGTCATAAAAATTTCA------A-AAAT-------TACT---AT---TGATTATAAATGATTATC--AATAATTGA-T---TG----TTTTGATTATCTTT-------TTTTATATAACTAT-GGA-ATAGTAATG-CTTTTTTATGAAGAATTTCTCAATACATACTATGTTTCAAATCGTCTTGAAGATTTAACAAAaacgttgtacgtttta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T---TATTGGATATAACAATG-TTTTTTTATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATACAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTGTTGTACAGCTTTGAATATTTTAGTAGTATCAACGTATACAAGATTAGAGTTGCCATATAATATTAACCTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tTTATCCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------CTTTTTCTTAAAAAAATCAATAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTGAC-AAGGTTAA--AAGAAAA-TGA--GAAAACTGG------------GAAAGGAATAA--GATTGCAATAGATGAATTTAGACAC--a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGTACACAATTATCCATCAATTAGTTACAAATGAAACAA-----------------AA--------T---------AATAA--CAGCAATAT---CT---ATTCAGTTTAATTCTTTT-AAAGTTAG--G--ACAA-G-A--GAAGACAAG------------AAACGAAA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTACACAGTT--CCATCAGTTAATACCAATTGAAATAA---T-----AGAGA-AAAA--------TTATTTCTT-AAAAAATCAGTAATAT---CA---ATTCCATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA---A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GAATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TATGCAGACTTGTAAC-AC---AACAATA---AAAAAAGATT-AACCCGGTATGA--------TC-----TA----CATTGTTGTCATTAAGGTAACTGTTTACATA----TTCTAGA---TATATAT-------CACT---AT---TGATTATGAATGTTTGTC--AATCGTT-A-T---------TTTT---TATTTTC-------TTTTTTCT---TATTGGATATAACAATA-CTTTT-TATGACGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAAGTGTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATACAAGATTAGAATTGCCATATAATATTAATCTTAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                              ACAATTATCCGTCATTTAATAACAATTGAAATGA---TTTTTT------------------T---------TTAAAATCAATAATAC---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAG--A--AAAA-A-AATGAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGGTGCAATGGATGCATTTAGACAC--TAGGTAGACTTGTTAC-AC---GACAACA---AATA--TGTT-AATCCGGTATGA--------TC-----AG----CAATGTTGTCATTAAA-TAACTGTTTACATA----TTCTAGA---TG----T-------CAAT---AT---TGATTATG----CTTTTC--AATAATC-A-T---AAAAA-ACTT---TTTTCTC-------T---ATCT---TAATGGATTTAACAATG-CTTTT-TATGATGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTCAAATCTTTTTAAAGATTTAATAAACTGTTGCACAGCTTTAAATATTTTAGTATTATCATCGTATTCAAGATTGGAGTTGGCATATAATATTAACCATA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGTTTTGAAGATTTTATAAAATTTTGTATAGCTTTAAATATTTTAGTATTGCAATCATTTACTTCATCATGGTTGCCATGTAGTAACAACCTTAattgaatgatcgttttgaagattttataaaattttgtatagctttaaatattttagtattgcaatcatttacttcatcatggttgccatgtagtaacaacctta
gi|6                          :                             tattcaccagttaataacaattgaaacaaaaataataaaaaaaaagaatagtaatggcaattctgtttagttcttacaaagttaggatcagaaaagacgagcacatatagtgggacaatagttacatttaaacattctgcatacgtaaagaacaaaagcaaaaaatatttaacccagtatgatccactgagtcaccattgttgtcattaaagtgtgtatctattcgagaaattgacatgggtaaccaataacatatataattatgaattgttaaattgaatgAATATCAGTAATAT---CA---ATTCAATTTAGTTCTTAT-AAGGTTAA--A--AAAA-T-A--GAAGACTGG------------AAAAGGAATAG--GGATGCAATAGATGCATTTAGACAC--TAAGCAGGCTTGTTAC-AC---AACAATA---AAAAAA-GTT-AACCCGGTATGA--------TC-----AA----AATTGTTGTCATTAAAGTAACTGTTTACATA----TTCTAG-------ATAT-------CAAT---AT---TGATTTTGAATGTTTGTA--AATAGTT-T-A---AGAAA--------GCTTTTCGG-----TTTTATCA---TATTGGATATAACAATG-CTTTT-TATGAAGGATTTCTTAATTAGTACTCGGATTGAAATCTTTTTGAAGATTTAATAAACTCTTGTACAGCTTTAAATATTTTAGTA
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