lowQualScore                  :                                                                                 11                   1                                                                     11                                                                                                                                                        1111111111111111     1      22222222                                                   11111111                       222222222222222222222                                                                                                                                                                                                1111                       11               11                                                      4444444444444444444  111          111     11111    111   1                2222222222222   2222222222222        11     1    1111                                                             111                      2222                  333333333333333         2222222                                                            1111             1   1111                         1     222222222                     111        11111111    1         1111          
lowQualScore                  :             33         6     33           555 7  555  2                         00  2 8     1        4 2    666666 2        5555            1         5          2     1   33              5       4       7   33  66    1   2               9999999999   66 333       33    333     6 2 33  4       0          99999999  5  2 5     5555555555555555 0   4   77 88888888        33   22  7      33    55555 2 5555     2   00000000  5555             444 000000000000000000000            2  444     0  66 2    2        2   0   777777           2  2 2           5                     2 2          3            33  6666 5 2     555    0   44  0   4 33  2           2 8  9999  2    33 2   55       66   3   5       88                        99      44     66 7777        1111111111111111111  222    0   4 111     44444    555   0  5 66    66 55 3333333333333   0000000000000 777    33     5    2222   5  5     4     66             1                    777    555   777      55        1111         1        222222222222222 55      6666666                          1            33                   0000 9    777    1   7777               2         5     777777777  55   4   7         000  0     44444444    2      0  0000   6      
lowQualScore                  :             ..         .     ..           ... .  ...  .                         ..  . .     .        . .    ...... .        ....            .         .          .     .   ..              .       .       .   ..  ..    .   .               ..........   .. ...       ..    ...     . . ..  .       .          ........  .  . .     ................ .   .   .. ........        ..   ..  .      ..    ..... . ....     .   ........  ....             ... .....................            .  ...     .  .. .    .        .   .   ......           .  . .           .                     . .          .            ..  .... . .     ...    .   ..  .   . ..  .           . .  ....  .    .. .   ..       ..   .   .       ..                        ..      ..     .. ....        ...................  ...    .   . ...     .....    ...   .  . ..    .. .. .............   ............. ...    ..     .    ....   .  .     .     ..             .                    ...    ...   ...      ..        ....         .        ............... ..      .......                          .            ..                   .... .    ...    .   ....               .         .     .........  ..   .   .         ...  .     ........    .      .  ....   .      
lowQualScore                  :             33         3     44           000 1  111  5                         66  6 1     8        1 4    888888 4        0000            8         3          4     4   11              1       1       6   22  55    8   1               7777777777   66 999       11    999     5 4 22  7       5          11111111  0  5 0     6666666666666666 2   0   33 11111111        22   88  1      22    99999 4 0000     4   33333333  0000             444 666666666666666666666            4  111     8  55 4    4        5   4   222222           5  5 5           0                     7 7          1            99  1111 3 9     000    1   44  7   3 99  9           9 6  9999  9    77 7   00       55   1   7       88                        00      22     11 7777        3333333333333333333  777    6   0 000     55555    999   0  0 99    99 44 5555555555555   9999999999999 555    44     8    1111   0  0     5     11             1                    888    666   000      55        1111         0        999999999999999 55      6666666                          6            44                   9999 4    888    6   0000               5         0     999999999  55   0   6         888  5     00000000    8      4  6666   0      
consensus                     :  ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGT--GTCAGCATTTT--ATNGT--TAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNAATTGAANCTA--AA--TATATACAATTCAAGACTGATTAT----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT-ATACCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TT--T-AG-CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-TTGGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATTTGATTAGT-CAAAATANA----TGTTATAT---T--A---TGT------TT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTTT-GA-G--AGTT--T-TA--GG---------AAG--------GG--AGAAGTCATATTAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAA---ATTTACGTTGATTGTGAATA-----A-----CTTA--ATTAATCGT----TTTGTCTGGTTATACCGACATAGATANATAAATATTGGTTCTCCAATTGTCAAAAGTTGATTACGATTAT---TGTATATA----AAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--GTA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AGAC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( gi|1 )            :  ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGT--GTCAGCATTTT--ATTGT--TAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTAGGTAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTAT----------GGA-CT---AAATATA--TCTA---AAGAACA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTC---G---CA-A-A------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT-ATATCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TAT-ATATT---TCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TT--A-AG-CACC--T-TTTA-TTATAACGCTGA-TTGATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATTCGATTAGT-CAAAATAAA----TGTTATAT---T--A---TGG------TT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTTT-GA-G--AGTT--T-TA--GA---------AAG--------AG--AGAAATCATATTAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAA---CTTTACGTTGATTGTGAATA-----A-----ATGA--ATTAATCGA----TTTGTCTGGTTATACCGACATAGATAAATAAATATTGGTTCTCCAATTGTCAAAAGTTGATTGCGCTTAT---TATAAATA----AAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--GTA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AGACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|4                          :  ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGT--GTCAGCATTTT--ATTGT--TAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTTACAATTAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTAT----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGTAAT----------------------GA-A-TGTTA----------------GCACATTTT--A-----TT-CTGGTGTT--TTCC-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------CT----AATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACAT-ATATCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TT--T--G-CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-TTGGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATTTGATTAGT-CAAAATAAA----TGTTATAT---T--A---TGT------TT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTTT-TA-G--AGTT--T-TA--GG---------AAG--------GG--AGAAGTCATATTAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAA---ATTTACGTTGATTGTGAATA-----A-----CTTA--ATTAATCGT----TTTGTCTGGTTATACCGACATAGATAAATAAATATTGGTTCTCAAATTGTCAAAAGTTAATTACGCTTAT---CAGATATA----AAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--GTA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AGGCTAAAA-ATTA----CAGCGTAAC
gi|3                          :  ATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGT--GTCAGCATTTT--ATAGT--TAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTATAAAACTAACAATCAAAGCATAGTAGATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGACTAC----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---GAGAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGC--------AT-GA-A-TGTGA----------------ATACATTTT-AA-----T--ATGATGTT--TTCA-TT-AAAATA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTC---G---TA-G-A------AT----AATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAAT-ATACCAT------CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTG-A-TT--TTAG-CACC--T-TTTT-TCATAACAATGA-TTGGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATTTGATTAGT-CAAAATATA----TGTTATGT---A--A---TGT------TT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTTTTGC-G--AGTT--T-TA--GG---------AAG--------GG--AGAAGTCATATTAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAA---AGTTATGTTGTTTGTGAATT-----A-----CTTA--ATTAATAAT----TTTGTCTGGTTATACCGACATAGCTATATAAATATTGGTTTTCCAATTGTCAAAAATTGATGAAGATTAT---TGTTTATA----AAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--GTG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AAAC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|9                          :  ATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGT--GTCAGCATTTT--ATTGT--TAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTAAATAACTTACAATCAAAGCATATTTGATTAAATCTA--AA--TATACAAAAGTCAAGACTGATTAT----------GTA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------CT----GATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACAT-ATGTCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCG-A-TT--T-AG-CACC--T-TTTG-TTATAAC
gi|5                          : tACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAA--ATCAGCATTTT--CTTGTAGTGT-AGATTTT-------------AGGTCA-------TTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC----GATTCATTTGATGTTTG-----------CATATAATGATTTCAAATAACTTACACTCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGATTAT----------AGA-AT---AATTATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-----GATTT-CATATTGT--------AT-GA-A-TGTTT----------------ACACAGTTT--A-----TT-CTGGTGTT--TTCA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTT---G---TA-G-A------AT----AACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAC-ATACCAG------TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--GA----TGT-ATATT---TCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCC-A-TTTTA-A--CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-TTGGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATTTGATTAGT-CAAAACATA----TTTTATATAG-T--A---TGC------TTTG-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AG--ATGTTTAGA-GTCAGTT--T-TA--GG---------AAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT--TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATT--TATGCTAA---ATTAACGTTGAT-GTAAATA-----A-----CTTA--ACAAATAGT----TTTGTCTGGTAATACCGACATAGATAGATATATATTGGATTTCCAATTGTCAAAAGTTGATCAAGATAAT---AGTATATA----AAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AGAC--ACATATTT----CAGCGTAAaatg
gi|14                         :  ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGT--GTCAGCATTTT--CTAGT--AAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT----GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTAT----------AAA-TT---AAACATG--TCTA---GAGAATA-C--GT-TTGCAATGTCCACATTGT--------AC-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTC---G---TA-G-A------AT----TATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT-GTACTAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-t
gi|13                         :  ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGT--GTCAGCATTTT--CTAGT--AAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT----GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTAT----------AAA-TT---AAACATG--TCTA---GAGAATA-C--GT-TTGCAATGTCCACATTGT--------AC-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTC---G---TA-G-A------AT----TATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT-GTACTAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|27                         :  ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGT--ATCAGCATTTT--ATAAT--CATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCACGATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTAACTAGCTTA-AATCAAGGCATA
gi|2                          :  cTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGT--GTCAGCATTTT--AT-GT--TAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT----GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTAT----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGCAATCTTCATAGTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT--A-----TT-CTGGTGAT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-------------------------T----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT-ATATCAT------TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TT--T-AG-CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-TTGGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATTTGATAAGT-CAAAATAAA----TGTTATAT---T--A---TGT------TT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTTT-GA-G--AGTT--T-AA--GG---------AAG--------GG--AGACGTCATATTAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAA---ATTTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAATTTATAA--TTTGATCGT----TTTATCTGGTTATACCGAC----ATACATAAATATTGGTTCTCCAATTATCAAAAGTTGATTACGCTTAT---TATATATA----AAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--GTA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA-TA----GGAATAAAACATTA----CAGCGTAACAgt
gi|10                         :   TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGT--GTCAGCATTTT--ATTGT--TAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTAACAAACAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGATTAT----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------CT----AATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACGT-ATATCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-ATATT---TTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCG-A-TT--T-AG-CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-t
gi|16                         :   TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGT--GTCAGCATTTT--ATTGT--TAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATCGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGGTCAT----------GGA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TT-CAAATTTCATATTAT--------AT-GA-A-TATTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAATTA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AAC
gi|30                         :   TGCCGCGCATTGTT---TGCAAATTTTAAGTCAGTATTTT---CTAT--T-T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATT
gi|26                         :    GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GT--GCCAGCATTTT--ATAGT--AAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTAAATAAACAACAATCAAAGCATATTAAATTGAAtgaggtcatgttgg
gi|11                         :      CACACAT-ATTCAGTAAACATTGT--GTCAGCATTTT--ATAGT--AAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT----GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAAGGCATAGTAGATTAAAATTA--AG--TACATACAATTCAAGACCGATTAT----------AGA-TT---AAATATA--TCTA---GCGAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATAGAGC--------AT-GA-A-TGTGA----------------ATACA-TTT-TA------TTCTGATGCT--TTTG-TT-AAAGTA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTC---G---TA-G-A------AA----AATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAAT-ATACCAT------T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCAT--AA----TGT-TTA---------------------GTACATCAAGGGCTTTCG-ATTT--T-AG-CACC--T-Tac
gi|22                         :    gaCGCACAT-TGTCAGTATATATTGA--GTCAGCATTTT--CTAGT--AAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT----TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTTAATAACTAACAATCAAGGAATACCAAATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGACTGATTAT----------AAA-TT---AAATATA--TCTA---AAGAATA-A--GT-TTGTAA-TTTCATACTGatgtc
gi|32                         :            T-ACTCAGTAAATATGGA--GTCAGCATTTT--CTAGT--AAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTT
gi|8                          :                             T--GTCAGTATTTTCTATTAC--TGT-GTGTTTT-----GCGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT----GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCAAATAAGTGTTAATAAATACATATTTAATTGAA-CTA--TG--TACATACAGTTCAGGACTGATTAT----------AAA-TT---AAATGTA--TCAA---AGAAAAA-A--AA-TTGCAAGTTTCATATTGT--------ATAAA-A-TGTTA----------------AGATATTCT--------TTTCTGGTATT--TTAC-TT-TGATCG--TTTTCAAAGA-A----TTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACG--TA---G---CA-ACA------C-----A------GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACAT-ATGCCAT------TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCAT--AA----TGT-A-ATT---TTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAG-ATTT--T-AG-CACC--A-TTGA-TTATAAGAATGA-TTGTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATT--ATGAATATGATATGAACTTTTGTTACATGTAT--A---TAGACGT--TT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTTgg
gi|17                         :                                                        ttATTTTCTTTGACACTCGCAGATT-----------TTAGGTCATA-C-ATTT------T-AACGCTTT----GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGAATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATT-AAAACTAGTTATCAAACGTTCAAGA-CT---GATTAT------------GAAT--A--GTATTGCAAATTTCATATTGTTACAATTGGT-GAGA-TGTTATATTCCGTTATTTTTGATAGATTGT-TACATACTTGTTAGTGAT--TTTA-TT-TAAGCATGTTCT-----A-AAACTTGTGC-TCC----T---GT----TATTCAACGT
gi|6                          :                                                         ttttcagTTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT----GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCAAATAACTAACAATCAATGCATATTCAATTGAAACCA--AG--TATCTACAATTCAAGACTGATGAT----------AGA-TTAAAAAATATATTTCTA---GAAAATA-A--GT-TTACAATTTTTATATTGT--------AT-GA-A-TGTTT----------------AAACA-TTT-TA------TTCTGGTATT--TTCATTT-AAAGAA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTC---G---TA-G-A------AT----AATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACAT-ATACCAT------CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCAT--TA----TGT-TCATT---TACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTG-A-TT--T-AA-CAAC--T-TTTG-TTATGACATTGA-TTGGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTTTTAGTAGT-CTAAATATA----TGTTATAT---T--A---GAGAATGTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT---TTT-GT-G--AGAT--T-TAAGGAAGGAAGTTGAAG--------GA--AGAAGTCAT-TTAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAG--TGTGCTAA---ATTTACGTCGTTTGTGAATA-----A-----CTCA--AATAGT-----------TCT-----------------TAATTGAATATT------------GTCAAAAGTTGATTAAGATTAT---TGCACATA----AAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G------TT--ATT-TCACTTATACACCTATATAATTTAG--T----AGA--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACA
gi|21                         :                                                                                            TTTTGTTATACA-TTTT------A-AACGATTC----GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTAAATAAGTAACGATCAATGC--ACTTAGT---ATATA--CATTTGTATACAGTTTGGTACTGAATAT----------
gi|31                         :                                                                                                                                 ttttagcaaagttcatgtaagcattttcaagtaaatgtttttaaggtcaTAACAATTAATGCAAATTCAATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGAGTGATTAT----------GGA-CC---CAATATG--TATA---AAAAaaatcagtattgtcagttaaaatatcactgagtttaataaatcacaactttattcatgttttttaacaagttcaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                   AACAGTCAATGGATATCTAATAGACTC----AA--T--------TTCCGGACAGATT-------------GATCT---AA--------CAA---AAGAATA-A--TT-TGGCAATGTTT-TAAGGT--------AT-AA-AATGTTA----------------AG------T-TACC---TTTCTGATATC--TCC--------GCT--TTTT------------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCC---ATTTCA-----------T----AAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCAC-AAGCCAT------TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAGt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                         ATTAG----------AAA-AT---AAGTATA--TAAA---ATGAATGTACTGTGTTGCAATTTTCAGATTAT--------ATAAA-A-TGCTA----------------TGACG-TTT-CA------TTCTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCA--TTAT-----ATA----AATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCATAG---AA-A-AAAATACCTGTCAAATT-ATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGA-TTATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCG-TGCTT--AA----GCA-ATATT---TTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAA-TT--T-AG-CAAC--G-TTTA-TTGTAAGGT----TCGGTATTTAAA-TAATACAGA-TTTATTAGACAATATAATTTAT--AAAGT-------TATTGTAT---A--AAGCTGT------TT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCTT-AA-G--GGTT--T-----GA---------AA---------AT--AG---TC--GCTAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAA---ATTAAC-T---TTGTGAAAT-----A-----TTTA--ATT-ATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGATAGGTTGATACTGGCCTTCCAATTGTT--AAGTTAA-TACG--TATGAATATAAATGTATTAAAGG---GAAATT--AAGCTGGAC-TTTCTTAATA-T--TT--ACT-T--TTTATTTAc
gi|18                         :                                                                                                                                                       tcagagtttatataatagtagtgtaatacttcacatcgcttttacataaaatgtaattcatattttcaaatagtatccatatagtgatattaaataagtgttT---AAATATA--TATATATAGGAGTT-A--TT-TTGCCATATTTATATTGT--------TT-AA-AATGTTA----------------ACATATTTCATA--------CTGGTGTT--TTTA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGC---G---TA-G-C------AT----AATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCGT-ATACTAG------TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA---AA----TATCATATT---TCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAG-CTTT--C-AG-CACCGTT-TTTG-TTATacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taGTTA----------------AGCTATTTT-TA-----TT-CTGGTATT--TCCA-TTTAAAGTA--TGTT-----A-T----TAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTC---G---TAGA-A------CC----A-TTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAAT-ACACAGT------TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG---T-TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAAT--AATGTGTGT-ATATA---TCTT-AAC-AATACta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ------CC----AATATGTATAAA-AA---TA--TCAT--A-T----AACAACAT-ATATCAT------TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCAT--------TAT-GTAT--------------GT--ATTTACATCAAGGTCTTTCG-A-TT--T-AG-CACC--T-TTTG-TTATAACAATGA-TTGGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGTTGA-TGGT-CAAAATACA----TGTTATAT---
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gattatggacCTTTGATACATTTAA----TTT-ATAATCAGTCCTGAACT-GT--ATGTACAT--AG----TTCA-A-TT--A-AA-TATG--TATTTA-T--TAACACTTATTTGATAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttgtcagtattttctattactgtgtgttttgcgcttgcagattttaggtcattttggtgtaatacattttaaattttaatgctttgatatatttgatatttgaaaatattttctatgtaatggACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAG-C-TT--T-TGACACC--T-T------GTAACAATGA-CTGGTATATAAGT-AATCC-----------GGCAGT-------GT---GAATAAA----AGCT-T-T---T--A---------------A-GCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTTT-AACA--AGTTAATATA---A---------AAG--------AG---GTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCATA-----A-----TTTA--ATCAATTGT----TTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATaaaaaaaattgcaagtttcatattgtataaaatgttaagatattcttttctggtattttactttgatcgttttcaaagaatttatagtttattattaacgtagcaacacagtcaaataacattttaagaacatatgccattctaaaaataattactagacagtggatttgtataaatgtttgttttgacaggtgtctctttgttgcataatgtaattttataaacatatttttagatttagattttagcaccattgattataagaatgattgttatataaagtaatctgggttttatcagaaattatgaatatgatatgaacttttgttacatgtatatagacgtttagacctgaatgcgtgatacagttagttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-CTTAGTCATAACAATGA-TTGGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATTTCATTAGT-CTAAATATA----TGTTATAT---A--A---TGT------TTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTTT-GA-G--TGTT--T-TA--GG---------AAG--------GG--TAAGGTCAT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATG--TGTGCTAA---AGTTACGTTGATTGTGAATT-----ACT---ATTATTATTAATAGT----TTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGATAAATGAATATTGGT-------TTGT---GATTTGA---AGATTAT---TGTATATA----AAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--GTGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAGACAAAAACATTG----CAGCGTAACAgaactcgtactgttgttgttgttttttgggggtttttgtagttttttttaaaagttgatcaatataaatgtttgtaagaggaaatacattatatctttactttcatgttatttagttattcattcaacaacaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tataaataatagaatttgggtttttcataaTTA-TCGTTACAATAG-TTAGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATTCGTTTAA--CAAAAC-AA----TGGTATATA--TAAA---TGT------TT-T-GATTTGAACT---CGAGA--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACC--TGTGTCAA---ATTTACGTTGATTATGAATA-----A-----TTAA--ATAAACAGT----TTTGTCTTGTCATAC-GACATCGATATATAGATATTCGTTTACCAACTGCCAACAATTTATAACGATAAT---TGTATATA----AAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAAT-TTTGT--A-A-T--TTGAATTATCAACT-TTCAC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---TACATG--TGTGTTAA---ATTTACGTTGATTGTGAATT-----A-----CTTA--ATTAATCAT----TTTGTCTGGTTAAACCGACATAGATAAATAAATATTGGTTCTCCAATTGTCAAAAGTTCATTACGCTTAT---TATATATA----AAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AGACTTAAACATTA----CAGCGTAaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAATAGTGTAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AGACAAAAACA-TA----CAGCATAACA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                            1                      1111111                                                                                                                                                                                                1111111111111111     1      22222222                                                                                      1111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                2222222222222222222     111          111     11111                           1111111111     1111111111                                                                                          111                                            11111111                                                                    11111111         111111    111111111                                                                    2222222                                              22                      
lowQualScore                  :                                                                                       22         1                33  3  2  2                                     5        2 2    666666 2        1111111                      0                                    1       1       3   33  66        1               0  333  333       22    333 22 2     2 33  4                  88888888  2  2 7     4444444444444444     2   33 66666666        33    2  6      33    55555 2 4444     2   9999 333  4444               444   4444444444 4444            2  333     0  66 2    2       666666        2           2  2 2                                 2 2          2              6666   5         0   2 1     4 33              2 5   8  2    33                   3                                   3   3           5 7777        8888888888888888888 7   000        3 000     22222    7    4 4  4 66     66  9999999999   1 9999999999        1 99999          9999   4  4     2     55                                  777    444   666      55          666        0        22222222  55   99999   666  5                          7777  1     7777     33333333   1     000000    444444444           6666 5      666                       2           2   44 1111111  44   3             666         55 9999  66  00        9999          
lowQualScore                  :                                                                                       ..         .                ..  .  .  .                                     .        . .    ...... .        .......                      .                                    .       .       .   ..  ..        .               .  ...  ...       ..    ... .. .     . ..  .                  ........  .  . .     ................     .   .. ........        ..    .  .      ..    ..... . ....     .   .... ...  ....               ...   .......... ....            .  ...     .  .. .    .       ......        .           .  . .                                 . .          .              ....   .         .   . .     . ..              . .   .  .    ..                   .                                   .   .           . ....        ................... .   ...        . ...     .....    .    . .  . ..     ..  ..........   . ..........        . .....          ....   .  .     .     ..                                  ...    ...   ...      ..          ...        .        ........  ..   .....   ...  .                          ....  .     ....     ........   .     ......    .........           .... .      ...                       .           .   .. .......  ..   .             ...         .. ....  ..  ..        ....          
lowQualScore                  :                                                                                       66         0                22  3  6  4                                     2        6 1    111111 1        3333333                      2                                    0       0       8   11  11        4               2  777  555       99    777 99 1     2 11  4                  55555555  4  4 1     7777777777777777     7   77 44444444        11    2  7      11    66666 2 7777     2   4444 999  7777               111   2222222222 7777            2  999     2  11 2    2       888888        4           4  4 4                                 5 5          9              1111   7         1   3 1     3 99              9 7   6  9    99                   3                                   3   3           4 1111        8888888888888888888 3   666        6 000     11111    2    0 4  4 11     77  4444444444   1 4444444444        9 44444          8888   4  4     9     55                                  000    000   444      00          444        1        33333333  00   11111   444  1                          7777  0     7777     22222222   8     555555    555555555           8888 1      444                       5           5   66 1111111  66   3             444         22 4444  11  00        4444          
consensus                     :                                                                            ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTT--ATNGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACTA--AA--TATATACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGT---AGA---------NT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACA------TATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( family-6174 )     :                                                                            ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTT--ATNGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNAATTGAANCTA--AA--TATATACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGT---AGA---------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACA------TATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
gi|1                          :                                                                            ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTT--ATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTAGGTAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---CT---AAATATA--TCTA---A--A-GAACA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGC---AAA---------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACA------TATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TAT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TTA-AG-CACC--TTTTATTATAACGCTGATT-GATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATT-CGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-GTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------AAAGA----------GAGAAATCAT-AT--TAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAACT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAA--TGA--A--TTA---ATCGATTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TGCGCTTAT---TATAAATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AG--ACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|10                         :                                                                             TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGTGTCAGCATTTT--ATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTAACAAACAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTCGT---AGA---------CT----AATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACG------TATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGA
gi|11                         :                                                                                CACACAT-ATTCAGTAAACATTGTGTCAGCATTTT--ATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAAGGCATAGTAGATTAAAATTA--AG--TACATACAATTCAAGACCGATTATAGA---TT---AAATATA--TCTA---G--C-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATAGAGC--------AT-GA-A-TGTGA----------------ATACA-TTT-TA------TTCTGATGCT--TTTG-TT-AAAGTA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGT---AGA---------AA----AATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAA------TATACCAT-T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-TTA------------------GTACATCAAGGGCTTTCG-ATTTT-AG-CACC--TTATGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gaTTAGTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TCATTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--A-----A---T------G-TTTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTT-T-GA-G--TGTTT-TAG----------GAAGG----------GTAAGGTC---AT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATG--TGTGCTAAAG---TTACGTTGATTGTGAAT-------TACTATTATTA--TTA---ATAGTTTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGA----TAAATGAA----TATTG--------GT-------------TTGT------------GATTTGA-----A-GATTAT---TGTATATAAAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--G-TGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAG--ACAAAAACATTG----CAGCGTAACAc
gi|13                         :                                            tataaataatagaatttgggtttttcataatcATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTT--CTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTATAAA---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATA-C--GT-TTGCAATGTCCACATTGT--------AC-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGT---AGA---------AT----TATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGA------TGTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|14                         :                                                                            ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTT--CTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTATAAA---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATA-C--GT-TTGCAATGTCCACATTGT--------AC-GA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGT---AGA---------AT----TATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGA------TGTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAG-C-TTT-TGACACC--TT-----GTAACAATGACT-GGTATATAAG-TAATCC-----------GGCAGTG-TGA---------ATAAA----AGCT-------------------------TTT-AAGCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTT-T-AACA--AGTTAATAT----------AAA-------------AGAGGTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCAT-------AAT--TTA--A--TCA---ATTGTTTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATGAACTCGTACTGTTGTTGTTGTTTTTTGGGGGTTTTTGTAGTTTTTTTTAAAAGTTGAT---CAATATAAA---TGTTTGTAAGAGGAAATACATTATATCTT-TACTTTCAT--GTTA-T--TT--AGT-T-ATTCATTCA
gi|16                         :                                                                             TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTT--ATTGTTAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATCGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGGTCATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TT-CAAATTTCATATTAT--------AT-GA-A-TATTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAATTA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGT---AGA---------CT----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACacaacaa
gi|17                         :                                                                                                                                ATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTTAGGTCAT---------ACA----TTT------T-AACGCTTT-------GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGAATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATT-AAAACTAGTTATCAAACGTT---CAAGA-----CTG---ATTATGAAT--A--GTATTGCAAATTTCATATTGTTACAATTGGT-GAGA-TGTTATATTCCGTTATTTTTGATAGATTGT-TACATACTTGTTAGTGAT--TTTA-TT-TAAGCATGTTCT-----A-AAACTTGTGC-TCC----T---GT----TATTCAACGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttcagT---AAATATA--TATATATA--G-GAGTT-A--TT-TTGCCATATTTATATTGT--------TT-AA-AATGTTA----------------ACATATTTCATA--------CTGGTGTT--TTTA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGCGT---AGC---------AT----AATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCG------TATACTAG-TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA-AA----TATCATATTTCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAG-C-TTTCAG-CACCGTTTTTGTTAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ta---------CC----AATATGTATAAA-AA---TA--TCAT--A-T----AACAACA------TATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCATTA----TGT-ATGT---------------ATTTACATCAAGGTCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGT-TGA-TGGTCAAAATACA----TGTTATAT--ta
gi|2                          :                                                                   gattatggacTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTT--AT-GTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGCAATCTTCATAGTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT--A-----TT-CTGGTGAT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-----------------------T----AATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACA------TATATCAT-TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATAAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-AAG----------GAAGG----------GAGACGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAAAT---TTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAAT--TTAT-AATTTG---ATCGTTTTATCTGGTTATACCGAC----A----TACATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTAT---------CAAAAGTTGAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA--T----AGGAAT-AAAACATTA----CAGCGTAACAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACC--TGTGTCAAAT---TTACGTTGATTATGAAT-------AAT--TAA--A--TAA---ACAGTTTTGTCTTGTCATAC-GACATCGA----TATATAGA----TATTC--------GTTTACCAA------CTGC---------CAACAATTTAT---AACGATAAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAATTT-TGT--A--A-T--TTGAATTATCAACT-TTCACt
gi|21                         :                                                                                                                                                     TTTAAGGTCATTTT---GTTATACA-TTTT------A-AACGATTC-------GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTAAATAAGTAACGATCAATGC--ACTTAGT---ATATA--CATTTGTATACAGTTTGGTACTGAATATAAA---TC---Aaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|22                         :                                         ttttagcaaagttcatgtaagcattttcaagtaaatgttCGCACAT-TGTCAGTATATATTGAGTCAGCATTTT--CTAGTAAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT-------TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTTAATAACTAACAATCAAGGAATACCAAATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGACTGATTATAAA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGTAA-TTTCATACTGgtattgtcagttaaaatatcactgagtttaataaatcacaactttattcatgttttttaacaagttcaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTA----------------AGCTATTTT-TA-----TT-CTGGTATT--TCCA-TTTAAAGTA--TGTT-----A-T----TAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTCGT---AGA---------AC----CATTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAA------TACACAGT-TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG-T---TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAATAATGTGTGT-ATATATCTT-AAC-AATAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                            AACAGTCAATGGATATCTAATAGA--CTC--AA--T--------TTCCGGACAGATT---GA---TC---TAACA-------A---A--A-GAATA-A--TT-TGGCAATGTTT-TAAGGT--------AT-AA-AATGTTA----------------AG------T-TACC---TTTCTGATATC--TCC--------GCT--TTTT------------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCCATTTCA------------T----AAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCA------CAAGCCAT-TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TACATG--TGTGTTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATCATTTTGTCTGGTTAAACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTCAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA-----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACTTAAACATTA----CAGCGTAc
gi|26                         :                                                                              GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GTGCCAGCATTTT--ATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTAAATAAACAACAATCAAAGCATATTAAATTGAAAC
gi|27                         :                                                                            ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGTATCAGCATTTT--ATAATCATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCAC---GATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTAACTAGCTTA-AATCAAGGCATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AG--ACAAAAACA-TA----CAGCATAACAgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatagtgcgtttccacgttatatatattctataggtgatatgaaaatagtgtTTATCGTTACAATAGTT-AGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATT-CGTTTAA-CAAAACA-A----TGGTATATA-TAA---A---T------G-TTT-T-GATTTGAACT---CGAGA--c
gi|3                          :                                                                           gATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGTGTCAGCATTTT--ATAGTTAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTATAAAACTAACAATCAAAGCATAGTAGATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGACTACGGA---TT---AAATATA--TCTA---G--A-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGC--------AT-GA-A-TGTGA----------------ATACATTTT-AA-----T--ATGATGTT--TTCA-TT-AAAATA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTCGT---AGA---------AT----AATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAA------TATACCAT-CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTG-A-TTTTAG-CACC--TTTTTTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATATA----TGTTATGT--A-----A---T------G-TTT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTT-TTGC-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAAAG---TTATGTTGTTTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATAATTTTGTCTGGTTATACCGACATAGC----TATATAAA----TATTG--------GTTTTCCAA------TTGT---------CAAAAATTGAT---GAAGATTAT---TGTTTATAAAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--G-TG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AA--AC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|30                         :                                                                             TGCCGCGCATTGTTT-GCAAATTTTAAGTCAGTATTTT--CTA-TT-T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATTTGAGGTCATGTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                           TAACAATTAATGCAAATTCAATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGAGTGATTATGGA---CC---CAATATG--TATA---A--A-AAgg
gi|32                         :                                                                                      T-ACTCAGTAAATATGGAGTCAGCATTTT--CTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTTt
gi|4                          :                                                                            ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGTGTCAGCATTTT--ATTGTTAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTTACAATTAAAGCATATTTGATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGTAAT----------------------GA-A-TGTTA----------------GCACATTTT--A-----TT-CTGGTGTT--TTCC-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGT---AGA---------CT----AATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACA------TATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCG-A-TTT--G-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTT-T-TA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATG--TGTGCTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCAAA------TTGT---------CAAAAGTTAAT---TACGCTTAT---CAGATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--GC-TAAAAATTA----CAGCGTAACgg
gi|5                          :                                                                            ACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAAATCAGCATTTT--CTTGTAGT-------------------GTAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC-------GATTCATTTGAT-----------GTTTGCATATAATGATTTCAAATAACTTACACTCAATGCATATTAAATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGATTATAGA---AT---AATTATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-----GATTT-CATATTGT--------AT-GA-A-TGTTT----------------ACACAGTTT--A-----TT-CTGGTGTT--TTCA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTTGT---AGA---------AT----AACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACA------CATACCAG-TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATGA----TGT-ATATTTCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCC-A-TTTTAA-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATT-TGATTAGTCAAAACATA----TTTTATATAGT-----A---T------GCTTT-G-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AGAT-GTTT-A-GA-GTCAGTTT-TAG----------GAAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT-----TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATT--TATGCTAAAT---TAACGTTGAT-GTAAAT-------AAC--TTA--A--CAA---ATAGTTTTGTCTGGTAATACCGACATAGA----TAGATATA----TATTG--------GATTTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---CAAGATAAT---AGTATATAAAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AG--AC--ACATATTT----CAGCGTAA
gi|6                          :                                                                                                                                      TTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT-------GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCAAATAACTAACAATCAATGCATATTCAATTGAAACCA--AG--TATCTACAATTCAAGACTGATGATAGA---TTAAAAAATATATTTCTA---G--A-AAATA-A--GT-TTACAATTTTTATATTGT--------AT-GA-A-TGTTT----------------AAACA-TTT-TA------TTCTGGTATT--TTCATTT-AAAGAA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTCGT---AGA---------AT----AATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACA------TATACCAT-CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCATTA----TGT-TCATTTACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTG-A-TTT-AA-CAAC--TTTTGTTATGACATTGATT-GGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTT-TTAGTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--TAGAGAA---T------GTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT--TTTGT-GA-G--A-TTT-AAGGAAGGAAGTTGAAGG----------AAGAAGTCAT--T--TAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAG--TGTGCTAAAT---TTACGTCGTTTGTGAAT-------AAC--TCA-------A---ATAGTTCT-------------------------TAATTGAA----TATTG--------------------------T---------CAAAAGTTGAT---TAAGATTAT---TGCACATAAAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G-------TT--ATT-TCACTTATACACCTATA-TAATTTA-GT----AG--A--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACAt
gi|7                          :                                                                                                                                                                    GTGTAATA-C-TTCA------C-ATCGCTTTTACATAAAATGTAATTCATATTTTCAAATAGTATCCATATAGTGATATTAAATAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcagagtttatataatagtaATTAGAAA---AT---AAGTATA--TAAA---A--T-GAATGTACTGTGTTGCAATTTTCAGATTAT--------ATAAA-A-TGCTA----------------TGACG-TTT-CA------TTCTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCA--TTAT-----ATA----AATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCAT---AGAAAAAAATACCTGTCAAATT-ATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGA-TTATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCG-TGCTTAA-----GCAATATTTTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAA-TTT-AG-CAAC--GTTTATTGTAA----GGTTCGGTATTT-AAATAATACAGA-TTTATTAGACAATA-TAATTTAT-AAAGT-------TATTGTAT--A-----AAGCT------G-TTT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCT-T-AA-G--GGTTT--------------GAA-------------AATAGTC---GC--TAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAAAT---TAAC-T---TTGTGAAA-------TAT--TTA--A--TTATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGA----TAGGTTGA----TACTG--------GCCTTCCAA------TTGT---------T--AAGTTAATACGTATGAATATAAATGTAT-TAAAGG----GAAATT--AAGCTGGACTT-TCTTAA-TA-T--TT--ACT-Tgtgttattagaaaataagtatataaaatgaatgtactgtgttgcaattttcagattatataaaatgctatgacgtttcattctggtatttcttcttaaagcattatataaatatttacgtcgtctcatagaaaaaaatacctgtcaaattatgtcaaatcaacttgcattttaacaacatgatattatacaatattttgaaataatttaacagacggcagattatataaatggttattttgacagatgttatcgtgcttaagcaatattttcttaacggttacattttaaaggttttcgaatttagcaacgtttattgtaaggttcggtatttaaataatacagatttattagacaatataatttataaagttattgtataaagctgttttgacttgaatacaagatggagttaatcttaagggtttgaaaatagtcgctagaagggaagcaaaaatgtgtccacagtgattattcataccgaatttccgaagatacataaatatgtctgttctaaattaactttgtgaaatatttaattattgataactttgactggttatacaaatatagataggttgatactggccttccaattgttaagttaatacgtatgaatataaatgtattaaagggaaattaagctggactttcttaatatttactttttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|8                          : tcagagtttatataatagtagtgtaatacttcacatcgcttttacataaaatgtaattcatattttcaaatagtatccatatagtgatattaaataagtgttTGTCAGTATTTTCTATTACTGT-GTGTTTT-----GCGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT-------GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCAAATAAGTGTTAATAAATACATATTTAATTGAA-CTA--TG--TACATACAGTTCAGGACTGATTATAAA---TT---AAATGTA--TCAA---A--G-AAAAA-A--AA-TTGCAAGTTTCATATTGT--------AT-AA-AATGTTA----------------AGATATTCT-T-------TTCTGGTATT--TTAC-TT-TGATCG--TTTTCAAAGA-A----TTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACGT--------AG-----------C----AACACA-GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACA------TATGCCAT-TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCATAA----TGT-A-ATTTTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAG-ATTTT-AG-CACC--ATTGATTATAAGAATGATT-GTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATTATGAATA--TGATATGAACTTTTGTTACATG-T-----A---TATAGACG-TTT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTT-tttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|9                          :                                                                          ttATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTT--ATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTAAATAACTTACAATCAAAGCATATTTGATTAAATCTA--AA--TATACAAAAGTCAAGACTGATTATGTA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATA-A--GT-TTGCAATTTTCATATTGT--------AT-GA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA------TTCTGGTGTT--TTCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTCGT---AGA---------CT----GATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACA------TATGTCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-ATATTTCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCG-A-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               1                      1111111                                                                                                                                                                                             1111111111111111     1      22222222                                                                                   1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                            2222222222222222222     111          111     11111                           1111111111     1111111111          11111                                                                           111                                            11111111                                                                    11111111         111111    111111111                                                                    2222222                                              22                      
lowQualScore                  :                                            22         1                1 3  3  2                                     3        2 2    666666 2        1111111                      0                                    1       1 2      1   22  22        0               0  333  333       22    333 22 2        4                  88888888    2 9     4444444444444444     0   55 66666666         33   2  6      33    55555 2 4444     2   9999 333  4444                  3333333333333             2  444        66 2    2        666666       2           2  2 2                                 2 2          2              6666   2 2        0   2 1     4 33               8   8  2    33                   3          3            0           3   3           5 7777        8888888888888888888 7   000        3 000     22222    7    4 4  4 66     66  9999999999   1 9999999999          44444          9999   4  4     2     55                                  777    444   666          55      666        0        22222222  55   99999   666  1                          7777  1     7777     33333333   1     000000    444444444           6666 5      666                       2           2   44 1111111  44   3             666         55 9999  66  00        9999          
lowQualScore                  :                                            ..         .                . .  .  .                                     .        . .    ...... .        .......                      .                                    .       . .      .   ..  ..        .               .  ...  ...       ..    ... .. .        .                  ........    . .     ................     .   .. ........         ..   .  .      ..    ..... . ....     .   .... ...  ....                  .............             .  ...        .. .    .        ......       .           .  . .                                 . .          .              ....   . .        .   . .     . ..               .   .  .    ..                   .          .            .           .   .           . ....        ................... .   ...        . ...     .....    .    . .  . ..     ..  ..........   . ..........          .....          ....   .  .     .     ..                                  ...    ...   ...          ..      ...        .        ........  ..   .....   ...  .                          ....  .     ....     ........   .     ......    .........           .... .      ...                       .           .   .. .......  ..   .             ...         .. ....  ..  ..        ....          
lowQualScore                  :                                            66         0                7 2  2  2                                     5        6 1    111111 1        3333333                      2                                    0       0 0      2   99  99        9               7  777  555       99    777 99 1        4                  55555555    4 4     7777777777777777     0   66 44444444         11   2  7      11    66666 2 7777     2   4444 999  7777                  9999999999999             4  111        55 4    2        888888       4           4  4 4                                 5 5          9              1111   9 9        1   3 1     3 99               6   6  9    99                   3          8            5           3   3           4 1111        8888888888888888888 3   666        6 000     11111    2    0 4  4 11     77  4444444444   1 4444444444          22222          8888   4  4     9     55                                  000    000   444          00      444        1        33333333  00   11111   444  0                          7777  0     7777     22222222   8     555555    555555555           8888 1      444                       5           5   66 1111111  66   3             444         22 4444  11  00        4444          
consensus                     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNG-ATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( family-6174 )     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATNGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNG-ATTGAAACTA--AA--TATATACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAN------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
gi|1                          :                                 ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTAGGTAACTAACAATCAAAGCATATTTG-ATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---CT---AAATATA--TCTA---A--A-GAACAAGT-TTGCAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGCAAAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TAT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTA-AG-CACC--TTTTATTATAACGCTGATT-GATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATT-CGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-GTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------AAAGA----------GAGAAATCAT-AT--TAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAACT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAA--TGA--A--TTA---ATCGATTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TGCGCTTAT---TATAAATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AG--ACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|10                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTAACAAACAAAGCATATTTG-ATTGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACGT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGA
gi|11                         :                                     CACACAT-ATTCAGTAAACATTGTGTCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAAGGCATAGTAG-ATTAAAATTA--AG--TACATACAATTCAAGACCGATTATAGA---TT---AAATATA--TCTA---G--C-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATAGAGC--------ATGA-A-TGTGA----------------ATACA-TTT-TA------TTCTGATGCTT--TTG-TT-AAAGTA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------AAATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAAT------ATACCAT-T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-T-TA------------------GTACATCAAGGGCTTTCGATTTT-AG-CACC--TTATGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaTTAGTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TCATTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--A-----A---T------G-TTTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTT-T-GA-G--TGTTT-TAG----------GAAGG----------GTAAGGTC---AT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTACGTTGATTGTGAAT-------TACTATTATTA--TTA---ATAGTTTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGA----TAAATGAA----TATTG--------GT-------------TTGT------------GATTTGA-----A-GATTAT---TGTATATAAAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--G-TGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAG--ACAAAAACATTG----CAGCGTAACAc
gi|13                         : tataaataatagaatttgggtttttcataatcATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAA-ATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTATAAA---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTGCAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|14                         :                                 ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAA-ATTGAAACTA--AG--TATATACATTTGAAGATTGGTTATAAA---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTGCAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAGC-TTT-TGACACC--TT-----GTAACAATGACT-GGTATATAAG-TAATCC-----------GGCAGTG-TGA---------ATAAA----AGCT-------------------------TTT-AAGCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTT-T-AACA--AGTTAATAT----------AAA-------------AGAGGTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCAT-------AAT--TTA--A--TCA---ATTGTTTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATGAACTCGTACTGTTGTTGTTGTTTTTTGGGGGTTTTTGTAGTTTTTTTTAAAAGTTGAT---CAATATAAA---TGTTTGTAAGAGGAAATACATTATATCTT-TACTTTCAT--GTTA-T--TT--AGT-T-ATTCATTCA
gi|16                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTG-ATCGAATCTA--AA--TATACACATTTCAAGACTGGTCATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TT-CAAATTTCATATTAT--------ATGA-A-TATTA----------------ACACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAATTA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACacaacaa
gi|17                         :                                                                                   ATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTTAGGTCAT---------ACA----TTT------T-AACGCTTT-------GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGA-ATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATT-AAAACTAGTTATCAAACGTT---CAAGA-----CTG---ATTATGAAT-AGTATTGCAAATTTCATATTGTTACAATTGGTGAGA-TGTTATATTCCGTTATTTTTGATAGATTGT-TACATACTTGTTAGTGATT--TTA-TT-TAAGCATGTTCT-----A-AAACTTGTGC-TCC----T---GT----TATTCAACGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttcagT---AAATATA--TATATATA--G-GAGTTATT-TTGCCATATTTATATTGT--------TTAA-AATGTTA----------------ACATATTTCATA--------CTGGTGTTT--TTA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGCGTAGCA------------TAATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCGT------ATACTAG-TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA-AA----TATCA-TATTTCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAGC-TTTCAG-CACCGTTTTTGTTAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCATTA----TGT-A-TGT---------------ATTTACATCAAGGTCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGT-TGA-TGGTCAAAATACA----TGTTATAT--ta
gi|2                          : gattatggacccaatatgtataaaaatatcataTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTAT-GTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTG-ATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGCAATCTTCATAGTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACATTTT--A-----TT-CTGGTGATT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-----------------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATAAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-AAG----------GAAGG----------GAGACGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAAT--TTAT-AATTTG---ATCGTTTTATCTGGTTATACCGAC----A----TACATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTAT---------CAAAAGTTGAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA--T----AGGAAT-AAAACATTA----CAGCGTAACAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACCTGTG--TCAAAT---TTACGTTGATTATGAAT-------AAT--TAA--A--TAA---ACAGTTTTGTCTTGTCATAC-GACATCGA----TATATAGA----TATTC--------GTTTACCAA------CTGC---------CAACAATTTAT---AACGATAAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAATTT-TGT--A--A-T--TTGAATTATCAACT-TTCACt
gi|21                         :                                              TTTAGCAAAGTTCATGTAAGCATTTTCAAGTAA--ATGTTTT------------------TAAGGTCATTTT---GTTATACA-TTTT------A-AACGATTC-------GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTAAATAAGTAACGATCAATGCAC-TTAGTATATACATT-------TGTATACAGTTTGGTACTGAATATAAA---TC---Aaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|22                         :                                    tCGCACAT-TGTCAGTATATATTGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT-------TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTTAATAACTAACAATCAAGGAATACCAA-ATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGACTGATTATAAA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGTAA-TTTCATACTGgtattgtcagttaaaatatcactgagtttaataaatcacaactttattcatgttttttaacaagttcaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTA----------------AGCTATTTT-TA-----TT-CTGGTATTT--CCA-TTTAAAGTA--TGTT-----A-T----TAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTCGTAGAA------------CCATTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAAT------ACACAGT-TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG-T---TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAATAATGTGTGT-A-TATATCTT-AAC-AATAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                               AACAGTCAATGGATATCTA-AT--AGACTC--AA--T--------TTCCGGACAGATT---GA---TC---TAACA-------A---A--A-GAATAATT-TGGCAATGTTT-TAAGGT--------ATAA-AATGTTA----------------AG------T-TACC---TTTCTGATATCT--CC--------GCT--TTTT------------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCCATTTCA------------TAAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCAC------AAGCCAT-TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---TACATGTGTG--TTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATCATTTTGTCTGGTTAAACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTCAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA-----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACTTAAACATTA----CAGCGTAc
gi|26                         :                                   GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GTGCCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTAAATAAACAACAATCAAAGCATATTAA-ATTGAAAC
gi|27                         :                                 ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGTATCAGCATTTTATAATCATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCAC---GATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTAACTAGCTTA-AATCAAGGCATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AG--ACAAAAACA-TA----CAGCATAACAgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatagtgcgtttccacgttatatatattctataggtgatatgaaaatagtgtTTATCGTTACAATAGTT-AGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATT-CGTTTAA-CAAAACA-A----TGGTATATA-TAA---A---T------G-TTT-T-GATTTGAACT---CGAGA--c
gi|3                          :                                gATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTATAGTTAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTATAAAACTAACAATCAAAGCATAGTAG-ATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGACTACGGA---TT---AAATATA--TCTA---G--A-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATATTGC--------ATGA-A-TGTGA----------------ATACATTTT-AA-----T--ATGATGTTT--TCA-TT-AAAATA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAAT------ATACCAT-CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTGA-TTTTAG-CACC--TTTTTTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATATA----TGTTATGT--A-----A---T------G-TTT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTT-TTGC-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTATGTTGTTTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATAATTTTGTCTGGTTATACCGACATAGC----TATATAAA----TATTG--------GTTTTCCAA------TTGT---------CAAAAATTGAT---GAAGATTAT---TGTTTATAAAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--G-TG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AA--AC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|30                         :                                  TGCCGCGCATTGTTT-GCAAATTTTAAGTCAGTATTTTCTATT--T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATTTGAGGTCATGTTGG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                              TAACAATTAATGCAAATTCA-ATTGAAACTA--AG--TATATACAATTCAAGAGTGATTATGGA---CC---CAATATG--TATA---A--A-AA
gi|32                         :                                           T-ACTCAGTAAATATGGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTTGGt
gi|4                          :                                 ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTTACAATTAAAGCATATTTG-ATTGAATCTA--AA--TATACACAATTCAAGACTGATTATGGA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGTAAT---------------------GA-A-TGTTA----------------GCACATTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCC-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT--G-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTT-T-TA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCAAA------TTGT---------CAAAAGTTAAT---TACGCTTAT---CAGATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--GC-TAAAAATTA----CAGCGTAAC
gi|5                          :                                 ACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAAATCAGCATTTTCTTGTAGT-------------------GTAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC-------GATTCATTTGAT-----------GTTTGCATATAATGATTTCAAATAACTTACACTCAATGCATATTAA-ATTGAAACTA--AA--TATATACAGTTCAAGACTGATTATAGA---AT---AATTATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-----GATTT-CATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------ACACAGTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTTGTAGAA------------TAACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAC------ATACCAG-TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATGA----TGT-A-TATTTCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCCA-TTTTAA-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATT-TGATTAGTCAAAACATA----TTTTATATAGT-----A---T------GCTTT-G-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AGAT-GTTT-A-GA-GTCAGTTT-TAG----------GAAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT-----TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATTTATG--CTAAAT---TAACGTTGAT-GTAAAT-------AAC--TTA--A--CAA---ATAGTTTTGTCTGGTAATACCGACATAGA----TAGATATA----TATTG--------GATTTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---CAAGATAAT---AGTATATAAAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AG--AC--ACATATTT----CAGCGTAA
gi|6                          :                                                                                         TTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT-------GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCAAATAACTAACAATCAATGCATATTCA-ATTGAAACCA--AG--TATCTACAATTCAAGACTGATGATAGA---TTAAAAAATATATTTCTA---G--A-AAATAAGT-TTACAATTTTTATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------AAACA-TTT-TA------TTCTGGTATTT--TCATTT-AAAGAA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACAT------ATACCAT-CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCATTA----TGT-T-CATTTACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTGA-TTT-AA-CAAC--TTTTGTTATGACATTGATT-GGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTT-TTAGTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--TAGAGAA---T------GTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT--TTTGT-GA-G--A-TTT-AAGGAAGGAAGTTGAAGG----------AAGAAGTCAT--T--TAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAGTGTG--CTAAAT---TTACGTCGTTTGTGAAT-------AAC--TCA-------A---ATAGTTCT-------------------------TAATTGAA----TATT--------------------------GT---------CAAAAGTTGAT---TAAGATTAT---TGCACATAAAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G-------TT--ATT-TCACTTATACACCTATA-TAATTTA-GT----AG--A--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACAt
gi|7                          :                                                                                                                     TAGTGTAATA-C-TTCA------C-ATCGCTTTTACATAAAATGTAATTCATATTTTCAAATAGTATCCATATAGTGATATTA----------AATAAGTGT-TATTAG-A---AAA-TA--AG--TATATAAAA----------------------T---GAATGTA---CT---------------GTGTTGCAATTTTCAGATTAT--------ATAA-AATGCTA----------------TGACGTTTC--A-----TT-CTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCA--TTAT-----ATA----AATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCATAGAAAAAAATACCTGTCAAATTATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGATT-ATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCGT-GCTTAA-----GC-AATATTTTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAATTT-AG-CAAC--GTTTATTGTAA----GGTTCGGTATTTAAA-TAATACAGATTT-ATTAGACAATA-TAATTTAT-AAAGT-------TATTGTAT--A-----AAGCT------G-TTT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCT-T-AA-G--GGTTT--------------GAA-------------AATAGTCGC-----TAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAAAT---TAAC--T--TTGTGAAA-------TAT--TTA--A--TTATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGA----TAGGTTGA----TACTG--------GCCTTCCAA------TTGT---------T--AAGTTAATACGTATGAATATAAATGTAT-TAAAGG----GAAATT--AAGCTGGACTT-TCTTAA-TA-T--TT--ACT-T
gi|8                          :                                          tcagagtttatataatagTGTCAGTATTTTCTATTACT-GTGTGTT--TTG-CGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT-------GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCAAATAAGTGTTAATAAATACATATTTA-ATTGAA-CTA--TG--TACATACAGTTCAGGACTGATTATAAA---TT---AAATGTA--TCAA---A--G-AAAAAAAA-TTGCAAGTTTCATATTGT--------ATAA-AATGTTA----------------AGATATTCT-T-------TTCTGGTATTT--TAC-TT-TGATCG--TTTTCAAAGA-A----TTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACGT-------AG------------CAACACA-GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACAT------ATGCCAT-TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCATAA----TGT-A--ATTTTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAGATTTT-AG-CACC--ATTGATTATAAGAATGATT-GTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATTATGAATA--TGATATGAACTTTTGTTACATG-T-----A---TATAGACG-TTT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTT-tttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|9                          :                               ttATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTAAATAACTTACAATCAAAGCATATTTG-ATTAAATCTA--AA--TATACAAAAGTCAAGACTGATTATGTA---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTGCAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------ACACATTTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTCGTAGAC------------TGATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACAT------ATGTCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               1                      1111111                                                                                                                                                                                               1111111111111111          1      22222222                                                                                   1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                            2222222222222222222     111          111     11111                           1111111111     1111111111          11111                                                                           111                                            11111111                                                                    11111111         111111    111111111                                                                    2222222                                              22                      
lowQualScore                  :                                            22         1                1 2  3  2                                     3        2 2    666666 2        1111111                      0                                    1       1       1  4444           0  2               2 333  333       22    333 22 2        6   2               88888888    2 8     3333333333333333 55555    0   44 44444444         22  22  6      33    55555 2 4444     2   9999 333  4444                  2222222222222             2  444        66 2    2        666666       2           2  2 2                                 2 2          2              6666   2 2        0   2 1     4 33               8   8  2    33                   3          3            0           3   3           5 7777        8888888888888888888 7   000        3 000     22222    7    4 4  4 66     66  9999999999   1 9999999999          44444          9999   4  4     2     55                                  777    444   666          55      666        0        22222222  55   99999   666  1                          7777  1     7777     33333333   1     000000    444444444           6666 5      666                       2           2   44 1111111  44   3             666         55 9999  66  00        9999          
lowQualScore                  :                                            ..         .                . .  .  .                                     .        . .    ...... .        .......                      .                                    .       .       .  ....           .  .               . ...  ...       ..    ... .. .        .   .               ........    . .     ................ .....    .   .. ........         ..  ..  .      ..    ..... . ....     .   .... ...  ....                  .............             .  ...        .. .    .        ......       .           .  . .                                 . .          .              ....   . .        .   . .     . ..               .   .  .    ..                   .          .            .           .   .           . ....        ................... .   ...        . ...     .....    .    . .  . ..     ..  ..........   . ..........          .....          ....   .  .     .     ..                                  ...    ...   ...          ..      ...        .        ........  ..   .....   ...  .                          ....  .     ....     ........   .     ......    .........           .... .      ...                       .           .   .. .......  ..   .             ...         .. ....  ..  ..        ....          
lowQualScore                  :                                            66         0                7 4  2  2                                     5        6 1    111111 1        3333333                      2                                    7       7       2  5555           2  1               1 777  555       88    555 88 0        3   1               11111111    2 9     9999999999999999 33333    4   88 44444444         99  88  3      11    66666 2 7777     2   4444 999  7777                  4444444444444             4  111        55 4    2        888888       4           4  4 4                                 5 5          9              1111   9 9        1   3 1     3 99               6   6  9    99                   3          8            5           3   3           4 1111        8888888888888888888 3   666        6 000     11111    2    0 4  4 11     77  4444444444   1 4444444444          22222          8888   4  4     9     55                                  000    000   444          00      444        1        33333333  00   11111   444  0                          7777  0     7777     22222222   8     555555    555555555           8888 1      444                       5           5   66 1111111  66   3             444         22 4444  11  00        4444          
consensus                     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( family-6174 )     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
gi|1                          :                                 ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTAGGTAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---CT---AAATATA--TCTA---A--A-GAACAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGCAAAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TAT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTA-AG-CACC--TTTTATTATAACGCTGATT-GATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATT-CGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-GTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------AAAGA----------GAGAAATCAT-AT--TAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAACT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAA--TGA--A--TTA---ATCGATTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TGCGCTTAT---TATAAATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AG--ACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|10                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTAACAAACAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACATTT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACGT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGA
gi|11                         :                                     CACACAT-ATTCAGTAAACATTGTGTCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAAGGCATAGTAGATTAAAATT----AAGTACATACAATT-CAAGACCGATTATAG-A---TT---AAATATA--TCTA---G--C-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATAGAGC--------ATGA-A-TGTGA----------------A-----TACA-TTT-TA------TTCTGATGCTT--TTG-TT-AAAGTA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------AAATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAAT------ATACCAT-T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-T-TA------------------GTACATCAAGGGCTTTCGATTTT-AG-CACC--TTATGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaTTAGTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TCATTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--A-----A---T------G-TTTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTT-T-GA-G--TGTTT-TAG----------GAAGG----------GTAAGGTC---AT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTACGTTGATTGTGAAT-------TACTATTATTA--TTA---ATAGTTTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGA----TAAATGAA----TATTG--------GT-------------TTGT------------GATTTGA-----A-GATTAT---TGTATATAAAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--G-TGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAG--ACAAAAACATTG----CAGCGTAACAc
gi|13                         : tataaataatagaatttgggtttttcataatcATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAGTATATACATTT-GAAGATTGGTTATAA-A---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTG-CAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|14                         :                                 ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAGTATATACATTT-GAAGATTGGTTATAA-A---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTG-CAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAGC-TTT-TGACACC--TT-----GTAACAATGACT-GGTATATAAG-TAATCC-----------GGCAGTG-TGA---------ATAAA----AGCT-------------------------TTT-AAGCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTT-T-AACA--AGTTAATAT----------AAA-------------AGAGGTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCAT-------AAT--TTA--A--TCA---ATTGTTTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATGAACTCGTACTGTTGTTGTTGTTTTTTGGGGGTTTTTGTAGTTTTTTTTAAAAGTTGAT---CAATATAAA---TGTTTGTAAGAGGAAATACATTATATCTT-TACTTTCAT--GTTA-T--TT--AGT-T-ATTCATTCA
gi|16                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATCGAATCT----AAATATACACATTT-CAAGACTGGTCATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TT--CAAATTTCATATTAT--------ATGA-A-TATTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAATTA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACacaacaa
gi|17                         :                                                                                   ATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTTAGGTCAT---------ACA----TTT------T-AACGCTTT-------GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGAATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATT--AAAACTAGTTATCA-AACGTT---CAAGA-----CTG---ATTATGAAT-AGTATTG-CAAATTTCATATTGTTACAATTGGTGAGA-TGTTATATTCCGTTATTTTTGA-----TAGATTGT-TACATACTTGTTAGTGATT--TTA-TT-TAAGCATGTTCT-----A-AAACTTGTGC-TCC----T---GT----TATTCAACGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttcagT---AAATATA--TATATATA--G-GAGTTATT-TTG-CCATATTTATATTGT--------TTAA-AATGTTA----------------A-----CATATTTCATA--------CTGGTGTTT--TTA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGCGTAGCA------------TAATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCGT------ATACTAG-TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA-AA----TATCA-TATTTCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAGC-TTTCAG-CACCGTTTTTGTTAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCATTA----TGT-A-TGT---------------ATTTACATCAAGGTCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGT-TGA-TGGTCAAAATACA----TGTTATAT--ta
gi|2                          : gattatggacccaatatgtataaaaatatcataTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTAT-GTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATCTTCATAGTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT--A-----TT-CTGGTGATT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-----------------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATAAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-AAG----------GAAGG----------GAGACGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAAT--TTAT-AATTTG---ATCGTTTTATCTGGTTATACCGAC----A----TACATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTAT---------CAAAAGTTGAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA--T----AGGAAT-AAAACATTA----CAGCGTAACAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACCTGTG--TCAAAT---TTACGTTGATTATGAAT-------AAT--TAA--A--TAA---ACAGTTTTGTCTTGTCATAC-GACATCGA----TATATAGA----TATTC--------GTTTACCAA------CTGC---------CAACAATTTAT---AACGATAAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAATTT-TGT--A--A-T--TTGAATTATCAACT-TTCACt
gi|21                         :                                              TTTAGCAAAGTTCATGTAAGCATTTTCAAGTAA--ATGTTTT------------------TAAGGTCATTTT---GTTATACA-TTTT------A-AACGATTC-------GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTAAATAAGTAACGATCAATGC-------------ACT----TAGTATATACATTT-GTATACAG-TT-TGGTA---CT---GAATATA---------------AATCAGTATTGTCAGTTAAAATATCAC---------TGA-G-T-TTA----------------ATAAATCACAACTT-TA-----TTC---ATGTTT--T---TT-AAaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|22                         :                                    tCGCACAT-TGTCAGTATATATTGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT-------TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTTAATAACTAACAATCAAGGAATACCAAATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATAA-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-TAA-TTTCATACTGcaagttcaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTA----------------A-----GCTATTTT-TA-----TT-CTGGTATTT--CCA-TTTAAAGTA--TGTT-----A-T----TAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTCGTAGAA------------CCATTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAAT------ACACAGT-TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG-T---TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAATAATGTGTGT-A-TATATCTT-AAC-AATAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                               AACAGTCAATGGATATCTAAT--AGACT-------------CAATTTCCGGACAGATT---G-A---TC---TAACA-------A---A--A-GAATAATT-TGG-CAATGTTT-TAAGGT--------ATAA-AATGTTA----------------A-----G------T-TACC---TTTCTGATATCT--CC--------GCT--TTTT------------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCCATTTCA------------TAAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCAC------AAGCCAT-TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---TACATGTGTG--TTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATCATTTTGTCTGGTTAAACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTCAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA-----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACTTAAACATTA----CAGCGTAc
gi|26                         :                                   GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GTGCCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTAAATAAACAACAATCAAAGCATATTAAATTGAAAC
gi|27                         :                                 ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGTATCAGCATTTTATAATCATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCAC---GATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTAACTAGCTTA-AATCAAGGCATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AG--ACAAAAACA-TA----CAGCATAACAgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatagtgcgtttccacgttatatatattctataggtgatatgaaaatagtgtTTATCGTTACAATAGTT-AGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATT-CGTTTAA-CAAAACA-A----TGGTATATA-TAA---A---T------G-TTT-T-GATTTGAACT---CGAGA--c
gi|3                          :                                gATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTATAGTTAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTATAAAACTAACAATCAAAGCATAGTAGATTGAAACT----AAATATATACAGTT-CAAGACTGACTACGG-A---TT---AAATATA--TCTA---G--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGC--------ATGA-A-TGTGA----------------A-----TACATTTT-AA-----T--ATGATGTTT--TCA-TT-AAAATA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAAT------ATACCAT-CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTGA-TTTTAG-CACC--TTTTTTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATATA----TGTTATGT--A-----A---T------G-TTT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTT-TTGC-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTATGTTGTTTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATAATTTTGTCTGGTTATACCGACATAGC----TATATAAA----TATTG--------GTTTTCCAA------TTGT---------CAAAAATTGAT---GAAGATTAT---TGTTTATAAAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--G-TG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AA--AC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|30                         :                                  TGCCGCGCATTGTTT-GCAAATTTTAAGTCAGTATTTTCTATT--T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATTTGAGGTCATGTTGG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                              TAACAATTAATGCAAATTCAATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGAGTGATTATGG-A---CC---CAATATG--TATA---A--A-AA
gi|32                         :                                           T-ACTCAGTAAATATGGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTTGGt
gi|4                          :                                 ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTTACAATTAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-TAAT---------------------GA-A-TGTTA----------------G-----CACATTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCC-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT--G-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTT-T-TA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCAAA------TTGT---------CAAAAGTTAAT---TACGCTTAT---CAGATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--GC-TAAAAATTA----CAGCGTAAC
gi|5                          :                                 ACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAAATCAGCATTTTCTTGTAGT-------------------GTAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC-------GATTCATTTGAT-----------GTTTGCATATAATGATTTCAAATAACTTACACTCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAATATATACAGTT-CAAGACTGATTATAG-A---AT---AATTATA--TCTA---A--A-GAATAAGT------GATTT-CATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------A-----CACAGTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTTGTAGAA------------TAACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAC------ATACCAG-TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATGA----TGT-A-TATTTCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCCA-TTTTAA-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATT-TGATTAGTCAAAACATA----TTTTATATAGT-----A---T------GCTTT-G-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AGAT-GTTT-A-GA-GTCAGTTT-TAG----------GAAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT-----TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATTTATG--CTAAAT---TAACGTTGAT-GTAAAT-------AAC--TTA--A--CAA---ATAGTTTTGTCTGGTAATACCGACATAGA----TAGATATA----TATTG--------GATTTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---CAAGATAAT---AGTATATAAAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AG--AC--ACATATTT----CAGCGTAA
gi|6                          :                                                                                         TTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT-------GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCAAATAACTAACAATCAATGCATATTCAATTGAAACC----AAGTATCTACAATT-CAAGACTGATGATAG-A---TTAAAAAATATATTTCTA---G--A-AAATAAGT-TTA-CAATTTTTATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------A-----AACA-TTT-TA------TTCTGGTATTT--TCATTT-AAAGAA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACAT------ATACCAT-CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCATTA----TGT-T-CATTTACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTGA-TTT-AA-CAAC--TTTTGTTATGACATTGATT-GGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTT-TTAGTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--TAGAGAA---T------GTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT--TTTGT-GA-G--A-TTT-AAGGAAGGAAGTTGAAGG----------AAGAAGTCAT--T--TAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAGTGTG--CTAAAT---TTACGTCGTTTGTGAAT-------AAC--TCA-------A---ATAGTTCT-------------------------TAATTGAA----TATT--------------------------GT---------CAAAAGTTGAT---TAAGATTAT---TGCACATAAAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G-------TT--ATT-TCACTTATACACCTATA-TAATTTA-GT----AG--A--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACAt
gi|7                          :                                                                                                                     TAGTGTAATA-C-TTCA------C-ATCGCTTTTACATAAAATGTAATTCATATTTTCAAATAGTATCCATATAGTGATATTAAATAAGT----------GT-TATTAGA---AAA-T----AAGTATATAAAA------------------------T---GAATGTA---CT---------------GTGTTG-CAATTTTCAGATTAT--------ATAA-AATGCTA----------------T-----GACGTTTC--A-----TT-CTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCA--TTAT-----ATA----AATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCATAGAAAAAAATACCTGTCAAATTATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGATT-ATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCGT-GCTTAA-----GC-AATATTTTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAATTT-AG-CAAC--GTTTATTGTAA----GGTTCGGTATTTAAA-TAATACAGATTT-ATTAGACAATA-TAATTTAT-AAAGT-------TATTGTAT--A-----AAGCT------G-TTT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCT-T-AA-G--GGTTT--------------GAA-------------AATAGTCGC-----TAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAAAT---TAAC--T--TTGTGAAA-------TAT--TTA--A--TTATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGA----TAGGTTGA----TACTG--------GCCTTCCAA------TTGT---------T--AAGTTAATACGTATGAATATAAATGTAT-TAAAGG----GAAATT--AAGCTGGACTT-TCTTAA-TA-T--TT--ACT-T
gi|8                          :                                          tcagagtttatataatagTGTCAGTATTTTCTATTACT-GTGTGTT--TTG-CGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT-------GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCAAATAAGTGTTAATAAATACATATTTAATTGAA-CT----ATGTACATACAGTT-CAGGACTGATTATAA-A---TT---AAATGTA--TCAA---A--G-AAAAAAAA-TTG-CAAGTTTCATATTGT--------ATAA-AATGTTA----------------A-----GATATTCT-T-------TTCTGGTATTT--TAC-TT-TGATCG--TTTTCAAAGA-A----TTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACGT-------AG------------CAACACA-GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACAT------ATGCCAT-TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCATAA----TGT-A--ATTTTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAGATTTT-AG-CACC--ATTGATTATAAGAATGATT-GTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATTATGAATA--TGATATGAACTTTTGTTACATG-T-----A---TATAGACG-TTT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTT-tttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|9                          :                               ttATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTAAATAACTTACAATCAAAGCATATTTGATTAAATCT----AAATATACAAAAGT-CAAGACTGATTATGT-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTCGTAGAC------------TGATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACAT------ATGTCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               1                      1111111                                                                                                                                                                                               1111111111111111          1      22222222                                                                                   1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                            2222222222222222222     111          111     11111                           1111111111     1111111111          11111                                                                           111                                            11111111                                                                    11111111         111111    111111111                                                                    2222222                                              22                      
lowQualScore                  :                                            22         1                1 2  3  2                                     3        2 2    666666 2        1111111                      0                                    1       1       1  4444           0  2               2 333  333       22    333 22 2        6   2               88888888    2 8     3333333333333333 55555    0   44 44444444         22  22  6      33    55555 2 4444     2   9999 333  4444                  2222222222222             2  444        66 2    2        666666       2           2  2 2                                 2 2          2              6666   2 2        0   2 1     4 33               8   8  2    33                   3          3            0           3   3           5 7777        8888888888888888888 7   000        3 000     22222    7    4 4  4 66     66  9999999999   1 9999999999          44444          9999   4  4     2     55                                  777    444   666          55      666        0        22222222  55   99999   666  1                          7777  1     7777     33333333   1     000000    444444444           6666 5      666                       2           2   44 1111111  44   3             666         55 9999  66  00        9999          
lowQualScore                  :                                            ..         .                . .  .  .                                     .        . .    ...... .        .......                      .                                    .       .       .  ....           .  .               . ...  ...       ..    ... .. .        .   .               ........    . .     ................ .....    .   .. ........         ..  ..  .      ..    ..... . ....     .   .... ...  ....                  .............             .  ...        .. .    .        ......       .           .  . .                                 . .          .              ....   . .        .   . .     . ..               .   .  .    ..                   .          .            .           .   .           . ....        ................... .   ...        . ...     .....    .    . .  . ..     ..  ..........   . ..........          .....          ....   .  .     .     ..                                  ...    ...   ...          ..      ...        .        ........  ..   .....   ...  .                          ....  .     ....     ........   .     ......    .........           .... .      ...                       .           .   .. .......  ..   .             ...         .. ....  ..  ..        ....          
lowQualScore                  :                                            66         0                7 4  2  2                                     5        6 1    111111 1        3333333                      2                                    7       7       2  5555           2  1               1 777  555       88    555 88 0        3   1               11111111    2 9     9999999999999999 33333    4   88 44444444         99  88  3      11    66666 2 7777     2   4444 999  7777                  4444444444444             4  111        55 4    2        888888       4           4  4 4                                 5 5          9              1111   9 9        1   3 1     3 99               6   6  9    99                   3          8            5           3   3           4 1111        8888888888888888888 3   666        6 000     11111    2    0 4  4 11     77  4444444444   1 4444444444          22222          8888   4  4     9     55                                  000    000   444          00      444        1        33333333  00   11111   444  0                          7777  0     7777     22222222   8     555555    555555555           8888 1      444                       5           5   66 1111111  66   3             444         22 4444  11  00        4444          
consensus                     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( family-6174 )     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
gi|1                          :                                 ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTAGGTAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---CT---AAATATA--TCTA---A--A-GAACAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGCAAAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TAT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTA-AG-CACC--TTTTATTATAACGCTGATT-GATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATT-CGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-GTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------AAAGA----------GAGAAATCAT-AT--TAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAACT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAA--TGA--A--TTA---ATCGATTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TGCGCTTAT---TATAAATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AG--ACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|10                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTAACAAACAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACATTT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACGT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGA
gi|11                         :                                     CACACAT-ATTCAGTAAACATTGTGTCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAAGGCATAGTAGATTAAAATT----AAGTACATACAATT-CAAGACCGATTATAG-A---TT---AAATATA--TCTA---G--C-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATAGAGC--------ATGA-A-TGTGA----------------A-----TACA-TTT-TA------TTCTGATGCTT--TTG-TT-AAAGTA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------AAATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAAT------ATACCAT-T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-T-TA------------------GTACATCAAGGGCTTTCGATTTT-AG-CACC--TTATGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaTTAGTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TCATTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--A-----A---T------G-TTTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTT-T-GA-G--TGTTT-TAG----------GAAGG----------GTAAGGTC---AT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTACGTTGATTGTGAAT-------TACTATTATTA--TTA---ATAGTTTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGA----TAAATGAA----TATTG--------GT-------------TTGT------------GATTTGA-----A-GATTAT---TGTATATAAAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--G-TGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAG--ACAAAAACATTG----CAGCGTAACAc
gi|13                         : tataaataatagaatttgggtttttcataatcATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAGTATATACATTT-GAAGATTGGTTATAA-A---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTG-CAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|14                         :                                 ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTAAATAACAAACAATCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAGTATATACATTT-GAAGATTGGTTATAA-A---TT---AAACATG--TCTA---G--A-GAATACGT-TTG-CAATGTCCACATTGT--------ACGA-A-TGTTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTA--CTTT-----A-A----TGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAGC-TTT-TGACACC--TT-----GTAACAATGACT-GGTATATAAG-TAATCC-----------GGCAGTG-TGA---------ATAAA----AGCT-------------------------TTT-AAGCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTT-T-AACA--AGTTAATAT----------AAA-------------AGAGGTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCAT-------AAT--TTA--A--TCA---ATTGTTTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATGAACTCGTACTGTTGTTGTTGTTTTTTGGGGGTTTTTGTAGTTTTTTTTAAAAGTTGAT---CAATATAAA---TGTTTGTAAGAGGAAATACATTATATCTT-TACTTTCAT--GTTA-T--TT--AGT-T-ATTCATTCA
gi|16                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATCGAATCT----AAATATACACATTT-CAAGACTGGTCATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TT--CAAATTTCATATTAT--------ATGA-A-TATTA----------------A-----CACA-TTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAATTA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACacaacaa
gi|17                         :                                                                                   ATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTTAGGTCAT---------ACA----TTT------T-AACGCTTT-------GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGAATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATT--AAAACTAGTTATCA-AACGTT---CAAGA-----CTG---ATTATGAAT-AGTATTG-CAAATTTCATATTGTTACAATTGGTGAGA-TGTTATATTCCGTTATTTTTGA-----TAGATTGT-TACATACTTGTTAGTGATT--TTA-TT-TAAGCATGTTCT-----A-AAACTTGTGC-TCC----T---GT----TATTCAACGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttcagT---AAATATA--TATATATA--G-GAGTTATT-TTG-CCATATTTATATTGT--------TTAA-AATGTTA----------------A-----CATATTTCATA--------CTGGTGTTT--TTA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGCGTAGCA------------TAATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCGT------ATACTAG-TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA-AA----TATCA-TATTTCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAGC-TTTCAG-CACCGTTTTTGTTAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCATTA----TGT-A-TGT---------------ATTTACATCAAGGTCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGT-TGA-TGGTCAAAATACA----TGTTATAT--ta
gi|2                          : gattatggacccaatatgtataaaaatatcataTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTAT-GTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTAAATAACTAACAATCAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATCTTCATAGTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT--A-----TT-CTGGTGATT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-----------------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATAAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-AAG----------GAAGG----------GAGACGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAAT--TTAT-AATTTG---ATCGTTTTATCTGGTTATACCGAC----A----TACATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTAT---------CAAAAGTTGAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA--T----AGGAAT-AAAACATTA----CAGCGTAACAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACCTGTG--TCAAAT---TTACGTTGATTATGAAT-------AAT--TAA--A--TAA---ACAGTTTTGTCTTGTCATAC-GACATCGA----TATATAGA----TATTC--------GTTTACCAA------CTGC---------CAACAATTTAT---AACGATAAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAATTT-TGT--A--A-T--TTGAATTATCAACT-TTCACt
gi|21                         :                                              TTTAGCAAAGTTCATGTAAGCATTTTCAAGTAA--ATGTTTT------------------TAAGGTCATTTT---GTTATACA-TTTT------A-AACGATTC-------GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTAAATAAGTAACGATCAATGC-------------ACT----TAGTATATACATTT-GTATACAG-TT-TGGTA---CT---GAATATA---------------AATCAGTATTGTCAGTTAAAATATCAC---------TGA-G-T-TTA----------------ATAAATCACAACTT-TA-----TTC---ATGTTT--T---TT-AAaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|22                         :                                    tCGCACAT-TGTCAGTATATATTGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT-------TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTTAATAACTAACAATCAAGGAATACCAAATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATAA-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-TAA-TTTCATACTGcaagttcaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTA----------------A-----GCTATTTT-TA-----TT-CTGGTATTT--CCA-TTTAAAGTA--TGTT-----A-T----TAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTCGTAGAA------------CCATTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAAT------ACACAGT-TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG-T---TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAATAATGTGTGT-A-TATATCTT-AAC-AATAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                               AACAGTCAATGGATATCTAAT--AGACT-------------CAATTTCCGGACAGATT---G-A---TC---TAACA-------A---A--A-GAATAATT-TGG-CAATGTTT-TAAGGT--------ATAA-AATGTTA----------------A-----G------T-TACC---TTTCTGATATCT--CC--------GCT--TTTT------------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCCATTTCA------------TAAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCAC------AAGCCAT-TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---TACATGTGTG--TTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATCATTTTGTCTGGTTAAACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTCAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA-----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACTTAAACATTA----CAGCGTAc
gi|26                         :                                   GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GTGCCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTAAATAAACAACAATCAAAGCATATTAAATTGAAAC
gi|27                         :                                 ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGTATCAGCATTTTATAATCATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCAC---GATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTAACTAGCTTA-AATCAAGGCATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AG--ACAAAAACA-TA----CAGCATAACAgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatagtgcgtttccacgttatatatattctataggtgatatgaaaatagtgtTTATCGTTACAATAGTT-AGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATT-CGTTTAA-CAAAACA-A----TGGTATATA-TAA---A---T------G-TTT-T-GATTTGAACT---CGAGA--c
gi|3                          :                                gATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTATAGTTAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTATAAAACTAACAATCAAAGCATAGTAGATTGAAACT----AAATATATACAGTT-CAAGACTGACTACGG-A---TT---AAATATA--TCTA---G--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGC--------ATGA-A-TGTGA----------------A-----TACATTTT-AA-----T--ATGATGTTT--TCA-TT-AAAATA--GTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAAT------ATACCAT-CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTGA-TTTTAG-CACC--TTTTTTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATATA----TGTTATGT--A-----A---T------G-TTT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTT-TTGC-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTATGTTGTTTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATAATTTTGTCTGGTTATACCGACATAGC----TATATAAA----TATTG--------GTTTTCCAA------TTGT---------CAAAAATTGAT---GAAGATTAT---TGTTTATAAAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--G-TG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AA--AC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|30                         :                                  TGCCGCGCATTGTTT-GCAAATTTTAAGTCAGTATTTTCTATT--T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATTTGAGGTCATGTTGG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                              TAACAATTAATGCAAATTCAATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGAGTGATTATGG-A---CC---CAATATG--TATA---A--A-AA
gi|32                         :                                           T-ACTCAGTAAATATGGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTTGGt
gi|4                          :                                 ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTAAATAACTTACAATTAAAGCATATTTGATTGAATCT----AAATATACACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-TAAT---------------------GA-A-TGTTA----------------G-----CACATTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCC-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT--G-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTT-T-TA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCAAA------TTGT---------CAAAAGTTAAT---TACGCTTAT---CAGATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--GC-TAAAAATTA----CAGCGTAAC
gi|5                          :                                 ACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAAATCAGCATTTTCTTGTAGT-------------------GTAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC-------GATTCATTTGAT-----------GTTTGCATATAATGATTTCAAATAACTTACACTCAATGCATATTAAATTGAAACT----AAATATATACAGTT-CAAGACTGATTATAG-A---AT---AATTATA--TCTA---A--A-GAATAAGT------GATTT-CATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------A-----CACAGTTT--A-----TT-CTGGTGTTT--TCA-TTTAAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTTGTAGAA------------TAACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAC------ATACCAG-TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATGA----TGT-A-TATTTCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCCA-TTTTAA-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATT-TGATTAGTCAAAACATA----TTTTATATAGT-----A---T------GCTTT-G-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AGAT-GTTT-A-GA-GTCAGTTT-TAG----------GAAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT-----TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATTTATG--CTAAAT---TAACGTTGAT-GTAAAT-------AAC--TTA--A--CAA---ATAGTTTTGTCTGGTAATACCGACATAGA----TAGATATA----TATTG--------GATTTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---CAAGATAAT---AGTATATAAAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AG--AC--ACATATTT----CAGCGTAA
gi|6                          :                                                                                         TTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT-------GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCAAATAACTAACAATCAATGCATATTCAATTGAAACC----AAGTATCTACAATT-CAAGACTGATGATAG-A---TTAAAAAATATATTTCTA---G--A-AAATAAGT-TTA-CAATTTTTATATTGT--------ATGA-A-TGTTT----------------A-----AACA-TTT-TA------TTCTGGTATTT--TCATTT-AAAGAA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACAT------ATACCAT-CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCATTA----TGT-T-CATTTACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTGA-TTT-AA-CAAC--TTTTGTTATGACATTGATT-GGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTT-TTAGTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--TAGAGAA---T------GTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT--TTTGT-GA-G--A-TTT-AAGGAAGGAAGTTGAAGG----------AAGAAGTCAT--T--TAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAGTGTG--CTAAAT---TTACGTCGTTTGTGAAT-------AAC--TCA-------A---ATAGTTCT-------------------------TAATTGAA----TATT--------------------------GT---------CAAAAGTTGAT---TAAGATTAT---TGCACATAAAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G-------TT--ATT-TCACTTATACACCTATA-TAATTTA-GT----AG--A--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACAt
gi|7                          :                                                                                                                     TAGTGTAATA-C-TTCA------C-ATCGCTTTTACATAAAATGTAATTCATATTTTCAAATAGTATCCATATAGTGATATTAAATAAGT----------GT-TATTAGA---AAA-T----AAGTATATAAAA------------------------T---GAATGTA---CT---------------GTGTTG-CAATTTTCAGATTAT--------ATAA-AATGCTA----------------T-----GACGTTTC--A-----TT-CTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCA--TTAT-----ATA----AATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCATAGAAAAAAATACCTGTCAAATTATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGATT-ATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCGT-GCTTAA-----GC-AATATTTTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAATTT-AG-CAAC--GTTTATTGTAA----GGTTCGGTATTTAAA-TAATACAGATTT-ATTAGACAATA-TAATTTAT-AAAGT-------TATTGTAT--A-----AAGCT------G-TTT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCT-T-AA-G--GGTTT--------------GAA-------------AATAGTCGC-----TAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAAAT---TAAC--T--TTGTGAAA-------TAT--TTA--A--TTATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGA----TAGGTTGA----TACTG--------GCCTTCCAA------TTGT---------T--AAGTTAATACGTATGAATATAAATGTAT-TAAAGG----GAAATT--AAGCTGGACTT-TCTTAA-TA-T--TT--ACT-T
gi|8                          :                                          tcagagtttatataatagTGTCAGTATTTTCTATTACT-GTGTGTT--TTG-CGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT-------GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCAAATAAGTGTTAATAAATACATATTTAATTGAA-CT----ATGTACATACAGTT-CAGGACTGATTATAA-A---TT---AAATGTA--TCAA---A--G-AAAAAAAA-TTG-CAAGTTTCATATTGT--------ATAA-AATGTTA----------------A-----GATATTCT-T-------TTCTGGTATTT--TAC-TT-TGATCG--TTTTCAAAGA-A----TTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACGT-------AG------------CAACACA-GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACAT------ATGCCAT-TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCATAA----TGT-A--ATTTTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAGATTTT-AG-CACC--ATTGATTATAAGAATGATT-GTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATTATGAATA--TGATATGAACTTTTGTTACATG-T-----A---TATAGACG-TTT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTT-tttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|9                          :                               ttATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTAAATAACTTACAATCAAAGCATATTTGATTAAATCT----AAATATACAAAAGT-CAAGACTGATTATGT-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA------TTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTCGTAGAC------------TGATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACAT------ATGTCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATG


blockSeqs                     :                                            TG         A                A T  T  G                                     T        C A    AAATTT T        TACATAA                                                           A       T       T  ATTA              T               T ACG  AAA       TT    TAT TT T        A   T               TACAATTG    G A     TATTCCGTTATTTTTG TAAAT    T   AT CATACTTG         CT  AT  T      TG    CAAAG T AACT     A   TCAG ATA  TTTG                  AAAAAATACCTGT             T  AAA        AT T    T        GATATT       A           A  C T                                 G T          A              TGTG   C A            T G     G AC               T   C  A    GT                   C          A                        A   T           T CTTT        GTATATAGAC          C   TG         C GCG     GAC      A    G T  C TC     AT  GAAGGAAGTT   G CATTTGAAGG          TATAA          GTTT   T  T     T     TA                                  ATA    CAC   ATA          TT      ATT                 ATTTTTAA  TA   TAAT    TTG  A                          TTAG  A     CTCG     TTGTTGTT   T     GGGTTT    AGTTTTTTT           ACGT A      AAA                       G           G   TA TGTTA    GA   A             CAT         CT TAAA  GA  AA        CGAG
blockSeqs                     :                                            A          C                A A  A  .                                     C        C .    .      .        GCAC                                                              G       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        A   .               .           . A     .                .        T   T  CCTTT            .   A   T      .     .     . .        .   TCAG .    .                     C                         .  .          AT .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     G AC               A   T  .    .                    .          A                        .   T           A .           TAGAGAAT            T   AA         . A       TGG      G    . .  . .      T   .            G .                   AT             T      .  .     G     .                                   .      AAT   .            .       .                   T         .    TTA     .    T                          .     T     .        .          C     .         .                   C    C      .                         T           T   .  TGTT     .    .             CAT         C  .     .   TT        .   
blockSeqs                     :                                            A          T                C A  A  .                                     G        C .    .      .        .                                                                 T       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        G   .               .           . A     .                .        T   T  TTC              .   G   T      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     T AC               T   T  .    .                    .          A                        .   T           C .           ATAAAT              .   TT         . .       C        A    . .  . .      A   .            G .                   AT             T      .  .     G     .                                   .      .     .            .       .                   A         .    A       .    C                          .     C     .        .          T     .         .                   T    C      .                         G           G   .  TTAT     .    .             TAA         T  .     .   AA        .   
blockSeqs                     :                                            T          T                C A  A  .                                     G        C .    .      .        .                                                                 T       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . A     .                .        A   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     T AC               .   .  .    .                    .          G                        .   T           A .           AAAGCT              .   G          . .       G        A    . .  . .      T   .            G .                   AT             T      .  .     G     .                                   .      .     .            .       .                   A         .    A       .    A                          .     T     .        .          C     .         .                   A    C      .                         T           G   .  TAT      .    .             CAT         T  .     .   A         .   
blockSeqs                     :                                            T          A                A T  T  .                                     T        C .    .      .        .                                                                 A       T       T  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T A     T AC               .   .  .    .                    .          A                        .   T           T .           AGTAT               .   T          . .       C        A    . .  . .      T   .            G .                   AT             T      .  .     G     .                                   .      .     .            .       .                   T         .    A       .    C                          .     A     .        .          T     .         .                   T    A      .                         G           G   .  TAT      .    .             TAT         T  .     .   A         .   
blockSeqs                     :                                            A          A                A A  T  .                                     T        C .    .      .        .                                                                 G       G       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     C                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     G AC               .   .  .    .                    .          A                        .   T           A .           AAT                 .   G          . .       G        A    . .  . .      T   .            G .                   T              A      .  .     A     .                                   .      .     .            .       .                   T         .    A       .    A                          .     T     .        .          C     .         .                   G    C      .                         G           G   .  TAT      .    .             TA          T  .     .   T         .   
blockSeqs                     :                                            A          G                C A  A  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 A       T       T  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     G AC               .   .  .    .                    .          A                        .   G           T .           TAT                 .   G          . .       C        .    . .  . .      A   .            . .                   .              G      .  .     .     .                                   .      .     .            .       .                   A         .    A       .    C                          .     A     .        .          T     .         .                   T    A      .                         G           G   .  AT       .    .             T           G  .     .   A         .   
blockSeqs                     :                                            T          T                C A  A  .                                     T        . .    .      .        .                                                                 T       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        G   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     G AC               .   .  .    .                    .          A                        .   T           T .           AAT                 .   G          . .       C        .    . .  . .      .   .            . .                   .              .      .  .     .     .                                   .      .     .            .       .                   A         .    A       .    A                          .     G     .        .          T     .         .                   C    A      .                         T           G   .  .        .    .             .           .  .     .   .         .   
blockSeqs                     :                                            A          T                A A  A  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 G       T       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            G T     G A                .   .  .    .                    .          G                        .   A           A .           TAT                 .   T          . .       .        .    .                                                                                         .                                   .      .     .            .       .                   A         .    A       .    A                          .     A     .        .          .     .         .                   T    T      .                         T           .   .  .        .    .                                                    
blockSeqs                     :                                            A          C                A A  C  .                                     T        . .    .      .        .                                                                 T       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            T G     T .                .   .  .    .                    .          .                        .   .           . .           .                   .   A          . .                                                                                                                                                                .            .       .                   T         .    .       .    A                          .     G     .        .          .     .         .                   .    .      .                         .           .   .  .        .    .                                                    
blockSeqs                     :                                            A          T                A A  T  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 A       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        T   A  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     C                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            . .     G .                .   .  .    .                    .          .                        .   .           . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .           .   .  .        .    .                                                    
blockSeqs                     :                                            A          T                C A  A  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 G       C       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   T  TT               .   C   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            . .     . .                .   .  .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                            A          T                C T  T  .                                     T        . .    .      .        .                                                                 A       T       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   T  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     A                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .          .              .      . .            . .     . .                .   .  .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                            T          A                A T  A  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 T       A       T  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   T  TT               .   C   .      .     .     . .        .   .    .    .                     G                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .                                               . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                            T          T                C A  A  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 A       C       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   .  TT               .   A   .      .     .     . .        .   .    .    .                     C                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                 . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                       A                C T  T  .                                     A        . .    .      .        .                                                                 T       A       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   .  TT               .   .   .      .     .     . .        .   .    .    .                     .                         .  .          .  .    .        .            .           .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                        A .  .  .                                     G        . .    .      .        .                                                                 T       T       A  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .               .           . .     .                .        .   .  T                .   .   .      .     .     . .        .   .    .    .                                                                     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                      T        . .    .      .        .                                                                 T       T       T  .                 .               . .    .         .     .   .  .        .   .                                   .                .        .   .  .                .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                      .                                                                                                 A       .       .                                           .         .     .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                      .                                                                                                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TT******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAT****                                              A*
originalCons                  :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TA-----TTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
finalCons                     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTAAATAACTAACAATCAANGCATATTNGATTGAAACT----AAGTATATACAATT-CAAGACTGATTATGG-A---TT---AAATATA--TCTA---A--A-GAATAAGT-TTG-CAATTTTCATATTGT--------ATGA-A-TGTTA----------------A-----CACATTTT-TATT------CTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCA--TTTT-----A-A----TGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--GTAT----TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACA-AAACATTA----CAGCGTAACA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               1                      1111111                                                               111111111111111                                                                                                                                      1                                                     11111111                        1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                            2222222222222222222     111          111     11111                           1111111111     1111111111          11111                                                                           111                                            11111111                                                                    11111111         111111    111111111                                                                    2222222                                              22                      
lowQualScore                  :                                            22         1                1 2  3  2                                     3        2 2    666666 2        1111111                      0                    6666666         22  111111111111111     1       1       1             3333  2               2   333       22    333          4   2    2          2   2   6      55555    2   6   2         22  33  6          55555 2      2   00000000  5555                  2222222222222             2  444        66 2    2        666666       2           2  2 2                                 2 2          2              6666   2 2        0   2 1     4 33               8   8  2    33                   3          3            0           3   3           5 7777        8888888888888888888 7   000        3 000     22222    7    4 4  4 66     66  9999999999   1 9999999999          44444          9999   4  4     2     55                                  777    444   666          55      666        0        22222222  55   99999   666  1                          7777  1     7777     33333333   1     000000    444444444           6666 5      666                       2           2   44 1111111  44   3             666         55 9999  66  00        9999          
lowQualScore                  :                                            ..         .                . .  .  .                                     .        . .    ...... .        .......                      .                    .......         ..  ...............     .       .       .             ....  .               .   ...       ..    ...          .   .    .          .   .   .      .....    .   .   .         ..  ..  .          ..... .      .   ........  ....                  .............             .  ...        .. .    .        ......       .           .  . .                                 . .          .              ....   . .        .   . .     . ..               .   .  .    ..                   .          .            .           .   .           . ....        ................... .   ...        . ...     .....    .    . .  . ..     ..  ..........   . ..........          .....          ....   .  .     .     ..                                  ...    ...   ...          ..      ...        .        ........  ..   .....   ...  .                          ....  .     ....     ........   .     ......    .........           .... .      ...                       .           .   .. .......  ..   .             ...         .. ....  ..  ..        ....          
lowQualScore                  :                                            66         0                7 4  2  2                                     5        6 1    111111 1        3333333                      2                    8888888         66  999999999999999     7       7       2             9999  1               1   555       88    555          2   1    1          1   2   7      33333    5   5   1         99  55  7          99999 4      4   33333333  0000                  4444444444444             4  111        55 4    2        888888       4           4  4 4                                 5 5          9              1111   9 9        1   3 1     3 99               6   6  9    99                   3          8            5           3   3           4 1111        8888888888888888888 3   666        6 000     11111    2    0 4  4 11     77  4444444444   1 4444444444          22222          8888   4  4     9     55                                  000    000   444          00      444        1        33333333  00   11111   444  0                          7777  0     7777     22222222   8     555555    555555555           8888 1      444                       5           5   66 1111111  66   3             444         22 4444  11  00        4444          
consensus                     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAANGCATATTNGATTGAAACTAAGTATATACAA---TT-CAAGACTGATTATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACATTTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
Reference ( family-6174 )     :                                 ATGCCGCACAT-ATTCAGTAAANATTGTGTCAGCATTTTATAGTNAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTNGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATAGTTTGCATATAATGGTATTA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAANGCATATTNGATTGAAACTAAGTATATACAA---TT-CAAGACTGATTATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACATTTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATACCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATANA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATNGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TANATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TACGATTAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--AC-AAAACATTA----CAGCGTAACA
gi|1                          :                                 ATGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCATATGATGGTGTTA-------GGTAACTAA--CA---------------ATCAAAGCATATTTGATTGAATCTAAATATACACAA---TT-CAAGACTGATTATGG-ACT---AAATATA--TCTA---AAGAACAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACATTTTTATTTCTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGCAAAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCAGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TAT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTA-AG-CACC--TTTTATTATAACGCTGATT-GATATTTAAGTTAATCTATATTTTATCAGACAATT-CGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-GTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--AGTTAGGTT-T-GA-G--AGTTT-TAG----------AAAGA----------GAGAAATCAT-AT--TAGAATCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAACT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAA--TGA--A--TTA---ATCGATTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---TGCGCTTAT---TATAAATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACGTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCATCTATTCACCCATATTAAATAG-TT----AG--ACTAAAACATTA----CAGTGTAACA
gi|10                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAATAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAATAATTTTTGTGTTATT-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACATGATGGTGTTA-------AATAACTAA--CA---------------AACAAAGCATATTTGATTGAATCTAAATATACACAT---TT-CAAGACTGATTATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACA-TTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----AGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTTGTGTCAA-AA---C-AGTTAC--A-TTTT-AACAACGT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTATTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTTCTGAACTAGTACATGTACATTAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGA
gi|11                         :                                     CACACAT-ATTCAGTAAACATTGTGTCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAAGTTTAAAGTCATTTTCATGAAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTAATATTTGAAAATAGTTTGTACATAATGGTATTA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAAGGCATAGTAGATTAAAATTAAGTACATACAA---TT-CAAGACCGATTATAG-ATT---AAATATA--TCTA---GCGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATAGAG-CAT-GAA-TGTGAA-----TACA-TTTTATT-CTGATGCTT--TTG-TT-AAAGTAGTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAA------------AAATTCGTGCCAA-AA---GAAGTTAT--ATTTTT-AACAAAAT------ATACCAT-T-TTTAAATAA-AA-A-CAAGAGACAACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAAGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-T-TA------------------GTACATCAAGGGCTTTCGATTTT-AG-CACC--TTATGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaTTAGTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TCATTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--A-----A---T------G-TTTTG-GCTTGAAA-T---CGAGA------GTTAGTTT-T-GA-G--TGTTT-TAG----------GAAGG----------GTAAGGTC---AT--TAGAAGCGAG---TAAA-AA-TAGTGTTTTTTTACACAGTTGTTATAGAAATCGGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TGA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTACGTTGATTGTGAAT-------TACTATTATTA--TTA---ATAGTTTTGTCTGGTTTTACCGACAAAGA----TAAATGAA----TATTG--------GT-------------TTGT------------GATTTGA-----A-GATTAT---TGTATATAAAAGAAAAGAAACTAGAA---GGATGTGTAT--G-TGTT--TT--ATT-TCTCCTATTCACT----TTAATTAA-CTTAAAAG--ACAAAAACATTG----CAGCGTAACAc
gi|13                         : tataaataatagaatttgggtttttcataatcATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTA-------AATAACAAA--CA---------------ATCAATGCATATTAAATTGAAACTAAGTATATACAT---TT-GAAGATTGGTTATAA-ATT---AAACATG--TCTA---GAGAATACGT-TTG-CAAT-GTCCACATTG-TAC-GAA-TGTTAA-----CACA-TTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTACTTT-----A-ATGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|14                         :                                 ATACCGCACAT-TTTCAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAAATCTTAGGTCATTTTGGTGTAATG-T-ATAT------T-AACGCTTT-------GATTTATTTACTACTTGAACATAGTTTGCATATCATGGTATTA-------AATAACAAA--CA---------------ATCAATGCATATTAAATTGAAACTAAGTATATACAT---TT-GAAGATTGGTTATAA-ATT---AAACATG--TCTA---GAGAATACGT-TTG-CAAT-GTCCACATTG-TAC-GAA-TGTTAA-----CACA-TTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-CAAGTACTTT-----A-ATGTAT-TTTTCAGT---GT----TGATTGACGTCTCGTAGAA------------TTATTCATGTCAA-AA---CAAGTTACATA-TTTT-TATACGAT------GTACTAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CACGAGACGATGGATTTGTATATGTGCTTGTCT-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTAGTACACTT---TTAAAGGTTTTAGC-TTT-TGACACC--TT-----GTAACAATGACT-GGTATATAAG-TAATCC-----------GGCAGTG-TGA---------ATAAA----AGCT-------------------------TTT-AAGCTTTAAG-G---TGAGAGAC--AGGCGGTTT-T-AACA--AGTTAATAT----------AAA-------------AGAGGTCATTATAATAGAAACGAA-----AA-CA-AAAT---TCTT--CACAGCGATTGTACTAATTGAATTTCTGAAGAAA---CGGTCACTTA---TAAAT-------CTAAATATTTTACGTTGCTTGTGCAT-------AAT--TTA--A--TCA---ATTGTTTTGCATGGTTAAACCGACACAAATTAGTATATGAACTCGTACTGTTGTTGTTGTTTTTTGGGGGTTTTTGTAGTTTTTTTTAAAAGTTGAT---CAATATAAA---TGTTTGTAAGAGGAAATACATTATATCTT-TACTTTCAT--GTTA-T--TT--AGT-T-ATTCATTCA
gi|16                         :                                  TGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-TTATTTTCTTTGACAATCGCAGATTAAAAATAAGTTTTGTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATATTTGAAAATTGTTTGCACATGAAGGTGTTA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAAAGCATATTTGATCGAATCTAAATATACACAT---TT-CAAGACTGGTCATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TT--CAAA-TTTCATATTA-TAT-GAA-TATTAA-----CACA-TTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-AAATTATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACacaacaa
gi|17                         :                                                                                   ATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTTAGGTCAT---------ACA----TTT------T-AACGCTTT-------GATATATTAGATTTTTTAAAATAGTTTGTATATAACGGTATTAAACAAGAAACAATCAAGACATATTGAATGGAAACTATTAAGGCATATTGAATTAAAACTAGTTAT---CAAACGTT-CAAGACTGATTATGA-AT-----------------------AGTA----TTG-CAAA-TTTCATATTGTTAC-AAT-TGGTGA-----GATG-TTATATT-CCGTTATTT--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttttcagT---AAATATA--TATATATAGGAGTTATT-TTG-CCAT-ATTTATATTG-TTT-AAAATGTTAA-----CATATTTC-ATA-CTGGTGTTT--TTA-TTTAAAGCATTTT-----A-ATGTAT-ATT----T---AA----TGATTAATATTGCGTAGCA------------TAATGCGTGTCAA-A----CAAGTTTC--A-TTTT-AAAACCGT------ATACTAG-TCT--AGACAAATT-G-CAAGAAACGACGGATTTTTATAAATGTTTGTTT-T-GACTCATGTC-TCTTTGTAACA-AA----TATCA-TATTTCCTGAACTGGTACATTTA----AAGGGCTTTAGC-TTTCAG-CACCGTTTTTGTTATtgatagattgttacatacttgttagtgattttatttaagcatgttctaaaacttgtgctcctgttattcaacgt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTAGTTT-T-GACAGATGTA-GCTTTATTGCATTA----TGT-A-TGT---------------ATTTACATCAAGGTCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGAAATTGATATAATCGATATATTATCAGACAAGT-TGA-TGGTCAAAATACA----TGTTATAT--ta
gi|2                          : gattatggacccaatatgtataaaaatatcataTGCCACACAT-ATTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTAT-GTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCATATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TTTT------TTAGCGTTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGC-CATGATGGTGTTA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAAAGCATATTTGATTGAATCTAAATATACACAA---TT-CAAGACTGATTATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-CAAT-CTTCATAGTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACATTTT-ATT-CTGGTGATT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAAC-----------------------TAATTCGTGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAT-TT-A-CAAGAGATGGAGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAATTAGAACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATAAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTATA-T---CGAGA--C--AGTTAGTTT-T-GA-G--AGTTT-AAG----------GAAGG----------GAGACGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AATAAGTGGTTTTC--CACAGTAGTTATAGATAATGAATCTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTTTGAATATTTTTAAAT--TTAT-AATTTG---ATCGTTTTATCTGGTTATACCGAC----A----TACATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTAT---------CAAAAGTTGAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTTACCCATATTAAATAA--T----AGGAAT-AAAACATTA----CAGCGTAACAgaacacatacaggtctatgttgaaatcat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTC--CACAACGATTA-AG-TCTCTGATTTTCGAAGGAA---CAATAATTTA---AACACCTGTG--TCAAAT---TTACGTTGATTATGAAT-------AAT--TAA--A--TAA---ACAGTTTTGTCTTGTCATAC-GACATCGA----TATATAGA----TATTC--------GTTTACCAA------CTGC---------CAACAATTTAT---AACGATAAT---TGTATATAAAAGGAAAGAAACTGTAAGTTAAATTT-TGT--A--A-T--TTGAATTATCAACT-TTCACt
gi|21                         :                                              TTTAGCAAAGTTCATGTAAGCATTTTCAAGTAA--ATGTTTT------------------TAAGGTCATTTT---GTTATACA-TTTT------A-AACGATTC-------GATATATTTGATATTGTATAATAGTTC-TATATAATGGTGTTA-------AATAAGTAA--CG---------------ATCAATGC-------------ACTTAGTATATACAT---TT-GTATACAG-TT-TGGTACT---GAATATA------------AATCAGTATTGTCAGT-TAAAATATCA-C-T-GAG-T-TTAATAAATCACAACTTTATT-C--ATGTTT--T---TT-AAaaaaaatagaggaacaaatcagatcgtaat
gi|22                         :                                    tCGCACAT-TGTCAGTATATATTGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTGTCTTTAACACTTGCAGATTAAAAGGCATTTTGGTTTAATA-AATGTT------T-AACTCTTT-------TATTTATTTGATATTTGAAAAT---TTGCATATAATGGTATTT-------AATAACTAA--CA---------------ATCAAGGAATACCAAATTGAAACTAAGTATATACAA---TT-CAAGACTGATTATAA-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-TAA--TTTCATACTG-caagttcaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTAA-----GCTATTTTTATT-CTGGTATTT--CCA-TTTAAAGTATGTT-----A-TTAAAT-TTT----TATAGT----TTATTAACGTCTCGTAGAA------------CCATTCATGTAAA-AAAAACAAATTAC--A-TTTT-AACATAAT------ACACAGT-TCTAAATATAA-TT-A-CAAGAGACGACGG-T---TATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TGTTTGTTGAATAATGTGTGT-A-TATATCTT-AAC-AATAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                      AA--CA---------------GTCAATGGATATCTAAT--AGACT---------CAA---TTTCCGGACAGATT---G-ATC---TAACA-------A---AAGAATAATT-TGG-CAATGTTT--TAAGG-TATAAAA-TGTTAA-----GTTACCT---TT-CTGATATCT--CC--------GCTTTTT--------TATA-------------GT----TTATTAACGTCCCATTTCA------------TAAATCATGTCAA-AA---CAAATAAC--A-CACT-AACAGCAC------AAGCCAT-TC--TAAA-AA-AT-A-CAACAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---TACATGTGTG--TTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATCATTTTGTCTGGTTAAACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTCAT---TACGCTTAT---TATATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAATTGGA-----------------------------CTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--ACTTAAACATTA----CAGCGTAc
gi|26                         :                                   GCCGCACAT-ATTCAGTAAATA--GTGCCAGCATTTTATAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTATAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTAATTTGATATAAGAAAGTAGTTTGCATATAATCGTATTA-------AATAAACAA--CA---------------ATCAAAGCATATTAAATTGAAAC
gi|27                         :                                 ATGTCGCACA--ATTAAGTAAAC-TTGTATCAGCATTTTATAATCATGATA-TTTGTTTGACATTCGCATATTTTAGGTCATTTTGATGAAAT--A-TTTT------A-AACGCTTTGCAC---GATTTATTTGATATTTTTAAATAACTTCGATATAATGGTTTTA-------ACTAGCTTA---A---------------ATCAAGGCATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAAGGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCAATTATACACCTAAATTGAATAT-TT----AG--ACAAAAACA-TA----CAGCATAACAgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatagtgcgtttccacgttatatatattctataggtgatatgaaaatagtgtTTATCGTTACAATAGTT-AGTATTTAAAGTAATCTGGATTTCATCAGACAATT-CGTTTAA-CAAAACA-A----TGGTATATA-TAA---A---T------G-TTT-T-GATTTGAACT---CGAGA--c
gi|3                          :                                gATGCCGCACAT-ATTAAGTAAATATTGTGTCAGCATTTTATAGTTAT-ATATTTTCTTTGACGCTCGCAGATTTAAAGTCATTTTTGTGTAATACA-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTAATTGATATTTGAAAATAGTTTGCACATAATGGTATTA-------TAAAACTAA--CA---------------ATCAAAGCATAGTAGATTGAAACTAAATATATACAG---TT-CAAGACTGACTACGG-ATT---AAATATA--TCTA---GAGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-CAT-GAA-TGTGAA-----TACATTTTAAT--ATGATGTTT--TCA-TT-AAAATAGTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATAAACGTCTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAA-AG---CAAGTTAC--A-TTTTTAACAAAAT------ATACCAT-CATTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTCGTTT-T-GACAGGTGTT-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTTGA-TTTTAG-CACC--TTTTTTCATAACAATGATT-GGTATTTAAAAAAATGTATATTTAATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATATA----TGTTATGT--A-----A---T------G-TTT-TTGCTTGAAA-T---CGAGA--G--AGTTAGTTT-TTGC-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAT-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATACATAACAGATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAG---TTATGTTGTTTGTGAAT-------TAC--TTA--A--TTA---ATAATTTTGTCTGGTTATACCGACATAGC----TATATAAA----TATTG--------GTTTTCCAA------TTGT---------CAAAAATTGAT---GAAGATTAT---TGTTTATAAAAAGAAAGA------AAGTTAGACTTGTGT--G-TG-TTATT--ATT-TCACCTATTCTCCT-------ATAA-TT----AA--AC-AAAACATTA----CAGCATAACA
gi|30                         :                                  TGCCGCGCATTGTTT-GCAAATTTTAAGTCAGTATTTTCTATT--T-ATGTTTTC-TTGGCGCTCGCTGATTTGAGGTCATGTTGG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                     TAA--CA---------------ATTAATGCAAATTCAATTGAAACTAAGTATATACAA---TT-CAAGAGTGATTATGG-ACC---CAATATG--TATA---AAAA
gi|32                         :                                           T-ACTCAGTAAATATGGAGTCAGCATTTTCTAGTAAT-ATATTTTCTTTGACACTTGCAGATTTAAAGTTATTTTGGt
gi|4                          :                                 ATGACACACAT-ATTCAGTAAAAACTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCCTTGACACTCGCAGATTAAAAATAATTTTTGTGTAATA-A-TCTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGTTTTGCACATGATGGTGTTA-------AATAACTTA--CA---------------ATTAAAGCATATTTGATTGAATCTAAATATACACAA---TT-CAAGACTGATTATGG-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-TAAT----------------GAA-TGTTAG-----CACATTTT-ATT-CTGGTGTTT--TCC-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GT----TGATTAACGTCTCGTAGAC------------TAATTCGTGTCTTTAA---CAAGTGAA--A-TTTT-AACAACAT------ATATCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGACGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATCAAGGGCTTTCGA-TTT--G-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTTAAGATAATCTATATTTTATCAGACAATT-TGATTAGTCAAAATAAA----TGTTATAT--T-----A---T------G-TTT-G-GCTTTAAA-T---CGAGA--C--ATTT--TTT-T-TA-G--AGTTT-TAG----------GAAGG----------GAGAAGTCAT-AT--TAGAAGCGAG---TTAA-AA-AAGTGGTTTTC--CACAGTGGTTATAGATATCGGATTTCCGAATAAA---CAAT---TTA---TACATGTGTG--CTAAAT---TTACGTTGATTGTGAAT-------AAC--TTA--A--TTA---ATCGTTTTGTCTGGTTATACCGACATAGA----TAAATAAA----TATTG--------GTTCTCAAA------TTGT---------CAAAAGTTAAT---TACGCTTAT---CAGATATAAAAGGAAAGAAACTAGAAGTTGGACTTGTGT--G-TA-T--TT--ATT-TCACCTATTCACCCATATTAAATAA-TT----AG--GC-TAAAAATTA----CAGCGTAAC
gi|5                          :                                 ACGCCGCACAT-TTCCAGCAAATGTTAAATCAGCATTTTCTTGTAGT-------------------GTAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTT------T-AACACTTC-------GATTCATTTGAT-----------GTTTGCATATAATGATTTCA-------AATAACTTA--CA---------------CTCAATGCATATTAAATTGAAACTAAATATATACAG---TT-CAAGACTGATTATAG-AAT---AATTATA--TCTA---AAGAATAAGT------GAT-TT-CATATTG-TAT-GAA-TGTTTA-----CACAGTTT-ATT-CTGGTGTTT--TCA-TTTAAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT--------GA----TGATTAACCTCTTGTAGAA------------TAACTCATGTCAA-AA---CAAGTTAC--A-TTTT-AACAACAC------ATACCAG-TCTTTAAAAGA-TT-A-CAAGAGGCGGCG---------AAGTGTTTGTTT-TTGACAGGTGTC-GCTTTGTTGCATGA----TGT-A-TATTTCCTGAACTGGTACAT------TAAGGGCTTTCCA-TTTTAA-CACC--TTTTGTTATAACAATGATT-GGTATTGAAAATAATCTATACTTTGTAAGATAATT-TGATTAGTCAAAACATA----TTTTATATAGT-----A---T------GCTTT-G-ACTTGAAA-T---CGAAA--G--AGAT-GTTT-A-GA-GTCAGTTT-TAG----------GAAGGCATTTGAAGGAAGAAGTCAT-----TAGAAACGAGGTTTTAATAA-AAGTGGGTTTC--AACAGTGATTTTAGATATTGGATTTCCGAAGAAAATACAAC---TTAATATACATTTATG--CTAAAT---TAACGTTGAT-GTAAAT-------AAC--TTA--A--CAA---ATAGTTTTGTCTGGTAATACCGACATAGA----TAGATATA----TATTG--------GATTTCCAA------TTGT---------CAAAAGTTGAT---CAAGATAAT---AGTATATAAAAGGAAAGAAAGTATATGTTGAACTTGTGT--G-------TT--ATT-TCACTTATTCACCTA-ATAAAAAAACTT----AG--AC--ACATATTT----CAGCGTAA
gi|6                          :                                                                                         TTTGACACTCGCGGACTTAAAGTCATTTTGGTGTAATA-A-TTTT------T-AACGCTTT-------GGTCTATTTGATATTTGAAAATAGTTAGCATATAATGGTATCA-------AATAACTAA--CA---------------ATCAATGCATATTCAATTGAAACCAAGTATCTACAA---TT-CAAGACTGATGATAG-ATTAAAAAATATATTTCTA---GAAAATAAGT-TTA-CAAT-TTTTATATTG-TAT-GAA-TGTTTA-----AACA-TTTTATT-CTGGTATTT--TCATTT-AAAGAATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---AT----TGATTAACGTTTCGTAGAA------------TAATTCGTGTCAG-AA---CA--T-------TTTT-AACAACAT------ATACCAT-CCTTCAAATAA-TTCATCAAGATAATGCGGATTTGTTTCAGTGTTTGTTTGT-GACAGGTGACAGGTTTGTTGCATTA----TGT-T-CATTTACTGAACTA------GTACATCAAGGGCTTTTGA-TTT-AA-CAAC--TTTTGTTATGACATTGATT-GGTATTGAAAATAATTTATATTTTATTAGACAGTT-TTAGTAGTCTAAATATA----TGTTATAT--TAGAGAA---T------GTTTT-G-ACTTGAAA-T-----AGT--C--AGTT--TTTGT-GA-G--A-TTT-AAGGAAGGAAGTTGAAGG----------AAGAAGTCAT--T--TAGAAAAGAG---ATAA-AA-AAGTGATTTTC--CACAGTTGTTATACACATCGAATTTCCGAAGAAA---CAAT---TTA---TACAAGTGTG--CTAAAT---TTACGTCGTTTGTGAAT-------AAC--TCA-------A---ATAGTTCT-------------------------TAATTGAA----TATT--------------------------GT---------CAAAAGTTGAT---TAAGATTAT---TGCACATAAAAGGAAAGCAACTATAAATTCGACGTGTGG--G-------TT--ATT-TCACTTATACACCTATA-TAATTTA-GT----AG--A--AAAACAAAACGAGCAGCGTAACAt
gi|7                          :                                                                                                                     TAGTGTAATA-C-TTCA------C-ATCGCTTTTACATAAAATGTAATTCATATTTTCAAATAGTATCCATATAGTGATATTA-------AATAAGT---------------------------GT-TATTAGA---AAA-TAAGTATATAAAA------------------------T---GAATGTA---CT------------GTGTTG-CAAT-TTTCAGATTA-TAT-AAAATGCTAT-----GACGTTTC-ATT-CTGGTATTTCTTC--TT-AAAGCATTAT-----ATAAATAT-TTA----C---GT-----------CGTCTCATAGAAAAAAATACCTGTCAAATTATGTCAA-AT---CAACTTGC--A-TTTT-AACAACATGATATTATACAATATTTTGAAATAA-TT---TAACAGACGGCAGATT-ATATAAATGGTTATTT-T-GACAGATGTT-A--TCGT-GCTTAA-----GC-AATATTTTCTTAACGGTTACAT-T---TTAAAGGTTTTCGAATTT-AG-CAAC--GTTTATTGTAA----GGTTCGGTATTTAAA-TAATACAGATTT-ATTAGACAATA-TAATTTAT-AAAGT-------TATTGTAT--A-----AAGCT------G-TTT-T-GACTTGAA-TA--CAAGA--TGGAGTTAATCT-T-AA-G--GGTTT--------------GAA-------------AATAGTCGC-----TAGAAGGGAA---GCAA-AA-ATGTG----TC--CACAGTGATTATTCATACCGAATTTCCGAAGATA---CA------TA---AATATGTCTGTTCTAAAT---TAAC--T--TTGTGAAA-------TAT--TTA--A--TTATTGATAACTTTGACTGGTTATACAAATATAGA----TAGGTTGA----TACTG--------GCCTTCCAA------TTGT---------T--AAGTTAATACGTATGAATATAAATGTAT-TAAAGG----GAAATT--AAGCTGGACTT-TCTTAA-TA-T--TT--ACT-T
gi|8                          :                                          tcagagtttatataatagTGTCAGTATTTTCTATTACT-GTGTGTT--TTG-CGCTTGCAGATTTTAGGTCATTTTGGTGTAATACA-TTTTAAATTTT-AATGCTTT-------GATATATTTGATATTTGAAAATATTTTCTATGTAATGGTATCA-------AATAAGTGT--TA---------------ATAAATACATATTTAATTGAA-CTATGTACATACAG---TT-CAGGACTGATTATAA-ATT---AAATGTA--TCAA---AGAAAAAAAA-TTG-CAAG-TTTCATATTG-TAT-AAAATGTTAA-----GATATTCTT-TT-CTGGTATTT--TAC-TT-TGATCGTTTTCAAAGA-ATTTATAGTT----T---AT----T-ATTAACGT-------AG------------CAACACA-GTCAA-A--------TAAC--A-TTTT-AAGAACAT------ATGCCAT-TCTAAAAATAA-TT-A-C--TAGACAGTGGATTTGTATAAATGTTTGTTT-T-GACAGGTGTC-TCTTTGTTGCATAA----TGT-A--ATTTTATAAAC----ATATTT---TTA---GATTTAGATTTT-AG-CACC--ATTGATTATAAGAATGATT-GTTATATAAAGTAATCTGGGTTTTATCAGA-AATTATGAATA--TGATATGAACTTTTGTTACATG-T-----A---TATAGACG-TTT-A-GACCTGAA-TGCGTGATA--C--AGTTAGTTT-tttatttaacagaaactaatcgaagagaataacaataaaaagtaa
gi|9                          :                               ttATGCCACACAG-TTTCAGTAAAAATTGTGTCAGCATTTTATTGTTAT-ATATTTTCTTTGACACTCGCAGATTAAAAATATTTTTTTTGTAATA-A-TTTT------T-AGCGCTTT-------GATTTATTTGATGTTTGAAAATGGTTTGCACAAGATGGTGTTA-------AATAACTTA--CA---------------ATCAAAGCATATTTGATTAAATCTAAATATACAAAA---GT-CAAGACTGATTATGT-ATT---AAATATA--TCTA---AAGAATAAGT-TTG-CAAT-TTTCATATTG-TAT-GAA-TGTTAA-----CACATTTTTATT-CTGGTGTTT--TCA-TT-AAAGCATTTT-----A-ATGTAT-TTT----T---GTTTTGTGATTAACGTCTCGTAGAC------------TGATTCGTGTCAA-AA---CAAGTAAC--A-TTTT-AACAACAT------ATGTCAT-TCTTTAAATAA-TT-A-CAAGAGACGGCGGATTTGTATAAGTGTTTGTTT-T-GAAAGGTGTC-GCTTTGTTGCATAA----TGT-A-TATTTCCTGAACTAGTACATGTACATGAAGGGCTTTCGA-TTT-AG-CACC--TTTTGTTATAACAATG