lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                     11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                    1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1111111111111111111111111111                                                                                                              111111111111111111111                                                                       111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1111111111                                      111111                                                                                                                                                               33333333333333333333                                                                                                        222222222222                                                                                                           3333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    22222222222222222                                                                                                                                                 11111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           222222222222222222                                                                  1111111111                                                                                                               22222222222222                                                                                                            222222222222222222                                                                                                                                                                333333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11111111                                                         33333333333333333333333                                                                                          111111111111                                                                                                                          1111111111111111111                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                     222       1     99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999              1     2222222222222222           222   11  444444444444       1               3333     1          1   2   4444444444444444          333   11   22   2     333333333333333333                                    222       22222     22            111           22         44444         1             11                       2    11                        2222222222222222222222222222              1111      1             555 11                    55555555     111    22222     222   1         777777777777777777777                                                              111      444444444444444444444444444444444444444444444444             111            1       11  11       2                   1                                                22     1  55  1     1      1                            1     222  1       1                         1        1  6666666   1        1     66666666                                1      11         222                                                1               1              1               1   1            1                 1        7777777777                                      111111      1       1   11                    2222                1                                              1    1                                              00000000000000000000      1             8888    1           11          1   22   33                22      1                000000000000                    1     1                   1  333                                              1        1111111111111111111                                 1    1                                                1             22   1                                    22                           4        33  1            1     1                                                               11                                                                      88888888888888888                                33        1     222                    11           1                                            1     1         00000                        1                   1          11  4               11   22                         1       222           1         1              1  1          1                                             444444          222             1                                   1                                    1                           999999999999999999   1       4      1        1                                      7777777777             11                         1        1      4       222              1                             33333333333333        33                                         333                       99999999999  1                 999999999999999999              1          222                22                     1     1        1  33   1           33        4               22           1                  000000000000000000000000                                            4       1          1                                                   1   1       1               11                                                                   1  1                   1   1                           777        11                 44444444         1           44444         1       1             22222222222222222222222                            1          1    55555        1     33                         000000000000                  444444444444               1                           11             1                                 8888888888888888888                            22                  1  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               6     777   6   5     99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999              0     7777777777777777           000   88  666666666666     4 5         4  6  3333 2   5    4     5   0   4444444444444444          555   99   66   0     999999999999999999   2    4       4              2  2 111  77   22222     77   4     4  444  2   4    55  3      00000 3    3  5             77  3              2     0 4  88     2   2              9999999999999999999999999999  6      4    0000  6 6 0  555  4     000 00        3 66     2  33333333     111    33333     999   5       2 333333333333333333333     4  2 3            2  2         6       55              6 777 55   555555555555555555555555555555555555555555555555 3       66  666       88   1    2  44  88    3  0 4  6              7       6    6   6                  6            33  6  7  55  5     5      5                            5  6  222  7       5         6          6    5 6 6    5  4444444   5   6 6  5     44444444                                7      22         555        6 6                                     5               5         6    7         6   6 7   5   6      6 7                 7 6      5555555555        6 6     6                     555555    6 5       5   22                    6666                5        6                                     7    7       6 6     6                              22222222222222222222  6   5             5555    5 6    6    22          7   11   44        6       11      7             6  555555555555                    5     7        6          5  555     6            6         6                 5        0000000000000000000      2                4         5  2 5  2    6     6                                  7    6        33   7                6                   33 6                 6       0     6  22  5   6  6 6   7     7                       6  6   6        6                     6 22 6  6                               6                       6     6   00000000000000000  6                             44        7     333           6        22  6    6   5                  6                6        7     7       6 00000   6            6       5                   5          22  0 6             22   11                     6   7       222           5         5         6    5  5          5                       6                     222222        6 000             5    6       6        6             7                   6                5                           555555555555555555   7       0 6    5        7                                      5555555555        6    22           6      6      5        7      0       333              7    6   6                    55555555555555        22                   6                6    666                       88888888888  5           6     555555555555555555           6  5          333                11                     5     5     6  5  44   5 6         22        0            6  11           5       6       6  555555555555555555555555     6             6      6        6  6     0       5        6 5     6               6 6     6                     5   5       5      6        22   6            6                                    6             7  7                   5   5         6                 000     6  22            6    55555555         5      6    55555       6 5   6   5             11111111111111111111111  6            6       6  6 5          5    99999     66 5     00                         000000000000 6            2   222222222222               5             5    5 0  2   88             5        66      66   6           5555555555555555555                       6    11     8    0 66    5  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               .     ...   .   .     ................................................................................................................................................................................              .     ................           ...   ..  ............     . .         .  .  .... .   .    .     .   .   ................          ...   ..   ..   .     ..................   .    .       .              .  . ...  ..   .....     ..   .     .  ...  .   .    ..  .      ..... .    .  .             ..  .              .     . .  ..     .   .              ............................  .      .    ....  . . .  ...  .     ... ..        . ..     .  ........     ...    .....     ...   .       . .....................     .  . .            .  .         .       ..              . ... ..   ................................................ .       ..  ...       ..   .    .  ..  ..    .  . .  .              .       .    .   .                  .            ..  .  .  ..  .     .      .                            .  .  ...  .       .         .          .    . . .    .  .......   .   . .  .     ........                                .      ..         ...        . .                                     .               .         .    .         .   . .   .   .      . .                 . .      ..........        . .     .                     ......    . .       .   ..                    ....                .        .                                     .    .       . .     .                              ....................  .   .             ....    . .    .    ..          .   ..   ..        .       ..      .             .  ............                    .     .        .          .  ...     .            .         .                 .        ...................      .                .         .  . .  .    .     .                                  .    .        ..   .                .                   .. .                 .       .     .  ..  .   .  . .   .     .                       .  .   .        .                     . .. .  .                               .                       .     .   .................  .                             ..        .     ...           .        ..  .    .   .                  .                .        .     .       . .....   .            .       .                   .          ..  . .             ..   ..                     .   .       ...           .         .         .    .  .          .                       .                     ......        . ...             .    .       .        .             .                   .                .                           ..................   .       . .    .        .                                      ..........        .    ..           .      .      .        .      .       ...              .    .   .                    ..............        ..                   .                .    ...                       ...........  .           .     ..................           .  .          ...                ..                     .     .     .  .  ..   . .         ..        .            .  ..           .       .       .  ........................     .             .      .        .  .     .       .        . .     .               . .     .                     .   .       .      .        ..   .            .                                    .             .  .                   .   .         .                 ...     .  ..            .    ........         .      .    .....       . .   .   .             .......................  .            .       .  . .          .    .....     .. .     ..                         ............ .            .   ............               .             .    . .  .   ..             .        ..      ..   .           ...................                       .    ..     .    . ..    .  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               0     000   0   0     55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555              5     5555555555555555           555   00  555555555555     0 0         0  0  0000 5   5    0     5   0   0000000000000000          000   00   00   0     555555555555555555   5    0       0              5  5 555  00   55555     55   0     0  000  5   0    55  0      00000 0    0  0             55  0              5     0 0  55     5   5              0000000000000000000000000000  0      0    5555  0 0 5  000  0     555 00        0 55     5  00000000     555    00000     000   0       5 555555555555555555555     0  5 0            5  5         0       00              0 000 00   555555555555555555555555555555555555555555555555 0       55  000       55   5    5  00  00    0  0 0  0              0       0    0   0                  0            00  0  0  00  0     0      0                            0  0  000  0       0         0          0    0 0 0    0  0000000   0   0 0  0     00000000                                0      00         000        0 0                                     0               0         0    0         0   0 0   0   0      0 0                 0 0      0000000000        0 0     0                     000000    0 0       0   00                    0000                0        0                                     0    0       0 0     0                              00000000000000000000  0   0             0000    0 0    0    00          0   00   00        0       00      0             0  000000000000                    0     0        0          0  000     0            0         0                 0        0000000000000000000      5                0         0  5 0  5    0     0                                  0    0        00   0                0                   00 0                 0       0     0  00  0   0  0 0   0     0                       0  0   0        0                     0 00 0  0                               0                       0     0   00000000000000000  0                             00        0     000           0        00  0    0   0                  0                0        0     0       0 00000   0            0       0                   0          00  0 0             00   00                     0   0       000           0         0         0    0  0          0                       0                     000000        0 000             0    0       0        0             0                   0                0                           000000000000000000   0       0 0    0        0                                      0000000000        0    00           0      0      0        0      0       000              0    0   0                    00000000000000        00                   0                0    000                       00000000000  0           0     000000000000000000           0  0          000                00                     0     0     0  0  00   0 0         00        0            0  00           0       0       0  000000000000000000000000     0             0      0        0  0     0       0        0 0     0               0 0     0                     0   0       0      0        00   0            0                                    0             0  0                   0   0         0                 000     0  00            0    00000000         0      0    00000       0 0   0   0             00000000000000000000000  0            0       0  0 0          5    00000     55 0     00                         888888888888 0            1   333333333333               0             6    0 1  5   11             2        99      99   5           9999999999999999999                       0    00     8    8 99    0  
consensus                     :                                                                                                                                           NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTANTCCATTCGAGGCACNNGANGATANCTAGGGCTGNNGGTTGTATGCGCATGTTCAAAGTTCCATTCTTTNGAGAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTGCTCTGGNCAATAATACATTGCGTTGTCNGAGACTAGCTTNTCCGGTGATANCCATGTCTNGCAAATATGCACCTTNAGCNTTTGTACNNTGCCACTGCTGTGCTTCGTGTCAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTCCGAGAAATCGGCTGNAGTAATCNACAGTAACCAGGCANTCNTTANTCNNCCATGAGTGAAACCGGTCNGTGGCNACNNTCTNCCANGGTCGATCNGGGGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTNTTNGAATTCCGGTGTTTNAGACAGANTGTNGCATTNCAANACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCGTTTTCGGCCCTACCAGTCCAAAACATNACGTCNCGTGCTCTNTGNGNACNTTTTTNCTGTNCCCATGCGNCNNGTATGNACTTTTTCGNTTGTATNNTGTCATCAAGCGGTAAGTTTGGGATGACNAGTGTTTTTCCCTTTCTCACCTCTGAANATNANGTCGTCTGAAACGGANAGCTCGTCTCTGTGGTTNNAATACTCCACAGCTAANNNGNNGCAGTCTACTNTCTTAANTCTGGCCAGCCNTGAANNATAGTCCATGTTNAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGNACANGTTCGAGTTNTATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAAGGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATATAACATTTGTCTGGGTTAAATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATNCCATCAACAATTGAAGNAACACCCGTTGANCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCTTGTT------------------GTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----CA---------------TTTCACTTAATTCCATTTTAATTGAATAAAGTGTTACTATTTGCGGT-TTTTTANNTCTGGCACAGTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA----TGTAATACGAAATAGTAATACA---AT---GATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAG-ATAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAAGAAATTGGG---ATTG--------T--CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                           CATGTGTTGATGGCAATATAGATCTTAACCTACGTCCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT------CACA------AAGTTCCATTCTTTTGAGAA-----G----------GAAGCAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTC-AACTTAAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAAC--GTCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATTTCGGTGTTTCAAACA-ATTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTT--G----------CCGAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA----------T----------CTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA-TTT-CTTTCT-AAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC--T-TT---ATGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAG-TATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT--GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATTACATTTGTTTGGGTTAAATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCACTTTAATTAAACACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACCATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---AT---G---GAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAG-ATAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAAGAAATTGGGTAAATTG-GTAAGAATT-CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                              CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAGGATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTATGTGTA------AAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAA------------TTATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAA--GTTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTCGAAGA-ATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACCGGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTT-AATGGTTCCTTTGTTTTGGAATTCCGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTT--GCCCTACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTTCCC----------CTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC--AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCCAT-TTCA-AGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATA
gi|2                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaCTACTTTATTCGA--C-CTTGAGGATATCTAGGACTGCTAGT------CACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----G----------GAAGTAAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAAATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAAC--ATCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATTTCGGTGTTTCAAACA-AATGTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTTCGG----------TCAAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGA----------TTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCA-TTT-TTGTCTTAAGT----------A--AAGAATAGTC--TGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAG-TTTATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAAGGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATATAACATTTGTCTGGGTTAAATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCTTGTT------------------GTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----CA---------------TTTCACTTAATTCCATTTTAATTGAATAAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACACAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAATACAATGAT---G---GAATGAAAATATTtctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---ATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccccatcaatgtcattttctgaaattcaacagatataaagTACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA--GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATGTTCAGACA---AT---GATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAG-ATAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAAGAAACTGGG----CTG-----------CTAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAaat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttaattttatatcatttaaagtatatcgaatcaaaaTGTAATATCTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAAAACAGTGAT---G---GAGTGAAAGTATTAAGAAAC--------------------ACTACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAAGAAATTGGG----TTG-----------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATtttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAAAACA---AT---GATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAG-ATAAGACTACTTTATTCGACCT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccGTAATTTTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAATACA---ATAATG---GAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAG-ATACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAAGAAATTGG----ATTGCATA-----------GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTA------------------AGTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AAAAAATTGGGT---T-------GCAT-----GATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCCA----TACAATGCATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACA---AT---GATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAG-ATAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAAGAAATTGGGC----TG-----------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGTAATAATTGC-----TGTAATACGAAATAGTAATACA---AT---GACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAA-ATAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAAGAAATTGGGT----TG-----------CTAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatatctgattggtttgatAGTAGTAATATA---AT---GTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAG-A-----CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAAGAAATTGGG---AT-------GCATT-----GTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTtat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagtagtagtTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-----AATTG---AAATTG------AGTTGCTAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTtac
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): AATTTACTTCAAAATTTCCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGACTGGTAGCTTATCTCTATTGACGAATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGTTTCGTCCGTCAAAGTGGAACAGGTCATTGACTACATGTGCTATGGTCTCAAGAGTACCTCATAGGGAGTTAATAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTGGGCATTGCAAAACATAGTTGATTATTTGTTCTGCCATACCAGCCCAACACATGCCGTTTTTGC
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|14 ): ATGATTTGTTGCAGTCTGCTCTCAATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCCGTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGTGCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGTCTGTAAAGTTCATTCCTTTGAGGATA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     11111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                444444444                             22       11                                                    33333333            66666666666                      00000000000000                      9999999999999999999                                                        333                 22        11   222             222        1    1     222   2222222                                      11           1   1     22            11            22           222           1                     22222              1    11                        7777777777777777777777777777                                      222                       555555                        111             55555555555555555555                                                                            1     33             11            4444                                 1                     11                                                                            11                                                                                                          11                  111     1                                                                                                                                                                                                4444444444                                      555555                                                                                                                                                               55555555555555555555                    4444                                                                                444444444444                          1             11    222     11                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                       44444444444444444                                                                                                                                                 55555                                                           1                                                                                                                                                          2    1                                                                                                                               666666666666666666           2                                                      4444444444                                                        2                                                      55555555555555                                                                             333333                         444444444444444444                                                                                                                2                                               5555555555555555     222                                            1                                                                                                                                                                                                                              333                           33333333                     2                                     444444444444444444444                2222     333333      1                22222               111                            44444444                                                                                                                      5555555555555555                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          2        3     3 3    000000000        55    2      4    4  77     4 88   2  2   2       4  2    55  2 4         4     2   44444444     1  0   77777777777  1 7  999   0   222  22222222222222                1     2222222222222222222        6    888   7               1    0      1     7  111   7    1     7  44     1  33   111 22 2        444   22   2 2  5     444   4444444  8     2   55       1        0 2 2 1 11 777  22   5   5     33   11    1  11 0 1   1    11  1  2   0 111 1    1    5            1  1     33333        1     9 1  66     1   1              9999999999999999999999999999         1     1        1  1 1  1     333  1      0 1 22     1  888888 1      22    7 0    11 000     0     1 99999999999999999999      1  1 1   0       0   1  0        0     22       0 0 11   333 22   8   9  1  00  1 55   2 2 11 0  22      2222  777 1       22  333        1   0    1  33   1    6   77                 4                                                 4     4  88  3     3      2                            2     2 4  4       7         1               7   0       7    44             7    999     3                                                  4 4                                                2               2              4               4   2            4                 4        0000000000                                      222222      2       2                          2 2                2                                              4    4                                              77777777777777777777      2             2222    2                       4    3   88                 2      4                666666666666                          6      6      88    333     55                                                        7                        11               1      0   0 1     0                                            4              4   4                                    4                            5        66  2            4     4                                                                                                                                       00000000000000000                                88        4     2 4                                 3                                            4     4         00000                        2                   2              5                    3                          4       4 2           3         3              2  2          2                                             0    5          2 3             2                                   4                                    2                           333333333333333333   4       0      3        4                                      0000000000                                        2        4      0       3 4              4                             11111111111111        66                                         333                       666666    3  3                 777777777777777777              2          4 2                2                      3     3        2  88   2           66        0                2           3                  8888888888888888     000                                            5       2          2                                                   2   3       2                                                                                    4  4                   2   3                           555                           55555555         2           0  4          3       2             2 888888888888888888888                8888     888888      3     6   0  7   33333      22 6  0  444                            88888888              3                               0      3     4   1                           66      66   4  66         1111111111111111  1                                        66       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .        .     . .    .........        ..    .      .    .  ..     . ..   .  .   .       .  .    ..  . .         .     .   ........     .  .   ...........  . .  ...   .   ...  ..............                .     ...................        .    ...   .               .    .      .     .  ...   .    .     .  ..     .  ..   ... .. .        ...   ..   . .  .     ...   .......  .     .   ..       .        . . . . .. ...  ..   .   .     ..   ..    .  .. . .   .    ..  .  .   . ... .    .    .            .  .     .....        .     . .  ..     .   .              ............................         .     .        .  . .  .     ...  .      . . ..     .  ...... .      ..    . .    .. ...     .     . ....................      .  . .   .       .   .  .        .     ..       . . ..   ... ..   .   .  .  ..  . ..   . . .. .  ..      ....  ... .       ..  ...        .   .    .  ..   .    .   ..                 .                                                 .     .  ..  .     .      .                            .     . .  .       .         .               .   .       .    ..             .    ...     .                                                  . .                                                .               .              .               .   .            .                 .        ..........                                      ......      .       .                          . .                .                                              .    .                                              ....................      .             ....    .                       .    .   ..                 .      .                ............                          .      .      ..    ...     ..                                                        .                        ..               .      .   . .     .                                            .              .   .                                    .                            .        ..  .            .     .                                                                                                                                       .................                                ..        .     . .                                 .                                            .     .         .....                        .                   .              .                    .                          .       . .           .         .              .  .          .                                             .    .          . .             .                                   .                                    .                           ..................   .       .      .        .                                      ..........                                        .        .      .       . .              .                             ..............        ..                                         ...                       ......    .  .                 ..................              .          . .                .                      .     .        .  ..   .           ..        .                .           .                  ................     ...                                            .       .          .                                                   .   .       .                                                                                    .  .                   .   .                           ...                           ........         .           .  .          .       .             . .....................                ....     ......      .     .   .  .   .....      .. .  .  ...                            ........              .                               .      .     .   .                           ..      ..   .  ..         ................  .                                        ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          5        0     0 0    555555555        55    5      0    0  55     0 00   5  5   5       0  5    55  5 0         0     5   00000000     0  7   00000000000  0 3  000   7   777  33333333333333                0     3333333333333333333        7    333   3               0    7      0     3  777   3    0     3  00     0  22   000 00 0        555   88   8 5  5     555   5555555  2     5   22       0        2 0 0 0 00 222  00   5   5     88   22    0  88 2 0   0    88  0  0   2 000 0    0    0            0  0     22222        0     0 0  55     0   0              8888888888888888888888888888         0     0        0  0 0  0     000  0      7 0 00     0  333333 0      00    3 7    33 000     7     0 00000000000000000000      0  0 0   7       7   0  7        7     00       7 7 33   000 00   8   2  0  88  0 55   5 5 00 2  00      0000  555 0       00  000        0   8    0  55   0    5   88                 0                                                 0     0  55  0     0      5                            5     5 0  0       0         0               7   7       3    33             3    777     3                                                  0 0                                                5               5              0               0   5            0                 0        0000000000                                      555555      5       5                          5 5                5                                              0    0                                              00000000000000000000      5             5555    5                       0    0   00                 5      0                000000000000                          0      7      33    333     00                                                        3                        77               0      7   7 0     7                                            0              0   0                                    0                            5        55  5            0     0                                                                                                                                       00000000000000000                                00        0     5 0                                 0                                            0     0         00000                        5                   5              5                    0                          0       0 5           0         0              5  5          5                                             0    0          5 0             5                                   0                                    5                           555555555555555555   0       0      0        0                                      0000000000                                        5        0      0       0 0              0                             55555555555555        55                                         555                       000000    0  0                 555555555555555555              5          0 5                5                      0     0        5  00   5           55        0                5           0                  0000000000000000     555                                            0       5          5                                                   5   0       5                                                                                    0  0                   5   0                           000                           00000000         5           0  0          0       5             5 555555555555555555555                3333     333333      3     7   7  3   33333      00 7  7  333                            99999999              5                               9      9     4   1                           11      11   8  11         6666666666666666  9                                        11       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--CACTT-GATGATATTTAGGACTGCTAGT--------CATGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT--G--GAGGCAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTGA--GCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGAATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAAC-GGTCNGTGGCTACNATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATTT----CGGTGTTTNAGACAGATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTT--GCC-TACCAGCCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCACG-----GCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA----------C---------TCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTGCTCTCT-AANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCC-TGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACNTGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATAT-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACAC-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( family-5759 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTANTCCATTCGAGGCACNN-GANGATANCTAGGGCTGNNGGTTGTATGCGCATGTTCAAAGTTCCATTCTTTNGAGAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTGCTCTGGNCAATAATACATTGCGTTGTCNGAGACTAGCTTNTCCGGTGATANCCATGTCTNGCAAATATGCACCTTNAGCNTTTGTACNNTGCCACTGCTGTGCTTCGTGTCAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTCCGAGAAATCGGCTGNAGTAATCNACAGTAACCAGGCANTCNTTANTCNNCCATGAGTGAAACCGGTCNGTGGCNACNNTCTNCCANGGTCGATCNGGGGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTNTTNGAATTC----CGGTGTTTNAGACAGANTGTNGCATTNCAANACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCGTTTTCGGCCCTACCAGTCCAAAACATNACGTCNCGTGCTCTNTGNGNACNTTTTTNCTGTNCCCATGCGNCNNGTATGNACTTTTTCGNTTGTATNNTGTCATCAAGCGGTAAGTTTGGGATGACNAGTGTTTTTCCCTTTCTCACCTCTGAANATNANGTCGTCTGAAACGGANAGCTCGTCTCTGTGGTTNNAATACTCCACAGCTAANNNGNNGCAGTCTACTNTCTTAANTCTGGCCAGCCNTGAANNATAGTCCATGTTNAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGNACANGTTCGAGTTNTATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATATAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATNCCATCAACAATTGAAGNAACACCCGTTGANCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCTTGTT------------------GTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----CA---------------TTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTACTATTTGCGGT-TTTTTANNTCTGGCACAGTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA----TGTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG---ATTG--------TCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT------ACTTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--------CA----CAAAGTTCCATTCTTTTGAGAA-------------G--GAAGCAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTGA--GCCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTCAA-CTTAAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAAC--GTCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATTT----CGGTGTTTCAAACA-ATTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTT-----------G-CCGAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCACG-----GCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA--------------------TCTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA-TTT-CTTTCT-AAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC----TTTA--TGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAGT-ATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT---GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATTACATTTGTTTGGG--TTAA---ATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAC----TTTAA------TTAAAC-ACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACCATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---ATGGAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGGTAAATTGGTAAGAATTCTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catgtgttgatggcaatatagatcttaacctacgtTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAA------------GTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AA--AAAATTGGG----TTG--------CAT-GATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCC----ATACAATGCATGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCAATGT--CATTT-TCTGAAATTCAACAGATATAAAGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccccTGTAATATCTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAAAACAGTGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACAC--------------------TACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTAGTA-GTAGTAGTAATATAATGTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAGA------CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAA--GAAATTGGG---A-TG--------CAT-TGTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taTGATTTGTTGCAGTCTGCTCTC--AATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCC--GTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGT-GCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAAAACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTtctgtaaagttcattcctttgaggata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-AATTGAAATTGAG----TTG---------CTAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTCAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTACTTTATTCGA--C-CTT-GAGGATATCTAGGACTGCTAGT------CACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT----------AAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTGA--GCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAAATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAAC--ATCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATTT----CGGTGTTTCAAACA-AATGTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTTCGGTC----------AAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCACG-----GCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGA----------TTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCATTTT--TGTCTTAAGT------------AAAGAATAGTC--TGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAGTT-TATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATATAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCTTGTT------------------GTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----CA---------------TTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACACAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAATACAATGATGGAATGAAAATATTgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAG-GATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTATG----TGT--AAAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAAT------------TATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAAG--TTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTC-GAAGAATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACCGGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTTAA-TGGTTCCTTTGTTTTGGAATTC----CGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTT--GCCCTACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTTCCC----------CTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC--AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCCAT-TTC-AAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaTACGTCAAGGTCGTATTTCTGTAATTGAAGCATCATTCTCTGCAG-CCGCGGCGGGGCAG--CAGAATGGGAT-TTCTTCATAATGAAGGATAACGGTTTATGGTCAGActgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|4                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctactcattaacagttgagatggagaataattacagaaaagcggcgtgtttctgtattcaaggatagcaatataggtatcgctcccgctgtcttttgccttctgtaacaatcgcttgacagtttggacagtcctctcagctaatccattaggcataggatgtaatgggctggaggttgtatgtgtaaaattccattctttggaaaacaattgaaagtttgccgaggcaaactgtggccaattatctgaaactaacttatccgggatacccagtctagcaaaatgcactttaagtttccttaccactgttgtgcttcgtgtgtctggtaacctgtctatctcgaagaatctactgtaataatctacagtaactagacagttctgtcaatcaaagtgaaaccggtcaatggctacattcttccatggtctcgggggtacctcaaggggagttaatggttcctttgttttggaattccggtgtttaagacagattgggcattccaaaacaaagttaattatttgttttgccctaccagtccaaaacataacatcttttgctctttggaaacttttttactgttcccatacggccaatatgaactttttcaattatatgctgtctaagtggttttgggataaccagtgtttttcccctaaatataagatcgtctgaaattgagagctcatctctgtggttaaaatattccacaactaattcgttgcagtctactctcaattctggccagccttgaactatagtccatttcaaggcttgcatatgatggtcagtcttagtggcttctctcacagattcgagttatatctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtctCTTCAAAATTT---CCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGA--CTGGTAGCTTATCTCTATT-GACGAATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGT--TTCGTCCGTCA-AAGTGGAACAGGTCATTGACTACA-TGTGCTATGGTC--TCAAGAGTACCTCATAGGGAGTTAA-TAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTG-GGCATTGCAAAACATAGTTGATTAT--------TTGTTCT--GCCATACCAGCCCAACACATGCCGTgtgaacaacgactgctctacctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatttaTTAATTTTATATCATTTAAAGTATATCGAATCAAAAT---ACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA--GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATGTTCAGACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAACTGGG----CTG---------CTAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAttttgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTAATAATTGC-----TGTAATACGAAATAGTAATACAATGACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAAA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAtttgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatatctgattggtttgatGTAATTTTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAATACAATAATGGAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAGA-TACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAA--GAAATT-GG---ATTG--------CATA-GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAGA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----CTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             222222222                             11       11                                                    33333333            44444444                        5555555555                      33333     8888888888                                                      11                    1             222             222        1    1     222   1111  1     1                                              1   1    1 111           1             22           222         1                       2222               1    11                        66666666       33333333333333                                     22                       33333                         111             1111111111                                                                            1    11                           333                                 1                     11                                                                            11                                                                                                          1                   111     1                                                                                                                                                                                                4444444444                                      222222                                                                                                                                                               55555555555555555555                    2222                                                                                444444444444                         2222            11    222     33                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                       66666666666666666                                                                                                                                                 22222                                                           1                                                                                                                                                          1    1                                                                                                                               666666666666666666           1                                                      4444444444                                                        1                                                      55555555555555                                                                             222  1                     666666666666666666                                                                                                                    1                                               5555555555555555     222                                            1                                                                                                                                                                                                                              222                           33333333                     1                                     66666666666666666666                 2222     333333      1                22222               3333                            44444444                                                                                                                             333333333                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2        1     1 1    666666666        22    1      1    1  88     1 88   1  1   1       1  1    22  1 1         1     1   44444444            22222222      7    7            4444444444                3     33333     6666666666       6      6  7                                  7 88     7          7   3     1 999   111 11          444   22   0 2  5     444   0000  0     0   2   22                0     1 99 777  88   5   5    0 999  11       0  0     1    11  1      0 111 1    1  5              0  1     1111         1     0  3 66         1              33333333       22222222222222       1              1              00         0             33333               7      0  000             3333333333               0       0                                       333 22   8   2    88  1 55   2 2 88 0  11      666    3 1       22  333        1   0    1  22   1    1   44                 1                                                 1     1  66  1     1      1                            1     1 1  1                                 1           7    3              7    999     3                                                  1 1                                                1               1              1               1   1            1                 1        0000000000                                      888888      1       1                          1 1                1                                              1    1                                              77777777777777777777      1             3333    1                       1    2   22                 1      1                666666666666                         5555     6      88    333     44                                                        7                                                0           0                                            1              1   1                                    1                            5        22  1            1     1                                                                                                                                       00000000000000000                                22        1     1 1                                 1                                            1     1         77777                        1                   1              5                    1                          1       1 1           1         1              1  1          1                                             5    5          1 1             1                                   1                                    1                           333333333333333333   1       5      1        1                                      0000000000                                        1        1      5       1 1              1                             11111111111111        22                                         1 1                       000  5    1  1             111111111111111111                  1          1 1                1                      1     1        1  22   1           22        5                1           1                  8888888888888888     000                                            5       1          1                                                   1   1       1                                                                                    1  1                   1   1                           111                           55555555         1           5  1          1       1             1 88888888888888888888                 8888     888888 0    3     6      7   33333         6     4444                            00000000              3                               0      3     4   1                           66      66   4  66         9999   555555555  1                                        66       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .        .     . .    .........        ..    .      .    .  ..     . ..   .  .   .       .  .    ..  . .         .     .   ........            ........      .    .            ..........                .     .....     ..........       .      .  .                                  . ..     .          .   .     . ...   ... ..          ...   ..   . .  .     ...   ....  .     .   .   ..                .     . .. ...  ..   .   .    . ...  ..       .  .     .    ..  .      . ... .    .  .              .  .     ....         .     .  . ..         .              ........       ..............       .              .              ..         .             .....               .      .  ...             ..........               .       .                                       ... ..   .   .    ..  . ..   . . .. .  ..      ...    . .       ..  ...        .   .    .  ..   .    .   ..                 .                                                 .     .  ..  .     .      .                            .     . .  .                                 .           .    .              .    ...     .                                                  . .                                                .               .              .               .   .            .                 .        ..........                                      ......      .       .                          . .                .                                              .    .                                              ....................      .             ....    .                       .    .   ..                 .      .                ............                         ....     .      ..    ...     ..                                                        .                                                .           .                                            .              .   .                                    .                            .        ..  .            .     .                                                                                                                                       .................                                ..        .     . .                                 .                                            .     .         .....                        .                   .              .                    .                          .       . .           .         .              .  .          .                                             .    .          . .             .                                   .                                    .                           ..................   .       .      .        .                                      ..........                                        .        .      .       . .              .                             ..............        ..                                         . .                       ...  .    .  .             ..................                  .          . .                .                      .     .        .  ..   .           ..        .                .           .                  ................     ...                                            .       .          .                                                   .   .       .                                                                                    .  .                   .   .                           ...                           ........         .           .  .          .       .             . ....................                 ....     ...... .    .     .      .   .....         .     ....                            ........              .                               .      .     .   .                           ..      ..   .  ..         ....   .........  .                                        ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       5        0     0 0    555555555        00    0      0    0  00     0 00   0  0   0       0  0    00  0 0         0     0   00000000            00000000      3    3            3333333333                7     33333     0000000000       7      7  3                                  3 33     3          3   3     0 222   000 22          555   88   8 5  5     555   2222  0     0   5   22                2     0 00 222  55   5   5    0 000  22       8  2     0    55  0      2 000 0    0  0              2  0     2222         0     5  2 55         0              55555555       22222222222222       0              0              00         7             33333               3      7  000             3333333333               7       7                                       000 00   8   8    00  0 55   5 5 00 2  22      888    2 0       00  000        0   8    0  88   0    0   00                 0                                                 0     0  55  0     0      0                            0     0 0  0                                 0           3    3              3    777     3                                                  0 0                                                0               0              0               0   0            0                 0        0000000000                                      555555      0       0                          0 0                0                                              0    0                                              00000000000000000000      0             0000    0                       0    5   00                 0      0                000000000000                         0000     7      33    333     00                                                        3                                                7           7                                            0              0   0                                    0                            5        00  0            0     0                                                                                                                                       55555555555555555                                00        0     0 0                                 0                                            0     0         00000                        0                   0              5                    0                          0       0 0           0         0              0  0          0                                             0    0          0 0             0                                   0                                    0                           555555555555555555   0       5      0        0                                      0000000000                                        0        0      5       0 0              0                             55555555555555        00                                         0 0                       555  5    0  0             555555555555555555                  0          0 0                0                      0     0        0  00   0           00        5                0           0                  0000000000000000     555                                            0       0          0                                                   0   0       0                                                                                    0  0                   0   0                           555                           00000000         0           5  0          0       0             0 55555555555555555555                 3333     333333 7    3     7      3   33333         7     0000                            88888888              5                               9      9     4   1                           11      11   8  11         4444   777777777  9                                        11       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAG--T-------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA-T-TCTC-CCTCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCC-GTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( family-5759 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--CACTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAG--TG--GAGGCAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACNATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAGATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCAGCCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---------CTCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTGCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCTGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACNTGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA------CAAAGTTCCATTCTTTTGAGAA-----GGAAG----------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTCAA-CTT-AAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAA-C-G-TCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACA-ATTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTTG-CC----------GAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA----------TCTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA-TTT-CTTTCTAAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC---TTTA--TGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAGT-ATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT---GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATT-ACATTTGTTTGGG--TTAA---ATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAC----TTTAA------TTAAAC-ACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACC-ATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---ATGGAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGGTAAATTGGTAAGAATTCTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catgtgttgatggcaatatagatcttaacctacgtTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAA------------GTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AA--AAAATTGGG----TTG--------CAT-GATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCC----ATACAATGCATGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATCAATG-T--CATTT-TCTGAAATTCAACAGATATAAAGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccccTGTAATATCTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAAAACAGTGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACAC--------------------TACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TA-----GTAGTA-GTAGTAGTAATATAATGTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAGA------CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAA--GAAATTGGG----ATG--------CAT-TGTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGATTTGTTGCAGTCTGCTCTC-AATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCC-GTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGT-GCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAAAACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTtctgtaaagttcattcctttgaggata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-AATTGAAATTGAG----TTG---------CTAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTCAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTACTTTATTCGA--C-CTTGAGGATATCTAGGACTGCTAGT--CACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAG--T--------AAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAA-ATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAA-C-A-TCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAAAT-GTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTT--------CGGTC-AAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGATTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCATTTTTGTCT-TAAGT------------AAAGAATAGTC-TGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAGTT-TATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-TAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCT------------------TGTTGTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----C---------------ATTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACA-CAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATT--------GTAATATGAAATAGTAATACAATGATGGAATGAAAATATTgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAGGATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTA--TGTGTAAAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAA------------TTATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAA--GTTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTC-GAAGA-ATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACC-GGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTT-AATGGTTCCTTTGTTTTGGAATT----CCGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTTGCCC-TACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTTCCCCTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC-AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCC-ATTTCAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaACATGTCTTACGTCAAGGTCGTATTTCTGTAATTGAAGCATCATTCTCTGCAG-CCGCGGCGGGGCAG--CAGAATGGGAT-TTCTTCATAATGAAGGATAACGGTTTATGGTCAGActgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|4                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctactcattaacagttgagatggagaataattacagaaaagcggcgtgtttctgtattcaaggatagcaatataggtatcgctcccgctgtcttttgccttctgtaacaatcgcttgacagtttggacagtcctctcagctaatccattaggcataggatgtaatgggctggaggttgtatgtgtaaaattccattctttggaaaacaattgaaagtttgccgaggcaaactgtggccaattatctgaaactaacttatccgggatacccagtctagcaaaatgcactttaagtttccttaccactgttgtgcttcgtgtgtctggtaacctgtctatctcgaagaatctactgtaataatctacagtaactagacagttctgtcaatcaaagtgaaaccggtcaatggctacattcttccatggtctcgggggtacctcaaggggagttaatggttcctttgttttggaattccggtgtttaagacagattgggcattccaaaacaaagttaattatttgttttgccctaccagtccaaaacataacatcttttgctctttggaaacttttttactgttcccatacggccaatatgaactttttcaattatatgctgtctaagtggttttgggataaccagtgtttttcccctaaatataagatcgtctgaaattgagagctcatctctgtggttaaaatattccacaactaattcgttgcagtctactctcaattctggccagccttgaactatagtccatttcaaggcttgcatatgatggtcagtcttagtggcttctctcacagattcgagttatatctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaCTTCAAAATTT---CCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGA--CTGGTAGCTTATCTCTATT-GACGA-ATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGT--TTCGTCCGTCA-AAGTGGAA-CAGGTCATTGACTAC-ATGTGCTATGGTC--TCAAGAGTACCTCATAGGGAGTT-AATAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTG-GGCATTGCAAAACATAGTTGATTAT--------TTGTTCTG-CCATACCAGCCCAACACATGCCGTgtgaacaacgactgctctacctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatttaTTAATTTTATATCATTTAAAGTATATCGAATCAAAAT---ACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA---GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATGTTCAGACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAACTGGG----CTG---------CTAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAttttgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTAATAATTGCT-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAAA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAtttgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatatctgattggtttgatGTAATTTTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAATACAATAATGGAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAGA-TACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAA--GAAATTGGA----TTG--------CATA-GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAGA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----CTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             222222222                             11       11                                                    33333333            3333333                         5555555555                      33333     66666666666                                                     11                    1             222             222        1    1     222   1111  1     1                                              1   1    1 111                         22           222         1                       2222                    11                        66666666       33333333333333                                     22                       33333                         111             55555555555555                                                                                11                                                              1                     11                                                                            11                                                                                                          1                   111     1                                                                                                                                                                                                4444444444                                      222222                                                                                                                                                               55555555555555555555                    2222                                                                                444444444444                         2222            11    222     33                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                       66666666666666666                                                                                                                                                 22222                                                           1                                                                                                                                                          1    1                                                                                                                               666666666666666666           1                                                      4444444444                                                        1                                                      55555555555555                                                                             222  1                     666666666666666666                                                                                                                    1                                               5555555555555555     222                                            1                                                                                                                                                                                                                              222                           33333333                     1                                     66666666666666666666                 2222     333333      1                22222               3333                            44444444                                                                                                                             333333333                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2        1     1 1    666666666        22    1      1    1  88     1 88   1  1   1       1  1    22  1 1         1     1   44444444            1111111       7    7            4444444444                3     33333     77777777777      6      6  7                                  7 88     7          7   3     1 999   111 11          444   22   0 2  5     444   0000  0     0   2   22                0     1 99 777  88   5   5    0 999  11       9  0     1    11  1      0 111 1    1  5              0  1     1111         1      3 3 66         1              33333333       22222222222222       1              1              00         0             33333               7      0  000             77777777777777              0       0                                       333 22   8   1    88  1 55   2 2 88 0  11      66    3 1       22  333        1   0    1  22   1    1   44                 1                                                 1     1  66  1     1      1                            1     1 1                                    1           7    3              7    999     3                                                  1 1                                                1               1              1               1   1            1                 1        0000000000                                      888888      1       1                          1 1                1                                              1    1                                              77777777777777777777      1             3333    1                       1    2   22                 1      1                666666666666                         5555     6      88    333     44                                                        7                                                0           0                                            1              1   1                                    1                            5        22  1            1     1                                                                                                                                       00000000000000000                                22        1     1 1                                 1                                            1     1         77777                        1                   1              5                    1                          1       1 1           1         1              1  1          1                                             5    5          1 1             1                                   1                                    1                           333333333333333333   1       5      1        1                                      0000000000                                        1        1      5       1 1              1                             11111111111111        22                                         1 1                       000  5    1  1             111111111111111111                  1          1 1                1                      1     1        1  22   1           22        5                1           1                  8888888888888888     000                                            5       1          1                                                   1   1       1                                                                                    1  1                   1   1                           111                           55555555         1           5  1          1       1             1 88888888888888888888                 8888     888888 0    3     6      7   33333         6     4444                            00000000              3                               0      3     4   1                           66      66   4  66         9999   555555555  1                                        66       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .        .     . .    .........        ..    .      .    .  ..     . ..   .  .   .       .  .    ..  . .         .     .   ........            .......       .    .            ..........                .     .....     ...........      .      .  .                                  . ..     .          .   .     . ...   ... ..          ...   ..   . .  .     ...   ....  .     .   .   ..                .     . .. ...  ..   .   .    . ...  ..       .  .     .    ..  .      . ... .    .  .              .  .     ....         .      . . ..         .              ........       ..............       .              .              ..         .             .....               .      .  ...             ..............              .       .                                       ... ..   .   .    ..  . ..   . . .. .  ..      ..    . .       ..  ...        .   .    .  ..   .    .   ..                 .                                                 .     .  ..  .     .      .                            .     . .                                    .           .    .              .    ...     .                                                  . .                                                .               .              .               .   .            .                 .        ..........                                      ......      .       .                          . .                .                                              .    .                                              ....................      .             ....    .                       .    .   ..                 .      .                ............                         ....     .      ..    ...     ..                                                        .                                                .           .                                            .              .   .                                    .                            .        ..  .            .     .                                                                                                                                       .................                                ..        .     . .                                 .                                            .     .         .....                        .                   .              .                    .                          .       . .           .         .              .  .          .                                             .    .          . .             .                                   .                                    .                           ..................   .       .      .        .                                      ..........                                        .        .      .       . .              .                             ..............        ..                                         . .                       ...  .    .  .             ..................                  .          . .                .                      .     .        .  ..   .           ..        .                .           .                  ................     ...                                            .       .          .                                                   .   .       .                                                                                    .  .                   .   .                           ...                           ........         .           .  .          .       .             . ....................                 ....     ...... .    .     .      .   .....         .     ....                            ........              .                               .      .     .   .                           ..      ..   .  ..         ....   .........  .                                        ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       5        0     0 0    555555555        00    0      0    0  00     0 00   0  0   0       0  0    00  0 0         0     0   00000000            0000000       3    3            3333333333                7     33333     33333333333      7      7  3                                  3 33     3          3   3     0 222   000 22          555   88   8 5  5     555   2222  0     0   5   22                2     0 00 222  55   5   5    0 000  22       8  2     0    55  0      2 000 0    0  0              2  0     2222         0      2 2 55         0              55555555       22222222222222       0              0              00         7             33333               3      7  000             33333333333333              7       7                                       000 00   8   0    00  0 55   5 5 00 2  22      88    2 0       00  000        0   8    0  88   0    0   00                 0                                                 0     0  55  0     0      0                            0     0 0                                    0           3    3              3    777     3                                                  0 0                                                0               0              0               0   0            0                 0        0000000000                                      555555      0       0                          0 0                0                                              0    0                                              00000000000000000000      0             0000    0                       0    5   00                 0      0                000000000000                         0000     7      33    333     00                                                        3                                                7           7                                            0              0   0                                    0                            5        00  0            0     0                                                                                                                                       55555555555555555                                00        0     0 0                                 0                                            0     0         00000                        0                   0              5                    0                          0       0 0           0         0              0  0          0                                             0    0          0 0             0                                   0                                    0                           555555555555555555   0       5      0        0                                      0000000000                                        0        0      5       0 0              0                             55555555555555        00                                         0 0                       555  5    0  0             555555555555555555                  0          0 0                0                      0     0        0  00   0           00        5                0           0                  0000000000000000     555                                            0       0          0                                                   0   0       0                                                                                    0  0                   0   0                           555                           00000000         0           5  0          0       0             0 55555555555555555555                 3333     333333 7    3     7      3   33333         7     0000                            88888888              5                               9      9     4   1                           11      11   8  11         4444   777777777  9                                        11       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( family-5759 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTCTC---CCTCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA------CAAAGTTCCATTCTTTTGAGAA-----GGAAG----------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTCAA-CTT-AAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAA-C-G-TCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAA-TTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTTG-CC----------GAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA---T----------CTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA--TTTCTTTCTAAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC--TTTA--TGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAGT-ATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT---GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATT-ACATTTGTTTGGG--TTAA---ATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAC----TTTAA------TTAAAC-ACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACC-ATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---ATGGAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGGTAAATTGGTAAGAATTCTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               catgtgttgatggcaatatagatcttaacctacgtTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAA------------GTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AA--AAAATTGGG----TTG--------CAT-GATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCC----ATACAATGCATGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCAATG-T--CATTT-TCTGAAATTCAACAGATATAAAGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccccTGTAATATCTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAAAACAGTGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACAC--------------------TACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA-----GTAGTA-GTAGTAGTAATATAATGTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAGA------CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAA--GAAATTGGG----ATG--------CAT-TGTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGATTTGTTGCAGTCTGCTCTC-AATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCCGTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGT-GCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAAAACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTtctgtaaagttcattcctttgaggata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-AATTGAAATTGAG----TTG---------CTAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTCAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTACTTTATTCGA--C-CTTGAGGATATCTAGGACTGCTAGT--CACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT----------AAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAA-ATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAA-C-A-TCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAAAT-GTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTT--------CGGTC-AAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCATTTTTGTCT-TAAGT------------AAAGAATAGTCTGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAGTT-TATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-TAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCT------------------TGTTGTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----C---------------ATTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACA-CAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATT--------GTAATATGAAATAGTAATACAATGATGGAATGAAAATATTgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAGGATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTA--TGTGTAAAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAA------------TTATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAA--GTTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTC-GAAGA-ATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACC-GGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTT-AATGGTTCCTTTGTTTTGGAATT----CCGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTTGCCC-TACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTT---CCCCTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC-AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCCATTTCAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaACATGTCTTACGTCAAGGTCGTATTTCTGTAATTGAAGCATCATTCTCTGCAG-CCGCGGCGGGGCAG--CAGAATGGGAT-TTCTTCATAATGAAGGATAACGGTTTATGGTCAGActgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|4                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctactcattaacagttgagatggagaataattacagaaaagcggcgtgtttctgtattcaaggatagcaatataggtatcgctcccgctgtcttttgccttctgtaacaatcgcttgacagtttggacagtcctctcagctaatccattaggcataggatgtaatgggctggaggttgtatgtgtaaaattccattctttggaaaacaattgaaagtttgccgaggcaaactgtggccaattatctgaaactaacttatccgggatacccagtctagcaaaatgcactttaagtttccttaccactgttgtgcttcgtgtgtctggtaacctgtctatctcgaagaatctactgtaataatctacagtaactagacagttctgtcaatcaaagtgaaaccggtcaatggctacattcttccatggtctcgggggtacctcaaggggagttaatggttcctttgttttggaattccggtgtttaagacagattgggcattccaaaacaaagttaattatttgttttgccctaccagtccaaaacataacatcttttgctctttggaaacttttttactgttcccatacggccaatatgaactttttcaattatatgctgtctaagtggttttgggataaccagtgtttttcccctaaatataagatcgtctgaaattgagagctcatctctgtggttaaaatattccacaactaattcgttgcagtctactctcaattctggccagccttgaactatagtccatttcaaggcttgcatatgatggtcagtcttagtggcttctctcacagattcgagttatatctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaCTTCAAAATTT---CCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGA--CTGGTAGCTTATCTCTATT-GACGA-ATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGT--TTCGTCCGTCA-AAGTGGAA-CAGGTCATTGACTAC-ATGTGCTATGGTC--TCAAGAGTACCTCATAGGGAGTT-AATAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTG-GGCATTGCAAAACATAGTTGATTAT--------TTGTTCTG-CCATACCAGCCCAACACATGCCGTgtgaacaacgactgctctacctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatttaTTAATTTTATATCATTTAAAGTATATCGAATCAAAAT---ACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA---GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATGTTCAGACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAACTGGG----CTG---------CTAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAttttgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTAATAATTGCT-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAAA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAtttgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatatctgattggtttgatGTAATTTTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAATACAATAATGGAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAGA-TACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAA--GAAATTGGA----TTG--------CATA-GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAGA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----CTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             222222222                             11       11                                                    33333333            3333333                         5555555555                      33333     66666666666                                                     11                    1             222             222        1    1     222   1111  1     1                                              1   1    1 111                         22           222         1                       2222                    11                        66666666       33333333333333                                     22                       33333                         111             44444444444444                                                                                11                                                              1                     11                                                                            11                                                                                                          1                   111     1                                                                                                                                                                                                4444444444                                      222222                                                                                                                                                               55555555555555555555                    2222                                                                                444444444444                         2222            11    222     33                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                       66666666666666666                                                                                                                                                 22222                                                           1                                                                                                                                                          1    1                                                                                                                               666666666666666666           1                                                      4444444444                                                        1                                                      55555555555555                                                                             222  1                     666666666666666666                                                                                                                    1                                               5555555555555555     222                                            1                                                                                                                                                                                                                              222                           33333333                     1                                     66666666666666666666                 2222     333333      1                22222               3333                            44444444                                                                                                                             333333333                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2        1     1 1    666666666        22    1      1    1  88     1 88   1  1   1       1  1    22  1 1         1     1   44444444            1111111       7    7            4444444444                3     33333     77777777777      6      6  7                                  7 88     7          7   3     1 999   111 11          444   22   0 2  5     444   0000  0     0   2   22                0     1 99 777  88   5   5    0 999  11       9  0     1    11  1      0 111 1    1  5              0  1     1111         1      3 3 66         1              33333333       22222222222222       1              1              00         0             33333               7      0  000             77777777777777              0       0                                       333 22   8   1    88  1 55   2 2 88 0  11      66    3 1       22  333        1   0    1  22   1    1   44                 1                                                 1     1  66  1     1      1                            1     1 1                                    1           7    3              7    999     3                                                  1 1                                                1               1              1               1   1            1                 1        0000000000                                      888888      1       1                          1 1                1                                              1    1                                              77777777777777777777      1             3333    1                       1    2   22                 1      1                666666666666                         5555     6      88    333     44                                                        7                                                0           0                                            1              1   1                                    1                            5        22  1            1     1                                                                                                                                       00000000000000000                                22        1     1 1                                 1                                            1     1         77777                        1                   1              5                    1                          1       1 1           1         1              1  1          1                                             5    5          1 1             1                                   1                                    1                           333333333333333333   1       5      1        1                                      0000000000                                        1        1      5       1 1              1                             11111111111111        22                                         1 1                       000  5    1  1             111111111111111111                  1          1 1                1                      1     1        1  22   1           22        5                1           1                  8888888888888888     000                                            5       1          1                                                   1   1       1                                                                                    1  1                   1   1                           111                           55555555         1           5  1          1       1             1 88888888888888888888                 8888     888888 0    3     6      7   33333         6     4444                            00000000              3                               0      3     4   1                           66      66   4  66         9999   555555555  1                                        66       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .        .     . .    .........        ..    .      .    .  ..     . ..   .  .   .       .  .    ..  . .         .     .   ........            .......       .    .            ..........                .     .....     ...........      .      .  .                                  . ..     .          .   .     . ...   ... ..          ...   ..   . .  .     ...   ....  .     .   .   ..                .     . .. ...  ..   .   .    . ...  ..       .  .     .    ..  .      . ... .    .  .              .  .     ....         .      . . ..         .              ........       ..............       .              .              ..         .             .....               .      .  ...             ..............              .       .                                       ... ..   .   .    ..  . ..   . . .. .  ..      ..    . .       ..  ...        .   .    .  ..   .    .   ..                 .                                                 .     .  ..  .     .      .                            .     . .                                    .           .    .              .    ...     .                                                  . .                                                .               .              .               .   .            .                 .        ..........                                      ......      .       .                          . .                .                                              .    .                                              ....................      .             ....    .                       .    .   ..                 .      .                ............                         ....     .      ..    ...     ..                                                        .                                                .           .                                            .              .   .                                    .                            .        ..  .            .     .                                                                                                                                       .................                                ..        .     . .                                 .                                            .     .         .....                        .                   .              .                    .                          .       . .           .         .              .  .          .                                             .    .          . .             .                                   .                                    .                           ..................   .       .      .        .                                      ..........                                        .        .      .       . .              .                             ..............        ..                                         . .                       ...  .    .  .             ..................                  .          . .                .                      .     .        .  ..   .           ..        .                .           .                  ................     ...                                            .       .          .                                                   .   .       .                                                                                    .  .                   .   .                           ...                           ........         .           .  .          .       .             . ....................                 ....     ...... .    .     .      .   .....         .     ....                            ........              .                               .      .     .   .                           ..      ..   .  ..         ....   .........  .                                        ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       5        0     0 0    555555555        00    0      0    0  00     0 00   0  0   0       0  0    00  0 0         0     0   00000000            0000000       3    3            3333333333                7     33333     33333333333      7      7  3                                  3 33     3          3   3     0 222   000 22          555   88   8 5  5     555   2222  0     0   5   22                2     0 00 222  55   5   5    0 000  22       8  2     0    55  0      2 000 0    0  0              2  0     2222         0      2 2 55         0              55555555       22222222222222       0              0              00         7             33333               3      7  000             00000000000000              7       7                                       000 00   8   0    00  0 55   5 5 00 2  22      88    2 0       00  000        0   8    0  88   0    0   00                 0                                                 0     0  55  0     0      0                            0     0 0                                    0           3    3              3    777     3                                                  0 0                                                0               0              0               0   0            0                 0        0000000000                                      555555      0       0                          0 0                0                                              0    0                                              00000000000000000000      0             0000    0                       0    5   00                 0      0                000000000000                         0000     7      33    333     00                                                        3                                                7           7                                            0              0   0                                    0                            5        00  0            0     0                                                                                                                                       55555555555555555                                00        0     0 0                                 0                                            0     0         00000                        0                   0              5                    0                          0       0 0           0         0              0  0          0                                             0    0          0 0             0                                   0                                    0                           555555555555555555   0       5      0        0                                      0000000000                                        0        0      5       0 0              0                             55555555555555        00                                         0 0                       555  5    0  0             555555555555555555                  0          0 0                0                      0     0        0  00   0           00        5                0           0                  0000000000000000     555                                            0       0          0                                                   0   0       0                                                                                    0  0                   0   0                           555                           00000000         0           5  0          0       0             0 55555555555555555555                 3333     333333 7    3     7      3   33333         7     0000                            88888888              5                               9      9     4   1                           11      11   8  11         4444   777777777  9                                        11       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( family-5759 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA------CAAAGTTCCATTCTTTTGAGAA-----GGAAG----------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTCAA-CTT-AAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAA-C-G-TCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAA-TTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTTG-CC----------GAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA---T----------CTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA--TTTCTTTCTAAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC--TTTA--TGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAGT-ATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT---GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATT-ACATTTGTTTGGG--TTAA---ATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAC----TTTAA------TTAAAC-ACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACC-ATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---ATGGAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGGTAAATTGGTAAGAATTCTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               catgtgttgatggcaatatagatcttaacctacgtTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAA------------GTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AA--AAAATTGGG----TTG--------CAT-GATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCC----ATACAATGCATGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCAATG-T--CATTT-TCTGAAATTCAACAGATATAAAGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccccTGTAATATCTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAAAACAGTGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACAC--------------------TACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA-----GTAGTA-GTAGTAGTAATATAATGTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAGA------CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAA--GAAATTGGG----ATG--------CAT-TGTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGATTTGTTGCAGTCTGCTCTC-AATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCCGTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGT-GCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAAAACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTtctgtaaagttcattcctttgaggata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-AATTGAAATTGAG----TTG---------CTAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTCAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTACTTTATTCGA--C-CTTGAGGATATCTAGGACTGCTAGT--CACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT----------AAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAA-ATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAA-C-A-TCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAAAT-GTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTT--------CGGTC-AAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCATTTTTGTCT-TAAGT------------AAAGAATAGTCTGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAGTT-TATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-TAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCT------------------TGTTGTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----C---------------ATTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACA-CAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATT--------GTAATATGAAATAGTAATACAATGATGGAATGAAAATATTgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAGGATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTA--TGTGTAAAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAA------------TTATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAA--GTTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTC-GAAGA-ATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACC-GGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTT-AATGGTTCCTTTGTTTTGGAATT----CCGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTTGCCC-TACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTT---CCCCTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC-AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCCATTTCAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaACATGTCTTACGTCAAGGTCGTATTTCTGTAATTGAAGCATCATTCTCTGCAG-CCGCGGCGGGGCAG--CAGAATGGGAT-TTCTTCATAATGAAGGATAACGGTTTATGGTCAGActgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|4                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctactcattaacagttgagatggagaataattacagaaaagcggcgtgtttctgtattcaaggatagcaatataggtatcgctcccgctgtcttttgccttctgtaacaatcgcttgacagtttggacagtcctctcagctaatccattaggcataggatgtaatgggctggaggttgtatgtgtaaaattccattctttggaaaacaattgaaagtttgccgaggcaaactgtggccaattatctgaaactaacttatccgggatacccagtctagcaaaatgcactttaagtttccttaccactgttgtgcttcgtgtgtctggtaacctgtctatctcgaagaatctactgtaataatctacagtaactagacagttctgtcaatcaaagtgaaaccggtcaatggctacattcttccatggtctcgggggtacctcaaggggagttaatggttcctttgttttggaattccggtgtttaagacagattgggcattccaaaacaaagttaattatttgttttgccctaccagtccaaaacataacatcttttgctctttggaaacttttttactgttcccatacggccaatatgaactttttcaattatatgctgtctaagtggttttgggataaccagtgtttttcccctaaatataagatcgtctgaaattgagagctcatctctgtggttaaaatattccacaactaattcgttgcagtctactctcaattctggccagccttgaactatagtccatttcaaggcttgcatatgatggtcagtcttagtggcttctctcacagattcgagttatatctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaCTTCAAAATTT---CCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGA--CTGGTAGCTTATCTCTATT-GACGA-ATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGT--TTCGTCCGTCA-AAGTGGAA-CAGGTCATTGACTAC-ATGTGCTATGGTC--TCAAGAGTACCTCATAGGGAGTT-AATAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTG-GGCATTGCAAAACATAGTTGATTAT--------TTGTTCTG-CCATACCAGCCCAACACATGCCGTgtgaacaacgactgctctacctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatttaTTAATTTTATATCATTTAAAGTATATCGAATCAAAAT---ACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA---GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATGTTCAGACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAACTGGG----CTG---------CTAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAttttgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTAATAATTGCT-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAAA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAtttgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatatctgattggtttgatGTAATTTTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATATGAAATAGTAATACAATAATGGAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAGA-TACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAA--GAAATTGGA----TTG--------CATA-GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAGA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----CTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C        T     A A    CAGAAA           GT    G      A    A  .      A GT   G  C   C       T  C    GT  C A         A     G   GTCCTCTC            AGGCA         A    T            CACATGTT                  C     CAATT     TTTGCCGAGGC      C      C  T                                  T AT     T          T   C     T GCT   GTA AA          GTG   AA   C G  T     CCT   TATC  C     .   G   AA                      C CA TAT  TC   T   T    C AGG  TG       T        A    GA  T        TCA T    T  G                 T     TGTA         C      A T TT         C              GTATGAAA       GCCCTACCAGTCC        T              G              CT                       TTTTT               A         AAG             TTTTCTCACCT                                                                 TTT TT   G   G    C   T CT   A G TT    CT      CG    A G       TA  ATG        T   T    C  TC   G    A   CG                 A                                                 T     A  TT  T     A      G                            G     G A                                    T           T    .              T    AAT     .                                                  A T                                                C               G              T               T   G            A                 A        TACCCAAGTC                                      G           C       G                          G G                C                                              T    T                                              TATAGTTCACCATACCACGT      G             .       G                       A    T   TT                 C      T                ATATGGTACCTC                         TAA      G      AT    CAG     AA                                                        T                                                                                                         A              A   A                                    T                            A        AC  C            A     T                                                                                                                                       .                                                TT        T     C A                                 T                                            A     T         .                            G                   C              A                    A                          T       T G           A         A              C  C          G                                             .    C          C A             G                                   A                                    G                           CCTGTATCAATCTTAAAC   A       .      A        A                                      TCTTACCGTG                                        C        A      .       T T              A                             CGTTTGTCCTTTAG        GA                                         G C                       .    .    T  T             .                                   G          A C                G                      A     T        C  AA   G           AC        .                C           T                  CGAATTTGTTCCAAAT     TCG                                            C       G          C                                                   C   A       G                                                                                    T  T                   C   A                           .                             ACCACTAA         C           .  T          T       G             C C                                    ATCA     AGTATA      C     G      T   TGGT          C     CAA                             GTA                   A                                      G     A   G                           AA      TG   A  TT         .      C          A                                        GC
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAC          .    .            TGTATGTG                  G     .         T                .      .  .                                  . .      .          .   .     A AAA   .   CT          GTA   CG   G G  T     CTT   TCTA  .     .   T   GT                      G TC TCG  AA   .   T    . GG   AA       A        T    .   G        TCA G    G  .                 G     .            A      A T G          A              .              GCCATACCAGCCC        A              T              C                        .                   .         .               GTGTTTTTCCC                                                                 GGA GG   T   T    T   G CT   C G CT    GA      TG    A T       AC  TGT        G   G    G  GA   T    T   TA                                                                                                                                                                       A           T    .              .    AA      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T        .      .     .       AT                                                        T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .        .           .     .      .   C             .     G                               GTA                   T                                      G     .   G                           .       .    T  .          .      C          A                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C G     .   CT          .     CG   . .  .     .     ATT   .     .   T   TT                      G .  G    CG   .   .    . A    AT       .        T    .   A        .   A    G  .                 G     .            G      A . G          A              .              CGGTC                G                                                                                                                                                                                TTC TT   G   A    C   T .    . . .     CT      CA    A G       TA  ATG        T   .    C  TC   G    G   T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTA                   A                                      G     .   G                           .       .    T  .          .      C          A                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     T                                      G     .   G                           .       .    T  .          .      .          A                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     G                                      G     .   G                           .       .    T  .          .      .          A                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     T                                      .     .   .                           .       .    T  .          .      .          A                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     T                                      .     .   .                           .       .    .  .          .      .          .                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     T                                      .     .   .                           .       .    .  .          .      .          .                                        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                     .                                                                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ********                                                                                                                      ****   *********
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA-----GTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG--------CCTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--C-TTTGATGATATTTAGGACTGCTAGT--CA--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTG--AGCCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTA--------ATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------CTAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             222222222                             11       11                                                    33333333            22222   1                        555555555                      33333     66666666666                                                       11                  1        11   222             222        1    1     222   1111  1     1                                              1   1    1 111                         22           222         1                       2222                    11                        66666666       33333333333333                                     22                       33333                         111             44444444444444                                                                                11                                                              1                     11                                                                            11                                                                                                          1                   111     1                                                                                                                                                                                                4444444444                                      222222                                                                                                                                                               55555555555555555555                    2222                                                                                444444444444                         2222            11    222     33                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                       66666666666666666                                                                                                                                                 22222                                                           1                                                                                                                                                          1    1                                                                                                                               666666666666666666           1                                                      4444444444                                                        1                                                      55555555555555                                                                             222  1                     666666666666666666                                                                                                                    1                                               5555555555555555     222                                            1                                                                                                                                                                                                                              222                           33333333                     1                                     66666666666666666666                 2222     333333      1                22222               3333                        11111111                                                                                                                                 111111111                                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2        1     1 1    666666666        22    1      1    1  88     1 88   1  1   1       1  1    22  1 1         1     1   44444444            77777 4 3     7    7             999999999                3     33333     77777777777      6      6   7                                 7   88   7          7   3     1  55   111 11          444   22   0 2  5     444   0000  0     0   2   22                0     1 99 777  88   5   5    0 999  11       9  0     1    11  1      0 111 1    1  5              0  1     1111         1      3 3 66         1              33333333       22222222222222       1              1              00         0             33333               7      0  000             77777777777777              0       0                                       333 22   8   1    88  1 55   2 2 88 0  11      66    3 1       22  333        1   0    1  22   1    1   44                 1                                                 1     1  66  1     1      1                            1     1 1                                    1           7    3              7    999     3                                                  1 1                                                1               1              1               1   1            1                 1        0000000000                                      888888      1       1                          1 1                1                                              1    1                                              77777777777777777777      1             3333    1                       1    2   22                 1      1                666666666666                         5555     6      88    333     44                                                        7                                                0           0                                            1              1   1                                    1                            5        22  1            1     1                                                                                                                                       00000000000000000                                22        1     1 1                                 1                                            1     1         77777                        1                   1              5                    1                          1       1 1           1         1              1  1          1                                             5    5          1 1             1                                   1                                    1                           333333333333333333   1       5      1        1                                      0000000000                                        1        1      5       1 1              1                             11111111111111        22                                         1 1                       000  5    1  1             111111111111111111                  1          1 1                1                      1     1        1  22   1           22        5                1           1                  8888888888888888     000                                            5       1          1                                                   1   1       1                                                                                    1  1                   1   1                           111                           55555555         1           5  1          1       1             1 88888888888888888888                 8888     888888 0    3     6      7   33333         6     4444                        66666666                  3                               0      3     4   1                           66      66   4  66         9999   777777777 4                                          66       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .        .     . .    .........        ..    .      .    .  ..     . ..   .  .   .       .  .    ..  . .         .     .   ........            ..... . .     .    .             .........                .     .....     ...........      .      .   .                                 .   ..   .          .   .     .  ..   ... ..          ...   ..   . .  .     ...   ....  .     .   .   ..                .     . .. ...  ..   .   .    . ...  ..       .  .     .    ..  .      . ... .    .  .              .  .     ....         .      . . ..         .              ........       ..............       .              .              ..         .             .....               .      .  ...             ..............              .       .                                       ... ..   .   .    ..  . ..   . . .. .  ..      ..    . .       ..  ...        .   .    .  ..   .    .   ..                 .                                                 .     .  ..  .     .      .                            .     . .                                    .           .    .              .    ...     .                                                  . .                                                .               .              .               .   .            .                 .        ..........                                      ......      .       .                          . .                .                                              .    .                                              ....................      .             ....    .                       .    .   ..                 .      .                ............                         ....     .      ..    ...     ..                                                        .                                                .           .                                            .              .   .                                    .                            .        ..  .            .     .                                                                                                                                       .................                                ..        .     . .                                 .                                            .     .         .....                        .                   .              .                    .                          .       . .           .         .              .  .          .                                             .    .          . .             .                                   .                                    .                           ..................   .       .      .        .                                      ..........                                        .        .      .       . .              .                             ..............        ..                                         . .                       ...  .    .  .             ..................                  .          . .                .                      .     .        .  ..   .           ..        .                .           .                  ................     ...                                            .       .          .                                                   .   .       .                                                                                    .  .                   .   .                           ...                           ........         .           .  .          .       .             . ....................                 ....     ...... .    .     .      .   .....         .     ....                        ........                  .                               .      .     .   .                           ..      ..   .  ..         ....   ......... .                                          ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       5        0     0 0    555555555        00    0      0    0  00     0 00   0  0   0       0  0    00  0 0         0     0   00000000            77777 7 3     3    3             000000000                7     33333     33333333333      7      7   3                                 3   33   3          3   3     0  22   000 22          555   88   8 5  5     555   2222  0     0   5   22                2     0 00 222  55   5   5    0 000  22       8  2     0    55  0      2 000 0    0  0              2  0     2222         0      2 2 55         0              55555555       22222222222222       0              0              00         7             33333               3      7  000             00000000000000              7       7                                       000 00   8   0    00  0 55   5 5 00 2  22      88    2 0       00  000        0   8    0  88   0    0   00                 0                                                 0     0  55  0     0      0                            0     0 0                                    0           3    3              3    777     3                                                  0 0                                                0               0              0               0   0            0                 0        0000000000                                      555555      0       0                          0 0                0                                              0    0                                              00000000000000000000      0             0000    0                       0    5   00                 0      0                000000000000                         0000     7      33    333     00                                                        3                                                7           7                                            0              0   0                                    0                            5        00  0            0     0                                                                                                                                       55555555555555555                                00        0     0 0                                 0                                            0     0         00000                        0                   0              5                    0                          0       0 0           0         0              0  0          0                                             0    0          0 0             0                                   0                                    0                           555555555555555555   0       5      0        0                                      0000000000                                        0        0      5       0 0              0                             55555555555555        00                                         0 0                       555  5    0  0             555555555555555555                  0          0 0                0                      0     0        0  00   0           00        5                0           0                  0000000000000000     555                                            0       0          0                                                   0   0       0                                                                                    0  0                   0   0                           555                           00000000         0           5  0          0       0             0 55555555555555555555                 3333     333333 7    3     7      3   33333         7     0000                        11111111                  5                               9      9     4   1                           11      11   8  11         4444   888888888 4                                          11       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--CNT-TGATGATATTTAGGACTGCTAGTC--A--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTGAG--CCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------C-TAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
Reference ( family-5759 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATTAGCGGTTGAGANGGAGANTNACCACAGAAACTTAGCGGCGTNNTTCTNTATTCANGGATNGCCAAATATNGGTATCNCTNCCGNTGTCCTTNGCNTTCTNNAANANTCGCTTGACNGTCTGNACGGTCCTCTCAGCTAATCTATT--A--CTT-TGATGATATTTAGGACTGCTAGTC--A--TGT-CAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT---------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTGAG--CCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTNAGCGTTTGTACCNTACCACTGCTGTGCTTCGTGTNAGTCTGGTAGCCTGTCTATCTT-GAAGA-ATCGGCTANAGTAATCAACAGTAACCAAGTANTCCTTANTCCGCCATGAGTGAAA-C-GGTCNGTGGCTACTATCTGCCANGGTCGGTCNGGAGTACCTCAANGGGANTTGAGTGGCTCCTTTGTGTTNGAATT----TCGGTGTTTNAGACAAATTGTNGCATTGCAANACAAAGTCGGTTAT-T-CGAAATCGTTTTG-CC-TACCGGTCCAAAACATNACGTCACGTGCTCTNTGTGTACATTTTTAC-GTACCCATGCGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATTAAGCGATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTC---CCCCTGAAAATCATGTCGTCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAATTGANNNGNNGCAGTCTNCTCTCTAANTCTGGCCAGCNTTGAACNATAGTCCGTTTAAANGCTTGCANNTGNNNGTCAGTCTNAGTNGCCTNTCGCACANGTTCNAGTTATATGATCACTGACAGCANTACTTGACATAACTGTGTGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCNGGGTANGTNTCTNGTAGANAATTACNCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATNTTCCANGNACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAACTGTNACATCATGCGCTGCAA-CCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGNTNACCGTATACACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGNATTTCTTTCTCAATTNGCGCATAACCTATTNCAGTTTGCGCTAGGGNTTTNGATGCATAGGCANTTGGTTTGCCATCCTGTNACAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGGAGGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTNAAAGAAANAAAGGACTGGACTGTCTGTCAGTACGNGNTTTACATTTTGAAATGNATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTNAATCNCTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATGGTCNCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGNTGATTTCATTTCGCTTATAGCGTNAATCGTCTNNGGATCTGGCTTAAGTCCNTTTTTANTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-T-ACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTA-GATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCCGTTAAGCCTTCGAATGTTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTNAGTCCAAAAGGTAGNCGTNGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGNGAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTGATACTCCAGNNACNACTCGTCGCGTTNAAGACNGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATGCTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTCGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGANNATGTCACTNTTCTCNANTCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCGTAGNGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCNGGTTTNAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGACCCACACCNTGGAACAAATCACTGAATTNATGCATTACTCGTGACCTGTTTCCAGTCAAGGTTTNCTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCANTTCGATANGNCTTAGTTCAAGNGATGTACTGNGGCTCAAAAGGGGGNACNAATTTGTTTCNACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTACCTTGATTTGANCNATCACTTTAAGTGNATCACCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGNCTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTNCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTNAGGGAGATTCTTTTNGGACCAACNGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTNATGTGATGNTTTCACTTTTTTCTNANCTACAGACACTTTTNAAGTGATTCAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAANNTTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATANCNTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGCCNTCNTTTTGCTGCTGCTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGCTTNGCCTCGATCGNANATACTGCACGTCTTCTNCTTTACTCATCTCATTCATTTGNGTCTTNGCGTACTCNTANNTCTNACTTACTTGAANNGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGCNAATGTTGATCANTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTGCTTTTAATNTCAGTCTTGTNACAAACATGTCGATTGATTCACACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATNTCGNAAAGATTNGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCNTGNGTGTCTAATATCACGTCCTNTGTNACCAACCCACAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTCGGTTTTCCTTTTCGATGGACCACTAAACATAAGTTNCGCATGCCTCATTANCTTTTCCCGTNGTTCAGGNAAGTTTGTGTCTTNCAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAT----TTTAA------TCGAAT-AAAGTGTTATTATTTGCGGT-TTTTTACTTCTGACA-C-GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------C-TAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAATAGCCACAAATACAAT--ATGTCAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCATTAGAGGTTAAGAGGGAGACTCACCA----AACTTAATGGTGTTGTTCTTTATTCATAGATTGCCAAATATTG--ATCCTTGCTAATGTCCTTAGCATTTTTGAAAATTCGTTTGACTGTCTGTACG--------AGCTAATCTATT--A--CTT-TGATGATATTTAGGACTGCTAGTC--A------CAAAGTTCCATTCTTTTGAGAA-----GGAAG----------CAAACTGCTCTGAACAATAATACATTGCGTTGTCAGCGATTAGCTTTTCTGGTGAG--CCATGTCTTGCAAATATA-ACCATGAGCGTTTGTATTGTACTACTGCT---CTTATTGTTAGTC-AGTAG---GTCAA-CTT-AAAAATATCGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCCTTATTTTACCATGAG-AAAA-C-G-TCTGTAGCTACTACCTGCCAAGGTCGGTCTGGAATAGC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGGGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAA-TTGTTACATTGTAACACAAAGTCAGTTATCT-CGAAATCATTTTG-CC----------GAAACATTATGTTACGTGTTTTCTGTGTACATTTTTA--GCACCCATGTGTCCTGTATGCAC-----GGCTTGTACCATGTCATTACGCAATAAATTTCGAATGACGA---T----------CTGAAAATCATGTCATCTGAAATGGACAGTTCGTCTTTATGGTTCCAATACTCTATAATTGAGAAGGGGCA--TTTCTTTCTAAGTCGGGCCATCAATCAATAATAGTC--TTTA--TGTTTGTAACTGCGTGTCAGTTCGAGTAGCCTGTCGTACCTGTTCTAGT-ATACGATCACTGACAGCATTACTTGATATAATTGTGTGTATATGCAAGTCTAACTCATTTGACAGTTTAGGGTATGTG-CTGGTAGACAATTACCCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATTTTCCATGTACATGCAGTACGTCTAAGTCGTATCGCTGCAGCTGTGATATCATGAGC-ACAAACCTACGGGATACTCTTCCT---GATTTCTTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCTGATTCCATAGTAACACGTTAACCGTATACATACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGAATTTCTTTCTCAATTTGCGCATAACTTATTACAGTTTGCGTTAGAGATTTTGATACATAGGCATTTGGTTTGCCATCCTGTTACAAGGTT----------CATATTTGGAGGCGTCTGTCTGAATTGTCACAGGTTTGTCGGGTCGGGGTAAAAGAAATAAAGAACTGGACTGTCTGTCAGTACACGCTTTACATTTTGAAATGAATTGTCATATGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTAAATCACTCAATGGAGATGTGGTGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCA---AG---A-----------ATGGTCTCGAGCTCTGCTTTGCTCGTCGTTAATTTTATTTTGCTTATAGCGTTAATTGTCTAAGGATCTGGCTTAAGTCCATTTTTAATGAGAATGTGACCAAA------------ATATGGTACCTCATTCAAACAAATATT-ACATTTGTTTGGG--TTAA---ATCTT---ATACCACGTTCTTGTGCGTGCTTCATAATCTGTCTCAAATGTTTGTAATGTTCTG-------------------TAGAATGTCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTGAAGCATTCAAATATTTCGCCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTTAGTCCAAAAGGTAGTCGTTGAAATCGGTATCTACCGAAAGGTGTATTGAATGTCGAAAGGTAAGACGATGATTCTGCGAGTTTG-TACTCCAGTAACAACTCGTCGTGTTTAAGACAGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGCTGCGATACTACTTCGCCAAACGTACGCATAGGATAGTAAAATCGGTGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAGCAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTAGGTTTCTCCACAACAACACGTGAATTAACCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGAAAATGTCACTATTCTCAATTCTATTTAACTTATCCTTCAAACGACTGCGTAGGGCTGCAGGTACGCGTCTAGGAGGGTTAACCACGGGAATTGCGTCTGGTTTAAAATGTAGCTGTATGGTGCCTGGGAGAAGATCCACACCTTGGAACAAATCACTGAATTGATGCATTACTTGTG-CCTGTTTCCAGTCAAGATTTCCTGCTGATTATCAATTGCGTAGATCAATTCGATAAGTCTTAGTTCAAGCGATGTACTGCGGCTCAAAAGGGGGGACGAATTTGTTTCTACTATGTAAAACAGCGTTTTAATAGTTTGTTCTTTGTAGCTTACAGGGTA-CTTGATTTAAACCATCACTTTAAGTGTATCACCTGTGTATGATGACAAATGAGTGTCACATGTCTCCAATGTGTGACTGACTTCAAGTTTATAAAACTTCCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGAT------------------TTTTAGGGAGATTTTTTTCGGACCAACTGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGA----------TCAACATGAAAATTTGAGTCATATTGGTCTATGGTCACTTAATGTGATGTTTTCACTTTTTTCTGAACTACAGACACTTTTTAAGTAATTCAATTTACCACAGTTTTTACA--------------CAGGGAAATTTTGGTTTTGTTTGTGAGCATTATAGCCACAATGGCTACATACCATTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAATGGCATGGTCGTCGTTTTGCTGCTGTTTGTTGTCTAGGGACTGCCTGTTGTCTTTCGTGGTTTTGCCTCGATCGTAAATACTGCACGTCTTCTTTTTTACTCATCTCATTCATTTGCGTCTTGGCGTACTCGTATTTCTCACTTACTTGAATGGCTTTTTCAAGTGTCAAGTCTCTGTAAATGTTGATCAGTTTTTCTTTAATTTTATG----------------ATAAT---ATCACAAATCATTTCGTCGTTGTTTGCAAATTCACGATCTCTTG-TTTTAATCTCAGTCTTGTGACAAATATGTCGATTGATTCATACTGTTGCTTCTCATTGTTAAACTGATATATCGCAAAGATTTGGTTTAGCGTTGGTTGGAGACGATTCTTGAAGCGTGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCCGATATGTCTGTCCATGAGTGTCTAATATCACGTCCTATGTCACCAACCCATAGTAGAAGATATGACACTTTTTCTTCTTTGGTTTTCCTTTTCGATGG--------ACATAAGTTACGCATGTCTCATTAACTTTTCCCGTGGTTTAGGTAAGTTTGTGTCTTACAATTCATCTTAAGCGGCGTAATTCCACTTAATTCCAC----TTTAA------TTAAAC-ACAGTGTTATTATTTGTAGTGTTTTTACTTCTGACACC-ATGTAATATTTCCATGTGTAGTTATTGTACATGTGTAACACGAAATAGTAATACA---ATGGAGTGAAAGTATTAATAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTGATTTATTCGACCTCTTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGGTAAATTGGTAAGAATTC-TAGGTATAGCAGGAAGTATTATAAAATATTCACAACTACAAT--ATGTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               catgtgttgatggcaatatagatcttaacctacgtTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTAA------------GTGAATGTACTAAGAAAAACGAACTTTGTTAGAATAA-ACTACTTTATTCGACCTTATGTGAGAGAAAGTGTTTGAGA-AA--AAAATTGGG----TTG---------C-ATGATATAGGAGGCAGAATTGTAGAATAGCC----ATACAATGCATGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCAATG-T--CATTT-TCTGAAATTCAACAGATATAAAGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAAAATGCCATCAACAATTGAAGTAACACCTGTTAAGCCTTGAAATGTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccccTGTAATATCTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAAAACAGTGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACAC--------------------TACTTTATTTGACCTTGTGTGAGAG--AGTGAT--AAAAAA--GAAATTGGG----TTG---------C-TAGGTATAGCAGGAAGTATTGTAGAAAAGCCATAAATACATT--ATaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTAGTA-GTAGTAGTAATATAATGTTGGAGTTAA-GTACTAAGAAGAACAAACTGT-TTAGA------CTACTTTATTCGACCTCGTCTCAGAG--TGTGCT--AGATAA--GAAATTGGG----ATG---------C-ATTGTGTAGCAGAAAGTTTTGTAGAAGAGCCACAAATACAAT--ATGTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taTGATTTGTTGCAGTCTGCTCTC-AATTCTGGCAAGCTTTGAACTAAAGTCCGTTTAAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTGGT-GCTTCTCTCACAGATTCAAGTCGTCTGc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTAAAACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACAAACTGTGTTAGA-TAAGACTACTTTATTCGACCTtctgtaaagttcattcctttgaggata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGA-AATTGAAATTGAG----TTG---------C-TAGGTTGAGCAGGAGGTATTATAGAATAGCCACAAATACATT--ATGTCAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTACTTTATTCGA--CCT-TGAGGATATCTAGGACTGCTAGTC--ACATGTTCAAAGTTCCATTCTTTCGAGAA-----GGAAGT----------AAACTGCTCTGAA-AATAATACATTGCGTTGTCAGAGATTAGCTTTTCCGGTGAG--CCATGTCTTGCAAATATA-ACCTTTAGCTTTTGTATAATGCTACTGCT---CTTAATGTCAGTC-AGTAG---GTC-ATTTTCGAAAA-ATTGGCTAAAGTAATCAACAGTAACCAAGTACTCATTATTTTCCCATGAA-AAAA-C-A-TCTGTAGCAACTATTTGCCAAGGTCGATCTGGAATATC---ATGAGATTTGAGTGGCTCTTTTGTGTTTGAATT----TCGGTGTTTCAAACAAAT-GTTACATTGTAACACAAAGTCGGTTATGTATGAAATCATTTT--------CGGTC-AAAACATTATGTCACGTGCTCTGTGTGTACATTTTTCC-GTACCCATGTGTCGTGTATGCAC-----GGCTTGTATCATGTCATCAAGCAATAAGTTTGGAATGACGA---TTTTCTCACCTCTGAAAATCATGTCATCTGAAACGGACAGTTCGTCTCTATGGTTCCAATACTCTATAGTTAAGGAGGGGCATTTTTGTCT-TAAGT------------AAAGAATAGTCTGTTGAAATGTTTGTAACTGTGTGTCAGTTTGAGTTGCCTGTTGAACATGTTTTAGTT-TATGATCACTGACAGCAATACTTGACATAACTGTATGTATATGCAAGTCTAACCCATTTGACAGTTCTGGATAAGTTTCTTGTAGAAAATTACGCGATAGAGCGTCTGCTACTGGAATACATGTTTCAGGAACTTGCAGTAAGTCTAAGTCATATCGCTGCAACTGTTACACCATGCGCTGCAA-TCTAGGGGGTGCTGTTCCTAA-GGTTT-TTTTTCATTATTGAAGATAAGGGCTTGTGGTCAGATTCCGCAGTAACACGATTACCGTATATACACTGGTGAAAGCGCTTACATGCAAATAATATTGCGAGCATTTCTTTCTCAATTGGCGCATAACCTATTTCAGTTTGCGCTAGGGTTTTGGATGCATAGGTAATTGGTTTGCCATCCTGTAATAAGGTTTACCCAAGTCCATATTTGAAAGCGTCCGTCTGAATTGTCACAGGTTTG--G---CGGGATCAAAGAAAGAAAAGACTGGACTGTCTGTCAGTACGGGGTTTACATTTTGAAATGCATTGTCATGTGTACTGTCCCAAATAAAGTCTACATCTTTCTTCAGTTAATCTCTCAATGAAAATGTGATGCTAGCGAGATTTGGTGCAAACTTTGTCATATAGTTCACCATACCACGTATAGTCGCGAGCTCTGCTTT----GTCGGTGATTTCATTTCACTTATAGCGTAAATCTTCTTTGGATCTGGTTTAAGTCTCTTTTTATTGAGAATGTGACCGAAATATGGTACCTCATATGGTACCTCATTCAAACCAATA-TAACATTTGTCTGGG--TTAA---ATATTATGATACCGCGTTCTTGTGCGCGCTTCATAACCTGTCTCAAATGTTTGTCATGTTCTGTCTTATTTCGTCCATAGACTAGAATCTCATCAACAATTGAAGAAACATCCGTTGATCCTTCGAATGTTTCGTCGATTTTACGTTGAAATTCATCTTGGGAACAATTAAGTCTAAAAGGTAAACGTAGAAATCGGTATCTACCAAAAGGTGTATTGAATGTCGTGAAGTAAGACGATGATTCTGTGAGTTTGATACTCTAGACACCACTTGTTGCGTTAAAGACTGAAAAATGTGTAGCTCCAGCGAGTTGTGATGCTACTTCGTCAAACGTACGCATAGGATAGTGAGGTTGGCGTATGGCCTCATTAAGCGCTTTAGGATCTAAACAAATCCTTAGTTTTTTCGTCTTGGGTTTTTCC-----------------AATCCAGTCGGTCGGTTTTGTCACCTTAACGATTATGTCACTTTTCTCCAATCTATTTAACTCATCCTTCAGGCGGCTGCATAGTGCTGCAGGTACGCGTCTAAGAGGGTTAACCACGGGGATTGCGTCAGGTTTTAAATGTAAC-----GGTACCTGGGAGAAGACCCACACCGTGGAACAAATCACTGAATTCATGCATTACTCATGACTTGTTTCCAGTCAAAGTTTATTGCTGATTATCAATTGCGTAGGTCATTTCGATATGGCTTAGTTCAAGAGATGTACTGAGGCTCAAAAAGGGGCACCAATTTGTTTCGACTATGTAAAACAGCGTTTTAATGGTTTGTTCTTTGTAGCTTACA-GGTACCTTGATTTGACCAATCACTTTAAGTGGATCATCTGTGTACGATGACAAGTGAGTGTCACATGACTCCAATGTGTGACTGACTCCAAGTTTATAAAACTTGCTTGCTGGGATTATGTTGACCTGTGATCCTGTATCAATCTTAAACTTTAAGGGAGA-TCTTTTAGGACCAACAGTTAAAGTGGCAAAAGCTTGATTGTTATGAGAAAAAGATCTTACCGTGTCAACATGGAAATCCGAGTCATATTGATCTATGATCACTTCATGTGATGATTTCAC-TTTTTCTTATCTACAGACACTTTTAAAGTGATTTAATTTACCACAGTTTTTACACGTTTGTCCTTTAGCAGGGAAAGATTGGTTTTGTTTGTGAGCACTATAGCCACAATGGCTGCATAGTCTTTCATTGTTCTGTCTCTGTGAA---CA-AGCCTTCTTTTTGCTGCTGCT------------------TGTTGTCTTTCGTGGCTTGGCCTCGATCGAACATACTGCACGTCTTCTGCTTTACTCATCTCATTCATTTGAGTCTTTGCGTATTCCTAAATCTGATTTACTTGAAACGCTTTTTC-AGTGTCAAGTCTTTGCCAATGTTGATCATTTTTTCTCTAATTTTGTGCGAATTTGTTCCAAATACAATTCGATCACGAATCATTTCGTCGCTGTTTGTAAATTCACAATTTCTTGCTTTTAATGTCAGTCTTATCACAAACATGTCGATTGATTCACATTGTTGTTTCTCATTGTTAAACTGATATCTCGAAAAGATTGGGTTTAACGTTGGTTAAAGATGATTCTTGAAGCATGTATAAAACGTTTCCGTAAGTTTAGCATTTTCTTCTGATATGTCTGTCCTTGTGTGTCTAATATCACGTCCTCTGTAACCAACCCACAGTAGAAGATATGACAC---TTCTTTTTCAGTTTTCCTTTTCAATGGACCACTAAACATAAGTTCCGCATGCCTCA-TATTTTTTCCCATTGTTCAGGGAAGTTTGTGTCTTCC----C---------------ATTTCACTTAATTCCAT----TTTAA------TTGAAT-AAAGTGTTATTA-TTGTGGT-TTTTTACTTCTGACA-CAATGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAATACAATGATGGAATGAAAATATTgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCATTAACAGTTGAGATGGAGAATAATTACAGAAA---AGCGGCGTGTTTCTGTATTCAAGGATAGC--AATATAGGTATCGCTCCCGCTGTCTTTTGCCTTCTGTAACAATCGCTTGACAGTTTGGACAGTCCTCTCAGCTAATCCATT--AGGCATAGGATG-TAAT--GGGCTGGAGGTTGTA--TGTGTAAAATTCCATTCTTTGGAAAACAATTGAAAGTTTGCCGAGGCAAACTG---TGGCCAAT------------TATCTGAAACTAACTTATCCGG-GATACCCA-GTCTAGCAAA-ATGCACTTTAAG--TTT---CCTTACCACTGTTGTGCTTCGTGT--GTCTGGTAACCTGTCTATCTC-GAAGA-ATCTACTGTAATAATCTACAGTAACTAGACAGTTCT--GTCAATCA-AAGTGAAACC-GGTCAATGGCTACATTCTTCCATGGTC--TCGGGGGTACCTCAAGGGGAGTT-AATGGTTCCTTTGTTTTGGAATT----CCGGTGTTTAAGACAGATTG-GGCATTCCAAAACAAAGTTAATTAT--------TTGTTTTGCCC-TACCAGTCCAAAACATAACATCTTTTGCTCTTTGGAAACTTTTTTACTGTTCCCATACGGCCAATATGAACTTTTTCAATTATATGCTGTC--TAAGTGGT---TTTGGGATAACCAGTGTTTTT---CCCCTAAATATAAGATCGTCTGAAATTGAGAGCTCATCTCTGTGGTTAAAATATTCCACAACTAATTCGTTGCAGTCTACTCTC-AATTCTGGCCAGCCTTGAACTATAGTCCATTTCAAGGCTTGCATATGATGGTCAGTCTTAGTGGCTTCTCTCACAGATTCGAGTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctaACATGTCTTACGTCAAGGTCGTATTTCTGTAATTGAAGCATCATTCTCTGCAG-CCGCGGCGGGGCAG--CAGAATGGGAT-TTCTTCATAATGAAGGATAACGGTTTATGGTCAGActgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaacatgtcttacgtcaaggtcgtatttctgtaattgaagcatcattctctgcagccgcggcggggcagcagaatgggatttcttcataatgaaggataacggtttatggtcagagtgaacaacgactgctctacctgg
gi|4                          : taatatctggaaattgttcatttgtcttattcaagacccgcctattacgtcgatatattccaccatccttagtttgtacaacataggaacggtcagcatgtttcttaatgatctttgctggtttccagatttttcctatttgcagtcttacactatcgtttacaaataacggtggtaatgtttttgatgacttgtcaaaataagacttttgtctgtcttttgattgttggatattgttacttacagtatcagggttcacttttggggacataagctgtttatttgtagtagggagaattgacttcgttcttctactcattaacagttgagatggagaataattacagaaaagcggcgtgtttctgtattcaaggatagcaatataggtatcgctcccgctgtcttttgccttctgtaacaatcgcttgacagtttggacagtcctctcagctaatccattaggcataggatgtaatgggctggaggttgtatgtgtaaaattccattctttggaaaacaattgaaagtttgccgaggcaaactgtggccaattatctgaaactaacttatccgggatacccagtctagcaaaatgcactttaagtttccttaccactgttgtgcttcgtgtgtctggtaacctgtctatctcgaagaatctactgtaataatctacagtaactagacagttctgtcaatcaaagtgaaaccggtcaatggctacattcttccatggtctcgggggtacctcaaggggagttaatggttcctttgttttggaattccggtgtttaagacagattgggcattccaaaacaaagttaattatttgttttgccctaccagtccaaaacataacatcttttgctctttggaaacttttttactgttcccatacggccaatatgaactttttcaattatatgctgtctaagtggttttgggataaccagtgtttttcccctaaatataagatcgtctgaaattgagagctcatctctgtggttaaaatattccacaactaattcgttgcagtctactctcaattctggccagccttgaactatagtccatttcaaggcttgcatatgatggtcagtcttagtggcttctctcacagattcgagttatatctgtctgtaaagttcattcctttgaggatcgtatgaaaatgttagtaaaggccttccatgtcgtaactgtccgacatacgtttcctcgaaaataagtcctttatgggaacttccttcccgctaCTTCAAAATTT---CCTTATCGCTGTTGTACTTCGTATGA--CTGGTAGCTTATCTCTATT-GACGA-ATCTACTTTAATAAACAGCAGGAACAAAATAGT--TTCGTCCGTCA-AAGTGGAA-CAGGTCATTGACTAC-ATGTGCTATGGTC--TCAAGAGTACCTCATAGGGAGTT-AATAGTTCCTTTGTATTGGAATTTGTATTGGGGTTTGAGACAAATTG-GGCATTGCAAAACATAGTTGATTAT--------TTGTTCTG-CCATACCAGCCCAACACATGCCGTgtgaacaacgactgctctacctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatttaTTAATTTTATATCATTTAAAGTATATCGAATCAAAAT---ACTATTTGC-----TTTTAAAT-TGGCA---GTGTAATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATGTTCAGACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAGA-TAAGACTTCTTTATTCGAACTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAACTGGG----CTG---------C-TAGGTATAGTAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAttttgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATTGC--------TGTAATACGAAATAGTAATACAATGACTGAGAGAAAGTATTAAGAAACACGAACTGTGTTAAA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----TTG---------C-TAGGTATAACAGGAAGTATTATAGAATAGCCACAACTACAAT--ATGTCAAtttgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatatctgattggtttgattgtaaGTAATTTTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATATGAAATAGTAATACAATAATGGAGTGAAAGTATTAAGAAGCATAAACAGT--TAGA-TACGACTACTTTATTCGGCCTCGTGAGAGAG--AGTAAT--AAATAA--GAAATTGGA----TTG---------CATA-GTATAGCAGAAATTATTGTAGAATAGCTACAAATACAAT--GTGTCAAtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATTTCCATGTGTAGTTAT--------TGTAATACGAAATAGTAATACAATGATGGAGTGAAAGTATTAAGAAACACGTACTGTGTTAGA-TAAGACTGCTTTATTCGACCTCGTGTGAGAG--AGTGAT--AGATAA--GAAATTGGG----CTG---------C-TAGGTATAGCAGGAAGTATTATAGAATAGCAACAAATACATT--ATGTCAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAGTATTTATGACTTTATATTGGAAGCAGAATGAAGTGAAGAACACAAATATGTTAACTCTAAAGTGTTTAATCTAGAAGTCGAGTCCCTATTGCAGATTCAATGATCTTATGCGCATGCGTAACTATAGTTTATTTCAATAATGTTACATACTGAAGAAATTCAGCTTTAGGATATATGCAATCGATTGGTAATGTTAAATTATTAGTATATATACGGACAACGACGGAGATAGTGGCAACATTTGGGTCCGTCGTTAAGTATTATAGA
Unaligned ( gi|17 ): TCAACTTAGTATACATGAACTGGATTGGTAATGCTGTACGTGTTTGTCAACGGCGGAGATAGGGTGACAAAATGTCGGTCCGTTTCGTATTATAGA