lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                    1111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                            1111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          111111111111111111111111                                                                             111111111111111111111111111111                                                              1111111                                                            1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                        222   1                     4444444444444444444444444444444444       1       11111                               33333333                                      33333              1        666666666                      6666666666666666666                                                   55555555555                33   1    1       1       1                    5555555555555555555555555            1       1   11      55555555555        11              222    1        333333    1      11  11                                888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                     2222222222        1  22222                 3333333    2222222                                      44444444           1             5555         111                                            333333333333333333333                                   1                            666666666666666666666666          1      1           22222   1  666666666666666666666                444444444444444444444444444444   2      4       22            1                         11  1111111                                    1   1               1   8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888         1  11         2222    22222                      11        111        11     1               22222222   11                 333333333                   222222222   11              1            1                      1   555555555555   11                                                            222         1           1      3333333       1   1             11                 33333333          2               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                      6 444   3      6              8888888888888888888888888888888888     3 0  8    66666  2      8 0            5  88  55555555         2  2  0                      66666              7  6     333333333    99           6    4444444444444444444             3    6 3  7             2  11    7    22222222222                88   3    3       7       5      6           0 0000000000000000000000000   7  7     5 0     6   22      66666666666        88              222    0        777777    5      33  22          8 88                  444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      3      0 5   1       0    3 2  3333333333    8   0  00000  8           0  6666666    0000000 6   1   8               0        3   11111111   1       3   0    0    6666 0       222  44    6    3     3               3        888888888888888888888      8                         2  5          8    0            999999999999999999999999          7 4    3           11111   2  999999999999999999999 2         2    666666666666666666666666666666   0      0       11            6     2         4      6  22  7777777                  8      1   6      1   7               5   6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  0   6  0  11         1111    11111                  66  11   8  0 333   8 8  33     5     6  9      22222222   22                 444444444                   222222222   11 1  1         2         0  4           55         0   333333333333   33    3    3   0            3     6 1        2    9           777         0   0       0      7777777   6   1   0    1   6    33       8     3   66666666 4    4   4               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                      . ...   .      .              ..................................     . .  .    .....  .      . .            .  ..  ........         .  .  .                      .....              .  .     .........    ..           .    ...................             .    . .  .             .  ..    .    ...........                ..   .    .       .       .      .           . .........................   .  .     . .     .   ..      ...........        ..              ...    .        ......    .      ..  ..          . ..                  ...............................................................................................................................................................................................................      .      . .   .       .    . .  ..........    .   .  .....  .           .  .......    ....... .   .   .               .        .   ........   .       .   .    .    .... .       ...  ..    .    .     .               .        .....................      .                         .  .          .    .            ........................          . .    .           .....   .  ..................... .         .    ..............................   .      .       ..            .     .         .      .  ..  .......                  .      .   .      .   .               .   ........................................................................................  .   .  .  ..         ....    .....                  ..  ..   .  . ...   . .  ..     .     .  .      ........   ..                 .........                   .........   .. .  .         .         .  .           ..         .   ............   ..    .    .   .            .     . .        .    .           ...         .   .       .      .......   .   .   .    .   .    ..       .     .   ........ .    .   .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                      0 000   2      0              8888888888888888888888888888888888     2 5  0    00000  8      0 8            6  66  88888888         0  5  2                      88888              0  0     222222222    22           0    8888888888888888888             2    0 2  8             2  77    3    00000000000                00   3    3       0       3      0           7 3333333333333333333333333   0  3     7 7     3   33      00000000000        33              000    0        000000    0      88  00          3 33                  777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      8      6 4   4       8    8 8  0000000000    2   0  00000  0           8  0000000    0000000 0   4   0               8        2   88888888   4       6   8    8    0000 8       222  44    0    0     0               6        555555555555555555555      8                         5  5          8    8            000000000000000000000000          0 7    3           88888   0  333333333333333333333 5         5    000000000000000000000000000000   0      0       00            0     5         0      0  00  5555555                  0      4   4      8   0               4   7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  2   0  0  22         2222    44444                  44  00   2  8 666   2 0  88     0     0  6      00000000   22                 222222222                   222222222   00 4  4         8         8  0           22         0   000000000000   88    2    0   2            5     0 2        5    0           000         0   2       5      5555555   0   5   5    2   0    88       2     5   22222222 0    7   7               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                  GGACTATGTGATGAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGA-TGCA--ATCAATGATAAC-ATACTATTTGTTTGTCA-AAA--ATGCTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCGAGACATTACATTGACGT-ATC--AATTTATCTGGAAGAAGGAGCTT-------TAATATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGCGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGCGNATT-ATTC-GTTTTCTAAAGACAG-GCTTTCACGTTTTATTTAAC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGGATATTCATGAAAACAAAGATNNGTCTTTGTTTGACG---TCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTACTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAC------TACTATGTAAC--TT--AT-AG-CA-ATGAGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACTCATGCT----------AT--GTAAACA-------------A-T----------AGT--GTAGTCAA----TAC-A---------TG--------CATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGC--GANTACACCAATAT-----TC-AAGACAAAGATACATG-----GTTT-A-T---CTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAANTTC---AGNT-AGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA---AAGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGNGATGGCAGAAGA---TTTAAGAGGAATANTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCANGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTA-CGTG------AGG-------CGTGATGTCTTGTAANTATA-TCATTTATAGT-T---TACGAT-----GCTATGNGATTCGTGTTNCCGAAAATGNATATGACCTAGAGTAGTTGCCAAAAATGTACANATAACTTTTCCATTGCACGTGTATGATGTTAATCGTAATNTACACATATNGCAGTGACAGGGT------GTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACCATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGC-A-CTAAACATTTAACGGGCAATGATCG-CAT--------T-ACGACGATAAC---------TTT--AAGGCCGAA-TT-TATCATCTTT----TGAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCACAGT----ACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTATTACCGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-AAAGG----ANG--CTGT--CAATAAACANACGCTGTAGACATTGTNAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAGATAA-TTTGTCTTTAAATGAACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTCATNAGT--------ANTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                  GGACCAAGAGATTAATGCCGGGGATGGATTCATATTTTTAGATTCTGTTTCACTTGATTATGGTGCACTTGATACTGA-TGCA--ATAAACGATAAC-ATACTATTTGTTTGTCA-AAA--A-GCTTATAAATATGGTGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCACAATTAACTATTCAAGACAATATATTGA-A--GTC--AATTTGTCTGGAAGAAGAAGCTTTAATTACTAATACTAATATATTTTAGCACTATCGACTATTGACAAATGAAGTTTTTGTTGTGATAATTTGACTGTCACCTATGGCCTGTCACCTGCTTATT-ATTT-GTTTTCTTAAGACAGAGCTTTCGTGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ACGAAG-TACATGTATATTCATTAGAACAATGATTAGTCTTT-TTT-ATG---TCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATTAGCACA--TATGAATTATGTCTTCTTTAGTATGTACAGTACAGTAATATAAAATGTACTATGTAACCATTAAATAAGACACACAAGGTGTTTATTGAAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACAAATGATGGAACT------TAA------ATTCATGCT----------AT--GGAAACA-------------A-T----------AAT--GTAGCCAA--------A---------TG--------CATTCAAAGTGAGACAACCAGTGCCTGTTGATTGCAGACCGC--AATTACACCAAGAT-----TC-AAGACAAAGATACA-G-----GTTT-A-T---CCGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---ATGT-AGTAACAGATGAAAAACGGGAACTAAATTAAGTTACAA-TGTGTTACTGATTTATTAGTAAGCCATGTTCCTAAAGTGATGGCAGCATA---TTTAAGAGAAATGCTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTTGAAATCCTGTATCCAACTTTGTATCTTAACCTGTGCCACAAGTAAGTGGTGCGATGTCTTGTTATTATA-TCATTTATAGT-T---TATGAT-----GC-A-GAG--TTGAGTTGCCAAAAATGCATAT----T----TAATT------------CAT-TAA-TTTTTC-TTGCATGCCTATGATGTTAATAATAATGTACATATATTACAGTGGCAAAGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTACTGTTCAATTATTGCAAGGTTGTACCATTTT-TATAT-AGTATAGAACCAGCAACTTAAACATTTAATGGGCAATGATTG-CAT--------TCACGAGGATA-----------CTT--AAGGCCAAA-TT-TATCATCTTT----TGAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAACACACCAATTTGT-TAATTATTATGTGATGATAACTGTA----AAGATGATAGTTAAATATTGCACAGT----ACTAATTAAACAGCCCTCGGACACT----GCTGCAT--CATAAAATATGCGCAATTCGTTACTACAGGAAGTGACCCAGTATCACCTG-AAA------ATG--CTGT--CAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCAAATTTAAAATGGAAAATTCACAGAATGATCGATAAATAA-TTTGTCTTTAATTGAACTCT-----AAATAAATCATTACTAACAACTTGA--AGATTGACTTTATTAGT--------ATTAAATGAATAGTGATTCGTTAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                  GGACTATGTGATCAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTACCACCTGGTT---------TTGATACAGA-TGCA--A---ACAATGAC-A---------------A-AAA--T-GTTAATAAATATGATGCTTCTATACCATTTGCTATATTATCATA-CCAACTATTTGAGACATTACATTGA-G--ATATAAATTTATATGGAAGAAGGAGCTT--------AATATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGGCAAATGAATTTTTCGTCACGATAATTTGTCTATCGTCCATGGTCTGTCACCTGC-CATTAATTT-GTTTTCTAAAGACAT-GCTTTCACGTTTTATTTAAT--TTTACCGGTAT--ATGAAACTA-ATGTATATTCATGAAAACAAAGATTAGTCTTT-GTT--TGGCTTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-GATTGA-CATCTTGT---TAACTATGAGCAAATTTATGAATTATGTCTTC-TTAGCATGTACAGTACAGTAA---------TACTATGTAAC------------------AGTTG---AT--AAAGGAA-------CCTCA-----ATTC----ATGCT---ACG------TAA------A--CAGTCT----------AA--GTGAAGA-------------A-C----------AGT--GTTGTCAAATGCTACCA---------TG--------CATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTCGATTGTA---CAC--GAATACACCAATGT-----TT-AAGACAAAGAT-CA-G-----GTTTAA-T---CTGGATACC-TGATTAAAATCATTCAGAAGTTAAGTTC-----------AGCAGATGCAAAACGATAATTA----AAGTTACAATTGTG----TAGTTTCTTAGGAGGCTATGTTCCTAAAGTGATGGCAG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                ttcatctttgcagtgcctGGATTATGTGATAAATGCCAGGGATGGAAACATAA----AGAATTTGTTCCACCTGGCT---------TTGATACAGA-TGCA--ATCAATGATAAA-ATACTATTTGTTTGTCACAAATGA-GC--ATAAATATTGTGCTTCCATACCATTTGCTATACTACCATA-CCAACAGTTCAGGACATTACATTGACAT-ATC--AATT-ATCTGGAAGAAGGAGCTT--------AATATTG---TATTTTAGCACTATTGACCATTGTCAAATGAAGTTTTCGTCATTATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                               attcatcttggcagtgcctGGACTATGTGACGAATGACAGGGATGTATTCATAG----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGA-TGCA--ATCAATGATAAC-ATACTATTTGTTTGTCA-CAA--ATGATCATAAATATGATG----CATACCATTTGCTATATTATCAT-ACCAACTATTCAAGACATTACATTGA-GATATT--AATTTATCTGGAAGAAGGAGCT--------TAATGT---TGTATTTTATCACTA-CGACCA-TGTCAAATGAAGTTTTCGT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                attcatcatggcagtgccaGACTATGTGATGAATGCCAAGGATGGATTCATAcca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                            ttcatcttggcagtgcctaGGTGGGCTTACT-CTGAATGCATAGTAAATGTTAACTATACTATTTGTTTA-CA-AAaaaattatgt
gi|9                          : attatttagttttctacagacagagctttaatgttttattcagcggtatgttcatgagaacaagggttcataaaatcaaggatgtgtctttgtttgacgtcaatagagaaccattcagtctctggtgggcatcttgttaactatgaacacgtaattatgtctactcttgtatgtatagtacagttattctatgtaacagtttcatcagtcaaatgagatgtttaataagggatttttttattcattcatggatgatggaacctctgctcctgctcgtaaacagtaGA-TGTA--ATCAATGGTGAC-ATACTGTTTGTTTGTCA-CAA--ATGCTCATAAATATGATGCTTTCATACTATTTGCTATATTATCATAACCAATTATTCAAGACATTACATTGACAT-ATC--AATTTACCCGGAAGAAGGAGCT--------TAATAT---TATGTTAAAGCACTATCGACCATTGACAAATGAAGTTTTTATTGTGAT-ATTT-------------GGCCTGTCACCTGCGGATA-ATTC-GTTTCCTAAAGACAGCGCTTTCATGTTTCATTTAAC--T------ATAC--ATGAAA-TTCATGGATATTCATGAGAACAAAGATAGGTCTTTGTTTGACG---TCAATAGA--ATCATTCAGTCTCTAA-TGGA-CATCGTGT---TAACTATGAGCACA--TATGAATTATGtgtgtctgttgattgttgaccgcgtaaccacaaatattcaaggcaaagatacatgtttaatctggaaacccaattgataattttcaaaagcaaattttagttagttacacacggaaatgggtaatgaagttataacttgctactggtttaccagtaggtcatgttcctagagggatggcagaatatttaagagaaataactgataatggtagtaaaatattttgtaagccatgtggatatcctgttcccacttttgtatcttattgtgcgccacaagaaagtgatgtctggtaactatatttttttatagttatatataatttatataactacaaactggactatctgtgttgccagaaaaaaaactatgatgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATT-ATTTAGTTTTCTACAGACAGAGCTTTAATGTTTTATTCAGCGGT------ATGTTCATGA-G-AACAAGGGT--TCATAAAATCAAGGATGTGTCTTTGTTTGACG---TCAATAGAGAACCATTCAGTCTCT-G-GTGGGCATCTTGTTAA---CTATGAACACG--TA---ATTATGTCTACTCTTGTATGTATAGTACAGT--TAT------T-CTATGTAACAGTTTCATCAGTCAAATGAGATGTTTAAT-AAGGGAT-------TTTTTTATTCATTCATGGATGATGGAACC------TCT------GCTCCTGCTCGTAAACAGTATTTGTAAACA-------------AAT----------AGT--ATAGTTAACATTTACTA---------TG--------CATTCAGAGTAAGCCCACCTGTGTCTGTTGATTGTTGACCGCGTAACCACA--AATAT-----TC-AAGGCAAAGATACA-T-----GTTT-AAT---CTGGAAACC-CAATTGATAATTTTCAAAAGCAAATTTT---AGTT-AGTTACACACGGAAA-TGGG---TAA-TGAAGTTATAA-CTTGCTACTGGTTTACCAGTAGGTCATGTTCCTAGAGGGATGGCAGAATA---TTTAAGAGAAATAACTGATAATGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCATGTGGATATCCTGTTCCCACTTTTGTATCTTATTGTGCGCCACAAGAAAGT-----GATGTCTGGTAACTATATTTTTTTATAGT-TATATATAAT-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GA-CATCTTGTTAAT---TGTGAGCACA--TAT-AATTATGTCTACTCTAGTATGCACAATACTGTAATAC----TGTA---TGCAA---TTGAATAAGATATATGAGATGTTTAATTAAGGGAGAGAAAACTTTTC-----ATTCACAAATGATAGAACCGCAGCCCAAGGAGGAACTCATGCT----------AT--GTTAACAGTCTATGTGAAGAA-T----------AGT--GTAATCAA--------AATGTTACCATG--------CATTCAAAGTGAGACAGCCTGTGCCTGTTAATCGTAGACCGC--GAATACATCAATAT-----TC-AAGACAGAGATACATGTATATGTTTGA-T---CTGGATTCC-TGATTAAAAACATTC-AAATTAAAGTTC---A-GCAAGTAACAAATGTAAAACGGGAACTA----AAGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTTGGCCTTATTTCTAGAGCGAT--------------------------TTGACACTAGTAGTAAAAGAGTGTGTAAGCCATGTAGAAATCCTGTGTCCAGCTTTGTTTCTTA-----------AGGT------TGTGATTTCTTGTAAATATA-TCATTTATAGTAT---TAC-ATTTTTCGCTATGTG--TCG---TGCCAAAAATAAATATGACCTAGAGTAGTTGCCAAAAATGTACATATAACTTTTTCATTGCATGTGTATGATGTTAATTGTAATTTACACATATTATAGTGACttatataactacaaactggactatctgtgttgccagaaaaaaaactatgatgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gA-------TCTTT-----ATTCACAAATCATGGAACC------T--------CTTCATGCT----------AT--GTAAACA-------------G-TCTATGTGAAAAATAGGTAGTCAA--------A---------TGATACCATACATTCAAAGTGAGACCACCAGTTCCTGTTGATTGTAG--CG---AA-TACACCAATAC-----TC-AAGACAAAGAAACATG-----TTTT-A-T---CTGGATATC-TGATTAAAAACAGTCAAAAGTAAATTTC---AGCT-AGTAACAGATGCAAAACGGGAACTA----AAGTTACAA-T-TGTGACTGGTTTACTAGTAGGTTATGTTCCAAAAGTGATGGCAGCAGAAGGTTTAAGAG-AACACTTGACACTGGAAGTAAACTATTTTGTAAACAAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTGTGTtgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaatggataaagtcctttttttagaatatttattgttcgtttaatgcaaggttgtaccattttatataagtatagaacctaaacgaacggtgatcgcatttatgacaataattttaaggccgaatttatcatctgttgacttactttaattaaaaaggaagaaaaacactttttggtaataattactgtaaagctgattgaaaaatattgcacagtacattttaaacagccctcggacacagcctcatcataaaatatgcccgattcgttacgacccggtatcatctgaaaaggcactggcaataacacacgctgtagacattgtaagatcgaatttaaaatggaaacttcaaagaatactagataaataatttctctttaaatgaactataaacaaaccataactaacaatttaaagattgaattcacaagtaataaaagaaaatgattccttaacaccggcgacactgtatc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cCCAA--------A---------TG--------CATTCA------GCTAAGCAGTATTTG--GAT-ACAG--TGC--GATGAATGTAAGATATTCATCTAAGACAAATATACA-T-----GTAT-A-TAATCTGTAAACCCTGTTAAAAAACATTCAAAAGTAAAATCCGTAATGT-AGTTACAGATGCAAAACGAAAACTGAAGTA----ACAA-AGTGTTGCTGGTTTACCAGTAAACCATGATCATAGAGGGGTGACAGAAGA---TTT-AGAGGAATATTCGACA---GTAG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGAAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAGCATG--------------GGCGTGATGTCTTGTAATGGTA-TCATTTTTAGT-T---
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaact---TATGAT-----GC-A-GAGATTTGTGTTTCCGAAAATGCATAT----T----TAATT------------CAA-TAA-TTTTCCATTGCACATGTATGATGTTAATCATAATGTACATATATAGCAGTGACAGGGT--------AGATAAAGTTATTTTTT-AGTATATTTAATGTTAATTTAATGCAAGGTTGTACTA-TTT-TATATGAGTACAGAACCTGCAAACTAAGCATTTAATGGGTAATGAT---CAA--------T-------ATT-----------TTT--ATCGTCGAATTT-TAGTATCTTT----TGAC--TCACTTCTTTGATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACAAATTTGT-TAACTATTAgaattatttatattattatacattgtggtatttatatcgtgcaaaaaaaaaaaatatgatgcagagatttgtgtttccgaaaatgcatatttaattcaataattttccattgcacatgtatgatgttaatcataatgtacatatatagcagtgacagggtagataaagttattttttagtatatttaatgttaatttaatgcaaggttgtactattttatatgagtacagaacctgcaaactaagcatttaatgggtaatgatcaatatttttatcgtcgaattttagtatcttttgactcacttctttgattaaaaaaaaagaaggaaaacacaaatttgttaactatta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttaacttgttagtaaaatattttgtaagccaggtgaaaatcctgtgtccaactttgtatcttagcatgggcgtgatgtcttgtaatggtatcatttttagttgaattatttatattattatacattgtggtatttatatcgtgcaaaaaaaaaaaaGTGGATAAAATTGGCTTTT-AGTGTAATTGGTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACCA-TTT-TATAT-A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttctcatcatggtttgagaaaagTGGATAAAGTCCTTTTTTTAGAATATTTATTGTTCGTTTAATGCAAGGTTGTACCATTTTATATA--AGTATAGAACC-------TAAACG---AACGG----TGATCG-CAT--------TTATGACAATAAT---------TTT--AAGGCCGAA-TT-TATCATCTGT----TGAC--T---TACTTTAATTAAAAAGGAAGAA-AAACAC-----TTT-T-TG--------GTAATAATTACTGTA----AAGCTGATTGAAAAATATTGCACAGT----ACATTTTAAACAGCCCTCGGACACA----GCCTCAT--CATAAAATATGCCCGATTCGTTAC----------GACCCGGTATCATCTG-AAA------AGGCACTGG--CAAT-AACACACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCAAAGAATACTAGATAAATAA-TTTCTCTTTAAATGAACTAT-----AAACAAACCATAACTAACAATTTAA--AGATTGAATTCACAAGT--------AATAAAAGAA-AATGATTCCTTAACAagttta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggacatcttgttaattgtgagcacatataattatgtctactctagtatgcacaatactgtaatactgtatgcaattgaataagatatatgagatgtttaattaagggagagaaaacttttcattcacaaatgatagaaccgcagcccaaggaggaactcatgctatgttaacagtctatgtgaagaatagtgtaatcaaaatgttaccatgcattcaaagtgagacagcctgtgcctgttaatcgtagaccgcgaatacatcaatattcaagacagagatacatgtatatgtttgatctggattcctgattaaaaacattcaaattaaagttcagcaagtaacaaatgtaaaacgggaactaaagttacaatgtgttactggtttactagttggccttatttctagagcgatttgacactagtagtaaaagagtgtgtaagccatgtagaaatcctgtgtccagctttgtttcttaaggttgtgatttcttgtaaatatatcatttatagtattacatttttcgctatgtgtcgtgccaaaaataaatatgacctagagtagttgccaaaaatgtacatataactttttcattgcatgtgtatgatgttaattgtaatttacacatattatagtgactgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaaGTTCTTTTTT-AGTATATTTATTCTTAATTTAATGCAAGGTTGTACCATGTT---------------------------AACATTCAATCAGCAATGATCG--------------------ATA-----------TTTTCAAGGCTGAA-TTGCATTATCTTT----TGTC--CATCTTTTTTTATTAAAACAAA-GAAGGAAAACACCAATTTGT-TATTTATTAGGTGATAATGACTGTA----AAGCTAATAGTTAAATGTTGCACAGT----GCTTTTTAAACAGCCCTCAGACACT----GCCTCATATCATAAAATATGCATGATTCGTTATTACGGGAAGTGATCCGATATCACCTGTAAAGG----ATG---TGT--CAATAAACACACGTTGTATACATCGTCAGATCGAAGTTAAAATGGAAACTTCACATAATGCTACATAGATAA-TTTGTCTTTAAATGAACTGT-----AAACAAAACATAACGAACAATTTGA--AGATTGATTGTATTAGT--------AATAAACGAAAAGTGATTCGTTAACAccggcgacactgtatc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTCTTTT-AGTTTAATAACTGTTCAATTAATTCAACGTTGTATCGGTTCGTATAT--TTGTAAAATATATTACCTAAACATTTGACGATCAA--ACCGTCATGTTTTTTATGACAATGATAACAGTTTATTTTTTG-AAAGCCGTA-TT-AATCATATTTGCCGTAGCAATAACGCCATTAATTAATGAAAAAGC--GCATACATTGGTTTATGCAACTATTAGGTGATAATTTCTGTA----A-GCTGGTTGTTAAATATTGCACAGT----ACTTTTTAAACAGCCATCGGACATT----GCCTCAT--CTTATAATATGCGC-GCTCTTTATTACTGGAActggtgaaactgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatgctctataactctaacaaacagtatttattattttttatttggacacacatttgcaaagcattgtaactgtgttcacaatgcttgattgacgctttcatattttgatttgtgaaagaacgaataaGAC---AACTTCTTTAATTTTAAAAT--GATGAAAAACACCG-TCTTT-CAGCTATAAGGTGATATTAATT-TATGATAAACTGGTTGTTAAATATAACATTTTTTTTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACATG----GTCTCAT--CTTATAATATGCGCGATTTGTTATTACCGGAAGTAACCCTCTATCCCATG-AAAAGAAAGATA--GTAT--CAATAATCAAATGATGTAGACAATATTAGATCGAGTTTATAAC-GCAAATTTACAGAATGCGAGATAAATCATTTTATCTATAATACAACTGA-----AAACAAACCATTACTATCAATTCGAAGAGATTGATTTTGTGTGT--------ATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttaacagtcaagcagcgatcgcatttatagcaatcatatattttgaaggacgactgtgctgccaaagaTTAGGTGATAATTACTGTA----AATCTGA--GTTAAATATTGCACAGT----GCTTTTTAAACATCCCTCGGACACTCGCAGCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCATTACTACTGGAAGTGACACAGTATCACCAG-AAA------AGG--CTGTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGATTTTAAAATGGAAACTTTACAGAATGCTAGATAGATAT-TTTGTCTTTAAATGAACTGTAAACAAAACAAAACATAACTAGCAATTTGA--AGATTGATTTCATTAGTAATAAATCATTAAATGAAAAGTGATTCGTCAACAtcgattgatactccggcgacattgta

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1111111111111111111111                                                                                                        1111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1111111111111111111111111111111                                                  111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                             111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111                    444444444                                                                                           11                                                    2     333333333333                                                                                11   1   11               3                    333333333    11      11                                                  11              111             111111           11                                    33333333333333        2222222222222222222222              2       2222222     22222                   5555555555555555555      3333333333  11       0000000000000000000000000000000000000                                                  11            1111               222222   1                                         111                            22222222                                                   111                                                                                      3333333333333333333333333333333              111   555555555555555         222   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   1                                                         555555                                                         2222222     1111111           66666666             11111         000000000000000000000000000000000000000   1           111         2222222222   111                   111            111                               1111                      1111                             1111                                                               4444444444444                                                                                                 22222                         11                 22222222                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3                      7777   1 1              000000000                      0                    5   0 3                                         11          2              77 0    0                  0 0   999999999999  0            0      0  1                  2   3   3 3  0  11 0                66   0   22               0       2            333333333    33      33 2   2  3     0       1   22      2   2           33              444    8        888888           11  55          4  6                  44444444444444        6666666666666666666666 11  0        0       6666666     00000    0 4      3     2222222222222222222      5555555555  11       3333333333333333333333333333333333333                      1                 5     44  11            4444             7 444444   3 6          6                        1   111  7    3       5            00000000        777  1                                1    111      5    5   66    3      5                         1                               5555555555555555555555555555555              444   666666666666666         111   333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333   2     6      0               44    1    0    11           777777  3                 6          1                         1111111     5555555       1   22222222     0       66666   1     333333333333333333333333333333333333333   3           111 3       4444444444   000     1             333  3         333   666  1                      4444        3             4444                             4444       99                           7           1          8   5555555555555         6  1                1                     5                          5      8    8      00000       1   1             11             1   99999999 1    4     2             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      ....   . .              .........                      .                    .   . .                                         ..          .              .. .    .                  . .   ............  .            .      .  .                  .   .   . .  .  .. .                ..   .   ..               .       .            .........    ..      .. .   .  .     .       .   ..      .   .           ..              ...    .        ......           ..  ..          .  .                  ..............        ...................... ..  .        .       .......     .....    . .      .     ...................      ..........  ..       .....................................                      .                 .     ..  ..            ....             . ......   . .          .                        .   ...  .    .       .            ........        ...  .                                .    ...      .    .   ..    .      .                         .                               ...............................              ...   ...............         ...   ..........................................................................................   .     .      .               ..    .    .    ..           ......  .                 .          .                         .......     .......       .   ........     .       .....   .     .......................................   .           ... .       ..........   ...     .             ...  .         ...   ...  .                      ....        .             ....                             ....       ..                           .           .          .   .............         .  .                .                     .                          .      .    .      .....       .   .             ..             .   ........ .    .     .             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2                      0000   4 0              000000000                      8                    4   8 2                                         44          8              88 8    8                  4 8   000000000000  8            8      8  0                  0   2   2 5  8  00 2                00   0   00               0       0            555555555    88      22 5   5  2     2       2   00      5   5           88              000    0        888888           00  88          0  5                  00000000000000        5555555555555555555555 00  8        0       0000000     00000    8 6      2     4444444444444444444      0000000000  00       4444444444444444444444444444444444444                      4                 6     66  00            2222             3 333333   3 7          7                        0   777  5    7       2            88888888        000  7                                0    777      0    6   44    8      0                         0                               0000000000000000000000000000000              888   000000000000000         888   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   0     7      7               33    0    7    77           555555  2                 7          0                         7777777     7777777       0   00000000     8       77777   7     222222222222222222222222222222222222222   3           222 2       3333333333   888     0             888  5         000   888  8                      2222        7             2222                             2222       22                           8           4          0   6666666666666         0  0                0                     0                          0      0    0      00000       0   4             00             0   00000000 0    2     5             
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-NATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC-G--TNAA-T-AG--N--AC--ACGAGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCT----------AT--GTAAACAGTCTATGTGAA-AA-TAGTGTAGTCAAANNN-TA-CCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCGAATA--CACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAN---------C--GTGAG--G-C--------GTGATGTCTTGTAAT--TAT-------------A-TCATTTATAGT-TTAT-AT-----GC--TATGNGATTTGTGT--TGCCA-AAAATGAA--TATGACCTAGAG---TA-GTTGCCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT------TT---ACGAC---GATA-AT---------TTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-AAAAGA-----CGC--TGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
Reference ( family-5685 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATGAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCAAAAATGCTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCGAGACATTACATTGACGTATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGCGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGCGNATT-ATTC-GTTTTCTAAAGACAG-GCTTTCACGTTTTATTTAAC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGGATATTCATGAAAACAAAGATNNGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTACTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAC------TACTATGTAAC----TTA--T-AG--C--A---ATGAGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCT----------AT--GTAAACA-------------A-TAGTGTAGTCAA-----TA-C-ATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCGANTA--CACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAANTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGNGATG---GCAGAAGATTTAAGAGGAATANTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCANGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTA----------C--GTGAG--G-C--------GTGATGTCTTGTAAN--TAT-------------A-TCATTTATAGT-TTACGAT-----GC--TATGNGATTCGTGT--TNCCG-AAAATGNA--TATGACCTAGAG---TA-GTTGCCAAAAATGTACAN--------ATAACTTTTCCATTGCACGTGTATGATGTTAATCGTAATNTACACATATNGCAGTGACAGGG------TGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCA--CTAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT------T----ACGAC---GATA-AC---------TTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTATTACCGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-AAAGGA-----NGC--TGTCAATAAACANACGCTGTAGACATTGTNAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAGATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTCATNAGT--------ANTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACCAAGAGATTAATGCCGGGGATGGATTCATATTTTTAGATTCTGTTTCACTTGATTATGGTGCACTTGATACTGATGCAATAAACGATAACATACTATTTGTTTGTCAAAAA-GCTTATAAATATGGTGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCACAATTAACTATTCAAGACAATATATTGAAGT--CAATTTGTCTGGAAGAAGAAGCTTTAATTACTAATACTAATATATTTTAGCACTATCGACTATTGACAAATGAAGTTTTTGTTGTGATAATTTGACTGTCACCTATGGCCTGTCACCTGCTTATT-ATTT-GTTTTCTTAAGACAGAGCTTTCGTGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ACGAAG-TACATGTATATTCATTAGAACAATGATTAGTCTTT-TTT-ATGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATTAGCACA--TATGAATTATGTCTTCTTTAGTATGTACAGTACAGTAATATAAAATGTACTATGTAACCA--TTAAAT-AAGAC--AC--ACAAGGTGTTTATTGAAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACAAATGATGGAACT------TAA------ATT-CATGCT----------AT--GGAAACA-------------A-TAATGTAGCCAA----------ATGCATTCAAAGTGAGACAACCAGTGCCTGTTGATTGCAGACCGCAATTA--CACCAAGATTCA----AGACAAAGATACA-G-----GTTT-A-TCCGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---ATGTAGTAACAGATGAAAAACGGGAACTAA--ATTAAGTTACAA-TGTGTTACTGATTTATTAGTAAGCCATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGCATATTTAAGAGAAATGCTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTTGAAATCCTGTATCCAACTTTGTATCTTAACCTGTGCCACAAGTAAGTGG-T--------GCGATGTCTTGTTAT--TAT-------------A-TCATTTATAGT-TTATGAT-----GC------AGAGTTGAGT--TGCCA-AAAATGCA--TAT----T-------TA-ATT------------CAT---------TAATTTTTC--TTGCATGCCTATGATGTTAATAATAATGTACATATATTACAGTGGCAAAGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTACTGTTCAATTATTGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCAGCAACTTAAACATTTAATGG----GCAATGATTG-CAT------TC---ACGAG---GATA------------CTT-AAGGCCAAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAACACACCAATTTGT-TAATTATTATGTGATGATAACTGTA----AAGATGATAGTTAAATATTGCA----CAGTACTAATTAAACAGCCCTCGGACACT----GCTGCAT--CATAAAATATGCGCAATTCGTTACTACAGGAAGTGACCCAGTATCACCTG-AAA--A-----TGC--TGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCAAATTTAAAATGGAAAATTCACAGAATGATCGATAAATAATTTGTCTTTA-ATTG-AACTCT-----AAATAAATCATTACTAACAACTTGA--AGATTGACTTTATTAGT--------ATTAAATGAATAGTGATTCGTTAACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-------TCTTT-----ATTCACAAATCATGGAACC------T---------CTTCATGCT----------AT--GTAAACAGTCTATGTGAAAAA-TAG-GTAGTCAAATGA-TA-CCATACATTCAAAGTGAGACCACCAGTTCCTGTTGATTGTAG----CGAATA--CACCAATACTCA----AGACAAAGAAACATG-----TTTT-A-TCTGGATATC-TGATTAAAAACAGTCAAAAGTAAATTTC---AGCTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-T-TGTGACTGGTTTACTAGTAGGTTATGTTCCAAAAGTGATGGCAGCAGAAGGTTTAAGA-GAACACTTGACACTGGAAGTAAACTATTTTGTAAACAAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTGTGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cTTAGGTGATAATTACTGTA----AATCTGA--GTTAAATATTGCA----CAGTGCTTTTTAAACATCCCTCGGACACTCGCAGCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCATTACTACTGGAAGTGACACAGTATCACCAG-AAA--A-----GGCTGTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGATTTTAAAATGGAAACTTTACAGAATGCTAGATAGATATTTTGTCTTTA-AATG-AACTGTAAACAAAACAAAACATAACTAGCAATTTGA--AGATTGATTTCATTAGTAATAAATCATTAAATGAAAAGTGATTCGTCAACA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGATTATGTGATAAATGCCAGGGATGGAAACATAA----AGAATTTGTTCCACCTGGCT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAAAATACTATTTGTTTGTCACAAATGAGCATAAATATTGTGCTTCCATACCATTTGCTATACTACCAT-ACCAACAGTTCAGGACATTACATTGACATATCAA-TTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------AT---TGTATTTTAGCACTATTGACCATTGTCAAATGAAGTTTTCGTCATTATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attcatcttggcagtgcctGGACTATGTGACGAATGACAGGGATGTATTCATAG----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGATCATAAATATGATG----CATACCATTTGCTATATTATCAT-ACCAACTATTCAAGACATTACATTGAGATATTAATTTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------GT---TGTATTTTATCACTA-CGACCA-TGTCAAATGAAGTTTTCGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attcatcatggcagtgccaATATTCATCTAAGACAAATATACATGT----ATAT-AATCTGTAAACCCTGTTAAAAAACATTCAAAAGTAAAATCCGTAATGTAGTTACAGATGCAAAACGAAAACTGA--A----GTAACAA-AGTGTTGCTGGTTTACCAGTAAACCATGATCATAGAGGGGTG---ACAGAAGATTT-AGAGGAATATTCGACA---GTAGca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccaaatgcattcagctaagcagtatttggatacagtgcgatgaatgtaagGTGGATAAAATTGGCTTTT-AGTGTAATTGGTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------A-TTT-TATAT-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcatcatggtttgagaaaagGACTATGTGATGAATGCCAAGGATGGATTCATAA----AAATTATGTagttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttcatcttggcagtgcctaGA-CATCTTGTTAAT---TGTGAGCACA--TAT-AATTATGTCTACTCTAGTATGCACAATACTGTAATAC------TG-TATGCAAT----TGAA-T-AA--G--ATATATGAGATGTTTAATTAAGGGAGAGAAAACTTTTC-----ATTCACAAATGATAGAACCGCAGCCCAAGGAGGAACT-CATGCT----------AT--GTTAACAGTCTATGTGAAGAA-TAGTGTAATCAAAATGTTA-CCATGCATTCAAAGTGAGACAGCCTGTGCCTGTTAATCGTAGACCGCGAATA--CATCAATATTCA----AGACAGAGATACATGTATATGTTTGA-TCTGGATTCC-TGATTAAAAACATTC-AAATTAAAGTTC---AGCAAGTAACAAATGTAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTTGGCCTTATTTCTAGAGCGAT--------------------------TTGACACTAGTAGTAAAAGAGTGTGTAAGCCATGTAGAAATCCTGTGTCCAGCTTTGTTTCTTA----------------AG--GTT--------GTGATTTCTTGTAAA--TAT-------------A-TCATTTATAGTATTAC-ATTTTTCGC--TATGTG--TCGTG-----CCA-AAAATAAA--TATGACCTAGAG---TA-GTTGCCAAAAATGTACAT--------ATAACTTTTTCATTGCATGTGTATGATGTTAATTGTAATTTACACATATTATAGTGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTGGATAAAGTCCTTTTTTTAGAATATTTATTGTTCGTTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTTATATA--AGTATAGAACCT-------AAACG---AACGG--------TGATCG-CAT------TT---ATGAC---AATA-AT---------TTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTGT----T-----GAC--TTACTT---TAATTAAAAAG---GAAGAAAAACAC---TTT---------TT-GGTAATAATTACTGTA----AAGCTGATTGAAAAATATTGCA----CAGTACATTTTAAACAGCCCTCGGACACA----GCCTCAT--CATAAAATATGCCCGATTCGTTAC----------GACCCGGTATCATCTG-AAAAGG-----CAC--TGGCAATAA-CACACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCAAAGAATACTAGATAAATAATTTCTCTTTA-AATG-AACTAT-----AAACAAACCATAACTAACAATTTAA--AGATTGAATTCACAAGT--------AATAAAAGAAAA-TGATTCCTTAACAtgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaatggataaagtcctttttttagaatatttattgttcgtttaatgcaaggttgtaccattttatataagtatagaacctaaacgaacggtgatcgcatttatgacaataattttaaggccgaatttatcatctgttgacttactttaattaaaaaggaagaaaaacactttttggtaataattactgtaaagctgattgaaaaatattgcacagtacattttaaacagccctcggacacagcctcatcataaaatatgcccgattcgttacgacccggtatcatctgaaaaggcactggcaataacacacgctgtagacattgtaagatcgaatttaaaatggaaacttcaaagaatactagataaataatttctctttaaatgaactataaacaaaccataactaacaatttaaagattgaattcacaagtaataaaagaaaatgattccttaacaccggcgacactgtatc
gi|3                          : ggacatcttgttaattgtgagcacatataattatgtctactctagtatgcacaatactgtaatactgtatgcaattgaataagatatatgagatgtttaattaagggagagaaaacttttcattcacaaatgatagaaccgcagcccaaggaggaactcatgctatgttaacagtctatgtgaagaatagtgtaatcaaaatgttaccatgcattcaaagtgagacagcctgtgcctgttaatcgtagaccgcgaatacatcaatattcaagacagagatacatgtatatgtttgatctggattcctgattaaaaacattcaaattaaagttcagcaagtaacaaatgtaaaacgggaactaaagttacaatgtgttactggtttactagttggccttatttctagagcgatttgacactagtagtaaaagagtgtgtaagccatgtagaaatcctgtgtccagctttgtttcttaaggttgtgatttcttgtaaatatatcatttatagtattacatttttcgctatgtgtcgtgccaaaaataaatatgacctagagtagttgccaaaaatgtacatataactttttcattgcatgtgtatgatgttaattgtaatttacacatattatagtgactgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaaGGACTATGTGATCAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTACCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAAACAATGA-------------------CAAAAATGTTAATAAATATGATGCTTCTATACCATTTGCTATATTATCATA-CCAACTATTTGAGACATTACATTGAGATATAAATTTATATGGAAGAAGGAGCTT-AAT-------ATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGGCAAATGAATTTTTCGTCACGATAATTTGTCTATCGTCCATGGTCTGTCACCTGC-CATTAATTT-GTTTTCTAAAGACAT-GCTTTCACGTTTTATTTAAT--TTTACCGGTAT--ATGAAACTA-ATGTATATTCATGAAAACAAAGATTAGTCTTTGTTTGGCTTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-GATTGA-CATCTTGT---TAACTATGAGCAAATTTATGAATTATGTCTTCT-TAGCATGTACAGTACAGTAA---------TACTATGTAAC-----------AG------------------TTGAT-AAAGGAA-------CCTCA-----ATTC----ATGCT---ACG------TAA------A---CAGTCT----------AA--GTGAAGA-------------A-CAGTGTTGTCAAATGC-TACC-ATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTCGATTGTA---CACGAATA--CACCAATGTTTA----AGACAAAGAT-CA-G-----GTTTAA-TCTGGATACC-TGATTAAAATCATTCAGAAGTTAAGTTC---AG-------CAGATGCAAAACGATAATT-A--A---AGTTACAATTGTG----TAGTTTCTTAGGAGGCTATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGAccggcgacactgtatc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcatctttgcagtgcctATT-ATTTAGTTTTCTACAGACAGAGCTTTAATGTTTTATTCAGCGGT------ATGTTCATGAGA--ACAAGGGT--TCATAAAATCAAGGATGTGTCTTTGTTTGACGTCAATAGAGAACCATTCAGTCTCT-G-GTGGGCATCTTGTTAA---CTATGAACACG--TA---ATTATGTCTACTCTTGTATGTATAGTACAGT--TAT------T-CTATGTAACAGTTTCA--TCAG--TCAA---ATGAGATGTTTAAT-AAGGGAT-------TTTTTTATTCATTCATGGATGATGGAACC------TCT------GCT-CCTGCTCGTAAACAGTATTTGTAAACA-------------AATAGTATAGTTAACATT-TA-CTATGCATTCAGAGTAAGCCCACCTGTGTCTGTTGATTGTTGACCGCG--TAACCACAAATATTCA----AGGCAAAGATACATG-----TTTA-A-TCTGGAAACC-CAATTGATAATTTTCAAAAGCAAATTTT---AGTTAGTTACACACG-GAAATGGG---TAATGA---AGTTATAA-CTTGCTACTGGTTTACCAGTAGGTCATGTTCCTAGAGGGATG---GCAGAATATTTAAGAGAAATAACTGATAATGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCATGTGGATATCCTGTTCCCACTTTTGTATCTTAT---------T--GTGCG--C-CACAAGAAAGTGATGTCTGGTAAC--TAT-------------ATTTTTTTATAG--TTA-------------TATATAATTTATAT--AACTACAAACTGGAC-TAT---CT---G---T--GTTGCCAGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTCTTTTTT-AGTATATTTATTCTTAATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATGTT---------------------------AACATTCAATCA----GCAATGATCG------------------------ATA-TT---------TTC-AAGGCTGAATTGC-ATTATCTTT----T-----GTC--CATCTTTTTTTATTAAAACAAA-GAAGGAAAACACCAATTTGT-TATTTATTAGGTGATAATGACTGTA----AAGCTAATAGTTAAATGTTGCA----CAGTGCTTTTTAAACAGCCCTCAGACACT----GCCTCATATCATAAAATATGCATGATTCGTTATTACGGGAAGTGATCCGATATCACCTGTAAAGGA-----TG---TGTCAATAAACACACGTTGTATACATCGTCAGATCGAAGTTAAAATGGAAACTTCACATAATGCTACATAGATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAAACATAACGAACAATTTGA--AGATTGATTGTATTAGT--------AATAAACGAAAAGTGATTCGTTAACAaaaaactatgatgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGAAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAG---------C--ATG-G--G-C--------GTGATGTCTTGTAATGGTATCATTTTTAGTTGAA-TTATTTATA---TTATTAT-----ACATTGTGGTATTTATATCGTGCAA-AAAAAAAAAATATGATGCAGAGATTTGTGTTTCCGAAAATGCATATTTAATTCAATAA-TTTTCCATTGCACATGTATGATGTTAATCATAATGTACATATATAGCAGTGACAGGG------TA--GATAAAGTTATTTTTT-AGTATATTTAATGTTAATTTAATGCAAGGTTGTACT-------ATTTT--ATATGAGTACAGAACCTGCAAACTAAGCATTTAATGG----GTAATGATCA------------------------ATA-TT---------TTT-ATCGTCGAATT-TTAGTATCTTT----T-----GAC--TCACTTCTTTGATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACAAATTTGT-TAACTATTActggtgaaactgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttaactCTCTTTT-AGTTTAATAACTGTTCAATTAATTCAACGTTGTATCGGTTCGTATATT-TGTAA-AATATATTACCT-------AAACATTTGACGA----TCAA--ACCGTCATGTTTTTT----ATGACAATGATA-ACAGTTTATTTTTTGAAAGCCGTATT-A-ATCATATTTGCCGT-----AGCAATAACGCCATTAATTAATGAAAAAGC--GCATACATTGGTTTATGCAACTATTAGGTGATAATTTCTGTA----A-GCTGGTTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCATCGGACATT----GCCTCAT--CTTATAATATGCGCG-CTCTTTATTACTGGAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaatgctctataactctaacaaacagtatttattattttttatttggacacacatttgcaaagcattgtaactgtgttcacaatgcttgattgacgctttcatattttgatttgtgaaagaacgaataaTTAACAGTCAAGCAGCGATCG-CAT------TTATAGCAAT---CATATAT---------TTTGAAGGACGACTG-T-G----CTGC----CAAAGAGAC---AACTTCTTTAATTTTAAAAT--GATGAAAAACACCG-TCTTT-CAGCTATAAGGTGATA-TTAATTTATGATAAACTGGTTGTTAAATATAACATTTTTTTTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACATG----GTCTCAT--CTTATAATATGCGCGATTTGTTATTACCGGAAGTAACCCTCTATCCCATG-AAAAGAAAGATAG---TATCAATAATCAAATGATGTAGACAATATTAGATCGAGTTTATAACGCAAA-TTTACAGAATGCGAGATAAATCATTT-TATCTATAATACAACTGA-----AAACAAACCATTACTATCAATTCGAAGAGATTGATTTTGTGTGT--------ATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gGATGTAATCAATGGTGACATACTGTTTGTTTGTCACAAATGCTCATAAATATGATGCTTTCATACTATTTGCTATATTATCATAACCAATTATTCAAGACATTACATTGACATATCAATTTACCCGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------ATTA-TG--TTAAAGCACTATCGACCATTGACAAATGAAGTTTTTATTGTGAT-ATT-------------TGGCCTGTCACCTGCGGATA-ATTC-GTTTCCTAAAGACAGCGCTTTCATGTTTCATTTAAC--T------ATAC--ATGAAA-TTCATGGATATTCATGAGAACAAAGATAGGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCTAA-TGGA-CATCGTGT---TAACTATGAGCACA--TATGAATTATGtcgattgatactccggcgacattgta

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    111111111111111111111111111111                                         11111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111                    444444444                                                                                           11                                                    2     333333333333                                                                                222   1    1                                    333333333    11      11                                                  11              111             111111           11                                    33333333333333        000000000000000000000000           2       2222222     22222                   6666666666666666666                          22               222222                                                                  1111               222222   1                                         111                            22222                                                    111                                                                                      000000000000000000000000000000                   44444444444           11111111111111111111111111111111111111111111111111111             22     3333333333333   1111           555555555   1                                                          333333                                                        2222222     1111111           55555555             11111         7777777777777777777777777777777777777    1           111         2222222222   111                   111            111                               1111                      1111                             1111                                                             1111      11                                                                                                 22222                         11                 22222222                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                      7777   1 1              000000000                         5                     0 1                                         11                         1  0    0                  0 0   666666666666  0            0      0  1                      3   3 3  0  11 0                444   0    0               9                    333333333    33      33 2   1  3     0       1   22      2   2           33              444    8        888888           11  55          1  6                  00000000000000        111111111111111111111111  0        0       6666666     00000    0 4            6666666666666666666      0       0    22     77  8   0        000000                         1                 5     8   0            4444             7 444444   3 6          6                        1   111  7    3       5            99999         777  1                                1    111      3    5   66    3      5                                                         222222222222222222222222222222              1    77777777777           44444444444444444444444444444444444444444444444444444         66  77   2 3333333333333   5555      3    555555555   2     6      0 0             44                            000000                   6          1                         1111111     5555555       1   99999999     0       66666   1     9999999999999999999999999999999999999    3           111 3       4444444444   000     1             333  3         333   666  1                      4444        3             4444                             4444       99                           3           1          8 7777  3   11         6  0                1                     5                          5      8    8      00000       1   1             11             1   99999999 1    4     2             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      ....   . .              .........                         .                     . .                                         ..                         .  .    .                  . .   ............  .            .      .  .                      .   . .  .  .. .                ...   .    .               .                    .........    ..      .. .   .  .     .       .   ..      .   .           ..              ...    .        ......           ..  ..          .  .                  ..............        ........................  .        .       .......     .....    . .            ...................      .       .    ..     ..  .   .        ......                         .                 .     .   .            ....             . ......   . .          .                        .   ...  .    .       .            .....         ...  .                                .    ...      .    .   ..    .      .                                                         ..............................              .    ...........           .....................................................         ..  ..   . .............   ....      .    .........   .     .      . .             ..                            ......                   .          .                         .......     .......       .   ........     .       .....   .     .....................................    .           ... .       ..........   ...     .             ...  .         ...   ...  .                      ....        .             ....                             ....       ..                           .           .          . ....  .   ..         .  .                .                     .                          .      .    .      .....       .   .             ..             .   ........ .    .     .             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             0                      0000   4 0              000000000                         0                     8 0                                         44                         0  8    8                  4 8   222222222222  8            8      8  0                      2   2 5  8  00 2                333   0    0               2                    555555555    88      22 5   0  2     2       2   22      5   5           88              000    0        888888           00  88          0  5                  55555555555555        555555555555555555555555  8        0       0000000     00000    8 6            6666666666666666666      8       8    00     00  0   8        888888                         4                 6     0   8            2222             3 333333   3 7          7                        0   777  5    7       2            88888         000  7                                5    777      8    6   44    2      0                                                         222222222222222222222222222222              2    55555555555           55555555555555555555555555555555555555555555555555555         00  55   5 0000000000000   3333      7    777777777   0     7      7 7             33                            555555                   7          0                         7777777     7777777       0   22222222     8       77777   7     0000000000000000000000000000000000000    3           222 2       3333333333   888     0             888  5         000   888  8                      2222        7             2222                             2222       22                           3           4          0 0000  8   44         0  6                0                     0                          0      0    0      00000       0   4             00             0   00000000 4    2     5             
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC------TNAATA--GN-ANAC--GAGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTACGTAAACAGTCTATGTGAAG-AA-TAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA---AAGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAAC-----------GTG---GGC--------GTGATGTCTTGTAATTATA-----------TCATTTATAGT----------------TTAT-AT-----GCTA-----TGGG--ATTTGTGT--TGCCAAAAANAAAA-TATGAC-TAGAG---TA-GTT-CCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGNTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
Reference ( family-5685 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC--G---TNAATA--GN-ACAC--GAGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTATGTAAACAGTCTATGTGAA--AA-TAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA---AAGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTANC-----------GTGA--GGC--------GTGATGTCTTGTAATTATA-----------TCATTTATAGT----------------TTAT-AT-----GCTA-----TGNG--ATTTGTGT--TGCCAAAAATGAA--TATGACCTAGAG---TA-GTTGCCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGCTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACCAAGAGATTAATGCCGGGGATGGATTCATATTTTTAGATTCTGTTTCACTTGATTATGGTGCACTTGATACTGATGCAATAAACGATAACATACTATTTGTTTGTCAAAAA-GCTTATAAATATGGTGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCACAATTAACTATTCAAGACAATATATTGAAGT--CAATTTGTCTGGAAGAAGAAGCTTTAATTACTAATACTAATATATTTTAGCACTATCGACTATTGACAAATGAAGTTTTTGTTGTGATAATTTGACTGTCACCTATGGCCTGTCACCTGC-TTATT-ATTT-GTTTTCTTAAGACAGAGCTTTCGTGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ACGAAG-TACATGTATATTCATTAGAACAATGATTAGTCTTT-TTT-ATGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATTAGCACA--TATGAATTATGTCTTCTTTAGTATGTACAGTACAGTAATATAAAATGTACTATGTAACCAT---TAAATAAGAC-ACAC--AAGGTGTTTATTGAAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACAAATGATGGAACT------TAA------ATT-CATGCTATGGAAAC--------------AA-TAATGTAGCCAA---------ATGCATTCAAAGTGAGACAACCAGTGCCTGTTGATTGCAGACCGCA-ATTACACCAAGATTCA----AGACAAAGATACA-G-----GTTT-A-TCCGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---ATGTAGTAACAGATGAAAAACGGGAACTAAATTAAGTTACAA-TGTGTTACTGATTTATTAGTAAGCCATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGCATATTTAAGAGAAATGCTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTTGAAATCCTGTATCCAACTTTGTATCTTAACCTGTGCCACAAGTAAGTGGT--------GCGATGTCTTGTTATTATA-----------TCATTTATAGT----------------TTATGAT-----GC---------AG--AGTTGAGT--TGCCAAAAATGCA--TAT----T-------TA-ATT------------CAT---------TAATTTTTC--TTGCATGCCTATGATGTTAATAATAATGTACATATATTACAGTGGCAAAGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTACTGTTCAATTATTGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCAGCAACTTAAACATTTAATGG----GCAATGATTG-CAT-----TCA---CGAG---GATA------------CTT-AAGGCCAAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAACACACCAATTTGT-TAATTATTATGTGATGATAACTGTA----AAGATGATAGTTAAATATTGCA----CAGTACTAATTAAACAGCCCTCGGACACT----GCTGCAT--CATAAAATATGCGCAATTCGTTACTACAGGAAGTGACCCAGTATCACCTG-A----AA--ATGCTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCAAATTTAAAATGGAAAATTCACAGAATGATCGATAAATAATTTGTCTTTA-ATTG-AACTCT-----AAATAAATCATTACTAACAACTTGA--AGATTGACTTTATTAGT--------ATTAAATGAATAGTGATTCGTTAACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-------TCTTT-----ATTCACAAATCATGGAACC------T---------CTTCATGCTATGTAAACAGTCTATGTGAA--AAATAG-GTAGTCAAATGAT-ACCATACATTCAAAGTGAGACCACCAGTTCCTGTTGATTGTAG----CG-AATACACCAATACTCA----AGACAAAGAAACATG-----TTTT-A-TCTGGATATC-TGATTAAAAACAGTCAAAAGTAAATTTC---AGCTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACT-A---AAGTTACAA-T-TGTGACTGGTTTACTAGTAGGTTATGTTCCAAAAGTGATGGCAGCAGAAGGTTTAAGA-GAACACTTGACACTGGAAGTAAACTATTTTGTAAACAAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTGTGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cTTAGGTGATAATTACTGTA----AATCTGA--GTTAAATATTGCA----CAGTGCTTTTTAAACATCCCTCGGACACTCGCAGCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCATTACTACTGGAAGTGACACAGTATCACCAG-A----AAAGGCTGTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGATTTTAAAATGGAAACTTTACAGAATGCTAGATAGATATTTTGTCTTTA-AATG-AACTGTAAACAAAACAAAACATAACTAGCAATTTGA--AGATTGATTTCATTAGTAATAAATCATTAAATGAAAAGTGATTCGTCAACA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGATTATGTGATAAATGCCAGGGATGGAAACATAA----AGAATTTGTTCCACCTGGCT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAAAATACTATTTGTTTGTCACAAATGAGCATAAATATTGTGCTTCCATACCATTTGCTATACTACCAT-ACCAACAGTTCAGGACATTACATTGACATATCAA-TTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------AT---TGTATTTTAGCACTATTGACCATTGTCAAATGAAGTTTTCGTCATTATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attcatcttggcagtgcctGGACTATGTGACGAATGACAGGGATGTATTCATAG----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGATCATAAATATGATG----CATACCATTTGCTATATTATCAT-ACCAACTATTCAAGACATTACATTGAGATATTAATTTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------GT---TGTATTTTATCACTA-CGACCA-TGTCAAATGAAGTTTTCGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attcatcatggcagtgccaATATTCATCTAAGACAAATATACATGT----ATAT-AATCTGTAAACCCTGTTAAAAAACATTCAAAAGTAAAATCCGTAATGTAGTTACAGATGCAAAACGAAAACTGA---A-GTAACAA-AGTGTTGCTGGTTTACCAGTAAACCATGATCATAGAGGGGTG---ACAGAAGATTT-AGAGGAATATTCGACA---GTAGca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccaaatgcattcagctaagcagtatttggatacagtgcgatgaatgtaagGTGGATAAAATTGGCTTTT-AGTGTAATTGGTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------A-TTT-TATAT-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcatcatggtttgagaaaagGACTATGTGATGAATGCCAAGGATGGATTCATAA----AAATTATGTagttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcatcttggcagtgcctaGA-CATCTTGTTAAT---TGTGAGCACA--TAT-AATTATGTCTACTCTAGTATGCACAATACTGTAATAC------TG-TATGCAAT------TGAATA--AG-ATATATGAGATGTTTAATTAAGGGAGAGAAAACTTTTC-----ATTCACAAATGATAGAACCGCAGCCCAAGGAGGAACT-CATGCTATGTTAACAGTCTATGTGAAG-AA-TAGTGTAATCAAAATGTTACCATGCATTCAAAGTGAGACAGCCTGTGCCTGTTAATCGTAGACCGCG-AATACATCAATATTCA----AGACAGAGATACATGTATATGTTTGA-TCTGGATTCC-TGATTAAAAACATTC-AAATTAAAGTTC---AGCAAGTAACAAATGTAAAACGGGAACT-A---AAGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTTGGCCTTATTTCTAGAGCGAT--------------------------TTGACACTAGTAGTAAAAGAGTGTGTAAGCCATGTAGAAATCCTGTGTCCAGCTTTGTTTCTTAAG-----------GT------T--------GTGATTTCTTGTAAATATA-----------TCATTTATAGTA---------------TTAC-ATTTTTCGCTA-----TGTG----TCG-----TGCCAAAAATAAA--TATGACCTAGAG---TA-GTTGCCAAAAATGTACAT--------ATAACTTTTTCATTGCATGTGTATGATGTTAATTGTAATTTACACATATTATAGTGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTGGATAAAGTCCTTTTTTTAGAATATTTATTGTTCGTTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTTATATA--AGTATAGAACCT-------AAACG---AACGG--------TGATCG-CAT-----TTA---TGAC---AATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTGT----T-----GAC--TTACTT---TAATTAAAAAG---GAAGAAAAACAC---TTT---------TT-GGTAATAATTACTGTA----AAGCTGATTGAAAAATATTGCA----CAGTACATTTTAAACAGCCCTCGGACACA----GCCTCAT--CATAAAATATGCCCGATTCGTTAC----------GACCCGGTATCATCTG-A----AAAGGCACTGGCAATAA-CACACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCAAAGAATACTAGATAAATAATTTCTCTTTA-AATG-AACTAT-----AAACAAACCATAACTAACAATTTAA--AGATTGAATTCACAAGT--------AATAAAAGAAAA-TGATTCCTTAACAtgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaatggataaagtcctttttttagaatatttattgttcgtttaatgcaaggttgtaccattttatataagtatagaacctaaacgaacggtgatcgcatttatgacaataattttaaggccgaatttatcatctgttgacttactttaattaaaaaggaagaaaaacactttttggtaataattactgtaaagctgattgaaaaatattgcacagtacattttaaacagccctcggacacagcctcatcataaaatatgcccgattcgttacgacccggtatcatctgaaaaggcactggcaataacacacgctgtagacattgtaagatcgaatttaaaatggaaacttcaaagaatactagataaataatttctctttaaatgaactataaacaaaccataactaacaatttaaagattgaattcacaagtaataaaagaaaatgattccttaacaccggcgacactgtatc
gi|3                          : ggacatcttgttaattgtgagcacatataattatgtctactctagtatgcacaatactgtaatactgtatgcaattgaataagatatatgagatgtttaattaagggagagaaaacttttcattcacaaatgatagaaccgcagcccaaggaggaactcatgctatgttaacagtctatgtgaagaatagtgtaatcaaaatgttaccatgcattcaaagtgagacagcctgtgcctgttaatcgtagaccgcgaatacatcaatattcaagacagagatacatgtatatgtttgatctggattcctgattaaaaacattcaaattaaagttcagcaagtaacaaatgtaaaacgggaactaaagttacaatgtgttactggtttactagttggccttatttctagagcgatttgacactagtagtaaaagagtgtgtaagccatgtagaaatcctgtgtccagctttgtttcttaaggttgtgatttcttgtaaatatatcatttatagtattacatttttcgctatgtgtcgtgccaaaaataaatatgacctagagtagttgccaaaaatgtacatataactttttcattgcatgtgtatgatgttaattgtaatttacacatattatagtgactgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaaGGACTATGTGATCAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTACCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAAACAATGACAA-------------------AAATGTTAATAAATATGATGCTTCTATACCATTTGCTATATTATCATA-CCAACTATTTGAGACATTACATTGAGATATAAATTTATATGGAAGAAGGAGCTT-AAT-------ATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGGCAAATGAATTTTTCGTCACGATAATTTGTCTATCGTCCATGGTCTGTCACCTGC-C-ATTAATTT-GTTTTCTAAAGACAT-GCTTTCACGTTTTATTTAAT--TTTACCGGTAT--ATGAAACTA-ATGTATATTCATGAAAACAAAGATTAGTCTTTGTTTGGCTTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-GATTGA-CATCTTGT---TAACTATGAGCAAATTTATGAATTATGTCTTCT-TAGCATGTACAGTACAGTAA---------TACTATGTAAC-----------A--G---------------TTGAT-AAAGGAA-------CCTCA-----ATTC-----------------------------------ATGCTACGTAAACAGTCTAAGTGAAG-AA-CAGTGTTGTCAAATGCT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTCGATTGTA---CACG-AATACACCAATGTTTA----AGACAAAGAT-CA-G-----GTTTAA-TCTGGATACC-TGATTAAAATCATTCAGAAGTTAAGTTC---AG-------CAGATGCAAAACGATAATT-A---AAGTTACAATTGTG----TAGTTTCTTAGGAGGCTATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGAccggcgacactgtatc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcatctttgcagtgcct-ATT-ATTTAGTTTTCTACAGACAGAGCTTTAATGTTTTATTCAGCGGT------ATGTTCATGAGA--ACAAGGGT--TCATAAAATCAAGGATGTGTCTTTGTTTGACGTCAATAGAGAACCATTCAGTCTCT-G-GTGGGCATCTTGTTAA---CTATGAACACG--TA---ATTATGTCTACTCTTGTATGTATAGTACAGT--TAT------T-CTATGTAAC--AGTTTCATCA--GTCAAAT--GAGATGTTTAAT-AAGGGAT-------TTTTTTATTCATTCATGGATGATGGAACC------TCT------GCT-CCTGCT-CGTAAACAGTATTTGTAAACAAA-TAGTATAGTTAACATTT-ACTATGCATTCAGAGTAAGCCCACCTGTGTCTGTTGATTGTTGACCGCGTAAC-CACAAATATTCA----AGGCAAAGATACATG-----TTTA-A-TCTGGAAACC-CAATTGATAATTTTCAAAAGCAAATTTT---AGTTAGTTACACACG-GAAATGGG---TAATG-AAGTTATAA-CTTGCTACTGGTTTACCAGTAGGTCATGTTCCTAGAGGGATG---GCAGAATATTTAAGAGAAATAACTGATAATGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCATGTGGATATCCTGTTCCCACTTTTGTATCTTATT-----------GTGC--GCCACAAGAAAGTGATGTCTGGTAACTATATTTTTTTATAGTTATATATAAT----------------TTAT-ATA----ACTACAAACTGGACTATCTGTGT--TGCCAGAAAAAAAACTATGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTCTTTTTT-AGTATATTTATTCTTAATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATGTT---------------------------AACATTCAATCA----GCAATGATCG-----------------------ATA-T---------TTTC-AAGGCTGAATTGC-ATTATCTTT----T-----GTC--CATCTTTTTTTATTAAAACAAA-GAAGGAAAACACCAATTTGT-TATTTATTAGGTGATAATGACTGTA----AAGCTAATAGTTAAATGTTGCA----CAGTGCTTTTTAAACAGCCCTCAGACACT----GCCTCATATCATAAAATATGCATGATTCGTTATTACGGGAAGTGATCCGATATCACCTGTA----AAGGATG-TGTCAATAAACACACGTTGTATACATCGTCAGATCGAAGTTAAAATGGAAACTTCACATAATGCTACATAGATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAAACATAACGAACAATTTGA--AGATTGATTGTATTAGT--------AATAAACGAAAAGTGATTCGTTAACAtgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGAAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAGC-----------ATG---GGC--------GTGATGTCTTGTAATGGTA-----------TCATTTTTAGTTGAATTATTTATATTATTAT-AC-----ATTG-----TGGT--ATTTATATCGTGCAAAAAAAAAAAATATGATGCAGAGATTTGTGTTTCCGAAAATGCATATTTAATTCAATAA-TTTTCCATTGCACATGTATGATGTTAATCATAATGTACATATATAGCAGTGACAGGGT--------AGATAAAGTTATTTTTT-AGTATATTTAATGTTAATTTAATGCAAGGTTGTACT-------ATTTT--ATATGAGTACAGAACCTGCAAACTAAGCATTTAATGG----GTAATGATCA-----------------------ATA-T---------TTTT-ATCGTCGAATT-TTAGTATCTTT----T-----GAC--TCACTTCTTTGATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACAAATTTGT-TAACTATTActggtgaaactgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaactCTCTTTT-AGTTTAATAACTGTTCAATTAATTCAACGTTGTATCGGTTCGTATATT-TGTAA-AATATATTACCT-------AAACATTTGACGA----TCAA--ACCGTCATGTTTTTTA---TGACAATGATA-ACAGTTTATTTTTTGAAAGCCGTATT-A-ATCATATTTGCCGT-----AGCAATAACGCCATTAATTAATGAAAAAGC--GCATACATTGGTTTATGCAACTATTAGGTGATAATTTCTGTA----A-GCTGGTTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCATCGGACATT----GCCTCAT--CTTATAATATGCGCG-CTCTTTATTACTGGAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaatgctctataactctaacaaacagtatttattattttttatttggacacacatttgcaaagcattgtaactgtgttcacaatgcttgattgacgctttcatattttgatttgtgaaagaacgaataaTTAACAGTCAAGCAGCGATCG-CAT-----TTATAGCAAT---CATATA---------TTTTGAAGGACGACTG-T-G----CTGC----CAAAGAGAC---AACTTCTTTAATTTTAAAAT--GATGAAAAACACCG-TCTTT-CAGCTATAAGGTGATA-TTAATTTATGATAAACTGGTTGTTAAATATAACATTTTTTTTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACATG----GTCTCAT--CTTATAATATGCGCGATTTGTTATTACCGGAAGTAACCCTCTATCCCATG-AAAAGAAAGATAGTATCAATAATCAAATGATGTAGACAATATTAGATCGAGTTTATAACGCAAA-TTTACAGAATGCGAGATAAATCATTT-TATCTATAATACAACTGA-----AAACAAACCATTACTATCAATTCGAAGAGATTGATTTTGTGTGT--------ATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gGATGTAATCAATGGTGACATACTGTTTGTTTGTCACAAATGCTCATAAATATGATGCTTTCATACTATTTGCTATATTATCATAACCAATTATTCAAGACATTACATTGACATATCAATTTACCCGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------ATTA-TG--TTAAAGCACTATCGACCATTGACAAATGAAGTTTTTATTGTGAT-ATT-------------TGGCCTGTCACCTGCGG-ATA-ATTC-GTTTCCTAAAGACAGCGCTTTCATGTTTCATTTAAC--T------ATAC--ATGAAA-TTCATGGATATTCATGAGAACAAAGATAGGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCTAA-TGGA-CATCGTGT---TAACTATGAGCACA--TATGAATTATGtcgattgatactccggcgacattgta

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111                    444444444                                                                                           11                                                    2     333333333333                                                                                222   1    1                                    333333333    11      11                                                  11              111             111111           11                                    33333333333333        8888888888888888888888           2       2222222    222222                   555555555555555                                               22222                                                                  1111               222222   1                                         111                            22222222                                                   111                                                                                      9999999999999999999999999999999                         222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     11             22     888888888888888888888888888888888888888888   1                                                          333333                                                        2222222     1111111           55555555             11111         7777777777777777777777777777777777777    1           111         2222222222   111                   111            111                               1111                      1111                             1111                                                             1111      11                                                                                                 22222                         11                 22222222                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                      7777   1 1              000000000                         5                     0 1                                         11                         1  0    0                  0 0   666666666666  0            0      0  1                      3   3 3  0  11 0                444   0    0               9                    333333333    33      33 2   1  3     0       1   22      2   2           33              444    8        888888           11  55          1  6                  00000000000000        8888888888888888888888  0        0       6666666    333333      4            666666666666666   8      0            22     99     0         00000                         1                 5     8   0            4444             7 444444   3 6          6                        1   111  7    3       5            00000000        777  1                                1    111      3    5   66    3      5                                                         0000000000000000000000000000000              1          888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0 33         88  33   2 333333333333333333333333333333333333333333   2     6      0 0             44                            000000                   6          1                         1111111     5555555       1   99999999     0       66666   1     9999999999999999999999999999999999999    3           111 3       4444444444   000     1             333  3         333   666  1                      4444        3             4444                             4444       99                           3           1          8 7777  3   00         6  0                1                     5                          5      8    8      00000       1   1             11             1   99999999 1    4     2             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      ....   . .              .........                         .                     . .                                         ..                         .  .    .                  . .   ............  .            .      .  .                      .   . .  .  .. .                ...   .    .               .                    .........    ..      .. .   .  .     .       .   ..      .   .           ..              ...    .        ......           ..  ..          .  .                  ..............        ......................  .        .       .......    ......      .            ...............   .      .            ..     ..     .         .....                         .                 .     .   .            ....             . ......   . .          .                        .   ...  .    .       .            ........        ...  .                                .    ...      .    .   ..    .      .                                                         ...............................              .          ...............................................................   . ..         ..  ..   . ..........................................   .     .      . .             ..                            ......                   .          .                         .......     .......       .   ........     .       .....   .     .....................................    .           ... .       ..........   ...     .             ...  .         ...   ...  .                      ....        .             ....                             ....       ..                           .           .          . ....  .   ..         .  .                .                     .                          .      .    .      .....       .   .             ..             .   ........ .    .     .             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             0                      0000   4 0              000000000                         0                     8 0                                         44                         0  8    8                  4 8   222222222222  8            8      8  0                      2   2 5  8  00 2                333   0    0               2                    555555555    88      22 5   0  2     2       2   22      5   5           88              000    0        888888           00  88          0  5                  55555555555555        0000000000000000000000  8        0       0000000    888888      6            222222222222222   0      8            00     44     8         22222                         4                 6     0   8            2222             3 333333   3 7          7                        0   777  5    7       2            88888888        000  7                                5    777      8    6   44    2      0                                                         5555555555555555555555555555555              2          555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   2 88         00  22   5 000000000000000000000000000000000000000000   0     7      7 7             33                            555555                   7          0                         7777777     7777777       0   22222222     8       77777   7     0000000000000000000000000000000000000    3           222 2       3333333333   888     0             888  5         000   888  8                      2222        7             2222                             2222       22                           3           4          0 0000  8   22         0  6                0                     0                          0      0    0      00000       0   4             00             0   00000000 4    2     5             
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC-GT-TNAATAGG-ANAC--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTACGTAAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAAC--GTG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTAT-AT-----G-CTA-----TGGN--ATTTGTGT--TGCCAAAAANAAAA-TATGA-C-TAGAG-----TANTT-CCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGNTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
Reference ( family-5685 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC----TNAATAGN-ANAC--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTACGTAAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAAC--GTG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTAT-AT-----G-CTA-----TGGG--ATTTGTGT--TGCCAAAAANAAAA-TATGA-C-TAGAG-----TAGTT-CCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGNTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACCAAGAGATTAATGCCGGGGATGGATTCATATTTTTAGATTCTGTTTCACTTGATTATGGTGCACTTGATACTGATGCAATAAACGATAACATACTATTTGTTTGTCAAAAA-GCTTATAAATATGGTGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCACAATTAACTATTCAAGACAATATATTGAAGT--CAATTTGTCTGGAAGAAGAAGCTTTAATTACTAATACTAATATATTTTAGCACTATCGACTATTGACAAATGAAGTTTTTGTTGTGATAATTTGACTGTCACCTATGGCCTGTCACCTGC-TTATT-ATTT-GTTTTCTTAAGACAGAGCTTTCGTGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ACGAAG-TACATGTATATTCATTAGAACAATGATTAGTCTTT-TTT-ATGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATTAGCACA--TATGAATTATGTCTTCTTTAGTATGTACAGTACAGTAATATAAAATGTACTATGTAACCAT-TAAATAAG-ACAC--ACAAGGTGTTTATTGAAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACAAATGATGGAACT------TAA------ATT-CATGCTATGGAAACA--------------ATAATGTAGCCAAA---------TGCATTCAAAGTGAGACAACCAGTGCCTGTTGATTGCAGACCGCA-ATTACACCAAGATTCA----AGACAAAGATACA-G-----GTTT-A-TCCGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---ATGTAGTAACAGATGAAAAACGGGAACTAA--ATTAAGTTACAA-TGTGTTACTGATTTATTAGTAAGCCATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGCATATTTAAGAGAAATGCTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTTGAAATCCTGTATCCAACTTTGTATCTTAACCTGTGCCACAAGTAAGTGGT---------GCGATGTCTTGTTATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTATGAT-----G-C---------AG--AGTTGAGT--TGCCAAAAATGCA--TAT-----T---------TAATT-C-----------AT---------TAATTTTTC--TTGCATGCCTATGATGTTAATAATAATGTACATATATTACAGTGGCAAAGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTACTGTTCAATTATTGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCAGCAACTTAAACATTTAATGG----GCAATGATTG-CAT-----TCA---CGAG---GATA------------CTT-AAGGCCAAATT-T-ATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAACACACCAATTTGT-TAATTATTATGTGATGATAACTGTA----AAGATGATAGTTAAATATTGCA----CAGTACTAATTAAACAGCCCTCGGACACT----GCTGCAT--CATAAAATATGCGCAATTCGTTACTACAGGAAGTGACCCAGTATCACCTG-A----AA--ATGCTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCAAATTTAAAATGGAAAATTCACAGAATGATCGATAAATAATTTGTCTTTA-ATTG-AACTCT-----AAATAAATCATTACTAACAACTTGA--AGATTGACTTTATTAGT--------ATTAAATGAATAGTGATTCGTTAACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-------TCTTT-----ATTCACAAATCATGGAACC------T---------CTTCATGCTATGTAAACAGTCTATGTGAA-AAATAG-GTAGTCAAATGAT-ACCATACATTCAAAGTGAGACCACCAGTTCCTGTTGATTGTAG----CG-AATACACCAATACTCA----AGACAAAGAAACATG-----TTTT-A-TCTGGATATC-TGATTAAAAACAGTCAAAAGTAAATTTC---AGCTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-T-TGTGACTGGTTTACTAGTAGGTTATGTTCCAAAAGTGATGGCAGCAGAAGGTTTAAGA-GAACACTTGACACTGGAAGTAAACTATTTTGTAAACAAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTGTGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cTTAGGTGATAATTACTGTA----AATCTGA--GTTAAATATTGCA----CAGTGCTTTTTAAACATCCCTCGGACACTCGCAGCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCATTACTACTGGAAGTGACACAGTATCACCAG-A----AAAGGCTGTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGATTTTAAAATGGAAACTTTACAGAATGCTAGATAGATATTTTGTCTTTA-AATG-AACTGTAAACAAAACAAAACATAACTAGCAATTTGA--AGATTGATTTCATTAGTAATAAATCATTAAATGAAAAGTGATTCGTCAACA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGATTATGTGATAAATGCCAGGGATGGAAACATAA----AGAATTTGTTCCACCTGGCT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAAAATACTATTTGTTTGTCACAAATGAGCATAAATATTGTGCTTCCATACCATTTGCTATACTACCAT-ACCAACAGTTCAGGACATTACATTGACATATCAA-TTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------AT---TGTATTTTAGCACTATTGACCATTGTCAAATGAAGTTTTCGTCATTATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attcatcttggcagtgcctGGACTATGTGACGAATGACAGGGATGTATTCATAG----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGATCATAAATATGATG----CATACCATTTGCTATATTATCAT-ACCAACTATTCAAGACATTACATTGAGATATTAATTTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------GT---TGTATTTTATCACTA-CGACCA-TGTCAAATGAAGTTTTCGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attcatcatggcagtgccaATATTCATCTAAGACAAATATACATGT----ATAT-AATCTGTAAACCCTGTTAAAAAACATTCAAAAGTAAAATCCGTAATGTAGTTACAGATGCAAAACGAAAACTGA--A----GTAACAA-AGTGTTGCTGGTTTACCAGTAAACCATGATCATAGAGGGGTG---ACAGAAGATTT-AGAGGAATATTCGACA---GTAGca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccaaatgcattcagctaagcagtatttggatacagtgcgatgaatgtaagGTGGATAAAATTGGCTTTT-AGTGTAATTGGTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------A-TTT-TATAT-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcatcatggtttgagaaaagGACTATGTGATGAATGCCAAGGATGGATTCATAA----AAATTATGTagttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcatcttggcagtgcctaGA-CATCTTGTTAAT---TGTGAGCACA--TAT-AATTATGTCTACTCTAGTATGCACAATACTGTAATAC------TG-TATGCAAT----TGAATAAG-ATATATG--AGATGTTTAATTAAGGGAGAGAAAACTTTTC-----ATTCACAAATGATAGAACCGCAGCCCAAGGAGGAACT-CATGCTATGTTAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAATCAAAATGTTACCATGCATTCAAAGTGAGACAGCCTGTGCCTGTTAATCGTAGACCGCG-AATACATCAATATTCA----AGACAGAGATACATGTATATGTTTGA-TCTGGATTCC-TGATTAAAAACATTC-AAATTAAAGTTC---AGCAAGTAACAAATGTAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTTGGCCTTATTTCTAGAGCGAT--------------------------TTGACACTAGTAGTAAAAGAGTGTGTAAGCCATGTAGAAATCCTGTGTCCAGCTTTGTTTCTTAA-----G------------GTT---------GTGATTTCTTGTAAATATATCATTT-----------ATAGTA---------------TTAC-ATTTTTCG-CTA-----TG-------TGTCG--TGCCAAAAAT-AAA-TATGACC-TAGAG-----TAGTTGCCAAAAATGTACAT--------ATAACTTTTTCATTGCATGTGTATGATGTTAATTGTAATTTACACATATTATAGTGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gTGGATAAAGTCCTTTTTTTAGAATATTTATTGTTCGTTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTTATATA--AGTATAGAACCT-------AAACG---AACGG--------TGATCG-CAT-----TTA---TGAC---AATA-A---------TTTT-AAGGCCGAATT-T-ATCATCTGT----T-----GAC--TTACTT---TAATTAAAAAG---GAAGAAAAACAC---TTT---------TT-GGTAATAATTACTGTA----AAGCTGATTGAAAAATATTGCA----CAGTACATTTTAAACAGCCCTCGGACACA----GCCTCAT--CATAAAATATGCCCGATTCGTTAC----------GACCCGGTATCATCTG-A----AAAGGCACTGGCAATAA-CACACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCAAAGAATACTAGATAAATAATTTCTCTTTA-AATG-AACTAT-----AAACAAACCATAACTAACAATTTAA--AGATTGAATTCACAAGT--------AATAAAAGAAAA-TGATTCCTTAACAtgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaatggataaagtcctttttttagaatatttattgttcgtttaatgcaaggttgtaccattttatataagtatagaacctaaacgaacggtgatcgcatttatgacaataattttaaggccgaatttatcatctgttgacttactttaattaaaaaggaagaaaaacactttttggtaataattactgtaaagctgattgaaaaatattgcacagtacattttaaacagccctcggacacagcctcatcataaaatatgcccgattcgttacgacccggtatcatctgaaaaggcactggcaataacacacgctgtagacattgtaagatcgaatttaaaatggaaacttcaaagaatactagataaataatttctctttaaatgaactataaacaaaccataactaacaatttaaagattgaattcacaagtaataaaagaaaatgattccttaacaccggcgacactgtatc
gi|3                          : ggacatcttgttaattgtgagcacatataattatgtctactctagtatgcacaatactgtaatactgtatgcaattgaataagatatatgagatgtttaattaagggagagaaaacttttcattcacaaatgatagaaccgcagcccaaggaggaactcatgctatgttaacagtctatgtgaagaatagtgtaatcaaaatgttaccatgcattcaaagtgagacagcctgtgcctgttaatcgtagaccgcgaatacatcaatattcaagacagagatacatgtatatgtttgatctggattcctgattaaaaacattcaaattaaagttcagcaagtaacaaatgtaaaacgggaactaaagttacaatgtgttactggtttactagttggccttatttctagagcgatttgacactagtagtaaaagagtgtgtaagccatgtagaaatcctgtgtccagctttgtttcttaaggttgtgatttcttgtaaatatatcatttatagtattacatttttcgctatgtgtcgtgccaaaaataaatatgacctagagtagttgccaaaaatgtacatataactttttcattgcatgtgtatgatgttaattgtaatttacacatattatagtgactgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaaGGACTATGTGATCAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTACCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAAACAATGACAA-------------------AAATGTTAATAAATATGATGCTTCTATACCATTTGCTATATTATCATA-CCAACTATTTGAGACATTACATTGAGATATAAATTTATATGGAAGAAGGAGCTT-AAT-------ATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGGCAAATGAATTTTTCGTCACGATAATTTGTCTATCGTCCATGGTCTGTCACCTGC-C-ATTAATTT-GTTTTCTAAAGACAT-GCTTTCACGTTTTATTTAAT--TTTACCGGTAT--ATGAAACTA-ATGTATATTCATGAAAACAAAGATTAGTCTTTGTTTGGCTTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-GATTGA-CATCTTGT---TAACTATGAGCAAATTTATGAATTATGTCTTCT-TAGCATGTACAGTACAGTAA---------TACTATGTAAC---------AG-----------------TTGAT-AAAGGAA-------CCTC---------------------------------A------ATT-CATGCTACGTAAACAGTCTAAGTGAA-GAACAGTGTTGTCAAATGCT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTCGATTGTA---CACG-AATACACCAATGTTTA----AGACAAAGAT-CA-G-----GTTTAA-TCTGGATACC-TGATTAAAATCATTCAGAAGTTAAGTTC---AG-------CAGATGCAAAACGATAATT-A--A---AGTTACAATTGTG----TAGTTTCTTAGGAGGCTATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGAccggcgacactgtatc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcatctttgcagtgcct-ATT-ATTTAGTTTTCTACAGACAGAGCTTTAATGTTTTATTCAGCGGT------ATGTTCATGAGA--ACAAGGGT--TCATAAAATCAAGGATGTGTCTTTGTTTGACGTCAATAGAGAACCATTCAGTCTCT-G-GTGGGCATCTTGTTAA---CTATGAACACG--TA---ATTATGTCTACTCTTGTATGTATAGTACAGT--TAT------T-CTATGTAACAGTTTCATCAGTCAAAT--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAT-------TTTTTTATTCATTCATGGATGATGGAACC------TCT------GCT-CCTGCT-CGTAAACAGTATTTGTAAACAAATAGTATAGTTAACATTT-ACTATGCATTCAGAGTAAGCCCACCTGTGTCTGTTGATTGTTGACCGCGTAAC-CACAAATATTCA----AGGCAAAGATACATG-----TTTA-A-TCTGGAAACC-CAATTGATAATTTTCAAAAGCAAATTTT---AGTTAGTTACACACG-GAAATGGG---TAATGA---AGTTATAA-CTTGCTACTGGTTTACCAGTAGGTCATGTTCCTAGAGGGATG---GCAGAATATTTAAGAGAAATAACTGATAATGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCATGTGGATATCCTGTTCCCACTTTTGTATCTTATT--GTG------------CGCCACAAGAAAGTGATGTCTGGTAACTATATTTTTTTATAGTTATATATAAT----------------TTAT-AT-----AACTACAAACTGGACTATCTGTGT--TGCCAGAAAAAAAACTATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTCTTTTTT-AGTATATTTATTCTTAATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATGTT---------------------------AACATTCAATCA----GCAATGATCG-----------------------ATA-T---------TTTC-AAGGCTGAATTGC-ATTATCTTT----T-----GTC--CATCTTTTTTTATTAAAACAAA-GAAGGAAAACACCAATTTGT-TATTTATTAGGTGATAATGACTGTA----AAGCTAATAGTTAAATGTTGCA----CAGTGCTTTTTAAACAGCCCTCAGACACT----GCCTCATATCATAAAATATGCATGATTCGTTATTACGGGAAGTGATCCGATATCACCTGTA----AAGGATG-TGTCAATAAACACACGTTGTATACATCGTCAGATCGAAGTTAAAATGGAAACTTCACATAATGCTACATAGATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAAACATAACGAACAATTTGA--AGATTGATTGTATTAGT--------AATAAACGAAAAGTGATTCGTTAACAtgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGAAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAGC--ATG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATGGTATCATTT-----------TTAGTTGAATTATTTATATTATTAT-AC-----A-TTG-----TGGT--ATTTATATCGTGCAAAAAAAAAAAATATGA-TGCAGAGATTTGTGTTT-CCGAAAATGCATATTTAATTCAATAA-TTTTCCATTGCACATGTATGATGTTAATCATAATGTACATATATAGCAGTGACAGGGT--------AGATAAAGTTATTTTTT-AGTATATTTAATGTTAATTTAATGCAAGGTTGTACT-------ATTTT--ATATGAGTACAGAACCTGCAAACTAAGCATTTAATGG----GTAATGATCA-----------------------ATA-T---------TTTT-ATCGTCGAATT-TTAGTATCTTT----T-----GAC--TCACTTCTTTGATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACAAATTTGT-TAACTATTActggtgaaactgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaactCTCTTTT-AGTTTAATAACTGTTCAATTAATTCAACGTTGTATCGGTTCGTATATT-TGTAA-AATATATTACCT-------AAACATTTGACGA----TCAA--ACCGTCATGTTTTTTA---TGACAATGATA-ACAGTTTATTTTTTGAAAGCCGTATT-A-ATCATATTTGCCGT-----AGCAATAACGCCATTAATTAATGAAAAAGC--GCATACATTGGTTTATGCAACTATTAGGTGATAATTTCTGTA----A-GCTGGTTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCATCGGACATT----GCCTCAT--CTTATAATATGCGCG-CTCTTTATTACTGGAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatgctctataactctaacaaacagtatttattattttttatttggacacacatttgcaaagcattgtaactgtgttcacaatgcttgattgacgctttcatattttgatttgtgaaagaacgaataaTTAACAGTCAAGCAGCGATCG-CAT-----TTATAGCAAT---CATATA---------TTTTGAAGGACGACTG-T-G----CTGC----CAAAGAGAC---AACTTCTTTAATTTTAAAAT--GATGAAAAACACCG-TCTTT-CAGCTATAAGGTGATA-TTAATTTATGATAAACTGGTTGTTAAATATAACATTTTTTTTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACATG----GTCTCAT--CTTATAATATGCGCGATTTGTTATTACCGGAAGTAACCCTCTATCCCATG-AAAAGAAAGATAGTATCAATAATCAAATGATGTAGACAATATTAGATCGAGTTTATAACGCAAA-TTTACAGAATGCGAGATAAATCATTT-TATCTATAATACAACTGA-----AAACAAACCATTACTATCAATTCGAAGAGATTGATTTTGTGTGT--------ATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gGATGTAATCAATGGTGACATACTGTTTGTTTGTCACAAATGCTCATAAATATGATGCTTTCATACTATTTGCTATATTATCATAACCAATTATTCAAGACATTACATTGACATATCAATTTACCCGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------ATTA-TG--TTAAAGCACTATCGACCATTGACAAATGAAGTTTTTATTGTGAT-ATT-------------TGGCCTGTCACCTGCGG-ATA-ATTC-GTTTCCTAAAGACAGCGCTTTCATGTTTCATTTAAC--T------ATAC--ATGAAA-TTCATGGATATTCATGAGAACAAAGATAGGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCTAA-TGGA-CATCGTGT---TAACTATGAGCACA--TATGAATTATGtcgattgatactccggcgacattgta

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111                    444444444                                                                                           11                                                    2     333333333333                                                                                222   1    1                                    333333333    11      11                                                  11              111             111111           11                                    33333333333333       77777777777777777777777           2       2222222     22222                   6666666666666666666                                           22222                                                                  1111               222222   1                                         111                            22222222                                                   111                                                                                      9999999999999999999999999999999                         222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     11         6666666666666666666666666666666666666666666666666666    1                                                          333333                                                        2222222          11           55555555             11111         6666666666666666666666666666666666666    1                       2222222222   111                   111            111                               1111                      1111                             1111                                                             1111      11                                                                                                 22222                         11                 22222222                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                      7777   1 1              000000000                         5                     0 1                                         11                         1  0    0                  0 0   666666666666  0            0      0  1                      3   3 3  0  11 0                444   0    0               9                    333333333    33      33 2   1  3     0       1   22      2   2           33              444    8        888888           11  55          1  6                  00000000000000       66666666666666666666666  0        0       6666666     00000     77            6666666666666666666 0    0            22     99     0         00000                         1                 5     8   0            4444             7 444444   3 6          6                        1   111  7    3       5            00000000        777  1                                1    111      3    5   66    3      5                                                         0000000000000000000000000000000              1          666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666   0 33         2222222222222222222222222222222222222222222222222222    2     6      0 0             44                            000000                   6          1                         1111111 7   6    44       1   99999999     0       66666   1   1 9999999999999999999999999999999999999    3         6  6  3       4444444444   000     1             333  3         333   666  1                      4444        3             4444                             4444       99                           3           1          8 7777  3   00         6  0                1                     5                          5      8    8      00000       1   1             11             1   99999999 1    4     2             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      ....   . .              .........                         .                     . .                                         ..                         .  .    .                  . .   ............  .            .      .  .                      .   . .  .  .. .                ...   .    .               .                    .........    ..      .. .   .  .     .       .   ..      .   .           ..              ...    .        ......           ..  ..          .  .                  ..............       .......................  .        .       .......     .....     ..            ................... .    .            ..     ..     .         .....                         .                 .     .   .            ....             . ......   . .          .                        .   ...  .    .       .            ........        ...  .                                .    ...      .    .   ..    .      .                                                         ...............................              .          ...............................................................   . ..         ....................................................    .     .      . .             ..                            ......                   .          .                         ....... .   .    ..       .   ........     .       .....   .   . .....................................    .         .  .  .       ..........   ...     .             ...  .         ...   ...  .                      ....        .             ....                             ....       ..                           .           .          . ....  .   ..         .  .                .                     .                          .      .    .      .....       .   .             ..             .   ........ .    .     .             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             0                      0000   4 0              000000000                         0                     8 0                                         44                         0  8    8                  4 8   222222222222  8            8      8  0                      2   2 5  8  00 2                333   0    0               2                    555555555    88      22 5   0  2     2       2   22      5   5           88              000    0        888888           00  88          0  5                  55555555555555       55555555555555555555555  8        0       0000000     00000     88            6666666666666666666 6    8            00     44     8         22222                         4                 6     0   8            2222             3 333333   3 7          7                        0   777  5    7       2            88888888        000  7                                5    777      8    6   44    2      0                                                         5555555555555555555555555555555              2          555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   2 88         4444444444444444444444444444444444444444444444444444    0     7      7 7             33                            555555                   7          0                         7777777 3   7    22       0   22222222     8       77777   7   0 2222222222222222222222222222222222222    3         7  7  2       3333333333   888     0             888  5         000   888  8                      2222        7             2222                             2222       22                           3           4          0 0000  8   22         0  6                0                     0                          0      0    0      00000       0   4             00             0   00000000 4    2     5             
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC-GTTNAATAAG--ANAC--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTACGTAAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAAC--GTG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTAT-AT-----G-CTA-----TGGN--ATTTGTGT--TGCCAAAAANAAAA-TATGA-C-CAGAG-----TATTT-CCGAAAATGCATAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAA-TT-TATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGNTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
Reference ( family-5685 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACTATGTGATNAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGNTCATAAATATGATGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCATAACCAACTATTCAAGACATTACATTGANATATCAATTTATCTGGAAGAAGGAGCTTTAAT-------ATTA-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGNCAAATGAAGTTTTCGTCGTGATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGTCACCTGC-N-ATT-ATTT-GTTTTCTAAAGACAGAGCTTTCATGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ATGAAA-TACATGNATATTCATGAGAACAAAGATNAGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATGAGCACA--TATGAATTATGTCTNCTCTAGTATGTACAGTACAGTAATAT------TACTATGTAAC-GTTNAATAGG--ANAC--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACGAATGATGGAACC------TAA------ACT-CATGCTACGTAAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAGTCAAANNNT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTTGATTGTAGACCGCG-AATACACCAATATTCA----AGACAAAGATACATG-----GTTT-A-TCTGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---AGNTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACTAA--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTAGGCCATGTTCCTAGAGTGATG---GCAGAANATTTAAGAGGAATACTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAAC--GTG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTAT-AT-----G-CTA-----TGGN--ATTTGTGT--TGCCAAAAANAAAA-TATGA-C-TAGAG-----TANTT-CCGAAAATGCACAT--------ATAACTTTTCCATTGCACGCGTATGATGTTAATCGTAATGTACATATATTACAGTGACAGGGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTANTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCTGCAA--TAAACATTTAACGG----GCAATGATCG-CAT-----TTA---CGAC---GATA-A---------TTTT-AAGGCCGAA-TT-TATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACCGATTTGT-TAACTATTAGGTGATAATTACTGTA----AAGCTGATTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACACT----GCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCGTTACTACNGGAAGTGACCCGGTATCACCTG-A----AAAGACGNTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCACAGAATGCTAGATAAATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAANCATAACTAACAATTTGA--AGATTGATTTTATTAGT--------ATTAAACGAAAAGTGATTCGTTAACA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGACCAAGAGATTAATGCCGGGGATGGATTCATATTTTTAGATTCTGTTTCACTTGATTATGGTGCACTTGATACTGATGCAATAAACGATAACATACTATTTGTTTGTCAAAAA-GCTTATAAATATGGTGCTTCCATACCATTTGCTATATTATCACAATTAACTATTCAAGACAATATATTGAAGT--CAATTTGTCTGGAAGAAGAAGCTTTAATTACTAATACTAATATATTTTAGCACTATCGACTATTGACAAATGAAGTTTTTGTTGTGATAATTTGACTGTCACCTATGGCCTGTCACCTGC-TTATT-ATTT-GTTTTCTTAAGACAGAGCTTTCGTGTTTTATTTAGC--T------ATAT--ACGAAG-TACATGTATATTCATTAGAACAATGATTAGTCTTT-TTT-ATGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-G-TTGA-CATCTTGTTAATAACTATTAGCACA--TATGAATTATGTCTTCTTTAGTATGTACAGTACAGTAATATAAAATGTACTATGTAACCATTAAATAAG--ACAC--ACAAGGTGTTTATTGAAGGGAA-------TCTTT-----ATTCACAAATGATGGAACT------TAA------ATT-CATGCTATGGAAACA--------------ATAATGTAGCCAAA---------TGCATTCAAAGTGAGACAACCAGTGCCTGTTGATTGCAGACCGCA-ATTACACCAAGATTCA----AGACAAAGATACA-G-----GTTT-A-TCCGGATACC-TGATTAAAAACATTCAAAAGTAAAGTTC---ATGTAGTAACAGATGAAAAACGGGAACTAA--ATTAAGTTACAA-TGTGTTACTGATTTATTAGTAAGCCATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGCATATTTAAGAGAAATGCTTGACACTGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTTGAAATCCTGTATCCAACTTTGTATCTTAACCTGTGCCACAAGTAAGTGGT---------GCGATGTCTTGTTATTATATCATTT-----------ATAGT----------------TTATGAT-----G-C---------AG--AGTTGAGT--TGCCAAAAAT---------------GCA-----TATTT------AATTCAT-----------TAATTTTTC--TTGCATGCCTATGATGTTAATAATAATGTACATATATTACAGTGGCAAAGTTAAATTGTGGATAAAGTTCTTTTTT-AGTATATTTACTGTTCAATTATTGCAAGGTTGTACC-------ATTTT-TATAT-AGTATAGAACCAGCAACTTAAACATTTAATGG----GCAATGATTG-CAT-----TCA---CGAG---GATA------------CTT-AAGGCCAAA-TT-TATCATCTTT----T-----GAC--TAACTTCTTTAATTAAAAAAAAAGAAGGAACACACCAATTTGT-TAATTATTATGTGATGATAACTGTA----AAGATGATAGTTAAATATTGCA----CAGTACTAATTAAACAGCCCTCGGACACT----GCTGCAT--CATAAAATATGCGCAATTCGTTACTACAGGAAGTGACCCAGTATCACCTG-A----AA--ATGCTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCAAATTTAAAATGGAAAATTCACAGAATGATCGATAAATAATTTGTCTTTA-ATTG-AACTCT-----AAATAAATCATTACTAACAACTTGA--AGATTGACTTTATTAGT--------ATTAAATGAATAGTGATTCGTTAACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-------TCTTT-----ATTCACAAATCATGGAACC------T---------CTTCATGCTATGTAAACAGTCTATGTGAA-AAATAG-GTAGTCAAATGAT-ACCATACATTCAAAGTGAGACCACCAGTTCCTGTTGATTGTAG----CG-AATACACCAATACTCA----AGACAAAGAAACATG-----TTTT-A-TCTGGATATC-TGATTAAAAACAGTCAAAAGTAAATTTC---AGCTAGTAACAGATGCAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-T-TGTGACTGGTTTACTAGTAGGTTATGTTCCAAAAGTGATGGCAGCAGAAGGTTTAAGA-GAACACTTGACACTGGAAGTAAACTATTTTGTAAACAAGGTGGAAATCCTGTGTCCAACTGTGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cTTAGGTGATAATTACTGTA----AATCTGA--GTTAAATATTGCA----CAGTGCTTTTTAAACATCCCTCGGACACTCGCAGCCTCAT--CATAAAATATGCGCGATTCATTACTACTGGAAGTGACACAGTATCACCAG-A----AAAGGCTGTGTCAATAAACAAACGCTGTAGACATTGTAAGATCGATTTTAAAATGGAAACTTTACAGAATGCTAGATAGATATTTTGTCTTTA-AATG-AACTGTAAACAAAACAAAACATAACTAGCAATTTGA--AGATTGATTTCATTAGTAATAAATCATTAAATGAAAAGTGATTCGTCAACA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGATTATGTGATAAATGCCAGGGATGGAAACATAA----AGAATTTGTTCCACCTGGCT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAAAATACTATTTGTTTGTCACAAATGAGCATAAATATTGTGCTTCCATACCATTTGCTATACTACCAT-ACCAACAGTTCAGGACATTACATTGACATATCAA-TTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------AT---TGTATTTTAGCACTATTGACCATTGTCAAATGAAGTTTTCGTCATTATAATTTGTCTATCGTCCATGGCCTGc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attcatcttggcagtgcctGGACTATGTGACGAATGACAGGGATGTATTCATAG----AGAATATGTTCCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAATCAATGATAACATACTATTTGTTTGTCACAAATGATCATAAATATGATG----CATACCATTTGCTATATTATCAT-ACCAACTATTCAAGACATTACATTGAGATATTAATTTATCTGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------GT---TGTATTTTATCACTA-CGACCA-TGTCAAATGAAGTTTTCGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attcatcatggcagtgccaATATTCATCTAAGACAAATATACATGT----ATAT-AATCTGTAAACCCTGTTAAAAAACATTCAAAAGTAAAATCCGTAATGTAGTTACAGATGCAAAACGAAAACTGA--A----GTAACAA-AGTGTTGCTGGTTTACCAGTAAACCATGATCATAGAGGGGTG---ACAGAAGATTT-AGAGGAATATTCGACA---GTAGca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccaaatgcattcagctaagcagtatttggatacagtgcgatgaatgtaagGTGGATAAAATTGGCTTTT-AGTGTAATTGGTGTTCATTTAATGCAAGGTTGTACC-------A-TTT-TATAT-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcatcatggtttgagaaaagGACTATGTGATGAATGCCAAGGATGGATTCATAA----AAATTATGTagttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcatcttggcagtgcctaGA-CATCTTGTTAAT---TGTGAGCACA--TAT-AATTATGTCTACTCTAGTATGCACAATACTGTAATAC------TG-TATGCAA---TTGAATAAG--ATATATG--AGATGTTTAATTAAGGGAGAGAAAACTTTTC-----ATTCACAAATGATAGAACCGCAGCCCAAGGAGGAACT-CATGCTATGTTAACAGTCTATGTGAA-GAATAGTGTAATCAAAATGTTACCATGCATTCAAAGTGAGACAGCCTGTGCCTGTTAATCGTAGACCGCG-AATACATCAATATTCA----AGACAGAGATACATGTATATGTTTGA-TCTGGATTCC-TGATTAAAAACATTC-AAATTAAAGTTC---AGCAAGTAACAAATGTAAAACGGGAACT-A--A---AGTTACAA-TGTGTTACTGGTTTACTAGTTGGCCTTATTTCTAGAGCGAT--------------------------TTGACACTAGTAGTAAAAGAGTGTGTAAGCCATGTAGAAATCCTGTGTCCAGCTTTGTTTCTTAA-----G------------GTT---------GTGATTTCTTGTAAATATATCATTT-----------ATAGTA---------------TTAC-ATTTTTCG-CTA-----TG-------TGTCG--TGCCAAAAAT-AAA-TATGACC-TAGAG-----TAGTTGCCAAAAATGTACAT--------ATAACTTTTTCATTGCATGTGTATGATGTTAATTGTAATTTACACATATTATAGTGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gTGGATAAAGTCCTTTTTTTAGAATATTTATTGTTCGTTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATTTTATATA--AGTATAGAACCT-------AAACG---AACGG--------TGATCG-CAT-----TTA---TGAC---AATA-A---------TTTT-AAGGCCGAA-TT-TATCATCTGT----T-----GAC--TTACTT---TAATTAAAAAG---GAAGAAAAACAC---TTT---------TT-GGTAATAATTACTGTA----AAGCTGATTGAAAAATATTGCA----CAGTACATTTTAAACAGCCCTCGGACACA----GCCTCAT--CATAAAATATGCCCGATTCGTTAC----------GACCCGGTATCATCTG-A----AAAGGCACTGGCAATAA-CACACGCTGTAGACATTGTAAGATCGAATTTAAAATGGAAACTTCAAAGAATACTAGATAAATAATTTCTCTTTA-AATG-AACTAT-----AAACAAACCATAACTAACAATTTAA--AGATTGAATTCACAAGT--------AATAAAAGAAAA-TGATTCCTTAACAtgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaatggataaagtcctttttttagaatatttattgttcgtttaatgcaaggttgtaccattttatataagtatagaacctaaacgaacggtgatcgcatttatgacaataattttaaggccgaatttatcatctgttgacttactttaattaaaaaggaagaaaaacactttttggtaataattactgtaaagctgattgaaaaatattgcacagtacattttaaacagccctcggacacagcctcatcataaaatatgcccgattcgttacgacccggtatcatctgaaaaggcactggcaataacacacgctgtagacattgtaagatcgaatttaaaatggaaacttcaaagaatactagataaataatttctctttaaatgaactataaacaaaccataactaacaatttaaagattgaattcacaagtaataaaagaaaatgattccttaacaccggcgacactgtatc
gi|3                          : ggacatcttgttaattgtgagcacatataattatgtctactctagtatgcacaatactgtaatactgtatgcaattgaataagatatatgagatgtttaattaagggagagaaaacttttcattcacaaatgatagaaccgcagcccaaggaggaactcatgctatgttaacagtctatgtgaagaatagtgtaatcaaaatgttaccatgcattcaaagtgagacagcctgtgcctgttaatcgtagaccgcgaatacatcaatattcaagacagagatacatgtatatgtttgatctggattcctgattaaaaacattcaaattaaagttcagcaagtaacaaatgtaaaacgggaactaaagttacaatgtgttactggtttactagttggccttatttctagagcgatttgacactagtagtaaaagagtgtgtaagccatgtagaaatcctgtgtccagctttgtttcttaaggttgtgatttcttgtaaatatatcatttatagtattacatttttcgctatgtgtcgtgccaaaaataaatatgacctagagtagttgccaaaaatgtacatataactttttcattgcatgtgtatgatgttaattgtaatttacacatattatagtgactgttttcacattgcttgtttgacatttttctctttctgattcgtgaaagaaGGACTATGTGATCAATGCCAGGGATGGATTCATAA----AGAATATGTACCACCTGGTT---------TTGATACAGATGCAAACAATGACAA-------------------AAATGTTAATAAATATGATGCTTCTATACCATTTGCTATATTATCATA-CCAACTATTTGAGACATTACATTGAGATATAAATTTATATGGAAGAAGGAGCTT-AAT-------ATTG-TGTATTTTAGCACTATCGACCATTGGCAAATGAATTTTTCGTCACGATAATTTGTCTATCGTCCATGGTCTGTCACCTGC-C-ATTAATTT-GTTTTCTAAAGACAT-GCTTTCACGTTTTATTTAAT--TTTACCGGTAT--ATGAAACTA-ATGTATATTCATGAAAACAAAGATTAGTCTTTGTTTGGCTTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCT-GATTGA-CATCTTGT---TAACTATGAGCAAATTTATGAATTATGTCTTCT-TAGCATGTACAGTACAGTAA---------TACTATGTAAC--------AG------------------TTGAT-AAAGGAA-------CCTCA-----ATTCA-----------------------------------TGCTACGTAAACAGTCTAAGTGAA-GAACAGTGTTGTCAAATGCT-ACCATGCATTCAAAGTGAGACCACCAGTGCCTGTCGATTGTA---CACG-AATACACCAATGTTTA----AGACAAAGAT-CA-G-----GTTTAA-TCTGGATACC-TGATTAAAATCATTCAGAAGTTAAGTTC---AG-------CAGATGCAAAACGATAATT-A--A---AGTTACAATTGTG----TAGTTTCTTAGGAGGCTATGTTCCTAAAGTGATG---GCAGAccggcgacactgtatc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcatctttgcagtgcct-ATT-ATTTAGTTTTCTACAGACAGAGCTTTAATGTTTTATTCAGCGGT------ATGTTCATGAGA--ACAAGGGT--TCATAAAATCAAGGATGTGTCTTTGTTTGACGTCAATAGAGAACCATTCAGTCTCT-G-GTGGGCATCTTGTTAA---CTATGAACACG--TA---ATTATGTCTACTCTTGTATGTATAGTACAGT--TAT------T-CTATGTAACAGTTTCATCAGTCAAAT--G--AGATGTTTAAT-AAGGGAT-------TTTTTTATTCATTCATGGATGATGGAACC------TCT------GCT-CCTGCT-CGTAAACAGTATTTGTAAACAAATAGTATAGTTAACATTT-ACTATGCATTCAGAGTAAGCCCACCTGTGTCTGTTGATTGTTGACCGCGTAAC-CACAAATATTCA----AGGCAAAGATACATG-----TTTA-A-TCTGGAAACC-CAATTGATAATTTTCAAAAGCAAATTTT---AGTTAGTTACACACG-GAAATGGG---TAATGA---AGTTATAA-CTTGCTACTGGTTTACCAGTAGGTCATGTTCCTAGAGGGATG---GCAGAATATTTAAGAGAAATAACTGATAATGGTAGTAAAATATTTTGTAAGCCATGTGGATATCCTGTTCCCACTTTTGTATCTTATT--GTG------------CGCCACAAGAAAGTGATGTCTGGTAACTATATTTTTTTATAGTTATATATAAT----------------TTAT-AT-----AACTACAAACTGGACTATCTGTGT--TGCCAGAAAAAAAACTATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTCTTTTTT-AGTATATTTATTCTTAATTTAATGCAAGGTTGTACC-------ATGTT---------------------------AACATTCAATCA----GCAATGATCG-----------------------ATA-T---------TTTC-AAGGCTGAA-TTGCATTATCTTT----T-----GTC--CATCTTTTTTTATTAAAACAAA-GAAGGAAAACACCAATTTGT-TATTTATTAGGTGATAATGACTGTA----AAGCTAATAGTTAAATGTTGCA----CAGTGCTTTTTAAACAGCCCTCAGACACT----GCCTCATATCATAAAATATGCATGATTCGTTATTACGGGAAGTGATCCGATATCACCTGTA----AAGGATG-TGTCAATAAACACACGTTGTATACATCGTCAGATCGAAGTTAAAATGGAAACTTCACATAATGCTACATAGATAATTTGTCTTTA-AATG-AACTGT-----AAACAAAACATAACGAACAATTTGA--AGATTGATTGTATTAGT--------AATAAACGAAAAGTGATTCGTTAACAtgttaggatgagtacacctgagtcattagtttgtcattgcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTAGTAAAATATTTTGTAAGCCAGGTGAAAATCCTGTGTCCAACTTTGTATCTTAGC--ATG------------GGC---------GTGATGTCTTGTAATGGTATCATTT-----------TTAGTTGAATTATTTATATTATTAT-AC-----A-TTG-----TGGT--ATTTATATCGTGCAAAAAAAAAAAATATGA-TGCAGAGATTTGTGTTT-CCGAAAATGCATATTTAATTCAATAA-TTTTCCATTGCACATGTATGATGTTAATCATAATGTACATATATAGCAGTGACAGGGT--------AGATAAAGTTATTTTTT-AGTATATTTAATGTTAATTTAATGCAAGGTTGTACT-------A-TTT-TATATGAGTACAGAACCTGCAAACTAAGCATTTAATGG----GTAATGAT--------------------C---AATA-T---------TTTT-ATCGTCGAATTT-TAGTATCTTT----T-----GAC--TCACTTCTTTGATTAAAAAAAAAGAAGGAAAACACAAATTTGT-TAACTATTActggtgaaactgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaactCTCTTTT-AGTTTAATAACTGTTCAATTAATTCAACGTTGTATCGGTTCGTATATT-TGTAA-AATATATTACCT-------AAACATTTGACGA----TCAA--ACCGTCATGTTTTTTA---TGACAATGATA-ACAGTTTATTTTTTGAAAGCCGTA-TT-AATCATATTTGCCGT-----AGCAATAACGCCATTAATTAATGAAAAAGC--GCATACATTGGTTTATGCAACTATTAGGTGATAATTTCTGTA----A-GCTGGTTGTTAAATATTGCA----CAGTACTTTTTAAACAGCCATCGGACATT----GCCTCAT--CTTATAATATGCGCG-CTCTTTATTACTGGAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatgctctataactctaacaaacagtatttattattttttatttggacacacatttgcaaagcattgtaactgtgttcacaatgcttgattgacgctttcatattttgatttgtgaaagaacgaataaTTAACAGTCAAGCAGCGATCG-CAT-----TTATAGCAAT---CATATA---------TTTTGAAGGACGAC-TG-TG----CTGC----CAAAGAGAC---AACTTCTTTAATTTTAAAAT--GATGAAAAACACCG-TCTTT-CAGCTATAAGGTGATA-TTAATTTATGATAAACTGGTTGTTAAATATAACATTTTTTTTACTTTTTAAACAGCCCTCGGACATG----GTCTCAT--CTTATAATATGCGCGATTTGTTATTACCGGAAGTAACCCTCTATCCCATG-AAAAGAAAGATAGTATCAATAATCAAATGATGTAGACAATATTAGATCGAGTTTATAACGCAAA-TTTACAGAATGCGAGATAAATCATTT-TATCTATAATACAACTGA-----AAACAAACCATTACTATCAATTCGAAGAGATTGATTTTGTGTGT--------ATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gGATGTAATCAATGGTGACATACTGTTTGTTTGTCACAAATGCTCATAAATATGATGCTTTCATACTATTTGCTATATTATCATAACCAATTATTCAAGACATTACATTGACATATCAATTTACCCGGAAGAAGGAGC-TTAAT-------ATTA-TG--TTAAAGCACTATCGACCATTGACAAATGAAGTTTTTATTGTGAT-ATT-------------TGGCCTGTCACCTGCGG-ATA-ATTC-GTTTCCTAAAGACAGCGCTTTCATGTTTCATTTAAC--T------ATAC--ATGAAA-TTCATGGATATTCATGAGAACAAAGATAGGTCTTTGTTTGACGTCAATAGA--ATCATTCAGTCTCTAA-TGGA-CATCGTGT---TAACTATGAGCACA--TATGAATTATGtcgattgatactccggcgacattgta