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gi|3                          :                                                                                                                                                      CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAA-TACTTTACATTACTTTCCAAAATATCATTAAGTA-TATACCAACTGCTTGAAACAATATTTTACATT-------ATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGGTGAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAA-TT--AAACA----CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACCGGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG--------TT--TACACA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                             T-ACGTTTGACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGGTTAAACGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAA-----A--CAAACGCAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC--------ATGA--ATA-----------AAATCATGT---AAAGCAC---------GGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCA----TGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCGCA-----------------TGGCATAATG-TTATAACAGTTATTTagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCACACATACAAATTGAA--CA---ATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC--------ATGA--ATG-----------AAAGCACGT---TAAGCAA---------GGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA--CTT-ATCA------------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG-A-----------------TTGCATAATG-CAGTTATATTTCTTT---TG---------------AAT--------GAATACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCACT------------GA---------------------------------------------------------------------TAAC--GT--------------------TAAACTATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGACATTCCAATGCGACTATACCATTTCC-------ATGA--ATG-----------AAAGCACGT---TGAGCAC---------GTGAAGATGAGAAAACTCTCCCAACCT----TGAGTAGACGGTGTG--------TT--AACACGCCCATCTGCAAAGTTATGA------------ATGAAA--CTA-ATCGG------CCAACAGTGCTTTTAATGCAGAAGCATACAACG-A-----------------TAATTTTATGATAATGATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGA------------AT-AAA--CTT-ATAAATCGTGTCCA----TGATTGAAATGCACAAGCCTACACTGTATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATG-TATTTATATTTGTTTTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTT-AAAAAC--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAG---------AATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGCATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAAT------AACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTG--------------CA----AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagtcttttttagag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                      ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggcca----------TGGATATTGTTATTTAAACA-C--AATCGTTGGAGGAA-TGTT---CAAAGTGGTGTGAATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC-------------------------ATTATTTGAATATTGAAAATTTTAATAACATGTAACTAATAAC---------------TATAAACTATTTTAT---TG-ATTGTAAATAGTGAATGTATA----TATGTATTATATTT----------TGT----GTAAACCGCCTAGTTCAAGGTAATAAACATt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taataaatgtagttgttgcattacaa-TTCAGAATCCTATAAATGCTACATTTAATCAATTGCATTGAATGAATATTGAATATTGAAATTGTTA-----------------------AT------AATATT------------------TAACTAATAAC---------------TTTAAACTATTTTATTGACGCAATGTAAAGAGTGAAAGTATA----TATG-------TTTCTCCTCGGTATGTTTTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatgTATG----TATGCTTTTT-TTTTTTCTTTGTATGTTTTTGTAACCCGCATTGTTCAAGGCAATAAACATGTATATGCGTGTAACGCCATTCA---ACT--ATTGCAAgaaattgaattgaaattggtatgtttgtgtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGTATTATGTTTCTTCTCTGTTTGTTTTTGAAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-tgaattgaacaattgaattgaaatcccatcatgttaataacgcttaaatgtatgactctaatggataacatttaacttagttatgatatacatg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaacctctagatgcattgggaagATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTGTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAACttgaaacctgatttgttattgttttaagatatcctgtatttttaattgtcaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATACACATGTAT-T---TGTTATGCAAAGAA----CT--ATTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGA---ACT--ATTGaaattg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T--GTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAACaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attatgtttcttctctgtatgtTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAAaaattg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taataactaaactgtacttatcaatatggcgtttttatttgcagtggaagacgaagcataccttgtgaagaacacagaaatattgttttactcaataagtgttagttatattaggaaatatcaattagtaatataggtaaggttggacactctatatgatttacacaacaagtgttagttatgttagtaatattttactagttggacgttgtttacgttggatagtatactaaattgcagcaattatctggaaaacgagtgtctggtaaggcacacatataacttaacgcaacatacttacctttcattttagctatagttatatccaagtcagtcatattccctcaagttatccactagattaaattatacactgtattgctaataaaccgcagtcaatgacagtccagtgcgacattacaatatcatatataaaatcacgtaaagcacgggcaaatgagaaaaccctcgcaacctagagtaaacagacagtgaaataacacacgtacactgccgaataaactgatcagttgggtccatgatttaaatgtacaagcctgcactgcattgtaatatgcaattatatttgttttgctgtgggtaatttgtttaaaaaacaatcattgacatgtgttcagaatcctataaatactacatttcatcaatttgcataatatttaactagtaacttttaaactattttatcaatgcattgtaaagagtgaatgtatgtatgtattatatttcttccttgtatgtttTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAAccgcctagttcaaggcaataa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgttcagaatcctataaatgctacatttaatcaattgcattgaatgaatattgaatattgaaattgttaataatatttaactaataactttaaactattttattgacgcaatgtaaagagtgaaagtatatatgtttctcctcggtatgtttTTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATACACATGTAT-T---TGTTATGCAAAGAA----CT--ATTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGA---ACT--ATTG-AAttgaattgaaattggtatgtttgtgtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGTAACCCGCATTGTTCAAGGCAATAAACATGTATATGCGTGTAACGCCATTCA---ACT--ATTGCAAt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatgtatgctttttttttttctttgtatgtttTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGTAATAAACATtgaattgaacaattgaattgaaatcccatcatgttaataacgcttaaatgtatgactctaatggataacatttaacttagttatgatatacatg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taataaatgtagttgttgcattacaatggatattgttatttaaacacaatcgttggaggaatgttcaaagtggtgtgaatactacatttaatcaatttgcattatttgaatattgaaaattttaataacatgtaactaataactataaactattttattgattgtaaatagtgaatgtatatatgtattatattttgAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-------TTG-AAACC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaacctctagatgcattgggaagatgtattatgtttcttctctgtttgtttttgaT--GTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAAtgatttgttattgttttaagatatcctgtatttttaattgtcaca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attatgtttcttctctgtatgtTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAATTcaaattg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgttcagaatcctataaatgctacatttaatcaattgcattgaatgaatattgaatattgaaattgttaataatatttaactaataactttaaactattttattgacgcaatgtaaagagtgaaagtatatatgtttctcctcggtatgtttTTGAAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-------TTG-AAAgaattgaaattggtatgtttgtgtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaacctctagatgcattgggaagatgtattatgtttcttctctgtttgtttTTGTAACCCGCATTGTTCAAGGCAATAAACATGTATATGCGTGTAACGCCATTCA---ACT--ATTG-CAATcctgatttgttattgttttaagatatcctgtatttttaattgtcaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatgtatgctttttttttttctttgtatgtttTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGTAATAAACATgaattgaacaattgaattgaaatcccatcatgttaataacgcttaaatgtatgactctaatggataacatttaacttagttatgatatacatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taataaatgtagttgttgcattacaatggatattgttatttaaacacaatcgttggaggaatgttcaaagtggtgtgaatactacatttaatcaatttgcattatttgaatattgaaaattttaataacatgtaactaataactataaactattttattgattgtaaatagtgaatgtatatatgtattatattttgAATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ACGATGTCGGTTATATTCATGAAATATTGCTCAAAGTAACGCTACTGTTACATAGTCGTTGACAGTTACACTTTATCTTTAGACTTTTATAATTAATCAGTTTGCTTAAGTGAATATTAAAATTGTTAATAACATTTAA
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Reference ( family-5642 )     :                                                                                                                                                                                                                                                 TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTACGTGNTTTACGTGCAGTACAAGTGCTTTACGTTACGTTNNAAAATATCATTAAGTAATATNCCAACTGNTTGGAACGNTGTTTACGTT-G-ACAGTATNCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAA-TT--A--CA---GCAACANACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAANAGTCATATTCCCTCAAGTAATCCACTAGATTAAATTAT--ACACCGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACATTACAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACTCTCCCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA---A-------TAACACGC------GCANACTNCCGA------------AT-AAA---CTNATCAGTCGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACCGCAT-----------------TGCATNATG-TAATTATATTTGTT---TTG-TG----------TGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCGTTGAC---A-TGTT-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TTTAAACTATTTTATCGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTTTTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGAAATT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GATGCATTGGGAAGA-----------------TGTATTATGTTTCTTCTCTGTTTGTTTTTGAAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-------TTG-AAACC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTGTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAACt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGCACACATACAAATTGAA--CA---ATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATAaaattg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                 TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGATTTACA--CA--ACAAGTG--TTA-GTTATGTT--------------AGTAATATTTTA-CTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTT-GGATAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-A-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCACACATATAACTT--A--AC---GCAACATACTTACCTTTCATTTTAGCTATAGTTATATCCAAGT-CAGTCATATTCCCTCAAGTTATCCACTAGATTAAATTAT--ACACTGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAGTGCGACATTACAATATC-A----------TATATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACCCTCGCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA---A-------TAACACAC------GTACACTGCCGA------------AT-AAA---CTGATCAGTTGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACTGCAT-----------------TGTAATATG-CAATTATATTTGTT---TTGCTG----------TGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCATTGAC---A-TGTG-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAGTAACT--------------TTTAAACTATTTTATCAATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATATTTCTTCCTTGTATGTTTTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAA-TACTTTACATTACTTTCCAAAATATCATTAAGTA-TATACCAACTGCTTGAAACAATATTT----T---ACATTATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-GAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAA-TT--AAACA----CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACC-GGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG---T-------TTACAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCACCGA------------AT-AAA---CTTATAAATCGTGTCCATGATTGAAATGCACAAGCCTACACTGTATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATG-TATTTATATTTGTT---TTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTT-AAAAAC--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAG---------AATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAATAACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTGCA------------------AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|4                          : ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggTACGTTTG-ACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGG-TTAAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAA-----A--CAAACGCAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCATGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA---A-------TAACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCATGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCGCAT-----------------GGCATAATG-TTATAACAGTTATT---Tt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC-A----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------AAGCAAGGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA---CTTATCA--------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG-AT-----------------TGCATAATG-CAGTTATATTTCTT---TTG-AA----------TG---AAT------------ACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCA------------------------CTG---AT-------------------------AACGTT------------------AAAC-----------------------------TATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaacctctaTTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATACACATGTATTTGTTATGCAAAGAA---CTATTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATGA--ACTATTGAAtgatttgttattgttttaagatatcctgtatttttaattgtcaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTGTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAACt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCACACATACAAATTGAACA---ATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATAaaattg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGATTTACA--CA--ACAA-GTGTTA-GTTATGTT----------------AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGATAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-A-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCACACATATAACTT--AAC---GCAACATACTTACCTTTCATTTTAGCTATAGTTATATCCAAGT-CAGTCATATTCCCTCAAGTTATCCACTAGATTAAATTAT--ACACTGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAGTGCGACATTACAATATC-A----------TATATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACCCTCGCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GTACACTGCCGA------------AT-AAA---CTGATCAGTTGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACTG--CAT-----------------TGTAATATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CTGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCATTGAC---A-TGTG-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAGTAACT--------------TTTAAACTATTTTATCAATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATATTTCTTCCTTGTATGTTTTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAATACTTTACATTACTTTCCAAAATATCA--TTAAGTATATACCA-ACTGCTTGAAACAATATTT----T--ACATTATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-GAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAA-TTAAACA----CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACC-GGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG--------TT--TACAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCGA------------AT-AAA---CTTATAAATCGTGTCCATGATTGAAATGCACAAGCCTACACTG--TATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATGTATTTATATTTGTT---TTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTTAAAAA-C--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAGAAT---------ACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAATAACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTGCA------------------AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|4                          : ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaTACGTTTGACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGG-TTAAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAA-----ACAAACGCAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCATGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCATGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------GGCATAATGTTATAACAGTTATT---Tt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC-A----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------AAGCAAGGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA---CTTATCA--------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG---AT-----------------TGCATAATGCAGTTATATTTCTT---TTG------------------AAT--------GAATACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCA------------------------CTG---AT-------------------------AACGTT------------------AAAC-----------------------------TATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TTCAGAATCCTATAAATGCTACATTTAATCAATTGCATTGAATGAATATTGAATATTGAAATTGTTAAT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TT-AAACTATTTTATTGACGCAATGTAAAGAGTGAAAGTATA----TATGT-------TTCTCCTCGGTATGTTTTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatgAAATGTAGTTGTTGCATTA----------CAATGGATATTGTTATTTAAACA-C--AATCGTTGGAGGAA-TGTT---CAAAGTGGTGTGAATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTATTTG-------------------AATATTGAAAATTTTAATAACATGTAACTAATAAC---------------TATAAACTATTTTATTG----ATTGTAAATAGTGAATGTATA----TATGTATTATATTT------TG--------TGTAAACCGCCTAGTTCAAGGTAATAAACATttgaattgaaattggtatgtttgtgtt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taatAATGACATTCCAATGCGACTATACCATTTCCA----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------GAGCACGTGAAGATGAGAAAACTCTCCCAACCTTGAGT----AGACGGTGTG--------TT--AACACGCCCATCTGCAAAGTTATGA------------ATGAAA---CTAATCGGCCAA--CAGTGCTTTTAATGCAGAAGCATACAACGATAAT-----------------TTTATGAT--AATGATA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATG----TATGCTTT-TTTTTTTTCTTTGTATGTTTTTGTAACCCGCATTGTTCAAGGCAATAAACATGTATATGCGTGTAACGCCATTCA---ACT--ATTGCAAaagtcttttttagag
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): AAAAAAAAATCATATACATGTAATAAGCATTGTGTATAATATACATATCAGCCGGATAAACCATTTCACAATATTTCTGGTGTTCAT
Unaligned ( gi|16 ): CAATTGTATAATGCAATTACAGTTATTTGCGTAATGCAATATATATT






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Reference ( family-5642 )     :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAANTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGANATATTGTTTTANTCAACAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGTTTTACG--CA--ACAA-GCGTTA-GTTACGTT--GAAATATCA--T--AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGACAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAACTT-AACAGCAACATACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAACAGTCATATTCCCTCAAGTNATCCACTAGATTAAATTAT--ACACCGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACATTACAATATC-A----------TGNATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACTCTCCCAACCTNGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACGC------GTAAACTGCCGA------------AT-AAA---CTNATCAGTCGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------TGCATNATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CNGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCGTTGAC---A-TGTT-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TTTAAACTATTTTATCGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTTTTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATGAACACTATTGAAATT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATGCATTGGGAAGA-----------------TGTATTATGTTTCTTCTCTGTTTGTTTTTGAAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-------TTG-AAACC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCACACATACAAATTGAACAATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATAaaattg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGATTTACA--CA--ACAA-GTGTTA-GTTATGTT----------------AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGATAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-A-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCACACATATAACTT-AAC-GCAACATACTTACCTTTCATTTTAGCTATAGTTATATCCAAGT-CAGTCATATTCCCTCAAGTTATCCACTAGATTAAATTAT--ACACTGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAGTGCGACATTACAATATC-A----------TATATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACCCTCGCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GTACACTGCCGA------------AT-AAA---CTGATCAGTTGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACTG--CAT-----------------TGTAATATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CTGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCATTGAC---A-TGTG-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAGTAACT--------------TTTAAACTATTTTATCAATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATATTTCTTCCTTGTATGTTTTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAATACTTTACATTACTTTCCAAAATATCA--TTAAGTATATACCA-ACTGCTTGAAACAATATTT----T--ACATTATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-GAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAATTA-AACA-CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACC-GGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG--------TT--TACAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGA------------AT-AAA---CTTATAAATCGTGTCCATGATTGAAATGCACAAGCCTACACTG--TATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATGTATTTATATTTGTT---TTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTTAAAAA-C--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAGAAT---------ACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAATAACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTGCA------------------AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|4                          : ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaTACGTTTGACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGG-TTAAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAAACA-AAC-GCAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCATGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCATGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------GGCATAATGTTATAACAGTTATT---Tt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC-A----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------AAGCAAGGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA---CTTATCA--------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG---AT-----------------TGCATAATGCAGTTATATTTCTT---TTG------------------AAT--------GAATACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCA------------------------CTG---AT-------------------------AACGTT------------------AAAC-----------------------------TATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TTCAGAATCCTATAAATGCTACATTTAATCAATTGCATTGAATGAATATTGAATATTGAAATTGTTAAT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TT-AAACTATTTTATTGACGCAATGTAAAGAGTGAAAGTATA----TATGT-------TTCTCCTCGGTATGTTTTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5642 )     :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAANTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGANATATTGTTTTANTCAACAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGTTTTACG--CA--ACAA-GCGTTA-GTTACGTT--GAAATATCA--T--AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGACAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAANTT-AACAGCAACATACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAACAGTCATATTCCCTCAAGTNATCCACTAGATTAAATTAT--ACACCGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACATTACAATATC-A----------TGNATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACTCTCCCAACCTNGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACGC------GTAAACTGCCGA------------AT-AAA---CTNATCAGTCGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------TGCATNATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CNGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCGTTGAC---A-TGTT-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TTTAAACTATTTTATCGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTTTTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATGAACACTATTGAAATT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaacctctaTTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATACACATGTATTTGTTATGCAAAGAA---CTATTGTAAACCATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATGA--ACTATTGAAtgatttgttattgttttaagatatcctgtatttttaattgtcaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTGTTGTTAACCGCCTTGTTCAAGGCAATAAACATGTTT-A---TGTTTTTCCAATCAACTACTGAATTG-AAACt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCACACATACAAATTGAACAATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATAaaattg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGATTTACA--CA--ACAA-GTGTTA-GTTATGTT----------------AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGATAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-A-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCACACATATAACTT-AAC-GCAACATACTTACCTTTCATTTTAGCTATAGTTATATCCAAGT-CAGTCATATTCCCTCAAGTTATCCACTAGATTAAATTAT--ACACTGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAGTGCGACATTACAATATC-A----------TATATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACCCTCGCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GTACACTGCCGA------------AT-AAA---CTGATCAGTTGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACTG--CAT-----------------TGTAATATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CTGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCATTGAC---A-TGTG-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAGTAACT--------------TTTAAACTATTTTATCAATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATATTTCTTCCTTGTATGTTTTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAATACTTTACATTACTTTCCAAAATATCA--TTAAGTATATACCA-ACTGCTTGAAACAATATTT----T--ACATTATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-GAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAATTA-AACA-CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACC-GGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG--------TT--TACAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGA------------AT-AAA---CTTATAAATCGTGTCCATGATTGAAATGCACAAGCCTACACTG--TATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATGTATTTATATTTGTT---TTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTTAAAAA-C--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAGAAT---------ACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAATAACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTGCA------------------AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|4                          : ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaTACGTTTGACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGG-TTAAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAAACA-AAC-GCAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCATGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCATGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------GGCATAATGTTATAACAGTTATT---Tt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC-A----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------AAGCAAGGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA---CTTATCA--------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG---AT-----------------TGCATAATGCAGTTATATTTCTT---TTG------------------AAT--------GAATACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCA------------------------CTG---AT-------------------------AACGTT------------------AAAC-----------------------------TATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TTCAGAATCCTATAAATGCTACATTTAATCAATTGCATTGAATGAATATTGAATATTGAAATTGTTAAT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TT-AAACTATTTTATTGACGCAATGTAAAGAGTGAAAGTATA----TATGT-------TTCTCCTCGGTATGTTTTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatgAAATGTAGTTGTTGCATTA----------CAATGGATATTGTTATTTAAACA-C--AATCGTTGGAGGAA-TGTT---CAAAGTGGTGTGAATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTATTTG-------------------AATATTGAAAATTTTAATAACATGTAACTAATAAC---------------TATAAACTATTTTATTG----ATTGTAAATAGTGAATGTATA----TATGTATTATATTT------TG--------TGTAAACCGCCTAGTTCAAGGTAATAAACATttgaattgaaattggtatgtttgtgtt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatAATGACATTCCAATGCGACTATACCATTTCCA----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------GAGCACGTGAAGATGAGAAAACTCTCCCAACCTTGAGT----AGACGGTGTG--------TT--AACACGCCCATCTGCAAAGTTATGA------------ATGAAA---CTAATCGGCCAA--CAGTGCTTTTAATGCAGAAGCATACAACGATAAT-----------------TTTATGAT--AATGATA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATG----TATGCTTT-TTTTTTTTCTTTGTATGTTTTTGTAACCCGCATTGTTCAAGGCAATAAACATGTATATGCGTGTAACGCCATTCA---ACT--ATTGCAAaagtcttttttagag


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): AAAAAAAAATCATATACATGTAATAAGCATTGTGTATAATATACATATCAGCCGGATAAACCATTTCACAATATTTCTGGTGTTCAT
Unaligned ( gi|16 ): CAATTGTATAATGCAATTACAGTTATTTGCGTAATGCAATATATATT






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Reference ( family-5642 )     :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAANTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGANATATTGTTTTANTCAACAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGTTTTACG--CA--ACAA-GCGTTA-GTTACGTT--GAAATATCA--T--AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGACAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAANTT-AACG-CAACATACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAACAGTCATATTCCCTCAAGTNATCCACTAGATTAAATTAT--ACACCGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACATTACAATATC-A----------TGNATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACTCTCCCAACCTNGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACGC------GTAAACTGCCGA------------AT-AAA---CTNATCAGTCGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------TGCATNATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CNGTGGGTAAT-TTGTTT-AAAAAC--AATCGTTGAC---A-TGTT-TCCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TTTAAACTATTTTATCGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATGTTTCTTCTCTGTATGTTTTTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTATTTGTTATGCCAATGAACACTATTGAAATT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATGCATTGGGAAGA-----------------TGTATTATGTTTCTTCTCTGTTTGTTTTTGAAAACCGCCTAGTTCAAGGAAATAAACATGCAT-C---TGTTATGCCAATAAAC-------TTG-AAACC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCACACATACAAATTGAACAATAACATGCTTA---TTCATTCCAGCTATCGTTATAaaattg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAACTAAACTGTACTTATCAATATGGCGTTTTTATTTGCAGTGGAAGACGAAGCATACCTTGTGAAGAACACAGAAATATTGTTTTACTCAATAAGTGTTAGTTATATTAGGAAATATCAATTAGTAATATAGGTAAGGTTGGACACTCTATATGATTTACA--CA--ACAA-GTGTTA-GTTATGTT----------------AGTA-ATATTTTACTAGTTGGA-CGTTGTTTACGTTGGATAGTATACTAAATTGCAGCAATTATCTGG-A-AAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCACACATATAACTT-AACG-CAACATACTTACCTTTCATTTTAGCTATAGTTATATCC-AAGTCAGTCATATTCCCTCAAGTTATCCACTAGATTAAATTAT--ACACTGTATTGCTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAGTGCGACATTACAATATC-A----------TATATA-----------AAATCACGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAAAACCCTCGCAACCTAGAGTAAACAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GTACACTGCCGA------------AT-AAA---CTGATCAGTTGGGTCCATGATTTAAATGTACAAGCCTGCACTG--CAT-----------------TGTAATATGCAATTATATTTGTT---TTG----------CTGTGGGTAAT-TTGTTTAAAAAAC--AATCATTGAC---A-TGTG-TTCAGAATCCTATAAATACTAC---------ATTTCATC------------AAT-------TTGC--AT-------------------------AATATT------------------TAACTAGTAACT--------------TTTAAACTATTTTATCAATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATG----TATGTATTATATTTCTTCCTTGTATGTTTTTTTGAACCGCCTAGTTCATGGCAATAAACGTGTAT-T---TGTTATGCCAATAAAC-ACT--ATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAAACGTGTATTTGTTATGCCAATAAACACTATTGTAAACCGCCTAGTTCAAGGCAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTACGTGTTTTACGTGCAGTACAATACTTTACATTACTTTCCAAAATATCA--TTAAGTATATACCA-ACTGCTTGAAACAATATTT----T--ACATTATCCTAAATTGCAGCAATTATCTGG-T-GAAGCAAGTGTATCTTATTAACATCTGAAGGTCAGGTAAGGCGCACACATAATTA-AACA-CAAAAGACTTACATTTCATTTGAGCTATGGTTATATCCAAAAAATGTCATATTCCCTCAATTAATCCACTGGCTTTAATTATGCACACCAT-TTACTAATAAAGCGCACTCAATGACATTCCAATGCGACATTACAATACC-GGAACTTAATTTGGATAGGTCACTGACGATATCATGTACAAAAGTACGTTAAGCGCGGGCAAATGAGAAAACTTTTCCAACCTGGAGTAAGCAAACAGTGAG--------TT--TACAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGA------------AT-AAA---CTTATAAATCGTGTCCATGATTGAAATGCACAAGCCTACACTG--TATATGCAATTATAGTTATTTGCATGATGTATTTATATTTGTT---TTGATACAAACATCATTAAGTAAT-TTGTTT-AAAAAC--AATCGTTGAC---A-GATTATCCAG---------AATACTAC---------ATTTAATC------------AAT-------TTGC--ATTAATTGAATATGGAAAGTTGTTAATAACATT------------------TAACTTATAACTATTTAACTAATAACTTTAAACTGTTTTATTGATGCATTATAAAGAGTGAATGTACGTATATATGTATTATGTTTTTTCTCTGTATGTTTTTGCA------------------AATAAACATGTA--T---TGTTGTGTCAATAAAC-aagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaccgaataaacttataaatcgtgtccatgattgaaatgcacaagcctacactgtatatgcaattatagttatttgcatgatgtatttatatttgttttgatacaaacatcattaagtaatttgtttaaaaacaatcgttgacagattatccagaatactacatttaatcaatttgcattaattgaatatggaaagttgttaataacatttaacttataactatttaactaataactttaaactgttttattgatgcattataaagagtgaatgtacgtatatatgtattatgttttttctctgtatgtttttgcaaataaacatgtattgttgtgtcaataaact
gi|4                          : ctttacgtgttttacgtgcagtacaatactttacattactttccaaaatatcattaagtatataccaactgcttgaaacaatattttacattatcctaaattgcagcaattatctggtgaagcaagtgtatcttattaacatctgaaggtcaggtaaggcgcacacataattaaacacaaaagacttacatttcatttgagctatggttatatccaaaaaatgtcatattccctcaattaatccactggctttaattatgcacaccatttactaataaagcgcactcaatgacattccaatgcgacattacaataccggaacttaatttggataggtcactgacgatatcatgtacaaaagtacgttaagcgcgggcaaatgagaaaacttttccaacctggagtaagcaaacagtgagtttacacaagctcacctacaaagatataaatgctcttatgacataaactctgattggccaTACGTTTGACAGTATGCTTAATTGCAGAAAGTATCTGG-TTAAA-CGAGTGT-------------CTG--------GTAAGGCGCACATATAAACA-AACG-CAACAGACTTACCTTTCATTTCAGCTATGGTTATATCCAAAAATAGTCATATTCCCTCAAGTAGTCAACTAGATTAATTTAT--ACACAGTATTACTAATAAACCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCGACGATATAATATC-A----------TGAATA-----------AAATCATGTA------------AAGCACGGGCAAATGAGAGAACTCTCCCAACTTAGAGTAAAGAGACAGTGAA--------AT--AACACAC------GCCCACTTACAAGGATATAAGTGTAT-AAATGCCGAATCAAATGGGTCCATGATTGAAATGTACAAGCCTGCATCG--CAT-----------------GGCATAATGTTATAACAGTTATT---Tt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGCAGTCAATGACAGTCCAATGCAGTATTACAATATC-A----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------AAGCAAGGACAAATGGGAAAACTCTCCCAATCTTGAGTAAACAGACAGTGAACTTAAAGGATTTAA-ATGT------GTAAA-TGCCAA------------AT-AAA---CTTATCA--------------TTGAGTGTACAAGCCTGCATTG---AT-----------------TGCATAATGCAGTTATATTTCTT---TTG------------------AA-------T-GAATACCGAAT-ATTGAC---ATTGTT---------------AATA--AC---------ATTTCA------------------------CTG---AT-------------------------AACGTT------------------AAAC-----------------------------TATTTTATTGATGCATTGTAAAGAGTGAATGTATA----TATGTATTTTGTTTCTTCTATGTATG-TTTTGTAAATTATCTAGTTCAAGGCAATAAACATGTAT-T---TGTTATGCCAATGAAC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A-TGTT---CAGAATCCTATAAATGCTACATTTAATCAATTGCATTGAATGAATATTGAATATTGAAATTGTTAAT-------------------------AATATT------------------TAACTAATAACT--------------TT-AAACTATTTTATTGACGCAATGTAAAGAGTGAAAGTATA----TATGT-------TTCTCCTCGGTATGTTTTTGTAAACCGTCTCATTCAAGACAATCAACATGTAT-A---TGTTATGCCAATAA---ACT--ATTG-AAA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatAATGACATTCCAATGCGACTATACCATTTCCA----------TGAATG-----------AAAGCACGTT------------GAGCACGTGAAGATGAGAAAACTCTCCCAACCTTGAGT----AGACGGTGTG--------TT--AACACGCCCATCTGCAAAGTTATGA------------ATGAAA---CTAATCGGCCAA--CAGTGCTTTTAATGCAGAAGCATACAACGATAAT-----------------TTTATGAT--AATGATA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ACGATGTCGGTTATATTCATGAAATATTGCTCAAAGTAACGCTACTGTTACATAGTCGTTGACAGTTACACTTTATCTTTAGACTTTTATAATTAATCAGTTTGCTTAAGTGAATATTAAAATTGTTAATAACATTTAA
Unaligned ( gi|14 ): AAAAAAAAATCATATACATGTAATAAGCATTGTGTATAATATACATATCAGCCGGATAAACCATTTCACAATATTTCTGGTGTTCAT
Unaligned ( gi|16 ): CAATTGTATAATGCAATTACAGTTATTTGCGTAATGCAATATATATT