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lowQualScore                  :           2  2  2 2    5   33   22222222  2 2    22  1     333     0 555555 1   666      5     5          000000   333 1 1                  4  2  
lowQualScore                  :           .  .  . .    .   ..   ........  . .    ..  .     ...     . ...... .   ...      .     .          ......   ... . .                  .  .  
lowQualScore                  :           7  7  2 2    7   11   44444444  2 4    66  7     000     6 666666 7   000      7     4          000000   000 3 8                  0  5  
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Reference ( gi|3 )            :    GTTAAAG-GAAATTA-CTTTAAAG--GTAC------GAA-CTAAAT--AT-TATCA---AGATAGTA-----T-TTGC--TGTTTTGATTTTGTTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCATAGTA
gi|8                          :    GTTAAAG-GAGATTG-CTTTGAAG--ATCT------GAA-CCAAAT--AT-TATCA---AGACAGTA-----T-TTGT--TGTTTTTATTATATTGCCAATAT------AAC---ACT-ACCTATTGAATGTCCCTCGT
gi|2                          :    GTTAAAA-GGTATAA-CTTTGAAG--ATAT------GAA-ACAAAT--AT-TATCA---ACATAATA-----T-TTGT--TGTTTTTATTTTATTACCAATAT------AAT---AAT-TCTTGTTGAACGTCCCTCGTATTA
gi|7                          :    GTTAA-G-AAAATAA-CTTTGAAG--ATAT------AAA-CTAAAT--AG-TATCA---AGATATTA-----A-GTGT--TGTTTGCATGCTGTTACCATTTT------AAC---ATT-ACTTATTGAACGCCCCT
gi|4                          :    GTTAAAG-GAGAT-A-CTTTGAAT--ATAT------AAA-CCAAAT--AT-TATTA---AGATATTC-----G-TTGT--TGTTTGCATTTTACTTTCAATAT------GAC---ATT-TCTTATTGAACGCCCCTCGTAggtat
gi|12                         : tctGTTAAAG-GAGATAA-CATTGAAG--GTCT------GAC-CCAGAT--AG-TTTCA---AGATGTTA-----T-TTGT--TGTTTTTATTCTATTACCATTAT------AAC---AAT-ACTTGTTGAACGc
gi|5                          :  ctGTTAAAATGAAAC---CTTTGAAG--GTAT------GAA-CCAACT--AT-TATCA---AGATATT------T-TTGT--TTTTTATATTTTATTAAAATTAT------AAC---ACA-ATTTATTAAACGCCCCTTGTAaac
gi|9                          : tctGTTAA-T-GAAGTTAACTTTGAAG--GTAT------GAA-ATAAAT--AT-TATCA---AGATGTTA-----A-TTTCAATATGTTAA-----TCACCAATAT------GAT---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTCGTta
gi|1                          :    tTTACAG-GAGATTC-CTTTGAAG--GTACATGTATGAA-CCATATTTAT-TATGATTCAGATAGT-----------T--TGTTCT---TTTATTACCAAAAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTAt
gi|16                         : tctaTTAAAA-GGA-TTA-CTTTGTAG--GTGT------GGA-CTAAAT--GT-CATCA---AGATA--------------------TT-ATTTTATTACCAATTT------AAC---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTTATAG
gi|24                         :  tgtTTAAAG-GAGATTA-CTTTATAA--ATAT------AAA-CCAAAT--AT-TATCA---AGATAGTA-----TCTTGT--TGTTg
gi|21                         :     aTAAAA-GAGATTA-CATTGAAG--ACAC------AAA-CCAAAT--AT-TATCA---AGATATTT-----T-TTTC--T------ATTTTATTACCAATAT------AAC---
gi|6                          :       AAAG-GAGATTA-CTTTCGAG--GTAT------AAAGCAAAAT--AG-TATCA---AGATATTAATTTAT-TTGT--TGTTTTTATTTTATTATCAACAT------AAC---AATCATTTTTTGAATGCCCCTCA
gi|15                         :         AG-AAGATTA-CTTTGAAG--GTAC------AAA-CTCAAT--AT-TACCA---ATATATTA-----T-TTTC---------ATTTGAATACCAATAT------AAC---ATT-ACTTATTGAACATCCCTCTTA
gi|11                         :        gtG-GAGATTA-CTTCGAAGAAGTA--------AA-CCAAAT--AT-AATCA---AGATATTA-----T-TTGC--TGTTTACATCTTATTACCAATAA------AGCTTTAAT-A---ATTGAACACCCCTCGTAtg
gi|13                         :           -GAGACTA-CTTTGGAG--GTAT------AAC-CTAAAG--ATATATTT---TTTTAGT--------TTGT--TATTTTGGTTTCCTT-------T------AGC---AAT-ACTTATTGAACGTCCCTCGTctt
gi|10                         :   gcattcctgtttATAA-CTTTGAAT--GTAT------AAA-TCAAAT--AT-AATCA---GAATGATA-----T-CTGT--TGTTTGTATTTTGTTACCAATAT------AAC---AAT-ATTTATGGAACGCTCATCGTA
gi|18                         :        aaacggtATTA-CTTTGAAG--ATAT------AAA-CCAAGT--AT-AATCA---ATGTATTA-----T-TTAT--TGTTTTTATTTTATTACCAATAT------GAT---AAT-ACTTt
gi|17                         :                 TA-CTTTGAAG--ATAA------AAA-CCAAAT--AG-TATCA---AGATAAAA-----T-TTGT--TGTTTTTATTTTATTACCATTAA------AAC---AAT-ACTTATTGAACACCCCTCAcgtatacat
gi|20                         :                                              AAAT--AT-TATCA---AGATATTA-----T-TTGT--TGTTTTCATTTTATTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGT
gi|19                         :                                              AAAT--AT-TATCA---AGATATTA-----T-TTGT--TGTTTTCATTTTATTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGT
gi|14                         :                                             cAAAT--AT-TACCA---AGATGTTG-----T-TTGT--AGTTTTTATTTTATTACTAATTT------AAC---AAA-ACTTAATGAGCGCCCTTTGTA
gi|22                         :                             taaaaagtgcatatcagttaaagga-TATCA---AGATATTA-----T-TGAT--TGTTTTTAGTTTATCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCCT
gi|23                         :                                                  atgg-TATCA---AGATATTA-----T-TGAT--TGTTTTTAGTTTATCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCC
gi|25                         :                                                                                 atggGTTTTTATTTTATTACCAATAT------AAC---AAT-ACATATTGAACGCCCCTCGTc





Alignments
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lowQualScore                  :                            .     .              ......       . ..       ...     . ........         . ..      . .          ......   ... . .                     .  
lowQualScore                  :                            4     0              111111       8 55       999     3 88888888         7 33      7 7          666666   999 8 7                     0  
consensus                     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
Reference ( family-5490 )     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
gi|1                          :                      TTACAG-GAGATTCCTTTGAAGGTACATGTATGAACCATA-TTTATTATGATTCAGATAGT-----------TTGTTC-T--T---TT-A-TTACCAAAAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|10                         :                    tctaAAAC-GGTATAACTTTGAATGTATA------AATCAAA-T--ATAATCA---GAATGATA-----T-CTGTTGTTT-G--TATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ATTTATGGAACGCTCATCGTA
gi|11                         :                           G-GAGATTACTTCGAAGAAGTA------AACCAAA-T--ATAATCA---AGATATTA-----T-TTGCTGTTT-A--CATCTT-A-TTACCAATAA------AGCTTTAAT-A---ATTGAACACCCCTCGTACt
gi|12                         :                     GTTAAAG-GAGATAACATTGAAGGTCTG------ACCCAGA-T--AGTTTCA---AGATGTTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTCT-A-TTACCATTAT------AAC---AAT-ACTTGTTGAACGt
gi|13                         :                          ct-GAGACTACTTTGGAGGTATA------ACCTAAA-G--AT----------ATATT------T-TTTTAGTTTGT--TATTTT-GGTTTCC--TTT------AGC---AAT-ACTTATTGAACGTCCCTCGTaac
gi|14                         :                                               gcattcctgtttAAA-T--ATTACCA---AGATGTTG-----T-TTGTAGTTT-T--TATTTT-A-TTACTAATTT------AAC---AAA-ACTTAATGAGCGCCCTTTGTA
gi|15                         : taaaaagtgcatatcagttaaaggaAG-AAGATTACTTTGAAGGTACA------AACTCAA-T--ATTACCA---ATATATTA-------------TTT-T--CATTTG-A-ATACCAATAT------AAC---ATT-ACTTATTGAACATCCCTCTTA
gi|16                         :                    gtTTAAAA-G-GATTACTTTGTAGGTGTG------GACTAAA-T--GTCATCA---AGATA--------------------T--TATTTT-A-TTACCAATTT------AAC---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTTATAGtg
gi|17                         :                               tgtTACTTTGAAGATAAA------AACCAAA-T--AGTATCA---AGATAAAA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCATTAA------AAC---AAT-ACTTATTGAACACCCCTCg
gi|18                         :                                ATTACTTTGAAGATATA------AACCAAG-T--ATAATCA---ATGTATTA-----T-TTATTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------GAT---AAT-ACTTa
gi|19                         :                                                          CAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGTcgtatacat
gi|2                          :                     GTTAAAA-GGTATAACTTTGAAGATATG------AAACAAA-T--ATTATCA---ACATAATA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAT---AAT-TCTTGTTGAACGTCCCTCGTATTA
gi|20                         :                                                           AAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGT
gi|21                         :                       TAAAA-GAGATTACATTGAAGACACA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATT------T-T-----TTT-C--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---
gi|22                         :                                                                    TATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCCT
gi|23                         :                                                                atggTATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCC
gi|24                         :                  atggTTAAAG-GAGATTACTTTATAAATATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----TCTTGTTGTTc
gi|25                         :                                                                                               aGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACATATTGAACGCCCCTCGT
gi|3                          :                     GTTAAAG-GAAATTACTTTAAAGGTACG------AACTAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----T-TTGCTGTTT-T--GATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCATAGTA
gi|4                          :                     GTTAAAG-GAGAT-ACTTTGAATATATA------AACCAAA-T--ATTATTA---AGATATTC-----G-TTGTTGTTT-G--CATTTT-A-CTTTCAATAT------GAC---ATT-TCTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|5                          :                  tctGTTAAAATGAAAC--CTTTGAAGGTATG------AACCAAC-T--ATTATCA---AGATATT------T-TTGTTTTTT-A--TATTTT-A-TTAAAATTAT------AAC---ACA-ATTTATTAAACGCCCCTTGTAc
gi|6                          :                     tctAAAG-GAGATTACTTTCGAGGTATA------AAGCAAAAT--AGTATCA---AGATATTAATTTAT-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTATCAACAT------AAC---AATCATTTTTTGAATGCCCCTCta
gi|7                          :                     GTTAA-G-AAAATAACTTTGAAGATATA------AACTAAA-T--AGTATCA---AGATATTA-----A-GTGTTGTTT-G--CATGCT-G-TTACCATTTT------AAC---ATT-ACTTATTGAACGCCCCTGGTAa
gi|8                          :                     GTTAAAG-GAGATTGCTTTGAAGATCTG------AACCAAA-T--ATTATCA---AGACAGTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTAT-A-TTGCCAATAT------AAC---ACT-ACCTATTGAATGTCCCTCGTt
gi|9                          :                     GTTAATG-AAGTTAACTTTGAAGGTATG------AAATAAA-T--ATTATCA---AGATGTTA------------ATTT-CAATATGTTAA-TCACCAATAT------GAT---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTCGT





Alignments
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lowQualScore                  :                            .     .              ......       . ..       ...     . ........         . ..      . .          ......   ... . .                     .  
lowQualScore                  :                            4     0              111111       8 55       999     3 88888888         7 33      7 7          666666   999 8 7                     0  
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Reference ( family-5490 )     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
gi|1                          :                      TTACAG-GAGATTCCTTTGAAGGTACATGTATGAACCATA-TTTATTATGATTCAGATAGT-----------TTGTTC-T--T---TT-A-TTACCAAAAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|10                         :                    tctaAAAC-GGTATAACTTTGAATGTATA------AATCAAA-T--ATAATCA---GAATGATA-----T-CTGTTGTTT-G--TATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ATTTATGGAACGCTCATCGTA
gi|11                         :                           G-GAGATTACTTCGAAGAAGTA------AACCAAA-T--ATAATCA---AGATATTA-----T-TTGCTGTTT-A--CATCTT-A-TTACCAATAA------AGCTTTAAT-A---ATTGAACACCCCTCGTACt
gi|12                         :                     GTTAAAG-GAGATAACATTGAAGGTCTG------ACCCAGA-T--AGTTTCA---AGATGTTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTCT-A-TTACCATTAT------AAC---AAT-ACTTGTTGAACGt
gi|13                         :                          ct-GAGACTACTTTGGAGGTATA------ACCTAAA-G--AT----------ATATT------T-TTTTAGTTTGT--TATTTT-GGTTTCC--TTT------AGC---AAT-ACTTATTGAACGTCCCTCGTaac
gi|14                         :                                               gcattcctgtttAAA-T--ATTACCA---AGATGTTG-----T-TTGTAGTTT-T--TATTTT-A-TTACTAATTT------AAC---AAA-ACTTAATGAGCGCCCTTTGTA
gi|15                         : taaaaagtgcatatcagttaaaggaAG-AAGATTACTTTGAAGGTACA------AACTCAA-T--ATTACCA---ATATATTA-------------TTT-T--CATTTG-A-ATACCAATAT------AAC---ATT-ACTTATTGAACATCCCTCTTA
gi|16                         :                    gtTTAAAA-G-GATTACTTTGTAGGTGTG------GACTAAA-T--GTCATCA---AGATA--------------------T--TATTTT-A-TTACCAATTT------AAC---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTTATAGtg
gi|17                         :                               tgtTACTTTGAAGATAAA------AACCAAA-T--AGTATCA---AGATAAAA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCATTAA------AAC---AAT-ACTTATTGAACACCCCTCg
gi|18                         :                                ATTACTTTGAAGATATA------AACCAAG-T--ATAATCA---ATGTATTA-----T-TTATTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------GAT---AAT-ACTTa
gi|19                         :                                                          CAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGTcgtatacat
gi|2                          :                     GTTAAAA-GGTATAACTTTGAAGATATG------AAACAAA-T--ATTATCA---ACATAATA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAT---AAT-TCTTGTTGAACGTCCCTCGTATTA
gi|20                         :                                                           AAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGT
gi|21                         :                       TAAAA-GAGATTACATTGAAGACACA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATT------T-T-----TTT-C--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---
gi|22                         :                                                                    TATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCCT
gi|23                         :                                                                atggTATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCC
gi|24                         :                  atggTTAAAG-GAGATTACTTTATAAATATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----TCTTGTTGTTc
gi|25                         :                                                                                               aGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACATATTGAACGCCCCTCGT
gi|3                          :                     GTTAAAG-GAAATTACTTTAAAGGTACG------AACTAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----T-TTGCTGTTT-T--GATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCATAGTA
gi|4                          :                     GTTAAAG-GAGAT-ACTTTGAATATATA------AACCAAA-T--ATTATTA---AGATATTC-----G-TTGTTGTTT-G--CATTTT-A-CTTTCAATAT------GAC---ATT-TCTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|5                          :                  tctGTTAAAATGAAAC--CTTTGAAGGTATG------AACCAAC-T--ATTATCA---AGATATT------T-TTGTTTTTT-A--TATTTT-A-TTAAAATTAT------AAC---ACA-ATTTATTAAACGCCCCTTGTAc
gi|6                          :                     tctAAAG-GAGATTACTTTCGAGGTATA------AAGCAAAAT--AGTATCA---AGATATTAATTTAT-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTATCAACAT------AAC---AATCATTTTTTGAATGCCCCTCta
gi|7                          :                     GTTAA-G-AAAATAACTTTGAAGATATA------AACTAAA-T--AGTATCA---AGATATTA-----A-GTGTTGTTT-G--CATGCT-G-TTACCATTTT------AAC---ATT-ACTTATTGAACGCCCCTGGTAa
gi|8                          :                     GTTAAAG-GAGATTGCTTTGAAGATCTG------AACCAAA-T--ATTATCA---AGACAGTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTAT-A-TTGCCAATAT------AAC---ACT-ACCTATTGAATGTCCCTCGTt
gi|9                          :                     GTTAATG-AAGTTAACTTTGAAGGTATG------AAATAAA-T--ATTATCA---AGATGTTA------------ATTT-CAATATGTTAA-TCACCAATAT------GAT---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTCGT


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blockSeqs                     :                            .     T              .            . .        .         CG               . .       . .          .        .     .                      
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blockSeqCons                  :                                                 ******         **       ***       AT******
originalCons                  :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
finalCons                     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTAT------TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA





Alignments
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consensus                     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
Reference ( family-5490 )     :                     GTTAAAG-GAGATTACTTTGAAGGTATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTANTA
gi|1                          :                      TTACAG-GAGATTCCTTTGAAGGTACATGTATGAACCATA-TTTATTATGATTCAGATAGT-----------TTGTTC-T--T---TT-A-TTACCAAAAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|10                         :                    tctaAAAC-GGTATAACTTTGAATGTATA------AATCAAA-T--ATAATCA---GAATGATA-----T-CTGTTGTTT-G--TATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ATTTATGGAACGCTCATCGTA
gi|11                         :                           G-GAGATTACTTCGAAGAAGTA------AACCAAA-T--ATAATCA---AGATATTA-----T-TTGCTGTTT-A--CATCTT-A-TTACCAATAA------AGCTTTAAT-A---ATTGAACACCCCTCGTACt
gi|12                         :                     GTTAAAG-GAGATAACATTGAAGGTCTG------ACCCAGA-T--AGTTTCA---AGATGTTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTCT-A-TTACCATTAT------AAC---AAT-ACTTGTTGAACGt
gi|13                         :                          ct-GAGACTACTTTGGAGGTATA------ACCTAAA-G--AT----------ATATT------T-TTTTAGTTTGT--TATTTT-GGTTTCC--TTT------AGC---AAT-ACTTATTGAACGTCCCTCGTaac
gi|14                         :                                               gcattcctgtttAAA-T--ATTACCA---AGATGTTG-----T-TTGTAGTTT-T--TATTTT-A-TTACTAATTT------AAC---AAA-ACTTAATGAGCGCCCTTTGTA
gi|15                         : taaaaagtgcatatcagttaaaggaAG-AAGATTACTTTGAAGGTACA------AACTCAA-T--ATTACCA---ATATATTA-------------TTT-T--CATTTG-A-ATACCAATAT------AAC---ATT-ACTTATTGAACATCCCTCTTA
gi|16                         :                    gtTTAAAA-G-GATTACTTTGTAGGTGTG------GACTAAA-T--GTCATCA---AGATA--------------------T--TATTTT-A-TTACCAATTT------AAC---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTTATAGtg
gi|17                         :                               tgtTACTTTGAAGATAAA------AACCAAA-T--AGTATCA---AGATAAAA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCATTAA------AAC---AAT-ACTTATTGAACACCCCTCg
gi|18                         :                                ATTACTTTGAAGATATA------AACCAAG-T--ATAATCA---ATGTATTA-----T-TTATTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------GAT---AAT-ACTTa
gi|19                         :                                                          CAAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGTcgtatacat
gi|2                          :                     GTTAAAA-GGTATAACTTTGAAGATATG------AAACAAA-T--ATTATCA---ACATAATA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAT---AAT-TCTTGTTGAACGTCCCTCGTATTA
gi|20                         :                                                           AAA-T--ATTATCA---AGATATTA-----T-TTGTTGTTT-T--CATTTT-A-TTACCAATATAACATAAAC---AAT-AATTATTGAATGCCCCTCGT
gi|21                         :                       TAAAA-GAGATTACATTGAAGACACA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATATT------T-T-----TTT-C--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---
gi|22                         :                                                                    TATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCCT
gi|23                         :                                                                atggTATCA---AGATATTA-----T-TGATTGTTT-T--TAGTTT-A-TCACCAGTAT------AAC---ACT-ACTTATTGACCACTCC
gi|24                         :                  atggTTAAAG-GAGATTACTTTATAAATATA------AACCAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----TCTTGTTGTTc
gi|25                         :                                                                                               aGTTT-T--TATTTT-A-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACATATTGAACGCCCCTCGT
gi|3                          :                     GTTAAAG-GAAATTACTTTAAAGGTACG------AACTAAA-T--ATTATCA---AGATAGTA-----T-TTGCTGTTT-T--GATTTT-G-TTACCAATAT------AAC---AAT-ACTTATTGAACGCCCCTCATAGTA
gi|4                          :                     GTTAAAG-GAGAT-ACTTTGAATATATA------AACCAAA-T--ATTATTA---AGATATTC-----G-TTGTTGTTT-G--CATTTT-A-CTTTCAATAT------GAC---ATT-TCTTATTGAACGCCCCTCGTA
gi|5                          :                  tctGTTAAAATGAAAC--CTTTGAAGGTATG------AACCAAC-T--ATTATCA---AGATATT------T-TTGTTTTTT-A--TATTTT-A-TTAAAATTAT------AAC---ACA-ATTTATTAAACGCCCCTTGTAc
gi|6                          :                     tctAAAG-GAGATTACTTTCGAGGTATA------AAGCAAAAT--AGTATCA---AGATATTAATTTAT-TTGTTGTTT-T--TATTTT-A-TTATCAACAT------AAC---AATCATTTTTTGAATGCCCCTCta
gi|7                          :                     GTTAA-G-AAAATAACTTTGAAGATATA------AACTAAA-T--AGTATCA---AGATATTA-----A-GTGTTGTTT-G--CATGCT-G-TTACCATTTT------AAC---ATT-ACTTATTGAACGCCCCTGGTAa
gi|8                          :                     GTTAAAG-GAGATTGCTTTGAAGATCTG------AACCAAA-T--ATTATCA---AGACAGTA-----T-TTGTTGTTT-T--TATTAT-A-TTGCCAATAT------AAC---ACT-ACCTATTGAATGTCCCTCGTt
gi|9                          :                     GTTAATG-AAGTTAACTTTGAAGGTATG------AAATAAA-T--ATTATCA---AGATGTTA------------ATTT-CAATATGTTAA-TCACCAATAT------GAT---ATT-ACTTATTGAATGTCCCTCGT