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Reference ( gi|1 ) : AAACTG---GATACTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGA-CC-CCT-CTGTGAAATGACCCCGGGG-----------------TCAAAATAC--------TA--TA-T------AGTAA--AACGACACCGG-GG--TCATTTT---GC---A---GCTA------TA--G---TAAAATGA---C-----C---CAC-AC-C-------TATAGTATATTGACCTCCCCTCT-------CCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAATCATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAAA-----------TATT----TTT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTAC-TGGAATA-GTGAAATTATA------AGATACTTA-----TCA--ACA-TCA-AT---ATA---CTCATTAAAG--AA--------TGA--T-TAG-TGCGG-T------G--GGA--C---------TGGGA--GA--GG----TGT-CAC-T-T-------G-------CCATTGT---G--------------C-TC--TA--G------C-----C--CC-ACTT---GTCCCCC-T---TA-TC-TCTCC-----------ATGTTT----A-GT-------TGCT---------T-TCAAAT--T--------G-CAAT-TGTGT-TA--TGT---GATCAAAATTTGT-T---------TT--AGCATTCATGAAT-C-TACAA--------G-A-AAT--T-----CAT-CATAACA---GC----TAA--A-----T-TT---------TAA------------A-A----------A------G-------------A---------------A---A--A----A--T--TG--------GGG--G-AG----GG-GT--G---------------------GGAGTCACTTA-ACCATGGCCATTGTAAAGTGACTTCC---CC-G---A---CCCC-A------------------C----A-TCTTT---TT---AT-GTTTAGTGATT--------TAG-TGT-TT--GG----------TGA---T--TAT-T----A-T-GTAT-TT---TGTGATCA--T-AATTTG-TT-TTATC-AT-TCATG-AAT-CTACAA--------G-A-AAT-----T-------CA-T----CAT-AA------T-A---G----T-T---AA--A-G-T---------TAA----A-----A-A----A----A-----A----A--AT-----T----G--------GG---G---GGG---GG-G--G-----G------------GAAGTCAC-TTT-ACTATGGCCATTGT-AAAGTGA----C-C---CTC---C-TCC-------C----AC---TACCC---A-C-G-T-CATCTCTT-----------CA------------TGTT-T-A---GT-------T-ATT-A---TC-AC--AT------T-AG---------A--------A---A------AT-GT--------G---T----T----AAA--T--T----A---T---TAT--A----A------CTTG----T--TT------------------A--A---G---A-A-----T----T----------CAG--G-A-----A-----T-C--------TAC--A------------------A------T---A----T------AT---T---T----------------T----------G---G------GGG--A-G---GGG-----GT----G------------G-G--TC--A-TTTT-ATCATGGCCATTGTATA---CTGAC--CC------C------------------------C--T---C------C-------C-------------------C---C-C--C-----T----------T-------T--A-T-AC-T--T---A---GT--GATTATCACAT-T------A-AACATGTG---T-TA--TG-TG-ATTA--------T-AA-TTTGTT---TTAG-CATTC----------ATG--AAT-C-----TACAA--------G-A-AA----T--T-----C--A---T-C----------A--TA----ACA---GT----TAAA-----T-TT--AA-TAA------AA-A---TA----A-------A----TT-T------------GGGA-G-A----G------------------AG-GGTT-------C-------ACTTT-ACC-ATGGCC--AGTGCATA-T----------------TG-----TCCCC----C----------------------C---G-----------C--ATCT-----CT----------TCA--TGTT--T-----A---GTGATT-A-TCAAA-T------AA-AA---C--AT-GTG-------TTTTG--T-G-ATTAA----AATTTG-----T---T---------TCAGCA-GTCA-AT-AA-T-CT---ACAA--------GACA----T--TCA---T-CATA----ACA---GT----T-A--A------A-A-----TT--TAAA---AA----A-----TA--A--AT--T---------T--T----------GGG--G-A-GT------------------GGG----------G----TCAC-TTTACTATGGC-CATT-----G----T------A----------T-----------C-----------A--------T------C----T---C---------ATC-TCTCCA---TGTTTA---GTTG------CT------A-T---CATATTATA--AT-TGTGTTATTTG-ACCA--------TAAA-T-TGTTCTAGT--ATTTGTG-A------TTC-TAAAA-GA-----GATTCATCAT-TG-CAG----TCAGT----TA--A--A-------TTAAAAA-----A-----AA----A---------T-----GGC-----GG---A---G----GGGGTG----------GG-GG---C-T--C---TTTACCATGGCCAC
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gi|11 : cattataacaatggttcagggtagatatttaatttatggactacttataaataaaacatgaaattatcatgcaacttttaacaacaattaaggcGT-CAC-T-TTACCATGG-------CCATTGT---A--------------T-AT--TG--G------C-----C--CCCACCC---CTTCCTCAT---GA-TCATCTC------------ATGTTT----A-GT-------GATT---------A-TTACAT--T--------A-TTAA-TGTGT-TA--TGT---GATTTTAATTTGT-T---------TT--AGCATTTGTGAAT-C-TACAA--------A-A-CAT--T-----CAT-CATTACA---GT----TAA--A-----T-TA---------AAA------------A-A----------A------A-------------ACAT------------A---A--A----T--T--TT--------GGG--G-AG--------T--G---------------------GG-GTCATATT-ACTATGACCATTGTATATCGATATCC---CC-G--------CAC-AG-----------------C----A-TCTCT---TT---AT-GTTTAATGATTATCACATATAA-TGT-TA--TG----------TGA---T--TA-------A-----AA-CT---TGTTA-------AACTTG-TT-TTTGC-AT-TCGTA-AAT-CCATAA--------G-A-TAT-----T-------CA-T----CAT-AA------C-A---G----T-T---AA--cactttgaatattgac
gi|9 : ggAT-T-T-------A-------CTATTGT---A--------------T-AT--TG--A------C-----C--CC-AC---------CCC-T---CA-TC-TCTTC-----------ATGTTA----A-GT-------GATT---------A-TCATATAAT--------A-CA---TGTGT-TA--TGT---GATGATGAGTTGT-T---------AT--TGCATTAGTGAAT-C-TACAA--------G-A-TAT--G-----CAT-CAAATCA---GT----TAC--A-----T-TT---------TAA------------A-T----------A------G-------------C---------------ATC-A--A----T--T--TGATATAGGTGGG--G-GG----GG-GG--G---------------------GGGGGGACTTT-ATCATGGCCATTGTAtttttttaa
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gi|16 : aagaagtgggggcggcca-------G-------CCATTGT---A--------------T-AT--TG--A------C-----T--CC-AA--------CACC-T---CA-TC-TTTTC-----------ATGTTT----A----------TGAT---------TATCACAT--T--------A-AAAA-CGTTT-TA--TGT---GATTATTATTTGT-T---------TT--AGCATTTATAAAT-C-TACAA--------G-A-CAT--T-----CAT-CATt
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gi|16 : T---GAT--GAATGTCT-T---------GT--AG-ATTTATAAATGC-TAAAA--------C-A-AAT--------AAT-AATCACA---------TAA--AACGT-T-TT---------TAATGTGATAATCATA-A----------ACAT---G-------------A---------------A---A--A--------------------GAT--G-AG----GT-GT--T---------------------GGAGTCAATAT-ACAATGGCCATGGTAAATTGAC--CC---CC-AATCA---CCCC-gtgacccccacctttctatattttttctctgataattattctgatttatatccaaaattagatttgtgcccttaacgtaagataaagttgactaaaaagtgatttgcatgataaaatagcgggggtagtcattttacaataggggggaggggtcattttactctctttatataaaatagctgtatacccatagtacaacggtggtcacaatactatacgacaccgggtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataataa
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gi|14 : aattgaattaaaatattaaaatcagttaaaacagtgtatatttcaatttcaatttaCTATTGTATATTGAC---C---CC-----A---CCCC-T------------------C----A-TCTCT---TC---AT-GTTAAGTGATT---------AT-CAT-------------------A---T--TATAC----A-T-GTGT-TA---TGTGATCA--T-AAGTTG-TT-CTTGC-AA-TTGTG-AAT-CTACAA--------G-A-TAT-----G-------CA-T----CAA-AA------C-A---A----T-T---AC--A-T-T---------TAA----A-----T-A----GCATCA-----ATTT-G--AT-----T----G--------AG---GTTAGGG---TG-T--G-----G------------GTGG-GAC-TTT-ATCATGGCCATTGT-Agttacgcatcaatacagttaaattttaaatatcgtcaatatgggggaggggatcattttattat
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gi|13 : ctttttcatggtttcagattttgactgtggaaatacttgccgtaaactgattgaggctagtgccggtattgtatagtattttgaccactctgtaaaattactatatagtaaaacgaccccggggtcattttaccgctatagtaaaatggctccacccactatagtaaattgactcactaatttatcaccaatacagttactttcttcttagtttaatgactaattattgtttatggatacagctcttgataaataattttgaataaaatctctccatgtcatacaatatatgacattatacataacagtcagttaaatttttaacaacaattatttgggggagt---G------GGG--T-G---GAG-----GT----G-----------------TC--A-GTTT-AATATGGCCATAATAAA---GTGAC--CC------C------------------------C--T---A------C-------CTGCT---------------C---C-C--C-----TAAACAA----T-------C--A-T-TCTT--T---G---GT--GGGGGTAAC-------------ACATGTGATTT-TT--TG-T--------------T-AA-TTTGTTAA-TTAATCATTTAGAG------ATG--CAT-C-----CGTAAAC------A-A-AA----C--T-----TGGG---T-CTTAAGTGGAGA--TA----A-A---AT----TAAC-----T-TT--AT-TGA------AG-C---TA----A-------A----TC---------------AAA-G-G----G------------------AG-GGGA-------C-------AATTT-ACTAATGG-T--AGTGatctttttatgtttagtgattatcacatttaacatgtgttttgtatcattatttgtttgaacattcatgaatctacaagaaattcatcataacagttaaattttaaaa
gi|17 : gggtaattttaccactacatgtatattaaaatgacatcccc------GGG--A-T---GAG-----G-----G------------G-A--TC--A-CTTT-ACTATGACAATTTTTAA---TTGAC--GC------C------------------------A--T---C------A-------C-------------------C---T-T--C-----T----------C----------A-T-GT-T--T---GTATGT--TTTTTTCACAT-A------A-TAAATGCA---T-AA--TA------------------AA-TGTGT------GG-TATTT----------CTG--AAT--------ACAA--------T-A-TA----T--T-----T--A---T-C----------AGTTA----A-----GT----TCAA-----T-TT--AA-ATA------AC-A---TT----A-------A----TT-T------------GGGG-G-accattttcttttaatagatatgctctatagtatttt
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gi|2 : aagaagt----G------------G-G--TC--A-CTTT-ACCATGGCTTTTGTAAA---GTGAC--CC------C------------------------CCAT---C------C-------C-------------------CACCC-C--CATCTTT----------T-------T--A-T-GT-T--T---A---GT--GATTATCACAT-T------A-AACATGTG---T-TT--TG-TG-AACA--------T-A-----------------ATTC----------GTG--AAT-C-----T---A--------G-A-AA----T--T-----A--A---T-C----------A--CA----ACA---GT----GTAA-----T-TT--AA-AAT------AA-A---TA----ATTCGGGGA----GT-T------------GGGG-G-G----G------------------GGAGGGT-------C-------ACTTG-ACT-ATGGCC--GTTGTAAAGT----------------TA-----CCCCCAT--C----------------------C---------------C--ATCT-----TT----------TTA--TGTT--T-----A---GTGATGAA-TCTAT-T------AG-AAACTC--ATCGTA-------C------C-A-GTTAA----A---TG-----T---T-------------------A-AT-AA----------AA--------TAAA----T--T---------TA----ACA---GT----T-A--ATTTT--T-T-----TT--TAAA---AA----A-----TG---------------------------------GGG--GCA-G-------------------GGG----------G----TCAC-TTTACCATGGC-TTTT-----G----T------AAAGTGACCCCC-----------C-----------AACCCCCACC------C----C---C---------ATC-TTTTTA---TGTTTA---GTGA------TT------A-T---CACATTA-A--ACATGTGTTTTGTG-AACA--------TAAT-T-TGTTTTAGC--ATTTGTG-A------ATC-TAAAA---------ATTAATCA-----CAA-----CAGTG---TA--A--T-------TTAAAAA-----A-----AG----A---------TAATTCGG------GG---AGTGG----GGGGTG----------GG-GGTGTC-A--C---TTGACTATGGCC
gi|11 : gtgtgcg----G------------G-G--TC--A-CTTT-ACCATGGCCATTGTATA---TTGGC--CC------C------------------------C--A---C------C-------C-------------------C---TTC--C-----TCATGATCATCT-------C--A-T-GT-T--T---A---GT--GATTATTACAT-T------A-TTAATGTG---T-TA--TG-TG-ATTT--------T-AA-TTTGTT---TTAG-CATTT----------GTG--AAT-C-----TACAA--------A-A-CA----T--T-----C--A---T-C----------A--TT----ACA---GT----TAAA-----T-TA--AA-AAA------AA-ACA-TA----A-------A----TT-T------------TGGG-G-A----G------------------TG-GGGT-------C-------ATATT-ACT-ATGACC--ATTGTATA-T----------------CGATA--TCCCC----G----------------------CACAG-----------C--ATCT-----CT----------TTA--TGTT--T-----A---ATGATT-A-TCACA-T------AT-AA----------TG-------TTATG--T-G-ATTAA----AACTTG-----T---TAAACTTGTTTTTGCA-TTCG-TA-AA-T-CC---ATAA--------GATA----T--TCA---T-CATA----ACA---GT----T-A--A------gttgtaaagtgacccccacccaatcttttatgtttagtgatgaatctacagaaacgcatcgtacacgttaaattttaataaaataaattgaacagttaattttttttttaaaaatggggggagggggtcactttaccatggccatcgtaaaatgacccccaccacgtttttatgtgattatcatattaaacatgtaatttgttttagcattcatgaatctacaagaaattaatcacaacagttaaattaaaaaaaaaattgggggagaccattgttaagtgacccccatctgtttaagtttaatgattatcacattatgtaatcataacagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctattgtaaagtgacccccctaatttgaggaggatgatgagtgggtcactttaccatggccattgtatattgcccccccccctcccccactgcccccctcgtctcttcatgtttagttatcatcacaattcatgtgattataataacattcatgaatttacaagaacttcatcataacagttaaatttgaagaaaaaaaaattggggggtcactttaccatggccattgtaaagtgacccccatcttcaccttttcccaatcttttcatgattctttatcaatgtggtatgtgagcatttgatcttgcatttgtaactctacaagatgttcatttatacagttaaattttgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
gi|9 : CTATTGTATA---TTGAC--CC------CA-----------------------C--C---C------C-------T-------------------CAT-C-T--C-----T----------T-------C--A-T-GT-T--A---A---GT--GATTATCATAT-A------A-TACATGTG---T-TA--TG-TG-ATGA--------T-GA-GTTGTT---ATTG-CATTA----------GTG--AAT-C-----TACAA--------G-A-TA----T--G-----C--A---T-C----------A--AA----TCA---GT----TACA-----T-TTTAAA-T-A------GC-A---TC----A-------A----TT-TGATATAGGTGGGGGGG-G-G----G------------------GG-GGGG-------G-------ACTTT-ATC-ATGGCC--ATTGTATC-TCACACACACAACCACATA-----ACCCC----C----------------------T---A-----------CTTATCT-----GA----------GCA--TACT--TG----A---GAAATG-G-TCACG-T------TA-TC---A--AT-GTG-------TTATG--T-A-ATCAT----AAGTTT-----T---T---------CCAGCA-TTTG-TG-AA-T-CT---ACAA--------GTTA----C--GCA---T-CAAT----ACA---GT----T-A--A------A-T-----TT--TAAA---TATC--G-----TC--A--AT--A---------T--G----------GGG--G-A-G-------------------GGG----------A----TCAT-TTTATTATtttttttaa
gi|3 : aattgaattaaaatattaaaatcagttaaaacagtgtatatttcaatttcaattta-----T----------T-------T--AGT-AA-T--T---A---GT--TATTATCACAT-T------T-AATATGTG---TATT--TG-TG-ATCA--------T-TA-TTTGTT---TTAG-CATTC----------TTG--AAT-C-----TACAA--------G-A-AA----T--T-----T--A---T-C----------T--TA----ATT---TT----T--------T-TT---------------------TA----G-------A----TTGT------------GGG--G-A----G------------------GG-GGT--------C-------ATTTTTACG-AAGGCC--ATTGTAAA-G----------------TGAC---TCCCCAC--C----------------------C---C-----------C--ATCT-----AT----------TTA--TGTT--T-----A---GTTATT-A-TCACA-T------TA-AA---C--AT-TTG-------TTTTG--G-GGATCAT----TATTCG-----T---T---------TTAGCA-TTCA-TG-AA-T-CT---ACAA--------GAAA----T--TTA---T-CACA----TCA---GT----T-A--A------A-------TC--TAAAT--AA----A-----AA--A--AA--T---------T--G----------GGG--G-A-ATCTG---------------GGG----------G----TCAC-TTTACCATAAC-CATT-----G----T------AAAGTGACC--C-----------C-----------A--------T------C----C---C---------AAT-TTTTTA---TGTTTA---GTGA------TT------A-T---CACATTA-A--ACATGTGTTATGTG-ATCA--------TAAT-T-TGTTTGAGC--ATTCTTG-A------ATC-TACAA-TA-----AATTCATC-T-TA--A------CAGT----TA--A--AATTGTTTTTAAAAA-----A-----
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gi|7 : AT-T------T-AAC---TG---T-TA--TGATG-A--------------A-TTTCTT---GTAG--ATTC----------ATG--AAT-G-----TTCAA--------ACA-AA----TAAT-----G--A---TAC----------A--AA----ACACATGT----TAAA-----T-GT--GA-TAATCACTAAACA---TA----A-------AAAGAT----------------GGT-G-A----G------------------GG-GGT--------C-------ACTTT-AAA-ATGACC--ATGGTAAA-G----------------TG-----ACCCC----T----------------------C---T-----------C--CACT-----CT----------gttaaatattaat
gi|5 : ctttttcatggtttcagattttgactgtggaaatacttgccgtaaactgattgaggctagtgccggtattgtatagtattttgaccactctgtaaaattactatatagtaaaacgaccccggggtcattttaccgctatagtaaaatggctccacccactatagtaaattgactcactaatttatcaccaatacagttactttcttcttagtttaatgactaattattgtttatggatacagctcttgataaataattttgaataaaatctctccatgtcatacaatatatgacattatacataacagtcagttaaatttttaacaacaattatttgggggagtagggggtgG-TG-ATCA--------T-AA-TTTGTT---TCAA-AATTC----------ATA--AAT-C-----TACAA--------G-A-AA----T--T-----C--A---T-A----------A--TT----ACA---GT----TAAA-----T-TG--AA-AAA------AACA---TA----A-------A----TT-T------------TGG--G-G----T------------------AG-GG-T-------A-------ACTTT-ACC-ATGGCC--ATTGTATA-T----------------TA-----ACCCC----C----------------------T---AT----------C--ATCT-----CT----------TTA--TGTT--A-----A---GTGATT-A-TCACATT------AC-AA---T---T-GTG-------TTTTG--T-G-ATCAT----TACTTG-----T---T---------CTAGCA-GTT--GT-GATT-CT---ACAC--------GATA----G--TCA---T-TATAATATATA---GT----T-A--A------tttaaaa
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gi|7 : TCC----------ATG----T-CA----TACAATATAT---G-A-CA----T--T--------A---TAC----------A--TA----ACA---GTCAGTTAAA-----T-TT--T--TAA------CA-A---CA----ATT-----A----TT-T------------GGGG-G-A----GTAGGGGGTGAGAGTGGAGAG-GGGT-------C-------ACTTT-ACC-ATGGTC--ATTTTAAA-G----------------TG-----ACCCC----CT---------------------C---A-----------CC-ATCT-----TT----------TTA--TGTT--T-----A---GTGATT-A-TCACA-T------TT-AA---C--AT-GTG-------TTTTG--T---ATCAT----TATTTG-----T---T---------TGAACA-TTCA-TG-AA-T-CT---ACAA--------GAAA----T--TCA---T-CATA----ACA---GT----T-A--A------A-T-----TT--TAAA---Agtgacccccacctttctatattttttctctgataattattctgatttatatccaaaattagatttgtgcccttaacgtaagataaagttgactaaaaagtgatttgcatgataaaatagcgggggtagtcattttacaataggggggaggggtcattttactctctttatataaaatagctgtatacccatagtacaacggtggtcacaatactatacgacaccgggtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataataa
gi|8 : ctttttcatggtttcagattttgactgtggaaatacttgccgtaaactgattgaggctagtgccggtattgtatagtattttgaccactctgtaaaattactatatagtaaaacgaccccggggtcattttaccgctatagtaaaatggctccacccactatagtaaattgactcactaatttatcaccaatacagttactttcttcttagtttaatgactaattattgtttatggatacagctcttgataaataattttgaataaaatctcACAT--------G-A-AA----T--T--------A---T-C----------A--TG-----CA---AC----T--------T-TT--AA-CAA------CA-A---TT----A-------A---------------------GGC-G-A----G------------------GG-GGGT-------C-------ACTTT-ACT-AT------AGT--ATA-T----------------TGA----TGCCC----C----------------------T---G-----------T--GTCTAGTCTCT----------GCA--TGTT--A-----A---GTGATT-A-TCACA-T------TATAA---T---T-GTG-------TTATG--T-G-ATCAT----AATTTG-----C---T---------GTAGCA-TTTG--T-GA-TACT---ACAATATATTCTGATAA---T--TCA---T-CATA----ACA---GT----T-A--T------A-T-----CT--TAAA---TA----G-----TA--ATAAT--T---------A--T----------GGA--G-A-GT------------------GGG----------T----TCAC-TTTAACATGAT-CATA-----G----C------A----------TATTGA------C-----------A--------C------CACTTT---C---------ATC-TCTTCA---TGTTTA---GTT---------------------------ATA--AT-TGTGTTATATA-GTCA--------TAAT-C-TGTTGTAGC--ATTTGTG-A------CTC-TACAA-GA-----AATTCATCAT-TA-CAG----TTAG------A--T--A-------TTTAAAA-----A-----AA----A---------C-----ATCAATTTGG---G---G----GAAGTG----------GG--------T--CACTTTTACCATG
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gi|17 : atttgggatgagggnnnnnnnnnn-T------------GGGATG-A----G-------------------G-GGAT-------C-------ACTTT-ACT-ATGACA--ATTTTTAA-T----------------TG-----ACGCC----A----------------------T---------------C--ACCT-----TC----------TCA--TGTT--T-----GTATGTTTTT-T-TCACA-T------AA-TA---A--AT-G------------CA--T-A-AT--A----AATGTGTGGTAT---T---------TC------TGA-A--------T---ACAA--------TATA----T--TTA---T----------CA---GT----T-A--AGTTC--A-A-----TT--TAAA---TA----A-----CATTA--AT--T---------T--G----------GGG--G-
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gi|9 : TT-------C-------AATTT-ACT-AT--------TGTATA-T----------------TG-----ACCCCACC-C----------------------C---T-----------C--ATCT-----CT----------TCA--TGTT--A-----A---GTGATT-A-TCATA-T------AA-TA---C--AT-GTG-------TTATG--T-G-ATGAT----GAGTTG-----T---T---------ATTGCA--TTA-GTGAA-T-CT---ACAA--------GATA----T--GCA---T-CAAA----TCA---GT----T-A--C------A-T-----TT--TAAA---TAGC--A-----TC--A--AT--T---------TGATATAGGTGGGGGGG--G-G-GG------------------GGG----------G----GGAC-TTTATCATGGC-CATT-----G----T------A----------T-----------CTCACACACACAA--------C------C----A---C---------ATA-ACCCCC---TACTTA---TCTGAGCATACTTGAGAAA-TGGTCACGTTATC--AA-TGTGTTATGTA-ATCA--------TAAG-T-TTTTCCAGC--ATTTGTG-A------ATC-TACAA-GT-----TACGCATCAA-TA---------CAGT----TA--A--ATT-----TTAAATATCGTCA-----AT----A---------T-----GGG-----GG---A---G----GGGATtttttaa
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Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGAGGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTAAAATGACCCCGGGGT---C-AANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACC-CCGGGGT--CAT---TTTA-C---AGCTA------T-------------AGTAAAATGAC--CCC---CCC-C-TA----TAGTAAANTGACCNCCCCC---------C--CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTANTTTCATCTCAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-CGATTATACCTATATCCC-----CCTTTACTGGAANA-GTGAANTTATAAGATATTTATCAACA-TCANTATAATCATTA--AANAATAATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-C---CACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATT--ACAANTGTGTTATGTG-ATCATAATTTGT-TTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCA-TA-ACAGT-TA-AATT-TT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------G------------GGGAG------G-----------GGT-GGGG--GT--CACTTTACNATGGCCATNGTAAAGTGAC--CCCC-----CAC-----C----CCA-CA-T----CTCT--TTATGTTTAGTG-ATTT----ANCGT-TT----A--TT-A-----TC-ATGTGTTNTGTGATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ACAGTTAAA------NTTAAAA-----AA----------------------AAAA-TTGGGGGGGGGGGGG-----------------------GTCACTTTACNATGGCCATNGTAAAGTGACCCCCC--TCCCAC-ACCCA-GTCATCTCTTCATGTTTAGTNATTA-------TCACATTA-AAAATGTGT-TANATTATCATAACTTGTTTNAGNATTCANGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCACTTT-ACCATGGCCATTGTANANTGACCCCCTCCC----CC-C--CT----------TTA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACATTAAACATGT-G---T-TATGTG-ATCATAATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCT----ACAAGANATTCATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTANATTGA---CCCC---CCN----C--ATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATNA-AACATGTGTTNTGTGATCA----T-----AATTTGTTTTAGCATTCGNNAATCTACAA--------GANA-TTCATCATAACAGTTAAA-----NTTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACCATGGCCATTG--T--ATT--CA-CC----C-----CATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTATAANTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCATTACAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGG-GGAGGGGGTGGGGGNAC-TTTACCATGGCCA
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gi|15 : aaGG---AGGG-GTCACT-------ATGGCCACTGTATATC-------------CCTC---CCCC-ATCCCAACACAAATACACATCG--CGCATCTCTGCATTTTTAA--GTTATTATACT--ATAATTGTGTTATGTG-ATCATATGTTGT-TCTATTATTTG-GAATCTACAAGATATTCATTA-AC-ACAGT-TA-AATA-TT---AA-ATA----------AC--------------AA--GA----ATTT--------G------------GGATG------A---------------GGGG--AT--CACTTTACTATGt
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gi|2 : gtgtgcTTTATGTTTAG---TGATGAATCTACA-GAAACGCATCG-TACAC-GT-TA-AATT-TTAATAA-A-ATAAATTGAACAGTTAATTTTTTTTTTAA--AA----ATGG--------G------------GGGAG------G-----------GG--------GT--CACTTTACCATGGCCATCGTAAAATGAC--CCCC------AC-----C------A-CG-T----TT----TTATGT-----G-ATT-----ATCATATT----A-----A-----AC-ATGT-------------AATTTGTTTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTAATCACA-ACAGTTAAA-------TTAAAA-----AA----------------------AAAA-TTGGGGGA-------------------------------------------GACCATTGTTAAGTGACCCC-------------------CATCTGTTTAAGTTTAATGATTA-------TCACATT-----ATGTA--------ATCATAAC-AGTTAAAATATTTTTTAA--A--------------ACAA------T-T----AGTGGGGGGTGTC----------G--------------AGGGA---GGTGAGTGG----GTAACTAA-ACTATGGCTATTGTAAAGTGACCCCCcagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctattgtaaagtgacccccctaatttgaggaggatgatgagtgggtcactttaccatggccattgtatattgcccccccccctcccccactgcccccctcgtctcttcatgtttagttatcatcacaattcatgtgattataataacattcatgaatttacaagaacttcatcataacagttaaatttgaagaaaaaaaaattggggggtcactttaccatggccattgtaaagtgacccccatcttcaccttttcccaatcttttcatgattctttatcaatgtggtatgtgagcatttgatcttgcatttgtaactctacaagatgttcatttatacagttaaattttgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
gi|2 : gtgtgcggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccatccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataattcgtgaatctagaaattaatcacaacagtgtaatttaaaataaataattcggggagttgggggggggagggtcacttgactatggccgttgtaaagttacccccatcccatctttttatgtttagtgatgaatctattagaaactcatcgtaccagttaaatgttaataaaataaatttaacagttaatttttttttaaaaaatgggggcagggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccaacccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataatttgttttagcatttgtgaatctaaaaattaatcacaacagtgtaatttaaaaaaagataattcggggagtggggggtgggggtgtcacttgactatggccgttgtaaagtgacccccacccaatctTGTAAAGTGACCCC----C---CTAATT-TG--------------AGGAGGATGATG-AGTGGGT--CAC---TTTA-CCATGGCCA------T-------------TGTATATTGCC--CCC---CCC-C-ctaatttgaggaggatgatgagtgggtcactttaccatggccattgtatattgcccccccccctcccccactgcccccctcgtctcttcatgtttagttatcatcacaattcatgtgattataataacattcatgaatttacaagaacttcatcataacagttaaatttgaagaaaaaaaaattggggggtcactttaccatggccattgtaaagtgacccccatcttcaccttttcccaatcttttcatgattctttatcaatgtggtatgtgagcatttgatcttgcatttgtaactctacaagatgttcatttatacagttaaattttgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
gi|2 : gtgtgcggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccatccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataattcgtgaatctagaaattaatcacaacagtgtaatttaaaataaataattcggggagttgggggggggagggtcacttgactatggccgttgtaaagttacccccatcccatctttttatgtttagtgatgaatctattagaaactcatcgtaccagttaaatgttaataaaataaatttaacagttaatttttttttaaaaaatgggggcagggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccaacccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataatttgttttagcatttgtgaatctaaaaattaatcacaacagtgtaatttaaaaaaagataattcggggagtggggggtgggggtgtcacttgactatggccgttgtaaagtgacccccacccaatcttttatgtttagtgatgaatctacagaaacgcatcgtacacgttaaattttaataaaataaattgaacagttaattttttttttaaaaatggggggagggggtcactttaccatggccatcgtaaaatgacccccaccacgtttttatgtgattatcatattaaacatgtaatttgttttagcattcatgaatctacaagaaattaatcacaacagttaaattaaaaaaaaaattgggggagaccattgttaagtgacccccatctgtttaagtttaatgattatcacattatgtaatcataacagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctat--GCAG-TG--GGGGAGGGG---GGGG-GGCAATAT-A-CAATGGCCATGGTAAAGTG-----------ACC-CACTCATC-ATCCT---------------C---CTCActcccccactgcccccctcgtctcttcatgtttagttatcatcacaattcatgtgattataataacattcatgaatttacaagaacttcatcataacagttaaatttgaagaaaaaaaaattggggggtcactttaccatggccattgtaaagtgacccccatcttcaccttttcccaatcttttcatgattctttatcaatgtggtatgtgagcatttgatcttgcatttgtaactctacaagatgttcatttatacagttaaattttgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
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consensus : AAACTGATTGA-N-CTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTT---ATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGT-TTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCA-TA-ACAGT-TA-AATT-TT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------G------------GGGAG------G-----------GGT-GGGG--GT--CACTTTACCATGGCCATTGTA------------AA----GTGAC--CCCC-----CAC-----CCCA-CATCTTTTTATGTTT-AGTGAT--TCATCGT-TT----ATT-A------CAT-GTGTTATGTGATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAAAA---------------------T----AAAA-TTGGGGGGGGGGGGG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC--NCCCGC-ACCC----AC--CATC--TCTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATTA-AA-ATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTAAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCACTTT-ACTATGGCCATTGTAAAGTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACATTAAACATGTG-TTATGTGA-T-T-A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGAT--CCCC----CCNCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGAC-CCCCTATCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGA-G-CTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TGATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATNNGATATTT---ATCNACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTANANTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGT-TTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCA-TA-ACAGT-TA-AATT-TT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------G------------GGGAG------G-----------GGT-GGGG--GT--CACTTTACCATGGCCATTGTA------------AA----GTGAC--CCCC-----CAC-----CCCA-CATCTTTTTATGTTT-AGTGAT--TTATCGT-TT----ATT-A-----TCAT-GTGTTATGTGATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAAAA---------------------T----AAAA-TTGGGGGGGGGGGGG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC--NCCCAC-ACCC----AC--CATC--TCTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATTA-AANATGTG---T-TTTGTGATCATAACTTGT---TTNAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCACTTT-ACTATGGCCATTGTAAAGTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TTA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACATTAAACATGTG-TTATGTGATT-T-A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGA---CCCC----CCNCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTNAC-CCCCTATCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
gi|1 : AAACTG---GATA-CTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAA-TACTA--TAT------AGTAAAACGACACCGGGGTCATT---TTGCAGCTA------TAGTAAAATGAC--CCA---CAC-CTA----TAGTATATTGACCTCCC-----------CTCTCCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-CATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAA-------ATATTT-------TT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTACTGGAATA-GTGAAATTATAAGATACTT---ATCAACA-TCAATATACTCATTA--AAGAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGACTGGGA---GAGGTGTCACTT---------GCCATTGTGCTCTA-----------GCC-CCACTTGTCCC---------------C---CTTATCTCTCCATGTTTAGTTGCTTTCAAATTGCAATTGTGTTATGTG-ATCAAAATTTGT-TTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCA-TA-ACAGC-TA-AATT-TT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------G------------GGGAG------G-----------GGT-GGGA--GT--CACTTAACCATGGCCATTGTA------------AA----GTGACTTCCCC-----GAC-----CCCA-CATCTTTTTATGTTT-AGTGAT--TTAGTGT-TTGGTGATT-A-----TTAT-GTATTTTGTGATCATAATTTGTTTTATCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ATAGTTAAA------GTT-----AAAAAA--------------------------AAAA-TTGGGGGGGGGGGGGAA---------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCTCC--TCCCACTACCC----ACGTCATC--TCTTCATGTTTAGTTATTA-------TCACATTAGAAAATGTG---T-TAAATTATTATAACTTGT---TTAAGAATTCAGGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCATTTT-ATCATGGCCATTGTATACTGAC-CCCCTCCC----CC--CC-T----------TTA-TACTTA---GTGATT-ATC-ACATTAAACATGTG-TTATGTGATTAT-A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----ATGAATCTACAA--GAAATT--CATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGAGAG---AGGGTTCACTTTACC-ATGGCCAGTGCATATTGT---CCCC----CCGCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCAAAT-AA-AACATGTGTTTTGTGATTA----A-----AATTTGTTTCAGCAGTCAATAATCTACAA--------GA-CATTCATCATAACAGTTAAA-----ATTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACTATGGCCATTGTA---TCAT-C-----TCATCTCTCCATGTTTAGTTGCTATCATATTATAATTGTGTTATTTGACCATAAATTGTTCTAGTATTTGTGATTCTAAAAGAGATTCATCATTGCAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGGCGGAGGGGGTGGGGGCTC-TTTACCATGGCCA
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gi|11 : gtacagatgactgccggtgtcctatagtattttgattctcgttgtaatgtaaccccggggtcactttgcagctatagtataattaacccactattgtaaattgaccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcacccctgatttattaccaataaagttactttcatctcagtttaaggactaattattgtttatggatacattctcttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacaccaagaaaacactcacgtttgtaaacgaaaaccattctattataGG----GTCACTTT-ACCATGGCCATTGTATATTGGC-CCCCACCC----CTT-CC-TCATGATCATCTCA-TGTTTA---GTGATT-ATT-ACATTATTAATGTG-TTATGTGATT-TTA--ATTTGTT--TTAG-CATTT----GTGAATCTACAA--AACATT--CATC----------A--TTACAGTTAA---ATTAAA-AAAAAACATAAATTTTGGGGAG---TGGGGTCATATTACT-ATGACCATTGTATATCGATATCCCCGCA-CAGCATCTCTTTATGTTTAATGATTATCACATATA-A-----TGTTATGTGATTAAAACTTGTTAAACTTGTTTTTGCATTCGTAAATCCATAA--------GA-TATTCATCATAACAGTTAAT-----TTTTg
gi|12 : ATTGA-T-TTG-GTCCCAGTGTTGTATATTACATGTATTTTAAAC-C-CT-CTCTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAT-TACTA--TAT------AGAAAATTGATCCCAAGGTCATTTGATCACCCCC-----------------AC--CCCA--CCC-ATA----TAGTTAACTGA----CC-----------C----CTCTGATTTATCA--TCAATAA------AGTTACTTT-ATCTCAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGATTATttaa
gi|13 : tggatgaacatcttaatatttgcaataaaggtatattgggataggataacattcctgcatcgcacgatggacttgtagcagtaattttttttggtgattttttGGGTAATT---TTACCACTACATGTATATTAAAATGACATCCC---CCA-CTACCATTAGTAAATTGTCCCCTC-----------C----CTTTGATTTAGCT--TCAATAA------AGTTAATTTTATCTCCACTTAAGA--CCCAAG-TTTTGTTTACGGATGCA-TCTCTAAATGATTA-------ATgcaatatgaa
gi|13 : --------------GGGGT---GG-AGGTG------TCAGTTT-AATATGGCCATAATAAAGTGAC-CCCCTACCTGCTCC--CC-TAAACAA----TCATTCTTTG---GTGGGG-GTA-AC-----ACATGTGATTTTTTG--T-T-A--ATTTGTTAATTAATCATTTAGAGATGCATCCGTAAACAAAACTTGGGTCTTAAGTGGAGA--TAA-AATTAA---CTTTAT-TGAAG--CTAAATCAAAGGGAG---GGGA--CAATTTACTAATGGtaacaaattaacaaaaaatcacatgtgttacccccaccaaagaatgattgtttaggggagcaggtagggggtcactttattatggccatattaaactgacacctccaccccaccattttcttttaatagatatgctctatagtatttt
gi|13 : gggtaattttaccactacatgtatattaaaatgacatcccccactaAAAA---------------------G----AAAA-TGGTGGGGTGGAGGT-----------------------GTCAGTTTAATATGGCCATAATAAAGTGACCCCCT--ACCTGC-TCCCCTAAAC--AATCATTCTTTG-GT---GGGGGTA-------ACAC--------ATGTGATTT-TTTGT-----TAATTTGTTAATTAATCATTaccattttcttttaatagatatgctctatagtatttt
gi|13 : gggtaattttaccactacatgtatattaaaatgacatcccccactaccattagtaaattgtcccctccctttgatttagcttcaataaagttaattttatctccacttaagacccaagttttgtttacggatgcatctcta-A-A----------AG--------------AA--TG----ATTGTTTA----G------------GGGAGC-----A-----------GGTAGGGG--GT--CACTTTATTATGGCCATATTA------------AA----CTGACA-CCTC-----CAC-----CCCACCATTTTCTTaatagatatgctctatagtatttt
gi|14 : gggtaattttaccactacatgtatattaaaatgacatcccccactaccattagtaaattgtcccctccctttgatttagcttcaataaagttaattttatctccacttaagacccaagttttgtttacggatgcatctctaaatgattaattaacaaattaacaaaaaatcacatgtgttacccccacc--GAAGTGGGG---GCGG--CCAATTT-A-C------TATTGTATATTG-----------ACC-CCACC---------------------C---CTCATCTCTTCATGTTAAGTGATTATCATATTATACATGTGTTATGTG-ATCATAAGTTGT-TCTTGCAATTGTGAATCTACAAGATATGCATCA-AA-ACAAT-TA-CA-T-TT---AA-A-T----------AG--------------CATCAATTTGATTG--------A------------GGTTA------G-----------GGT-GTGG--GTGGGACTTTATCATGGCCATTGTA------------ttaatagatatgctctatagtatttt
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gi|2 : gtgtgcTTTATGTTTAG---TGATGAATCTACA-GAAACGCATCG-TACAC-GT-TA-AATT-TTAATAA-A-ATAAATTGAACAGTTAATTTTTTTTTTAA--AA----ATGG--------G------------GGGAG------G-----------GG--------GT--CACTTTACCATGGCCATCGTA------------AA----ATGAC--CCCC------AC-----C--A-CGT--TTTTATGT------GAT--T-ATCATATT----A---A-----ACAT-GT-------------AATTTGTTTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTAATCACA-ACAGTTAAA-------TT-----AAAAAA--------------------------AAAA-TTGGGGGA-------------------------------------------GACCATTGTTAAGTGACCC---------------------C--CATC--TGTTTAAGTTTAATGATTA-------TCACATTA----------------TGTAATCATAAC-AGT---TAAAATATTTTTTAA--A--------------ACAA------T-T----AGTGGGGGGTGTC----------G--------------AGGGA---GGTGAGTGG----GTAACTAA-ACTATGGCTATTGTAAAGTGAC-CCCCcagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctattgtaaagtgacccccctaatttgaggaggatgatgagtgggtcactttaccatggccattgtatattgcccccccccctcccccactgcccccctcgtctcttcatgtttagttatcatcacaattcatgtgattataataacattcatgaatttacaagaacttcatcataacagttaaatttgaagaaaaaaaaattggggggtcactttaccatggccattgtaaagtgacccccatcttcaccttttcccaatcttttcatgattctttatcaatgtggtatgtgagcatttgatcttgcatttgtaactctacaagatgttcatttatacagttaaattttgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
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Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGAN-CTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGT-TTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCATA-ACAGT-TAAATTTT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------GGGGAG------GGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTA------------AA----GTGAC--CCCC-----CAC-----CCCACATCTTTTTATGTTT-AGTGAT--TCATCGTTT----ATTA--CATGTGTTATGTGATCATAATTTGTTTTAGCA-TT---CGTGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAAAA---------------------T----AAAA-TTGGGGGGGGGGGGG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC-NCCCGC-ACCC----AC--CATC--TCTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATT--AAA-ATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTAAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCACTTT-ACTATGGCCATTGTAAAGTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTATGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGACCCC-CTATCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
gi|1 : AAACTG---GATACTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAA-TACTA--TAT------AGTAAAACGACACCGGGGTCATT---TTGCAGCTA------TAGTAAAATGAC--CCA---CAC-CTA----TAGTATATTGACCTCCC-----------CTCTCCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-CATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAA-------ATATTT-------TT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTACTGGAATA-GTGAAATTATAAGATACTTATCAACA-TCAATATACTCATTA--AAGAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGACTGGGA---GAGGTGTCACTT---------GCCATTGTGCTCTA-----------GCC-CCACTTGTCCC---------------C---CTTATCTCTCCATGTTTAGTTGCTTTCAAATTGCAATTGTGTTATGTG-ATCAAAATTTGT-TTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ACAGC-TAAATTTT---AA-A-A----------AG--------------AA--AA----ATTG--------GGGGAG------GGGTGGGAGT--CACTTAACCATGGCCATTGTA------------AA----GTGACTTCCCC-----GAC-----CCCACATCTTTTTATGTTT-AGTGAT--TTAGTGTTTGGTGATTAT-TATGTATTTTGTGATCATAATTTGTTTTATCA-TT---CATGAATCTACAAGAAATTCATCATA-ATAGTTAAA------GTT-----AAAAAA--------------------------AAAA-TTGGGGGGGGGGGGGAA---------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCTCC-TCCCACTACCC----ACGTCATC--TCTTCATGTTTAGTTATTA-------TCACATTAGAAA-ATGTG---T-TAAATTATTATAACTTGT---TTAAGAATTCAGGAATCT--------------ACAA------TAT----A--------TTTT----------G--------------GGGGA---GG-GGGTGG----GTCATTTT-ATCATGGCCATTGTATACTGAC-CCCCTCCC----CC--CC-T----------TTA-TACTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTATGTG-ATTAT--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----ATGAATCTACAA--GAAATT--CATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGAGAG---AGGGTTCACTTTACC-ATGGCCAGTGCATATTG-TCCCCC-----C-----GCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCAAAT-AA-AACATGTGTTTTGTGATTA----A-----AATTTGTTTCAGCAGTCAATAATCTACAA--------GA-CATTCATCATAACAGTTAAA-----ATTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACTATGGCCATTGTAT--------C-ATCTCATCTCTCCATGTTTAGTTGCTATCATATTATAATTGTGTTATTTGACCATAAATTGTTCTAGTATTTGTGATTCTAAAAGAGATTCATCATTGCAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGGCGGAGGGGGTGGGGGCTC-TTTACCATGGCCA
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gi|20 : gtgtgcggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccatccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataattcgtgaatctagaaattaatcacaacagtgtaatttaaaataaataattcggggagttgggggggggagggtcacttgactatggccgttgtaaagttacccccatcccatctttttatgtttagtgatgaatctattagaaactcatcgtaccagttaaatgttaataaaataaatttaacagttaatttttttttaaaaaatgggggcagggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccaacccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataatttgttttagcatttgtgaatctaaaaattaatcacaacagtgtaatttaaaaaaagataattcggggagtggggggtgggggtgtcacttgactatggccgttgtaaagtgacccccacccaatcttttatgtttagtgatgaatctacagaaacgcatcgtacacgttaaattttaataaaataaattgaacagttaattttttttttaaaaatggggggagggggtcactttaccatggccatcgtaaaatgacccccaccacgtttttatgtgattatcatattaaacatgtaatttgttttagcattcatgaatctacaagaaattaatcacaacagttaaattaaaaaaaaaattgggggagaccattgttaagtgacccccatctgtttaagtttaatgattatcacattatgtaatcataacagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctattgtaaagtgacccccctaatttgaggaggatgatgagtGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CTATTGTATAATGACCCT----------ATC-CCCTA--TA-------AAT-AAATGACGCTGGtgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
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Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGATGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGAAATTCATCANAACAGT-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATTG--------GGGGAG------GGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTAAAGTGAC--CCCC-AC-CCCACAT------CTTTTT---A--T-G-------TTTAGTGAT--TCATCGTTT----ATTA---ATGTGTTATGTGATCATAATTTGTTTTAGCA-TT---CGTGA--ATCTACAAGAAAT-TCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAA-AA---------------------T----AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC-NCCCNC-ACCC----AC--CATC--TCTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATT--AAA-ATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTAAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCACTTT-ACTATGGCCATTGTAAAGTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTNCGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGACCCC-CTNTCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
gi|1 : AAACTG---GATACTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAA-TACTA--TAT------AGTAAAACGACACCGGGGTCATT---TTGCAGCTA------TAGTAAAATGAC--CCA---CAC-CTA----TAGTATATTGACCTCCC-----------CTCTCCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-CATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAA-------ATATTT-------TT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTACTGGAATA-GTGAAATTATAAGATACTTATCAACA-TCAATATACTCATTA--AAGAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGACTGGGA---GAGGTGTCACTT---------GCCATTGTGCTCTA-----------GCC-CCACTTGTCCC---------------C---CTTATCTCTCCATGTTTAGTTGCTTTCAAATTGCAATTGTGTTATGTG-ATCAAAATTTGTTTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCATAACAGC-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATTG--------GGGGAG------GGGTGGGAGT--CACTTAACCATGGCCATTGTAAAGTGACTTCCCCGAC-CCCACAT------CTTTTT---A--T-G-------TTTAGTGAT--TTAGTGTTTGGTGATTATT-ATGTATTTTGTGATCATAATTTGTTTTATCA-TT---CATGA--ATCTACAAGAAAT-TCATCATA-ATAGTTAAA------GTT-----AAAA-AA--------------------------AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GGAA---------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCTCC-TCCCACTACCC----ACGTCATC--TCTTCATGTTTAGTTATTA-------TCACATTAGAAA-ATGTG---T-TAAATTATTATAACTTGT---TTAAGAATTCAGGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCATTTT-ATCATGGCCATTGTATACTGAC-CCCCTCCC----CC--CC-T----------TTA-TACTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTATGTG-ATTAT--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----ATGAATCTACAA--GAAATT--CATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGAGAG---AGGGTTCACTTTACC-ATGGCCAGTGCATATTG-TCCCCC-----C-----GCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCAAAT-AA-AACATGTGTTTTGTGATTA----A-----AATTTGTTTCAGCAGTCAATAATCTACAA--------GA-CATTCATCATAACAGTTAAA-----ATTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACTATGGCCATTGTAT--------C-ATCTCATCTCTCCATGTTTAGTTGCTATCATATTATAATTGTGTTATTTGACCATAAATTGTTCTAGTATTTGTGATTCTAAAAGAGATTCATCATTGCAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGGCGGAGGGGGTGGGGGCTC-TTTACCATGGCCA
gi|10 : GATG--A-CTGCCGGTGTCCTATA------GTATTTTGATT-CTCG-TTGTAATGTAACCCCGGGGT---CACTT-TGC-AGCTAT------AGTATAATTAACCCA-----------------CTA------TTGTAAATTGAC--CCC---CCN-NNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCAC----CCCTGATTTATTA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTCAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACATTCTCT---TGc
gi|10 : gtacaA-GTAAAATTATAAGATATT-ATCCACA-TTGTTGTAATCATTA--AATAATGATT------AGT--GCGGCTGTCGGAGTAGGA---GGGG-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacaccaagaaaacactcacgtttgtaaacgaaaaccattctattataagtaaaattataagatattatccacattgttgtaatcattaaataatgattagtgcggctgtcggagtaggagggggg
gi|11 : gtacagatgactgccggtgtcctatagtattttgattctcgttgtaatgtaaccccggggtcactttgcagctatagtataattaacccactattgtaaattgaccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcacccctgatttattaccaataaagttactttcatctcagtttaaggactaattattgtttatggatacattctcttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacaccaagaaaacactcacgtttgtaaacgaaaaccattctattataGG----GTCACTTT-ACCATGGCCATTGTATATTGGC-CCCCACCC----CTT-CC-TCATGATCATCTCA-TGTTTA---GTGATT-ATT-ACAT--TATTAATGTG-TTATGTG-AT--TTTA--ATTTGTT--TTAG-CATTT----GTGAATCTACAA--AACATT--CATC----------A--TTACAGTTAA---ATTAAA-AAAAAACATAAATTTTGGGGAG---TGGGGTCATATTACT-ATGACCATTGTATATCGATATCCC-----CGCACAGCATCTCTTTATGTTTAATGATTATCACATATA-A-----TGTTATGTGATTAAAACTTGTTAAACTTGTTTTTGCATTCGTAAATCCATAA--------GA-TATTCATCATAACAGTTAAT-----TTTTg
gi|12 : ATTGAT-TTG-GTCCCAGTGTTGTATATTACATGTATTTTAAAC-C-CT-CTCTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAT-TACTA--TAT------AGAAAATTGATCCCAAGGTCATTTGATCACCCCC-----------------AC--CCCA--CCC-ATA----TAGTTAACTGA----CC-----------C----CTCTGATTTATCA--TCAATAA------AGTTACTTT-ATCTCAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGATTATttaa
gi|13 : tggatgaacatcttaatatttgcaataaaggtatattgggataggataacattcctgcatcgcacgatggacttgtagcagtaattttttttggtgattttttGGGTAATT---TTACCACTACATGTATATTAAAATGACATCCC---CCA-CTACCATTAGTAAATTGTCCCCTC-----------C----CTTTGATTTAGCT--TCAATAA------AGTTAATTTTATCTCCACTTAAGA--CCCAAG-TTTTGTTTACGGATGCA-TCTCTAAATGATTA-------ATgcaatatgaa
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gi|16 : aGG-GG--GGAGGGGTGATTGGGG-GTCAATTT-A-CCATGGCCATTGTATATTG-----------ACT-CCAAC-A-------------------C---CTCATCTTTTCATGTTTA-TGATTATCACATTAAAAACGTTTTATGTG-ATTATTATTTGTTTTAGCATTTATAAATCTACAAGACATTCATCAa
gi|17 : aaacgtgttgaatgtgatggggggaggcaGGGA---TGAGG-GG----ATCACTTT-ACTATGACAATTTTTAATTGAC-GCCATCAC----CT--TC-T-----------CA-TGTTTGTATGTTTTT-TTC-ACATAATAAA--------TGCATA-AT--A--A--ATGTGT-----GG-TATTT----CTGAAT--ACAA--TATATT--TATC----------AGTTAA--GTTCA---ATTTAA-ATAAC--ATTAATTTGGGGGtc
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lowQualScore : 3 88888 888888 9 4 4 6 88 000 4 0 1 11 666666 11 3 000 3 444444 5 99 555 0 6666 8 8 000 5555555555555555 0 88 888888 4 2 88 0 2 2 7 444 000 6666666 222222222222 2 88 0000000 2 0 0 44 8 6 5 0 0 2 2 88 0 2 888888 88 0 22 888 0 1 0000000 3 7 11111111111 4 2 0000000000000000000000000 1 6 1 4 3 4 8 6 0 0 0 1 0 0 4 77 1111 1111111111111111111111111 99 22222222 000000000 88 8888 000 0 0 666666666666666 000 7 0 888 22 5 7 22 2 0 8 7 5 5 7 333333 77777 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 6 0 7777 0 22222222222222222 66666666 7 8 0 0000000 2 55 2 55555 5555 555 0 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 777 7 99999 7 7 4 0 0 7 0 8888888888888888888888 7 777 7 7 333 5 0 7 77 33333333333 22 77 777777 5 666 9999999999999999999 00 4 6666 33 11111 1 4 000 0 7 6 4 0 66 000000000000 0 0 0 8 6 8 0 1111111111 4 7 4 77777777 7 000000 2222 22 66 4 8 44 4 00 8 4 0 2 0 6 0 0 0 0 00 2 2 55555 000 0 0 0 5
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Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGATGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCANAACAGT-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGNGGGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTA--------AAGTGAC--C------CCC-ATCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TCATCGTTT----ATTA---ATGTGTTAT-GTGATCATAATTTGTTTNAGCATTCGTGA--ATCTACAANAAAT-TCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAA-AA---------------------T----AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC-N--CCCNC-A---------------CCC----AC--CAT-CTTTTTATG-TTTAGTGATTA-------TCACATTA-AACATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTNAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAC-TTT-ACCATGGCCATTGTANANTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTNCGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGACCCC-CTNTCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
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gi|14 : gggtaattttaccactacatgtatattaaaatgacatcccccactaccattagtaaattgtcccctccctttgatttagcttcaataaagttaattttatctccacttaagacccaagttttgtttacggatgcatctcta--GAAGTGGGG---GCGG--CCAATTT-A-C------TATTGTATATTG-----------ACC-CCACC---------------------C---CTCATCTCTTCATGTTAAGTGATTATCATATTATACATGTGTTATGTG-ATCATAAGTTGTTCTTGCAATTGTGAATCTACAAGATATGCATCAAAACAAT-TACA-TTTAA-A-TAGCATCAATTTGATT--G--------AG----GTTAGGGTGTGGGTGGGACTTTATCATGGCCATTGTA--------aatagatatgctctatagtatttt
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gi|16 : aGG-GG--GGAGGGGTGATTGGGG-GTCAATTT-A-CCATGGCCATTGTATATTG-----------ACT-CCAAC-A-------------------C---CTCATCTTTTCATGTTTA-TGATTATCACATTAAAAACGTTTTATGTG-ATTATTATTTGTTTTAGCATTTATAAATCTACAAGACATTCATCAa
gi|17 : aaacgtgttgaatgtgatggggggaggcaGGGA---TGAGG-GG----ATCAC-TTT-ACTATGACAATTTTTAATTGAC-GCCATCAC----CT--TC-T-----------CA-TGTTTGTATGTTTTT-TTC-ACATAATAAA--------TGCATA-AT--A--A--ATGTGT-----GG-TATTT----CTGAAT--ACAA--TATATT--TATC----------AGTTAA--GTTCA---ATTTAA-ATAAC--ATTAATTTGGGGGtc
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gi|20 : gtgtgcggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccatccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataattcgtgaatctagaaattaatcacaacagtgtaatttaaaataaataattcggggagttgggggggggagggtcacttgactatggccgttgtaaagttacccccatcccatctttttatgtttagtgatgaatctattagaaactcatcgtaccagttaaatgttaataaaataaatttaacagttaatttttttttaaaaaatgggggcagggggtcactttaccatggcttttgtaaagtgaccccccaacccccacccccatctttttatgtttagtgattatcacattaaacatgtgttttgtgaacataatttgttttagcatttgtgaatctaaaaattaatcacaacagtgtaatttaaaaaaagataattcggggagtggggggtgggggtgtcacttgactatggccgttgtaaagtgacccccacccaatcttttatgtttagtgatgaatctacagaaacgcatcgtacacgttaaattttaataaaataaattgaacagttaattttttttttaaaaatggggggagggggtcactttaccatggccatcgtaaaatgacccccaccacgtttttatgtgattatcatattaaacatgtaatttgttttagcattcatgaatctacaagaaattaatcacaacagttaaattaaaaaaaaaattgggggagaccattgttaagtgacccccatctgtttaagtttaatgattatcacattatgtaatcataacagttaaaatattttttaaaacaattagtggggggtgtcgagggaggtgagtgggtaactaaactatggctattgtaaagtgacccccctaatttgaggaggatgatgagtGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CTATTGTATAATGACCCT----------ATC-CCCTA--TA-------AAT-AAATGACGCTGGtgggcttgatatgaagttatcacattataaagaggggcattgctttagtgattgtggaatga
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consensus : AAACTGATTGATGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCANAACAGT-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGNGGGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTA--------AAGTGAC--C------CCC-ATCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TCATCGTTT----ATTA---ATGTGTTAT-GTGATCATAATTTGTTTNAGCATTCGTGA--ATCTACAANAAAT-TCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAA-AA---------------------T----AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCCN-CCCNC-ACCC----AC--CATCTTTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATTA-AACATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTNAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAC-TTT-ACCATGGCCATTGTANANTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTNCGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGAC-CCCCTNTCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGATGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCANAACAGT-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGNGGGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTA--------AAGTGAC--C------CCC-ATCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TCATCGTTT----ATTA---ATGTGTTAT-GTGATCATAATTTGTTTNAGCATTCGTGA--ATCTACAANAAAT-TCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAA-AA---------------------T----AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GG-----------------------GTCACTNTACTATGGCCATNGTAAAGTGACCCCCCN-CCCGC-ACCC----AC--CATCTTTTTATGTTTAGTGATTA-------TCACATTA-AACATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTNAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAC-TTT-ACCATGGCCATTGTANANTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTNCGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGAC-CCCCTNTCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
gi|1 : AAACTG---GATACTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAA-TACTA--TAT------AGTAAAACGACACCGGGGTCATT---TTGCAGCTA------TAGTAAAATGAC--CCA---CAC-CTA----TAGTATATTGACCTCCC-----------CTCTCCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-CATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAA-------ATATTT-------TT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTACTGGAATA-GTGAAATTATAAGATACTTATCAACA-TCAATATACTCATTA--AAGAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGACTGGGA---GAGGTGTCACTT---------GCCATTGTGCTCTA-----------GCC-CCACTTGTCCC---------------C---CTTATCTCTCCATGTTTAGTTGCTTTCAAATTGCAATTGTGTTATGTG-ATCAAAATTTGTTTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCATAACAGC-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGAGGGGTGGGAGT--CACTTAACCATGGCCATTGTA--------AAGTGACTTC------CCCGACCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TTAGTGTTTGGTGATTATT-ATGTATTTT-GTGATCATAATTTGTTTTATCATTCATGA--ATCTACAAGAAAT-TCATCATA-ATAGTTAAA------GTT-----AAAA-AA--------------------------AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GGAA---------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCTCCT-CCCACTACCC----ACGTCATCTCTTCATGTTTAGTTATTA-------TCACATTAGAAAATGTG---T-TAAATTATTATAACTTGT---TTAAGAATTCAGGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAT-TTT-ATCATGGCCATTGTATACTGAC-CCCCTCCC----CC--CC-T----------TTA-TACTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTATGTG-ATTAT--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----ATGAATCTACAA--GAAATT--CATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGAGAG---AGGGTTCACTTTACC-ATGGCCAGTGCATATTG-TCCCCC-----C-----GCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCAAAT-AA-AACATGTGTTTTGTGATTA----A-----AATTTGTTTCAGCAGTCAATAATCTACAA--------GA-CATTCATCATAACAGTTAAA-----ATTTAAAAA--ATA--AATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACTATGGCCATTGTAT---------CATCTCATCTCTCCATGTTTAGTTGCTATCATATTATAATTGTGTTATTTGACCATAAATTGTTCTAGTATTTGTGATTCTAAAAGAGATTCATCATTGCAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGGCGGAGGGGGTGGGGGCTC-TTTACCATGGCCA
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gi|12 : ATTGAT-TTG-GTCCCAGTGTTGTATATTACATGTATTTTAAAC-C-CT-CTCTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAT-TACTA--TAT------AGAAAATTGATCCCAAGGTCATTTGATCACCCCC-----------------AC--CCCA--CCC-ATA----TAGTTAACTGA----CC-----------C----CTCTGATTTATCA--TCAATAA------AGTTACTTT-ATCTCAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGATTATttaa
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Reference ( family-5467 ) : AAACTGATTGATGCTA-GTGCCGGTGTCGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAANT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCCGGGGTCATT---TTACCGCTA------TAGTAAAATGAC--CCC---CCC-CTA----TAGTAAANTGACCCCCC-----------C----CNCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTATGGATACA-NCTCT---TGATAA-------ATATTT-------TT-TNATTATATCTATATCCC-----CCTTTACTGGGANA-GTGAAATTATANGATATTTATCCACA-TCANTATAATCATTA--AANAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGAGTGGGG---GGGG-GTCACTTT-A-C-ATGGCCATTGTATATTG-----------ACC-CCACC-GTCCC---------------C---CTCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCACATTANACATGTGTTATGTG-ATCATAATTTGTTTTAGCATTCGTGAATCTACAAGANATTCATCANAACAGT-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGNGGGGTGGGGGT--CACTTTACCATGGCCATTGTA--------AAGTGAC--C------CCC-ATCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TCATCGTTT----ATTA---ATGTGTTAT-GTGATCATAATTTGTTTNAGCATTCGTGA--ATCTACAANAAAT-TCATCATA-ACAGTTAAA------TTT-----AAAA-AA---------------------T----AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GG-----------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCCCC-N--CCCNC-A---------------CCC----AC--CAT-CTTTTTATG-TTTAGTGATTA-------TCACATTA-AACATGTG---T-TTTGTGATCATAATTTGT---TTNAGCATTCGTGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAC-TTT-ACCATGGCCATTGTANANTGAC-CCCCNCCC----CC--CC-T----------TCA-TGTTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTNCGTG-AT--T--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----GTGAATCTACAA--GAAATT--NATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGGGAG---GGGGGTCACTTTACC-ATGGCCATTGTATATTGATCCCCC-----C-----NCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACAT-TA-AACATGTGTTATGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAGCATTCGTGAATCTACAA--------GA-AATTCATCATAACAGTTAAA-----TTTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTNACTTTACCATGGCCATTGTATATTGACCCC-CTNTCATCTCTTTATGTTTAGTGATTATCACATTATAATTGTGTTATGTGATCATAANTTGTTCTAGCATTTGTGATTCTACANGANANTCATCATNACANNTAGTTAAGTTAAAAAAAACATCAATNNCGGGGGGGGTGGGGNCNCTTTTACCATGGCCA
gi|1 : AAACTG---GATACTAAGTGCCGGTGTTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCGGGGT---CAAAA-TACTA--TAT------AGTAAAACGACACCGGGGTCATT---TTGCAGCTA------TAGTAAAATGAC--CCA---CAC-CTA----TAGTATATTGACCTCCC-----------CTCTCCCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTACGTTTATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-CATTGTTTATTGATACA-TCTTT---TGATAA-------ATATTT-------TT-T--TTATATCTATATCCCAGGACCCTTTACTGGAATA-GTGAAATTATAAGATACTTATCAACA-TCAATATACTCATTA--AAGAATGATT------AGT--GCGG-TG--GGACTGGGA---GAGGTGTCACTT---------GCCATTGTGCTCTA-----------GCC-CCACTTGTCCC---------------C---CTTATCTCTCCATGTTTAGTTGCTTTCAAATTGCAATTGTGTTATGTG-ATCAAAATTTGTTTTAGCATTCATGAATCTACAAGAAATTCATCATAACAGC-TAAATTTTAA-A-AAGAA--AA----ATT--G--------GG----GGAGGGGTGGGAGT--CACTTAACCATGGCCATTGTA--------AAGTGACTTC------CCCGACCCCAC--ATCTTTTT---AT-GTTT-AGTGAT--TTAGTGTTTGGTGATTATT-ATGTATTTT-GTGATCATAATTTGTTTTATCATTCATGA--ATCTACAAGAAAT-TCATCATA-ATAGTTAAA------GTT-----AAAA-AA--------------------------AAAA-TTGGGGGG-------GGGGG-----GGAA---------------------GTCACTTTACTATGGCCATTGTAAAGTGACCCTCC-T--CCCACTA---------------CCC----ACGTCAT-CTCTTCATG-TTTAGTTATTA-------TCACATTAGAAAATGTG---T-TAAATTATTATAACTTGT---TTAAGAATTCAGGAATCT--------------ACAA------TAT----ATTTT----------G--------------GGGGA---GGGGGTGG----GTCAT-TTT-ATCATGGCCATTGTATACTGAC-CCCCTCCC----CC--CC-T----------TTA-TACTTA---GTGATT-ATC-ACAT--TAAACATGTG-TTATGTG-ATTAT--A--ATTTGTT--TTAG-CATTC----ATGAATCTACAA--GAAATT--CATC----------A--TAACAGTTAA---ATTTAA-TAAAA--ATAAATTTGGGAGAG---AGGGTTCACTTTACC-ATGGCCAGTGCATATTG-TCCCCC-----C-----GCATCTCTTCATGTTTAGTGATTATCAAAT-AA-AACATGTGTTTTGTGATTA----A-----AATTTGTTTCAGCAGTCAATAATCTACAA--------GA-CATTCATCATAACAGTTAAA-----ATTTAAAAA--ATAA--ATTTTGGGGAGTGGGGTCACTTTACTATGGCCATTGTAT--------C-ATCTCATCTCTCCATGTTTAGTTGCTATCATATTATAATTGTGTTATTTGACCATAAATTGTTCTAGTATTTGTGATTCTAAAAGAGATTCATCATTGCAGTCAGTTAAATTAAAAAAA-----AATGGCGGAGGGGGTGGGGGCTC-TTTACCATGGCCA
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gi|5 : gtgatcataatttgtttcaaaattcataaatctacaagaaattcataattacagttaaattgaaaaaaacataaattttggggtagggtaactttaccatggccattgtatattaaccccctatcatctctttatgttaagtgattatcacattacaattgtgttttgtgatcattacttgttctagcagttgtgattctacacgatagtcattataatatatagttaagtgacccccacctttctatattttttctctgataattattctgatttatatccaaaattagatttgtgcccttaacgtaagataaagttgactaaaaagtgatttgcatgataaaatagcgggggtagtcattttacaataggggggaGTGATCA----T-----AATTTGTTTCAAAATTCATAAATCTACAA--------GA-AATTCATAATTACAGTTAAA-----TTGAAAAAAACATAA--ATTTTGGG--GTAGGGTAACTTTACCATGGCCATTGTATATTAACCCC-CTATCATCTCTTTATGTTAAGTGATTATCACATTACAATTGTGTTTTGTGATCATTACTTGTTCTAGCAGTTGTGATTCTACACGATAGTCATTATAATATATAGTTAAGTgtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataataa
gi|5 : AGTAAAATGAC--CCCTCCCCC-CTA----TTGTAAAATGACTACCC-----------C----CGCTATTTTATCATGCAAATCACTTTTTAGTCAACTTTATCTTACGTTAAGGGCACAAATCTA--ATTT-TGGATATA-AATCA---GAATAA-------TTATgacccccacctttctatattttttctctgataattattctgatttatatccaaaattagatttgtgcccttaacgtaagataaagttgactaaaaagtgatttgcatgataaaatagcgggggtagtcattttacaataggggggaggggtcattttactctctttatataaaatagctgtatacccatagtacaacggtggtcacaatactatacgacaccgggtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataata
gi|5 : gtgatcataatttgtttcaaaattcataaatctacaagaaattcataattacagttaaattgaaaaaaacataaattttggggtagggtaactttaccatggccattgtatattaaccccctatcatctctttatgttaagtgattatcacattacaattgtgttttgtgatcattacttgttctagcagttgtgattctacacgatagtcattataatatatagttaagtgacccccacctttctatattttttctctgCCGGTGTCGTATA------GTATTGTGACCAC-CG-TTGTACTAT-------GGGTATACAGCTATTTTA--TATAAAGAGAGTAAAATGACCCCctctttatataaaatagctgtatacccatagtacaacggtggtcacaatactatacgacaccgggtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataata
gi|6 : gtgatcataatttgtttcaaaattcataaatctacaagaaattcataattacagttaaattgaaaaaaacataaattttggggtagggtaactttaccatggccattgtatattaaccccctatcatctctttatgttaagtgattatcacattacaattgtgttttgtgatcattacttgttctagcagttgtgattctacacgatagtcattataatatatagttaagtgacccccacctttctatattttttctctgataattattctgatttatatccaaaattagatttgtgcccttaacgtaagataaagttgactaaaaagtgatttgcatgataaaatagcgggggtagtcattttacaataggggggaCCAGTGCTGTATA------GTATTTTGACC-C-CT-CTGTGAAATGACCCCATGGT---CAAAT-TACTA--TAT------AGTAAAATGACCCT--GGTCATT---TTACCGCTA------AAGTAAATTGAC--TCC---TCT-CT-------------CCCCCCCCC-----------C----CCCTGATTTATCA--CCAATAA------AGTTATTTTCATCTTAGTTTAAGG--ACTAAT-TATTGTTTAT-AATATA-GAATT---TAAAAAAAAACACACATTTATTACTGTT-TTATTATACCTATAT--C-----CCTTTACTTGGAAA-GTGAAATTATTTGGTATTTgtctaattatagttaagacctttttgattctcgttctgtatttttggtgtaaatacaaatttccaatctattttctattaaagcatatgattcagtaatttagcacaataaggatagtttggtgtaaagtcctatgagcaatatgtgtaaatatacacatatcttgatgtgtacttatatatttgggtatattaggctgatctgaatatataataatataatatatatttctaaactccagatcatcaaccattgctataata
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blockSeqs : . . . . G A . C . . . . . . . . . . . A T TC C C . . T C . . . . GC . . . . AC A . . . AC G A C . T T A A T . . . . . G . T . . . T T . G G C . . C A . . . . T G . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AACATACGTTATATAATCCTTGTTTATTAACATTTAAAATTACATTTTCCTTAGTTAATTTTTATGATCGTGTATGATTTGAATATTGATCAATTCTAAATTAAGATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCCAGACAATCAAATAAGGTAGTAGA
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