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Reference ( gi|2 ) : ACCCACTTACTGCTTGTATAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTA-CTG-GT-TA----TTAAT--------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGAAAGTTAGTTACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTACA------CAA--------T--------T--T--A-AATAC--T-AAT----TTGG---------TA-ATA-T-A-AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AAT-T--TA-ATACTTCC----ATAAC-TGAAA--TA-TT--ATGCT-TTATAATGTTA-ATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-T-TG-T--------T------AACAT-------GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTC-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTCTTGTATTTATAGGCTAAAACA----TATATTAAATAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AA----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----AT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAA
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gi|20 : ACCCACTAACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACACAGGT--ATCTTTTTG-TCTATTTGTCT---TA-AAATAAGGTTTTAACTAA------AACAATCATGAAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT-ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAATCT----TGTTTGATATTTA-CTG-GTATA----TTAAT--------ATCAA-AATGTCACATTCTTAAACATGACAGTTAGTTACGATTATGA--TGTGATCCAGATAG--TATGTTCATACTA--TATAAATTTACA------CAATATCAATTT--------C--T--A-AATAT--G-AAT----TTGG---------AA-ATA-T-G-AT------TATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AAT-T--TA-ATAATTTC----ATAAC-TGAAA------T--ATGCT-TTATAGTGTTA-ATGACA--T--AGGTTA--ATTGA-T-TG-T--------T------AACAC-------A------ATAACCA-------TCA-TAATTATTGTGT---TTATAGGCTA-AA--------T--------CAT--AAATAATACA--G--T----T--T----A-ATAT-A------------CT------TTTGTATACGTT--TTTCTT-TG---TT-------TCC--AATACTTC-ttatatgtttgtgttaatctttaatagaattaaaattagttttggagtaataacaacatcatcagtaatttttatcagtttaatattgagttacaataattttaaactcagacattaattatttatctcataagacttggtgcaaaactattgtaacttgagttacaatagttttgcaccaaatataaatttagttttattgaattttcaacgcaacactattgtaactcaaa
gi|22 : ACGCACTTACCGCTTGTTTAGATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTCAATAAACCACAGGT--AT-CTTTTGGTCTATTTGTCT----AAAAATAAGGTTTTAACCAA------AACAATCACGTAGTATG-CAATTTGATCTGAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT-ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAAGCT----TGTTCAATATTTA-CTG-GTATA----TTAAT--------ATCAA-GATGTCACATTTTTAAACATGACAGTTAGTAACGATTATGC--TGTGGTCCACATAG--TATCTGCATACTA--TATCAATTTACA------CAA--------TATCAAT--T--TCCA-AGTAT--G-AAT----TTGG---------AA-ATA-T-A-GT------TATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AAT-T--TA-ATACTTTC----ATAAC-TGAAA--TA-TT--ATGCT-TTACAGTGTTA-ATGATA--T--AGGTTA--ATTGA-T-TG-T--------T------AACAT-------GA-----AA-ACTA-------T---CAA-------AA---TTATT--G---TA--------T--------T-T--ATAGGCTAAA--A--C----A--TAAACA-ATAC-A------------GC------TTAATATA---C--T---TTATA---Tttatatgtttgtattaacctttaattgaatttgaattagttaaattaggagtaataacaacataattttaaacagttttatattgagttaca
gi|9 : ACCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAGACGATACTTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACACACGT--ATCTTTTTG-TATATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACAAA------AACAATCATGTAGTATT-CAATTTGATCTCAACTACCTGTTGCGCCCAAGGA-AAAAAATCGTCAATAAATTT-ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATATTTA-CTG-GTATA----TTAAT--------ATCAG-AATGTCATATTCTTAAACATGACAGTTAGTTAGGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAA---TA-G------CAA--------T--------T--TCTA-AATAC--G-AAT----AAGA----------A-ATA-T-A-AT------TAAAT---ATAT----TAACT--T-ATATAAAAAT---AAT-T--TA-ATACTTTC----ATAAC-TGAAA--TA-TT--ATGCT-TTACGATGTTA-ATGACA--T--AAGTAA--ATTGA-T-CG-T--------T------AACAT-------GA-----AA-ACTA-------T-A-AAATTATTGTAT---TTATAGGCTAAAA--------C--------A-T--AAATAAT--ACAG--C----T--T----A-ATAT-A------------CT------TTTGTATA---T--GT--TTTTC---TTTACGT---CT--AATACTTCTTAT----ATGTTTGTGTAGAATTAAA-ATTA-GTTTTGGATAA---TAACAACAT--AATTTTT--AATAG--T---TTggttttctttatttccaatacatctgatatgtttgtgctaacctttaatagaatta
gi|26 : ATCCACTCACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAGTTTTTA-ACTAAATAAAACACAGG--TATCTTTTTG-TCTATT----TGTCTAAAAATAAGG-TTTATCCAA------AACAATCATGTAATATG-CAATTTGATCTCAA----------CAGCCTAGGT-AAAAGTTCGTCAATA-AATGTATAAGACTGAA---AACTACGTGTTTTTTCTTTATTACCTATACTTCTTAATATATATTTGTGT-TAATCTTTAATAGA-----ATTAA-AATtatattgagttacactatttttaagcttagaaattaatgatttatctcattaaacttggtgcaaatctattgttacttgagttacaatagttttgcaccaaatataaattcagttttattgaattttcaacgcaacactattgtaacattttgtttacattttatatctgacttacattaactgtagttttattaaacaacacaggca
gi|33 : ACCCACTTGCTGCTTGTTTAAATTCAAAAGATAAC-TTAT-CCAAATTTTGA-AATAAACAAAAAACAG--TTAT-CTTTTG----ATATATTTGTCTAAAAATGAGGTTTT-ATCAAGAATGTAACATTCTTG-AACATGACAATTtggttttggattaataacaacatacttttaaacagttttatattgagttacaataattttaaacttagaaattaattatttgtctcataaaacttggtgcaaaactattgttacttgagttacaatagttttgcaccaaatataaattcagttttattgaattttcgacgcaacactattgtaactcaa
gi|40 : ACCCAATAACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTagttatgattatgctgtggtccagatagcatctgcatactatataaatttacacaattgtcaatatcagtttcaaaaatgaatttggagtttatatattgcatctgaaaa
gi|27 : CCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAAATGATACCTTTTT-CCAAATTTTTTTACTAAATAAAACACAGGT--ATCTTTTTG-TCTATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATT-TAATGTGATCTCAACTGCCTATTGCGCCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATA-AATTTATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATATTTA-CTG-GTATA----TTAAT--------ATCAA-AAAGTCATATTCTTAAACATGACAGTTAGTTACGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATTAATTTACATAATATCAA--------T--------TTCT--A-AATAC--G-AAT----TTGG---------AA-ATA-T-A-AT------TGTA-------------------T-ATATTAAAAT---AAT-T--TA-TTAT---------TAAC-TGAAA--TA-TT--A
gi|19 : CCGCTGACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTTTCCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACTCAGGTATAT-TTTT-G-TCTATTTGTCT----ATGAATGAGGTTTTAACTAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGCT-AAAAATTTGTCAATAATTTTT-TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATATTTA-CTG-GTATA----TAAAT--------ATCAA-AATGTCACATTTTTAAACATGACAGTAAGTTACGATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--AATAAATTTACA------CAA--------TATCAATTTC--T--A-AATAC--G-AAT----TTTG---------AA-ATA-T-A-AA------TATAT---ATAT----TCACT--T-ATATTAACAT---AAT-T--TA-ATACTTTC----ATAAC-TGAAA--TA-TT--ATGCT-TTACAGCGTTA-ATGACA--T--A----A--ATTGA-T-TG-T--------T------AACAT-------GA-----GA-ATTA-------T-C-AAA-------AT---T
gi|13 : CCAA-ATTTTT-----AACTGAATAAAACA-CA-GG------TTTATT-TTT----TGTCT---ATTTGTCTG-TC-TA----T----------------A-AATGAGGT---TTTAACCAAAACAATCA--TA-TAGTATGCAATTTGATCTCAACTGCCTAT-TGCACCCTAGGTAAAAATTCAC-------CAA--------TATTTT---T--T--ATAAGAC--TGAA-------------------A-ACAAC-A-GT------TTTAT----TATC---TTGTT--TGATATTTAC-T---GGT-TATTA-ATAT---C----A-------AAA--TG-TTGCAT-CC-TTA-AAC-----ATGACAGTT--AG-TTACTATTATGT-TG-TGGTCCAGAT------AGTATCT-----GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AC---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAACTATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AA----CT-T--TAA-T--AGAGT---TAAA--ATTG----AT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--C---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAAattgtatttataggctaaaacgtatctaatacagcagctgcttaatttacttttgtatatgttttttttttatttccaatacttattatatgtttgtgttaacctttaatagaattaaaattggttttggattaataacaacataattttaaacagttttatattgggttacaatatttttaaacttagaaattaattatttatctcgtaaaacttgg
gi|33 : acccacttactgcttgtttaaatttaaacgataactttttA---AAAAACA-GT------T-----ATCT----T--TTGATAT--A-TTT-GTCTA----AAAATGAGGTTTTATCAAGAATGTAACATTCTTGAACATGACAATTAGTTATGATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--CATCTGCATACTA--TATAAATTTACA------CAA--------T--------TG-T--C-AATAT--C-AGT----TTCA----------A-AAA-TGA-ATTTGGAGTTTAT---ATAT----T
gi|14 : acccacttgctgcttgtttaaattcaaaagataacttatccaaattttgaaataaac--TAT-TGCACCCTAGGTAAAAATTCAC-------CAA--------TATTTT---T--T--ATAAGAC--TGAA-------------------A-ACAAC-A-GT------TTTAT----TATC---TTGTT--TGATATTTAC-T---GGT-TATTA-ATAT---C----A-------AAA--TG-TTGCAT-CC-TTA-AAC-----ATGACA--TTTAG-TTACTATTATGT-TG-TGGTCCAGAT------AGTATCT-----GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AA----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----AT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACATT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAAgcatctgaaaa
gi|17 : acccacttactgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactgaataaaacacaagtttattttttgtctatttgtctgtctataaatgaggttttaaccaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgccATAAATTTATA------AGA--------C--------T--G--A-AA-ACAAC-AAT----TT---------------TA-T-T-AT------CTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATTAATATCAAAATGT--CACATTCTTAA----ATA---TGACA---G-TT--A-GTTATTATTATGCTG--TGGTC--C--AG------ATAGT-----------------------ATCT-------GC-----AT-ACTT-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------TATCAATTTC-T--AAATATG--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-ATATAATATATATAT------TATATATA---TAATAACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CATTTATA-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAATGTTAAAGACAT--AA--GTT--AATTG--G---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-AGTATTGTATTTATAGGCTAAATCA----TA-----AATAATACAGC------TTAATATATTTTTGTGTA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-GTA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTTGTA-AC----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----GT-T---TT-AGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---C-T---C---TT-------AAA------C--T----T--A-GAAA-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTT-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-TACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-A
gi|11 : acccacttactgcttgtttaaatttaaacgatacctttttccatatttttaactaaataaaccacaggtttatttttgtctatttgtttgtctataaatgaggttttaaccaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccaggtaaaaaattcgtcaATAAATTTATA------AGA--------C--------T--G--A-AA-ACAAC-AGT----TT-----------TA-A-----A-AT------CTTGTTTGATAT----ATACTGGT-ATATTAATATCAAAAT-G--TC-ACATT-----------C-TTAAA--CA-TG--ACA----------GTTA-GTTAC-------GATTA----TGT-TGTG-G--------TCCAGAAAATATCT-----GC-----AC-ACTA-------T-A-TCA-------AT---TTACA--C---AA--------TATCAATTTC-T--AAATATG--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TATATATA---T--TAACTTATA---TAAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATACTTT--ACATTGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--A---TTG--TTAACATGAAAAC-TA---CCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAGT------TTAATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AT----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTA----GT-T---TT-GGAG-TA---A-------------TA-AC---AAC-ATCATCAGTAAT-T----TTT-ATCAGT-TT-A----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---A-T---T---TT-------AAA------C--T----C--A-G--A-C---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------A-------TA-AG----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---T---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAA
gi|20 : acccacttacagcttgtttaaatttaaacgataattttttccaaatttttaactaataaaacagaggtatctttttgtctatttgtctaaaaataaggttttaaccaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaattgcttattgcaccccaggtaaaaattcgtcaATAAATTTATA------AGA--------C--------T--G--A-AA-ACAAC-AGT----TT-----------TA-A-----A-AT------CTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATTAATATCAAAAT-G--TC-ACATTCTT----A-AACATGACAGTTAGTT--ACGA--TTATGATG-----TGATC--C--AG------ATAGT-A-TG-T--------T-------------------C-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AATATCAATTT--------C-T--AAATATG--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-G------------AT------TATATATA---T--TAACTTATA---TTAACATAATTT--AATAATTT-CAT----A-----------ACTGAAA---TATGCTTT--ATAGTGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--A---TTG--TTAACACAATAAC-CA---TCATA-ATTATTGTGTTTATAGGCTAAATCA---------TAAATAATACAGT------TTAATATACTTTTGTATA--CGTT-TTTCTTT-G-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTATTA-AC----CT-T--TAA-T--TGAAT---TTGA--ATTA----GT-TAAATTAGGAG-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------A
gi|22 : acccactaaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtcttaaaataaggttttaactaaaacaatcatgaagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccaggtaaaaattcgtcaATAAATTTATA------AGA--------C--------T--G--A-AA-ACAAC-AGT----TT-----------TA-A-----A-AG------CTTGTTCAATAT----TTACTGGT-ATATTAATATCAAGAT-G--TC-ACATTTTT----A-AAC---------------ATG-----ACA--GTTA-GTAAC-------GATTA----TGC-TGTGGT--------C------CACATAGTATCTGC-----AT-ACTA-------T-A-TCA-------AT---TTACA--C---AA--------TATCAAT--T-TCCAAGTATG--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------GT------TATATATA---T--TAACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAGTGTTAATGATAT--AG--GTT--AATTG--A---TTG--TTAACATGAAAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA---------TAAACAATACAGC------TTAATATACTT---TATA--TGGT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CATCTGA---TAT-GTTTGTGCTA-AC----CT-T--TAA-T--AGAAT---TA
gi|9 : acgcacttaccgcttgtttagatttaaacgataactttttccaaatttttaactcaataaaccacaggtatcttttggtctatttgtctaaaaataaggttttaaccaaaacaatcacgtagtatgcaatttgatctgaactgcctattgcaccccaggtaaaaattcgtcaATAAATTTATA------AGA--------C--------T--G--A-AA-ACAAC-AGT----TT---------------TA-T-A-AT------CTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATTAATATCAGAAT-G--TC-ATATTCTT----A-AACATGACAGTTAGTT--AGGAT-T-ATGATGT---------------GGTCC--A--GA-T-AG-T----------------ATCT-------GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------------TA-G--C---AA--------T--------T-TCTAAATACG--A--A--T----A---AGA-A-ATAT-A------------AT------TAAATATA---T--TAACTTATA---TAAAAATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACGATGTTAATGACAT--AA--GTA--AATTG--A---TCG--TTAACATGAAAAC-TA---T-AAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAGC------TTAATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----CGTC--T------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGT----------------------AGAAT---TAAA--ATTA----GT-T---TT-GGAT--A---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTT-AATAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------ACT---------A---T-T---T---TT-------AAG------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TG---A---TT-TATCTC-------A-------TT-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAATCTATTGT-TACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAAC
gi|24 : acccagttaccgcttgtttaaatttagacgatacttttttccaaatttttaactaaataaaacacacgtatctttttgtatatttgtctaaaaatgaggttttaacaaaaacaatcatgtagtattcaatttgatctcaactacctgttgcgcccaaggaaaaaaatcgtcaA------CAA--------T--------T--T--G-CATAT--T-AATAAAATTGA---------CACATA-T-A-AT------TT-AC---ATA--------------ATATT----T---AAT-T--TA-ATACTTTC----ATAAC-TGAAA--TC-TT--ATGCT-TTACAGTGTTA-ATGACA--T--AGATTA--ATTGA-T-TG-T--------T------AACATCAGA---ACTGTCAAT-ACTATTG----T-A-TAT-------ATAGGCTAAA--A---CA--------T--------C-A--AAAAAAC--A--G--C----T--T----A-ATAT-A------------CT------TTTGTATA---T--attttgtttacattttatatctgacttacattaactgtagttttattaaacaacacaggca
gi|19 : gcttattaatgaatcaacaaagtcgtattattTA-T-A-AT------CTTGTTTGATAT----TTACT--G-GTAT----AT---AA--------ATAT---C----A-------AAA--TG-TC--ACATT-TT-TAA----ACATGACAG-T--AAGTTACGATTATGC-TG-TGGTCCAGAT------AGTATCT-----GC-----AT-ACTA-------A-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------TATCAATTTC-T--AAATACG--A--A--T----T--TTGA-A-ATAT-A------------AA------TATATATA---T--TCACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAGCGTTAATGACAT--AA--------ATTG--A---TTG--TTAACATGAGAAT-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACG----TATCT-----AATACAGCAGCTGCTTAATTTACTTTTGTATA--TGTT-TTTTTTTTA-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTATTA---TAT-GTTTGTGTTA-AC----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----GT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GG------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGatgtttttttttttccccccccccccccccccccaatgcttctatatgtttgtgttaatctttaatggaattaaaaatgagtttgggttaataacaacataattttaaacaattgtatattcagttacaatattttaaactaaaaaattaattatttaattaaaaaatcttggtgcaaaactattataacttgagttacaatagttttgcactaaatctgaattcagtttttattgaattttcaatgcaacactattgtaacttaa
gi|33 : ccgctgactgcttgtttaaatttaaacgataacttttttccaaatttttaactaaataaaactcaggtatatttttgtctatttgtctatgaatgaggttttaactaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccagctaaaaatttgtcaataattttttaagactgaaaacaacagttt--------T------AGCATCT-----GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------TGT--CAATATC--A--G--T----T--TCAA-A-A-ATGA------------ATTTGGAGTTTATATA---T--T
gi|23 : acccacttgctgcttgtttaaattcaaaagataacttatccaaattttgaaataaacaaaaaacagttatcttttgatatatttgtctaaaaatgaggttttatcaagaatgtaacattcttgaacatgacaattagttatgattatgctgtggtccagaT-------GC-----AT-ACTA-------C-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTAGTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA---------TAAATAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTgcatctgaaaa
gi|16 : acccacttactgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactgaataaaacacaggtttatattttgtctatttgtctgtctataaatgaggttttaaccaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccctaggtaaaaattcaccaatattttttataagactgaaaacaacagttttattatcttgtttgatatttactggttattaatatcaaaatgtcgcatccttaaacatgacagttagttactattatgttgtggtccagatagtatcT-------GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAAC------TTTAAATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AA----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----AT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAA
gi|12 : acccacttactacttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactgacaggtttattttttgtctatttgtctgtctataaatgaggttttaaccaaaacaaacatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccctagttaaaagttcactaatattttttataagactgaaaacaacagttttattatcttgtttgatatttactggttattaatatcaaaatgttgcatccttaaacatgacagttagttactattatgttgtggtccagatagtatcT-------GC-----AT-ACTA-------T-A-TAA-------AT---TTACA--C---AA--------T--------T-T--AAATACT--A--A--T----T--TGGA-A-ATAT-A------------AT------TTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTT-CAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AG--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA----TA-----AATAATACAAC------TTTAAATACTTTTGTATA--TGTT-TTTCTTT-A-----TTTC--C------------------A-ATA-CTTCTTA---TAT-GTTTGTGTTA-AA----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----AT-T---TT-GTAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------AAT-T----TTA-AACATT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---T-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TATCTC-------G-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCAACGC--AACACTATTGTAACTCAAA
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gi|26 : ttttgcataaattactgtagttttacaatgtgcatcttgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatgcacaaattcTT-TTTCTTT-A-----TTAC--C------------------T-ATA-CTTCTTAATATAT-ATTTGTGTTA-AT----CT-T--TAA-T--AGAAT---TAAA--ATTG----GT-T---TT-GGAT-TA---A-------------TA-AC---AAC-AT-------ACT-T----TTA-AACAGT-TT-T----ATATT-GA------G--TTAC------AAT---------A---A-T---T---TT-------AAA------C--T----T--A-G--A-A---AT-T------------A-A---TT---A---TT-TGTCTC-------A-------TA-AA----AC-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-TACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAA-AT--------A-TAAAT--T---C---AG--TT---T-T-----A-----TTGA--------A-------TT-T---TCGACGC--AACACTATTGTAACTCAAgagactttatattttttttttttttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtgctataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgtattttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttattatatcagtactagaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaattaatttg
gi|8 : atccactcaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaagtttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtctaaaaataaggtttatccaaaacaatcatgtaatatgcaatttgatctcaacagcctaggtaaaagttcgtcaataaatgtataagactgaaaactacgtgtCTGT-A-----TTTCTTC------------------A-AAATCTTTTTA---AAT-TTTT---CTA-AA----CT-A--TCA-TTTGAAAC---TAATGTATTGCAATAT-TC--TT-GGAC-TA---AATAAAAGTGTGGTTATAC---AAG-AT-------AAC-TGGGTTTA-ATAAAA-TT-T----AAATTCAA------G--TTAC------AAT---------A---G-T---T---TT-------GCA------C--CAA--T--A-T--A-A---AT-A------------A-A---G------------GTCTC-------C-------AA-GATATTAT-----T-------T-GGTGCAAAACTATTGT-AACTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCGCTAA-A
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gi|10 : tttttttgcataaattactgtagttttacaatgtgcatcttgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattct-----T-------T-AGCGCAAAACTATTGT-GATTTGAATT-GCAATAGTATTGGACCAA-AT------------AAT-----------A--TC---T-T-----GGAGACTTTA--------A-------TT-TATATCGGTGC--AAAACTATTGTAATTTGAAtttaaattttattaaacccagttatcttgtataaccacacttttatttagtccaagaatattgcaatacattagcttcaaatgatagttcagaaaaatctagcaagatttagaagaaataaaggtatagatatttttttttttttttttactcatctttgataacatttgaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtgctataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtgctagaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaattaatttg
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|23 : ACCCACTTACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-ATTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGT-TATTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--CATAAATTTAC--A------CAA--------T-----T--T---A-AATACTA--ATTTGGAAATA-T-A----------ATTT------TAT---ATAT----TTAGT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGAAATATT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-T-TGT--------T------AACAT--GAGAACTA-------T---CAA-------AA-TTATT--G---TAT--------T-T--ATAGGCT--A--AAAC----A--TAAATA-ATACA------------ACTTTATATA---C--TT--TTGTA---T---ggttttctttatttccaatacatctgatatgtttgtgctaacctttaatagaatta
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gi|26 : gcttattaatgaatcaacaaagtcgtattattATCCACTCACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAGTTTTTA-ACTAAATAAAACACAGG--TATCTTTTTG-TCTATT----TGTCTAAAAATAAGG-TTTATCCAA------AACAATCATGTAATATG-CAATTTGATCTCAACAGCCT----------AGGT-AAAAGTTCGTCAATA-AATGTATAAGACTGAA---AACTACGTGTTTTTTCTTTATTACCTATACTTCTTAATATATATT--TGTGTTAAT---------
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Reference ( family-5449 ) : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATANNTTTT---ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGTATATTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T-----T--------------T---AAATACGA--ATTTGGAAATA-TA----------ATTTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAACGTTAATGACA--T--AGGTT--A--AT--TGT-TTGT--------TAACAT--GAGAACTAT-ATAA-------AT-TTACA--C---AAT--------T-T--ANATACT--AAT----T--TGGA-A-ATATA------------ATTTTATATA---T--TTNCTTATA---TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATA---TAAA-TAATACAGC------TTNATATACTTTTGTATATGTTTTTCTTT-ATTTC--C------------------AATA-CTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--AT--AGAAT--TAAA--AT-TG----AT-T---TT---GGATTA---A-------------TA-ACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AAT--TTT----A----TATT-GA-GTT--ACAAT---------AT-TTTTGAA----------C-T----TA----G--AA---AT-T------------AA---TT---AT--T-TAT-CTCG-A--A-----A-----A----C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---NAG--T----T---T------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
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gi|19 : TA-TA----------ATCTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATAAATATCAAAATG--TCACATTTTT----A-AACATGACAG--TAAGTT--ACGAT-T----ATGCTG-TGGTC--C--AGAT------AG--TAT-CTG------------CAT------ACTAA-ATAA-------AT-TTACA--C---AATATCAATTTC-T--AAATACG--AAT----T--TTGA-A-ATATA------------AATATATATA---T--TCACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAGCGTTAATGACAT--AA--------ATTG--A---TTG--TTAACATGAGAAT-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACGTA---TC---TAATACAGCAGCTGCTTAATTTACTTTTGTATATGTTTTTTTTTTATTTC--C------------------AATA-CTTATTA---TATGTTTGTGTTAACCTTTA--AT--AGAAT--TAAA--AT-TG----GT-T---TT---GGATTA---A-------------TA-ACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT----A----TATT-GG-GTT--ACAAT---------AT-TTTTAAA----------C-T----TA----G--AA---AT-T------------AA---TT---AT--T-TAT-CTCGTA--A-----A-----A----C---------T-------TGGaacgtatctaatacagcagctgcttaatttacttttgtatatgttttttttttatttccaatacttattatatgtttgtgttaacctttaatagaattaaaattggttttggattaataacaacataattttaaacagttttatattgggttacaatatttttaaacttagaaattaattatttatctcgtaaaacttgg
gi|2 : ccgctgactgcttgtttaaatttaaacgataacttttttccaaatttttaactaaataaaactcaggtatatttttgtctatttgtctatgaatgaggttttaactaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccagctaaaaatttgtcaataattttttaagactgaaaacaacagtttACCCACTTACTGCTTGTATAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTT---ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGT-TATTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGAAAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T-----T--------------T---AAATACTA--ATTTGGTAATA-TA----------ATTTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTCC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTT--A--AT--TGT-TTGT--------TAACAT--GCATACTAT-ATAA-------AT-TTACA--C---AAT--------T-T--AAATACT--AAT----T--TGGA-A-ATATA------------ATTTTATATA---T--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTT-CCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAATGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTCTTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATATATTAAA-TAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATATGTTTTTCTTT-ATTTC--C------------------AATA-CTTCTTA---TATGTTTGTGTTAAACTTTA--AT--AGAAT--TAAA--AT-TG----AT-T---TT---GGATTA---A-------------TA-ACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT----A----TATT-GA-GTT--ACAAT---------AT-TTTTAAA----------C-T----TA----G--AA---AT-T------------AA---TT---AT--T-TAT-CTCGTA--A-----A-----A----C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-ACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---CAG--T----T---T------T----ATTGA-A----TT-T-------TCAACGCAACACTATTGTAACTCAAA
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gi|22 : ACGCACTTACCGCTTGTTTAGATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTCAATAAACCACAGGT--AT-CTTTTGGTCTATTTGTCT----AAAAATAAGGTTTTAACCAA------AACAATCACGTAGTATG-CAATTTGATCTGAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT----ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAAGCT----TGTTCAATATTTACTGGTATATTAAT---------ATCAA-GATGTCACATTTTTAAACATGACAGTTA-GT-AACGATTATGC--TGTGGTCCACATAG--TATCTGCATACTA--TATCAATTTAC--A------CAA--------TATCAAT--------------TTCCAAGTATGA--ATTTGGAAATA-TA----------GTTATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAGTGTTAATGATA--T--AGGTT--A--AT--TGA-TTGT--------TAACAT--GAAAACTAT--CAA-------AA-TTATT--G---TAT--------T-T--ATAGGCTAAAAC----A--TAAACA-ATACA------------GCTTAATATA---C--T---TTATA---Ttgtttgtattaacctttaattgaatttgaattagttaaattaggagtaataacaacataattttaaacagttttatattgagttaca
gi|23 : ACCCACTTACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-ATTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTT---ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGT-TATTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--CATAAATTTAC--A------CAA--------T-----T--------------T---AAATACTA--ATTTGGAAATA-TA----------ATTTTAT---ATAT----TTAGT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTT--A--AT--TGT-TTGT--------TAACAT--GAGAACTAT--CAA-------AA-TTATT--G---TAT--------T-T--ATAGGCTAAAAC----A--TAAATA-ATACA------------ACTTTATATA---C--TTTTGTATA---Tggttttctttatttccaatacatctgatatgtttgtgctaacctttaatagaatta
gi|24 : A--C---AAT--------T-T--GCATATT--AATAAAAT--TGAC-ACATATA------------ATTT-ACATA------------ATA---TT----TAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATCTTATGCTTT--ACAGTGTTAATGACAT--AG--ATT--AATTG--A---TTG--TTAACATCAGAAC-TG---TCAAT-ACTATTGTATATA--TAGGCTA-----AAACAT----CAAA-AAA-ACAGC------TTAATATACTTTTGTATATATGTTTTTTT-TTTTC--CCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATG-CTTCT-A---TATGTTTGTGTTAATCTTTA--AT--GGAAT--TAAA--AA-TG----AG-T---TT---GGGTTA---A-------------TA-ACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AAT--TGT----A----TATT-CA-GTT--ACAAT---------A--TTTTAAA----------C-T----AA----A--AA---AT-T------------AA---TT---AT--T-TAA-TTAA-A--A-----A-----AT---C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTATA-ACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACTAAA-T--------CTGAAT--T---CAGT-T----T---T------T----ATTGA-A----TT-T-------TCAATGCAACACTATTGTAACTgtttttctttatttccaatact
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gi|9 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattctttagcgcaaaactattgtaacACCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAGACGATACTTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACACACGT--ATCTTTTTG-TATATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACAAA------AACAATCATGTAGTATT-CAATTTGATCTCAACTACCTGTTGCGCCCAAGGA-AAAAAATCGTCAATAAATTT----ATAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATATTTACTGGTATATTAAT---------ATCAG-AATGTCATATTCTTAAACATGACAGTTA-GT-TAGGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAA---TA---G------CAA--------T-----TTC------------T---AAATACGA--A-TAAGAAATA-TA----------ATTAAAT---ATAT----TAACT--T-ATATAAAAAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACGATGTTAATGACA--T--AAGTA--A--AT--TGA-TCGT--------TAACAT--GAAAACTAT-AAAATTATTGTAT-TTATAGGCTAAAAC--------A-T--AAATAATACAGC----T--T----A-ATATA------------CTTTTGTATA---T--GTTTTTCT----TT-AC---GTCT--AATACTTCTTAT----ATGTTTGTGTAGAATTAAA-ATTA-GTTTTGGATAA---TAACAACAT--AATTTTT--AATAG--T---TTtagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
gi|9 : ATAAATTTAT--A------AGA--------C-----T--------------G---AAA-ACAACAGTTT-----TA-TA----------ATCTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATTAATATCAGAATG--TCATATTCTT----A-AACATGA-CA---G--TT--A-G---TTAGGA--TTA-TGATG--T---GGTCCAG--ATAGTAT-CTG------------CAT------ACTAT-ATAA-----------TA-G--C---AAT--------T-TCTAAATACG--AAT----A---AGA-A-ATATA------------ATTAAATATA---T--TAACTTATA---TAAAAATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACGATGTTAATGACAT--AA--GTA--AATTG--A---TCG--TTAACATGAAAAC-TA---T-AAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAAC--A---TAAA-TAATACAGC------TTAATATACTTTTGTATATGTTTTTCTTT-ACGTC--T------------------AATA-CTTCTTA---TATGTTTGTG-------------T--AGAAT--TAAA--AT-TA----GT-T---TT---GGA-TA---A-------------TA-ACAAC-A-------TA----AT-T----TT------TAAT-AGT--TTT----A----TATT-GA-GTT--ACACT---------AT-TTTTAAG----------C-T----TA----G--AA---AT-T------------AA---TG---AT--T-TAT-CTC--ATTA-----A-----A----C---------T-------TGGTGCAA--ATCTATTGTT-ACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---CAG--T----T---T------T----ATTGA-A----TT-T-------TCAACGCAACACTATTGTAACtatattgagttacactatttttaagcttagaaattaatgatttatctcattaaacttggtgcaaatctattgttacttgagttacaatagttttgcaccaaatataaattcagttttattgaattttcaacgcaacactattgtaacattttgtttacattttatatctgacttacattaactgtagttttattaaacaacacaggca
gi|9 : acccagttaccgcttgtttaaatttagacgatacttttttccaaatttttaactaaataaaacacacgtatctttttgtatatttgtctaaaaatgaggttttaacaaaaacaatcatgtagtattcaatttgatctcaactacctgttgcgcccaaggaaaaaaatcgtcaTGCCTGTGTTG---TTTA--AT--AAAAC--TACA--GT-TA----ATGTAAGTC---AGAT-----A-------------TA-A--------------A----AT-G----T-------AAAC-AA----------A-----AT-----GTT--ACAAT---------AG-TGTTG------------CGT----TG----A--AA---AT-TCAATAA------AA---CTGA-AT--T-TAT---------------------A----T---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-ACTCAAGTA-ACAATAGATTTGCACCAAG-T--------TTAA----T---GAG--A----TAAAT------C----ATTAA-T----TT-C-------TAAGCTTAAAAATAGTGTAACTCAAattttgtttacattttatatctgacttacattaactgtagttttattaaacaacacaggca
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : acccacttactacttgtttaaatttaaacgataactttttccaACCCACTTACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATACCTTTTT-CCATATTTTTA-ACTAAATAAACCACAGGTTTAT-TTT--------TG-TCTATTTGTTTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGTAAAAAATTCGTCAATAA-ATTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-AT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGTATATTAAT---------ATCAA-AATGTCACATTCTTAAATATGACAGTTA-GT-TATTATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTT--TATAAATTTAC--A------CAATATCAATTT-----C--------------T---AAATATGA--ATTTGGAAATA-TATATAATATATATATTAT---ATATATAATAACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTCATTTATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAATGTTAAAGACA--T--AAGTTA--ATTGG-TTGT--------TAACAT--GAGAACTAT-CAAAAG-----TATT-GTAT-TTATAGGCT-AA--ATCATAAAT--------------A-A----TACA---GCTTAATATAT--TTTTGTGTA---T
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gi|19 : TA-TA----------ATCTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATAAATATCAAAATG--TCACATTTTT----A-AACATGACAG--TAAGTT--ACGAT-T----ATGCTG-TGGTC--C--AGAT----AGTAT-CTG------------CAT------ACTAAATAAATT-----TACA-CAATATCAATTTCT-AA--A-TACGAATTTTGA---------A-A----TATA---AATATATATAT--TCACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTTCAT----AACTGAAATATTATGCTTTACAGCGTTAATGACAT--AA------ATTG--A---TTG--TTAACATGAGAAT-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACGTA---TC---TAATACAGCAGCTGCTTAATTTACTTTTGTATATGTTTTTTTTTTATTTCC------------------AATACTTATTA---TATGTTTGTGTTAACCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGT-T---TT---GGATTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT-----------------A----TATT-GGGTTACAATATTTTTA-AACT----TAG--AAAT-T------AA---TT---AT--T-TAT-CTCGTA--A------A-----A-C---------T-------TGGgcagctgcttaatttacttttgtatatgttttttttttatttccaatacttattatatgtttgtgttaacctttaatagaattaaaattggttttggattaataacaacataattttaaacagttttatattgggttacaatatttttaaacttagaaattaattatttatctcgtaaaacttgg
gi|2 : ccgctgactgcttgtttaaatttaaacgataacttttttccaaatttttaactaaataaaactcaggtatatttttgtctatttgtctatgaatgaggttttaactaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccagctaaaaatttgtcaataattttttaagactgaaaacaacagtttACCCACTTACTGCTTGTATAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTT-------TG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATATTTACTGGT-TATTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGAAAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T-----T--------------T---AAATACTA--ATTTGGTAATA-TA----------ATTTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTCC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GCATACTATATAAATT-----TACA-CAAT-TTAAATACT--A--A-TTTGGA---------------A-A----TATA---ATTTTATATAT--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTCCAT----AACTGAAATATTATGCTTTATAATGTTAATGACAT--AAGTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTCTTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATATATTAAA-TAATACAAC------TTTATATACTTTTGTATATGTTTTTCTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAAACTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GAT-T---TT---GGATTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT-----------------A----TATT-GAGTTACAATATTTTTA-AACT----TAG--AAAT-T------AA---TT---AT--T-TAT-CTCGTA--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---CAG--T----T---T-------T----ATTGA-A----TT-T-------TCAACGCAACACTATTGTAACTCAAA
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gi|29 : tttttacataaattactctagtttgacaatgtgcattttgtgttaaaatttggtcctaatattttagataattttgaagatattcacttttgttgaaaatattgtatctcaaatacactaATGACAT--AAGTT--GATTG--A---TTG--CTAACTTAAGAAC-TA---TAAAA-TTTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATA-----AA-TAATACAGC------TTAATATACTTTTGTATATGTTTTTCTTT-ATTTCA------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAACCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-AGT-T---TT---GGATTG---A-TAACAAC-A-------TT----AT-T----TT------AAAC-AA---TAT-----------------A----TATT-TAGTTACAATATTTTTA-AACT----TAG--AAAT-T------G---------AT--T-TAT-CTCATA--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTTGAGTTAACAATAGTTTTGCACCAAA-C--------ATAAAT--T---CAG--T----T---T-------T----ATTGA-A----TG-T-------TCAACGCAACACTATTGT-ACTCAAAtagtccatgaatattgcaatacaagttcaaatgatagttcaggaaaatctttcaagattctgaagaaatacaggtatggagac
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Reference ( family-5449 ) : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTT-------TG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAACTATACA-------AANT-----T----ATN-GNA-T-TTANAGGCTAA-AACATGAAT-----A-A----TACA------ACTTTATATAC--TTNCGTATA---TTAACATAATTT--AATACTTTCAT----AACTGAAATATTATGCTTTACAACGTTAATGACAT--AAGTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATA----AAA--TAATACAG-C------TTAATATACTTTTGTATATGTTTT---TCTT------T-ATTTCC------------------AATACT-TCTTA---TATG---TTTGTGTT-AAN---CTTTA--A-TAGAATTAAAAT-T-GGT-T---TT---GGATTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AAT--TTT-----------------A----TATT-GAGTTACAATANTTTTG-GACT----T--AAAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCG-A--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---NAG--T----T---T-------T-----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
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gi|18 : TTTG--A-TCAAATTAAAAT----GT-T---TTTAAAGATTT---A-TTAAAAA-A-------AA----AT-C----TT------GCAA-GAT--TTTCCTGAGCTTTCATTTGAA----TCTT-GTATTGCAGTATTCTTG-GACT----------AAT-A------AA---GT---GTG-TTATACATG-A--T------A-----A-C---------T-------GGGTTTAAT-AA--AGTTTA-AGTTCAAGTT-ACAATAGTTTTACACC-GA-T--------ATAAAT--A---AAG--G----T---TACCAAGAT-----ATT---A----TT-T---------GGTGCAActtaaactttattaaacccagttatcatgtataacacactttattagtccaagaatactgcaatacaagattcaaatgaaagctcaggaaaatcttgcaagatttttttttaataaatctttaaaaacattttaatttgatcaaaaagaaattttagtcaatgaatatattaaatgttttactgatttgaatattggtgtcaataaaatggatgattaatatagttaatatgctatacatagccatttgttgatattttgttaaaaaatctgattattaaaatttgctgaaagttttttgtttgcatttttttttaataaaaaggccgtccaatctaacaatgttactcaacaaacttttttaatttataccaattataactttactaaaccaatatatcccttttgaatacttccagaatgagatattctaattacctggtacactcagtattaatctttttaatatatcagtactagaagtcgacagtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaaatatattttagatatcgataaaccttggttttgcagagttaactacaccaattgaataaagcacaatgtgggtagtggggttggtatgggtatggtggatacagagtgtacagtggatagctgagatggtaaagtggatctagagggtacagtagct
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gi|19 : TA-T-A----------AT------CTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATAAATATCAAAATG--TCACATTTTT----A-AACATGACAG--TAAGTT--ACGAT-T-ATGCTGTGGTCCAGA--T--AG--TA--TCTGC-ATAC--------TAA-AT--AA-ATTTACACA-------A--------T----ATC--AA-T-TT-----CTAA-A-TACGAATTTTGAA-A----TATA------AATATATATAT--TCACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTTCAT----AACTGAAATATTATGCTTTACAGCGTTAATGACAT--AA------ATTG--A---TTG--TTAACATGAGAAT-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACGTA----TC---TAATACAG-CAGCTGCTTAATTTACTTTTGTATATGTTTT---TTTT------TTATTTCC------------------AATACT-TATTA---TATG---TTTGTGTT-AAC---CTTTA--A-TAGAATTAAAAT-T-GGT-T---TT---GGATTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT-----------------A----TATT-GGGTTACAATATTTTTA-AACT----T--AGAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCGTA--A------A-----A-C---------T-------TGGgttttttttttatttccaatacttattatatgtttgtgttaacctttaatagaattaaaattggttttggattaataacaacataattttaaacagttttatattgggttacaatatttttaaacttagaaattaattatttatctcgtaaaacttgg
gi|2 : ccgctgactgcttgtttaaatttaaacgataacttttttccaaatttttaactaaataaaactcaggtatatttttgtctatttgtctatgaatgaggttttaactaaaacaatcatgtagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccagctaaaaatttgtcaataattttttaagactgaaaacaacagtttACCCACTTACTGCTTGTATAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTT-------TG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGAAAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACTA--ATTTGGTAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTCC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GCATACTATATA-------AATT-----T----ACA-CAA-T-TTAAATACT---AATTTGGA------A-A----TATA------ATTTTATATAT--TTACTTATA---TTAACATAATTT--AATACTTCCAT----AACTGAAATATTATGCTTTATAATGTTAATGACAT--AAGTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTCTTGTATTTA--TAGGCTA-----AAACATATATTAAA--TAATACAA-C------TTTATATACTTTTGTATATGTTTT---TCTT------T-ATTTCC------------------AATACT-TCTTA---TATG---TTTGTGTT-AAA---CTTTA--A-TAGAATTAAAAT-T-GAT-T---TT---GGATTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT-----------------A----TATT-GAGTTACAATATTTTTA-AACT----T--AGAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCGTA--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------ATAAAT--T---CAG--T----T---T-------T-----ATTGA-A----TT-T-------TCAACGCAACACTATTGTAACTCAAA
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gi|20 : ATAAATTTAT--A------AGA--------C--------T--G--AAA-ACAACAGTTTTAAAATC-T-T----------GT------TTGAT---AT------TTACTGGT-ATATTAATATCAAAATG--TCACATTCTT----A-AACATGA-CAGTTAG-TT--ACGAT-T-ATGATGT----GATC--C--AG------ATAGT-ATGT--------T--CAT------ACTATATA-------AATT-----T----ACA-CAA-TATCAATTTCTAA-A-TATGAATTTGGAA-A----TATG------ATTATATATAT--TAACTTATA---TTAACATAATTT--AATAATTTCAT----AACTGAAATAT---GCTTTATAGTGTTAATGACAT--AGGTT--AATTG--A---TTG--TTAACACAATAAC-CA---TCATA-ATTATTGTGTTTA--TAGGCTA-----AATCATA----AA---TAATACAG-T------TTAATATACTTTTGTATACGTTTT---TCTT------T-GTTTCC------------------AATACT-TCTTA---TATG---TTTGTATT-AAC---CTTTA--A-TTGAATTTGAAT-T-AGT-TAAATTA--GGAGTA---A-TAACAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-AGT--TTT-----------------A----TATT-GAGTTACAcgtttttctttgtttccaatacttcttatatgtttgtattaacctttaattgaatttgaattagttaaattaggagtaataacaacataattttaaacagttttatattgagttaca
gi|22 : acccactaaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtcttaaaataaggttttaactaaaacaatcatgaagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccaggtaaaaattcgtcaACGCACTTACCGCTTGTTTAGATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTCAATAAACCACAGGT--AT-CTTT-------TGGTCTATTTGTCT----AAAAATAAGGTTTTAACCAA------AACAATCACGTAGTATG-CAATTTGATCTGAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT-A--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAAGCT----TGTTCAATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAA-GATGTCACATTTTTAAACATGACAGTTA-GT-AACGATTATGC--TGTGGTCCACATAG--TATCTGCATACTA--TATCAATTTAC--A------CAA--------TATCAAT--T--TCCAAGTATGA--ATTTGGAAATA-T-A----------GT------TATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAGTGTTAATGATA--T--AGGTTA--ATTGA-TTGT--------TAACAT--GAAAACTAT-CA-------AAAT-----T----ATT-GTA-T-TTATAGGCTAA-AACATAAAC-----A-A----TACA------GCTTAATATAC--TT---TATA---T
gi|23 : ACCCACTTACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-ATTT-------TG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--CATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACTA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTAGT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAACTAT-CA-------AAAT-----T----ATT-GTA-T-TTATAGGCTAA-AACATAAAT-----A-A----TACA------ACTTTATATAC--TTTTGTATA---Tggttttctttatttccaatacatctgatatgtttgtgctaacctttaatagaatta
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gi|8 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatACAAG-A-------TA----AC-TGGGTTT------AATA-AAA--TTT-----------------A----AATTCAAGTTACAATAGTTTTG-CACCAA--T--ATAAAT-A------AA-------------GGT-CTCC-A--A------GATATTA-T---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCGCTAAA-tttaaattttattaaacccagttatcttgtataaccacacttttatttagtccaagaatattgcaatacattagtttcaaatgatagtttagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
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gi|9 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattctttagcgcaaaactattgtaacACCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAGACGATACTTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACACACGT--ATCTTTT-------TG-TATATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACAAA------AACAATCATGTAGTATT-CAATTTGATCTCAACTACCTGTTGCGCCCAAGGA-AAAAAATCGTCAATAAATTT-A--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAG-AATGTCATATTCTTAAACATGACAGTTA-GT-TAGGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAA---TA---G------CAA--------T--------T--TCTAAATACGA--ATA-AGAAATA-T-A----------AT------TAAAT---ATAT----TAACT--T-ATATAAAAAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACGATGTTAATGACA--T--AAGTAA--ATTGA-TCGT--------TAACAT--GAAAACTAT--A-------AAAT-----T----ATT-GTA-T-TTATAGGCTAA-AACATAAAT-----A-A----TACA------GCTTAATATAC--TTTTGTATA---Ttagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|27 : atccactcaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaagtttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtctaaaaataaggtttatccaaaacaatcatgtaatatgcaatttgatctcaacagcctaggtaaaagttcgtcaataaatgtataagactgaaaactacgtgtCCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAAATGATACCTTTTT-CCAAATTTTTTTACTAAATAAAACACAGGT--ATCTTTTTG-TCTATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATT-TAATGTGATCTCAACTGCCTATTGCGCCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAA-ATTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAA-AAAGTCATATTCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATTAATTTAC--ATAATATCAA--------T--------TTCT--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TGTA-------------------T-ATATTAAAAT---AATT--TATTAT---------TAAC-TGA-AA--TA--TT--A
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gi|29 : tttttacataaattactctagtttgacaatgtgcattttgtgttaaaatttggtcctaatattttagataattttgaagatattcacttttgttgaaaatattgtatctcaaatacactaATGACAT--AA--GTT--GATTG--A---TTG--CTAACTTAAGAAC-TA---TAAAA-TTTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCA------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAACCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-AGTT---TT---GGATT-G---A-T----AA--CAAC-A-------TT----AT-T----TT------AAAC-A----------A---TAT-----------------A----TAT-T-TAGTTACAATATTTTTA-AACT----T--AGAAAT-T------G---------AT--TTAT-CTCATA--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-A-CTTGAGTTAACAATAGTTTTGCACCAAA-C--------ATAAAT--T---CAG--T----TT-------T----ATTGA-A----TG-T-------TCAACGCAACACTATTGT-ACTCAAAtagtccatgaatattgcaatacaagttcaaatgatagttcaggaaaatctttcaagattctgaagaaatacaggtatggagac
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gi|33 : ttttcaaaaatcgtttcacaatgtgcatcttgagttaaaatttggtcctgatattttaaataattttgaagatattcacttatggtgaaaatattgtatctcaattacactaattcattagcgcaaaactattgtaacACCCACTTGCTGCTTGTTTAAATTCAAAAGATAAC-TTAT-CCAAATTTTGA-AATAAACAAAAAACAG--TTAT-CTTTTG----ATATATTTGTCTAAAAATGAGGTTTT-ATCAAGAATGTAACATTCTTG-AACATGACAATTcaggaaaatctttcaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttactttttttctactaaatttttaaaaacattttaatttgataaaagagaaattttagtcagatgactatgttaaatgttttattgatttggacataagcgacaataaaatggatgtttaatatagttattgtgctataaaagaaccatttgttgatattttgttaaaaaatctgattattaaaatttgcagtgatttttctggtttgcatttttttaataaaaaggccgtccaatctcacaatattactcaacacacttttaatttataccaattataaccttacaaaaccaatatatcacttttgaatacttccagaatgagataagacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactagaagtcaacagtatcttatcattttaaaatggctgttaacttagaaccaaaacaatatattttagatattgataaactttgatttctcagaattatcttttgattataccaatttaataaagca
gi|33 : AATTTTGAAATAA-AC--AA---AA-AACA-GT------T-----ATCT----T--TTGATATATTTGTCTAAAAATGAG-GT-T------T--T---------ATCAAGAATGTAACATTCTTGAACATGACAATTA-GT-TATGATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--CATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------TG-T--CAATATCA--GTTTCAAAA-A-TGA----------ATTTGGAGTTTAT---ATAT----Tagttatgattatgctgtggtccagatagcatctgcatactatataaatttacacaattgtcaatatcagtttcaaaaatgaatttggagtttatatattgcatctgaaaa
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gi|19 : TA-T-A----------AT------CTTGTTTGATAT----TTACTGGT-ATATAAATATCAAAATG--TCACATTTTT----A-AACATGACAG--TAAGTT--ACGAT-T-ATGCTGTGGTCCAGA--T--AG--TA--TCTGC-ATAC--------TAA-AT--AA-AT--T----TACACAATAT--CA--------------ATTT-----CT--AAA-TACGAA--TTTTGAAATATA------AATATATATAT--TCACTTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ACAGCGTTAATGACAT--AA--------ATTG--A---TTG--TTAACATGAGAAT-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACG-----TATCTAATACAGCAGCTGCTTAATTTACTT-TTGT--ATATGTTTTT-TTTTTATTTCC------------------AATACTTATTA---TATGTTTGTGTTAACCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------GT--TTT----A----TAT-T-GGGTTACAATATTTTTA-AACT----T--AGAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCGTA--A------A-----A-C---------T-------TGGgttttttttttatttccaatacttattatatgtttgtgttaacctttaatagaattaaaattggttttggattaataacaacataattttaaacagttttatattgggttacaatatttttaaacttagaaattaattatttatctcgtaaaacttgg
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gi|22 : acccactaaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtcttaaaataaggttttaactaaaacaatcatgaagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccaggtaaaaattcgtcaACGCACTTACCGCTTGTTTAGATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTCAATAAACCACAGGT--AT-CTTTTGGTCTATTTGTCT----AAAAATAAGGTTTTAACCAA------AACAATCACGTAGTATG-CAATTTGATCTGAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT-A--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAAGCT----TGTTCAATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAA-GATGTCACATTTTTAAACATGACAGTTA-GT-AACGATTATGC--TGTGGTCCACATAG--TATCTGCATACTA--TATCAATTTAC--A------CAA--------TATCAAT--T--TCCAAGTATGA--ATTTGGAAATA-T-A----------GT------TATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAGTGTTAATGATA--T--AGGTTA--ATTGA-TTGT--------TAACAT--GAAAA--C----TAT-CAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--C-----AATACA------GCTTAATATAC--TT---TA-TA--------T
gi|23 : ACCCACTTACTGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-ATTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCTAGGT-AAAAATTCACCAATATTTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACTATTATGT--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--CATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACTA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTAGT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TAT-CAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTTTGTA-TA--------Tggttttctttatttccaatacatctgatatgtttgtgctaacctttaatagaatta
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gi|8 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatA--CAAG-A-------TA----AC-TGGGTTT------AATA-A----------AA--TTT----A----AAT-TCAAGTTACAATAGTTTTG-CACCAA--T--ATAAAT-A------AA-------------GGT-CTCC-A--A------GATATTA-T---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-ACTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCGCTAAA-tttaaattttattaaacccagttatcttgtataaccacacttttatttagtccaagaatattgcaatacattagtttcaaatgatagtttagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
gi|8 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattcAACTA-------TC----AT-T----TG------AAACTA----------AT---------G----TAT-T-G-----CAATATTCTTG-GACTAAA-T--AAAAGTGT------GG---TT---AT--ACA----AG-A--T------A-----A-C---------T-------GGGTTTAA--TAAAATTTAA-ATTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCACC-AA-T--------A-TAAAT--A---A-AG--G----TC------TCCA-A--GATA----TTAT-------TTGGTGCAAAACTATTGTAACTCAAataaccacacttttatttagtccaagaatattgcaatacattagtttcaaatgatagtttagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
gi|9 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattctttagcgcaaaactattgtaacACCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAGACGATACTTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTAAATAAAACACACGT--ATCTTTTTG-TATATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACAAA------AACAATCATGTAGTATT-CAATTTGATCTCAACTACCTGTTGCGCCCAAGGA-AAAAAATCGTCAATAAATTT-A--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAG-AATGTCATATTCTTAAACATGACAGTTA-GT-TAGGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAA---TA---G------CAA--------T--------T--TCTAAATACGA--ATA-AGAAATA-T-A----------AT------TAAAT---ATAT----TAACT--T-ATATAAAAAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACGATGTTAATGACA--T--AAGTAA--ATTGA-TCGT--------TAACAT--GAAAA--C----TAT--AAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------GCTTAATATAC--TTTTGTA-TATGTTTTTCTTTAC---GTCT--AATACTTCTTAT----ATGTTTGTGTAGAATTAAA-ATTA-GTTTTGGATAA---TAACAACAT--AATTTTT--AATAG--T---T----TTA-----------TA---TT-GA-GTTACACTATTTTTAAGCTTAGAAA-----TTAATGATTTATC------TCATTAAACTTGGTGCAAATCTATTGTTACTTG-AGTTAC------------------AATAGT------------TTTGCACCA------A--ATA----TAAATT-C-AGTT---TT-----ATTGA---A-TTTTCAACGCAAC-A-------CT----AT-T----GT-------AAC-ATTTTGTTTACAT--TTT----A----TATCT-GACTTACATTAACTGTA-GTTT----T--Atagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-5449 ) : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TATACAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTNCGTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------AT--TTT----A----TAT-T-GAGTTACAATANTTTTG-GACT----T--AAAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCG-A--A------A-----A-C---------T-------TGGCGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------A-TAAAT--T---N-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
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gi|26 : TTTTT-CTTT-ATTACC------------------TATACTTCTTAATATATATTTGTGTTAATCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----CT-T----TT------AAAC-A----------GT--TTT----A----TAT-T-GAGTTACAATAATTTTA-AACT----T--AGAAAT-T------AA---TT---AT--TTGT-CTCATA--A------A-----A-C---------T-------TGGTGCAA--AACTATTGTT-ACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------A-TAAAT--T---C-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGACGCAACACTATTGTAACTCAAtggttttggattaataacaacatacttttaaacagttttatattgagttacaataattttaaacttagaaattaattatttgtctcataaaacttggtgcaaaactattgttacttgagttacaatagttttgcaccaaatataaattcagttttattgaattttcgacgcaacactattgtaactcaa
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gi|8 : ttttgcataaattactgtagttttacgatgttcatattgtgttaaaatttggtcctgatattttaaataactttgaagatattcacttttggtgaaaatattgtatctcaaatacactaattcAACTA-------TC----AT-T----TG------AAACTA----------AT---------G----TAT-T-G-----CAATATTCTTG-GACTAAA-T--AAAAGTGT------GG---TT---AT--ACA----AG-A--T------A-----A-C---------T-------GGGTTTAA--TAAAATTTAA-ATTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCACC-AA-T--------A-TAAAT--A---A-AG--G----TC------TCCA-A--GATA----TTAT-------TTGGTGCAAAACTATTGTAACTCAAataaccacacttttatttagtccaagaatattgcaatacattagtttcaaatgatagtttagaaaaatttaaaaagattttgaagaaatacaggtatagagacttttttttttttactcatctttgaaaacattttaatttgataataaagtaatttagtcagatgagtatgttaaatgttttattgatttggacattagtgacaatgaaatcgatgattaataattaattgtactataaaagagccataaaaatctgattattaaaatttgcagtgaattgtttggtttgcatttttttttataataaaaaggccgtccaatcgaacaatattactcaacatacttttaatgtataccaattataactttacttaaccaatatatcccttttgaaaacttccaaaatgagatattattctaattacctggtacactcagtattattctttttaatatatcagtactaaaagtcaacactgtatctaattattttaaaatggctgttaaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagaatt
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blockSeqs : T T T G T C G G T GAATGT A A TT AAT TAA T TTTTTC ATAC G AT T AAAAATGA T A ATCT GAGGTTTTA G C T A T CAA CC C GT ATAATAT TATCAATTT TC CC A CAG A G TATAATATAT TTGGAG TTGA ATAA GG G CAA AT T ATTT T A C GT AG GC A T GT TT A CT G GGTCCAGA CT T AT AATT A CG CACAATATCA TG AA TTTGGA GCAGCT AA ACT A TGTTTTTC TT T CC CTTATATGTTTGTGTAG A GG T C TA TT AA TGGA GA A ATT C TATAT AGCTGC T G AA A T CCCCCCCCCCCCCCCCCC ATA A . G T AAA CAA G . G TTTC CG T TCATCAG GAAG . GGGT TTTTCT T TTTTGTTTACAT GAAG AAGG C CAAG G CACCGATA AG ATTGTATACCTCAAATACAGTAATTCT AATTCAT T TT T A G TTTACGAGA TAAAGTCTCCAAGATATTATTT
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blockSeqs : T . . G . . . . A . . . TT T . . . . G . . . . . . . . C . . T A . C . A T . . G A . . . . A . . . . . C . T . . . . . . T . . G . . . . G . . . . TTGT . AA T . . TTG . . AA A . . . . . C . . . A . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . GAG C CACCAA . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . T . . . . A TGGAGACCTTTATTTATATT
blockSeqs : C . . A . . . . A . . . AA T . . . . A . . . . . . . . T . . G C . C . A T . . A A . . . . A . . . . . A . T . . . . . . T . . G . . . . T . . . . CACA . AA T . . ACT . . AA A . . . . . T . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . GAG T CACCAA . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . T . . . . A AAAGGTCTCCAAGATATTAT
blockSeqs : C . . A . . . . A . . . TT T . . . . G . . . . . . . . T . . G T . C . A T . . G A . . . . A . . . . . T . T . . . . . . C . . G . . . . G . . . . TTGT . AA T . . TTG . . AA A . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . GAG T CACCAA . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . T . . . . A TGGAGACCTTTATTTATATT
blockSeqs : T . . A . . . . A . . . AT T . . . . G . . . . . . . . T . . T A . C . A T . . T A . . . . A . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . TTGT . AA C . . ACT . . TA . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . GAG A CACCAA . TCAATAAAACTGAATTTATAT . T . . . . A AAAGGTCTCCAAGATATTAT
blockSeqs : T . . A . . . . . . . AA T . . . . G . . . . . . . . . . . G C . . . A C . . G A . . . . A . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . CACA . A T . . ACT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . GAG C CACCAA . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . C . . . . A TGGAGACCTTTATTTATATT
blockSeqs : C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . A T . . A G . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TTGT . A T . . TTG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . GAG G GACT . TAATTATTTATCTTGTAAAAC . T . . . . A AAAGGTCTCCAAGATATTAT
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A C . . G A . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . TTGT . . . . . ACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . GGG T AACT . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . T . . . . A TGGAGACTTTAATTTATA
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . TTGT . . . . . TTG . . . . . . . . . . AT . . . GAG G AACT . TAATTATTTATCTCGTAAAAC . C . . . . C TCAGTTTTTATTGAATTT
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . G T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TTGT . . . . . ACA . . . . . . . . . . AA . . . GAG T AACT . TAATTATTTAATTAAAAAATC . T . . . . A TTAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . GT . . . CAG T AACT . TAATTATTTGTCTCATAAAAC . T . . . . A TCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . GAG C AACT . TAATTATTTATCTAATAAAAC . T . . . . A CCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AC . . . TAG C AACT . AAAGGTTTCGAAGATATTAT . C . . . . A TCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . CAC G AACT . AAAGGTTTCCAAGTTATTAT . C . . . . A AATTAATTTCTATGTTT
blockSeqs : . . . . . . . AT . . . TCG T AACT . GTGGTTATGGACATGATTAC . C . . . . A TCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . . . . . . . AC . . . GAC C AACT . AAAGGTCTCCAAGATATTAT . T . . . . A TCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . G G AACT . AAAGGTCTCCAAGATATTAT . T . . . . A TCAGTTTTATTGAATTT
blockSeqs : . . . . . . . AT . . . G T AACT . AAAGGTCTCCAAGATATTAT . C . . . . A TCAGTTTTATTGAATGT
blockSeqs : . . . . . . AC . . . G C AACT . AAAGGTCTCCAAGATATTAT . T . . . . A TCAGTTTTATTGAAATT
blockSeqs : . . . . . AA . . . G G GTTT . AAAGGTCTCCAAGATATTAT . T . . . . A TTTTATAGAATTT
blockSeqs : . . . . . AC . . . . T TGT . AAGGTTTCAAAGACATTAT . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . C GA . GTGGTTATACATGATAAC . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . . . G T . TGATTTATCTCATAAAAC . T . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . T G . ATTGTATCTCAATTACAC . C . . . .
blockSeqs : . . . . . AT . . . . C G . GTGGTTATACAAGATAAC . T . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . G G . GTGGTTATACAAGATAAC . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T G . GTGGTTATACAAGATAAC . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A G . GTGGTTATACAAGATAAC . T . . . .
blockSeqs : . . . G . GTGGTTATACAAGATAAC . T . . . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqCons : T**************** ** *** **** GAG* GACTA**** A*********
originalCons : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TATACAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTNCGTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------AT--TTT----A----TAT-T-GAGTTACAATANTTTTG-GACT----T--AAAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCG-A--A------A-----A-C---------T-------TGGCGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------A-TAAAT--T---N-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
finalCons : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAAT----------------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TATACAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTNCGTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------AT--TTT----A----TAT-TGAG-TTACAATANTTTTGGACTA----T--AAAAAT-T------AA---TT---AT--TTAT-CTCG-A--A------A-----A-C---------T-------TGGCGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-TA---------TAAAT--T---N-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AAATATAGGTACATAGAGACTTATTTTATTTTTTGTTTTAAACTAAAATTTTAAAAACATTTATCAAAAAAAGTAATTTTAGTCAGATGAGTATGTTAAATGCTTTATTGATTTGGACATTAGTGACAATAAAATGGATGATTTATATTAGTTATTGTGCTATAAAAGAACCATTTGTTGATATTTTGTTAAAAAATCTGATTATTAAAATTTGCAGTGAATTTTAAGGTTTGCATTTTTTTTTAATAAAAAGGCCGTCCAATCTCACAATATTACTCAACACACTTTTAATTTATACCAATTATAACTTTACTAAACCAATATATCCCTTTTAAATACTTCCAGAATGAGATATGACCTGGTACACTCAGTATTATTCTTTTAAATATATCAGTACTAGAAGTCAACAGTACACATGTATCTAATTATTTTAAAATGGCTTTTAACTTAGAACCAAAACAATATATTTTAGATATTGATAAACCTTGGTTTCTCAGAGTTAACTTTTAATTATACCAATTGATTAAAGCACAATGTGGGTAGTGGGGTTGGTATGGTGTATACTGAGTGTACAGCGGATAGTTGAGATGGTGAAGTGGATCTAGAGGGTACAGCAGCT
Unaligned ( gi|25 ): TTTTTTTTTTTTTTTTACTTACCTTTGAAAACATTTTAATTTAATAATAAAGTAATTTAGTCAGATGAGTATGTTAAATGTTTTATTGATTTGGACATTAGTGACAATGAAATCAATGATTAATAATTTATTGTGCTATAAAAGAGCCATTTTTGATATTTTGTTTGAAAATCTGATTATTAAAATTTGCAGAGAGTTGTTTGGTTTGCATTTTTTTTTATAATACGAAGGCCGTCCAATCGAACAATATTACTTAACATACTTTTAATGTTTACCAATTATAACTTTACTTAACCAATATATCTCTTTTGAAAACTTCCAAAATGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATTATTCTATTTAATATATCAGTACTAGATGTCAACACTGTATCTAATTATTTTAAAATGACTGTTAAAGAACCAAAACAATATATTTTAGATATCAATAAACCTTGGTTTCTCAGAATTAATTTG
Unaligned ( gi|30 ): TTGTGCTATAAAAGAGCCATTTGTTGATATTTTGTTTAAAAATCTGATTATTAAAATTTGCAGTGAATTGTTTGGTTTGCATTTTTTTTATAATAAAAAGGCTGTCCAATCGAACAATATTACTCAACATACTTTTAATGTATACCAATTATAACTTTACTTAACCAATATATCCCTTTTGAAAACTTCCAAAATGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATTATTTTTTTTAATATATCAGTACTAGAAGTCAACACTGTATGTAATTATTTTAAAATGGCTGTTAAAGAACCAAAACAATATATTTTAGATATCAATAAACCTTG
Unaligned ( gi|31 ): TTACAGTGAATTTTTTGGTTTGCATTTTTGTTAAAAAAAAGGCCGTCCAATTTAACAATAAAACTCAACACACTTTTAATTTATATAAATTATAACTTTACTTAACCAATATATCCCTTTTGAATACTTCCAGAATGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATAATTCTTTTTAATATATCAGTACTCGAAGTCAACATTATCTAATTATTTTAAAATGGCTTTTAAAGAACCAAAACAATATAGTTTAGATTTCGATAAACTTTGGTTTATTAGAGTTTAAGTTTTGATTATACCAACTGAATAAAT
Unaligned ( gi|32 ): ATATATCCCTTTTGAATACTTCCAGAACGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATTATTCTTTTTAGTATATCAGTACTAGAAGTCAACATTATCTTATTATTTTAAAATGGCTTTTAAAGAACCAAAACAATATATTTTAGATTTCAATAAACTTTGTTTATCCGAGTTAACTTTTAATTATACTAATTGCATAAATTAGCACAATGTGGGTAGTCGGGTTGGTATGGGGTATGGCGGATACAGAG
Unaligned ( gi|36 ): CCTAGTACACTCAGTATTATTATTTTTAATATATCAGTACTATAAGTCAACAGTATCTTTAGAAGTATTTTAAAATGGCTGTTAAAGAACCAAAACAATATATTTAAGATATTTAATAAACCTTGGTTTTTCAGAATTAATTTG
Unaligned ( gi|37 ): TTTTGCATAAATTACTGTAGTTTTACAATGTGCATCTTGTGTTAAAATTTGGTCCTGATATTTTAAATAATTTTGAAAATATTCACTTTTGGTGAAAATATTGTATCTCAAATACACTAATTCTTTAGCGCAAAACTTA
Unaligned ( gi|39 ): TTTTTTACATAAATTACTTTAGTTTGAAATGTGCATCTTGTGTTAAAAATTTGGTCCTGATATTT
Alignments
lowQualScore : 1 111 1 1 111111111 11 11 33333333333333333 1111 11 111 11 11 11 22222222 11 1 11111111111111 11111111 22222222 11 222222222222222222222 1 11 111111 11111 222222222222222222 1111 2222 2222 33333333333 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 2 2 1 9 2 2 8 3 777777 2 0 2 44 333 000 2 555555 0 4444 1 22 2 77777777 2 4 4444 999999999 2 2 2 4 1 999 11 1 11 666666666 11111111111111111 44 55 1 999 7 1 7777777777 555555 6666 0000 1 00 7 222 00 3 3333 8 7 1 55 66 00 0 1 5 77 22 7 00 7 66666666 00 2 22 3333 7 22 11111111111111 0 1 22 55 99999999 888888 22 444 1 22222222 44 3 0 77 111111111111111111111 6 33 0 2 22 33 33 111111 66 2 444 2 44444 888888 1 3 44 3 3 222222222222222222 555 2 33 4 2 333 666 2 333 2 4444 22 7 4444444 2222 1 1111 333333 3 44444444444444 0000 4444 1 1111 0 3 22222222222 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555555 1 11 1 1 0 1 8888888888 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 1 0 0
lowQualScore : . . . . . . . . . ...... . . . .. ... ... . ...... . .... . .. . ........ . . .... ......... . . . . . ... .. . .. ......... ................. .. .. . ... . . .......... ...... .... .... . .. . ... .. . .... . . . .. .. .. . . . .. .. . .. . ........ .. . .. .... . .. .............. . . .. .. ........ ...... .. ... . ........ .. . . .. ..................... . .. . . .. .. .. ...... .. . ... . ..... ...... . . .. . . .................. ... . .. . . ... ... . ... . .... .. . ....... .... . .... ...... . .............. .... .... . .... . . ........... . .................................................... ....... . .. . . . . .......... .................................................... . . . .
lowQualScore : 8 4 5 7 4 5 5 8 8 222222 5 8 7 88 555 555 0 888888 8 2222 6 88 0 22222222 0 0 2222 555555555 0 0 1 2 7 111 66 8 66 444444444 00000000000000000 33 00 3 555 0 7 6666666666 000000 7777 7777 0 00 3 777 00 9 9999 8 3 8 00 11 00 3 9 8 99 66 0 55 3 44444444 00 6 55 9999 7 55 00000000000000 9 0 55 44 00000000 444444 55 000 8 55555555 44 7 6 22 222222222222222222222 3 44 1 1 99 22 22 555555 55 7 777 7 22222 888888 0 1 66 1 1 777777777777777777 444 1 99 4 2 999 111 2 999 2 7777 44 1 5555555 4444 1 5555 000000 2 99999999999999 1111 5555 0 4444 3 3 77777777777 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 0000000 5 44 0 0 6 0 6666666666 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 0 7 5
consensus : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TATACAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTNCGTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------AT--TTT----A----TAT-T-GAGTTACAATANTTTTGGAC---T-A--TAAAAAT-T------AA---TT---AT-TATCTCG-A--A------AA-CA-TA-----T-------TGGCGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------A-TAAAT--T---N-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
Reference ( family-5449 ) : ACCCACTTACCGCTTGTTTAAATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTGAATAAAACACAGGTTTAT-TTTTTG-TCTATTTGTCTGTCTATAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATG-CAATTTGATCTCAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAATTTTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATTATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GT-TA----TTAAT---------ATCAA-AATGTCGCATCCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACNATTATGC--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATAAATTTAC--A------CAA--------T--------T--T--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TTTAT---ATAT----TTACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTATAATGTTAATGACA--T--AGGTTA--ATTGT-TTGT--------TAACAT--GAGAA--C----TATACAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--T-----AATACA------ACTTTATATAC--TTNCGTA-TA--------TTAACATAATTT--AATACTT-TCAT----A-----------ACTGAAATATTATGCTTT--ATAACGTTAATGACAT--AA--GTT--AATTG--T---TTG--TTAACATGAGAAC-TA---TCAAA-ATTATTGTATTTATAGGCTAAAACA-----TAAATAATACAGC------TTAATATACTT-TTGT--ATATGTTTTT-CTTT-ATTTCC------------------AATACTTCTTA---TATGTTTGTGTTAANCTTTA--ATAGAATTAAAAT-T-GGTT---TT---GGATT-A---A-T----AA--CAAC-A-------TA----AT-T----TT------AAAC-A----------AT--TTT----A----TAT-T-GAGTTACAATANTTTTGGAC---T-A--TAAAAAT-T------AA---TT---ATTTATCTCG-A--A------AA-C---------T-------TGGCGCAA--AACTATTGTA-ACTCGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-T--------A-TAAAT--T---N-AG--T----TT------T----ATTGA-A----TT-T-------TCGGCGCAAAACTATTGTAACTCGAA
gi|1 : -------TA----ATAT----TT------AAAC-A----------TT--TTTGAAGA----TAT-T-------CACTA---TTGG----------TGAAAAT---------A---TT-----TTATCTCA-A--A------TA-CACTAATTCTT-------TAGCGCAA--AACTATTGTA-ACTTGAGTT-ACAATAGTTTTGCACCAAA-TA-------A-TATCT--TCGAA-AC--C----TT------T----ATTTA-------T-A-------TCGGTGTAAAACTATTTTTACTTGAA
gi|1 : ttttttgtataaattactctagttttacaatgtgcatcttatgttaaaatttggtccTAGA--TAAAAG-T-G-------T---GG-TT-ATACA-T----GA--TAAC---------TG----GG-T----TT------AATA-A----------AA--TTT----A----TAT-TCAAGTAAAAATAGTTTTACAC---CGA--TATAAAT-A------AA---G--------GTTTCG-A--A------GA-TATTAT----T-------TGGTGCAA--AACTATTGTA-ACTCAAGTT-ACAATAGTTTTGCGCTAAA-tataaattttattaaacccagttatcatgtataaccacacttttatctagtccaagaatattgaatacaagtttcaaatgatagtttaggaatatctttcaagattctgaagaaatacaggtataaagactttttttatggttttttttactaaatctttgaaacattttgctttgataaaaaagtaattttagtcagatgagtaccggtatgttaaatgttttgttgatttcgacataagtgacaataaaatggatgattaatatagttattgtgctataaaagaaccatttttttgatattttgttaaaaaatctgattatcaaaatttgcattgaattttttggtttgcatttttttaaataaaaaggccatccaatctaacaatattactcaacacacttttaacttataacaattataactatacttaaccaatatatcccttttgaatacttccagaatgagaaattattctaattacctggtacactcagtattatctttttaatatatcagtactagaagtcaacattatctaattattttaaaatggctgtttaagaaccaaaacaatatattttagatatcaataaaccttggtttctcagggttaacttttaattataccaaatgaataaattagcacaatgtgggtagtggagtttgtatggggtatggtggatacagagggtacagtggatagttgagatggtaaagtgagagggtacagcagct
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gi|22 : acccactaaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaaatttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtcttaaaataaggttttaactaaaacaatcatgaagtatgcaatttgatctcaactgcctattgcaccccaggtaaaaattcgtcaACGCACTTACCGCTTGTTTAGATTTAAACGATAACTTTTT-CCAAATTTTTA-ACTCAATAAACCACAGGT--AT-CTTTTGGTCTATTTGTCT----AAAAATAAGGTTTTAACCAA------AACAATCACGTAGTATG-CAATTTGATCTGAACTGCCTATTGCACCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAAATTT-A--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTAAAAGCT----TGTTCAATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAA-GATGTCACATTTTTAAACATGACAGTTA-GT-AACGATTATGC--TGTGGTCCACATAG--TATCTGCATACTA--TATCAATTTAC--A------CAA--------TATCAAT--T--TCCAAGTATGA--ATTTGGAAATA-T-A----------GT------TATAT---ATAT----TAACT--T-ATATTAACAT---AATT--TAATACTTTC----ATAAC-TGA-AA--TA--TT--ATGCT-TTACAGTGTTAATGATA--T--AGGTTA--ATTGA-TTGT--------TAACAT--GAAAA--C----TAT-CAAAAT--TA--T----TGT----ATTTATAGGCT--AAAACATAAA--C-----AATACA------GCTTAATATAC--TT---TA-TA--------T
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gi|27 : atccactcaccgcttgtttaaatttaaacgataactttttccaagtttttaactaaataaaacacaggtatctttttgtctatttgtctaaaaataaggtttatccaaaacaatcatgtaatatgcaatttgatctcaacagcctaggtaaaagttcgtcaataaatgtataagactgaaaactacgtgtCCCAGTTACCGCTTGTTTAAATTTAAATGATACCTTTTT-CCAAATTTTTTTACTAAATAAAACACAGGT--ATCTTTTTG-TCTATTTGTCT----AAAAATGAGGTTTTAACCAA------AACAATCATGTAGTATT-TAATGTGATCTCAACTGCCTATTGCGCCCCAGGT-AAAAATTCGTCAATAA-ATTTA--TAAGACTGAA---AACAACA-GT------TTTATAATCT----TGTTTGATAT--TTA-CT--------G-GTATA----TTAAT---------ATCAA-AAAGTCATATTCTTAAACATGACAGTTA-GT-TACGATTATGA--TGTGGTCCAGATAG--TATCTGCATACTA--TATTAATTTAC--ATAATATCAA--------T--------TTCT--AAATACGA--ATTTGGAAATA-T-A----------AT------TGTA-------------------T-ATATTAAAAT---AATT--TATTAT---------TAAC-TGA-AA--TA--TT--A
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Unaligned ( gi|30 ): TTGTGCTATAAAAGAGCCATTTGTTGATATTTTGTTTAAAAATCTGATTATTAAAATTTGCAGTGAATTGTTTGGTTTGCATTTTTTTTATAATAAAAAGGCTGTCCAATCGAACAATATTACTCAACATACTTTTAATGTATACCAATTATAACTTTACTTAACCAATATATCCCTTTTGAAAACTTCCAAAATGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATTATTTTTTTTAATATATCAGTACTAGAAGTCAACACTGTATGTAATTATTTTAAAATGGCTGTTAAAGAACCAAAACAATATATTTTAGATATCAATAAACCTTG
Unaligned ( gi|31 ): TTACAGTGAATTTTTTGGTTTGCATTTTTGTTAAAAAAAAGGCCGTCCAATTTAACAATAAAACTCAACACACTTTTAATTTATATAAATTATAACTTTACTTAACCAATATATCCCTTTTGAATACTTCCAGAATGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATAATTCTTTTTAATATATCAGTACTCGAAGTCAACATTATCTAATTATTTTAAAATGGCTTTTAAAGAACCAAAACAATATAGTTTAGATTTCGATAAACTTTGGTTTATTAGAGTTTAAGTTTTGATTATACCAACTGAATAAAT
Unaligned ( gi|32 ): ATATATCCCTTTTGAATACTTCCAGAACGAGATATTATTCTAATTACCTGGTACACTCAGTATTATTCTTTTTAGTATATCAGTACTAGAAGTCAACATTATCTTATTATTTTAAAATGGCTTTTAAAGAACCAAAACAATATATTTTAGATTTCAATAAACTTTGTTTATCCGAGTTAACTTTTAATTATACTAATTGCATAAATTAGCACAATGTGGGTAGTCGGGTTGGTATGGGGTATGGCGGATACAGAG
Unaligned ( gi|36 ): CCTAGTACACTCAGTATTATTATTTTTAATATATCAGTACTATAAGTCAACAGTATCTTTAGAAGTATTTTAAAATGGCTGTTAAAGAACCAAAACAATATATTTAAGATATTTAATAAACCTTGGTTTTTCAGAATTAATTTG
Unaligned ( gi|37 ): TTTTGCATAAATTACTGTAGTTTTACAATGTGCATCTTGTGTTAAAATTTGGTCCTGATATTTTAAATAATTTTGAAAATATTCACTTTTGGTGAAAATATTGTATCTCAAATACACTAATTCTTTAGCGCAAAACTTA
Unaligned ( gi|39 ): TTTTTTACATAAATTACTTTAGTTTGAAATGTGCATCTTGTGTTAAAAATTTGGTCCTGATATTT