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gi|17 : cacatatattgcctaatgttgtacagactgaccagagaatattaacctagttccttcttgcggtcaacgactccaagaaattcgtccaggttgccaggaatttaagacctttgcatatagctttctacgtgtcctgtttcctatcgttaatcatgtaaaaaactaccctgcacatgctcatccctaccaatcggctgacatcggagagctttcttcttttacttatggttttaacacattttaccgtgactttgggatgtctgtcaggcaatggatttcactaagactgtgcttcaaagaataacatctttttggtgtgttcctagttgtacatttggttttaattttaaggtccaatttgatcaaattcgcttttttccttgaggaagagaaaC--------TGGTG-----------------------TTT--TTTGTGTCACAAACACA-AGTCAAGATATGCGTTTCGCATTT
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gi|15 : gtgaatggatgaaatgctggcagggacctcaccctctctttatcaagttgatatgaaacggtttgcatacaagaagtatcttccagttccaaaatccaacccaattcacattaaaatcagtttgtcaatggctaataccaggacatgtgtatcaactgctttctatcgtgacatttcatatacatttagtggcagaccgtagctatgcttgtttgaaacacatatactaccagactggccagaagttctttcttgttgtcatcaaacccaagaaatgtgtctggagcttcacatggctttctatgtatcccatttcctatcgtagatcctgttaaagactaccatgcacatactcatccctgcttacatcggagagttctcttcttattcttagttttaacacattttaaccataattttgggatgtctggcaggttatggatttcacttagactgtgtcaccgagaataacattatatttattgtgttttcttagttgtacactgggtttagtttgaaggtcagatttgatccaatgcgcatatttcacttgatggggaggaacttgttttttttTCTTTCTTTCGCACAAGACATGACAAGCGGGGTAGTAGTGC---CTTGGATATCATTGGCCGCTCATGCCAGATTTCGAATCCA
gi|11 : ggttttggatttcacttaccgagaataacattatagttattgtgttttcttagttgtacactaagcttagtttgaaggtcagatttgatccaatgcgcacatttcacttgatggaaaggaactggtgtttctttcttGTCCAAACTGTCAGCTAATCAACAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGAT-AAAAGAATTGGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATAGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGaaatcgaccctttggtctctcaaaaacagctctggttctacatagaaaaggaactccagatcgatacatataaattctgatcttcacagtctagctatataggttgttatatacta
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gi|18 : ATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGAAATTTT-TTT--ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATATTTGTTTTCACGCACATA-------CATGTATGGAAATAATA--------AAAAAAATCACCAACAGCGGATGCT--CATTCAATACAACCTGAATAAC--AGG-AAAATaacctgaataacaggaaaatggtataaaaccttgtgatatcttgtgtctaccctactgcaagattcagtttatagtctatatacttctgcta
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gi|25 : aTATGTGCGTGAAAACAAATATC-ACAA-GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGAT--AAA-AAAATTCCCCAACAGCGGATTCACATTC---Acatgtatggaaataataaaaaaaatcaccaacagcggatgctcattcaatacaacctgaataacaggaaaatggtataaaaccttgtgatatcttgtgtctaccctactgcaagattcagtttatagtctatatacttctgctag
gi|22 : aACTGAT--AAA-AAAATTCCCAAACAGCGGATTCTCATTC---AATA--CAACCT-----AAATAA-CAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATCTCTTGTGTCTATCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGACcatgtatggaa
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consensus : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTGGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGCAAAAT--CTATTGCGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATATAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGGTTGGCCATCC-TTATG--TGTGAANAATACCTTTAAGGACTT--T-A-CATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGCGA---ATATAGTTTNAANTNC-CTTATTGTTCCCGGTCTNCCCTGCTCTNTAGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGATGA---AGTTTGGTCACACGCCGTGAATGAATGAAANGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTCTTTATCAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTC-CAGTTCC-AAACCCAACCCAATCCACACTCAAACCAGCCTGTGAACTTAAATCAACGGCTNATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGACATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACTGACCAGAAGATATTGAACTAGTTCTTTCTTGTTGTCATCAACCCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--GC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCATGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATCCCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATNCTTATGGTTTTAACACATTTTAACCATGATTTTGGGGATGT-CTGGCA-GTTA-TGNATTTCACTTAGGCT--GT-CGCCAAGCCGAGAATAA------CAT-----T------------T----TTT---------CCTA--G-TTGTACACTGGGTTT-AGTTTT---AAGGTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAANATATAGGCAAN-A-----TCTGCCTTT--------CGCACTTGGCTTGACAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATTATTGGCCGCTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTCCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTA-TTCATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATC-ACNA-GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCCAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
Reference ( family-523 ) : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACNCTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTAGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCCGCAAAAT--CTATTNCGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATATAGCTGAGCTGTCGATACAAAGGTTGGTCATCC-TTATG--TGTGAACAATACCTTTAAGGACTTAAT-A-CATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGNGA---ATATAGTTTAAATTNC-CTTATTGTTCCCGGTCTNCCCTGCTCTATAGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGATGA---AGTTTGGTCACACGCCGTGAATGAATGAAATGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTCTTTATCAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTC-CAGTTCC-AAACCCAACCCAATCCACACTCAAACCAGTTTGTGAACTTAAATCAACGGCTNATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGACATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACTGACCAGAAGATATTGAACTAGTTCTTTCTTGTTGTCATCAACCCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--GC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCATGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTNATCCCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATNCTTATGGTTTTAACANANTTTAACCATGATTTTGGGGATGT-CTGGCA-GTTA-TGNATTTCACTTAGGCT--GT-CACCAAGCCAAGAATAA------CAT-----T------------T----TTT---------CTTA--A-TTGTACACTGGGTTT-AGTTTT---AAGGTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAANATATAGGCAAN-A-----TCTGCCTTT--------CGCACTTGGCTTGACAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATCATTGGCCGCTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTTCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCNATTAAGTA-TT-ATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCGTGAAAACAAGTATC-ACAA-GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCCAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
gi|1 : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTTCATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCCAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTA-AGAGACGACCAGATTGGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGAAAAAT--CTATTGCGATCAGCTATTTGTTTGGTGCGTTATACAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGATTGGCCATCC-TTATG--TGTGAAAAATACCTTTAAGGACT-------CATTTGAAGACGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCACTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGAGA---ATTTAGTTTAAATTTC-CTTATTGATCCCGGTCTGCCCTGCTCTCTAATTT-TCTTTTCCCACTAAATGATAA---AGTTTAGTCACACGCAGTGAATGAATAAAAAGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTGTTTATTAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTTACAGTTCT-AAACCCAACCCAATCCACATTCAAACCAGCCTATGAACGTAAATCAACGACTTATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTGATCATGATATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAACTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACAGACTAGAAGATATTGAAATAGTTTTTCCTTGTAGTCATCAACACCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--AC---------------TTTC---------------TTATCGTAGATCAGGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATACCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-ATCTTATTCTTACGGTTTTAAAAAAAATTAACCATGATTTTGGGGATGT-ATAGCA-GTTA-TGTACTTCACTTAGGCT--GT-CAACAAGCCAAGAA-AA------CAT-----T------------T----CT----------------A-TTGTACACTGGGTTT-AATTTT---AAGTTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---T---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAATATATAGGCAAT-A-----TCTGCCTTT--------CGCAATTGGTTTGAAAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTTGATATTTTTGGCCACTCGTGACAGAGTTCAAATTCATTTGCCACTTCCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATAGTTCATAATTTGTTTAGCAGAAGCTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTA-TTCATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTATGATACTTGTTTTCACGCAAATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATC-ACAA-GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCTAACAGCGGCTTCTCATTCAATATAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTAATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGTTAGAC
gi|10 : ACATTAGGTACACACATCA-TCAATGCTAGAAGAAATTAAAGATAAGAATTTAGATGTATTCAACAGCT-TATGTTATTTTATTATGATGTACAAAATACTTAAGCCTTTGTACATTTACATCTGCAATACCCTTTGTCATCATGCAGAGCGATGACCACATTAGTTCCCATCTTTTTCCCATTTTTTTT------A-----TACTTAGAATGGTGAATGGAAAATAAGT-ATATTCCTGCAATAT--TAATTTCGATAAGCTGTCCGTTTGGTGCGTTATA--GCTGAGTTGACGATACAAAAGTTGGTC-TCCATTATGACTGTGAACACTTCCTTTAAGGATTTATTTA-CATTTGAAGAAGTGATTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCAATAACT
gi|11 : aactctctattatttagatattattttatactgttactcaacgttttcatcgatttttttcaaaaaagatatgcatggacacgtacgatacaaaattgttacagtaatgctataaacaaagcaaagatttgcatcgataagcaaattaaagcaggtggggtaaattatcgttGTCCAAACTGTCAGCTAATCAACAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGAT-AAAAGAATTGGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATAGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGctataagagaaagtcgtgaatatagt
gi|11 : GGCAGAAACTGGAATTGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTA-TTCATGAATGTGAATTCGCTGTTGGGGATTTTTTTTTATCAGTCAGTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGATTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCAAGAAAACAAGTATC-ACTA-GGTTAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAAAAAAATTCCCCAACAGTGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATACAACCTTGTGATATCGTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGACcagaaactggaattggctgattatttctattaagtattcatgaatgtgaattcgctgttggggatttttttttatcagtcagtatataatgttattatccttgtgatacttgatttcacgcacatacatgtatggaaataatatgtgcaagaaaacaagtatcactaggttaataacattatataatgactgataaaaaaaaattccccaacagtggattctcattcaatacaacctaaataacaggaaaatggtatacaaccttgtgatatcgtgtgtctaccctactgcaagattcagtttatagtctatatacttctgctagac
gi|12 : gtccaaactgtcagctaatcaacaattttcagcaagcatttactacaaaggataaaagaattggatgaacaatttacttaaattgcaataggattaaaatcatttattatgaaaagagggCACATAT-ATTGCCTAATGTTGTACAGACTGACCAGAGAATATTAACCTAGTTCCTTCTTGCGGTCAACGACTCCAAGAAATTCGTCCAGGTTGCCAGG--AA-TTTAAGACCTTTGCATATAGC---------------TTTCTACGTGTCCTGTTTCCTATCGTTAATCATGTAAAAAACTACCCTGCACATG-CTCATCCCTACCAATCGGCTGAC--ATCGGAGAGCTTTC-TTCTTTTACTTATGGTTTTAACACATTTTA-CCGTGACTTTGGG-ATGT-CTGTCA-GGCAATGGATTTCACTAAGACT--GTGCTTCAA----AGAATAA------CAT-----C------------T----TTTTGGTGTGTTCCTA--G-TTGTACATTTGGTTTTAATTTT---AAGGTCCAATTTGATCAAATTCGCTTTTTTCC-----------------TTGAG---GAAGAGAAACTGT-------------TT---TTTGGTTGGTT-----------------------CTA-GAAAATCTAGGCAAG-A-----TCGGCCTTT--------CGTA
gi|13 : TGAAAAGAGAG--ATTTTAATTATAATGGAAA-TTGACACACTTTTCATCACTATATTTCACCATTTGTTTG-------TTTGTCATGGCTGATTTTATACAATGAACTATTT-AAAAATGT--ATCC
gi|14 : GCCTTTTGTTGTACAGACAGACCAGAATATATTGAACTAGGTCTTTCTTGTTGTCATTTACCCCATGAAATGCGTCTCGG-----AGGT----TTGAAG--CTTTGCACA--GC---------------TTTCTACGTATCCCGTTTCCTATCGTAGATTATGTTAAAGAATACCATGCATATA-CTCACCCCTGTCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAG------TTCTTATGCTTATGGTTTTACCACAATTTAACCATAATTTC-GGGATGTCCTGAAG-GTTA-TTGATTTCACTTCGACTGCGT-CACT------AGAATAA------CACAGCTAT------------TGTAGTTT---------CCTA--A-ATGTACACTGGG-TC-AGTTTT---A--GTCAGATTTGA---------------TCCAATGCACATATTTCACTT---G---A---------TGTGCGAGGACCTGGATT---TTC----GATA-----------------------TCA-GAAAAACTAGTCAAA-A-----TCTGACTTT--------CG-GCTTGaagtatatgcattagtttatgtcccgaattatcggaaatatttgacatctaatatttttgacaacaatcaaatttatattccggacactcgaacatatttttacaattcaatacattcttataccgttttattctattatacagatattcgaaataatctgacacattttaccaatgtaatacatgtcggaaaattagaaaataaatgttatatagaaattccggacaatcaaacataattcaacaaagtagttaatttctgaataacggacatgaatattatatggaaattccacacaatcagaaataa
gi|15 : -GTTT-TGGATTTCACTTA----------------CCGAGAATAA------CAT-----TATAGTTATTGTGT----TTT---------CTTA--G-TTGTACACTAAGCTT-AGTTTG---AAGGTCAGATTTGA---------------TCCAA---------------T---GCGCA---------CAT-------------TTCACTT-----GATG---------------------------GAA-----AGGAACT-GGTGTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCGCACAAGACATGACAAGCGGGGTAGTAGTGC---CTTGGATATCATTGGCCGCTCATGCCAGATTTCGAATCCA
gi|16 : gCCGCAAAAAA-CCATTTCGAGAAGCTGTTCGTCCGGTGCGTTATA--GCTGAGCTGT--ATACAAATGTTTATCACCC-TTATG---GTGGACAGTTTCTTTATCAATTCAAT-AACATTTAAAGAAGTGTTTGTTGGGACAAATACAAAACACTGTATAACTGGCATTACACCATCGTGA-ACTC---TTCA-GC-AGAAACGGTACATATAATTCCAACAGCAGTTATTGTTCCCGGTCACTCTTGCTCTATTGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGCTGA---TG-TTGGTCACAaaatcgaccctttggtctctcaaaaacagctctggttctacatagaaaaggaactccagatcgatacatataaattctgatcttcacagtctagctatataggttgttatatacta
gi|17 : gcagagtcaaccagatC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----TGTG-----------------------TCACAAACACA-AGTCAAG-A-----TATGCGTTT--------CGCATTT
gi|18 : tcttagtttcttaatttcaaaaaggtcacattatgttccaatacgcatatttcaaaactatgatcgtgatgaagagaag-ATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGAAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATATTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATA--------AAAAAAATCACCAACAGCGGATGCT--CATTCAATACAACCTGAATAACAGGA--AAATcgatcccaaacccaaccttctgtacattcaaaaaccacacgcttgttctacctaagactgatttatataaattctaatcttacttggcagtctaattaaataaattgttatcactatacatata
gi|18 : TAATAAAA--AAAATCACCAACAGCGGATGCTCATTCAATACAACCTGAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGggtataaaaccttgtgatatcttgtgtctaccctactgcaagattcagtttatagtctatatacttctgctag
gi|2 : atgaatgtgaatccgctgttgggaaatttttttatcagtcattatataatgttattatccttgtgatatttgttttcacgcacatacatgtatggaaaACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAATAGCTTTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTAGTTCCAAT---------CTTTTT---------G-----GTCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGCAAAAT--CTATTGCGATAAGCTATTTGTTTGGTGCGTAAAATAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGGGTGGCCATCC-TTATG--TGTGAAAAATACCTTTAAGGACT-------CATTTGAAGACGTGCTTGTTGGGACAAAT-CA-------CTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGTGA---ATATAGTTTAAATTTC-CTTATTGTTCCCGGTCTGCCCTGCTCTCTAGTTT-TCTTTTCCCACTAAATGATAA---ATTTTAGTCACACGCAGTGAATGAATAAAAAGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTGTGTATTAAGTTAATATGAAACGGT----ATGCATACGAAAAGTACTTTTA-CAGTTCT-AAACCCAACCCAATCAACATTCAAACCAGCCAATGAACCTAAATCAACGACTAATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGATATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACAAAT-ACTGCCTATTGTT-TACAGACTGACTAGAAGATATTGAACTAGTTTTTCCTTGTTGTCATCAACGCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--AC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCAGGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATACCTACCGATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATTCTTATGGTTTTAACAAATTTTAAACATGATTTTGGGGATGT-ATAGCA-GTTA-TGTACTTCACTTAGGCT--GT-CACCAAGCCAAGAA-AA------TAT-----T------------T----TT----------------A-TTTTACACTGGGTTT-AATTTT---AAGTTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAATATATAGACAAT-A-----TCTGCCTTT--------CGCAATTGGCTTGAAAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATTATTGGCCACTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTTCCTTTAATTACCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAACATTTACTACAAAGGACTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATAAAGTA-TTAATGAATGTGAATCCGCTGTTCGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATT---------ATACGTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATC-ACCA-GGATAATAACATT--ATATAA--TGNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTATTCA
gi|20 : CAATTATTATGAAAAGAGGGGGAATAAAAATACAACAAAAACTTAATATACTTTT-ATCAATATATTTCATTATgcattaagcaaacaat
gi|22 : ttttgtataacattgtattatgtcttacatgtaataaaatgtattcatcacacaaaagtgaatatatatatataaACTGATAAAA--AAATTCCCAAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATCTCTTGTGTCTATCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
gi|23 : CAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTGAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTA
gi|24 : TTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTGCCCTACTTCAAGATTCAATTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
gi|25 : -ATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATATTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAA
gi|26 : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTA
gi|3 : gTGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACACCAATAACT-AATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTAGGCAGAATCTGGACATGGCTGACATT-TTCTATTAAGTA-TTCATGAATGTAA
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gi|5 : AAATACCATTTTTCAGCATGTAGACAGACGAC-AGATATGTTCCAAT---------ATTTTTCCAAATCTTATTTTTGGCTCGGAATG-------------G--TGATA-----GGAAAATAACT-----GGTAAACTGTTCTTTTGGTGCTTTATAT--CTTAGCTGCCGATATAAAGGTTGGTCACCT-TAATG--TGTGAACAATACCTTTAAGGACTT--T-A-CATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGCAC
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gi|6 : tttaaataccatttttcagcatgtagacagacgacagatatgttccaatatttttccaaatcttatttttggctcggaatggtgataggaaaataactggtaaactgttcttttggtgctttatatcttagctgccgatataaaggttggtcaccttaatgtgtgaacaatacctttaaggactttacatttgaagaagtgcttgttggcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtTAAAGAAGTGTTTGTGGATACAAATACATATCGCTCTTTTATTGGCATTAAAACTTCATGGTATCTTTAT-AA-GA-AACAGTAC---ATAGAGTTTCAAAAAC-ATTATTGCTCCCGATCTTCGCTGTTCTATCTTTTGTCCGTTCCTACAATATCCTGA---AGTTTGATCACCC-CCGTGAATGTATGAAATGCTGGCAGGGATCTCGTCCTTTCTTTACTAAGTTAATGTGAAACGCT----ATGCATACGAGAAGTA-GTTTC-CAGTTCC-AAACACAACCATATCCACACTCAAACCGGTTTGTAAACTTAAATCAATGGCTAATACCAGGACATTGGTATCAAC------TGG--TTTTATCATGAC------------CTTAG----AGACCATAGCTGTGCTTTTTTGAAACACATGT-TCTGCTTATTGTTGTACATGCTGATCAGAAGCTATTGAACTAGTTCTGTCTTGTTGTCATCAACCCCATATAATACTTCCCGGGTGCCA-GGAAG-TTGGTG--C-TTGCATA--AT---------------TTTCAATACATTCCTTTTTCTATCTTATATCATGTCAAAGACTACCCTGGACATA-GTCATCCCTATCAGTCTGC-TAC--ATATGAGAGATCTCTTTCTTA---CTGTGGCTTTGATACATTT--------------GGGATGT-CTGGCAGGCTG-TGGATTTCAGACAG--T--GC-CATCAAG--AACAATAAATCTTTTAT-----T------------T----TGT---------TTTACTATTTGTACA--GGGATT-AATTTCACGAAGGTCAAATTTGG---------------T
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-523 ) : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTGGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGCAAAAT--CTATTGCGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATATAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGGTTGGCCATCC-TTATG--TGTGAANAATACCTTTAAGGACT---T---TACATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGCGA---ATATAGTTTNAANTNC-CTTATTGTTCCCGGTCTNCCCTGCTCTNTAGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGATGA---AGTTTGGTCACACGCCGTGAATGAATGAAANGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTCTTTATCAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTC-CAGTTCC-AAACCCAACCCAATCCACACTCAAACCAGCCTGTGAACTTAAATCAACGGCTNATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGACATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACTGACCAGAAGATATTGAACTAGTTCTTTCTTGTTGTCATCAACCCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--GC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCATGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATCCCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATNCTTATGGTTTTAACACATTTTAACCATGATTTTGGGGATGT-CTGGCA-GTTA-TGNATTTCACTTAGGCTGTCGC--CAAGCCGAGAATAA------CAT-----T------------T----TTT---------CCTAGTTGTACACTGGGTTT-AGTTTT---AAGGTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAANATATAGGCAAN-A-----TCTGCCTTT--------CGCACTTGGCTTGACAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATTATTGGCCGCTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTCCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTATTCATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATCACNA-----GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCCAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
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gi|11 : GGCAGAAACTGGAATTGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTATTCATGAATGTGAATTCGCTGTTGGGGATTTTTTTTTATCAGTCAGTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGATTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCAAGAAAACAAGTATCACTA-----GGTTAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAAAAAAATTCCCCAACAGTGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATACAACCTTGTGATATCGTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGACcagaaactggaattggctgattatttctattaagtattcatgaatgtgaattcgctgttggggatttttttttatcagtcagtatataatgttattatccttgtgatacttgatttcacgcacatacatgtatggaaataatatgtgcaagaaaacaagtatcactaggttaataacattatataatgactgataaaaaaaaattccccaacagtggattctcattcaatacaacctaaataacaggaaaatggtatacaaccttgtgatatcgtgtgtctaccctactgcaagattcagtttatagtctatatacttctgctagac
gi|12 : gtccaaactgtcagctaatcaacaattttcagcaagcatttactacaaaggataaaagaattggatgaacaatttacttaaattgcaataggattaaaatcatttattatgaaaagagggCACATAT-ATTGCCTAATGTTGTACAGACTGACCAGAGAATATTAACCTAGTTCCTTCTTGCGGTCAACGACTCCAAGAAATTCGTCCAGGTTGCCAGG--AA-TTTAAGACCTTTGCATATAGC---------------TTTCTACGTGTCCTGTTTCCTATCGTTAATCATGTAAAAAACTACCCTGCACATG-CTCATCCCTACCAATCGGCTGAC--ATCGGAGAGCTTTC-TTCTTTTACTTATGGTTTTAACACATTTTA-CCGTGACTTTGGG-ATGT-CTGTCA-GGCAATGGATTTCACTAAGACTGT-GCTTCAA----AGAATAA------CAT-----C------------T----TTTTGGTGTGTTCCTAGTTGTACATTTGGTTTTAATTTT---AAGGTCCAATTTGATCAAATTCGCTTTTTTCC-----------------TTGAG---GAAGAGAAACTGT-------------TT---TTTGGTTGGTT-----------------------CTA-GAAAATCTAGGCAAG-A-----TCGGCCTTT--------CGTA
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Reference ( family-523 ) : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTGGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGCAAAAT--CTATTGCGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATATAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGGTTGGCCATCC-TTATG--TGTGAANAATACCTTTAAGGAC-TTA----CATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGCGA---ATATAGTTTNAANTNC-CTTATTGTTCCCGGTCTNCCCTGCTCTNTAGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGATGA---AGTTTGGTCACACGCCGTGAATGAATGAAANGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTCTTTATCAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTC-CAGTTCC-AAACCCAACCCAATCCACACTCAAACCAGCCTGTGAACTTAAATCAACGGCTNATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGACATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACTGACCAGAAGATATTGAACTAGTTCTTTCTTGTTGTCATCAACCCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--GC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCATGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATCCCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATNCTTATGGTTTTAACACATTTTAACCATGATTTTGGGGATGT-CTGGCA-GTTA-TGNATTTCACTTAGGCTGTCGC--CAAGCCGAGAATAA------CAT-----T------------T----TTT---------CCTAGTTGTACACTGGGTTT-AGTTTT---AAGGTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAANATATAGGCAAN-A-----TCTGCCTTT--------CGCACTTGGCTTGACAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATTATTGGCCGCTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTCCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTATTCATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATCACCA-----GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCCAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-523 ) : ACATTAGGTGCACACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAT--TTTACATATAAACAACAGCTCTTTGT-ATATAACTATGATGTAAACAGTACTCTAGCCTTTGTACATTTACATCTGAAATACACTTTGTCAGCATGTAGAGAGACGACCAGATTGGTTCCAAT---------ATTTTT---------A-----GGCTTGGAATG-------------AACT-ATACCCCTGCAAAAT--CTATTGCGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATATAGCTGAGCTGTCGGTACAAAGGTTGGCCATCC-TTATG--TGTGAANAATACCTTTAAGGAC-TTA----CATTTGAAGAAGTGCTTGTTGGGACAAATACAAATCGCTCTATAACTGGCATTACACCTTCATGG-ATTCTGATTCG-GA-AGTAGCGA---ATATAGTTTNAANTNC-CTTATTGTTCCCGGTCTNCCCTGCTCTNTAGTTT-TCCTTTCCCACTAAATGATGA---AGTTTGGTCACACGCCGTGAATGAATGAAANGCTGGCAGGGATCTCGTCCTCTCTTTATCAAGTTGATATGAAACGGT----ATGCATACGAGAAGTA-TTTTC-CAGTTCC-AAACCCAACCCAATCCACACTCAAACCAGCCTGTGAACTTAAATCAACGGCTNATACCAGGACATATGTATCAAC------T-G--TTTTATCATGACATTTCATATACATTTAGTAGCAGACCATAGCTGTGCTTGTTTGAAACACATAT-ACTGCCTATTGTC-TACAGACTGACCAGAAGATATTGAACTAGTTCTTTCTTGTTGTCATCAACCCCAAGAAATGCGTCCCGGTTGCCAGGGAAA-TTGGAG--CTTTGCATA--GC---------------TTTC---------------CTATCGTAGATCATGTTAAAGACTACCATGCACATA-CTAATCCCTACCAATCTGCTTAC--ATCGGAGAGTTCTC-TTCTTATNCTTATGGTTTTAACACATTTTAACCATGATTTTGGGGATGT-CTGGCA-GTTA-TGNATTTCACTTAGGCTGTCGC--CAAGCCGAGAATAA------CAT-----T------------T----TTT---------CCTAGTTGTACACTGGGTTT-AGTTTT---AAGGTCAGATTTGA---------------TCC-----------------T---G---G---------TGT-------------TT---TT-----GGTG-----------------------TCA-GAANATATAGGCAAN-A-----TCTGCCTTT--------CGCACTTGGCTTGACAAGCGGGTT-GTAGTGA---CTTGGATATTATTGGCCGCTCATGACAGAGTTCAAATCCATTTGCCACTTCCCTTTAATTCCCATATGTACAAACTGTCAGCCAATCAGCAATTTTCAGCAAGCATTTACTACAAAGGATTAAAAGGATTAGATGAACAATTTACTTAAATTGCAATCGGATTAAAATCATTTATTATGAAAAGAGGGGGAATTAAAATACAACAAAAACTTAATAAACTTTT-ATCAATATATTTCATAATTTGTTTGGCAGAAACTGGACATGGCTGATTAT-TTCTATTAAGTATTCATGAATGTGAATCCGCTGTTGGGGAATTTTTTT-ATCAGTCATTATATAATGTTATTATCCTTGTGATACTTGTTTTCACGCACATACATGTATGGAAATAATATGTGCATGAAAACAAGTATCACCA-----GGATAATAACATT--ATATAA--TGACTGATAAAA--AAATTCCCCAACAGCGGATTCTCATTCAATACAACCTAAATAACAGGAAAATGGTATAAAACCTTGTGATATCTTGTGTCTACCCTACTGCAAGATTCAGTTTATAGTCTATATACTTCTGCTAGAC
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gi|12 : gtccaaactgtcagctaatcaacaattttcagcaagcatttactacaaaggataaaagaattggatgaacaatttacttaaattgcaataggattaaaatcatttattatgaaaagagggCACATAT-ATTGCCTAATGTTGTACAGACTGACCAGAGAATATTAACCTAGTTCCTTCTTGCGGTCAACGACTCCAAGAAATTCGTCCAGGTTGCCAGG--AA-TTTAAGACCTTTGCATATAGC---------------TTTCTACGTGTCCTGTTTCCTATCGTTAATCATGTAAAAAACTACCCTGCACATG-CTCATCCCTACCAATCGGCTGAC--ATCGGAGAGCTTTC-TTCTTTTACTTATGGTTTTAACACATTTTA-CCGTGACTTTGGG-ATGT-CTGTCA-GGCAATGGATTTCACTAAGACTGT-GCTTCAA----AGAATAA------CAT-----C------------T----TTTTGGTGTGTTCCTAGTTGTACATTTGGTTTTAATTTT---AAGGTCCAATTTGATCAAATTCGCTTTTTTCC-----------------TTGAG---GAAGAGAAACTGT-------------TT---TTTGGTTGGTT-----------------------CTA-GAAAATCTAGGCAAG-A-----TCGGCCTTT--------CGTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12 : gtccaaactgtcagctaatcaacaattttcagcaagcatttactacaaaggataaaagaattggatgaacaatttacttaaattgcaataggattaaaatcatttattatgaaaagagggCACATAT-ATTGCCTAATGTTGTACAGACTGACCAGAGAATATTAACCTAGTTCCTTCTTGCGGTCAACGACTCCAAGAAATTCGTCCAGGTTGCCAGG--AA-TTTAAGACCTTTGCATATAGCTTTCTACGTGTCCTGTTTCCTATCGTTAATCATGTAAAAAACTACCCTGCACATG-CTCATCCCTACCAATCGGCTGAC--ATCGGAGAGCTTTC-TTCTTTTACTTATGGTTTTAACACATTTTA-CCGTGACTTTGGG-ATGT-CTGTCA-G-GCAATGGATTTCACTAAGACTGT-GCTTCAA----AGAATAACA-------T-------C-------TTTTTGGTGTGTTCCTAGTTGTACATTTGGTTTTAATTTT---AAGGTCCAATTTGATCAAATTCGCTTTTTTCC-----------------TTGAG---GAAGAGAAACTGT-------------TT---TTTGGTTGGTT-----------------------CTA-GAAAATCTAGGCAAG-A-----TCGGCCTTT--------CGTA
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