lowQualScore                  :                                             1111                         222                                                                              11111                     1                                                                        1                                                                         1                            11                  1                                                                                                                                                                                                                                        11  1               2  11                                      2                                                                                                               
lowQualScore                  :                  1         2222  5555  22   8888 2     5           1 3   222      11 88888888888888888  1 1  1     666666666666 1            6   1     11 00000  11 2           11  3    5  33 44444444   2    11    555555555555      1               1     6               11      55                              6 444          5  6                            11 1      11        4     2222                        1            8   66666  2                  6   1  3 999                3  1                6           88    666666666666 333333   1  9999 3333 222 4444 2222  1  222 1  4 4444 1   2   222            66  2               7  00        11 55           444 11        1   888 1    3                                                 222                                              
lowQualScore                  :                  .         ....  ....  ..   .... .     .           . .   ...      .. .................  . .  .     ............ .            .   .     .. .....  .. .           ..  .    .  .. ........   .    ..    ............      .               .     .               ..      ..                              . ...          .  .                            .. .      ..        .     ....                        .            .   .....  .                  .   .  . ...                .  .                .           ..    ............ ......   .  .... .... ... .... ....  .  ... .  . .... .   .   ...            ..  .               .  ..        .. ..           ... ..        .   ... .    .                                                 ...                                              
lowQualScore                  :                  2         6666  2222  99   2222 4     5           2 5   888      66 22222222222222222  2 2  2     000000000000 2            1   1     66 99999  66 3           66  6    4  11 00000000   2    55    555555555555      1               1     9               55      55                              3 222          3  9                            99 1      55        7     4444                        1            1   77777  2                  5   1  5 222                4  1                0           77    000000000000 333333   1  0000 6666 000 9999 4444  1  000 1  6 7777 1   3   000            22  7               9  22        77 66           222 77        8   888 2    6                                                 222                                              
consensus                     :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCCNGTA-TTCTNG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGCAATACAG-ACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ACGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
Reference ( gi|5 )            :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATATG--A-ATCCACAACATCGGTGT-A-TTT-G-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATGACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GACTAGTTTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGAACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTGA---GGATGCTAATGCATTGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTAAAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTCTTG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGTTGCAAGAAGACCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTTGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACAAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|6                          :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGC----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCAGCGT-A-TT------ACGC--C-----------------AT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGATTAA---GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT--GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------T------AAT-TA----A----T---TTATCA----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTGGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGTACAG-TTT-C-A-ACTC-AGAGTTGCAGAATCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCCCAGACAGGTGTTGGGACAGGCTT
gi|3                          :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTATAC--C-----------------GC-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGATTAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAAGCAACTGACCGCCTGTA-ATCTT--GTGAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGAACCTACA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-AG---T-TAT-TATTAGTTGGTAATACAG-GCTGGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGTACAGTTTT-C-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGATCGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|2                          :       tGTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCAGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GC-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-TAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCAATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAACAAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT--GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGATGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------T------AAT-TA----A----T---TTATCA----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTGGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGTGCAGTTTT-C-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCTCAGACAGTCGTTGGGACAGGCTTg
gi|4                          :      gtGTGATGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GC-T-AT-ACTTT------------T-TTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGATTAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TG-TATAACCAGCTGACCGACTGTA-TTC-TG-GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCAAGAAGACTTTTCA------------T------AAT-TAATTTA----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTAGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGCGCAG-TTTCC-A-ACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|1                          :       tGTGACGAAAA-ACGCATTGT----AC----AT--ATATA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTAATAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTCATATAT--GACTAGTCTA--A--------GTA-TTCT--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGGTACTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GATCGA--ACAACCCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTTACTAG-GCCATGTGACTTATGC-----TATTATAAACAGCCGACCGCCAGTA-TTCTGG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGTAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCAANNNNNNNNNNNN------NNN-NN----N----N---N----N----NN-NN---N-NN-N----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGAGACA
gi|12                         :       tGTGACGAGAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATATA--A-ATCCATAACATCGGTGT-----------------------------------GC-T-AT-ATTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAATGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGATTAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCCTGTGACTTCTGC-----TA-TATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TCCTT--GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------T------AAT-TAATTTA----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTGGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGTGCAGTTTT-C-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTTCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAAGCTT
gi|9                          :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AT----CT--ATAGA--A-ATCCGTAACATCGGTGT-A-TTT-TCTTACGC--C-----------------AT-T-AT-ATTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATATAG--GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAATGACATTTAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAA---CTGTCAGGCAGATGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTTATTCAATAGAATCGCATAATCTCGAACATCATTAAGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGATTAT-GTCATGTGAC--ATAC-----TA-TAAAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGA-GTCAGTCTGGTGTTAC-A------ACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TTAA----T-TAT-TAT---TTGGCAATACAG-ACTGAGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAAAACCGTCTGAAACTTGTGAACAGTCCTCCGGGTCTTAGT---CTGTTGGGTATCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTT
gi|20                         :       tGTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACAACGGTGT-ATTTT-G-TTACGC--C-----------------GT-T-GT-ACTTT---------------------------GCT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTCTATAT--GACTAGTCTT--A--------ATA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTATAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGTAGACGCTCATTGAATTCGATTAA---GGATGGTAAGTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATT--AT-G-------ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGACTAG-GCCATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGGCAGTA-TTCTTG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCGCGAAGGCCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---G-TT-A----A-TAT-TAT---TTGGT-ATACAG-ACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ACAAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAAT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGGTGGGACAGGTTT
gi|10                         :        GTGATGAAAA-ACACATTGC----AC----AT--GTAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--T-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T------------------ATGT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTTGAATATC-TTATGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGTCATGTGACTAG-GCCATGTATCTTATGC-----TA-TAGCAGCAGCCGATCGCCAGTA-TTCTAG-GTCAGTCTCGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAGGAGCTGCAAGAGTACTTTGCA------------T------AAT-CA----A----T---T----T----AT-TA---A-TTAA----T-TAT-AAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTGGGCCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCTGGGTCATAAT---CTGTTCGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTAGGACAGGTTTg
gi|13                         :       tGTGACGAAAAAACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-ATTTT-G-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGTTTGATAACT-TTTTA--T-T---TA--C-C-TTTATATAT--GAATAGCCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATCTCGAACAT------GT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGCCATGTGATAAG-GTCATGTGACTTATGC-----TA-TATAACCAGCCAATCGCCAGTA-CT-TTGCGTCAGTCTGGTGCTACAAA-CTCGACGAAGAAGGAGCTGCAAGGAAAGCCCGCA------------T------AGT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGCAATACAG-ACTGGGACTTTGAACCGAGTGT-CACAAATGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTT-T-T-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGCCTCAGACAGGTGTTTAGACAGGTTTga
gi|19                         :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AT----CT--ATAGA--A-ATCCAT--------------TTT-G-TTACGT--T-----------------GT-T-AT-ACTTT--------------CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCA--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTGGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTGGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTAATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATTATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GTCCGATTAAAGTCATGTGACTAG-TTCATGTGACTTATAC-----TATTATAAGTAGCCGACCACC--TG-GTTTCGAGTCAGTTTGGTGTTAC-AA-CGCGACGAAAAAGGAGCTGAAAGAAGACACTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA--------A----T-TAT-TAT---TTGGCAATACAG-ACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--AAGAAGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTT-T-T-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGATTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTT
gi|7                          :       tGTGATGAAAA-ACGCCCTGT----AT----CT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-T---TA--T-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTTC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTACAATAAACATAGTT--AATAAA--CTATCAGGCAGACTCTCATTGAATTTGATAAA---GGATGCTAATTCAATAGAATCTCATAATCTCGAACATCATTAAGT-GGTCAA--ACAACACTAAGAAT----TACCGATTGAAGTCATGTGACAAG-GTCATATGACTTATAT-----TA-TATAAGCAGCCGACCGGTTGTA-TTCTGG-GTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------T------GAT-TA----A----T---T----T----AT-TATTTACTT-A----T-CAT-TAT---TTGGCAATACAGTACTGGTACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATT----------GAGT-----TTT-G-A-ACTC-AGAGATGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGTCGTAGT---CTGTTAGGTGCCATTGTTTGTCTCCGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|16                         :       tGTGACGAAAA-GAGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TAACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGCTGAGAACT-TCAT---T-G---TA--C-ATTTCATAAAT--GA--A----A--A--------GTT-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTATATAAAT-AAACGTTCAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGATGGTTGAATAGAATCGCATGATCTCGAACACCATTAAGT-GGTCGA--ACAACACTAAGTAT----GCCCAATTGAATTCATGTGACTAG-GCCATGTGATTTATGC-----TA-TATAAGAAGCCGAACGCCAGTA-TTTTTG-GCCAGTCTGGTGTTAC-AA-TTCGACGGGGAAGGAGCTGTAAGAAGATGTTGCT------------T------AAT-TATTT-G----T---T----A----AA-TA---A-TT-A----G-TAT---------GG------GG-ACTGGGACTTTGGACGGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGTGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTTTG-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGATCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|32                         :        GTGACGAAAA-ACGCTTTGT----AT----AG--A------A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--T-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTATT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGATTAA---GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCAT--------------GTGACTTCTGCT----TT-TATAAGGACCCGACCGCCTGTA-TT-TTGCGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAAGAGCTGCAAGAAGg
gi|33                         :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATATAGAA-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GC-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-TAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT--GTCAGTCgac
gi|26                         :       tGTGACAAAAA-ACACCTTGT----AT----CT--ATA-G--ACACCCATAACACTGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-TT-TCTTT------------TTCTATTGGTTGATAACTATTATA--A-T-------C-CTTTTATATAT--GAATGATCT-------------------------------------------------GTTA---TAAT-AAATGTACC-AAAACATAGTT--AATAA---TTGTAAGGCA-------------TTTTATAAA---GGATGATTATTCAATAAAATCGCATAAACTCGAACAGTATTATGC-AG--GATTACAACACTAAGAAT----GCATGATTAAAGCCATGTGACTAG-GTCATGGGGTTTATGC-----TC-TATCAGCAGCTGACCACCAGTA-CTTTGA-GGCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCCAGGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGAC---------------------------T-TG----A----T---T----A----AT-TA--------A----T-TAT-CAT---TTGGCAAGACAGTACTGGAACATTGGACCGAGTGT-AACAAGTAA--ATGAGGGATTCTTA---G--AAGTGCAGTTTT-A-A-ACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAATGCAACAGGTCGCAATCGACTGTTGCG-GTCATTGGTTTTTTTACACAGGTGTTTGAGCAGGTT
gi|27                         :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCTATAACATGGGTGT-ATTTT-G-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGTTTGATAACT-TTTTA--T-T---TA--C-C-TTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATATGGAACAT------GT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGATAAG-GTCATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCca
gi|18                         :        GTGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTAT--ATAGA--A-ATCCATATAATCGTTGT-A-TTCAG-CTATAC--T-----------------GTCT-TT-A-TTT------------A-CTATTGGTTAATAACT-TT-TA--T-TGTATA--CACATTCAAATAT--TAATGATTTATTA--------TTAATTCG--CTAT------------TGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGGTAAAC--AGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGAATATTATCGAAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTTATATCATGTGACTTA-TCCATGTGACTTATGA-----TA-TATAAGCA----------ATTA-TTTTGA-GTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------T------AAG-TG----A----A---T----A----AT-TA---A-TA-T----T-TAT-GAG---TTAGCTAGACAGTGATGGAACTTTGGACCGAG-TTTCACAAGTGG--ATGAGAAATTCTCATCAG--AAGTGCAG-TTTTG-A-ATTA-AGACCTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGTTGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTGtatataaggaaagcccgcatagttaattaattaattattattatttggtaatacagactgggactttgaaccgagtgtcacaaatgaatgagggattctcagaagtgcagtttttactcagagaaccctctgaaatttgtgaacagtgcttcgggtcgtagtctgttgggtgccattgttcgtctcagacaggtggtgagacag
gi|38                         :        GTGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GC-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAAAGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACTCTTATTGAATTTGATTAA---GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGAATTTCATTATGT-GGTCGT--ACAACACT
gi|31                         :        GTGACGAAAA-ACGACTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCACAACATCGGGATAA-TTT-T-TTACAC--CAAATTTCTTTTCTATTGGT-TGATAACTTTATATATACATTTT-CTATTGGTTGATGATT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------ATA--TCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTGAAATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTA-----AATAAAATTTGTCAGGCAGACGCTCATTAAATTTAATAAA---GGATGTTTATTCAATGAAATCACATAATCTCAAAGATCGTTATGTAGGGC-A--ACAACACTGAGAAT----GCCCAGTTG-AGTCATGTGACTAG-GTCATGTGACTaa
gi|34                         :      atGTAACGAAAA-ACGCCTTGT-----T----ATT-ATATA--A-ATCTATAACGTCGGTGT-A-TTTTG-TTGCGC--C-----------------GT-T-TT-TCTTT------------T-CGATTGGCTGACAACA-ATATA--T-A---TATTC-CTTTTATATAT--AAATGACCTG--A---------TA-TTCCATTTATATATAAATGACCTGTTAT-TTAAATCTCATTTAT-CAGCGTACGGAAG-CGTAGTT--AATAAA--TTGTTAGGCAGAC-CTCAATGAATTTGATTTA---GGATGCTTATTCAATAGAATCTTATAATCTCTAACCGTAGTCTGT-AGTGGA--ACAACACTAAGAATGCCAGCCCGATTAAAGT-------CTAG-CTCATATTACTTACGC-----TA-TATAAGCAGCCAACCGaagcatgtaaatcacttggtgcccccctacatcattttcaa
gi|44                         :        GTGACGAAAA-ACGCCCTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCAGTGT-A-TTTTG-TTACGC--T-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-TTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T------------------ATGT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTC---TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGT
gi|41                         :        GTGACGAAAA-AGGCCTTGTTATTAC----ATGTATATT--A-ATCCATAACATTAGGGT-A-TTTTA-CTACAT--T-----------------GT-T-TT-TCTTT------------T-CTGTTAGTTGACAACT-TTATA--TATA--TA--C-CATTTATATAT--GAATGATCTG---------------------TTAT-------------------TTAAATTGCATTTAT-CAAGGTAC-GGAAACAAAGTT--AATAAA--TTG
gi|50                         : tacatgtGTGACGAAAA-ACGCCTTGT----TC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGatttattttagcaatttcgaatttcatctctgagacggttacagtttggaatagcaaaa
gi|14                         :         TGACGAAAA-ACGTCTTGT----AT----AG--A-ATG--ACATCCATAATATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTATTGATTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTAATATAT--GAATAGTCTG--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AACC----------------T--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAATTGCATAATCTCTAACATCATTATGT-GGTCGA--GCAACACTAAGAAT----GCCGAATTGAAGTCATGTGACTAG-GCCATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCAACCGACCGCCAGTA-CTCTGG-GTTAGTCTGGTGTTATAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------T------AAT-TA----AG---TAAAT----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTTGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATAAGGGATTCTCA---G--AAGTGAAGTTTT-G-A-ACTC-GGAGTTACAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGAAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGATT
gi|15                         :         TGACGAAAA-AAGCCTTGT----TT----CT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTTTG-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACA-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTTTATAT--GAATAGGCTT--A--------GTA-TTCT--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTTCAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTTATTGAATTT--------------------CAATAGAATCGCATAATCTCGAACATCATTAAGT-GGTCAA--ACAACACTTAGAGT----GCCCGACTGAAGTCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTATAC-----TA-CATAAGCAGCCGAACGCCTGTA-TGTTAG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAAAAGGAGCTGCAAGATAACTGCGCA------------T------ACT-TAAGTTA----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGC-GTACAGTACTTGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGGGTGATTCAGA---G--AAATGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAAAACCCTTCGAAACTTGTTAGCAGTGCATCGGGTTGTAAT---TTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTAAGGCAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|11                         :         TGACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGGAT-A-AGT-C-TTACAC--C-----------------AC-T-TT-TCTTT------------T-TTATTGGTTGATAACT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATA----------GTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTACGGTGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATAATTAAAT-TGTCGT--ACAACACTGAGAAT----GCCAAATTAAAGTCATGTGACTAG-GTTATGTGACTTATGC-----TA-TATTAGCAGCCGATCGCCTGCA-TTTCGG-GTCAGTATGTTGTTAC-AA-CTGCACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGA--CTGCA------------T------AAA-TA----A----T---T----T----AT-TA---A-TT-A----T-TGT-TAT---TTGGCAATACAGTACTGGGACTTTTGACCGAGTGT-CACAAATGA--ATGAGGGAATTTTA---G--AAGTGCAG-TTT-T-T-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGAGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCAATTGCTTGTCTCAGACAGATATTGAGACATGTTTg
gi|23                         :        aTGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTAT--ATAGA--A-ATCCATA---TAGCTAT-A-CT--------GT--C-----------------TT-T-AT----TT------------A-CTATTGGTTAATAACT-TT-TA--T-TGTATA--CACATTCAAATAT--TAATGATTTATTA--------TTAATTCG--CTAT------------TGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGGTAAAC--AGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGAATATTATCGAAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTCATATCATGTGACTTA-TCCATGTGACTTATGA-----TA-TATAAGCA----------ATTA-TTTTGA-GTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------T------AAG-TG----A----A---T----A----CT-TA---A-TA-T----T-TAT-GAG---TTAGCTAGACAGTGATGGAACTTTGGACCGAG-TTTCACAAATGG--ATGAGAGATTCTCATCAG--AAGTGCAG-TTTTG-C-ATTA-AGACTTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGTTGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTGg
gi|8                          :           ACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATATA--A-ATCCATAACATCGGTGT-A-TTT-G-TTACGC--C-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTG----ATAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GACAAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTTATTAAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATACTAATGCAATGGAATCGCATACTCTCGAACATCATTATGT-GGACGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TAAAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTTG-GTCGGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTATA------------T------AAT-TA----A----C---T----A----AT-TA---T-TA-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTGGGTCTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|22                         :           ACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCTATAACATCTGTGT-A-TTT-------------------------------------ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T------------------ATGT--GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTACTGCTATTATA-TATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------T------AAT-TA----G----T---T----T----GT-TA---A-TTAA----T-TAT-TAT---TTAGTAATACAG-ACTGAGACTTTGAACCGAGTGT-CACAAGTGA--ACGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAag
gi|21                         :           ACGAAAA-ACGCCTTGT----AC----AT--ATAGA--A-ATCTATAACATCTGTGT-A-TTT-------------------------------------ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTATA--T------------------ATGT--GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-GTCATGTGACTACTGCTATTATA-TATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------T------AAT-TA----G----T---T----T----GT-TA---A-TTAA----T-TAT-TAT---TTAGTAATACAG-ACTGAGACTTTGAACCGAGTGT-CACAAGTGA--ACGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACA
gi|17                         :            CGAAAA-ACGCATTGT----AT----AG--A------A-ATCTATAACATCTGTGT-A-TTTTG-TTACAC--T-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGGTAACT-TTATA--T-T---TA--C-CTTTTATATAT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCA--TTAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAACCGCATAATTTTGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGGATGAAG--------------TCATGTAACTTATGC-----TA-TATAAGCAGCCGACAGCTAGTA-TTCTGG-GTCAGTCTGGTGTTAC-AAACTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-AATCAT-CAT-TAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTGGACGAAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTTTG-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|24                         :                            ----AC----AT--ATAGA--A-ATCCATAACATCGGGAT-A-TTT-T-TTATAAAAT-----------------GT-T--T--CGTT------------T-CTATTGGTTGATAACT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATA-AT--GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--TAAT------------TGTTTA----AGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGCAGTT--AATTAA--CTGTCAGGCAGATGTTCATTGA----------------TGCTATTTCAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTAAGT-GGTCGA--ACCACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTAATGTAACTAG-GCTATGTGACTTATAC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCCAGTATTTTTTG-GTCAGTCTGGTGTAAC-AT-CCCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACC---------------------------------------T---T----A----AT-TA---A-TT-A----G-TAT-TAT---TTGGCAGTACAG---T----CTTTGTACCGAGTGT-CACAAGTAG--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-GTT-T-T-ACTC-AGAGTTGCAGAAACCg
gi|48                         :                                 ttatttaaaaagcaatacatgtgtgacgTCAGTGT-A-TTTTG-TTACGC--T-----------------GT-T-AT-ACTTT------------T-CTGTTGGTTGATAACT-TTA--------------------TATATGT--GAATAGTCTA--A--------GTA-ATCC--TTAT------------TGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|25                         :                                                                   T-A-CTT-T-TTACAC--C-----------------AC-T-TT-TCTTT------------T-CTATTGGTTGATTACT-TTATA--T-A---TA--C-CTTTTATAT----GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCC--ACAT------------TGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGT---AATAAAA-CTGTCAGACAAACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTTATTCAGTGGT-TCGCATAATCTCGAACATCATTAAAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCTATTGAAGTCGTGTGACTAG-GTCATGTGACTTATGC-----TA-TATAATCAGCCGAACGCCTGTA-TTTTTG-GTCAGCCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGTT------------T------AAT-TA----ATTTGT---T----A----AT-TA---A-TT-AT---T-TAT-TAT---TTGGCAATACAGTACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAATGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTG-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTACATCGGTTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|28                         :                                                                                                                                   TATCGATTGATAACT-TTATACAT-A---TA--C-CTTTTATATATATGAATAGCCTA--ATAAAATATGTA-TTCC--TTAT------------TGTTTAATTAAGTAACATTAAT-CAACGTATGGAAA-CGTAGTC--AGTAAA--CTGTTTGGCAATCACTCATTGAATTTGATTGAAAAGGATGCTTATTCAATAGAATTGCATAATCTCGGACGCCATTATGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTAACT-------TATGA------------TG-TATAAACAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGA-GTCAGTCTGGTGTTAC-AA----GAT---GAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----ATTTGAT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGCAATACAG-TACTGGACTTTGGACAGAGTGT-AATTAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-A-A-ATTCAAGAGTTGCAGAACACTCTg
gi|45                         :                                                                                                                                       taatatcaatctcttgtttgttgtgccacttcaagtttgtataatgtaagttgt--A--------GTA-TTCC--TTAT------------TGTTTA-TTAACTTACATTAAT-AAACGTACAGATAATGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGATCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTTATTCAATGGAATCGCATAATATTGAACATCATTAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                           -TTCG--TTAT------------TGCTTA----ATTGACATTAAT-TAAAGTATTAAAAACGTAGTTAGAATA-----T-TCATGCAGGCGTTCATTTCATTTg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                               TATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTATTGTAATGGAATCGCATAATCTCGAACATCATTATGT-GGTCGA--ACAACGC-TAAAAT----GCCCTATTGAAGTCATGTGACTAG-GTCATGTGACTTCTGC-----TA-TATAAGCAGCCGATCGCTTGTA-TTTTGA-GTCAGTCTGGTGTTATAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTACAAGAAGACCCTGCA------------T------AAT-TA----tagtatacagacgattatttagtagaaccaggttttctcggcacggcacaacttgtaatggggcaaaaccagagtcatgtgactttgctatataagcagtggcctttatttaagctagcctggtgctagaacatgacggaagagagcgactagtatgtaaatataatttatctaataatgtatctatatagtacgtgaatacgtgattacaagatatgcaggaaactgttttaaactcagagttgcagaaccctctgaaacttttaaacagtccatacatagtctatcgggtgccattgcattacttcatcacaattgaatctggt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGCAGACGTTCATTGAATTTGATTAA---GGATGCTAATTAAATAGAATTGCATAATCTCGAACATCATTAAGT-GGTC-A--ACAACACTAAGAAT----GCCCAATTGAAGTCATGTGACTAG-GCCATGTGACTTATGC-----AA-TATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTGG-GTCAGTTTAGTGTAAC-AT-TTTGACGGAGAAGGAGCTGCGAGA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATTAA---GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATTATCTCGAACATCGTTATGT-GGTCGA--ACAACAATAAGGAT----GTCCGATTGAAGCCATGTGACTAG-ACCATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCTAGTA-TTCCGG-GTCAGTCTAGAGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------T------AAT-TA----A----T---T----A----GT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-G-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGAGTCGTAAT---CTGTTGGATACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGAAGGGTTT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAATCGAATAATCTCGCACAGTATTTAAT-GG--GA--AT-ACACAAAAAAT----GACAGACTGAAgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttggtatacggacatatattcagtggaaacaACCAGAGTCATGTGACTT-TGC-----TA-TATAAGCAG-TG---GCCTTTA-TT-TAA-GCTAGCCTGGTGCTAG-AA-CATGACGGA-AGAGAGCGACTAGTA-----TGTA-------------------AATATA----A----T---T----T----ATCTA---A-TA-A----TGTATCTAT---ATAGTA--------CGTG------------------AATACGTGATTACAAGATAT--GCA---GGAAACTGT---TTT-A-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTTTAAACAG---TCCATA-CATAGT---CTATCGGGTGCCATTGtaaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacactattttgacccgtctcctgtcacaactcgacagagaatgaactgcaatgagatatatataaacaattgattatttaattaatatgtgtttattgttttggctagacattatgttggcttacgcctgagtttcctgtgattggcgaattatctggaaaatagtttcatactcagatttccagaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcgttattgcttaattgacattaattaaagtattaaaaacgtagttagaatattcatgcaggcgttcatttcattttagtatacagacgattatttagtagaaccaggttttctcggcacggcacaacttgtaatggggcaaaTAT-GTAATGTGACTTATGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCCCGAA-TTTTGA-ATCAGTTTGGTGTAAC-AA-CTCGACGGAAAAGGACCTGTAAGAAGAC---------------------------T-TA----A----T---G----A----AT-TA---A-TC-A----T-TAT-TAT---CTGACAAGACGGTACTCGGGCCTTGGACCACGTGT-CACAAGTGA--GTGAAGGGCTCTCA---G--AAGTTAAG-TTT-T-ATACTC-AGTGTTGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAAAAGTGCAACGGGTCGCAGT---CTGTAAGGTGCTATTGTTTGTTTCAG-TAGTTGTTGAGACGGGcattacttcatcacaattgaatctggt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTGACGTGTGC-----TA-TATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTTA-GTCAGTCTGGTGTAAC-AA-ATCCACG-AGAAGTAGCTGCAAGTAGACTTTGCA------------T------GAT-TA----A----T---C----A-----T-TA-----TT-G----T-TAA-TAT---TTGGTAATACAGTACTTGGACCTTTGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAGGGTTTCTCA---G--AAGTGCAGTTTT-A-A-ACTC-TGAGTTGCAGAACCCTTTGAAA-TTGTGAACAGTGCATCGGGTCGCAAT---CGAATGGATGACATTGGTTGTTTCAAACAAGTGTCGAGGCAGGTTgtgcagtctgttaggtgttattgtttgtttcagtaggtgttgagacg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTA-TT-TTG-ACCCGTCTCCTGTCAC-AA-CTCGACAGAGAATGAACTGCAATGAGA---TATA------------TATAAACAAT-TG----A----T---T----A----TT-TA---A-TT-A----A-TATGTGT---TTcg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttggtatacggacatatattcagtggaaacatggaatcgaataatctcgcacagtatttaatgggaatacacaaaaaatgacagactgaataaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacaca-GTTAGTCTGGTGTTAC-AC-CTCGACAGAGAAAAAACTGTAAGAAGACTTTG----------------------AT-TA----A----T---C----A-------------------------AT-TAT---TTGACAAGACAGTACTGGGACTTTGGACCGAGTGT-CACAAGTGA--ATGAAGGATTCTCA---G--AAGCGCAGTTTT-A-A-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCATATGGTCGCAGT---CTGTTGGGTGCCATTGGTTCTTTCAAACAGGTGTTGAGACAGGCTattgttttggctagacattatgttggcttacgcctgagtttcctgtgattggcgaattatctggaaaatagtttcatactcagatttccagaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgaAAGGAAAGCCCGCA------------T------AGT-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-ACTGGGACTTTGAACCGAGTGT-CACAAATGA--ATGAGGGATTCTCA---G--AAGTGCAG-TTT-T-T-ACTC-AGAG------AACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGTCTCAGACAGGTGGTGAGACAGcaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                    gtgacgaaaaacgccttgtacatatagaaatctataacatgggtgtattttgttacgccgttatacttttctgttgtttgataactttttatttacctttatatatgaatagtctaagtattccttattgtttattaagttacattgataaacgtacagaaaacgtagttaataaactgtcagacagacgctcattgaatttgattaaggatgctaatgtaatggaatcgcataatatggaacatgtggtcgtacaacactaagaatgcccgattgaagccatgtgataaggtcatgtgacttatgctatataagctatat------AAT-TT----A----T---T----A----AT-TA---A-TT-A----T-TAT-TAT---TTGGTAATACAG-GCTGGGACTTTGGACCGAG-GT-AACAAGTGA--ACGAGGGATTCCCA---G--AAGTGCAG-TTT-TCA-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGTCGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTCTTGGAACAGGCTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-TA----A----T---T----A----AT-TA---A-GT-T----T-TAT---T---TTGGCAATACAGTACTGGGGCATTGGGCCt
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actTTGCAGAACTCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCAGGTCGTAGT---CTGTAGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTTGGACAGGTTT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): CCCCCCCCCCCCCCCAACCGGTGGGGTTGGGGTAACGCCCAGGGGAATTAGACATTTTTACACATAGTTTTTGCAAACGTTTCTTATTGTTC
Unaligned ( gi|51 ): ACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111          1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   1        3333  5555    11   11                         1       222 1 0       1               666666666666666 1     11 111111111   55555  0000000000000         7777777777777          33 33333333   2              1               1                     11      55                            1 1 111  2          1                      1         11   1      11              2222                                   55555       1 1                 1   1  1 44                3  1                            88    555555555555   555555555555 1  8888 3333 111 4444 2222  333  111 1  4444 4       111    0      2222 55                   2 1           1            444        1     2     3                                           1      222                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   .        ....  ....    ..   ..                         .       ... . .       .               ............... .     .. .........   .....  .............         .............          .. ........   .              .               .                     ..      ..                            . . ...  .          .                      .         ..   .      ..              ....                                   .....       . .                 .   .  . ..                .  .                            ..    ............   ............ .  .... .... ... .... ....  ...  ... .  .... .       ...    .      .... ..                   . .           .            ...        .     .     .                                           .      ...                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   2        7777  0000    66   66                         1       000 1 1       1               999999999999999 1     55 777777777   00000  6666666666666         6666666666666          00 99999999   1              1               1                     44      44                            1 1 888  1          1                      0         44   1      44              3333                                   33333       1 1                 8   1  2 99                3  1                            66    999999999999   555555555555 1  8888 5555 999 7777 4444  111  999 1  6666 4       999    1      4444 33                   2 1           5            000        1     5     4                                           2      111                                              
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
Reference ( family-5121 )     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCNGTA-TTCTNGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCATTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTAATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTCATATAT-------------GACTAGTCTA--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGGTACTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GATCGA--ACAACCCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTTACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-TTATAAACAGCCGACCGCCAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGTAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCAANNNNNNNNNNNNNN------------N-NN----N----N---N----N----NN---NN---N-NN----N-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGAGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGATGAAAAA-CACATTGC----AC----ATGT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTTGA-ATATC-TTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTATCT-----TATGCTA-T-AGCAGCAGCCGATCGCCAGTA-TTCTAGGTCAGTCTCGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAGGAGCTGCAAGAGTACTTTGCA------------TAA------------T-CA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----AATTATAAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGGCCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCTGGGT-CATAAT---CTGTTCGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTAGGACAGGTTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                        tTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATAAGTC-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-TTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA---------------------GTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTACGGTGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATAATTA--AAT-TGTCGT--ACAACACTGAGAAT----GCCAAATTAAAGTCATGTGACTAGGTTATGTGACT-----TATGCTA-T-ATTAGCAGCCGATCGCCTGCA-TTTCGGGTCAGTATGTTGTTAC-AA-CTGCACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGA--CTGCA------------TAA------------A-TA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----A-TTGTTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGAATTTTA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGAGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCAATTGCTTGTCTCAGACAGATATTGAGACATGTTTga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                       aGTGACGAGAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGT--------------G---C-TATATTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAATGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCCTGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TCCTT-GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAAGCTTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAAACGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGCCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAACCAGCCAATCGCCAGTA-CTTTGCGTCAGTCTGGTGCTACAAA-CTCGACGAAGAAGGAGCTGCAAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGCCTCAGACAGGTGTTTAGACAGGTTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-CGTCTTGT----AT----AGAA--TGA--CATCCATAATATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTATTGATTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTAATATAT-------------GAATAGTCTG--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AACC----------------T--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATTGCATAATCTCTA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--GCAACACTAAGAAT----GCCGAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAACCGACCGCCAGTA-CTCTGGGTTAGTCTGGTGTTAT-AAACTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----AG---TAAAT----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATAAGGGATTCTCA---GAAGTGAA-GTTTTGAACTC-GGAGTTACAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGAAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-AGCCTTGT----TT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------A-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTTTATAT-------------GAATAGGCTT--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTTCAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTTATTGAATTT-----------------------CAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTTAGAGT----GCCCGACTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATACTA-C-ATAAGCAGCCGAACGCCTGTA-TGTTAGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAAAAGGAGCTGCAAGATAACTGCGCA------------TAC------------T-TAAGTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGC-GTACA----GT-ACTTGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGGGTGATTCAGA---GAAATGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCCTTCGAAACTTGTTAGCAGTGCATCGGGT-TGTAAT---TTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTAAGGCAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAG-AGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-AACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGCTGAGAAC---------------T-TCAT---T-----G---TAC-----AT-------------TTCATAAAT-------------GAA------A--A--------GTT-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTATATAAAT-AAACGTTCAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGATGGTTGAATAGAATCGCATGATCTCGA-ACACCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGTAT----GCCCAATTGAATTCATGTGACTAGGCCATGTGATT-----TATGCTA-T-ATAAGAAGCCGAACGCCAGTA-TTTTTGGCCAGTCTGGTGTTAC-AA-TTCGACGGGGAAGGAGCTGTAAGAAGATGTTGCT------------TAA------------T-TATTT-G----T---T----A----AA---TA---A-TT----A-GTAT--------GG------G----G--ACTGGGACTTTGGACGGAGTG-TCACAAGTGAATGAGTGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                            CGAAAAA-CGCATTGT----A--------T--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTTTGT-TACACTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAACCGCATAATTTTGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGGATGAA-------------GTCATGTAACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACAGCTAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTACAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TTAATCA-TCATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACGAAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATATAATCGTTGTATTCAGC-TATACTG---TCTTTA-TTTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTTATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----AT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAGTGGATGAGAAATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGAATTA-AGACCTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTGg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCAT-------------TTTGT-TACGTTG---T-TATACTTT--CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTGGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTGGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTAA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATTATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GTCCGATTAAAGTCATGTGACTAGTTCATGTGACT-----TATACTATT-ATAAGTAGCCGACCACCTG-G-TTTCGAGTCAGTTTGGTGTTAC-AA-CGCGACGAAAAAGGAGCTGAAAGAAGACACTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAAAGAAGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGATTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCAATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACAAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT-GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGATGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCTCAGACAGTCGTTGGGACAGGCTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                      gtGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACAACGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TGTACTTT---------------GC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTCTATAT-------------GACTAGTCTT--A--------ATA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTATAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGTAGACGCTCATTGAATTCGA-T-T---AA-GGATGGTAAGTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TG----------ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCGCGAAGGCCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---G-TT----A-ATATTAT---TTGGT-ATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAAT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGGTGGGACAGGTTTg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATA---TAGCTATACT--------GTCT---T-TAT---TTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTCATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----CT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAATGGATGAGAGATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGCATTA-AGACTTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                            ----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATATTTTTTATAAAATG---T-T-T-CGTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA-AT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTAATTGTTTA----AGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGCAGTT--AATTAA--CTGTCAGGCAGATGTTCATTGA-------------------TGCTATTTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACCACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTAATGTAACTAGGCTATGTGACT-----TATACTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTATTTTTTGGTCAGTCTGGTGTAAC-AT-CCCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACC---------------------------------------------T---T----A----AT---TA---A-TT----A-GTATTAT---TTGGCAGTACA----G----T----CTTTGTACCGAGTG-TCACAAGTAGATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCAGGTTTT--ACTC-AGAGTTGCAGAAACC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttatttaaaaagcaatacatgtgtgacgTACTTT-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-CTATTGGTTGATTAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATAT---------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCACATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGT---AATAAAA-CTGTCAGACAAACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAGTGGT-TCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCTATTGAAGTCGTGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAATCAGCCGAACGCCTGTA-TTTTTGGTCAGCCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGTT------------TAA------------T-TA----ATTTGT---T----A----AT---TA---A-TT----ATTTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTG-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTACATCGGTT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACAAAAAA-CACCTTGT----AT----CTAT--AGA--CACCCATAACACTGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TTTTCTTTTTCTATTGGTTGATAAC---------------TATTATA--A-----T-----C-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATGATCT-----------------------------------GTTA---TAAT-AAATGTACC-AAAACATAGTT--AATAA---TTGTAAGGCA-------------TTTTA-T-A---AA-GGATGATTATTCAATAAAATCGCATAAACTCGA-ACAGTATTA--TGC-AG--GATTACAACACTAAGAAT----GCATGATTAAAGCCATGTGACTAGGTCATGGGGTT-----TATGCTC-T-ATCAGCAGCTGACCACCAGTA-CTTTGAGGCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCCAGGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TG----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATCAT---TTGGCAAGACA----GT-ACTGGAACATTGGACCGAGTG-TAACAAGTAAATGAGGGATTCTTA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAATGCAACAGGT-CGCAATCGACTGTTGCG-GTCATTGGTTTTTTTACACAGGTGTTTGAGCAGGTTg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATGGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATATGGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCca
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGTCTCAGACAGGTGGTGAGACAGtatataaggaaagcccgcatagttaattaattaattattattatttggtaatacagactgggactttgaaccgagtgtcacaaatgaatgagggattctcagaagtgcagtttttactcagagaaccctctgaaatttgtgaacagtgcttcgggtcgtagtctgttgggtgccattgttcgtctcagacaggtggtgagacag
gi|28                         : gtgacgaaaaacgccttgtacatatagaaatctataacatgggtgtattttgttacgccgttatacttttctgttgtttgataactttttatttacctttatatatgaatagtctaagtattccttattgtttattaagttacattgataaacgtacagaaaacgtagttaataaactgtcagacagacgctcattgaatttgattaaggatgctaatgtaatggaatcgcataatatggaacatgtggtcgtacaacactaagaatgcccgattgaagccatgtgataaggtcatgtgacttatgctatataagctatatTATCGATTGATAAC---------------T-TTATACAT-----A---TAC-----CT-------------TTTATATATAT-----------GAATAGCCTA--ATAAAATATGTA-TTCCTTATTGTTTAATTAAGTAACATTAAT-CAACGTATGGAAA-CGTAGTC--AGTAAA--CTGTTTGGCAATCACTCATTGAATTTGA-T-TGAAAA-GGATGCTTATTCAATAGAATTGCATAATCTCGG-ACGCCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGC-------------CATGTAACT-----TATGATG-T-ATAAACAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA----GAT---GAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----ATTTGAT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACT-GGACTTTGGACAGAGTG-TAATTAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAATTCAAGAGTTGCAGAACACTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatatcaatctcttgtttgttgtgccacttcaagtttgtataatgtaagttgt-TTCGTTATTGCTTA----ATTGACATTAAT-TAAAGTATTAAAAACGTAGTTAGAATA-----T-TCATGCAGGCGTTCATTTCATTTTAGTAT---AC-AGACGATTATTTAGTAGAACCAGGTTTTCTCGGCACGGCACAACTTGT-AATGGG--GCAAAACCA------------------GAGTCATGTGACT---T----------------TGCTA-T-ATAAGCAG-TG---GCCTTTA-TT-TAAGCTAGCCTGGTGCTAG-AA-CATGACGGA-AGAGAGCGACTAGTA-----TGTA-------------AA------------TATA----A----T---T----T----ATC--TA---A-TA----A-T--GTAT---CT----ATATA----GT-AC-GTGAAT----AC---GTGATTACAA----------GATATGCA---GGAA-ACT-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTTTAAACAG---TCC--ATACATAGT---CTATCGGGTGCCATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TATACCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAACTGACCGCCTGTA-ATCTT-GTGAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGAACCTACA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AGTTATTATTAGTTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTcattacttcatcacaattgaatctggt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATTATCTCGA-ACATCGTTA--TGT-GGTCGA--ACAACAATAAGGAT----GTCCGATTGAAGCCATGTGACTAGACCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCTAGTA-TTCCGGGTCAGTCTAGAGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----GT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGAGT-CGTAAT---CTGTTGGATACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGAAGGGTTTg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGACTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCACAACATCGGGATAATTTTT-TACACCAAATT-T---CTTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TACATTTTCTATTGGTTGATGATTTTATATATACCTTTTATATATGAATAGTCTA--A--------ATA--TCCTTATTGTTTA-TTAAGTGAAATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTA-----AATAAAATTTGTCAGGCAGACGCTCATTAAATTTAA-T-A---AA-GGATGTTTATTCAATGAAATCACATAATCTCAA-AGATCGTTA--TGTAGGGC-A--ACAACACTGAGAAT----GCCCAGTTG-AGTCATGTGACTAGGTCATGTGAC------TAAGC-A-T-GTAAgg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                      atGTGACGAAAAA-CGCTTTGT----A--------T--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTATT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACT---TC---TGCTT-----T-------T-ATAAGGACCCGACCGCCTGTA-TTTTGCGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAAGAGCTGCAAGAAGatcacttggtgcccccctacatcattttcaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATATATAGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT-GTCAGTCgac
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTAACGAAAAA-CGCCTTGTT---AT-----TAT--ATA--AATCTATAACGTCGGTGTATTTTGT-TGCGCCG---T-TTTTCTTTT-CGATTGGCTGACAACAATATATATATTCCTT-TTATA--TATAAAT---GAC-----CTGATATTCCA----TTTATATAT-------------AAATGACCTG-------------------TTAT-------TTAAATCTCATTTAT-CAGCGTAC-GGAAGCGTAGTT--AATAAA--TTGTTAGGCAGAC-CTCAATGAATTTGA-T-T---TA-GGATGCTTATTCAATAGAATCTTATAATCTCTA-ACCGTAGTC--TGT-AGTGGA--ACAACACTAAGAATGCCAGCCCGATTAAAGT-------CTAGCTCATATTACT-----TACGCTA-T-ATAAGCAGCCAACCG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGTAATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCCGAA-TTTTGAATCAGTTTGGTGTAAC-AA-CTCGACGGAAAAGGACCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TA----A----T---G----A----AT---TA---A-TC----A-TTATTAT---CTGACAAGACG----GT-ACTCGGGCCTTGGACCACGTG-TCACAAGTGAGTGAAGGGCTCTCA---GAAGTTAA-GTTTTATACTC-AGTGTTGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAAAAGTGCAACGGGT-CGCAGT---CTGTAAGGTGCTATTGTTTGTTTCAG-TAGTTGTTGAGACGGG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGGGG-TGCAGT---CTGTTAGGTGTTATTGTTTGTTTCAG-TAGGTGTTGAGACgtgcagtctgttaggtgttattgtttgtttcagtaggtgttgagacg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgtaatgtgacttatgctatataagcagccgaccgcccgaattttgaatcagtttggtgtaacaactcgacggaaaaggacctgtaagaagacttaatgaattaatcattattatctgacaagacggtactcgggccttggaccacgtgtcacaagtgagtgaagggctctcagaagttaagttttatactcagtgttgcagaaccctttgaaacttgtgaaaagtgcaacgggtcgcagtctgtaaggtgctattgtttgtttcagtagttgttgagaATGGAATCGAATAATCTCGC-ACAGTATTT--AAT-GG--GA--AT-ACACAAAAAAT----GACAGACTGAAg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttggtatacggacatatattcagtggaaacTA-TT-TTGACCCGTCTCCTGTCAC-AA-CTCGACAGAGAATGAACTGCAATGAGATA-TATA------------TAAACAATTGATTATT-TA----A----T---T----A----ATATGTG---T-TT----A-TTGT--T---TTGGCTAGACATTATG---TTGG--CTTACGCCTGAGTT-TCCT--GTGATTGGCGAATTATCT---GGAAAATA-GTTTCATACTC-AGATTTCCAGAAtaaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacactattttgacccgtctcctgtcacaactcgacagagaatgaactgcaatgagatatatataaacaattgattatttaattaatatgtgtttattgttttggctagacattatgttggcttacgcctgagtttcctgtgattggcgaattatctggaaaatagtttcatactcagatttccagaa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtatacggacatatattcagtggaaacatggaatcgaataatctcgcacagtatttaatgggaatacacaaaaaatgacagactgaataaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacacTGTGACG-----TGTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTTAGTCAGTCTGGTGTAAC-AA-ATCCACG-AGAAGTAGCTGCAAGTAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---C----A-----T---TA-----TT----G-TTAATAT---TTGGTAATACA----GT-ACTTGGACCTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGTTTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTC-TGAGTTGCAGAACCCTTTGAAA-TTGTGAACAGTGCATCGGGT-CGCAAT---CGAATGGATGACATTGGTTGTTTCAAACAAGTGTCGAGGCAGGTT
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAAAGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACTCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAcg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTATTGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAA-AAT----GCCCTATTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGATCGCTTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTATAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTACAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-TTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTG-T-ATAACCAGCTGACCGACTGTA-TTCT-GGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCAAGAAGACTTTTCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTAGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGCGCA-GTTTCCAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTGGGACAGGTTT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTGAGTTAGTCTGGTGTTAC-AC-CTCGACAGAGAAAAAACTGTAAGAAGACTTTG----------------A------------T-TA----A----T---C----A--------------------------ATTAT---TTGACAAGACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAAGGATTCTCA---GAAGCGCA-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCATATGGT-CGCAGT---CTGTTGGGTGCCATTGGTTCTTTCAAACAGGTGTTGAGACAGGCT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-GGCCTTGTTATTAC----ATGT--ATATTAATCCATAACATTAGGGTATTTTAC-TACATTG---T-TTTTCTTTT-CTGTTAGTTGACAAC---------------T-TTATA--TA----TA--TAC-----CA-------------TTTATATAT-------------GAATGATCTG-------------------TTAT-------TTAAATTGCATTTAT-CAAGGTAC-GGAAACAAAGTT--AATAAA--TTGcaa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatgtGGCAGACGTTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTAAATAGAATTGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTC-A--ACAACACTAAGAAT----GCCCAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCAA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTGGGTCAGTTTAGTGTAAC-AT-TTTGACGGAGAAGGAGCTGCGAGAatttattttagcaatttcgaatttcatctctgagacggttacagtttggaatagcaaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA------------T-TT----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTCTTGGAACAGGCTT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCCTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-TTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TT-CTTATTGTTTA-TTAAGTTATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTt
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAACTTACATTAAT-AAACGTACAGATAATGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGATCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATGGAATCGCATAATATTGA-ACATCATTA--
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGCAGAACTCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTAGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTTGGACAGGTTTag
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-ATCCTTATTGTTTg
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-GT----T-TTAT--T---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGGCATTGGGCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     actGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATG--AATCCACAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATGAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACTAGTTTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGAACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---GA-GGATGCTAATGCATTGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGTTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTTGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-G-TTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----TC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGC----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGCGTATT------ACGCCA---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTT-GTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTC-AACTC-AGAGTTGCAGAATCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCCCAGACAGGTGTTGGGACAGGCTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCCTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAT-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTTCTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTACAATAAACATAGTT--AATAAA--CTATCAGGCAGACTCTCATTGAATTTGA-T-A---AA-GGATGCTAATTCAATAGAATCTCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTAAGAAT----TACCGATTGAAGTCATGTGACAAGGTCATATGACT-----TATATTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGTTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---T----T----AT---TATTTACTT----A-TCATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGTACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATT-------G------A-GTTTTGAACTC-AGAGATGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTAGGTGCCATTGTTTGTCTCCGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                          tACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTG----ATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACAAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTTATTAAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATACTCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGACGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-AAAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTTGGTCGGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTATA------------TAA------------T-TA----A----C---T----A----AT---TA---T-TA----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGTCTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCGTAACATCGGTGTATTTTCT-TACGCCA---T-TATATTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAG-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAATGACATTTAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAA---CTGTCAGGCAGATGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGATTATGTCATGTGAC-------ATACTA-T-AAAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-C-----GGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AATTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGAGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCGTCTGAAACTTGTGAACAGTCCTCCGGGT-CTTAGT---CTGTTGGGTATCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): CCCCCCCCCCCCCCCAACCGGTGGGGTTGGGGTAACGCCCAGGGGAATTAGACATTTTTACACATAGTTTTTGCAAACGTTTCTTATTGTTC
Unaligned ( gi|51 ): ACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111          1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   1        3333  5555    11   11                         1       222 1 0       1               666666666666666 1     11 111111111   55555  0000000000000         7777777777777          33 33333333   2              1               1                     11      55                            1 1 111  2          1                      1         11   1      11              2222                                   55555       1 1                 2   1  0 4                 3  1                            88    555555555555   555555555555 1  8888 3333 111 4444 2222  333  111 1  4444 4       111    0      2222 55                   2 1           1            444        1     2     3                                           1      222                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   .        ....  ....    ..   ..                         .       ... . .       .               ............... .     .. .........   .....  .............         .............          .. ........   .              .               .                     ..      ..                            . . ...  .          .                      .         ..   .      ..              ....                                   .....       . .                 .   .  . .                 .  .                            ..    ............   ............ .  .... .... ... .... ....  ...  ... .  .... .       ...    .      .... ..                   . .           .            ...        .     .     .                                           .      ...                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   2        7777  0000    66   66                         1       000 1 1       1               999999999999999 1     55 777777777   00000  6666666666666         6666666666666          00 99999999   1              1               1                     44      44                            1 1 888  1          1                      0         44   1      44              3333                                   33333       1 1                 5   1  3 1                 3  1                            66    999999999999   555555555555 1  8888 5555 999 7777 4444  111  999 1  6666 4       999    1      4444 33                   2 1           5            000        1     5     4                                           2      111                                              
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
Reference ( family-5121 )     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCATTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTAATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTCATATAT-------------GACTAGTCTA--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGGTACTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GATCGA--ACAACCCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTTACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-TTATAAACAGCCGACCGCCAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGTAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCAANNNNNNNNNNNNNN------------N-NN----N----N---N----N----NN---NN---N-NN----N-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGAGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGATGAAAAA-CACATTGC----AC----ATGT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTTGA-ATATC-TTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTATCT-----TATGCTA-T-AGCAGCAGCCGATCGCCAGTA-TTCTAGGTCAGTCTCGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAGGAGCTGCAAGAGTACTTTGCA------------TAA------------T-CA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----AATTATAAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGGCCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCTGGGT-CATAAT---CTGTTCGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTAGGACAGGTTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                        tTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATAAGTC-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-TTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA---------------------GTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTACGGTGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATAATTA--AAT-TGTCGT--ACAACACTGAGAAT----GCCAAATTAAAGTCATGTGACTAGGTTATGTGACT-----TATGCTA-T-ATTAGCAGCCGATCGCCTGCA-TTTCGGGTCAGTATGTTGTTAC-AA-CTGCACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGA--CTGCA------------TAA------------A-TA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----A-TTGTTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGAATTTTA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGAGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCAATTGCTTGTCTCAGACAGATATTGAGACATGTTTga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                       aGTGACGAGAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGT--------------G---C-TATATTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAATGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCCTGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TCCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAAGCTTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAAACGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGCCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAACCAGCCAATCGCCAGTA-CTTTGCGTCAGTCTGGTGCTACAAA-CTCGACGAAGAAGGAGCTGCAAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGCCTCAGACAGGTGTTTAGACAGGTTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-CGTCTTGT----AT----AGAA--TGA--CATCCATAATATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTATTGATTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTAATATAT-------------GAATAGTCTG--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AACC----------------T--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATTGCATAATCTCTA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--GCAACACTAAGAAT----GCCGAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAACCGACCGCCAGTA-CTCTGGGTTAGTCTGGTGTTAT-AAACTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----AG---TAAAT----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATAAGGGATTCTCA---GAAGTGAA-GTTTTGAACTC-GGAGTTACAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGAAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-AGCCTTGT----TT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------A-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTTTATAT-------------GAATAGGCTT--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTTCAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTTATTGAATTT-----------------------CAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTTAGAGT----GCCCGACTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATACTA-C-ATAAGCAGCCGAACGCCTGTA-TGTTAGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAAAAGGAGCTGCAAGATAACTGCGCA------------TAC------------T-TAAGTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGC-GTACA----GT-ACTTGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGGGTGATTCAGA---GAAATGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCCTTCGAAACTTGTTAGCAGTGCATCGGGT-TGTAAT---TTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTAAGGCAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAG-AGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-AACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGCTGAGAAC---------------T-TCAT---T-----G---TAC-----AT-------------TTCATAAAT-------------GAA------A--A--------GTT-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTATATAAAT-AAACGTTCAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGATGGTTGAATAGAATCGCATGATCTCGA-ACACCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGTAT----GCCCAATTGAATTCATGTGACTAGGCCATGTGATT-----TATGCTA-T-ATAAGAAGCCGAACGCCAGTA-TTTTTGGCCAGTCTGGTGTTAC-AA-TTCGACGGGGAAGGAGCTGTAAGAAGATGTTGCT------------TAA------------T-TATTT-G----T---T----A----AA---TA---A-TT----A-GTAT--------GG------G----G--ACTGGGACTTTGGACGGAGTG-TCACAAGTGAATGAGTGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                            CGAAAAA-CGCATTGT----A--------T--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTTTGT-TACACTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAACCGCATAATTTTGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGGATGAA-------------GTCATGTAACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACAGCTAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTACAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TTAATCA-TCATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACGAAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATATAATCGTTGTATTCAGC-TATACTG---TCTTTA-TTTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTTATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----AT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAGTGGATGAGAAATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGAATTA-AGACCTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTGg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCAT-------------TTTGT-TACGTTG---T-TATACTTT--CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTGGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTGGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTAA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATTATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GTCCGATTAAAGTCATGTGACTAGTTCATGTGACT-----TATACTATT-ATAAGTAGCCGACCACCTG-G-TTTCGAGTCAGTTTGGTGTTAC-AA-CGCGACGAAAAAGGAGCTGAAAGAAGACACTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAAAGAAGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGATTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCAATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACAAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGATGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCTCAGACAGTCGTTGGGACAGGCTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                      gtGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACAACGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TGTACTTT---------------GC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTCTATAT-------------GACTAGTCTT--A--------ATA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTATAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGTAGACGCTCATTGAATTCGA-T-T---AA-GGATGGTAAGTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TG----------ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCGCGAAGGCCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---G-TT----A-ATATTAT---TTGGT-ATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAAT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGGTGGGACAGGTTTg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATA---TAGCTATACT--------GTCT---T-TAT---TTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTCATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----CT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAATGGATGAGAGATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGCATTA-AGACTTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                            ----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATATTTTTTATAAAATG---T-T-T-CGTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA-AT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTAATTGTTTA----AGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGCAGTT--AATTAA--CTGTCAGGCAGATGTTCATTGA-------------------TGCTATTTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACCACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTAATGTAACTAGGCTATGTGACT-----TATACTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTATTTTTTGGTCAGTCTGGTGTAAC-AT-CCCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACC---------------------------------------------T---T----A----AT---TA---A-TT----A-GTATTAT---TTGGCAGTACA----G----T----CTTTGTACCGAGTG-TCACAAGTAGATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCAGGTTTT--ACTC-AGAGTTGCAGAAACC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttatttaaaaagcaatacatgtgtgacgTACTTT-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-CTATTGGTTGATTAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATAT---------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCACATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGT---AATAAAA-CTGTCAGACAAACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAGTGGT-TCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCTATTGAAGTCGTGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAATCAGCCGAACGCCTGTA-TTTTTGGTCAGCCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGTT------------TAA------------T-TA----ATTTGT---T----A----AT---TA---A-TT----ATTTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTG-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTACATCGGTT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACAAAAAA-CACCTTGT----AT----CTAT--AGA--CACCCATAACACTGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TTTTCTTTTTCTATTGGTTGATAAC---------------TATTATA--A-----T-----C-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATGATCT-----------------------------------GTTA---TAAT-AAATGTACC-AAAACATAGTT--AATAA---TTGTAAGGCA-------------TTTTA-T-A---AA-GGATGATTATTCAATAAAATCGCATAAACTCGA-ACAGTATTA--TGC-AG--GATTACAACACTAAGAAT----GCATGATTAAAGCCATGTGACTAGGTCATGGGGTT-----TATGCTC-T-ATCAGCAGCTGACCACCAGTA-CTTTGAGGCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCCAGGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TG----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATCAT---TTGGCAAGACA----GT-ACTGGAACATTGGACCGAGTG-TAACAAGTAAATGAGGGATTCTTA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAATGCAACAGGT-CGCAATCGACTGTTGCG-GTCATTGGTTTTTTTACACAGGTGTTTGAGCAGGTTg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATGGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATATGGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCca
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGTCTCAGACAGGTGGTGAGACAGtatataaggaaagcccgcatagttaattaattaattattattatttggtaatacagactgggactttgaaccgagtgtcacaaatgaatgagggattctcagaagtgcagtttttactcagagaaccctctgaaatttgtgaacagtgcttcgggtcgtagtctgttgggtgccattgttcgtctcagacaggtggtgagacag
gi|28                         : gtgacgaaaaacgccttgtacatatagaaatctataacatgggtgtattttgttacgccgttatacttttctgttgtttgataactttttatttacctttatatatgaatagtctaagtattccttattgtttattaagttacattgataaacgtacagaaaacgtagttaataaactgtcagacagacgctcattgaatttgattaaggatgctaatgtaatggaatcgcataatatggaacatgtggtcgtacaacactaagaatgcccgattgaagccatgtgataaggtcatgtgacttatgctatataagctatatTATCGATTGATAAC---------------T-TTATACAT-----A---TAC-----CT-------------TTTATATATAT-----------GAATAGCCTA--ATAAAATATGTA-TTCCTTATTGTTTAATTAAGTAACATTAAT-CAACGTATGGAAA-CGTAGTC--AGTAAA--CTGTTTGGCAATCACTCATTGAATTTGA-T-TGAAAA-GGATGCTTATTCAATAGAATTGCATAATCTCGG-ACGCCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGC-------------CATGTAACT-----TATGATG-T-ATAAACAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA----GAT---GAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----ATTTGAT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACT-GGACTTTGGACAGAGTG-TAATTAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAATTCAAGAGTTGCAGAACACTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatatcaatctcttgtttgttgtgccacttcaagtttgtataatgtaagttgt-TTCGTTATTGCTTA----ATTGACATTAAT-TAAAGTATTAAAAACGTAGTTAGAATA-----T-TCATGCAGGCGTTCATTTCATTTTAGTAT---AC-AGACGATTATTTAGTAGAACCAGGTTTTCTCGGCACGGCACAACTTGT-AATGGG--GCAAAACCA------------------GAGTCATGTGACT---T----------------TGCTA-T-ATAAGCAG-TG---GCCTTTA-TT-TAAGCTAGCCTGGTGCTAG-AA-CATGACGGA-AGAGAGCGACTAGTA-----TGTA-------------AA------------TATA----A----T---T----T----ATC--TA---A-TA----A-T--GTAT---CT----ATATA----GT-AC-GTGAAT----AC---GTGATTACAA----------GATATGCA---GGAA-ACT-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTTTAAACAG---TCC--ATACATAGT---CTATCGGGTGCCATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TATACCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAACTGACCGCCTGTA-ATCT-TGTGAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGAACCTACA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AGTTATTATTAGTTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTcattacttcatcacaattgaatctggt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATTATCTCGA-ACATCGTTA--TGT-GGTCGA--ACAACAATAAGGAT----GTCCGATTGAAGCCATGTGACTAGACCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCTAGTA-TTCCGGGTCAGTCTAGAGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----GT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGAGT-CGTAAT---CTGTTGGATACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGAAGGGTTTg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGACTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCACAACATCGGGATAATTTTT-TACACCAAATT-T---CTTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TACATTTTCTATTGGTTGATGATTTTATATATACCTTTTATATATGAATAGTCTA--A--------ATA--TCCTTATTGTTTA-TTAAGTGAAATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTA-----AATAAAATTTGTCAGGCAGACGCTCATTAAATTTAA-T-A---AA-GGATGTTTATTCAATGAAATCACATAATCTCAA-AGATCGTTA--TGTAGGGC-A--ACAACACTGAGAAT----GCCCAGTTG-AGTCATGTGACTAGGTCATGTGAC------TAAGC-A-T-GTAAgg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                      atGTGACGAAAAA-CGCTTTGT----A--------T--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTATT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACT---TC---TGCTT-----T-------T-ATAAGGACCCGACCGCCTGTA-TTTTGCGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAAGAGCTGCAAGAAGatcacttggtgcccccctacatcattttcaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATATATAGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCgac
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTAACGAAAAA-CGCCTTGTT---AT-----TAT--ATA--AATCTATAACGTCGGTGTATTTTGT-TGCGCCG---T-TTTTCTTTT-CGATTGGCTGACAACAATATATATATTCCTT-TTATA--TATAAAT---GAC-----CTGATATTCCA----TTTATATAT-------------AAATGACCTG-------------------TTAT-------TTAAATCTCATTTAT-CAGCGTAC-GGAAGCGTAGTT--AATAAA--TTGTTAGGCAGAC-CTCAATGAATTTGA-T-T---TA-GGATGCTTATTCAATAGAATCTTATAATCTCTA-ACCGTAGTC--TGT-AGTGGA--ACAACACTAAGAATGCCAGCCCGATTAAAGT-------CTAGCTCATATTACT-----TACGCTA-T-ATAAGCAGCCAACCG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGTAATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCCGAA-TTTTGAATCAGTTTGGTGTAAC-AA-CTCGACGGAAAAGGACCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TA----A----T---G----A----AT---TA---A-TC----A-TTATTAT---CTGACAAGACG----GT-ACTCGGGCCTTGGACCACGTG-TCACAAGTGAGTGAAGGGCTCTCA---GAAGTTAA-GTTTTATACTC-AGTGTTGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAAAAGTGCAACGGGT-CGCAGT---CTGTAAGGTGCTATTGTTTGTTTCAG-TAGTTGTTGAGACGGG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGGGG-TGCAGT---CTGTTAGGTGTTATTGTTTGTTTCAG-TAGGTGTTGAGACgtgcagtctgttaggtgttattgtttgtttcagtaggtgttgagacg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgtaatgtgacttatgctatataagcagccgaccgcccgaattttgaatcagtttggtgtaacaactcgacggaaaaggacctgtaagaagacttaatgaattaatcattattatctgacaagacggtactcgggccttggaccacgtgtcacaagtgagtgaagggctctcagaagttaagttttatactcagtgttgcagaaccctttgaaacttgtgaaaagtgcaacgggtcgcagtctgtaaggtgctattgtttgtttcagtagttgttgagaATGGAATCGAATAATCTCGC-ACAGTATTT--AAT-GG--GA--AT-ACACAAAAAAT----GACAGACTGAAg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttggtatacggacatatattcagtggaaacTA-TTTTGACCC-GTCTCCTGTCAC-AA-CTCGACAGAGAATGAACTGCAATGAGATA-TATA------------TAAACAATTGATTATT-TA----A----T---T----A----ATATGTG---T-TT----A-TTGT--T---TTGGCTAGACATTATG---TTGG--CTTACGCCTGAGTT-TCCT--GTGATTGGCGAATTATCT---GGAAAATA-GTTTCATACTC-AGATTTCCAGAAtaaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacactattttgacccgtctcctgtcacaactcgacagagaatgaactgcaatgagatatatataaacaattgattatttaattaatatgtgtttattgttttggctagacattatgttggcttacgcctgagtttcctgtgattggcgaattatctggaaaatagtttcatactcagatttccagaa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtatacggacatatattcagtggaaacatggaatcgaataatctcgcacagtatttaatgggaatacacaaaaaatgacagactgaataaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacacTGTGACG-----TGTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTTAGTCAGTCTGGTGTAAC-AA-ATCCACG-AGAAGTAGCTGCAAGTAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---C----A-----T---TA-----TT----G-TTAATAT---TTGGTAATACA----GT-ACTTGGACCTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGTTTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTC-TGAGTTGCAGAACCCTTTGAAA-TTGTGAACAGTGCATCGGGT-CGCAAT---CGAATGGATGACATTGGTTGTTTCAAACAAGTGTCGAGGCAGGTT
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAAAGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACTCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAcg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTATTGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAA-AAT----GCCCTATTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGATCGCTTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTATAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTACAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-TTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTG-T-ATAACCAGCTGACCGACTGTA-TTCT-GGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCAAGAAGACTTTTCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTAGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGCGCA-GTTTCCAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTGGGACAGGTTT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTGAGTTAGTCTGGTGTTAC-AC-CTCGACAGAGAAAAAACTGTAAGAAGACTTTG----------------A------------T-TA----A----T---C----A--------------------------ATTAT---TTGACAAGACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAAGGATTCTCA---GAAGCGCA-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCATATGGT-CGCAGT---CTGTTGGGTGCCATTGGTTCTTTCAAACAGGTGTTGAGACAGGCT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-GGCCTTGTTATTAC----ATGT--ATATTAATCCATAACATTAGGGTATTTTAC-TACATTG---T-TTTTCTTTT-CTGTTAGTTGACAAC---------------T-TTATA--TA----TA--TAC-----CA-------------TTTATATAT-------------GAATGATCTG-------------------TTAT-------TTAAATTGCATTTAT-CAAGGTAC-GGAAACAAAGTT--AATAAA--TTGcaa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatgtGGCAGACGTTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTAAATAGAATTGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTC-A--ACAACACTAAGAAT----GCCCAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCAA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTGGGTCAGTTTAGTGTAAC-AT-TTTGACGGAGAAGGAGCTGCGAGAatttattttagcaatttcgaatttcatctctgagacggttacagtttggaatagcaaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA------------T-TT----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTCTTGGAACAGGCTT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCCTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-TTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TT-CTTATTGTTTA-TTAAGTTATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTt
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAACTTACATTAAT-AAACGTACAGATAATGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGATCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATGGAATCGCATAATATTGA-ACATCATTA--
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGCAGAACTCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTAGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTTGGACAGGTTTag
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-ATCCTTATTGTTTg
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-GT----T-TTAT--T---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGGCATTGGGCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     actGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATG--AATCCACAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATGAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACTAGTTTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGAACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---GA-GGATGCTAATGCATTGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGTTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTTGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-G-TTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----TC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGC----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGCGTATT------ACGCCA---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTC-AACTC-AGAGTTGCAGAATCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCCCAGACAGGTGTTGGGACAGGCTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCCTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAT-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTTCTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTACAATAAACATAGTT--AATAAA--CTATCAGGCAGACTCTCATTGAATTTGA-T-A---AA-GGATGCTAATTCAATAGAATCTCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTAAGAAT----TACCGATTGAAGTCATGTGACAAGGTCATATGACT-----TATATTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGTTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---T----T----AT---TATTTACTT----A-TCATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGTACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATT-------G------A-GTTTTGAACTC-AGAGATGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTAGGTGCCATTGTTTGTCTCCGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                          tACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTG----ATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACAAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTTATTAAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATACTCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGACGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-AAAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTTGGTCGGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTATA------------TAA------------T-TA----A----C---T----A----AT---TA---T-TA----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGTCTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCGTAACATCGGTGTATTTTCT-TACGCCA---T-TATATTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAG-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAATGACATTTAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAA---CTGTCAGGCAGATGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGATTATGTCATGTGAC-------ATACTA-T-AAAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-C-----GGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AATTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGAGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCGTCTGAAACTTGTGAACAGTCCTCCGGGT-CTTAGT---CTGTTGGGTATCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTag


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   A        TATT  CTGT    AT   TT                         A       AAT C         T               AATATATATATTCCT A     CA ATAAAT      ATTTT  ATTGGTTGATGAT         ACCTTTTATATAT          TT TAAAATAT   A              A               T                     AG      GG                            G A GAA  C          G                      C         CT   A      TT              GCCA                                   ACTGC       T .                 A   T    A                 A  A                            TT    .              ACAATTGATTAT A  ATTT TTTG AAA TATC TTTG  ATG  TTT C  AATC A       TAG           TTAT TG                   T A           T            TCA        G     G     A                                           A      CGA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        T     CTGT    .    .                          .       .   .         .               .               .     .  TGTA        A      GATATTCCA             AT                     TT .          A              .               .                     .       GG                            . . .    C          T                      .         .    .      .               .                                      ACTGC       . .                 T   .    G                 A  .                            TT    .              .            .  AGTT G    .   TATC .     C    .   .  A    T       .             .    TG                   T .           T            TCA        .     T     A                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  TGTA        A      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       AT                            . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 A  .                            CC    .              .            .  ATTT .    .   .    .     .    .   .  A    G       .             .    T                    T .           C            .          .     C     A                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  ATA         .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       A                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  TTT  .    .   .    .     .    .   .  .    A       .             .    T                    T .           T            .          .     T     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    A                 .  .                            TG    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    T                 .  .                            GT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            AC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  G           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    T                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           A            .          .     T     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            GT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           C            .          .     C     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            GT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            GT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    T                    T .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    T                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    T                 .  .                            CT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    A                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     T     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           C            .          .     C     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 C   .    T                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            TT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            CT    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            CC    .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    T .           C            .          .     C     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    T                 .  .                            C     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           T            .          .     A     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 A   .    G                 .  .                            T     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           C            .          .     C     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  T           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    T                 .  .                            T     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  A           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    G                 .  .                            C     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  .           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    .                 .  .                            A     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           T            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .        .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  .           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 T   .    .                 .  .                            .     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           C            .          .     G     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .     .       .    .                          .       .   .         .               .               .     .  .           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 .   .    .                 .  .                            .     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           T            .          .     .     .                                           .      .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .       .   .         .               .               .     .  .           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                 .   .    .                 .  .                            .     .              .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                    . .           .            .          .     .     .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .               .     .  .           .      .                     .                      .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          G                      .         .    .      .               .                                      .           . .                     .    .                 .  .                                                 .            .  .    .    .   .    .     .    .   .  .    .       .             .    .                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .          .              .               .                     .       .                             . . .    .          T                      .         .    .      .               .                                      .           . .                          .                                                                      .            .  .                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .                              .                     .       .                             . . .    .          .                      .         .    .      .                                                      .           . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ************
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): CCCCCCCCCCCCCCCAACCGGTGGGGTTGGGGTAACGCCCAGGGGAATTAGACATTTTTACACATAGTTTTTGCAAACGTTTCTTATTGTTC
Unaligned ( gi|51 ): ACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111          1111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   1        3333  5555    11   11                         1       222 1 0       1               666666666666666 1     11 111111111   55555  0000000000000         7777777777777          33 33333333   2              1               1                     11      55                            1 1 111  2          1                      1         11   1      11              2222                                   55555       1 1                 2   1  0 4                 3  1                            88    555555555555   555555555555 1  8888 3333 111 4444 2222  333  111 1  4444 4       111    0      2222 55                   2 1           1            444        1     2     3                                           1      222                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   .        ....  ....    ..   ..                         .       ... . .       .               ............... .     .. .........   .....  .............         .............          .. ........   .              .               .                     ..      ..                            . . ...  .          .                      .         ..   .      ..              ....                                   .....       . .                 .   .  . .                 .  .                            ..    ............   ............ .  .... .... ... .... ....  ...  ... .  .... .       ...    .      .... ..                   . .           .            ...        .     .     .                                           .      ...                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   2        7777  0000    66   66                         1       000 1 1       1               999999999999999 1     55 777777777   00000  6666666666666         6666666666666          00 99999999   1              1               1                     44      44                            1 1 888  1          1                      0         44   1      44              3333                                   33333       1 1                 5   1  3 1                 3  1                            66    999999999999   555555555555 1  8888 5555 999 7777 4444  111  999 1  6666 4       999    1      4444 33                   2 1           5            000        1     5     4                                           2      111                                              
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
Reference ( family-5121 )     :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCATTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTAATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTCATATAT-------------GACTAGTCTA--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGGTACTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GATCGA--ACAACCCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTTACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-TTATAAACAGCCGACCGCCAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGTAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCAANNNNNNNNNNNNNN------------N-NN----N----N---N----N----NN---NN---N-NN----N-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGAGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGATGAAAAA-CACATTGC----AC----ATGT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTTGA-ATATC-TTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTATCT-----TATGCTA-T-AGCAGCAGCCGATCGCCAGTA-TTCTAGGTCAGTCTCGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAGGAGCTGCAAGAGTACTTTGCA------------TAA------------T-CA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----AATTATAAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGGCCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCTGGGT-CATAAT---CTGTTCGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTAGGACAGGTTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                        tTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATAAGTC-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-TTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA---------------------GTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTACGGTGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATAATTA--AAT-TGTCGT--ACAACACTGAGAAT----GCCAAATTAAAGTCATGTGACTAGGTTATGTGACT-----TATGCTA-T-ATTAGCAGCCGATCGCCTGCA-TTTCGGGTCAGTATGTTGTTAC-AA-CTGCACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGA--CTGCA------------TAA------------A-TA----A----T---T----T----AT---TA---A-TT----A-TTGTTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGAATTTTA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGAGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCAATTGCTTGTCTCAGACAGATATTGAGACATGTTTga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                       aGTGACGAGAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGT--------------G---C-TATATTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAATGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCCTGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TCCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAAGCTTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAAACGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGCCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCTGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAACCAGCCAATCGCCAGTA-CTTTGCGTCAGTCTGGTGCTACAAA-CTCGACGAAGAAGGAGCTGCAAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGCCTCAGACAGGTGTTTAGACAGGTTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-CGTCTTGT----AT----AGAA--TGA--CATCCATAATATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTATTGATTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTAATATAT-------------GAATAGTCTG--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AACC----------------T--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATTGCATAATCTCTA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--GCAACACTAAGAAT----GCCGAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAACCGACCGCCAGTA-CTCTGGGTTAGTCTGGTGTTAT-AAACTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----AG---TAAAT----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATAAGGGATTCTCA---GAAGTGAA-GTTTTGAACTC-GGAGTTACAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGAAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAAA-AGCCTTGT----TT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------A-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTTTATAT-------------GAATAGGCTT--A--------GTA-TTCTTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTTCAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTTATTGAATTT-----------------------CAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTTAGAGT----GCCCGACTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATACTA-C-ATAAGCAGCCGAACGCCTGTA-TGTTAGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAAAAGGAGCTGCAAGATAACTGCGCA------------TAC------------T-TAAGTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGC-GTACA----GT-ACTTGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGGGTGATTCAGA---GAAATGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCCTTCGAAACTTGTTAGCAGTGCATCGGGT-TGTAAT---TTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTAAGGCAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAG-AGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-AACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGCTGAGAAC---------------T-TCAT---T-----G---TAC-----AT-------------TTCATAAAT-------------GAA------A--A--------GTT-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTATATAAAT-AAACGTTCAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGATGGTTGAATAGAATCGCATGATCTCGA-ACACCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGTAT----GCCCAATTGAATTCATGTGACTAGGCCATGTGATT-----TATGCTA-T-ATAAGAAGCCGAACGCCAGTA-TTTTTGGCCAGTCTGGTGTTAC-AA-TTCGACGGGGAAGGAGCTGTAAGAAGATGTTGCT------------TAA------------T-TATTT-G----T---T----A----AA---TA---A-TT----A-GTAT--------GG------G----G--ACTGGGACTTTGGACGGAGTG-TCACAAGTGAATGAGTGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                            CGAAAAA-CGCATTGT----A--------T--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTTTGT-TACACTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACATAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAACCGCATAATTTTGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGGATGAA-------------GTCATGTAACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACAGCTAGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTACAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TTAATCA-TCATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACGAAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATATAATCGTTGTATTCAGC-TATACTG---TCTTTA-TTTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTTATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----AT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAGTGGATGAGAAATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGAATTA-AGACCTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTGg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCAT-------------TTTGT-TACGTTG---T-TATACTTT--CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCATTATTGTTTA-TTAAGTGGCATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTGGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTAA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATTATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GTCCGATTAAAGTCATGTGACTAGTTCATGTGACT-----TATACTATT-ATAAGTAGCCGACCACCTG-G-TTTCGAGTCAGTTTGGTGTTAC-AA-CGCGACGAAAAAGGAGCTGAAAGAAGACACTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAAAGAAGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGATTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                       tGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCAATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACAAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGATGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCTCAGACAGTCGTTGGGACAGGCTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                      gtGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACAACGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TGTACTTT---------------GC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTCTATAT-------------GACTAGTCTT--A--------ATA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTATAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGTAGACGCTCATTGAATTCGA-T-T---AA-GGATGGTAAGTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TG----------ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCGCGAAGGCCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---G-TT----A-ATATTAT---TTGGT-ATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAAT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGGTGGGACAGGTTTg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                           ACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATCTGTGTATTT-------------------ACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-------------------------------------ATGT-------------GAACAGTCGA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTCA-ATAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAAACGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GGCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACTACTGCTATTATA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTTTGGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-GTCGACAGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGCT------------TAA------------T-TA----G----T---T----T----GT---TA---A-TTA---A-TTATTAT---TTAGTAATACA----G--ACTGAGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAATTTTTTTAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAAAA--CGCCTTAT----ATCTGTATAT--AGA--AATCCATA---TAGCTATACT--------GTCT---T-TAT---TTA-CTATTGGTTAATAAC---------------T-TT-TA--T-----TGTATACA----CA-------------TTCAAATAT-------------TAATGATTTATTA--------TTAATTCGCTATTGTT-A---AAGTTACATTAAT-CAACGTACGGAAAATGTAATT--AA-AAGGGTTGTCAGTCAAACGCCCATTGGATTTGG-T-A---AACAGACGATTATTCAATAAAATCGGATAACATCGA-ATATTATCG--AAT-GG---A--ACAACAATAAAAAA----GCCTGATTCATATCATGTGACTTATCCATGTGACT-----TATGATA-T-ATAAGCAAT----------TA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGTGATTGAGCTGCAAGAAGACT-----------------TAA------------G-TG----A----A---T----A----CT---TA---A-TA----T-TTATGAG---TTAGCTAGACA----GTGA-TGGAACTTTGGACCGAGTT-TCACAAATGGATGAGAGATTCTCATCAGAAGTGCA-GTTTTGCATTA-AGACTTGCAGAACCGTCTGATACTTGTGAACAGTGCATCGGGT-TGCAGT---CTGTTTGGTGCCATTGATTG-CTCCAACAGGTGTTG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                            ----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGGATATTTTTTATAAAATG---T-T-T-CGTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATA-AT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTAATTGTTTA----AGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGCAGTT--AATTAA--CTGTCAGGCAGATGTTCATTGA-------------------TGCTATTTCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACCACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTAATGTAACTAGGCTATGTGACT-----TATACTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTATTTTTTGGTCAGTCTGGTGTAAC-AT-CCCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACC---------------------------------------------T---T----A----AT---TA---A-TT----A-GTATTAT---TTGGCAGTACA----G----T----CTTTGTACCGAGTG-TCACAAGTAGATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCAGGTTTT--ACTC-AGAGTTGCAGAAACC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttatttaaaaagcaatacatgtgtgacgTACTTT-T-TACACCA---C-TTTTCTTTT-CTATTGGTTGATTAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATAT---------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCACATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGT---AATAAAA-CTGTCAGACAAACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAGTGGT-TCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCTATTGAAGTCGTGTGACTAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAATCAGCCGAACGCCTGTA-TTTTTGGTCAGCCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGACGTTGTT------------TAA------------T-TA----ATTTGT---T----A----AT---TA---A-TT----ATTTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTG-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTACATCGGTT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACAAAAAA-CACCTTGT----AT----CTAT--AGA--CACCCATAACACTGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TTTTCTTTTTCTATTGGTTGATAAC---------------TATTATA--A-----T-----C-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATGATCT-----------------------------------GTTA---TAAT-AAATGTACC-AAAACATAGTT--AATAA---TTGTAAGGCA-------------TTTTA-T-A---AA-GGATGATTATTCAATAAAATCGCATAAACTCGA-ACAGTATTA--TGC-AG--GATTACAACACTAAGAAT----GCATGATTAAAGCCATGTGACTAGGTCATGGGGTT-----TATGCTC-T-ATCAGCAGCTGACCACCAGTA-CTTTGAGGCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCCAGGGAGAAGGAGCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TG----A----T---T----A----AT---TA-----------A-TTATCAT---TTGGCAAGACA----GT-ACTGGAACATTGGACCGAGTG-TAACAAGTAAATGAGGGATTCTTA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAATGCAACAGGT-CGCAATCGACTGTTGCG-GTCATTGGTTTTTTTACACAGGTGTTTGAGCAGGTTg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCTATAACATGGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGTTTGATAAC---------------T-TTTTA--T-----T---TAC-----CT-------------TT-ATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTGAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGTAATGGAATCGCATAATATGGA-AC------A--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGATAAGGTCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCca
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGGAAAGCCCGCA------------TAG------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGAACCGAGTG-TCACAAATGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTT-ACTC-AG------AGAACCCTCTGAAATTTGTGAACAGTGCTTCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTCGTCTCAGACAGGTGGTGAGACAGtatataaggaaagcccgcatagttaattaattaattattattatttggtaatacagactgggactttgaaccgagtgtcacaaatgaatgagggattctcagaagtgcagtttttactcagagaaccctctgaaatttgtgaacagtgcttcgggtcgtagtctgttgggtgccattgttcgtctcagacaggtggtgagacag
gi|28                         : gtgacgaaaaacgccttgtacatatagaaatctataacatgggtgtattttgttacgccgttatacttttctgttgtttgataactttttatttacctttatatatgaatagtctaagtattccttattgtttattaagttacattgataaacgtacagaaaacgtagttaataaactgtcagacagacgctcattgaatttgattaaggatgctaatgtaatggaatcgcataatatggaacatgtggtcgtacaacactaagaatgcccgattgaagccatgtgataaggtcatgtgacttatgctatataagctatatTATCGATTGATAAC---------------T-TTATACAT-----A---TAC-----CT-------------TTTATATATAT-----------GAATAGCCTA--ATAAAATATGTA-TTCCTTATTGTTTAATTAAGTAACATTAAT-CAACGTATGGAAA-CGTAGTC--AGTAAA--CTGTTTGGCAATCACTCATTGAATTTGA-T-TGAAAA-GGATGCTTATTCAATAGAATTGCATAATCTCGG-ACGCCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGC-------------CATGTAACT-----TATGATG-T-ATAAACAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA----GAT---GAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----ATTTGAT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACT-GGACTTTGGACAGAGTG-TAATTAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAATTCAAGAGTTGCAGAACACTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatatcaatctcttgtttgttgtgccacttcaagtttgtataatgtaagttgt-TTCGTTATTGCTTA----ATTGACATTAAT-TAAAGTATTAAAAACGTAGTTAGAATA-----T-TCATGCAGGCGTTCATTTCATTTTAGTAT---AC-AGACGATTATTTAGTAGAACCAGGTTTTCTCGGCACGGCACAACTTGT-AATGGG--GCAAAACCA------------------GAGTCATGTGACT---T----------------TGCTA-T-ATAAGCAG-TG---GCCTTTA-TT-TAAGCTAGCCTGGTGCTAG-AA-CATGACGGA-AGAGAGCGACTAGTA-----TGTA-------------AA------------TATA----A----T---T----T----ATC--TA---A-TA----A-T--GTAT---CT----ATATA----GT-AC-GTGAAT----AC---GTGATTACAA----------GATATGCA---GGAA-ACT-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTTTAAACAG---TCC--ATACATAGT---CTATCGGGTGCCATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TATACCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAACTGACCGCCTGTA-ATCT-TGTGAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGAACCTACA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AGTTATTATTAGTTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGAT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTTcattacttcatcacaattgaatctggt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTGA-T-T---AA-GGATGCTAATGCAATGGAATCGCATTATCTCGA-ACATCGTTA--TGT-GGTCGA--ACAACAATAAGGAT----GTCCGATTGAAGCCATGTGACTAGACCATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCTAGTA-TTCCGGGTCAGTCTAGAGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----GT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCTTCTAAAACTTGTGAACAGTGCTCCGAGT-CGTAAT---CTGTTGGATACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGAAGGGTTTg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGACTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCACAACATCGGGATAATTTTT-TACACCAAATT-T---CTTTT-CTATTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TACATTTTCTATTGGTTGATGATTTTATATATACCTTTTATATATGAATAGTCTA--A--------ATA--TCCTTATTGTTTA-TTAAGTGAAATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTA-----AATAAAATTTGTCAGGCAGACGCTCATTAAATTTAA-T-A---AA-GGATGTTTATTCAATGAAATCACATAATCTCAA-AGATCGTTA--TGTAGGGC-A--ACAACACTGAGAAT----GCCCAGTTG-AGTCATGTGACTAGGTCATGTGAC------TAAGC-A-T-GTAAgg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                      atGTGACGAAAAA-CGCTTTGT----A--------T--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTATT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGACAGACGCTCGTTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACT---TC---TGCTT-----T-------T-ATAAGGACCCGACCGCCTGTA-TTTTGCGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACAGAGAAAGAGCTGCAAGAAGatcacttggtgcccccctacatcattttcaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATATATAGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA---T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAACCAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCgac
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                       tGTAACGAAAAA-CGCCTTGTT---AT-----TAT--ATA--AATCTATAACGTCGGTGTATTTTGT-TGCGCCG---T-TTTTCTTTT-CGATTGGCTGACAACAATATATATATTCCTT-TTATA--TATAAAT---GAC-----CTGATATTCCA----TTTATATAT-------------AAATGACCTG-------------------TTAT-------TTAAATCTCATTTAT-CAGCGTAC-GGAAGCGTAGTT--AATAAA--TTGTTAGGCAGAC-CTCAATGAATTTGA-T-T---TA-GGATGCTTATTCAATAGAATCTTATAATCTCTA-ACCGTAGTC--TGT-AGTGGA--ACAACACTAAGAATGCCAGCCCGATTAAAGT-------CTAGCTCATATTACT-----TACGCTA-T-ATAAGCAGCCAACCG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGTAATGTGACT-----TATGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCCGAA-TTTTGAATCAGTTTGGTGTAAC-AA-CTCGACGGAAAAGGACCTGTAAGAAGAC---------------------------------T-TA----A----T---G----A----AT---TA---A-TC----A-TTATTAT---CTGACAAGACG----GT-ACTCGGGCCTTGGACCACGTG-TCACAAGTGAGTGAAGGGCTCTCA---GAAGTTAA-GTTTTATACTC-AGTGTTGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAAAAGTGCAACGGGT-CGCAGT---CTGTAAGGTGCTATTGTTTGTTTCAG-TAGTTGTTGAGACGGG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGGGG-TGCAGT---CTGTTAGGTGTTATTGTTTGTTTCAG-TAGGTGTTGAGACgtgcagtctgttaggtgttattgtttgtttcagtaggtgttgagacg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgtaatgtgacttatgctatataagcagccgaccgcccgaattttgaatcagtttggtgtaacaactcgacggaaaaggacctgtaagaagacttaatgaattaatcattattatctgacaagacggtactcgggccttggaccacgtgtcacaagtgagtgaagggctctcagaagttaagttttatactcagtgttgcagaaccctttgaaacttgtgaaaagtgcaacgggtcgcagtctgtaaggtgctattgtttgtttcagtagttgttgagaATGGAATCGAATAATCTCGC-ACAGTATTT--AAT-GG--GA--AT-ACACAAAAAAT----GACAGACTGAAg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttggtatacggacatatattcagtggaaacTA-TTTTGACCC-GTCTCCTGTCAC-AA-CTCGACAGAGAATGAACTGCAATGAGATA-TATA------------TAAACAATTGATTATT-TA----A----T---T----A----ATATGTG---T-TT----A-TTGT--T---TTGGCTAGACATTATG---TTGG--CTTACGCCTGAGTT-TCCT--GTGATTGGCGAATTATCT---GGAAAATA-GTTTCATACTC-AGATTTCCAGAAtaaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacactattttgacccgtctcctgtcacaactcgacagagaatgaactgcaatgagatatatataaacaattgattatttaattaatatgtgtttattgttttggctagacattatgttggcttacgcctgagtttcctgtgattggcgaattatctggaaaatagtttcatactcagatttccagaa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtatacggacatatattcagtggaaacatggaatcgaataatctcgcacagtatttaatgggaatacacaaaaaatgacagactgaataaactccttagaattgcgcaaacgcacacacgcacacacacacacacacacacTGTGACG-----TGTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTTAGTCAGTCTGGTGTAAC-AA-ATCCACG-AGAAGTAGCTGCAAGTAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---C----A-----T---TA-----TT----G-TTAATAT---TTGGTAATACA----GT-ACTTGGACCTTTGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGTTTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTAAACTC-TGAGTTGCAGAACCCTTTGAAA-TTGTGAACAGTGCATCGGGT-CGCAAT---CGAATGGATGACATTGGTTGTTTCAAACAAGTGTCGAGGCAGGTT
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-CTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAAAGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACTCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAcg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTATTGTAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAA-AAT----GCCCTATTGAAGTCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGATCGCTTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTATAAA-CTCGACGGAGAAGGAGCTACAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---C-TATACTTTT-TTGTTGGTTGGTAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGGTAATTCAATTGAATCGCATTATCTCGA-ATTTCATTA--TGT-GGTCGT--ACAACACTAAGGAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTG-T-ATAACCAGCTGACCGACTGTA-TTCT-GGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTCCAAGAAGACTTTTCA------------TAA------------T-TAATTTA----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTAGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGCGCA-GTTTCCAACTCAAGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAAGTGTTGGGACAGGTTT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTGAGTTAGTCTGGTGTTAC-AC-CTCGACAGAGAAAAAACTGTAAGAAGACTTTG----------------A------------T-TA----A----T---C----A--------------------------ATTAT---TTGACAAGACA----GT-ACTGGGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAAGGATTCTCA---GAAGCGCA-GTTTTAAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCATATGGT-CGCAGT---CTGTTGGGTGCCATTGGTTCTTTCAAACAGGTGTTGAGACAGGCT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-GGCCTTGTTATTAC----ATGT--ATATTAATCCATAACATTAGGGTATTTTAC-TACATTG---T-TTTTCTTTT-CTGTTAGTTGACAAC---------------T-TTATA--TA----TA--TAC-----CA-------------TTTATATAT-------------GAATGATCTG-------------------TTAT-------TTAAATTGCATTTAT-CAAGGTAC-GGAAACAAAGTT--AATAAA--TTGcaa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatgtGGCAGACGTTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTAATTAAATAGAATTGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTC-A--ACAACACTAAGAAT----GCCCAATTGAAGTCATGTGACTAGGCCATGTGACT-----TATGCAA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTTTGGGTCAGTTTAGTGTAAC-AT-TTTGACGGAGAAGGAGCTGCGAGAatttattttagcaatttcgaatttcatctctgagacggttacagtttggaatagcaaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA------------T-TT----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTGCA-GTTTTCAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTACCATTGTTTGTCTCAGACAGGTCTTGGAACAGGCTT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCCTGT----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-TTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TT-CTTATTGTTTA-TTAAGTTATATTAAT-AAACGTACTGATAACGTAGTT--AATACA--TTGTt
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAACTTACATTAAT-AAACGTACAGATAATGTAGTT--AATACA--TTGTCAGGCAGACGATCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATGGAATCGCATAATATTGA-ACATCATTA--
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGCAGAACTCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCAGGT-CGTAGT---CTGTAGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTTGGACAGGTTTag
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAGTGTATTTTGT-TACGCTG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTA---------------------------------------TATATGT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-ATCCTTATTGTTTg
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-GT----T-TTAT--T---TTGGCAATACA----GT-ACTGGGGCATTGGGCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     actGTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATG--AATCCACAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATGAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACTAGTTTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGAACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--CTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---GA-GGATGCTAATGCATTGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AAT-GGTCGA--ACAACACTTAGAAT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCCGACCGCCAGTA-TTCTTGGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGTTGCAAGAAGACCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTTGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACAAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-G-TTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----TC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCGGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGC----AC----ATAT--AGA--AATCCATAACATCAGCGTATT------ACGCCA---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTAAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTA--AATAAA--CTGTCAGGTAGACGCTTATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGTCGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-ATAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCT-TGTCAGTCTGATGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---TTATCA----AT---TA---A-TT----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGACTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCCCA---GAAGTACA-GTTTC-AACTC-AGAGTTGCAGAATCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGCCCCAGACAGGTGTTGGGACAGGCTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGATGAAAAA-CGCCCTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCATAACATCGGTGTATTTTGT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAT-----CT-------------TTTATATAT-------------GAATAGTCTA--A--------GTA-TTTCTTATTGTTTA-TTAAGTGACATTAAT-AAACGTACAATAAACATAGTT--AATAAA--CTATCAGGCAGACTCTCATTGAATTTGA-T-A---AA-GGATGCTAATTCAATAGAATCTCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCAA--ACAACACTAAGAAT----TACCGATTGAAGTCATGTGACAAGGTCATATGACT-----TATATTA-T-ATAAGCAGCCGACCGGTTGTA-TTCTGGGTCAGTCTGGTGTTGC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACTTTGCA------------TGA------------T-TA----A----T---T----T----AT---TATTTACTT----A-TCATTAT---TTGGCAATACA----GT-ACTGGTACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATT-------G------A-GTTTTGAACTC-AGAGATGCAGAACCCTTTGAAACTTGTGAGCAGTGCATCGGGT-CGTAGT---CTGTTAGGTGCCATTGTTTGTCTCCGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                          tACGAAAAA-CGCCTTGT----AC----ATAT--ATA--AATCCATAACATCGGTGTATTT-GT-TACGCCG---T-TATACTTTT-CTGTTG----ATAAC---------------T-TTATA--T-----T---TAC-----CT-------------TTTATATAT-------------GACAAGTCTA--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAGTTACATTTATTAAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAAA--TTGTCAGGCAGACGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATACTAATGCAATGGAATCGCATACTCTCGA-ACATCATTA--TGT-GGACGA--ACAACGCTAAGAGT----GCCCGATTGAAGCCATGTGACTAGGTCATGTGACT-----TCTGCTA-T-AAAAGCAGCTGACCGCCTGTA-TTCTTGGTCGGTCTGGTGTTAC-AA-CTCGACGGAGAAGGAGCTGCAAGAAGACCTTATA------------TAA------------T-TA----A----C---T----A----AT---TA---T-TA----A-TTATTAT---TTGGTAATACA----G--GCTGGGTCTTTGGACCGAG-G-TAACAAGTGAACGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAGAACCCTCTGAAACTTGTGAACAGTGCTCCGGGT-CGTAGT---CTGTTGGGTGCCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                        GTGACGAAAAA-CGCCTTGT----AT----CTAT--AGA--AATCCGTAACATCGGTGTATTTTCT-TACGCCA---T-TATATTTTT-CTGTTGGTTGATAAC---------------T-TTATA--T-----A---TAC-----CT-------------TTTATATAG-------------GAATAGTCTT--A--------GTA-TTCCTTATTGTTTA-TTAAATGACATTTAT-AAACGTACAGAAAACGTAGTT--AATAA---CTGTCAGGCAGATGCTCATTGAATTTGA-T-T---AA-GGATGCTTATTCAATAGAATCGCATAATCTCGA-ACATCATTA--AGT-GGTCGA--ACAACACTAAGAAT----GCCCGATTGAAGTCATGTGATTATGTCATGTGAC-------ATACTA-T-AAAAGCAGCCGACCGCCTGTA-TTTTGAGTCAGTCTGGTGTTAC-AA-C-----GGAGAAGGAGCTGCAAGAAGATCCTGCA------------TAA------------T-TA----A----T---T----A----AT---TA---A-TT----AATTATTAT---TTGGCAATACA----G--ACTGAGACTTTGGACCGAGTG-TCACAAGTGAATGAGGGATTCTCA---GAAGTGCA-GTTTTGAACTC-AGAGTTGCAAAACCGTCTGAAACTTGTGAACAGTCCTCCGGGT-CTTAGT---CTGTTGGGTATCATTGTTTGTCTCAGACAGGTGTTGGGACAGGTTag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): CCCCCCCCCCCCCCCAACCGGTGGGGTTGGGGTAACGCCCAGGGGAATTAGACATTTTTACACATAGTTTTTGCAAACGTTTCTTATTGTTC
Unaligned ( gi|51 ): ACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN