lowQualScore : 1
lowQualScore : 33 5 33 33 2
lowQualScore : .. . .. .. .
lowQualScore : 99 9 99 99 9
consensus : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( gi|3 ) : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCG--TTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|1 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACTCT--TTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCTTT--TT-TTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|11 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCTTT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|7 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5 : aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--CTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|8 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTATTT--TTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|12 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|9 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACTCT--TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|15 : tTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16 : TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|6 : aagATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCTCT--CTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|2 : caAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCTTT--TTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Alignments
lowQualScore : 33 0 33 33 2
lowQualScore : .. . .. .. .
lowQualScore : 77 8 77 77 7
consensus : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 ) : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16 : TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2 : aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3 : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5 : aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6 : ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7 : caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Alignments
lowQualScore : 33 0 33 33 2
lowQualScore : .. . .. .. .
lowQualScore : 77 8 77 77 7
consensus : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 ) : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16 : TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2 : aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3 : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5 : aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6 : ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7 : caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
blockSeqs : CT GT . G
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
finalCons : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Alignments
lowQualScore : 33 0 33 33 2
lowQualScore : .. . .. .. .
lowQualScore : 77 8 77 77 7
consensus : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 ) : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16 : TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2 : aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3 : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4 : ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5 : aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6 : ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7 : caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8 : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9 : aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT