lowQualScore                  :                                           1                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                       33  5   33    33                            2                                                                              
lowQualScore                  :                                       ..  .   ..    ..                            .                                                                              
lowQualScore                  :                                       99  9   99    99                            9                                                                              
consensus                     :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( gi|3 )            :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10                         :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCG--TTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|1                          :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACTCT--TTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4                          :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCTTT--TT-TTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|11                         : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCTTT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|7                          : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5                          : aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--CTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|8                          :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTATTT--TTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|12                         : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13                         : aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TT--TT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14                         :  ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCT--TTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|9                          :   aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACTCT--TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|15                         :   tTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16                         :    TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|6                          :  aagATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCTCT--CTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|2                          :     caAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCTTT--TTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT





Alignments
lowQualScore                  :                                        33     0  33    33                            2                                                                              
lowQualScore                  :                                        ..     .  ..    ..                            .                                                                              
lowQualScore                  :                                        77     8  77    77                            7                                                                              
consensus                     :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 )      :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15                         :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16                         :       TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2                          :       aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3                          : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5                          :    aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6                          :        ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7                          :   caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8                          :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9                          :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT





Alignments
lowQualScore                  :                                        33     0  33    33                            2                                                                              
lowQualScore                  :                                        ..     .  ..    ..                            .                                                                              
lowQualScore                  :                                        77     8  77    77                            7                                                                              
consensus                     :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 )      :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15                         :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16                         :       TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2                          :       aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3                          : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5                          :    aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6                          :        ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7                          :   caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8                          :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9                          :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT


blockSeqs                     :                                        CT        GT    .                             G
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .
blockSeqs                     :                                        .         .     .                             .


blockSeqCons                  :                                                        **
originalCons                  :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
finalCons                     :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT





Alignments
lowQualScore                  :                                        33     0  33    33                            2                                                                              
lowQualScore                  :                                        ..     .  ..    ..                            .                                                                              
lowQualScore                  :                                        77     8  77    77                            7                                                                              
consensus                     :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
Reference ( family-511 )      :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|1                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTGTGAATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|10                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CGTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAACGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|11                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGATAAACTCT----TTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTAGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATT
gi|12                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGAACAATATTAACACAATTTGACAATTAGTAATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGGTAAACATT
gi|13                         :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTTGGTGGGG-TAAATTGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGTTCAATAATTTTTAACATT
gi|14                         :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTTTTT--TGTG--AATTGCAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAAT-----------------TTAATCATGTTTAACATT
gi|15                         :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCTCTCTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATGAAAGTGGGTGGGG-TAAATC
gi|16                         :       TATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTa
gi|2                          :       aagAGATTTTATCACAATTAGGTGTTAAACTCT--TTTTTTTTGTTGTG--AATATCAGCAAAATCAAAGTAGGTGAGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATAAGTCATAATTTACATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|3                          : ctgaACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTCTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|4                          :     ACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAATTCT---TTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTCATATTCATATATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|5                          :    aACAATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTCTCTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGAGGGTGGGGGTAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATT
gi|6                          :        ATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAAATCT--CTCTTTTT--TGCG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAATCATGTTGAACATTT
gi|7                          :   caACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTCT--CTTTT--T--TGTG--AATTACAGAAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTTACAATTAGTCATAATTCATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT
gi|8                          :    aACTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACTAT--TTTTTTTA--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGCACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATATATTGGTTAAACATGTCTTACAT
gi|9                          :      aTATAGATTTTATCAAAATTAGGTGTTAAACACT--CTTTTTTT--TGTG--AATTACAGCAAAATCAAAGTGGGTGGGG-TAAATCGTACAATATTTACACAATTTGACAATTAGTCATAATTTATATACATGTATTGGTTAATCATGTTTAACATTT