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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-5068 ) : GCTCCA--CGCTCCATTGACCTCTG-TCAACGTCTCAAAGTTTGTAAGA-TTNTTGCAATATTAAACCTACACA----TG-GTCAC--TCAT---ACAT---G--TGGACAAAAT---TAAGACATG-GCGATTTT-AA--C-AT---TT----AAT--T--TC-CATTCAAATTAAATNTGNNTTTTTA--CTT-AAAA--GN--ATGTTTTT--A--A---------ACATGCCTGTTTACTTACA---TTTACTTCCGC---------GC------AA--AATAATC--CAACGCATAAAC-C--TAGTT-T--AAA----T---ANATT-T-A--TTTAAGC-AAATGTGGAA-----GTATA-----AA-----TGCTGAT------TT-GGTA--T-GAAC-----AAA-ATAATNTAAAACTG--CCATGTCNTG--ATTTT----GT------CAANTGTGCGA------G-TAGATTTG--A-TATTGCAAG---------AA-TCT--TGCA-A-------A--------C--------G---TT--G-------------A--------C------AGAGGTNA--ATGG-----AGC-GTA--A-----CG-CAGTGNAC-CCTGG-GAGAGATTG
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gi|11 : cattctTGTTTTT--A--A---------ACGTAAGTATTAACTTAC-------------GT---------G-------AA--AATAATT--CAACCCATTGAC-C--TAGTT-A--CAA--------AAATA-T-A--TTTAGGC-AAATGT-----------ATG-----AC-----GGCTGAA------TT-GGTACAT-GTAT-----AAACAAAATGTCAAACTG--CCATGTCATG--ACTTT----GT------CAACTTGGCAA------C-TATATTTG--A-TGT----AA---------AA-TCT--TGCA-A-------AATCGGCGAC--------G---TT--G-------------A--------C------AGAGGATG--TTGG-----AGC-CTA--G-----CG-CAGTGTAC-CTTGG-CAGAGATTG
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gi|15 : TTTC-AA--C-AT----------AT--T---C-CATTCAAATTAAATATTA--TTTTA--GTT-AAAT--AA--ATTTTTGT--A--A---------ACACGAATGTTTATTTATAATATTTACCTTAAC---------GC------AAGAAAAAAGA--AAAC-CATCAAC-C--TAGTT-T--AAA----T---A-ATA-T-A--ATCAAGC-AAATATGGAA-----ATAT
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gi|17 : ttttgttacatgagtgacaacaatatttttaatatAACGTCTCAAACTCTGTAAGA-TTCT----ATTTTAAACCTACACA----TG-ATAACTATCAT------T---G--CGGACACATT---TAAGACATG-GCGG---T-A---------------------T--TC-CATTCAAATTAA-----TATTTTT---CTT-AAAA---C--ATGTTTTT--AT-AAACTGTTTTACATGCCTGTTTACTT
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gi|21 : atA--CGCTCCATTGATCTTTG-TCAACGTCTTTAAGTTCGTAAGATTTTTTTCAATATTAAACCTACACC----TG-ATCAT--TCAT---ACGT---acctgatcattcatacgtcggca
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gi|24 : tA--CACTCCATTTACCTCTG-TCAACATCTCAAAGTTTATAAAA-ATGTTTCTATATTAAACCTACACA----aca
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gi|28 : ctctatttgacgaagtctcttgccaaagatgtgGCGCTA--CGCTACATTGACCTCTG-TCAAAGTCTCAAAGTTTGTAAGA-TTTTCG
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Reference ( family-5068 ) : GCTCCA--CGCTCCATTGACCTCTG-TCAACGTCTCAAAGTTTGTAAGA-TTNTTGCAATATTAAACCTACACA----TG-GTCAC--TCAT---ACAT---G--TGGACAAAAT---TAAGACATG-GCGATTTT-AA--C-AT-T-----AAT-T------TC-CATTCAAATTAAATNTGCATTTTTA--CTT-AAAA--GN--ATGTTTTT--A--A---------ACATGCCTGTTTACTT---ACATTTACTTCCGC---------GC------A--AAATAATC--CAACGC-ATAAACC--TAGTT-T--AAA----T---ANA-TT-TA--TTTAAGC-AAATGTGGAA-----GTATA-----AA-----TGCTGAT------TT-GGTA--T-GAAC-----AAA-ATAATNTAAAACTG--CCATGTCNTG--ATTTT----GT------CAANTGTGCGA------G-TAGATTTG--A-TATTGCAAG---------AA-TCT--TGCA-A-------A--------C--------G---TT--G-------------A--------C------AGAGGTNA--ATGG-----AGC-GTA-----GCG-CAGTGNAC--CCTGG-GAGAGATTG
gi|1 : GCTCCA--CGCTCCATTAACATCTG-TAAATGTCTCGAAGTTTGTAAGA-CTCTAGCAATATTAAACCTATACA----TG-TCCAC--TCAC---ACATTGGA--TGGACAAAAC---GAAGATATG-GCAATTTT-AATCC-AT-TTT---AATCT------TC-CATTCGAATTATATCTGACTTTTTA--CTT-AAAA--GT--ATGCTTGT--A--A---------ACATGCCTGTTTAAAT---ACATTTACTTCCGC---------TC------A--AAATAATC--CAACGC-AAAAGTC--TAGTT-T--AAA----T---ACA-TTCTA--CTTAATC-AAATGCAGAC-----GTATA-----AA-----TGTTGAT------TT-GGTA--T-GAAC-----AGC-ATAATTTAAAACTG--ACATGTCTTC--ATTTT----GT------CGAACGTGCGA------T-TATATTTG--A-TATTGCAAG---------AA-TCT--TGCA-A-------A--------C--------G---GT--G-------------A--------C------AGAAGTTA--ATGGTTCATAGCAGTG-----ACGTCAGTGCAT--CATGA-AAGAGATTG
gi|10 : CTCCATACGCTCCATTGACCTGTGGTCAATGTCTTAAAGTTTGTAAGA-TCTTTGCAATATCAAACTTACATA----CG-GTCAC--TTGG---ACAT------TGAACAAAAT---CAAGACATG-ATTATTTT-AA--C-AT-T-------T-T------TC-TATTCAAATGGAATTTGTATTTTT-----T-A--------------TTT--A--A---------TCATGCCTTTTTACT----------AC---CGT---------GC------A--ATTTAATT--CAAAGT-ATAAA----TATTT-T--TTT----T---AAA-TT-TA--T--ACTC-AGATTTGGAA-----GAATA-----AA-----TGCTG
gi|11 : cattctTGTTTTT--A--A---------ACGTAAGTATTAACTT---AC----------GT---------G-------A--AAATAATT--CAACCC-ATTGACC--TAGTT-A--CAA--------AAA-TA-TA--TTTAGGC-AAATGT-----------ATG-----AC-----GGCTGAA------TT-GGTACAT-GTAT-----AAACAAAATGTCAAACTG--CCATGTCATG--ACTTT----GT------CAACTTGGCAA------C-TATATTTG--A-TGT----AA---------AA-TCT--TGCA-A-------AATCGGCGAC--------G---TT--G-------------A--------C------AGAGGATG--TTGG-----AGC-CTA-----GCG-CAGTGTAC--CTTGG-CAGAGATTG
gi|12 : tataaaatATTTGAATTTAATCTGCATTTTAA--CAT-AAAA--ATCTATATTTTT--T--TTTT------ACATACATGTTTACTT---ATATTAACTACTGC---------GC------A--AAATAATC--CTTTGC-ATAAACC--TACGG-T--AGG----TCAGAAA-TT-CAAATTTAATC-AAACATGCAAAAACAGAATT-----AA-----TGCTGGT------TA-AATA--T-GAACTCCACAAA-ATAATTTAAAACTG--CTGTGTCATT--ATTTT----GC------CAAATGTGCAA------G-TTGATTTG--A-TATT
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gi|2 : caCTA--CGCTCCATTGA-----G-TCGATATCTCAAAGACT-----A-CTTTT-CAATATAAAACTAACATA----AG-GTCAC--CCAT---ACAT---A---GAACAAGAT---TTAGATATA-GTGATTTT-AA--C-AT-------AAT-TCA----TCTCATTCAAATTTAATATGTTCTTTTA--C---AAAA--AA--ATGGTTTTGCA--A---------ACGTGCCTGTTTACTT---ATATTTCCTTCCTC---------GC------A--AGCAAATC--CGACGCAAAAAAAT--TAGCA-T--AAA----A---AGATTT-TG--TTGAAGC-AAATGAGGAA-----GAGTA-----TA-----TTTTTAT------TT-GGTA--T-AAAC-----ATA-ATAATCTAAAACTT--CCATGTCTGGGTATTTT----CT-------AAATATAAGA------G-TAGATTTG--A-TATTACAAG---------AG-TCT--TGCA-A-------A--------C--------A---TT--G-----------------------------AGACGTTG--ACAG-----AGC-TTAATAATGTG-CAGTGTAT--CCTGG-GAGAGATTG
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blockSeqs : . . T . G G A A . . G A . . . CATAATTCA C T A G ACTTT TAAA G . TCA A . C . . . . T G . CC A AAGATTT ATC . . T . . . . . . . . T . G . . . T . . . . C G . . . ACTTTGAGATG . ACAGATCT T . . . . . C . .
blockSeqs : . . T . T T A G . . A A . . . CATTTT C T A G ACAT AAAA T . A A . T . . . . A A . CC T TAAATT TCA . . T . . . . . . . . G . T . . . A . . . . C G . . . ACTTTGAGATG . ATACGT C . . . . . A . .
blockSeqs : . . C . T T A G . . G A . . . CATATT C T C G AGTT ACAG G . A A . T . . . . A G . AT T TAAAGT TTG . . T . . . . . . . . T . A . . . T . . . . C C . . . ACTGTAGGGCA . AC T . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . A C C A . . A A . . . TATATA C T C C AATT CAAA G . A C . T . . . . A A . CC T GACTTA TAA . . A . . . . . . . . C . T . . . A . . . . A C . . . ACTTTGAGACT . AC T . . . . . C . .
blockSeqs : . . T . C G A G . . . A . . . CATATT C A A G ACTC AGAT T . A C . C . . . . A G . AC T AAATA TTT . . T . . . . . . . . C . T . . . A . . . . A G . . . AACTGGGACG . AT C . . . . . C . .
blockSeqs : . . C . G G G A . . . A . . . TAAAT A T T A CTT TGTT T . A T . T . . . . A G . TC A TAATA TTA . . T . . . . . . . . T . T . . . A . . . . G G . . . CGG . AC A . . . . . A . .
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blockSeqs : . A . T G A A . . . . . . . . TT . T . A A . G . . . . C . . C T TGA TT . . A . . . . . . . . C . T . . . A . . . . C C . . . ATG . AC T . . . . . C . .
blockSeqs : . T . T G . . . . T . T . A C . . . . . . . . . . . AA T . . A . . . . . . . . G . A . . . T . . . . C A . . . TAG . AC C . . . . . A . .
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blockSeqs : T . C G . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . T . . . . C T . . . GCT . AC A . . . . . C . .
blockSeqs : C . . . . . . . A . . . T . . . . C G . . . AAG . AC C . . . . . A . .
blockSeqs : . . A . . . T . . . . C C . . . AC . AC T . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . A G . . . CG . . T . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . G A . . . G . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : G***** CATATT****************** TAAATN********* *****
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gi|5 : atctcatccagggtacattacgctattctcgtGCAATATTAAAC-----------TG----------AT---ACAT---AAATGGACAAG-T---TAAGAC---ACG-------GCCATTTTTAA--GAT----AAATTAAGCATTC----CATTTAAGTAAAATATCCATTTTTA--A-TTAAAA--CA--GTTTTTTT--T--A---------ACACGCCTGATTACCT---ACATTAACCTCCAC---------GCCAAAAAA--AAATAACC--T----C-ATAAATC--TATGT-TAAGCTTTT---ACA-T--TG--TTAAAGG-ACATGTGGAT-----CTATA-----GA-----TGCCGAT------TT-AATA--T-AAGC-----AAG-TTAATGTAAAACTG--CCAGATCAAG--GTTTT----GTAAACTACGAGTATGCCA------G-TAGATTTA--G-TATTACAAG---------AA--CT--TGCC-A-------A--------C--------G---TTTAG-------------A--------C------AGAAGTAA--A-------------TA-----ATG-CATCGCAC--TCTGG-GAGAGATTGgactttgaatgatg
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gi|8 : taaTCCATTAACCTCTG-TCAATGTCTCCATGTTTG----A-TTCTTGCAATATTAAACCTACACA----TA-ATCAC--CCAT---ACAT------CGGACAAAAT---TAAGAC---ATG-------GCAATTTT-AA--CAT----A---T-----TC-----------AATTAAATGTACATTTTTAGTT-TTAAAT--GT--TTTTTTTT--A--A---------GTATGCC-------------CATTTTCTTTCAT---------AC------A--AAATAATT--GAATGC-ATGAAGC--TAGAT-TAAA----G---ACT-TA-TA--TCTAAGG-AAATGTGGAA-----GAATAGAGTTAA-----TGCTGAT------TG-GGTG--T-GAAG-----AAA-ATAATGTAAAAC-A--TCAAGTCATG--G-TTT----GT------CA-----GTGA------G-TAGATTTG--A-TATTGAAAG---------AA-TCT--Tga
gi|9 : cacattctatccaactttgctgcagTTTTA--C-TCAAAATTGC--CTTTTTTT--ATCA---------TCATGCCTGTTTGATT---AGATTTTTGTCTGC---------GC------A--AAATAATC--CA----------CC----GTC-TAAA---------AA-TA-TA--TTTAAGC-AAATTTGAAC-----GTATA-----AA-----ATATGGT------TT-AGTA--T-AAAC-----AGA-ATAATGTTACACTG--TCATGTCATT--ATTTT----GT------AAATTGTGCAA------ACTAAATTTG--A-TATCGGCAG---------TA-CCG--TGCA-AAACTGGGA--------C--------G---TT--G-------------A--------CAGATCTAGAGGTTT--TAGG-----AAT-GCT-----GCG-CAGTGCAC--CCTGG-TAGAaaa