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lowQualScore                  :       .        ...  .   ..   . .. .   ...      ..  .  .. ...        .     . .    .               .      ..   ......  .   .       .    ....................  .       .    .            .       .     .   ...    . .                           ....             . .                      .        .  .                          .    .                  ......   .              .      .  .         .       .                             .       .                     . ..  .....   .               ..           .       ...................       ...       ....  .   .. .         ..   .  .......                                      .  .    .     . .                            .....     .     .                 . .                                                    .      .           . .          .                                 .                     .     ........................            . .         .  .     .                                    .                                               .. . ...    .                           .                  .    .    .       .         .              
lowQualScore                  :       0        666  8   44   9 77 7   333      66  7  99 666        6     1 0    0               0      00   000000  0   0       2    00000000000000000000  0       0    0            3       3     0   555    8 0                           6666             0 9                      2        1  5                          2    0                  888888   4              0      9  9         6       5                             0       9                     0 22  00000   0               00           4       0000000000000000000       444       3333  4   55 1         55   8  9999999                                      3  0    9     2 1                            11111     4     4                 0 4                                                    4      0           7 9          0                                 2                     0     555555555555555555555555            6 4         0  0     2                                    6                                               44 1 666    0                           1                  0    0    1       1         9              
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gi|11                         :  taTTATGGTGGGATT-ATTTGATCCTTTAA--A-CTATTAGATAATGAATATT--GAT-TGTTATGAAACCAAACTTGAT-A----TTGTTTCTTC-GTACTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTT------------------TATTA-CATAATA-ACAG-TGACTATAATAGATCTCACTTTACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATACTAAAATAATGATACAAGAAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACCTATTTCGAGTGTTAATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAATTGTCcatacagaatcggtattatatttataccgtctccaaatatgcttcgggtgtaatctaatcaaccacatgtaataaaagcgtcttgtaatgagattttgtgtctcatcttaagtgaagaacgaattccgtttcctcgtttcttacgtaacattggtgttatcagactgtttgccgtctgttaattataaaggtttatggctatattgtatctgttatgtaaaatatgcttacattcaatttgtaacgttttatgcattttgtttataaaacatttcacaagaactgtatctgaatataaataaaaaaatcaaaatctatattttgtcgccgctcgattgatacccattttgtattagtttacattataaattatgaaacaattttttatgggtctaaaa
gi|1                          :       taGTGGGATTTTTTTTATCCTTTGC--A-CTAGTAGATCATGTATATT--GAT-TGTTATGAAACCAAACTTAAT-ACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTATAA-CAAAATA-ACAG-TGACGATAATTGTTTTCACTTCACAA-ATA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTAATAATATTAAATTAATGATATAAGTAGTGCCCACTTAATTAATCTTTAACACACATATTTCGATTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTATGTTGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTCAATACGTCCACGCCTTTAA-----AAA-TAACACAACTCCTATATTGTTATTTCTTATATCTCTCCC-CTC---TTTGCT-TTTTATCTC--TCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCT--CCTTTTTCAT---ACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTATCCGAATATGCTTCGGAC-TAATCGACTCAATCACATGTAATAAACACTTCTTGTAAATAAATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGGACGAATACCGCATCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATGACTAAGCCTTGTGGCTATCATATAGCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAAGA--------T-------TTCACAAGAACTATATCTGAATATAAA-TAACAGAATTAAAATCAATACTTTGTCGTCACTAGATTGATACCCATTTTGTATAAATTTTCATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAA-AACTAGTATGTTTTTGTTAATTTAACTTTTAAGCAGCATTATATAATTAACAGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|14                         :                         attTTTAGCA-CTATTACATAATGTATGTT--G-T-TGTTATGATACCAAACTTAAT-ACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------A-CAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTt
gi|15                         :        tgatgatgtgtaattttttcTTTAGCA-CTATTACATAATGTATGTT--G-T-TGTTATGATACCAAACTTAAT-ACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------A-CAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-T
gi|9                          :                                                  tgatgatgtgtaattttttcACCAAACTCATT-ACTGTTTGTTTCTTC-ATATTC--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ATACTCAATGTTTGTTA-CAAAATG-ACAG-TAACGATGACAGCTCTCCCTCCACAA-TCA---AATGACAGTATTGATATTAGTTGTATCCACTTTGTTTTTTTTTTAA-ATGAAATTAATGATATATATTGTGTCCACTTAACTAATTTTGTATACAAATATTTCGAGTA-TGATAACAATGACAAAC-TGTCCTGAAT--------ATATTCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTTTA----ATCATG---ATTAA---------------TGTA-----AAT------ATGATTACATCT---A-----AAG-TAACATCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTCTCATTCAGGCTTGGTATTATAT
gi|5                          :                                                                                               atC-ATATTTGATTACGTATGTTACACATAACAATATTTACGAATGAACATAAAATG-ATTA-CAAAATATATAACTTATGCAGATGGATTGAACT--ACAAGTTATAAAATGACAGTTATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAAATTATGATATAAGTAGTGTCCATATAGTTAATTTTCTATACACATATTTCGAGTGTTGCTAACAATG-TAAACATGTCCTGACTTC------ATA-TCCATTTAACATTT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTATGCGGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTTAA-----ATA-CAACATAACTCATATAATGTTATTTCTTATATCTCTTTT-CTA---TTTttataccatctccggatatgcttcgggggtaatctaatcaaccacatgttataaacgcgccttgtgatgagctgtgtcatcttacgtgaagaacgaaaccgcttccccgtttcttgcgtaacgttgatgttatcagactgtttgtcgtctgttaattattaaggcttgtggctgttatgtatctgttatgtaaaatattcttacattcaatttgtaacgttttggtacattttgtttataaaacatttcacaagaactttatctgaatataaattacaaaatcaaatgtata
gi|6                          :                                                                                           tttaaaC-ATATTTGATTACGTATGTTACACATAACAATATTTACGAATGAACATAAAAT--GATAACAAAATA-ATAACTTATGCAGATGGATTGAACT--ACAAGTTATAAAATGACAGTTATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAAATTATGATATAAGTAGTGTCCACGTAGTTAATTTTCTATACACATATTTCGAGTGTTGCTAACAATG-TAAACATGTCCTGACTTC------CTA-TCCATTTAACATTT-TTACTATAATTGTCCTGTAATCTATGCAGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTTAA-----ATA-CAACATAACTCATATAATGTTATTTCTTATATCTCTTTT-CTA---TTTcatacagaatcggtattatatttataccatctccgaatatgcttcaggctaatccactcaaccacacgtaatacaaacttcttgtaatgaacgtttattgcatctaatgtgaagaacgaataccgcttcctcgtttcttacgtaacgttgatgttatcagactgtttattgcctgttaattactaaacattatgactattacatatctgttatgtagaatgtgctcacattcaatttgtaacgtttttatgcattttgtttataaaacatttcacaagaactgtatctgaatataaataacaaaatcaaaatctatactttgtcgccactcgattgatacccattttgtattagtttacattataaattatgaaacaattttatatatataataagtatgtttttgataatttaaatattaagcagcattatataataaactgtattgttacaaaactgtgtaatgaatacacatta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttaaaCATTTCTTTATTCACGAATAATA-T--GTCTACTATATACTACTATAATTGTCCTGTAGTCTATGCGGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCGCATCTTAAA-----AAA-TAACACCACTCCTATATTGTTATTTCTT---------------------------ATGTCTC--TCCCCTCT----TTGCTT--TTCATTTCTCT--CCTTTA---T---ACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCTGAATATGCTTCAGGC-TTATCAAATCAACCACATGTAATAAACATTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTAAAGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATATTATCTGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACATTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTT-------A--------TAAA----ATAACAAGAACTATATCTGATTATAAA-TAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATACCCATTTTGAATTAGTTTACATTATAAATTATAAAACAGTTCTTTATAGTTCTAA-AACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTATTGTTACCCAAAACTACGTAATGAATATACACATTATAAcatacagaatcggtattatatttataccatctccgaatatgcttcaggctaatctactcaaccacacgtaataaaaactccttgtaatgaacgtttattgcatctaatgtgaagaacgaataccgcttcctcgtttcttacgtaacgttgatgttatcagactgtttatcgcctgttacttactaagcattatgactattacatatctgttacgtagaatgtgctcacattcaatttgcaacgtttttatgcattttgtttataaaacatttcacaagaactgtttctgattataaataacaaaatcaaaatgtatactttgtcgccactcgattgatacccattttgtattagtttacattataaattatgaaacaattttatatatataataagtatgtttttgataatttaaatattaagcagcattatataataaactgtattgttacaaaactgtgtaatgaatacacatta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATGT-CTACTATAATTGTCCTGTGTTCTATGCTGTATTATGAATTTCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCT---A-----TAA-T-ATACAACTCCTATAATATCATTTCCTATATCTCTC-C-TTC---t
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGTATTCTATGTGGTATCATGATTATCCAGGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTAAGA-----AAA-CAACATAGCTCTTATAATGTTATTTTTTTTGTCTCTCTT-TTT---CCTATT-TCATACATatacatgttcggtattattcttgtaccatctccggatac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATATACA--ACTCCTATAATATCATTT--CCTATATCTCT--CCTTCA---T---ACATGTTCGGTATTATTCTTGTACCATCTCCGGATAaatcggtattatatttataccatctccgaataggcttcgggataatctattcaaccacatataataaacacttcttgtaatgaacttttatttcaccttatgtgaagaacgaataccgcttccccgtttcttacgtaacgttgatgttatcagactgtttgtcgtctgttaattactaaactttatggctattatatatctgttatgtaaaatgtgtttacattcaatttgaaacgttttgatacattttgtttatagaacatttcaaaagaactgtttcaaaatataaataacaaaatcaaaatgtatactttgtcaccgctcgactgatacccattttgtattagtttacataataaattatgaaacaattcttatagttataaaactagtatgttttcgataatttaaatattaagcagcattatataataaacagtactgttacccaaaattacgttatgaatatacacattatga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catgtctactataattgtcctgtgttctatgctgtattatgaatttcaacgtcacaatgcattttgtatgattaatgtaaatatgatcacatctataACATC--ACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTCT--C--ATT--------CAGGCTTGGTATTATATTTATACCATCTCCGGATATGCTTCGGGGGTAATCTAATCAACCACATGTTATAAACGCGCCTTGT-----GATGA-GCT----GTGTCATCTTACGTGAAGAACGAA-ACCGCTTCCCCGTTTCTTGCGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTATTAAGGCTTGTGGCTGTTATGTATCTGTTATGTAAAATATTCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTGGTACATTTTGTTTATAAAACA--------T-------TTCACAAGAACTTTATCTGAATATAAA-TTACAAAATC-AAATGTATAc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                       ataccaaactcattactgtttgtttcttcatattcttattcactaagaatagttaatactcaatgtttgttacaaaatgacagtaacgatgacagctctccctccacaatcaaatgacagtattgatattagttgtatccactttgttttttttttaaatgaaattaatgatatatattgtgtccacttaactaattttgtatacaaatatttcgagtatgataacaatgacaaactgtcctgaatatattccgtgtaacatgtctactataattgtcctgtattctttaatcatgattaatgtaaatatgattacatctaaagtaT----TTTTTT--TGTCTCTCTTTTTCCTATT---TCATACATAATCGGTATTATATTTATACCATCTCCGAATAGGCTTCGGGA-TAATCTATTCAACCACATATAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCACCTTATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCCCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACTTTATGGCTATTATATATCTGTTATGTAAAATGTGTTTACATTCAATTTGAAACGTTTTGATACATTTTGTTTATAGAACA--------T-------TTCAAAAGAACTGTTTCAAAATATAAA-TAACAAAATCAAAATGTATACTTTGTCACCGCTCGACTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATAATAAATTATGAAACAATTC-TTATAGTTATAA-AACTAGTATGTTTTCGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTACTGTTACCCAAAATTACGTTATGAATATACACATTATGA
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-4958 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGATNTNTTTGATCCTTTTA--ACTATTAGATAATGTATGTT--GATTGTTATGANACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ANACACAANGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAANTAATGATATAAGTAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACATATTTCGAGTGTTGATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTATGCGGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATAATGTTATTTCTTATA-TCTCTCTCCTNTTTG-TTTATATATCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTNTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGCTTCGGGC-TAATCNACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAGCCTTATGGCTATTATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTGTATCTGAATATAAATAACAAAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCGCTCGATTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACNGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTATTCTATGTGGTATCATGATTATCCAGGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCT-AAG-----AAA-----ACAAC----ATAGC------TCTTATAATGT------TATTTT-TTT---TGTCTCTC-----------TTT--T---------TCCTATTTCATACATAATCGGTATTATATTTATACCATCTCCGAATAGGCTTCGGGA-TAATCTATTCAACCACATATAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCACCTTATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCCCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACTTTATGGCTATTATATATCTGTTATGTAAAATGTGTTTACATTCAATTTGAAACGTTTTGATACATTTTGTTTATAGAACATTTC-AAAAGAACTGTTTCAAAATATAAATAACAAAATCAAAATGTATACTTTGTCACCGCTCGACTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATAATAAATTATGAAACAATTC-TTATAGTTATAAAACTAGTATGTTTTCGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTACTGTTACCCAAAATTACGTTATGAATATACACATTATGAt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGAT-TATTTGATCCTTTAA--ACTATTAGATAATGAATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTGATA----TTGTTTCTTC-GTACTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTT------------------TATTACATAATA-ACAG-TGACTATAATAGATCTCACTTTACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATACTAAAATAATGATACAAGAAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACCTATTTCGAGTGTTAATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAATTGTC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATGT-CTACTATAATTGTCCTGTGTTCTATGCTGTATTATGAATTTCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCT---A-----TAA-T-ATACAACTCCTATAATATCATTTCCTATA-TCTCTC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCATACATGTTCGGTATTATTCTTGTACCATCTCCGGATActtcatacatgttcggtattattcttgtaccatctccggatac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            catgtctactataattgtcctgtgttctatgctgtattatgaatttcaacgtcacaatgcattttgtatgattaatgtaaatatgatcacatctataatatacaactcctataatatcatttcctatatctctccTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgatgatgtgtaattttttcTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-T
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgatgatgtgtaattttttcTTACGGTGGGATTTGTTTGATTATTTTA--ACTATTTGATAATGAATGTT--GATTGTTATGAAACCAAACCTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTAATACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTACATTAATGATATAAGTAGTGTCCACTTAATTAATCTTTTATACACATATTTCGAGTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTACAACTGTCCTGTAGTCTATGCAGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGGTTAATGTAAATATGATCACATTTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATGTTGTTATTTCTTATA-TCTCTCTCTTCTTTGCTTTATATATCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTATT---TACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGTTTTGGGC-TAATCAACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGATGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTTTCGTCTTTTAATTACTAATCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTGTGTTT-------ATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATAT-AATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATATCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCT-AAATTGGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAACAGCATTATATAATAAACAGTATAGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACCCCAAACTATGTAATGAATATGCACATTATAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgaTTATGGTGGGATGT-TTTGATCTTTTAA--ACTAAATGATAATTTTTG----GGATATTATG---------TTAATACTGACTGTTTCTTC-ATAGTT--TTA------TT-CAA-TAAGAATTGTTA-----ATACACAATGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGACAGTAATAATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAAATAATGATATAATTAGTGTCCACGTAATTATTTTTCTATACACATATTTAGAGTGTTTATAACAATG-TAAACATGTCCTGACTCA------ATT-TCCGTGTGACATGT-CTGCTATAATTGTCCTGTATTCTATGCCCTATTACAAATATCAACGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTAAAAAAAACAAA-AAACATAACTGCTATAATGTAATTTATTATA-TCTCTTTCCTATTT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGAT-TATTTGATCCTTTAA--ACTATTAGATAATGAATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTGATA----TTGTTTCTTC-GTACTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTT------------------TATTACATAATA-ACAG-TGACTATAATAGATCTCACTTTACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATACTAAAATAATGATACAAGAAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACCTATTTCGAGTGTTAATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAATTGTC
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgatgatgtgtaattttttcTTACGGTGGGATTTGTTTGATTATTTTA--ACTATTTGATAATGAATGTT--GATTGTTATGAAACCAAACCTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTAATACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTACATTAATGATATAAGTAGTGTCCACTTAATTAATCTTTTATACACATATTTCGAGTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTACAACTGTCCTGTAGTCTATGCAGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGGTTAATGTAAATATGATCACATTTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATGTTGTTATTTCTTATATCTCTC--TCTTCTTTG--CTTTATATATCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTATT---TACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGTTTTGGGC-TAATCAACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGATGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTTTCGTCTTTTAATTACTAATCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTGTGTTT-------ATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATAT-AATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATATCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCT-AAATTGGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAACAGCATTATATAATAAACAGTATAGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttaaaTCT--TATATCTCTTTTCTATTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCATCTCCGAATATGCTTCAGGC-TAATCTACTCAACCACACGTAATAAAAACTCCTTGT-----AATGA-ACGTT-TATTGCATCTAATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTATCGCCTGTTACTTACTAAGCATTATGACTATTACATATCTGTTACGTAGAATGTGCTCACATTCAATTTGCAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTGTTTCTGATTATAAATAACAAAATCAAAATGTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTTTATATA----TATAATAAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACTGTATTGTTA--CAAAACTGTGTAATGA--ATACACATTAcatacagaatcggtattatatttataccatctccgaatatgcttcaggctaatctactcaaccacacgtaataaaaactccttgtaatgaacgtttattgcatctaatgtgaagaacgaataccgcttcctcgtttcttacgtaacgttgatgttatcagactgtttatcgcctgttacttactaagcattatgactattacatatctgttacgtagaatgtgctcacattcaatttgcaacgtttttatgcattttgtttataaaacatttcacaagaactgtttctgattataaataacaaaatcaaaatgtatactttgtcgccactcgattgatacccattttgtattagtttacattataaattatgaaacaattttatatatataataagtatgtttttgataatttaaatattaagcagcattatataataaactgtattgttacaaaactgtgtaatgaatacacatta
gi|7                          : tttaaacatatttgattacgtatgttacacataacaatatttacgaatgaacataaaatgataacaaaataataacttatgcagatggattgaactacaagttataaaatgacagttatgatgttagttgtatccactttgctttataatattaaaattatgatataagtagtgtccacgtagttaattttctatacacatatttcgagtgttgctaacaatgtaaacatgtcctgacttcctatccatttaacatttttactataattgtcctgtaatctatgcagtattacgaatatcaacgtcacaatgcatgttgtatgattaatgtaaatatgatcacatctttaaatacaacataactcatataatgttattTTATGGTGGGAAAAATT--ATTCTTTTA--A--ACTAGATAATA-ATTTTTGGGTTGTTATGATACCAA-CTAATTACTGATTGTTTTTTTTATATTT--TTA------TT------GAGAA--GTTA-----ATGCACCATGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTGTCACTTCACAG-TTA---AATGACAGTAATGATGTTACTTGTATCCATTTTG----CTTTATAATATTGAATTAATTATATAAGTAGTGTCCATGTA--T--TTTTTTATACACATATTTCGAGTATTGATAACAATG-AAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAAGTGTTCTGTAGTCTATGCGGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTGGTATGAATAATGTAAATATGGTCACATCTAAAA-----AAA-TAACACAACTACTATAATGTTATTTCTTATTTCTCTT--T
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ta----TTATTT--CTTATTTCTCTTTTTTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCAAATATGCTTCGGGTGTAATCTAATCAACCACATGTAATAAAAGCGTCTTGT-----AATGAGATTTTGTGTCTCATCTTAAGTGAAGAACGAATTCCGTTTCCTCGTTTCTTACGTAACATTGGTGTTATCAGACTGTTTGCCGTCTGTTAATTATAAAGGTTTATGGCTATATTGTATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAATTTGTAACGTTTT-ATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTGTATCTGAATATAAATAAAAAAATCAAAATCTATATTTTGTCGCCGCTCGATTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTTTTTATGGGTCTAAAAtttttcatacagaatcggtattatatttataccgtctccaaatatgcttcgggtgtaatctaatcaaccacatgtaataaaagcgtcttgtaatgagattttgtgtctcatcttaagtgaagaacgaattccgtttcctcgtttcttacgtaacattggtgttatcagactgtttgccgtctgttaattataaaggtttatggctatattgtatctgttatgtaaaatatgcttacattcaatttgtaacgttttatgcattttgtttataaaacatttcacaagaactgtatctgaatataaataaaaaaatcaaaatctatattttgtcgccgctcgattgatacccattttgtattagtttacattataaattatgaaacaattttttatgggtctaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tattatggtgggaaaaattattcttttaaactagataataatttttgggttgttatgataccaactaattactgattgttttttttatatttttattgagaagttaatgcaccatgtttattacaaaataacagtgacgataatagttgtcacttcacagttaaatgacagtaatgatgttacttgtatccattttgctttataatattgaattaattatataagtagtgtccatgtatttttttatacacatatttcgagtattgataacaatgaaaacatgtcctgattcaatatccgtgttacatgtctactataagtgttctgtagtctatgcggtattatgaatatcaacgtcacaatgcatttggtatgaataatgtaaatatggtcacatctaaaaaaataacacaactactataatgCATTTCTTTATTCACGAATAATA-T--GTCTACTATATACTACTATAATTGTCCTGTAGTCTATGCGGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCGCATCTTAAA-----AAA-TAACACCACTCCTATATTGTTATTTCTTATGTCTCTC--CCCT------------------------CT----TTGCTT--TTCATTTCTCTCCTTT---ATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCTGAATATGCTTCAGGC-TTATCAAATCAACCACATGTAATAAACATTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTAAAGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATATTATCTGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACATTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAATA-----ACAAGAACTATATCTGATTATAAATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATACCCATTTTGAATTAGTTTACATTATAAATTATAAAACAGTTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTATTGTTACCCAAAACTACGTAATGAATATACACATTATAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACCAAACTCATTACTGTTTGTTTCTTC-ATATTC--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ATACTCAATGTTTGTTACAAAATG-ACAG-TAACGATGACAGCTCTCCCTCCACAA-TCA---AATGACAGTATTGATATTAGTTGTATCCACTTTGTTTTTTTTTTAA-ATGAAATTAATGATATATATTGTGTCCACTTAACTAATTTTGTATACAAATATTTCGAGTA-TGATAACAATGACAAAC-TGTCCTGAAT--------ATATTCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTTTA----ATCATG---ATTAATGT---AA--------ATATGATT---------------ACATCT---A-----AAG-TAACATCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTC--TCt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACATCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTCTC-------ATTCAGGCTTGGTATTATATTTATACCATCTCCGGATATGCTTCGGGGGTAATCTAATCAACCACATGTTATAAACGCGCCTTGT-----GATGA-GCT----GTGTCATCTTACGTGAAGAACGAA-ACCGCTTCCCCGTTTCTTGCGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTATTAAGGCTTGTGGCTGTTATGTATCTGTTATGTAAAATATTCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTGGTACATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTTTATCTGAATATAAATTACAAAATC-AAATGTATAattcaggcttggtattatatttataccatctccggatatgcttcgggggtaatctaatcaaccacatgttataaacgcgccttgtgatgagctgtgtcatcttacgtgaagaacgaaaccgcttccccgtttcttgcgtaacgttgatgttatcagactgtttgtcgtctgttaattattaaggcttgtggctgttatgtatctgttatgtaaaatattcttacattcaatttgtaacgttttggtacattttgtttataaaacatttcacaagaactttatctgaatataaattacaaaatcaaatgtata
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATATTTTATTATAGTTTAAACATCTTTTATTACGTATGTTACATATACGAGTATCAATATATACATTTAAACATCACATGATAACTAATGTATAACATATGCTGCAGCAAATGGTTTAATTTTATTATAATTTACAGTGACAGT
Unaligned ( gi|17 ): GTTTGAACATATTTTATTACTTATATTACGTATATTATATACAAATGAACAAAAAATTATAACAAAATATATAACATATGCAAATGGATTGAACTATCACTAGTTGTCACAATAGTCTGTCACTATGTTGTCACCGCTGTAG
Unaligned ( gi|18 ): TTTAGTTTAAACATATTTTATTATGTATGTTACATATATAAATATATACAAATGAACATAAAATGATAACAAAATATATA
Unaligned ( gi|19 ): TTTAAACATGTTTTATTACATATGTTACATATATCCACATATACAAATGAACATGCACTGACAACAAGTATATAA
Unaligned ( gi|20 ): TTAGATATATTTTAGTACGTATGTTACATATATCAATATATACAAATGAACATAAAATGATAACAAAATATATA






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Reference ( family-4958 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGATNTNTTTGATCCTTTTA--ACTATTAGATAATGTATGTT--GATTGTTATGANACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGACGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAANTAATGATATAAGTAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACATATTTCGAGTGTTGATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTANTCTATGCGGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATANTGTTATTTCTTATATCTCTC--TCCTATTTG--TTT--TACGTCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTNTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGCTTCGGGC-TAATCNACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAGCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTGTATCTGAATATAAATAACAAAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCGCTCGATTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACNGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTGTGGGATTTTTTTTATCCTTTGC--ACTAGTAGATCATGTATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTATAACAAAATA-ACAG-TGACGATAATTGTTTTCACTTCACAA-ATA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTAATAATATTAAATTAATGATATAAGTAGTGCCCACTTAATTAATCTTTAACACACATATTTCGATTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTATGTTGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTCAATACGTCCACGCCTTTAA-----AAA-TAACACAACTCCTATATTGTTATTTCTTATATCTCTC--CCCTCTTTGCTTTT--TATCTCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTTTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTATCCGAATATGCTTCGGAC-TAATCGACTCAATCACATGTAATAAACACTTCTTGTAAATAAATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGGACGAATACCGCATCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATGACTAAGCCTTGTGGCTATCATATAGCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAAGATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATATAAATAACAGAATTAAAATCAATACTTTGTCGTCACTAGATTGATACCCATTTTGTATAAATTTTCATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGTTAATTTAACTTTTAAGCAGCATTATATAATTAACAGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTATTCTATGTGGTATCATGATTATCCAGGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTAAGA-----AAA-CAACATAGCTCTTATAATGT----------------------TATTTT--TTT--T--GTCTCTC-----------TTT--T---------TCCTATTTCATACATAATCGGTATTATATTTATACCATCTCCGAATAGGCTTCGGGA-TAATCTATTCAACCACATATAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCACCTTATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCCCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACTTTATGGCTATTATATATCTGTTATGTAAAATGTGTTTACATTCAATTTGAAACGTTTTGATACATTTTGTTTATAGAACATTTC-AAAAGAACTGTTTCAAAATATAAATAACAAAATCAAAATGTATACTTTGTCACCGCTCGACTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATAATAAATTATGAAACAATTC-TTATAGTTATAAAACTAGTATGTTTTCGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTACTGTTACCCAAAATTACGTTATGAATATACACATTATGAt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGAT-TATTTGATCCTTTAA--ACTATTAGATAATGAATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTGATA----TTGTTTCTTC-GTACTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTT------------------TATTACATAATA-ACAG-TGACTATAATAGATCTCACTTTACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATACTAAAATAATGATACAAGAAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACCTATTTCGAGTGTTAATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAATTGTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taTATGGCTATATTGTATATGTTATGTAAAATATGCTTACATTTAATTTGTAACTTTTTTATACATTTTGTTTATATAACATTTC-ACAAGAATTATATCTGAATATAAATAACAAACTCAAAATTTATACTTTATCGCAGCTCGATTGATATCTATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGGTATATAATTAGTGTGTTTCTGATAATTTAAATATTAAACAACATTATATAATATACTTTATTGTTACCCAAAACTGTGTAATGAATAT--ACATTATAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATGT-CTACTATAATTGTCCTGTGTTCTATGCTGTATTATGAATTTCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCT---A-----TAA-T-ATACAACTCCTATAATATCATTTCCTATATCTCTCCTTCATACATG--TT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTT--CCTATATCTCTCCT---TCATACATGTTCGGTATTATTCTTGTACCATCTCCGGATAcggtattattcttgtaccatctccggatac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            catgtctactataattgtcctgtgttctatgctgtattatgaatttcaacgtcacaatgcattttgtatgattaatgtaaatatgatcacatctataatatacaactcctataatatcaTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgatgatgtgtaattttttcTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-T
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgatgatgtgtaattttttcTTACGGTGGGATTTGTTTGATTATTTTA--ACTATTTGATAATGAATGTT--GATTGTTATGAAACCAAACCTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTAATACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTACATTAATGATATAAGTAGTGTCCACTTAATTAATCTTTTATACACATATTTCGAGTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTACAACTGTCCTGTAGTCTATGCAGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGGTTAATGTAAATATGATCACATTTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATGTTGTTATTTCTTATATCTCTC--TCTTCTTTG--CTTTATATATCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTATT---TACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGTTTTGGGC-TAATCAACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGATGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTTTCGTCTTTTAATTACTAATCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTGTGTTT-------ATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATAT-AATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATATCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCT-AAATTGGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAACAGCATTATATAATAAACAGTATAGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCCCAAACTATGTAATGAATATGCACATTATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCATGGTGGGATATTTTTGATCCTTT-A--ACTATTAGATAATGTATGTT--GACTGTTATGAAACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ATACACAAAGTTTATTACAGAATA-ACAG-TGACGCTAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAACTAATGATATAAGTAGTTTCCAATTAATTAATCTTTAATGCACATATTGCAAGTATTGATAATAACG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGCAACATGT-CTA---TAATTGTCCTGTAGTATATGCGGTATTATGAAAATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTAAA-----AAAATAACACAACTCCTATATTGTTATTTCTTATATC-------------------------GT-TCTTCTCT----TTGCTT--TACATCTCTCTCCTCTTTCATACCGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATTTTTCGGCC-AAATCGACTCAACCACATGTAATAAACACTTTTTGT-----AATGA-ACTTA-TATTTCATTTAATGTAAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTGACGTTACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAGCCTTATGACTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTTACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-TCAAGAACTGTTTCTGAATATAAATAACAGAATTAAAAGCTATGCTTTGTCGCCACTCGATTGATAACCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTTTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGTATTATATAATAAACAGTATTGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgaTTATGGTGGGATGT-TTTGATCTTTTAA--ACTAAATGATAATTTTTG----GGATATTATG---------TTAATACTGACTGTTTCTTC-ATAGTT--TTA------TT-CAA-TAAGAATTGTTA-----ATACACAATGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGACAGTAATAATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAAATAATGATATAATTAGTGTCCACGTAATTATTTTTCTATACACATATTTAGAGTGTTTATAACAATG-TAAACATGTCCTGACTCA------ATT-TCCGTGTGACATGT-CTGCTATAATTGTCCTGTATTCTATGCCCTATTACAAATATCAACGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTAAAAAAAACAAA-AAACATAACTGCTATAATGTAATTTATTATATCTCTT--TCCTATTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taT--TATATCTCTTTCCTATTTCATACAGAATCGGTATTATATTCATACCATCTGCGAATATTCTTCGGAC-TAATTGACTTAAACACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-AATTT-TTGTTCATCTAATGCGAAGAACGAAAACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTGACG------------G--TGTTTGTCGTTTGTTAATTACTAAGCCTTATGGCTATTGTATATTTGTTATGTAAAATGTGCTTACATTCAATTTGAAACGTTTTAATGCATTTTGTTTATAAAACATTTCCGCAAGAACTGTTTCTGAATACAAATAAAAAAATCAAAATCTAGACTTTTTCGCCGCTCGATTGATACCCATTTTGAATTATTTTACTTTATAAATTATGAATCAAGTCTTTATAGGTCTAAAATTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAACATTATATAATATACTGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGTATATACACATTGTAAcatacagaatcggtattatattcataccatctgcgaatattcttcggactaattgacttaaacacatgtaataaacacttcttgtaatgaaatttttgttcatctaatgcgaagaacgaaaaccgcttcctcgtttcttacgtgacggtgtttgtcgtttgttaattactaagccttatggctattgtatatttgttatgtaaaatgtgcttacattcaatttgaaacgttttaatgcattttgtttataaaacatttccgcaagaactgtttctgaatacaaataaaaaaatcaaaatctagactttttcgccgctcgattgatacccattttgaattattttactttataaattatgaatcaagtctttataggtctaaaattagtatgtttttgataatttaaatattaagcaacattatataatatactgtattgttacccaaaactatgtaatgtatatacacattgtaat
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tattatggtgggaaaaattattcttttaaactagataataatttttgggttgttatgataccaactaattactgattgttttttttatatttttattgagaagttaatgcaccatgtttattacaaaataacagtgacgataatagttgtcacttcacagttaaatgacagtaatgatgttacttgtatccattttgctttataatattgaattaattatataagtagtgtccatgtatttttttatacacatatttcgagtattgataacaatgaaaacatgtcctgattcaatatccgtgttacatgtctactataagtgttctgtagtctatgcggtattatgaatatcaacgtcacaatgcatttggtatgaataatgtaaatatggtcacatctaaaaaaataacacaactactataatgCATTTCTTTATTCACGAATAATA-T--GTCTACTATATACTACTATAATTGTCCTGTAGTCTATGCGGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCGCATCTTAAA-----AAA-TAACACCACTCCTATATTGTTATTTCTTATGTCTCTC--CCCT------------------------CT----TTGCTT--TTCATTTCTCTCCTTT---ATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCTGAATATGCTTCAGGC-TTATCAAATCAACCACATGTAATAAACATTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTAAAGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATATTATCTGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACATTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAATA-----ACAAGAACTATATCTGATTATAAATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATACCCATTTTGAATTAGTTTACATTATAAATTATAAAACAGTTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTATTGTTACCCAAAACTACGTAATGAATATACACATTATAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACCAAACTCATTACTGTTTGTTTCTTC-ATATTC--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ATACTCAATGTTTGTTACAAAATG-ACAG-TAACGATGACAGCTCTCCCTCCACAA-TCA---AATGACAGTATTGATATTAGTTGTATCCACTTTGTTTTTTTTTTAA-ATGAAATTAATGATATATATTGTGTCCACTTAACTAATTTTGTATACAAATATTTCGAGTA-TGATAACAATGACAAAC-TGTCCTGAAT--------ATATTCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTTTA----ATCATG---ATTAATGT---AA--------ATATGATT---------------ACATCT---A-----AAG-TAACATCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTC--TCt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACATCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTCTC-------ATTCAGGCTTGGTATTATATTTATACCATCTCCGGATATGCTTCGGGGGTAATCTAATCAACCACATGTTATAAACGCGCCTTGT-----GATGA-GCT----GTGTCATCTTACGTGAAGAACGAA-ACCGCTTCCCCGTTTCTTGCGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTATTAAGGCTTGTGGCTGTTATGTATCTGTTATGTAAAATATTCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTGGTACATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTTTATCTGAATATAAATTACAAAATC-AAATGTATAattcaggcttggtattatatttataccatctccggatatgcttcgggggtaatctaatcaaccacatgttataaacgcgccttgtgatgagctgtgtcatcttacgtgaagaacgaaaccgcttccccgtttcttgcgtaacgttgatgttatcagactgtttgtcgtctgttaattattaaggcttgtggctgttatgtatctgttatgtaaaatattcttacattcaatttgtaacgttttggtacattttgtttataaaacatttcacaagaactttatctgaatataaattacaaaatcaaatgtata


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Reference ( family-4958 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGATNTNTTTGATCCTTTTA--ACTATTAGATAATGTATGTT--GATTGTTATGANACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTATTACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGACGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAANTAATGATATAAGTAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACATATTTCGAGTGTTGATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTANTCTATGCGGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATANTGTTATTTCTTATATCTCTCTCCTATTTG---------TCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTNTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGCTTCGGGC-TAATCNACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAGCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTGTATCTGAATATAAATAACAAAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCGCTCGATTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACNGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTGTGGGATTTTTTTTATCCTTTGC--ACTAGTAGATCATGTATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTATAACAAAATA-ACAG-TGACGATAATTGTTTTCACTTCACAA-ATA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTAATAATATTAAATTAATGATATAAGTAGTGCCCACTTAATTAATCTTTAACACACATATTTCGATTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTATAATTGTCCTGTATTCTATGTTGTATTACGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTCAATACGTCCACGCCTTTAA-----AAA-TAACACAACTCCTATATTGTTATTTCTTATATCTCTCCCCTCTTTGCTTTTTATCTCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTTTTTCATACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTATCCGAATATGCTTCGGAC-TAATCGACTCAATCACATGTAATAAACACTTCTTGTAAATAAATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGAAGGACGAATACCGCATCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATGACTAAGCCTTGTGGCTATCATATAGCTGTTATGTAAAATATACTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAAGATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATATAAATAACAGAATTAAAATCAATACTTTGTCGTCACTAGATTGATACCCATTTTGTATAAATTTTCATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGTTAATTTAACTTTTAAGCAGCATTATATAATTAACAGTATTGTTACCCAAAACTATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTATTCTATGTGGTATCATGATTATCCAGGTCACAATGCATGTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTAAGA-----AAA-CAACATAGCTCTTATAATGTTATTTTTT---------------TTG---------TCTCTC-----------TTT--T---------TCCTATTTCATACATAATCGGTATTATATTTATACCATCTCCGAATAGGCTTCGGGA-TAATCTATTCAACCACATATAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCACCTTATGTGAAGAACGAATACCGCTTCCCCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAACTTTATGGCTATTATATATCTGTTATGTAAAATGTGTTTACATTCAATTTGAAACGTTTTGATACATTTTGTTTATAGAACATTTC-AAAAGAACTGTTTCAAAATATAAATAACAAAATCAAAATGTATACTTTGTCACCGCTCGACTGATACCCATTTTGTATTAGTTTACATAATAAATTATGAAACAATTC-TTATAGTTATAAAACTAGTATGTTTTCGATAATTTAAATATTAAGCAGCATTATATAATAAACAGTACTGTTACCCAAAATTACGTTATGAATATACACATTATGAt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGGTGGGAT-TATTTGATCCTTTAA--ACTATTAGATAATGAATATT--GATTGTTATGAAACCAAACTTGATA----TTGTTTCTTC-GTACTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTT------------------TATTACATAATA-ACAG-TGACTATAATAGATCTCACTTTACAA-TTA---AATGACAGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATACTAAAATAATGATACAAGAAGTGTCCACGTAATTAATTTTCTATACACCTATTTCGAGTGTTAATAACAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTTACATGT-CTACTATAATTGTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taTATGGCTATATTGTATATGTTATGTAAAATATGCTTACATTTAATTTGTAACTTTTTTATACATTTTGTTTATATAACATTTC-ACAAGAATTATATCTGAATATAAATAACAAACTCAAAATTTATACTTTATCGCAGCTCGATTGATATCTATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGGTATATAATTAGTGTGTTTCTGATAATTTAAATATTAAACAACATTATATAATATACTTTATTGTTACCCAAAACTGTGTAATGAATAT--ACATTATAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATGT-CTACTATAATTGTCCTGTGTTCTATGCTGTATTATGAATTTCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCT---A-----TAA-T-ATACAACTCCTATAATATCATTTCCTATATCTCTC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCATACATGTTCGGTATTATTCTTGTACCATCTCCGGATActtcatacatgttcggtattattcttgtaccatctccggatac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            catgtctactataattgtcctgtgttctatgctgtattatgaatttcaacgtcacaatgcattttgtatgattaatgtaaatatgatcacatctataatatacaactcctataatatcatttcctatatctctccTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgatgatgtgtaattttttcTTTAGCACTATTACATAATGTATGTT--G-TTGTTATGATACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTT-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATTGTTA-----AA--------------ACAAAATC-ACTG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-T
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgatgatgtgtaattttttcTTACGGTGGGATTTGTTTGATTATTTTA--ACTATTTGATAATGAATGTT--GATTGTTATGAAACCAAACCTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----AAACACAAAGTTTAATACAAAATA-ACAG-TGACGATAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTACATTAATGATATAAGTAGTGTCCACTTAATTAATCTTTTATACACATATTTCGAGTATTGATAATAATG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGTAACATGT-CTACTACAACTGTCCTGTAGTCTATGCAGTATTATGAATATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGGTTAATGTAAATATGATCACATTTTAAA-----AAA-TAACACAACTCCTATGTTGTTATTTCTTATATCTCTCTCTTCTTTGCTTTATATATCTCTCCTCT----TTGTTT--TATATCTCTCTCCTATT---TACAGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATGTTTTGGGC-TAATCAACTCAACCACATGTAATAAACACTTCTTGT-----AATGA-ACTTT-TATTTCATCTAATGTGATGGACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTTACGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTTTCGTCTTTTAATTACTAATCCTTATGGCTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTAACGTTTTTATGCATTGTGTTT-------ATTTC-ACAAGAACTATATCTGAATAT-AATAACAGAATCAAAATCTATACTTTGTCGCCACTCGATTGATATCCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTCTTTATAGTTCT-AAATTGGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAACAGCATTATATAATAAACAGTATAGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACCCCAAACTATGTAATGAATATGCACATTATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCATGGTGGGATATTTTTGATCCTTT-A--ACTATTAGATAATGTATGTT--GACTGTTATGAAACCAAACTTAATACTGATTGTTTCTTC-ATATTT--TTA------TT-CAC-TAAGAATAGTTA-----ATACACAAAGTTTATTACAGAATA-ACAG-TGACGCTAATAGTTCTCACTTCACAA-TTA---AATGCCGGTAATGATGTTAGTTGTATCCACTTTG----CTTTATAATATTAAACTAATGATATAAGTAGTTTCCAATTAATTAATCTTTAATGCACATATTGCAAGTATTGATAATAACG-TAAACATGTCCTGATTCA------ATA-TCCGTGCAACATGT-CTA---TAATTGTCCTGTAGTATATGCGGTATTATGAAAATCAACGTCACAATGCATTTTGTATGATTAATGTAAATATGATCACATCTTAAA-----AAAATAACACAACTCCTATATTGTTATTTCTTATATC------------G---------T-TCTTCTCT----TTGCTT--TACATCTCTCTCCTCTTTCATACCGAATCGGTATTATATTTATACCGTCTCCGAATATTTTTCGGCC-AAATCGACTCAACCACATGTAATAAACACTTTTTGT-----AATGA-ACTTA-TATTTCATTTAATGTAAAGAACGAATACCGCTTCCTCGTTTCTGACGTTACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTACTAAGCCTTATGACTATCATATATCTGTTATGTAAAATATGCTTACATTCAGTTTGTTACGTTTTTATGCATTTTGTTTATAAAACATTTC-TCAAGAACTGTTTCTGAATATAAATAACAGAATTAAAAGCTATGCTTTGTCGCCACTCGATTGATAACCATTTTGTATTAGTTTACATTATAAATTATGAAACAATTTTTTATAGTTCTAAAACTAGTATGTTTTTGATAATTTAAATATTAAGCAGTATTATATAATAAACAGTATTGTTACCCAAAACAATGTAATGAATATACACATTATAt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---------TCACTCCTGTAGTATTATTTCTTATATATCTCTC-------ATTCAGGCTTGGTATTATATTTATACCATCTCCGGATATGCTTCGGGGGTAATCTAATCAACCACATGTTATAAACGCGCCTTGT-----GATGA-GCT----GTGTCATCTTACGTGAAGAACGAA-ACCGCTTCCCCGTTTCTTGCGTAACGTTGATGTTATCAGACTGTTTGTCGTCTGTTAATTATTAAGGCTTGTGGCTGTTATGTATCTGTTATGTAAAATATTCTTACATTCAATTTGTAACGTTTTGGTACATTTTGTTTATAAAACATTTC-ACAAGAACTTTATCTGAATATAAATTACAAAATC-AAATGTATAattcaggcttggtattatatttataccatctccggatatgcttcgggggtaatctaatcaaccacatgttataaacgcgccttgtgatgagctgtgtcatcttacgtgaagaacgaaaccgcttccccgtttcttgcgtaacgttgatgttatcagactgtttgtcgtctgttaattattaaggcttgtggctgttatgtatctgttatgtaaaatattcttacattcaatttgtaacgttttggtacattttgtttataaaacatttcacaagaactttatctgaatataaattacaaaatcaaatgtata
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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