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Reference ( gi|2 )            :   TCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTCACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAATTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTAT-ACAGGGGTCGTCTCAAAAGTAAA-TGGAAGGCAAC-------AT---TGTTATTTGTT-CCTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTT-TATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATCTGGTAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAG--ATATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTGTA-------TACTGTTTTGTACTCAACATTTAGAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTT-TTTAAAAGGCCATTTTTTATAA--CAAAATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATT---AA---ATCTGTATCATTTTAAAT-ATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-A--AGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATAT--CCAAATAATCCT--TGC--CTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTAT-TAATA-TACACACTGAACACTCACA------AGAACAATTA-GTA-TATTGA---TAT--CA--GTTTTAT---TTAGGCTTATTTTTTCATT-GTCTT-AAAAA-CATTT--TTTTTTTAAT-TTT-CA-------------TTA---ATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTT-----CACTGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---A-G---ATAT--TTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACT----GTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAAAA--ATTAAAATTAT-TTTT-----------TTAAGAGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTGAAACACT-------ACAATT----AT----ACATAAAACAATTC
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gi|23                         :        ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTCCTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAccaatcagatcg
gi|25                         :        ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTCCTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAta
gi|3                          :                                                                                                 -----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGTGG-----GGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAG-ATTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGACT-TAT-ATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAA-AGGGAGGCAAC------------CGGTCTCT-CT-CGTTCTTTATTTCTAT---------CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTA-TATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTTATTAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTT-TATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATCTTGTAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTAGAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATGTCTTTGGTTAAAata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atatctactatggatTCTTTATTTTCAA---AACT--ATCATATTGAAT-ATGCATGTATAATTGAGTTTTAATAATGACTTAATTACAGTCTTTATGTCTCTGATTTTA--AGATG---AACAAATTGGCCTTATTTATGAAACAATAATTTCAATAT--CAAAATGGTCCT--AGC--CTGT-CTTTTTTCTTTTCTTTATCAAA-------AATA-TAAAAAAT-CATACTCACA------AT-----TCATGTA-AATTGA---CATTATA--CTTTTAT---TTAGGCCTA-GTTTCCATC-ATATT-AAAAA-CAGTTGCTTTTTTTAAT-TTT-CA-------------CCG---ATGGGATTTATTTCATGTCAAACAAGgataattaacaaattggcctaatttatgaaacaataatttc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTAAT---AAGATATATATATCAGTTTTAAT-ATGCATGTTCAACTGAGTTTAAACAATGACTTAATTAAATTCTTTATGTC---------------TGATGAACAAATTGGCCTAATGTATTGAACAATACTTTCAATAT--CAAAATGGTCCTACCGC--CTGTG-ACTTTTCTTTTCTTTATTAAAAATATATAA-A-TACACA---AA----CGCA------AGAACAGTTG-GTA-CATTGA---CAT--TATTGTTTTAT---TTAGGCCTATTTTTTCATT-GTCTTGAAAAA-CA-TT--TGTTTTTAAT-TTCACA-------------T----------ATTTATTTCATGTCAAAGAAGCAGCCCGGTGCACAAATATTGCCGATATAACTTTTTTACTGTGCATGGA-ATTT-----TAGTGAGAGCTTGATTTTATTTTTAATTCA-T---ATAT--TTCAGCATCCCATGACAAAAAAATTAGATTTTATTAAAATTCACATTTTTAACCAGTATTGGGTTTCTGTTTGCCTCA--T---AGTAATGTA-TTCTCCAGAA-A--AA-CGCAATT----GCGGGGCGATGCGTTTTAT--AAAAGGAGG-G-ATAAAATG--ATTTAAATTAT-TGTT-----------TAAAGAGTTTCACAATCA--A--TATAATTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAGGC-----AATTG
gi|6                          :                                                                                                                  agtcaggacacatacagtcattttagtacgcagtcctgcttactttatgacagcataatcacggtgaaaatagtccgctttcagcatcccaagctacgataaatcgattttagtctccattttttttttttttggtggggtgggggtaaaatgcaggggaaaattgaaattgtcgtgtcaataccacggtttcatattcatattgtttatagaaacgctagaatactttaaacatatagtatagttcctttgtttattcaaaatatcgatttgaacctgcgcaaatgtcactatttgtgcttaactgtttcttttttcgtgaaaattagtcattttcgattcacatttacgctattatacgaaaatgtttttgtttttttttatacatttgctataaaataaaaacttttaataagcctgccacattcaaacaatcatttgtaacgacgaaaaacatacaaaatattagatttttttaacgccacttgctcgatttttgcgatggtgaaagtgataattcacgccaattgattttattatgggggccgtctcaaaagtaaaatggaggcaacccgtgttatctctgttgtttgtttccttctttctttttatctatcaaccagaggcacttgattgtaggagattttattaaataaattgcatacgtctttcaaatattttgtattatatgaatttatgatcatagcttttgcaactaccataaagctataatcacgtgtttggtaggtcagatttgtttatgatattaaacaggaaacgataaaataactcaaactgtttacagttatgtcctcaccacttataaattataaaaatcaatatttgttaataaaaaatcatttataaagcaaaatttctctctttattttttgataaaaaaatctgtaataaagcatcaaattgactggtgtatgatgttgacattgactcagtaagtgcaattaacattgaattgtcactaagATTCTTTATGTCTTTGGTTA-A--AGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCttttattttactgagaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatctactatggattcacccagaggcactttattgtacgagtttttataaaataaattacatccattttcaaatattttatttttataggttttcatgacaataggttcatttatcttgtagactatagctgcaactagtataaagatatatagagcctaataatgtgtttgataggtcaggtttgtttatgaaacaattaatagtataatcaaaactgtatagggtctactgttttgaactcactatttagaattaagaaaaaaaaaTCTTTATGTCTTTGGTTA-A--AGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATAT--CCAAATGGTCCC--TGC--CTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTAT-AAATG-TACACACTGAACACCCACA------AGAACAATTA-GTA-TATTGA---TAT--CATTGTTTTAT---TTAGGCTTATTTTGTCATT-GTCTT-AAAAT-CATTT--AACTTTTAAAATTT-CA-------------CCA---ATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCT-----TACTGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---A-G---ATAT--TTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACT----GTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAAAA--A--AAA---------------------TTAAGAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTTT-ACAAGACGGTGGAATAATAGGACTAA---ATAAAACAATAATGTCAATATTGCC--ATTGTCCCCGTGA--GTGTGTAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttaatTTC-A--AGACAATGAAAAAATAGGCCTAA---ATAAAACAATAATGTCAATGTA-CCAACT-GTTCT--TGCGTTTGTGTATTTATATATT-TTTAATAAA-GAA---AA-----------GAAAAGTCACAGGCGGTAGGACCATTT-TGA-TATTGAAAGTAT--T---GTTCAATACATTAGGCCAATTTGTTCATCAGACAT-AAAGA--ATTT--atattatttcagattttcacccaacctactcgttaccggtatgatttattctgtgaacaagccgcccaatgcaccggtataacgaccgctgttcctgcgcatggctgcttttaagcgcgagagtggttttctttccaaataatatacttcagtatcataaaataattacatgtttttaaaattcacaatttaagcgagttgtctactggcctctttgtaccgtattcccccaaataaacgc
gi|10                         :                                                                  agtcaggacacatacagtcattttagtacgcagtcctgcttactttatgacagcataatcacggtgaaaatagtccgctttcagcatcccaagctacgataaatcgattttagtctccattttttttttttttggtggggtgggggtaaaatgcaggggaaaattgaaattgtcgtgtcaataccacggtttcatattcatattgtttatagaaacgctagaatactttaaacatatagtatagttcctttgtttattcaaaatatcgatttgaacctgcgcaaatgtcactatttgtgcttaactgtttcttttttcgtgaaaattagtcattttcgattcacatttacgctattatacgaaaatgtttttgtttttttttatacatttgctataaaataaaaacttttaataagcctgccacattcaaacaatcatttgtaacgacgaaaaacatacaaaatattagatttttttaacgccacttgctcgatttttgcgatggtgaaagtgataattcacgccaattgattttattatgggggccgtctcaaaagtaaaatggaggcaacccgtgttatctctgttgtttgtttccttctttctttttatctatcaaccagaggcacttgattgtaggagattttattaaataaattgcatacgtctttcaaatattttgtattatatgaatttatgatcatagcttttgcaactaccataaagctataatcacgtgtttggtaggtcagatttgtttatgatattaaacaggaaacgataaaataactcaaactgtttacagttatgtcctcaccacttataaattataaaaatcaatatttgttaataaaaaatcatttataaagcaaaatttctctctttattttttgataaaaaaatctgtaataaagcatcaaattgactggtgtatgatgttgacattgactcagtaagtgcaattaacattgaattgtcactaagtgtaataagatatatatatcagttttaatatgcatgttcaactgagtttaaacaatgacttaattTTT-A--AGACGATGAAAAAATAGGCCTAA---ATAAAACAATAATGTCAATATA-CCAAaaacatttgtttttaatttcacatatttatttcatgtcaaagaagcagcccggtgcacaaatattgccgatataacttttttactgtgcatggaattttagtgagagcttgattttatttttaattcatatatttcagcatcccatgacaaaaaaattagattttattaaaattcacatttttaaccagtattgggtttctgtttgcctcatagtaatgtattctccagaaaaacgcaattgcggggcgatgcgttttataaaaggagggataaaatgatttaaattattgtttaaagagtttcacaatcaatataattgtgtttgttaattgtttcacaggcaattgttttattttactgagaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agaacaaT-TAATAATAAA-ACTACACACTCACG------GGGACAAT-G-GCAATATTGA---CAT--TATTGTTTTAT---TTAGTCCTATTATTCCACC-GTCTT-GTAAA-CATAT--TATTTCAGAT-TTT-CACCCAACCTACTCGTTACCGGTATGATTTATTCTGTG---AACAAGCCGCCCAATGCACCGGTATAAC-GAC----CGCTGTTCCTGCGCATGGCTGCTTTTAAGCGC-GAGAG--TGGTTTTCTTTCCAA---ATA---ATATACTTCAGTAT--CAT---AAAATAATTACATGTTTTTAAAATTCACAATTTAAGCGAG--TTG----TCTACTGGCCTCT--T---TGTACCGTATTCCCCCAAAT-A--AA-CGC-aaacatttttttttaattttcacagttaggatttatttcatgtcaaagaagcagtccggtgcacaaatattgccgatatgacttttttcttgtggatggaattttagtgagagcttgattttatttctaaatcatatatttcagcatcccacgacaaaataattagattttattaaaattcacacttttaaccagtattgggcttctgctggcttttttag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AGAACAATTG-GTA-TATTGA---CAT--TATTGTTTTAT---TTAGGCCTATTTTTTCATC-GTCTT-AAAAAACATTT--TTTTTT-AAT-TTT-CA-------------CAG---TTAGGATTTATTTCATGTCAAAGAAGCAGTCCGGTGCACAAATATTGCCGATATGACTTTTTTCTTGTGGATGGA-ATTT-----TAGTGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---A-TCATATAT--TTCAGCATCCCACGACAAAATAATTAGATTTTATTAAAATTCACACTTTTAACCAGTATTGGGCTTCTGCTGGCTTTT--T---
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTATTCCAGTGCACGGA-ACTT-----TACTGAGAGCTTGATT--ATTT---------------AT--TTTAGCATCCAATGACAAAATAATTACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAATATCGGGTTTCTACTGGCTTGTAGTATAAATATTGTA-TACTCCAG------AA-GGC-AC------TGTGGC---CCGTTAAGTTCAAAAGGAGG-G-ACAGAAAA--AATA--------TTTT-----------TGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGAGAATT-GTTTCACAAGC-----AATTGTAACACTAATTGTAACACTTAAAAATGTAAACATAAAACAATTCtag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T--T---AATATCGTA-TACTCCAAAA-ATAAA-GGC-ACT----GTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAAAA---------TTAT-TTCT-----------TGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctACTGTA-TTCCCCTGAATA--AATGG---------GT-TGAT---CCATT---TTTAAAAGG-GG-GCGT---------------TTAT-TTGTGGGAGTGGAGGTTAATAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAAC-----AAAT-ACACATT-------ACA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--ATTTATATTCTATTTT-----------GGAAGAGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACActggtaacacttcaaaaagattgttgttttttttaactaaaatttgtagggacctttatacagggagatacagtagtt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tactgttttcccctgaataaatgccctcT-----------TGAAGAGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATAAAA-ACT-------ACAATT----Actaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaT-----------TGAAGAGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG-CACATT-------ACAAAT----Aggtttcatttactgataacactccaa
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaaaaaaacacAGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATTaacaaata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT--AGACATT-------ACAATT----acatttattttttt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): TATGTATGTATAACGGTATTACAAACATAAGTTTATT






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agtcaggacacatacagtcattttagtacgcagtcctgcttactttatgacagcataatcacggtgaaaatagtccgctttcagcatcccaagctacgataaatcgattttagtctccattttttttttttttggtggggtgggggtaaaatgcaggggaaaattgaaattgtcgtgtcaataccacggtttcatattcatattgtttatagaaacgctagaatactttaaacatatagtatagttcctttgtttattcaaaatatcgatttgaacctgcgcaaatgtcactatttgtgcttaactgtttcttttttcgtgaaaattagtcattttcgattcacatttacgctattatacgaaaatgtttttgtttttttttatacatttgctataaaataaaaacttttaataagcctgccacattcaaacaatcatttgtaacgacgaaaaacatacaaaatattagatttttttaacgccacttgctcgatttttgcgatggtgaaagtgataattcacgccaattgattttattatgggggccgtctcaaaagtaaaatggaggcaacccgtgttatctctgttgtttgtttccttctttctttttatctatcaaccagaggcacttgattgtaggagattttattaaataaattgcatacgtctttcaaatattttgtattatatgaatttatgatcatagcttttgcaactaccataaagctataatcacgtgtttggtaggtcagatttgtttatgatattaaacaggaaacgataaaataactcaaactgtttacagttatgtcctcaccacttataaattataaaaatcaatatttgttaataaaaaatcatttataaagcaaaatttctctctttattttttgataaaaaaatctgtaataaagcatcaaattgactggtgtatgatgttgacattgactcagtaagtgcaattaacattgaattgtcactaagAGAACAATT--GGTA-TATTGACATTATTGTTTTATTTAGGCCTATTTTTTCATCGTCTTAAAAAACATTT--T-TTTTTAAT-TTTCACA----------------GTTAGGATTTATTTCATGTCAAAGAAGCAGTCCGGTGCACAAATATTGCCGATATGACTTTTTTCTTGTGGATGGA-ATTTT---AG-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAAATCATA---TATTTCAGCATCCCACGACAAAATAATTAGATTTTATTAAAATTCACACTTTTAACCAGTATTGGGCTTCTGCTGGCTTTT--T---ttttattttactgagaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTATTCCCCTGAATA--AATGG-----GT-TGAT---CCATT---TTTAAAAGG-GG-GCGT----------------TT-AT-TTGTGGGAGTGGAGGTTAATAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAAC-----AAAT---ACAC--ATT---ACAtag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actCGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTActggtaacacttcaaaaagattgttgttttttttaactaaaatttgtagggacctttatacagggagatacagtagtt
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-----TGAAG------AGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG---CAC--ATT---ACAAAT----AGGTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--T---AATATCGTATACTCCAAAA-ATAAA-GGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCT-----TGAAG------AGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AA--TTT-ATATT-CTATTTT-----GGAAG------AGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATT-----TTAAC------AGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattT-----TGAAG------AGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATA--AAA---ACT---ACAATT----AGGT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAAT-----AAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACGCA-GATCGATTCTAT-ACAGGGGTCGTCTCAAAAGTAAA-TGGAAGGCAACAT-TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTT-TATAGGTTTTCATGACAATAGC-----TTCATTTATCTGGT--AGACT--ATAGTTGCAACTAGCATAAAGAT--ATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATGA-----AACA---ATTAATAGATTAATTAAAACTGTATA-------CTGTTTTGTACTCAACATTTAGAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT-TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAAT-ATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-AAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTTAAT-TTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGA---TATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTT-----TTAAG------AGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTG--AAAC--ACT---ACAATT----AT----ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT----AGAC--ATT---ACAATT----TTG-AAATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT-----AC--ATT---ggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAC------AGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATG----TTATTCATA-GAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGAC-TTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA------------CCGGTCTCT--CTCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTA-TATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTT-ATTTA--T--T--AGACTTAA--GTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTTTATGTCTTTGGTTA-AAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGA---TATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT---------------AAG------AGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTT-TATAGGTTTTCATGACAATAGG-----TTCATTTATCT--TGTAGACT--ATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTAGAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATGTCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTT---ATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtcaggacacatacagtcattttagtacgcagtcctgcttactttatgacagcataatcacggtgaaaatagtccgctttcagcatcccaagctacgataaatcgattttagtctccattttttttttttttggtggggtgggggtaaaatgcaggggaaaattgaaattgtcgtgtcaataccacggtttcatattcatattgtttatagaaacgctagaatactttaaacatatagtatagttcctttgtttattcaaaatatcgatttgaacctgcgcaaatgtcactatttgtgcttaactgtttcttttttcgtgaaaattagtcattttcgattcacatttacgctattatacgaaaatgtttttgtttttttttatacatttgctataaaataaaaacttttaataagcctgccacattcaaacaatcatttgtaacgacgaaaaacatacaaaatattagatttttttaacgccacttgctcgatttttgcgatggtgaaagtgataattcacgccaattgattttattatgggggccgtctcaaaagtaaaatggaggcaacccgtgttatctctgttgtttgtttccttctttctttttatctatcaaccagaggcacttgattgtaggagattttattaaataaattgcatacgtctttcaaatattttgtattatatgaatttatgatcatagcttttgcaactaccataaagctataatcacgtgtttggtaggtcagatttgtttatgatattaaacaggaaacgataaaataactcaaactgtttacagttatgtcctcaccacttataaattataaaaatcaatatttgttaataaaaaatcatttataaagcaaaatttctctctttattttttgataaaaaaatctgtaataaagcatcaaattgactggtgtatgatgttgacattgactcagtaagtgcaattaacattgaattgtcactaagAGAACAATT--GGTA-TATTGACATTATTGTTTTATTTAGGCCTATTTTTTCATCGTCTTAAAAAACATTT--T-TTTTTAAT-TTTCACA----------------GTTAGGATTTATTTCATGTCAAAGAAGCAGTCCGGTGCACAAATATTGCCGATATGACTTTTTTCTTGTGGATGGA-ATTTT---AG-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAAATCATA---TATTTCAGCATCCCACGACAAAATAATTAGATTTTATTAAAATTCACACTTTTAACCAGTATTGGGCTTCTGCTGGCTTTT--T---ttttattttactgagaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTATTCCCCTGAATA--AATGG-----GT-TGAT---CCATT---TTTAAAAGG-GG-GCGT----------------TT-AT-TTGTGGGAGTGGAGGTTAATAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAAC-----AAAT---ACAC--ATT---ACAtag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actCGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTActggtaacacttcaaaaagattgttgttttttttaactaaaatttgtagggacctttatacagggagatacagtagtt
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-----TGAAG------AGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG---CAC--ATT---ACAAAT----AGGTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--T---AATATCGTATACTCCAAAA-ATAAA-GGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCT-----TGAAG------AGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AA--TTT-ATATT-CTATTTT-----GGAAG------AGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATT-----TTAAC------AGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattT-----TGAAG------AGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATA--AAA---ACT---ACAATT----AGGT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTA-TACAGGGGTCGTCTCAAAAGT-AAATGGAAGGCAACAT--TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATC--TGGTAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAGA--TATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTG--TA-----TACTGTTTTGTACTCAACATTTAGAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT--TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAATATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-AAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTTAAT-TTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGA---TATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTT-----TTAAG------AGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTG--AAAC--ACT---ACAATT----AT----ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT----AGAC--ATT---ACAATT----TTG-AAATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ------AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT-----AC--ATT---ggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAC------AGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGA-CTTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA-------------CCGGTCTCT-C-TCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTATATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTTAT--TAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTTTATGTCTTTGGTTA-AAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGA---TATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AA-GGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT---------------AAG------AGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATC--TTGTAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTAGAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATG-TCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAA---TTTATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTAtag
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGAAGAGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG---CAC--ATT---ACAAAT----AGGTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--T---AATATCGTATACTCCAAAA-ATAAAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AA--TTT-ATATT-CTATTTTGGAAGAGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATTTTAACAGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattTTGAAGAGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATA--AAA---ACT---ACAATT----AGGT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTA-TACAGGGGTCGTCTCAAAAGT-AAATGGAAGGCAACAT--TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATCTGG-TAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAGA--TATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTG--TA-----TACTGTTTTGTACTCAACATTTA-GAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT--TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAATATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-AAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTTAAT-TTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGA---TATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTTTTAAGAGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTG--AAAC--ACT---ACAATT----AT----ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT----AGAC--ATT---ACAATT----TTG-AAATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT-----AC--ATT---ggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGA-CTTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA-------------CCGGTCTCT-C-TCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTATATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTT-ATTAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTTTATGTCTTTGGTTA-AAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGA---TATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTATACTCCAGAA-A--AAGGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT----------AAGAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
gi|5                          :                         TCAGGACCTACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTCACTTTA-CGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCACTTTCAGCATCCCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTG-----------------GGGGTAAACT-GCGGGGGGAAATTGAAATTGTGGCCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGTTTCAGAAACATTTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAAAGTAGTATACTTGCTTTGTTTGGTCCAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGTCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACATTTAGGCTATTATACGAATGTG----TGT----GTG-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCT--------GTCTGCCACATTTAAACTATTATTAATAACGACGAAAAACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATCTTG-TAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTA-GAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATG-TCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAA---TTTATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTAtag
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGAAGAGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG---CAC--ATT---ACAAAT----AGGTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--T---AATATCGTA-TACTCCAAAAATAAAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AA--TTT-ATATT-CTATTTTGGAAGAGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATTTTAACAGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattTTGAAGAGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATA--AAA---ACT---ACAATT----AGGT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTA-TACAGGGGTCGTCTCAAAAGT-AAATGGAAGGCAACAT--TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATCTGG-TAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAGA--TATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTG--TA-----TACTGTTTTGTACTCAACATTTA-GAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT--TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAATATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-AAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTTAAT-TTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGA---TATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTTTTAAGAGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTG--AAAC--ACT---ACAATT----AT----ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT----AGAC--ATT---ACAATT----TTG-AAATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT-----AC--ATT---ggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGA-CTTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA-------------CCGGTCTCT-C-TCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTATATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTT-ATTAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTTTATGTCTTTGGTTA-AAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGA---TATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT----------AAGAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
gi|5                          :                         TCAGGACCTACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTCACTTTA-CGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCACTTTCAGCATCCCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTG-----------------GGGGTAAACT-GCGGGGGGAAATTGAAATTGTGGCCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGTTTCAGAAACATTTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAAAGTAGTATACTTGCTTTGTTTGGTCCAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGTCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACATTTAGGCTATTATACGAATGTG----TGT----GTG-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCT--------GTCTGCCACATTTAAACTATTATTAATAACGACGAAAAACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATCTTG-TAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTA-GAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATG-TCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAA---TTTATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTAtag
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGAAGAGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG---CAC--ATT---ACAAAT----AGGTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--T---AATATCGTA-TACTCCAAAAATAAAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AA--TTT-ATATT-CTATTTTGGAAGAGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATTTTAACAGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattTTGAAGAGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATA--AAA---ACT---ACAATT----AGGT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTA-TACAGGGGTCGTCTCAAAAGT-AAATGGAAGGCAACAT--TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATCTGG-TAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAGA--TATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTG--TA-----TACTGTTTTGTACTCAACATTTA-GAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT--TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAATATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGGTTT-AAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTTAAT-TTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGA---TATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTTTTAAGAGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTG--AAAC--ACT---ACAATT----AT----ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT----AGAC--ATT---ACAATT----TTG-AAATA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT-----AC--ATT---ggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGA-CTTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA-------------CCGGTCTCT-C-TCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTATATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTT-ATTAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTTTATGTCTTTGGTTA-AAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGA---TATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT----------AAGAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
gi|5                          :                         TCAGGACCTACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTCACTTTA-CGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCACTTTCAGCATCCCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTG-----------------GGGGTAAACT-GCGGGGGGAAATTGAAATTGTGGCCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGTTTCAGAAACATTTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAAAGTAGTATACTTGCTTTGTTTGGTCCAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGTCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACATTTAGGCTATTATACGAATGTG----TGT----GTG-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCT--------GTCTGCCACATTTAAACTATTATTAATAACGACGAAAAACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATCTTG-TAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTA-GAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATG-TCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAA---TTTATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatctactatggatTTAATAATAAA-ACTACACACTCACGGGGACAAT---GGCAATATTGACATTATTGTTTTATTTAGTCCTATTATTCCACCGTCTT-GTAAACATAT--TATTTCAGAT-TTTCACCCAACCTACTCGTTACCGGTATGATTTATTCTGTG---AACAAGCCGCCCAATGCACCGGTAT-AACGAC----CGCTGTTCCTGCGCATGGCTGCTTTTAAGCGCGAGAG--TGGTTTTCTTTCCAA---ATAATATACTTCAGTATC-----ATAAAATAATTACATGTTTTTAAAATTCACAATTTAAGCGAG--TTG----TCTACTGGCCTCT--T---TGTACCGTATTCCCCCAAATA--AACGC-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATATTGAATATGCATGTATAATTGAGTTTTAATAATGACTTAATTACAGTCTTTATGTCTCTGATTTTAAGATG---AACAAATTGGCCTTATTTATGAAACAATAATTTCAATATCAAAATGGTCCT--AGCCTGT-CTTTTTTCTTTTCTTTATCAAA------AATA-TAAAAAAT-CATACTC------ACAATTCATGTA-AATTGACATTATACTTTTATTTAGGCCTA-GTTTCCATCATATT-AAAAACAGTTGCTTTTTTTAAT-TTTCACC----------------GATGGGATTTATTTCATGTCAAACAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctttattttcaaaacTTTATTCCAGTGCACGGA-ACTTT---AC-TGAGAGCTTGATT--ATTT--------------ATTTTAGCATCCAATGACAAAATAATTACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAATATCGGGTTTCTACTGGCTTGTAGTATAAATATTGTA-TACTCCAG-----AAGGC-AC--TGTGGC---CCGTTAAGTTCAAAAGGAGG-G-ACAGAA-AA--AAT-A--------TTTTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGAGAATT-GTTTCACAAGC-----AATTGTAACACTAATTGTAACACTTAAAAATGTAAACATAAAACAATTC


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): ACAATATTCCTCTGAATAAATTCCCCCGGGCGATGCATTTTTTTACAAACGGTAGGGGGTGGGGAATTCGTTGAAGTGTTACAATCAATATAG
Unaligned ( gi|28 ): TATGTATGTATAACGGTATTACAAACATAAGTTTATT






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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAATACCACTATTTGTGCTTAACTGTTTCTTCTTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACGTTTACGCTATTATACGAATGTG--TTTTTCTTCTTC-TTTTTTTTTCATATATGTGCTATATAATATCAGAGCTTTTAGTAAGCCTGCCACATTTAAACTATTAtag
gi|13                         :                         TCAGGACCCACATGGTCATTTCAGTACGCAATCCTGCTC-CTTTAACGACAGCATAGCAACAGTGAAAGTAGTCCGCTTTCAGTATCCCAAGCTA-----------CGATAAATCTAAATTGGTCGCCA---TTT-----------------GGGGTAGG-G-GTGGGGGata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGAAGAGTTTTACTAACA--A--T---ATTGTGTTCGATAATT-GTTTCCCAAGC-----ATCTG-CACATT-------ACAAATAG----GTtgataaaatgcagggaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T--T---AATATCGTA-TACTCCAAAAATAAAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-GGATAAAA-AA---------TT-AT-TTCTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----tttttttttactgataacactttatttttttctattattcaaaccaaaattggtgtgtgtggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AA--TTT-ATATT-CTATTTTGGAAGAGTTTTACAACCA-----T---ATTGTATTTGATTATT-GTTTCACA
gi|17                         : tactgttttcccctgaataaatgccctcGACCCACATGGTCATTTTAGTACGCAGTCATGCTC-ACTTAACGACAGCATAGTAACGGTGAAAATAGTTCGCTTTCAGCATCCCGAGCTA-----------ctaaaagaggctttttttactgataatacttaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCAATAGG-GGTG-AAGGGG-AATTATT-AAATTTAT-TATTTTAACAGATTTACAAACA--A--T---ATTccaatcagatcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctgtattgttccaaataaacaccccaggggtgatgcattTTGAAGAGTTTTACAAACA--C--T---GTTGTGTTTGTTAATT-GTTTCACAAGC-----AAATAAAA-ACT-------ACAATTAG----GT
gi|2                          :                     aaaaTCAGGACCCACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTC-ACTTAACGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCAGTTTCAGCATCGCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTT-----------------GGGGTAAA-TTACGGGGGGAAATTGAAATTGTGGTCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGATTCGGAAAAATGTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAATGTAGAATACTTGCTTTGTTTGGTCAAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGCCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACGTTTAGGTTATTATACGAATGTG--TTTTT----TTC-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCTTTAAGTATGTCTGCCACATTTAAACTATTATTTATAAATACGAAAAACATGCACAATACTAG-TTTTTTTAACACCACTTGCTCGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGGCGAGTTCACG-CAGATCGATTCTA-TACAGGGGTCGTCTCAAAAGT-AAATGGAAGGCAACAT--TGTTATTT--GTTC----CTTCCTT-TTTCTGTCAACCAAAGCTATCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACGTCCGT-TTTCAAATATTTCAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGCTTCATTTATCTGG-TAGACTATAGTTGCAACTAGCATAAAGA--TATAGAGTCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGATTAATTAAAACTG--TA-----TACTGTTTTGTACTCAACATTTA-GAATTTTAAAAAAAAATTAATAGTATTT-TTATATTTTTT--TTAAA----------AGGCC------ATTTTTTATAA--CAA-AATCTCTTTCTAACTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAAATCTGTATTAA-----ATCTGTATCATTTTAAATATGTATGTACAACTGAGTTTTAACAGTAACTTAATTACACTCTTTATGTCTTTGG-TTTAAGATGATGAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACGATAATTTCAATATCCAAATAATCCT--TGCCTGTGCATTTTTCTTTTCTTTATTAAATGTATTAATA-TACACACTGAACACTCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCA--GTTTTATTTAGGCTTATTTTTTCATTGTCTT-AAAAACATTT--TTTTTTT-AATTTTCATT----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATTAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTGCATGAA-ACTTC---AC-TGAGAGCTTGATTTTATTTCTAA---AGATATTTTAGCATTCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCCTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---CCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--ATTAAAATT-AT-TTTTTTAAGAGATTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTCACAAGC-----AATTGAAACACT-------ACAATTA------T--ACATAAAACAATTCttcatttactgataacactccaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTAAACAAGCAAAATAAT--AGACATT-------ACAATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGTTTTACAAACACTAGTT---ATTGTGTTTGATAATTTGTTTCACAAGC-----AATT---ACATT-------ttgaaataggtttcttttttctttttaaaagaatt
gi|23                         :                              ATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTGAAtattttttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAGTTTTACAAACA--A--T---ACTGTGTTTGATAATT-GTTTGACAAta
gi|25                         :                  aaaaaaaaacacATCCATATGGTCATTTTAGTATGGAGACCTGCTC-CTTTAACAATTGCATGGCAACGTTAAAaacaaata
gi|26                         :                         TCAGGATCCACACGATTGTTCTAGTCCGCTACCCTGCTC-TTTTAAGGGCTTCCTAGCA
gi|27                         :                       agTCAGTACCCATACGGTCATTTAAGTCTGAAACCATGGTC-CTTTAATGA
gi|3                          :                                                                                                                     cag-----------T--T---------TTGGTCGCCATTT---------------------GGGT------GGGGGGGGGGATTGAAATTGTGGTGTCAATACCAATGTTTCAGCTTGCCGTTCGATTCGGAAATATTCATGTTATTCATAGAAATGCTAGAATACT--AAAAATGTAGTATAATTCCTTTGTTTATTCAAAATATCAATTTGAACCCGCGCAAATGCCACTATTTGTGCTCAACTGTTTCTTCCTTCGTGAAAATCGGTCATTTTCGATTCACATTTACGCTTTTATATGAATGTGGTTTTTT----TTCATTTTTTT---ATATATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCCTTTAGTTAGCCTGCAACATTCAAACTATCATTTGTAGCGACGAAAAACATACAAAATATTAGA-TTTTTTAACGCCACCTGCTAGATTTTTGCGGTGGTGAAAGTGAC-AATTCACGCCCTATTGA-CTTA-TATGGGGGCCGTCTCAAAAGTAAAA-GGGAGGCAA-------------CCGGTCTCT-C-TCGTTCTTTATTTCTAT-----CTATCAACCAGAAGCACTTGATTGTAGGAGTTTTTATTAGATAAATTGCACCCGTCTTTCAAATGTTTTGTATTATATGAATTT--ATGATCGTAGCTAGATTTATTT-ATTAGACTTAAGTTGCAACTACCATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTTTATGTCTTTGG-TTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAATTTATGAAACAATAATTTCAATATCCAAATGGTCCC--TGCCTGTGCATTTTTCTTTCCTTTATTAAATGTATAAATG-TACACACTGAACACCCACAAGAACAATT--AGTA-TATTGATATCATTGTTTTATTTAGGCTTATTTTGTCATTGTCTT-AAAATCATTT--AACTTTTAAAATTTCACC----------------AATAGGATTTATTTCGTG---AACAAGCAGCCCAATGCATCAGTATTACTGATATAACTTTTTTCCTGTACATGAA-ACCTT---AC-TGAGAGCTTGATTGTATTTCTAA---AGATATTTTACCATCCCATGACAAAATAATAACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAGTATTGGGTTTCTACTGGCTTCT--T---AGTATTGTA-TACTCCAGAAA--AAGGC-ACTGTGTGGC---TCATTGAATTCAAAAGG-GG-G-ATAAAA-AA--A---AAATT----------AAGAGTTTTACAAACA--A--T---ATTGTGTTTGATAATT-GTTTC
gi|5                          :                         TCAGGACCTACACGGTCATTTTAGTACGCAACCCTGCTCACTTTA-CGACAGCGTAGCAACGGTGAAAATAGTCCACTTTCAGCATCCCAAGCTA-----------T--T---------TTGGTCGCCATTTTTG-----------------GGGGTAAACT-GCGGGGGGAAATTGAAATTGTGGCCTCAATACCACGATTTCAGCTTGATGTTCGTTTCAGAAACATTTATAATAATAAAAGAAATGCTGGAATACTTTAAAAAAGTAGTATACTTGCTTTGTTTGGTCCAAATATCGATTTTAACCCGCACAAAGGCCACTTTTTATGCTCCACTGTTTCGTCGTTCTTGAAAATCGCTCATTTTCGATTCACATTTAGGCTATTATACGAATGTG----TGT----GTG-TTTTTTT---ATACATGTGCTATA-AA-ATCAGAGCT--------GTCTGCCACATTTAAACTATTATTAATAACGACGAAAAACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACCCAGAGGCACTTTATTGTACGAGTTTTTATAAAATAAATTACATCCAT-TTTCAAATATTTTAT-TTTTATAGGTTTTCATGACAATAGGTTCATTTATCTTG-TAGACTATAGCTGCAACTAGTATAAAGATATATAGAGCCTAATAATGTGTTTGATAGGTCAGGTTTGTTTATG-----AAAC---AATTAATAGTATAATCAAAACTGTATAGGGTCTACTGTTTTGAACTCACTATTTA-GAA--TTAAGAAAAAAAAAAT----TCT-TTATG-TCTTTGGTTAAAGATAATTAACAAATTGGCCTAA---TTTATGAAACAATAATTTCtttcaaaaacaaattgaaatactttagc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatctactatggatTTAATAATAAA-ACTACACACTCACGGGGACAAT---GGCAATATTGACATTATTGTTTTATTTAGTCCTATTATTCCACCGTCTT-GTAAACATAT--TATTTCA-GATTTTCACCCAACCTACTCGTTACCGGTATGATTTATTCTGTG---AACAAGCCGCCCAATGCACCGGTA-TAACGAC----CGCTGTTCCTGCGCATGGCTGCTTTTAAGCGCGAGAG--TGGTTTTCTTTCCAAATAATATACTTCAGTATC-----ATAAAATAATTACATGTTTTTAAAATTCACAATTTAAGCGAG--TTG----TCTACTGGCCTCT--T---TGTACCGTATTCCCCCAAATA--AACGC-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATATTGAATATGCATGTATAATTGAGTTTTAATAATGACTTAATTACAGTCTTTATGTCTCTGATTTTAA---GATGAACAAATTGGCCTTATTTATGAAACAATAATTTCAATATCAAAATGGTCCT--AGCCTGT-CTTTTTTCTTTTCTTTATCAAA------AATA-TAAAAAAT-CATACTC------ACAATTCATGTA-AATTGACATTATACTTTTATTTAGGCCTA-GTTTCCATCATATT-AAAAACAGTTGCTTTTTTT-AATTTTCACC----------------GATGGGATTTATTTCATGTCAAACAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctttattttcaaaacTTTATTCCAGTGCACGGA-ACTTT---AC-TGAGAGCTTGATT--ATTT-----------ATTTTAGCATCCAATGACAAAATAATTACATTTTATTAAAATTCACAATTTTAACCAATATCGGGTTTCTACTGGCTTGTAGTATAAATATTGTA-TACTCCAG-----AAGGC-AC--TGTGGC---CCGTTAAGTTCAAAAGGAGG-G-ACAGAA-AA--AAT-A--------TTTTTGAAGAGTTTTACAAACG--A--T---ATTGTGTTTGAGAATT-GTTTCACAAGC-----AATTGTAACACTAATTGTAACACTTAAAAATGTAAACATAAAACAATTC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ACTGTATTCCCCTGAATAAATGGGTTGATCCATTTTTAAAAGGGGGCGTTTATTTGTGGGAGTGGAGGTTAATAGTTTTACAAACAATATTGTGTTTGATAATTGTTTCACAAACAAATACACATTACACTGGTAACACTTCAAAAAGATTGTTGTTTTTTTTAACTAAAATTTGTAGGGACCTTTATACAGGGAGATACAGTAGTT
Unaligned ( gi|21 ): ACAATATTCCTCTGAATAAATTCCCCCGGGCGATGCATTTTTTTACAAACGGTAGGGGGTGGGGAATTCGTTGAAGTGTTACAATCAATATAG
Unaligned ( gi|28 ): TATGTATGTATAACGGTATTACAAACATAAGTTTATT