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Reference ( gi|14 )           :           AACAAGCAAATTCTGTGAATATATGTCCCTTGCTTTTT--TC---AAAAA-ATTTGATTCAGTCAT
gi|15                         :           AACAAGCAAATTCTGTGAATTTATGTCTCCTGCTTTTT--TC---AAAAA-ATT
gi|8                          :           AACGAGCAAATTCAGTGAATTTATATCCCACGCTGTTT--TC---AAAAG-ATTTAATTCAGTCATgttaagttagg
gi|4                          :         atAACAAGCAAATTCTGGGAATTTATATCCCCTGCTTTTT--TC-----AAG-ACTTGATTCATTCATtctta
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gi|2                          :           AACAAGCAAATTCAGTGAATGTGTGTCCCCCGCTTTTTTATT---AAAAT-ATTAAATTCGGGCAT
gi|11                         :           AATAAGCAAATTCAGGGAATTTATGTCGCCTGTTTTTT--TTTAAAAAAG-ATCTGATTCAGGCAtcctaagtcagtgcacgaaaacccc
gi|3                          :           AACAAGCAAATTCAGAAAATTCATGTCCCCCGC-TTTT--TG---AAAAG-ATTTGATTCg
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gi|27                         :             CGAGCAAATTCAGTAAATTTGTGTCCCCCGCTT
gi|3                          :           AACAAGCAAATTCAGAAAATTCATGTCCCCCGC-TTTT--TG---AAAAGA-TTTGATTC
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Reference ( family-4931 )     :           AACAAGCAAATTCNGTGAATTTATGTCCCCCGCTTTTT--TC---AAAAGA-TTTGATTCAGGCAT
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finalCons                     :           AACAAGCAAATTCNGTGAATTTATGTCCCCCGCTTTTT--TC---AAAAGA-TTTGATTCAGGCAT





Alignments
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lowQualScore                  :                        .                .       ..  ...      .              
lowQualScore                  :                        0                3       44  444      7              
consensus                     :           AACAAGCAAATTCNGTGAATTTATGTCCCCCGCTTTTT--TC---AAAAGA-TTTGATTCAGGCAT
Reference ( family-4931 )     :           AACAAGCAAATTCNGTGAATTTATGTCCCCCGCTTTTT--TC---AAAAGA-TTTGATTCAGGCAT
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gi|10                         : agttaaattaAACAAGCATGTGTTGTGAATTTACGTCCCTCGCCTTTT--TC---AAAAGA-TTTTATTCAGTCAagttattgcatagaaactttc
gi|11                         :           AATAAGCAAATTCAGGGAATTTATGTCGCCTGTTTTTT--TTTAAAAAAGA-TCTGATTCAGGCAgtcttat
gi|12                         :            ACAAGCAAAGTCAGTGAATTTATGTCCCCAACTTTTT--T----AAAATATTTTGATTCAGGCATg
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gi|18                         :        aacAACAAGCAAAGTCCGTGAATTTATATCCCCTGCTT
gi|19                         :          aAACAAGCAAATTCTGTGAATTTATGTCCCCTGCTTT
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gi|24                         :           AACAAGCAAATTCAGGGAATTTATGTCCC
gi|25                         :          cAACAAGCAAATTCAGGGAATTTATGTCCCTCGCTtgtc
gi|26                         :            ACAAGCAAATTCTGTGAATTAATGTCCCCTGCTT
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gi|9                          :         atAACATGCAAATTCAGCAAATTTATGTCCCC-GCCTTTT--TC---AAAAGA-TTTGATTCAGGCATtctta