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Reference ( gi|1 )            :  ATACATCAGACCTATCATTCTTTTTGAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAAATCACACGGAATTTCATAACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTAAT--TTGTATCTTT---A---A-AAATGGCGCCGCATCTTT-CAAAAATCTTGCAGGAATGT--TG-------T---CCA--ATCC-----AGTGC--TTTAA-G---A-ACAATTCA-A-TTTACATA-GTTCTTTG-TATACAAAATCTTCACTTAC-TGT-ACGAA-GTTTAAATTTAACAGAAT--CTG--GA--TTTCT-----TTTT-T--T--TTTAT-AAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATTCAGC----AT-TGTGCATTTTTGAGGGTAAAGGCAATTTTTTAACTAACAAA---G-----A-----AGCAACATTGGTA-AAAAAAAT--ATTA-AAATGAATGGCAATTTTCATAGGCTCAAAACAATTTTCATC-------G-------TCAA-------AACAATATT-AGGAGAAGATTT---AGTCTTG--TT----A---CT-G-TACCCTA-----ACT-T--TTT-A-AT-T--TG----AGAC--CAGAG--TTTTTGAGGACAGTTCTTATTTTCTTCTAGCTTATTGGAAA-GAT----ACTC----AGA-TTT----GGCTC-T-TTAACATCCCTCTGTACTAAA-----TT-TCTAT-ATGA----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CTT---CTTCT-TTGA---ATTT----TTAAAATGATACATATAAAA----ATCTCTCTGTTTAATAAGTTCTAAAATATTAGAATCTAA----C---CAAGGCTCACTTCTTTGTTTAAGAC---GTACCTCTTTTATAGGTGCAACAGAATT-TAGAAC--TG--A--T-A-AAAA-TATTTCTATAAAATTCT-G-CCAAGAGTCCTGT--ACA-GAT----TTTGCA--GTAAATAC-A-T-TAGTCCAATCA--C--AC--AATTT-T-----AACA-----T-ATGAATA------AA-------------------TTCATC-------------------AACCTAATTACAAC--ATTTTTGTGT--TTGTTAA-AA-ATAC-C--TTTTCCTATTTTTCTGGTGCAAAAT---ATAGGTAAATGATCACTAAGACTAACAGG-TAAGGTTCC----TGACTGAAT-TA-CTTTGTCATGATGATTACATG-CAATATGGTCGAGCA---G----AG---TTGAAGACTTATCCGATGTACGTGTAG--GCT-GATCAAT-GATCTGTTTGATAA---TAAATATATGTAAAA-TCTGTTGATA---T-TTA---TA-AAAC----AAAGCGGA----TT--TGTTTTCTTT-AAAACA---TATGTTAAAATCACCAAAAACAT-A----CCACTCAATA-TCAGATCTAATGCATGATGAA-AT-CGATT---CAAAATGATCTA-----AAAAGTCTGT-CTGTTTAGGTGG--TCTATA-ACA-AGAACTTATTAAAATTGGTT--TTGTTTTTGG-GAGCGAAATTTCTGCCCAAATTGATTC-----T-A----CATTTTTATT--ATCTAGATCGG-ATTGTTCATTAAAGGCCATGTC--TTCTCGGATGTACAGGCACACTCCA-CATCCTTGTCTG--TCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ATTGTAGCCATCAATATGTATTTCTGCATCGCTAACAGAGTTATCTAACC-AGGTTTC---T-G-TAAAGGCTAATG-CAGCAA----AACT------G-----CAAG--TAGATGTCATATGTTAATTTCCAATAATTTTGGTAAA-AGCGACCGTATATTAAAATGAATA-AAATGTAATCCTTTTCTCTTAAAACAGTCAAAATTGAAAA-AATCAT------CGTTAAAATGTTCCTGTTGTGTTG-------ATTTATTATGATTGAAT--T---GTTCATATTTTTCACTGACATCTTCTAATTCATGAAATGGTTAGTCAATAAAACTACAATTAAGGCACGTAAAATTAAA--------AGCATCAC-TGAAA----TT----GTCA--AACTGTTCACTGGAAGTATAATTTGTACATTTAATATGGGTCCACTT--ATCACATATATCGCAGCTTACTGCTTTACTCCGACGAGTAACTCCTCTGTCGCAAATAATACATGAACATTTTGGTTG
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gi|7                          : gATACATAAGACGTAGCATT-TTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACATGGACTTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAGAAATGTTAT--TGGTATCTTT---ATAAATAAATGGTGCTGCATCTTT-CAAAAATCTTCCAGGAATGT--TG-------T---CCA--ATCC-----AGTGC--TTGTA-G---A-ACAACTTT-A-TTAACATA-GTTCTTTG-AATACAAAATCTTCACTAAC-TGT-GCGAA-GTTAAAATTTAACAGAAT--CTG--GA--TTTCT-----TTTT-T--T--TTTTTAAAAAAACT--------TTT--A-AA-A--T----AGT--AGAATCAGC----AT-TGTGCATTTTTTAGGTTAAAGGTAATTTGTTAATTAGCATA---G-----A-----AGCAACATTGGT--AGAAAAAT--ATTA-AAATGATTGGCAATTTTCGTAGGCTCAAAATAATTTTCATCCTCAATTT-------TCAA-------AACAACATT-AGGAGAAGATTT---AGTCTTA--TT----A---CT-G-TATCCTA-----AGT-T--TTT-A-AT-T--TG----AGAC--CACAG--TTTTTGAGGACTGTTCTTATTTTCTTCTAGCTTATTTGAAA-GATATCGATTCAAAAAGA-TTT----G---------AAAGTGTATCTGT-TTAAG-----TTGTCTAT----A----ACAAGA----------A-C--CTTT-TAA--AA----T
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcctcgaacccagggatgtagtc-TTT----GTCTT-T-CTAACATCTCTTTGCACAGTA-----TT-TCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acatttaatcagaacataatgtggagTTATAA--AAATGTTTT-CAT---CTTTC-TTGA---ATT-------------ATACATATAACA----GTCCCTTTGTTTGTCAATTTCTAGAATTTCATATGTTAA----C---CAAGATTCACTACAATGTTTCAGAC---ATCCTTCcaatgaatagtcctcatgactact
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAAAATCTCAGATGC---CA---TTCAATGCTCTGTTTAAG----------TCTTTCACAGGAGCAA-AGGATTGCAACAC--TG--A--C-ATAAAA-TATCTTTGTAAAGT--A-A-CCAAGAA--CTATTGACATTATTGTATTTATA--ATAAAAAC-ACT-TACTCCAATCA--
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaaacatgttgttgctagaatttatatctttgtaaaaatctatcaaggcttttgaatccagatcaaacaatttactaggacaaggtaatttatgaacaagttttaaagctactgtgataaaaaaatcaataatatgatttgctattttttaggactatggcaattttgattttcacattatttaaaactacctttatgagattgataacctacatgtaattgctttagatgttgccacagactctttggattatttctattttctgatattttatcagaaaaacatttggagtttgcccttaacatctcttcggacaatatttctgtataaactatacaacgaatcatcctcatgactaccgtC---GTACCTCTTTTATAGGTGCAACAGAATT-TAGAAC--TG--A--T-A-AAAA-TATTTCTTTAAAATTCT-G-CCAAGAGTCCTGT--ACA-GAT----ATTGCA--GTAAATAC-A-T-TAGTCCAATCA--C--AC--AATTT-T-----AACA-----T-GTGAATA------AA-------------------TTCATCTACATTGTGATTTTTTACTGACCTAATTACAAC--ATTTTTGTGT--TTGTTAA-AA-ATTC-C--TTTTCCTATTTTTCTGCTGCgcctgaggtagcttgtcaataaattactcttttgtataattctcaactcttctactttagaaaagtagtgcttagggaagtctgtttagtaatattcttagtataaaaagtcatacaactatcactta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTTCACACGAACAATGAAATT-CAAAAC--TG--ACAT-A-AAAA-TATCTTTG-AAAG--CTAA-CCAAGAA--CTAT--TGA-TAT----TATAAG--GAAAAAAC-ACT-TACTCCAATCA--
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCTTCCTAGTACAAAATGTCATA---AAATAATCACTTAAGCCAACAGAATATGGTACCAGATTGACTCAATCTATCTTTG----GA--ATT-TGTGGCAATATGATCAA-TA---ATACTAC---TTGAAGTTTTAGT-GAT-----TCCAGTTGCT---TCACT-GATA-ATCTGATG----TAAATA-A---AAAA-T-TCTCAATA---TATTGGACTA-AAACTTCAAAAGTGAACTAGTT--TTTTTTGTTT-AAAACA---AATACCGACATC-CCAAGGAGGT-AAGTTTCA--CAGTA---AGATTTGTTACATG-TAAG-ACACG-TT---CAAGATGATCAAT----AAAAG--TGTCCTGGTTTGGAGG--TATAT--ACATAGTACCCAAAATAATGGGTTTGTTGTTTTTAA-AAA-GAAATgcgtgacctagcttttcaataagcaactcttttgtataattcttaactcatcgaacttatcgaaaaatagtcctcagaacatgtatgtatagcaatcttcctagtacaaaatgtcataaaataatcacttaagccaacagaatatggtaccagattgactcaatctatctttggaatttgtggcaatatgatcaataatactacttgaagttttagtgattccagttgcttcactgataatctgatgtaaataaaaaattctcaatatattggactaaaacttcaaaagtgaactagttttttttgtttaaaacaaataccgacatcccaaggaggtaagtttcacagtaagatttgttacatgtaagacacgttcaagatgatcaataaaagtgtcctggtttggaggtatatacatagtacccaaaataatgggtttgttgtttttaaaaagaaatcaaacaaaaataagttaatcatgcataacgtttaaatcaggtctagtagtaatgcaatatcattatatcgcatcttactacactataattgtcaatgtgtatatctgcatcattcacagaactgtctaatcaaagtttttaaagcaatgacagctgctctggtcttcatggctagaattttcatttcagacattttaggtaaaatagatctaacatgaatatgaatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctttcacacgaacaatgaaattcaaaactgacataaaaatatctttgaaagctaaccaagaactattgatattataaggaaaaaacacttactccaatcagcgtgacctagcttttcaataagcaactcttttgtataattcttaactcatcgaacttatcgaaaaatagtcctcagaacatgtatgtatagcaTTTTCCATGATGATTACATA-ACATATGGTCGAGCA---G----AG---TTGATG----------TATATATGTAG--GCT-GATCAATAAATCTGTTCGATAA---TAAATcaaacaaaaataagttaatcatgcataacgtttaaatcaggtctagtagtaatgcaatatcattatatcgcatcttactacactataattgtcaatgtgtatatctgcatcattcacagaactgtctaatcaaagtttttaaagcaatgacagctgctctggtcttcatggctagaattttcatttcagacattttaggtaaaatagatctaacatgaatatgaatgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAT-AT-CGATT---CAAAAAGATTTG-----AAA-GTGTAT-CTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atacataagacgtagcatttttttaaacaaaggttttactttggcacttttaagatcacatggactttcattactagtaatggaactatttatcagaaatgttattggtatctttataaataaatggtgctgcatctttcaaaaatcttccaggaatgttgtccaatccagtgcttgtagaacaactttattaacatagttctttgaatacaaaatcttcactaactgtgcgaagttaaaatttaacagaatctggatttcttttttttttttaaaaaaacttttaaaatagtagaatcagcattgtgcattttttaggttaaaggtaatttgttaattagcatagaagcaacattggtagaaaaatattaaaatgattggcaattttcgtaggctcaaaataattttcatcctcaattttcaaaacaacattaggagaagatttagtcttattactgtatcctaagtttttaatttgagaccacagtttttgaggactgttcttattttcttctagcttatttgaaa-AT-CGATT---CAAAAAGATTTG-----AAA-GTGTAT-CTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCAAACTGATTC-----A-A----CATTTTTATT--GTCTGGATAAG-ATCTTTCATTAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCA-CCTCCTTGTCTG--TCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTC---T-G-TAAAAGCTAAGG-CAGCAA----AACT------G-----CAAG--CAATTATCAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atCATACTCTT-CCCCCATGTCTG--T-----TTCTATTAC-AACTTACTAAACTATAATTGTCAATGTGTATTTCTTCATCATTCACAGAACTGTCTAACC-ATGTTTC---T-GATAAA-GTTATTA-CAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattatttctaacaaTAC---ACTATAATTGTCAATGTGTATATCTGCATCATTCACAGAACTGTCTAATCAAAGTTTT---T-----AAAGC-AATGACAGCTG----CTCT------GGTCTTCATGGCTAGA------ATTTTCATTTCAGACATTTTAGGTAAA-ATAGATC------TAACATGAATATGAATGTtgcttttgtttttatggtaacaattttcatttcagacaattaaggtaaaatagatctta
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAAGAAATTGGCAATTTTAAGAAAACTGCAGCATCTTTCAAAAAAATCTAGCAAGGACTTCATGATCTAAACCAGCATTTTTTATGCATAAAGATTCTTAAACGCCTTGTAGACAAATGACCCTGACACATGTTTTAAAACAAATATGTTGTTGCTAGAGTTCCAAGGCTTTTGAGTCCAGATCAAACAATTTACTAGGAAAAGGTATTTTACCAGCAAGTTTTGAAGCTACTGTGTTAAAAAAAAGTCTTTAAAATGATTTGCTATTTTTTTTTTGGAATATGCCAATTTTGATCTTCAATATTTTAAACTACATTTACATTTCCACCTTTATAAGATTTATAACCTAACTTCTTAAAATGTTACACTTTTTGG
Unaligned ( gi|11 ): TGTTATTTTTGTAACGATTAAAAGCCTTATCTCTTTCATTAATGGCATTCAAAATATCTTAATCGATCCATGGTTCTGTCCTCTGCTTGATTCGTACCTGCTTGACTGGAGCGATATTGTCAATAACCGACATAAACAAATGTTTAAAGTTATCCAAGCCCAAGATAAATCATCGCTAATCATAACCGGACTCCAGTCTGAAGATAACAGATTGGTTTGGATGTCCTCTTTGTTGTAGTTCTTCGTGGAACGTATTGTAACATTATTATGTGTACTGATAGAGGATTTTGTAGTTTTTCTTATACAAAAAGTCATGCTATTGTCACTGAAGCTAGTTTCAATAACACCAGACTGGGAAATCTTGTCATTGTC
Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






Alignments
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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACGTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTNATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTN-GCNGGAATGTCGT---CTAATCCAGTGCTTTT------AGAACNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCANTGAC-TGT-ACNAA-N-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGTAATTTATTAACTAAC-ANA---GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TT-ATTAAAATGATTTGCNATTTTCATA--GGACCATGACAATCTTCATCTTCA-A-TATTTAAAACAACATT-AGAANAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATTTGTAACCTAACT-TTTTAANTTGACGC--CANAG--TTTTTGA-GACTGTTCCTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GNCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATTT----TTAAA---ATACGTATAANA----ATCCCTNTGTTTAA-TAAANTCTAGAATNTCAGANNCTAACCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TATCTTTGTAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ANA-TAT----TNT--GC-A--GTAAAAAC-A-T-TACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----AC-----CTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCGTAAAATGATCGCTTAAGCCAATAG-ANATGGTACCAGACTNAATNANTCTGTCTTNATNATTACGTGGCGATATGGTCGAT--TA---G---ANTTGAAGTTTTA-GCGATACACGTNTAGTTGCTGGTCANT-GATNTG-TCCGATAA---TAAATA---ACAAAAT-TCTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC-----T--T-TTTTGTTT-AAAACAA---ATATCGACATC-C-CTAAGA--GAT-A--T--TTCANTA-TCNGATCT-G-T-GTATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAANGATCTATAAAAGTGTGTCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATGGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTC-G-CCC-A-ANC-GATTCGT----A----CACTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCNAAATC--TTCTCGGATATACGTGCATACTCCACCCCCNTGTCTGTTNCGGTCCTTTC-GGCTTAC---ACTATAACCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCATTCACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTGT-A-AAAGCTAATG-CAGCGG-----ANCT------G-----CA-AG--TAAACG----ATTTTNATTTCNGACANTTTNGGNAAATANAGANCGTGCATTAANATGAGCATGANNGCAATCCTTTCCTGGTAAAAC-------ATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGAAGG--CAAATTGT-TTGAAGAATCATTT-TTATGCTAAAATAATCAAATTCATAATTTTCA--AA----TTCAGAGTCACCAAGTAATAATT---TAAAAGTACATTGAACGCA-GTAAAA-TAGATTGTCTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGT------GA--TGAAGCCGGTACACTT-ATATGTGTT--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGTTTTGCT-------GT-ACTCCTCTCTGACAAACTGTACAGGGAAATTTCGGCT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattatttctaacaa-TTT----GCCT-TTTT--TACTTCTCTCTTTACAAGGTTTCTGT-AAAT----ACAATA------------G----TTGGCG--AC----TTCTCTT---TTTGT-TTGCCTTATTTGTATCTAAA---A---GGA-AATA----ATCTCTATGTTCAAATAGA-TCTAGAATATGTGAGTTAAGCTAAGGCTCACTTCTtta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACCAT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acatttaTGATGATTACATAAC-ATATGGTCGAG--CA---G---AGTTGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGATAA---TAAATcaatgaatagtcctcatgactact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttccaGTAATTGGCAATTTT---A---AGAAAA----CTGCCGCATCGTT-CAGACA--TCTA-GCGGGGACTTCAT---CTAAAACAATGCTTTT------TGATGCATTAAGA-TTCCTA-A-GTTCCTTGTAAACAAA----------TGAC-TGTGACACA-TGTTTTAA---AACAAA-T--CTGTTG---TTGCTAAAG-TTTC-TGCC--T-------TTGTAAAAATCT--------ATC--AAGG-C--TTTTGAGTCCAGATCAAGC----A-------ATTTGCTTAGAA-GAAGGTAGTTTATT---TAAA-AGATTTGAA-GCTACTGTGGTAAAAACG--TTTAT--AAATTATTTGCTATTTTT-TA--GGACTATGACAACTTTGATCTTCA-A-TATTTAAAACTACATT-AATTTTATATTT-------TTA--TT--AGATTTATAAACTTACTGCTTTAAAT-GATGCTACAAAT--TTTTTG--GATTATTTCTATTTTCAGATATTTGATCAGAAACAATAT---GT-----AAACTTT----GCCT-TTCT--AACATATCTTTGCAAAATATTTCTAT-GTTT----ACAATACAATAAATGGT-GGTCCCCATGAC-AA------C-CAT---GCTTT-CTGA---ATTT----GTACA---A-----ATAAGA----ATCCCTCAGTTTAA-TAAAATTTAAAATCTCAGTTGCTATCCATGGCTCAGTTCTCTGTTTAAGTC---TAACTTCTTTCACAGGGGCAATGGAAT--TAAA-AAC--TG--ACAT-A-AAAA-TATCTTTA-AAAG-CTAACCAAGAA--C----TAT--TGA-TAT----AATCAGC----GTATAAAC-ACT-TACTCCAATC-----AGTCTGACCGAGCTT-GTCA--ATAAACA-------------AC-------------------TCTTATG-------------------T----ATAATTTCTAAT-ACATC--AGACTTTAGAAAAATAGTGCTTA-----GA-AA-ATGTCGGTTTAGC---AA--TC--TTCCTAGTACAAATGGTCATTAAATGATCACTTAAACAAATAG-AAATGGTACCAGATTAAATCAATCTATCTTTAGAATTA-GTGACAATTTGATCAAT--TATACT---ACTTGAAGTTTTA-GTGAT-----TCTAGTTGCT--TCACT-GATA-A-TCTGAT-G---TGAAT-----CAAAAT-TCTCAAAATAT-TTG---TATAGACTT-A-AAGAGTGAAC-----TACTGTTTTGTTTCAAAACAA---ATATTGACATC-CTCTAAGA--GATGA--T--TTTAATAGTCTGATCT-A-TGGTTTG-TTTAAC-ACTTT-----CAAGATGATCAATAAAGATG-GCCTGTTTTGGAGGCATTTACATAC----TACCTACAATAATGGGTT--TGGGTTTTGGTCAACAAAAGTTC-A-TC---------ATTCATA---A----CA-----ATTCAATC-----CGG-----------T----ATAGTGGTAAAAGCAATATCATTTCTCACATA-ACA-ACATACT---CCTCCATGTCTGTTTCTGTCATATCTAACTTA----ACTATAAATGTCAATGTGTATTTCTGCATCGTTCACAAAACTGTATAACC-ATGTTTTTAA-T-AAAGTTATTA-CAGCta
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--AGA-A--TAGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TN-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-A-TATTTAAAACNACA-TT-AGGANAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGA-TTTTTGAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAAT-------A--T-G-----CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATT----TTTAAA---ATACGTATAANA----ATCTCTCTGTTT-AATAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTATAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ACAN-ATTNT-GC----A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----A-----CCTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTACGTGGCAATATGGTCGATCA---G---ACTTGAAGTTTTA-GCGATATACGTGTAGTTGCTGATCANT-GATNTG-TCTGA---TAATAAA--TA---ACAAAAT-TCTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACAA---ATATTGANATCACCNAAGA--GAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCNATAAAAGTGTGCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT----A----CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTGT-A-AAAGCTAATG-CAGCNGC--T---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCGTGCATTAANATGAATAAAATGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGTGTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA-----A----CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTGT-A-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atGTGTTTTT---AGAAAAAATT----GCACTG--TCTCTGCAGA----TTTATGTTGAAA-ACC---AT---CTAGTCCAGTGCTTTA------AGCAGCATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTTGAAAACAAA--ATCCTCAGTGACATG--ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTG--GA------GA----CTTC-T--T--CGAA----TTATAAAAAT-T--------CTT--AAA-AATTTGTGAAGATGTAGCAAAAATATGTACATTT-TTTttatcat
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAAT-------A--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCA---G---AGTTGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGA---TAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TT-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-A-TATTTAAAACNACA-TT-AGGAGAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGATTTTTNAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATTT----TTAAA---ATACGTATAANA----ATCTCTCTGTTTAA-TAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTATAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ACA-NAT----TNT-GC-A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----AC-----CTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTACGTGGCAATATGGTCGATNATACGACTTGAAGTTTTA-GCGATATACGTGTAGTTGCTGATCANTGA-TNTG-TCTGA---TAATAAA--TA---ACAAAAT-TNTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACA---AATATTGANATCACCNA--AGAGAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCGATAAAAGTGTGCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT-A-------CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTG-TA-AAAGCTAATG-CAGCNG--CT---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCGTACATTAANATGAATAAANNGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGTGTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA--A-------CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTG-TA-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atGTGTTTTT---AGAAAAAATT----GCACTG--TCTCTGCAGA----TTTATGTTGAAA-ACC---AT---CTAGTCCAGTGCTTTA------AGCAGCATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTTGAAAACAAA--ATCCTCAGTGACATG--ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTG--GA------GA----CTTC-T--T--CGAA----TTATAAAAAT-T--------CTT--A-AA-AATT----TGTGAAGATGTAGCAAAAATATGTACATTT-TTTttatcat
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTATAA--AAATGTTTT-CAT---CTTTC-TTGA---ATT-------------ATACATATAACA----GTCCCTTTGTTTGT-CAATTTCTAGAATTTCATATGTTAACCAAGATTCACTACAATGTTTCAG-------ACATCCTTCtatttttcac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCA---GAGTTGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGA---TAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATAAAATAATCACTTAAGCCAACAGAATATGGTACCAGATTGACTCAATCTATCTTTGGAATT-TGTGGCAATATGATCAATAATACTACTTGAAGTTTTA-GTGAT-----TCCAGTTGCT--TCACTGA-TA-A-TCTGA---T-GTAAA--TA---A-AAAAT-TCTC--AATATATTGGACTA-AAACTTCA-AA-AGTGAACTAGTT--TTTTTTGTTT-AAAACA---AATACCGACATC-CCAA--GGAGGT-AAGT--TTCACAG-TAAGATTT-GTT-ACATG-TAAGACACG-TT-----CAAGATGATCAATAAAAGTGT-CCTGGTTTGGAGG--TATAT--ACATAGTACCCAAAATAATGGGTTTGTTGTTTTTAA-AAAGAAAgcgtgacctagcttttcaataagcaactcttttgtataattcttaactcatcgaacttatcgaaaaatagtcctcagaacatgtatgtatagcaatcttcctagtacaaaatgtcataaaataatcacttaagccaacagaatatggtaccagattgactcaatctatctttggaatttgtggcaatatgatcaataatactacttgaagttttagtgattccagttgcttcactgataatctgatgtaaataaaaaattctcaatatattggactaaaacttcaaaagtgaactagttttttttgtttaaaacaaataccgacatcccaaggaggtaagtttcacagtaagatttgttacatgtaagacacgttcaagatgatcaataaaagtgtcctggtttggaggtatatacatagtacccaaaataatgggtttgttgtttttaaaaagaaatcaaacaaaaataagttaatcatgcataacgtttaaatcaggtctagtagtaatgcaatatcattatatcgcatcttactacactataattgtcaatgtgtatatctgcatcattcacagaactgtctaatcaaagtttttaaagcaatgacagctgctctggtcttcatggctagaattttcatttcagacattttaggtaaaatagatctaacatgaatatgaatgt
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TT-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-A-TATTTAAAACNACA-TT-AGGAGAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGACTTTTNAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATTT----TTAAA---ATACGTATAANA----ATCTCTCTGTTTAA-TAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTATAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ACA-NAT----TNT-GC-A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----AC-----CTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTACGTGGCAATATGGTCGATNATACTACTTGAAGTTTTA-GCGATATACGTGTAGTTGCTGATCANTGA-TNTG-TCTGA---TAATAAA--TA---ACAAAAT-TNTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACA---AATATTGANATCACCNA--AGAGAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCGATAAAAGTGTGCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT-A-------CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTG-TA-AAAGCTAATG-CAGCNG--CT---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCNTACATTAANATGAATAAANNGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGTGTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA--A-------CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTG-TA-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atGTGTTTTT---AGAAAAAATT----GCACTG--TCTCTGCAGA----TTTATGTTGAAA-ACC---AT---CTAGTCCAGTGCTTTA------AGCAGCATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTTGAAAACAAA--ATCCTCAGTGACATG--ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTG--GA------GA----CTTC-T--T--CGAA----TTATAAAAAT-T--------CTT--A-AA-AATT----TGTGAAGATGTAGCAAAAATATGTACATTT-TTTttatcat
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTATAA--AAATGTTTT-CAT---CTTTC-TTGA---ATT-------------ATACATATAACA----GTCCCTTTGTTTGT-CAATTTCTAGAATTTCATATGTTAACCAAGATTCACTACAATGTTTCAG-------ACATCCTTCtatttttcac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCAGAGT---TGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGA---TAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATAAAATAATCACTTAAGCCAACAGAATATGGTACCAGATTGACTCAATCTATCTTTGGAATT-TGTGGCAATATGATCAATAATACTACTTGAAGTTTTA-GTGAT-----TCCAGTTGCT--TCACTGA-TA-A-TCTGA---T-GTAAA--TA---A-AAAAT-TCTC--AATATATTGGACTA-AAACTTCA-AA-AGTGAACTAGTT--TTTTTTGTTT-AAAACA---AATACCGACATC-CCAA--GGAGGT-AAGT--TTCACAG-TAAGATTT-GTT-ACATG-TAAGACACG-TT-----CAAGATGATCAATAAAAGTGT-CCTGGTTTGGAGG--TATAT--ACATAGTACCCAAAATAATGGGTTTGTTGTTTTTAA-AAAGAAAgcgtgacctagcttttcaataagcaactcttttgtataattcttaactcatcgaacttatcgaaaaatagtcctcagaacatgtatgtatagcaatcttcctagtacaaaatgtcataaaataatcacttaagccaacagaatatggtaccagattgactcaatctatctttggaatttgtggcaatatgatcaataatactacttgaagttttagtgattccagttgcttcactgataatctgatgtaaataaaaaattctcaatatattggactaaaacttcaaaagtgaactagttttttttgtttaaaacaaataccgacatcccaaggaggtaagtttcacagtaagatttgttacatgtaagacacgttcaagatgatcaataaaagtgtcctggtttggaggtatatacatagtacccaaaataatgggtttgttgtttttaaaaagaaatcaaacaaaaataagttaatcatgcataacgtttaaatcaggtctagtagtaatgcaatatcattatatcgcatcttactacactataattgtcaatgtgtatatctgcatcattcacagaactgtctaatcaaagtttttaaagcaatgacagctgctctggtcttcatggctagaattttcatttcagacattttaggtaaaatagatctaacatgaatatgaatgt
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TT-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-A-TATTTAAAACNACA-TT-AGGAGAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGACTTTTNAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATTT----TTAAA---ATACGTATAANA----ATCTCTCTGTTTAA-TAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTATAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ACA-NAT----TNT-GC-A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----AC-----CTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTACGTGGCAATATGGTCGATNANANTACTTGAAGTTTTA-GCGATATACGTGTAGTTGCTGATCANT-GATNTG-TCTGA---TAATAAA--TA---ACAAAAT-TNTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACA---AATATTGANATCACCNA--AGAGAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCGATAAAAGTGTGCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT-A-------CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTG-TA-AAAGCTAATG-CAGCNG--CT---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCNTACATTAANATGAATAAANNGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGTGTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA--A-------CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTG-TA-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atGTGTTTTT---AGAAAAAATT----GCACTG--TCTCTGCAGA----TTTATGTTGAAA-ACC---AT---CTAGTCCAGTGCTTTA------AGCAGCATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTTGAAAACAAA--ATCCTCAGTGACATG--ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTG--GA------GA----CTTC-T--T--CGAA----TTATAAAAAT-T--------CTT--A-AA-AATT----TGTGAAGATGTAGCAAAAATATGTACATTT-TTTttatcat
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTATAA--AAATGTTTT-CAT---CTTTC-TTGA---ATT-------------ATACATATAACA----GTCCCTTTGTTTGT-CAATTTCTAGAATTTCATATGTTAACCAAGATTCACTACAATGTTTCAG-------ACATCCTTCtatttttcac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCAGAG---TTGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGA---TAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCT--------TTT--A-GA-A--T----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-TTTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TT-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-A-TATTTAAAACNACA-TT-AGGAGAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGACTTTTNAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC-CNT---CTTNT-TTGA---ATTT----TTAAA---ATACGTATAANA----ATCTCTCTGTTTAA-TAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTATAAAGTCTAACCAAGAA--C----TAT--ACA-NAT----TNT-GC-A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A--C--AC--AGTTTTGACAT-ATGAATA-------------AA-------------------T-TCATC-------------------G----AC-----CTAATTACAAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AA-ATACC--TTTNCC---TA--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTACGTGGCAATATGGTCGATNAGAGTACTTGAAGTTTTA-GCGATATACGTGTAGTTGCTGATCANT-GATNTG-TCTGA---TAATAAA--TA---ACAAAAT-TNTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACA---AATATTGANATCACCNA--AGAGAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCGATAAAAGTGTGCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT-A-------CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTG-TA-AAAGCTAATG-CAGCNG--CT---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCNTACATTAANATGAATAAANNGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGTGTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA--A-------CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTG-TA-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atGTGTTTTT---AGAAAAAATT----GCACTG--TCTCTGCAGA----TTTATGTTGAAA-ACC---AT---CTAGTCCAGTGCTTTA------AGCAGCATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTTGAAAACAAA--ATCCTCAGTGACATG--ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTG--GA------GA----CTTC-T--T--CGAA----TTATAAAAAT-T--------CTT--A-AA-AATT----TGTGAAGATGTAGCAAAAATATGTACATTT-TTTttatcat
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTATAA--AAATGTTTT-CAT---CTTTC-TTGA---ATT-------------ATACATATAACA----GTCCCTTTGTTTGT-CAATTTCTAGAATTTCATATGTTAACCAAGATTCACTACAATGTTTCAG-------ACATCCTTCtatttttcac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCAGAG---TTGATGT--------ATATA--TGTAG--GCTGATCAATAAATCTG-TTCGA---TAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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Unaligned ( gi|24 ): TACATTTCAATTTTTATTAGATTTATACCTTATTAATTACTTTAAATGATGCCACAAACTTTATGGATTATTT






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Reference ( family-480 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATACATCAGACNTATCATTCTTTTTAAACAAAGGTTTTACTTTGGCACTTTTAAGATCACACGGAATTTCATTACTAGTAATGGAACTATTTATCAAAAATGTTATTTGTATCTTT---A---AAAATA----GCGCCGCATCTTT-CAAAAA--TCTA-GCNGGAATNTC---AT---CTAANCCAGTGCTTTT------AGAANNATTTA-A-CTTATATA-GTTCCTTGNAAACAAA--ATCCTCA-TGAC-TGT-ACGAAT-TTTAAA---AACAGAGT--CTG--GA--TTTCTA----TTTT-T--T--T-------TTNTAAAAATCTNTTAAAA--T-----AGT--AGATCNAGC----AT-TGTACATTT-T-TTAGGNTAAAGGCAGTTTATTAACTAAC-A---TT-GAA-GCNACTGTGGTAAAAAAA--TCATTA-AAATGATTTGCNATTTTCATA--GGATCATGACAATTTTCATCNTCA-AT-ATTTAAAACNACATT-AGGAGAANATTT--A-GT-TTG--TT--A-ATCTGTAACCTAACT-TTTTAAATTGATGCCACAGACTTTTNAGGATCGTTCTTATTTTCTTCTANCTTATCGGAAA-AATAT---TT-----AGA-TTT----GCCT-TTCT--AACATCTCTCTGCACAANATTTCTAT-ATNN----ACAATA----------T-G--CTTTATAA--AA----TTC------CNT---CTTNTTTGA---ATT-------T--------G-TA-C---AAAT--AANA-----ATCTCTC-TGTTT-AATAAANTCTAAAATNTCAGANGCCANCCAAGGCTCANTTCTCTGTTTAAGTC---GTACCTCTTTCACAGGNGCAACGGAAT--TCAA-AAC--TG--A--T-A-AAAA-TA--TCTTTA-AAAG--CTAACCAAGAA--C----TAT--ACA-NAT----TNT-GC-A--GTAAAAACACTTACTCCAATC-----A------C--AC--AGTTT----TGACAT-ATGAATA-------------A---A-------------------T---TCATC-------------------G----A-----CCTAATTA-C--AAC--A---TTT-------TTGTGTTTAT---TAA-AAANTA-NT---------------TTTC-----------------C----T-A--TC--TTCCTAGTACAAAATGTCATNAAATGATCACTNAAGCCAATAG-GNATGGTACCAGACTGAATNANTCTGTCTTTATGATTGCGTGGCAATATGGTCGATNAGAGTACTTGAAG--T-T---G--CGA--TACATGTAGTTGCT--TCANTGAT-NATCT----GAT-ATAAA--TA---ACAAAAT-TNTC--GATAT-TTG---TA-AGACTT-A-AA-AGTGAAC----T--TGTTTTNTTT-AAAACA---AATATTGANATCACCNA--AGAGAT-A--T--TTCANTA-TCGGATCT-A-T-GCATG-TNAAAT-CGATT-----CAAAATGATCGATAAAAGT-G-GCCTGTTTAGGNGG--TCTATA-ACA-AGTACCTATAATAATNGGTT--TTGTTTTTGG-NAACAAAANTTCTGCCCA-AA-C-GATTCGT-A-------CATTTTTATT--ATCT---TCGGAT---------T----AT-----TAAAAGCCANGTC--TTCTCGGATGTACATGCATACTCCACCTCCATGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGNTTAC---ACTATAGCCGTCAATGTGTATTTCTGCGTCGTTNACAGAACTGTCTAACC-ANGTTTCTG-TA-AAAGCTAATG-CAGCNG--CT---ANCT------G----CA-AG--TAAACG----ATTTTCATTTCNGACANTTTAGGTAAAANAGATCNTACATTAANATGAATAAANNGCAATCCTTTCCTNNTAAAACAGTCAAAATTGAAAATGGTCACTTTTAACGTTAGAANGTTCNNGTTGTGTTGAAGAATCATTTATTATGNTNGAATAATCAAGTTCATANTTTTCACTGACATCTTCNGANTCACGAAGTGGTNANTCAATAAAANTACANTNAANGCACGTAAAATTAGATTGTCTTTANCGTCACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGTTCACTGGAAGTGNAGCCGGTACACTTAATATGNGTCCACTTGAATNACANGNATCGCAGNTTACTGCTTTGCTCCGACGAGTAACTCCTCTNTCGCAAACNGTACANGGANATTTCGGCT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaAT-CGATT-----CAAAAAGATT--TGAAAGT-GTATCTGTTTAAGTTG--TCTATA-ACA-AGAACCTTTTAAAATCGGTT--TTGTTATTGG-AAGCAAAATTTCTGCCCA-AA-CTGATTCA--A-------CATTTTTATT--GTCT-----GGATAAGATCTTTC----AT-----TAAAAGCCAAGTC--TTCTCGGATGTACATGCAAACTCCACCTCCTTGTCTGTCGCGGTCCT-TT-C-GGGTTAC---ACGGTAGCCACCAATATGTATTTCTGCGTCACTAACAGAGTTGTCTTGCC-AGGTTTCTG-TA-AAAGCTAAGG-CAGCAA-------AACT------G----CA-AG--CAAtttgttgttgctagagttccaaggcttttgagtccatatcaaacaatttactaggaaaaggtattttacctgcaagttttgaagctattttttttttggctatttgccaattgatcttcaatattttaaactatatttacttttccacttttataagacttataacctaac
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcctcgaacccagggatgtagtcTGTATTTAG---A---AAAATT----GCACTG--TCTCT-CACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---CTAAACCAGTGCTTTT------AGCAGCATTTA-A-TTTAT-TACATTCCTTGAAAACTAA--ATCCTTA-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagtaataagGTGTTTTTTAGA---AAAATT----ACACTG--TCTCT-GACAAA--TTTA-GGTGGAATACC---AT---TTAGTCCAG------------------CATTTA-A-CTTATTTA-ATTCCTGGAAAACAAA--ATCTTCAATGAC-ATT-ATTAAT-TTTAAA---AAGAGTGT--CTA--GAGACTTCTACGAGTTATAT--TAAT-------TCTTAAAAACTTGTGAAGA--T------GT--AG--TAAAA----ATATGTATAT--------GGTTC--GGCAGCTTATTAAC-AAG-A---TTTGCC-GCGACTGTAGTAAAAAA---TCATTA-AAAGGATTTGCGATTGTCAAA--GGATCATGACAAACCTCATTATCA-AT-ATTTAAAACAATATT-CG---AACTTTT----GT-TTG--TTTTATATTTGTAACCCAGCT-TTTTCAACTGCTGCCATAGACTTTTCACG-TCATACTTACGTTCTTCCACTTTATCCGAGA-AATAG---TT-----AGA-TTTTGTAGATT-TTATTAAATAT-----TGAACCTTGTTTCGAA-AGCT----ACAAAA----------TTG--CTT-ATAC--AA----TTCAGTAGGCTTATGTTTTTTTAT---AAT-------T--------G-TA-T---AAAG--CATT-----GTCTCTT-TCTAT-AATAAATTCGAGAATTTCAGAGGTCATCCACGGTTCTGTTCTCTGCTTTAGTCTCTG-ACCTCTTTAATAGGAGCTATATTGT--TTAA-TACATTC--A--T-A-AAAAATA--TAATGA-AAAA--ATGACCAAGCA--TCGTTTAT--ACA-TGT----TG-----A--GTTTAAACATGTGCTCCAGTC-----AG-----C--AC----TCG----TGAGATTATGAATG-------------A---AATCTTGTTTAGTATAATTTT---TCATT-------------------G----A-----CCAAAT---C--AACGGA---TTT-------ATGTGT--AT---TAA-AA--TA-A-------------------C-----------------CGG--T-A--CC--TTCCTTAAACAAAATGTCATAAAAAGATCGCTAATGCCAATAA-GGATAGTACCAGACTGGAAAATTCTGTTTTTATTATTGCATAG-GATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAA--TGT---G--CGA--TACACGC-GTGGGT--TCGGTTAT-GATTT----GAT-CTAAGTTTA---AAAAACG-TAAC---ATAT-TGA---CA-TGCTTT-ATAC-AATGAAC----T--T-TCTTTTTC-AAAACAACCAATATTAAAATCACCTAATATAAAT-G--T--TTCACTA-TCGGATC------GTATA-TTAACT-AGATTTACCACAAACCTATCGGTAAAAGT-A-GACTGATTAGGCGG--CCTATA-ACA-CGTACCAATAATAATAGGCT--TTGCTTTCAG-TAACAATAGCCCGATCCATAA-A-AATTCGTCAGTATGGTCACTTTTA-T--ATGT---TCTAA----------T----AT-----TAAAAGCTAAATC--GTTTCGGATATAGGTGCGTACACCACCACCATTTGGATTAAGATCTT-TA-C-GG---AC---AATACAGCAATC--TTTATACTTCTACGTCTGTAATAGAATCATCAAGCC-AAGTTTCAGTTATACAGATAA---CAGCGGCCCT---AGCTTTGTCAG----CA-AA--TAAACG----A-----ATTTCTGACATTTTAGGAAATAAAGAGCGTGCATTAAGATGAGCAAATGGCAATCCTTTCCTGGTAAAAC-------ATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGAAGG--CAAATTGT-TTGAAGAATCATTT-TTATGCTAAAATAATCAAATTCATAATTTTCA--AA----TTCAGAGTCACCAAGTAATAATT---TAAAAGTACATTGAACGCA-GTAAAA-TAGATTGTCTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTAGCTGT------GA--TGAAGCCGGTACACTT-ATATGTGTT--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGTTTTGCT-------GT-ACTCCTCTCTGACAAACTGTACAGGGAAATTTCGGCTaaaagaatgtctggtgacttcttcgagttgtaaaaattct
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aTTATAA--AAATGTTTT------CAT---CTTTCTTGA---ATT----------------A-TA-C---ATAT--AACA-----GTCCCTT-TGTTT-GTCAATTTCTAGAATTTCATATGTTAACCAAGATTCACTACAATGTTTCAG-------ACATCCTTCtatttttcac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCAGAAC-ATAAT---GT-----GGAGTTT----GTCT-TTCT--AACATCTCTTTGCACAGTATTTCTAT-ATTT----ACAATA----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatttaATGATTACATAACA-TATGGTCGAGCAGAG---TTGATG--T----------A--TATATGTAG--GCTGATCAATAA---ATCTGTTCGATAATAAA--Tcaatgaatagtcctcatgactact
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