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Alignments
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Reference ( family-4733 ) : TCATTTACTTGCCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAACGGCGACACGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AATAAAAAA----AATACCCCTGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAANGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTAATACTTTC-AAAA--TTA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCA-T-T-TTT-GTCGGTGTTA--AT--TACGTCNCAT-----AATA-----CAG-----ATATGTCAACACAACTGTCACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TTGT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCGTAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTATCAGCCTTTATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTGGACAACAATATGTCGGCTGGCGTCCCTCAGCTGGAGTCGTGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATTCAATAAGTATACATGAATTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTCGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTCA-CCAACCGTGGGAACCAACCATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--TTTTCACCG--GCGCTNTGCGCCG-GTGATAAATCCCCT
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gi|5 : TCATTTACTTACCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGAATGAATCTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAAATGCGACATGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AATAAAAAA----A-TACCCCTGCTA----------------------ACAACTATACTACCATATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAAGGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTTATACTTTC-AAAAATTTA------------CACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTTGAGCAAAGCTGCGAG-------GATAAACAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCATT-T-TTT-GTCGGTGTTAATAT--TACGTCTCAT-----GA--------AG-----ATATGTCAACACAACTGTCACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAATCT------A------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TT-T--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTACATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATGGTAGCGAGAAAA-ATAACAAGTATATCAGCC-TTATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTAGACAACAATATATTGGCTGTCGTCCCTCAGCTGGAGTCGTGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATTCAATAAGTATACATTAATTGATATACATA-TATATATTGTTAAATCATAAAAAA-CATCGTGTATGTAACGAAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATC---GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTACTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACCAATTTTT---CTTACCGTGGGAACCAACTATTTAAGTTATACGGGTTACAGTCCTTGACCTACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGGATAACTTG-CAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCC---CCGGTGA--TT
gi|6 : TCATTTA-TTACCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCTTTACAACGGCGACATGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AATATAAAA----AA-ACCCATGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAAGGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTTATACTTCC-AAAAA-TTA-----------ACATTGTATATGTAGACGACAAAA----------TACCTTGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACAAT--CATAGACTGACTGACTAAAGACATCT-T-T-TTTTGTCGGTGTTA--AT--TACGTCTCAT-----A--------CAG-----ATATGTCAACACAACTGTCACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAGGCATTA-------TT-T--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAAAACTACACCTATCGTAGCGAG-AAA-ATAACAAGTGTATCAGCCCT-ATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTAGACAACAATATATTGGCTGGCGTCCTTCAGCTGGAGTCATGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTACTTTCAATAAGTATACATGACTTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATCATAAAAAAACATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--G-ACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGTTAACTCCTTTAGTTCA-TATTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTTA-CTAACCGTGAGAACCAACCATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACACACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--Tga
gi|7 : TCATTTACTTGCCCGAATAAGCCGCTGTGATGAAACCCAACAGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATTCTTACAACAGCGACACGATTTACCAC-ATACTA--ACA-------AATAAAAAA----A-TACTCCTGCTA----------------------ACCACTAGACTACCATATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAAGGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTAATACTTTC-AAAA--TTA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGTCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACGAA--CATAGACTGACTGAATGAAGACATCA-T-T-TTTTGTCAGTGTTA--AT--TATGTCTCAT-----G--------CAG-----ATATGTCAACACAGCTGTCACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAGCATTACGTAGTATTATTTGTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCATAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTATCAGCCTTTATCTA--CGTATAAATGTACTAAGATTCTAGACAACAATATGTTGGCTG-----------CTGG-----TGTTGTTCGGATGGCAGAATCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATTCAATAAGTATACATGAATTG-TATATA-------TATTGTTAAATCATAAA-CA-CATCGTGTATGTAACGTAATGATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCA--A-ACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTCATCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTAA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTCA-CAAATCGTGGGAACCAACTATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAATGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCTGTTCTGGTGA--Taa
gi|8 : TGAAACCCAACTGGGAATGAAACTGGAGACCCTCGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAACGGCGGCGTGATTTACCCCCATACTACCACATACTTATAATAAAAAA----AATACCTCTGCTA----------------------ACAACTAGACCAGCTTATCCATTTTAAGTAGGGGAGAAAATTATTTGAAACAACAGAGC-A--ACGGACATTTTATA----CATTATTGGTTGTAATACTTTC-AAAA--TTAATTCTAAACAAGCACTGTATATGTAGACGCTATAA----------TGCCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------AGTAAACAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCA-T-T-TTT-GTCGGTGGTA--TT--TACGCCACAT-----A-------------------TGTCAACACAACTGTTACGCAGT--CACGATCTTTAACGAAAACT------C------TTTGTCCGCGAAACATTA-------TTGT--GTGGATGACAATACTTCCAAGATCGTGCATTTACAATAACTAATTAAATAGTACACCTACCGTAGCACACAAATATAACAAGTGTATCAGCCTTAATGTATTCGTATAATTGCACTAAGATCCTGGCCAACAATATGTCGGCTTGTATCCCTCAGCTGGAGTCATGTTGTTCGAATGGCAGATTCGGAACTGTTATTTATCAATTTTATTCAATAAGTATGAATGAAATG-TATATATA-TATATATTATTAAAGCATACAACA-CACCGTGTATTTTACTTAAGCATGC-GTTTAAACGTAGCATTTCTTCATGTATTTATC---GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTCGGTTACCCCAAACGCGCACATTTGTTTTGTCAATGGAGTTTACTCCT---GTTC--TTTTTTGGTTGCCGTCCTGAACA-A-TTTTAA-CCAGACGTGGGACCCAACAATTTAAaa
gi|9 : CC-ATACTT--ACA-------AATAAAAAA----A-TACACCCGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAA---GGT-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTTTTGATTCTAATATTTTC-AAAA--TTA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGTTGCGAG-------GGTAAACAAA--CATAGACTGACTGA----AGACATCA-T-T-TTTTGTCAGTGTTA--AT--TACGTCACATTATACAGTA-----CAG-----ATATGTCAACACAATTGTTACGGTCT--AACGATCTGTAACGAAAACT------ATCCATACTTGTCCACGAAGCATTA-------TTGT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTTCAATAACTGATTAAATAGTACACCTGTCGTAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTACCAGCCTTTATCTATACGTATAATTGTACTAAGATCCAGGACATCAATATGTCGGCTGGCATCCCTTAGCTGCTGTCATGTTGTTCGAATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCGTTCAATAAGAATACATGAATTG-TATATACA-TATATATTATTTAATCATAAAACA-CATCGCGTATGTAACGAAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATAAACTTATC---GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTAT----------------------TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGTCGTCCTGCACC-ATTTTT-A-CCAACCGTGGGAACCAACTATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--AT
Alignments
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lowQualScore : . .. ....... . .... . ...................... . ... . . .. .. . .. ........... .......... ....... .. . . . . . .. .. . .............. ..... .. ............. ....... . .. . . .. . . . . ..... . . . . . . . .. . .. .. .
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Reference ( family-4733 ) : TCATTTACTTGCCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAACGGCGACACGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AATAAAAAA----AATACCCCTGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAANGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTAATACTTTC-AAAA--TTA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCA-T-T-TTT-GTCGGTGTTA--AT--TACGTCACAT-----AATA-----CAG-----ATATGTCAACACAACTGTTACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TTGT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCGTAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTATCAGCCTTTATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTGGACAACAATATGTCGGCTGGCGTCCCTCAGCTGGAGTCATGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATTCAATAAGTATACATGAATTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTCA-CCAACCGTGGGAACCAACCATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--TTTTCACCG--GCGCTCTGCGCCG-GTGATAAATCCCCT
gi|1 : TTGCCCGAATAAGGCAGTGTGATGAAACCCAATCGGGAATGAAACTGGAGACCCTTGGTTCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAAGGACGACACGATTTATCCC-ATACTT--ACA-------AATAAAAAATAAAAATACCCCTGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTAATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAATGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGATTCTAATACTTTC-AAAA--ATA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAATCAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCA-TGT-TTT-GTCAGTGTTA--AT--TACGTCACAT-----AATA-----CAGTAAAGATTTGTCAACACAACTGTTACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACTTTCGATA------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TTGT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATAAAATAGTACACCTGCCGTAGCGGGCAAA-ACAACAAGTGTACCAGCCTTTATTTATTCGTATAATTATACTAAGATCCTGGACATCAATATGTCGGTTGGCGTCCCTTAGCTGCTGTCATGTTGTTCGACTGGCAGATTCGAAACTGTTATCTATCAATTTCGTTCAATAAGTATACATGAATTG-TATATACA-TCTATATTGTTTAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGAAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--G-ACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGT----TATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTCA-CCAACCGTGGGAACCAACTATTTAAATTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATACCATTCCGGTGA--TTTTCACCG--GCGCTCTGCACCC-GTGATAAATCCC
gi|10 : aaTCATTTACTTACCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCAAATCGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACGACGGCGACATGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AAT-AAAAA----AATACCCCGGCTA----------------------ACAACTATACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAAGGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTTATACTTTCAAAAA--TTA-----------ACACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTTGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACAAA--CATAGAGTGACTGACTGAAGACATCATT-T-TTT-GTCAGTGTTA--AT--TACGTC---T-----CATG-----CAG-----ATATGTCAACACAACTGTCACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TT-T--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCGTAGCGAGAAAA-ATAACAAGTGTATCAGCC-TTATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTAGACAACAATATATTGG-GGGCGTCCCTCAGCTGGAGTCGTGTTGTTCGGATGGCAGAT
gi|11 : GTGTATCAGCCTT-ATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTAGACAACAATATGTTGGCTGGCGTACTTCAGCTGGAGT
gi|11 : ATGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTACTTTCAATAAGTATACATGACTTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATTATGAAAAA-CATCGTGTATGTAACGTAATATTGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--A-ACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCTAGTTCA-TATTTTGGTTGCAGTCCTGCACC-ATTTTTTA-CTAACAGTAAGAACCAACCACTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATTAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCGCTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--TTTTCACCG--GCGCTCTGCGCCA-GTGATAAATCCCCTgggtatgactaaacaccggaaagggatcctttccgcggaatgttgttcggatggcagattcgaaactgttatttatcaattactttcaataagtatacatgacttgtatatacatatatattgttaaattatgaaaaacatcgtgtatgtaacgtaatattgcgtattaccgtaacatttcttcatatacttatcgaactactttttgaagtatggaaagagtaagttatttggtttagccaaacgtgcactttttttgtcaagggagctaactcctctagttcatattttggttgcagtcctgcaccattttttactaacagtaagaaccaaccacttaagttgtacgggttacagtccttgactcaccagtgcattaaccggaaatacaaaaaataaataagcatcgcttgtaatttaacggacgcgtgtacaatgccgttccggtgattttcaccggcgctctgcgccagtgataaatcccct
gi|12 : gtgtatcagccttatctacgtataattgtactaagatcctagacaacaatatgttggctggcgtacttcagctggagtgggtatgactaaacaccggaaagggatcctttccgcggaTCATTTATTTGCCCGAATAAGGCATTGTGATAAAACCCAACCGGGGATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAACGGCAAC
gi|12 : ACCTTATCAATATCG-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACACCACTAC-A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTAATACTTTC-AAAA--TTA-----------TCACTGTATATGTAGACGAAAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGTTGCGAG-------GGTAAACAAA--CGTAGACTGACAAACTGAAGACATCA-T-TATTT-GTC--TGTTT--AT--TACGTCACAT-----AATA-----CAG-----ACATGTCAACACAACTGTTACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAACATTA-------TTTT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCATGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCGTAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTATCAGCCTtagttgacttgtgtacggattgataaggattactcgtaacggcatggacagatttttgttgatgttttattacgaatgtgatcaaaccttatcaatatcggcagagaaaattatttgaaacaacaccactacagtcatgttataaatacagtattggttctaatactttcaaaattatcactgtatatgtagacgaaaaaatgcctagagcaaagttgcgagggtaaacaaacgtagactgacaaactgaagacatcattatttgtctgtttattacgtcacataatacagacatgtcaacacaactgttacggtgtcacgatctgtaacgaaaactacttgtccacgaaacattattttgtaagtggcaatacttccaagaccatgcatctacaataactgattaaatagtacacctatcgtagcgggcaaaataacaagtgtatcagcct
gi|13 : tcatttatttgcccgaataaggcattgtgataaaacccaaccggggatgaaactggagacccctggatcctgaagcaataatgtatcctaacaacggcaactagttgacttgtgtacggattgataaggattactcgtaacggcatggacagatttttgttgatgttttattacgaatgtgatcaaTAACTGATTAAATAGTACACCTATCGAAGCGAGCAAA-ATAAAAAGTGTATCAGCCTTTATATA--CGTATAATTGTACTAACACCCCGGACAACAATATGTTGGCTGGCGTCCCTCAGCTGGAGTCATGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATCCATTAAGTATACATGAATTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTTTTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATC---GGACTACTTTTTGATATATGGAAAGAGAAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-ATTTGTCAAGGGAGCTAAATCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-GTTTTTCA-CTAACCGTGGGAACCAACCATTTAGGTTGTGCGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATC
gi|14 : CCTTTATATA--CATATAATTGTACTAAGACCCTGGACAACAATATGTTGGCTGGCGTCCCTCAGCGGGAGTTTTGTTGTTCGGATGGTAGATTCGAAACTGTTATCTATCAATTTCATTCAATATGTATACATGAATTG-TATTTACA-TATATATTGTTAAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATC---GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAATAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-ATTCGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTTATTTTTTTGGTTGCCATCCTGCAAA-GTTTTTCA-CTAACCGTGGGAACCAACCATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAACATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATACTGTTCCGGTGA--T
gi|15 : AAAA----------TACCTAGACCAAAGCTGCGAC-------GGTAAACAAA--CATAGACGGACTGACTGGAGACATCA-T-T-TTT-GTCACTATTA--AT--TACATCACAT-----A--------CAG-----ATATGTCAACATAACTGTTATGGTGT--CCCGATCTGTAATGTAAACT------A------CTTGTGCACGAAGCATTA-------TT-T--GTAAGTGGCAAAACTTCCAAGATTGTGCATCTACAATAACTGAATAAATAGTACATCTACTGTAGCACACAAA-TTAACAAGTGTATCAGCCTTTATCTA--CGTATAATTGCACTAAGATCCTGGCCAACTATATGTCGGCTGa
gi|16 : aaaaatttatttaacagacttgtatagTCATTTACT-GCCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGGATGAAACTGGAGACCC-TGGATCCTGAAGCAATACTGTATCCTAACAACGGCAACACAATTTACCAA-GTACTA--ACA-------AAT-AAAAA----AATTTCCCTGCTAACGGTATTACTGAATACCAGAAACAACTAGACTACCTTATCAATTTCA-GCAG---AGAACATTATTTAAAACAACACCGC-AACA--GTCA
gi|17 : AGTTCA-TATTTTGGTTGCCGTCCTGCACG-ATTTTTTA-CTAACCGTAAGAACCAACCATTTCAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACACACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--TTTTCACCGGCGCGCTCTGCGCCG-GTGATAAATCCCCT
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Reference ( family-4733 ) : TCATTTACTTGCCCGAATAAGGCACTGTGATGAAACCCAACCGGGAATGAAACTGGAGACCCCTGGATCCTGAAGCAATAATGTATCCTAACAACGGCGACACGATTTACCCC-ATACTA--ACA-------AATAAAAAA----AATACCCCTGCTA----------------------ACAACTAGACTACCTTATCAATTTTA-GCAG---AGAAAATTATTTGAAACAACAANGC-A--A--GTCATGTTATAAATACAGTATTGGTTCTAATACTTTC-AAAA--TTA-----------GCACTGTATATGTAGACGACAAAA----------TGCCTAGAGCAAAGCTGCGAG-------GGTAAACAAA--CATAGACTGACTGACTGAAGACATCA-T-T-TTT-GTCGGTGTTA--AT--TACGTCACAT-----AATA-----CAG-----ATATGTCAACACAACTGTTACGGTGT--CACGATCTGTAACGAAAACT------A------CTTGTCCACGAAGCATTA-------TTGT--GTAAGTGGCAATACTTCCAAGACCGTGCATCTACAATAACTGATTAAATAGTACACCTATCGTAGCGGGCAAA-ATAACAAGTGTATCAGCCTTTATCTA--CGTATAATTGTACTAAGATCCTGGACAACAATATGTCGGCTGGCGTCCCTCAGCTGGAGTCATGTTGTTCGGATGGCAGATTCGAAACTGTTATTTATCAATTTCATTCAATAAGTATACATGAATTG-TATATACA-TATATATTGTTAAATCATAAAACA-CATCGTGTATGTAACGTAATAATGC-GTATTACCGTAACATTTCTTCATATACTTATCG--GGACTACTTTTTGAAGTATGGAAAGAGTAAGTTATTTGGTTTAGCCAAACGTGCAC-TTT-TTTTGTCAAGGGAGCTAACTCCTCCAGTTCA-TTTTTTGGTTGCCGTCCTGCACC-ATTTTTCA-CCAACCGTGGGAACCAACCATTTAAGTTGTACGGGTTACAGTCCTTGACTCACCAGTGCATAAACCGGAAATACAAAAAATAA--ATAAGCATCACTTG-TAATTTAACGGACGCGTGTACAATGCCGTTCCGGTGA--TTTTCACCG--GCGCTCTGCGCCG-GTGATAAATCCCCT
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