lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 555555 111 11 3333 1111 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 1 22 1 999999999999999999999999 11 1 111 11111111111111111111111111111 2 1 77777777777777 66666666666 11 333333 55555 555555 333333 2222 222 1 11 11 333333333333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 111 1 11111111 8888888888888888888 1 1 1 333333333 11 11 444444 3 11 1 11 1111 11 111 1111 55555555555555555555555555555 11 11 22 444 1 1 88888888888888 1 1 55 1 1 333 1 22 1 11 4444444444 55555555555555555 1 1 1 2 11 22 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 333 4444444 22222 3333 6666666 1 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222 11 222 1 1 222 1 22 1 1 3333333 1 4 2 1 11 1 555555
lowQualScore : 1 33 7 5 888888 777 44 0000 0 0000 4 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 11 5 11 1 1 5 9 0 4 2 444444444444444444444444 33 3 4 7 5 99 0 000 55555555555555555555555555555 7 6 7 44444444444444 6 6 66666666666 0 1 55 6 888888 7 9 99999 6 777777 4 999999 7 6666 7 000 4 7 8 7 8 6 3 0 5 22 7 00 333333333333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 2 1 777 6 7 1 77777777 0 2222222222222222222 5 3 3 222222222 88 66 222222 1 66 2 9 44 6 9999 88 555 9999 3 22222222222222222222222222222 55 0 6 22 4 11 777 6 5 7 33333333333333 6 6 5 6 7 55 6 7 7 6 333 4 0 77 4 2 88 7 99 1111111111 1 0 33333333333333333 0 7 7 6 6 4 5 3 6 6 4 0 6 77 11 3 6 2 7 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 7 0 999 0000000 88 33333 7 1111 4 6 1111111 6 7 3 7 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 7 7777 0 111 4444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 2 0000 2 22 000 6 0 7 3 55 444 6 5 7 33 5 3 0 4444444 2 7 0 0 6 5 1 3 33 6 3 5 2 3 777777 4
lowQualScore : . .. . . ...... ... .. .... . .... . ....................................................................... . .. . .. . . . . . . . ........................ .. . . . . .. . ... ............................. . . . .............. . . ........... . . .. . ...... . . ..... . ...... . ...... . .... . ... . . . . . . . . . .. . .. ............ ................................................................................ ..... . . ... . . . ........ . ................... . . . ......... .. .. ...... . .. . . .. . .... .. ... .... . ............................. .. . . .. . .. ... . . . .............. . . . . . .. . . . . ... . . .. . . .. . .. .......... . . ................. . . . . . . . . . . . . . .. .. . . . . ..................................................... . . . ... ....... .. ..... . .... . . ....... . . . . . ............................................................................... . . .... . ... .... . ........................................................................................... . . .... . .. ... . . . . .. ... . . . .. . . . ....... . . . . . . . . .. . . . . . ...... .
lowQualScore : 2 00 0 5 555555 222 22 2222 2 8888 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 00 8 00 0 0 0 4 5 0 0 888888888888888888888888 88 7 7 7 0 88 2 222 77777777777777777777777777777 7 7 3 77777777777777 7 7 33333333333 7 0 77 0 333333 3 7 00000 0 555555 0 222222 3 7777 3 777 7 0 3 0 3 7 7 7 0 00 3 00 333333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00000 2 2 555 0 0 0 00000000 7 7777777777777777777 0 3 3 777777777 33 33 000000 7 00 0 0 33 0 3333 33 000 8888 5 22222222222222222222222222222 77 7 0 00 0 00 000 0 0 0 00000000000000 0 0 0 0 0 00 0 0 0 0 555 0 5 55 0 5 00 0 77 3333333333 0 7 33333333333333333 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 77 3 7 0 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 7 000 0000000 00 00000 3 3333 7 0 0000000 0 0 3 3 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 8 2222 7 777 2222 5 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 0 8888 5 22 000 5 5 3 3 33 333 0 0 7 33 7 3 7 7777777 0 0 7 0 7 0 0 2 88 0 2 0 2 2 000000 0
consensus : TCTCTGCGTACGTCCTTTAGTTACTAGGACCGTTTCATTGTTTCTTCTGCGACATCTA-CTCGTGGTGGTAAATTAACAATAGTCCATTAAGATATTTGCTGACTCTT-----------GT----A--C--------CAG------------CTTA--G----T--CCNCCT-------ATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATATTTCCACTCATGAAATATGTTCNATTAACTT---AGAA-A----C------GGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCGATTTTCCCTCC-GTTTTGTCAAAGAG----A-ATTT--CAAAT---------GTTACATCNTTACC-AATGGGCT-------GT-----TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATG-CA-TA---TGCTATATTGCTGCCTGACGGTGTCTNAGTATTTTCATTGTTATGG-TCC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCCTNGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAANATGTGTTGCTTTATTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGTTTT-CTANTGCTATAACTGTATAACGTTAATCTACTNAACTTTNAACTAAATTCAAAACC-T-TTCCT-ACCAGTCAAAC---------GTTGCTT--TC---------CT-----------TG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATCGGT-GAACCTG---TAAAAAGTACTT-AAAA-AA-AAAC-CCCTTGAGTTCTTTAGGA--TTGGTGCTCTCTCCATCNTTTAGCA-CTCCGTAGTCGGAGACTGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTA---CATANTAA----------NTAT-ACGGAC--GAACCAATTAATCGTAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACNGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAGCNTATTCANTTGTGTTTTTTTTCAGATNATATNTNNAAAATGGAATTT-CGTA--TACACG--TGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGACGTG-AGAAGATACAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCNAAGTATAATCCTNAAACATATTCAGNATTTTTCAGAACNATTTATAAATAAAAANAAGGC-CAAAGCATTCAACNAAATG-GTATA-TTGCAG---AAAAACGGTCA-TTTTTC-TGTTT-GGC-GCCACTTTGTCNCTTATTTAGACTT-TTGTACATGAATCAACCGTATNTTTTATTT-TT--TTACCCTNA--AACATGTCATNCAACTTACAA---CAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCGGATTACGTT-TAT--TATNACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGT--TAGTAAGAA---AT----GNATT---------TTCGGAC----TAA-CTC---------GCATTT-----------A-----TA---------A----T-------T-------AAAAATAATAC-CAAAGCATTC-GACA-AAATGCGTATATTTGCAGA-AAANATGTNA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACATGAATCAACCATAT-TTTTACTTTT-TTT-C-CTAAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAAT-AAATCTAACATTTTACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCNNTCCCTANCTCTGG
Reference ( gi|1 ) : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTA-TCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTATTGGCTCTT-----------GC----A--C--------CAG------------CTTA--G----T--CCAC---------ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGGTA-AATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAACTTC--GGAA-A----C------GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCCTTC-GTTTTGTCAAAGAA---TACATTT--TAAAT---------GTTACATCATTACC-AATGGACT-------TT-----TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGACAATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC-A---GTCTGATTTAGTT------CAATATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGTTTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGT-TTCCT-ATCAGTCAAAC---------GTTGCTT--TC---------CT-----------TG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATCGGTAGAACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAA-AA-AAAC-TCTTCAAATTCTTTAGGA--TTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTA---TATAATAA----------GTAT-ACAAAC--GAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTTCATA--TATACA--TGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTGACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTTGCAGGAAAAAAACAGTCA-TTTTTCTTATTTTGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGACTGGCTGTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-TTGATTACCCTTT--AACATGTCATACAGCTT---A---CAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAAATTGTAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCAT--TTGTAGGAA---AT----GGATT---------TT---------TAA-------------GCATTT-----------A-----TA---------A----T-------T-------AAAAATGATAC-CAAAGCATTT-AACA-AAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACCCTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTTACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACACCCTA----TATCTCTGGA
gi|2 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTA-CTCGTGGTGGTAAATAAACAGT-ATTCATTAACATATTTGCTGACTCTT-----------CC----A--A--------CAGCAAGTCATTCCACTTA--A----T--CCCC---------ATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGGTA-AATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCGCT------GA-T----C------GATTTCCCCTCCGTTT
gi|5 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGT-GGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTG--TCTTA----------GTGATGA--CTCCCCTGACAG-------------TTA--GGTATT--CCACTCAGAACCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAGTT-TATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAACTC-----AATA----CTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAAtgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|9 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaTATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTA-CTCGTGGTATTAAATTAAAAA-GGTCCATTAAGAAAT---TTGACTCTTCTACGGTGAAGGT----ATTC--------CA-------------CTCAGGG----T--CCACCT-------ATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATA-TTCCACtactt
gi|8 : cattttctactagttcacaaagtttcaatgtcataccgatatcctccgtactatagttttaaactcggtctacctgttaggaatccgttcaatgaacctgaggcaaaagttgtatataaaatggacctaatcatatgaaaacgccagaaaagagtttcaactttttgaaatcgtatagctgtttggccacatcgaacagtatagtattgttacatactcatcttttcataatTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTA-CTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGCTGACTCTT-----------AT----A--C--------CAG------------TTCA--G----T--TCAC---------ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAATATG--AGAA-A----T------GGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGCTCT-GTTTTGTCAAAGAG---GACATTT--TAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCT-------GT-----TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAATATGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCt
gi|4 : --C--------CA-------------CTTA--G----TGTCCTCCT-------GTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTA--TTCTGAGAA-ATCTTT------GGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTCTCT-GTTTTATCAAAAAAGTTCAAATTTGCCAAAT---------GTTACATCATTACCAAATGG-CT-------GT-----TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATA-CTA-----------TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCC-AGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTGTTT--CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACT-T-ATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTC---------CTGTCCTATAGTGTG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGCGAACCTG---TAAAAAGTATTTGAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAG--CTCTCTCCATATTTTAACA-CTTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTG----------ATATCACAAATTAGAA---A
gi|14 : atagataaatatc--G----T--CCTCCT-------ATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATATTTCccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|13 : attccactcagg--G----T--CCTCCT-------ATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATA-TCCCACactc
gi|16 : attccactcagg---------ATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGtt
gi|15 : taaatatttcactcaggtccctcctTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGATA-AATA-TTCCAC
gi|2 : attccactcagggtcctcctgGCTGATCGATTTCCCCTCC-GTTTTGCCAAA-------------------T---------GTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCCA-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCCTT---GTCTGATTTAATT------CAAAATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG-TTTG-TACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTT-TTT--------TCAACC---------GTTGCTT--CCTGGCTTTATCC-----------TG----------------------GCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGtc
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTTCTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA--TTCAACGCGTATTCCT-ACCAGTCAAAC---------GTTTCTT--TC---------TT-----------TGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGC------------AAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGG---------AATCATT--------TTA---------CTT---AA-AA-AAAC-CC---AGGCTCTTTAGGA--TTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCAGCT--GTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|7 : -----------TG----------------------GC------------AAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATCGGTGGAACCTG---TAAAAAGTACTTTAAAA-AA-AAACACCCTTGAGTTCTTTAGGA--TTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCA-CTCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--tactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgAAA--CTA---CATATTAA----------TTAT-ACTGAC--GAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGAATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAAGAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAA-TTTTTAGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTATATTTT--GG-------CGGCCA-TTTT---------------------ATCCCTGACTTAGACTTGTTGTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGTTTACCCTTA--ATCATGTCATACAACTTACAA---CAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATTATATATTAT--TATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGT--TAGTAGGAA---AT----GCATT---------TTCGGACTCGCCAT-------------ACATTT-----------AACCTCTAGAAACAAGCA----T-------TTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCC-AATA-AAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTACCCTT----------AAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTTAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAC--CTA---CATAATAATTTTTCAGAAGTAT-CCGAAC---AA---ATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|7 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTA---CATACTAA----------TTAC-ACAGTC--GGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAgacgt
gi|2 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggact--TAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGAATTTTCATA---A-ACT--TGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAAGA------------------TGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------TGCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTTGGTGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGACT---TGTGCATGAAATAACCATA-TTTTTATTTGTT--TTACCATAA--AACATGTCACGCAACTT---ACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--TACA-TGTATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGT--AAGTAAGAA---AT----ATATA---------TT---------TGAACTC---------ACATTTTACCTCTAGAAA-----TA---------AGTTTT-------T-------ATAAATAA-AT-GTAAGCATTC-AAC--AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTACACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTTGCTcg
gi|12 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtactAAATGGAATTT--GTA--TACACG--TGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATAGAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|6 : gTTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAG---AAAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTT-TTT-TTTATT-TCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAA---CAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT--GTT-TAT--TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTT--TAGTAAGAT---AT----GGATT---------
gi|10 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcaGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGT--TAGTAAAAA---AT----GGGGT---------TTCGGAC----TCA-------------GCA--T-----------A-----AA---------A----TTTGCCTCT-------AGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATA-GTAAATAcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttAAACGCCCCAACAGCCGTGATT-TAGAAATATATTTTCGGATTCACCATACATT---------TAACCTCTAGAAACAAGCATTT-----------A-----TA---------A----A-------T-------AAAAATAAGACACAAAG-ATTC-AAAT-AAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTTAaacaccccttaactctggg
gi|11 : caACGCCCCAACAGCCGT--TAGTAAGAA---AT----ATATT---------TT---------acactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|3 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttACTCGGCATGAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCGTTTGGAAATAAAAAGTAAATAAACACCCcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|6 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGc
gi|10 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACACCCCT----TAACTCTGG
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 33333333333 4444444444444444 11111 1111 1111111111111111 444444444444444444 11 1111111111111111111111 1 555555555555 55555555 111 333333 555 444444 111 111 22 1 1111 333333333 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 1111111 111 2 2222222 11 1 11 222222 111 11 2 2 22 1 333 1 5555555 333333333 555555555555555555555555555555555555555555 222222 222222 11 22222 1111 2222222 88888888888888888888888888888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 1 1 1 55555555555555 1 111 11 111111
lowQualScore : 0 2 4 3 2 0 3 3 88888888888 1111111111111111 99999 5555 55 7777777777777777 4 7 1 888888888888888888 11 222 1 3 8 1111111111111111111111 1 0 111111111111 1 66 44444444 777 2 44 111111 3 0 777 0 111111 1 0 333 0 3 777 55 0 1 2 4 2 4 2 1 55 0 9999 999 222222222 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 00000 3 3 9999999 777 3 3 0 4444444 44 0 1 33 2 6 1 0 3 33 1 1 1 8 888888 55 1 3 000 2 4 88 0 2 0 2 4 77 4 4 5 0 1 1 111 1 1 22 0 0000000 6 6 7 0 000000000 0 3 1 1 3 1 7 6 1 22 8 1 666666666666666666666666666666666666666666 8 999999 2 1 1 777777 4 77 22 8 44444 1 1 3 6 7777 2 0 6666666 1 77777777777777777777777777777777777777777777 99 1 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 6 00 8 0 2 0 1 44 0 2 1 4 0 0 66666666666666 3 2 8 5 6 777 0 11 0 0 888888 1
lowQualScore : . . . . . . . . ........... ................ ..... .... .. ................ . . . .................. .. ... . . . ...................... . . ............ . .. ........ ... . .. ...... . . ... . ...... . . ... . . ... .. . . . . . . . . .. . .... ... ......... .. ............................................................ ..... . . ....... ... . . . ....... .. . . .. . . . . . .. . . . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . . . ... . . .. . ....... . . . . ......... . . . . . . . . . .. . . .......................................... . ...... . . . ...... . .. .. . ..... . . . . .... . . ....... . ............................................ .. . . .......................................................................... . . .. . . . . . .. . . . . . . .............. . . . . . ... . .. . . ...... .
lowQualScore : 7 0 6 8 8 8 2 2 00000000000 4444444444444444 33333 6666 55 0000000000000000 4 3 0 222222222222222222 00 000 0 2 0 8888888888888888888888 0 0 222222222222 0 00 55555555 555 0 55 222222 2 2 777 7 777777 0 7 333 2 2 000 55 0 0 5 0 5 0 5 0 00 8 6666 888 000000000 00 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000 2 2 5555555 555 5 5 0 0000000 00 2 0 22 0 5 2 0 2 88 2 0 0 2 888888 00 0 0 000 5 0 00 0 5 0 5 0 55 0 0 0 7 0 0 333 0 0 00 0 5555555 5 5 0 2 000000000 8 2 0 0 7 0 3 7 0 44 0 0 888888888888888888888888888888888888888888 0 444444 8 4 0 444444 6 44 88 0 00000 0 0 8 7 0000 8 8 6666666 0 88888888888888888888888888888888888888888888 22 0 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 0 88 0 8 5 0 0 22 0 0 0 0 2 0 55555555555555 5 5 0 0 4 555 8 00 8 8 666666 0
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTT-----------NTA--CCAGC---TCAG----T--CC-------NC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-TN-AGAAAC-T-T--GGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG-C------A-ATTTG-C-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC---TTGTCTGATTTAATTCA----CAATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACT-TATTCCT-ACCAGTCAAAC---------GTTGCTT--TC---------CT-----------TGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAATCTACATANTAATTATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTA--TTTTTTCAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCATTTTT-CAT--N--TTT-GG--CGGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTACCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTCTA----CCAGATTA-AT-T-TATTATAACA--AATTTCNNNNNNNNNTGCATTTCGATATTTGGCGGCCATTTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGAC------------T------------AA-C-TCTAGAAACAAGCATTT-----------ATAA----T-------TAAAAATAATAC-CAAAGCATTC-AACA-AAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCATTTT-TCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTT-TTGTTTA-C--CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCNATCCCTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTACGTCCTTTAGTTACTAGGACCGTTTCATTGTTTCTTCTGCGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATAGTCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTT-----------GTA--CCAGC---TTAG----T--CC-------NC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCNATTAA-C-TT-AGAAAC------GGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCGATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAG---------A-ATTT--C-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATG-C----A-TA---TGCTATATTGCTGCCTGACGGTGTCTNAGTATTTTCATTGTTATGG-TCC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCCTNGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAANATGTGTTGCTTTATTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTANTGCTATAACTGTATAACGTTAATCTACTNAACTTTNAACTAAATTCAAAACC-T-TTCCT-ACCAGTCAAAC---------GTTGCTT--TC---------CT-----------TG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTTGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCNTTTAGCAC-TCCGTAGTCGGAGACTGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAATCTACATANTAANTATACGGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACNGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAGCNTATTCANTTGTGTTTTTTTTCAGATNATATNTNNAAAATGGA-ATTT-----CGTATACACGTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGACGTG-A-GAAGATACAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCNAAGTATAATCCTNAAACATATTCAGNATTTTTCAGAACNATTTATAAATAAAAANAAGGC-CAAAGCATTCAACNAAATG-GTATA-TT-GCAG---AAAAACGGTCATTTTT-C-T--G--TTT-GG--C-G-CCACTTTGTCNCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCGTATNTTTTATTT-T--T--TTACCCTNAAACATGTCATNCAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTCTA----CCGGATTACGT-T-TATTATNACA--AATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGAC------------T------------AA-C-TC---------GCATTT-----------ATAA----T-------TAAAAATAATAC-CAAAGCATTC-GACA-AAATGCGTATATTTGCAGA-AAANATGTNATTTT-TCATATTTTGGCGGCCGTTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACATGAATCAACCATAT-TTTTACTT-TT-TTT--C--CTAAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAAT-AAATCTAACATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCNNTCCCTANCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTATTG-----------GCTCTT-----------GCA--CCAGC---TTAG----T--CC-------AC---------ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCGGAAAC------GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT--------ACATTT--T-AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCCA----GTCTGATTTAGTTCA------ATATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGT-TTCCT-ATCAGTCAAAC---------GTTGCTT--TC---------CT-----------TG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAATCTATATAATAAGTATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTA--TTTTTTCAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCATTTTT-C-TTAT--TTT-GG--TGG-TCATTTAGTCCCATACTTAGACTGG-CT-GTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTACCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-TA----CCAGATTAAAT-TGTATNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTT-----------------T------------AA--------------GCATTT-----------ATAA----T-------TAAAAATGATAC-CAAAGCATTT-AACA-AAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCATTTT-TCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTC-TTGTTTACC--CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACACCCTA----TATCTCTGG
gi|10 : GT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGAC------------T------------CA--------------GCA--T-----------AAAA----TTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATa
gi|10 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggattt---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACACC----CCTTAACTCTGGagtaaataaacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGAC------------acgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCCTTacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT------GTATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTa
gi|13 : gG----T--CC-------TC-------CTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attccactcaggG----T--CC-------TC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attccactcaggG----T--CC-------TC-------CTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attccactcagg--CC-------TC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcactcaggtcTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGCTG-----------ACTCTT-----------CCA--ACAGCAAGTCAT----T--CCACTTAATCC-------CCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-T----GATC------GATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA-------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC---TTGTCTGATTTAATT------CAAAATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACC-T-TTTT-------TCAACC---------GTTGCTT--CCTGGCTTTATCC-----------TG----------------------GCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----T-CATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTC-T--TATTTT-GG--T-GGCCACTTTGTCTCTTATTTAGACT-T----GTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTACCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--TACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTG----------------------------AA-C-TC---------ACATTTTACCTCTAGAAATAAGTTTT-------TATAAATAA-AT-GTAAGCATTC-AACA-AA-TGCGTATATTTGCA---AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATT-TTTA-CA-CTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCG-TATTCCT-ACCAGTCAAAC---------GTTTCTT--TC---------TT-----------TGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGC------------AAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTTTA----------------------------CTT-AAAAAAA-------CCC--AGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCAG--CTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAACTACATATTAATTATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTA--TTTTTTCAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTATA-T----------------------------------TTT-GG--CGG-CCATTTTATCCCTGACTTAGACT-TGTT-GTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTACCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTCTA----CCAGATTATATAT-TATTATANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACTCGCCATACATTT------------AACC-TCTAGAAACAAGCATTT-----------ATAA----A-------TAAAATTGATAC-CAAAGCATCC-AATA-AAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT-TTTT-TCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC-----------C--CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTTTTTTT-CAT--A--TTTTGG--C-GGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAAT-TATT-GTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTACCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTCTA----TCAGATTA--T-A-TATTATAACA-----------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCATTTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGAC------------T------------actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacATTTTCGGACTCGGCATGAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCGTTTGGAAATAAAAAGTAAATAAACACCCcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatgg--CCA-C---TTAG----TGTCC-------TC-------CTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-TG-AGAAATCTTT--GGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA----A-ATTTGCC-AAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCC-AGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACT-T-ATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTC---------CTGTCCTATAGTGTG----------------------GC------------AAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATAc
gi|4 : atagataaatatcAACCTACATAATAATTTTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTctgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCC-----------CTG--ACAG----TTAGGTATT--CC-------ACTCAGAACCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-TC-A-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGAT------------TCACCATACATTTAA-CCTCTAGAAACAAGCATTT-----------ATAA----A-------TAAAAATAAGACACAAAG-ATTC-AAAT-AAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAATTTT-TCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTT-TTATTT--CCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAATTTTT-CAT--G--TTT-GGGCC-G-CCATTTTGTCACTTATTTCGACT-T-TTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTT-T--TATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTCTA----TCAGATT--GT-T-TATTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGAC------------acactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACT-TATTAAT-TCTAGTCAAGC---------TTTGCTC--TC---------CT-----------TGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGC------------AAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT
gi|7 : TACATACTAATTACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTT-----------ATA--CCAGT---TCAG----T--TC-------AC---------ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TATG-AGAAAT------GGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGGACATTTTAA-ATTTG-CGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAA-GGTCCATTAAGAAATTTG--------------ACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCA-C---TCAGGG--T--CC-------AC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 222222222222 11111 22 1111111111111111 44444444444444444 11 999999999999999999999 1 555555555555 222222 111 11 2222 55555 333 111 22 1 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 2222 111 11111 22 33333 11 11111 1111 1111 33333333 55555555555555555555 111111 666666666666666666666666666666666666666666 22222222 1 1 11 1 111 1 222222222222 1 111 11 2222222
lowQualScore : 0 3 8 0 88888888888 1 555555555555 22222 55 22 777 7777777777777777 4 7 1 77777777777777777 11 222 1 1 8 333333333333333333333 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 11111 7 333 0 3 777 55 0 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 5 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 0000 444 1 1 44 44 66666 8 33 1 33333 44 88 8 33333 7777 1 3 6 7777 0 66666666 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 333333333333333333333333333333333333333333 99999999 1 8 6 3 0 2 00 3 0 1 333 1 1 0 0 555555555555 1 1 8 5 3 000 1 3 33 3 3 2222222
lowQualScore : . . . . ........... . ............ ..... .. .. ... ................ . . . ................. .. ... . . . ..................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ..... . ... . . ... .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . .... ... . . .. .. ..... . .. . ..... .. .. . ..... .... . . . .... . ........ .................... . .. . . ...... .. . . . .......................................... ........ . . . . . . .. . . . ... . . . . ............ . . . . . ... . . .. . . .......
lowQualScore : 7 8 0 8 00000000000 0 666666666666 11111 55 00 000 0000000000000000 4 3 4 66666666666666666 00 000 0 0 0 888888888888888888888 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 77777 3 000 2 2 000 55 0 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 6666 000 0 0 22 22 44444 0 22 4 44444 44 88 0 00000 0000 4 8 7 0000 8 66666666 44444444444444444444 5 11 4 1 444444 99 1 0 1 555555555555555555555555555555555555555555 00000000 8 0 8 0 0 5 00 2 0 2 555 0 0 2 0 000000000000 0 0 0 0 6 000 0 2 88 2 2 8888888
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTCTAC------------CAGC---TCA--GG-T---CC-------NC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-TG-AGAAAC-T--TTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAA-G-C-C----AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTCNT--ATTT-GGC-GGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGA------------C-CA-C-------T-------AAA-TT---CTCTAGAAACAAG--------CGTTTATAAATAAAAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC-A-CCCTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTNTAC------------CAGC---TCA--G--T---CC-------NC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-TN-AGAAAC----TTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAA-G-C------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA----CAATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATANTAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTCAT--NTTT-GGCGGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGA------------C------------T-------AA-------CTCTAGAAACAAG--------CATTTATAATTAAAAA-TAATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTGTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCNATCCCTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTATTG-----------GCTCTTGCAC------------CAGC---TTA--G--T---CC-------AC---------ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCGGAAAC------GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAATA-C------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA------ATATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCATTTTTCTT--ATTT-TGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGAC-TGG-CTGTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAA-AT-TGTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTT-------------------------------------------------------TAAG--------CATTTATAATTAAAAA-TGATAC-CAAAGCATTTAACAAAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACACCCTA----TATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGA------------CTCAGCA------T-------AAAATTTGCCTCTAGAAATAAa
gi|10 : tattataaca---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACACC----CCTTAACTCTGGttctcaaaccttttggacataaatagtaaataaacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGA------------CACAGCA------T-------AAAATTTACCTCTAGAAACAacgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCgtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTctta
gi|13 : gC------------CA-C---TCA--GGGT---CC-------TC-------CTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attC------------CA-C---TCA--GGGT---CC-------TC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attC------------CA-C---TCA--GGGT---CC-------TC-------CTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attC---TCA--GGTC---CC-------TC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcaTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGCTG-----------ACTCTTCCAA------------CAGCAAGTCA--T--T---CCACTTAATCC-------CCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-TG-A---------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTT-GGT-GGCCACTTTGTCTCTTATTTAGAC-----TTGTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--T-ACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAA------------CTCACATTT----T-------AC-------CTCTAGAAATAAG--------TTTTTATAAATAAATG-T--------AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTATA-T-------------------------------TTT-GGC-GGCCATTTTATCCCTGACTTAGAC-T-TGTTGTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATT-ATATAT-TATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGA------------CTCGCCATACATTT-------AAC------CTCTAGAAACAAG--------CATTTATAAATAAAAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTTTTTTTCAT--ATTTTGGCGG-CCGTTTAGTCCATTATTTAGAA-T-TATTGTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATT---AT-A-TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGA------------C------------TCGGCATGAAATTTGC-CTCTAGAAACAAGTCTCAAACCGTTTGGAAATAAAAAGTAAactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaac--G--T---CC-------TC-------CTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-TG-AGAAATCT--TTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAA-G-TTCA---AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcccacttagtAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTGA------------CAGT---TAG--G--TATTCC-------ACTCAGAACCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-TC-A-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATTCACCATACATT------------T-------AAC------CTCTAGAAACAAG--------CATTTATAAATAAAAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAATTTTTCAT--GTTT-GGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTT-T-TTGTACTTAAATCAACTATATATTTT--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT---GT-T-TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGA------------C------------acactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTATAC------------CAGT---TCA--G--T---TC-------AC---------ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TATG-AGAAA------TGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAG-GACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATT---TG-----------ACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCAC---TCAGGG--T---CC-------AC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 222222222222 11111 11111 22222222222222222 444444444444444444 11 8888888888888888888888 1 555555555555 222222 111 11 2222 33333333 333 111 22 1 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 2222 111111111111111 1 2222 11 11111 1111 1111 33333333 55555555555555555555 111111 22222222222222222222222 1111111 44444444 11111 1 11 1 111 1 2222 1 111 11 4444
lowQualScore : 0 3 8 0 88888888888 222222222222 44444 77777 777 11111111111111111 4 7 1 777777777777777777 11 222 1 1 8 3333333333333333333333 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 99999999 333 0 3 777 55 0 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 3 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 0000 555555555555555 3 6 8 8 1 5555 8 44 88 8 33333 7777 1 3 6 7777 0 66666666 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 77777777777777777777777 6666666 11111111 7 44444 5 5 3 0 2 00 3 0 1 333 1 1 0 0 99999 3333 1 1 8 5 3 000 1 3 33 3 3 5555 3
lowQualScore : . . . . ........... ............ ..... ..... ... ................. . . . .................. .. ... . . . ...................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ........ ... . . ... .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . .... ............... . . . . . .... . .. .. . ..... .... . . . .... . ........ .................... . .. . . ...... .. . . . ....................... ....... ........ . ..... . . . . . .. . . . ... . . . . ..... .... . . . . . ... . . .. . . .... .
lowQualScore : 7 8 0 8 00000000000 888888888888 22222 55555 000 00000000000000000 4 3 4 666666666666666666 00 000 0 0 0 2222222222222222222222 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 00000000 000 2 2 000 55 0 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 6666 666666666666666 8 0 0 0 4 4444 0 44 88 0 00000 0000 4 8 7 0000 8 66666666 44444444444444444444 0 11 4 1 444444 99 1 0 1 99999999999999999999999 2222222 44444444 6 33333 7 7 2 0 5 00 2 0 2 555 0 0 2 0 00000 0000 0 0 0 0 6 000 0 2 88 2 2 3333 7
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G-T---CC-------N-C-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG--AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTT-GG-CGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCAC--NAA----ATTTGCCCTCTAGAAA-------CAAG--------CNTTT-----ATAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G-T---CC-------N-C-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG--CC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTA-TTT-GG-CGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGAC----CAC--TAA----ATT----CTCTAGAAA-------CAAG--------CGTTT-----ATAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCA--CCCTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTATTG-----------GCTCTTGCAC------------CAGC---TTA-G---T---CC-------A-C---------ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCG-GAAA---C---GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT--AC------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA-----A-TATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCA-TTTTTCTTATTTT-GG-TGGTCATTTAGTCCCATACTTAGACTGG-CT-GTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAA-AT-TGTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTT--------------------------------------------TAAG--------CATTT-----ATAATTAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTTAACAAAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACACC----CTATATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGACTCAGCAT--AAA----ATTTGC-CTCTAGAAATAATTCTCAAA--------CCTTTTGGACATAAATAGTAAA-TAAa
gi|10 : tattataaca---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACACC----CCTTAACTCTGGacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGACACAGCAT--AAA----ATTTAC-CTCTAGAAA-------CAacgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCCgtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTctta
gi|13 : gC------------CA-C---TCA-G-GGT---CC-------T-C-------CTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attC------------CA-C---TCA-G-GGT---CC-------T-C-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attC------------CA-C---TCA-G-GGT---CC-------T-C-------CTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attC---TCA-G-G-T---CC-------CTC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcaTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGCTG-----------ACTCTTCCAA------------CAGCAAGTCA---T-T---CCACTTAATC-C-------CCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-T--GA---------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA-------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTT-GG-TGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGAC----TT-GTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--T-ACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAACT---CAC---------ATTTTACCTCTAGAAA-------TAAG--------TTTTT-----ATAAAT---AAA-TG-T-----AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTATA-T-------------------------------TTT-GG-CGGCCATTTTATCCCTGACTTAGACT-TGTT-GTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATT-ATATAT-TATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACT---CGCCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------CAAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTT-TTTTTCATA-TTTTGG-CGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAAT-TATT-GTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATT-A--T-A-TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGACTCGGCAT--GAA----ATTTGC-CTCTAGAAA-------CAAGTCTCAAACCGTTT-----GGAAATAA-AAA-actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacC------------CA-C---TTA-GTG-T---CC-------T-C-------CTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-T--GAGAAAT--CTTTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA------AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAgtaaataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTGA------------CAGT---T-A-G-G-TATTCC-------A-CTCAGAACCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-T--CA-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATT---CACCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------CAAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAA-TTTTTCATG-TTT-GGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACT-T-TTTGTACTTAAATCAACTATATATTTT--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT---GT-T-TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGACG---CAG--CAAAACTATTTGC-CTCTATAAA-------CAAGTCTCAAACCTTTT-----AGACATAA-AAAGTGAacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGcgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTATAC------------CAGT---TCA---G-T---TC-------A-C---------ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TAT--GAGAAA------TGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGG--ACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATT---TG-----------ACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCAC---TCAGG-G-T---CC-------A-C-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
Alignments
lowQualScore : 33333333333 22222222222222222222222222222 333333333 444444444444444444 11 88888888888888888888888 1 555555555555 222222 111 11 2222 33333333 333 111 22 1 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 222222 111111111111111 33333 11 11111 1111 1111 33333333 55555555555555555555 111111 333333333333 33 44444444444444444444444444 11111 1 11 1 111 1 2222 1 111 11 1 111
lowQualScore : 0 3 8 0 88888888888 55555555555555555555555555555 111111111 4 7 1 777777777777777777 11 222 1 1 8 11111111111111111111111 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 99999999 333 0 3 777 55 0 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 3 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 666666 555555555555555 3 1 33333 44 88 8 33333 7777 1 3 6 7777 0 66666666 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 3 888888888888 22 66666666666666666666666666 2 22222 3 0 5 5 3 0 2 00 3 0 1 333 1 1 0 0 99999 3333 1 1 8 5 3 000 1 3 33 3 3 5 777 1
lowQualScore : . . . . ........... ............................. ......... . . . .................. .. ... . . . ....................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ........ ... . . ... .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . ...... ............... . . ..... .. .. . ..... .... . . . .... . ........ .................... . .. . . ...... .. . . . . ............ .. .......................... . ..... . . . . . . . .. . . . ... . . . . ..... .... . . . . . ... . . .. . . . ... .
lowQualScore : 7 8 0 8 00000000000 33333333333333333333333333333 000000000 4 3 4 666666666666666666 00 000 0 0 0 55555555555555555555555 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 00000000 000 2 2 000 55 0 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 666666 666666666666666 8 4 44444 44 88 0 00000 0000 4 8 7 0000 8 66666666 44444444444444444444 0 11 4 1 444444 99 1 0 1 4 111111111111 99 11111111111111111111111111 8 55555 2 1 0 0 2 0 5 00 2 0 2 555 0 0 2 0 00000 0000 0 0 0 0 6 000 0 2 88 2 2 0 555 0
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCA-NNAA---ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCA-CNAA---ATTTGCCCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ATAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTAT-----------TGGCTCTTGCAC------------CAGC---TTA-G-----TCC-------A-C--ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCG-GAAA---C---GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT---AC------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA-----A-TATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCA-TTTTTCTTATTTTGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGAC-TGG-CTGTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAA-AT-TGTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTTTAAGC--------------ATTT-----------A-------T-------AA------------TT-----AAAAA--------TGATAC-CAAAGCATTTAACAAAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACA-CC---CTATATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGACTCAGCA-TAAA---ATTTG-CCTCTAGAAATAATTCTC-------AAA--------CCTTTTGGACATAAATAGTAAA-TAAa
gi|10 : tattataaca---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACA-CC---CCTTAACTCTGGacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGACACAGCA-TAAA---ATTTA-CCTCTAGAAA-------CAGTCTCAAAC--------CTTTT-----GGACATAA-AAA-acgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---Cgtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTtta
gi|13 : gC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attC---TCA-G-G---TCC-------CTCCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcaTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGC-----------TGACTCTTCCAA------------CAGCAAGTCA---T---TCCACTTAATC-CCCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-T--GA---------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA--------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTTGGTGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGAC-----TTGTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--T-ACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAACTC-AC---------ATTTTACCTCTAGAAA-------T-------AAG--------TTTTT-----ATAAAT---AAA-TG-T-----AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTA--------------------------------TATTTTGGCGGCCATTTTATCCCTGACTTAGAC-T-TGTTGTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATT-ATATAT-TATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACTC-GCC-ATAC---ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTT-TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAA-T-TATTGTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATT---AT-A-TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGACTCGGCA-TGAA---ATTTG-CCTCTAGAAA-------C-------AAGTCTCAAACCGTTT-----GGAAATAA-AAA-actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacC------------CA-C---TTA-GTG---TCC-------T-CCTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-T--GAGAAAT--CTTTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA-------AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAgtaaataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTGA------------CAG----TTA-G-GTATTCCACTCAGAA-CCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-T--CA-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATTC-ACC-ATAC---ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTT-T-TTGTACTTAAATCAACTATATATTTT--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT---GT-T-TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGA--C-GCAGCAAAACTATTTG-CCTCTATAAA-------C-------AAGTCTCAAACCTTTT-----AGACATAA-AAAGTGAacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGcgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTATAC------------CAGT---TCA---G---TTC-------A-C--ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TAT--GAGAAA------TGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGG---ACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATT--------------TGACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCAC---TCAGG-G---TCC-------A-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
Alignments
lowQualScore : 33333333333 22222222222222222222222222222 333333333 444444444444444444 11 88888888888888888888888 1 555555555555 222222 111 11 2222 33333333 333 111 22 1 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 222222 111111111111111 33333 11 11111 1111 1111 33333333 55555555555555555555 111111 333333333333 22 44444444444444444444444444 11111 1 11 1 111 1 2222 1 111 11 1 111
lowQualScore : 0 3 8 0 88888888888 55555555555555555555555555555 111111111 4 7 1 777777777777777777 11 222 1 1 8 11111111111111111111111 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 99999999 333 0 3 777 55 0 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 3 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 666666 555555555555555 3 1 33333 44 88 8 33333 7777 1 3 6 7777 0 66666666 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 3 111111111111 22 66666666666666666666666666 2 22222 1 0 5 5 3 0 2 00 3 0 1 333 1 1 0 0 99999 3333 1 1 8 5 3 000 1 3 33 3 3 5 777 1
lowQualScore : . . . . ........... ............................. ......... . . . .................. .. ... . . . ....................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ........ ... . . ... .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . ...... ............... . . ..... .. .. . ..... .... . . . .... . ........ .................... . .. . . ...... .. . . . . ............ .. .......................... . ..... . . . . . . . .. . . . ... . . . . ..... .... . . . . . ... . . .. . . . ... .
lowQualScore : 7 8 0 8 00000000000 33333333333333333333333333333 000000000 4 3 4 666666666666666666 00 000 0 0 0 55555555555555555555555 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 00000000 000 2 2 000 55 0 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 666666 666666666666666 8 4 44444 44 88 0 00000 0000 4 8 7 0000 8 66666666 44444444444444444444 0 11 4 1 444444 99 1 0 1 4 000000000000 00 11111111111111111111111111 8 55555 0 1 0 0 2 0 5 00 2 0 2 555 0 0 2 0 00000 0000 0 0 0 0 6 000 0 2 88 2 2 0 555 0
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCANNAA----ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCANNAA----ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTAT-----------TGGCTCTTGCAC------------CAGC---TTA-G-----TCC-------A-C--ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCG-GAAA---C---GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT---AC------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA-----A-TATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCA-TTTTTCTTATTTTGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGAC-TGG-CTGTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAA-AT-TGTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTTTAAGC--------------ATTT-----------A-------T-------AA------------TT-----AAAA-------A-TGATAC-CAAAGCATTTAACAAAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACA-CC---CTATATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGACTCAGCATAAA----ATTTG-CCTCTAGAAATAATTCTC-------AAA--------CCTTTTGGACATAAATAGTAAA-TAAa
gi|10 : tattataaca---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACA-CC---CCTTAACTCTGGacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGACACAGCATAAA----ATTT-ACCTCTAGAAA-------CAGTCTCAAAC--------CTTTT-----GGACATAA-AAA-acgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---Cgtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTtta
gi|13 : gC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attC---TCA-G-G---TCC-------CTCCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcaTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGC-----------TGACTCTTCCAA------------CAGCAAGTCA---T---TCCACTTAATC-CCCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-T--GA---------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA--------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTTGGTGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGAC-----TTGTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--T-ACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAACTC-AC---------ATTTTACCTCTAGAAA-------T-------AAG--------TTTTT-----ATAAAT---AAA-TG-T-----AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTA--------------------------------TATTTTGGCGGCCATTTTATCCCTGACTTAGAC-T-TGTTGTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATT-ATATAT-TATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACTC-GCCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTT-TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAA-T-TATTGTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATT---AT-A-TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGACTCGGCATGAA----ATTTG-CCTCTAGAAA-------C-------AAGTCTCAAACCGTTT-----GGAAATAA-AAA-actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacC------------CA-C---TTA-GTG---TCC-------T-CCTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-T--GAGAAAT--CTTTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA-------AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAgtaaataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTGA------------CAG----TTA-G-GTATTCCACTCAGAA-CCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-T--CA-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATTC-ACCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTT-T-TTGTACTTAAATCAACTATATATTTT--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT---GT-T-TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGA--C-GCAGCAAAACTATTTG-CCTCTATAAA-------C-------AAGTCTCAAACCTTTT-----AGACATAA-AAAGTGAacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGcgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTATAC------------CAGT---TCA---G---TTC-------A-C--ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TAT--GAGAAA------TGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGG---ACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATT--------------TGACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCAC---TCAGG-G---TCC-------A-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
Alignments
lowQualScore : 33333333333 22222222222222222222222222222 333333333 444444444444444444 11 88888888888888888888888 1 555555555555 222222 111 11 2222 33333333 333 111 22 1 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 222222 111111111111111 33333 11 11111 1111 1111 33333333 55555555555555555555 111111 333333333333 22 44444444444444444444444444 11111 1 11 1 111 1 2222 1 111 11 1 111
lowQualScore : 0 3 8 0 88888888888 55555555555555555555555555555 111111111 4 7 1 777777777777777777 11 222 1 1 8 11111111111111111111111 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 99999999 333 0 3 777 55 0 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 3 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 666666 555555555555555 3 1 33333 44 88 8 33333 7777 1 3 6 7777 0 66666666 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 3 111111111111 22 66666666666666666666666666 2 22222 1 0 5 5 3 0 2 00 3 0 1 333 1 1 0 0 99999 3333 1 1 8 5 3 000 1 3 33 3 3 5 777 1
lowQualScore : . . . . ........... ............................. ......... . . . .................. .. ... . . . ....................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ........ ... . . ... .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . ...... ............... . . ..... .. .. . ..... .... . . . .... . ........ .................... . .. . . ...... .. . . . . ............ .. .......................... . ..... . . . . . . . .. . . . ... . . . . ..... .... . . . . . ... . . .. . . . ... .
lowQualScore : 7 8 0 8 00000000000 33333333333333333333333333333 000000000 4 3 4 666666666666666666 00 000 0 0 0 55555555555555555555555 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 00000000 000 2 2 000 55 0 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 666666 666666666666666 8 4 44444 44 88 0 00000 0000 4 8 7 0000 8 66666666 44444444444444444444 0 11 4 1 444444 99 1 0 1 4 000000000000 00 11111111111111111111111111 8 55555 0 1 0 0 2 0 5 00 2 0 2 555 0 0 2 0 00000 0000 0 0 0 0 6 000 0 2 88 2 2 0 555 0
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCANNAA----ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCANNAA----ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTAT-----------TGGCTCTTGCAC------------CAGC---TTA-G-----TCC-------A-C--ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAA-C-TTCG-GAAA---C---GGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT---AC------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA-----A-TATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAACAGTCA-TTTTTCTTATTTTGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGAC-TGG-CTGTACATGAATCAACCTTA-ATTTTACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAA-AT-TGTATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTTTAAGC--------------ATTT-----------A-------T-------AA------------TT-----AAAA-------A-TGATAC-CAAAGCATTTAACAAAATGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACA-CC---CTATATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGACTCAGCATAAA----ATTTG-CCTCTAGAAATAATTCTC-------AAA--------CCTTTTGGACATAAATAGTAAA-TAAa
gi|10 : tattataaca---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACA-CC---CCTTAACTCTGGacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGACACAGCATAAA----ATTT-ACCTCTAGAAA-------CAGTCTCAAAC--------CTTTT-----GGACATAA-AAA-acgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|11 : acacttaaaagtgttaagAAG-AAAT---ATATTTTCGGACACAGCATAAA--ATTTACCTCTAGAAACA-GTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---Cgtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagatttatatttgttttgttgttacgccccaacagccgttagtAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTtta
gi|13 : gC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : attC------------CA-C---TCA-G-GG--TCC-------T-CCTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : attC---TCA-G-G---TCC-------CTCCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttcaTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGC-----------TGACTCTTCCAA------------CAGCAAGTCA---T---TCCACTTAATC-CCCATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATTCG-C-T--GA---------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA--------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG---AAAAACAGTCATTTTTTCTTATTTTGGTGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGAC-----TTGTGCATGAAATAACCATAT-TTTTATTTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGG--T-ACAT-G-TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAACTC-AC---------ATTTTACCTCTAGAAA-------T-------AAG--------TTTTT-----ATAAAT---AAA-TG-T-----AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTT---GCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTA--------------------------------TATTTTGGCGGCCATTTTATCCCTGACTTAGAC-T-TGTTGTACATGAATCAA--GTATGTTTTACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATT-ATATAT-TATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACTC-GCCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTT---Atactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG---ATATATATTTT-TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAA-T-TATTGTACAGGAATCAACCATAT----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATT---AT-A-TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGACTCGGCATGAA----ATTTG-CCTCTAGAAA-------C-------AAGTCTCAAACCGTTT-----GGAAATAA-AAA-actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacC------------CA-C---TTA-GTG---TCC-------T-CCTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTC-T--GAGAAAT--CTTTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA-------AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTG--TTT-CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAgtaaataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTGA------------CAG----TTA-G-GTATTCCACTCAGAA-CCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAA-C-T--CA-ATACTTCTTTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATTC-ACCATAC----ATTTAACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTT---Atactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG---AAAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTT-T-TTGTACTTAAATCAACTATATATTTT--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATT---GT-T-TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGA--C-GCAGCAAAACTATTTG-CCTCTATAAA-------C-------AAGTCTCAAACCTTTT-----AGACATAA-AAAGTGAacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaac---ACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGcgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTATAC------------CAGT---TCA---G---TTC-------A-C--ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAA-TAT--GAGAAA------TGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGG---ACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATT--------------TGACTCTTCTACGGTGAAGGTATTCCAC---TCAGG-G---TCC-------A-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT
blockSeqs : C . TGTCTTAGTGA GGTGAAGGTATTCCACTCAGGG ACTTAATC T T A TCTGAGAAATCTT CC TGC C G A GAGGACATTTTAAATTTGCG C T TTGGTTTCTGCA G CA C AATAA . TA T C TA T AGTT TTGACAAT TTA T ACT TA . C C A G A C AA T C A C G G A ATTTT T TC AGGCG . A T ATACACC C A T T A GA GC T G AGTATC CC T AAA G T TC . C . C T . T A G G TT . ATATAATT C G A TGTATA T T T C A A A A TATTT AAAAACAGTCAT T T TTG TG AT G CGT TTTC A A T TATA ATATAT ACACAAATTTCNNNNNNNNN A AA G CTTGGA GA G T GCAGCAAAACT TA CAAGTCTCAAAC C TGGAC T T G A A C TA A T G CAT G A A TTATT ACA A C . C T CGG T T CT A A C GAT T
blockSeqs : T . . CAGCAAGTCAT ACTCAGAA . T A CTCAATACTTCTT . CAT A G . AAAGTTCAAATTTGCC A . . A CT A A . AT A A . T TT AA . T A . . T A T T T C CA A T A T C C T . G TA GGTGG . A . AACAC C G T . A . . A . . CA C . . GT A T A CATGAA T C T . A . C C TAATT ATATATATTTT A T TTA TA AC . T . T A . . ACATG NNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN N . . T A AGCATAAA AA CAAGTCTCAAAC T . G . . A . C AT A . T AA A A . TTTTA CCT A A . C C . A T . A A C . C
blockSeqs : T . . CAGTTAGGTAT CT . T T TATGAGAAA . AAG T T . . T . . C . . . . TC . C . . . . . . A C A G A . TT A A T T T T G . G . . . . . . . . A . . . . A . . CC . TC A T . . . T . A T T AAAAAGTGTAA A A TTT T . . T . T G . . ATA NNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN N . . T T AGCATAAA AA TAATTCTCAAA T . T . . . . . C . . A T T T . . C T C . G T . T . . . . . .
blockSeqs : . . . CACTCAGGG T . T T CTGAT . TGA A . A . . T C C T . A . C . A . T . . . . T . T . . T . A A . . GTT ACA C CG G . . C T GGCATGAA G CAGTCTCAAAC A . T . . . . . . G
blockSeqs : CACTCAGGG T . T . N NN N . . G T GCCATAC A TAAG G . G . . .
blockSeqs : CACTCAGGG T . . . . . . T T ACCATAC G CAAG A . T . . .
blockSeqs : CACTTAGTG T . . G . AC G CAAG T . G . .
blockSeqs : CAGTTCAG A . .
blockSeqs : A
blockSeqCons : CACTCAGGG******************** CNCGAAT*********** AAAT*********** ** T**** ATA***** AGCATAAA**** G* CAAGTCTCAAA***************
originalCons : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTAC------------CAGC---TCA-G-G---TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAA-C-T--GAGAAA---CTTTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG---AAAAACAGTCA-TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTTACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATT-A-AT-T-TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTC-GCANNAA----ATTTGACCTCTAGAAA-------C-------AAG--------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
finalCons : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGC-----------TGACTCTTCTACCACTCAGGG--------------------TCC-------N-CCTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAACNCGAAT-----------TGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAGAAAT-----------TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGAC-T-T-TTGTACATGAATCAACCATATATTTT--TT-TT----TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATTATA-----TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTCAGCATAAA----ATTTG-CCTCTAGAAACAAGTCTCAAA---------------CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTT---ACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 333333333333333333333333333 11111111 666666666666666 11 88888888888888888888888 1 555555555555 222222 111 11 2222 33333333 333 111 11 11 22222 2222222 111 2 22222222 11 1 11 11 222222 11 1 1 11 1 11 1 44444444 2222222 2222222222222222222222222222222222 222222 2222222222222 1111 1111 22222222 55555555555555555555 111111 33333333 1111111 3333333333333333333 1 111 1 2222 1 1 11 222222
lowQualScore : 0 3 8 3 88888888888 999999999999999999999999999 8 7777 1 88888888 4 7 1 11 111111111111111 11 222 1 1 8 11111111111111111111111 1 0 111111111111 1 66 3 888888 777 11 9 1 33 3 0 5555 99999999 333 0 3 777 33 33 1 1 1 1 1 2 0 11 0 1 8 1 0 3 3 3 3 00000 1 66 3333333 777 3 0 44444444 0 0 22 6 4 0 3 33 11 1 8 888888 55 0 1 333 1 1 88 5 1 5 1 1 88 1 1 5 1 88 0 00000000 1 1 7 0 0 8888888 0 3 1 7 6 1 8 1 8 4444444444444444444444444444444444 3 1 777777 99 9999999999999 7777 1 3 6 7777 11111111 11111111111111111111 1 99 3 0 666666 77 0 1 0 2 777777777 11 00000000 1 6666666 5 55 9999999999999999999 3 0 1 333 1 1 0 0 99999 3333 1 1 0 9 7 88 0 7 666666 1
lowQualScore : . . . . ........... ........................... . .... . ........ . . . .. ............... .. ... . . . ....................... . . ............ . .. . ...... ... .. . . .. . . .... ........ ... . . ... .. .. . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... . .. ....... ... . . ........ . . .. . . . . .. .. . . ...... .. . . ... . . .. . . . . . .. . . . . .. . ........ . . . . . ....... . . . . . . . . . .................................. . . ...... .. ............. .... . . . .... ........ .................... . .. . . ...... .. . . . . ......... .. ........ . ....... . .. ................... . . . ... . . . . ..... .... . . . . . .. . . ...... .
lowQualScore : 7 8 0 2 00000000000 222222222222222222222222222 0 1111 0 00000000 4 3 4 88 222222222222222 00 000 0 0 0 55555555555555555555555 0 0 222222222222 0 00 0 222222 555 22 8 0 88 2 2 3333 00000000 000 2 2 000 22 22 2 0 0 0 0 5 2 22 8 4 2 0 8 8 2 2 8 00000 0 22 0000000 555 5 0 22222222 2 2 55 5 2 0 2 88 00 0 0 888888 00 7 0 000 0 0 00 0 0 5 0 0 55 0 0 0 0 33 0 00000000 0 0 0 2 8 8888888 8 2 0 3 7 4 0 0 8 8888888888888888888888888888888888 8 4 444444 88 4444444444444 0000 4 8 7 0000 22222222 44444444444444444444 0 11 4 1 444444 99 1 0 1 5 666666666 66 11111111 0 1111111 0 44 7777777777777777777 2 0 2 555 0 0 2 0 00000 0000 0 0 0 2 3 33 7 3 777777 0
consensus : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTCTA-------------C-------------CA-CTCAGGG--TCCNC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAACNC--GA-A------TCGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG-----AAAAA--G---TA------TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCATATATTT-TACTT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATTA---TG---TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTCAGCA--TAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCNTTT-----ATAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAAN-AAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAACATTTTACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACA-CC---CCNTATCTCTGG
Reference ( family-455 ) : TCTCTGCGTATGTCCTTTAGTTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAACAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTCTA-------------C-------------CA-CTCAGGG--TCCNC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGG-TAAATATTTCCACTCATGAAATATGTTCTATTAACNC--GA-A------TTGGTTT--CTTTCGTTTCGNTANTTTTCAATGTGGAGCTGATCNATTTTCCC-TCCGTTTTGTCAAAGAAG---AC------AATTTGC-AAATGTTACATCNTTACC-AATGGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATANTATACCTATGAC----A-TA---TGCCATATTGCTGCCTGACAGTGTCNCAGTATTTTCATTGTTATGGATNC--ATGCTGAACCTTTGGAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AATATGTATTGCTTT-TTCCCTTTGTTTCTGTTGCCA--TTTGTGT-TTT-CTATTGNTATNACTGTATAACNTTANTCTACTGAGCTTTCNACTAAATTCAAAACTTATTCCTACCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATANTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAATTCACAANTCTCTGTACTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGC-G-AACCTGT---AAAAAGTACTT-AAAAAAAA---AC-CCCTCGAGTTCTTTAGGATTGGTGCTCTCTCCATCCTTTAGCAC-TCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTACATAATAATT-ATACAGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTACGCATATCACTGAATAAAANCACANNNTTCTAGCTTTNGTGGCCNTTTTTACCCATATTTGCATTCTGTCTTANATCAAACAAGTGACNAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATNTCTATAAAAAAGANAGTTNACTTGAGCTTAGGTTAACATATTCANTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGA-ATTT-----NNTATANACNTGTTTATTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATAACGTG-A-GAAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCCTTAAACATATTNAGTATTTTTCAGAACCATTTATAAATAAAAATAAGGC-CAAAGCATTCAACAAAATGNGTATA-TT-GCAG-----AAA--------T-------TTTTTCNTATTTTGGCGGCCATTTTGTCCCTTATTTAGACT-T-TT-GTACATGAATCAACCATATATTT-T--TT-T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TACCAGATTA---TA---TATTATA--ACAAATTTCNNNNNNNNNTGNATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GACCAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGNATTTTCGGACTCAGCA--TAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAA-CNTTT-----ANAAATAA-AAA-TGATAC-CAAAGCATTCAACAAAATGCGTATATTTGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGCGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACTTNTTGTACNTGAATCAACCATAT-TTTTACTTTTNTTTA-C-CTAAAACATGTCATNCAANTTGCAACAACACAAT-AAATCTAATATTTTACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCTTTTGGACATAAAAAGTAAATAAACACCC---CCNTATCTCTGG
gi|1 : TCTCTGCATATGTCCTTTAGTTACTAGGATTGTTTCATTGTTTCTTCTTTGACATCTATCAAAGGTATCAAACCAACAATAATCCATTAAGATATTTATTG-----------GCTCTTGCA-------------C-------------CAGCTTAG----TCCAC---------ATTTGTGTTCGCTTATGTGAGGATAACCTGATGATTCAGAATAGG-TAAATATTTCCACACATGAAATATGTTCTATCAACTTCGGA-A------ACGGTTT--CTTTCGTTTCAATAATTGTCAATGTGGAGCTGATCTATTTTCCC-TTCGTTTTGTCAAAGAAT---AC------ATTTT---AAATGTTACATCATTACC-AATGGACTTT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATACTATACCTATGAC----AATAAAGTGCCATATTGTTGCCTGACAGTGTCGCAGTATTTTCATTGTCATGGATAT--ATGCTGAATCTTTGGAAAACCC--A-GTCTGATTTAGTTCA-----A-TATGTATTGCTTTCTTCCCTTTGTTTCTGTTGCTA--TTTGTGT-TTTGCTATTGATATTACTGTATAACTTTATTCTACTGAGCGTTCTACTAAATTTGAAACTGTTTCCTATCAGTCAAACGTTGCTTTCCTTG----------------------GCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAAAATTCACTATTCTCTATACTAAGATGGAATCATTATAATC-GGTAG-AACCTGTTATAATAAGAACTTGAAAAAAAA---AC-TCTTCAAATTCTTTAGGATTGGTACTCTCTCCCTCCAATAGCACCTCTGTAGTCGGAGACCGGTAGGTCATCAACAACA-TCAGTCGGCCTTGAATAAGTTTAGTGTTCTTAGGTG--ATATAAT--CTATATAATAAGT-ATACAAA------CGAA---ATTAATAGTAAAAAGGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGCACACATATCACTGAATAAAAGCACATCCTTCTAGCTTTTGTGGCCATTTTTACCCATATTTGCAT--TGTCTTAAATTAAACAAGTGACAAAATATTTAATAAACTATTCTAAAATGTATGTATATCTATAAAAAAAAAAGTTTACTTGAGCTTAG--TAACATATTCATTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAAAATGGATTTTT-----CATATATACATGTTTATTACATTGCTTTGTTAGAGTGAAAGAAGCATAATGTG-ACGGAGATGCAGATATTCCAGTTTGTATTAAGAAAAGGTAGCAAAGTATACTCCTTAAACATGTTAAGTA-TTTCCAGAACTGTTTATAAATAAAATTAAGGC-CAAAGCATTGAACAAAATGAGTATATTT-GCAGGAAAAAAA--------CAGTCA--TTTTTCTTATTTTGGTGGTCATTTAGTCCCATACTTAGACTGG-CT-GTACATGAATCAACCTTA-ATTT-TACTT-T--TGATTA----CCCTTTAACATGTCATACAGCTT---ACAACACGAAAAATCTAA-ATTTTAACACTTTGCAGGGTTTT-----TACCAGATTAAATTG---TATNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--AACCAAACGCCTCAACAGCCATTTGTAGGAAATGGATTTT-----TAAGCATTTATA--AT-------TAAAAATGA-TACCAAAGCATTT--------AACAA-AA--------------------------TGCGTATATATGCAGA-AAAAGTGTCA-TTTTTCATATTTTGGTGGCCATTTTGTCCATTATTTAGACGTTTTGTAATTGAATCAACAATAT-TTTTACTCTTGTTTACC-CTAAAACATGTCATCCAAATTGCAACAACACAATAAAATCTAA-ATGTTACTCAGCATAAA--ATTTGCCTTTAGAAACAAGTCTCAAACATTTTAGACATAAAAAGTAAATAAACA-CC---CTATATCTCTGG
gi|10 : TGAATTTAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGT--GACCAAACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGGGTTTCGGACTCAGCA--TAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAA-CCTTTTGGACATAAATAGTAAA-TAAa
gi|10 : tattataacaACTCAGCATAAA--ATTTGCCTCTAGAAATAATTCTCAAACCTTTTGGACATAAATAGTAAATAAACA-CC---CCTTAACTCTGGacaccccttaactctggg
gi|11 : tattataacatgaatttaaatatttggcggccatcttggatttgtgaccaaacgctccaacagccgttagtaaaaaatggggtttcggAACAACAAAACAAATATAA-ATCTTAACACTTTTAAGTGTg
gi|11 : ATTT--ATATTTG-------T------TTTGT--TGTTA--CGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCGGACACAGCA--TAAA--ATTTACCTCTAGAAAC-AGTCTCAAACCTTTT-----GGACATAA-AAA-acgccccaacagccgttagtaagaaatatattttcggacacagcataaaatttacctctagaaacagtctcaaaccttttggacataaaaagtaaataaacacccctta
gi|12 : acacttaaaagtgttaagAAATGGA-ATTT-----G-TATACACGTGTTTGTTGCATTGCTTTGTTAGAGTGAAAAAAGCATGATGTATA-GAAAATACAGATATTCCAGTTTGTTTTAAGTAGAAGTgtaaataaacacccctta
gi|13 : g-------------C-------------CA-CTCAGGG--TCCTC-------CTATTGGTGTTCTCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TCCCACT
gi|14 : att-------------C-------------CA-CTCAGGG--TCCTC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTAGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTT-CACTCt
gi|15 : att-------------C-------------CA-CTCAGGG--TCCTC-------CTGTTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACTC
gi|16 : att-------------CA-CTCAGGT--CCCTC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAG
gi|2 : taaatatttTCTCTGCATATGTCCTTTAGCTGCTAGGACTGTTCCATTGTTTCCTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATAAACAGTA-TTCATTAACATATTTGCTG-----------ACTCTTCCAACAGCAAGTCATTC-------------CA-CTTA--A--TCCCC---------ATTGGTGTTTGCCGGCGTGTGGATAAATTGATGGTTCAGAATAGG-TAAATATTTCTACTCATGAAATATGTTCAATT--CGC--TG-A------TCGATTTCCCCTCCGTTTTGCCA
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcaGCTGATCGATTTCCCC-TCCGTTTTGCCAAA--------------------------TGTTATATCCTTACC-AATGGGCTGTTTGGTTTCTGCATTGTTGCTTGCAGTATGTTGATAGAGCATACCAATGCC----A-TA---TGCCATATTGTTTCATGACAGTGTCTAAGTATTTTCATTGTTATGGTTCC--ATGCTGAAACTTTGAAAAACCC--TTGTCTGATTTAATTCA-----AA-ATGTGTTGCT--------TTTGT---TGTTACT---TTTGTG--TTT-GTACTGCTATAACTGTATAACGGTAATCTACTGAGATTTAAACTAAATTCAAAACCTTTTT-------TCAACCGTTGC-TTCCTGGCTTTATCCTGGCCGATAATGTTGTAAATACTGCATTTTATTTTCACTAATAGAATTCACAATTCTCTGTACTTAGaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacttagcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|2 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcTTAGCATATTCAGTTGTGTTTTTTTTCAGATAATATATATAAAATGGA-ATTT-----TC-ATAAACTTGTTTAGTGCAGTGCTTTGTTAGAGTGAAA-------------------GATGCAGATATTCAAGTTTGTATTAAGTAGAAATAGCTAAATATAATCCTTAAACATATTTAATATTTTTCAGAACAATATATAAACACAAAAAAGGC-CACATCATGAAACAAAATA--------T-GCAG-----AAAAACAGTCAT-------TTTTTCTTATTTTGGTGGCCACTTTGTCTCTTATTTAGACT-T----GTGCATGAAATAACCATATTTTTAT--TTGT--T--TTA----CCATAAAACATGTCACGCAACTTACAGCAACACAATAAATCTAA-ATTTCAACACTTTGCAGTGTTTTCTATATACCGGTACA---TG---TATTATAACACAAATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAATAGCCGTAAGTAAGAAATATATATTTGAACTCA-CA--T------TTTACCTCTAGAAATAAGT--------TTTT-----ATAAAT---AAA-TG-T-----AAGCATTCAAC-AAATGCGTATATTTGC--A-AAAGATGTCATTTTTTCATATTTTGGCGGTCATTTTGTTCATTATTTAATCTTGTTGTACATGATTCAACCATCA-TTTTACTTATTTTTA-CACTAAAACATGCTATACAACTTACAGCAACACAAT-AAATCTAACATTTTGCTcatattcagttgtgttttttttcagataatatatataaaatggaattttcataaacttgtttagtgcagtgctttgttagagtgaaagatgcagatattcaagtttgtattaagtagaaatagctaaatataatccttaaacatatttaatatttttcagaacaatatataaacacaaaaaaggccacatcatgaaacaaaatatgcagaaaaacagtcattttttcttattttggtggccactttgtctcttatttagacttgtgcatgaaataaccatatttttatttgttttaccataaaacatgtcacgcaacttacagcaacacaataaatctaaatttcaacactttgcagtgttttctatataccggtacatgtattataacacaaatttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaatagccgtaagtaagaaatatatatttgaactcacattttacctctagaaataagtttttataaataaatgtaagcattcaacaaatgcgtatatttgcaaaagatgtcattttttcatattttggcggtcattttgttcattatttaatcttgttgtacatgattcaaccatcattttacttatttttacactaaaacatgctatacaacttacagcaacacaataaatctaacattttgctgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : atagtataatattttcatcattataaaactaatacagtttcaatgtcttaccggtatcctctgtactatagttttaaagtcggcttagctgtatagaatccgttcaaggaagctgaggctaaaacctatgcatgctgccagtttgatattagatggacctgggcatataaaaaacaccattaatgagtttttgctgcttcaatctgcatagctgttttggccacatccaaccgtctattatagttacactcatctctgcatatgtcctttagctgctaggactgttccattgtttcctctgtgacatctactcgtggtggtaaataaacagtattcattaacatatttgctgactcttccaacagcaagtcattccacttaatccccattggtgtttgccggcgtgtggataaattgatggttcagaataggtaaatatttctactcatgaaatatgttcaattcgctgatcgatttcccctccgttttgccaaatgttatatccttaccaatgggctgtttggtttctgcattgttgcttgcagtatgttgatagagcataccaatgccatatgccatattgtttcatgacagtgtctaagtattttcattgttatggttccatgctgaaactttgaaaaacccttgtctgatttaattcaaaatgtgttgcttttgttgttacttttgtgtttgtactgctataactgtataacggtaatctactgagatttaaactaaattcaaaaccttttttcaaccgttgcttcctggctttatcctggccgataatgttgtaaatactgcattttattttcactaatagaattcacaattctctgtacTCCCCTTGTTTCTGTTGCCA--CTTTTGTATTT-CTATTGATATTACTGTATAAATTTATTCTACTAAACTTTCAACTAA-TTCAACGCGTATTCCTACCAGTCAAACGTTTCTTTCTTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAATACCGC-----CTATTCACTGATAGAATTCACAAGTCTCTGTACTTAGATGGAATCATTT----------------------------TACTT-AAAAAAA---------CCCAGGCTCTTTAGGATTGGTGCTTTCTTCATCATTTAGCA--GCTGTAGTCGAAGACTGGTAAGTCATAAACAACA-CCAGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCTAATGTG--ATATAgttttctatcacattatgtattataatatgaatttcaatatttggcggcaatttt
gi|3 : AAA--CTACATATTAATT-ATACTGA------CGAACCAATTAATCGTAAAAAGGGTCTCATGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACTGAATAAAATTACAAAATTCTAGTTTTGGTGGCCTTTTTTACCCATATTTGCATTCTGT-TTACATC-AACAAATAACCAAATATTTAATAAACTACTCTAAAATGTATGTATTTCTAT--AAAAGATAGTTAACTTGAACTTAAGTTAACTTATTCACTTGTATTTTTT--CAGATTATATCTTAAACATGGA-ATTTATATAATTATAAACTTGTATATAACATTGCTTGGTTAGAGTGAAAAAAACATAACATGAA-GAAGATACAACTATTCCAG-TAGAATTAAGTAGAAGTAGCAAAGTATAATCTTGAAATATATTCAGAATTTTT-AGAACCATTTATAAATAAAAACAAGGT-CAAAGCATTCAACCAAATGAGTA-----------------------------------------TATTTTGGCGGCCATTTTATCCCTGACTTAGACT-TGTT-GTACATGAATCAA--GTATGTTT-TACTT-TCGT--TTA----CCCTTAATCATGTCATACAACTTACAACAACACAATAAGTCTAA-A-TCTAACACTTAGCCGGATTTTC----TACCAGATTA---TATATTATTATA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNGT--GACCAAACGCCCCAACAGCTGTTAGTAGGAAATGCATTTTCGGACTCGCCA--TACA--TTTAACCTCTAGAAACAAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAT-TGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATATTTGCAGATATATATTTT--TTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAATTATTGTACAGGAATCAACCATAT-TTTTAC----------C-CTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCAT-AAATCTAA-ATTTTAtactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaattgataccaaagcatccaataaaatgcgtatatttgcagatatatatttttttttcatattttggcggccgtttagtccattatttagaattattgtacaggaatcaaccatatttttacccttaaacatgtcataccaattgcaacaacaccataaatctaaattttaactttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|3 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaAAGCATTTATAAATAAAATTGATAC-CAAAGCATCCAATAAAATGCGTATA-TTTGCAG-----ATA--------TATATTTTTTTTTCATATTTTGGCGGCCGTTTAGTCCATTATTTAGAAT-TATT-GTACAGGAATCAACCATAT-----------T--T--TTA----CCCTTAAACATGTCATACCAATTGCAACAACACCATAAATCTAA-ATTTTAACTTTTTGCCGTATTTTC----TATCAGATTA---TA---TATTATA--ACA---------------TGCATTTCGATATTTGGCGGCCAT------TTTGT--GAACACACGCTCCAACAGCCGTTAGTAAAAAATGGATTTTCGGACTCGGCA--TGAA--ATTTGCCTCTAGAAACAAGTCTCAAACCGTTT-----GGAAATAA-AAA-actttttgccgtattttctatcagattatatattataacatgcatttcgatatttggcggccattttgtgaacacacgctccaacagccgttagtaaaaaatggattttcggactcggcatgaaatttgcctctagaaacaagtctcaaaccgtttggaaataaaaagtaaataaacacccc
gi|4 : tccccttgtttctgttgccacttttgtatttctattgatattactgtataaatttattctactaaactttcaactaattcaacgcgtattcctaccagtcaaacgtttctttctttgttttatcctgccccatattgtggcaaataccgcctattcactgatagaattcacaagtctctgtacttagatggaatcattttacttaaaaaaacccaggctctttaggattggtgctttcttcatcatttagcagctgtagtcgaagactggtaagtcataaacaacaccagccggccttgaataaggtcagtgttctaatgtgatatatactgcctccgttacaattgctatcacaaattaaaaattatactcctgtaatttgaaaactacatattaattatactgacgaaccaattaatcgtaaaaagggtctcatgaatttaacaatatatgtatgcatatcactgaataaaattacaaaattctagttttggtggccttttttacccatatttgcattctgtttacatcaacaaataaccaaatatttaataaactactctaaaatgtatgtatttctataaaagatagttaacttgaacttaagttaacttattcacttgtattttttcagattatatcttaaacatggaatttatataattataaacttgtatataacattgcttggttagagtgaaaaaaacataacatgaagaagatacaactattccagtagaattaagtagaagtagcaaagtataatcttgaaatatattcagaatttttagaaccatttataaataaaaacaaggtcaaagcattcaaccaaatgagtatattttggcggccattttatccctgacttagacttgttgtacatgaatcaagtatgttttactttcgtttacccttaatcatgtcatacaacttacaacaacacaataagtctaaatctaacacttagccggattttctaccagattatatattattatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaccaaacgccccaacagctgttagtaggaaatgcattttcggactcgccatacatttaacctctagaaac-------------C-------------CA-CTTAGTG--TCCTC-------CTGTTTGTGTTTGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATATTTGTACTCATGAAATATGTTCAATTATTCT--GA-GAAATCTTTGGCAT--CTTTCGATTCATTACTTTAAAATGTAGAGATGATAGATTTTCTC-TCTGTTTTATCAAAAAAGTTCA-------AATTTGCCAAATGTTACATCATTACC-AAATGGCTGT------------TTGTTGCTTGGAATGTGTTGATATGATATAC-------------TA---TACTATATTGCTGCCTGACAGTGCCATAGTATTTTCATTGTTATGG-TACTAATTC-GAACCTTTGGAAAACCCAGTTGTCTGATTTAACTCATTGACAATATGTATTATTTTATTTCCTTTGCTTCTGTTGCCACTTTTGTGT-TT--CTAATGCTATAACTGTATAACGTTAAT-TACTTAACTTCTTACTGAATTCAAAACTTATCCTCACCAGTCAAACTTTCATTTTCTTGTTTTGTCCTGTCCTATAGTGTGGCAAATACTGC-----ATTTTCACTAATAGAACTCACAAGTCTCTGTATTTAGACGGAATCATTTTCATCAGGC-G-AACCTGT---AAAAAGTATTT-GAAAATAATACAC-CCTTTGAGTTCTTTAGGACTTTAGCTCTCTCCATATTTTAACAC-TTTGTACTTG--GACTGTCAGGTCAGCAGCAACATTCACCCTGCCTTGAATAAGGTC-GAGTTCTTGGGTGGAATATACTGCCTCCGTTATAATTGATAgtaaataaacacccc
gi|4 : atagataaatatcAAC--CTACATAATAATT-TTTCAGAAGTATCCGAACAAATCAATCATAAAAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATAGACGTtcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaaacctacataataatttttcagaagtatccgaacaaatcaatcataaaaaaggtctcaagaatttaacaatagacgt
gi|5 : atagataaatatcccacttagtgtcctcctgtttgtgtttgctggtgtgtggataaattggtgattcggaatagataaatatttgtactcatgaaatatgttcaattattctgagaaatctttggcatctttcgattcattactttaaaatgtagagatgatagattttctctctgttttatcaaaaaagttcaaatttgccaaatgttacatcattaccaaatggctgtttgttgcttggaatgtgttgatatgatatactatactatattgctgcctgacagtgccatagtattttcattgttatggtactaattcgaacctttggaaaacccagttgtctgatttaactcattgacaatatgtattattttatttcctttgcttctgttgccacttttgtgtttctaatgctataactgtataacgttaattacttaacttcttactgaattcaaaacttatcctcaccagtcaaactttcattttcttgttttgtcctgtcctatagtgtggcaaatactgcattttcactaatagaactcacaagtctctgtatttagacggaatcattttcatcaggcgaacctgtaaaaagtatttgaaaataatacaccctttgagttctttaggactttagctctctccatattttaacactttgtacttggactgtcaggtcagcagcaacattcaccctgccttgaataaggtcgagttcttgggtggaatatactgcctccgttataattgatatcacaaattagaaaccctactcctggaatttgaTACGTACTTCCTTCAATCACAAGGACCGTT-CATTGTTTCTTCTACAACATATAATCGTGGTGGTAAATTAACACTA-TCCATTAAAATAGTTGCTGTCTTAGTGATGACTCCCCTG-------------A-------------CA-GTTAGGTATTCCACTCAGAACCCATTGGTGTTTGCTGGTGCGTGACTAAATTGATTATTCAGAATGAG-TTTATGTGTCTACATTTAAAATATGTTGTTTCAACTC--AATACTTCT-TTGGTTT--CTTTCGTTTAAGCAATTTTCAATGTGGAGCTCATCTTTTGTCCCATCTGTTTTGTCAAA
gi|6 : atttataaacgcttcataacatcctgtcctcttttcaaaacagtccagtaagatacctctgacgtcatcagtcacttatttaccagttatgtatagtttcaatgttttactgatagcatatacacacttggttttaaagtatgtttactggtaaaggaattcgttctaggaacccgagtaaaatgtgaattctgtcagttggatatctataagaccaatgccataaaagagcttcgactgcttgaatctgcagatctgtttaggccacatctaatatcgtaAAACGCCCCAACAGCCGTGATTTAGAAATATATTTTCGGATTCACCA--TACA--TTTAACCTCTAGAAACAAG--------CATTT-----ATAAATAA-AAA-TAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATTGCAGA-AAAAGTGTAA-TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACTTTTTGTACTTAAATCAACTATATATTTTTTTTTTATTTC-CTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAAT-AAATGTAATATTTTAtactt
gi|6 : caAAGCATTTATAAATAAAAATAAGACACAAAG-ATTCAAATAAATGTGTATAATT-GCAG-----AAAAAGTG---TAA-----TTTTTCATGTTTGGGCCGCCATTTTGTCACTTATTTCGACT-T-TTTGTACTTAAATCAACTATATATTT-T--TT-T--T--TTATTTCCTCTAAAACATGTCATTCAACTTACAACAACACAATAAATGTAATATTTTAACACTTTGCAGTGTTTTC----TATCAGATTG---TT---TATTATN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGAGACCAAACGCTCCAACAGCCTTTAGTAAGATATGGA--TTCGGACGCAGCA---AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTT-----AGACATAA-AAAGTGAacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggacgcagcaaaactatttgcctctataaacaagtctcaaaccttttagacataaaaagtgacgaacacccgatccctatctctg
gi|6 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacACGCAGCA-AAACTATTTGCCTCTATAAACAAGTCTCAAACCTTTTAGACATAAAAAGT-GACGAACACCCGATCCCTATCTCTGcgaacacccgatccctatctctg
gi|7 : caaaacgccccaacagccgtgatttagaaatatattttcggattcaccatacatttaacctctagaaacaagcatttataaataaaaataagacacaaagattcaaataaatgtgtataattgcagaaaaagtgtaatttttcatgtttgggccgccattttgtcacttatttcgactttttgtacttaaatcaactatatattttttttttatttcctctaaaacatgtcattcaacttacaacaacacaataaatgtaatattttaacactttgcagtgttttctatcagattgtttattatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagaccaaacgctccaacagcctttagtaagatatggattcggATTCAAAACTTATTAATTCTAGTCAAGCTTTGCTCTCCTTGTTTTATCCTGCCCCATATTGTGGCAAAAACTGC-----ATTTTCACTAATAAAAATCACAAATCTCTGTTCTTAGACGGAATCATTTTAATC-GGT-GGAACCTGT---AAAAAGTACTTTAAAAAAAA---ACACCCTTGAGTTCTTTAGGATTGATGCTCTCTCTATCCTTTGGCAC-TCCGTAGTCGGAGATAGGTAGGTCATCAACAACA-CCCGCCGGCCTTGAATAAGGTCAGTGTTCCTAGATG--ATATTAT--
gi|7 : TACATACTAATT-ACACAGT------CGGACCAATTAATCATAATAAAGGTCTCAAGAATTTAACAATATATGTATGCATATCACAGAATAAAAactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggacttacatactaattacacagtcggaccaattaatcataataaaggtctcaagaatttaacaatatatgtatgcatatcacagaataaaacg
gi|8 : attcaaaacttattaattctagtcaagctttgctctccttgttttatcctgccccatattgtggcaaaaactgcattttcactaataaaaatcacaaatctctgttcttagacggaatcattttaatcggtggaacctgtaaaaagtactttaaaaaaaaacacccttgagttctttaggattgatgctctctctatcctttggcactccgtagtcggagataggtaggtcatcaacaacacccgccggccttgaataaggtcagtgttcctagatgatattatactgcctccgttacaattgatatcacaaattaaaattttactcctggactTACTAGGACTGTTTCATTGTTTCTTCTGTGACATCTACTCGTGGTGGTAAATTAGCAATA-TCCATTAAGATATTTGCTG-----------ACTCTTATA-------------C-------------CAGTTCA--G--TTCAC---------ATTTGTGTTTGCTGGTGTGGGGATAAATTGATGATATAGAATAGGTTTAATATTTCTACTCATGAAATGTGTTCTATTAATATGAGA-A------ATGGTTT--CTTTCCTTTTGATATTTTTCAATATGGAGCTGATTAATTTTCGC-TCTGTTTTGTCAAAGAGG---ACATTTTAAATTTGCGAAATGTTACATCTTTACCTAATGGGCTGT------------TTGTTGCTTAGAATGTGTTGATGTACTATACCTATGACAATAA-TA---TGCTATACTGCTGTCTGACGGTGTCTCAGTATTTTCATTGTTATGGATCC--ATGTTGAACCTTTGGAAAACCcg
gi|9 : TATGTTCTCTAGTAACTGGGATGGCTTCATTGCTTCTTCTGTGGCATCTACTCGTGGTATTAAATTAAAAAGG-TCCATTAAGAAATTTG--------------ACTCTTCTA-------------CGGTGAAGGTATTCCA-CTCAGGG--TCCAC-------CTATTGGTGTTCGCTGGTGTGTGGATAAATTGGTGATTCGGAATAGA-TAAATA-TTCCACT