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gi|46                         :                 TTGTGATCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---TAT-TTATTT----C-T--TGTTTATGTA--AA-AAA--TCCAATAAACCA--GAAAA-GATAATTTCCGAA----TATAA--T-------T-A--TA------T---TAT-----TAT-ATTA-agttatatttagctttcggtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactccggttttaccgggtcctttaccaagttgctcggcaatcgtcaaagaggctgacttagctatcccccggttaccgggtccgtcactaagttgct
gi|22                         :                 TTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTA---AA-ATAAAACTGT-GTGTCT----T-----GTTTATG-A--GAGAAA--TGCATTTGACTA--AAGAACAATA-TTTTCAAA----TTTAA--T-------TA---------------CAA-----TAC-AGAA-AA-G----A---C--C-----T--TTT-A--TGGGG---------------T--------TT---------T--T--AT-CGTA--TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TAT---CAATACGTTTAGC--T------ACCAGTTTGCATTA-AATGTA----AA-TGTCATGACAATCACAa
gi|23                         :                cTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTCAAAAA-AAAA---TGT-GTG--T----C-T--TATTTATG-A--GAGAAA--TGCATTTGACTAATGAACA--AT-ATTTTCAAA----T------T-------TA----------------AT-----TAC-AATA-GAGAAG--AGACC--T-----TGATTT-G--TT------------------T--------TT---------TTTT--AT-CGTA--TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TCA---ATATA--TTTAGC--T------ACAATTTTGCATTA-AATGTA----AA-TGTCATGACAATCACAaatcaactcatcaaaatatacataaattattgaaaag
gi|14                         :                 cTGTGAGCGTGT--------ACTCCC----ATGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT----C-T--TGTTTATTTG--GA-AAA--TCCAATATACCA--GTAAA-AATAATTTTCAAA----TACAG--T-------TAA--TT------G---TAT-----TAC-ACTA-TA-ATT--A---C--T-----TAATCT-A--CC------------------T--------TT---------TTTC--AT-CATA------TATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGT--T------TTCGGTGTGCGTGGGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCCAGTTTTACTGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCCCTCCCGTC--ACTGGGTCCTTCACTAAGGTGCTCAGCaatcaactcagcaaaatatacataaattattgaaaa
gi|18                         :                  TGTGAGCGTGTTATT---GAATTCC----ATG---ACGC
gi|39                         :                  TGTGAGCGTGTTATTATTGACTTTC----ATGTGTATGCT-TTTTTTACAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------G-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT----T-T--TGTTTATATG--GA-AAA--TCCAATATACCA--GAAAA-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TAA--TAATTATTG---TAA-----TAC-ACTA-TC-ATT--A---C--T-----TAATTT-gtatttcttgtttatttggaaaatccaatataccaataaaaataattttcaaatataattaattgtattacgctacagttacttaatttatgcttttttcactatatacacacatgtataaatatctatatttagctttcagtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactcctgttttaccggttccttcacaaagttgctcgacaatagtcaaagaggccgacttagttatcgcctcctgttaccgggtccttcacttagttgctcagct
gi|48                         :                   GTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT----C-T--TGTTTACTC------AAA--TCCAGTATACAA--GAAAT-GATAATTTgc
gi|6                          :                    TGAGCATGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT----C-T--TGTTAATGTA--GA-AAA--TACAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TAA--TT------G---TAA-----TAC-ACTA-TC-ATT--A---C--T-----TAATTT-A--CC------------------T--------TT---------CATC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---ATATA--TTTAGC--T------TTC-GTGTGTGTGAGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCTGGTTTTACTGGGTCCTTCATGA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAGAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTT--ACTGGGTCCGTCATTTAGTTGCTCAGCCG
gi|19                         :                        CGTGTTATT---GAATCCC----GCGTTTACGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------A-AT-----TA-ATGA---TGT-GTGTGC----C-T--TGTATATTTG--GG-AAG--TGCAATACACT----AAAA-CATAATTTTCAAA----GTTCA--T-------TAA--TT------T---CAT-----T-C-ATTA-CA-ATT--A---C--T-----TAATTT-A--CA------------------T--------TTGATTCCTTGTGTC--AC-CATAACCACAGATGCAT---TACATA-AGAGCA-------A----TGA---CAATA--TTTAGCAATCCGA--TTCGGTTTGCGTGAGAACGTATGGCAA-TGA
gi|51                         :                  tatcatCATGTTAT----AAATCTA----ATGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------T-TT-----TA-ATGA---TGC-ATGCTT----C-T--TGataacgttatatatagactgaatatgagagctgtataacaacattt
gi|28                         :                     taacGTGTTATA---GAATCCC----GCGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------TA------T-TT-----AA-ATGA---TGC-ATATTT----C-T--TGTTTATTTG--GA-AAA--TCCAATATACCA--GAAAA-GATAAATTCCAAA----TATCA--T-------AAA--TT------G---TAT-----TAT-ACTA-CA-ATT--A---C--T-----CAATTT-ACCTACAATTACTCAATTTACCCT--------TT---------TTTC--AT-CA------TATATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAG---CTACA--TTTAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATATA----AA-TGACATGATAATCACACTCCGGT
gi|36                         :                        tGTGTTACT---GG-TCCC----ATGTGTATGCT-TTTA--------TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----TATATGA---TGT-GCGTTT----C-T--TCTTTATTTA--GA-AAA--TGTAATACACTA--GAAAA-CATTATT----AG----TTTCA--T-------TAA---------------AC-----TAC-A-TG-TA-CTT--A---CCGT-----TA--TT-AGTTG------------------T--------TT---------CATC--AT-AAAAACATTACACAC-A---CA---ATA----A-------T----TA
gi|40                         :             acattggtcaaatTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT-------A------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT----C-T--TGTTTATTTG--AA-AAT--TCCAATATACCA--GAAAA-GAAAATTTACAAA----TATAA--T-------TAA--TT------G---TAT-----TAC-ACTA-TA-ATT--A---C--T-----TAATTT-ACCT-------------------T--------TT---------TTTC--AT-CATA
gi|21                         :                      cgttTGTTATT---GAATCCT----ATGTGTATGCT-TTAA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----CA-ACGA---CAT-GTGTTT----C-T--TGTATATA-A--GAGAAG--TGCAATACACTA--CTAAA-TAACATTTTCAAA----TTTAA--T-------TAATTTA------A---CATCAA--TGC-AATACTG-ATTTGC---C--T-----TTATTC-A--T-------------------T--------TT---------T-TC--AT-CATAA----ATA--------CAT-TATA----ACGT----A----TA-----TATA--TTTAGA--T------ATTGGTTTGCATTACAATTCA----AA-TGGCATGACAATCCCAt
gi|27                         :                   tgtcaaaTGTTATT---GAATCCCTTGTATATATATGCTATT----ACAAGATCCA-A----TGGAT------GA------T-AT-----TG-ATGG---TGT-GTGTTTCTTTT-T--TATTTGTGAA--AA-AAA--AACAACA--CTG--GAAAA-CCT---TTTCAAA----TATAA--T-------TAA--TT------T---TAT-----TAC-ACTA-CA-ATT--A---T--T-----TAATTT-AC-TG------------------TA-------TT---------TGTT--GTACATGA-TTTATTTG--T---TATGTATaatgaactcagcggtgaaatacatgttgtttattgaaaatt
gi|32                         :                           GTAATT---GAATCCT----GTATGTACACT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------CAGT------A-ATGA---TGC-CCGTTT----C-T--TGTTTATTTG--GG-AAA--TGAAATGCGCTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----CATgtcatgacaatcctgttcatacaataaacatgttgataaataacatttgtattcctttataaggcataacatttttt
gi|30                         : acatgtacatcatgcattagtcacctgTTATT---GAATCTT----GTGTGTATGCC-ATTA--TCAGA-T-CAGA----TAAAT------GA------T-AA-----AA-ATGA---TGT-GTG-TT----T-A--TGTTTAT-TAGGGA-AAAC-TGCAATACACCA--GGAAA-CATTATTTTTGAAATTTTATAAATT-------TAA--TT------A---CAA-----AACAATTA-CA-TTT--A---C--T-----GAATTT-A--TC------------------TTTGTTTGCTT---------TTTCATAT-TATAA----ATATAT-TTCACAGGCATA----ATGACAACA----TAT---TTTTA--TTTAGC--T------ATTGATTTGCATGAAAtaagtttttggacacccttattttttagaaaattaattactttttcgacaataaagttcagggcatatttgtacttatgtagttatttt
gi|52                         :                            ttACT---GAATCCT------------GCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------T-AT-----TA-ATGA---TGT-GT
gi|20                         :            cacgtcatcttcttcttgaTT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATTCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTT----TCT--TGTTTATGTA--GA-AAC--TACAATGTACCA--GATAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TAA--TT------G---TAT-----TA--A-------------------T-----TAATTT-A--CC------------------T--------TT---------TATC--AT-CATAATCTTAT-TA--T---CA-----------------------------------------------------CGGTGTGCGCAAGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCCGGTTTTACCGAGTCCTTCACCA--AGTTGCTT---------------GGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTT--ACTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCCg
gi|26                         :                                               gTGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----AA-ATGA---TGC-------------------TT-------GA-AGA----------ACTA--GAAAA-CATAATTTTTAAA----TTTAA--T-------AAA--T-------------T-----T--------TA-GTT--A---T--G-----TTATTCGA--TG------------------G--------TT------------C--AT-TATAAATACATGTAC------AT-TACA----A-------AAACATAATGTCTATA--TTTAGC--TACCTGATTTGGCG-GCGTGATGATGTA----AA-TGTCATGACAATCACAa
gi|18                         :                                                                                                   ttatgaagctgt-ATGA---CGC-GTATTT----C-T--TGTTTATTTG--GA-AAA--TCCAATATACCA--ATAAA-AATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TAA--TT------G---TAT-----TAC-GCTA-CA-GTT--A---C--T-----TAATTT-A--TGC-----------------T--------TT---------TTTC--AC-TATA------TACAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGC--T------TTCAGTGTGCGTGAGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCCTGTTTTACCGGTTCCTTCACAA--AGTTGCTCGACAATAGTCAAAGAGGCCGACTTAGTTATCGCCT--CCTGTT--ACCGGGTCCTTCACTTAGTTGCTCAGCtgcaatgtacataggttggcacattgataaaaacattttcatttcttaataaggaataacattttt
gi|41                         :                                                                                                                                  tgtgagcgtgttattgaattcc-AAA--TCCAATATACCA--GAAAA-GATCATTTCCAAG----TATAA--T-------TAA--TT------G---TAT-----TAC-CCTG-TA-ATC--A---C--T-----TAATTT-A---G------------------T--------CT---------TATC--A------------------T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------AT--------------AT-TA----AA-TGAAATGATAATCACATTCCGGTTTTACTGGGTCCATCACTA--AGTTGCTCAGCt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                         ------G---TTT-----TAC-ACTA-TA-ATC--A---C--T-----TAATTT-A--CC------------------T--------TT---------TATC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TGG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTA----AA-TGAAATAATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTTCGTCACTT--AGTCGCTTAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tT-CATAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATT--TTTAGC--T------TTCCGTGTGCATGTGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCTGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTTACTTAGTTAT--CCC--CTGGTT--ACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTTAGCCG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTTACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGCTAT--CCC--CCGGTT--ACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCT
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttgagagcgtgttattgagtcccatgtgtacgctttgaacag-------A----TAG----TACA--TGTAG---T------TTCGGTTTGCGTGAATATATA----AA-TGTCATGAC-GTCACA
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cTGTA----AA-TGACATGATAATCACACTCCAGTTTTAC------CTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATTGTCAAAAAGGCTGACTTAATTAT--CCC--CCGGTT--ACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCaattagctcagcggtgaaatacatgtaaatcattgaaaac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAATCAC--ACT--CCGGTTTTACCAGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCa
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gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttgtgagcgtgttattgaatcccatgtgtacactttgaacagatgatgtaaatgatgtgtatttcttgtttatgtagaaatccaatataccagaaaagataatttccaaatataaataattgtattacactataatcacttaatttaccttttatcatcataattctatatactcatgtataaatagctatctttagctttcggtgtacctgagaatgtaaattgaatgaTAATCAC--ACT--CCGGTTTTACCAGGTTCGTCACTTAGTCGCTTAGC
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|18                         :                                              TGTGAGCGTGTTATT---GAATTCC----ATG---ACGC
gi|18                         :                                                                                                                                           -ATGA---CGC-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--ATAAA-AATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-GCTACAGTTA-C--T-----TAAT--TTA---------TG---C--------T------------TTTT--------TC--AC-TATA------TACAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGC--T------TTCAGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCTGTTTTACCGGTTCCTTCACAA--AGTTGCTCGACAATAGTCAAAGAGGCCGACTTAGTTATCGCCT--CCTGTTACCGGGTCCTTCACTTAGTTGCTCAGCgtatttcttgtttatttggaaaatccaatataccaataaaaataattttcaaatataattaattgtattacgctacagttacttaatttatgcttttttcactatatacacacatgtataaatatctatatttagctttcagtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactcctgttttaccggttccttcacaaagttgctcgacaatagtcaaagaggccgacttagttatcgcctcctgttaccgggtccttcacttagttgctcagct
gi|19                         :                              tgtgagcgtgttattgaattccCGTGTTATT---GAATCCC----GCGTTTACGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------A-AT-----TA-ATGA---TGT-GTGTGC-CTT-GTATAT--TT--G--GG-AAG--TG-CAATACACT----AAAA-CATAATTTTCAAA----GTTCA--T-------TA------AT-T-T---CA-T-----T--C-ATTACAATTA-C--T-----TAAT--TTACATTTGATTC----C--------T------------TGTG--------TC--AC-CATAACCACAGATGCAT---TACATA-AGAGCA-------A----TGA---CAATA--TTTAGCAATCCGA--TTCGGTTTGCGTGAGAACGT--A-TGGCAATGAATAAt
gi|2                          :                                      tatcatTTTGTGAGTGTGTTTTT---GAATCGA----ATGTGTACCAT-TTGA--ATAGG-TGTA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAAAATC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------A----C--------T------------TTTC--------TC--AT-CATAATTTTATAAAC-T---TATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGATGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-AAAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTTTCACCAACAGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTTGTTAT--CCC--CCGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCGcgttatatatagactgaatatgagagctgtataacaacattt
gi|20                         :                                                         caTT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATTCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTTTCTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAC--TA-CAATGTACCA--GATAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA---A-------------T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATCTTAT-TA--T---CA-----------------------------------------------------CGGTGTGCGCAAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGAGTCCTTCACCA--AGTTGCTT---------------GGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|21                         :                                                     gTGTTATT---GAATCCT----ATGTGTATGCT-TTAA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----CA-ACGA---CAT-GTGTTT-CTT-GTATAT--A---A--GAGAAG--TG-CAATACACTA--CTAAA-TAACATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-----TA-A-----CATC-AATGCAA-TA-C--------TGAT--TTG---------C----CTTTATTCAT------------TTTT--------TC--AT-CATAA----ATA--------CAT-TATA----ACGT----A----TA-----TATA--TTTAGA--T------ATTGGTTTGCATTACAATTCAAA-TGGC-ATG-ACAATCCCAa
gi|22                         :                                      tgtcaaaTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTA---AA-ATAAAACTGT-GTG--T-CTT-GTTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTA--AAGAACAAT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-C-A--GAAAAGA-C--C-----T--T--TTA---------TGGGGT--------T------------TTTA--------TC--GT--A----TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TAT---CAATACGTTTAGC--T------ACCAGTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatgaactcagcggtgaaatacatgttgtttattgaaaatt
gi|23                         :                                            cTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTCAAAAA-AAAA---TGT-GTG--T-CTT-ATTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTAATGAACA--AT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-G-AGAAGAG--ACC--T-----TGAT--TTG---------T----T--------T------------TTTT--------TT--AT-CGTA--TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TCA---ATATA--TTTAGC--T------ACAATTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatcaactcatcaaaatatacataaattattgaaaag
gi|24                         :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAG---------------AT------TA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-TTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TT-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAGA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATTATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAAC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTCCGTCACTA--AGTTGCTCAGCaatcaactcagcaaaatatacataaattattgaaaa
gi|25                         :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAG---------------AT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AA---TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTCTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATC--TTTAGC--T------TTCGGTGTACCTGAGAATGTAAATTGA--ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTGTCACTA--AGTTGCTCAGC
gi|26                         :                                                                            TGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----AA-ATGA---TG---------CTT-G---------------A-AGA-----------ACTA--GAAAA-CATAATTTTTAAA----TTTAA--T-------AA------AT-T-T---TA-G-----T------TATG-TTA-T--T-----CGATGGTT--------------------------------------------------C--AT-TATAAATACATGTAC------AT-TACA----A-------AAACATAATGTCTATA--TTTAGC--TACCTGATTTGGCG-GCGTGATGATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACA
gi|27                         :                                          ttatgaagctgtTGTTATT---GAATCCCTTGTATATATATGCTATT----ACAAGATCCA-A----TGGAT------GA------T-AT-----TG-ATGG---TGT-GTGTTT-CTT-TTTTATTTGTGAA--AA-AAA--AA-CAACA--CTG--GAAAA-CCT---TTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTACAATTA-T--T-----TAAT--TTA---------C----TG-------TA-----------TTTG--------TT--GTACATGA-TTTATTTG--T---TATGTATtgcaatgtacataggttggcacattgataaaaacattttcatttcttaataaggaataacattttt
gi|28                         :                                                     GTGTTATA---GAATCCC----GCGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------TA------T-TT-----AA-ATGA---TGC-ATATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAAATTCCAAA----TATCA--T-------AA------AT-T-G---TA-T-----TA-T-ACTACAATTA-C--T-----CAAT--TTA---------C----C--------TACAATTACTCAATTTACCCTTTTTTC--AT-CA------TATATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAG---CTACA--TTTAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATATAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTgtcatgacaatcctgttcatacaataaacatgttgataaataacatttgtattcctttataaggcataacatttttt
gi|29                         :                                          tGTTTGTGAGCGTATTATT---GATTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTGAT--GT--A--GA-AAAA-TC-CAATATACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-ACACTA-TAATTATA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTAA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTA
gi|3                          :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGCG-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-AGGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATAAACAA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AA-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TG--AT-CATACTTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTTGGTGTGTGTGAGAATGTATA-TGAC-ATG-ATAATCTCACTCCGGTTTTACCGGGTTCTTCACCA--AGTTGCTTGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGGTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|30                         :                                                     tacTTATT---GAATCTT----GTGTGTATGCC-ATTA--TCAGA-T-CAGA----TAAAT------GA------T-AA-----AA-ATGA---TGT-GTGTTT-A-T-GTTTAT---T--AGGGA-AAAC-TG-CAATACACCA--GGAAA-CATTATTTTTGAAATTTTATAAATT-------TA------AT-T-A---CA-A-----AA-CAATTACATTTA-C--T-----GAAT--TTA---------T----C--------TTTGTTTGC----TTTT--------TCATAT-TATAA----ATATAT-TTCACAGGCATA----ATGACAACA----TAT---TTTTA--TTTAGC--T------ATTGATTTGCATGAAAa
gi|31                         :                                                   ttGTGCTATT---GTATACC----ATGTGTAT-------A--TCA------A-A----TAAAT------GA------T-AA-----TA-ACAA---TAT-GTGTTG-CAT-GTTTAT---C--A--GG-GAA--TTGCAAACCACTA--GAAGA-CATA---TTCAAA----TTTAT--T-------TA------AT-T-A---CATT-----TA-T-ACAAT--TTATC--T-----TTAT--T-----------C----G--------T------------TGTT--------TC--AT-CATAATT
gi|32                         :                                                     ttGTAATT---GAATCCT----GTATGTACACT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------CAGT-----AA--TGA---TGC-CCGTTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GG-AAA--TG-AAATGCGCTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----CATaccttacacggcataatggcaacgtattattgtttagcaattggtggcggaaatattacaatcacaataacaaataacaat
gi|33                         :                 acatgtacatcatgcattagtcacctgTTTGTCACCATGTAATT---GAATCCT----GTGTGTATGTT-TTTA--------TGTA-ACTATCAGATCC----AA------T--T------A-ATGA---TGT-GTGTTT-TTT-ATTTAT--TT--G--GG-AAA--CG-CA-------A--GAAAA-CATGATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTTTAATTA-C--TGACGGTAAT--TTA---------C----C--------T------------TTtaagtttttggacacccttattttttagaaaattaattactttttcgacaataaagttcagggcatatttgtacttatgtagttatttt
gi|34                         :                                           taTTGAGAGCGTGTTATT---GAGTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGT--A----TAAAT------atagtctgttgctgcatcaaaaatacatgtacattacacaaggata
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTTACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGCTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTagttatatttagctttcggtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactccggttttaccgggtcctttaccaagttgctcggcaatcgtcaaagaggctgacttagctatcccccggttaccgggtccgtcactaagttgct
gi|35                         : ttgagagcgtgttattgagtcccatgtgtacgctttgaacagGTCTGTGAGCATGTTACT---GAATCCC----ATGTGGACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----GA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATGTACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CAT-----------------------------A-------A----CAG---CTATA--TTTAGC--T------TT
gi|36                         :                                                    cGTGTTACT---GG-TCCC----ATGTGTATGCT-TTTA--------TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----TATATGA---TGT-GCGTTT-CTT-CTTTAT--TT--A--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATTATT----AG----TTTCA--T-------TA------A---------A-C-----TA-C-A-TGTACTTA-CCGT-----TA----TTA---------G----T--------T------------GTT---------TC--AT-CATAA
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acattggtcaaatT-CATAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATT--TTTAGC--T------TTCCGTGTGCATGTGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTTACTTAGTTAT--CCC--CTGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTTAGCCGaaacattacacacacaataatta
gi|39                         :                                              TGTGAGCGTGTTATTATTGACTTTC----ATGTGTATGCT-TTTTTTACAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------G-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT-TTT-GTTTAT--AT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TAATAATTAT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTG---------C----
gi|4                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTAC--GC--A--GA-AAA--TC-CAATATACAA--GAAAT-GATAATTTCTAAA----TATGA--T-------GA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTTAAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTGTA--TTAAGC--T------TTCCGTGTGCGTAAGAATGTAAA-TGAC-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTAATGGGTCCTTCACCA--AATTCCTCGGCAATTGTCAAAGAGGCTGCCTTAGTTAT--ACC--CTGGTTACCAGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|40                         :                                                   tacTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT-------A------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--AA-AAT--TC-CAATATACCA--GAAAA-GAAAATTTACAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----CT-------T------------TTTT--------TC--AT-CATA
gi|41                         :                                                                                                                                                                               cgtt-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATCATTTCCAAG----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-CCTGTAATCA-C--T-----TAAT--TTA--------------G--------T------------CTTA--------TC--A------------------T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------AT--------------AT-TAAA-TGAA-ATG-ATAATCACATTCCGGTTTTACTGGGTCCATCACTA--AGTTGCTCAGCt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                        -T-G---TT-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TGG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTTCGTCACTT--AGTCGCTTAGC
gi|43                         :                                            TTTGTCATTGTGTTATT---GAATCGC----ATGT-----------------------A-A----TGAAT------TA------T-GT-----TA-ATGA---TGC-GTGTTT-CTTTATTTAT--TT--G--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----TTTCA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-GCTACAACTT-C--T-----TAAT--GTA---------C----A--------T------------TT
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gi|5                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-TTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-G-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------T----A--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAT-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACGGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------A----TAG----TACA--TGTAG---T------TTCGGTTTGCGTGAATATATAAA-TGTC-ATG-AC-GTCACA
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gi|52                         :                                                      taacACT---GAATCCT------------GCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------T-AT-----TA-ATGA---TGT-GT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacgtcatcttcttcttgaACCGGGTCCGTCAATAAGTTGCTCAGCCg
gi|6                          :                                                TGAGCATGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTAAT--GT--A--GA-AAA--TA-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTCA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---ATATA--TTTAGC--T------TTC-GTGTGTGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACTGGGTCCTTCATGA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAGAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCGTCATTTAGTTGCTCAGCCGa
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|44 ): TTTATTAAAGAAATGCAATACACCAGAAAATAACATTTTCAAATTTGATATAATACAATTACTGTATGTATAAATACATGTATATTACACAGGTATAATGAACATATCTATATGTAAATGTCACGGCAATCACAAATGAACTCGGCAAT
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consensus                     :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCG
Reference ( family-453 )      :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|1                          :                                           GTTTGTGAGCTTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTGCGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATTA---TGT-CTATTT-CTT-ATATAG--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATATCCAAA----TATAA--TATTATAGTA------ATATAG---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTCTATATAC-T---CATCTATA----A-------A----TAG---CTTTA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATTATCATACTCCGGTTTTACCAGGTCCTTCACCA--AGTTGCTTGGCAATCGTCAAAGAGGGTGACTTAGTCAT--TCC--CAGGTTACCAGGTCTGTCACTAAGCTGCTCAGCC
gi|10                         :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTACT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTGC--GC--A--GA-AAA--TC-AAATATACAA--GAAAT-GATAATTTTTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTAAAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATGTAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGGTGTGCATGAGAATGTAAA-TGAT-ATG-ATAATCACACTCAGGTTTTACCGGGTCCTTCGCCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAAAGGCTGCCTTAGTTTT--ACC--CCAGTTAC---AT--GTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|11                         :                                        tacGTTTATGAGCGTGTTATT---GAATTCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATAA---TGT-CTTTTTTCCT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TA-CAATATACCA--GAAAA-TATAATTTCCAAA----TTTAA--A-------TA------AT-T-A---TT-T-----TA-C-ACTATAATAA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATACTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTTCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAAGTCCTTCACCA--AGTTGCTT---------------GGCTGACTTAGTTAT---CC--CCGGTTATTTGATCCATCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|12                         :                                          cGTTTATGAGCGTGTTATT---GAATCCT----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----AAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTT-CTT-ATTTAT--GT--A--GA-AAA--AA-TAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAA--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTGTA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGC---------------TGACTTAGTTAT--CCC--CCAGTTATTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|13                         :                                           GTTTATGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATAA---TGT-ATTTTT-CCT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA---A-CAATATACCA--GAAAA-TATAATTTCTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TT-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATACTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTTCTTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTTCGGTTTTACCGAGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGC---------------TGACTTAGTTAT--CCC--CCAGTTACTTGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|14                         :                                             cTGTGAGCGTGT--------ACTCCC----ATGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GTAAA-AATAATTTTCAAA----TACAG--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--CTA---------C----C--------T------------TTTT--------TC--AT-CATA------TATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGT--T------TTCGGTGTGCGTGGGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCAGTTTTACTGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCCCTCCCGTCACTGGGTCCTTCACTAAGGTGCTCAGC
gi|15                         :                                             TTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TATAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-AACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATATTAA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CA--TATA----A-------A----TAG---CTATG--TTGAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAT-GTA-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCAGCAATCATCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CTGGTTACCGGGTACGTCACTAAGT
gi|16                         :                                            TTTATTAGCATGTTATT---GAATCCC----ATGTGTATG-T-TTGA--ACAGG-TGCA-A----AAGATAAATCCGA------T-GT-----AA-ATGA---TGTTGTTTTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TA-AAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCAAAA----TGTAA--T-------CA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATTATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-TATAATCTTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTTTA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAAAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAACCACACTCAGGTTTTACCGGGTCCTT---------TTGCTC---------------GGCTGACTTAGTTAT--CCC--CTTGTTACTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|17                         :                                           aTTTATGAGCGTGTTATT---GAATCCC----AGGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--T------------------------AT---CAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-A-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-GTG-ATAATCACACTCCGGTTTTA------CCTTCACCA--AGTTGCTC---------------GGCTGACTTCGTTAT--CCC--CCGGTTACTGGGTCCATCACTTAGTTGCTCAGCCG
gi|18                         :                                              TGTGAGCGTGTTATT---GAATTCC----ATG---ACGC
gi|18                         :                                                                                                                                           -ATGA---CGC-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--ATAAA-AATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-GCTACAGTTA-C--T-----TAAT--TTA---------TG---C--------T------------TTTT--------TC--AC-TATA------TACAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGC--T------TTCAGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCTGTTTTACCGGTTCCTTCACAA--AGTTGCTCGACAATAGTCAAAGAGGCCGACTTAGTTATCGCCT--CCTGTTACCGGGTCCTTCACTTAGTTGCTCAGCgtatttcttgtttatttggaaaatccaatataccaataaaaataattttcaaatataattaattgtattacgctacagttacttaatttatgcttttttcactatatacacacatgtataaatatctatatttagctttcagtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactcctgttttaccggttccttcacaaagttgctcgacaatagtcaaagaggccgacttagttatcgcctcctgttaccgggtccttcacttagttgctcagct
gi|19                         :                              tgtgagcgtgttattgaattccCGTGTTATT---GAATCCC----GCGTTTACGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------A-AT-----TA-ATGA---TGT-GTGTGC-CTT-GTATAT--TT--G--GG-AAG--TG-CAATACACT----AAAA-CATAATTTTCAAA----GTTCA--T-------TA------AT-T-T---CA-T-----T--C-ATTACAATTA-C--T-----TAAT--TTACATTTGATTC----C--------T------------TGTG--------TC--AC-CATAACCACAGATGCAT---TACATA-AGAGCA-------A----TGA---CAATA--TTTAGCAATCCGA--TTCGGTTTGCGTGAGAACGT--A-TGGCAATGAATAAt
gi|2                          :                                      tatcatTTTGTGAGTGTGTTTTT---GAATCGA----ATGTGTACCAT-TTGA--ATAGG-TGTA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAAAATC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------A----C--------T------------TTTC--------TC--AT-CATAATTTTATAAAC-T---TATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGATGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-AAAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTTTCACCAACAGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTTGTTAT--CCC--CCGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCGcgttatatatagactgaatatgagagctgtataacaacattt
gi|20                         :                                                         caTT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATTCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTTTCTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAC--TA-CAATGTACCA--GATAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA---A-------------T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATCTTAT-TA--T---CA-----------------------------------------------------CGGTGTGCGCAAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGAGTCCTTCACCA--AGTTGCTT---------------GGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|21                         :                                                     gTGTTATT---GAATCCT----ATGTGTATGCT-TTAA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----CA-ACGA---CAT-GTGTTT-CTT-GTATAT--A---A--GAGAAG--TG-CAATACACTA--CTAAA-TAACATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-----TA-A-----CATC-AATGCAA-TA-C--------TGAT--TTG---------C----CTTTATTCAT------------TTTT--------TC--AT-CATAA----ATA--------CAT-TATA----ACGT----A----TA-----TATA--TTTAGA--T------ATTGGTTTGCATTACAATTCAAA-TGGC-ATG-ACAATCCCAa
gi|22                         :                                      tgtcaaaTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTA---AA-ATAAAACTGT-GTG--T-CTT-GTTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTA--AAGAACAAT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-C-A--GAAAAGA-C--C-----T--T--TTA---------TGGGGT--------T------------TTTA--------TC--GT--A----TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TAT---CAATACGTTTAGC--T------ACCAGTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatgaactcagcggtgaaatacatgttgtttattgaaaatt
gi|23                         :                                            cTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTCAAAAA-AAAA---TGT-GTG--T-CTT-ATTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTAATGAACA--AT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-G-AGAAGAG--ACC--T-----TGAT--TTG---------T----T--------T------------TTTT--------TT--AT-CGTA--TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TCA---ATATA--TTTAGC--T------ACAATTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatcaactcatcaaaatatacataaattattgaaaag
gi|24                         :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAG---------------AT------TA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-TTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TT-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAGA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATTATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAAC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTCCGTCACTA--AGTTGCTCAGCaatcaactcagcaaaatatacataaattattgaaaa
gi|25                         :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAG---------------AT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AA---TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTCTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATC--TTTAGC--T------TTCGGTGTACCTGAGAATGTAAATTGA--ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTGTCACTA--AGTTGCTCAGC
gi|26                         :                                                                            TGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----AA-ATGA---TG---------CTT-G---------------A-AGA-----------ACTA--GAAAA-CATAATTTTTAAA----TTTAA--T-------AA------AT-T-T---TA-G-----T------TATG-TTA-T--T-----CGATGGTT--------------------------------------------------C--AT-TATAAATACATGTAC------AT-TACA----A-------AAACATAATGTCTATA--TTTAGC--TACCTGATTTGGCG-GCGTGATGATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACA
gi|27                         :                                          ttatgaagctgtTGTTATT---GAATCCCTTGTATATATATGCTATT----ACAAGATCCA-A----TGGAT------GA------T-AT-----TG-ATGG---TGT-GTGTTT-CTT-TTTTATTTGTGAA--AA-AAA--AA-CAACA--CTG--GAAAA-CCT---TTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTACAATTA-T--T-----TAAT--TTA---------C----TG-------TA-----------TTTG--------TT--GTACATGA-TTTATTTG--T---TATGTATtgcaatgtacataggttggcacattgataaaaacattttcatttcttaataaggaataacattttt
gi|28                         :                                                     GTGTTATA---GAATCCC----GCGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------TA------T-TT-----AA-ATGA---TGC-ATATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAAATTCCAAA----TATCA--T-------AA------AT-T-G---TA-T-----TA-T-ACTACAATTA-C--T-----CAAT--TTA---------C----C--------TACAATTACTCAATTTACCCTTTTTTC--AT-CA------TATATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAG---CTACA--TTTAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATATAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTgtcatgacaatcctgttcatacaataaacatgttgataaataacatttgtattcctttataaggcataacatttttt
gi|29                         :                                          tGTTTGTGAGCGTATTATT---GATTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTGAT--GT--A--GA-AAAA-TC-CAATATACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-ACACTA-TAATTATA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTAA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTA
gi|3                          :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGCG-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-AGGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATAAACAA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AA-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TG--AT-CATACTTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTTGGTGTGTGTGAGAATGTATA-TGAC-ATG-ATAATCTCACTCCGGTTTTACCGGGTTCTTCACCA--AGTTGCTTGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGGTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|30                         :                                                     tacTTATT---GAATCTT----GTGTGTATGCC-ATTA--TCAGA-T-CAGA----TAAAT------GA------T-AA-----AA-ATGA---TGT-GTGTTT-A-T-GTTTAT---T--AGGGA-AAAC-TG-CAATACACCA--GGAAA-CATTATTTTTGAAATTTTATAAATT-------TA------AT-T-A---CA-A-----AA-CAATTACATTTA-C--T-----GAAT--TTA---------T----C--------TTTGTTTGC----TTTT--------TCATAT-TATAA----ATATAT-TTCACAGGCATA----ATGACAACA----TAT---TTTTA--TTTAGC--T------ATTGATTTGCATGAAAa
gi|31                         :                                                   ttGTGCTATT---GTATACC----ATGTGTAT-------A--TCA------A-A----TAAAT------GA------T-AA-----TA-ACAA---TAT-GTGTTG-CAT-GTTTAT---C--A--GG-GAA--TTGCAAACCACTA--GAAGA-CATA---TTCAAA----TTTAT--T-------TA------AT-T-A---CATT-----TA-T-ACAAT--TTATC--T-----TTAT--T-----------C----G--------T------------TGTT--------TC--AT-CATAATT
gi|32                         :                                                     ttGTAATT---GAATCCT----GTATGTACACT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------CAGT-----AA--TGA---TGC-CCGTTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GG-AAA--TG-AAATGCGCTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----CATaccttacacggcataatggcaacgtattattgtttagcaattggtggcggaaatattacaatcacaataacaaataacaat
gi|33                         :                 acatgtacatcatgcattagtcacctgTTTGTCACCATGTAATT---GAATCCT----GTGTGTATGTT-TTTA--------TGTA-ACTATCAGATCC----AA------T--T------A-ATGA---TGT-GTGTTT-TTT-ATTTAT--TT--G--GG-AAA--CG-CA-------A--GAAAA-CATGATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTTTAATTA-C--TGACGGTAAT--TTA---------C----C--------T------------TTtaagtttttggacacccttattttttagaaaattaattactttttcgacaataaagttcagggcatatttgtacttatgtagttatttt
gi|34                         :                                           taTTGAGAGCGTGTTATT---GAGTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGT--A----TAAAT------atagtctgttgctgcatcaaaaatacatgtacattacacaaggata
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTTACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGCTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTagttatatttagctttcggtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactccggttttaccgggtcctttaccaagttgctcggcaatcgtcaaagaggctgacttagctatcccccggttaccgggtccgtcactaagttgct
gi|35                         : ttgagagcgtgttattgagtcccatgtgtacgctttgaacagGTCTGTGAGCATGTTACT---GAATCCC----ATGTGGACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----GA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATGTACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CAT-----------------------------A-------A----CAG---CTATA--TTTAGC--T------TT
gi|36                         :                                                    cGTGTTACT---GG-TCCC----ATGTGTATGCT-TTTA--------TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----TATATGA---TGT-GCGTTT-CTT-CTTTAT--TT--A--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATTATT----AG----TTTCA--T-------TA------A---------A-C-----TA-C-A-TGTACTTA-CCGT-----TA----TTA---------G----T--------T------------GTT---------TC--AT-CATAA
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acattggtcaaatT-CATAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATT--TTTAGC--T------TTCCGTGTGCATGTGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTTACTTAGTTAT--CCC--CTGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTTAGCCGaaacattacacacacaataatta
gi|39                         :                                              TGTGAGCGTGTTATTATTGACTTTC----ATGTGTATGCT-TTTTTTACAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------G-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT-TTT-GTTTAT--AT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TAATAATTAT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTG---------C----
gi|4                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTAC--GC--A--GA-AAA--TC-CAATATACAA--GAAAT-GATAATTTCTAAA----TATGA--T-------GA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTTAAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTGTA--TTAAGC--T------TTCCGTGTGCGTAAGAATGTAAA-TGAC-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTAATGGGTCCTTCACCA--AATTCCTCGGCAATTGTCAAAGAGGCTGCCTTAGTTAT--ACC--CTGGTTACCAGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|40                         :                                                   tacTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT-------A------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--AA-AAT--TC-CAATATACCA--GAAAA-GAAAATTTACAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----CT-------T------------TTTT--------TC--AT-CATA
gi|41                         :                                                                                                                                                                               cgtt-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATCATTTCCAAG----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-CCTGTAATCA-C--T-----TAAT--TTA--------------G--------T------------CTTA--------TC--A------------------T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------AT--------------AT-TAAA-TGAA-ATG-ATAATCACATTCCGGTTTTACTGGGTCCATCACTA--AGTTGCTCAGCt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                        -T-G---TT-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TGG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTTCGTCACTT--AGTCGCTTAGC
gi|43                         :                                            TTTGTCATTGTGTTATT---GAATCGC----ATGT-----------------------A-A----TGAAT------TA------T-GT-----TA-ATGA---TGC-GTGTTT-CTTTATTTAT--TT--G--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----TTTCA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-GCTACAACTT-C--T-----TAAT--GTA---------C----A--------T------------TT
gi|45                         :                                           GTTTTTGAGTGTGGTATT---GAATCAA----ATGTTTACGCT-TTGA--ACAG---------------AT------GA------T-GT-----TA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTT-AT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-attcgttg
gi|46                         :                                            cTTGTGATCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---TAT-TTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--AA-AAA--TC-CAATAAACCA--GAAAA-GATAATTTCCGAA----TATAA--T-------TATATT--AT-T-A---TA-T-----TA-gtcgagctaaaagtt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCAGTTTTACC------TTCACCA--AGTTGCTCGGCAATTGTCAAAAAGGCTGACTTAATTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCa
gi|48                         :                                               GTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTAC--TC--------AAA--TC-CAGTATACAA--GAAAT-GATAATTTa
gi|5                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-TTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-G-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------T----A--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAT-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACGGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------A----TAG----TACA--TGTAG---T------TTCGGTTTGCGTGAATATATAAA-TGTC-ATG-AC-GTCACA
gi|51                         :                                                   cCATGTTAT----AAATCTA----ATGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------T-TT-----TA-ATGA---TGC-ATGCTT-CTT-Gaattagctcagcggtgaaatacatgtaaatcattgaaaac
gi|52                         :                                                      taacACT---GAATCCT------------GCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------T-AT-----TA-ATGA---TGT-GT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacgtcatcttcttcttgaACCGGGTCCGTCAATAAGTTGCTCAGCCg
gi|6                          :                                                TGAGCATGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTAAT--GT--A--GA-AAA--TA-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTCA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---ATATA--TTTAGC--T------TTC-GTGTGTGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACTGGGTCCTTCATGA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAGAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCGTCATTTAGTTGCTCAGCCGa
gi|7                          :                                           GTTTGTGAGCTTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGCA-A----AAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GT-TTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACTA--GAAAA-GATAATATCTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CAGAATTTTATAAAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGTGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATTACACTCTGGTTTTACAGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATTGTCAAAGAGGCTGATTTAGTAAT--CCC--CAAGTTAACGGGTCCGTCACTAAATTGCTCAGTC
gi|8                          :                                             TTGTGAGCATGTTATT---GATTCCT----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AG-ATCA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTGC--GC--A--AA-AAA--TC-AAATATACAA--GAAAT-GATAATTTTTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTACAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATGTAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGCCTTAGTTAT--ACC--CCAGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|9                          :                                           cgTTGTGAGCGTGTTACT---GAATCCC----ATGTGGATGCT-TT-A--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----GA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATGTACCA--GAAAG-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----CA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TT-A--------TC--AT-CAAAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTATGCATGACAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--GGTTACTCGGCAATCGTCAAAGCAGTTTACTTAGTTGT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACGAAGTTGCTCAGCCG


blockSeqs                     :                                                             ATT       TTGT                TT    GA      CTAT     AAATCC  ATCCGA    TCAAA       AAC          T          TT  GA GG  G   AA TG          AT     CA            ATTT     AT .        ATAATT      CAC    AATTA    A          C CG GACGG    GG   CATTTGATT GGGG TTTATTCA ACAATTACTCAA    CCCTTTTT  AT  A     T         A TCA        GAGC TGACAAC AACA   TGT     CG      AA ACCTGA                       T    A   A                                   AC                                      CG   CT
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        CC      ATCCGA    TA          .            T          .   .  .   G   A  C           .      G             .        .  .        TATT        .      .        .          T .  .        .    .         G    G        TTGTTTGC        .         .   .     T         . .          .    CGT     .      .       .       .  CCGA                         .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       ATCCGA    .           .            .          .   .  .   G   C  A           .      T             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    T        A               .         .   .     T         . .          .    C       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       ATCCGA    .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    C       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       ATTCGA    .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      T             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       ATCCGA    .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      A             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      A             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     C         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      A             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      T             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     A         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  T           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                       .    . 
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                              
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                              
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     T         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                              
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                   .                                              
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  G           .      C             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                            .    .   .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     A       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .         . .          .    .       .      .       .       .  .                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .     .                           .       .      .       .       .  .                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     G       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .               .         .   .                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     .       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  A           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .                             .                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     .       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .    .        .                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     .       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .          . .  .        .    .         .                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     .       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  C           .      G             .        .  .        .           .      .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                             .         .                   .     .       .        .       .         .           .            .          .   .  .   .   .  .           .      .             .                                .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                         
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|18                         :                                              TGTGAGCGTGTTATT---GAATTCC----ATG---ACGC
gi|18                         :                                                                                                                                           -ATGA---CGC-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--ATAAA-AATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-GCTACAGTTA-C--T-----TAAT--TTA---------TG---C--------T------------TTTT--------TC--AC-TATA------TACAC-A---CATGTATA----A-------A----TAT---CTATA--TTTAGC--T------TTCAGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCTGTTTTACCGGTTCCTTCACAA--AGTTGCTCGACAATAGTCAAAGAGGCCGACTTAGTTATCGCCT--CCTGTTACCGGGTCCTTCACTTAGTTGCTCAGCgtatttcttgtttatttggaaaatccaatataccaataaaaataattttcaaatataattaattgtattacgctacagttacttaatttatgcttttttcactatatacacacatgtataaatatctatatttagctttcagtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactcctgttttaccggttccttcacaaagttgctcgacaatagtcaaagaggccgacttagttatcgcctcctgttaccgggtccttcacttagttgctcagct
gi|19                         :                              tgtgagcgtgttattgaattccCGTGTTATT---GAATCCC----GCGTTTACGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------A-AT-----TA-ATGA---TGT-GTGTGC-CTT-GTATAT--TT--G--GG-AAG--TG-CAATACACT----AAAA-CATAATTTTCAAA----GTTCA--T-------TA------AT-T-T---CA-T-----T--C-ATTACAATTA-C--T-----TAAT--TTACATTTGATTC----C--------T------------TGTG--------TC--AC-CATAACCACAGATGCAT---TACATA-AGAGCA-------A----TGA---CAATA--TTTAGCAATCCGA--TTCGGTTTGCGTGAGAACGT--A-TGGCAATGAATAAt
gi|2                          :                                      tatcatTTTGTGAGTGTGTTTTT---GAATCGA----ATGTGTACCAT-TTGA--ATAGG-TGTA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAAAATC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------A----C--------T------------TTTC--------TC--AT-CATAATTTTATAAAC-T---TATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGATGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-AAAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTTTCACCAACAGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTTGTTAT--CCC--CCGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCGcgttatatatagactgaatatgagagctgtataacaacattt
gi|20                         :                                                         caTT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATTCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-CTTTTTTCTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAC--TA-CAATGTACCA--GATAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA---A-------------T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATCTTAT-TA--T---CA-----------------------------------------------------CGGTGTGCGCAAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGAGTCCTTCACCA--AGTTGCTT---------------GGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCATCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|21                         :                                                     gTGTTATT---GAATCCT----ATGTGTATGCT-TTAA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----CA-ACGA---CAT-GTGTTT-CTT-GTATAT--A---A--GAGAAG--TG-CAATACACTA--CTAAA-TAACATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-----TA-A-----CATC-AATGCAA-TA-C--------TGAT--TTG---------C----CTTTATTCAT------------TTTT--------TC--AT-CATAA----ATA--------CAT-TATA----ACGT----A----TA-----TATA--TTTAGA--T------ATTGGTTTGCATTACAATTCAAA-TGGC-ATG-ACAATCCCAa
gi|22                         :                                      tgtcaaaTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTA---AA-ATAAAACTGT-GTG--T-CTT-GTTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTA--AAGAACAAT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-C-A--GAAAAGA-C--C-----T--T--TTA---------TGGGGT--------T------------TTTA--------TC--GT--A----TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TAT---CAATACGTTTAGC--T------ACCAGTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatgaactcagcggtgaaatacatgttgtttattgaaaatt
gi|23                         :                                            cTTGTCAATATTTTAGT---GTATCCT----ATGTGTACACT-TTTA--TCAGA-TTCG-A----TAAAT------AA------T-ATTCAAAAA-AAAA---TGT-GTG--T-CTT-ATTTAT--G---A--GAGAAA--TG-CATTTGACTAATGAACA--AT-ATTTTCAAA----T------T-------TA------AT-T-A---CA-A-----TA-G-AGAAGAG--ACC--T-----TGAT--TTG---------T----T--------T------------TTTT--------TT--AT-CGTA--TTTATA-AC-T---TATTGATA----AC------A----TCA---ATATA--TTTAGC--T------ACAATTTTGCATTA-AATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACAaatcaactcatcaaaatatacataaattattgaaaag
gi|24                         :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAG---------------AT------TA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-TTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TT-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAGA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATTATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAAC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTCCGTCACTA--AGTTGCTCAGCaatcaactcagcaaaatatacataaattattgaaaa
gi|25                         :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAG---------------AT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AA---TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--A-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTCTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATC--TTTAGC--T------TTCGGTGTACCTGAGAATGTAAATTGA--ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCTGTCACTA--AGTTGCTCAGC
gi|26                         :                                                                            TGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----AA-ATGA---TG---------CTT-G---------------A-AGA-----------ACTA--GAAAA-CATAATTTTTAAA----TTTAA--T-------AA------AT-T-T---TA-G-----T------TATG-TTA-T--T-----CGATGGTT--------------------------------------------------C--AT-TATAAATACATGTAC------AT-TACA----A-------AAACATAATGTCTATA--TTTAGC--TACCTGATTTGGCG-GCGTGATGATGTAAA-TGTC-ATG-ACAATCACA
gi|27                         :                                          ttatgaagctgtTGTTATT---GAATCCCTTGTATATATATGCTATT----ACAAGATCCA-A----TGGAT------GA------T-AT-----TG-ATGG---TGT-GTGTTT-CTT-TTTTATTTGTGAA--AA-AAA--AA-CAACA--CTG--GAAAA-CCT---TTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTACAATTA-T--T-----TAAT--TTA---------C----TG-------TA-----------TTTG--------TT--GTACATGA-TTTATTTG--T---TATGTATtgcaatgtacataggttggcacattgataaaaacattttcatttcttaataaggaataacattttt
gi|28                         :                                                     GTGTTATA---GAATCCC----GCGTGTATGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAAAT------TA------T-TT-----AA-ATGA---TGC-ATATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAAATTCCAAA----TATCA--T-------AA------AT-T-G---TA-T-----TA-T-ACTACAATTA-C--T-----CAAT--TTA---------C----C--------TACAATTACTCAATTTACCCTTTTTTC--AT-CA------TATATAC-A---CATGTATA----A-------A----TAG---CTACA--TTTAGC--T------TTTGGTGTGCGTGAGAATATAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTgtcatgacaatcctgttcatacaataaacatgttgataaataacatttgtattcctttataaggcataacatttttt
gi|29                         :                                          tGTTTGTGAGCGTATTATT---GATTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTGAT--GT--A--GA-AAAA-TC-CAATATACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-ACACTA-TAATTATA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTAA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTA
gi|3                          :                                          cGTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGCG-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-AGGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATAAACAA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AA-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TG--AT-CATACTTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTTGGTGTGTGTGAGAATGTATA-TGAC-ATG-ATAATCTCACTCCGGTTTTACCGGGTTCTTCACCA--AGTTGCTTGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGGTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCC
gi|30                         :                                                     tacTTATT---GAATCTT----GTGTGTATGCC-ATTA--TCAGA-T-CAGA----TAAAT------GA------T-AA-----AA-ATGA---TGT-GTGTTT-A-T-GTTTAT---T--AGGGA-AAAC-TG-CAATACACCA--GGAAA-CATTATTTTTGAAATTTTATAAATT-------TA------AT-T-A---CA-A-----AA-CAATTACATTTA-C--T-----GAAT--TTA---------T----C--------TTTGTTTGC----TTTT--------TCATAT-TATAA----ATATAT-TTCACAGGCATA----ATGACAACA----TAT---TTTTA--TTTAGC--T------ATTGATTTGCATGAAAa
gi|31                         :                                                   ttGTGCTATT---GTATACC----ATGTGTAT-------A--TCA------A-A----TAAAT------GA------T-AA-----TA-ACAA---TAT-GTGTTG-CAT-GTTTAT---C--A--GG-GAA--TTGCAAACCACTA--GAAGA-CATA---TTCAAA----TTTAT--T-------TA------AT-T-A---CATT-----TA-T-ACAAT--TTATC--T-----TTAT--T-----------C----G--------T------------TGTT--------TC--AT-CATAATT
gi|32                         :                                                     ttGTAATT---GAATCCT----GTATGTACACT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------CAGT-----AA--TGA---TGC-CCGTTT-CTT-GTTTAT--TT--G--GG-AAA--TG-AAATGCGCTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----CATaccttacacggcataatggcaacgtattattgtttagcaattggtggcggaaatattacaatcacaataacaaataacaat
gi|33                         :                 acatgtacatcatgcattagtcacctgTTTGTCACCATGTAATT---GAATCCT----GTGTGTATGTT-TTTA--------TGTA-ACTATCAGATCC----AA------T--T------A-ATGA---TGT-GTGTTT-TTT-ATTTAT--TT--G--GG-AAA--CG-CA-------A--GAAAA-CATGATTTTCAAA----TTTAA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-ACTTTAATTA-C--TGACGGTAAT--TTA---------C----C--------T------------TTtaagtttttggacacccttattttttagaaaattaattactttttcgacaataaagttcagggcatatttgtacttatgtagttatttt
gi|34                         :                                           taTTGAGAGCGTGTTATT---GAGTCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGT--A----TAAAT------atagtctgttgctgcatcaaaaatacatgtacattacacaaggata
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGTATA----A-------A----TAG---TTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTTACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGCTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTagttatatttagctttcggtgtgcgtgagaatgtaaatgacatgataatcacactccggttttaccgggtcctttaccaagttgctcggcaatcgtcaaagaggctgacttagctatcccccggttaccgggtccgtcactaagttgct
gi|35                         : ttgagagcgtgttattgagtcccatgtgtacgctttgaacagGTCTGTGAGCATGTTACT---GAATCCC----ATGTGGACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----GA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATGTACCA--GAAAA-GACAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CAT-----------------------------A-------A----CAG---CTATA--TTTAGC--T------TT
gi|36                         :                                                    cGTGTTACT---GG-TCCC----ATGTGTATGCT-TTTA--------TCCA-A----TAAAT------GA------T-AT-----TATATGA---TGT-GCGTTT-CTT-CTTTAT--TT--A--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATTATT----AG----TTTCA--T-------TA------A---------A-C-----TA-C-A-TGTACTTA-CCGT-----TA----TTA---------G----T--------T------------GTT---------TC--AT-CATAA
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acattggtcaaatT-CATAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATT--TTTAGC--T------TTCCGTGTGCATGTGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTTACTTAGTTAT--CCC--CTGGTTACTGGGTCCGTCACTAAGTTGCTTAGCCGaaacattacacacacaataatta
gi|39                         :                                              TGTGAGCGTGTTATTATTGACTTTC----ATGTGTATGCT-TTTTTTACAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------G-GT-----AA-ATGA---TGC-GTATTT-TTT-GTTTAT--AT--G--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TAATAATTAT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTG---------C----
gi|4                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTAC--GC--A--GA-AAA--TC-CAATATACAA--GAAAT-GATAATTTCTAAA----TATGA--T-------GA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTTAAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAT-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTGTA--TTAAGC--T------TTCCGTGTGCGTAAGAATGTAAA-TGAC-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTAATGGGTCCTTCACCA--AATTCCTCGGCAATTGTCAAAGAGGCTGCCTTAGTTAT--ACC--CTGGTTACCAGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|40                         :                                                   tacTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACACT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT-------A------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--TT--G--AA-AAT--TC-CAATATACCA--GAAAA-GAAAATTTACAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----CT-------T------------TTTT--------TC--AT-CATA
gi|41                         :                                                                                                                                                                               cgtt-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATCATTTCCAAG----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-CCTGTAATCA-C--T-----TAAT--TTA--------------G--------T------------CTTA--------TC--A------------------T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------AT--------------AT-TAAA-TGAA-ATG-ATAATCACATTCCGGTTTTACTGGGTCCATCACTA--AGTTGCTCAGCt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                        -T-G---TT-T-----TA-C-ACTATAATCA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TGG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTACGTGAGAATGTAAA-TGAA-ATA-ATAATCACACTCCGGTTTTACCAGGTTCGTCACTT--AGTCGCTTAGC
gi|43                         :                                            TTTGTCATTGTGTTATT---GAATCGC----ATGT-----------------------A-A----TGAAT------TA------T-GT-----TA-ATGA---TGC-GTGTTT-CTTTATTTAT--TT--G--GA-AAA--TG-TAATACACTA--GAAAA-CATAATTTTCAAA----TTTCA--T-------TA------AT-T-T---TA-T-----TA-C-GCTACAACTT-C--T-----TAAT--GTA---------C----A--------T------------TT
gi|45                         :                                           GTTTTTGAGTGTGGTATT---GAATCAA----ATGTTTACGCT-TTGA--ACAG---------------AT------GA------T-GT-----TA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTT-AT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-attcgttg
gi|46                         :                                            cTTGTGATCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---TAT-TTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--AA-AAA--TC-CAATAAACCA--GAAAA-GATAATTTCCGAA----TATAA--T-------TATATT--AT-T-A---TA-T-----TA-gtcgagctaaaagtt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCAGTTTTACC------TTCACCA--AGTTGCTCGGCAATTGTCAAAAAGGCTGACTTAATTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCa
gi|48                         :                                               GTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-TT-----AA-ATGA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTAC--TC--------AAA--TC-CAGTATACAA--GAAAT-GATAATTTa
gi|5                          :                                           GTTTGTGAGCGTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-TTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-G-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------T----A--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAT-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACGGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGCCG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------A----TAG----TACA--TGTAG---T------TTCGGTTTGCGTGAATATATAAA-TGTC-ATG-AC-GTCACA
gi|51                         :                                                   cCATGTTAT----AAATCTA----ATGTATATGCT-TTTA--TCAGA-TGCA-A----TAAAT------GA------T-TT-----TA-ATGA---TGC-ATGCTT-CTT-Gaattagctcagcggtgaaatacatgtaaatcattgaaaac
gi|52                         :                                                      taacACT---GAATCCT------------GCT-TTTA--TCAGA-TCCA-A----TAAAT------TA------T-AT-----TA-ATGA---TGT-GT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacgtcatcttcttcttgaACCGGGTCCGTCAATAAGTTGCTCAGCCg
gi|6                          :                                                TGAGCATGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GAATCCGAT-GT-----AA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTAAT--GT--A--GA-AAA--TA-CAATATACCA--GAAAA-GATAATTTCCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-A-----TA-C-ACTATCATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTCA--------TC--AT-CATAATTTTATATAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---ATATA--TTTAGC--T------TTC-GTGTGTGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCTGGTTTTACTGGGTCCTTCATGA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAGAGAGGCTGACTTAGTTAT--CCC--CAGGTTACTGGGTCCGTCATTTAGTTGCTCAGCCGa
gi|7                          :                                           GTTTGTGAGCTTGTTATT---GAATCCC----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGA-TGCA-A----AAGAT------GA------T-GT-----AA-ATGA---TGT-GT-TTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATATACTA--GAAAA-GATAATATCTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CAGAATTTTATAAAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTGTGTGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATTACACTCTGGTTTTACAGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATTGTCAAAGAGGCTGATTTAGTAAT--CCC--CAAGTTAACGGGTCCGTCACTAAATTGCTCAGTC
gi|8                          :                                             TTGTGAGCATGTTATT---GATTCCT----ATGTGTACGCT-TTGA--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----AG-ATCA---AGT-GTATTT-CTT-GTTTGC--GC--A--AA-AAA--TC-AAATATACAA--GAAAT-GATAATTTTTAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----TA-C-ACTACAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TTTA--------TC--AT-CATAATTTTATGTAC-T---CATGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTAAGC--T------TTCGGTGTGCGTGAGAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--AGTTGCTCGGCAATCGTCAAAGAGGCTGCCTTAGTTAT--ACC--CCAGTTACCGGGTCCGTCACTAAGTTGCTCAGC
gi|9                          :                                           cgTTGTGAGCGTGTTACT---GAATCCC----ATGTGGATGCT-TT-A--ACAGG-TGCA-A----TAGAT------GA------T-GT-----GA-ATGA---TGT-GTATTT-CTT-GTTTAT--GT--A--GA-AAA--TC-CAATGTACCA--GAAAG-GATAATTTTCAAA----TATAA--T-------TA------AT-T-G---TA-T-----CA-C-ACTATAATTA-C--T-----TAAT--TTA---------C----C--------T------------TT-A--------TC--AT-CAAAATTTTATATAC-T---CGTGTATA----A-------A----TAG---CTATA--TTTAGC--T------TTCGGTATGCATGACAATGTAAA-TGAC-ATG-ATAATCACACTCCGGTTTTACCGGGTCCTTCACCA--GGTTACTCGGCAATCGTCAAAGCAGTTTACTTAGTTGT--CCC--CCGGTTACCGGGTCCGTCACGAAGTTGCTCAGCCG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTATTAAAAAAATGAAATACATCAGAAAACAATATTTTCAAATTTAATATAATACAATTACTGTATGTATAAATACATGACTGTATATTACACAGGTATAATGAACATATCTATATGTTAATGACATGGCAAGCACAAATGAGCTCGGCGATGAAATACATGTCAATTATTTACAATCAATGAC
Unaligned ( gi|44 ): TTTATTAAAGAAATGCAATACACCAGAAAATAACATTTTCAAATTTGATATAATACAATTACTGTATGTATAAATACATGTATATTACACAGGTATAATGAACATATCTATATGTAAATGTCACGGCAATCACAAATGAACTCGGCAAT
Unaligned ( gi|49 ): TTAGAAAAATGCAATTCACTAGAAAATAATATTTTCAATTTTGATTACAATACAATTAACGGATTGACATTTATTCATTGTTTAATGATAATACATTACA