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blockSeqs : . A T . . .
blockSeqs : . A A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
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blockSeqs : .
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blockSeqCons : AACGAAGC*************************************
originalCons : TTCGGAACACCTCGCTCAATTCTC-----CGAATCA------A--------A----C-------G-------A---A--GCACAAA---A---A-GT-G--CG--AGCAGTGCC---CGAGGAGTTCC
finalCons : TTCGGAACACCTCGCTCAATTCTC-----CGAATCAAACGAAGC-------------------------------------ACAAA---A---A-GT-G--CG--AGCAGTGCC---CGAGGAGTTCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): ATTCGGAAATCCTCGCCCAATTCTTACTCAAGCAGTGGCCGAGAGTTCCGA
Alignments
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lowQualScore : ..... ............................................. ....... . . .. .. ...
lowQualScore : 33333 000000000000000000000000000000000000000000000 6666666 0 0 33 33 777
consensus : TTCGGAACACCTCGCTCAATTCTC-----CGAATCA------A--------A----C-------G-------A---A--GCACAAA---A---A-GT-G--CG--AGCAGTGCC---CGAGGAGTTCC
Reference ( family-4426 ) : TTCGGAACACCTCGCTCAATTCTC-----CGAATCA------A--------A----C-------G-------A---A--GCACAAA---A---A-GT-G--CG--AGCAGTGCC---CGAGGAGTTCC
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): ATTCGGAAATCCTCGCCCAATTCTTACTCAAGCAGTGGCCGAGAGTTCCGA