lowQualScore : 1111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 22 1 1 3333333333333333 1 1 2 1 1 1 111 11 222 111 11 111 11 1 11 1 22222222 11 22222 1111 1 1111111 111111111 2 111 1 111111 2 2222222222222 22222222 444444444444444 2222222222222222 666 2222222222 1 333333333333333 11111 2222 1 333333333333 33333 55555555555 6666666666666666 111 33333333333 11 1111111 1 11 1 22222222 333333333333333333 333333333333333 111 222222 1 8888888888888888888 222 222 11 111 777777777 111111 1 111111111 111 1111 1111 2222222222 1 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55555555 222222 1 11 4444444444444444 222222222 1 55555555555555555555555555555555555 1 22222222 3333333333 11111 1111 111 111 1 22222222 2222222 1 1 111 11 222 1111111 1111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333 111111 11 11111111 111 11111111111 111111 11 11 2222 111 1 2222222 1
lowQualScore : 11 7 5 1 1111111111111111 7 5 0 3 5 5 5 1 111 4444 88 33 4 000 8 777 22 3 111 3 0 11 333 5 66 0 11 4 0 77777777 0 33 2 1 8 88888 1 0 5 2222 5 66 0 0 0 0000000 222222222 5 1 2 99 9999 0 2 000 1 6 666666 5 5 1 2 55 4 2 66 6 6 0 3 5555555555555 6 22222222 1 333333333333333 5555555555555555 1 6 2 555 7777777777 6 8 2 0 777777777777777 888 1 55555 1 8888 9 1 111111111111 44444 0 99 55555555555 6666666666666666 6 6 444 88888888888 8 88 11 6 88 6 6 8888888 5 77 6 9 0 3 99999999 55 333333333333333333 7 6 1 55 66 4 4 111111111111111 333 777 1 999 666666 4 55 8 0 6 0000000000000000000 1 99 888 0 55 333 1 8 7 888 8 999 99 0 5 3 1 111 444444444 66 777777 8 33 5 999999999 4 111 4444 0 1111 6 4 4 1111111111 8 6 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444 777777 7 0 1 11 6666666666666666 888888888 5 1 11111111111111111111111111111111111 1 88 666 77777777 3 9 8888888888 33 0 0 33333 0 5 5 7 1111 5 5555 7 111 55 4 66 666 1 777 0 1 777 33333333 1 5 6666666 77 55 7 55 5 6 1 222 777 88 3 11 4 4 2 2 5 555 55 444 3 7 666 1 55 0000000 4 3 66 3 9999999999 2 3 3 55 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9999999 000000 2 7 6 3 6 55 3 99999999 111 3 2 55 33333333333 3 222222 00 0 33 0 4 8888 333 66 5 3 6666666 1
lowQualScore : .. . . . ................ . . . . . . . . ... .... .. .. . ... . ... .. . ... . . .. ... . .. . .. . . ........ . .. . . . ..... . . . .... . .. . . . ....... ......... . . . .. .... . . ... . . ...... . . . . .. . . .. . . . . ............. . ........ . ............... ................ . . . ... .......... . . . . ............... ... . ..... . .... . . ............ ..... . .. ........... ................ . . ... ........... . .. .. . .. . . ....... . .. . . . . ........ .. .................. . . . .. .. . . ............... ... ... . ... ...... . .. . . . ................... . .. ... . .. ... . . . ... . ... .. . . . . ... ......... .. ...... . .. . ......... . ... .... . .... . . . .......... . . . . .............................................................................................................................................................. ........ ...... . . . .. ................ ......... . . ................................... . .. ... ........ . . .......... .. . . ..... . . . . .... . .... . ... .. . .. ... . ... . . ... ........ . . ....... .. .. . .. . . . ... ... .. . .. . . . . . ... .. ... . . ... . .. ....... . . .. . .......... . . . .. .................................................................................................................................................... ....... ...... . . . . . .. . ........ ... . . .. ........... . ...... .. . .. . . .... ... .. . . ....... .
lowQualScore : 00 0 0 0 3333333333333333 0 0 7 0 5 0 0 0 777 7777 88 33 3 000 7 555 55 0 000 2 2 55 222 0 99 0 99 0 0 99999999 2 88 5 3 9 44444 1 2 0 2222 0 99 2 3 7 6666666 333333333 0 7 3 66 6666 6 9 000 4 4 444444 7 7 7 3 99 9 1 99 7 7 0 7 5555555555555 0 77777777 0 333333333333333 5555555555555555 0 7 2 888 3333333333 7 0 5 3 888888888888888 777 5 66666 4 0000 4 4 222222222222 44444 8 44 88888888888 0000000000000000 6 8 000 00000000000 0 66 00 7 88 7 7 8888888 0 00 7 8 5 5 00000000 99 999999999999999999 4 3 7 44 77 7 7 666666666666666 333 777 4 444 111111 3 77 3 6 4 2222222222222222222 4 00 444 8 88 222 4 2 4 444 0 444 00 7 2 3 0 777 000000000 22 888888 0 22 0 777777777 2 777 2222 3 3333 3 4 4 3333333333 8 8 5 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 777777 9 1 6 99 1111111111111111 333333333 4 4 11111111111111111111111111111111111 4 66 777 77777777 0 6 4444444444 11 8 1 11111 2 0 0 6 5555 0 8888 2 888 66 4 11 777 4 888 0 7 888 99999999 7 7 1111111 22 55 0 55 7 0 4 555 000 77 8 88 0 0 5 1 4 000 55 888 2 5 999 6 55 5555555 2 5 55 6 7777777777 1 6 4 00 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 555555 8 3 0 6 4 00 6 55555555 999 6 1 55 66666666666 7 888888 99 5 88 8 1 7777 444 77 6 0 0000000 8
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA-T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGGTAT---GACCTNAGGCCATTTCTTAATAGAGCAATA---AAAGACAA---GAAA-CGTGCCTACCTNA-AATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGAC-ACTGATTTA-AATGACA--TTGTNAAAGTTA-ATAAATAGGACGGAGGCCAAGG-TC-TA-TA-TAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---ACTTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-TT---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAA------TGT-AA-CGCTGACTTTTTGTNTTTTTTAAAGCAATNTGATATATGTGCNCTTAA-TGA-AACNTGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGANC-TTTTCGTTGGTTAC-CATCGTTTTAAT-ATGTTAGAAA--AAAGACGTCATC-TAAAGGTCGCCAC-TCGG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGA--AACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAA----ATAGTTAA-C--TTGTGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAAAAAAATATAATTAA--G------------TATTTTGTTT---ATGT-----------ATCTC-CGGAAGGT-TC--CTCTATAT-ATAATGCGAATG-AA-G--AGTTNAATGGTGTN-AATTGT-TTCGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGTGT-ATTTCCAGAT--------G--ACGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATNCNAGATGTGG---GTCA--TTT-CAAGATATTATNGAAGATGACAATGTT--GATTTCA----TATTTNAAGACGANGATGTATTATATGAAAATGATAATTTTT-----ANTGTA-A-A---AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNTATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTAT-GGAATTCACNTTCTGAACGGTNGATTGCATAACGATA---AAG--A-ATGGTAATTACACTTGC-A-CAGCAAACGATGGCTCTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCTCA--G--ATCTATTTCC---ACA----TAT-CT-CACGCTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GAGTCTGNCCA-CTTTCC----ATT---------GCATTTNT---N---TTNTA-C-T-AAA--TC--------A-T--ATGCAGT-GATGCTGAC-ANTACG--A--T---A-TGA---TAAC--AAT-ACCT-NAACGAT------GATTTAAGA-GC------------TTTAAATGGGA--TA-TGNAAAACNG----GACGAATTTNTTAACAGTCTAA--GATCTT-----CTTTTGTT--GA-A--NTAAAAGATGCTATT-TTA--GAGA---CCGTAC---CT--CATGAC-ATA-GAAC-AAGCTGTACATCAAATTGT-T-ACA--TGTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAANATTAAC-GCAACCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAA-CAGTTAAAATTTAAT-A-A--AAAC---AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTA---AACGG-TGACACTCNAAA--TTACGAAA-T--ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAGCAGGCTTGC---AAACNGAAACAACTTGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTNTAGACTCACGGTC-AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGAA--TCAGATTT--AAGCAGACACG---TTGCGATAG-TAAC-ATTTCATCA--TNA-----GCGTGGTATANCC-ACTTCAA--AA--------------------------A-----T--------------AT--------------ATT-A---CN--------A---------T----T------------G------A------A-CAG-AAC-GTATT----------ACCTGAACG------ATGA------TACNATAGAT-GATATATTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT-GCC------GAACT-T-GA-GAAAA--GTG-TAA-----GCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( gi|3 ) : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA-TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAATA---AAATACAA---GAAA-CGTGCCTACCTTA-ATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGAC-ACGAATTTA-AATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TA-TAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---ATTTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-TT---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAA------TGT-AA-TGCTGACTTTTTGTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAA-TGA-A-CATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGT-TTCTTGTTGGTTAT-CATTGTTTTAACTATGTTAGAAA--AAGGACGTCATC-TAAAGGTCGTCAT-TCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGA--ATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAA----ATAGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTT--TCAAAGAAATATAATCAA--G------------TGTTATACTT---ATGT-----------ATCTC-CAGAAGGT-TC--CTCTATAT-ATAATGTAAATG-AA-G--AGTTGAATTGTGTT-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGTGT-ATTTCCAAAT--------G--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTT--TATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAATGTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-----ATTGTA-A-A---AGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATAT-GTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATA---AAGTTATATTATAATTATATTTGC-A-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCTTA--G--ATTTATTTCC---ACA----TAT-CT-CATGCTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCA-TTTCCC----ATT---------GCATTTTT---C---TTTTA-C-T-AAA--TC--------A-T--ATGC--T-TATGCTGAC-ATTACGGAA--T---A-TGA---TAAC--AAT-ACCT-TAACGA-------GACTTGAGA-GG------------TTTAAATGGGA--AACTGTAAAACAG----GACGAATTTGTTAACAGGCTAC--GTTCTT-----CTTTTGTT--GA-A--ATAAAAGATACTATT-TTA--AAAA---CCACAC---CT--CATAAC-ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-ACAT-TATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAA-CAGTTTAAATTGAAT-A-A--AAAC---AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTA---AATGG-TGATACTCCAAA--TTATGAAA-T--ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACAAACTTGC---AAACGGAAACAACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG---AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAA--TCAGATTT--AAACAGACACA---TTACGATAG-TAAC-ATTTCATCA--TCA-----GCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA--------------------------A-----T--------------A---------------ATT-A---C---------A---------T----T------------G------A------A-CAA-AAT-CTATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATATTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT-GCT------GAACT-T-GA-GAAAA--GTG-TAA-----GTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA-T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAATA---AAAGACAA---GAAA-CGTGCCTACCTTA-AGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGAC-ACTGGTTTA-AATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TA-TAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---ACTTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCTT---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAA------TGTAAA-TG-TAACTTTTTGTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTAC
gi|12 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT----GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAATA---AAAGACAA---GAA--CGTGCCTACCTTA-AATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGAC-ACTGATTTA-AATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAA
gi|7 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA-T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTA
gi|2 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAAT--AG-AA-A---AATTGCAAAACGAAATCGTGCTTTTCTGAGATT-TGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGA--TCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCA-AAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------ATC-ATTTTATAT--AAAT--GTGGT-TTCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAAACAAATTGG-AACTGCTTAGTT-----ACTTT---AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAA-TGA-A-TCTGAA--------------GACGAATTTGAT---------TGTT---TAC---TTGCTATAATTTTATCAGAAA--AAAGAGAT-ATAATAAGGGCCGCCAC-TCTG---GTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGA--G-AAG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAA----TTAAATAAAC--TTC-GTATTTTTACG---------AATTGCA----AATGACATTTTTAATATAAAAAATAACATTA----------------TATTATGTTTTCTATAT-----------ATTTCACAAGAAGTGTC--ACCTATTT-AAAACG-AAATA-AATG--GATTTAATGGTGTG-AAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTA--GTCTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTGCA----T--TTAAAGTCGATGATGTTTTATATGAAAACGATGATTTTT---------CA-ATACCTAGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTT-GGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACA---AA----TAAGGTAACTTCACTT-C-ATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGTCT--A--ACCT-TTTCCCTTACA----TTT-CT-AAT--TTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCA-CTTTCC----ATT---------ATA--------------ATA-CGC-AAACGTT--------A-TGGATGT--T-AA---TGAA-A--ACGAAAGCTTAAA-TGA---CAACCAAAT-ACCTGTAA--AT------GATCTAAGA-TGCATTTTAACCTTTTTAAATGGGACGAA--GAAAAACTA----AA--AATAT-TTAAAA--CCA------TTTAAAAGCTTTGGTTACGA-AT-GTAAAAGATGATATT-TCT--GAGG---CCATA----TTGACA-AACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGATA--TGTATCAGAAAGCTGC--A--------ACAAACATGAG---AAAGAGGCCTTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAA-TCCTTAAAA-------A-A--AGACT--AAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTA---AACAGCT--CACGCGAAACTTTAC-AAA-T--ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCAGGTTTGC---AAACTTAAAGAAACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTC-CAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAAT--TAAGATTT--AAGAAAA--------TGCGA-AGCCAAA-ATAGTATTA--CTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA--------------------------ACC---T------------------------------GTT-A---CA--------A---------TCGAGT------------G------A------G-CAG-AACGCAATTCTCATGAAA-ATTTGAACGAGGAAAATGT------TATTATAGAT-AAAAGTTTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT-A--------GAACT----A-G--------------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATAT
gi|13 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaatacgtttcttaggattttccaagtagagttgccAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAAT-------TGCAAAAGGAAATCGTGCCTTTCTGAGATT-TGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGA--TCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCA-CAC--ATAGTtctctaaaagacatatcaccattatta
gi|1 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAATAGAGAAAAACAA---TAAA----GCCTATTTGA-AACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGAT-GCTGAT----AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC------------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAACTT---TAG-ATTTAAACATGTTATGCT---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACA------CGT-AA-CATTGATTTCTTGTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAA-TGA-AACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACC-ATTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAATAATGCTCGAAACAAAAGGTGTTAC---AAAGGTCGCCAC-TCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGAT--------AG------------AGAATG---GCTTAGTGAAGAGGATAGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-TTTTAT--T------AATGTAATTAA--GGATATTATTTTATGTTTTGTTT---ACAT-----------ATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA-G--A----AATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGTAT-ACT----GAT--------G--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTT--GATTTTA----TTTTTGACCACGAGGATACATTGTATGACAATGATA-CTTTT-----AATGTATA-T---CGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTAT-GGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAGAAG-GAAATT----TCACAT---CAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGCTTC--TAGCG--AGCTGTTTCC---ACA----TAT-AA-CACACTTTGAGATAGGAGATCGGCAC--GAGTCTGACCACTTTCCT----CTT-----------ATTTGTAGAC---TAGTATT-T-AAA--TCCGACCAAAA-T--A-GCAGT-GATACTGAT-GATA-----------A-TGA---TAAC--GAA-ATC---AATGATGTAAACGATTTTAAACGC------------TTTAAATGGAA-----TG-AAAACAAAAGTGAAGAGTTTTCGAATAATATAA--GATCTG-----C-TTTATT--AACA--ATAAAATATACTATTCTTAGGACAT---CCGTAC---------TGAT-ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-ACA--TGTTTCATAAAGCTGC-AATT------A-GCAAA-CGAATAAAAC-----CCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAA-CA-TTTAAAAAGGGA-A-A--AAATATAAAAAC--TAAGA---TTATTTAGATTATTCAATA---CAAAATCTAGT--TTACAAGATT--ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATA---TTGCTGTAAACAAAAACAGACTGATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTCGT---AAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGT--AAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAA---TTGTGATA---AACAATTTTAAAA--CAA-----ACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG--------------------------A-----TCTACTGTATGATGCA---------------AAT-G---C---------AGTAAATAATT----T------------G------ATTG---A-CGATAAT-ATTTT----------ACCTGAAA-------ATGA------AATTGTAGAT-GACATGTTT-AAT-GTCTCTTCCT--CATTAGCA------GAGTT--------AAA--GAG--GA-----GTATTCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGT-GGAATA--TTATCAGCGACGGTcagccttcatcatttaatataaatgtgatttcatggaacaattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|6 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatatttatgtctcagaggatttttcaaagagagtttcgcAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAATAGAGAAAAACAA---TAAA----GCCTATTTGA-AACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGAT-GCTGAT----AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC--A-TAATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---ATTT---TAACAT--------GTTATGCC---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACA------TGT-AA-CATTGATTTCTTGTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAA-TGAGA-CTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACC-TTTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAATAATGTTCGAAACAAAAGGTGTTAC---AAAGGTCGCCAC-TCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAAT--G-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCAT----TTAGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACTA-A--ATAATGA-TTTTAT--T------AATGTAACTAATGG------------TATTAT-TTT---ATGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TC--GACTTTGT-ATGATACGAATA-AA-ACAAG--AAATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGTGT-ACT----GAT--------G--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTT--GATTTTA----TTTTTGATCATGAGGATACATTGTATGACAATGATA-CTTTT-----AATGTA-T-A---TCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTA-TTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATA---AAG--A-AGGA-AATTTCACATCA-A-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGCTTC--TA--GCAATCTGTTTCC---ACA----TAC-AA-CACATTTTGAGATAGGAG-ATCG-ACATGAGTCTGATCA-CTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTTAA---A---TCCGA-C-C-AAA------------A-T--A-GCAGT-GATACTGATGATAATG--A--T---AGCGA---AATC--AATGATGT-AAACG--------GTTTTAAAC-GC------------TTTAAATGGAA-----TG-AAAACAAAAGTGAAGAGTTTTTGAATAATATAA--GATCTG-----C-TTTATT---A-ACTATAAAAGATACTATTCTTG--AGGACATCCGTAC---------TGAT-ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-ACA--TGTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGAtaaatgcacccttactgacatgtcagatgtattgctc
gi|4 : ttttcaaagagagtttcgcGCAATA---AAAGACAA---GAAA-CGTGCTTACTTTA-AATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGAC-ACTGATTTG-AATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TA-TAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---ATTTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-TT---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAA------TGT-AA-TGCTAACTTTATGTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAA-TGA-AACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGT-TTTTCGTTAGTTAT-CATTGTTTTAACTCTGTAAGAAA--AAATACATCATC-CAAAGGTCGTCAT-TCAG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGA--AACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAA----ATGGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-ATTTT----CAAAAAAATATAATCAT--A------------TATTTTACTT---ATGT-----------ATCTC-CAGAAGGT-TC--CTCTATAT-ATAATGTAAATG-AA-G--AGTTGAATGGTGTA-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGTGT-ATTGACAGAT--------G--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTT--GATTTCA----TATTTCAAGACGAAAATGTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT-----TTT----A-A---AGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATAT-GGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATA---AAG----ATGGTAATTATACTTGC-A-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCTCA--G--ATTTATTTCC---ACA----TGT-CT-CATGCTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACTC-GTTTA-TT--------ATT---------GCATTTTT---CATCTTATA-C-T-GAA--TC--------A-T--ATGC--T-GATGTTGAC-AGTACGGGA--G---C-TGAATTTACC--AAT-ACCT-AACCGA-------TATTTGATA-GG------------TTTAAATGGGA--TAATGGAAAACGG----GACGAATTTGTTTACAGGCTAC--GAT-TT-----CTTTTGTT--GA-A--CTAAAAGATACAATT-TTA--GAAA---CCATAC---CA--CATAAC-GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-TATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAA-CAGTTAAAATTTAATAA-A--AAAC---AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTA---GAAGG-TGATACTCAAAAG-TTA-GAAA-T--ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACAATCTTGC---AAAAAGAAACAACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG---GAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAA--TCAGATTG--AAACAGACACT---TTCCGATAG-TAAC-ATTTCATCA--TAA-----GCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA--------------------------ACTGT-T--------------ATCTGCGAATCACGCCATT-A---CT--------A---------T----T------------GACATGCA------A-CAC-AAT-ATATT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATA-TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT-GCC------GAACT-T-AA-G-AAA--GTG-TTA-----GCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCTcttatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : ACAA---GAAA-CGTGCCTACCTTA-AGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTC-ACTGGTTTA-AATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TA-TAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---ACTTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCTT---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAA------TGT-AA-TGCTGACTTTTTATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAt
gi|9 : aaaacgagAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TA-TAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---ATTTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-TT---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAA------TGT-AA-TGCTGACTTTTTGTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAA-TGA-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAAT-TTCTCGTTGGTTAT-CA-----------ATGTTAGAAA--AAAGACATCATC-TAAAGGTCGTTTT-TCGGC---TGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGA--AACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAA----ATGGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-ATTTT----CAAAAAAATATAACCA---G------------TGTTTTACTT---ATGT-----------ATCTC-CAGAAGGT-TC--CTCTATAT-ATAATGTTAATG-AA-G--AGCTAAATGGTGTA-AATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGTGT-ATTTCCAGAT--------G--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTT--GATTTCA-------TTCAAGATGtaaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|22 : atgcttattaaaaaaaaaaaaaaCTTAACTAA-A-TATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTTC--GTTGGTTAT--ATCA----AA-----TTAGAAA--TTTGA--TC-TC-T----GTCAT-ATATCGG----TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGA--AACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA----tgggtcacttcaagacactatagaagatgatgatgttgatttca
gi|21 : tTAC-ATAATCCAAACG-AA-G--AATTTAATGGTGCT-ACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GTGC-ATTTTTAGGT--------A--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATGT------T--------------------GAAGATGATAATGTT--GATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAATATATTATGTta
gi|13 : ttTAT---A----AATGTGATTTC---AT--------GGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTT--GATTTTG----TATTTAAAGACGATGATGTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATGATT----------AGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTAT-GGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGAC----AAGATGCATTTTAA
gi|24 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaTTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATA---AAG----ATGGTAATTAGACTTGC-A-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCTCA--G--ATTTATTTCC---ACA----TGT-CT-CATGCTTCGTGA
gi|27 : tggaaTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCTCG--G--ATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|8 : TTTTT---A---TTTTG-T-TTAAA--GC--------AAT--ATGA--TATATG-TG-C-ACT--------------T-A---TAAC----C-ACTT-TAATAA-------AA-----GA-GC------------TTTAAATGGAA--TACTGTTAAACTG----GACGAATTTGTTAACAGGCTAC--GTTCTT------TTTTGTT--GA-A--TTAAAAGATACAATT-TTA--GAAA---CCATAC---CT--CATAAC-GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-ACAC-TCAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAA-CAGTTAAAATTGAAT-A-A--AAAC---AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TA---A----------------------------T--ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACAAACTTGC---AGACAAAAACAACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGA---AAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAA--TCAGATTT--AAACAGACACA---TTACGATAT-TAAC-ATTTCATCA--TCA-----GCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGTTATCTGCGAATCACGCCATTA-----C--------------A---------------ATTGA---C---------A---------T----G------------G------A------A-CAA-AAT-ATATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATATTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT-GCT------GAACT-T-AA-GAAAA--GTG-TAA-----GCAGCTTGAAATTA------AG-Ac
gi|11 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgac------------TTTAAATGGGACGAA--GAAAAACTA----GAAATATTTTTAAACAATTTAAAAG----------CTTTGGTTTCGA-AT-GTAAAAGATGATATT-TGT--TAGG---CCATATTGACA--AATGAT-ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-T-G-ATATGTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCCT--TAT---TT--TCA-A-AAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATC--CTTAAAATAAGA-A-A--AGACT--AAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTA---AACAG-CT-CACGCGAAAATTTACGAA--T--ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCAGGTTTGC---AAACTTAAACAACC-GAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTC-GAATA--CCAATCT--ATTTTGGAAAACTGTGAAGAAAT--TAAGATTT--AAGAAAATGTG---TAGCCAAAA-TAGT-ATT--ACTAGGTAC-----GCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA--------------------------A-----T--------------AT--------------GTT-A---CA--------A---------TCGAGT------------G------A------AGCAG-AAC-ACGTTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAAACGT-TTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT-A--------GAACT-A-GA-GA
gi|10 : tactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaaccttAATGGAA--TAATGCAAAA-AG----GACGAATATATTAACAGTCAAA--GGCCCT-----CTTTTATT--GA-A--TTAAAAGATGC-ATT-TTA--------------C---CT--CA-AA----A-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-ACGT-TATACCATAATGC-------------CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAA-AAGTTTAAATATAAC-AGA--AAAG---AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTA---AATAC-CGATACTCCAAA--TTTAGAAA-C--ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACACACTTGC---AAACAGAAACAAGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG---AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAA--TCAGATTT--AAACGGACACA---TTCCGAAAG-TAAC-ATTTCATCG--TAA-----GCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA--------------------------A-----TTGATATCCGCA---A---------------ATC-A---CGCTATTAATA---------T----T------------GACATGAA------A-CAA-AAC-ATAGT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACAT-GATATATTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA-GCT------TAACT-T-AA-CAGAG--ATGATAACATACATAG--TGAAATTca
gi|15 : gacagatatttaaaataatcTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAA-CCGTTAAAATTTAAT-T-G--AAAC---CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTA---AATGG-TGATATTCCAAA--TT-TAGAA-TTGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT------------C---AAACGGAAACAACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG---AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAA--TCAAATTT--AATCAGACACA---TTACGATAT-TAAC-ATTTCATCA--TCA-----GTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA--------------------------A-----TTGTTATCTGAG---A---------------ATC-ACGCC---------A---------T----TACTATTGACATGG------A------A-CAA-AAT-CTATT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATATTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT-GCT------GAACA-T-GA-GAAAA--GTG-TAA-----GCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCTtcatagatatagctcccattcttctt
gi|14 : AAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAA-CAGTTAAAATTTAAT-A-A--AAAC---AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTA---AATGG-TGATACTCCAAA--TTTAGAAA-T--ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACAAACTTGC---AAATAGAAACAACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG---AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAA--TCAGATTT--AAACAGACAGA---TTCCGATAG-TAAC-ATTTCATCA--TCA-----GCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA--------------------------AAATGTT--------------ATCTGCGAATCACGCCATT-A---CT--------A---------T----T------------GACATGCA------A-CAA-AAT-CTATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATATTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT-GCC------GAACT-T-GA-GAAAA--GTG-TTA-----ACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTT
gi|16 : acAAT-A-ATGAAAT---AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTA---AACAG-TT-CACGCGAAAATTTACGAA--T--ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCAGGTTTGC---AAACCGAA----CT------GCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATAC--CAA---TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAAT--TAAGATTT--AAGAAAA--------TGCGAGGC-CAAA-ATAGTATTA--CTAC----GCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA--------------------------A-----T--------------CT--------------GTT-A---CA--------A---------TCGAGT------------G------A------AGCAG-AAC-GCATTTCTCATGAAAATTTAAACGAGGAAAATGT------TATTATAGAT-AAAAGTTTTAAATGACCCCTTTTC---AAT-GTTTAATAAGAACT-A-GA-GACAACGATG-TCC-----G--GTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTAT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacAAA--TTAATAAA-T--ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCAGGTTTGC---AAACTTAAACAAACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATAC--CAA---TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAAT--TAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAG-TA------TTACTAGGTAC-----GCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA--------------------------A-----T--------------CT--------------GTT-A---CA--------A---------T----T------------GAGTGA-A------G-CAG-AAC-GTGTTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAAACGT-TTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT-A--------GAGCTATAGACGAAAA--TTT-CAA-----GT---TTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATtctctaaaagacatatcaccattatta
gi|23 : ataacaatgactaaggcctcacgtaagagactaaacagttcatgcaaAG-TAAC-ATTTCATCA--TAA-----GCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA--------------------------AAT---C--------------ACGCC-----------ATT-A---CT--------A---------T----T------------G------ACATGCAA-CAC-AAT-CTATT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGAT-GATATATTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT-GCC------GAACT-T-GA-GAAAA--GTG-TAA-----Gtctctaaaagacatatcactat
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGT-TGCTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|10 : tCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCT
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 1 333333333333 11 11111 11 111 222 1111 1111 44444 22222222 11 11111 444444444444444444444444444444 111 11111 11 1 1 22222222 3333333333 1 111111 222222222 1 1 33333333 222222 1111111 111 1111 1111 11 7777777777777777777777777777 11 22222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333 2222 1111 222222222 2222222222222222 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 222 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 1111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 2 4 2 000 1 22 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 0 888 22 1 0 8 44444 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 1 1 6 55 22222 5 6 33 6 1 000000000000 55 22222 1 77 0 0 000 0 0 000 5555 5 1 0 1 888 2222 111 444 11111 22 2 00000000 66 11 3 6 88888 1 444444444444444444444444444444 111 6 0 6 44 66666 5 33 6666 1 1 5 3 1 0 77777777 5 5 2222222222 66 2 2 1 0 0 0 2 2 5 777777 0 0 1 333333 1 1 000000000 0 1 1 1 00000000 1 0 0 33 55 1 3 0 1 1 999999 4 6 6 0 2 5 1111111 2 000 2222 11 0000 1 1 3 8 44 3 9 1 0 1111111111111111111111111111 333 8 88 11111 6 1 6 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 888 6666 1 1 1111 5 5 1 3 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 000000000 3 8888888888888888 77 0 0 3 777 5 0 5 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 55 4 0 1 666 1 33 0 1 3 1 1 1 555 2 55 1 4 2 2 0 55 1 1 33 2 3 3 5 33 1 1 3 2 999999 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 4444444 2 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . .. ..... . . .. . . ............ .. ..... . .. . . ... . . ... .... . . . . ... .... ... ... ..... .. . ........ .. .. . . ..... . .............................. ... . . . .. ..... . .. .... . . . . . . ........ . . .......... .. . . . . . . . . . ...... . . . ...... . . ......... . . . . ........ . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . . ....... . ... .... .. .... . . . . .. . . . . ............................ ... . .. ..... . . . . ................................................................................... ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ......... . ................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . .. . . . ... . .. . . . . . . ... . .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . . . . ...... . .................................................................................................................. ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ....... . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 5 0 5 000 0 44 3 1111111 00 0 4 1 4 11 9 66 0 1 777 22 0 3 0 00000 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 0 0 6 77 33333 1 3 44 6 4 666666666666 77 66666 7 11 4 4 000 4 7 000 4444 7 0 4 0 333 1111 999 444 77777 88 5 33333333 77 22 2 7 33333 5 333333333333333333333333333333 777 7 7 7 77 77777 7 66 1111 4 0 7 4 0 9 55555555 0 0 8888888888 99 0 8 2 2 2 4 8 8 6 888888 0 5 0 111111 0 0 000000000 8 4 4 0 55555555 0 7 7 22 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 2 0 3333333 3 000 1111 33 0000 0 0 2 0 44 2 0 0 8 8888888888888888888888888888 444 0 66 00000 7 0 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888 8888 0 0 2222 6 0 0 5 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 444444444 1 4444444444444444 22 0 2 2 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 3 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 00 5 5 0 666 0 11 4 0 6 4 0 4 333 8 00 9 4 3 8 5 00 0 0 55 8 7 3 4 88 0 0 3 9 666666 3 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444444444444 0 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 4444444 6 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGNGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CAT-GTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACA-GGGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA-----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAAAAAAATATAATCAA--G------------TGTT----------TTGCTT---ACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TGAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGGGTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANNTCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGAC-GAT-ACG--A----T---A--TG---------A---TAAC--AAT-ACC-------T-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTAC---C-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACAACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAAA------A-A-----TA--------------TC-------------AT--TACNAT----------T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGGTAT---GACCTNAGGCCATTTCTTAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTNAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTNAAAGTTA-ATAAATAGGACGGAGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATNTGATATATGTGCNCTTAATGAAACNTGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGANCTTTTCGTTGGTTAC-CATCGTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAAACA-GGGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTAA-C---TTGTGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAAAAAAATATAATTAA--G------------TATT----------TTGTTT---ATGTATCTC-CGGAAGGT-TCCTCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TNAATTGT-TTCGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ACGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATNCNAGATGTGGGTCA--TTT-CAAGATATTATNGAAGATGACAATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGANGAT---------GTATTATATGAAAATGATAATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNTATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTNGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTACACTTGCA-CAGCAAACGATGGCTCTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GAGTCTGNCCACTTTCC----ATT---------GCATTT---NTNTTNTAC-TAAATCATATGCAGTGATGCTGAC-ANT-ACG--A----T---A--TG---------A---TAAC--AAT-ACC-------T-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTTAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATGCTATT-TTAGAGA----CCGTAC---CTCATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCAAATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAANATTAAC-GCAACCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAGCA-GGCTTGCAAACNGAAACAACTTGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTNTAGACTCACGGTCAAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGAATCAGATTT--AAGCAGACACGTTGCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TNAGCGTGGTATANCC-ACTTCAAA------A-A-----TA--------------T--------------AT--TACNAT----------T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACNATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : ATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAATGCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-A-TGGC----TTA--------GTG---AAGAGGATAGTTAG-CCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-TTTTAT--T------AATGTAATTAA--GGATATTATTTTATGTT----------TTGTTT---ACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA--GA----AATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGT-GGTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-G--AGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCAC--GAGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGAT-GAT-A-------------A--TG---------A---TAAC--GAA-ATCAATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTAC-------TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACTGATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTCG--TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAGA------G-A-----TC--------------T--------------ACTGTATGATGCAAATGCAGT------A------A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCAC
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA-------------C---CTCA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACAAGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAAATTG-A-----TATCCGCAAATCACGCT--------------AT--TAATAT----------T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAccttactgacatgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgcaG---------A---TTAC--ATT-ACG-------A-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACAAATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACAAC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAAA------A-A-----TA--------------T--------------GT--TACAATCGAG------T------G------A------AGCA----GA---ACA-C-G-----TTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcaatggtaCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATTTC---------ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAG--TTT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG---A-TTAGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACAACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-AAATGTTA--------------TCTGCGAATCACGCCAT--TACTAT----------T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACAACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAAA------A-ATTGT-TA--------------TCTGAGAATCACGCCAT--TACTAT----------TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAAA------A-A-----TC--------------T--------------GT--TACAATCGAG------T------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACAAACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAAA------A-A-----TC--------------T--------------GT--TACAAT----------T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----TTGT--TTACTTGC-TATAATTTTA-------TCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACT---CTGGTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-A-GGGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAAC---TT-CGTATTTTTACG---------AATTGCAA----ATGACATTTTTAATATAAAAAATAACATTA----------------TATT----------ATGTTTTCTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG----AAATA-AAT-GGATTTAATGGTG-TGAAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG--CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT----AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTA--ACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT---------ATA-----------ATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAA-ACG--AAAGCTTAAA--TG---------A---CAACCAAAT-ACC-------TGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATAT-------TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGAAACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAAA------A-A-----CC--------------T--------------GT--TACAATCGAG------T------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCC---AAACG-AA--GAATTTAATGGTG-CTACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTT-T---T----AGT-GC-ATTTT----TA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG-----------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTAT--ATCA----AA-T-----TAGAAA--TTTGATCTCTGTCATA-TA-----------T---CGG-TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACA-GGGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAAA------A-A------A--------------TCACGCC--------AT--TACTAT----------T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGG--ATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATG-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATTGTTTTAACTA-TGTTAGAAA--AAGGAC----GTCATC-TAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCA-GGGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA-----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTT--TCAAAGAAATATAATCAA--G------------TGTT----------ATACTT---ATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATTGTG-TTAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGGGTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTG--TA-AAAGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAG--ATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGAC-ATT-ACGGAA----T---A--TG---------A---TAAC--AAT-ACC-------T-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACAC---CTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CATT-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACAACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-A-----TA-----------------------------AT--TAC-AT----------T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CATTGTTTTAACTC-TGTAAGAAA--AAATAC----ATCATC-CAAAGGTCGTCATT---CAGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACA-GGTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAATGGTTGA-----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-ATTTT----CAAAAAAATATAATCAT--A------------TATT----------TTACTT---ATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTGA----CA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGGGTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT-TTT------AAAGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACTC-GTTTATT--------ATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGAC-AGT-ACG--G----G---AGCTG---------AATTTACC--AAT-ACC-------T-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATAC---CACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACAACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG--GAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-ACTGT-TA--------------TCTGCGAATCACGCCAT--TACTAT----------T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAATGTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAAT-GGCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTTAGATAA-----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA-TTTTAT--T------AATGTAACTAATGG------------TATTATTTTATGTTTTGTTT---ACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATAC---GAATA-AAACAAG--AAATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGT-GGTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TA-TATCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCT---AGCAATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGAT-CG-ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGAT-GATAATG--A----T---AG-CG---------A---AATC--AATGATG-------T-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTAC-------TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagagagtttcgcCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgC-AAT-ATG--A----T---A--TATGTGCACTTA---TAAC----C-ACT-------T-TAATAA--------AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATAC---CTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACAACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGA--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAAA------ACATTGT-TA--------------TCTGCGAATCACGCCAT--TACAAT----------TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA-----------A-TGTTAGAAA--AAAGAC----ATCATC-TAAAGGTCGTTTTT---CGGCTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAATGGTTGA-----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-A--TTT--TCAAAAAAATATAACC-A--G------------TGTT----------TTACTT---ATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---TAATG-AA--GAGCTAAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGGGTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTTG-ATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 33333333333333333 11 11111 11 1111 222 1111 1111 1111 22222222 11 33333333333333 1111 44444444444444 11111 11 1 11 22222222 3333333333 1111111111 1 111111 222222222 1 33333333 222222 1111111 111 1111 1111 11 2222 666666666 111111 11 22222 555555555555555555555 111 222222222222222222 3333333333333333 3333 2222 1111 33333333333333333333333333333333 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 22 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 1 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 0 1 1 5 55 22222 5 6 555 44 22222222222222222 55 22222 1 77 0 0 0 0000 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 6 4444 6 2 00000000 888888 00 22222222222222 99 4444 6 99999999999999 6 0 6 0 6 22 66666 5 33 6666 1 1 2 00 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 5 6666666666 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 1 1 00000000 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 1111111 2 000 2222 11 0000 1 1 3 8 44 1 1 1 3 1111 222222222 999999 333 8 88 11111 222222222222222222222 111 99 6 666666666666666666 5 1111111111111111 888 6666 1 1 1111 5 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 77777777777777777777777777777777 77 0 0 1 777 5 5 0 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 999 4 0 666 1 3 55 0 1 3 1 1 3 88 4 55 1 44 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 999999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . . .. ..... . . ... .. ................. .. ..... . .. . . . .... ... .... . . . . . . .... ... ... . .... . . ........ ...... .. .............. .. .... . .............. . . . . . .. ..... . .. .... . . . .. . ........ . . .......... .. . . . . . . . . .......... . . . . ...... . . ......... . . . . ........ . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . ....... . ... .... .. .... . . . . .. . . . . .... ......... ...... ... . .. ..... ..................... ... .. . .................. . ................ ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ................................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . ... . . ... . . .. . . . . . . .. . .. . .. . . . .. . . .. . . . . .. . . . ...... . .......................................................................................................... ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 8 0 7 4 77 33333 1 3 000 44 66666666666666666 77 66666 7 11 4 4 4 7777 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 7 2222 3 5 33333333 888888 22 77777777777777 22 2222 7 77777777777777 3 7 7 7 7 00 77777 7 66 1111 4 7 3 77 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 6 9999999999 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 4 0 55555555 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 3333333 3 000 1111 33 0000 0 0 2 0 44 0 4 0 2 6666 444444444 888888 000 0 66 00000 000000000000000000000 777 22 7 333333333333333333 0 8888888888888888 888 8888 0 0 2222 6 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 00000000000000000000000000000000 22 0 2 0 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 444 5 5 666 0 6 99 4 0 6 4 1 6 77 5 00 9 11 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 666666 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44444444444444444 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CAT-GTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGCCACTCGG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAA---AA--AA--ATA----TA-ATCA-G------------TGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TGAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-AT-ACG--A----T---AG-TGA---TAAC--AAT-ACC-------T-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAAA------A-A-------TAT-----AA-C----C-------------G-----TTA-------CNAT----T------G------A------A-CAGAACGT-ATT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGNGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CAT-GTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGCCACTCGG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAA---AA--AA--ATA----TA-ATCAAG------------TGTTTTGCTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TGAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANNTCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-AT-ACG--A----T---A--TGA---TAAC--AAT-ACC-------T-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAAA------A-A-------TAT-------------C-------------A-----TTA-------CNAT----T------G------A------A-CAGAACGT-ATT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : ATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAATGCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACTCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGAT-AGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-TTTTAT--T-----------A--ATG----TA-ATTAAGGATATTATTTTATGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA--GA----AATGGTATTGAACTA--TTTGAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-G--AGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCAC--GAGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-AT-A-------------A--TGA---TAAC--GAA-ATCAATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACT-GATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTC-G-TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAGA------G-ATCTACTGTATGATGCAAATG---C-------------A-----GTAAATAATTTGAT----T------G------A------C-GATAATAT-TTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACAT
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA---------C-------CT-CA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACA-AGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAAATTG-A-------TAT-------------CCGCAAATCACGCTA-----TTA-------ATAT----T------GACATGAA------A-CAAAACAT-AGT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgcaGA---TTAC--ATT-ACG-------A-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA-AATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAAA------A-A-------TAT---------------------------G-----TTA-------CAATCGAGT------G------A------AGCAGAACAC-GTTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcaatggtaCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATT----TC-----ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG---A-TTAGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACA-ACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-AAATGT--TATCTGCGAATCACGCC-------------A-----TTA-------CTAT----T------GACATGCA------A-CAAAATCT-ATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACA-ACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAAA------A-ATTGT---TATCTGAGAATCACGCC-------------A-----TTA-------CTAT----TGACATGG------A------A-CAAAATCT-ATT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA-----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAAT--TTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAAA------A-A-------TCT---------------------------G-----TTA-------CAATCGAGT------G------A------AGCAGAACGC-ATTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAAA------A-A-------TCT---------------------------G-----TTA-------CAAT----T------GAGTGA-A------G-CAGAACGT-GTTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T-T-GCTATAATTT-TATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACTCTG---GTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAA----CTTCGTATTTTTACG---------AATTGCA----AATGACATTTTTAATATA---AA--AA--ATAACATTATATTA--------------TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG----AAATA-AAT-GGATTTAATGGTG-TGAA-TGTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT----AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTA--ACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAA-ACG--AAAGCTTAAA--TGA---CAACCAAAT-ACC-------TGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATA----T----TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGA-AACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAAA------A-A-------CCT---------------------------G-----TTA-------CAATCGAGT------G------A------G-CAGAACGCAATTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCC---AAACG-AA--GAATTTAATGGTG-CTACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATT----TTTA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG--------------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA-------TATCAA-----ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCAT-ATA-----------TCGG----TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAAA------A-A--------AT-------------C-------------ACGCCATTA-------CTAT----T------G------ACATGCAA-CACAATCT-ATT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGG--ATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATGAA-CATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATTGTTTTAACTA-TGTTAGAAA--AAGGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTT--TCAA---AG--AA--ATA----TA-ATCAAG------------TGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATTGTG-TTAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTG--TA-AAAGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAG--ATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGACA-TT-ACGGAA----T---A--TGA---TAAC--AAT-ACC-------T-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACA----CCTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CA-TTATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACA-ACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-A-------TA----------------------------A-----TTA-------C-AT----T------G------A------A-CAAAATCT-ATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CATTGTTTTAACTC-TGTAAGAAA--AAATAC----ATCAT-CCAAAGGTCGTCATTCAG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAAT-GGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-ATTTT----CAA---AA--AA--ATA----TA-ATCATA------------TATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----GACA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT-TTT------AAAGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACT-CGTTTA--------TTATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACA-GT-ACG--G----G---AGCTGAATTTACC--AAT-ACC-------T-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACA-ACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG-GAAA-A--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAA------A-ACTGT---TATCTGCGAATCACGCC-------------A-----TTA-------CTAT----T------GACATGCA------A-CACAATAT-ATT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAATGTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACTCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTT-AGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA--TTTTA--TTAATGTAACTAATGGTA----TT-ATTTTA------------TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATAC---GAATA-AAACAAG--AAATGGTATTGAACTA--TTTGAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TA-TATCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCT---AGCAATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGAT-CG-ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-ATAATG--A----T---AG-CGA---AATC--AATGATG-------T-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacg-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACA-ACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCA-AG-AAAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAAA------ACATTGT---TATCTGCGAATCACGCC-------------A-----TTA-------CAAT----TGACATGG------A------A-CAAAATAT-ATT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagcaatatgatatatgtgcacttataaccactttaataaAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA-----------A-TGTTAGAAA--AAAGAC----ATCAT-CTAAAGGTCGTTTTTCGG---CTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAAT-GGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-ATTTT----CAA---AA--AA--ATA----TA-ACCA-G------------TGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---TAATG-AA--GAGCTAAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTTG-ATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 333333333333333333 11 11111 11 111 222 1111 1111 1111 22222222 11 44444444444444 1111 44444 11111 11 1 11 22222222 3333333333 1111111111 1 111111 222222222 1 33333333 222222 1111111 111 1111 1111 11 2222 666666666 111111 11 22222 1 33333333333333333333333 1 33333333333333333333333333 3333 2222 1111 33333333333333333333333333333333 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 22 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 3 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 0 1 5 55 22222 5 6 555 44 222222222222222222 55 22222 1 77 0 0 000 0 0 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 6 4444 6 2 00000000 888888 44 33333333333333 99 99 4444 6 00000 4 0 6 0 6 22 66666 5 33 6666 1 1 2 00 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 5 6666666666 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 1 1 00000000 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 1111111 2 000 2222 11 0000 1 1 3 8 44 1 1 1 3 1111 222222222 999999 333 8 88 11111 6 3 77 88888888888888888888888 1 77 1 3 66 6 44444444444444444444444444 888 6666 1 1 1111 5 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 77777777777777777777777777777777 77 0 0 1 777 5 0 5 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 999 4 0 666 1 3 55 0 1 3 1 1 3 88 4 55 1 4 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 44 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . .. ..... . . ... .. .................. .. ..... . .. . . ... . . ... .... . . . . . . .... ... ... . .... . . ........ ...... .. .............. .. .. .... . ..... . . . . . .. ..... . .. .... . . . .. . ........ . . .......... .. . . . . . . . . .......... . . . . ...... . . ......... . . . . ........ . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . ....... . ... .... .. .... . . . . .. . . . . .... ......... ...... ... . .. ..... . . .. ....................... . .. . . .. . .......................... ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ................................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . ... . . ... . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. . ................................................................................................................ ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 8 0 4 77 33333 1 3 000 44 666666666666666666 77 66666 7 11 4 4 000 4 7 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 7 2222 3 5 33333333 888888 00 33333333333333 22 22 2222 7 33333 2 7 7 7 7 00 77777 7 66 1111 4 7 3 77 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 6 9999999999 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 4 0 55555555 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 3333333 3 000 1111 33 0000 0 0 2 0 44 0 4 0 2 6666 444444444 444444 000 0 66 00000 7 3 99 44444444444444444444444 9 99 4 0 77 6 66666666666666666666666666 888 8888 0 0 2222 6 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 00000000000000000000000000000000 22 0 2 0 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 444 5 5 666 0 6 99 4 0 6 4 1 6 77 5 00 9 4 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 66 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444444444444444 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTT---TCAA-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TGAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-AT-ACG--ATA---G------C-G-----A---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-TGTTAGAAA--AAAGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT--TCAA-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGC---GAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TGAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TA-AAAGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-AT-ACG--ATA---G------T-G-----A---TAAC--AAT-ACCT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : ATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAATGCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGAT-AGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA--TTTTA--TTAATGTAATTAA--GG--ATA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA--GA----AATGGTATTGAACTA--TTTGAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-G--AGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCAC--GAGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-ATAATG--ATA---A------C-G-----A---AATC--AATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACT-GATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTC-G-TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG-A-----T--CT------A-----C--TG------------TATGATGCAAA----T------GCAGTA-A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACAT
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA---------C-------CT-CA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACA-AGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA-A-----TTGAT-----AT-----C--CGCAAATCACGCTAT----TAATAT----T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgcaCA--ATG---G------TAG-----A---TTAC--ATT-ACGA-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA-AATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA-A-----T--AT----------------G------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACA-C-G-----TTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATT----TC-----ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG---A-TTAGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACA-ACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-AAATGTT--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACA-ACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA-ATTGT-T--ATCTGAGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA-----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAAT----T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T--T-GCTATAATTT-TATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACT---CTGGTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAA----CTTCGTATTTTTACG---------AATTGCA----AATGACATTTTTAATATA-------AA--AA--ATAACATTATATT--A--TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG----AAATA-AAT-GGATTTAATGGTG-TGAA-TGTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT----AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTA--ACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAA-ACG--AAA---GCTTAAAT-G-----A---CAACCAAAT-ACCTGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATA----T----TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGA-AACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA-A-----C----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCC---AAACG-AA--GAATTTAATGGTG-CTACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATT----TTTA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG--------------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA--------TATCAA-----ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCAT-ATA-----------T---CGG-TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA-A--------AT-----CA-----CGCCA------------T----TACTAT----T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGG--ATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATG-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATT-GTTTTAACTA-TGTTAGAAA--AAGGAC----GTCAT-CTAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAAT-AGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTT--TCAA-------AG--AA--ATA----TA-ATCA-A-GTGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATTGTG-TTAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----TCCA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTG--TA-AAAGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAG--ATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGACA-TT-ACGGAATA----------T-G-----A---TAAC--AAT-ACCT-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACA----CCTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CATT-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACA-ACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-A-----T--A-----------------A------------T----TAC-AT----T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CA-TTGTTTTAACTC-TGTAAGAAA--AAATAC----ATCAT-CCAAAGGTCGTCATT---CAGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAAT-GGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-ATTTT----CAA-------AA--AA--ATA----TA-ATC--ATATATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---AAATG-AA--GAGTTGAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATT----GACA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT-TTT------AAAGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACT-CGTTTA--------TTATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACA-GT-ACG--GGA---GC-----T-G-----AATTTACC--AAT-ACCT-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACA-ACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG-GAAA-A--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-ACTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAATGTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTT-AGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA--TTTTA--TTAATGT----AACTAATGGTA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATAC---GAATA-AAACAAG--AAATGGTATTGAACTA--TTTGAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGT-G---GTAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TA-TATCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCT---AGCAATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGAT-CG-ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-ATAATG--ATA---G------C-G-----A---AATC--AATGATGT-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgCA-AT-ATG--ATATATG------T-GCACTTA---TAAC----C-ACTT-TAATAA--------AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACA-ACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCA-AG-AAAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACAAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA------------A-TGTTAGAAA--AAAGAC----ATCAT-CTAAAGGTCGTTTTT---CGGCTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAAT-GGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-ATTTT----CAA-------AA--AA--ATA----TA-ACC--A-GTGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGT---TAATG-AA--GAGCTAAATGGTG-TAAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATT----TCCA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTTG-ATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 22222222222222222222 11 11111 11 111 222 1111 1111 2222 22222222 11 111 33333333333 1111 44444 11111 11 22222222 3333333333 2222222222 1 111111 222222222 1 33333333 222222 11 111 1111 1111 11 2222 666666666 111111 11 22222 1111 11 222222 1111 1 33333333333333333333333333 3333 2222 1111 33333333333333333333333333333333 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 22 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 3 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 0 1 5 55 22222 5 6 555 44 77777777777777777777 55 22222 1 77 0 0 000 0 0 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 3333 77 2 00000000 66 11 3 333 66666666666 99 99 4444 6 00000 4 0 6 0 6 22 66666 5 5 77 6666 33 5 7 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 9999999999 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 1 1 00000000 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 55 3 2 000 2222 11 0000 1 1 44 8 1 1 1 3 1111 222222222 999999 333 8 88 11111 9999 11 1 3 555555 0000 1 77 1 1 66 6 44444444444444444444444444 888 6666 1 1 1111 5 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 77777777777777777777777777777777 77 0 0 1 777 5 0 5 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 999 4 0 666 1 3 55 0 1 3 1 1 3 88 4 55 1 4 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 44 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . .. ..... . . ... .. .................... .. ..... . .. . . ... . . ... .... . . . . . . .... ... ... .... .. . ........ .. .. . ... ........... .. .. .... . ..... . . . . . .. ..... . . .. .... .. . . . ........ . . .......... .. . . . . . . . .......... . . . . ...... . . ......... . . . . ........ . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . .. . . ... .... .. .... . . .. . . . . . .... ......... ...... ... . .. ..... .... .. . . ...... .... . .. . . .. . .......................... ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ................................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . ... . . ... . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. . ................................................................................................................ ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 8 0 4 77 33333 1 3 000 44 00000000000000000000 77 66666 7 11 4 4 000 4 7 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 3333 33 5 33333333 77 22 2 000 00000000000 22 22 2222 7 33333 2 7 7 7 7 00 77777 7 7 99 1111 11 7 1 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 4444444444 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 4 0 55555555 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 77 9 3 000 1111 33 0000 0 0 44 0 0 4 0 2 6666 444444444 444444 000 0 66 00000 4444 00 0 2 888888 6666 9 99 4 0 77 6 66666666666666666666666666 888 8888 0 0 2222 6 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 00000000000000000000000000000000 22 0 2 0 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 444 5 5 666 0 6 99 4 0 6 4 1 6 77 5 00 9 4 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 66 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444444444444444 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-ATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTG--TAAA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACG-AT-ACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : ATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGATAGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-T-TTTATTA---ATGTAATTAA--GG--ATA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA-G--A----AATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-GAGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCACG--AGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-ATAATG--ATAAC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACT-GATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTC-G-TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG-A-----T--CT------A-----C--TG------------TATGATGCAAA----T------GCAGTA-A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACAT
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA---------C-------CT-CA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACA-AGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA-A-----TTGAT-----AT-----C--CGCAAATCACGCTAT----TAATAT----T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgca------GA---TTAC--ATT-ACGA-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA-AATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA-A-----T--AT----------------G------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACA-C-G-----TTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcaatggtaCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATTTC---------ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG---ATT-AGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACA-ACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-AAATGTT--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACA-ACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA-ATTGT-T--ATCTGAGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA-----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAAT----T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T--T-GCTATAA-TT-TTATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACT---CTGGTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAAC--TT-CGTATTTTTACG---------AATTGCAA----ATGACA-TTTTTAATATA-------AA--AA--ATAACATTATATT--A--TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG-A---AATA-AATG--GATTTAATGGTGT-GAAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT----AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTAACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAA-ACG--AAAGCTTAAATGA---CAACCAAAT-ACCTGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATA----T----TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGA-AACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA-A-----C----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCCA---AACG-AA-G--AATTTAATGGTGC-TACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATTTT----TA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG--------------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA--------TATCAA------ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCATA-TA-----------T---CGG-TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA-A--------AT-----CA-----CGCCA------------T----TACTAT----T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGGATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATG-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATT-GTTTTAACTA-T-GTTAGAAA--AAGGAC----GTCATC-TAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTTTCA---A-------AG--AA--ATA----TA-ATCA-A-GTGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATTGTGT-TAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTG--TAAA-AGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAGATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGACA-TT-ACGGAATA-T------GA---TAAC--AAT-ACCT-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACA----CCTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CATT-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACA-ACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-A-----T--A-----------------A------------T----TAC-AT----T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CA-TTGTTTTAACTC-T-GTAAGAAA--AAATAC----ATCATC-CAAAGGTCGTCATT---CAGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAATGGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-A--TTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--ATATATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTGA----CA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT-TTT-----AA-AGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACT-CGTTTA--------TTATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACA-GT-ACG--GGAGCT-----GAATTTACC--AAT-ACCT-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACA-ACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG-GAAA-A--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-ACTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTTAGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA-T-TTTATTA---ATGT----AACTAATGGTA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACG---AATA-AA-ACAAG--AAATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATG--TATA-TCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGCA-ATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGATCG--ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATG-ATAATG--ATAGC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgA---TAAC----C-ACTT-TAATAA--------AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACA-ACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCA-AG-AAAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACAAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagcaatatgatatatgtgcacttAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA------------A-T-GTTAGAAA--AAAGAC----ATCATC-TAAAGGTCGTTTTT---CGGCTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAATGGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-A-TTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-ACC--A-GTGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTT---AATG-AA-G--AGCTAAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTTG-ATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 22222222222222222222 11 11111 11 111 222 1111 1111 2222 22222222 11 111 33333333333 1111 44444 11111 11 22222222 3333333333 2222222222 1 111111 222222222 111 111 222222 11 111 1111 1111 11 2222 666666666 111111 11 11111 22222222 1111 1 33333333333333333333333333 3333 2222 1111 33333333333333333333333333333333 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 22 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 3 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 0 1 5 55 22222 5 6 555 44 77777777777777777777 55 22222 1 77 0 0 000 0 0 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 3333 77 2 00000000 66 11 3 333 66666666666 99 99 4444 6 00000 4 0 6 0 6 22 66666 5 5 77 6666 33 5 7 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 9999999999 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 222 1 333 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 55 3 2 000 2222 11 0000 1 1 44 8 1 1 1 3 1111 222222222 999999 333 8 88 77777 1 1 77 33333333 4444 0 66 1 1 66 6 44444444444444444444444444 888 6666 1 1 1111 5 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 77777777777777777777777777777777 77 0 0 1 777 5 0 5 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 999 4 0 666 1 3 55 0 1 3 1 1 3 88 4 55 1 4 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 44 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . .. ..... . . ... .. .................... .. ..... . .. . . ... . . ... .... . . . . . . .... ... ... .... .. . ........ .. .. . ... ........... .. .. .... . ..... . . . . . .. ..... . . .. .... .. . . . ........ . . .......... .. . . . . . . . .......... . . . . ...... . . ......... . . ... . ... . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . .. . . ... .... .. .... . . .. . . . . . .... ......... ...... ... . .. ..... . . .. ........ .... . .. . . .. . .......................... ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ................................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . ... . . ... . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. . ................................................................................................................ ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 8 0 4 77 33333 1 3 000 44 00000000000000000000 77 66666 7 11 4 4 000 4 7 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 3333 33 5 33333333 77 22 2 000 00000000000 22 22 2222 7 33333 2 7 7 7 7 00 77777 7 7 99 1111 11 7 1 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 4444444444 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 444 7 777 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 77 9 3 000 1111 33 0000 0 0 44 0 0 4 0 2 6666 444444444 444444 000 0 66 11111 0 7 99 33333333 2222 5 99 4 0 77 6 66666666666666666666666666 888 8888 0 0 2222 6 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 00000000000000000000000000000000 22 0 2 0 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 444 5 5 666 0 6 99 4 0 6 4 1 6 77 5 00 9 4 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 66 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444444444444444 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-ANTGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : AATGATGTTGACGATAATG--ATGAC------GA----AAC--
gi|1 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGATAGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-T-TTTATTA---ATGTAATTAA--GG--ATA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA-G--A----AATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-GAGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCACG--AGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAAC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACT-GATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTC-G-TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG-A-----T--CT------A-----C--TG------------TATGATGCAAA----T------GCAGTA-A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACATtactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatatttatgtctcagaggatttttcaaagagagtttcgcaagctaggtataattttcggccattcctaaaaagagcaatagagaaaaacaataaagcctatttgaaacatgataaacttgtcgttaatggagatatattcgtttttgatgctgataataaaaacctgaaacagctatatagataggacagaggtcaaggtcataatgcggaaaatagaaggcgaactttagatttaaacatgttatgctggaatatacaaggcttatcgaaatacacacgtaacattgatttcttgtcacttgtaagacaatttgatatatgtgctttcaatgaaacttggtctaaaagaaaagacgagtttaacgaccatttaagaggttacacatgttttaataatgctcgaaacaaaaggtgttacaaaggtcgccactcaggtggtgtatgtgcatttgttaaaacatctttgatagagaatggcttagtgaagaggatagttagccatttggataattatgtattcttaagactaaatactgattttattaatgtaattaaggatattattttatgttttgtttacatatctccggaagggtcgactttgtatgatacggagaatacaagaaatggtattgaactatttgaagaaaatctattagaggttgtatcagagtatactgatgatgaacttattttggcgggtgactttaatgccaaatgtggtaatttgcaagatattattgatgatggtaatgttgattttatttttgaccacgaggatacattgtatgacaatgatacttttaatgtatatcgaaactccaaagatactctatgtaacacattcgggtttacgcacattgaattatgcaaaatgtatggtgttcactttttgaatggctgattgtttaacgatacagaaggaaatttcacatcaacagcaaacggtggctcaagtttaattgattatgtaattgcttctagcgagctgtttccacatataacacactttgagataggagatcggcacgagtctgaccactttcctcttatttgtagactagtatttaaatccgaccaaaatagcagtgatactgatgataatgataacgaaatcaatgatgtaaacgattttaaacgctttaaatggaatgaaaacaaaagtgaagagttttcgaataatataagatctgctttattaacaataaaatatactattcttaggacatccgtactgatatcaaccaagctatacataaaattgtagacatgtttcataaagctgcaattagcaaacgaataaaacccacttatatacatcgtaaacctgcacaacccgagtggtgggattttgaatgtgaacatttaaaaagggaaaaaatataaaaactaagattatttagattattcaatacaaaatctagtttacaagattatacacgaagcagaaataaatttaaatattgctgtaaacaaaaacagactgatcttcaagagaaatttcgacaagaactcgtagaatctcgtaagaacccagatttattttggaaagcagtaaacaagtttagatttaaaaacaatcaaattgtgataaacaattttaaaacaaacctggtataatcacttcagagatctactgtatgatgcaaatgcagtaaataatttgattgacgataatattttacctgaaaatgaaattgtagatgacatgtttaatgtctcttcctcattagcagagttaaagaggagtattctgaaattaaaagttgggaaatccacaggccctagtggaatattatcagcgacggttaaatgcacccttactgacatgtcagatgtattgctc
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA---------C-------CT-CA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACA-AGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA-A-----TTGAT-----AT-----C--CGCAAATCACGCTAT----TAATAT----T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgcaAATG--GTAG--------A---TTAC--ATT-ACGA-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA-AATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA-A-----T--AT----------------G------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACA-C-G-----TTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATTTC---------ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG-ATT-AGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACA-ACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-AAATGTT--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACA-ACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA-ATTGT-T--ATCTGAGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA-----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAAT----T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T--T-GCTATAA-TT-TTATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACT---CTGGTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAAC--TT-CGTATTTTTACG---------AATTGCAA----ATGACA-TTTTTAATATA-------AA--AA--ATAACATTATATT--A--TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG-A---AATA-AATG--GATTTAATGGTGT-GAAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT--AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTAACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAAACG--AAAGCTTAAATGA---CAACCAAAT-ACCTGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATA----T----TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGA-AACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA-A-----C----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCCA---AACG-AA-G--AATTTAATGGTGC-TACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATTTT----TA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG--------------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA--------TATCAA------ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCATA-TA-----------T---CGG-TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA-A--------AT-----CA-----CGCCA------------T----TACTAT----T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGGATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATG-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATT-GTTTTAACTA-T-GTTAGAAA--AAGGAC----GTCATC-TAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTTTCA---A-------AG--AA--ATA----TA-ATCA-A-GTGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATTGTGT-TAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTGTAAA-AGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAGATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGAC-ATTACGGAATA-T------GA---TAAC--AAT-ACCT-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACA----CCTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CATT-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACA-ACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-A-----T--A-----------------A------------T----TAC-AT----T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CA-TTGTTTTAACTC-T-GTAAGAAA--AAATAC----ATCATC-CAAAGGTCGTCATT---CAGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAATGGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-A--TTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--ATATATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTGA----CA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT---TTTA-A-AGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACT-CGTTTA--------TTATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACAGT-ACG--GGAGCT-----GAATTTACC--AAT-ACCT-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACA-ACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG-GAAA-A--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-ACTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTTAGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA-T-TTTATTA---ATGT----AACTAATGGTA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACG---AATA-AA-ACAAG--AAATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATA-TCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGCA-ATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGATCG--ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAGC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgA---TAAC----C-ACTT-TAATAA--------AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACA-ACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCA-AG-AAAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACAAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagcaatatgatatatgtgcacttAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA------------A-T-GTTAGAAA--AAAGAC----ATCATC-TAAAGGTCGTTTTT---CGGCTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAATGGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-A-TTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-ACC--A-GTGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTT---AATG-AA-G--AGCTAAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTTG-ATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 11 111111111111 11 222222222 11 11111 22222222222222222222 11 11111 11 111 222 1111 1111 2222 22222222 11 111 33333333333 1111 44444 11111 11 22222222 3333333333 2222222222 1 111111 222222222 1 111 222222 11 111 1111 1111 11 2222 666666666 111111 11 11111 22222222 1111 1 33333333333333333333333333 3333 2222 1111 33333333333333333333333333333333 1 111 1 2222222222 11111111111111 1 22222 22 1 22 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 3 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 8 11 66 8 33 11 6666 111111111111 1 0 11 55 1 000000000 2 7 66 5 11 0 1 5 55 22222 5 6 555 44 77777777777777777777 55 22222 1 77 0 0 000 0 0 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 3333 77 2 00000000 66 11 3 333 66666666666 99 99 4444 6 00000 4 0 6 0 6 22 66666 5 5 77 6666 33 5 7 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 9999999999 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 3 1 333 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 55 3 2 000 2222 11 0000 1 1 44 8 1 1 1 3 1111 222222222 999999 333 8 88 77777 1 1 77 33333333 4444 0 66 1 1 66 6 44444444444444444444444444 888 6666 1 1 1111 5 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 77777777777777777777777777777777 77 0 0 1 777 5 0 5 3 6666666666 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 999 4 0 666 1 3 55 0 1 3 1 1 3 88 4 55 1 4 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 44 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99999999999999999 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. . .. .. .... ............ . . .. .. . ......... . . .. . .. . . . .. ..... . . ... .. .................... .. ..... . .. . . ... . . ... .... . . . . . . .... ... ... .... .. . ........ .. .. . ... ........... .. .. .... . ..... . . . . . .. ..... . . .. .... .. . . . ........ . . .......... .. . . . . . . . .......... . . . . ...... . . ......... . . . . ... . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . .. . . ... .... .. .... . . .. . . . . . .... ......... ...... ... . .. ..... . . .. ........ .... . .. . . .. . .......................... ... .... . . .... . . . . . . . . .. . .... . . ................................ .. . . . ... . . . . .......... . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . ... . . ... . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. . ................................................................................................................ ................. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 9 33 11 1 88 00 6666 666666666666 9 9 33 22 9 333333333 0 4 99 0 88 8 0 4 77 33333 1 3 000 44 00000000000000000000 77 66666 7 11 4 4 000 4 7 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 3333 33 5 33333333 77 22 2 000 00000000000 22 22 2222 7 33333 2 7 7 7 7 00 77777 7 7 99 1111 11 7 1 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 4444444444 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 3 7 777 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 77 9 3 000 1111 33 0000 0 0 44 0 0 4 0 2 6666 444444444 444444 000 0 66 11111 0 7 99 33333333 2222 5 99 4 0 77 6 66666666666666666666666666 888 8888 0 0 2222 6 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 00000000000000000000000000000000 22 0 2 0 000 0 0 0 6 4444444444 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 444 5 5 666 0 6 99 4 0 6 4 1 6 77 5 00 9 4 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 66 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444444444444444 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : AATGATGTTGACGATAATG--ATGAC------GA----AAC--
gi|1 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TC-----------ATAATGCGGAAAAT---AGAA----GGCGAAC-TT---TAG-ATTTAAACATGTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGATAGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-T-TTTATTA---ATGTAATTAA--GG--ATA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA-G--A----AATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-GAGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCACG--AGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAAC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGAT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCTTAG-GACAT-CCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATT------------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACT-GATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTC-G-TAAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG-A-----T--CT------A-----C--TG------------TATGATGCAAA----T------GCAGTA-A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAA-A------ATGA------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACATtactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatatttatgtctcagaggatttttcaaagagagtttcgcaagctaggtataattttcggccattcctaaaaagagcaatagagaaaaacaataaagcctatttgaaacatgataaacttgtcgttaatggagatatattcgtttttgatgctgataataaaaacctgaaacagctatatagataggacagaggtcaaggtcataatgcggaaaatagaaggcgaactttagatttaaacatgttatgctggaatatacaaggcttatcgaaatacacacgtaacattgatttcttgtcacttgtaagacaatttgatatatgtgctttcaatgaaacttggtctaaaagaaaagacgagtttaacgaccatttaagaggttacacatgttttaataatgctcgaaacaaaaggtgttacaaaggtcgccactcaggtggtgtatgtgcatttgttaaaacatctttgatagagaatggcttagtgaagaggatagttagccatttggataattatgtattcttaagactaaatactgattttattaatgtaattaaggatattattttatgttttgtttacatatctccggaagggtcgactttgtatgatacggagaatacaagaaatggtattgaactatttgaagaaaatctattagaggttgtatcagagtatactgatgatgaacttattttggcgggtgactttaatgccaaatgtggtaatttgcaagatattattgatgatggtaatgttgattttatttttgaccacgaggatacattgtatgacaatgatacttttaatgtatatcgaaactccaaagatactctatgtaacacattcgggtttacgcacattgaattatgcaaaatgtatggtgttcactttttgaatggctgattgtttaacgatacagaaggaaatttcacatcaacagcaaacggtggctcaagtttaattgattatgtaattgcttctagcgagctgtttccacatataacacactttgagataggagatcggcacgagtctgaccactttcctcttatttgtagactagtatttaaatccgaccaaaatagcagtgatactgatgataatgataacgaaatcaatgatgtaaacgattttaaacgctttaaatggaatgaaaacaaaagtgaagagttttcgaataatataagatctgctttattaacaataaaatatactattcttaggacatccgtactgatatcaaccaagctatacataaaattgtagacatgtttcataaagctgcaattagcaaacgaataaaacccacttatatacatcgtaaacctgcacaacccgagtggtgggattttgaatgtgaacatttaaaaagggaaaaaatataaaaactaagattatttagattattcaatacaaaatctagtttacaagattatacacgaagcagaaataaatttaaatattgctgtaaacaaaaacagactgatcttcaagagaaatttcgacaagaactcgtagaatctcgtaagaacccagatttattttggaaagcagtaaacaagtttagatttaaaaacaatcaaattgtgataaacaattttaaaacaaacctggtataatcacttcagagatctactgtatgatgcaaatgcagtaaataatttgattgacgataatattttacctgaaaatgaaattgtagatgacatgtttaatgtctcttcctcattagcagagttaaagaggagtattctgaaattaaaagttgggaaatccacaggccctagtggaatattatcagcgacggttaaatgcacccttactgacatgtcagatgtattgctc
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGAT--ATTT-AAAA----------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AG----GACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-TTA---------C-------CT-CA---------AAA-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA------TG----C---CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACA-AGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA-A-----TTGAT-----AT-----C--CGCAAATCACGCTAT----TAATAT----T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------ATAA------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgcaAATG--GTAG--------A---TTAC--ATT-ACGA-CAA-GATGCATTTTAACC-TT-----------TTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----GAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA-AATGAT-----ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA-A-----T--AT----------------G------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACA-C-G-----TTTTTCATGAAAATTTGAACG------AAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT---CAG--CCTT--------------CATCATTTAATAT--AAA--TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATTTC---------ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGT-----TT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG-ATT-AGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACA-ACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-AAATGTT--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACA-ACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA-ATTGT-T--ATCTGAGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTG-ACC------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA-----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACA-AACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAA--TTTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAAT----T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAATGT------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGTCAGCA--TTC---------------A--TCATTTTATAT--AAAT--GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T--T-GCTATAA-TT-TTATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACT---CTGGTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAAC--TT-CGTATTTTTACG---------AATTGCAA----ATGACA-TTTTTAATATA-------AA--AA--ATAACATTATATT--A--TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAACG-A---AATA-AATG--GATTTAATGGTGT-GAAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGG-----CAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT--AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTAACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGATAGA-ACA-GAATCAGCCCACTTTCC----ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAAACG--AAAGCTTAAATGA---CAACCAAAT-ACCTGTAA--ATG-ATCT-AAGATGCATTTTAACCTTTTTAA---ATGGGACGA-AGAAAAACTA----AA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-TCTGAGG----CCATA----T----TGACAAACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AA---CAAACATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGA-AACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA-A-----C----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACG------AGGAAAATGTTATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAATCCA---AACG-AA-G--AATTTAATGGTGC-TACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATTTT----TA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG--------------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA--------TATCAA------ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCATA-TA-----------T---CGG-TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA-A--------AT-----CA-----CGCCA------------T----TACTAT----T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGGATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGATAG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AT-TTATCTAATATCCAAAT-TATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATG-AACATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATT-GTTTTAACTA-T-GTTAGAAA--AAGGAC----GTCATC-TAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTTTCA---A-------AG--AA--ATA----TA-ATCA-A-GTGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATTGTGT-TAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTGTAAA-AGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAGATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAAAGG-ACG-GACTCCGATCATTTCCC----ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGAC-ATTACGGAATA-T------GA---TAAC--AAT-ACCT-TAACGA-G-ACTT-GAGA-GG-----------TTTAA---ATGGGAA-ACTGTAAAACAG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-TTAAAAA----CCACA----CCTCATAAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CATT-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACA-ACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-A-----T--A-----------------A------------T----TAC-AT----T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A-------CAGGCTCTTGCAA----AG---AT-TTATCTAACATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CA-TTGTTTTAACTC-T-GTAAGAAA--AAATAC----ATCATC-CAAAGGTCGTCATT---CAGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAATGGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-A--TTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--ATATATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTGAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTGA----CA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT---TTTA-A-AGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGATAAA-ACG-GACT-CGTTTA--------TTATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACAGT-ACG--GGAGCT-----GAATTTACC--AAT-ACCT-AACCGAT--ATTT-GATA-GG-----------TTTAA---ATGGGATAA-TGGAAAACGG----GACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCACATAAC-----GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACA-ACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG-GAAA-A--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-ACTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGTTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATATA-AGGC-----GAACATTAG---AT-TT---TAACAT--------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACA-T-GTTTTAA-TAAT-GTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACT---CAGGTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTTAGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGACT--AA-ATAATGA-T-TTTATTA---ATGT----AACTAATGGTA----TT-ATTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACG---AATA-AA-ACAAG--AAATGGTATTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGTGG----TAA--TTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATA-TCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGCA-ATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGATCG--ACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAGC------GA---AATC--AATGATGT-AAACGGT---TTT-AAAC-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-----GAAAACAAAAGTGAAGAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-CTTGAGGACATCCGTA----C----TGAT-----ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AATTAG---CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCAAAAT-TA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgA---TAAC----C-ACTT-TAATAA--------AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGAAT-ACTGTTAAACTG----GACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-TTAGAAA----CCATA----CCTCATAAC-----GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGATT-C---AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACA-ACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCA-AG-AAAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACAAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagcaatatgatatatgtgcacttAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGTACAGGCTCTTACAA----AG---AT-TTATTTAATATCCAAAT-TATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA------------A-T-GTTAGAAA--AAAGAC----ATCATC-TAAAGGTCGTTTTT---CGGCTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAATGGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-A-TTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-ACC--A-GTGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAATGTT---AATG-AA-G--AGCTAAATGGTGT-AAATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTT
blockSeqs : TTTAATA AGC G G CG C T G AAT C CC C TGCA TC T G G T CC A C T A TTA AC C T AAGGT C C GC GG T CA GT TTGG CATTAGAT A CC T T TTCAT T T GA A TA G A TA CACT T T GCG TT TCATTGTTTTAACTAT CA TCTCT C AA CGG TGT AAAT C C C C T ATAA CAA CGC AC GA C TAT GC CA A CA TATA CT TG ACAT T AAG A A G AC CA . T CA ATTT TG A T G ATCAG A G TGAATACACT GA C T G C CGAGT G T A TATTTA A T CACTTCAAG G C C TT A TA AT A T A A TTATAT T G T A AG T A CTT CTAG CT CGTA T C A T A A C C TCTT TGTAGACTA TTCATC AAT G CG GCAG G A GA GCTTAAAT ATTT CA G G GT C TGATCTAAGATGCATTTTAACCTT TCA AAT C A AAGT C A A T C T A AC . CTA T . TTAGGCCATATTGACAAATGAT CA G T TG C T T A GACAAA A A . . T G GG A G TATA A G TG G T A CTT G TA C GAT T C AT TAG A G A G CA A . TT A A C A A TC T . C T C A . A A TC A G . T GG A A T AG C AATGTTATCTGCGAATCACGCCATTACTATTGACATGCAACAAAATCTATT GAAGAAAAAGT A T T A AA TAATAA T CG CG A TAAC . AA CA G G AAC AGTGAAAT T C
blockSeqs : T . G G AA A A T . G TA A AGAG TC G A T . . . . A T CAG . G . AAGGT . A GC . T GT GC TTGC AGAT A CC T T TTCAT T T . . AT A A . GCAT T T GTT TC TCATTGTTTTAACTCT . G C A . . GTA . T A C . . TCT CGC . AT C TAC GT CT A AT ATGT . . . . ATA A . . CT TA . . . ATTT G . C A CTCA . . TTTA . G T T A CAAGT . T A TA A T . G C T AA A TA AC A T A A AA A G . A . A A . . CT TG T T G . C C A T TT . TTC TTT . TC TGC G A . GCT A . . C C C TGCATTTTAACCTT . GAA A T . A . T A G G G . . TG T . TGAGGCCATATTGACAAACG G G A TG . C . A TGATTC T A . . . C C G . TTTA . . . . T G . G CA . GAT G G AT ACG A . A G GG T . TT T . C C C TC T . C T G T . G G AG A A . T GG C . C . . TTGATATCCGCAAATCACGCTATTAATATTGACATGAAACAAAACATAGT GAGGAAAATGT T T T . AA GCT A . . . AAGC . A CA G G A A T C
blockSeqs : T . A G AA A A C . G TA A TG C G A G . . . . A T CAG . G . ACGTT . . T . T GT GT TTGG AGAT A CC T T CTT T A . . AT A A . GTAT T T GTT TA CACATGTTTTAATAAT . C C C . . GTT . A T C . . TAG CGC . GT C TAT GT CG A A A . . . . TTA G . . CT TA . . . GTTG T . T C A . . TCCA . A A T A GTCAC . C T CA C A . A . T TA G AC AA T A A C AT A G . A . G A . . GC TG T T A . C C T C . . AAA TAT . TC TGC A A . AC T . . C T C GACTTGAGAGG . GAA A T . C . T A T T G . . TG T . AAAAACCACACCTCATAAC G . A AG . . . T AACAAA T A . . . T G A . TTTA . . . . T A . T TG . GAT T C CT TAG T . A G AA A . TT A . C A A TC A . A T C A . A A TC T G . T GG A . T . . TTGTTATCTGAGAATCACGCCATTACTATTGACATGGAACAAAATCTATT GAAGAAAATGT A T . . AA GCC T . . . AAGT . T . G G A A T C
blockSeqs : G . CT C T G . C CC C A C T A G . . . . T A TTA . C . TCGTA . . T . C AT GC TTGG AGAC A CA T T GCC T C . . TT T T . GCAT A C CCT TC CTTGCTATAATTTT . C T C . . GTT . A T A . . TAG AGG . GT C . GT A A T A . . . . AG A . . GA CG . . . GTTG T . T T A . . GACA . A C T A GTCAC . C A TC C A . A . T T G CT GC C A T C AT A C . A . A A . . CT TG C T . . G T A . . . A CCG . . TG G T . GC C . . C A T TATTTGATAGG . ACT T A . C . G T T T G . . T A . AGAAACCATACCACATAAC G . C T . . . T TGATTC A A . . . T C A . TTGA . . . . . A . T TG . GAT T C A TAG A . A T GG G . CC A . A A A TC A . A T C A . A A TA T T . A . A . G . . CTGTTATCTGCGAATCACGCCATTACTATTGACATGCAACACAATATATT GAGGAAAATGT A A . . AA GCT T . . . TAGC . A . T A A T A T
blockSeqs : . . CG C T G . C CC C A C T G G . . . . T A TTG . C . ACAGA . . T . A GT GC TTAC AGAC A CC T T CTT C T . . CA A A . GT T T ATT C TATCAA . T C C . . GTT . T A C . . TGA CAC . C . . . . . A A . . . . A . . . CT TT . . . GCTA A . T T A . . TCCA . T C G C GTCAC . T G TA C A . G . . A C GT A C G T C AA T . . A . A G . . CT CA A A . A . G T . . G A . TTTTAAACGC . AAT G G . A . G T T T A . . A T . TGAGGACATCCGTACTGAT A . C T . . . A TGATTC T A . . . G G G . TTTA . . . . . G . G CA . GAT G G G ACG A . A . GG C . CC T . A C C G T . C T G T . G G GG A A . T . C . A . . TTGTTATCTGCGAATCACGCCATTACAATTGACATGGAACAAAATATATT CATGA T A . . . GCC A . . . AAGC . A . . A A T A C
blockSeqs : A C . T TA A A C T G T . . . . A A TTA . C . TCGTA . . T . C GT GC TT AGAT A . T T TT T T . . TT T . . . . . . . TCAAT . C . . . . . . A T . . . TAG . A . . . GA A . . A A . . TC . A T T A TAAT . C T TT G G . . T A . . A . . . AA . . . T A . . T T . TATTTAAAA . ACT G A . C . T G T T G . . C A . AGAAACCATACCTCATAAC G . A T . . . A AATTAG T G . . . G G A . TTGA . . . . . G . G CA . TC G A . AAT A . A . GG T . TT T . A C C A T . C T G T . A G GC A A . T . C . C . . TATGTTACAATCGAGTGAAGCAGAACACGTTTTTCATGAAA ATAA T T . . . GCT A . . . CC . A . . A A T A T
blockSeqs : A C G G G . . . . T G TTA . A . . . . T . . . T G CA A . . . TT T . . . AT T . . . . . A . . . . . A . C G . T . AAGAGC . . T T . . . G T . . . . . T . . ACCTCA . . C T . . . . TGATTC T A . . . G C A . TA . . . . . A . G CA . TC G G . ATG A . A . AA T . TT T . C C C . T . C T G T . G G AG A A . T . C . C . . TCTGTTACAATCGAGTGAAGCAGAACGCATTTCTCATGAAA ATGA T T . . . GCC T . . . CA . A . . A . A A .
blockSeqs : . T . . . . . . A A . . C . . . . . . . . . . A . . . . TT TGC T . . . . . C A . . . . . . . A . T TG . TC T C . AC . . . . AT G . TT A . C A A . A . A T C A . A A TA T G . T . T . A . . TCTGTTACAATTGAGTGAAGCAGAACGTGTTTCTCATGAAA ATGA A T . . . GCT T . . . . . . . . G . A T .
blockSeqs : . . . . . . . . A . T AG . C T A . AG . . . . AA A . C A . C A C . A . A . C A . A T TC T G . . . A . T . . CCTGTTACAATCGAGTGAGCAGAACGCAATTCTCATGAAA ATGA A T . . . A T . . . . . . . A T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . A . . . . A . . A . A A TA T G . . . A . T . . ATCACGCCATTACTATTGACATGCAACACAATCTATT ATGA A . . . . A T . . .
blockSeqs : T . . . A . T . . TAATTACATTGAACAAAATCTATT ATGA A . . . . A . .
blockSeqCons : A****** C* ** TTG ** T* TTGG AGAT******** T* TT******* ** GCAT* ** C* *** GTT* TAG CGC **** TAT***** GT A********** TA*** GTTN N* A******* TCCA****** GTCGC***** TA* ** A* TC** ********* TC TGC** N*** TATTTAAGA***************** AAT* **** AGAAACCATACCTCATAAC************* T** TGATNC**** *** TTTA********** GAC** A* A** GG* TT ** ** ** ATGA************* GCC*** AAGC ******
originalCons : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAA----AG---AC-TTATCTAATATCCAAAT-TGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCA---A-------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGCG---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGT-GAATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGG---GTCA--CTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGG-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGCAGTGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---TAAC--AAT-ACNT-NAACGATG-ATTT-AAGA-GC-----------TTTAA---ATGGGAT-A-TGNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAGG----CCGTA----CC-CATGAC-----ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATT-C---CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACA-ACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACG------ATGA------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
finalCons : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAATA------AAAGACAAGAAAC-GTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TAT-ATAC--ATAATGTGCAGGCTCTTGGAAAGAT--------TTATCTAATATCCAAAT-TGTTATTT-------GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCAT-AATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CA-T-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACT---CGGGTGGTGTA---ACAGTT-TTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-A-TTTTTCAA----------AA--AA--ATA----TA-ATC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAATGTA---AATG-AA-G--AGTTNAATGGTGTN-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTATA-------AGT-GT-ATTTCCA------GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGGGTCGC-----TT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAGATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGATAGA-ACG-GANTCCGATCACTTTCCTC--ATT---------GCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGC--TGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GAN---AAC--AAT-ACNT-NAACGATATTTAAGA-----------------TTTAA---ATGGGATAAT-GNAAAACNG----GACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-TTAGAAACCATACCTCATAAC-------------ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGTT--A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGATNC----CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACAGG-CTTGCAAACNGAAACA-ACTTGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG--AAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAACATGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCTGCC---GAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 1 111 2222222 11 11 111 11 11111 1 11 11111111 222222222222 11 222222222 11 11111 2222222222222222222 11 11111 11 1111 222 1111 1111 2222 22222222 11 33333333333 33333333333333333 11111 11 22222222 3333333333 11111 1 111111 222222222 1 111 222222 1111111 111 1111 1111 22222 666666666666666666666 11 11111 222222 1111 11 1 111 555555555555555555 1 1 1111 1111 1111111 1 111 1 11111111 11111111111111 1 22222 22 1 222 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333 1111111111111 11 111111 1111 111111 11 1 111 11111111
lowQualScore : 7777777777 777 1 5 44 1 1 3 000 1 11 1 4444444 00 1 6 1 4 66 8 00 1 4 000 22 1 0 8 33333 4 3 44 66 33333333 555555555555 777 66 4444 000000000 2 7 66 5 11 0 1 1 5 55 22222 5 6 555 44 7777777777777777777 55 22222 1 77 0 0 0 0000 000 5555 5 1 0 1 7 5 2222 111 444 3333 77 2 00000000 1 11 3 6 6 66666666666 99 99 44444444444444444 4 0 6 0 6 22 11111 5 33 6666 5 66 5 0 1 44444444 5 5 2222222222 66 2 1 0 0 0 3 3 55555 0 1 0 1 333333 1 2 000000000 0 8 3 1 333 1 0 0 22 55 1 3 0 1 3 999999 1 6 6 0 5 1111111 2 000 2222 11 0000 1 1 6 8 1 1 77 5 55555 444444444444444444444 333 8 88 88888 1 3 99 3 555555 2222 6 11 6 222 1 888 77 111111111111111111 5 0 4 1 33 1 5 1 1 0 2 6 2 66 5 7777 3 5 66 4444 7777777 3 77 77 0 0 1 777 5 5 0 3 55555555 1 0 3 777 4 4 5 77 3 4 88888888888888 3 3 55 3 0 1 666 5 11 3 11111 1 2 22 888 88 3 55 4 0 666 1 33 0 1 3 1 1 1 000 1 55 1 88 2 1 0 55 1 1 11 1 3 3 5 33 1 3 1 44 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222 44 8888888888888 1 4 6 3 88 555555 3 44 55 3 0000 111111 88 22 5 3 111 0 44444444 1 4
lowQualScore : .......... ... . . .. . . . ... . .. . ....... .. . . . . .. . .. . . ... .. . . . ..... . . .. .. ........ ............ ... .. .... ......... . . .. . .. . . . . .. ..... . . ... .. ................... .. ..... . .. . . . .... ... .... . . . . . . .... ... ... .... .. . ........ . .. . . . ........... .. .. ................. . . . . . .. ..... . .. .... . .. . . . ........ . . .......... .. . . . . . . . ..... . . . . ...... . . ......... . . . . ... . . . .. .. . . . . . ...... . . . . . ....... . ... .... .. .... . . . . . . .. . ..... ..................... ... . .. ..... . . .. . ...... .... . .. . ... . ... .. .................. . . . . .. . . . . . . . . .. . .... . . .. .... ....... . .. .. . . . ... . . . . ........ . . . ... . . . .. . . .............. . . .. . . . ... . .. . ..... . . .. ... .. . .. . . ... . .. . . . . . . ... . .. . .. . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. . ................................................................................................................ ....... .. ............. . . . . .. ...... . .. .. . .... ...... .. .. . . ... . ........ . .
lowQualScore : 2222222222 555 0 0 77 0 0 0 000 7 77 3 1111111 00 7 4 1 4 11 9 66 0 4 000 22 1 3 0 11111 4 3 11 11 44444444 444444444444 888 11 3333 333333333 0 4 99 0 88 8 0 7 4 77 33333 1 3 000 44 0000000000000000000 77 66666 7 11 4 4 4 7777 000 4444 7 0 4 0 9 7 1111 999 444 3333 33 5 33333333 7 22 2 7 7 00000000000 22 22 33333333333333333 2 7 7 7 7 00 99999 7 66 1111 7 77 7 1 0 22222222 0 0 8888888888 99 8 2 2 2 4 0 0 88888 0 1 5 0 111111 0 2 000000000 8 9 3 7 777 0 7 7 00 88 0 7 6 0 0 777777 0 7 7 7 0 3333333 3 000 1111 33 0000 0 0 7 2 0 4 44 0 88888 888888888888888888888 000 0 66 99999 0 5 22 7 888888 7777 2 00 0 000 0 000 99 111111111111111111 0 0 0 0 55 9 0 0 0 2 0 2 2 99 0 9999 6 0 99 6666 5555555 2 22 22 0 2 0 000 0 0 0 6 77777777 0 4 8 888 4 4 7 33 4 4 66666666666666 6 6 00 6 9 7 444 1 44 6 55555 9 3 33 222 11 6 00 5 5 666 0 11 4 0 6 4 1 4 333 0 00 9 55 3 0 5 00 6 0 11 0 7 3 4 88 2 3 0 66 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555555 66 3333333333333 8 8 7 3 33 666666 8 66 00 6 8888 555555 99 22 0 0 222 3 22222222 0 7
consensus : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ANAATGT-GCAGGCTCTTGGAA----AGATTTATC---TAATATCCAAATTGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CAT-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACTCGG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-A--TC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAAT---GCGAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TN-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGGGTAACTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGAT-AGAACGGANTCCGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGC--TGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---NANC--AATGAC--GTAAACGATATTTA--A--GA--------------TT-TAAATGGGAT-AANGNAAAACTGGACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-T--TAGAA-A-CCATAC---CT--CATAAC-ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGAT-NC-CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACAACTCGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG-CAAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
Reference ( family-4387 ) : CAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTTTGCAGAGGACTTCCCCGGTNGNGTTGCGAAAGCTAGGTAT---GACCTCAGGCCATTTCTCAATAGAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGATTGTAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATNTGACGCTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGGNGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGT-GCAGGCTCTTGGAA----AGATTTATC---TAATATCCAAATTGTTAT-T---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATACGAATGTAACGCTG--ACTTTTT-GTNTTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCNCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGACGAATTTAACGAGCTTTTCGTTGGTTAC-CAT-GTTTTAA-TA-T-GTTAGAAA--AAAGAC----GTCATC-TAAAGGTCGCCACTCGG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCANATTTGATNGAGACAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGCGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAACACAATGA-ATTTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-A--TC--A-GTGTTTTACTTACGTATCTC-CGGAAGGT-TCNNCTATATATAAT---GTAAATG-AA--GAGTTNAATGGTG-TN-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATNAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTNATTTTGGCTGGTGACTTTAATTCAAGATGTGGGTCGCTT-CAAGACATTATNGAAGATGACGATGTTGATTTCA----TATTTNAAGACGAGGAT---------GTATTATATGAAAATGATGATTTTT-AATGTATA-AGGAACTCCAAAGATANTATATGTAACACGTTCGGNNATTCGCTTATTGAANTATGTAAATCGTATGGAATTCACNTTCTGAACGGTCGATTGCATAACGATAAAG--A-ATGGTAATTNCACTTGCA-CAGCAAACGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATCTATTTCC---ACA----TATCTCACG--CTTTGAGATNGGNGAT-AGAACGGANTCCGATCACTTTCCTC--ATT---------GCATTT---ANATCNTAC-CAAATCATATGC--TGATGCTGACGATAACG--ATAGC------GA---NAAC--AAT-AC--NTNAACGATATTTA--A--GA--------------TT-TAAATGGGAT-AATGNAAAACNGGACGAAT-TTNTNAACAGTCTAAGATCTTCTTTTGTT--GA-A--N-TAAAAGATACTATT-T--TAGAA-A-CCATAC---CT--CATAAC-ATA-GAAC-AAGCTGTACATCANATTGT-T-A-CA-T-GTATCATAAAGCTGCTGAT-NC-CATGAAAATCAAATCAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACGATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAACGG-TGAC--ACTCNAAA--TTACGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-GGCTTGCAAACNGAAACAACTTGAGCTGCAGGACAAANAT-AAACAAGAACTTATAGACTCACGG--AAANA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTNAAAAGANTCAGATTT--AAACAGACGCGTTNCGANAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTNAA--AA-A-----T--AT-----AA-----C--CG------------T----TACNAT----T------G------A------A-CA----GA---ACG-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCTAGTGGGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCANAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|1 : --TGATGTTGACGATAATG--ATGAC------GA---AA
gi|1 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaaATTTATGTCT-CAGAGGATTTTTCAAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---AATTTTCGGCCATTCCTAAAAAGAGCAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATTCGTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACCTGAAACAGCTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGC--GGAAAATAGAAGGC-----GAACTTTAGATTTA------AACAT-------GTTATGC---T---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACACGTAACATTG--ATTTCTT-GTCACTTGTAAGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAAACTTGGTCTAAAAGAA--AA-GACGAGTTTAACGACCATTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAAT-GCTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACTCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-AAACATCTTTGATAGAGA-AT-GGC----TTA--------GTG---AAGAGGATAGTTAGCCATTTGGATAATTAT--GTATTCTTAAGACTA-AATAC--TGA-TTTTAT-TA---ATGTAATTAA--GG--ATA----TT-A--TTTTA--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGATACGGAGAATACAA--GA----AATGGTA-TTGAACTAT-TT-GAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-AT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAAATGTGG-TAATTTGCAAGATATTATTGATGATGGTAATGTTGATTTTA----TTTTTGACCACGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATATCGAAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCACATTGAATTATGCAAAATGTATGGTGTTCACTTTTTGAATGGCTGATTGTTTAACGATACAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGCTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCTAGC-G--AGCTGTTTCC---ACA----TATAACACA--CTTTGAGATAGGAGATCGGCAC-GAGTCTGACCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGTATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAAC------GA---AATC--AATGAT--GTAAACGAT-TTTA--AACGC--------------TT-TAAATGGAATGAAAACAAAAGTGAA-GAGT-TTTCGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT--AACA--A-TAAAATATACTATTCT--TAGGACATCCGTAC---------TGAT-ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGC-AAT-T---------AGCAAA-CGAATAAAACCCACTTATATACATC-GTAAACCTGC-ACAACCCGAGTGGTGGGATTTTG-AATGTGAACATTTAAAA---AGGGAAAAAATAT-A-A--AA-AC--------TAAGA---TTATTTAGATTATTCAA-T-ACAAAATCTAGT--TTACAAGATT-ATACACGAAGC----AGAA-ATAAATTTAAATATTGC-TGTAAACAAAAACAGACTGATCTTCAAGAGAAATTT-CGACAAGAACTCGTAGAATCTCGT--AAGAACCCAGA--TTTATTTTGGAAAGCAGTAAACAAGTTTAGATTTAAAAACAATCAAATTGTGATA--AACAATTTTAAAA--CAAACCTGGTATAATC-ACTTCAG--AG-A-----T--CT------A-----C--TG------------TATGATGCAAA----T------GCAGTA-A------A-TAATTTGATTGACGAT-AATATTTT----------ACCTGAAA-------A--TGA-------------AATTGTAGATGACATG-TTT-AATG-TCTCTTCCT--CATTA--GCAGAGTTAAAGA--GGA--GTA-T------TCTGAAATTAAAAGTTGG-GAAATCC--ACAGGCCCTAGTGGAA-TA--TTATCAGCGACGGTTAAATGCACC-------CTTACTGACATctactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatatttatgtctcagaggatttttcaaagagagtttcgcaagctaggtataattttcggccattcctaaaaagagcaatagagaaaaacaataaagcctatttgaaacatgataaacttgtcgttaatggagatatattcgtttttgatgctgataataaaaacctgaaacagctatatagataggacagaggtcaaggtcataatgcggaaaatagaaggcgaactttagatttaaacatgttatgctggaatatacaaggcttatcgaaatacacacgtaacattgatttcttgtcacttgtaagacaatttgatatatgtgctttcaatgaaacttggtctaaaagaaaagacgagtttaacgaccatttaagaggttacacatgttttaataatgctcgaaacaaaaggtgttacaaaggtcgccactcaggtggtgtatgtgcatttgttaaaacatctttgatagagaatggcttagtgaagaggatagttagccatttggataattatgtattcttaagactaaatactgattttattaatgtaattaaggatattattttatgttttgtttacatatctccggaagggtcgactttgtatgatacggagaatacaagaaatggtattgaactatttgaagaaaatctattagaggttgtatcagagtatactgatgatgaacttattttggcgggtgactttaatgccaaatgtggtaatttgcaagatattattgatgatggtaatgttgattttatttttgaccacgaggatacattgtatgacaatgatacttttaatgtatatcgaaactccaaagatactctatgtaacacattcgggtttacgcacattgaattatgcaaaatgtatggtgttcactttttgaatggctgattgtttaacgatacagaaggaaatttcacatcaacagcaaacggtggctcaagtttaattgattatgtaattgcttctagcgagctgtttccacatataacacactttgagataggagatcggcacgagtctgaccactttcctcttatttgtagactagtatttaaatccgaccaaaatagcagtgatactgatgataatgataacgaaatcaatgatgtaaacgattttaaacgctttaaatggaatgaaaacaaaagtgaagagttttcgaataatataagatctgctttattaacaataaaatatactattcttaggacatccgtactgatatcaaccaagctatacataaaattgtagacatgtttcataaagctgcaattagcaaacgaataaaacccacttatatacatcgtaaacctgcacaacccgagtggtgggattttgaatgtgaacatttaaaaagggaaaaaatataaaaactaagattatttagattattcaatacaaaatctagtttacaagattatacacgaagcagaaataaatttaaatattgctgtaaacaaaaacagactgatcttcaagagaaatttcgacaagaactcgtagaatctcgtaagaacccagatttattttggaaagcagtaaacaagtttagatttaaaaacaatcaaattgtgataaacaattttaaaacaaacctggtataatcacttcagagatctactgtatgatgcaaatgcagtaaataatttgattgacgataatattttacctgaaaatgaaattgtagatgacatgtttaatgtctcttcctcattagcagagttaaagaggagtattctgaaattaaaagttgggaaatccacaggccctagtggaatattatcagcgacggttaaatgcacccttactgacatgtcagatgtattgctc
gi|10 : caacgagcagtgatagttaaattctcgttttttaaagacagggataaagtgttaaaagaatacagaatgaaaaggagagaattaaatgaacgacgtagatgcagatcaaacgaatggtttagaagaacgcaatagaaatgatgttgacgataatgatgacgaaactactgcagaaacagttaaaaaatcattgagatcaaatGATATTTA--A--AA--------------TAATCAATGGAAT-AATGCAAAA-AGGACGAAT-ATATTAACAGTCAAAGGCCCTCTTTTATT--GA-A--T-TAAAAGATGC-ATT-T--TA-----------C---CT--CA-AA----A-GAAC-AAACTGTACAACATATTAT-T-A-CG-TTATACCATAA---------T-GC-CATGAAA------TAAAATAA---TTGTTCA-ACAAATA-AAAGATTAAC-CTAAGCATGT-GGTGGTGCAATGGAATGGGAAAAGTTTAAATATA----------AC-AGA--AA-AG-AGAGCTTTAAGA---AAGTTTAGATTAAATAC-CGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-C-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-CACTTGCAAACAGAAACAAGTTGAGCTGCAGAACAGAAAC-AAACAAAAACTTATAAACTCAAAG--AAATA--CCCTTTTTTATTTCGGAAAACTGTC-AATGAATCAGATTT--AAACGGACACATTCCGAAAGTAAC-ATTTCATCG--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAAAGAA-A-----TTGAT-----AT-----C--CGCAAATCACGCTAT----TAATAT----T------GACATGAA------A-CA----AA---ACA-T-A-----GT----------ACCTGAAC-------A--TAA-------------TACAATACATGATATA-TTT-AAAGATCCATTTTC--TGCA---GCTTAACTTAACA--GAG--ATGATAAgtcagatgtattgctc
gi|10 : gacaGCTTAACTTAACAGAGATGATAACATACATAGTGAAATTTCATAGATATAGCTCCCATTCTTCTcatacatagtgaaatttcatagatatagctcccattcttctt
gi|11 : gacagatatttaaaataatcaatggaataatgcaaaaaggacgaatatattaacagtcaaaggccctcttttattgaattaaaagatgcattttacctcaaaagaacaaactgtacaacatattattacgttataccataatgccatgaaataaaataattgttcaacaaataaaagattaacctaagcatgtggtggtgcaatggaatgggaaaagtttaaatataacagaaaagagagctttaagaaagtttagattaaataccgatactccaaatttagaaacatacaaagccattagaaacaaattcaaacacacttgcaaacagaaacaagttgagctgcagaacagaaacaaacaaaaacttataaactcaaagaaatacccttttttatttcggaaaactgtcaatgaatcagatttaaacggacacattccgaaagtaacatttcatcgtaagcgtggtataaccactttaaagaaattgatatccgcaaatcacgctattaatattgacatgaaacaaaacatagtacctgaacataatacaatacatgatatatttaaagatccattttctgca--------------TT-TAAATGGGAC-GAAGAAAAACTAGAAATAT-TTTTAAACAATTTAAAAGCTTTGGTT-TC--GA-A--TGTAAAAGATGATATT-TGTTAGG----CCATATTGACA--AATGAT-ACA--AACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-GAC-AAACATGAGAAAGAGGCC---TTA---TT--TTC-AAAAATGTAGACAGTG---GCAACCATCTTGGAGGGATGAAC-AATGCGGATCCTTAAAAT--A----------AG-A-A--AAGACTAAGGCCTTACGT---AAGTTAAGACTAAACAG-CT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATAC---AAGTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACAAC-CGAACTGCAAGACAAATAT-AAA-AAGAGCTCCTGGACTCACGGTCGAATA--CCAATC--TATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGTGTAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCA-ATTTCAA--AA-A-----T--AT----------------G------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GAAC-ACG-T-T-----TT----------TCATGAAA-------ATTTGAACGAAGAAAAAGTTATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCTTTTCAATGTT---A--GAACTAGAGA--t
gi|12 : tactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaaccttCAATGCAGACAATACAGGCCCATTAATAGAATCT------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTTCGACCTGGTATTCAC-TTTGCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAACTAGATATAATGACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAA--CGTGCCTACCTTAAATATGATAAACTGACTATAAAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACTGATTTAAATGACA--TTGTCAAAGATA-ATAAAca
gi|13 : tagacaaaatgtcaaactcggtcattagacttgaggagcggttgaaataaagcaaaaataaatgtgaacaacttgaagcacagtccagacgagaaaatcttaaatttttttacttttaacaagatgtgcaagaaacttgggaagaaaaccaaagttagacactttattaaacacaatttagaattagatgaaagtgaaataaaaatagatcgcacccatcatatatgtatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttctttctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcacagagcaaaacagaaatactttaacgaaaacaaacATATACGTAT-CTGAGGATTTTCCAAGTAGAGTGATTAAAGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCATATCTTAATAGAGAAATTGCA---AAAG----GAAATCGTGCCTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTAAATGGTGA-CCC--T-TTT--GTATATGATTATGATCAGAATGACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAGCCC-TAGCACAC--ATAGT----CAGCCT-TCA-----------TCATT---TAATAT--AAA-TGTGAT-TTCAT---GGAACA
gi|13 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaTAT---A----AAT-GTGATTTC---------ATGGAACAATT--ATTTTAGCTGGTGACTTT-------GATGTGGCGAGTTT-CAAGATGTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATTTTG----TATTTAAAGACGATGAT---------GTTTTATATGAAAATGTTGATTTTTCAATG-ATT-AGGTATTCCAAACACAAAATATCTAACTCGTTTGGTAACTCA-TTAATAAAATGTATAAGTTTTATGGGATACACATACTCAATGGTAGATTACATTACGACAAattattttagctggtgactttgatgtggcgagtttcaagatgtttaagaagaagacaatgttgattttgtatttaaagacgatgatgttttatatgaaaatgttgatttttcaatgattaggtattccaaacacaaaatatctaactcgtttggtaactcattaataaaatgtataagttttatgggatacacatactcaatggtagattacattacgacaagatgcattttaa
gi|14 : gacttgaaccaagagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattatacctgtagaaagtacagttggaaaggaaatatacgtatctgaggattttccaagtagagtgattaaagccaagaatgacttgaggccatatcttaatagagaaattgcaaaaggaaatcgtgcctttctgagatttgataagttagtggtaaatggtgacccttttgtatatgattatgatcagaatgacattgtgaaagtaaataaataggaaggtggtcaaagccctagcacacatagtcagccttcatcatttaaAAATCAAATCAAATCA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAT-CTAGCCATGTTGGTGGGATAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTACGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTTAGAAA-T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAATAGAAACAACTTGAGCCGCAGAACAAAAAT-AAACAGGAACTTATAAAATGAAGG--AAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACAGATTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-AAATGTT--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTA-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TTAACAGCTTGACATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTGGT-GGCTTA--GTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTTTTTTgatgcattttaa
gi|15 : acTGCTGAT-TC-CATGAAAATCAAATTAAATAA---TTGCTTA-ACAAATA-AAATATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-GAGGCGAACCGTTAAAATTTA----------AT-T-G--AA-AC-CGAGCCTTAAGA---CATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ATTCCAAA--TTTAGAAT-TGATACA--AAGCCAGTAGAA-ACAAATT-------------CAAACGGAAACAACTTATGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATC----------AA---TGTCGAAAGAATCAAATTT--AATCAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGTGTGGTATAACCAACTTGAA--AA-ATTGT-T--ATCTGAGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACATGAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------GGAAAAAAGT--ACAGGTCCTAGT-GGCTTA--TTATCGGAGATAATAAAATATACA-------TTCATAGATATAGCACCCATTCTTCT
gi|16 : A----------AT-A-ATGAA-AT-AG---TTTAAAACTTAAGTTTAGACTAAACAG-TT-C--ACGCGAAAATTTACGAA--T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACCGAA----------CTGCAAGACAAATAT-AAAAAAAAGCTTCTGGACTCACAGTCCAATA--CCAAT--TTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAGGCCAAAATAGT-ATTAC------TACGCATGGTATACCC-ATTTAAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------AGCA----GA---ACG-C-A-----TTTCTCATGAAAATTTAAACGAGGAAAA--TGT-------------TATTATAGATAAAAGT-TTTAAATGACCCCTTTTCAATGTTTAATAAGAACTAGAGA--CAACGATG-T--CCGGTTTAAAACTT------GG---TAAGTCAACTGGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATT
gi|17 : gataatgaaagagttaaaaaacaccccttcatacTA----------AC-A-A--TG-ACTAAGGCCTCACGT---AAG---AGACTAAACAG-TT-C--ATGCAAAAA-TTAATAAA-T-ATACA--A-GTCATTAAAAGATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAACAAACCAAACAGCAAGACAAATAT-AAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAAT--TTATTTTGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATACGAGCCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTATACCC-ATTTCAA--AA-A-----T----------------C--TG------------T----TACAAT----T------GAGTGA-A------G-CA----GA---ACG-T-G-----TTTCTCATGAAAATTTGAACGAAGAAAA--TGT-------------TATTATAGATAA-ACGTTTT-AATGACCCCGTTTCAATGTT---A--GAGCTATAGACGAAA--ATT-TCA--AGTTTGAAACTT------GG-TAAGCCA--ACTGGTCCCAGTGGAATT---TTACCAGAGATGTTAAAGTATTCT-------CTAAAAGACATATCACa
gi|2 : aTACGTTT-CTTAGGATTTTCCAAGTAGAGTTGCCAAGGCCAAGAAT---GACTTGAGGCCAGTTTTTAATAGAAAAATT--G---CAAAAC--GAAATCGTGCTTTTCTGAGATTTGATAAGTTAGTGGTA---AATGGTAACCCT-TTT--TTATATGATTATGATCAGAATAACA--TTGTGAAAGTAA-ATAAATAGGAAGGTGGTCAAAG-CCCTAGCAAAG--ATAGT----CAG---C------------ATTCATCATTTTATAT--AAAT-GTGGT-T---TCATGGAACACACAAGGTTTGTTAAAACATGAA-ACAA-ATTGGAACTGCTTAGTTACTTT--AAGAAATTTGAAATTTGTGGGTTAAATGAATC-TGAA--------------GACGAATTTGA-----------TTGTTTAC-T-T-GCTATAA-TT-TTATCAGAAA--AAAGAG----AT-ATAATAAGGGCCGCCACTCTG---GTGGGGTA---ACTGT-ATTTGTTA-AATCCCACCTCATCGAGA-AG-GGTATAATCACAAGA---GTATTTGATCAATTAAATAAAC--TT-CGTATTTTTACG---------AATTGCAA----ATGACATTTTT-AATATA-------AA--AA--ATAACATTATA--TT--A--TGTTTT--CTATATATTTCACAAGAAGTGTCACCTATTTAAAAC---G-AAATA-AAT-GGATTTAATGGTG-TG-AAT-GTATTTGAAAAAAAATTGAGAAAACTTATCTCA----AGTAGT-CTCTGAATACACTGATG--ACGATATCATTTTAGCTAGTGACTTTAATGCCAGATGTGGCAAGTTT-CAAGATTTTTAAGAAGAAGACAATGTTGATATTG----CATTTAAAGTCGATGAT---------GTTTTATATGAAAACGATGATTTTTCAATACCT--AGGTATTCCAAAGACAAAATATCT----CGTTTGGTAACTCATTAATAGAAATGTGTAAGTCTTTTGGAATACACATACTTAATGGTAGATTGCATAACGACAAAT--A-A-GGTAACTTCACTT-CATCAGCAAATGACGGGTGTAGCTTAGTTGATTATGCTATAGCATCGT--CTA--ACCT-TTTCCCTTACA----TTTCTAA----TTTTGTTGTTAACGAT-AGAACAGAATCAGCCCACTTTC--C--ATT--------------------ATAATACGCAAACGTTATG----GATGTTAATGAAAACG--AAAGCTTAAATGA---CAACCAAAT-ACCTGTAAATG--ATCTA--A--GATGCATTTTAACCTTTT-TAAATGGGAC-GAAGAAAAACTAAA--AATATTTAAAACCATTTAAAA---GCTTTGGTTACGA-AT-G-TAAAAGATGATATT-T--CTGAG-G-CCATA----TTGACA-AACGATACAAACGAAGCTGTAGATTTAATAGT-TGA-TA-T-GTATCAGAAAGCTGC-AACAAA-CATGAGAAAGAGGCC---------TTATTTT-CCACATA-GTA-ATTAGTGGCAACCATCTTGGTGGGATGAAC-AATGCGAATCCTTAAAA-----------------A-A--AG-ACTAAGGCCTTACGT---AAGTTTAGACTAAACAGCT--C--ACGCGAAACTTTAC-AAA-T-ATAC---AAGTCATTAAAATATAAGTACAAGCA-GGTTTGCAAACTTAAAGAAACCGAACTGCAAGACAAATATAAAAAAAGAGCTTCTGGACTCACGGTCCAATA--CCAATTT---TTTGGGAAAACTGTGAAGAAATTAAGATTT--AAGAAAATGCGAAGCCAAAATAGT-ATT--ACTAGGTACGCATGGTAGACCC-ATTTCAA--AA-A-----C----------------C--TG------------T----TACAATCGAGT------G------A------G-CA----GA---ACG-CAA-----TTCTCATGAAA-ATTTGAACGAGGAAAA--TGT-------------TATTATAGATAAAAGT-TTT-AATGGCTCCCTTTCAATGTT---A--GAACT--AG-----------------AGTTTGAAACTT------GG---TCAGTCAACTAGTCCTAGTGGAATT---TTACCAGAGATGATAAAATATTCT-------CTAAAAGACATATCA-CCATTATTtat
gi|21 : ctccaagaccagtcactgttaaattctctttcttaaaagacaaggacaacatcataaaagaatacagatcaaaacgcaaagatttaaaccaacagctacgcaaaagaaccgaagaccagaacaacgctaggacagacgaggaaagagacaacattagacctgttgaatatacactttgaaaagaaaaaTACATAAT---CCAAACG-AA--GAATTTAATGGTG-CT-ACTTGT-TTCAAATAATAACAATAAGGAGTTTT---A-----GT-GC-ATTTT----TA--GGTA--ATGATTTGATTATGACAGGTGATTTAAATTCAAGATG---------------------TTGAAGATGATAATGTTGATTTCATATTTATTTCAAGATGAAAAT---------ATATTATGTa
gi|22 : ttCTTAACTAAATATGGAC--AAA-CACTACTGAGGAAATAAATGAGCGTT-CGTTGGTTA-------TATCAA------ATTAGAAA--TTTGATCTCTGTCATA-TA-----------TCGG----TGGTGTT---ACAAAATTTTATTACAAT-ATATTTGATAGAAACAG-GGC----TCATCTAACGCGTGTCTGATAAA
gi|23 : tAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATATCC-ACTTAAA--AA-A--------AT-----CA-----CGCCA------------T----TACTAT----T------G------ACATGCAA-CA----CA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGACC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACGATTTTTTGTT--TGCT---GCCGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGta
gi|24 : TGGAATTCATATTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAG--A--TGGTAATTAGACTTGCA-CAGCAAATGATAGCCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTCGTGA
gi|26 : TTTAAGTTA------GG-AACTAGC--ACAGATCTTAGTTG-CTTA--TTATCAGAGATGATAAAATATGCA-------TTCAAAGATATAGAATATATTCTTCT
gi|27 : tTTAACTGACTTTGTAATTGCATTCT--CGG--ATTTATTTCC---ATACTAGTATGCTACGTACTTTGAGATTGATGAT-AG
gi|3 : CAATAAAGACATTACATACCCATTAATAGA---TTTAATAGATGAAGCTCACCCAACAGAGTGAACTCTACGAACTGGCATTCACATTTGCAGAAGACTTCCCCTGTCGTTTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAATACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAATTATGATAAACTAATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATTTGACACGAATTTAAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGACGTTGGCCAAGG-TC-TA-TATAC--ATAATGT-GCAGGTTCTTGGAA----AGATTTATC---TAATATCCAAATTATTAT-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTTAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTAATGAA-CATGGAC--AAAGCA-TAATGACAAATTTAATGAGTTTCTTGTTGGTTAT-CATTGTTTTAACTA-T-GTTAGAAA--AAGGAC----GTCATC-TAAAGGTCGTCATTCGGCGGGTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAATCAG-GGT----TCATAGAACGCGTGTTTGATAAAATAGTTGA----TTGAGTATTTATACGTAT-----AAACTGTAGCACAATGA-ATTTTTTCA---A-------AG--AA--ATA----TA-A--TC--AAGTGTTATACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAAT---GTAAATG-AA--GAGTTGAATTGTG-TT-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATCAAAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTTC----CA--AATG--ATGATTTAATTCTGGCTAGTGATTTCAATTCAAGATGTGGGTCACTT-CAAGACATTATAGAAGATGATGATGTTTATTTCA----TCTTTCAAGATGAAAAT---------GTTTTATATGAAAATGATAGTTTTT-ATTGTAAA-AGAAACTTTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGACATTCACTTATTGAATTATGTAAATCATATGTACTTCAGTTTCTGAACGGTCGATTGCACAATGATAAAGTTATATTATAATTATATTTGCA-CAGCAAATGATGGCCTTAGCTTAGTTGACTATTTAATTGCATCCT--TAG--ATTTATTTCC---ACA----TATCTCATG--CTTTGAGATTGGTGAA-AGGACGGACTCCGATCA-TTTCC-C--ATT---------GCATTT---TTCTTTTAC-TAAATCATATGC--TTATGCTGAC-ATTACGGAATA-T------GA---TAAC--AAT-AC--CTTAACGAGACTTG--A--GAGG------------TT-TAAATGGGAA-ACTGTAAAACAGGACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTTCTTTTGTT--GA-A--A-TAAAAGATACTATT-T--TAAAA-A-CCACAC---CT--CATAAC-ATA-GAAC-AAGCTGTCCATCACATTGT-T-A-CA-TTATATCATAATGCTGCTGAT-TC-CATGAAAATCAAATCAAATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAC-GCAGCCATGTTGGTGGGACAATG-AATGCGAACAGTTTAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTAGGTTAAATGG-TGAT--ACTCCAAA--TTATGAAA-T-ATTCA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAAACGGAAACAACTTGAGATGCAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGG--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATAGTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-A-----T--A-----------------A------------T----TAC-AT----T------G------A------A-CA----AA---ATC-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTGAGA--AAA--GTG-TAAGTAGCTTGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTTCTAGT-TACTTA--TTATTGGAGATGATAATATATATA-------TTCATAGATAAAGCACCCATTCTTCTc
gi|4 : GCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCTTACTTTAAATATGATTAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--TGATTTGACACTGATTTGAATGACA--TTGTCAAAGTTA-ATAAA-------------AAGG-TA-TA-TATAC--A--------CAGGCTCTTGCAA----AGATTTATC---TAACATCCAAATTATTTC-T---T---GGAACGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTA--ACTTTAT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCAATTAATGAAACATGGAC--AAAGTA-TAATGACGAATTTAATGAGTTTTTCGTTAGTTAT-CATTGTTTTAACTC-T-GTAAGAAA--AAATAC----ATCATC-CAAAGGTCGTCATTCAG---GTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTG-AATCAAATTTAATTGAAACAG-GTT----TCATAGAACGCATGTTTGATAAAATGGTTGA----TTATGTATTTATACGTAC-----AAACTGTGACTCAATGA-A-TTTT-CA---A-------AA--AA--ATA----TA-A--TC--ATATATTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAAT---GTAAATG-AA--GAGTTGAATGGTG-TA-AATTGT-TTTGAAGAAAAACTATTAGAAGTTAT---A----AGT-GT-ATTGA----CA--GATG--ATGATTTAATTCTTGCTGGTGATTTCAATTCAAGATGTGGGTCACTT-CAAGACAATATGGAAAATGACGATGTTGATTTCA----TATTTCAAGACGAAAAT---------GTATTATATGAAAATGAAAGTTTTT---TTTA-A-AGAAACTCTAAAGATAGTATATGTAATACATTTGGCTATTCAATTATTGAACAATGTAAATCATATGGAATTCATTTTCTGTACGGTCAATTGCATAATGATAAAG----ATGGTAATTATACTTGCA-CAGCAAATGATGACCTTAGCTTAGTTGACTATGTAATTGCATCCT--CAG--ATTTATTTCC---ACA----TGTCTCATG--CTTTGAGATCGGTGAT-AAAACGGACT-CG------TTTATT--ATT---------GCATTTTTCATCTTATAC-TGAATCATATGC--TGATGTTGACAGT-ACG--GGAGCT-----GAATTTACC--AAT-AC--CTAACCGATATTTGATA--GG--------------TT-TAAATGGGAT-AATGGAAAACGGGACGAAT-TTGTTTACAGGCTACGAT-TTCTTTTGTT--GA-A--C-TAAAAGATACAATT-T--TAGAA-A-CCATAC---CA--CATAAC-GTA-GAAA-AGGCTGTCAATCACTTTGT-T-ACCA-T-ATATCATAATGCTGCTGAT-TC-CATGAAAATCGAATCAAATAA---TTGCTTA-ACGAATA-AAAGATTAAT-CCAGTCATGATGATGGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTTA----------ATAA-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AA-TTTAGGTTAGAAGG-TGAT--ACTCAAAAG-TTA-GAAA-T-ATACA--AAACCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-ATCTTGCAAAAAGAAACAACTTGAATTGCAGAACAAAAAT-AAACAAGCACTTATAAACTCACGG--GAAAA--CACATCTTTATTTTGGAAAACTGTCAAAAGAATCAGATTG--AAACAGACACTTTCCGATAGTAAC-ATTTCATCA--TAAGCGTGGTATAACC-ACTTTAA--AA-ACTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACTAT----T------GACATGCA------A-CA----CA---ATA-T-A-----TT----------AACTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA--TT-AACGATCCCTTTTC--TGCT---GCCGAACTTAAG---AAA--GTG-TTAGCAGCATGAAATTA------GG-AAAAAGT--ACAGGTCCAAGC-AGCTTA--TTATCGGAGATGATAAAATATACA-------TTCATAGATAAAGCATCCATTCTTCT
gi|5 : CAATGCAGACAATACAGAACCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAAAAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTACGTT-GCAGAAGACTTCCCCGGTCGTGTTGGGAAAGCTAGATAT---GACCTCAAACCATTTCTCCATCAAGCAAT---A---AAAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGACACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGTTA-ATAAATAGGTCGTAGGCCTATG-TC-TA-TATAC--ACAATGT-GCAGGTTCTTGGAA----AGACTTATC---TAATATCCAAATTA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATAAATGTAAATGTA--ACTTTTT-GTTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTACt
gi|6 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcgttacagaaaatgacgcctttaagacagttttctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtcctgtttggggtcgtttcaatgatgatagattgatggaacaaccggtgaaacctcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagagctgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacataaatttatgtttgtatccgaaaatataagaaatataaaaaattcgtctattttacttatttgtcatttcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttaaaacagtcacttaacatgcaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaagtgttgttgaatgtaagatcactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaacatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatgtttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagaacttgaagcaagttgtgcaagacttgcgaaaaatcggagaccaaagttagaaattttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaatagaacgcacccatcgtaaatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacaatacagagcaaaacggaaatgcttcaacgaacatatacgaaaacaaacGAGTTTCGCAAGCTAGGTAT---GATCTTCGGCCATTCCTTAAAAGAGAAAT---AGAGAAAAACAATAAA----GCCTATTTGAAACATGATAAACT---TGTCGTTAATGG-AGA--TATATC-GTTTTTGATGCTGAT---AATAAAAACTTGAAACAATTATATAGATAGGACAGAGGTCAAGG-TCATA--ATGCGGAAAATAT-A-AGGC-----GAACATTAGATTT------TAACAT-------GTTATGC---C---GGAATATACAAGGCTTATCGAAATACACATGTAACATTG--ATTTCTT-GTCATTTGTACGACAATTTGATATATGTGCTTTCAATGAGACTTGGTCTAAAAG---TAAAGACGAGTTTAACGACCTTTTAAGAGGTTACACAT-GTTTTAA-TAAT-GTTCGAAACAAAAGGT----GTTAC---AAAGGTCGCCACTCAG---GTGGTGTATGTGCA----TTTGTTA-GAACATCTTTGATAGAGAATG-GCT----TAGTGAAGAGGATATTTAGCCATTTAGATAA----TTGTGTATTCTTA----------AGAC--TAA-ATAATGA-TTTTAT-TA---ATGT----AACTAATGGTA----TT-ATTTT--A--TGTTTTGTTTACATATCTC-CGGAAGGG-TCGACTTTGTATGAT---ACGAATA-AAACAAG--AAATGGTATTG-AACTA--TTTGAAGAAAATCTATTAGAGGTTGT---ATCAGAGT-GT-ACT----------GATG--ATGAACTTATTTTGGCGGGTGACTTTAATGCCAGATGT-GGTAATTTGCAAGATATTATTGATGATGATAATGTTGATTTTA----TTTTTGATCATGAGGAT---------ACATTGTATGACAATGAT-ACTTTT-AATGTATA-TCGAACTCCAAAGATACTCTATGTAACACATTCGGGTTTACGCTTATTGAACTATGCAAAATGTATGGTATTCACTTTTTGAATGGCAGATTGTTTAACGATAAAG--A-A-GGAAATTTCACATCAA-CAGCAAACGGTGGTTCAAGTTTAATTGATTATGTAATTGC-TTCT---AGCAATCTGTTTCC---ACA----TACAACACA--TTTTGAGATAGGAGAT-CGACATGAGTCTGATCACTTTCCTCTTATTTGTAGACTAGCATTT---AAATCCGAC-CAAA--ATA-GCAGTGATACTGATGATAATG--ATAGC------GA---AATC--AATGAT--GTAAACGGT-TTTA--AACGC--------------TT-TAAATGGAATGAAAACAAAAGTGAA-GAGT-TTTTGAATAATATAAGATCTGC-TTTATT---A-ACTA-TAAAAGATACTATT-C--TTGAG-G-ACATCC---GT--ACTGAT-ATC-AACC-AAGCTATACATAAAATTGTAG-A-CA-T-GTTTCATAAAGCTGCAATT-AG-CATGAGAATAAAACCGA
gi|7 : ttttcaaagaCAATGCAGACAATACAGACCCATTAACAGA---T------GATGA---TCACCCAACAGAGTGTACTCTACGACCTGGCATTTActtatatacatcgtaaacctgcacaacccg
gi|8 : cacatataagttaataatataaaaccattcaaaacattcacttttcattacagaaaatgacgcctgcctttaagacagtttgctctcgcactaacatttacactgatggttacttacgttatgtccgaaaaacctgtttggggtcgtttcaatgataataaattgatggaacaaccggtgaaacttcgtaaagacgtcaacgcaaaagtagttaagagaactgtgtaagtgaaaaccatacaatcattctttttaatccaaacatcatattttactgacgcaattacaaatatttatgtttgtatccgaaaaaataagaccagttagattcaaaattcgtctattttacttatttatctattcaatatatagccctaaaatgacttcatatttttttcaaaacagtcacttaacatgtaaatgaaattaaaaacagaacaaataaagtcgacgctagtgattcttttattgtcaattccgactgaaagggaaataaatggttgatatatcatggcaattgttgttgaatgtaaggacactaaatcgaatatctgcataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggataccgatttgataccttagaacaatccctggccagccttaaaatatcaaacatcaaacttgaagaaaaacatgatcatatgcaacgatctttagacgaagcgtcaaattcggtcaagagcagttgaaattaagcgaaaataaatgtgaagtacttgaagcacaaaccagacgagaaaatcttattttttttggcttaaagcaagatgtgcaagacaaagaaaaagttttattaaacacgatttagaattagatgaaagtgaaattaaaacagaacgcacccatcgtatatacagtaaggaatcaccaaaacccatcattgtcaagttttcttcctttaaagacaaagacaaagtactacaacagcaaaacggaaaagcttaaacgaacacatacgaaaacaaacAGACAAGAAA-CGTGCCTACCTTAAGTATGATCAACTGATTATAGAGAACGA-AAC--T-TAT--GTATATGTCACTGGTTTAAATGTTA--TTGTCAAAGATA-ATAAATAGGTCGTAGGCCAATG-TC-TA-TATAC--ACAATGT-GCAGGCTCTTGGAA----AGACTTATC---TAATATCAAAATTA-TATCT---T---GGAATATACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-ATTTTGTTTAAAGCAATATGATATATGTGCACTTA
gi|8 : aaaacgA--A--GAGC------------TT-TAAATGGAAT-ACTGTTAAACTGGACGAAT-TTGTTAACAGGCTACGTTCTT-TTTTGTT--GA-A--T-TAAAAGATACAATT-T--TAGAA-A-CCATAC---CT--CATAAC-GTA-GAAA-AAACTGTCCATCACATTGT-T-A-CACT-CAATCATAAAGTTGCTGAT-TC-AATGAAAATCAAATCACATAG---TTGCTTA-ACAAATA-AAAGATTAAT-CCAACCATGTTGGTAGGACAATG-AATGCGAACAGTTAAAATTGA----------AT-A-A--AA-AC-AGAGCTTTAAGA---AATTTTA---TAA------------------------------T-ATACA--AAGCCATTAGAA-ACAAATTCAAACA-AACTTGCAGACAAAAACAACTTGAGATGGAGAACAAAAAT-AAACAAGAACTTATAAACTCAAGA--AAAAA--CAAATCTTTATTTTGG---------AAAAGAATCAGATTT--AAACAGACACATTACGATATTAAC-ATTTCATCA--TCAGCGTAGTATAACC-ACTTTAA--AACATTGT-T--ATCTGCGAATCACGC--CA------------T----TACAAT----TGACATGG------A------A-CA----AA---ATA-T-A-----TT----------ACCTGAAC-------A--TGA-------------TACAATAGATGATATA-TTT-AACAATCCCTTTTC--TGCT---GCTGAACTTAAGA--AAA--GTG-TAAGCAGCTTGAAATTA------AG-Ataaccactttaataaaagagctttaaatggaatactgttaaactggacgaatttgttaacaggctacgttcttttttgttgaattaaaagatacaattttagaaaccatacctcataacgtagaaaaaactgtccatcacattgttacactcaatcataaagttgctgattcaatgaaaatcaaatcacatagttgcttaacaaataaaagattaatccaaccatgttggtaggacaatgaatgcgaacagttaaaattgaataaaaacagagctttaagaaattttataatatacaaagccattagaaacaaattcaaacaaacttgcagacaaaaacaacttgagatggagaacaaaaataaacaagaacttataaactcaagaaaaaacaaatctttattttggaaaagaatcagatttaaacagacacattacgatattaacatttcatcatcagcgtagtataaccactttaaaacattgttatctgcgaatcacgccattacaattgacatggaacaaaatatattacctgaacatgatacaatagatgatatatttaacaatcccttttctgctgctgaacttaagaaaagtgtaagcagcttgaaattaaga
gi|9 : aaaacgagacaagaaacgtgcctaccttaagtatgatcaactgattatagagaacgaaacttatgtatatgtcactggtttaaatgttattgtcaaagataataaataggtcgtaggccaatgtctatatacacaatgtgcaggctcttggaaagacttatctaatatcaaaattatatcttggaatatacaaggtctgttaaaatatgaatgtaatgctgactttttattttgtttaaagcaatatgatatatgtgcacttataaccactttaataaAAAGATA-ATAAATAGG-------CCAAGG-TC-TA-TATAC--A--ATGT-ACAGGCTCTTACAA----AGATTTATT---TAATATCCAAATTATTTC-T---T---GGAATGTACAAGGTCTGTTAAAATATGAATGTAATGCTG--ACTTTTT-GTATTTTTTAAAGCAATATGATATATGTGCTCTTAATGAAACATGGAC--AAAGCA-TAATGATGAATTTAATGAATTTCTCGTTGGTTAT-CA-----------A-T-GTTAGAAA--AAAGAC----ATCATC-TAAAGGTCGTTTTTCGG---CTGGTGTA---ACAGT-TTTTGTTA-AATCAAATTTAATTGAAACATTGGT----TCATAGAACACGTGTTTTATAAAATGGTTGA----TTGTGTATTTATACGTAT-----CAACTGTAACGCAATGA-ATTTT--CA---A-------AA--AA--ATA----TA-A--CC--A-GTGTTTTACTTATGTATCTC-CAGAAGGT-TCCTCTATATATAAT---GTTAATG-AA--GAGCTAAATGGTG-TA-AATTGT-TTTGAGGAAAAACTATAAGAAGTTAT---T----AGT-GT-ATTTC----CA--GATG--ATGATTTAATTATTGCTGGTGATTTTTATTCAAGATGTGGGTCACTT-CAAGACACTATAGAAGATGATGATGTTGATTTCA-------TTCAAGATGTGGGTCACTTCAAGACACTATA-GAAGATGATGATGTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CACATTAAAATATTCCATTTTCATTACAGAAAATGACGTCTTCAAGATATTTTGCACTGGCTTTAACATTTACACTTATGCTTACTTACGTTGTGTCCGCTCCTACTCCTAGTGCTTTAAAATATGTTGTTAACGTGAATCATCAGACGAAACTTCTTCTTAAAGACAACAACGTTAATAGAGTTAAGAGAGCTGAGTAAGTTAACATCATACATGCATTCTTTTAAATTAAACAATTTATAATGCAGTTACATATACTAGAAGTTTGTGTCAGAAATTTTTAGATCAGTTTGTTTTGTTCTTCCTTATTACAATTATCTCTGTTCCAATTTCAAAACAGAAACACTGAACACTGAACATGCATTATGAATAATTGAAAACGATATGCTGTGAAATATAAATAGTGGTATTATTTTCTTGTCAATTCCGACTCAAACCTGGAGGGAAATATATGGT
Unaligned ( gi|19 ): CACATAAACATTGTAAATAATGATACCAAATCATTCAAAACATTCACTTTCCTTTACAGTTAATGAAGCCTTTAAGATATGTACACTGGCACTTACATTTGCACTTATGATTTCATTACTTGCGTTGTGTCACAAAAATCTGGTGGTTTCCATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTAGGTATAAGCTTCAAAGATGTTGGAATGATTAAATATCAGATGAAACTTCGTAAAGACATCAACGTGAATAGAGTTAAGAGAGCTGGGTAAGTGCAACACGTATACACGTTTTTTATTATACTGATGCAAGTAGATATACATGTGTTCATGTTTGT
Unaligned ( gi|20 ): GACAGTTCAACCGCTCTGGTGAGATGAACAGTGCGGCCTTTTTAAGAAGAAAAAAACTAAGAGCATTACGTCTTTACAGAAATAAAAGAAGAGGCGAAAATCTAAATAATTACAAATTTAAAAATGTTTGTAAAGATAAAAACTTGCTTCGCAAATGCAAAATAGACGATGTTAAATTGATTCACGAGGTGATAATAATTTATTTTTGAAAAATGTTAAATATTACGGTTTAAGTCAAAATGCA
Unaligned ( gi|25 ): AAGATAAAAAAAACTTACTTCTCTATCCAGAATACACAATGTTTGATTGATTCACGAAGTGACAATAAGTTATTTTGGAAAAAATGTTAAAAAGTATAGATATAAGTCAAAATGCAGGT