lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 666666666666 11 444444444444444 222222222 11111111 11111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 1 333333 11 1 333333333333333333 66666666 1 4 1
lowQualScore : 000000000000 6 3 3 11 333333333333333 44 444444444 6666 1 22222222 22222 2222 8 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 111 6 2 3 555555 44 4 444444444444444444 2 66666666 0 3 0 7
lowQualScore : ............ . . . .. ............... .. ......... .... . ........ ..... .... . . ................................................................................................................................................................................................................................................................ .. ... . . . ...... .. . .................. . ........ . . . .
lowQualScore : 333333333333 7 0 2 00 666666666666666 66 999999999 1111 9 88888888 00000 7777 0 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 777 7 3 2 666666 44 8 888888888888888888 0 99999999 5 0 0 0
consensus : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAANATAG--AAAAT-------TA-CA--AATTAAA--AT--TG-----TTTGTTT----GCTGT-CT----CCC-----TA---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTT----TTTTTCA-G-AT-----TTTGGAGAC-A--G-TATTTT---TTTT--T--AT---TCATCTAGGC----AATTGCATGTACATGTG--GTATGT-ACATTTATTG----TA--TT---T-TT-----ATA--------ATGATACTGT-TT--TTA-TA-TGA--TTAA---------TATT----C---TAG----------AC-CTACC---CA-ATTTTGAAAACTANG--A-TTGGAAGA-NAGCAAACA---ATA-ATTT--T---AATGTTGGCCTT--ATT--ATACATNAANGCAATTTTGT
Reference ( gi|1 ) : TATTCATTTTCAATGTTTGTCAATATCAAAATAG--AAAAT-------TATCA--GATTAAA--AT--TG-----TTTGTTT----GCTGT-TT----TCC-----TA---TCTA-C-C-A-T---C-G-AAGATGCTGCCTACC----CT----AAATT--TTT----TTTTTCA-A-AT-----TTTGAAAAC-A--G-TATTTT---TTTT--TAAAT--ATCATATAGGC----AATTACATGTACATGTGA-GTATGT-GTATTTATTG----TA--CT---T-TT-----ATA--------ATGATACTGT-TT--TTA-TA-TGA--TTAA---------TATC----C---CAG----------AC-CTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--A-CAGAAAGA-CAGCTAAC----ATA-ATTC--T---AATGCTGGCCTCAGATCAAATACATCAATAC-ATTATGTAATCTATCTAAA
gi|8 : TCATT----ATGTATAACAATATAAACATAA--AAAAT-------TA-----GGCCATA--AT---G-----TTTGTTT----ACTCT-CT----CCCC----TAAGGTCTA-C-CCA-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA----------------CA-C-ATAAAGATTTGGAGACTAC-G-CACTTT---TT------AAT--CTCATCTTGGC----AATTACAC-----------GTATGT-ATATTCA-TGACAATA--TTA--T-TT-----ATA--------ATGA
gi|7 : caaaaTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAA--AAAAT-------TA-----GGCCATA--AT---G-----TTTGTTT----ACTCT-CT----CCCC----TAAGGTCTA-C-CCA-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA----------------CA-C-ATAAAGATTTGGAGACTAC-G-CACTTT---TT------AAT--CTCATCTTGGC----AATTACAC-----------GTATGT-ATATTCA-TGACAATA--TTA--T-TT-----ATA--------ATGA
gi|3 : caaaaATTTTTAAAGAGTAACATTGCCAAAA--G--ACAAG-------TA--A--GGTCAAA--AT--TGAAATATTTGTTTTGTTGCTGT-CT----CCC-----TA---CCTA-CTC-G-T---C-A-ATAAAGCTGACCACT----C-----AAAT----------------A-ATAT-----TTTGTAAAA-A--A-TGGTTT---TGTT--T--------CATCTAGGT----AGCTTT-TGTATATG-GA--TAAG----ATTTAATG----TA--TT---T-TT-----AT----------------TGT-TT--T--------A--TT-------------TT----T---TAG----------TT-CTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--T-TTGGGAGA-CAGCAAAC----GTT-ATTT--T---AATGCTGGTCT--GATT--GTACAT
gi|6 : AATAGTGAAAATATATTTGTATCATTAATTAAA--ATGGTA-----TTTGTGT----GCTCT-TT----CCC-----TA---CCTA-C-T-A-T---A-G-AAAA--CTCCCTATT----C-----AAATT--TTT----CTTT--A-A-TT-----TTTGGAAAC----------TT---TATT--T---T--GCCACCTAGGC----AATTGTATATATGTGT-A-CTACAT----TTTGTT-----TA--AT---T-TT------TA--------ATGATACTAT-TT--TTGCTATTGA--ACAA----------------------AGGAAAAAAAACAC-CTTCC---CA-ATTTTGAAAACT
gi|16 : --AAAAT-------TA-CA---AT------AT--TG-----TTTGTTT----GTTGT-CC----GCC-----TA---CATACC-C-A-TGAAC-A-AAGA---TGCCTACT----CA----AAACC--TTT----TCTATC--A-AT-----TTT
gi|9 : ggtaACCA--AATTAAA--ATATTG-----TTTGTTT----GCTCT-AT----CCC-----TA---ACTG-C-CCA-T---T-A-AGAAAGTTGCCT--T----CTGAAAAAAAA--CTT----TGTTACA-T-AA-----CTTGGAGAC-A--G-CATTTT---TTTC-----AT--TTCATTTAGAC----AATTACATGTATTTGT---ATATG------TTAATG----T---CTGAGT-TT-----ACAT-------ACAATTCTGT-ATACCTA-AG-TGA--TCAA---------T
gi|11 : A--AATTAGA--ATAGTG-----TTTGTTT----GCCGT-CT----CCA-----TA---CCTA-T-C-A-A---T-A-AA---GCTGCCTATG----C-------ATT--TTTTTTATTTTTT-----T-----TTTGGAAAC-------ATTTA---TTTT--T--AT--TTCATCCAGAC----AACCGCATGTACATGCAT-GTATATGGCATTTATTA----TA--TG---T-TT-----TGA--------ACGATtt
gi|14 : ggtcaA--AATTAAA--ATAGTG-----TGTGTCT----GATGT-CT----CCC-----TA---CCTACC-C-A-T-----G-AATAGGCAGCCT--T----CT----CACTT--TTC----TTTTTCA-G-AT-----TTTGGAG---A--G-TATTTtataatttttg
gi|4 : tggttaA--AATTGAA--AT--GGAA---TTTGTTT----GCTATATG----TCCCTCCTTG---CCGA-C-C-GGT---C-C-AAAA-GCTGTCTATTTAATCT----GAATT--TCT----GGTTT---A-A----------GAGAC-A--G-AACTTA---TTTT--TAA-T--ATCACCGAG-----------CATG--CATGTG---TATG--GCATTTATCA----TA--TT---C-TT------TA--------ATGATATTACATT--TTA-TA-TGAAATTAT---------TTTT----T---TAACCT-------AC-CTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTA-TTGAAAGAGTAATCAATA---ATA-GTTT--C---AATGgattatt
gi|5 : ttaggccaTTAAA--ATACTG-----TTCGTTT----ACTCT-TT----TC--------------A-----A-T--------AAATACT------------T----A---T--TTC----TTTTTCA-T-AT-----TTTTGAGAC-GATG-TGTTGT---TTTT--T-------TCATCCAGGC----AAGTATATGTAATTGTGA-G------ACATTCATTA----CA--TA---T-TT-----ATATCTGAATGATGATA--G---T--TTA----------TAA---------CATC----CCTACAT----------AA-CTA-C---CA-ACATTTAAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC----AAACATTT--TTTGGATGTAGGCCT----TTAAAGGCATTAATAt
gi|13 : TAAAGGAT--TG-----TTTGTTT----GCACT-CT----AGC-----TA---CCTA-C-C-C-TACAC-ATAAAAAGCCGTCTACT----TG----CAATTCTTTT----TTTTTCA-G-AT-----TTTGGAAAC-T--G-TATTCT---TTTTCATGCAT--ATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACA---GATATATAT-ATATTTATa
gi|12 : gccaaaaaAAT--AT--TA-----TTTGTTA----GCTGT-CT----CCC-----TA---CCTA-C-C-C-T---TTA-AAAAGGCTGCCT-----------------------------TGTCA-G-AT-----TTTGAAAAG-A--G-TATTTTCTATTTT--T-------TCATCTAAGC----ATTTGCTTTT--ATGT---GTATAA-AAATTAATTG----TA--TT---T-TT------TA--------ATTATTCTAT-TT--TTT-TA-T
gi|17 : c--TG-----TTTGTTT----GCTG---------CC-----TA---CCTACC-C-A-T---A-A-AAAAAGTTGCCTACT----CA----AAATC--GTT----TTTttttgaaattt
gi|2 : G-----TTTGTTT----GATGT-CTCTTATCC-----TG---TC-A-C-C-T-G---C-C-AAAA--CTGTCT--T----CT----AAAAA--TAT---------CA-G-GT-----TTTGAAAGT----T-TATTTT---TTTC--T---TTCATCAT-T--GC----AAGTGCATG--CATGTG---TATG--ACATTTATT-----TAATTT---T-TT-----TTA--------ATGTTCTTAT-TT--TTT-TA-T-A--TTAAAAGAGAGTTTATTTTCAC---TAG----------AA-CTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--A-TTGGGAGA-TAGCAAACAAAAATG-ATTT--T---AATGTTGGTCTTA
gi|15 : ggT-CT----CCC-----TA---TATA-C-CCA-T-----A-AAAAT-CTGCCAACT----CTGAAGAAACA--TTT----TAT---ACG-AT-----TTTGAACAC-A--GCTATATT---TTT-----AGT---TTATCTAGGC----AATTACATtgtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|10 : tcAGGT----ATTTACATGTATAT-----GTATG--ACATTTATTG----TA--TT---TATTTTTGAATGTGTCGT--ATGATATT-T-AT--TTA-TA-T----TTAA----------ACC----C---CCG----------CCTCTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--A-TCGGAATA-GAGCAAAC----AT---TTCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATC-TATACATAAAGGCAATTTTGT
Alignments
lowQualScore : 2222 333 222 111111111111111 4444444444444444444444444444444444444 222222 222 11 1111 2222222222222 999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 2222222 111 11 2222 1
lowQualScore : 8888 1 0 000 1 666 444 33 1 777777 999999 444 888 444444444444444 0 3 9999999999999999999999999999999999999 2 999999 3 888888 77777 6666 1 1 9999 555 33 1 1 5555 666 55 7 7777 5555555555555 55 4 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333 444444 0 1 99 6 77 2222222 6 111 11 4444 1 1 5 4
lowQualScore : .... . . ... . ... ... .. . ...... ...... ... ... ............... . . ..................................... . ...... . ...... ..... .... . . .... ... .. . . .... ... .. . .... ............. .. . . ................................................... ...... . . .. . .. ....... . ... .. .... . . . .
lowQualScore : 3333 0 7 000 3 666 666 77 1 222222 111111 444 888 555555555555555 8 2 6666666666666666666666666666666666666 2 111111 1 111111 11111 1111 8 6 1111 000 00 0 3 5555 444 00 3 7777 5555555555555 66 2 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555 000000 1 0 22 7 77 2222222 7 777 00 3333 0 0 5 0
consensus : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAA--ATA--TG--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCA-NAT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T----TT--ATA--------ATGATACTGT-TTTTN-TA-TGA--TTAA---------TATC----C-TAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNAT-TTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Reference ( family-434 ) : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAANATAGAAAATTA---CAAATTAAA--AT---TG--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCA-GAT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T----TT--ATA--------ATGATACTGT-TTTTA-TA-TGA--TTAA---------TATT----C-TAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTANG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATAAT-TTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTTTGT
gi|1 : TCATTTTCAATGTTTGTCAATATCAAAATAGAAAATTAT--CAGATTAAA--AT---TG--TTTGTTTGCTGT------TT-T----CCT---A---TCTA-C-C-A-T---C-G-AAGATGCTGCCTACC----CT----AAATT--TTTTTT-TTCA-AAT-----TTTGAAAACAG-T--ATTTTTT-TTTAAA-TATCATATA-----GGC----AATTACATGTACATGTGAGTATGT-GTATTTATTG----T---A--CT-T----TT--ATA--------ATGATACTGT-TTTTA-TA-TGA--TTAA---------TATC----C-CAG----------AC--CTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--ACAGA-AAGA-CAGCTAAC----ATAAT-TCT---AATGCTGGCCTCAGAT-CAAATACATCAATAC-ATTATGT
gi|10 : tatTCCA-----GGT----ATTTACATGTATATGT----ATG--ACATTTATTG----T---A--TT-TATTTTTGAATGTGTCGT--ATGATATT-T-ATTTA-TA-T----TTAA----------ACC----C-CCG----------CCT-CTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--ATCGG-AATA-GAGCAAAC---ATT--TCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATCT--ATACATAAAGGCAATTTTGTaatctatctaaa
gi|11 : AAATTAGA--ATAG-TG--TTTGTTTGCCGT------CT-C----CAT---A---CCT------A-T---C-A-ATAAAGCTGCCTATG----C-------ATT--TTTTTTATTTT-TTT-----TTTGGAAAC------ATTTATT-TTT--ATT-TCATCCA-----GAC----AACCGCATGTACATGCATGTATATGGCATTTATTA----T---A--TG-T----TT--TGA--------ACGATtgataaca
gi|12 : ggtcaAAT--AT---TA--TTTGTTAGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-C-T---TTA-AAAAGGCTGCCT-------------------------T-GTCA-GAT-----TTTGAAAAGAG-T--ATTTTCTATTT--T-T-TCATCTA-----AGC----ATTTGCTTTT--ATGT--GTATAA-AAATTAATTG----T---A--TT-T----TT---TA--------ATTATTCTAT-TTTTT-TA-Ttataatttttg
gi|13 : cAAAATAAAGGAT---TG--TTTGTTTGCACT------CT-A----GCT---A---CCTA-C-C-C-TACAC-ATAAAAAGCCGTCTACT----TG----CAATTCTTTTTTT-TTCA-GAT-----TTTGGAAACTG-T--ATTCTTT-TTC--A-T-GCATATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACAGAT--ATATAT-ATATTTATttttgaaattt
gi|14 : gccaTTA----AAATTAAA--ATAG-TG--TGTGTCTGATGT------CT-C----CCT---A---CCTACC-C-A-T-----G-AATAGGCAGCCT--T----CT----CACTT--TTCTTT-TTCA-GAT-----TTTGGAG--AG-T--ATTT
gi|15 : tggT------CT-C----CCT---A---TATA-C-C-------C-ATAAAAATCTGCCAACT----CTGAAGAAACA--TTTTAT----ACGAT-----TTTGAACACAGCT--ATATTTT-T----AGT-TTATCTA-----GGC----AATTACATgattatt
gi|16 : tcAAAATTA---CAA--TA-----T---TG--TTTGTTTGTTGT------CC-G----CCT---A---CATACC-C-A-T---G-A-ACAAAGATGCCTACT----CA----AAACC--TTTTCT-ATCA--AT-----TTT
gi|17 : ggta---TG--TTTGTTTGCTGC------CT-A----CCT---A---CC-----C-A-T---A-A-AAAAAGTTGCCTACT----CA----AAATC--GTTTTT-
gi|2 : G--TTTGTTTGATGT------CT-CTTATCCTGTCA---CCTG-C-C-A------------AAACTGTCT--T----CT----AAAAA--TAT------CA-GGT-----TTTGAA---AG-TTTATTTTTT-TCT----T-TCATCAT-----TGC----AAGTGCATG--CATGTG--TATG--ACATTTATT-----T---AATTT-T----TT--TTA--------ATGTTCTTAT-TTTTT-TA-T-A--TTAAAAGAGAGTTTATTTTCAC-TAG----------AA--CTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--ATTGG-GAGA-TAGCAAACAAAAATGAT-TTT---AATGTTGGTCTT--AT-
gi|3 : ggAAATTGAA--ATATTTG--TTTTGTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-CTC-G-T---C-A-ATAAAGCTGACCACT----C-----AAAT------------AA-TAT-----TTTGTAAAAAA-T--GGTTTTG-TTT-------CATCTA-----GGT----AGCTTT-TGTATATG-G-ATA----AGATTTAATG----T---A--TT-T----TT--AT----------------TGT-TTT--------A--TT-------------TT----T-TAG----------TT--CTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--TTTGG-GAGA-CAGCAAAC----GTTAT-TTT---AATGCTGGTCTG--AT-T--GTACATgtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|4 : atttttaaagagtaacattgccaaaagacaagtaaggtcaAAATTGAA--AT---GGAATTTGTTTGCTATATGTCCCT-C----CTT---G---CCGA-C-C-GGT---C-C-AAAA-GCTGTCTATTTAATCT----GAATT--TCT---------GGT-----TTAAGAGACAG-A--ACTTATT-TTT--AATATCACCGA-----G-----------CATG--CATGTG--TATG--GCATTTATCA----T---A--TT-C----TT---TA--------ATGATATTACATTTTA-TA-TGAAATTAT---------TTTT----T-TAACCT-------AC--CTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTATTGA-AAGAGTAATCAAT---AATAGT-TTC---AATGT
gi|5 : ttaggccaTTAAA--ATAC-TG--TTCGTTTACTCT------TT---------------------------T---C-A-ATAAA------TACT-----T----A---T--TTCTTT-TTCA-TAT-----TTTTGAGACGA-T--GTGTTGT-TTT--T-T-TCATCCA-----GGC----AAGTATATGTAATTGTG-A---G--ACATTCATTA----C---A--TA-T----TT--ATATCTGAATGATGATA--GT-TT---------A--T-AA---------CATC----CCTAC----------ATAACTACC---AACATTT--AAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC---AAACAT-TTTTTGGATGTAGGCCTT--
gi|6 : AATTAAA--ATGG-TA--TTTGTGTGCTCT------TT-C----CCT---A---CCTA-C-T-A-T-------AGAAAACTCCCTATT----C-----AAATT--TTTCTT-T--A-ATT-----TTTGGAAAC--------TTTAT-TTT--G---CCACCTA-----GGC----AATTG--TATATATGT--GTAC-T-ACATT--TTG----TTTAA--TT-T----T----TA--------ATGATACTAT-TTTTGCTATTGA--ACAA--------------------AGGAAAAAAAACAC--CTTCC---CA-ATTTTGAAAACTtaaaggcattaataa
gi|7 : aatagtgaaaatatatttgtatcattTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TAA--------TG--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CA-CATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT----TT--ATA--------ATGA
gi|8 : caaaaTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TAA--------TG--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CA-CATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT----TT--ATA--------ATGA
gi|9 : caaaa---CAAATTAAA--ATAT-TG--TTTGTTTGCTCT------AT-C----CCT---A---ACTG-C-CCA-T---T-A-AGAAAGTTGCCT--T----CTGAAAAAAAA--CTTTGT-TACA-TAA-----CTTGGAGACAG-C--ATTTTTT-TCA--T-T-TCATTTA-----GAC----AATTACATGTATTTGT--ATATGT-
Alignments
lowQualScore : 2222 3333 2222 11111111111 4444444444444444444444444444444444444 222222 222 11 1111 111111111111 111111 8888888888888888888888888888888888888888888888 111111 2222 111 11 2222 1
lowQualScore : 8888 2222 1 2 0000 33 1 777777 999999 444 888 7 2 55555555555 0 3 7777777777777777777777777777777777777 2 999999 3 888888 77777 6666 1 1 9999 555 33 1 1 5555 666 55 7 55 444444444444 000000 88 5 999 7777777777777777777777777777777777777777777777 444444 0 1 99 6 77 7777 1 111 11 4444 1 1 5 1
lowQualScore : .... .... . . .... .. . ...... ...... ... ... . . ........... . . ..................................... . ...... . ...... ..... .... . . .... ... .. . . .... ... .. . .. ............ ...... .. . ... .............................................. ...... . . .. . .. .... . ... .. .... . . . .
lowQualScore : 3333 5555 3 4 3333 77 1 222222 111111 444 888 5 5 77777777777 8 2 8888888888888888888888888888888888888 2 111111 1 111111 11111 1111 8 6 1111 000 00 0 3 5555 444 00 3 00 666666666666 555555 66 0 666 0000000000000000000000000000000000000000000000 000000 1 0 22 7 77 2222 0 777 00 3333 0 0 5 0
consensus : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-A--------ATG------ATACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Reference ( family-434 ) : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-A--------ATG------ATACTGT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
gi|1 : TCATTTTCAATGTTTGTCAATATCAAAATAGAAAATTAT--CAGATTAAAAT--T--G--TTTGTTTGCTGT------TT-T----CCT---A---TCTA-C-C-A-T---C-G-AAGATGCTGCCTACC----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAA-AT-----TTTGAAAACAG-T--ATTTTTT-TTTAAA-TATCATATA-----GGC----AATTACATGTACATGTGAGTATGT-GTATTTATTG----T---A--CT-T--TTAT-A--------ATG------ATACTGT-TTTT-ATA-TGA--TTAA---------TAT-C----CCAG----------AC--CTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--ACAGA-AAGA-CAGCTAAC----ATAATTCT---AATGCTGGCCTCAGAT-CAAATACATCAATAC-ATTATGT
gi|10 : tatTCCA-----GGT----ATTTACATGTATATGT----ATG--ACATTTATTG----T---A--TT-TATTTTTGA--------ATGTGTCGTATGATAT-TTAT-TTA-TAT--TTAA----------AC-C----CCCG----------CCT-CTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--ATCGG-AATA-GAGCAAAC----ATTTCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATCT--ATACATAAAGGCAATTTTGTaatctatctaaa
gi|11 : AAATTAGAATAGT--G--TTTGTTTGCCGT------CT-C----CAT---A---CCT------A-T---C-A-ATAAAGCTGCCTATG----C-------ATT--TTTTTTATTTTT-TT-----TTTGGAAAC------ATTTATT-TTT--ATT-TCATCCA-----GAC----AACCGCATGTACATGCATGTATATGGCATTTATTA----T---A--TG-T--TTTG-A--------ACG------ATtgataaca
gi|12 : ggtcaAATA-TT-A--TTTGTTAGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-C-T---TTA-AAAAGGCTGCCT-------------------------T-GTCAG-AT-----TTTGAAAAGAG-T--ATTTTCTATTT--T-T-TCATCTA-----AGC----ATTTGCTTTT--ATGT--GTATAA-AAATTAATTG----T---A--TT-T--TT-T-A--------ATT------ATTCTAT-TTTT-TTA-Ttataatttttg
gi|13 : cAAAATAAAGGA-TT-G--TTTGTTTGCACT------CT-A----GCT---A---CCTA-C-C-C-TACAC-ATAAAAAGCCGTCTACT----TG----CAATTCTTTTTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAAACTG-T--ATTCTTT-TTC--A-T-GCATATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACAGAT--ATATAT-ATATTTATttttgaaattt
gi|14 : gccaTTA----AAATTAAAATAGT--G--TGTGTCTGATGT------CT-C----CCT---A---CCTACC-C-A-T-----G-AATAGGCAGCCT--T----CT----CACTT--TTCTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAG--AG-T--ATTT
gi|15 : tggT------CT-C----CCT---A---TATA-C-C-------C-ATAAAAATCTGCCAACT----CTGAAGAAACA--TTTTAT----ACGAT-----TTTGAACACAGCT--ATATTTT-T----AGT-TTATCTA-----GGC----AATTACATgattatt
gi|16 : tcTA---AAAATTACAATA-TT-G--TTTGTTTGTTGT------CC-G----CCT---A---CATA-C-CCA-T---G-A-ACAAAGATGCCTACT----CA----AAACC--TTTTCT-ATCA--AT-----TTT
gi|17 : gg-T--G--TTTGTTTGCTGC------CT-A----CCT---A---CC-----C-A-T---A-A-AAAAAGTTGCCTACT----CA----AAATC--GTTTTT-
gi|2 : --G--TTTGTTTGATGT------CT-CTTATCCTGTCA---CCTG-C-C-A------------AAACTGTCT--T----CT----AAAAA--TAT------CAG-GT-----TTTGAA---AG-TTTATTTTTT-TCT----T-TCATCAT-----TGC----AAGTGCATG--CATGTG--TATG--ACATTTATT-----T---AATTT-T--TTTT-A--------ATG------TTCTTAT-TTTT-TTA-T-A--TTAAAAGAGAGTTTAT-TTTCACTAG----------AA--CTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--ATTGG-GAGA-TAGCAAACAAAAATGATTTT---AATGTTGGTCTT--AT-
gi|3 : ggAAATTGAAATA-TTTG--TTTTGTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-CTC-G-T---C-A-ATAAAGCTGACCACT----C-----AAAT------------AAT-AT-----TTTGTAAAAAA-T--GGTTTTG-TTT-------CATCTA-----GGT----AGCTTT-TGTATATG-G-ATA----AGATTTAATG----T---A--TT-T--TTAT-----------------------TGT-TTT--------A--TT-------------T-T----TTAG----------TT--CTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--TTTGG-GAGA-CAGCAAAC----GTTATTTT---AATGCTGGTCTG--AT-T--GTACATgtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|4 : atttttaaagagtaacattgccaaaagacaagtaaggtcaAAATTGAAATG----GAATTTGTTTGCTATATGTCCCT-C----CTT---G---CCGA-C-C-GGT---C-C-AAAA-GCTGTCTATTTAATCT----GAATT--TCT--------G-GT-----TTAAGAGACAG-A--ACTTATT-TTT--AATATCACCGA-----G-----------CATG--CATGTG--TATG--GCATTTATCA----T---A--TT-C--TT-T-A--------ATG------ATATTACATTTT-ATA-TGAAATTAT---------TTT-T----TTAACCT-------AC--CTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTATTGA-AAGAGTAATCAAT---AATAGTTTC---AATGT
gi|5 : ttaggccaTTAAAATACT--G--TTCGTTTACTCT------TT---------------------------T---C-A-ATAAA------TACT-----T----A---T--TTCTTT-TTCAT-AT-----TTTTGAGACGA-T--GTGTTGT-TTT--T-T-TCATCCA-----GGC----AAGTATATGTAATTGTG-A---G--ACATTCATTA----C---A--TA-T--TTAT-ATCTGAATGATG------ATA--GT-T-----TA-------TAA---------CATCC----CTAC----------ATAACTACC---AACATTT--AAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC---AAACATTTTTTGGATGTAGGCCTT--
gi|6 : AATTAAAATGGT--A--TTTGTGTGCTCT------TT-C----CCT---A---CCTA-C-T-A-T-------AGAAAACTCCCTATT----C-----AAATT--TTTCTT-T--AA-TT-----TTTGGAAAC--------TTTAT-TTT--G---CCACCTA-----GGC----AATTG--TATATATGT--GTAC-T-ACATT--TTG----TTTAA--TT-T--T--T-A--------ATG------ATACTAT-TTTTGCTATTGA--ACAA--------------------AGGAAAAAAAACAC--CTTCC---CA-ATTTTGAAAACTtaaaggcattaataa
gi|7 : aatagtgaaaatatatttgtatcattTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-A--------ATG------A
gi|8 : caaaaTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-A--------ATG------A
gi|9 : caaaa---CAAATTAAAATA-TT-G--TTTGTTTGCTCT------AT-C----CCT---A---ACTG-C-CCA-T---T-A-AGAAAGTTGCCT--T----CTGAAAAAAAA--CTTTGT-TACAT-AA-----CTTGGAGACAG-C--ATTTTTT-TCA--T-T-TCATTTA-----GAC----AATTACATGTATTTGT--ATATGT-
Alignments
lowQualScore : 2222 3333 2222 11111111111 4444444444444444444444444444444444444 222222 222 11 1111 1111111 111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 2222 111 11 2222 1
lowQualScore : 8888 2222 1 2 0000 33 1 777777 999999 444 888 7 2 55555555555 0 3 7777777777777777777777777777777777777 2 999999 3 888888 77777 6666 1 1 9999 555 33 1 1 5555 666 55 7 55 5555555 000000 3 88 4 99999999999999999999999999999999999999999999999999 444444 0 1 99 6 77 7777 1 111 11 4444 1 1 5 1
lowQualScore : .... .... . . .... .. . ...... ...... ... ... . . ........... . . ..................................... . ...... . ...... ..... .... . . .... ... .. . . .... ... .. . .. ....... ...... . .. . .................................................. ...... . . .. . .. .... . ... .. .... . . . .
lowQualScore : 3333 5555 3 4 3333 77 1 222222 111111 444 888 5 5 77777777777 8 2 8888888888888888888888888888888888888 2 111111 1 111111 11111 1111 8 6 1111 000 00 0 3 5555 444 00 3 00 1111111 555555 6 00 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888 000000 1 0 22 7 77 2222 0 777 00 3333 0 0 5 0
consensus : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Reference ( family-434 ) : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
gi|1 : TCATTTTCAATGTTTGTCAATATCAAAATAGAAAATTAT--CAGATTAAAAT--T--G--TTTGTTTGCTGT------TT-T----CCT---A---TCTA-C-C-A-T---C-G-AAGATGCTGCCTACC----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAA-AT-----TTTGAAAACAG-T--ATTTTTT-TTTAAA-TATCATATA-----GGC----AATTACATGTACATGTGAGTATGT-GTATTTATTG----T---A--CT-T--TTAT-----AATG------A-TACTGT-TTTT-ATA-TGA--TTAA---------TAT-C----CCAG----------AC--CTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--ACAGA-AAGA-CAGCTAAC----ATAATTCT---AATGCTGGCCTCAGAT-CAAATACATCAATAC-ATTATGT
gi|10 : tatTCCA-----GGT----ATTTACATGTATATGT----ATG--ACATTTATTG----T---A--TT-TATTTTTG----AATGTGTCGTA-TGATAT-TTAT-TTA-TAT--TTAA----------AC-C----CCCG----------CCT-CTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--ATCGG-AATA-GAGCAAAC----ATTTCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATCT--ATACATAAAGGCAATTTTGTaatctatctaaa
gi|11 : AAATTAGAATAGT--G--TTTGTTTGCCGT------CT-C----CAT---A---CCT------A-T---C-A-ATAAAGCTGCCTATG----C-------ATT--TTTTTTATTTTT-TT-----TTTGGAAAC------ATTTATT-TTT--ATT-TCATCCA-----GAC----AACCGCATGTACATGCATGTATATGGCATTTATTA----T---A--TG-T--TTTG-----AACG------ATTATAAT-TTTT-tgataaca
gi|12 : ggtcaAATA-TT-A--TTTGTTAGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-C-T---TTA-AAAAGGCTGCCT-------------------------T-GTCAG-AT-----TTTGAAAAGAG-T--ATTTTCTATTT--T-T-TCATCTA-----AGC----ATTTGCTTTT--ATGT--GTATAA-AAATTAATTG----T---A--TT-T--TT-T-----AATT------A-TTCTAT-TTTT-TTA-Tg
gi|13 : cAAAATAAAGGA-TT-G--TTTGTTTGCACT------CT-A----GCT---A---CCTA-C-C-C-TACAC-ATAAAAAGCCGTCTACT----TG----CAATTCTTTTTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAAACTG-T--ATTCTTT-TTC--A-T-GCATATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACAGAT--ATATAT-ATATTTATttttgaaattt
gi|14 : gccaTTA----AAATTAAAATAGT--G--TGTGTCTGATGT------CT-C----CCT---A---CCTACC-C-A-T-----G-AATAGGCAGCCT--T----CT----CACTT--TTCTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAG--AG-T--ATTT
gi|15 : tggT------CT-C----CCT---A---TATA-C-C-------C-ATAAAAATCTGCCAACT----CTGAAGAAACA--TTTTAT----ACGAT-----TTTGAACACAGCT--ATATTTT-T----AGT-TTATCTA-----GGC----AATTACATgattatt
gi|16 : tcTA---AAAATTACAATA-TT-G--TTTGTTTGTTGT------CC-G----CCT---A---CATA-C-CCA-T---G-A-ACAAAGATGCCTACT----CA----AAACC--TTTTCT-ATCA--AT-----TTT
gi|17 : gg-T--G--TTTGTTTGCTGC------CT-A----CCT---A---CC-----C-A-T---A-A-AAAAAGTTGCCTACT----CA----AAATC--GTTTTT-
gi|2 : --G--TTTGTTTGATGT------CT-CTTATCCTGTCA---CCTG-C-C-A------------AAACTGTCT--T----CT----AAAAA--TAT------CAG-GT-----TTTGAA---AG-TTTATTTTTT-TCT----T-TCATCAT-----TGC----AAGTGCATG--CATGTG--TATG--ACATTTATT-----T---AATTT-T--TTTT-----AATG------T-TCTTAT-TTTT-TTA-T-A--TTAAAAGAGAGTTTAT-TTTCACTAG----------AA--CTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--ATTGG-GAGA-TAGCAAACAAAAATGATTTT---AATGTTGGTCTT--AT-
gi|3 : ggAAATTGAAATA-TTTG--TTTTGTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-CTC-G-T---C-A-ATAAAGCTGACCACT----C-----AAAT------------AAT-AT-----TTTGTAAAAAA-T--GGTTTTG-TTT-------CATCTA-----GGT----AGCTTT-TGTATATG-G-ATA----AGATTTAATG----T---A--TT-T--TTAT-------TG------T-T-TTAT-TTTT---------------------------------TAG----------TT--CTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--TTTGG-GAGA-CAGCAAAC----GTTATTTT---AATGCTGGTCTG--AT-T--GTACATgtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|4 : atttttaaagagtaacattgccaaaagacaagtaaggtcaAAATTGAAATG----GAATTTGTTTGCTATATGTCCCT-C----CTT---G---CCGA-C-C-GGT---C-C-AAAA-GCTGTCTATTTAATCT----GAATT--TCT--------G-GT-----TTAAGAGACAG-A--ACTTATT-TTT--AATATCACCGA-----G-----------CATG--CATGTG--TATG--GCATTTATCA----T---A--TT-C--TT-T-----AATG------A-TATTACATTTT-ATA-TGAAATTAT---------TTT-T----TTAACCT-------AC--CTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTATTGA-AAGAGTAATCAAT---AATAGTTTC---AATGT
gi|5 : ttaggccaTTAAAATACT--G--TTCGTTTACTCT------TT---------------------------T---C-A-ATAAA------TACT-----T----A---T--TTCTTT-TTCAT-AT-----TTTTGAGACGA-T--GTGTTGT-TTT--T-T-TCATCCA-----GGC----AAGTATATGTAATTGTG-A---G--ACATTCATTA----C---A--TA-T--TTATATCTGAATG------A-TGATAG-TT----TA-------TAA---------CATCC----CTAC----------ATAACTACC---AACATTT--AAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC---AAACATTTTTTGGATGTAGGCCTT--
gi|6 : AATTAAAATGGT--A--TTTGTGTGCTCT------TT-C----CCT---A---CCTA-C-T-A-T-------AGAAAACTCCCTATT----C-----AAATT--TTTCTT-T--AA-TT-----TTTGGAAAC--------TTTAT-TTT--G---CCACCTA-----GGC----AATTG--TATATATGT--GTAC-T-ACATT--TTG----TTTAA--TT-T--T--T-----AATG------A-TACTAT-TTTTGCTATTGA--ACAA--------------------AGGAAAAAAAACAC--CTTCC---CA-ATTTTGAAAACTtaaaggcattaataa
gi|7 : aatagtgaaaatatatttgtatcattTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-----AATG------A-
gi|8 : caaaaTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-----AATG------A-
gi|9 : caaaa---CAAATTAAAATA-TT-G--TTTGTTTGCTCT------AT-C----CCT---A---ACTG-C-CCA-T---T-A-AGAAAGTTGCCT--T----CTGAAAAAAAA--CTTTGT-TACAT-AA-----CTTGGAGACAG-C--ATTTTTT-TCA--T-T-TCATTTA-----GAC----AATTACATGTATTTGT--ATATGT-
Alignments
lowQualScore : 2222 3333 2222 11111111111 4444444444444444444444444444444444444 222222 222 11 1111 1111111 111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 2222 111 11 2222 1
lowQualScore : 8888 2222 1 2 0000 33 1 777777 999999 444 888 7 2 55555555555 0 3 7777777777777777777777777777777777777 2 999999 3 888888 77777 6666 1 1 9999 555 33 1 1 5555 666 55 7 55 5555555 000000 3 88 4 99999999999999999999999999999999999999999999999999 444444 0 1 99 6 77 7777 1 111 11 4444 1 1 5 1
lowQualScore : .... .... . . .... .. . ...... ...... ... ... . . ........... . . ..................................... . ...... . ...... ..... .... . . .... ... .. . . .... ... .. . .. ....... ...... . .. . .................................................. ...... . . .. . .. .... . ... .. .... . . . .
lowQualScore : 3333 5555 3 4 3333 77 1 222222 111111 444 888 5 5 77777777777 8 2 8888888888888888888888888888888888888 2 111111 1 111111 11111 1111 8 6 1111 000 00 0 3 5555 444 00 3 00 1111111 555555 6 00 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888 000000 1 0 22 7 77 2222 0 777 00 3333 0 0 5 0
consensus : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Reference ( family-434 ) : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
gi|1 : TCATTTTCAATGTTTGTCAATATCAAAATAGAAAATTAT--CAGATTAAAAT--T--G--TTTGTTTGCTGT------TT-T----CCT---A---TCTA-C-C-A-T---C-G-AAGATGCTGCCTACC----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAA-AT-----TTTGAAAACAG-T--ATTTTTT-TTTAAA-TATCATATA-----GGC----AATTACATGTACATGTGAGTATGT-GTATTTATTG----T---A--CT-T--TTAT-----AATG------A-TACTGT-TTTT-ATA-TGA--TTAA---------TAT-C----CCAG----------AC--CTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--ACAGA-AAGA-CAGCTAAC----ATAATTCT---AATGCTGGCCTCAGAT-CAAATACATCAATAC-ATTATGT
gi|10 : tatTCCA-----GGT----ATTTACATGTATATGT----ATG--ACATTTATTG----T---A--TT-TATTTTTG----AATGTGTCGTA-TGATAT-TTAT-TTA-TAT--TTAA----------AC-C----CCCG----------CCT-CTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--ATCGG-AATA-GAGCAAAC----ATTTCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATCT--ATACATAAAGGCAATTTTGTaatctatctaaa
gi|11 : AAATTAGAATAGT--G--TTTGTTTGCCGT------CT-C----CAT---A---CCT------A-T---C-A-ATAAAGCTGCCTATG----C-------ATT--TTTTTTATTTTT-TT-----TTTGGAAAC------ATTTATT-TTT--ATT-TCATCCA-----GAC----AACCGCATGTACATGCATGTATATGGCATTTATTA----T---A--TG-T--TTTG-----AACG------ATTATAAT-TTTT-tgataaca
gi|12 : ggtcaAATA-TT-A--TTTGTTAGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-C-T---TTA-AAAAGGCTGCCT-------------------------T-GTCAG-AT-----TTTGAAAAGAG-T--ATTTTCTATTT--T-T-TCATCTA-----AGC----ATTTGCTTTT--ATGT--GTATAA-AAATTAATTG----T---A--TT-T--TT-T-----AATT------A-TTCTAT-TTTT-TTA-Tg
gi|13 : cAAAATAAAGGA-TT-G--TTTGTTTGCACT------CT-A----GCT---A---CCTA-C-C-C-TACAC-ATAAAAAGCCGTCTACT----TG----CAATTCTTTTTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAAACTG-T--ATTCTTT-TTC--A-T-GCATATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACAGAT--ATATAT-ATATTTATttttgaaattt
gi|14 : gccaTTA----AAATTAAAATAGT--G--TGTGTCTGATGT------CT-C----CCT---A---CCTACC-C-A-T-----G-AATAGGCAGCCT--T----CT----CACTT--TTCTTT-TTCAG-AT-----TTTGGAG--AG-T--ATTT
gi|15 : tggT------CT-C----CCT---A---TATA-C-C-------C-ATAAAAATCTGCCAACT----CTGAAGAAACA--TTTTAT----ACGAT-----TTTGAACACAGCT--ATATTTT-T----AGT-TTATCTA-----GGC----AATTACATgattatt
gi|16 : tcTA---AAAATTACAATA-TT-G--TTTGTTTGTTGT------CC-G----CCT---A---CATA-C-CCA-T---G-A-ACAAAGATGCCTACT----CA----AAACC--TTTTCT-ATCA--AT-----TTT
gi|17 : gg-T--G--TTTGTTTGCTGC------CT-A----CCT---A---CC-----C-A-T---A-A-AAAAAGTTGCCTACT----CA----AAATC--GTTTTT-
gi|2 : --G--TTTGTTTGATGT------CT-CTTATCCTGTCA---CCTG-C-C-A------------AAACTGTCT--T----CT----AAAAA--TAT------CAG-GT-----TTTGAA---AG-TTTATTTTTT-TCT----T-TCATCAT-----TGC----AAGTGCATG--CATGTG--TATG--ACATTTATT-----T---AATTT-T--TTTT-----AATG------T-TCTTAT-TTTT-TTA-T-A--TTAAAAGAGAGTTTAT-TTTCACTAG----------AA--CTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--ATTGG-GAGA-TAGCAAACAAAAATGATTTT---AATGTTGGTCTT--AT-
gi|3 : ggAAATTGAAATA-TTTG--TTTTGTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-CTC-G-T---C-A-ATAAAGCTGACCACT----C-----AAAT------------AAT-AT-----TTTGTAAAAAA-T--GGTTTTG-TTT-------CATCTA-----GGT----AGCTTT-TGTATATG-G-ATA----AGATTTAATG----T---A--TT-T--TTAT-------TG------T-T-TTAT-TTTT---------------------------------TAG----------TT--CTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--TTTGG-GAGA-CAGCAAAC----GTTATTTT---AATGCTGGTCTG--AT-T--GTACATgtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|4 : atttttaaagagtaacattgccaaaagacaagtaaggtcaAAATTGAAATG----GAATTTGTTTGCTATATGTCCCT-C----CTT---G---CCGA-C-C-GGT---C-C-AAAA-GCTGTCTATTTAATCT----GAATT--TCT--------G-GT-----TTAAGAGACAG-A--ACTTATT-TTT--AATATCACCGA-----G-----------CATG--CATGTG--TATG--GCATTTATCA----T---A--TT-C--TT-T-----AATG------A-TATTACATTTT-ATA-TGAAATTAT---------TTT-T----TTAACCT-------AC--CTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTATTGA-AAGAGTAATCAAT---AATAGTTTC---AATGT
gi|5 : ttaggccaTTAAAATACT--G--TTCGTTTACTCT------TT---------------------------T---C-A-ATAAA------TACT-----T----A---T--TTCTTT-TTCAT-AT-----TTTTGAGACGA-T--GTGTTGT-TTT--T-T-TCATCCA-----GGC----AAGTATATGTAATTGTG-A---G--ACATTCATTA----C---A--TA-T--TTATATCTGAATG------A-TGATAG-TT----TA-------TAA---------CATCC----CTAC----------ATAACTACC---AACATTT--AAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC---AAACATTTTTTGGATGTAGGCCTT--
gi|6 : AATTAAAATGGT--A--TTTGTGTGCTCT------TT-C----CCT---A---CCTA-C-T-A-T-------AGAAAACTCCCTATT----C-----AAATT--TTTCTT-T--AA-TT-----TTTGGAAAC--------TTTAT-TTT--G---CCACCTA-----GGC----AATTG--TATATATGT--GTAC-T-ACATT--TTG----TTTAA--TT-T--T--T-----AATG------A-TACTAT-TTTTGCTATTGA--ACAA--------------------AGGAAAAAAAACAC--CTTCC---CA-ATTTTGAAAACTtaaaggcattaataa
gi|7 : aatagtgaaaatatatttgtatcattTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-----AATG------A-
gi|8 : caaaaTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGGCCA---TA----A-T--G--TTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----C-----AAA-------------CAC-ATAAAGATTTGGAGACTA-C--GCACTTT-TTA--A-TCTCATCTT-----GGC----AATTACAC----------GTATGT-ATATTCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-----AATG------A-
gi|9 : caaaa---CAAATTAAAATA-TT-G--TTTGTTTGCTCT------AT-C----CCT---A---ACTG-C-CCA-T---T-A-AGAAAGTTGCCT--T----CTGAAAAAAAA--CTTTGT-TACAT-AA-----CTTGGAGACAG-C--ATTTTTT-TCA--T-T-TCATTTA-----GAC----AATTACATGTATTTGT--ATATGT-
blockSeqs : . GGCC A G TTT AA G ATGTCC CTTAT GTC AGG C T CTACACAT A CTGAAAAAAAACTTTGTTACATAA A AGTTT A AATA ATATT CAGA T A GTAT ATG TG T T ACAA TTA AT A AT ATATCTG TGTCGT T GA A TTATATTAAAAGAGAGTTTATTTTCACTAGAA AATCAT T TT A GT AAAA T TTG . CT A G A T
blockSeqs : . GGCC A A GT . G . CC . AGG C . CTTTA A TGCAATTCTTTTTTTTTCAGAT A AGCT . ATT . . C G GTAC GA A T T ACAA . . A . TTG . . AT . GCTATTGAACAAAGGAAAAAAAACAC AAC G . . G A G . . T
blockSeqs : A A A TT . C . CC . . C . CATGA A CTGAAGAAACATTTTATACGAT A AGT . AGT . . T G ATAC GA T A T . . . . . TG . . TC . ATATGAAATTATTTTTTTAACCTAC GA T . . T A T . .
blockSeqs : C A C TT . G . C . . . . GGTCC A CTCACTTTTCTTTTTCAGAT G TGT . ATC . . T G GTAT G T T T . . . . . TT . . CT . TTATATTTAAACCCCCGCCT TA A . . C . A . .
blockSeqs : . A A GT . G . C . . . . CATTA A CAAAACCTTTTCTATCAAT C AGT . ATC . . G A GTAA A T T T . . . . . AT . . AT . TATAACATCCCTACATAA CG G . . G . C .
blockSeqs : A A TT . G . A . . . . ATCA A CATTTTTTTTATTTTTTT A AAT . TT . . C G ATAT G T T A . . . . . AT . . GA . TAGTT CA
blockSeqs : A A CT . G . C . . . . ATAA A TAATCTGAATTTCTGGT G AGA . AT . . G T GTAT G T T T . . . . . AT . . AC .
blockSeqs : A A GT . G . C . . . . GTCA A CAAATTTTTCTTTAATT G GAT . TT . . T A TT G . C T . . . . . T . . T .
blockSeqs : . A TT . A . G . . . . ATCA A TATTTCTTTTTCATAT A TAC . TT . . T G GC G . C T . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . C . A . . . . ATCA A CTAAAAATATCAGGT G TAC . T . . T A GC G . C . . . . . . T . .
blockSeqs : . T . C . C . . . . ATG A CAAACACATAAAGA G AGC . G . . T A . A . . .
blockSeqs : T . C . C . . . . CAT . CAAACACATAAAGA G . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . C . C . . . . TCA . CAAATAATAT . . . . . .
blockSeqs : . C . C . . . . AT . TGTCAGAT
blockSeqs : . . . . . . A .
blockSeqCons : GC** NT** CAAAACCTTTTCTATCAAT****************** ATT*** G** TATAAAATATTTTTAACAN******************************* A*** **
originalCons : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTA---CAAATTAAAATA-T--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACT----CT----AAATT--TTTTTT-TTCAN-AT-----TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTT--A-T-TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG-GTATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTT-NTA-TGA--TTAA---------TAT-C----CTAG----------AC--CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
finalCons : NNNTCATT----ATGTATAACAATATAAACATAAAAAATTAGC--AAATTAAAATANT--G--TTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T---C-A-AAAAAGCTGCCTACTCAAAACCTTTTCTATCAAT------------------TTTGGAGACAG-T--ATTTTTT-TTTATT---TCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATGTG--TATGT-ACATTTATTG----T---A--TT-T--TTAT-----AATG------A-TACTAT-TTTTTATAAAATATTTTTAACAN-------------------------------CTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAACA---ATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 1 1 11 33 111 1111111111 6666666666666666666666666666666666666666 111 111111111 11111111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 2222 111 11 2222 1
lowQualScore : 1111 4 0 0 3 33 33 3 2 2 1 666666 888888 444 000 7 2 7777777777 0 4444444444444444444444444444444444444444 2 555 0 2 88888 77777 6666 1 8 44 44 444 2 1 666 55 7 55 000000000 44444444444444 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 444444 0 1 99 6 77 1111 1 111 11 4444 1 1 5 1
lowQualScore : .... . . . . .. .. . . . . ...... ...... ... ... . . .......... . ........................................ . ... . . ..... ..... .... . . .. .. ... . . ... .. . .. ......... .............. . ........................................................ ...... . . .. . .. .... . ... .. .... . . . .
lowQualScore : 2222 0 0 0 5 88 00 3 0 5 4 888888 000000 111 666 1 5 2222222222 8 6666666666666666666666666666666666666666 2 666 1 9 55555 11111 1111 8 4 22 22 999 5 8 444 00 3 00 555555555 55555555555555 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000000 1 0 22 7 77 5555 0 777 00 3333 0 0 5 0
consensus : NNNTCATT----ATGTNT-AACAATA-TNAAC--ATAGAAAATTAGGCCAA-ATTAAAATANT-GTTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T-CA---AAAAAGCTGCCTACT--C----AAA-AC---CT---TTTT--TA--TC-A-A-T-TTTGGAGACAG-TATTT-TTTTTT--ATTTCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATG--T--GTATGT-ACATTTATTGT---A--TT-T--TTAT-A-----ATG------A-TACT--ATTT-TT--T---AT----------AA--AA-------TA--TTTTTA--A-------C--ACCTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
Reference ( family-434 ) : NNNTCATT----ATGTAT-AACAATA-TAAAC--ATAAAAAATTAG--CAA-ATTAAAATANT-GTTTGTTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-A-T-CA---AAAAAGCTGCCTACT--C----AAA-AC---CT---TTTC--TA--TC-A-A-T-TTTGGAGACAG-TATTT-TTTTTT--ATTTCATCTA-----GGC----AATTGCATGTACATG--T--GTATGT-ACATTTATTGT---A--TT-T--TTAT-A-----ATG------A-TACT--ATTT-TT--T---AT----------AA--AA-------TA--TTTTTA--A-------C--ANCTACC---CA-ATTTTGAAAACTAGG--ATTGG-AAGA-NAGCAAAC---AATNATTTT---AATGTTGGCCTT--AT-T--ATACATNAANGCAATTNTGT
gi|1 : TCATTTTCAATGTTT-GTCAATA-TCAAA--ATAGAAAATTAT--CAG-ATTAAAAT--T-GTTTGTTTGCTGT------TT-T----CCT---A---TCTA-C-C-A-T-CG---AAGATGCTGCCTACC--C----TAA-AT---TT---TTTT--TT--TCAA-A-T-TTTGAAAACAG-TATTT-TTTTTTAAATATCATATA-----GGC----AATTACATGTACATG--TGAGTATGT-GTATTTATTGT---A--CT-T--TTAT-A-----ATG------A-TACT--GTTT-TTA-T---AT----------GATTAA-------TA--TCCC----A-------G--ACCTACC---CA-ATATTGAAAACTAGG--ACAGA-AAGA-CAGCTAAC----ATAATTCT---AATGCTGGCCTCAGAT-CAAATACATCAATAC-ATTATGT
gi|10 : tatTCCA-----GGT----ATTTACATGTATATG--T----ATG--ACATTTATTGT---A--TT-TATTTTTGA-----ATGTGTCGTA-TGAT--ATTTATT--T---AT----------A------------------TTTA--AACCCCCGC--CTCTGCCAATCATATCTTGGAAACCATG--ATCGG-AATA-GAGCAAAC----ATTTCTTT---ATTGTTGGCCTT--ATCT--ATACATAAAGGCAATTTTGTaatctatctaaa
gi|11 : AA-ATTAGAATAGT-GTTTGTTTGCCGT------CT-C----CAT---A---CCT------A-T-CA---ATAAAGCTGCCTATG--C--------AT---TT---TTTT--TATTTT-T-T-T-TTTGGAAAC----ATTT-ATTTTT--ATTTCATCCA-----GAC----AACCGCATGTACATGCAT--GTATATGGCATTTATTAT---A--TG-T--TTTG-A-----ACG------ATTATA--ATTT-TT--tgataaca
gi|12 : ggtcaAATATT-ATTTGTTAGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-C-C-CTT-TA---AAAAGGCTGCCT------------------------------TG--TC-AGA-T-TTTGAAAAGAG-TATTT-TCTATT--TTTTCATCTA-----AGC----ATTTGCTTTT--ATG--T--GTATAA-AAATTAATTGT---A--TT-T--TT-T-A-----ATT------A-TTCT--ATTT-TT--T----------------------------TA--TTTTTG--A-------g
gi|13 : cAA-AATAAAGGATT-GTTTGTTTGCACT------CT-A----GCT---A---CCTA-C-C-C-TACACATAAAAAGCCGTCTACTTGC----AAT-TC---TT---TTTT--TT--TC-AGA-T-TTTGGAAACTG-TATTC-TTTTTC--A-TGCATATAATATTGGCCAGAAA--GCAAATACAGA--T--ATATAT-ATATTTATaattt
gi|14 : gccaAA-ATTAAAATAGT-GTGTGTCTGATGT------CT-C----CCT---A---CCTACC-C-A-T--G---AATAGGCAGCCTTCT--C----A--------CT---TTTCTTTT--TC-AGA-T-TTTGGAG--AG-TATTT-
gi|15 : tggttaT------CT-C----CCT---A---TATA-C-C-----CAT--AAAAATCTGCCAACT--CTGAAGAA-AC---AT---TTTA--TA---C-G-A-T-TTTGAACACAGCTATAT-TTTT----AGTTTATCTA-----GGC----AATTACATgattatt
gi|16 : tcAA-ATTACAATATT-GTTTGTTTGTTGT------CC-G----CCT---A---CATA-C-CCA-T-GA---ACAAAGATGCCTACT--C----AAA-AC---CT---TTTC--TA--TC-A-A-T-TTT
gi|17 : ggtaaT-GTTTGTTTGCTGC------CT-A----CCT---A---CC-----C-A-T-AA---AAAAAGTTGCCTACT--C----AAA-AT---CG---TTTT--T
gi|2 : -GTTTGTTTGATGT------CT-CTTATCCTGTCA---CCTG-C-C-A-----------AAACTGTCTTCT--A----AAA-A---------------TA--TC-A-GGT-TTTGAA---AG-TTTAT-TTTTTT--CTTTCATCAT-----TGC----AAGTGCATG--CATG--T--GTATG--ACATTTATT-T---AATTT-T--TTTT-A-----ATG------T-TCTT--ATTT-TT--TTATATT---------AA--AAGAGAGTTTA--TTTTCACTA-------G--AACTGTC---GA-ATTTTAAAAACTAGG--ATTGG-GAGA-TAGCAAACAAAAATGATTTT---AATGTTGGTCTT--AT-
gi|2 : ggTT----ATGTTTTAACAACAGTTAACTGATAGTACATAAGACCAACATTAAAATCAT-TTTTGTTTGCTAT------CT-C----CCA---AT--CCTA-gtactatcagttaactgttgttaaaacataaatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|3 : gggtttgtttgatgtctcttatcctgtcacctgccaaaactgtcttctaaaaatatcaggttttgaaagtttatttttttctttcatcattgcaagtgcatgcatgtgtatgacatttatttaattttttttaatgttcttatttttttatattaaaagagagtttattttcactagaactgtcgaattttaaaaacAA-ATTGAAATATTTGTTTTGTTGCTGT------CT-C----CCT---A---CCTA-CTC-G-T-CA---ATAAAGCTGACCACT--C----AAATA----------------A--T----A-T-TTTGTAAAAAA-TGGTT-TT------GTTTCATCTA-----GGT----AGCTTT-TGTATATG--G--ATA----AGATTTAATGT---A--TT-T--TTAT--------TG-----------------T-TT--T---AT---------------------------TTTTTA--G-------T---TCTACA---TA-ATTTTGGAAACTATG--TTTGG-GAGA-CAGCAAAC---G-TTATTTT---AATGCTGGTCTG--AT-T--GTACATatatataatgtataaaaacagtatttacaaaaattg
gi|4 : atttttaaagagtaacattgccaaaagacaagtaaggtcaAA-ATTGAAATGGA-ATTTGTTTGCTATATGTCCCT-C----CTT---G---CCGA-C-CGG-T-C----CAAAAGCTGTCTATT--T------A-AT---CTGAATTTC--T------G-G-T-TTAAGAGACAG-AACTTATTTTTA--ATATCACCGA----------------GCATG--CATG--T--GTATG--GCATTTATCAT---A--TT-C--TT-T-A-----ATG------A-TATTACATTT-TA--T---AT----------GA--AAT------TATTTTTTTA--A-------CCTACCTACC---CG-ATTTCGAAAA--AAGTTATTGA-AAGAGTAATCAAT---AATAGTTTC---AATGT
gi|5 : ttaggccaTTAAAATACT-GTTCGTTTACTCT------TT---------------------------T-CA---ATAAA--TACTTATT--T-------------CT---TTTT--CA--T----A-T-TTTTGAGACGA-TGTGT-TGTTTT---TTTCATCCA-----GGC----AAGTATATGTA-AT---T--GTGAG--ACATTCATTAC---A--TA-T--TTAT-ATCTGAATG------A-TGAT--AGTT-T-------AT----------AA-----------CA--TCCCTAC-A-------T--AACTACC---AACATTT--AAAACTAGG--ATTGGAAAGA-GAGGAAAC---AAACATTTTTTGGATGTAGGCCTT--
gi|6 : A-ATTAAAATGGT-ATTTGTGTGCTCT------TT-C----CCT---A---CCTA-C-T-A-T------AGAAAACTCCCTATT--C----AAA------TT---TTTC--T---TT-A-ATT-TTTGGAAAC------TT-TATTTT--G--CCACCTA-----GGC----AATTG--TATATATG--T--GTAC-T-ACATT--TTGTTTAA--TT-T--T--T-A-----ATG------A-TACT--ATTT-TTGCT---ATTGAACAAAGGAA--AA-------AA-------A--A-------C--ACCTTCC---CA-ATTTTGAAAACTtaaaggcattaataa
gi|7 : aatagtgaaaatatatttgtatcattTCATT----ATGTAT-AACAATA-TAAAC--ATAAAAAATTAGGCC---------ATAAT-GTTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T-CA---AAAAAGCTGCCTACT--C----AAACAC---------------A--TA-A-A-GATTTGGAGACTA-CGCAC-TTTTTA--ATCTCATCTT-----GGC----AATTACACGTA------T--GTATAT-TCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-A-----ATG------A-
gi|8 : caaaaTCATT----ATGTAT-AACAATA-TAAAC--ATAAAAAATTAGGCC---------ATAAT-GTTTGTTTACTCT------CTCC----CCT---AAGGTCTACC-C-A-T-CA---AAAAAGCTGCCTACT--C----AAACAC---------------A--TA-A-A-GATTTGGAGACTA-CGCAC-TTTTTA--ATCTCATCTT-----GGC----AATTACACGTA------T--GTATAT-TCA-TGACAAT---A--TTAT--TTAT-A-----ATG------A-
gi|9 : caaaa--CAA-ATTAAAATATT-GTTTGTTTGCTCT------AT-C----CCT---A---ACTG-C-CCA-T-TA---AGAAAGTTGCCTTCT--G----AAA-AAAAACT---TTGT--TA---C-ATA-A-CTTGGAGACAG-CATTT-TT-TTC--ATTTCATTTA-----GAC----AATTACATGTATTTG--T--ATATGT-