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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGGATGAGGAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACTAGAGGAGAAAGATGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATAGAAGATAAAGTGAAAATCCCGAATGCAAAAACGGACATTAAAATACAAAGAGAACACAGGGTGGGTGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATTGTGGCCAAATTTGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATTGGCTAGGAACCTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAACAAGAAGGAGACTCATCCCCATAATAAAACAGGC-ACGCGAGCAGGGTAAGGACGCCTACATCAGTGTTAACAAACTGTTTATTAACAAG--AC----TTTATAC-GA---AGAAAATCAAA--AGCACCCATGT--GA----ATTT---TGTTTTAAAGTGTTTAACTTGGAATGTGGAAGGACTAACTG-TAGCAAAACGATCATTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGAAGTAGTATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGT-----AATTCA-----CTCGTACAG-AAAATTGCAACATAGAAAAGCAAGACAGTCCAGTGGTGGCATAATTGTGTATATTAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTGTTATTTAAAAATGATATCGATTGTTTAGT-ATGGCTGAAGTTCGATAAATTGTTTTTTCATATTGAA-ACTGATATGTATTTAGC-ATTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTGCGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGACA-TAAATAATTTCCATGATTTGGG---CAAAATATTCAT-T-GCAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACGGGT----CATAAATGTGATTACATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTGCATTGCCCCGGGCG----TCATGTGATTTTAAATCTAATCGATTCGGG-GAATACTTGCTGGACCTTTGTAAATCTACAAATATTCGAATAGTAAATGGGAGATT---A----CATAGTG-AAAAAAATATAGGTAAAATGACTTGCATGACATATAACGGAGAAAGCGTGGTCGATTATCTG-TTAAC--C-TC-GTTAC-CT---AATTTCAAGGAC---CTGGCCGATTTTA---ATGTAC--ACGATTTTAACGAGTATTCAAATCATGCACCGGTCTCCTTTTCATTCAAAATAATGACTAGA-AT-----GGAAACGAAATTAGATA--ATACGAG-A----ACGTTT--TACAAGTGGAACCCTAAATATAAAGAAC-AGTTTGTAAATGACGTCATTTCC---GATATTCGTAATCTCGAG-AGTAGCTTAGCAGACGACATAAACCG-A----------GGCGAGGACATGGATGTATTAGTTTATAAATT--TACCGAGT-TC-CTAA------GCACAAAA--GGGAAAAAATATTTTGATAAAAATGT---AACGA--T--AAAC-----GGTACCCATT-TCTTA-GCGAAAGAAC-AA-AATAAACATAAATGGAATAACGATGAA-TGTA---AAAAT----AAATACGAAATGTACAAACAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATTATTAAAACCGATG-AAACAAG-ACGTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAAGACTATAAATACTATTGTCG-AATATGTAAAAATAAATTTAAT
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gi|11                         : aaaaaatattgaataaacttgttaaaatgtagttctagaaagttgaaaatggtacgttgatgactttcttatagtgctggaataaattagtgccgagaaaatgtaagaagacaatggagtcgcctgaaaactgtcaagtttcatccaagagacagtcaacaatggatcaaaatggcgcgaaaaaatcgacaaagaaacagggaaacaatgttacacgaaacagtcaaacgaatcaaaatgaacaatatggacaatatcaggcaagtcaaatttttaatacgcctcaacctgtacaattgccattacataatatgaattataaccatcagtatatggctatgaactctgcatcaccagtggtttccccgcgcaacaaccaagtcacggaagcccaaccgacacaagctgatatgttctcaataatacttcaacagctggactccatggacgtaaaattaaaacagttagataccattcagtctacggttagctcgctaacggtacaaatggatacaacgggacaaaagattgccagtatcgaggtcaaaatgaaggacattcaacgcagtagggatttgacagtaaTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAG
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataCAGGT-ACACCAGGAGTGAAAGGAAGCTTTCATTATTGA-AATAAATTGTTTATTAAGAAGCAAC----TTTA-AA-GAGACAAAAAAT-AAA-----ACTCATGC--GAGAGTATTTAGGTGTTTT----TGT----CTT-AAATGTTGAAGG-CTTATTATTAGCTAAAAG-------------CTTT-TGAA------AAATGAT-----AATA-TATATTTAAGTGAGACATTGG-CAAATATAAAATCTAATATTCAACA-TAAA-CGTTagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgttgacaaactatataaacaaaacgttatttatgcaaagaaaatcaacaggacccgtgtgatagtgatttaaactgttaaactGATAAATATTTCTTTCATACTGAACGCT-ATTTGTATATTGC-GTGCACGTATATCGCACCGGAACAGTCAAAT--ATATAACCTTTATGACGTTAACAT-TTTAAAC-ACTAGATGATGATATTAAGGATTTTTCA-GAGCGGGGATACACGATGTTGAT-----GGGTGACTT--A---AAT-GCAACAACGGGT----CAGAAAAATGATTTTATC--GATCATGAATGATAAC--GGACAATAATCGGAGTGATATAATTAACGATA---AACCG-TCCAAGCACAATTC-TG-GATGGTATATGTAATC-ATTTGGGTGACTATTTAATTGACCTATGTAACGCGGTAAATATGTGTATACTGAATGGACGCTT---AGGATCACA----AAAACGATAT--TT----TCACATGTATAACTCACAATGAACAAAATGTAGTAGATTATATA-TTGAC--TGTCAGTT---CC---AATTTGAAGCTA---TTAAAGGATTTCACAGAT---C--ATAATTTTAATGATTTTTTTAATC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAATATGCATAAAGTTGATATGTTCGGACTAACTGAAAAAGACA-AGAAACATTCCCATGAGATGGG---CATAATATTAAT-T-GTTGATGACATTGATTTGATTGTAA-AACCGGA----CAGAAATGTTATTA-AGTAAG-TCAACGATCTAAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCAATcaaccacagtgtcagtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATTACACCGGGCT----ACATGTGATTTTAGCTCAGATCGTTTTGGT-GATTGTTTACTTGATCTTTGCAAGTCGACCAATATACGTATTGTTAACGGACGGTT---A----TACAACG-ATAAGAATGTAGGTAAACTAACATGCATGACTTATAATTGAGCGAGTACTGTCGATTATCTA-TTGAC--T-TT--CTA---TGAAAATTTTAATCAT---TTGTCCGACTTTG---AT----------TTTTA--TAGTTTTCAAATCATGCACCAATAGCATTTTCCTTTAACACAATGA---------------AAA--AAAT---ACAGTATACAAATA----ACGTTT--TATAGATGGGATGATAA-CATAAATTAG-ATTTTTTAAACGGTATCACGGAC---GATATTCAAATTCTCGAACAG-ACGTTAACAATCGAGAT-TTCCGTT----------GGCAGTAACGCTGATGTTTTGGTTAATATTTT--TACTGAAT-TT-TTGA------CAATAAGA--GGAAACAAGTATTTTAA-ACAAACTTCAAAACG---T--AAAC-----A----CAATTATTTTATGTGCAAGGATGAA-AACAAACAAAAATGGTATAACAATGAA-TGTA---AACAA----AAAAAAGATATTTATAAt
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAAATG---A----CATCGGG-ATAAAAGTTTAGGTAAAATTTCTTGCGTAACACATAATGGACAGAGCCTAGTTGACTACCTG-TTAACGGC-CC-ACAA---T---AACTTT---GACACACTTTCAGATTTTT---GTGTTC--ACAATTTTAACGAATTCTTCAATCATGCCCCAATCACATTTTCATTCGTTATAACGCCTCAATAT-----G-------AATCACGTG--ATACAAG-AGAATACATTTATTACAAGTGGAAACCTGAATTTAAA-AACGATTTTATAAATGA---CATTTCTCAAGGTATAAATGATTTAAAACAATCGCTT-TTAGATGGAAT-------A----------GATAAGAAC-----TGTAGTA-CTGATGAACTAGTATCGAGTCTCACTGACTTCATGGACAAAACTGCAAATAAATATTTC-----AGGCAT---ACTGT--T--AAACCTTCGGGTAATTATT-TTTTG-TC---AAATC-AA-AACAAAAATAAGTGT-TTTATGATGAA-TGTA---AAACTCGCCAATCAC----TATACAAGGAATATACTTTAT---TGAGTAATATAAATAAAACGGATACGAACAGGCAATTGATGC---TACA-ATCGAAAAAGAATTATAAATATTATTGCAG-AAAATGTAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATGTTTTGGTTAATAATTT--TACAGAAT-GT-TTGG------CTGTAAGA--GAAAACAAATGTATTGA-ATAAACTT---CAAAA--TCTAAA---------ACCCGTTATTTTAAGTGCAAGGAC-GAGAACAAACAAAAATAGTACAACAATGAA-TGTA---AAtgtgcgtacaatcggaacttaggatataagatgaacgaaatgagacgtaagcggtcaaaagaattctggaacatgtttaaaac
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|15 ): AAAAACATATATACTGAATGGCCGCTTATGATCGAAATAGGTAATTTTACATGCGTACGCACAATGGACAGTGTAGTAGATTATATATTGACTGCCTATTCCAAATCACGGAAAAA
Unaligned ( gi|16 ): TGTAATCGTTTTGGTGACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






Alignments
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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGCGAGAGCAACGAACAGAGGGAGNCGAGCTGTAAGTCGGANATTACNGACTTGAAGNGCCGCAGTATGNGNGACAACCTGATGTTTTACAAGCTNCNAGAGGAGAAAGGCGAAAACTGCGNAACGAGAAAGTGCTCCCTAAAATTCATTGAANATGAANTGAAGNTCGCNAATGCGGAAGCGGANATCAAANTNCACNGNGCGCACAGGATNGGCGNNTATAGCTCTAATGGGAAGATANGNCCNATCGTNGCCAAATTCGCNTACGACCCGGACAGGGAGNGNGTNCNGAAATCGGCCAGGGAACTGAAAGGNACGNAGTATGGCATNGGNGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTNGTNGANACCCGNNGGAGGCTCGTNCCCGTNATGAAGAAGGC-ACGCGAGNAGGGNAAGGA-GCNTTCATTAGCGTTGA--CAAACTGTATATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAAN--AGGACCCGTGTGAGATTTGTTTTAAAGTGTT--A-CTTG----GAATGTTGAAGGACTTATTG-TAGCAAAAAGATC-TTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACATAATATGTTTANNTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTTA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTGTTA-TTAAAAATGATATCGATTGTTTGGT--T-GGCTGAAATTAGATAAATCGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACGTATATAGCGCCAGAANANTCACCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTTAGACAAATTGAAAACGAC-A-TAAATATTTTCCATGATATGGG----CANAATATTNAT-T-GCGGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACG----GGACANAAATGTGATTNTATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTTCATTGCNCCGGGCGTCA----TGTGATTTTAGATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATGCGTATAGTTAACGGACGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACNCATAATGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AAT--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGANTTTTCNAATCATGCACCAATNNCATTTTCNTTCAACACAATGACTA-AAT-----G-AAACAAAATCAAATAATACAAG-A----ACGTT--TTACAGGTGGGACGNTAAACATAAATNANATTTTNTAAACGATATCACGNNCGATATTCANANTCTCGAACAG---TAGCTTAACAGACG-ANAT-AACCG-A--------G-GCAGNAACGCTGATGTTTTGGTTAAT--AATTTTACCGAATTTTTGACCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-T--AAAGA--TAAAC-----GGTACCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACAAAAATGGTATAACGATGAA-TGTA---AA---NANAAATATG-A-ATNTACAAANANGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATAAATAAAA-C-GA----GAACAAG-ANNTGANNTA--TATAGANCGAAAAAGGATTATAAATATTGCTGCNGTAAGATGTAAAAATAATTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AATAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAATCAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AAT--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAATCACACCCCAGTGTCATT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGNAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACNAGAGGAGAAAGACGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATTGAAGATAAANTGAAGATCCCNAATGCGAAAACGGACATTAAAATACACAGAGCGCACAGGATGGGCGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATCGTGGCCAAATTCGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATCGGCTAGGGAACTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAA--C--GAAGGAGACTCGTCCCCATNATGAAGNAGGC-ACGCGAGNAGGGTAAGGACGCCTNCATTAGCGTTGA--CAAACTGTNTATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAAN--AGGACCCGTGTGAGA--NTGTTTTAAAGTGTTT-A-CTTG----GAATGTTGAAGGACTTACTG-TAGCAAAANGATCATTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACGTAATATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTNA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTG--A-TTAAAAATGATATCGATTGTTTAGT--T-GGCTGAAGTTNGATAAATTGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGAC-A-TAAATATTTTCCATGATNTGGG---CANAATATTCAT-TG-CAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACGGGN----CANAAATGTGATTATATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTCCATTGCNCCGGGCGTCA----TGTGATTTTAAATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATNCGTATAGTNAATGGGCGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACGCATAACGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AA--T--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGAGTTTTCGAAT-CATGCACCAGTNNCATTTTCATTCAANATAATGACTAGA-AT-----GGAAACAAAATTAAATAATACGAG-A----ACGTTT--TACAAGTGGAACCCTAAATATAAANAAGATTTTNTAAACGACGTCACTNACGATATTCGNANTCTCGAACAG---TAGNTTAGCAGACG-ANAT-ANCCG-A--------G-GCGGTAACGCTGATGTNTTGGTTAAT--ANTTTTACCGAATTCTTGANCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-T--AAANA--TAAAC-----GGTACCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACANAAATGGTATAACGATGAA-TGTAAA---C---ANAAATATGAAATNTACAAANAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATNANTAAAA-C-GA--A----AACAAG-ANNTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAGGACTATAAATATTATTGTCG-AANATGTAAAAATAANTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AA--TAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAAT-CAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AA--T--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAAT-CACACCCCAGTGTCATT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGNAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACNAGAGGAGAAAGACGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATTGAAGATAAANTGAAGATCCCNAATGCGAAAACGGACATTAAAATACACAGAGCGCACAGGATGGGCGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATCGTGGCCAAATTCGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATCGGCTAGGGAACTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAA--C--GAAGGAGACTCGTCCCCATNATGAAGNAGGC-ACGCGAGNAGGGTAAGGACGCCTNCATTAGCGTTGA--CAAACTGTNTATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAAN--AGGACCCGTGTGAGA--NTGTTTTAAAGTGTTT-A-CTTG----GAATGTTGAAGGACTTACTG-TAGCAAAANGATCATTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACGTAATATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTNA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTG--A-TTAAAAATGATATCGATTGTTTAGT--T-GGCTGAAGTTNGATAAATTGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGAC-A-TAAATATTTTCCATGATNTGGG---CANAATATTCAT-TG-CAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACGGGN----CANAAATGTGATTATATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTCCATTGCNCCGGGCGTCA----TGTGATTTTAAATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATNCGTATAGTNAATGGGCGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACGCATAACGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AA--T--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGAGTTTTCGAAT-CATGCACCAGTNTCATTTTCATTCAANATAATGACTAGA-AT-----GGAAACAAAATTAAATAATACGAG-A----ACGTTT--TACAAGTGGAACCCTAAATATAAANAAGATTTTNTAAACGACGTCACTNACGATATTCGNANTCTCGAACAG---TAGNTTAGCAGACG-ANAT-ANCCG-A--------G-GCGGTAACGCTGATGTNTTGGTTAAT--ANTTTTACCGAATTCTTGANCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-T--AAANNTAAAC-----GGTACCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACANAAATGGTATAACGATGAA-TGTAAA---C---ANAAATATGAAATNTACAAANAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATNANTAAAA-C-GA--A----AACAAG-ANNTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAGGACTATAAATATTATTGTCG-AANATGTAAAAATAANTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AA--TAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAAT-CAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AA--T--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAAT-CACACCCCAGTGTCATT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGNAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACNAGAGGAGAAAGACGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATTGAAGATAAANTGAAGATCCCNAATGCGAAAACGGACATTAAAATACACAGAGCGCACAGGATGGGCGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATCGTGGCCAAATTCGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATCGGCTAGGGAACTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAA--C--GAAGGAGACTCGTCCCCATNATGAAGNAGGC-ACGCGAGNAGGGTAAGGACGCCTNCATTAGCGTTGA--CAAACTGTNTATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAAN--AGGACCCGTGTGAGA--NTGTTTTAAAGTGTTT-A-CTTG----GAATGTTGAAGGACTTACTG-TAGCAAAANGATCATTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACGTAATATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTNA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTG--A-TTAAAAATGATATCGATTGTTTAG-T--TGGCTGAAGTTNGATAAATTGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGAC-A-TAAATATTTTCCATGATNTGGG---CANAATATTCAT-T-GCAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACG----GGNCANAAATGTGATTATATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTCCATTGCNCCGGGCGTCA----TGTGATTTTAAATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATNCGTATAGTNAATGGGCGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACGCATAACGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AAT--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGAGTTTTCGAAT-CATGCACCAGTNTCATTTTCATTCAANATAATGACTAGA-AT-----GGAAACAAAATTAAATAATACGAG-A----ACGTTT--TACAAGTGGAACCCTAAATATAAANAAGATTTTNTAAACGACGTCACTNACGATATTCGNANTCTCGAACAG---TAGNTTAGCAGACG-ANAT-ANCCG-A--------G-GCGGTAACGCTGATGTNTTGGTTAAT--ANTTTTACCGAATTCTTGANCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-TCAAAATNTAAAC-GGTACCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACANAAATGGTATAACGATGAA-TGTAAA---C---ANAAATATGAAATNTACAAANAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATNANTAAAA-C-GA--A----AACAAG-ANNTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAGGACTATAAATATTATTGTCG-AANATGTAAAAATAANTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AATAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAAT-CAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AAT--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAAT-CACACCCCAGTGTCATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACATA--TATACTGAATGGCCGCTT---A----TG-ATCG-AAA------TAGGTAATTTTACATGCGT-ACGCACAATG--GACAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGNAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACNAGAGGAGAAAGACGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATTGAAGATAAANTGAAGATCCCNAATGCGAAAACGGACATTAAAATACACAGAGCGCACAGGATGGGCGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATCGTGGCCAAATTCGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATCGGCTAGGGAACTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAA--C--GAAGGAGACTCGTCCCCATNATGAAGNAGGC-ACGCGAGNAGGGTAAGGACGCCTNCATTAGCGTTGA--CAAACTGTNTATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAAN--AGGACCCGTGTGAGA--NTGTTTTAAAGTGTTT-A-CTTG----GAATGTTGAAGGACTTACTG-TAGCAAAANGATCATTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACGTAATATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTNA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTG--A-TTAAAAATGATATCGATTGTTTAG-T--TGGCTGAAGTTNGATAAATTGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGAC-A-TAAATATTTTCCATGATNTGGG---CANAATATTCAT-T-GCAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACG----GGNCANAAATGTGATTATATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT-GACGT-ATTTGA-TAGCGATATTCCATTGCNCCGGGCGTCA----TGTGATTTTAAATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATNCGTATAGTNAATGGGCGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACGCATAACGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AAT--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGAGTTTTCGAAT-CATGCACCAGTNTCATTTTCATTCAANATAATGACTAGA-AT-----GGAAACAAAATTAAATAATACGAG-A----ACGTTT--TACAAGTGGAACCCTAAATATAAANAAGATTTTNTAAACGACGTCACTNACGATATTCGNANTCTCGAACAG---TAGNTTAGCAGACG-ANAT-ANCCG-A--------G-GCGGTAACGCTGATGTNTTGGTTAAT--ANTTTTACCGAATTCTTGANCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-TCAAAATNTAAAC-GGTACCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACANAAATGGTATAACGATGAA-TGTAAA---C---ANAAATATGAAATNTACAAANAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATNANTAAAA-C-GA--A----AACAAG-ANNTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAGGACTATAAATATTATTGTCG-AANATGTAAAAATAANTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AATAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAAT-CAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AAT--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAAT-CACACCCCAGTGTCATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACATA--TATACTGAATGGCCGCTT---A----TG-ATCG-AAA------TAGGTAATTTTACATGCGT-ACGCACAATG--GACAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG






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Reference ( family-4223 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGTATGAGNAAGAGCAAAAAACAAAAGAAGCAGAGCTG-AAGTCGGAAATTATTGATTTGAAGAGCCGCAGTATGAGAGACAATTTAATGTTTTACAAGCTACNAGAGGAGAAAGACGAAAACTGCGT--CGAGAAAGTGCTTTCT----TTCATTGAAGATAAANTGAAGATCCCNAATGCGAAAACGGACATTAAAATACACAGAGCGCACAGGATGGGCGGATATAGCTCT---GGGAAAATACGACCAATCGTGGCCAAATTCGCATACGACCCGGACAAGGAAAGAGTACGGAAATCGGCTAGGGAACTGAAAGGTACGGAATATGGCATAAGCGAGCAGTTCCCGAGGGAAGTTATGGAAA--C--GAAGGAGACTCGTCCCCATNATGAAGNAGGC-ACGCGAGNAGGGTAAGGACGCCTNCATTAGCGTTGA--CAAACTGTNTATTAACAA--AAC----TTTATAC-GAAGAAAATCAA--TAGGACCCGTGTGAGA--NTGTTTTAAAGTG--T-----TT-----G----GAATGTTGAAGGACTTACTG-TAGCAAAANG----TTG-GATGACTTTGTGGATATTATAAGTAATTATGACGTAATATGTTTATCTGAAAC-TTGGACAAATAAAGACTCAAATATT-GATATTAAA-GGTTTTAGTAACC-----CA---ATT----CATTCGTACAG-AAAATTG-CGACATAGAAAAGCAAGACGGTCCAGTGGCGGCGTNA--TTGCGTATATNAAAGATTGCTTTAG-AAAAGGTGTAAAAGTTG--A-TTAAAAATGATATCGATTGTTTAG-T--TGGCTGAAGTTNGATAAATTGTTTTTTCATATTGAAACTGATATTTATTTA--GC-GTTAACCTATATAGCGCCAGAAAATTCGCCTACGCATAATATGTATGAAGTTGATATATTCAGGCAAATTGAAAACGAC-AT-AAATATTTTCCATGATNTGGG---CAAAATATTCAT-T-GCAGGTGACAC--A---AATAGTAG-AACG----GGNCANAAATGTGATTATATT--G-TCAACGATCGTAGCCTTGACAACGAT--GACGT-ATTTGAT-AGCGATATTCCATTGCNCCGGGCG----TCATGTGATTTTAAATCTAATCGATTTGGG-GANTATTTGCTTGACCTTTGTAAATCGACAAATATNCGTATAGTNAATGGGCGATT---A----CACAGCG-ANAANAATATAGGTAAANTNACATGCGTGACGCATAACGGAGAAAGTGTGGTCGATTATCTG-TTGAC--C-TCGCTA--CT---AAT--TTNAAGNAC-CTGNCCGATTTTA-ANGTAC--ACGATT----TTAACGAGTTTTCGAAT-CATGCACCAGTNTCATTTTCATTCAANATAATGACT-GAATG--AACA------AAATTAAATAATACGAG-A----ACGTT--TTACAAGTGGAACCCTAAATATAAANAAGATTTTNTAAACGACGTCACTNACGATATTCGNANTCTCGAACAG---TAGNTTAGCAGACG-ANAT-ANCCG-A--------G-GCGGTAACGCTGATGTNTTGGTTAAT--ANTTTTACCGAATTCTTGANCGTAAGAGGAAACAAATATTTTGA-ACAAACT-TCAAAATNTAAACGGTTCCCATTATTTTATGCGCAAGGACGAAAACAAACANAAATGGTATAACGATGAA-TGTAAA---CANAAAT-ACGAAATNTACAAANAGGCTA-TTTAT-AATTA-TAATATNANTAAAA-C-GA--A----AACAAG-ANNTGAGGTA--TATAGAACGAAAAAGGACTATAAATATTATTGTCG-AANATGTAAAAATAANTTTAAT
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gi|11                         :                                                                                    gaaaaggaaaaagaaggaatcgcctgggcaaaccaaagttgaacccaaatcaaaagtgagaaaggacaaggaaaaaatggctacaaatggcgcgagttcaagtcaacaaccggttttaccagttacaaataatgggcataatgagagctttagtcatcaacaggcaagtcaatcgttcaatatatcacatcctatgactccaatgcccccgccaaccaagttataattataatcaaaatatggctatgaattcagcgtctccaaatttttatcagtatacatcaacaccaacgccgacaaataattcgctactcaacaacgatatcatgactatgttatttcaacggatagactccgtggatagaaagttgtctacgttagatactattcagtcaagcgtgagtgctataacggttagattggacaatatggatcagagatcaacaacatggagagaaaaatgcaggacattgaaaatagccgtacttttgacgctagcataTTTATTGGAAAATGTCAGTAAAAAGCAA--ACTGAGCTAGAAAAATTAGTGTCGAAA--ATGAAAAAGagggatttaagtaaaaagatgatcgatatgagaaggaaaagcgcgcgagaattttggaaaatatttaaaaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taataaatatggaataaacttgttaaaatttagttctaaaaagttgaaaatggtacgttgatgactttgttatagtgctggagtaaattaatgccgagaaaacgtaagaagacaagggagtcccctgaaaactttaaGATTTGGG-TATAATCTGCTTGATATTTGTAAATCTACTAACATGTGCATACTTAATTGACGATCGGGA----AATAGCG-ACAAT------GGTAAAGTTACATGTTTCACGCACAATGGGGAAAGTTTGATCGATTACGTG-TTCAC--G-TT-TTA--C----AATAATTAAA--------------TTTA-AAGTACATACTATTACAATTAACA----CTCGAAT-CAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATATGGGTATACTAAATGGCCGCTT---A----C-----G-ATCACAA-ATAGGTAATTTTACATGCGTAACACACACTGGACAAAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--T-GC-CTATTCC---AAT--TTGAAAAAG-TTTAAGGATTTCA-CAGTCT--ATGATT----TTAAAGAATTTTCTAAT-CACACCCCAGTGTCATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAACATA--TATACTGAATGGCCGCTT---A----TG-ATCG-AAA------TAGGTAATTTTACATGCGT-ACGCACAATG--GACAGTGTAGTAGATTATATA-TTGAC--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaTAATCGTTTTGGT-GACTATTAAATTGACCTGTGTAAAGCGGTAAATAtgcctattccaaatcacggaaaaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACTACCTGTAGACAGCCAACTTTAACACACTTTCAGATTTTTCTGTAAGCAACTATATAAATTCTCCAATCATTCCCAAATCGCCTTTTCATTTCGTATAAAGCGTCACTAAAATCAATATGATATAAGTAAACAATGTTTATTGTTAGCAGGCTGTTAAGTCAACGAAATAAATGGACCTATGCCGCAACAGAAATAAAATATTTAA
Unaligned ( gi|17 ): ATATAATGAACGATAAACCGCCCAAGCGCAATTCACTGG