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Reference ( gi|1 )            :                            ACGGCCGGACGGACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGTAAGTATCA-TTTTTTAAAACAAA---GTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCT--CAGAGTTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TGCTT----A-G--TCGATTTA-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TAAAGA--A--ATAGTTTT--AATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAAAAGCTAA-GAAAATTTT-GAATATC-T----TAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|3                          :                            ACGGCCGGACGGACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGTAAGTATCA-TTTTTTAAAACAAA---GTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCT--CAGAGTTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TGCTT----A-G--TCGATTTA-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TAAAGA--A--ATAGTTTT--AATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAAAAGCTAA-GAAAATTTT-GAATATC-T----TAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATG
gi|18                         :                            ACGGATGGACGGACGGACGGGCAGACAGGCAGGCACATACAGGCAT-----AT--TTG-AGTTCTCAAGTA
gi|8                          : gtgttaactatatcagacaatcagacggacggCGAACGGACGGACAAATAAA-AG-CA-------ACAG-CA-----------T-TAGCTGTCAAGTATACATCAAGGATAAATGATAAATCGGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTATTAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAATGACACATGAATA----CTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---AT-------T----------------TTGGTGTAAGTATCA-TTTCTTTAAACCAA---GTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCT--CAGAGTTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TTCTT----A-G--TTGATTTA-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAATA-------C-TTAAGA--A--TAAGAATT--AATCT-------TAG-------------------ATGAAAA--TAT---AAATTT------A---------AGATGAATATAAATCTAAGAAG----CTTCATAA
gi|6                          :                                  GGACGGACGAATGGACAGA----CGG------AGAGACAA-----ATCGCTTTAATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA---------T----GGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTG---ATAAA--TTCTAATGACACAT----GTATGCTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGCAAGTATCA-TTTCTTTAAACCAA---GTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCT--CAGAGCTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TTCTT----A-G--ATGATTTT-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTAAGA--A--ATAGTTTT--AATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAAAAGTTTA-GAAAATTGT-GAATATC-T----TAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAata
gi|5                          :                                  GGACAGACGGACGGACAAAGAGACAG------ACAGACAA-----ATTGCTTTAACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG-------------GTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAATGACATAT----GTATGCTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---CT----ACTT----------------T-GGTGCAAGTATCA-TTTCTTTAAACCAA---GTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCT--CAGAGCTATC-TC-ATAGTTG--AGAGGAA--AA-ATGTTCTA---TTTTA----A-G--TTGTTTTT-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTAAGA--A--ATTGTTTT--AATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAAAAGTTAA-GAACATTTT-GAATATC-T----TAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|2                          :                                   GATGGACGGACGTACAGA----CAG------ATGGACAA-----ATCGCTTTTGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATATA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTA---ACCAA--GTCTAATAACACAT----GTATGCTGA---A-ATCGTGCTCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGCAAGTATTA-TTTCTTTAAACCAA---GTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCT--CAGAGCTATC-TT-ACAATTG--AGAGAAG--AA-ACTTTCTA---TCCTT----ATG--T-GATTTCTTTCGC---TATGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTAAGA--A--ATAGTTTT--AATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAAAAGTTAA-GAAAATATT-GAATATC-T----TAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTat
gi|4                          :                   acgaacaaacgaacaaaACGGACGGACGGGCGGGCGGACAG------ACAAATAATTGCAACCGCTTTAGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-TTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAATGACACATGCATG----CTGA---A-ATCGTGCTTAAA--TA----AT----ATTT----------------TTGGTGCTCATATCA-TGTCTTTGAACAAA---GTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCTATC----TTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTTTA---TTCTG----A-G--ACGATGTA-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTAAGA--A--TTAGTATT--AATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAAAAGTTAA-GAACATTTT-GAATATC-T----TAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGAa
gi|7                          :                                                       GACAG------AGAGACAA-----ATCGCTTTAACTGTCAAGTATACATAAAGGTTAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAATAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAAGG-------TATGTATGCTGA---A-ATCGTGATCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGTAAGTATCA-TTTCTTTAAACCAA---ATTATACGTTT-TAAGAAATTTCTTAAACAGTTAGTACACCT--CAGAGTTATC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TTCTT----A-G--TCGATTTA-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTCAGA--A--ATAGTTTT--AATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAAAAGTTAA-GAAAAATTT-GAATATC-T----TAGATGAAAACAAATTTTAGAAG----CTTTATGAa
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gi|17                         :                                                                       gcA-----ACCGCTTTAACTGTCAAGTATAAATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGATAA--ATCAATACA-AAATGT-TTA----------TCTTTAATAGC------A-GTTG---ATAAA--GTCTAGTAACACATTTA----TGCTGA---T-ATCGTGCACAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGAAAGTATCA-TTTCT
gi|9                          :                                                                             aaataaaagcAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGT------A-GTTG---ATAAA--GTCCAAAGACACAT----GTATGCTAA---A-ACCGTGCTCAAA--TAC---AT----ACTT----------------TTGGTGTAAGTATCA-TTTCTTTAAACCAA---GTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCT--CAGAGTTGTC-TT-ACAGTTG--AGAGGAA--AA-ACGTTCTA---TTCTT----A-G--ATGATTTT-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGA-ATAACA-------C-TTAAGA--A--ATAGTTTT--TATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAAAAGTTAA-GAAAGTTTT-AAATATC-T----TAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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Reference ( family-4105 )     :           ACGGNCGGACGGACGGACGGGCAGA-AGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTTTAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACACAT-CATGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGNCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTNAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :           ACGGCCGGACGGACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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gi|11                         :                 atgacaactcgaacataatgggcgaataacaagaacatgtaaatctaactggggtgtcTCAAATATGC-TAAAA-ATGGACA-------T-TC-AG--AGAAATAATGATATGCGTAA-AGGTAACTGTTAGTGCATAGATTTTATA----------TAATTA-TAAT------A-GCTACAAATAAAAAATGATGGCTGAT-ACAGAC-TAGTTACAC---A-A-----TCGTGCACA---ACT----ACATACTTT------------TGATTCAAGTATCATTT-TTTAAACC-AAGTCACATTTTT-TAAGAAATGTCTTAAATAGTTAATACACCTCAATGAT-ATC-TTACAGTTA--AGAGGA---A------------TCT-TGGATCTTGGATAAAACTTTGA-T---A---TAAGA-------TGAAAAGC---TAAGAAA--ATA--TTGAACATCGTAGAGTAGATGAAA--ATGAATCTAAGA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTATAAGAAACTTTATAAATA------ACGCTTAAGATTT-ATTGTTA-AATTGTAAGATGATTTAATCTCTA-AGATGCTTT---TATAGGATTA---TTT-A-TTCTCCTCTAAGATGCTTT-------ATACTTAAG-ATTTATAATT--AATTT-------TATATGAAAATATTTATTTA-GATGAA---AAAC-TA-TAATATAT-TGAATATCTTAGATGTAAAT-AATCAAAGAAGCAAACTTTGTGA
gi|15                         :                                                                                                                          AAGG-----ATAATGGGTAA--ATTT-TACA-AAATTT-AAACTCAAAAGACTCTGTAGTAGTTAAAAGATGTTA---ATAAA-------GTCTAGCAACACAT-T---TATGCTGAATA-----TCGTGCACA---TAT----ACAAAACTT------------TGGTGCTAACATGAGTTTTTTTAATC-AAGTCACA--TTG-T------TTTGT-------TTAAGACACCCCATAGCT-ATA-TTAAA---G--AGAAGA---AA-----ATACATTCTAC---Tata
gi|17                         :                                                        A-----ACCGCTTTAACTGTCAAGTATAAATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGATAA--ATCAATACA-AAATGT-TTA----------TCTTTAATAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAGTAACACAT-T---TATGCTGAT-A-----TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGAAAGTATCATTTCTt
gi|18                         : aaataaaagcACGGATGGACGGACGGACGGGCAGACAGGCAGGCACATACAGGCAT-----AT---TTGAGTTCTCAAGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtgttaactatatcagacaatcagacggacggGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCCTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|2                          :                  GATGGACGGACGTACAGA----CAG------ATGGACAA-----ATCGCTTTTGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATATA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTA---ACCAA-------GTCTAATAACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATTATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAATTG--AGAGAA---GA-----A-ACTTTCTAT---CCTTATGTGA---TTT-CTTTCGC---TATGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATAT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acgaacaaacgaacaaaGATTTAAGATGAA---AAGT-AAATAAAAATT-TCAATATCTTAGATGAAAATAATTCTAAGAAG----CTTTATGAa
gi|3                          :           ACGGCCGGACGGACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGa
gi|4                          :                CGGACGGACGGGCGGGCGGA----CAG------ACAAATAATTGCAACCGCTTTAGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-TTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACACAT----GCATGCTGAA-A-----TCGTGCTTA---AAT----A-ATATTTT------------TGGTGCTCATATCATGTCTTTGAACA-AAGTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCT---ATCTTATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTTTAT---TCTGAGACGA---TGT-A-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--TTAGTATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGA
gi|5                          :                aGGACAGACGGACGGACAAAGAGACAG------ACAGACAA-----ATTGCTTTAACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG-------------GTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACATAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACCTACTTT-------------GGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCTCAGAGCT-ATC-TCATAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ATGTTCTAT---TTTAAGTTGT---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATTGTTTTAATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAa
gi|6                          :                 GGACGGACGAATGGACAGA----CGG------AGAGACAA-----ATCGCTTTAATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA---------T----GGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTG---ATAAA-------TTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAA---AAGT-TTAGAAAATTG-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|7                          :                                      GACAG------AGAGACAA-----ATCGCTTTAACTGTCAAGTATACATAAAGGTTAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAATAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAAGG-------TATGTATGCTGAA-A-----TCGTGATCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAATTATACGTTT-TAAGAAATTTCTTAAACAGTTAGTACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAAATT-TGAATATCTTAGATGAAAACAAATTTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|8                          :                CGAACGGACGGACAAATAAA-AG-CA-------ACAG-CA------------TTAGCTGTCAAGTATACATCAAGGATAAATGATAAATCGGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTATTAGC------A-GTTG---ATAAA-------GTCTAATGACACAT-GA---ATACTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACA---TTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTTGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAATACTTAAG-AA--TAAGAATTAATCT-------TAGATGAAAATATAAATTTAAGATGAATATAAATCTAAGAAGCTTCATAAATAat
gi|9                          :                                                                  CTTAAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGA-----ATAA-AGGTAA--ATCAATACA-AAATGT-ATA----------TCTTTAGTAGT------A-GTTG---ATAAA-------GTCCAAAGACACAT----GTATGCTAAA-A-----CCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-GTC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTTATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAGTTT-TAAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GCCATATTTAAGAAATTTCTTAAAAGTTAAGAAAGCTCCCATGATTCCTCAATATTTAAGTAAAAAATAGACTACTTTAAGGAAATTTTTAAGTAAGAAGTTTTATGGATAGTACTTAAGAATTATTTCAAAATTTAAGAAAAAAACTTAGAAAAAGAAGAAAACCTAAGGAAAATCTTAAAATATAAGGT






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consensus                     :                                                              ACGGNCGGACGGACGGACGGGCAGANAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTTTAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT---TGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
Reference ( family-4105 )     :                                                              ACGGCCGGACGGACGGACGGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTTTAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT---TGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :                                                              ACGGCCGGACGGACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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Reference ( family-4105 )     :                                                            ACGGNCGGACG--GACGGACGGGCAGANAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTTTAGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT---TGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :                                                            ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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gi|2                          :                                                            ACAAACGAACAAAGATGGACGGACGTACAGACAG------ATGGACAA-----ATCGCTTTTGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATATAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTAAC--CAAGTCTAATAACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATTATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAATTG--AGAGAA---GA-----A-ACTTTCTAT---CCTTATGTGA---TTT-CTTTCGC---TATGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATAT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTa
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gi|3                          :                                                            ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAG------ACAGACAA-----ATCGCTGTAACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGa
gi|4                          :                                                                    ACG--GACGGACGGGCGGGCGGACAG------ACAAATAATTGCAACCGCTTTAGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT----GCATGCTGAA-A-----TCGTGCTTA---AAT----A-ATATTTT------------TGGTGCTCATATCATGTCTTTGAACA-AAGTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCT---ATCTTATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTTTAT---TCTGAGACGA---TGT-A-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--TTAGTATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGA
gi|5                          :                                                                  GGACA--GACGGACGGACAAAGAGACAG------ACAGACAA-----ATTGCTTTAACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG--------GTAAATCAATACAAAATGTATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACATAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACCTACTTT-------------GGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCTCAGAGCT-ATC-TCATAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ATGTTCTAT---TTTAAGTTGT---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATTGTTTTAATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAa
gi|6                          :                                                                      G--GACGGACGAATGGACAGACGG------AGAGACAA-----ATCGCTTTAATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA----T----GGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTGAT--AAATTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAA---AAGT-TTAGAAAATTG-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GCCATATTTAAGAAATTTCTTAAAAGTTAAGAAAGCTCCCATGATTCCTCAATATTTAAGTAAAAAATAGACTACTTTAAGGAAATTTTTAAGTAAGAAGTTTTATGGATAGTACTTAAGAATTATTTCAAAATTTAAGAAAAAAACTTAGAAAAAGAAGAAAACCTAAGGAAAATCTTAAAATATAAGGT






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Reference ( family-4105 )     :                                                              ACGGACGGACG--GACGGACGGGCGGACAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT---TGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :                                                              ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TGT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcATTTCTTTAAACC-AAGTCACAAGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCGCAGAGCT-ATC-TTTCAGTTG--ATAAGA---AA-----A-ACCTTCTTT---TCTCAGATGA---TTT-A-TCCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--TTAATATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGTA---AAGT-TAAGAAAATGT-TGAATATCTTAGATGAAAATAGATCTAAAAAG----CTTTAT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                               AAGGATAATGGGTAAATTT-TACAAAATTTAAACTCAAAAGACTCTGTAGTAGTTAAAAGATGTTAAT--AAAGTCTAGCAACACAT---T-TATGCTGAATA-----TCGTGCACA---TAT----ACAAAACTT------------TGGTGCTAACATGAGTTTTTTTAATC-AAGTCACA--TTG-T------TTTGT-------TTAAGACACCCCATAGCT-ATA-TTAAA---G--AGAAGA---AA-----ATACATTCTAC---Tata
gi|17                         :                                                                                                           AAC-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATAAATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGATAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAGTAACACAT---T-TATGCTGAT-A-----TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGAAAGTATCATTTCTt
gi|18                         :                                                    aaataaaagcACGGACGGATG--GACGGACGGACGGGCAGACAGG--CAG--GCACATACAGGCATATTTGAGTTCTCAAGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgttaactatatcagacaatcagacggGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCCTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|2                          :                                                              ACAAACGAACAAAGATGGACGGACGTACAGACAGA--TGG--ACAAAT-C--GC---TTT-TGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATATAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTAAC--CAAGTCTAATAACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATTATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAATTG--AGAGAA---GA-----A-ACTTTCTAT---CCTTATGTGA---TTT-CTTTCGC---TATGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATAT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acgaGATTTAAGATGAA---AAGT-AAATAAAAATT-TCAATATCTTAGATGAAAATAATTCTAAGAAG----CTTTATGAa
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gi|4                          :                                                                  ACGGACG--GACGGGCGGGCGGACAGACAAA--TAATTGCAA-C-C--GC---TTT-AGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT----GCATGCTGAA-A-----TCGTGCTTA---AAT----A-ATATTTT------------TGGTGCTCATATCATGTCTTTGAACA-AAGTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCT---ATCTTATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTTTAT---TCTGAGACGA---TGT-A-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--TTAGTATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGA
gi|5                          :                                                                    GGACA--GACGGACGGACAAAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-T--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG--------GTAAATCAATACAAAATGTATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACATAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACCTACTTT-------------GGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCTCAGAGCT-ATC-TCATAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ATGTTCTAT---TTTAAGTTGT---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATTGTTTTAATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAa
gi|6                          :                                                                        G--GACGGACGAATGGACAGACGGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA----T----GGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTGAT--AAATTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAA---AAGT-TTAGAAAATTG-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|7                          :                                                                                           GACAGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGTTAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAA-GGTA------TGTATGCTGAA-A-----TCGTGATCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAATTATACGTTT-TAAGAAATTTCTTAAACAGTTAGTACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAAATT-TGAATATCTTAGATGAAAACAAATTTTAGAAG----CTTTATGAat
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Reference ( family-4105 )     :                                                              ACGGACGGACG--GACGGACGGACGGACAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT---TGTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :                                                              ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TGT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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gi|12                         : tcaaatatgctaaaaatggacattcagagaaataatgatatgcgtaaaggtaactgttagtgcatagattttatataattataatagctacaaataaaaaatgatgAAC-C--GC---TTT-AGCTTTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGATTAA-AGGTAAAATAATATAAAATGTTTA----------TTCTTAGTAGC------A-GTTGACAAAAAGTCTAATGACACA----TGTATGCTG-A-A-----TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACGGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAACT-ATC-TTACAGCAA--AGAGG----AA-----A-ACATTCTAT---TCTTACACGA---TTT-A-TCCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAAAACTTAAA-AA--TTAATAGTAATCT-------TA
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gi|17                         :                                                                                                           AAC-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATAAATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGATAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAGTAACACAT---T-TATGCTGAT-A-----TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGAAAGTATCATTTCTt
gi|18                         :                                                     aaataaaagcCAGACAATCA--GACGGACGGACGGATGGACGGA--CGG--AC
gi|18                         :                                                 gtgttaactatatACGGACGGATG--GACGGACGGACGGGCAGACAGG--CAG--GCACATACAGGCATATTTGAGTTCTCAAGTAgggcagacaggcaggcacatacaggcatatttgagttctcaagta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgttaactatatcagacaatcagacggGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCCTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|2                          :                                                              ACAAACGAACAAAGATGGACGGACGTACAGACAGA--TGG--ACAAAT-C--GC---TTT-TGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATATAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTAAC--CAAGTCTAATAACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATTATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAATTG--AGAGAA---GA-----A-ACTTTCTAT---CCTTATGTGA---TTT-CTTTCGC---TATGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATAT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acgaGATTTAAGATGAA---AAGT-AAATAAAAATT-TCAATATCTTAGATGAAAATAATTCTAAGAAG----CTTTATGAa
gi|3                          :                                                              ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TGT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGa
gi|4                          :                                                                  ACGGACG--GACGGGCGGGCGGACAGACAAA--TAATTGCAA-C-C--GC---TTT-AGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT----GCATGCTGAA-A-----TCGTGCTTA---AAT----A-ATATTTT------------TGGTGCTCATATCATGTCTTTGAACA-AAGTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCT---ATCTTATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTTTAT---TCTGAGACGA---TGT-A-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--TTAGTATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGA
gi|5                          :                                                                    GGACA--GACGGACGGACAAAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-T--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG--------GTAAATCAATACAAAATGTATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACATAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACCTACTTT-------------GGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCTCAGAGCT-ATC-TCATAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ATGTTCTAT---TTTAAGTTGT---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATTGTTTTAATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAa
gi|6                          :                                                                        G--GACGGACGAATGGACAGACGGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA----T----GGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTGAT--AAATTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAA---AAGT-TTAGAAAATTG-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|7                          :                                                                                           GACAGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGTTAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAA-GGTA------TGTATGCTGAA-A-----TCGTGATCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAATTATACGTTT-TAAGAAATTTCTTAAACAGTTAGTACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAAATT-TGAATATCTTAGATGAAAACAAATTTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|8                          :                                                                             CGAACGGACGGACAAATAAAAGCA---ACA-------GC---ATT-AGCTGTCAAGTATACATCAAGGATAAATGATAAATCGGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTATTAGC------A-GTTGAT--AAAGTCTAATGACACAT----GAATACTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACAT---TT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTTGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAATACTTAAG-AA--TAAGAATTAATCT-------TAGATGAAAATATAAATTTAAGATGAATATAAATCTAAGAAGCTTCATAAATAat
gi|9                          :                                                                                                                   C---TTA-AGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGT------A-GTTGAT--AAAGTCCAAAGACACAT----GTATGCTAAA-A-----CCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-GTC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTTATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAGTTT-TAAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA


blockSeqs                     :                                                                         AA                      AG   TT      A AG  ATA   G                             ATAAATC    G                   T                        CTCAAAAGAC           TAAAAG T      AA                 ACATG         T ATCGT         CCC   TTTT         CTTATTCTTCTC                          G             A                                     T   G         TA      TTT  TCTCT T         GGA      AT  AAC   GA      CTC                           A  TTA            CGTAGAG                           TAT    C           A                          A     CAAA
blockSeqs                     :                                                                         .                       .    .       . .   .     .                             .          .                   .                        .                    .      .      .                  TG            . .             .     .            .                                     .             .                                     .   .         .       .    .     .         .        AT  .     CT      .                             .  T              .                                 .      .           .                          A     .   
blockSeqs                     :                                                                         .                       .    .       . .   .     .                             .          .                   .                        .                    .      .      .                  TG            . .             .     .            .                                     .             .                                     .   .         .       .    .     .         .        AC  .     T       .                             .  A              .                                 .      .           .                          T     .   
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4105 )     :                                                              ACGGACGGACG--GACGGACGGACGGACAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGACGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|1                          :                                                              ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TGT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                          TGTA-A----------TATTTAACAGC------A-GTTACTAAA--CCCCAGTGACATAT----TCATGCTGAA-AATCGTTCATACTTACCCGATTTTTACTTGTTTTCTTATTCTTCTCTGCTGCAAATGCCACTT-TCTAAACTGAACCCGCCATTTT-TAAGAAATTTCTTAGATAGATAAGATACCTCTGACCT-ATC-TTAAAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACAATTTAC---TCTAAGATGA---TTT-T-TTTGC---TAAGACGCTTTATGAATTCTACTTAAG-AT--TTATTTTTCATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAAATT-TGAATATCTAAGAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                  atgacaactcgaacataatgggcgaataacaagaacatgtaaatctaactggggtgtc-GCTGATACA--GACTAGTTACACA----------------A-----TCGTGCACA---ACT----ACATACTTT------------TGATTCAAGTATCATTT-TTTAAACC-AAGTCACATTTTT-TAAGAAATGTCTTAAATAGTTAATACACCTCAATGAT-ATC-TTACAGTTA--AGAGGA---A------------TCT-TGGATCTTGGATAAAACTTTGA-T---A---TAAGA-------TGAAAAGC---TAAGAAA--ATA--TTGAACATCGTAGAGTAGATGAAA--ATGAATCTAAGA
gi|12                         : tcaaatatgctaaaaatggacattcagagaaataatgatatgcgtaaaggtaactgttagtgcatagattttatataattataatagctacaaataaaaaatgatgAAC-C--GC---TTT-AGCTTTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGATTAA-AGGTAAAATAATATAAAATGTTTA----------TTCTTAGTAGC------A-GTTGACAAAAAGTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-------TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACGGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAACT-ATC-TTACAGCAA--AGAGG----AA-----A-ACATTCTAT---TCTTACACGA---TTT-A-TCCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAAAACTTAAA-AA--TTAATAGTAATCT-------TA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcATTTCTTTAAACC-AAGTCACAAGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCGCAGAGCT-ATC-TTTCAGTTG--ATAAGA---AA-----A-ACCTTCTTT---TCTCAGATGA---TTT-A-TCCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--TTAATATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGTA---AAGT-TAAGAAAATGT-TGAATATCTTAGATGAAAATAGATCTAAAAAG----CTTTAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTATAAGAAACTTTATAAATA------ACGCTTAAGATTT-ATTGTTA-AATTGTAAGATGATTTAATCTCTA-AGATGCTTT---TATAGGATTA---TTT-A-TTCTCCTCTAAGATGCTTT-------ATACTTAAG-ATTTATAATT--AATTT-------TATATGAAAATATTTATTTA-GATGAA---AAAC-TA-TAATATAT-TGAATATCTTAGATGTAAAT-AATCAAAGAAGCAAACTTTGTGA
gi|15                         :                                                                                                                                                                               AAGGATAATGGGTAAATTT-TACAAAATTTAAACTCAAAAGACTCTGTAGTAGTTAAAAGATGTTAATAAA--GTCTAGCAACACAT----TTATGCTGAATA-----TCGTGCACA---TAT----ACAAAACTT------------TGGTGCTAACATGAGTTTTTTTAATC-AAGTCACA--TTG-T------TTTGT-------TTAAGACACCCCATAGCT-ATA-TTAAA---G--AGAAGA---AA-----ATACATTCTAC---Tata
gi|17                         :                                                                                                           AAC-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATAAATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGATAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAGTAACACAT----TTATGCTGAT-A-----TCGTGCACA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGAAAGTATCATTTCTt
gi|18                         :                                                     aaataaaagcCAGACAATCA--GACGGACGGACGGATGGACGGA--CGG--AC
gi|18                         :                                                 gtgttaactatatACGGACGGATG--GACGGACGGACGGGCAGACAGG--CAG--GCACATACAGGCATATTTGAGTTCTCAAGTAgggcagacaggcaggcacatacaggcatatttgagttctcaagta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgttaactatatcagacaatcagacggGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATTT-TGAATATCCTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
gi|2                          :                                                              ACAAACGAACAAAGATGGACGGACGTACAGACAGA--TGG--ACAAAT-C--GC---TTT-TGCTGTCAAGTATACATAAATGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATATAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTAACCAA--GTCTAATAACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATTATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGATTT-TAAGAAATTTCTAAAATAGTTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAATTG--AGAGAA---GA-----A-ACTTTCTAT---CCTTATGTGA---TTT-CTTTCGC---TATGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATATATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAATAT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTGAGAAG----TTTa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acgaGATTTAAGATGAA---AAGT-AAATAAAAATT-TCAATATCTTAGATGAAAATAATTCTAAGAAG----CTTTATGAa
gi|3                          :                                                              ACGGCCGGACG--GACGGACAGGCAGAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-C--GC---TGT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACACATACATGTCTGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTTTTAAAACA-AAGTTATAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---GCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTAAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGC-TAAGAAAATTT-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGa
gi|4                          :                                                                  ACGGACG--GACGGGCGGGCGGACAGACAAA--TAATTGCAA-C-C--GC---TTT-AGCTGCCAAGTATACATAATGGATAAATA-------TATC-AACTTCAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTTTA----------TCTTTAGTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACACAT----GCATGCTGAA-A-----TCGTGCTTA---AAT----A-ATATTTT------------TGGTGCTCATATCATGTCTTTGAACA-AAGTGACAGGTTT-TAAGAAATTTATTAAATATTTAATACACCT---ATCTTATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTTTAT---TCTGAGACGA---TGT-A-TTCAC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--TTAGTATTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGATAAAAATAAATCTAAGAAG----CTTCATGA
gi|5                          :                                                                    GGACA--GACGGACGGACAAAGAGACAGA--CAG--ACAAAT-T--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAACGGATAAATA-------CGTC-AACTACAAATAAAG--------GTAAATCAATACAAAATGTATA----------TTTAAAGTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACATAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACCTACTTT-------------GGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTGAATAGTAAATACACCTCAGAGCT-ATC-TCATAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ATGTTCTAT---TTTAAGTTGT---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATTGTTTTAATCT-------TAGATGGAAATATGAATTTAATATGAA---AAGT-TAAGAACATTT-TGAATATCTTAGGTGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAa
gi|6                          :                                                                        G--GACGGACGAATGGACAGACGGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AATTGTTAAATATACATAAAGGACAAATA-------GGTCGAACTACAAATAA----T----GGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTGGTAGC------A-GTTGATAAA--TTCTAATGACACAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGCAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAATTAATACACCTCAGAGCT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCTC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATTTGGATTTAAGATGAA---AAGT-TTAGAAAATTG-TGAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|7                          :                                                                                           GACAGA--GAG--ACAAAT-C--GC---TTT-AACTGTCAAGTATACATAAAGGTTAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAATAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAAGG---TAT----GTATGCTGAA-A-----TCGTGATCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAATTATACGTTT-TAAGAAATTTCTTAAACAGTTAGTACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTCGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTCAG-AA--ATAGTTTTAATCT-------TAGATGAAAATATTGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAAATT-TGAATATCTTAGATGAAAACAAATTTTAGAAG----CTTTATGAat
gi|8                          :                                                                             CGAACGGACGGACAAATAAAAGCA---ACA-------GC---ATT-AGCTGTCAAGTATACATCAAGGATAAATGATAAATCGGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTATTAGC------A-GTTGATAAA--GTCTAATGACACAT----GAATACTGAA-A-----TCGTGCTCA---AAT----ACAT---TT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTCACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-ATC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGTTGA---TTT-A-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAATACTTAAG-AA--TAAGAATTAATCT-------TAGATGAAAATATAAATTTAAGATGAATATAAATCTAAGAAGCTTCATAAATAat
gi|9                          :                                                                                                                   C---TTA-AGCTGTCAAGTATACATAAAGGATAAATA-------GGTC-AACTACAAATAAAGAATAA-AGGTAAATCAATACAAAATGTATA----------TCTTTAGTAGT------A-GTTGATAAA--GTCCAAAGACACAT----GTATGCTAAA-A-----CCGTGCTCA---AAT----ACATACTTT------------TGGTGTAAGTATCATTTCTTTAAACC-AAGTTACAGGTTT-TAAGAAATTTCTTAAATAGTTAATACACCTCAGAGTT-GTC-TTACAGTTG--AGAGGA---AA-----A-ACGTTCTAT---TCTTAGATGA---TTT-T-TTCGC---TAAGATGCTTTCTGAATAACACTTAAG-AA--ATAGTTTTTATCT-------TAGATGAAAATATGGATTTAAGATGAA---AAGT-TAAGAAAGTTT-TAAATATCTTAGATGAAAATAAATCTTAGAAG----CTTTATGA
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Unaligned ( gi|16 ): GCCATATTTAAGAAATTTCTTAAAAGTTAAGAAAGCTCCCATGATTCCTCAATATTTAAGTAAAAAATAGACTACTTTAAGGAAATTTTTAAGTAAGAAGTTTTATGGATAGTACTTAAGAATTATTTCAAAATTTAAGAAAAAAACTTAGAAAAAGAAGAAAACCTAAGGAAAATCTTAAAATATAAGGT